View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5682_low_1 (Length: 1029)

Name: NF5682_low_1
Description: NF5682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5682_low_1
NF5682_low_1
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (309-1014)||(27760932-27761638)
chr7 (396-1014)||(7940083-7940705)
chr7 (377-1014)||(13828087-13828727)
chr7 (309-550)||(27756846-27757087)
chr7 (309-550)||(22901154-22901396)
chr7 (312-544)||(47419498-47419729)
chr7 (368-551)||(35705633-35705815)
chr7 (354-550)||(7466485-7466669)
chr7 (527-996)||(22580480-22580948)
chr7 (396-550)||(7944636-7944793)
chr7 (360-482)||(733634-733756)
chr7 (192-257)||(27757188-27757252)
chr7 (192-285)||(47419376-47419470)
chr7 (236-285)||(7939926-7939976)
chr7 (236-285)||(7944479-7944529)
chr7 (236-285)||(22901420-22901470)
chr7 (236-285)||(27757111-27757161)
chr7 (236-285)||(27761662-27761712)
chr7 (192-260)||(22901505-22901573)
chr7 (192-260)||(27761699-27761767)
chr7 (217-257)||(22901497-22901537)
chr7 (441-520)||(37355589-37355669)
chr7 (191-257)||(7939807-7939875)
chr7 (192-257)||(7944385-7944452)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (191-1014)||(21849734-21850574)
chr3 (396-1014)||(54167344-54167966)
chr3 (472-1014)||(43553827-43554371)
chr3 (542-1014)||(53353126-53353604)
chr3 (192-552)||(21847107-21847483)
chr3 (354-550)||(9697586-9697783)
chr3 (354-551)||(43547722-43547920)
chr3 (354-550)||(11004365-11004560)
chr3 (354-550)||(9105275-9105470)
chr3 (396-551)||(54171924-54172082)
chr3 (353-473)||(43554645-43554765)
chr3 (396-550)||(39399127-39399279)
chr3 (368-487)||(755892-756012)
chr3 (396-503)||(38175790-38175896)
chr3 (236-285)||(54167186-54167236)
chr3 (236-285)||(54171766-54171816)
chr3 (526-595)||(1299022-1299088)
chr3 (446-479)||(755824-755857)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (309-1014)||(8054927-8055632)
chr2 (396-1014)||(36674586-36675208)
chr2 (396-1014)||(35950443-35951060)
chr2 (309-550)||(8050839-8051079)
chr2 (354-550)||(12999426-12999622)
chr2 (309-550)||(6463355-6463583)
chr2 (396-551)||(36670502-36670660)
chr2 (387-550)||(13270980-13271131)
chr2 (209-285)||(12999289-12999366)
chr2 (396-550)||(41093824-41093976)
chr2 (191-257)||(8055698-8055763)
chr2 (217-285)||(8055656-8055726)
chr2 (236-285)||(8051103-8051153)
chr2 (224-285)||(6463272-6463332)
chr2 (396-484)||(34590280-34590366)
chr2 (449-537)||(29767953-29768041)
chr2 (236-285)||(36670768-36670820)
chr2 (236-285)||(36675316-36675368)
chr2 (192-257)||(8051180-8051247)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (309-1014)||(8315421-8316126)
chr6 (360-1014)||(17886816-17887467)
chr6 (309-736)||(27552026-27552453)
chr6 (734-1014)||(27568524-27568805)
chr6 (309-550)||(8319960-8320199)
chr6 (309-550)||(17779914-17780155)
chr6 (354-550)||(17096236-17096431)
chr6 (360-550)||(17895691-17895881)
chr6 (354-550)||(14531749-14531945)
chr6 (447-744)||(17163431-17163730)
chr6 (312-551)||(27574657-27574885)
chr6 (586-789)||(3596333-3596539)
chr6 (885-1009)||(23256016-23256140)
chr6 (217-285)||(8319866-8319935)
chr6 (237-285)||(8315348-8315396)
chr6 (224-285)||(27574569-27574630)
chr6 (225-285)||(17886692-17886753)
chr6 (396-511)||(6440865-6440979)
chr6 (192-285)||(17096075-17096167)
chr6 (939-994)||(3596272-3596327)
chr6 (542-624)||(8855275-8855358)
chr6 (542-624)||(23256303-23256385)
chr6 (446-501)||(7888212-7888268)
chr6 (191-246)||(8315266-8315319)
chr6 (447-537)||(17159610-17159700)
chr6 (246-285)||(17895589-17895628)
chr6 (192-261)||(27535334-27535404)
chr6 (192-246)||(8319806-8319858)
chr6 (543-576)||(3597592-3597625)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (223-1014)||(30405651-30406425)
chr8 (396-1014)||(197684-198306)
chr8 (396-1014)||(312521-313143)
chr8 (396-1014)||(43807485-43808105)
chr8 (449-1014)||(41949345-41949902)
chr8 (539-1014)||(1290859-1291335)
chr8 (562-1014)||(31473324-31473777)
chr8 (371-1016)||(27435169-27435805)
chr8 (217-550)||(30410154-30410486)
chr8 (312-550)||(28644562-28644799)
chr8 (18-192)||(41805942-41806116)
chr8 (354-550)||(33071918-33072113)
chr8 (354-550)||(42234656-42234851)
chr8 (354-550)||(38757003-38757186)
chr8 (396-551)||(202202-202360)
chr8 (396-551)||(317039-317197)
chr8 (396-550)||(43812044-43812199)
chr8 (543-757)||(17782356-17782570)
chr8 (453-550)||(41945339-41945434)
chr8 (887-1011)||(17782650-17782774)
chr8 (237-285)||(38757253-38757301)
chr8 (229-285)||(28644826-28644882)
chr8 (192-255)||(38757331-38757395)
chr8 (42-139)||(41799727-41799824)
chr8 (209-249)||(28644850-28644890)
chr8 (609-721)||(44912814-44912925)
chr8 (192-260)||(30410105-30410174)
chr8 (224-256)||(30405629-30405661)
chr8 (192-260)||(30405585-30405654)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (309-1014)||(26315548-26316240)
chr1 (354-1014)||(43591783-43592443)
chr1 (309-550)||(39793831-39794070)
chr1 (309-550)||(16588395-16588635)
chr1 (192-550)||(26311522-26311868)
chr1 (396-551)||(10504435-10504588)
chr1 (526-1014)||(30646900-30647386)
chr1 (192-285)||(26316253-26316348)
chr1 (190-285)||(16588275-16588370)
chr1 (237-285)||(39794097-39794145)
chr1 (192-246)||(39794198-39794250)
chr1 (192-246)||(39796802-39796854)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (354-1014)||(8892582-8893243)
chr4 (396-1014)||(44151093-44151715)
chr4 (354-1014)||(50627904-50628552)
chr4 (396-1014)||(31358687-31359303)
chr4 (229-551)||(31670089-31670411)
chr4 (354-551)||(53722006-53722202)
chr4 (354-550)||(10317025-10317220)
chr4 (354-550)||(27186142-27186341)
chr4 (396-550)||(3770842-3770999)
chr4 (396-550)||(44147023-44147180)
chr4 (354-543)||(43683636-43683813)
chr4 (354-453)||(35842843-35842942)
chr4 (396-550)||(41884925-41885076)
chr4 (396-551)||(49274517-49274669)
chr4 (217-285)||(44151819-44151889)
chr4 (192-260)||(44147345-44147414)
chr4 (192-260)||(44151856-44151925)
chr4 (446-501)||(45976222-45976277)
chr4 (355-515)||(53785880-53786039)
chr4 (236-285)||(3771106-3771156)
chr4 (236-285)||(44147284-44147334)
chr4 (454-550)||(31354678-31354772)
chr4 (543-678)||(29258261-29258396)
chr4 (472-522)||(35842797-35842847)
chr4 (190-256)||(53722313-53722380)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (396-1014)||(12022824-12023446)
chr5 (396-1014)||(7099374-7099996)
chr5 (396-1014)||(16798204-16798826)
chr5 (396-1014)||(37681571-37682182)
chr5 (312-904)||(40367531-40368112)
chr5 (441-1014)||(10276739-10277312)
chr5 (354-697)||(26336767-26337111)
chr5 (312-550)||(30695293-30695530)
chr5 (542-1016)||(26454406-26454881)
chr5 (354-550)||(32485947-32486143)
chr5 (354-550)||(19502307-19502504)
chr5 (192-550)||(40371549-40371892)
chr5 (354-550)||(36632314-36632497)
chr5 (396-550)||(12018731-12018888)
chr5 (396-550)||(7103943-7104100)
chr5 (396-550)||(16794108-16794265)
chr5 (364-537)||(43384960-43385138)
chr5 (368-498)||(20830304-20830434)
chr5 (192-285)||(30695558-30695651)
chr5 (396-550)||(37658732-37658878)
chr5 (542-1016)||(25632261-25632735)
chr5 (396-550)||(10274546-10274698)
chr5 (427-498)||(20808675-20808746)
chr5 (236-285)||(12018997-12019047)
chr5 (690-792)||(30066992-30067094)
chr5 (236-284)||(7099217-7099266)
chr5 (236-284)||(7103786-7103835)
chr5 (236-284)||(16798935-16798984)
chr5 (238-284)||(16794374-16794421)
chr5 (93-163)||(278834-278904)
chr5 (236-285)||(12023566-12023616)
chr5 (192-284)||(37658985-37659082)
chr5 (236-284)||(37682289-37682340)
chr5 (192-234)||(40367386-40367427)
[»] scaffold0440 (4 HSPs)
scaffold0440 (396-1014)||(7041-7662)
scaffold0440 (396-795)||(2735-3137)
scaffold0440 (224-285)||(7772-7833)
scaffold0440 (192-257)||(7836-7902)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (396-1014)||(44865-45487)
scaffold0044 (396-550)||(49445-49602)
scaffold0044 (236-285)||(44708-44758)
scaffold0044 (236-285)||(49288-49338)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (447-548)||(60201-60302)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 309 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 27761638 - 27760932
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761638 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27761539  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  27761538 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtgattaaccactgatt 27761439  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgat 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27761438 gtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgat 27761340  T
Q  608 gaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 707  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27761339 gaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctccctt 27761240  T
Q  708 agaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctatag 807  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27761239 agaaaatgaaactttgtttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctatag 27761140  T
Q  808 gtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttga 906  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761139 gtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttga 27761040  T
Q  907 caatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctcca 1006  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27761039 caatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctcca 27760940  T
Q  1007 caccaatc 1014  Q
    ||||||||    
T  27760939 caccaatc 27760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940705
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7940282  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7940283 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 7940382  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940383 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 7940482  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7940483 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 7940582  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940583 agactcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 7940682  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  7940683 tcttgtctgtctccacaccaatc 7940705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 377 - 1014
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828727
Alignment:
Q  377 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 476  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  477 aactaaaacaacatgtgattaatca-ctgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattag-aacaa-actaacatcctcccttaattcaagtttcca 573  Q
    ||| |||  || |||||||||| || || |   |||||||||||||   |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaagg-taaacttgaattaacaactagactaacatcctcccttaattcaagtttcca 13828285  T
Q  574 cttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaac 673  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  13828286 cttccttcatgccaatcaaacttctgagcttgatgaacccgtcaacctttaatgc-ttagtgaatatgtctgcaagttgcagctcagtggagcaatggac 13828384  T
Q  674 aatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagctt 773  Q
    |||||  | ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13828385 aatctacaatgcacctttgtttacttgctccctcaaaaaatgaaacttagcctctatgtgtttgcttcttccatgcaaaactggatttcttgctaagctt 13828484  T
Q  774 atagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttcca 873  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  13828485 attgtagatttgttatctatgaacaatgcaataggtatactaacttctatctccatcttcttgagtatattttcaagccatattgtctgacatgctgcca 13828584  T
Q  874 taca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggta 972  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  13828585 tacaccctgcaatatactcagactcacaggttgacaatgccacaactggtttcttcttagcacaccatgaaattggggcattcaggaacttgaataggta 13828684  T
Q  973 ccctga-agtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
     |||||  |||||||| ||||| || || ||| ||||||||||    
T  13828685 acctgagtgtgctcttcctatcctgcttatctacacaccaatc 13828727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 27757087 - 27756846
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757087 aagttatgatgaaaattgtaaatgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27756988  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  27756987 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgcgattaaccactgatt 27756888  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27756887 gtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 22901396 - 22901154
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaat-tgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22901396 aagttatgatgaatttgtaaaatgatctttattgattctacatacaaaa-tatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagc 22901298  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaac-aacatgtgattaatcactgat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22901297 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgat 22901198  T
Q  507 tgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22901197 tgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 312 - 544
Target Start/End: Original strand, 47419498 - 47419729
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47419498 ttatgatgaaattgtaattgatttttattgattctacatacgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaa 47419597  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtga 511  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47419598 acaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 47419697  T
Q  512 ttatcactaaaactaaacttgaattagaacaaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47419698 ttatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 368 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35705815 - 35705633
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 467  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35705815 aggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaac 35705717  T
Q  468 ttcat-aacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35705716 tccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 7466485 - 7466669
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7466485 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 7466584  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||            |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7466585 aacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 527 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 22580948 - 22580480
Alignment:
Q  527 aacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaat 626  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||      
T  22580948 aacttgaatta--acaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactttcaccatactaattatgcttcttagcttgatgaacgtgtcaaccttcata 22580851  T
Q  627 gccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggctt 726  Q
    |  || ||||| |  ||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||| |    
T  22580850 ggtttggtgaacaaatctgcaagctgcagttcagtggagcagtgaacaatcttcaatgcttccttgtttacttgttctataagaaaatggaatttggcct 22580751  T
Q  727 ctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctc 826  Q
    | || |||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||| || ||    
T  22580750 caatgtgcttgctccttccatgtaaaactggatttttagctaagtttatagttgatttgttgtctataaacaaacctataggtttgttaacctcaatttc 22580651  T
Q  827 catctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccatac-acctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgc 925  Q
    ||||||||  ||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |  | || |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||    
T  22580650 catctcctcaagtataacttcaagccaaactgcttgacaagctgctaggcaacatgcaatgtactcagattcacaggttgaaaatactaccacttgttgc 22580551  T
Q  926 ttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttg 996  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| | ||  ||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||    
T  22580550 ttctaagcacaccaagagattggagcatttagaaatttgaatatgtagcctaaggtactctttctatcttg 22580480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 733634 - 733756
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  733634 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaaattg 733733  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaa 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  733734 taacaaatttcataacaaactaa 733756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27757252 - 27757188
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27757252 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 27757188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Original strand, 47419376 - 47419470
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagca-gttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47419376 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctctgttcgaaagctcgttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 47419470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 7939926 - 7939976
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7939926 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7939976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 7944479 - 7944529
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7944479 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7944529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22901470 - 22901420
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22901470 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 22901420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27757161 - 27757111
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27757161 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 27757111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27761712 - 27761662
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27761712 gttcagaagcagttcagaagcagtttctaattctaaggttttatgtgaatt 27761662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22901573 - 22901505
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22901573 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagtttagaagctagttaagaagcagtt 22901505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27761767 - 27761699
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27761767 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtt 27761699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22901537 - 22901497
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22901537 gaagctagtttagaagctagttaagaagcagttcagaagca 22901497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37355669 - 37355589
Alignment:
Q  441 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgtgattaatcactgattgtgattatcacta 520  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  37355669 ctaatctctaagaaacttgtaacaactttcataacaaactaaagcaataatatgattaaccactaagtgtgattatcacta 37355589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 7939807 - 7939875
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7939807 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7939875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Original strand, 7944385 - 7944452
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7944385 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 7944452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 577; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 191 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 21850574 - 21849734
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta--------------gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850574 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttt 21850475  T
Q  277 -atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 375  Q
     |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21850474 tatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagct 21850375  T
Q  376 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850374 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 21850275  T
Q  476 aaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaa-caaactaacatcctcccttaattcaagtttccac 574  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccac 21850175  T
Q  575 ttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaaca 674  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21850174 ttccttcattccaataaagcttctgagcttgttgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaaca 21850075  T
Q  675 atctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagctta 774  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850074 atctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagctta 21849975  T
Q  775 tagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccat 874  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  21849974 tagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctaacatgctgccat 21849875  T
Q  875 aca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtac 973  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21849874 acaccctgcaatatattcagattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtac 21849775  T
Q  974 cctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21849774 cctgaagtactctttctatcttgtctgtctccacaccaatc 21849734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167966
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 54167543  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167544 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 54167643  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167644 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 54167743  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  54167744 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttaagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 54167843  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54167844 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 54167943  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  54167944 tcttgtctgtctccacaccaatc 54167966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 472 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43553827
Alignment:
Q  472 taacaaactaaaa-caacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagttt 570  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatctccccttaattcaagttt 43554272  T
Q  571 ccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatg 670  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  43554271 ccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatg 43554172  T
Q  671 aacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaag 770  Q
    ||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554171 aacaatctacaatgcttccttgttcactagctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaag 43554072  T
Q  771 cttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgctt 870  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43554071 attataccatatttgttgtctatgaacaatgccataggtctgctaacctatatctccatctatttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgctg 43553972  T
Q  871 ccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaatag 969  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43553971 ccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccgtgaaattggagcattcataaacttgaatag 43553872  T
Q  970 gtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  43553871 gtaccctgaagtgctctttctatcctatttgtctccacaccaatc 43553827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 542 - 1014
Target Start/End: Original strand, 53353126 - 53353604
Alignment:
Q  542 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgat-----gaacctgtcaaccttcaatgccttagtga 636  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  53353126 aaactagcatcctctcttaatttaagtttccacttccttcatgccaatcaagcttctgagcttgatatgatgaacctgtcaaccttcaatgcttttgtga 53353225  T
Q  637 atatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgctt 736  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || || | |||||||||    
T  53353226 atatgtctgcaagctgcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcacttgctcccttagaaaatggaatttagcctttatatgctt 53353325  T
Q  737 gcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttg 836  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  53353326 gcttctcccatgcagaactggatttattgctaagcttatagcatatttgttgtcgatgaacaatgctataggtctgctaacctctatctccatttcctta 53353425  T
Q  837 agtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcac 935  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53353426 agtatattttcaagtcatactgcctgacatgctgtcatacatcctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactggttgtttcttagcac 53353525  T
Q  936 accatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53353526 accatgaaattggagcatttaagaacttaaataggtaccctgaagtgctctttctatcctgcttgtctccacaccaatc 53353604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 192 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21847483 - 21847107
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct--------------agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-ttt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21847483 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttt 21847384  T
Q  277 atgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 376  Q
    |||||||||                       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847383 atgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaaatgatctttattgattctatatacaaaaatgtacaaaggaggtagctt 21847284  T
Q  377 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847283 atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataaca 21847184  T
Q  477 aactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaatt-agaacaaactaacatc 552  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21847183 aactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacatc 21847107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9697783 - 9697586
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9697783 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 9697684  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9697683 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 354 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 43547920 - 43547722
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43547920 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 43547821  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43547820 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 11004365 - 11004560
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11004365 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 11004464  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11004465 aacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 9105470 - 9105275
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9105470 aaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaaca 9105371  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9105370 aacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 353 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43554765 - 43554645
Alignment:
Q  353 aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaac 452  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  43554765 aaaaatatacaaaagaggtagctcatatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaac 43554666  T
Q  453 aaacttgtaacaaacttcata 473  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43554665 aaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 756012 - 755892
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatctactaac-ctctaacaaacttgtaacaa 465  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  756012 aggtagcttatatacaccatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttat-tagttacactctaacaaacttgtaacaa 755914  T
Q  466 acttcataacaaactaaaacaa 487  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  755913 acttcaaaacaaactaaaacaa 755892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 503
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175896
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  496 taatcact 503  Q
    ||| ||||    
T  38175889 taaccact 38175896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 54167186 - 54167236
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54167186 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 54171766 - 54171816
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54171766 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggatttatgcgaatt 54171816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1299088 - 1299022
Alignment:
Q  526 aaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct 595  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||    
T  1299088 aaacttgaattagaa---actaacatcctcccttaattcaagtttccaattctaccataccaatcaagct 1299022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 755857 - 755824
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaac 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  755857 ctctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaac 755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 576; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 309 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 8055632 - 8054927
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055632 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 8055534  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  8055533 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8055434  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgat 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8055433 gtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgat 8055335  T
Q  608 gaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 707  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055334 gaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaaactgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 8055235  T
Q  708 agaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctatag 807  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8055234 agaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgtagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctatag 8055135  T
Q  808 gtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttga 906  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055134 gtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttga 8055035  T
Q  907 caatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctcca 1006  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8055034 caatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtctcca 8054935  T
Q  1007 caccaatc 1014  Q
    ||||||||    
T  8054934 caccaatc 8054927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36674586
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccgtaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 36675009  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36675008 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 36674909  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674908 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 36674809  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36674808 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 36674709  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674708 agactcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 36674609  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  36674608 tcttgtctgtctccacaccaatc 36674586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35951060
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct 595  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct 35950640  T
Q  596 cctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttc 695  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35950641 tctaagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgtagctcagtggagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttc 35950740  T
Q  696 acttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatga 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950741 acttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcataactggatttattgctaagcttatagcagatttgttgtctatga 35950840  T
Q  796 acaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcaga 894  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35950841 acaattatataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcaga 35950940  T
Q  895 ttcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatct 994  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35950941 ttcacagattgacaatgccacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtactctttctatct 35951040  T
Q  995 tgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  35951041 tgaatgtctccacaccaatc 35951060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8051079 - 8050839
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaa-ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051079 aagttatgatgaaaattgtaaaagatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggcagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagc 8050981  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  8050980 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaatagaatgtgattaaccactgatt 8050881  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8050880 gtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 12999426 - 12999622
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12999426 aaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaaca 12999525  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12999526 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Original strand, 6463355 - 6463583
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6463355 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatactaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 6463454  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6463455 caaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattg 6463542  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6463543 tgattatcact-aaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 387 - 550
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  387 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca 486  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  487 acatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Original strand, 12999289 - 12999366
Alignment:
Q  209 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12999289 cagaagcggaagctagtccagaagctaattcagaagctagttcagaagcagtttctgatcctaaggtttatgtgaatt 12999366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8055763 - 8055698
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055763 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagttcagaagca 8055698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8055726 - 8055656
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8055726 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8055656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8051153 - 8051103
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8051153 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 8051103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Original strand, 6463272 - 6463332
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6463272 gttcagaaattagttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 6463332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa 484  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  449 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg-tgattatcactaaaactaaacttgaatta 537  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||| | | |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaa-ctaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36670820 - 36670768
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36670820 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36670768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36675368 - 36675316
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36675368 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 36675316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8051247 - 8051180
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagcagttcagaagca 257  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8051247 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcagttcagaagca 8051180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 309 - 1014
Target Start/End: Original strand, 8315421 - 8316126
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315421 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 8315519  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgtgattaatcactgatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8315520 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgtgattaaccactgatt 8315619  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgat 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8315620 gtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaacttctgagcttgat 8315718  T
Q  608 gaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 707  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8315719 gaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagatcaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 8315818  T
Q  708 agaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctatag 807  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8315819 agaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaaacttatagcagatttgttgtctatgagcaattctatag 8315918  T
Q  808 gtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttga 906  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8315919 gtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacaggttga 8316018  T
Q  907 caatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctcca 1006  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8316019 caatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtctcca 8316118  T
Q  1007 caccaatc 1014  Q
    ||||||||    
T  8316119 caccaatc 8316126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 360 - 1014
Target Start/End: Original strand, 17886816 - 17887467
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  17886816 tacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttt 17886915  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctccctt 559  Q
          |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17886916 ------actttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctccctt 17887009  T
Q  560 aattcaagtttccac--ttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagct 657  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17887010 aattcaagtttccacacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagct 17887109  T
Q  658 cagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactgg 757  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |    
T  17887110 cagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtttacttgctccctcagaaaatggaagttagcttctacatgtttacttcttccatgcagaactag 17887209  T
Q  758 atttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatatt 857  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17887210 atttcttgctaagcttatagctgatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatatt 17887309  T
Q  858 gcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattca 956  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17887310 gcctgacatgcttccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacacggtgaaattggatcattca 17887409  T
Q  957 taaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17887410 taaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 17887467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 309 - 736
Target Start/End: Original strand, 27552026 - 27552453
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552026 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacgaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagc 27552125  T
Q  408 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27552126 acaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgatt 27552225  T
Q  508 gtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgat 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27552226 gtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgat 27552324  T
Q  608 gaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctc 707  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  27552325 gaatatgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtttacttgctccctt 27552424  T
Q  708 agaaaatgaaacttggcttctatatgctt 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27552425 agaaaatgaaacttggcttctatatgctt 27552453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 734 - 1014
Target Start/End: Original strand, 27568524 - 27568805
Alignment:
Q  734 cttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctcc 833  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27568524 cttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctcc 27568623  T
Q  834 ttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttag 932  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27568624 ttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaattggttgcttcttag 27568723  T
Q  933 cacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27568724 cacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 27568805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Original strand, 8319960 - 8320199
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8319960 aagttatgatgaaaatgaaattgatctttattgattctacata-agaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtttcttgaagca 8320058  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  8320059 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacatattgtgattaaccactgattg 8320158  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8320159 tgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 17780155 - 17779914
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780155 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggagatagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 17780056  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17780055 caagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattg 17779956  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaatt-agaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17779955 tgattatcact-aaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 17096236 - 17096431
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17096236 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaaca 17096335  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17096336 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 360 - 550
Target Start/End: Original strand, 17895691 - 17895881
Alignment:
Q  360 tacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17895691 tacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg 17895790  T
Q  460 taacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17895791 taacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 14531749 - 14531945
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14531749 aaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 14531848  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14531849 aacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattataactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 447 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163431
Alignment:
Q  447 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatca-ctgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattag-aac-aa 543  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || ||   ||| ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaactaatcacgatcatcactaat-ctaaacttgaattatcaactaa 17163632  T
Q  544 actaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17163631 actaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcataccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtc 17163532  T
Q  644 tacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttctt 743  Q
    | ||||  |||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||||    
T  17163531 tgcaagaagcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcactttctccctcagaaaatggaactttgcctctacgtgtttgcttctt 17163432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 312 - 551
Target Start/End: Original strand, 27574657 - 27574885
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatac-aaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 410  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27574657 ttatggtgaaattgtaattgattcttattgattttccatacgaaaaatgttcaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcaca 27574756  T
Q  411 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtg 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27574757 agcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctc-----------taacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtg 27574845  T
Q  511 attatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27574846 attatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27574885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 3596539 - 3596333
Alignment:
Q  586 caatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgcc---ttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtag 682  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  |     ||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  3596539 caatcaagcttcttagcttgatgaacctgccaaccttcagaggtaatttagtgaactaatctgcaagttgcagctcagtagaacaatggacaatcttcaa 3596440  T
Q  683 tgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagat 782  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||| |||    
T  3596439 tgcttgcttgtttacttgttccctaagaaagtgaaacttagcttcaatgtgcttcctccttccatgcaaaactggattctttactaagtttatagccgat 3596340  T
Q  783 ttgttgt 789  Q
    |||||||    
T  3596339 ttgttgt 3596333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 885 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 23256140 - 23256016
Alignment:
Q  885 tatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgct 984  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| ||| | |||||    
T  23256140 tatactcagatttacatgttcacaatgctaccactagttgcttcttagcacaccaagagattggagcattcagaaatttaaataggtaacctaaggtgct 23256041  T
Q  985 ctttctatcttgtttgtctccacac 1009  Q
    |||| ||||||| || || ||||||    
T  23256040 ctttatatcttgcttatccccacac 23256016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Original strand, 8319866 - 8319935
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8319866 gaagctagttcagaagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8319935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 8315348 - 8315396
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8315348 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 8315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Original strand, 27574569 - 27574630
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27574569 gttcagaagctagttcagaagcagtttgagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 27574630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 17886692 - 17886753
Alignment:
Q  225 ttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17886692 ttcagaagcaagttcagaagctagttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 511
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  496 taatcactgattgtga 511  Q
    ||| |||| |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Original strand, 17096075 - 17096167
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctag-ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17096075 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagcttgttcataagcactcttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 17096167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 939 - 994
Target Start/End: Complemental strand, 3596327 - 3596272
Alignment:
Q  939 atgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatct 994  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  3596327 atgaaattggagcattcagaaacttgaataggtaacctgatgtgctcttcctatct 3596272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 624
Target Start/End: Original strand, 8855275 - 8855358
Alignment:
Q  542 aaactaacatcctcccttaattcaagttt-ccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttca 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  8855275 aaactaacatcctcccttaattcaagttttccaacttcaccattccaatcaagcttctgagcttgttaaacctttcaatcttca 8855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23256385 - 23256303
Alignment:
Q  542 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttca 624  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |  ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23256385 aaaccaacatcctcccttaattctggtttccattttcaccaaaccagtcaagcttcttagcttgatgaacctgtcaaccttca 23256303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 501
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888268
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa-caacatgtgattaatca 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaatcaaagtgtgattaatca 7888268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 246
Target Start/End: Original strand, 8315266 - 8315319
Alignment:
Q  191 ctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8315266 ctgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8315319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  447 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatc-actgattgtgattatcactaaaactaaacttgaatta 537  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| |||| ||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcact-aatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 285
Target Start/End: Original strand, 17895589 - 17895628
Alignment:
Q  246 agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17895589 agttcagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17895628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 27535334 - 27535404
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct-agttcagaagc-agttcagaagcagttt 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  27535334 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgttcagaagctagttcataagtagttt 27535404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Original strand, 8319806 - 8319858
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8319806 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 8319858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 3597625 - 3597592
Alignment:
Q  543 aactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3597625 aactaacatcctcccttaattcaagtttcaactt 3597592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 223 - 1014
Target Start/End: Original strand, 30405651 - 30406425
Alignment:
Q  223 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||||||||||    
T  30405651 agttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaa 30405750  T
Q  323 ttgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 422  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30405751 ttgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaaca 30405850  T
Q  423 aactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 522  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 || ||||||||||||||||    
T  30405851 aattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca-----------------gaatgtgattatcactaaa 30405933  T
Q  523 actaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaacctt 622  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  30405934 -ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaatctt 30406032  T
Q  623 caatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttg 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  30406033 caatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgttcccttagaaaatggaacttt 30406132  T
Q  723 gcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctcta 822  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30406133 gcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctcta 30406232  T
Q  823 tctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactgg 921  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30406233 tctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactgg 30406332  T
Q  922 ttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30406333 ttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtctccacaccaatc 30406425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 197684 - 198306
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 197883  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197884 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 197983  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197984 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 198083  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  198084 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 198183  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198184 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 198283  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  198284 tcttgtctgtctccacaccaatc 198306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 312521 - 313143
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 312720  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312721 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 312820  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  312821 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 312920  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  312921 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 313020  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313021 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 313120  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  313121 tcttgtctgtctccacaccaatc 313143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43808105
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  494 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaag 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaagctaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaag 43807683  T
Q  594 ctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgt 693  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43807684 cttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttgt 43807783  T
Q  694 tcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctat 793  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807784 tcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctat 43807883  T
Q  794 gaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactca 892  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43807884 gagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactca 43807983  T
Q  893 gattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctat 992  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43807984 gattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctat 43808083  T
Q  993 cttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  43808084 cttgtctgtctccacaccaatc 43808105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 449 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949345
Alignment:
Q  449 taacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaa 548  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaagcttgaattaaaagaaactaa 41949804  T
Q  549 catcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41949803 catcctcccttaattcaagtttccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatgaaactgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaa 41949704  T
Q  649 gctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatg 748  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||     
T  41949703 gctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgtagtg--------ttcacttgctccctcaaaaaatggaacttagcttatatgtgcttgcttctcccata 41949612  T
Q  749 cagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttca 848  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949611 caaaattggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtccatgaacaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttca 41949512  T
Q  849 agccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattg 947  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  41949511 agccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacacaataaaatta 41949412  T
Q  948 gagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949411 gagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 41949345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 539 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 1291335 - 1290859
Alignment:
Q  539 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaat 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  1291335 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagtttgatgaatctgtcaaccttcaaagctttagtgaat 1291236  T
Q  639 atgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgc 738  Q
    || ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1291235 atatctgcaagctgatgctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgc 1291136  T
Q  739 ttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgag 838  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  1291135 ttctcccaagcagaactggatttcttgccaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaatattataggtctgttaacttctatctccatctccttgag 1291036  T
Q  839 tatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacac 937  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  1291035 tatattttcaagtcatactgtctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaagttgacaataccacaacaggttgcttcttagcacac 1290936  T
Q  938 catgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    | |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1290935 cctgaaattgaagcattcataaatttgaataggtactctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1290859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 562 - 1014
Target Start/End: Original strand, 31473324 - 31473777
Alignment:
Q  562 ttcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31473324 ttcaagtttccacttccttcatggcagtcaaacttcttagcttgatgaacctgtcaaccttcaataccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagt 31473423  T
Q  662 agaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggattt 761  Q
     || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31473424 ggagcaatggacaatctgcagttctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttcttccatgaagaattggattt 31473523  T
Q  762 cttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgctt 861  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31473524 cttgctaagcttatagaagatttgttatctatgaacaatgcaataggtctgctaacttctatctccgtctccttgagtatattttcaagccatactgcct 31473623  T
Q  862 gacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataac 960  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||     
T  31473624 ggcatgctgccatacatcctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgccacaactggttgcttcttaacacaccatgaaattggggcatttagaaa 31473723  T
Q  961 cttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  31473724 cttgaataggtaacctgaagtgctttttctatcctgcttgtctccataccaatc 31473777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 371 - 1016
Target Start/End: Original strand, 27435169 - 27435805
Alignment:
Q  371 tagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaa-actt 469  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| || | |||| |      ||||||||||||| |  |    
T  27435169 tagcttatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaaccctaactct-atgtgctaatc------aaacttgtaacaataact 27435261  T
Q  470 cataacaaactaaaacaaca-tgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagt 568  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | || ||||||||||||   |||||| ||||||  || | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  27435262 cataacaaactaaaacaataatgtgattaaccactaagtgagattatcactaag--taaactagaatta--acta-ctaaattcctctcttaattcaagt 27435356  T
Q  569 ttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaa 668  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||    
T  27435357 tttcacttctttcatgccaatcaaactctttagcttgatgaacctgtcatccttcaatggcttagtgaatatttctgcaagctgcagcttagtgaaacaa 27435456  T
Q  669 tgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgcta 768  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27435457 tgaacaatctgcaatgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaacttagcctctatgtgtttgcttcttccaagcaaaactggatttcttgcta 27435556  T
Q  769 agcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgc 868  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  27435557 agcttatagcagatctgttatctttgaacaatgttattggtctgctcacttctatctccatctccttgagtatgttttaaagccatactgcctgacatgc 27435656  T
Q  869 ttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaat 967  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  27435657 tgtcatacaccctgcaatatactcagattcaaaggttgacaatgccacaactagttgcttcttagcacaccatgaaattggggcattcagaaacttgaat 27435756  T
Q  968 aggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatctg 1016  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  27435757 aggtaacctgaggtactttttctatcctgcttatctccacaccaatctg 27435805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 217 - 550
Target Start/End: Original strand, 30410154 - 30410486
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttat 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||    
T  30410154 gaagctagttcagaagc-agttcagaagctagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttat 30410252  T
Q  316 gatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaa 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30410253 gatgaaattgtaattgatctttattgattctacatataaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaa 30410352  T
Q  416 tgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattat 515  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30410353 tgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaattaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattat 30410452  T
Q  516 cactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30410453 cact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 312 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 28644799 - 28644562
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28644799 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatgcaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaa 28644700  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28644699 gcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 28644600  T
Q  512 ttatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28644599 ttatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 41805942 - 41806116
Alignment:
Q  18 ctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41805942 ctttgatgctttttattttacattttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggac 41806041  T
Q  118 ttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggatgtgtattctct 192  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41806042 ttgctcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctactgatgctgagaaccaggacgtgtattctct 41806116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 33072113 - 33071918
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33072113 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctccaaca 33072014  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33072013 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 42234656 - 42234851
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42234656 aaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 42234755  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42234756 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 38757186 - 38757003
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38757186 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 38757087  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||            ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38757086 aacttgtaaca------------aactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202360
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 202360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317197
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 317197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtg 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  494 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 543 - 757
Target Start/End: Original strand, 17782356 - 17782570
Alignment:
Q  543 aactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgt 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||  |  ||| |||| |  |    
T  17782356 aactaacatcctcccttaattcaagtttccactttcaccataccaatcaagcttcttagcttgatgaacctgtcaaatttcagaggtttaatgaacaaat 17782455  T
Q  643 ctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttct 742  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||| ||||| || || |||||||  |  |||||||| || || ||||||||    
T  17782456 ctacaatctgcagttcagtagaacaatggacaatcttcaatgcttccttgtttacttgttctctaagaaaatcgattttggcttcaatgtgtttgcttct 17782555  T
Q  743 tccatgcagaactgg 757  Q
    |||||||| ||||||    
T  17782556 tccatgcaaaactgg 17782570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 453 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41945434 - 41945339
Alignment:
Q  453 aaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41945434 aaacttgtaaccaacttg-taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 887 - 1011
Target Start/End: Original strand, 17782650 - 17782774
Alignment:
Q  887 tactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctct 986  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| || || |    
T  17782650 tactcagattcacatgttgacaatggtaacactggttgcttcttagcacactaagagattagagcattcagaaacttgaataggtagcctgaggtccttt 17782749  T
Q  987 ttctatcttgtttgtctccacacca 1011  Q
    |||||||||| || || ||||||||    
T  17782750 ttctatcttgcttatccccacacca 17782774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38757301 - 38757253
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38757301 ttcagaagcagttcagaagcagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 38757253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28644882 - 28644826
Alignment:
Q  229 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28644882 gaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 28644826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38757395 - 38757331
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagcagttcagaag 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  38757395 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactcttcagaagcagttcagaag 38757331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Original strand, 41799727 - 41799824
Alignment:
Q  42 ttatcatatatttctagaaactagctagcagtgatagttaacttgattaattaagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctg 139  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||  ||||| |||||| |||||    
T  41799727 ttatcatagattattagaaactagcttgcaacgatagttaacttgattagttaagtgttcttattccgcataggacttactcttgcatagagactctg 41799824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28644890 - 28644850
Alignment:
Q  209 cagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcagtt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28644890 cagaagcggaagctagttcagaagcgagttcagaagcagtt 28644850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 721
Target Start/End: Original strand, 44912814 - 44912925
Alignment:
Q  609 aacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctca 708  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| || || ||||| ||||  ||||| |    
T  44912814 aacctttcaatcttaactgccttagtgaatatgtcaggaagttgcagctcagtagaacaatgga-aatctttagagcccctttgtttacttattccctaa 44912912  T
Q  709 gaaaatgaaactt 721  Q
    |||||||||||||    
T  44912913 gaaaatgaaactt 44912925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Original strand, 30410105 - 30410174
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30410105 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30410174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 256
Target Start/End: Original strand, 30405629 - 30405661
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30405629 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagc 30405661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Original strand, 30405585 - 30405654
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagc-tagttcagaagc-agttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  30405585 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctagttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagtt 30405654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 546; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 309 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 26316240 - 26315548
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26316240 aagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatctagctaggttgcttgaagca 26316142  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26316141 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaact------------aaaacagaatgtgattaaccactgattg 26316054  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatg 608  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26316053 tgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatg 26315955  T
Q  609 aacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctca 708  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315954 aatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttgttcacttgctccctca 26315855  T
Q  709 gaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctatagg 808  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26315854 gaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctatagg 26315755  T
Q  809 tctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgac 907  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26315754 tctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagactcacaggttgac 26315655  T
Q  908 aatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccac 1007  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26315654 aatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtctgtctccac 26315555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1014
Target Start/End: Original strand, 43591783 - 43592443
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  43591783 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaaca 43591882  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcc 553  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43591883 atattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcc 43591981  T
Q  554 tcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgc 653  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  43591982 tcccttaattcaagtttctacttccttcattccaatcaagcttttgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagttgt 43592081  T
Q  654 agctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaa 753  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43592082 agctcagtagagcaatgaacaatctacagagctcccttgttcacttggtccctcataaaatggaacttagcttttatatgcttgcttctcccatgcagaa 43592181  T
Q  754 ctggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagcca 853  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592182 ctgaatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattatataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagcca 43592281  T
Q  854 tattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagca 952  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592282 tattgcctgacatgttgccatacaccctgtaatatactcaaattcacaggttaacaatgccacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagca 43592381  T
Q  953 ttcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592382 ttcataaatttgaataggtaccatgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 43592443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 39794070 - 39793831
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794070 aagttatgatgaaaatgtaattgatctttattgattctacatatgaaa-tgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 39793972  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  39793971 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgagattaaccactgattg 39793872  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39793871 tgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 309 - 550
Target Start/End: Original strand, 16588395 - 16588635
Alignment:
Q  309 aagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  16588395 aagttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctccatacaaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttaaaaca 16588494  T
Q  409 caagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  16588495 caagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattg 16588594  T
Q  509 tgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16588595 tgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 192 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26311868 - 26311522
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||        
T  26311868 tgattgcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagcactgttcagaagctagttcagaagcagattttgattctaaggtttatgtgaattagag 26311769  T
Q  290 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 389  Q
                       |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26311768 agagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctgcatacaaaa-tatacaaaggaagtagcttatatacaatatct 26311670  T
Q  390 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaca 489  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||  |    
T  26311669 agctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaaca------------aactaaaacagaa 26311582  T
Q  490 tgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26311581 tgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 526 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 30647386 - 30646900
Alignment:
Q  526 aaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaa 625  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||| ||||||||||| || |||||| | |||||| ||| |||||     
T  30647386 aaacttgaattagaa---actaacatcctcccttaaatcaagtttccaattctaccatgccaatcaagcttctaagcttgttaaacctgacaatcttcat 30647290  T
Q  626 tgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggct 725  Q
     ||||||||||| || |   |||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||| ||||| ||| | |  || ||||| |||||||| ||||| |||    
T  30647289 agccttagtgaacatattcgcaagctgcaaatcagtggaacaatggacaacctttagagctcctttggttaactgttccctaagaaaatggaactttgct 30647190  T
Q  726 tctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatct 825  Q
    || || || ||||| |||||||||| |||||| ||| | | |||| ||||||   | ||||||||||| |||||  | |||||  | |  ||||  ||||    
T  30647189 tcaatgtgtttgctccttccatgcaaaactgggtttttggataagtttatagttaacttgttgtctataaacaaagcaataggcttgcataccttaatct 30647090  T
Q  826 ccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccatacacc-tgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttg 924  Q
    |||| ||||| || ||  ||| |||||| | | ||||| | | | | |  |||| ||||||| ||||| | ||||| ||||| || | ||| || |||||    
T  30647089 ccatttccttcagaattgtttaaagccaaactacttgataagttgctaagcaccatgcaatacactcaaactcacaagttgataaggctaccaccggttg 30646990  T
Q  925 cttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || | ||| ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  30646989 cttcttagcacaccatgatatttgagcatttagaaatttaaacaagtagcctcaagtactctttctatcttgcctatctccacaccaatc 30646900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26316348 - 26316253
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26316348 tgatagcgcagaaaaaccagaaacggaagcttgtttagaagcactgttcagaagttagttcagaagcagtttttaattctaaggtttatgtgaatt 26316253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Original strand, 16588275 - 16588370
Alignment:
Q  190 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaag--cagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16588275 tctgatagcacagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcataagcttgttcagaagctctgtacagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaatt 16588370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39794145 - 39794097
Alignment:
Q  237 ttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39794145 ttcagaagcagttcagaagtagtttcttattctaaggtttatgtgaatt 39794097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39794250 - 39794198
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39794250 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39794198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39796854 - 39796802
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39796854 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagc-agttcagaagca 39796802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 518; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1014
Target Start/End: Original strand, 8892582 - 8893243
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  8892582 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcgatgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaaca 8892681  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcc 553  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8892682 aatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcc 8892781  T
Q  554 tcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgc 653  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8892782 tcccttaattcaaatttccacttccttcattccaatcaaccttttgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagttgc 8892881  T
Q  654 agctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaa 753  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8892882 agctcagtagagcaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaactcagcttctatatgtttgcttcttccatgcagaa 8892981  T
Q  754 ctggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagcca 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8892982 ctggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgattaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagcta 8893081  T
Q  854 tattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagca 952  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8893082 tattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgctacaactgggtgcttcttagcacaccatgaaattggagca 8893181  T
Q  953 ttcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8893182 ttcataaacttgaataggtatcctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 8893243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151093
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 44151516  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44151515 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagcttagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 44151416  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151415 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 44151316  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44151315 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 44151216  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151215 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 44151116  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  44151115 tcttgtctgtctccacaccaatc 44151093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 354 - 1014
Target Start/End: Original strand, 50627904 - 50628552
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50627904 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 50628003  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcc 553  Q
    |||||||||||||||            |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  50628004 aacttgtaacaaact------------aaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaaaacaaactaacatcc 50628090  T
Q  554 tcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgc 653  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50628091 tcccttaattcaagtttccactgccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgc 50628190  T
Q  654 agctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaa 753  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50628191 agctcagtagagcaatgaacaatctacagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcggaa 50628290  T
Q  754 ctggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagcca 853  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628291 ctgaatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacttctatctccatctccttgagtatattttcaagcca 50628390  T
Q  854 tattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagca 952  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628391 tattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgccacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagca 50628490  T
Q  953 ttcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628491 ttcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 50628552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31358687
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct 595  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct 31359106  T
Q  596 cctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttc 695  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31359105 c-tgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttaatgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctacagtgctcccttgttc 31359007  T
Q  696 acttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatga 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31359006 acttgctccctcagaaaatgaaacttgacttctatatgcttgcttctcccatgcataactagatttctttctaagcttataacagatttgttgtctatga 31358907  T
Q  796 acaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcaga 894  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||    
T  31358906 acaatgctataggtctgctaacctctatctccatctcattgagtatattttcaagccatactgcctgacatactgccatacatcctgcaatatacttaga 31358807  T
Q  895 ttcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatct 994  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358806 ttcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctatct 31358707  T
Q  995 tgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31358706 tgtttgtctccacaccaatc 31358687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 229 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31670411 - 31670089
Alignment:
Q  229 gaagctagttcagaagc-agttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgta 327  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       |||||||||||||||||||    
T  31670411 gaagctagttcagaagttagttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattagagagagaattgagagagaagaaagttatgatgaaattgta 31670312  T
Q  328 attgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactc 427  Q
    | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31670311 aatgatctttattgattctacattc-aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactc 31670213  T
Q  428 tagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaa 527  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31670212 tagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaa 31670113  T
Q  528 acttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  31670112 acttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 354 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 53722202 - 53722006
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53722202 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaaca 53722103  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53722102 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 10317025 - 10317220
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10317025 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 10317124  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10317125 aacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 27186341 - 27186142
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27186341 aaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 27186242  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataac-aaact--aaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27186241 aacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 354 - 543
Target Start/End: Original strand, 43683636 - 43683813
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||         
T  43683636 aaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatttgctaacctc----- 43683730  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaa 543  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43683731 ------taacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaa-taaacttgaattaaaacaa 43683813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 35842942 - 35842843
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35842942 aaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 551
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274669
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacat 551  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacat 49274669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44151889 - 44151819
Alignment:
Q  217 gaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44151889 gaagctagttcagaagcactgttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44151819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44147414 - 44147345
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44147414 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44147345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44151925 - 44151856
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagcagtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44151925 tgatagcgcagaaaatc-agaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcactgttcagaagcagtt 44151856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 501
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976277
Alignment:
Q  446 ctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatca 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaatca 45976277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 53786039 - 53785880
Alignment:
Q  355 aaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaa 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||   |||   ||||||||    
T  53786039 aaatgtacaaag-aggtagcttatatactagaactagttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaacccta-actatataagctagtttctaacaa 53785942  T
Q  455 acttgtaacaaacttcataacaaactaaaaca--acatgtgattaatcactgattgtgattat 515  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  53785941 acttgtaacaaa-ttcttaacaaacaaaaacactaaatgtgattaaccactgagtgtgattat 53785880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3771156 - 3771106
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3771156 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 3771106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44147334 - 44147284
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44147334 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44147284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354678
Alignment:
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaa-ctaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 29258396 - 29258261
Alignment:
Q  543 aactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgt 642  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||| ||||||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |  |  |||||||| |  |    
T  29258396 aactaatatcctcccttaattcaagtttaaacttttgtcataccaatcaagcctcttagtttgattaacctttcaacttttagaggtttagtgaacaaat 29258297  T
Q  643 ctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatct 678  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29258296 ctgcaagctgtagctcagtagaacaatgaacaatct 29258261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  472 taacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 522  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53722380 - 53722313
Alignment:
Q  190 tctgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagc 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||    
T  53722380 tctgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagcaggttctgaagcactgttcagaagc 53722313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 516; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12022824
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 12023247  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023246 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 12023147  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12023146 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 12023047  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12023046 tgagtaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttaagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 12022947  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12022946 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 12022847  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  12022846 tcttgtctgtctccacaccaatc 12022824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099996
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7099573  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7099574 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 7099673  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099674 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 7099773  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7099774 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 7099873  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7099874 agactcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 7099973  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  7099974 tcttgtctgtctccacaccaatc 7099996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798204
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 16798627  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16798626 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 16798527  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798526 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 16798427  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16798426 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 16798327  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798326 agactcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 16798227  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  16798226 tcttgtctgtctccacaccaatc 16798204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37681571
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| | |||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 37681994  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681993 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 37681894  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37681893 ttcatttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcaaatttgttgtcta 37681794  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37681793 tgagtaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 37681694  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681693 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaatttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 37681594  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  37681593 tcttgtctgtctccacaccaatc 37681571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 312 - 904
Target Start/End: Original strand, 40367531 - 40368112
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagtt-gcttgaagcaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  40367531 ttatgatgaaattgtaattgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcaca 40367630  T
Q  411 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40367631 agcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaaact------------aaaacaaaatgtgattaatctctgattgtg 40367718  T
Q  511 attatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaa 610  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40367719 attatcactaaa-ctaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaa 40367817  T
Q  611 cctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcaga 710  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40367818 tctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagcttagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttaga 40367917  T
Q  711 aaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40367918 aaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtc 40368017  T
Q  811 tactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggtt 904  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40368018 tgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactcatattcacaggtt 40368112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 441 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 10277312 - 10276739
Alignment:
Q  441 ctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaa 540  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10277312 ctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaa-ctaaacttgaattaaaa 10277214  T
Q  541 caaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatat 640  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277213 caaactaacatcctctcttaattcgagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatat 10277114  T
Q  641 gtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgctt 740  Q
    |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277113 gtccgcaagctgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgctt 10277014  T
Q  741 cttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagta 840  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10277013 cttccatgcagaattggatttcttactaagcttatagcagatttgttgtatatgaacaattatataggtctgctaacctctatctccatctctttgagta 10276914  T
Q  841 tattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacacca 939  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10276913 tattttcaagccatattgtttgacatgctgccatacaccctgcaatatactcagattcacaagttgacaatgccacaactggttgcttcttagcacacca 10276814  T
Q  940 tgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10276813 tgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccatgaagtgatctttctatcttgtttgtctccacaccaatc 10276739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 354 - 697
Target Start/End: Original strand, 26336767 - 26337111
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26336767 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 26336866  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaa-caacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatc 552  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26336867 aacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaaaacaaactaacatc 26336966  T
Q  553 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26336967 ctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctg 26337066  T
Q  653 cagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcac 697  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26337067 cagctcagtagagcaatgaaaaatctgcagtgctcccttgttcac 26337111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 312 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 30695530 - 30695293
Alignment:
Q  312 ttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30695530 ttatgatgaaattgtaattgatctttattgattctacatacgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaa 30695431  T
Q  412 gcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30695430 gcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtga 30695331  T
Q  512 ttatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30695330 ttatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 542 - 1016
Target Start/End: Original strand, 26454406 - 26454881
Alignment:
Q  542 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatg 641  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||     
T  26454406 aaactaacttcctcccttaattcaagtttccacttcaaccataccaatcatgctccttagcttgatgaatatgtcaaccttcaaaggtttagtgaatata 26454505  T
Q  642 tctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttc 741  Q
    ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| || | |||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || || || ||      
T  26454506 tctgcaagttgcagctcaatggaacaatgaacaatttgcaatgcctccttgttaacttgttccctcagaaagtgaaacttaacttcaatgtgtttactca 26454605  T
Q  742 ttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtat 841  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||  |||| || |  |||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  26454606 ttccatgcaaaattggattatttgctaagttaatagatgatttgttatctatgaacaatgatataagtatgttaacttctatttccatattcttgagtat 26454705  T
Q  842 attttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccat 940  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454706 attttcaagctaaactgcttgacaagctgtcatacatcctgcaatgtactcagattcacaagttgacagtgctacaactggttgcttcttagcacaccat 26454805  T
Q  941 gaaattgga--gcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatctg 1016  Q
    |||  ||||  ||||| | || ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||    
T  26454806 gaa--tggatcgcatttagaaacttgaataggtaatctgaggtgctcttcctatcttgcttatccccacactaatctg 26454881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Original strand, 32485947 - 32486143
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32485947 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 32486046  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32486047 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 19502504 - 19502307
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19502504 aaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttattttctaacctctaaca 19502405  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtga-ttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19502404 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 550
Target Start/End: Original strand, 40371549 - 40371892
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagcta-gttcagaagcagttc-agaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaattnnnn 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  40371549 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagctctgtttagaagcagttttagaagcagtttctgattctaaggttt-tgtgaattagag 40371646  T
Q  290 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagttatgatgaaattgtaattgacctttattaattctacatacaaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 389  Q
                       || |||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40371647 agagaattgagagagaagaaaattatgatgaaattgtagttgattcttattgattctacatatgaaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatct 40371746  T
Q  390 agctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaca 489  Q
    | |              ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40371747 aac--------------cacaaacaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaa 40371832  T
Q  490 tgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40371833 tgtgattaatctctgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 354 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 36632497 - 36632314
Alignment:
Q  354 aaaatgtacaaaggaggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaaca 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36632497 aaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaaca 36632398  T
Q  454 aacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||||||||            |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36632397 aacttgtaaca------------aactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaac-aacatgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 364 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 43385138 - 43384960
Alignment:
Q  364 aaggaggtagctt-atatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaa 462  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  43385138 aaggaggtagctttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaa 43385039  T
Q  463 caaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcacta----aaactaaacttgaatta 537  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  43385038 caaacttcataacaaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaactaaacttgaatta 43384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 368 - 498
Target Start/End: Original strand, 20830304 - 20830434
Alignment:
Q  368 aggtagcttatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaac 467  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20830304 aggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaac 20830403  T
Q  468 ttcataacaaactaaaacaacatgtgattaa 498  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20830404 ttcataacaaactgaaactaaatgtgattaa 20830434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30695651 - 30695558
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagcag-ttcagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30695651 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcttgttcagaagctagttcagaagcagtttcagaagtagtttcttattctaaggttt-tgtgaatt 30695558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||| | |||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 542 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 25632735 - 25632261
Alignment:
Q  542 aaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatg 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||| ||     
T  25632735 aaactaacatccttccttaattcaagttttcactctcaccataccaatcaggcttctcagtttgatgaacatgtcaaccttcacaggtttagtgaacata 25632636  T
Q  642 tctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttc 741  Q
    ||   ||| |  |  |||||||| ||||| | ||| |  |||||  | ||||| |||||    || | ||||||||| ||||||||  | ||| |||| |    
T  25632635 tcaggaagttttatatcagtagatcaatggataatattcagtgcctctttgtttacttgtaatctaataaaatgaaagttggcttcagtgtgcgtgctcc 25632536  T
Q  742 ttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtat 841  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||||| | || || || | ||||||||| |||||    
T  25632535 ttccaagcagaactggatttttagccaagtttatagctgatttgttgtccataaacagagttataggtctatttacttcaattttcatctcctttagtat 25632436  T
Q  842 attttcaagccatattgcttgacatgcttcc-atacacctgcaatatactcagattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccat 940  Q
    |  ||||||||| | ||||||||| ||| || ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||||| |||||     
T  25632435 agattcaagccaaactgcttgacaggctgccaatcaacctgcaatgtactcagattcacatgttgacaaggctgccattggtttcttcttagctcaccaa 25632336  T
Q  941 gaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctatcttgtttgtctccacaccaatctg 1016  Q
    || ||  ||||||| | ||  ||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  25632335 gagatcagagcatttagaaatttgaacaggtagcataaggtgttctttctatcttgcttat-tccacaccaatctg 25632261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgat 495  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||   |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  496 taatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcact-aaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 498
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808746
Alignment:
Q  427 ctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtgattaa 498  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaa 20808746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12019047 - 12018997
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12019047 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12018997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 690 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 30067094 - 30066992
Alignment:
Q  690 ttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgt 789  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||| | |||||| |||| |||||||  ||||    
T  30067094 ttgttcacttgttctctgagaaaatgaaactttgcttcaatatgcttgcttcttccatgcaacacatgatttttggctaagtttatggcagattgattgt 30066995  T
Q  790 cta 792  Q
    |||    
T  30066994 cta 30066992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 7099217 - 7099266
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7099217 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7099266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 7103786 - 7103835
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7103786 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 7103835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16798984 - 16798935
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16798984 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16798935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16794421 - 16794374
Alignment:
Q  238 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16794421 tcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 16794374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 278904 - 278834
Alignment:
Q  93 taagtcttcttattccataaaggacttggtcttgtatagaggctctggggatcagtagcaggacctctact 163  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  278904 taagtgttgttattccacaaaagacttactcttgcatagaggctctgtggatcagtagcaggacctctact 278834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12023616 - 12023566
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12023616 gttcaaaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 12023566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37659082 - 37658985
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagcta-gttcagaagc--tagttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37659082 tgatagcgcagaaaatc-agaagcagaagctttgttcagaagcagttgttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37658985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37682340 - 37682289
Alignment:
Q  236 gttcagaagca--gttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaat 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37682340 gttcagaagcactgttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaat 37682289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Original strand, 40367386 - 40367427
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagct 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40367386 tgatagcgcagaaaa-ccagaagcggaagcttgttcagaagct 40367427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 515; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7041
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaacatgtg 493  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  494 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaag 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaa 7463  T
Q  594 ctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgt 693  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7462 cttctgagcttgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagctacagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgt 7363  T
Q  694 tcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctat 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362 tcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctat 7263  T
Q  794 gaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactca 892  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7262 gagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactca 7163  T
Q  893 gattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttctat 992  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7162 gattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttctat 7063  T
Q  993 cttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  7062 cttgtctgtctccacaccaatc 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2735
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 2938  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2937 acttctgagcttgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 2838  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837 ttcacttgctccctcagaaaatgtaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 2738  T
Q  793 tga 795  Q
    |||    
T  2737 tga 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7772
Alignment:
Q  224 gttcagaagctagttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7833 gttcagaagc-agttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 7772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7902 - 7836
Alignment:
Q  192 tgatagcgcagaaaaaccagaagcggaagctagttcagaagctagttcagaagca--gttcagaagca 257  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  7902 tgatagcgcagaaaatt-agaagcggaagcttgttcagaagcaagttcagaagcactgttcagaagca 7836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 396 - 1014
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45487
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 45064  T
Q  593 gctcctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 692  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45065 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 45164  T
Q  693 ttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45165 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 45264  T
Q  793 tgaacaattctataggtctactaacctctatctccatctccttgagtatattttcaagccatattgcttgacatgcttccataca-cctgcaatatactc 891  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45265 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctctttgagtatattttcaagccatattgcctgacatgctgccatacaccctgcaatatactc 45364  T
Q  892 agattcacaggttgacaatgttacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaccttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 991  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45365 agattcacaggttgacaatgctacaactggttgcttcttagcacaccatgaaattggagcattcataaacttgaataggtaccctgaagtgctctttcta 45464  T
Q  992 tcttgtttgtctccacaccaatc 1014  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  45465 tcttgtctgtctccacaccaatc 45487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 396 - 550
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  396 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaa-catgt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  493 gattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaactaaca 550  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 44708 - 44758
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44708 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 44758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 49288 - 49338
Alignment:
Q  236 gttcagaagcagttcagaagcagtttctgattctaagg-tttatgtgaatt 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49288 gttcagaagcagttcataagcagtttctgattctaaggttttatgtgaatt 49338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 548
Target Start/End: Original strand, 60201 - 60302
Alignment:
Q  447 tctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaact-aaaacaacatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattagaacaaac 545  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||| | ||||||||||| |||||||    
T  60201 tctaacaaactggtaacaaaatttataacaaactaaaaattaaatgtgattaatcactaattgtgattatatcacaaagt-aacttgaattaaaacaaac 60299  T
Q  546 taa 548  Q
    |||    
T  60300 taa 60302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University