View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5676-Insertion-2 (Length: 1059)

Name: NF5676-Insertion-2
Description: NF5676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5676-Insertion-2
NF5676-Insertion-2
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (317-895)||(3813835-3814412)
chr4 (317-895)||(45356992-45357569)
chr4 (317-895)||(45347511-45348090)
chr4 (300-898)||(5732458-5733055)
chr4 (323-895)||(18855544-18856115)
chr4 (322-894)||(9228881-9229461)
chr4 (322-894)||(9224094-9224674)
chr4 (328-747)||(51520280-51520701)
chr4 (327-635)||(56146664-56146974)
chr4 (351-683)||(24741788-24742121)
chr4 (351-681)||(29760490-29760821)
chr4 (117-258)||(2904475-2904626)
chr4 (470-587)||(28468542-28468660)
chr4 (471-600)||(31985634-31985764)
chr4 (677-894)||(18712450-18712677)
chr4 (899-980)||(35149894-35149976)
chr4 (899-980)||(15471352-15471434)
chr4 (802-882)||(56141719-56141797)
chr4 (899-980)||(390375-390457)
chr4 (899-980)||(3260741-3260823)
chr4 (505-629)||(10047379-10047505)
chr4 (526-600)||(36315229-36315304)
chr4 (526-600)||(36329438-36329513)
chr4 (505-629)||(5396643-5396768)
chr4 (899-980)||(29383511-29383592)
chr4 (505-600)||(39245994-39246092)
chr4 (899-980)||(1583159-1583241)
chr4 (535-600)||(16623292-16623359)
chr4 (505-616)||(3796502-3796616)
chr4 (899-980)||(29449483-29449566)
chr4 (526-589)||(5143281-5143345)
chr4 (505-590)||(38152449-38152536)
chr4 (207-269)||(1995472-1995534)
chr4 (506-629)||(5147678-5147803)
chr4 (526-587)||(5269204-5269266)
chr4 (537-629)||(16630651-16630744)
chr4 (811-868)||(24742302-24742357)
chr4 (899-971)||(17667328-17667402)
chr4 (526-590)||(24333831-24333896)
chr4 (683-727)||(24742174-24742218)
chr4 (899-971)||(26394939-26395012)
chr4 (899-979)||(29456168-29456250)
chr4 (898-980)||(52499800-52499882)
chr4 (535-629)||(3777580-3777674)
chr4 (899-980)||(23436732-23436815)
chr4 (207-269)||(1994832-1994894)
chr4 (805-882)||(51520769-51520843)
chr4 (526-590)||(6743425-6743490)
chr4 (901-980)||(37624092-37624172)
chr4 (899-972)||(19129086-19129160)
chr4 (811-866)||(29761002-29761055)
chr4 (899-950)||(21396070-21396121)
chr4 (202-269)||(52305838-52305905)
chr4 (899-972)||(21880863-21880938)
chr4 (683-727)||(29760874-29760919)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (317-898)||(32246596-32247182)
chr2 (321-898)||(19344236-19344818)
chr2 (321-897)||(19349094-19349675)
chr2 (300-747)||(39811830-39812278)
chr2 (326-638)||(44312574-44312887)
chr2 (351-683)||(11098843-11099176)
chr2 (353-683)||(14291337-14291669)
chr2 (351-683)||(9296317-9296651)
chr2 (470-683)||(3491716-3491930)
chr2 (467-683)||(25398457-25398675)
chr2 (467-683)||(25403595-25403813)
chr2 (801-894)||(39811672-39811763)
chr2 (897-980)||(20964132-20964216)
chr2 (471-587)||(40738810-40738926)
chr2 (897-980)||(30197318-30197402)
chr2 (40-156)||(11083273-11083404)
chr2 (505-629)||(8040060-8040188)
chr2 (535-683)||(25407653-25407802)
chr2 (898-980)||(1060960-1061043)
chr2 (899-980)||(1066344-1066426)
chr2 (505-629)||(28259149-28259274)
chr2 (526-629)||(13569350-13569454)
chr2 (899-980)||(11361044-11361126)
chr2 (898-980)||(21121331-21121413)
chr2 (505-600)||(21629944-21630041)
chr2 (899-980)||(4076722-4076805)
chr2 (526-629)||(10445415-10445519)
chr2 (899-971)||(28926762-28926836)
chr2 (899-971)||(42552465-42552539)
chr2 (526-600)||(34388880-34388956)
chr2 (899-980)||(33354-33436)
chr2 (535-616)||(8390133-8390216)
chr2 (505-629)||(17865203-17865329)
chr2 (505-629)||(34682305-34682431)
chr2 (898-971)||(4072340-4072415)
chr2 (506-629)||(10707223-10707348)
chr2 (505-600)||(20522220-20522318)
chr2 (901-980)||(27728814-27728893)
chr2 (899-971)||(36985340-36985414)
chr2 (505-629)||(14698979-14699104)
chr2 (898-980)||(35584617-35584699)
chr2 (505-629)||(23078442-23078567)
chr2 (683-727)||(11098746-11098790)
chr2 (535-590)||(31056075-31056131)
chr2 (899-971)||(21604071-21604145)
chr2 (526-600)||(42039669-42039744)
chr2 (811-868)||(14291850-14291905)
chr2 (526-635)||(36757728-36757837)
chr2 (683-724)||(14291722-14291763)
chr2 (526-629)||(33118158-33118262)
chr2 (526-629)||(39482953-39483057)
chr2 (899-980)||(36593656-36593738)
chr2 (804-866)||(9296084-9296144)
chr2 (683-713)||(9296235-9296265)
chr2 (811-868)||(11098607-11098662)
chr2 (537-590)||(16940219-16940273)
chr2 (537-590)||(17010884-17010938)
chr2 (899-979)||(23832637-23832717)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (322-898)||(28155262-28155838)
chr6 (323-895)||(6438319-6438889)
chr6 (300-894)||(14737261-14737866)
chr6 (323-898)||(16838561-16839139)
chr6 (323-898)||(6005234-6005815)
chr6 (326-894)||(22010384-22010960)
chr6 (300-894)||(14742121-14742725)
chr6 (323-898)||(33330124-33330715)
chr6 (300-734)||(28184297-28184738)
chr6 (322-894)||(11856789-11857372)
chr6 (323-898)||(33335621-33336212)
chr6 (654-898)||(5343628-5343873)
chr6 (467-683)||(5674685-5674905)
chr6 (323-550)||(5343297-5343527)
chr6 (899-980)||(1069914-1069997)
chr6 (505-616)||(5757462-5757575)
chr6 (351-455)||(30125940-30126044)
chr6 (898-980)||(21966389-21966471)
chr6 (899-980)||(30800197-30800278)
chr6 (897-980)||(16224433-16224517)
chr6 (899-980)||(33874089-33874171)
chr6 (899-980)||(21965726-21965807)
chr6 (897-980)||(7238104-7238189)
chr6 (471-587)||(22708984-22709102)
chr6 (526-629)||(5572212-5572316)
chr6 (898-971)||(17308977-17309052)
chr6 (505-600)||(21356036-21356133)
chr6 (526-589)||(10077176-10077240)
chr6 (899-971)||(15298921-15298995)
chr6 (899-980)||(25316411-25316493)
chr6 (899-980)||(26203905-26203987)
chr6 (505-600)||(31086472-31086570)
chr6 (899-971)||(11582906-11582980)
chr6 (683-727)||(5674589-5674633)
chr6 (526-600)||(18232867-18232943)
chr6 (526-600)||(21801343-21801419)
chr6 (505-589)||(4629954-4630040)
chr6 (897-971)||(15332893-15332968)
chr6 (544-600)||(22963739-22963797)
chr6 (544-600)||(23824596-23824654)
chr6 (207-269)||(27902663-27902725)
chr6 (505-600)||(31979513-31979611)
chr6 (899-980)||(4106001-4106083)
chr6 (899-977)||(34134705-34134783)
chr6 (899-953)||(25463134-25463187)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (300-898)||(39784516-39785114)
chr8 (323-898)||(35745208-35745787)
chr8 (300-782)||(25328085-25328568)
chr8 (328-882)||(7289635-7290188)
chr8 (328-683)||(6311121-6311477)
chr8 (323-782)||(10684068-10684533)
chr8 (351-683)||(36979225-36979558)
chr8 (351-683)||(30655488-30655827)
chr8 (351-683)||(4759991-4760325)
chr8 (351-682)||(33037724-33038056)
chr8 (351-683)||(18853083-18853418)
chr8 (351-683)||(18870477-18870809)
chr8 (351-683)||(10689058-10689392)
chr8 (671-894)||(25327859-25328070)
chr8 (467-683)||(1261871-1262089)
chr8 (470-587)||(26287866-26287985)
chr8 (470-587)||(26301123-26301242)
chr8 (470-587)||(26313117-26313236)
chr8 (470-683)||(31071146-31071362)
chr8 (899-980)||(14765060-14765143)
chr8 (683-889)||(18852828-18853030)
chr8 (526-629)||(4456050-4456153)
chr8 (683-868)||(30655880-30656062)
chr8 (683-882)||(6311532-6311728)
chr8 (790-898)||(10683930-10684036)
chr8 (897-980)||(33799149-33799233)
chr8 (899-980)||(16888044-16888126)
chr8 (505-590)||(26403240-26403327)
chr8 (471-629)||(7412305-7412466)
chr8 (683-889)||(18870222-18870424)
chr8 (801-868)||(4759754-4759819)
chr8 (898-980)||(4979631-4979714)
chr8 (899-980)||(14737568-14737650)
chr8 (526-600)||(19175754-19175829)
chr8 (505-629)||(23799548-23799674)
chr8 (899-980)||(27910332-27910414)
chr8 (899-980)||(27956751-27956833)
chr8 (899-971)||(13362709-13362782)
chr8 (899-980)||(41242904-41242985)
chr8 (683-882)||(10688806-10689003)
chr8 (505-587)||(4696609-4696693)
chr8 (526-600)||(6127243-6127319)
chr8 (898-980)||(26486765-26486848)
chr8 (899-950)||(14562913-14562963)
chr8 (899-980)||(23225491-23225573)
chr8 (899-980)||(35540351-35540432)
chr8 (899-980)||(37235046-37235128)
chr8 (898-971)||(28979998-28980073)
chr8 (899-971)||(28985219-28985293)
chr8 (899-971)||(37879144-37879218)
chr8 (683-727)||(33037627-33037671)
chr8 (899-971)||(36801192-36801265)
chr8 (899-980)||(10949478-10949560)
chr8 (899-980)||(10957483-10957565)
chr8 (898-971)||(213298-213373)
chr8 (898-971)||(238881-238956)
chr8 (898-971)||(726921-726996)
chr8 (898-971)||(752619-752694)
chr8 (898-971)||(792236-792311)
chr8 (898-971)||(799422-799497)
chr8 (898-971)||(850815-850890)
chr8 (505-600)||(5702482-5702580)
chr8 (526-568)||(9765852-9765894)
chr8 (199-269)||(29702560-29702629)
chr8 (801-866)||(33037490-33037553)
chr8 (208-269)||(1283360-1283420)
chr8 (899-980)||(23746693-23746776)
chr8 (683-727)||(1261776-1261820)
chr8 (683-727)||(36979611-36979654)
chr8 (526-600)||(19752394-19752469)
chr8 (898-953)||(35033147-35033201)
chr8 (899-979)||(4521519-4521600)
chr8 (544-615)||(6813723-6813796)
chr8 (208-269)||(8744210-8744271)
chr8 (535-568)||(18810982-18811015)
chr8 (899-952)||(21986312-21986364)
chr8 (899-952)||(22003520-22003572)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (321-898)||(28807267-28807844)
chr5 (322-898)||(37561138-37561715)
chr5 (326-897)||(37556317-37556889)
chr5 (300-894)||(15044484-15045085)
chr5 (323-898)||(2785192-2785771)
chr5 (328-781)||(1456969-1457423)
chr5 (323-898)||(33791133-33791712)
chr5 (323-898)||(31396681-31397261)
chr5 (328-781)||(43592102-43592557)
chr5 (323-898)||(31401538-31402118)
chr5 (328-781)||(43598547-43599002)
chr5 (328-781)||(43604039-43604494)
chr5 (328-781)||(43609531-43609986)
chr5 (323-898)||(33767996-33768580)
chr5 (328-781)||(27444793-27445248)
chr5 (328-882)||(27449637-27450202)
chr5 (328-682)||(30631231-30631586)
chr5 (429-683)||(31180138-31180394)
chr5 (467-683)||(38192135-38192353)
chr5 (467-683)||(38219360-38219578)
chr5 (394-683)||(24135740-24136028)
chr5 (467-683)||(35387624-35387842)
chr5 (899-980)||(37540791-37540873)
chr5 (899-980)||(37548335-37548417)
chr5 (899-980)||(25852230-25852312)
chr5 (505-629)||(10281751-10281877)
chr5 (505-629)||(9353304-9353429)
chr5 (505-600)||(36932350-36932447)
chr5 (899-980)||(25845595-25845677)
chr5 (899-980)||(15460722-15460804)
chr5 (899-980)||(18895771-18895853)
chr5 (899-980)||(30780319-30780403)
chr5 (899-980)||(40011748-40011830)
chr5 (896-980)||(20339843-20339928)
chr5 (899-980)||(5583053-5583136)
chr5 (536-600)||(15464564-15464629)
chr5 (683-882)||(31180447-31180642)
chr5 (899-980)||(20346440-20346522)
chr5 (899-980)||(43028292-43028373)
chr5 (506-629)||(11916943-11917068)
chr5 (899-971)||(11994395-11994468)
chr5 (505-629)||(14520230-14520355)
chr5 (526-629)||(3880321-3880425)
chr5 (683-747)||(30631640-30631704)
chr5 (805-882)||(1456845-1456920)
chr5 (535-600)||(12084175-12084241)
chr5 (805-882)||(27445285-27445359)
chr5 (805-882)||(43592591-43592665)
chr5 (805-882)||(43599036-43599110)
chr5 (805-882)||(43604528-43604602)
chr5 (805-882)||(43610020-43610094)
chr5 (899-971)||(14883128-14883202)
chr5 (899-971)||(14889805-14889879)
chr5 (899-971)||(24795828-24795902)
chr5 (899-971)||(24801195-24801269)
chr5 (505-590)||(17003970-17004057)
chr5 (899-980)||(17939696-17939778)
chr5 (526-600)||(28832281-28832356)
chr5 (536-600)||(19588778-19588844)
chr5 (683-724)||(24136080-24136121)
chr5 (505-600)||(42127410-42127507)
chr5 (830-889)||(10593044-10593102)
chr5 (899-980)||(19801100-19801182)
chr5 (526-568)||(4410241-4410283)
chr5 (898-971)||(7508828-7508902)
chr5 (899-953)||(14615747-14615800)
chr5 (899-953)||(22249030-22249083)
chr5 (898-951)||(5453745-5453797)
chr5 (208-269)||(36423200-36423261)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (323-899)||(25444782-25445357)
chr1 (300-898)||(44023568-44024163)
chr1 (323-898)||(39445317-39445891)
chr1 (323-895)||(1054708-1055279)
chr1 (300-747)||(41398032-41398479)
chr1 (323-898)||(43988140-43988734)
chr1 (409-734)||(41390489-41390811)
chr1 (609-898)||(25439590-25439875)
chr1 (351-683)||(24787280-24787617)
chr1 (394-683)||(24202686-24202973)
chr1 (300-403)||(41386543-41386646)
chr1 (470-683)||(19358760-19358975)
chr1 (470-683)||(19361349-19361564)
chr1 (470-683)||(19379989-19380204)
chr1 (801-890)||(41390900-41390987)
chr1 (801-890)||(41398555-41398642)
chr1 (505-629)||(26644869-26644994)
chr1 (899-980)||(39093570-39093652)
chr1 (505-629)||(47703907-47704033)
chr1 (199-269)||(45529245-45529314)
chr1 (684-868)||(24787045-24787226)
chr1 (526-629)||(3281730-3281833)
chr1 (898-980)||(6739818-6739901)
chr1 (899-980)||(3653431-3653513)
chr1 (899-980)||(18417427-18417509)
chr1 (899-980)||(20277997-20278079)
chr1 (535-629)||(21536541-21536635)
chr1 (535-600)||(27104371-27104438)
chr1 (505-600)||(19072928-19073026)
chr1 (505-600)||(19120818-19120916)
chr1 (199-269)||(45528417-45528486)
chr1 (897-980)||(18027478-18027562)
chr1 (899-971)||(48427162-48427236)
chr1 (526-600)||(16124515-16124591)
chr1 (899-980)||(28557231-28557313)
chr1 (505-629)||(9476261-9476387)
chr1 (899-980)||(41050991-41051072)
chr1 (899-980)||(24423302-24423383)
chr1 (899-971)||(26739861-26739935)
chr1 (899-980)||(29152104-29152187)
chr1 (526-590)||(29651833-29651898)
chr1 (898-950)||(24065572-24065623)
chr1 (899-979)||(38908845-38908927)
chr1 (899-979)||(38911693-38911775)
chr1 (505-590)||(13598398-13598485)
chr1 (535-600)||(13604623-13604689)
chr1 (899-980)||(33684950-33685031)
chr1 (505-597)||(37069770-37069864)
chr1 (526-590)||(775694-775759)
chr1 (899-971)||(11385244-11385318)
chr1 (899-971)||(39190449-39190523)
chr1 (208-269)||(48578437-48578498)
chr1 (899-971)||(52399550-52399624)
chr1 (683-727)||(24202591-24202635)
chr1 (216-267)||(5226690-5226741)
chr1 (899-980)||(17145576-17145658)
chr1 (505-600)||(47098824-47098921)
chr1 (899-971)||(17378720-17378793)
chr1 (899-972)||(36917085-36917159)
chr1 (526-600)||(32889461-32889536)
chr1 (208-266)||(6307387-6307445)
chr1 (207-269)||(45517947-45518009)
chr1 (812-868)||(24793867-24793921)
chr1 (208-269)||(48579202-48579263)
chr1 (208-269)||(50799434-50799495)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (323-894)||(180-750)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (300-898)||(18656228-18656837)
chr3 (321-898)||(2676766-2677358)
chr3 (321-898)||(2672610-2673202)
chr3 (300-747)||(22173036-22173484)
chr3 (355-898)||(24967957-24968513)
chr3 (323-782)||(8512032-8512498)
chr3 (323-782)||(8516912-8517378)
chr3 (351-683)||(7167092-7167425)
chr3 (323-898)||(32475301-32475880)
chr3 (347-683)||(28503780-28504108)
chr3 (323-898)||(32480158-32480738)
chr3 (351-683)||(2671502-2671836)
chr3 (351-680)||(8738982-8739314)
chr3 (351-680)||(9091220-9091552)
chr3 (467-683)||(40372712-40372929)
chr3 (467-683)||(8477324-8477545)
chr3 (323-553)||(10207750-10207983)
chr3 (548-683)||(28501613-28501750)
chr3 (471-683)||(26928507-26928721)
chr3 (470-600)||(1305914-1306045)
chr3 (471-683)||(32143287-32143501)
chr3 (897-980)||(53572073-53572157)
chr3 (899-980)||(51848448-51848530)
chr3 (899-978)||(29492777-29492857)
chr3 (898-980)||(21351501-21351584)
chr3 (471-600)||(27452924-27453055)
chr3 (526-616)||(16264372-16264463)
chr3 (471-587)||(27986449-27986567)
chr3 (505-629)||(8370448-8370573)
chr3 (899-980)||(54833970-54834051)
chr3 (898-978)||(3107722-3107802)
chr3 (790-898)||(8512530-8512636)
chr3 (790-898)||(8517410-8517516)
chr3 (505-600)||(27974942-27975039)
chr3 (505-629)||(18552844-18552970)
chr3 (800-878)||(22172893-22172968)
chr3 (683-882)||(28503526-28503727)
chr3 (506-629)||(36029094-36029219)
chr3 (505-600)||(21711223-21711320)
chr3 (683-881)||(28501360-28501560)
chr3 (898-951)||(28752023-28752075)
chr3 (899-971)||(28758191-28758265)
chr3 (526-600)||(1736294-1736370)
chr3 (505-630)||(40592742-40592869)
chr3 (526-600)||(48438236-48438312)
chr3 (526-600)||(6794703-6794778)
chr3 (899-980)||(21152243-21152324)
chr3 (899-980)||(23866568-23866649)
chr3 (505-600)||(30709779-30709877)
chr3 (526-587)||(33386669-33386731)
chr3 (505-629)||(3715963-3716089)
chr3 (683-868)||(8738743-8738926)
chr3 (899-980)||(45610949-45611031)
chr3 (811-868)||(40372476-40372531)
chr3 (899-971)||(3783572-3783646)
chr3 (899-971)||(17596032-17596106)
chr3 (537-600)||(26299021-26299086)
chr3 (208-269)||(37538969-37539029)
chr3 (811-866)||(2671268-2671321)
chr3 (683-727)||(2671405-2671449)
chr3 (683-727)||(8477598-8477642)
chr3 (801-868)||(9090981-9091046)
chr3 (899-980)||(10767039-10767122)
chr3 (526-600)||(25795803-25795879)
chr3 (683-727)||(40372615-40372659)
chr3 (505-600)||(47923895-47923993)
chr3 (899-980)||(50656813-50656894)
chr3 (898-971)||(3554490-3554564)
chr3 (526-629)||(40844674-40844777)
chr3 (470-529)||(1309819-1309878)
chr3 (505-587)||(1417493-1417577)
chr3 (535-571)||(4386947-4386983)
chr3 (683-734)||(7167478-7167530)
chr3 (683-727)||(9091120-9091164)
chr3 (526-600)||(37466313-37466388)
chr3 (526-587)||(39039995-39040057)
chr3 (899-953)||(51854585-51854638)
chr3 (505-600)||(3328346-3328443)
chr3 (811-882)||(7167607-7167674)
chr3 (899-932)||(11965644-11965677)
chr3 (811-882)||(27352289-27352356)
chr3 (898-951)||(48775430-48775482)
chr3 (535-572)||(53894082-53894119)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (300-894)||(31109266-31109872)
chr7 (300-898)||(24024010-24024618)
chr7 (321-896)||(21811932-21812508)
chr7 (323-787)||(19992130-19992597)
chr7 (322-894)||(12396729-12397310)
chr7 (322-747)||(12406149-12406575)
chr7 (323-897)||(24261013-24261592)
chr7 (323-782)||(24266006-24266471)
chr7 (323-898)||(16879889-16880469)
chr7 (323-898)||(16884745-16885324)
chr7 (322-594)||(4866547-4866820)
chr7 (351-683)||(20357463-20357797)
chr7 (351-683)||(2057806-2058147)
chr7 (467-683)||(1533359-1533579)
chr7 (467-683)||(21639770-21639988)
chr7 (467-683)||(21645968-21646186)
chr7 (467-683)||(18408726-18408943)
chr7 (470-683)||(18413606-18413819)
chr7 (685-894)||(4873310-4873526)
chr7 (505-629)||(29159803-29159929)
chr7 (790-898)||(24265868-24265974)
chr7 (506-629)||(21983285-21983411)
chr7 (892-971)||(40685553-40685634)
chr7 (899-980)||(46649090-46649172)
chr7 (899-980)||(17727110-17727191)
chr7 (199-269)||(23956539-23956608)
chr7 (900-980)||(32626699-32626780)
chr7 (899-971)||(749152-749226)
chr7 (899-980)||(11878369-11878452)
chr7 (899-979)||(18437950-18438030)
chr7 (899-971)||(48988719-48988793)
chr7 (826-894)||(12406594-12406662)
chr7 (899-980)||(13964772-13964854)
chr7 (899-980)||(15630779-15630861)
chr7 (899-980)||(37284512-37284594)
chr7 (505-629)||(46516281-46516407)
chr7 (899-979)||(8214089-8214170)
chr7 (899-980)||(30603603-30603686)
chr7 (505-600)||(33332449-33332547)
chr7 (899-979)||(42057820-42057901)
chr7 (535-600)||(44848684-44848750)
chr7 (505-600)||(49091661-49091759)
chr7 (899-980)||(2027011-2027094)
chr7 (526-629)||(2647667-2647771)
chr7 (899-971)||(11300437-11300511)
chr7 (899-971)||(39050167-39050241)
chr7 (899-980)||(641855-641937)
chr7 (526-629)||(2580412-2580515)
chr7 (683-866)||(20357231-20357410)
chr7 (899-980)||(40923752-40923833)
chr7 (526-629)||(55970-56073)
chr7 (899-971)||(2280359-2280433)
chr7 (505-600)||(9190008-9190105)
chr7 (505-600)||(20284089-20284186)
chr7 (899-979)||(33404048-33404128)
chr7 (683-727)||(1533263-1533307)
chr7 (683-727)||(2058202-2058246)
chr7 (535-588)||(35960847-35960901)
chr7 (535-629)||(4796638-4796733)
chr7 (899-971)||(5188088-5188161)
chr7 (471-568)||(28617258-28617356)
chr7 (535-629)||(2479368-2479461)
chr7 (899-977)||(12404751-12404829)
chr7 (899-971)||(26090741-26090814)
chr7 (208-266)||(7040517-7040575)
chr7 (801-866)||(21640157-21640220)
chr7 (899-980)||(22994515-22994598)
chr7 (801-881)||(24789636-24789712)
chr7 (898-979)||(49149843-49149924)
chr7 (535-587)||(9185178-9185231)
chr7 (899-971)||(15811437-15811511)
chr7 (899-979)||(49156534-49156614)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (300-718)||(9514-9930)
scaffold0355 (591-898)||(3528-3845)
scaffold0355 (301-479)||(1-170)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (322-894)||(34749-35329)
[»] scaffold0197 (3 HSPs)
scaffold0197 (323-898)||(18855-19433)
scaffold0197 (323-782)||(14113-14578)
scaffold0197 (790-898)||(13975-14081)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (323-898)||(148635-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (323-898)||(1930-2519)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (467-683)||(17869-18087)
scaffold0188 (467-683)||(23962-24180)
scaffold0188 (683-718)||(17783-17818)
scaffold0188 (683-718)||(23876-23911)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (300-403)||(34136-34239)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (323-573)||(181980-182233)
scaffold0009 (643-782)||(176781-176922)
scaffold0009 (800-894)||(176645-176737)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (351-537)||(300-487)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (323-390)||(13166-13233)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (505-600)||(8419-8516)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (898-980)||(19299-19382)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (899-980)||(31075-31157)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (540-616)||(43945-44022)
scaffold0087 (505-629)||(36804-36929)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (506-600)||(85684-85780)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (899-980)||(10507-10589)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (901-976)||(13008-13085)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (899-980)||(12964-13046)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (898-979)||(10913-10995)
[»] scaffold0654 (1 HSPs)
scaffold0654 (899-971)||(8536-8610)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (526-629)||(10751-10855)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (907-979)||(33462-33534)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (899-979)||(16790-16870)
[»] scaffold2150 (1 HSPs)
scaffold2150 (899-980)||(859-940)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (899-958)||(63950-64008)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (505-590)||(2492-2579)
scaffold0006 (505-590)||(5683-5770)
scaffold0006 (535-600)||(133280-133346)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (899-980)||(49262-49343)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (535-587)||(45284-45337)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (899-972)||(31183-31258)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (898-937)||(9226-9264)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (899-953)||(434-487)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (208-266)||(16800-16858)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (899-932)||(8777-8810)
scaffold0243 (899-932)||(23268-23301)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (535-568)||(11500-11533)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (899-952)||(146407-146459)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 895
Target Start/End: Original strand, 3813835 - 3814412
Alignment:
Q  317 caaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3813835 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaa 3813934  T
Q  417 acagtcctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttc 514  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||     
T  3813935 acagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttg 3814034  T
Q  515 acccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagc 614  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3814035 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagc 3814134  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacct 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814135 tttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacct 3814233  T
Q  715 aagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcac 814  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  3814234 aagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccctcctttgatgtccaagttttctctcttaagctctcctaaggttgtcttcaaaaaagcac 3814333  T
Q  815 aagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  3814334 aagaacaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcttgtcacgatctgcaacggt 3814412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 45357569 - 45356992
Alignment:
Q  317 caaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  45357569 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaa 45357471  T
Q  417 acagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgtt 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45357470 acagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgtt 45357372  T
Q  514 cacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaag 613  Q
     |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45357371 gacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaag 45357272  T
Q  614 ctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357271 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 45357172  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagca 813  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45357171 taagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagca 45357072  T
Q  814 caagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45357071 caagaacacaata--tatactagtcctccccagaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggt 45356992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 45348090 - 45347511
Alignment:
Q  317 caaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  45348090 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaa 45347992  T
Q  417 acagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgagaagattgtt 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45347991 acagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgtt 45347893  T
Q  514 cacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaa 612  Q
     |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  45347892 gacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagacctctagccttcaa 45347793  T
Q  613 gctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaac 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347792 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttcccaac 45347693  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaag-ttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaag 811  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45347692 ctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagattttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaag 45347593  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45347592 cacaagaacaca--atatatactagttttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggt 45347511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 898
Target Start/End: Original strand, 5732458 - 5733055
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaat-aaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 398  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5732458 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 5732554  T
Q  399 caagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaa 496  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| |||||||    
T  5732555 caagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaa 5732652  T
Q  497 a----caccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 591  Q
    |    ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732653 aaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 5732752  T
Q  592 ttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 691  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  5732753 ttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggt 5732851  T
Q  692 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcact 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5732852 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagctctct 5732951  T
Q  792 taaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaa 891  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5732952 taaggttgtcttcaaaaaa-cacaagaacaca--atatatactagtcctcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaa 5733048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 895
Target Start/End: Original strand, 18855544 - 18856115
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  18855544 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcc 18855642  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18855643 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 18855742  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18855743 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 18855841  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855842 cacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 18855940  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855941 aactctctcatcaaaggcaaacaccccataggctcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaaga 18856040  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  18856041 acaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcatgtcacgatctgcaacggt 18856115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 322 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 9229461 - 9228881
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  9229461 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9229363  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9229362 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaaccca 9229264  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9229263 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagcttta 9229164  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  9229163 cacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaaga 9229064  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct---------tgagctcacttaaggttatcttcaaaaa 809  Q
     ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  9229063 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcatacaagctctcttaagattcacttcaaaaa 9228964  T
Q  810 agcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9228963 agcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 9228881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 322 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 9224674 - 9224094
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  9224674 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9224576  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9224575 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 9224477  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9224476 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagcttta 9224377  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  9224376 cacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaaga 9224277  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct---------tgagctcacttaaggttatcttcaaaaa 809  Q
     ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  9224276 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcatacaagctctcttaagattcacttcaaaaa 9224177  T
Q  810 agcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9224176 agcagaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagaaattgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 9224094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 328 - 747
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520701
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  51520280 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 51520378  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  51520379 ctagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttctg 51520478  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51520479 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 51520578  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  51520579 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 51520678  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
    |||| ||||| ||| || |||||    
T  51520679 ctcaacaaagacactcaacccat 51520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 327 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146664
Alignment:
Q  327 ttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctag 426  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  56146974 ttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 56146876  T
Q  427 actagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttca 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  56146875 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttca 56146776  T
Q  525 accaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacat 623  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  56146775 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 56146676  T
Q  624 gaacaaacccta 635  Q
    ||||||||||||    
T  56146675 gaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 24741788 - 24742121
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24741788 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 24741885  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24741886 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 24741984  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24741985 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 24742083  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24742084 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 351 - 681
Target Start/End: Original strand, 29760490 - 29760821
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacaca 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29760490 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacaca 29760587  T
Q  451 aagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggag 549  Q
    |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29760588 aagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggag 29760686  T
Q  550 agagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg-aacaaaccctagatccacccc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| | ||||| ||||||| | |||||  ||||||| |  |||    
T  29760687 agagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccc 29760785  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 681  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29760786 tttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2904626 - 2904475
Alignment:
Q  117 aataaaatattagaagtgaataactttgattttcccctttaat-----------gtgtgatagtttctcgttaaattccacatcattgatgagtaagtga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2904626 aataaaatattagaagtgaataactttgattttccc-tttaatcagagcggtgtgtgggatagtttctcgttaaattccacatcacttatgagtaagtga 2904528  T
Q  206 ggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcat 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2904527 ggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatattcattctcat 2904475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468542
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatcca 28468562  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  28468561 ctatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 471 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985634
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31985764 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatcca 31985667  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31985666 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 677 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712450
Alignment:
Q  677 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttc 776  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| ||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctc 18712578  T
Q  777 tct---------cttgagctca---cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgat 864  Q
    |||         ||| || ||    ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18712577 tctaaaagctctcttaagttcttctcttaagtcttacttcaaaaaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgat 18712480  T
Q  865 ttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    || |||| || ||||||| |||| ||||||    
T  18712479 tttcctagattgtgtcacgatcttcaacgg 18712450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 35149976 - 35149894
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35149976 tgtaacaccccgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 35149894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 15471434 - 15471352
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15471434 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 15471352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 802 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 56141797 - 56141719
Alignment:
Q  802 ttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  56141797 ttcaaaaaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttcccaagatcgtgtcac 56141719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 390375 - 390457
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  390375 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 390457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3260823 - 3260741
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3260823 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 3260741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047505
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10047478  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  10047479 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 10047505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 36315304 - 36315229
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36315304 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36315229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 36329513 - 36329438
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36329513 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36329438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396643
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||      
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaa 5396669  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5396668 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 5396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 29383592 - 29383511
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccaca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29383592 tgtaacaccccgttatccaaaaacaatt-aaataacatttatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 29383511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246092
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 39246092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 1583159 - 1583241
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1583159 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 1583241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16623359 - 16623292
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16623359 cctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16623292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796502
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3796517  T
Q  602 ctagctttcaagctt 616  Q
     |||||| |||||||    
T  3796516 ttagcttacaagctt 3796502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 29449566 - 29449483
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29449566 tgtaacaccccgttacccaaaa-caaataaaatagcttatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 29449483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 589
Target Start/End: Original strand, 5143281 - 5143345
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143281 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 1995472 - 1995534
Alignment:
Q  207 gttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1995472 gttttaatctcaaccattcctttttaatttgatggctcttattcattctcatcattctcatat 1995534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147803
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc 602  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||      
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaa 5147777  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5147778 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 5147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5269266 - 5269204
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269266 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 16630744 - 16630651
Alignment:
Q  537 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  16630744 taatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaagaacaa 16630651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Original strand, 24742302 - 24742357
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24742302 gcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgatttcc 24742357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 17667328 - 17667402
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  17667328 tgtaacaccccgttacccaaaagaaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 17667402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 590
Target Start/End: Original strand, 24333831 - 24333896
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333831 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742218
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24742218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 26394939 - 26395012
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  26394939 tgtaacaccccgttacccaaa-gcaata-aaatagcatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 26395012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 29456250 - 29456168
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  29456250 tgtaacatcccgttacccaaaa-caaataaaatagcttatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcattt 29456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 52499800 - 52499882
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52499800 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacataagagtaattccacaaagggcatgctacatgtcatttc 52499882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 629
Target Start/End: Original strand, 3777580 - 3777674
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  3777580 cctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaaac-ttacacaagaacaa 3777674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 23436815 - 23436732
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaat-agcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23436815 tgtaacaccccgttacccaaaaacaat--aactcagcatatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 23436732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1994894 - 1994832
Alignment:
Q  207 gttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1994894 gttttaatctcaaccgttcctttttaatttgatggctcttattcattctcatcattctcatat 1994832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 51520769 - 51520843
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  51520769 aaaaaagcacaagaacaca--atatatactagccttcctctgaagcaattgtgccacgatttccc-aaatcgtgtcac 51520843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 6743490 - 6743425
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743490 ccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37624172 - 37624092
Alignment:
Q  901 taacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatc-caca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37624172 taacaccctgttacccaaaagcaatt-aaataacaaatattcatcagagtaatttcacaacgggcatgctacacgtcatttc 37624092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 972
Target Start/End: Complemental strand, 19129160 - 19129086
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa--tccacacgggcatgctacac 972  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  19129160 tgtaacaccccgttacccaaaatc-atttaaatataacataaacatcagagtaagcaccaaacgggcatgctacac 19129086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 811 - 866
Target Start/End: Original strand, 29761002 - 29761055
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29761002 gcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgattt 29761055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 950
Target Start/End: Original strand, 21396070 - 21396121
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagt 950  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  21396070 tgtaacaccccgttacccaaaagtaattaaaataacaaatatacatcagagt 21396121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 52305905 - 52305838
Alignment:
Q  202 gtgaggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||  | |||||||||||||||||||    
T  52305905 gtgagtttttaatctcaaccatttatttttaatctaatggttgatgatcattctcatcattctcatat 52305838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 972
Target Start/End: Original strand, 21880863 - 21880938
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctacac 972  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  21880863 tgtaacaccccgttacccaaaagtaa-ttaaatataaaatatacatcagagtaattcaccaaacgggcatgctacac 21880938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760919
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatg-tttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctc 29760919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 317 - 898
Target Start/End: Original strand, 32246596 - 32247182
Alignment:
Q  317 caaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaa 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32246596 caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaa 32246695  T
Q  417 acagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa----ggaagaacaaaacaccgag-aagatt 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||    
T  32246696 acagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagatt 32246794  T
Q  511 gttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttc 610  Q
    ||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32246795 gttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttc 32246894  T
Q  611 aagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccca 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32246895 aagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccca 32246994  T
Q  711 acctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaa 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  32246995 acctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggaccccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctcttaaggttatcttcaaaaaa 32247094  T
Q  811 --gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
      |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32247095 aggcacaagaacaca--atatatactagtcctcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 32247182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 321 - 898
Target Start/End: Original strand, 19344236 - 19344818
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19344236 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 19344335  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19344336 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 19344433  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagc 614  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19344434 ccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagc 19344533  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa---tgtttttcccaa 711  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19344534 tttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaa 19344632  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19344633 cctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaaaa 19344732  T
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  19344733 gcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcatgatctgcaacggtccc 19344818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 321 - 897
Target Start/End: Original strand, 19349094 - 19349675
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19349094 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 19349193  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19349194 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 19349291  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagc 614  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19349292 ccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagc 19349391  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa---tgtttttcccaa 711  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19349392 tttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaa 19349490  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19349491 cctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctctaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaaaa 19349590  T
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtcc 897  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19349591 gcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtcc 19349675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 300 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 39812278 - 39811830
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812278 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 39812179  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaa 497  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| ||||||||    
T  39812178 aagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 39812080  T
Q  498 caccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812079 caccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 39811980  T
Q  598 gaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 697  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811979 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 39811880  T
Q  698 aatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  39811879 aatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 39811830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 326 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312574
Alignment:
Q  326 cttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtccta 425  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||    
T  44312887 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 44312789  T
Q  426 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttc 523  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44312788 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttc 44312690  T
Q  524 aaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacaca 622  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44312689 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacaca 44312590  T
Q  623 tgaacaaaccctagat 638  Q
    ||||||||||||||||    
T  44312589 tgaacaaaccctagat 44312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11099176 - 11098843
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11099176 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 11099079  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11099078 aaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 11098980  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  11098979 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 11098881  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11098880 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 353 - 683
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291669
Alignment:
Q  353 tgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaa 451  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  452 agagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggaga 550  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 14291534  T
Q  551 gagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||| |    
T  14291535 gagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccat 14291633  T
Q  648 tggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
      || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14291634 atgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 9296651 - 9296317
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  9296651 gatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacac 9296553  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  9296552 aaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggggga 9296454  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |  |||    
T  9296453 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctaccc 9296355  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296354 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491930
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 3491814  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctca 666  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| ||||||||||    
T  3491815 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 3491913  T
Q  667 cactatgaaccctaaaa 683  Q
    || ||||||||||||||    
T  3491914 caatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 25398457 - 25398675
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398457 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25398556  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || |||  ||||||    
T  25398557 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactc 25398655  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25398656 tcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 25403595 - 25403813
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403595 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 25403694  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || |||  ||||||    
T  25403695 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactc 25403793  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  25403794 tcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 801 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 39811763 - 39811672
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39811763 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 39811672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Original strand, 20964132 - 20964216
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20964132 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtaatcccccaacgggcatgctacacgtcatttc 20964216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 587
Target Start/End: Original strand, 40738810 - 40738926
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 569  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40738810 aagataagctagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccac 40738907  T
Q  570 tatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  40738908 tatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30197402 - 30197318
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30197402 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 30197318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11083404 - 11083273
Alignment:
Q  40 attctatagcagatggattttatcttacacaca--gatttaattagggatagccgaacaattgaaaa-------------ggttgatttgaaaataaaat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||             | ||||||||||||||||||    
T  11083404 attctatggcagatggattttatcttactcacaccgatttaattagggatagccgaacaactgaaaattggttaatttaagattgatttgaaaataaaat 11083305  T
Q  125 attagaagtgaataactttgattttccccttt 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11083304 attaaaagtgaataactttgattttccccttt 11083273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040188
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag---gttacaaga 599  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaaga 8040159  T
Q  600 atctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |  |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8040160 aattagcttacaagc-ttacacaagaacaa 8040188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 535 - 683
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaacc 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  633 ctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||| | |  ||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 1060960 - 1061043
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1060960 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 1061043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 1066344 - 1066426
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1066344 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 1066426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259149
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 28259175  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28259174 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 28259149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 13569350 - 13569454
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||     
T  13569350 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataag-tttacacaa 13569448  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  13569449 gaacaa 13569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 11361126 - 11361044
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11361126 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 11361044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 21121331 - 21121413
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21121331 ctgtaacaccccgttactcaaaagcaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatctacgacgggcatgctacacgtcatttc 21121413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630041
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 4076722 - 4076805
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4076722 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 4076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 10445519 - 10445415
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| | |||||||     
T  10445519 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttacaatc-ttacacaa 10445421  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  10445420 gaacaa 10445415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 28926762 - 28926836
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  28926762 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 28926836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 42552465 - 42552539
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  42552465 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 42552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 34388880 - 34388956
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34388880 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34388956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 33354 - 33436
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33354 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 33436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 8390216 - 8390133
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctt 616  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  8390216 cctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaattagcttacaagctt 8390133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865329
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaacc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 17865302  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  17865303 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 17865329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682305
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 34682332  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| || || ||||||| ||||||    
T  34682331 ttagcttacaggc-ttacacaagaacaa 34682305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 4072415 - 4072340
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  4072415 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 4072340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707223
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 602  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 10707249  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10707248 tagcttacaagc-ttacacaagaacaa 10707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522318
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaa 20522318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 901 - 980
Target Start/End: Original strand, 27728814 - 27728893
Alignment:
Q  901 taacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27728814 taacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 27728893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 36985414 - 36985340
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  36985414 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatacaaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 36985340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14698979
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||     
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaaa 14699006  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  14699005 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 14698979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 35584617 - 35584699
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  35584617 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcatttc 35584699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078442
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||      
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaa 23078468  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23078467 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 23078442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098746
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 11098746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 590
Target Start/End: Original strand, 31056075 - 31056131
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056075 cctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 21604071 - 21604145
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttaccc-aaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21604071 tgtaacaccccgttaccccaaaagcaata-aaataacatataaacatcagagtaattccacaacgggcatgctaca 21604145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 42039744 - 42039669
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42039744 ccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaa 42039669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Original strand, 14291850 - 14291905
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  14291850 gcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttcc 14291905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 36757837 - 36757728
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||   ||||||||||| ||||||| |    
T  36757837 ccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaaaagctttcaagc-ttacacaag 36757739  T
Q  625 aacaaacccta 635  Q
    |||||| ||||    
T  36757738 aacaaaaccta 36757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 724
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291763
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 14291763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 33118158 - 33118262
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  33118158 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 33118256  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  33118257 gaacaa 33118262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 39482953 - 39483057
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  39482953 ccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 39483051  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  39483052 gaacaa 39483057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 36593656 - 36593738
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttaccc-aaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36593656 tgtaacaccccgttaccccaaaaacaatt-aaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 36593738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 9296144 - 9296084
Alignment:
Q  804 caaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  9296144 caaaaaagcacaagaacac--tttaaatactagtcttcctctgaagcaatcgtgtcacgattt 9296084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296235
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 9296235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 11098662 - 11098607
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  11098662 gcacaagaacacaatatatg--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttcc 11098607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 537 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 16940273 - 16940219
Alignment:
Q  537 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940273 taatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 537 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 17010938 - 17010884
Alignment:
Q  537 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010938 taatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 23832717 - 23832637
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||    
T  23832717 tgtaacaccccgttacccaaaa-caataaatatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcattt 23832637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 322 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 28155838 - 28155262
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  28155838 aaaccttcacaccaatgcaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacag- 28155741  T
Q  422 ccta-gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  28155740 cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacc 28155641  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagcttt 617  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28155640 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagcttt 28155541  T
Q  618 acacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaag 717  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155540 acacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaag 28155442  T
Q  718 aaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaagg-ttatcttcaaaaaagcacaa 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || | |||||||||||||||    
T  28155441 aaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctcttaaggttttttttcaaaaaagcacaa 28155342  T
Q  817 gaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28155341 gaacaca--atatatactagtcctcccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 28155262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 895
Target Start/End: Original strand, 6438319 - 6438889
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  6438319 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcc 6438416  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  6438417 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtccca 6438516  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6438517 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagcttta 6438615  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438616 cacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 6438714  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6438715 aactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaaga 6438814  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6438815 acaca--atatatactagtccttccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggt 6438889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 300 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 14737866 - 14737261
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737866 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 14737768  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaa 496  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||    
T  14737767 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 14737669  T
Q  497 acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 596  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737668 acaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 14737569  T
Q  597 agaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 696  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737568 agactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 14737469  T
Q  697 caatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctc---------ttgagct 787  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| ||||||            ||||    
T  14737468 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgttatccaagttctctctcaaagctcatacaagct 14737369  T
Q  788 cacttaaggt---tatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcacca 884  Q
    | |||||| |   | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |    
T  14737368 ctcttaagttctctttctccaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacga 14737271  T
Q  885 tctgcaacgg 894  Q
    ||||||||||    
T  14737270 tctgcaacgg 14737261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 16838561 - 16839139
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||     
T  16838561 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 16838660  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  16838661 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 16838757  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagct-ttcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16838758 cagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 16838857  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacc 713  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16838858 ttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 16838956  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagca 813  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  16838957 taagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctctcaaggttctctccaaaaaagca 16839056  T
Q  814 caagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16839057 caagaacac--tttatatactagtcctgccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 16839139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 6005234 - 6005815
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  6005234 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 6005333  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  6005334 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 6005430  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6005431 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagct 6005530  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6005531 ttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 6005629  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttc--aaaaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||||||    
T  6005630 taagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggtttttttccaaaaaaa 6005729  T
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6005730 gcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 6005815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 326 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010384
Alignment:
Q  326 cttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtccta 425  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||    
T  22010960 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 22010862  T
Q  426 gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttc 523  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22010861 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttc 22010763  T
Q  524 aaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacaca 622  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22010762 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacaca 22010663  T
Q  623 tgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaaca 722  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22010662 tgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaca 22010563  T
Q  723 ctctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct---------tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagca 813  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  22010562 ctctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcatacaagctctcttaagttcttcttcaaaaaagca 22010463  T
Q  814 caagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  22010462 caagaacaca--atatatactagtctccctctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatttgcaacgg 22010384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 300 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742121
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742725 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 14742627  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaa 497  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||    
T  14742626 aagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 14742528  T
Q  498 caccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742527 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 14742428  T
Q  598 gaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 697  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14742427 gactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagtgattac 14742328  T
Q  698 aatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctc---------ttgagctc 788  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||  | ||||| || |||   ||||| | |||||||| ||||||            |||||    
T  14742327 aatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggttccctcctttgttatccaagttctctctcaaagctcatacaagctc 14742228  T
Q  789 acttaaggt---tatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccat 885  Q
     |||||  |   | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||    
T  14742227 tcttaaactctctttctccaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccttagatcgtgtcacgat 14742130  T
Q  886 ctgcaacgg 894  Q
    |||||||||    
T  14742129 ctgcaacgg 14742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 33330715 - 33330124
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  33330715 aaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33330616  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |  || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  33330615 ctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgac 33330518  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33330517 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 33330418  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33330417 tttacacatgacaaaaccctagatcta-ccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 33330319  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ctca-------cttaaggttatc 801  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||       ||||||||| ||    
T  33330318 ctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttaaggttgtc 33330219  T
Q  802 ttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33330218 ttcaaaaaagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 33330124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 300 - 734
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184738
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaa--tggtct 397  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28184297 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtct 28184396  T
Q  398 ccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagca--agaaaggaagaaca 494  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | |||| |||||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaaca 28184495  T
Q  495 aaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 594  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28184496 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28184595  T
Q  595 caagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 694  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184596 caacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 28184695  T
Q  695 tacaatgttttt---cccaacctaagaaacactctcatcaaag 734  Q
    ||| ||||||||   || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  28184696 tactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaag 28184738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 322 - 894
Target Start/End: Original strand, 11856789 - 11857372
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  11856789 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 11856887  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa---caccgagaagattgttcac 516  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| ||    
T  11856888 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgac 11856986  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagct 615  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11856987 ccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagct 11857086  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccta 715  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11857087 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccca 11857186  T
Q  716 agaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaag----gttatcttc------- 804  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||| | |||||| | |||     |||  |||           
T  11857187 agagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctc-taagctcattcaagctctcttaagttctcccagt 11857285  T
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  11857286 aaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccc-aaatcgtgtcacgatttgcaacgg 11857372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 33336212 - 33335621
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||     
T  33336212 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagc 33336113  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaac-acacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |  || ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  33336112 ctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgac 33336015  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33336014 ccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 33335915  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaac 712  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33335914 tttacacatgacaaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 33335816  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ctca-------cttaaggttatc 801  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||       ||||||||| ||    
T  33335815 ctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttaaggttgtc 33335716  T
Q  802 ttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33335715 ttcaaaaaagcacatgaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 33335621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 654 - 898
Target Start/End: Original strand, 5343628 - 5343873
Alignment:
Q  654 tttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccatagga 751  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5343628 tttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaagga 5343727  T
Q  752 tcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaaga 850  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| | |||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||   |||||||||    
T  5343728 tcccatctttgatatccaagttttctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatgagcacaagaacac--tttatatactagtccagccctgaaga 5343825  T
Q  851 aatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  5343826 aatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatatgcaacggtccc 5343873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 5674905 - 5674685
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674905 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 5674806  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg-aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccac 661  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||| |  ||||||||| ||| |||||    
T  5674805 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccac 5674707  T
Q  662 tctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  5674706 tctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 550
Target Start/End: Original strand, 5343297 - 5343527
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  5343297 aaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 5343396  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaa-cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |  || |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  5343397 ctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgac 5343493  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggaga 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5343494 ccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 1069914 - 1069997
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatc---cacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  1069914 tgtaacaccccgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 1069997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 505 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757462
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 5757476  T
Q  603 tagctttcaagctt 616  Q
    |||||| |||||||    
T  5757475 tagcttgcaagctt 5757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125940
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  450 aaagag 455  Q
    ||||||    
T  30125945 aaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 21966471 - 21966389
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21966471 ctgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 21966389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30800278 - 30800197
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30800278 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaattatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 30800197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 16224517 - 16224433
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16224517 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtaatttc 16224433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 33874089 - 33874171
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33874089 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 33874171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 21965726 - 21965807
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21965726 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttatacaacagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 21965807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7238189 - 7238104
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7238189 cctgtaacaccccgttacccaaaaacaa-taacatagcatatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 7238104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 587
Target Start/End: Original strand, 22708984 - 22709102
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaac-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||| |||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22708984 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 22709082  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  22709083 ctatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 5572316 - 5572212
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  5572316 ccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 5572218  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  5572217 gaacaa 5572212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 17308977 - 17309052
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  17308977 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 17309052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356133
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaa 21356133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10077240 - 10077176
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 589  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077240 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 15298921 - 15298995
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  15298921 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 15298995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 25316493 - 25316411
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25316493 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaatatcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 25316411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 26203987 - 26203905
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26203987 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaatatcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 26203905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086472
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaa 31086472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 11582906 - 11582980
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  11582906 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 11582980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674589
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 5674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232943
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18232943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21801419 - 21801343
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21801419 ccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21801343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 589
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 589  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 897 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 15332968 - 15332893
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  15332968 cctgtaacaccccgttaccc-aaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 15332893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 600
Target Start/End: Original strand, 22963739 - 22963797
Alignment:
Q  544 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22963739 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 22963797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23824654 - 23824596
Alignment:
Q  544 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23824654 ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23824596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 27902663 - 27902725
Alignment:
Q  207 gttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27902663 gttttaatcttaacccttttctttttatctgatgactcatattcattctcatcattctcatat 27902725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979611
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa 31979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 4106001 - 4106083
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||   |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4106001 tgtaacaccccgttatccaaaagcaa-ttaaataacaaatatttatcagagtaattccacaacggccatgctacacgtcatttc 4106083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 34134783 - 34134705
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcat 977  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||    
T  34134783 tgtaacaccccgttacccaaatgcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcat 34134705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 953
Target Start/End: Original strand, 25463134 - 25463187
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||    
T  25463134 tgtaacaccccgttacccaaatgcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaat 25463187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 39785114 - 39784516
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39785114 tgttgtgaatctggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 39785015  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaa 496  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||| |||||||||||||   ||| |  |||||||||    
T  39785014 aagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaa 39784916  T
Q  497 acaccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 595  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39784915 acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttac 39784817  T
Q  596 aagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 694  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39784816 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgat 39784718  T
Q  695 tacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaa 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  39784717 tacaatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaa 39784618  T
Q  795 ggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39784617 ggttctcttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 39784520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 35745208 - 35745787
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  35745208 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 35745307  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  35745308 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 35745404  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35745405 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagct 35745504  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35745505 ttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 35745603  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagc 812  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35745604 taagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaaaagc 35745703  T
Q  813 acaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35745704 acaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 35745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 300 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 25328568 - 25328085
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328568 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 25328469  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaag-cataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaa 496  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| |   |||||||  |||||||    
T  25328468 aagccaacaacaacaaaacaacccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaa 25328371  T
Q  497 acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 596  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328370 acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 25328271  T
Q  597 agaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 696  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25328270 agactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 25328171  T
Q  697 caatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  25328170 caatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttgatctccaagttctctctctt 25328085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 328 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289635
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||    
T  7290188 tcacaccaatgaaataaac-attgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctaga 7290090  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagc-ataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7290089 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 7289990  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7289989 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 7289890  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7289889 aacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 7289790  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaa 824  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||| | |||||    ||| |    ||||||||||||||||||||||     
T  7289789 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctc-taagctcttccaagctctctttcaaaaaagcacaagaacaca- 7289692  T
Q  825 tatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  7289691 -atatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttcccaagatcgtgtcac 7289635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 328 - 683
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311477
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  6311121 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 6311219  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaac 526  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6311220 ctagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 6311319  T
Q  527 caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  6311320 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag 6311419  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     ||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6311420 -acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 10684533 - 10684068
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  10684533 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 10684434  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  10684433 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 10684337  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10684336 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 10684237  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10684236 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 10684138  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10684137 ctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 10684068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 36979225 - 36979558
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36979225 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 36979322  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36979323 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 36979421  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  36979422 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 36979520  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36979521 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655827
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa--cagtcctagactagtgtatagcaaaaacaca 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  449 caaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaa----caccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctg 543  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30655586 catagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 30655685  T
Q  544 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatcc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  30655686 ggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattc 30655784  T
Q  641 acccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655785 taccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4759991
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacatcaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatggggga 4760128  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |  |||    
T  4760127 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 4760029  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4760028 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 351 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037724
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaa--aacagtcctagactagtgtatagcaaaaacaca 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  449 caaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggg 547  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 33037860  T
Q  548 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33037859 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 33037761  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 682  Q
     |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33037760 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18853083
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaaca-gtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||| | | |||||||| || || ||||||| |||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 18853320  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18853319 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 18853221  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccaccc 644  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||    
T  18853220 gagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttacc 18853122  T
Q  645 ctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18853121 ctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18853083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18870809 - 18870477
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacaca 450  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||| || || ||||||| ||||||    
T  18870809 gatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacaca 18870713  T
Q  451 aagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggag 549  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18870712 aagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggag 18870614  T
Q  550 agagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  18870613 agagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccc 18870515  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870514 tttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18870477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 10689392 - 10689058
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  10689392 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacac 10689295  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10689294 aaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 10689196  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tccaccc 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||    
T  10689195 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 10689097  T
Q  645 ctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689096 atatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 671 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327859
Alignment:
Q  671 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttgatctccaa 25327971  T
Q  771 gttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccct 870  Q
    ||| |||||          |||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25327970 gttctctct----------cttaagttcttcttcaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccct 25327883  T
Q  871 aaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    | |||||||||| | |||||||||    
T  25327882 agatcgtgtcacgagctgcaacgg 25327859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1262089 - 1261871
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262089 aaacaagataagatagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 1261990  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| | ||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||    
T  1261989 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 1261891  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1261890 tcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287985
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26287965  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26287966 ctatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301242
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26301222  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26301223 ctatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313236
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 26313216  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  26313217 ctatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071146
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 31071263  T
Q  568 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctc 665  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || ||| |||||||||    
T  31071262 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctc 31071164  T
Q  666 acactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  31071163 acaatatgaaccctaaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 14765060 - 14765143
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatc---cacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  14765060 tgtaacaccccgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 14765143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 683 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852828
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct- 781  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | ||||||||| ||||||     
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagttt-ctctctc 18852932  T
Q  782 tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtca 881  Q
    | |||||    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  18852931 taagctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc--aaatcgtgtca 18852836  T
Q  882 ccatctgc 889  Q
    | ||||||    
T  18852835 cgatctgc 18852828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456153
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||  ||||| ||||||| |    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagctggcaagc-ttacacaag 4456148  T
Q  625 aacaa 629  Q
    |||||    
T  4456149 aacaa 4456153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 683 - 868
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30656062
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||||||| ||||| ||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagttctctct-tt 30655978  T
Q  783 gagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
     |||||    ||| |   |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  30655979 aagctcttccaagctctccttcaaaaaaacacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc 30656062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 683 - 882
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311728
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||||||| | |||||     
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgctatccaagttctatctcta 6311631  T
Q  783 gagctcacttaaggttatct-tcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtca 881  Q
     |||||    ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||    
T  6311632 -agctcttccaagctc-tctctcaaaaaagcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaattgtgccacgatttcccacaatcgtgtca 6311727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 790 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 10684036 - 10683930
Alignment:
Q  790 cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10684036 cttaaggttaccttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgc 10683939  T
Q  890 aacggtccc 898  Q
    |||||||||    
T  10683938 aacggtccc 10683930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 33799233 - 33799149
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33799233 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 33799149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 16888126 - 16888044
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tcca-cacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16888126 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaaaagcaaatatacatcagagtaattccaccacgggcatgctacacgtcatttc 16888044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 629
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412466
Alignment:
Q  471 aagataagcaa-gaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 567  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  568 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  || ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaa 7412466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870222
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttt-tctctct 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||| |||| ||||||     
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccatgtttctctctc- 18870326  T
Q  782 tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtca 881  Q
    | |||||    ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  18870325 taagctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtctttctctgaagcaatcgtgccacgattttc--aaatcgtgtca 18870230  T
Q  882 ccatctgc 889  Q
    | ||||||    
T  18870229 cgatctgc 18870222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 801 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 4759819 - 4759754
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4759819 cttcaaacaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgatttcc 4759754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 4979631 - 4979714
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4979631 ctgtaacacctcgttacccaaaagcaa-taaaatagaatatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 4979714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 14737650 - 14737568
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14737650 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatattcatcagattaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 14737568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 19175829 - 19175754
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19175829 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 19175754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799548
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 23799575  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23799574 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 23799548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27910414 - 27910332
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910414 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagtatgtaatcatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 27910332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 27956833 - 27956751
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27956833 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagtatgtaatcatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 27956751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 13362782 - 13362709
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13362782 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaacgggcatgctaca 13362709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 41242985 - 41242904
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  41242985 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacatttttacatcagagtaatccacaacgtgcatgctacacttcatttc 41242904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688806
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttt-tctctct 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | ||||||||| ||| |||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagtttctctttct 10688904  T
Q  782 tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtca 881  Q
    | |||||    ||| |    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||    
T  10688903 t-agctcttccaagctctctttcaaaactgcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaattgtgccacgatttcccacaatcgtgtca 10688807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 6127243 - 6127319
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6127243 ccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 6127319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 26486848 - 26486765
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26486848 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcgtcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 26486765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 950
Target Start/End: Original strand, 14562913 - 14562963
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagt 950  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14562913 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagt 14562963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 23225573 - 23225491
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23225573 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaattatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 23225491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 35540351 - 35540432
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  35540351 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacgacggacatgctacatgtcatttc 35540432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 37235046 - 37235128
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37235046 tgtaacaccctgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgttatttc 37235128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 28979998 - 28980073
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  28979998 ctgtaacaccccgttacccaaaagtaa-taaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 28980073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 28985219 - 28985293
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  28985219 tgtaacaccccgttacccaaaagtaata-aaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 28985293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 37879144 - 37879218
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  37879144 tgtaacaccccgttacccaaaagaaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 37879218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037627
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 33037627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 36801265 - 36801192
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  36801265 tgtaacaccccgttacccaaa-gcaata-aaatagcatataaacatcagagtaattccacatacgggcatgctaca 36801192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10949560 - 10949478
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10949560 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaatagtaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgccacacgtcatttc 10949478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 10957565 - 10957483
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10957565 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaatagtaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgccacacgtcatttc 10957483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 213298 - 213373
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  213298 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 213373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 238956 - 238881
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  238956 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 238881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 726921 - 726996
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  726921 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 726996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 752694 - 752619
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  752694 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 752619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 792311 - 792236
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  792311 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 792236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 799422 - 799497
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  799422 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 799497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Original strand, 850815 - 850890
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  850815 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaacaacatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 850890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702482
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5702482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 526 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9765894 - 9765852
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765894 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29702629 - 29702560
Alignment:
Q  199 taagtgaggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29702629 taagtgaggttt-aatctcaatcattaatttttaatctaatggatcatattcattctcatcattttcatat 29702560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 801 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 33037553 - 33037490
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||    
T  33037553 cttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgattt 33037490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1283420 - 1283360
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  1283420 ttttaatctcaatcat-ctttttttatctaatgattgataattattctcatcattctcatat 1283360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 23746693 - 23746776
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||  ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  23746693 tgtaacaccccgttacccaaaagcga-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacatacgggcatgctgcacgtcatttc 23746776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261776
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctc 1261776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979654
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagagacactctc 36979654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 19752469 - 19752394
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  19752469 ccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 19752394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 898 - 953
Target Start/End: Original strand, 35033147 - 35033201
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  35033147 ctgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaat 35033201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 4521600 - 4521519
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatc-caca-cgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  4521600 tgtaacaccccgttacccataagcagta-aaataacataaatacatcagagtaatttcacaacgggcatgctacacgtcattt 4521519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 615
Target Start/End: Original strand, 6813723 - 6813796
Alignment:
Q  544 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaagaatctagctttcaagct 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||  |||||| ||||||    
T  6813723 ggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaattagcttgcaagct 6813796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Original strand, 8744210 - 8744271
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8744210 ttttaatctcaaccctttctttttaatctgatggctctcattcattctcatcattctcatat 8744271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 21986364 - 21986312
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa 952  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||    
T  21986364 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatattaaataatcatcagagtaa 21986312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 952
Target Start/End: Complemental strand, 22003572 - 22003520
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa 952  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||    
T  22003572 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatattaaataatcatcagagtaa 22003520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 321 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 28807844 - 28807267
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||    
T  28807844 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 28807746  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttca 515  Q
     ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28807745 ccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 28807646  T
Q  516 cccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagct 615  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807645 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagct 28807547  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccta 715  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807546 ttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaaccta 28807448  T
Q  716 agaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcaca 815  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28807447 agaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttctcttcaaaaaagcaca 28807348  T
Q  816 agaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28807347 agaacata--atatatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgagttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 28807267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 322 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 37561715 - 37561138
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacag 420  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  37561715 aaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 37561616  T
Q  421 tccta-gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37561615 -cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 37561517  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37561516 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagct 37561417  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccta 715  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37561416 ttacacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt-cccaaccta 37561319  T
Q  716 agaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcaca 815  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37561318 agaaacactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagccatcttaaggttctcttcaaaaaagcaca 37561219  T
Q  816 agaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  37561218 agaacacaata--tatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcatgtcacgatctgcaacggtccc 37561138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 37556889 - 37556317
Alignment:
Q  326 cttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcct 424  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  37556889 cttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cct 37556791  T
Q  425 a-gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacccag 520  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37556790 atgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 37556691  T
Q  521 ttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagctttac 619  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37556690 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttac 37556591  T
Q  620 acatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaa 719  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556590 acatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt-cccaacctaagaa 37556493  T
Q  720 acactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaa 819  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37556492 acactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagccatcttaaggttctcttcaaaaaagcacaagaa 37556393  T
Q  820 cacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtcc 897  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37556392 cacaata--tatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccatgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtcc 37556317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 894
Target Start/End: Original strand, 15044484 - 15045085
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15044484 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 15044580  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa 497  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15044581 aaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaa 15044679  T
Q  498 caccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044680 caccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 15044779  T
Q  598 gaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 697  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044780 gactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 15044879  T
Q  698 aatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctca------- 789  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||    ||||||           
T  15044880 aatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctacaaagctcatacaagc 15044979  T
Q  790 ---cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatc 886  Q
       |||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15044980 tctcttaagttcttcttcaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatc 15045077  T
Q  887 tgcaacgg 894  Q
    ||||||||    
T  15045078 tgcaacgg 15045085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 2785192 - 2785771
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  2785192 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2785291  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  2785292 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 2785388  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2785389 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagct 2785488  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2785489 ttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 2785587  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagc 812  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2785588 taagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaaaagc 2785687  T
Q  813 acaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  2785688 acaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgctccc 2785771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1456969
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  1457423 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 1457325  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaac 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1457324 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 1457225  T
Q  527 caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatga 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1457224 caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatga 1457125  T
Q  626 acaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactc 725  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1457124 acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactc 1457025  T
Q  726 tcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    ||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  1457024 tcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 1456969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 33791133 - 33791712
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  33791133 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33791232  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  33791233 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 33791329  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagc-tttcaagct 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33791330 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagct 33791429  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33791430 ttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 33791528  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagc 812  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33791529 taagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaaaagc 33791628  T
Q  813 acaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33791629 acaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 33791712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 31397261 - 31396681
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  31397261 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca-t 31397163  T
Q  422 ccta-gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa---acaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| ||||||   |||||||| ||||||||| ||    
T  31397162 cctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaa-aacaaacaaacaccgagcaagattgttgac 31397066  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31397065 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 31396966  T
Q  615 tttacacatga--acaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttccca 710  Q
    |||||||| ||  | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31396965 tttacacaagacaaaaaaccctagatctaccc-tttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 31396867  T
Q  711 acctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaa 810  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||    
T  31396866 acctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctctcaaggttgtcttcaaaaaa 31396767  T
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||  | || |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31396766 gcacaagaacac--tttaaatacaagtcctgccctgaagaaatcgtgtcacgattaccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 31396681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Original strand, 43592102 - 43592557
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  43592102 tcacatcaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43592200  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43592201 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 43592300  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43592301 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 43592400  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43592401 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 43592500  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  43592501 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 43592557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 31402118 - 31401538
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  31402118 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 31402019  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  31402018 ctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 31401922  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31401921 cagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 31401822  T
Q  616 ttacacatga--acaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaa 711  Q
    ||||||| ||  | |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31401821 ttacacaagacaaaaaactctagatctaccc-tttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 31401723  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaag 811  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  31401722 cctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagttttgtctcttaagctctctcaaggttgtcttcaaaaaag 31401623  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||  | || |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31401622 cacaagaacac--tttaaatacaagtcctgccctgaagaaatcgtgtcacgattaccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 31401538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43599002
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  43598547 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43598645  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  43598646 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcag 43598745  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43598746 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 43598845  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43598846 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 43598945  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  43598946 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 43599002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604494
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  43604039 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43604137  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  43604138 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcag 43604237  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43604238 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 43604337  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43604338 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 43604437  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  43604438 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 43604494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609986
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  43609531 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43609629  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  43609630 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcag 43609729  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43609730 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 43609829  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43609830 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 43609929  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  43609930 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 43609986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 33767996 - 33768580
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||     
T  33767996 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagc 33768095  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg---aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  || ||||| | | ||| |   ||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  33768096 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 33768192  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagcttt-caagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33768193 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagct 33768292  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggt-attttccca--ctctc-acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttccc 709  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || ||| ||||||||   | ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33768293 ttacacatgaacaaaccctagacctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcccaaggtgattacaatgttgttttccc 33768392  T
Q  710 aacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctc-tctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaa 808  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  33768393 aacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccccatctttgatctccaagttttctctcttaagctctcttaaggttatctccaaaa 33768492  T
Q  809 aagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33768493 aagcacaagaacac--tttaaatactagtcatgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 33768580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 328 - 781
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445248
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||    
T  27444793 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27444891  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27444892 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 27444991  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27444992 gcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 27445091  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27445092 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 27445191  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  27445192 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctct 27445248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 328 - 882
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27450202
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||    
T  27449637 tcacaccaatgaaataaac-aatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27449735  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaa 525  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27449736 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcag 27449835  T
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27449836 ccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatg 27449935  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27449936 aacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 27450035  T
Q  725 ctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttg---------agctcacttaaggttatcttc---aaaaaagc 812  Q
    |||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| || | ||    ||||||||    
T  27450036 ctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcattcaagctctcttaagttttttttttgtaaaaaagc 27450135  T
Q  813 acaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27450136 acaagaacaca--atatatactagccttcctctgaagcaatcgtgccacgatttccc-aaatcgtgtcac 27450202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 328 - 682
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631586
Alignment:
Q  328 tcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctaga 427  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  30631231 tcacacaaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctaga 30631328  T
Q  428 ctagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaac 526  Q
    |||||||||||||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |    
T  30631329 ctagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttcagc 30631428  T
Q  527 caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30631429 caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatg 30631528  T
Q  625 aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 682  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30631529 aacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 429 - 683
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  429 tagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaacc 527  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagcc 31180237  T
Q  528 aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatga 625  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |     
T  31180238 aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag- 31180336  T
Q  626 acaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180337 acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 38192135 - 38192353
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192135 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38192234  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  38192235 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 38192333  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  38192334 tcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 38219360 - 38219578
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219360 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 38219459  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  38219460 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 38219558  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  38219559 tcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 394 - 683
Target Start/End: Original strand, 24135740 - 24136028
Alignment:
Q  394 gtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaa 492  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||  |  |  ||  |||||  |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24135740 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacaagataa--tacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaa 24135835  T
Q  493 caaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| |    
T  24135836 caaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagg 24135935  T
Q  591 gttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24135936 gttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 35387624 - 35387842
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387624 aaacgagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 35387723  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    | | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||  ||||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  35387724 ctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 35387822  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  35387823 tcacaatatgaaccctaaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37540873 - 37540791
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatcc--acacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  37540873 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatt-aaatagcatataaacatcagagtaatcccgcaacgggcatgctacacgtcatttc 37540791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 37548417 - 37548335
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatcc--acacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  37548417 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatt-aaatagcatataaacatcagagtaatcccgcaacgggcatgctacacgtcatttc 37548335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 25852230 - 25852312
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25852230 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 25852312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281877
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10281851 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 10281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353304
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 9353330  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9353329 aagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 9353304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932350
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 36932350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 25845595 - 25845677
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  25845595 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatccacaaacgggcatgctacacgccatttc 25845677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 15460722 - 15460804
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15460722 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaattaaacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 15460804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18895853 - 18895771
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18895853 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 18895771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 30780319 - 30780403
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac---acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  30780319 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatatatacatcagagtaattccacataacgagcatgctacacgtcatttc 30780403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 40011830 - 40011748
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atcca-cacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40011830 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccaccacgggcatgctacacgtcatttc 40011748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 896 - 980
Target Start/End: Original strand, 20339843 - 20339928
Alignment:
Q  896 ccctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20339843 ccctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 20339928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 5583136 - 5583053
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5583136 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 5583053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 536 - 600
Target Start/End: Original strand, 15464564 - 15464629
Alignment:
Q  536 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15464564 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 15464629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 882
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180642
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||||||| |||||| |    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagttctctctc-t 31180545  T
Q  783 gagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
     |||||    |||     |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  31180546 aagctcttccaagccccgcttc-aaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcccaagatcatgtcac 31180642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 20346440 - 20346522
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20346440 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 20346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 43028292 - 43028373
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43028292 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 43028373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916943
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 602  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||      
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaa 11916969  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    ||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  11916968 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaa 11916943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 11994395 - 11994468
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11994395 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaataacatataaacatcagagtaattccacaacgggcatgctaca 11994468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520355
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 14520329  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14520330 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 14520355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 3880321 - 3880425
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| |||||||     
T  3880321 ccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagc-ttacacaa 3880419  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  3880420 gaacaa 3880425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 747
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631704
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 30631704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 1456920 - 1456845
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | | ||||||||    
T  1456920 aaaaaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctaaagaaatcgtgccacgatttcccaagaccgtgtcac 1456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 12084241 - 12084175
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12084241 cctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 12084175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 27445285 - 27445359
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  27445285 aaaaaagcacaagaacaca--atatatactagccttcctctgaagcaatcgtgccacgatttccc-aaatcgtgtcac 27445359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 43592591 - 43592665
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43592591 aaaaaagcacaagaacaca--atatatactagccttcctccgaagcaatcgtgtcacgatttccc-aaatcgtgtcac 43592665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 43599036 - 43599110
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43599036 aaaaaaacacaagaacacaatat--atactagccttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttccc-aaatcgtgtcac 43599110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 43604528 - 43604602
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43604528 aaaaaaacacaagaacacaatat--atactagccttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttccc-aaatcgtgtcac 43604602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 882
Target Start/End: Original strand, 43610020 - 43610094
Alignment:
Q  805 aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43610020 aaaaaaacacaagaacacaatat--atactagccttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttccc-aaatcgtgtcac 43610094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 14883202 - 14883128
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  14883202 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 14883128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 14889879 - 14889805
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  14889879 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 14889805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 24795902 - 24795828
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  24795902 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 24795828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 24801269 - 24801195
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  24801269 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 24801195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17939778 - 17939696
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatc-caca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17939778 tgtaacaccccgttacccataagcagta-aaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacgggcatgctacacgtcatttc 17939696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 28832281 - 28832356
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  28832281 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 28832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 600
Target Start/End: Original strand, 19588778 - 19588844
Alignment:
Q  536 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19588778 ctaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19588844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 724
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136121
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacact 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacact 24136121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127410
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaacc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 42127410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 10593102 - 10593044
Alignment:
Q  830 atactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10593102 atactagtcttcctctgttgaaatcgtgtcacgatttccc-aaatcgtgtcacgatctgc 10593044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 19801182 - 19801100
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagt-aatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  19801182 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtgattccacaacgggtatgctacacttcatttc 19801100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 4410283 - 4410241
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410283 ccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 7508902 - 7508828
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  7508902 ctgtaacaccccgttacccaaaag-aaataaaatagcatat-aacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 7508828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 14615800 - 14615747
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  14615800 tgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaat 14615747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 22249083 - 22249030
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  22249083 tgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaat 22249030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 951
Target Start/End: Original strand, 5453745 - 5453797
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta 951  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||    
T  5453745 ctgtaacaccccgttacccaaaagtaa-ttaaataacaaataatcatcagagta 5453797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36423261 - 36423200
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  36423261 ttttaatcgcaaccttttatttttaatctgatgattgataattattctcatcattctcatat 36423200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 25445357 - 25444782
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  25445357 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcc 25445259  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25445258 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 25445159  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25445158 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 25445059  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445058 cacatgaacaaaccctagagctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 25444960  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25444959 aactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttc-aaaaagcacaaga 25444861  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccct 899  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25444860 acaca--ataaatactagtcctcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccct 25444782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 44024163 - 44023568
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44024163 tgttgtgaatccgattccaaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttcc 44024064  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaac 498  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||    
T  44024063 aagcaaacaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaac 44023965  T
Q  499 accgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44023964 accgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaa 44023866  T
Q  598 gaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 696  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44023865 gactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaacta-ccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatta 44023767  T
Q  697 caatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaagg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  44023766 caatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaagg 44023667  T
Q  797 ttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtc 896  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44023666 ttatcctc-aaaaagcacaagaacaca--atatataccagtcctcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtc 44023570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 39445317 - 39445891
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  39445317 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcc 39445415  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39445416 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 39445515  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39445516 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 39445614  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445615 cacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 39445713  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445714 aactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaaga 39445813  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39445814 acaca--atatatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 39445891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 1055279 - 1054708
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||  || |||||||| ||| |    
T  1055279 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaa-cagcc 1055181  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1055180 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 1055081  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1055080 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 1054982  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054981 cacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 1054883  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1054882 aactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaaga 1054783  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggt 895  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1054782 acacaata--tatactagtcctcccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggt 1054708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 300 - 747
Target Start/End: Original strand, 41398032 - 41398479
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41398032 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctcc 41398131  T
Q  400 aagc---caaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaac 493  Q
    ||||   |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     ||||||||||    
T  41398132 aagcaaacaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaagaac 41398225  T
Q  494 aaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 593  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398226 aaaacaccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 41398325  T
Q  594 acaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 693  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398326 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 41398425  T
Q  694 ttacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  41398426 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 41398479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 43988734 - 43988140
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||     
T  43988734 aaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 43988635  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttcaccc 518  Q
    |  || ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  43988634 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttaccc 43988535  T
Q  519 agttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagctt 616  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43988534 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 43988435  T
Q  617 tacacatg--aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||| |  || |||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43988434 tacacaagacaaaaaaccctagatcta-ccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 43988336  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ctca-------cttaaggttatc 801  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||       ||||||||||||    
T  43988335 ctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttaaggttatc 43988236  T
Q  802 ttcaaaaaa-gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    | ||||||| |||||||| |||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  43988235 tccaaaaaatgcacaagagcac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatatgcaacggtccc 43988140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 409 - 734
Target Start/End: Original strand, 41390489 - 41390811
Alignment:
Q  409 acaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaa--cacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgaga 505  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||    
T  41390489 acaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaagaacaaaacatcgaga 41390582  T
Q  506 agattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctag 605  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41390583 agattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctag 41390682  T
Q  606 ctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 705  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390683 ccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 41390782  T
Q  706 tcccaacctaagaaacactctcatcaaag 734  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41390783 tcccaacccaagagacactctcaacaaag 41390811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 609 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439590
Alignment:
Q  609 tcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcc 25439777  T
Q  709 caacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaa 808  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  25439776 caacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttc-aaa 25439678  T
Q  809 aagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  25439677 aagcacaagaacaca--ataaatactagtcctcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacagtccc 25439590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787280
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc--caaccacaacaaaa--cagtcctagactagtgtatagcaaaaaca 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||  |||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||| ||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  447 cacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgg 544  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 24787421  T
Q  545 gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccac 642  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |      
T  24787420 gggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattcta 24787321  T
Q  643 ccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24787320 ccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 394 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202686
Alignment:
Q  394 gtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaac 493  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||| | |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaagaac 24202878  T
Q  494 aaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 591  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24202877 aaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggg 24202778  T
Q  592 ttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202777 ttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 300 - 403
Target Start/End: Original strand, 41386543 - 41386646
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386543 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 41386642  T
Q  400 aagc 403  Q
    ||||    
T  41386643 aagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358760
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  568 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctc 665  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19358778  T
Q  666 acactatgaaccctaaaa 683  Q
     || ||||||||||||||    
T  19358777 tcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361349
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  568 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctc 665  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19361367  T
Q  666 acactatgaaccctaaaa 683  Q
     || ||||||||||||||    
T  19361366 tcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379989
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaa-ggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  568 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctc 665  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19380007  T
Q  666 acactatgaaccctaaaa 683  Q
     || ||||||||||||||    
T  19380006 tcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 801 - 890
Target Start/End: Original strand, 41390900 - 41390987
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgca 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41390900 cttcaaaaaagcacaagaacacaatat--atactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgca 41390987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 801 - 890
Target Start/End: Original strand, 41398555 - 41398642
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgca 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41398555 cttcaaaaaagcacaagaacacaatat--atactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgca 41398642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644869
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 26644895  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26644894 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 26644869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 39093570 - 39093652
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatcc--acacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  39093570 tgtaacacctcgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccaccacgggcatgctacacgtcatttc 39093652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703907
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaaa 47703934  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  47703933 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 47703907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Original strand, 45529245 - 45529314
Alignment:
Q  199 taagtgaggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45529245 taagtgaggttt-aatctcaaccattcctttttaatctaatgactcatattcattctcatcattcttatat 45529314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 684 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787045
Alignment:
Q  684 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttg 783  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||||||| |||||||      
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagttctctctcta- 24787128  T
Q  784 agctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    |||||    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  24787127 agctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc 24787045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 3281730 - 3281833
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |    
T  3281730 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagc-ttacacaag 3281828  T
Q  625 aacaa 629  Q
    |||||    
T  3281829 aacaa 3281833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 6739818 - 6739901
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6739818 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgttatttc 6739901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 3653513 - 3653431
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3653513 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 3653431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 18417427 - 18417509
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tcca-cacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18417427 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccataacgggcatgctacacgtcatttc 18417509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 20278079 - 20277997
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20278079 tgtaacaccccgttaaccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 20277997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 21536635 - 21536541
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21536635 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 21536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27104438 - 27104371
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27104438 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 27104371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073026
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120916
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 45528486 - 45528417
Alignment:
Q  199 taagtgaggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45528486 taagtgaggttt-aatctcaaccattcaattttaatctaatgactcatattcattctcaccattctcatat 45528417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 18027562 - 18027478
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaa-gcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18027562 cctgtaacaccccgttacccaaaaagcaatt-aaataacatttatacataagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 18027478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 48427162 - 48427236
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  48427162 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 48427236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16124591 - 16124515
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16124591 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16124515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 28557313 - 28557231
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28557313 tgtaacaccccgttacctaaaagcaa-ttaaataacatttatacatctgagtaatccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 28557231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476387
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||     
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaaa 9476360  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9476361 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 9476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 41050991 - 41051072
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41050991 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 41051072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 24423302 - 24423383
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  24423302 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatccacaatggacatgctacacgtcatttc 24423383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 26739935 - 26739861
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  26739935 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 26739861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 29152187 - 29152104
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29152187 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 29152104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 590
Target Start/End: Original strand, 29651833 - 29651898
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651833 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 898 - 950
Target Start/End: Original strand, 24065572 - 24065623
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagt 950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24065572 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagt 24065623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 38908927 - 38908845
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  38908927 tgtaacaccccgttacccaaaa-caaataaaatagcttatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcattt 38908845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 38911775 - 38911693
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  38911775 tgtaacaccccgttacccaaaa-caaataaaatagcttatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcattt 38911693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 13604689 - 13604623
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  13604689 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaa 13604623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 33685031 - 33684950
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  33685031 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcatttc 33684950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 597
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 590
Target Start/End: Original strand, 775694 - 775759
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775694 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 11385244 - 11385318
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  11385244 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 11385318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 39190523 - 39190449
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  39190523 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 39190449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48578498 - 48578437
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||    
T  48578498 ttttaatctcaaccattcatttttaatctaatgattaacatgtattctcaccattctcatat 48578437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 52399550 - 52399624
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  52399550 tgtaacaccccgttacccaaaaacaata-aaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 52399624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202591
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24202591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 267
Target Start/End: Original strand, 5226690 - 5226741
Alignment:
Q  216 tcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcat 267  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5226690 tcaacctttcctttttaatctaatgactcatattcattctcaccattctcat 5226741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 17145576 - 17145658
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17145576 tgtaacatcccgttacccaaaaacaatt-aaataacaattatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 17145658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098824
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 47098824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 17378720 - 17378793
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  17378720 tgtaacaccccgttacccaaa-gcaata-aaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 17378793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 972
Target Start/End: Original strand, 36917085 - 36917159
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa--tccacacgggcatgctacac 972  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  36917085 tgtaacaccccgttacccaaaatc-atttaaatataacataaacatcagagtaagcaccaaacgggcatgctacac 36917159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 32889461 - 32889536
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  32889461 ccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 32889536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Original strand, 6307387 - 6307445
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctca 266  Q
    ||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6307387 ttttaatcttaatcatttgtttttaatctgatgactcacattcattctcatcattctca 6307445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 45517947 - 45518009
Alignment:
Q  207 gttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  45517947 gttttaatctcaaccatttctttttaatttgatggctcttattcattctcatcgttctcatat 45518009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 812 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 24793921 - 24793867
Alignment:
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  24793921 cacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc 24793867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Original strand, 48579202 - 48579263
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   || |||||||| |||||||||||    
T  48579202 ttttaatctcaaccattcatttttaatctaatggttaccatgtattctcaccattctcatat 48579263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 50799495 - 50799434
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  50799495 ttttaatctcaaccctttctttttaatctgatggctctcattcattctcatcattctcatat 50799434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 323 - 894
Target Start/End: Original strand, 180 - 750
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  180 aaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcc 278  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  279 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 378  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  379 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 477  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  478 cacatgaacaaaccctagaactaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 576  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaaga 818  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  577 aactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagatttctctcttaagctctcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaaga 676  T
Q  819 acacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  677 acaca--atatataccagtcctcccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 898
Target Start/End: Original strand, 18656228 - 18656837
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaat-aaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 398  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18656228 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 18656324  T
Q  399 caagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaa 496  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |   ||||||| |||||||    
T  18656325 caagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaa 18656422  T
Q  497 a----caccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 591  Q
    |    ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656423 aaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 18656522  T
Q  592 ttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 691  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18656523 ttacaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggt 18656621  T
Q  692 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ct 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    ||    
T  18656622 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccctctttgatctccaagttttctctcttaagttctct 18656721  T
Q  788 ca-------cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtc 880  Q
    ||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  18656722 caaggttgtcttaaggttgtcttcaaaaaagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtc 18656819  T
Q  881 accatctgcaacggtccc 898  Q
    || |||||||||||||||    
T  18656820 acgatctgcaacggtccc 18656837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 321 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 2677358 - 2676766
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaaca 419  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  2677358 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2677259  T
Q  420 gtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttca 515  Q
    | |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| |    
T  2677258 gcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttga 2677161  T
Q  516 cccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaag 613  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2677160 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 2677061  T
Q  614 ctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 711  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2677060 ctttacacatgacaaaaccctagatcta-ccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 2676962  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ctca-------cttaaggttat 800  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||       ||||||||| |    
T  2676961 cctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgacctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttaaggttct 2676862  T
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2676861 cttcaaaaaagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 2676766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 321 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 2673202 - 2672610
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaaca 419  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  2673202 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2673103  T
Q  420 gtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaa-gaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttca 515  Q
    | |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| |    
T  2673102 gcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttga 2673005  T
Q  516 cccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaag 613  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2673004 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 2672905  T
Q  614 ctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 711  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2672904 ctttacacatgacaaaaccctagatcta-ccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 2672806  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgag----ctca-------cttaaggttat 800  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||       ||||||||| |    
T  2672805 cctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgacctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttaaggttct 2672706  T
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2672705 cttcaaaaaagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 2672610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 300 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 22173484 - 22173036
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22173484 tgttgtgaatccggtttcaaacaaatcttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 22173386  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa 497  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22173385 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 22173287  T
Q  498 caccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 597  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173286 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 22173187  T
Q  598 gaa-tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 696  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173186 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 22173087  T
Q  697 caatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  22173086 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 22173036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 355 - 898
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968513
Alignment:
Q  355 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaaga 454  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  455 gctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggaga 550  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  24968057 gctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggaga 24968153  T
Q  551 gagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccaccccttt 648  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  24968154 gagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctaccc-ttt 24968252  T
Q  649 ggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacacccca 746  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24968253 ggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacacccca 24968352  T
Q  747 taggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatc-----------ttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatacta 835  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||           |||||| ||||||||||||||  | || ||||||    
T  24968353 aaggatcccctctttgatctccaagttatctctcttgagctctctcaagattgtcttaagccccctttcaaataagcacaagaacac--tttaaatacta 24968450  T
Q  836 gtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  24968451 gtcttgccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtggcacgatttgcaacggtccc 24968513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 323 - 782
Target Start/End: Original strand, 8512032 - 8512498
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||     
T  8512032 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8512131  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |  || ||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8512132 ctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 8512229  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8512230 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 8512329  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8512330 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 8512428  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8512429 ctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 8512498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 323 - 782
Target Start/End: Original strand, 8516912 - 8517378
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||     
T  8516912 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8517011  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataag-caagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
    |  || ||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  | | ||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8517012 ctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgac 8517109  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8517110 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 8517209  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8517210 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 8517308  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8517309 ctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 8517378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 7167092 - 7167425
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacaca 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7167092 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacaca 7167189  T
Q  451 aagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggag 549  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7167190 aagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggag 7167289  T
Q  550 agagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  7167290 agagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccct 7167388  T
Q  647 ttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167389 ttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 32475301 - 32475880
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || || |||||||||||    
T  32475301 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag 32475400  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  32475401 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 32475497  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  32475498 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 32475596  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  32475597 ttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaac 32475695  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaag 811  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | |||||||  ||    
T  32475696 ctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagtttcctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatgag 32475795  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  32475796 cacaagaacac--tttaaatactagtcctgcccagaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatatgcaacggtccc 32475880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 347 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503780
Alignment:
Q  347 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaca 446  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  447 cacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggg 545  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaaagcataaacaaga---------aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 28503920  T
Q  546 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacc 643  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |    
T  28503919 gaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctac 28503820  T
Q  644 cctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28503819 cctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 32480158 - 32480738
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaa-ccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaaca 419  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | || || ||||||||||    
T  32480158 aaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaaca 32480257  T
Q  420 gtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttca 515  Q
    | |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| |  ||||||||| |    
T  32480258 gcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttga 32480354  T
Q  516 cccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  32480355 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 32480453  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 711  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32480454 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaa 32480552  T
Q  712 cctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaa 810  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | |||||||  |    
T  32480553 cctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagtttcctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatga 32480652  T
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||| | ||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  32480653 gcacaagaacac--tttaaatactagtcctgcctagaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatatgcaacggtccc 32480738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671502
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||| |||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggga 548  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 2671639  T
Q  549 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| || ||||| ||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  2671638 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctaccc 2671540  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2671539 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2671502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 351 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8739314 - 8738982
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaac-aca 448  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||||| | | |||||||| || || | ||||||| |||    
T  8739314 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 8739216  T
Q  449 caaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggg 547  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8739215 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 8739117  T
Q  548 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccaccc 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||    
T  8739116 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacc 8739018  T
Q  645 ctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 680  Q
    | |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8739017 catatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 351 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9091552 - 9091220
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaac-aca 448  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||||| | | |||||||| || || | ||||||| |||    
T  9091552 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 9091454  T
Q  449 caaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggg 547  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9091453 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 9091355  T
Q  548 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccaccc 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||    
T  9091354 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacc 9091256  T
Q  645 ctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 680  Q
    | |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9091255 catatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372712
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 566  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagataggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 40372830  T
Q  567 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactct 664  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||| |  || ||| ||||||||    
T  40372829 caatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactct 40372731  T
Q  665 cacactatgaaccctaaaa 683  Q
    || | ||||||||||||||    
T  40372730 cataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 8477324 - 8477545
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477324 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 8477423  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacac-atgaacaaaccctagatccacccctttggtattt-tccca 660  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||||| || |||||  ||||||| |  ||||||||| |||  ||||    
T  8477424 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccca 8477522  T
Q  661 ctctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  8477523 ctctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 323 - 553
Target Start/End: Original strand, 10207750 - 10207983
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  10207750 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 10207849  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagat-aagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||| |  |||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  10207850 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgacc 10207947  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagag 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207948 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 548 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  548 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 471 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 26928721 - 26928507
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 569  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26928721 aagataagctagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccac 26928623  T
Q  570 tatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctca 666  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| ||||||||||    
T  26928622 tatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctca 26928524  T
Q  667 cactatgaaccctaaaa 683  Q
    || ||||||||||||||    
T  26928523 caatatgaaccctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 470 - 600
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306045
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatcca 1306012  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1306013 ctacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 1306045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 471 - 683
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143501
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 32143385  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctca 666  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||||     
T  32143386 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctct 32143484  T
Q  667 cactatgaaccctaaaa 683  Q
    || ||||||||||||||    
T  32143485 caatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 897 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 53572157 - 53572073
Alignment:
Q  897 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  53572157 cctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 53572073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 51848448 - 51848530
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51848448 tgtaacaccccgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 51848530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 899 - 978
Target Start/End: Original strand, 29492777 - 29492857
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatt 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  29492777 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatt-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacgcgtcatt 29492857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Original strand, 21351501 - 21351584
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21351501 ctgtaacatcccgttacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 21351584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 600
Target Start/End: Original strand, 27452924 - 27453055
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||   ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27452924 aagataagcaagaaagaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatcca 27453022  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27453023 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 27453055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 526 - 616
Target Start/End: Original strand, 16264372 - 16264463
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctt 616  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||    
T  16264372 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 16264463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 471 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 27986567 - 27986449
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986567 aagataagcaagaaagaatgaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 27986469  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaa 587  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  27986468 ctatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370448
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat 8370474  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  8370473 tagcttaaaagc-ttacacaagaacaa 8370448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 54834051 - 54833970
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54834051 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaattatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 54833970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 898 - 978
Target Start/End: Original strand, 3107722 - 3107802
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcatt 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  3107722 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcgtataaacatcagagtatcccacaacgggcatgctacacgtcatt 3107802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 790 - 898
Target Start/End: Original strand, 8512530 - 8512636
Alignment:
Q  790 cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8512530 cttaaggttaccttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgc 8512627  T
Q  890 aacggtccc 898  Q
    |||||||||    
T  8512628 aacggtccc 8512636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 790 - 898
Target Start/End: Original strand, 8517410 - 8517516
Alignment:
Q  790 cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8517410 cttaaggttaccttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgc 8517507  T
Q  890 aacggtccc 898  Q
    |||||||||    
T  8517508 aacggtccc 8517516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974942
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 27974942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552844
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 18552871  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  18552870 ttagcttataagc-ttacacaagaacaa 18552844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 800 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 22172968 - 22172893
Alignment:
Q  800 tcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtg 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22172968 tcttcaaaaaagcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccc-aaatcgtg 22172893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 683 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503526
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacac-accccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct 781  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||  | || |||   ||||| | |||||||| |||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcctttgttatccaagttctctctct 28503628  T
Q  782 ---tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtg 878  Q
       | |||||    ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  28503627 ctctaagctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcccaagatcgtg 28503530  T
Q  879 tcac 882  Q
    ||||    
T  28503529 tcac 28503526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029219
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatc 602  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 36029193  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  36029194 tagcttacaaac-ttacacaagaacaa 36029219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711320
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 21711320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 683 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501360
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctc-tttgatctccaagttttctctct 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| |  | | | ||| |||| | |||||||| |||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcctttgttatccaagttctctctct 28501461  T
Q  782 ---tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtg 878  Q
       | |||||    ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  28501460 ctctaagctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagtacacaatatata--ctagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcccaagatcgtg 28501363  T
Q  879 tca 881  Q
    |||    
T  28501362 tca 28501360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 898 - 951
Target Start/End: Original strand, 28752023 - 28752075
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28752023 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagta 28752075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 28758191 - 28758265
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  28758191 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 28758265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 1736370 - 1736294
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1736370 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 1736294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 505 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592742
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 40592770  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaaa 630  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  40592769 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaaa 40592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 48438236 - 48438312
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48438236 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 48438312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 6794778 - 6794703
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6794778 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 6794703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 21152324 - 21152243
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21152324 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 21152243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 23866649 - 23866568
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23866649 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacatgtcatttc 23866568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709779
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaa 30709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 526 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33386731 - 33386669
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386731 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3715963
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3715990  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  3715989 ttagcttacaaac-ttacacaagaacaa 3715963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 683 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738743
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct- 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||| ||| || ||||| || |||   |||||   ||||||||| ||||||     
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcaatccaagttt-ctctctc 8738828  T
Q  782 tgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    | |||||    ||| |   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  8738827 taagctcttccaagctctccttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagacttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc 8738743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 45610949 - 45611031
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45610949 tgtaacaccccgttactcaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggtatgctacacgtcatttc 45611031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 40372531 - 40372476
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40372531 gcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgatttcc 40372476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 3783646 - 3783572
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  3783646 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 3783572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 17596032 - 17596106
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  17596032 tgtaacaccccgtcacccaaaagcaata-aaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 17596106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 537 - 600
Target Start/End: Original strand, 26299021 - 26299086
Alignment:
Q  537 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26299021 taatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 26299086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 269
Target Start/End: Original strand, 37538969 - 37539029
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37538969 ttttaatctcaaccattctttt-taatctaatggttcataatcattctcatcattctcatat 37539029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 811 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 2671321 - 2671268
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2671321 gcacaagaacacaatatata--ctagtcttcctctgaagaaatcgtgtcacgattt 2671268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671405
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2671405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477642
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 8477642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 801 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 9091046 - 9090981
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttcc 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  9091046 cttcaaaaaagcacaagaacacaata--tatactagacttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc 9090981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 10767039 - 10767122
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagc-atataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10767039 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 10767122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 25795803 - 25795879
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25795803 ccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa 25795879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372615
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 40372615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923895
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaa 47923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 50656894 - 50656813
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  50656894 tgtaacaccccgttacccgaaagcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcatttc 50656813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 898 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 3554564 - 3554490
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  3554564 ctgtaacaccccgttacccaaa-gcaata-aaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 3554490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 40844674 - 40844777
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  40844674 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 40844771  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  40844772 gaacaa 40844777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Original strand, 1309819 - 1309878
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaa 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||    
T  1309819 caagataagcaagaaaggaagaacaaacacacc-aaaagattgttgacccagttcagccaa 1309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 505 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 587  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 535 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 4386983 - 4386947
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 571  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386983 cctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 683 - 734
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167530
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatg-tttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 734  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 7167530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091120
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctc 9091120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 600
Target Start/End: Original strand, 37466313 - 37466388
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  37466313 ccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 37466388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 39040057 - 39039995
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040057 ccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 51854638 - 51854585
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  51854638 tgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaat 51854585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328346
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 3328346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 811 - 882
Target Start/End: Original strand, 7167607 - 7167674
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||||    
T  7167607 gcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaatcgtgccatgattttc--aaatcgtgtcac 7167674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 11965677 - 11965644
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaata 932  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11965677 tgtaacaccccgttacccaaaaacaatttaaata 11965644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 811 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 27352356 - 27352289
Alignment:
Q  811 gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  27352356 gcacaagaacacaatatatat--tagccttcctctgaagcaatcgtgccacgatttcc--aaatcgtgtcac 27352289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 48775482 - 48775430
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||    
T  48775482 ctgtaacaccccgttacccaaaagc-atttaaataacaaatattcatcagagta 48775430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 572
Target Start/End: Original strand, 53894082 - 53894119
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 572  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894082 cctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 31109872 - 31109266
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109872 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 31109774  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaa 497  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31109773 aagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaa 31109676  T
Q  498 caccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 596  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109675 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 31109576  T
Q  597 agaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 696  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109575 agactctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 31109476  T
Q  697 caatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccata-ggatcctctctttgatctccaag-ttttctctcttgagctca----- 789  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||| || |||   ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||         
T  31109475 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgctatccaagtttttctctcttaagctcatacaa 31109376  T
Q  790 -------cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
           |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  31109375 gctctctcttaagtttatcttcaaaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcac 31109278  T
Q  883 catctgcaacgg 894  Q
     |||||||||||    
T  31109277 gatctgcaacgg 31109266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 300 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024010
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaa-ccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctc 398  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 24024520  T
Q  399 caagccaaccacaacaaaacagtccta-gactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaa 496  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24024519 caagcaaacaacaacaaaacag-cctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaa 24024421  T
Q  497 a-caccgag-aagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 594  Q
    | ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24024420 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgtta 24024321  T
Q  595 caagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 694  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24024320 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacggtgat 24024221  T
Q  695 tacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctca----- 789  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| ||||||   ||||||         
T  24024220 tacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctc-aaagctcatacaa 24024122  T
Q  790 -------cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcac 882  Q
           |||| |  |  ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  24024121 gctctctcttatgtcttacttcaaaaaagcacaagaacac----tatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcac 24024026  T
Q  883 catctgcaacggtccc 898  Q
     |||||||||||||||    
T  24024025 gatctgcaacggtccc 24024010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 321 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 21812508 - 21811932
Alignment:
Q  321 gaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |||    
T  21812508 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cag 21812410  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
     ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21812409 ccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 21812310  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaa-gct 615  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  21812309 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtgaa-gtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagct 21812211  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacct 714  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21812210 ttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacct 21812112  T
Q  715 aagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcac 814  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  21812111 aagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgacctccaagctttctctcttaagttctcttaaggttagcttcaaaaaagcac 21812012  T
Q  815 aagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtc 896  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  21812011 aagaacacaata--tatactagtcctgccctgagtaaatcgtgccacgatttcccaagatcgtgacacaatctgcaacggtc 21811932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 323 - 787
Target Start/End: Original strand, 19992130 - 19992597
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagtc 422  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||| ||| |    
T  19992130 aaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaa-cagcc 19992228  T
Q  423 ctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttcaccca 519  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19992229 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 19992328  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19992329 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagcttta 19992428  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-cccaacctaag 717  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19992429 cacatgaacaaaccctagaacta-ccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaag 19992527  T
Q  718 aaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagct 787  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19992528 aaacactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccctctttgacctccaagttttctctcttaagct 19992597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 322 - 894
Target Start/End: Original strand, 12396729 - 12397310
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||     
T  12396729 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12396827  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaagg-aagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12396828 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 12396926  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  12396927 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcctttaatcttta 12397026  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12397027 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 12397126  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct---------tgagctcacttaaggttatcttcaaaaa 809  Q
     ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| |  ||||||||||    
T  12397127 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcatacaagctctcttaagttcttcttcaaaaa 12397226  T
Q  810 a-gcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12397227 aggcacaagaacaca--atatatactagtattcctctgaagaaatcgtgccacgatttccccaaatcgtgtcacgatttgcaacgg 12397310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 322 - 747
Target Start/End: Original strand, 12406149 - 12406575
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||     
T  12406149 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12406247  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12406248 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccca 12406346  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12406347 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 12406446  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12406447 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 12406546  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccat 747  Q
     ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  12406547 gacactctcaacaaagacactcaacccat 12406575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 323 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 24261592 - 24261013
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  24261592 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24261493  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  24261492 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 24261396  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24261395 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 24261296  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24261295 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaac 24261197  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaag 811  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | |||||||  ||    
T  24261196 ctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagtttcctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatgag 24261097  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtcc 897  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  24261096 cacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgatgaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgattttcaacggtcc 24261013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 323 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 24266471 - 24266006
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  24266471 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24266372  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  24266371 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 24266275  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24266274 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 24266175  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24266174 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 24266076  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24266075 ctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 24266006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 16879889 - 16880469
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  16879889 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16879988  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16879989 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 16880085  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  16880086 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 16880185  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||| |||||    
T  16880186 ttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgtttttccaac 16880284  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaag 811  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | |||||||  ||    
T  16880285 ctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagtttcctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatgag 16880384  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16880385 cacaagaacac--tttaaatactagtcctgcccagaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 16880469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Original strand, 16884745 - 16885324
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  16884745 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16884844  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16884845 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 16884941  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  16884942 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 16885041  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||  ||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16885042 ttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttcccaac 16885140  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggtt-atcttcaaaaaag 811  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | |||||||  ||    
T  16885141 ctaagattcactctcatcaaaggaacaca-cccaaaggatcccatctttgatctccaagtttcctctcttaagttctctcaaggttaaccttcaaatgag 16885239  T
Q  812 cacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16885240 cacaagaacac--tttaaatactagtcctgcccagaagaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 16885324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 322 - 594
Target Start/End: Original strand, 4866547 - 4866820
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4866547 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagt 4866645  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaa-cacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4866646 cctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgaccc 4866744  T
Q  519 agttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 594  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866745 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357463
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctggggg 547  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  20357698 aaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggggg 20357601  T
Q  548 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||    
T  20357600 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctaccc 20357501  T
Q  646 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357500 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 20357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Original strand, 2057806 - 2058147
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa-cagtcctagactagtgtatagcaaaaacacac 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | |||||||| || || ||||||| |||||    
T  2057806 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 2057904  T
Q  450 aaagagctaacaa-gcataaa----caagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctg 543  Q
    |||||| || ||| ||| |||    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2057905 aaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 2058004  T
Q  544 ggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  2058005 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattc 2058103  T
Q  640 cacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
     |||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058104 tacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 1533579 - 1533359
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1533579 aaacaatataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaat 1533480  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatg-aacaaaccctagatccacccctttggtattttcccac 661  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  1533479 ccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccac 1533381  T
Q  662 tctcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1533380 tctcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21639988
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 21639869  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||    
T  21639870 ccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21639968  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21639969 tcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646186
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaat 21646067  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||| || || ||| |||||||    
T  21646068 ccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 21646166  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  21646167 tcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408943
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 18408824  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  || ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  18408825 ccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactc 18408923  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18408924 tcacaatatgaaccctaaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413819
Alignment:
Q  470 caagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18413606 caagataagcaagaaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatcca 18413703  T
Q  569 atatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctca 666  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| || ||||| ||||||| ||||||  ||||| | |  ||| || || ||| ||||||||||    
T  18413704 ctatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctca 18413802  T
Q  667 cactatgaaccctaaaa 683  Q
    || ||||||||||||||    
T  18413803 caatatgaaccctaaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 685 - 894
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873526
Alignment:
Q  685 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttg- 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||       
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgttatccaagttctctctctaag 4873409  T
Q  784 --------agctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatc 875  Q
            ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  4873410 ctcttccaagctctcttaagttcttcttcaaaaaagcacaagaacacaatat--atactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccctagatc 4873507  T
Q  876 gtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  4873508 gtgtcacgatttgcaacgg 4873526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159929
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 29159902  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  29159903 ttagcttacaagc-ttacacaagaacaa 29159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 790 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 24265974 - 24265868
Alignment:
Q  790 cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24265974 cttaaggttaccttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgc 24265877  T
Q  890 aacggtccc 898  Q
    |||||||||    
T  24265876 aacggtccc 24265868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 506 - 629
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983411
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa--ggttacaagaat 601  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||     
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaa 21983384  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21983385 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 21983411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 892 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 40685634 - 40685553
Alignment:
Q  892 cggtccctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  40685634 cggtacctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 40685553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 46649090 - 46649172
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46649090 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacagatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 46649172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 17727191 - 17727110
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccaca-cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17727191 tgtaacaccccgttaccaaaaaacaatt-aaataacatttatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcatttc 17727110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 269
Target Start/End: Original strand, 23956539 - 23956608
Alignment:
Q  199 taagtgaggttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctcatat 269  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23956539 taagtgaggttt-aatctcaatcattcctttttaatctaatgattcatattcattctcatcattctcatat 23956608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 900 - 980
Target Start/End: Original strand, 32626699 - 32626780
Alignment:
Q  900 gtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32626699 gtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 32626780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 749152 - 749226
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  749152 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 749226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 11878369 - 11878452
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11878369 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 11878452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 18438030 - 18437950
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  18438030 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttaaacatcagagtaatccgcaacgggcatgctacacatcattt 18437950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 48988793 - 48988719
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  48988793 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 48988719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 826 - 894
Target Start/End: Original strand, 12406594 - 12406662
Alignment:
Q  826 atatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12406594 atatatactagtcttcctctgaagaaatcgtgccacgatttccccaaatcgtgtcacgatttgcaacgg 12406662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13964854 - 13964772
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13964854 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatatacatcagagtaattccacaacggacatgctacacgtcatttc 13964772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 15630779 - 15630861
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15630779 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 15630861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 37284512 - 37284594
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37284512 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 37284594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516281
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaat 601  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 46516308  T
Q  602 ctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
     ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  46516307 ttagcttaaaagc-ttacacaagaacaa 46516281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 8214170 - 8214089
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8214170 tgtaacaccccgttacccaaaaacagta-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgttacacgtcattt 8214089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 30603686 - 30603603
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa---tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||    
T  30603686 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaacatacatcagagtaattctacaaacgggcatgctacacgtcatttc 30603603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332449
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaacc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| ||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33332449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Original strand, 42057820 - 42057901
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42057820 tgtaacaccccgttacccaaaaacagta-aaatagcatataaacatcagagtaatcccacaacgggcatgttacacgtcattt 42057901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 44848750 - 44848684
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44848750 cctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 44848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091759
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 49091759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 2027094 - 2027011
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccaca--cgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2027094 tgtaacaccccgttacccaaaaacaata-acatagcatatatacatcagagtaattccacaaacgggcatgctacacgtcatttc 2027011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 2647771 - 2647667
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  2647771 ccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 2647673  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  2647672 gaacaa 2647667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 11300511 - 11300437
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  11300511 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 11300437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 39050167 - 39050241
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  39050167 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcatataaacattagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 39050241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 641855 - 641937
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac--acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  641855 tgtaacaccccgttactcaaaaacaatt-aaataacatttacacatcagagtaatccacaaatgggcatgctacacgtcatttc 641937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 2580412 - 2580515
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatg 624  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |    
T  2580412 ccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaatagcttgcaagc-ttacacaag 2580510  T
Q  625 aacaa 629  Q
    |||||    
T  2580511 aacaa 2580515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357231
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | || |||   ||||| | |||||||| |||| | |    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgttatccaagttctctcac-t 20357312  T
Q  783 gagctcacttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
     |||||    ||| |   |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  20357311 aagctctaccaagctctccttc-aaaaagcacaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagcaatcgtgccacgattt 20357231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 40923833 - 40923752
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  40923833 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcatttc 40923752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 55970 - 56073
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||     
T  55970 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaa 56067  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  56068 gaacaa 56073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 2280359 - 2280433
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  2280359 tgtaacaccccgttacccaaaaggaata-aaatagcatataaacatcagagtattacaccaaacgggcatgctaca 2280433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190008
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa 9190008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284186
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaa 20284186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Original strand, 33404048 - 33404128
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33404048 tgtaacatcccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttatatatcagagtaatccacaacgggcatgctacacatcattt 33404128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533263
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 1533263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 727
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058246
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctc 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2058246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 588
Target Start/End: Original strand, 35960847 - 35960901
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960847 cctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 535 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 4796733 - 4796638
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  4796733 cctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaattagcttataagc-ttacacaagaacaa 4796638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 5188161 - 5188088
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctaca 971  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  5188161 tgtaacaccccgttacccaaa-gcaata-aaataacatataaacatcagagtaattccacaaacgggcatgctaca 5188088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 471 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 28617356 - 28617258
Alignment:
Q  471 aagataagcaagaaaggaagaa--caaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 566  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||   || |||||| |||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28617356 aagataagcaagaaaggaagaaaacaaacacacc---aatattgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatc 28617260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 629
Target Start/End: Original strand, 2479368 - 2479461
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2479368 cctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 2479461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 977
Target Start/End: Complemental strand, 12404829 - 12404751
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcat 977  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||    
T  12404829 tgtaacaccccgttacccaaatgcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcat 12404751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 26090814 - 26090741
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat--ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||  | | ||||||||||||||    
T  26090814 tgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaattccaaaacgggcatgctaca 26090741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7040575 - 7040517
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctca 266  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7040575 ttttaatgttaaccatttgtttttaatctgatgactcacattcattctcatcattctca 7040517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 801 - 866
Target Start/End: Original strand, 21640157 - 21640220
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgattt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||    
T  21640157 cttcaaaatagcacaagaacaca--atatatactagtctccttctgaagcaatcgtgtcacgattt 21640220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 22994515 - 22994598
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22994515 tgtaacaccccgttacccaaaagtaaaataaataaca-ataatcatcagagtatttcaccaaacgggtatgctacacgtcatttc 22994598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 801 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 24789712 - 24789636
Alignment:
Q  801 cttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtca 881  Q
    ||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  24789712 cttcaaagatgcacaagaacac--tttatatactagccttcctctgaagcaatcgtgtcacgatttcc--aaatcgtgtca 24789636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 898 - 979
Target Start/End: Original strand, 49149843 - 49149924
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||    
T  49149843 ctgtaacaccccgttacccaaaa-caataaatatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcattt 49149924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9185231 - 9185178
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185231 cctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 15811437 - 15811511
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  15811437 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatacaaaatattcatcagagtaattcaccaaacgggcatgctaca 15811511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Original strand, 49156534 - 49156614
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||    
T  49156534 tgtaacaccccgttacccaaaa-caataaatatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcattt 49156614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 300 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9514
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9930 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctcc 9831  T
Q  400 aagccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaca 499  Q
    || | ||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9830 aaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaca 9732  T
Q  500 ccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9731 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 9632  T
Q  600 atctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 699  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9631 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatcta-ccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 9533  T
Q  700 tgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9532 tgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 591 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3528
Alignment:
Q  591 gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 690  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  691 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacacccca-taggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctca 789  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||| | || |||   ||||| | |||||||| |||||    ||||||    
T  3746 tgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgctatccaagttctctctacaaagctca 3647  T
Q  790 ----------cttaaggttatcttc--aaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgt 877  Q
              |||||| |  ||| |  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  3646 tacaatctctcttaagttcttctacaaaaaaaagcacaagaataca--atatatactagtcttcccctgaagaaatcgtgtcacgattttcctagatcgt 3549  T
Q  878 gtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  3548 gtcacgatctgcaacggtccc 3528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 1
Alignment:
Q  301 gttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 400  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||    
T  170 gttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctcca 77  T
Q  401 agccaaccacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc 479  Q
    ||  ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  76 agtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 294; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 322 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 35329 - 34749
Alignment:
Q  322 aaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  35329 aaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 35231  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcaccca 519  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35230 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaaccca 35132  T
Q  520 gttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-tctagctttcaagcttta 618  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  35131 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagcttta 35032  T
Q  619 cacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  35031 cacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttcccaaacccaaga 34932  T
Q  719 aacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctct---------tgagctcacttaaggttatcttcaaaaa 809  Q
     ||||||||| ||||| ||| || ||||| || |||   ||||| | |||||||| |||||||           ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  34931 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgctatccaagttctctctctaagctcatacaagctctcttaagattcacttcaaaaa 34832  T
Q  810 agcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34831 agcaaaagaacaca--atatatactagtcttcctctgaagaaatagtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 34749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 19433 - 18855
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  19433 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 19334  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  19333 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 19237  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19236 cagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 19137  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacc 713  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19136 ttacacaagacaaaaccctagatctaccc-tttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 19038  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctcttgagctcacttaaggttatcttcaaaaaagca 813  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||    
T  19037 taagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccatctttgatctccaagttttctctcttaagttctctcaaggttgtcttcaaaaaagca 18938  T
Q  814 caagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    |||||||||  | || ||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  18937 caagaacac--tttaaatattagtcctgccctgaagaaatcgtgccacgatttccttagatcgtgtcacgatttgcaacggtccc 18855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 323 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 14578 - 14113
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  14578 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 14479  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  14478 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 14382  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagc 614  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14381 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 14282  T
Q  615 tttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaac 712  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14281 tttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaac 14183  T
Q  713 ctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14182 ctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 14113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 790 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 14081 - 13975
Alignment:
Q  790 cttaaggttatcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgc 889  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14081 cttaaggttaccttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgc 13984  T
Q  890 aacggtccc 898  Q
    |||||||||    
T  13983 aacggtccc 13975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 242; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 149224 - 148635
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  149224 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 149125  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  149124 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat--acaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacc 149028  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  149027 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 148928  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  148927 ttacacaagacaaaaccatagatcta-ccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 148829  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt--gagctc---------acttaaggttatct 802  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||   | |||          |||||||||| ||    
T  148828 taagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctccttgacctccaagttatcactcttccaacctctcaaggttgtcttaaggttacct 148729  T
Q  803 tcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  148728 tcaaataagcacaagaacac--tttatatactagtcctgccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 148635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 323 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 1930
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaacagt 421  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||     
T  2519 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2420  T
Q  422 cctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcacc 517  Q
    |  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  2419 ctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 2323  T
Q  518 cagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctt-tcaagct 615  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2322 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 2223  T
Q  616 ttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacc 713  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2222 ttacacaagacaaaaccatagatcta-ccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacc 2124  T
Q  714 taagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt--gagctc---------acttaaggttatct 802  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||   | |||          |||||||||| ||    
T  2123 taagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccctccttgacctccaagttatcactcttccaacctctcaaggttgtcttaaggttacct 2024  T
Q  803 tcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacggtccc 898  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2023 tcaaataagcacaagaacac--tttatatactagtcctgccctgaagaaatcgtgtcacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacggtccc 1930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 96; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18087 - 17869
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18087 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 17988  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  17987 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 17889  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17888 tcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 467 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24180 - 23962
Alignment:
Q  467 aaacaagataagcaagaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 565  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180 aaacaagataagaaagaaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 24081  T
Q  566 ccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatccacccctttggtattttcccactc 663  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  | ||| | |  ||| || || ||| |||||||    
T  24080 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactc 23982  T
Q  664 tcacactatgaaccctaaaa 683  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23981 tcacaatatgaaccctaaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17783
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 17783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23876
Alignment:
Q  683 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 23876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 300 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34239 - 34136
Alignment:
Q  300 tgttgtgaatcaagttccaaagaaaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 399  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34239 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 34140  T
Q  400 aagc 403  Q
    ||||    
T  34139 aagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 323 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 182233 - 181980
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataa-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacca-caacaaaacag 420  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  182233 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 182134  T
Q  421 tcctagactagtgtatagcaaaaacacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa---gaacaaaacaccgag-aagattgttcac 516  Q
     |  || ||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | ||| |||   |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  182133 cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgac 182037  T
Q  517 ccagttcaaccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 573  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182036 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 643 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 176922 - 176781
Alignment:
Q  643 ccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt--tttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacac 740  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  176922 ccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacac 176823  T
Q  741 accccataggatcctctctttgatctccaagttttctctctt 782  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  176822 accccaaaggatcccctctttgatctccaagttatctctctt 176781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 800 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 176737 - 176645
Alignment:
Q  800 tcttcaaaaaagcacaagaacacaatatatatactagtcttcccctgaagaaatcttgtcacgatttccctaaatcgtgtcaccatctgcaacgg 894  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||| |  ||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  176737 tcttcaaaagagcacaagaacac--tttaaatactagtcctgtcctgaggaaatcgtgccacgatttccctagatcgtgtcacgatctgcaacgg 176645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 300
Alignment:
Q  351 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaaccacaacaaaa--cagtcctagactagtgtatagcaaaaacaca 448  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| |||| |||||||   ||||||| ||||    
T  487 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccaca 389  T
Q  449 caaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttcacccagttcaaccaatgtggcct 537  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  388 caaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 323 - 390
Target Start/End: Original strand, 13166 - 13233
Alignment:
Q  323 aaccttcacaccaataaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13166 aaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8419
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 898 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 19382 - 19299
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19382 ctgtaacaccccgttactcaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 19299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 31157 - 31075
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagta-atccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31157 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtagttccacaacgggcatgctacacgtcatttc 31075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 540 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 44022 - 43945
Alignment:
Q  540 tctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctt 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||    
T  44022 tctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaatagcttgcaagctt 43945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36804
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaatc 602  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||      
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 36830  T
Q  603 tagctttcaagctttacacatgaacaa 629  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  36829 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaa 36804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 600
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85780
Alignment:
Q  506 agattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa 85780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 10507 - 10589
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat-ccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10507 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaatcccacaacgggcatgctacacgtcatttc 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 901 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 13085 - 13008
Alignment:
Q  901 taacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac--acgggcatgctacacgtca 976  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13085 taacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcaaatatacatcagagtaattccacatacgggcatgctacacgtca 13008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 13046 - 12964
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13046 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattccacaacgggcatgctacacgtcatttc 12964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 898 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10913
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10995 ctgtaacaccccgttacccaaaaatcaattaaataacatttatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacatcattt 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 971
Target Start/End: Original strand, 8536 - 8610
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctaca 971  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  8536 tgtaacaccccgttacccaaaaacaattt-aatagcatataaacatcagagtatttcaccaaacgggcatgctaca 8610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 629
Target Start/End: Original strand, 10751 - 10855
Alignment:
Q  526 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagaatctagctttcaagctttacacat 623  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| |||||||     
T  10751 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaattagtttacaagc-ttacacaa 10849  T
Q  624 gaacaa 629  Q
    ||||||    
T  10850 gaacaa 10855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 907 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 33534 - 33462
Alignment:
Q  907 cccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccaca-cgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33534 cccgttacccaaaaacaatt-aaataacatttatacatcagagtaatccacaacgggcatgctacacgtcattt 33462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 899 - 979
Target Start/End: Complemental strand, 16870 - 16790
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccac-acgggcatgctacacgtcattt 979  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16870 tgtaacaccccgttacccaaaaacaa-ttaaataacatttatacaacagagtaattcacaacgggcatgctacacgtcattt 16790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2150
Description:

Target: scaffold2150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 859 - 940
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccac-acgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  859 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagca-atatacatcagagtaattccacaacggacatgctacatgtcatttc 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 958
Target Start/End: Original strand, 63950 - 64008
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaatccaca 958  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  63950 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacatttatacatcagagtaatccaca 64008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 590
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  505 aagattgttcacccagttcaa-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 590  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 133346 - 133280
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaa 600  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  133346 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaa 133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 899 - 980
Target Start/End: Original strand, 49262 - 49343
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa-tccacacgggcatgctacacgtcatttc 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||    
T  49262 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-taaaatagcataaatacatcagagtaatttcacaacggcatgttacacgtcatttc 49343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 535 - 587
Target Start/End: Original strand, 45284 - 45337
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45284 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 972
Target Start/End: Original strand, 31183 - 31258
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat---ccacacgggcatgctacac 972  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  31183 tgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaataacaaatattcatcagagtaattcaccaaacgggcatgctacac 31258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 898 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 9264 - 9226
Alignment:
Q  898 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcata 937  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9264 ctgtaacaccccgttacccaaaagcaa-ttaaatagcata 9226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 899 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 434
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaat 953  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  487 tgtaacaccccgttacccaaaagc-agtaaaatagcataaatacatcagagtaat 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16858 - 16800
Alignment:
Q  208 ttttaatctcaaccattcttttttaatctaatgactcatatttattctcatcattctca 266  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16858 ttttaatgttaaccatttgtttttaatctgatgactcacattcattctcatcattctca 16800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8777
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaata 932  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8810 tgtaacaccccgttacccaaaaacaatttaaata 8777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 23301 - 23268
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaata 932  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23301 tgtaacaccccgttacccaaaaacaatttaaata 23268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 568
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  535 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 568  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 952
Target Start/End: Original strand, 146407 - 146459
Alignment:
Q  899 tgtaacaccccgttacccaaaagcaatttaaatagcatataaacatcagagtaa 952  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  146407 tgtaacaccccgttacacaaaagcaa-ttaaataatatataatcatcagagtaa 146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University