View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5674_low_8 (Length: 306)

Name: NF5674_low_8
Description: NF5674
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5674_low_8
NF5674_low_8
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (18-237)||(5003437-5003658)
chr2 (19-237)||(45463531-45463753)
chr2 (18-237)||(34599554-34599773)
chr2 (19-243)||(4391659-4391885)
chr2 (18-238)||(15381795-15382012)
chr2 (23-237)||(12131363-12131579)
chr2 (33-234)||(16492421-16492623)
chr2 (18-237)||(25459460-25459677)
chr2 (24-237)||(28439772-28439985)
chr2 (19-233)||(38903352-38903569)
chr2 (114-237)||(38033576-38033699)
chr2 (18-168)||(34132325-34132476)
chr2 (151-238)||(3515685-3515772)
chr2 (173-237)||(425070-425134)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (18-237)||(21405702-21405922)
chr8 (18-237)||(21800194-21800414)
chr8 (18-238)||(26426759-26426980)
chr8 (18-237)||(34501071-34501292)
chr8 (19-237)||(29601115-29601335)
chr8 (24-237)||(10953567-10953786)
chr8 (24-237)||(10961572-10961791)
chr8 (18-237)||(33817489-33817709)
chr8 (19-237)||(14122236-14122453)
chr8 (18-237)||(37233484-37233709)
chr8 (18-237)||(14123196-14123414)
chr8 (18-243)||(10582090-10582328)
chr8 (37-235)||(4078767-4078976)
chr8 (42-237)||(33317600-33317795)
chr8 (41-237)||(10334599-10334785)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (18-237)||(29665968-29666187)
chr7 (18-239)||(1783555-1783777)
chr7 (18-238)||(46940016-46940237)
chr7 (18-237)||(6587573-6587793)
chr7 (18-237)||(32801617-32801836)
chr7 (18-237)||(19893471-19893693)
chr7 (18-236)||(38098334-38098553)
chr7 (18-237)||(16188966-16189189)
chr7 (18-237)||(38150388-38150608)
chr7 (18-238)||(36332981-36333208)
chr7 (18-238)||(27895081-27895301)
chr7 (19-237)||(3175977-3176193)
chr7 (19-237)||(28147053-28147272)
chr7 (24-237)||(47748905-47749119)
chr7 (19-237)||(23979894-23980116)
chr7 (19-171)||(44073821-44073974)
chr7 (55-237)||(29172246-29172429)
chr7 (48-237)||(7118146-7118337)
chr7 (18-170)||(7835061-7835211)
chr7 (160-237)||(7835224-7835301)
chr7 (151-237)||(47262784-47262869)
chr7 (151-237)||(35407096-35407180)
chr7 (171-236)||(6381544-6381609)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (19-237)||(3466326-3466548)
chr5 (18-237)||(25764186-25764406)
chr5 (18-236)||(21145704-21145922)
chr5 (18-238)||(19858098-19858319)
chr5 (38-237)||(22527444-22527644)
chr5 (24-237)||(794511-794724)
chr5 (29-237)||(3514305-3514514)
chr5 (151-240)||(15927346-15927434)
chr5 (151-237)||(9717279-9717364)
chr5 (151-237)||(41284458-41284542)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (19-237)||(43100381-43100605)
chr4 (17-237)||(26619163-26619385)
chr4 (19-237)||(13229613-13229833)
chr4 (17-237)||(21629415-21629636)
chr4 (19-237)||(46580289-46580508)
chr4 (24-237)||(53227963-53228178)
chr4 (18-237)||(50435831-50436040)
chr4 (19-237)||(40218998-40219219)
chr4 (29-238)||(1121314-1121523)
chr4 (19-237)||(28714299-28714519)
chr4 (18-237)||(6890966-6891190)
chr4 (18-236)||(1124140-1124359)
chr4 (18-239)||(575866-576084)
chr4 (19-235)||(56038081-56038298)
chr4 (18-237)||(48832873-48833102)
chr4 (82-237)||(32129153-32129310)
chr4 (18-48)||(32129445-32129475)
chr4 (246-296)||(53469692-53469742)
chr4 (252-296)||(10396003-10396047)
chr4 (252-296)||(27272611-27272655)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (18-238)||(14206576-14206798)
chr6 (18-237)||(23219396-23219617)
chr6 (18-237)||(4486600-4486821)
chr6 (18-240)||(31715339-31715562)
chr6 (151-237)||(34527039-34527124)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (19-237)||(9411949-9412169)
chr1 (19-237)||(13832674-13832894)
chr1 (19-235)||(37350491-37350709)
chr1 (18-237)||(31924481-31924700)
chr1 (18-237)||(42434518-42434738)
chr1 (18-237)||(40976993-40977212)
chr1 (19-237)||(7351279-7351507)
chr1 (18-223)||(40535510-40535716)
chr1 (18-238)||(29824189-29824416)
chr1 (174-237)||(40535443-40535506)
chr1 (151-240)||(1804215-1804303)
chr1 (129-227)||(12870458-12870557)
chr1 (175-237)||(27286056-27286118)
chr1 (177-237)||(1791652-1791711)
chr1 (242-288)||(20260980-20261026)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (19-238)||(45906054-45906274)
chr3 (19-237)||(39625353-39625572)
chr3 (18-238)||(10695789-10696010)
chr3 (18-237)||(43171575-43171795)
chr3 (18-237)||(52722437-52722656)
chr3 (18-237)||(53175752-53175969)
chr3 (18-236)||(52553326-52553543)
chr3 (18-238)||(14242745-14242971)
chr3 (18-239)||(4970946-4971174)
chr3 (18-238)||(38572754-38572987)
chr3 (18-237)||(8034362-8034585)
chr3 (31-237)||(50517057-50517265)
chr3 (18-237)||(38834442-38834656)
chr3 (18-237)||(10475820-10476047)
chr3 (18-237)||(40690495-40690723)
chr3 (18-237)||(24656911-24657131)
chr3 (37-237)||(24596240-24596454)
chr3 (24-248)||(54244964-54245189)
chr3 (18-168)||(26406932-26407082)
chr3 (242-306)||(37133806-37133870)
chr3 (151-237)||(17332060-17332145)
chr3 (242-296)||(25889664-25889718)
chr3 (105-141)||(24656833-24656869)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (19-240)||(30368-30591)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (18-237)||(2900-3121)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 5003437 - 5003658
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5003437 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggcgacgccactaaagcaagctgtacaaattcaaaaaatttg 5003536  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa--aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5003537 cttttaatagatatataaccattattttcatgtcttacatataaaaaaaaaatattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 5003636  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5003637 gacgggctatgggccggccctg 5003658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 45463531 - 45463753
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45463531 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgc 45463630  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa----tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45463631 ttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatattaaaaaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 45463730  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45463731 cgacgggctatgggccggccctg 45463753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 34599554 - 34599773
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |  |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  34599554 tattaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacataacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaaacaagctgtacaaattgaattaatttg 34599653  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34599654 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataataaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 34599753  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34599754 cgggctatgggccggccctg 34599773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4391885 - 4391659
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4391885 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgc 4391786  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4391785 ttttaatagatatataatcattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaatattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 4391686  T
Q  217 acgggctatgggccggccctggttcta 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4391685 acgggctatgggccggccctgattcta 4391659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 15381795 - 15382012
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |    
T  15381795 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtagccatgccactaaagcaagctgtacagattaaattaattcg 15381894  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381895 cttttaataaatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa---ttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 15381991  T
Q  218 cgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15381992 cgggctatgggccggccctgg 15382012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Original strand, 12131363 - 12131579
Alignment:
Q  23 gaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaata-tgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttt 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  12131363 gaaattacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaaagtggccatgccactcaagcaaggtgtacaaatcaaaataatttgcttt 12131462  T
Q  122 taatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12131463 taatagatatataaccattattttcgtgtcttgcatataaaaaaaaatattttaggccccaaataattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgg 12131562  T
Q  221 gctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  12131563 gctatgggccggccctg 12131579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16492623 - 16492421
Alignment:
Q  33 tttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatata 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16492623 tttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactgaagcaagctgtatagattgaataaatttgcttttaatagatata 16492524  T
Q  133 taaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492523 taatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccg 16492424  T
Q  232 gcc 234  Q
    |||    
T  16492423 gcc 16492421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 25459460 - 25459677
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |  ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||    
T  25459460 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggtcacaccactaaagcaagctatacagattgaattaatttg 25459559  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25459560 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaa--aaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgcccagcctcga 25459657  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25459658 cgggctatgggccggccctg 25459677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 28439772 - 28439985
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |   || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28439772 aaatcacactttggtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccgcgctactaaagcaagctgtacaaataaaattaatttgctttta 28439871  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28439872 atagatatataaccattattttcgtagcttacatataaaaaaaatattttaggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgacggact 28439971  T
Q  224 atgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||    
T  28439972 atgggccggccctg 28439985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38903569 - 38903352
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaata-tgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||||| |||| |||  |||| || |||    
T  38903569 attagaaattacactttggtgggtcttgaacacttgacctcacactcaacaaaaaagtggcaataccactcaagcaaggtgtataaacaaaaataacttg 38903470  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38903469 cttttaatagatatataaccactattgtcatgtcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaataattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctc 38903370  T
Q  216 gacgggctatgggccggc 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38903369 gacgggctatgggccggc 38903352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 38033576 - 38033699
Alignment:
Q  114 tttgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38033576 tttgcttttaatagatatataactattattttcgtggcttacatataataaaaaaaaattaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcc 38033675  T
Q  214 tcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38033676 tcgacgggctatgggccggccctg 38033699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 34132325 - 34132476
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttga--acacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatt 115  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||     |   || ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  34132325 tattaaaaatcacactgtagtgggtcttgagaacgcatgacctcacactcaacaaaaacaagcctcgcaactgaagcaagctgtaaagattgaaataatt 34132424  T
Q  116 tgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa 168  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34132425 cacttttaatagatatataacca-tattttagagtcttacatataaaaaaaaa 34132476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3515772 - 3515685
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||| | ||||||| ||| | | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515772 cttacatataaaaaaaatgttttgggccccaaaaaaatcgaggcccagtggcatagtccatcctcgacggcctatgggccggccctgg 3515685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 425134 - 425070
Alignment:
Q  173 tgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  425134 tgggcccctaaaattttgaggccccgtggtctcgtcccgcctcgacgggctatgggccggccctg 425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 21405702 - 21405922
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21405702 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttg 21405801  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21405802 cttttaatagatatataaccattattttcatgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccagcctcg 21405901  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21405902 acgggctatgggccggccctg 21405922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 21800194 - 21800414
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21800194 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacacttaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttg 21800293  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21800294 cttttaatagatatataaccattattttcatgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccagcctcg 21800393  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21800394 acgggctatgggccggccctg 21800414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 26426759 - 26426980
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  26426759 tattaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttg 26426858  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426859 cttttaatagatatataaccattattttcatggcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 26426958  T
Q  217 acgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26426959 acgggctatgggccggccctgg 26426980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 34501071 - 34501292
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  34501071 tattaaaaatcacactttggtgaatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 34501170  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa--aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34501171 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 34501270  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34501271 gacgggctatgggccggccctg 34501292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 29601115 - 29601335
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  29601115 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatagccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgc 29601214  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataa--aaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29601215 ttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaatatattttgggccccaaaaaattggagacccggtgtcgtcgcccagcctcg 29601314  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29601315 acgggctatgggccggccctg 29601335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 10953567 - 10953786
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  10953567 aaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgctttta 10953666  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaa------taaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953667 atagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaaaaatttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 10953766  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  10953767 cgggctatggaccggccctg 10953786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 10961572 - 10961791
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  10961572 aaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttgctttta 10961671  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaa------taaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961672 atagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaaaaatttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 10961771  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  10961772 cgggctatggaccggccctg 10961791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 33817489 - 33817709
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  33817489 tattaaaaatcacactatggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttg 33817588  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaattt-gggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33817589 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 33817688  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33817689 acgggctatgggccggccctg 33817709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 14122236 - 14122453
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||| |    
T  14122236 attagaaatcacacct-ggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagcgacaatgccactgaagcaagctgcacaaattgaaatagttttc 14122334  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14122335 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttgcatataaaaaaaatattttgggtcccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcacccagcctcgac 14122434  T
Q  219 gggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14122435 gggctatgggccggccctg 14122453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37233709 - 37233484
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  37233709 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctttacaaatcaaattaatttg 37233610  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-aaaataaaaa-----atttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37233609 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaataaaaaaaaatatttgggccccaaaaaattggaggcccagtgtcgtcgcccag 37233510  T
Q  212 cctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  37233509 cctcgacgggctatggaccggccctg 37233484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 14123196 - 14123414
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     |  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  14123196 tattagaaatcacactt-ggtaggtcttgaacatatgacctcacactcaacaaaaagcagccttgccactaaagcaagctgcacatattgaaataatttg 14123294  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14123295 cttttaatagatatataacaattatttttgtgtcttgcatataaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcctggtgtcgtcgcccagcctcga 14123394  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14123395 cgggctatgggccggccctg 14123414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10582328 - 10582090
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |   ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  10582328 tattaaaaatcacacctttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtagctgcgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 10582229  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaa-------------taaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582228 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaataaaaataaaaataaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgt 10582129  T
Q  205 cgcccagcctcgacgggctatgggccggccctggttcta 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582128 cgcccagcctcgacgggctatgggccggccctggttcta 10582090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4078976 - 4078767
Alignment:
Q  37 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataac 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4078976 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 4078877  T
Q  137 cattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa-----------tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4078876 cattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaattattttaggccccaaaaaattgaaggcccggtatcgttgcccagcctcgacgggctat 4078777  T
Q  226 gggccggccc 235  Q
    ||||||||||    
T  4078776 gggccggccc 4078767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33317795 - 33317600
Alignment:
Q  42 tcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataaccatta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   || | | |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33317795 tcttgaacacatgacctcacactcaataaatattggccacgccactgaagcaagctgtacaaattagaataatttgcttttaatacatatataaccatta 33317696  T
Q  142 ttttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33317695 ttttcatgtcttacatttaaaaaaaatattttgggcctcaaaaaattggaggcgcggtgtcgtcgcccagcctcaacgggctataggccggccctg 33317600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 10334599 - 10334785
Alignment:
Q  41 gtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataaccatt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10334599 gtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccatgccactaaagcaaactgtacaatttgaattaatttgcttttaatagatatataaccatt 10334698  T
Q  141 attttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10334699 attttcatggcttacatataaaaaataaaat----------aaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgaagggctatgggccggccctg 10334785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29666187 - 29665968
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  29666187 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 29666088  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666087 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaatttgggccccaaaaagttggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 29665988  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29665987 cgggctatgggccggccctg 29665968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1783777 - 1783555
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1783777 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttg 1783678  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783677 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaatttgggccccaaaaagttggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 1783578  T
Q  217 acgggctatgggccggccctggt 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  1783577 acgggctatgggccagccctggt 1783555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46940237 - 46940016
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  46940237 tattaaaaatcacactttggtgaatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 46940138  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46940137 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 46940038  T
Q  217 acgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46940037 acgggctatgggccggccctgg 46940016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 6587573 - 6587793
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  6587573 tattaaaaatcacactttggtgagtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctatacaaattgaattaatttg 6587672  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6587673 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 6587772  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6587773 acgggctatgggccggccctg 6587793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 32801617 - 32801836
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32801617 tattagaaatcacattttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaaaaaatttg 32801716  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32801717 cttttaatagatatataaccattattttcatgtcttacatataaaaaaaatattttgggtcccaaaaaattggagacccagtgtcgtcgcccagcctcga 32801816  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  32801817 cgggttatgggccggccctg 32801836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 19893471 - 19893693
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19893471 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggtcacgccactaaagcaagttgtacaaattaaaaaaatttg 19893570  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa---aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19893571 cttttaatagatatataatcattattttcatgtcttacatataaaaaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgttgtcgcccatcct 19893670  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19893671 cgacgggctatgggccggccctg 19893693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 38098334 - 38098553
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  38098334 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatgtaggaacgccactgaagcaagatatacaaattaaaataatttg 38098433  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  38098434 cttttaatagatatataaccattcttttcgtgtcttacataaaaaataaaatattttgggccccaaaaaattggtggcccgatgtcgtctcccagcctcg 38098533  T
Q  217 acgggctatgggccggccct 236  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38098534 acgggctatgggccggccct 38098553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 16188966 - 16189189
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  16188966 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagttgccacgccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttg 16189065  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaa----taaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16189066 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaataaaatatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcc 16189165  T
Q  214 tcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16189166 tcgacgggctatgggccggccctg 16189189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 38150608 - 38150388
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  38150608 tattaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctg-acaaattaaattaattcg 38150510  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38150509 cttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatattaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 38150410  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38150409 gacgggctatgggccggccctg 38150388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 36332981 - 36333208
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  36332981 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttg 36333080  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-------aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36333081 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 36333180  T
Q  211 gcctcgacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36333181 gtctcgacgggctatgggccggccctgg 36333208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27895301 - 27895081
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || | |  ||||||||||||||| |||| ||||||  | || |    
T  27895301 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgaccttacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacatattaaattagttcg 27895202  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27895201 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaattgagccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 27895102  T
Q  218 cgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27895101 cgggctatgggccggccctgg 27895081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 3175977 - 3176193
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||    
T  3175977 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacac--gacctcacactcaacaaaaaatggtcacgccactaaagcaagctgtacagattgaataaattcgc 3176074  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgac 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3176075 ttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaatattttaggccccataaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgac 3176174  T
Q  219 gggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3176175 gggctatgggccggccctg 3176193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28147272 - 28147053
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||    
T  28147272 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaattaccatgccactaaagcaagctgtgtaaattaaatagatttgc 28147173  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacata-taaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28147172 ttttaatatatatataatcattactttcgtgtcttacatattaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgctcagcctcga 28147073  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  28147072 cgggctataggccggccctg 28147053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 47748905 - 47749119
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||| |||||||| ||||||| |   ||||||||||||    
T  47748905 aaatcacactttggtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatagccacgccactaaggcaagctgcacaaattgattaaatttgctttta 47749004  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47749005 atagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccgcaaaaaattggaggcccggtgtcatcgcccagcctcgacgggc 47749104  T
Q  223 tatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  47749105 tatgggccggccctg 47749119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 23979894 - 23980116
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaatta---aaacaatt 115  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| |||| | | ||   ||| ||||    
T  23979894 attaaaaatcacactttgttgagtcttgaacacatgatctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaaacaaggtgtatagactactaaaataatt 23979993  T
Q  116 tgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttggg-ccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23979994 tgcttttaataaatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaatatattttggaccccaaaaaattggaggcccggtatcgtcgcccagcct 23980093  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  23980094 cgacgggctatgggccggtcctg 23980116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44073974 - 44073821
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaata-tgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||| || |||    
T  44073974 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaagtgaccatgccactcaagcaaggtgtccaaattgaaataaattg 44073875  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaat 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44073874 cttttaatagatatataactattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaat 44073821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Original strand, 29172246 - 29172429
Alignment:
Q  55 acctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtctta 154  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29172246 acctcacactcaacaaaaaatggccacgccactaaagcaagttgtacaaattaaaataatttgcttttaatagatatataatcattattttcgtgtctta 29172345  T
Q  155 catat--aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||  |||||| | | ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29172346 catataaaaaatatatattttagattccaaaaaattggaggcccggtgtcatcgcccagcttcgac-ggctatgggccggccctg 29172429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 7118146 - 7118337
Alignment:
Q  48 acacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataaccattattttcg 147  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7118146 acacatgacctgacactcaataaaaagtgaccatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaataatttgcttttaatagatatataactattattttcg 7118245  T
Q  148 tgtcttacatataaaataa--aaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||| ||  | | ||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  7118246 tgtcttacatataaaaaaaatatattttgaatcccaaaaaattgaaggtccggtgtcgtcgcccaacctcgatgggctataggccggccctg 7118337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Original strand, 7835061 - 7835211
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | | | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  7835061 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcac--tcatcaaaaagcggccacgccactaaaacaagctgtacaaattaaattaatttg 7835158  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7835159 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaa 7835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 7835224 - 7835301
Alignment:
Q  160 aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7835224 aaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagccttgacgggctatgggccggccctg 7835301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 47262784 - 47262869
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47262784 cttacatataaaa-aaaatatatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccctg 47262869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 35407096 - 35407180
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35407096 cttacatataaaa--aaatatatgggccctcaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggtcggccctg 35407180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6381609 - 6381544
Alignment:
Q  171 tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccct 236  Q
    ||||||||||||| || |  ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6381609 tttgggccccaaagaaatcaaggtccggtggcatagcccagcctcgacgggctatgggccggccct 6381544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3466548 - 3466326
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3466548 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgc 3466449  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat----aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466448 ttttaatagatatataatcattattttcatgtcttacatattaaaaaaatatatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 3466349  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3466348 cgacgggctatgggccggccctg 3466326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 25764186 - 25764406
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  25764186 tattaaaaatcacactttggtgaatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 25764285  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25764286 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 25764385  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25764386 acgggctatgggccggccctg 25764406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 21145704 - 21145922
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |   |||||||||||||| |||| ||| ||  |||| |    
T  21145704 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacatcactaaagcaagctatacagattgaattaattcg 21145803  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21145804 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcaa 21145903  T
Q  218 cgggctatgggccggccct 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21145904 cgggctatgggccggccct 21145922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 19858098 - 19858319
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  19858098 tattaaaaatcacactatggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttg 19858197  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaattt-gggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19858198 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 19858297  T
Q  217 acgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19858298 acgggctatgggccggccctgg 19858319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 22527444 - 22527644
Alignment:
Q  38 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataacc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |    
T  22527444 tgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcatgtcactaaagcaagctgtacaaattaaataattttgcttttaaaagatatataatc 22527543  T
Q  138 attattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccct 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527544 attatttttgtgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccct 22527643  T
Q  237 g 237  Q
    |    
T  22527644 g 22527644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 794724 - 794511
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||||||    
T  794724 aaatcacacattggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccacgctactaaagcaagctttacaaatttaatatattttctttta 794625  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggct 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794624 atagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaattattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggct 794525  T
Q  224 atgggccggccctg 237  Q
    || ||||| |||||    
T  794524 ataggccgaccctg 794511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 3514305 - 3514514
Alignment:
Q  29 acactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaataga 128  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3514305 acactttaatgggtcttgaacacatgacctcatactcaacaaaaaatgaccacaccactaaagcaagctatacaaattaaattaatttgcttttaataga 3514404  T
Q  129 tatataaccattattttcgtgtcttacatat-aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgg 227  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3514405 tatataaccatcatttttgtggcttacatataaaaaaaaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccatcctcgatgggctatgg 3514504  T
Q  228 gccggccctg 237  Q
    ||||||||||    
T  3514505 gccggccctg 3514514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15927434 - 15927346
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctggtt 240  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15927434 cttacatataaaa-aaaatatatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccctggtt 15927346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9717364 - 9717279
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9717364 cttacatataaaa-aaaatatatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccctg 9717279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 41284458 - 41284542
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41284458 cttacatataaaa--aaaaatatgggcccccaaaaatttgaggcccgatgtcatcgcccagccccgacgggctatgggccggccctg 41284542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 43100381 - 43100605
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43100381 attagaaataacaatttggtgggtcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaaataatttgc 43100480  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaa-----taaa-aaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43100481 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaataaataaataaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagc 43100580  T
Q  213 ctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  43100581 ctcgacaggctatgggccggccctg 43100605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26619385 - 26619163
Alignment:
Q  17 gtattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |  |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||    
T  26619385 gtattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaatagaaaataaacatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaatatttt 26619286  T
Q  117 gcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26619285 gattttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaaatatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 26619186  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26619185 cgacgggctatgggccggccctg 26619163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 13229613 - 13229833
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  13229613 attaaaaaacacactttggagggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttgc 13229712  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat--aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13229713 ttttaatagatatataaccattattttcgtgacttacatataaaaaaaaaaaaatttggaccccaaaaaattggaggcccggtgccgtcgcctagcctcg 13229812  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13229813 acgggctatgggccggccctg 13229833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21629636 - 21629415
Alignment:
Q  17 gtattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||    
T  21629636 gtattagaaatcacactttggtggatcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtgaccatgccactaaagcaagttgtacaaattgaaataaatt 21629537  T
Q  117 gcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaa-aaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21629536 gcttttaatagatatataacaattattttcgtgtcttacatataaaaaaaatatattttgggcccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctc 21629437  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21629436 gacgggctatgggccggccctg 21629415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46580508 - 46580289
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  46580508 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgc 46580409  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttg-ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580408 ttttaatagatatataatcattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaatattttaggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 46580309  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46580308 cgggctatgggccggccctg 46580289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 53227963 - 53228178
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  53227963 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaattcgctttta 53228062  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa--aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacggg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  53228063 atagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccagcctcgacgga 53228162  T
Q  222 ctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  53228163 ctatgggccggccctg 53228178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50436040 - 50435831
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||     
T  50436040 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtgaccatgccactaaagcaagctgtacagattaaattaattta 50435941  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50435940 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaa----------aaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 50435851  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50435850 cgggctatgggccggccctg 50435831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 40218998 - 40219219
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  40218998 attaaaaattacactttggtgggtctagaacacatgaccacacattcaacaaaaattggccatgccactaaagcaagctgtacagattaaataaatttac 40219097  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa---tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40219098 ttttaatagatatataatcattattttcgtatcttacatattaaaaaaaaaatattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 40219197  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40219198 gacgggctatgggccggccctg 40219219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 1121314 - 1121523
Alignment:
Q  29 acactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaataga 128  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  1121314 acactttaatggatcttgaacacatgacctcatactcaacaaaa-atgaccacaccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttgcttttaataga 1121412  T
Q  129 tatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgg 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1121413 tatataaccatcattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccatcctcgacgggctatgg 1121512  T
Q  228 gccggccctgg 238  Q
    |||||||||||    
T  1121513 gccggccctgg 1121523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28714519 - 28714299
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || | | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |     
T  28714519 attaaaaatcacactttggtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaatagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaataaattcgt 28714420  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28714419 ttttaatagatatataatcattatttttgtatcttacatataaaaaaaaaatattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctcg 28714320  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28714319 acgggctatgggccggccctg 28714299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6891190 - 6890966
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||     
T  6891190 tattaaaaattacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaaatggccacgccactaaagcaaactgtacaaattaaattaatttt 6891091  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaata-----aaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagc 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6891090 cttttaattgatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaataaaaatttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaac 6890991  T
Q  213 ctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  6890990 ctcgacggactatgggccgaccctg 6890966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 1124140 - 1124359
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||     
T  1124140 tattaaaaatcacactttggtgagtcttgaacacatggcctcacactcaacaaaaaatggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttt 1124239  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaat-aaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||  |||||||    
T  1124240 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaataaaaaaatttggacccctaaaaattggaggctcggtatcatcgcttagcctcg 1124339  T
Q  217 acgggctatgggccggccct 236  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  1124340 acgggctatgagccggccct 1124359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 575866 - 576084
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  ||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |    
T  575866 tattaaaaatcacactttggtggatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacaaattgaattaattcg 575965  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  575966 cttttaatagttatataaccattattttcgtggcttacatataaaa--aaaaccttgggccc-aaaaaactggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 576062  T
Q  218 cgggctatgggccggccctggt 239  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  576063 cgggctatgggctggccctggt 576084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56038298 - 56038081
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||| |||| ||| ||  || || |    
T  56038298 attaaaaatcacactttggtgggtttagaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccacgtcactaaagcaagctatacagattgaataaacttac 56038199  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacata-taaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  56038198 ttttaatagatatataatcattattttcgtatcttacatattaaaaaaaaaaatttgaaccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgtccagcctcga 56038099  T
Q  218 cgggctatgggccggccc 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  56038098 cgggctatgggccggccc 56038081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 48832873 - 48833102
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | | ||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||| |    
T  48832873 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacatcacactcatcaaaaagtggccacgccactaaagcaaactgtacagattgaattaattcg 48832972  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaa-------ataaaaa---atttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832973 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatataaaaaaatatttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgc 48833072  T
Q  208 ccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48833073 ccagcctcgacggcctatgggccggccctg 48833102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32129310 - 32129153
Alignment:
Q  82 gccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataa--aaaatttgggccc 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||  | | ||| | |||    
T  32129310 gccactaaaataagctgtacaaattgaaaaaatttgcttttaatagatatataaccattatttacatgttttacatataaaaaaaatatattttagaccc 32129211  T
Q  180 caaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129210 caaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 32129153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 32129475 - 32129445
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32129475 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaa 32129445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Original strand, 53469692 - 53469742
Alignment:
Q  246 aaaattcactaactattgatgtaagaaatactaatatacaagacttttatt 296  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  53469692 aaaatccactaactattgattcaagaaatactaacacacaagacttttatt 53469742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10396047 - 10396003
Alignment:
Q  252 cactaactattgatgtaagaaatactaatatacaagacttttatt 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  10396047 cactaactattgatgcaagaaatactaacacacaaggcttttatt 10396003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27272655 - 27272611
Alignment:
Q  252 cactaactattgatgtaagaaatactaatatacaagacttttatt 296  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27272655 cactaactattggtgcaagaaatactaacacacaagacttttatt 27272611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14206798 - 14206576
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  14206798 tattaaaaatcacactttggtgaatcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 14206699  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa--aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14206698 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 14206599  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14206598 gacgggctatgggccggccctgg 14206576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 23219396 - 23219617
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  23219396 tattagaaattagactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 23219495  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataa--aaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23219496 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaaatatattttgtgccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 23219595  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  23219596 gaagggctatgggccggccctg 23219617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 4486600 - 4486821
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||| | ||||||||| ||  || |||    
T  4486600 tattagaaatcatactttgatgaatcttgaacacatgatctcacactcaacaaaaagtggccatgcctctaaagcaaacggtacaaattgaataaacttg 4486699  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4486700 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaaattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccaacctc 4486799  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4486800 gacgggctatgggccggccctg 4486821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31715562 - 31715339
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   | | | ||||||  |||||| |||||||| | |||    |||    
T  31715562 tattagaaattacactttggtaggccttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaggggccacgccactgtagcaagttgtacaaactgaaatggattg 31715463  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaattt-gggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31715462 cttttgatagatatataaacattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 31715363  T
Q  217 acgggctatgggccggccctggtt 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  31715362 acgggctatgggccgaccctggtt 31715339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 34527039 - 34527124
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34527039 cttacatataaaa-aaaatacatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcccagccccgacgggctatgggccggccctg 34527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9412169 - 9411949
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9412169 attagaaatcagactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaataaaaagtgatcttgccactaaagcaagctgtacaaattgaaataatttgc 9412070  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaata--aaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9412069 ttttaatagatatataaccattattttcgtatcttacatataaaaaaataatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 9411970  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9411969 acgggctatgggccggccctg 9411949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13832894 - 13832674
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  13832894 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgc 13832795  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832794 ttttaatagatatataatcattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 13832695  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13832694 acgggctatgggccggccctg 13832674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 37350491 - 37350709
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  37350491 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggtcacaccactaaagcaagctgtacaaattgaataaatttgc 37350590  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37350591 ttttaatagatatataatcattatttttgtgtcttacatataaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 37350690  T
Q  217 acgggctatgggccggccc 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37350691 acgggctatgggccggccc 37350709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31924700 - 31924481
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  31924700 tattaaaaatcacactttggtgagtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctgtacaaattgaattgatttg 31924601  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31924600 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaattttggatcccaaaaaattagaggtccggtgtcgtcgcccagcctcga 31924501  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31924500 cgggctatgggccggccctg 31924481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 42434518 - 42434738
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  |||||||||||| || |||||||| ||  ||||||    
T  42434518 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaatctatacaaattgaattaatttg 42434617  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaat-ttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42434618 tttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 42434717  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42434718 acgggctatgggccggccctg 42434738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 40976993 - 40977212
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  || | |  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||     
T  40976993 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacatatgacctcacactcctcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctatacaaattaaattaatttt 40977092  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40977093 cttttaatagatatataactattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaatttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcccaacctcga 40977192  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40977193 cgggctatgggccggccctg 40977212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 7351279 - 7351507
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaa-----cacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaa 113  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  7351279 attaaaaatcacactttggtaggtcttgaactgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacagattaaataaa 7351378  T
Q  114 tttgcttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-----aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     || ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7351379 tttgcttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatattaaaaaatatatatattttgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcc 7351478  T
Q  209 cagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351479 cagcctcgacgggctatgggccggccctg 7351507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40535716 - 40535510
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  40535716 tattaaaaatcacactatggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagttgtcacaccactaaagcaagctgtacaaatttaattaatttg 40535617  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaattt-gggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40535616 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaatatttcgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 40535517  T
Q  217 acgggct 223  Q
    |||||||    
T  40535516 acgggct 40535510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29824416 - 29824189
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  29824416 tattaaaaatcacacatttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattgaattaattcg 29824317  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-------aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29824316 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 29824217  T
Q  211 gcctcgacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29824216 gcctcgacgagctatgggccggccctgg 29824189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40535506 - 40535443
Alignment:
Q  174 gggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40535506 gggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 40535443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Original strand, 1804215 - 1804303
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctggtt 240  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  1804215 cttacatataaaa-aaaatatatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtcgtcgcctagtcccaacgggctatgggccggccctggtt 1804303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12870557 - 12870458
Alignment:
Q  129 tatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaa-aaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgg 227  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||| |||||||  || | | ||||||| ||||||||||||||    
T  12870557 tatataactattattttagtgtattacatataaaaaaaagtattttgggcccaaaaaaatttgaggcccaatggcatagcccagcttcgacgggctatgg 12870458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27286118 - 27286056
Alignment:
Q  175 ggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27286118 ggccctaaaaaatttgaggcccggtgtcatagcccagcctcgaaggactatgggtcggccctg 27286056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1791711 - 1791652
Alignment:
Q  177 ccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  1791711 ccccaaaaaattg-aggcccggtgtcatagcccagcttcgacggactatgggccgtccctg 1791652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 288
Target Start/End: Original strand, 20260980 - 20261026
Alignment:
Q  242 tagcaaaattcactaactattgatgtaagaaatactaatatacaaga 288  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20260980 tagcaaaattcattagctattgatgcaagaaatactaatacacaaga 20261026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45906274 - 45906054
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  45906274 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaatgatcacaccactaaagcaagctgtacagattgaataaatttgc 45906175  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45906174 ttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaataaatattttggaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 45906075  T
Q  218 cgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45906074 cgggctatgggccggccctgg 45906054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39625572 - 39625353
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  39625572 attaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggtcatgccactaaagcaagctatacaaattgaataaatttgc 39625473  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa-aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39625472 ttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattgaaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 39625373  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39625372 cgggctatgggccggccctg 39625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 10695789 - 10696010
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  10695789 tattaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaagcaagctg-acaaattaaattaattcg 10695887  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695888 cttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatattaaaaaaaaatattttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 10695987  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10695988 gacgggctatgggccggccctgg 10696010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43171795 - 43171575
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43171795 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttg 43171696  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataa-aaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43171695 tttttaatagatatataactattattttcgtggcttacatataaaaaaataaaaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 43171596  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43171595 acgggctatgggccggccctg 43171575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 52722437 - 52722656
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  52722437 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacttcacactcaacaaaaagtggtcatgccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttg 52722536  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacata-taaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52722537 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatattaaaaaaaaaaatttggg-cccaaaaaattggagacccggtgtcgtcgcccagcctcg 52722635  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  52722636 accggctatgggccggccctg 52722656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53175969 - 53175752
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  53175969 tattaaaaatcacacatttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacaccactaaagtaagctgtacaaattgaactaatttg 53175870  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53175869 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaa--aaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 53175772  T
Q  218 cgggctatgggccggccctg 237  Q
    || |||||||||||||||||    
T  53175771 cgagctatgggccggccctg 53175752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52553543 - 52553326
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   || | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  52553543 tattaaaaatcatacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggtcattc-actaaagcaagctgtacaaattgaattaatttg 52553445  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  52553444 cttttaatagatatataaccattattttcgtgacttacatataaaaaaaaaaatttgggccccaaaaaattggagacccgatgtcgtcgcccagcctcga 52553345  T
Q  218 cgggctatgggccggccct 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52553344 cgggctatgggccggccct 52553326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 14242745 - 14242971
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  | |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  14242745 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacacgactaaagcaagctgtacagattgaattaatttg 14242844  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa------aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14242845 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaataaaataaattgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccag 14242944  T
Q  212 cctcgacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14242945 cctcgacgggctatgggccggccctgg 14242971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 4970946 - 4971174
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  4970946 tattaaaaatcaaacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtaaccatgccactaaagcaagctatacaaattgaattaatttg 4971045  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-------aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4971046 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaatttgaccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccca 4971145  T
Q  211 gcctcgacgggctatgggccggccctggt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4971146 gcctcgacgggctatgggccggccctggt 4971174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 38572754 - 38572987
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  38572754 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtgactacgccactaaagcaagctgtacagattgaattaatttg 38572853  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-------------aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38572854 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaataaaaataaaaataaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcctggtgtcgt 38572953  T
Q  205 cgcccagcctcgacgggctatgggccggccctgg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38572954 cgcccagcctcgacgggctatgggccggccctgg 38572987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 8034362 - 8034585
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |    
T  8034362 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttaaacacatgacctcacactcatcaaaaagcggccacgccactaaagcaagctgtacagattgaattaattcg 8034461  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaata----aaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8034462 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaataaaaaaaaattgggccccaaaaaattagaggcccggtgtcgtcgcccagcc 8034561  T
Q  214 tcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8034562 tcgacgggctatgggccggccctg 8034585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 50517057 - 50517265
Alignment:
Q  31 actttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagata 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||| |||| ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  50517057 actttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaaacagccatgccactaaagcaagttgtataaattgaataactttgcttttaatagata 50517156  T
Q  131 tataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaa--tttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggg 228  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50517157 tataatcattattttcgtatcttacatataaaaaaaaaatattttggaccccaaaaaattggaagcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatggg 50517256  T
Q  229 ccggccctg 237  Q
    |||||||||    
T  50517257 ccggccctg 50517265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 38834442 - 38834656
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  38834442 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccatgccactaaagcaagctgtccaaattgaaaaaatttg 38834541  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataa--aaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctc 215  Q
    ||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38834542 cttt-------tatataaccattattttcatgtcttacatataaaaaaaatatattttgggccccaaaatattgaaagcccggtgtcgtcgcccagcctc 38834634  T
Q  216 gacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38834635 gacgggctatgggccggccctg 38834656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10476047 - 10475820
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||    
T  10476047 tattaaaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaataaaaagtggccatgccactaaagcaagctatacaaattgaattgatttg 10475948  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaa--------ataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgccc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10475947 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaatatatatatattttgggccccaaaaaattggaggcccgatgtcgtcgccc 10475848  T
Q  210 agcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10475847 agcctcgaccggctatgggtcggccctg 10475820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40690723 - 40690495
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | ||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  40690723 tattaaaaatcacacttttgtaggtcttgaacacatgacctcacactcatcaaaaagtggccacgccacaaaagtaagctgtacaaattgaattaatttg 40690624  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat---------aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40690623 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgcc 40690524  T
Q  209 cagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40690523 cagcctcgacgggctatgggccggccctg 40690495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 24656911 - 24657131
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | |   |||| ||| |||||||| || | |||| | | ||    
T  24656911 tattagaaatcacactttggtgggtcatgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaacactgaagtaagctgtaaaattcaaaatagtatg 24657010  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||     
T  24657011 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaaaattgggccccaaaaaattggaggcacggtgtcgtcgcccaacttca 24657110  T
Q  217 acgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  24657111 acgggctatgggctggccctg 24657131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24596454 - 24596240
Alignment:
Q  37 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgcttttaatagatatataac 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24596454 gtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacaccactaaagcaagctgtacaaattaaattaatttgcttttaatagatatataac 24596355  T
Q  137 cattattttcgtgtcttacatataaa-ataaaaa-------------atttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24596354 cattattttcgtgtcttacatataaatatatatatatatatatttttttttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggc 24596255  T
Q  223 tatgggccggccctg 237  Q
    |||||||||||||||    
T  24596254 tatgggccggccctg 24596240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 248
Target Start/End: Original strand, 54244964 - 54245189
Alignment:
Q  24 aaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgctttta 123  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||    
T  54244964 aaatcacactttggtgggtc----acacatgacctcacactcaacaaaaaatgaccacgccactaaagcaagctatacagattgaataaattcgctttta 54245059  T
Q  124 atagatatataaccattattttcgtgtcttacatat-----aaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgac 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  54245060 atagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaataaaaaaattgggccccaaaacattggagacccggtgtcgtcgcctaacctcgat 54245159  T
Q  219 gggctatgggccggccctggttctagcaaa 248  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  54245160 gggctttgggacggccctgatcctagcaaa 54245189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26407082 - 26406932
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  || | | ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||    
T  26407082 tattaaaaatcacacttttgtgggtcttgaacacatgaccttacattcatcaaaaagtggctacgccactaaagcaagctgtacaaattgaactaagttg 26406983  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26406982 cttttaatagatatataaccattattttcgtggcttacatataaaaaaaaa 26406932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Original strand, 37133806 - 37133870
Alignment:
Q  242 tagcaaaattcactaactattgatgtaagaaatactaatatacaagacttttattcatacggcta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37133806 tagcaaaattcactaactattgatgtaagaaatactaatacacaagacttttattcatacggcta 37133870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 17332060 - 17332145
Alignment:
Q  151 cttacatataaaataaaaaatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17332060 cttacatataaaa-aaaatatatgggcccccaaaaatttgaggcccagtgtggtcgcccagccccgacgggctatgggccggccctg 17332145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25889718 - 25889664
Alignment:
Q  242 tagcaaaattcactaactattgatgtaagaaatactaatatacaagacttttatt 296  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25889718 tagcaaaacccactaactattggtgcaagaaatactaacatacaagacttttatt 25889664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 24656833 - 24656869
Alignment:
Q  105 ttaaaacaatttgcttttaatagatatataaccatta 141  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24656833 ttaaaatagtttgcttttaatagatatataaccatta 24656869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30591 - 30368
Alignment:
Q  19 attagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttgc 118  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  30591 attaaaaatcacactttgatgggtcttgaacacatgacctcacacttcacaaaaaatggccatgccactaaagcaagctgtacaaattaaataaatttgt 30492  T
Q  119 ttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaa--aatttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcctcg 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30491 ttttaatagatatataatcattattttcatgtcttacatataaaaagaaattattttggaccccaaaaaattggaggtccggtgtcgtcgtccagcctcg 30392  T
Q  217 acgggctatgggccggccctggtt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30391 acgggctatgggccggccctggtt 30368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 2900 - 3121
Alignment:
Q  18 tattagaaatcacactttggtgggtcttgaacacatgacctcacactcaacaaaatatgacaatgccactaaagcaagctgtacaaattaaaacaatttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||| ||| ||| | | ||  ||  ||||||    
T  2900 tattaaaaatcacactttggtgggt-ttgaacacatgacctcacactcaacaaaaagtggccacgccactaaaacaaactgcatagatagaattaatttg 2998  T
Q  118 cttttaatagatatataaccattattttcgtgtcttacatataaaataaaaaat---ttgggccccaaaaaattggaggcccggtgtcgtcgcccagcct 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2999 cttttaatagatatataatcattattttcgtgtcttacatataaaaaaaaaaatattttgggccccaaaaatttagaggcccggtgtcgtcgcccagcct 3098  T
Q  215 cgacgggctatgggccggccctg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  3099 cgacgggctatggaccggccctg 3121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University