View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5682_high_2 (Length: 934)

Name: NF5682_high_2
Description: NF5682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5682_high_2
NF5682_high_2
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (549-924)||(41806110-41806484)
chr8 (217-549)||(30410154-30410486)
chr8 (312-549)||(28644562-28644799)
chr8 (223-550)||(30405651-30405961)
chr8 (18-192)||(41805942-41806116)
chr8 (354-549)||(33071918-33072113)
chr8 (354-549)||(42234656-42234851)
chr8 (354-549)||(38757003-38757186)
chr8 (598-834)||(41800036-41800270)
chr8 (396-550)||(43807485-43807641)
chr8 (396-549)||(43812044-43812199)
chr8 (396-551)||(202202-202361)
chr8 (396-551)||(317039-317198)
chr8 (396-550)||(197684-197842)
chr8 (396-550)||(312521-312679)
chr8 (453-549)||(41945339-41945434)
chr8 (449-550)||(41949801-41949902)
chr8 (836-904)||(42034087-42034154)
chr8 (237-285)||(38757253-38757301)
chr8 (229-285)||(28644826-28644882)
chr8 (192-255)||(38757331-38757395)
chr8 (371-425)||(27435169-27435223)
chr8 (42-139)||(41799727-41799824)
chr8 (209-249)||(28644850-28644890)
chr8 (192-260)||(30410105-30410174)
chr8 (224-256)||(30405629-30405661)
chr8 (192-260)||(30405585-30405654)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (312-549)||(30695293-30695530)
chr5 (354-549)||(32485947-32486143)
chr5 (312-550)||(40367531-40367758)
chr5 (354-549)||(19502307-19502504)
chr5 (354-550)||(26336767-26336965)
chr5 (192-549)||(40371549-40371892)
chr5 (354-549)||(36632314-36632497)
chr5 (364-529)||(43384972-43385138)
chr5 (396-550)||(7099374-7099532)
chr5 (396-550)||(12023288-12023446)
chr5 (396-549)||(7103943-7104100)
chr5 (396-549)||(12018731-12018888)
chr5 (396-550)||(16798668-16798826)
chr5 (396-549)||(16794108-16794265)
chr5 (368-501)||(20830304-20830437)
chr5 (396-549)||(10274546-10274698)
chr5 (441-555)||(10277198-10277312)
chr5 (192-285)||(30695558-30695651)
chr5 (396-550)||(37682035-37682182)
chr5 (549-696)||(278541-278689)
chr5 (396-549)||(37658732-37658878)
chr5 (427-501)||(20808675-20808749)
chr5 (236-285)||(12018997-12019047)
chr5 (236-284)||(7099217-7099266)
chr5 (236-284)||(7103786-7103835)
chr5 (236-284)||(16798935-16798984)
chr5 (238-284)||(16794374-16794421)
chr5 (93-163)||(278834-278904)
chr5 (236-285)||(12023566-12023616)
chr5 (192-284)||(37658985-37659082)
chr5 (718-834)||(278393-278511)
chr5 (236-284)||(37682289-37682340)
chr5 (192-234)||(40367386-40367427)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (309-550)||(27761396-27761638)
chr7 (309-549)||(27756846-27757087)
chr7 (312-543)||(47419498-47419729)
chr7 (309-549)||(22901154-22901396)
chr7 (368-550)||(35705633-35705815)
chr7 (354-549)||(7466485-7466669)
chr7 (360-536)||(733634-733811)
chr7 (396-550)||(7940083-7940241)
chr7 (396-549)||(7944636-7944793)
chr7 (192-257)||(27757188-27757252)
chr7 (192-285)||(47419376-47419470)
chr7 (377-537)||(13828087-13828248)
chr7 (236-285)||(7939926-7939976)
chr7 (236-285)||(7944479-7944529)
chr7 (236-285)||(22901420-22901470)
chr7 (236-285)||(27757111-27757161)
chr7 (236-285)||(27761662-27761712)
chr7 (192-260)||(22901505-22901573)
chr7 (192-260)||(27761699-27761767)
chr7 (441-537)||(37355573-37355669)
chr7 (217-257)||(22901497-22901537)
chr7 (191-257)||(7939807-7939875)
chr7 (192-257)||(7944385-7944452)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (191-550)||(21850198-21850574)
chr3 (192-550)||(21847108-21847483)
chr3 (354-549)||(9105275-9105470)
chr3 (354-549)||(11004365-11004560)
chr3 (354-550)||(43547722-43547920)
chr3 (354-549)||(9697586-9697783)
chr3 (396-550)||(54171924-54172082)
chr3 (396-550)||(54167344-54167502)
chr3 (396-549)||(39399127-39399279)
chr3 (353-473)||(43554645-43554765)
chr3 (549-819)||(24685192-24685444)
chr3 (600-795)||(24631841-24632035)
chr3 (368-488)||(755891-756012)
chr3 (472-550)||(43554291-43554371)
chr3 (617-692)||(24682519-24682594)
chr3 (583-745)||(24653501-24653664)
chr3 (396-501)||(38175790-38175894)
chr3 (236-285)||(54167186-54167236)
chr3 (236-285)||(54171766-54171816)
chr3 (446-479)||(755824-755857)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (309-549)||(39793831-39794070)
chr1 (309-549)||(16588395-16588635)
chr1 (192-549)||(26311522-26311868)
chr1 (309-550)||(26316012-26316240)
chr1 (354-550)||(43591783-43591979)
chr1 (396-550)||(10504435-10504588)
chr1 (192-285)||(26316253-26316348)
chr1 (190-285)||(16588275-16588370)
chr1 (237-285)||(39794097-39794145)
chr1 (192-246)||(39794198-39794250)
chr1 (192-246)||(39796802-39796854)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (309-549)||(8319960-8320199)
chr6 (309-550)||(8315421-8315662)
chr6 (309-550)||(27552026-27552268)
chr6 (309-549)||(17779914-17780155)
chr6 (354-549)||(17096236-17096431)
chr6 (312-551)||(27574657-27574886)
chr6 (360-549)||(17895691-17895881)
chr6 (354-549)||(14531749-14531945)
chr6 (360-550)||(17886816-17887001)
chr6 (217-285)||(8319866-8319935)
chr6 (237-285)||(8315348-8315396)
chr6 (224-285)||(27574569-27574630)
chr6 (225-285)||(17886692-17886753)
chr6 (396-511)||(6440865-6440979)
chr6 (192-285)||(17096075-17096167)
chr6 (447-488)||(17163689-17163730)
chr6 (191-246)||(8315266-8315319)
chr6 (246-285)||(17895589-17895628)
chr6 (192-261)||(27535334-27535404)
chr6 (446-484)||(7888212-7888250)
chr6 (192-246)||(8319806-8319858)
chr6 (447-536)||(17159610-17159700)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (229-550)||(31670089-31670411)
chr4 (354-550)||(53722006-53722202)
chr4 (354-549)||(10317025-10317220)
chr4 (354-550)||(8892582-8892779)
chr4 (354-549)||(27186142-27186341)
chr4 (354-556)||(43683636-43683826)
chr4 (396-550)||(44151557-44151715)
chr4 (396-549)||(3770842-3770999)
chr4 (396-549)||(44147023-44147180)
chr4 (354-550)||(50627904-50628088)
chr4 (396-549)||(41884925-41885076)
chr4 (354-453)||(35842843-35842942)
chr4 (396-550)||(31359150-31359303)
chr4 (396-551)||(49274517-49274670)
chr4 (454-549)||(31354678-31354772)
chr4 (217-285)||(44151819-44151889)
chr4 (192-260)||(44147345-44147414)
chr4 (192-260)||(44151856-44151925)
chr4 (355-515)||(53785880-53786039)
chr4 (236-285)||(3771106-3771156)
chr4 (236-285)||(44147284-44147334)
chr4 (446-498)||(45976222-45976274)
chr4 (190-256)||(53722313-53722380)
chr4 (472-522)||(35842797-35842847)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (309-550)||(8055391-8055632)
chr2 (309-549)||(8050839-8051079)
chr2 (309-549)||(6463355-6463583)
chr2 (354-549)||(12999426-12999622)
chr2 (396-550)||(36670502-36670660)
chr2 (396-550)||(36675050-36675208)
chr2 (387-549)||(13270980-13271131)
chr2 (396-550)||(35950443-35950596)
chr2 (209-285)||(12999289-12999366)
chr2 (396-549)||(41093824-41093976)
chr2 (191-257)||(8055698-8055763)
chr2 (217-285)||(8055656-8055726)
chr2 (236-285)||(8051103-8051153)
chr2 (224-285)||(6463272-6463332)
chr2 (449-536)||(29767953-29768041)
chr2 (396-484)||(34590280-34590366)
chr2 (236-285)||(36670768-36670820)
chr2 (236-285)||(36675316-36675368)
chr2 (192-257)||(8051180-8051247)
chr2 (458-495)||(27403696-27403733)
[»] scaffold0440 (4 HSPs)
scaffold0440 (396-550)||(2979-3137)
scaffold0440 (396-550)||(7505-7662)
scaffold0440 (224-285)||(7772-7833)
scaffold0440 (192-257)||(7836-7902)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (396-550)||(44865-45023)
scaffold0044 (396-549)||(49445-49602)
scaffold0044 (236-285)||(44708-44758)
scaffold0044 (236-285)||(49288-49338)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 549 - 924
Target Start/End: Original strand, 41806110 - 41806484
Alignment:
Q  549 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 648  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806110 attctcttcagtgcttatagaagcccgtcttacattctttctacagttaacattc-tcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 41806208  T
Q  649 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806209 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagaaaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 41806308  T
Q  749 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatctcttctggttcagaagagagaaacctaca 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41806309 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatctcttctggttcagaagagagaaacctaca 41806408  T
Q  849 ttttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccatcgaatgcgacctatgattct 924  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41806409 ttttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccatcgaatgcgacctgtgattct 41806484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 217 - 549
Target Start/End: Original strand, 30410154 - 30410486
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttat 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||    
T  30410154 gaagctagttcagaagc-agttcagaagctagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttat 30410252  T
Q  316 gatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaa 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30410253 gatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaa 30410352  T
Q  416 tgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattat 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30410353 tgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattat 30410452  T
Q  516 cactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30410453 cactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 312 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 28644799 - 28644562
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28644799 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaa 28644700  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28644699 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 28644600  T
Q  512 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28644599 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 223 - 550
Target Start/End: Original strand, 30405651 - 30405961
Alignment:
Q  223 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||||||||||    
T  30405651 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaa 30405750  T
Q  323 ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 422  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30405751 ttgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaaca 30405850  T
Q  423 aactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 522  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||||||||    
T  30405851 aattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca-----------------gaatgtgattatcactaaa 30405933  T
Q  523 ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405934 ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 30405961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 41805942 - 41806116
Alignment:
Q  18 ctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41805942 ctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggac 41806041  T
Q  118 ttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggatgtgtattctct 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41806042 ttgctcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggacgtgtattctct 41806116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 598 - 834
Target Start/End: Original strand, 41800036 - 41800270
Alignment:
Q  598 acattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatc 697  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  41800036 acattccccttgttcttcgggacctataaaatcaaataaccaggagaatctaacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaaggaaatgcaca 41800135  T
Q  698 taactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatc-tttttcctgac 796  Q
    | ||||||||||   |||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  || ||||||||| ||||||||||     
T  41800136 tcactttggagaataaaaaacagaagtaag----atatttagaagattcacggcttgtgtttttctacctcgtttgagctcctacatcttttttcctgaa 41800231  T
Q  797 ttttctgtgctgcttgttttatc-tcttctggttcagaa 834  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41800232 ttttctgtgcttcttgttttatcttcttctagttcagaa 41800270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807641
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  494 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43807641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  494 attaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202361
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 551  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 202361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317198
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 551  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 317198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 197684 - 197842
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 197842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312679
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 312679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  453 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 449 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949801
Alignment:
Q  449 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaac 548  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  549 at 550  Q
    ||    
T  41949802 at 41949801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 836 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 42034154 - 42034087
Alignment:
Q  836 agagaaacctacattttgtgtttgtctaatgatcaagtgaacttgcatggtattcaaagcaactcccat 904  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42034154 agagaaacctacatcttgtgtttgtctaatg-tcaagtgaacttgcttggcattcaaagcaactcccat 42034087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38757301 - 38757253
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38757301 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 38757253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28644882 - 28644826
Alignment:
Q  229 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28644882 gaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 28644826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38757395 - 38757331
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagcagttcagaag 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38757395 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactcttcagaagcagttcagaag 38757331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 425
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435223
Alignment:
Q  371 tagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 425  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaac 27435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Original strand, 41799727 - 41799824
Alignment:
Q  42 ttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctg 139  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  41799727 ttatcatagattattagaaactagcttgcaacgatagttaacttgattagttaagtgttcttattccgcataggacttactcttgcatagagactctg 41799824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28644890 - 28644850
Alignment:
Q  209 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagtt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28644890 cagaagcggaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtt 28644850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Original strand, 30410105 - 30410174
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30410105 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30410174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 256
Target Start/End: Original strand, 30405629 - 30405661
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405629 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 30405661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Original strand, 30405585 - 30405654
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30405585 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30405654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 312 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 30695530 - 30695293
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695530 ttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 30695431  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30695430 gcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 30695331  T
Q  512 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695330 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486143
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 312 - 550
Target Start/End: Original strand, 40367531 - 40367758
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtt-gcttgaagcaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40367531 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcaca 40367630  T
Q  411 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  40367631 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtg 40367718  T
Q  511 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40367719 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 40367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgt-aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26336965
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacat 26336965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 192 - 549
Target Start/End: Original strand, 40371549 - 40371892
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttc-agaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  40371549 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgtttagaagcagttttagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaattagag 40371646  T
Q  290 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 389  Q
                       || |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371647 agagaattgagagagaagaaaattatgatgaaattgtagttgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 40371746  T
Q  390 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaa 489  Q
    | |              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40371747 aac--------------cacaaacaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaa 40371832  T
Q  490 tgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371833 tgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||            |||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 364 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384972
Alignment:
Q  364 aaggaggtagctt-atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaa 462  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  463 caaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaact 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaact 43384972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099532
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7099532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023288
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 12023288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798668
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 16798668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 368 - 501
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830437
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 467  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  468 ttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 501  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20830437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 441 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10277312 - 10277198
Alignment:
Q  441 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 540  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277312 ctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaac 10277213  T
Q  541 aaactaacattctct 555  Q
    |||||||||| ||||    
T  10277212 aaactaacatcctct 10277198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30695651 - 30695558
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30695651 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagtttcagaagtagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 30695558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37682035
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| | ||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 37682035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 549 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 278689 - 278541
Alignment:
Q  549 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 648  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || |   |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  278689 attctcttcagtgcttatagaagcacacctaatcatcttcctacatttaacattcctcttgttctttgggacctataatatcaaatgacaaggagaattt 278590  T
Q  649 cacaaaatc-aaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcat 696  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  278589 cagaaaatcaaaatccaaaccataaaccgtggtggaaaaggaaatgcat 278541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaat-gt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||| | ||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 501
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808749
Alignment:
Q  427 ctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca 501  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaacca 20808749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12019047 - 12018997
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12019047 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12018997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 7099217 - 7099266
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7099217 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7099266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 7103786 - 7103835
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7103786 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7103835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16798984 - 16798935
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16798984 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16798935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16794421 - 16794374
Alignment:
Q  238 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16794421 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16794374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 278904 - 278834
Alignment:
Q  93 taagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctact 163  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278904 taagtgttgttattccacaaaagacttactcttgcatagaggctctgtggatcagtagcaggacctctact 278834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12023616 - 12023566
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12023616 gttcaaaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12023566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37659082 - 37658985
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37659082 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37658985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 718 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 278511 - 278393
Alignment:
Q  718 cagtagtaagtgaaatatttagaagatttacgg--cttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttt 815  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| | ||  ||| ||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  278511 cagtagtaagggagacatttagaagattcatgggccttctgtttgtta-cctcatttgagctcctagatctttttcctgaattttctgtgcttgtggttt 278413  T
Q  816 tat-ctcttctggttcagaa 834  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  278412 tatcctcttctggttcagaa 278393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37682340 - 37682289
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37682340 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37682289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Original strand, 40367386 - 40367427
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40367386 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagct 40367427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 27761638 - 27761396
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761638 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27761539  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27761538 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgattaaccactgatt 27761439  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761438 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27761396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 27757087 - 27756846
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757087 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27756988  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  27756987 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgattaaccactgatt 27756888  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27756887 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 312 - 543
Target Start/End: Original strand, 47419498 - 47419729
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47419498 ttatgatgaaattgtaattgatttttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaa 47419597  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtga 511  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47419598 acaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 47419697  T
Q  512 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419698 ttatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 22901396 - 22901154
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaat-tgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901396 aagttatgatgaatttgtaaaatgatctttattgattctacatacaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagc 22901298  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  22901297 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgat 22901198  T
Q  507 tgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901197 tgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 368 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 35705815 - 35705633
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 467  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35705815 aggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 35705717  T
Q  468 ttcat-aacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705716 tccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 360 - 536
Target Start/End: Original strand, 733634 - 733811
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  733634 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattg 733733  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 536  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || |||| |||||||| || |   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  733734 taacaaatttcataacaaactaactgaatatgtgattaaccatttaaacatgattatcactaatctaaacttgaatta 733811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940241
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7940241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27757252 - 27757188
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757252 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 27757188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Original strand, 47419376 - 47419470
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagca-gttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419376 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctctgttcgaaagctcgttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 47419470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 537
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828248
Alignment:
Q  377 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 476  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  477 aactaaaacaaaatgtaattaacc-attgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 537  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||| | | |   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaa 13828248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 7939926 - 7939976
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7939926 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7939976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 7944479 - 7944529
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7944479 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7944529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22901470 - 22901420
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22901470 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 22901420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27757161 - 27757111
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27757161 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 27757111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27761712 - 27761662
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27761712 gttcagaagcagttcagaagcagtttctaattctaaggttttatgtgaatt 27761662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22901573 - 22901505
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22901573 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagtttagaagctagttaagaagcagtt 22901505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27761767 - 27761699
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27761767 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtt 27761699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 37355669 - 37355573
Alignment:
Q  441 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-aatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaa 537  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  37355669 ctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcact-aggtaaacttgaattaa 37355573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22901537 - 22901497
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901537 gaagctagtttagaagctagttaagaagcagttcagaagca 22901497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 7939807 - 7939875
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7939807 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7939875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Original strand, 7944385 - 7944452
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7944385 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7944452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 191 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21850574 - 21850198
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta--------------gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850574 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 21850475  T
Q  277 -atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 375  Q
     |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21850474 tatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 21850375  T
Q  376 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850374 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 21850275  T
Q  476 aaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21850274 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 192 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21847483 - 21847108
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct--------------agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-ttt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21847483 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttt 21847384  T
Q  277 atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 376  Q
    |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847383 atgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 21847284  T
Q  377 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847283 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 21847184  T
Q  477 aactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaatt-aaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21847183 aactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacat 21847108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547722
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697586
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167502
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54167502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43554765 - 43554645
Alignment:
Q  353 aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaac 452  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43554765 aaaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaac 43554666  T
Q  453 aaacttgtaacaaacttcata 473  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43554665 aaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 549 - 819
Target Start/End: Original strand, 24685192 - 24685444
Alignment:
Q  549 attctcttcagtgcatatagaagcccatcttacattctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct 648  Q
    ||||||||| |||| |||| || | ||||| | ||||||  | || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24685192 attctcttctgtgcttataaaaccacatctcatattcttcatgcatttaacattcctcttgttcttggggacctataaaatcaaataaccagaagaatct 24685291  T
Q  649 cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttac 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                   |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |    
T  24685292 cacaaaatcaaacacaaaccataaactgtgcaggaaaa------------------agagagagaaaaacagtggtaagtgcaacatttagaagattcgc 24685373  T
Q  749 ggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctgacttttctgtgctgcttgttttatc 819  Q
    ||||| |||||||| |||||| || || |||||  |||||||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  24685374 ggcttttgtttgtctacctcagtcgagctcctaggtctttttcctgaattctctctgcttctggttttatc 24685444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 600 - 795
Target Start/End: Original strand, 24631841 - 24632035
Alignment:
Q  600 attcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaatgcatcta 699  Q
    |||||||||||||   |||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||  |||||| ||||| ||| |     
T  24631841 attcctcttgttctttgggactaataaaatcaaataaccgggataatctcacaaaatcgaaaacagaccataaattgtgttggaaaaagaaatccatatc 24631940  T
Q  700 actttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatttacggcttgtgtttgtcaacctcattcaagttcctacatctttttcctga 795  Q
    |||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  24631941 acttggaagaga-agaaacattagtaagtgaaatatttagaagatttgtggcttgtatctgtctacctcattcaagctcctggatctttttcctga 24632035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755891
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatctactaac-ctctaacaaacttgtaacaa 465  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttat-tagttacactctaacaaacttgtaacaa 755914  T
Q  466 acttcataacaaactaaaacaaa 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  755913 acttcaaaacaaactaaaacaaa 755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554291
Alignment:
Q  472 taacaaactaaaa-caaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43554291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 617 - 692
Target Start/End: Original strand, 24682519 - 24682594
Alignment:
Q  617 ggacctataaaatcaaataacaaggagaatctcacaaaatcaaacacaaaccataaactttgcaggaaaaggaaat 692  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24682519 ggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcataaaatcaaacgcaaacaataaactgtgcaggaaaagtaaat 24682594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 745
Target Start/End: Original strand, 24653501 - 24653664
Alignment:
Q  583 ttctttctacagttaacattcctcttgttccgcgggacctataaaatcaaataacaaggagaatct--cacaaaatcaaacacaaaccataaactttgca 680  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  24653501 ttcttcctacatttaacattcctctctttctttcggacctataaaatcaaagaaccaggagaatctcgcataaaatcaaacacacacaataaactgtgca 24653600  T
Q  681 gg--aaaaggaaatgcatctaactttggagagagaaaaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 745  Q
    ||  ||||| |||||||| | | | |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24653601 ggaaaaaagtaaatgcatatca-tatggaaaaag--aaacagtagtaagtgaaatatttagaagatt 24653664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 501
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175894
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  496 taacca 501  Q
    ||||||    
T  38175889 taacca 38175894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 54167186 - 54167236
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54167186 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 54171766 - 54171816
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54171766 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54171816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 39794070 - 39793831
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794070 aagttatgatgaaaatgtaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 39793972  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  39793971 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagattaaccactgattg 39793872  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793871 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Original strand, 16588395 - 16588635
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16588395 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaaca 16588494  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  16588495 caagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattg 16588594  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588595 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 192 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 26311868 - 26311522
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        
T  26311868 tgattgcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagattttgattctaaggtttatgtgaattagag 26311769  T
Q  290 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 389  Q
                       |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26311768 agagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatct 26311670  T
Q  390 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaa 489  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||    
T  26311669 agctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaa 26311582  T
Q  490 tgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311581 tgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26316240 - 26316012
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26316240 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26316142  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  26316141 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattg 26316054  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316053 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 26316012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43591979
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 43591979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26316348 - 26316253
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26316348 tgatagcgcagaaaaaccagaaacggaagcttgtttagaagcactgttcagaagttagttcagaagcagtttttaattctaaggtttatgtgaatt 26316253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Original strand, 16588275 - 16588370
Alignment:
Q  190 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaag--cagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16588275 tctgatagcacagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcataagcttgttcagaagctctgtacagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 16588370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39794145 - 39794097
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39794145 ttcagaagcagttcagaagtagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 39794097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39794250 - 39794198
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39794250 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39794198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39796854 - 39796802
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39796854 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39796802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Original strand, 8319960 - 8320199
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8319960 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacata-agaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagca 8320058  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  8320059 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaaccactgattg 8320158  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8320159 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Original strand, 8315421 - 8315662
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315421 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 8315519  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgtaattaaccattgatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  8315520 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgatt 8315619  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315620 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8315662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Original strand, 27552026 - 27552268
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552026 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacgaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27552125  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27552126 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgatt 27552225  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552226 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27552268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 17780155 - 17779914
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780155 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 17780056  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  17780055 caagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattg 17779956  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaatt-aaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17779955 tgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 312 - 551
Target Start/End: Original strand, 27574657 - 27574886
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 410  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574657 ttatggtgaaattgtaattgattcttattgattttccatacgaaaaatgttcaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 27574756  T
Q  411 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtg 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27574757 agcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtg 27574845  T
Q  511 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574846 attatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 27574886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 360 - 549
Target Start/End: Original strand, 17895691 - 17895881
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17895691 tacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg 17895790  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895791 taacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531945
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 360 - 550
Target Start/End: Original strand, 17886816 - 17887001
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  17886816 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaactt- 17886914  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
          |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886915 -----tactttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 17887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Original strand, 8319866 - 8319935
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8319866 gaagctagttcagaagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8319935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 8315348 - 8315396
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8315348 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Original strand, 27574569 - 27574630
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27574569 gttcagaagctagttcagaagcagtttgagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 27574630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 17886692 - 17886753
Alignment:
Q  225 ttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17886692 ttcagaagcaagttcagaagctagttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 511
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  496 taaccattgattgtga 511  Q
    |||||| | |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Original strand, 17096075 - 17096167
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17096075 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagcttgttcataagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 17096167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163689
Alignment:
Q  447 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa 488  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaa 17163689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 246
Target Start/End: Original strand, 8315266 - 8315319
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8315266 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8315319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 285
Target Start/End: Original strand, 17895589 - 17895628
Alignment:
Q  246 agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17895589 agttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17895628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 27535334 - 27535404
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct-agttcagaagc-agttcagaagcagttt 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27535334 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagctagttcataagtagttt 27535404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 446 - 484
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888250
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 484  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaa 7888250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Original strand, 8319806 - 8319858
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8319806 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8319858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  447 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa-ccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 536  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | || || | | | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcactaatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 229 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 31670411 - 31670089
Alignment:
Q  229 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgta 327  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||||||||||||||    
T  31670411 gaagctagttcagaagttagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgta 31670312  T
Q  328 attgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactc 427  Q
    | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31670311 aatgatctttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactc 31670213  T
Q  428 tagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaa 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31670212 tagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaa 31670113  T
Q  527 acttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31670112 acttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722006
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317220
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8892779
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8892779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186142
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataac-aaact--aaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 354 - 556
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683826
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacattct 553  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaaac-aactaacattgt 43683823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151557
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 44151557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628088
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||||            ||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50628004 aacttg------------taacaaactaaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaacat 50628088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31359150
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||| ||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31359150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274670
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 551  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatt 49274670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354678
Alignment:
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || | |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44151889 - 44151819
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44151889 gaagctagttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44151819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44147414 - 44147345
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44147414 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44147345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44151925 - 44151856
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44151925 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44151856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 53786039 - 53785880
Alignment:
Q  355 aaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaa 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||   |||   ||||||||    
T  53786039 aaatgtacaaag-aggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaacccta-actatataagctagtttctaacaa 53785942  T
Q  455 acttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca--aaatgtaattaaccattgattgtgattat 515  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  53785941 acttgtaacaaa-ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3771156 - 3771106
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3771156 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 3771106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44147334 - 44147284
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44147334 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44147284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 498
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976274
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaa 498  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaa 45976274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53722380 - 53722313
Alignment:
Q  190 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagc 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  53722380 tctgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagcaggttctgaagcactgttcagaagc 53722313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  472 taacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcactaaa 522  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8055632 - 8055391
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055632 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 8055534  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8055533 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8055434  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055433 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 8055391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 8051079 - 8050839
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051079 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagc 8050981  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  8050980 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8050881  T
Q  508 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050880 gtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Original strand, 6463355 - 6463583
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6463355 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 6463454  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattg 508  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6463455 caaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattg 6463542  T
Q  509 tgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6463543 tgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 354 - 549
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999622
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36675050
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36675050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 387 - 549
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  387 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 486  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  487 aaatgtaattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35950596
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35950596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Original strand, 12999289 - 12999366
Alignment:
Q  209 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999289 cagaagcggaagctagtccagaagctaattcagaagctagttcagaagcagtttctgatcctaaggtttatgtgaatt 12999366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  496 taaccattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8055763 - 8055698
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055763 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 8055698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8055726 - 8055656
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055726 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8055656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8051153 - 8051103
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051153 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8051103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Original strand, 6463272 - 6463332
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6463272 gttcagaaattagttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 6463332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  449 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaattaacca-ttgattgtgattatcactaaactaaacttgaatta 536  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 484  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36670820 - 36670768
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36670820 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36670768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36675368 - 36675316
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36675368 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36675316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8051247 - 8051180
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8051247 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 8051180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 495
Target Start/End: Original strand, 27403696 - 27403733
Alignment:
Q  458 tgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtaat 495  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27403696 tgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtaat 27403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2979
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 2979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7505
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgta 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  494 attaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 7505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7772
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7833 gttcagaagc-agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7902 - 7836
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  7902 tgatagcgcagaaaatt-agaagcggaagcttgttcagaagcaagttcagaagcactgttcagaagca 7836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45023
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 550  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 45023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 549
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaa-atgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  493 aattaaccattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 549  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 44708 - 44758
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44708 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 49288 - 49338
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49288 gttcagaagcagttcataagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 49338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University