View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5682_low_12 (Length: 342)

Name: NF5682_low_12
Description: NF5682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5682_low_12
NF5682_low_12
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (15-325)||(10672832-10673142)
chr3 (15-325)||(4049807-4050118)
chr3 (15-323)||(31076298-31076606)
chr3 (15-325)||(10591189-10591499)
chr3 (15-325)||(31081401-31081711)
chr3 (15-325)||(1302138-1302449)
chr3 (15-325)||(8458311-8458622)
chr3 (15-325)||(6857949-6858259)
chr3 (15-325)||(10584752-10585062)
chr3 (15-325)||(10677945-10678257)
chr3 (15-325)||(4054941-4055252)
chr3 (15-325)||(6852846-6853156)
chr3 (15-325)||(8464750-8465060)
chr3 (15-325)||(33702493-33702804)
chr3 (15-325)||(5481382-5481692)
chr3 (15-325)||(5457905-5458216)
chr3 (15-221)||(33703299-33703506)
chr3 (13-318)||(49784494-49784789)
chr3 (162-317)||(29827551-29827705)
chr3 (13-122)||(3187551-3187660)
chr3 (15-118)||(20891059-20891162)
chr3 (13-121)||(18024246-18024354)
chr3 (171-232)||(18024167-18024228)
chr3 (233-318)||(49784763-49784848)
chr3 (170-231)||(20891182-20891243)
chr3 (15-123)||(29827429-29827532)
chr3 (233-281)||(20891354-20891402)
chr3 (183-231)||(18023560-18023607)
chr3 (229-281)||(18024085-18024137)
chr3 (233-317)||(29827680-29827764)
chr3 (233-292)||(18023466-18023525)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (15-325)||(26986883-26987193)
chr8 (15-325)||(14314805-14315115)
chr8 (15-325)||(14318509-14318819)
chr8 (15-325)||(26981769-26982080)
chr8 (15-325)||(18494071-18494380)
chr8 (15-325)||(34108229-34108541)
chr8 (17-305)||(43956764-43957051)
chr8 (13-317)||(10340869-10341163)
chr8 (15-303)||(25953090-25953363)
chr8 (165-315)||(18608554-18608703)
chr8 (15-123)||(18608724-18608832)
chr8 (16-87)||(18885065-18885136)
chr8 (165-317)||(1781968-1782117)
chr8 (270-318)||(10340819-10340867)
chr8 (210-246)||(18616167-18616203)
chr8 (45-115)||(1781869-1781939)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (15-325)||(12856789-12857099)
chr7 (15-325)||(26051021-26051331)
chr7 (15-325)||(26060380-26060690)
chr7 (15-325)||(26056134-26056444)
chr7 (15-325)||(26065493-26065803)
chr7 (15-325)||(12851674-12851986)
chr7 (15-157)||(14610364-14610506)
chr7 (198-325)||(14610512-14610639)
chr7 (15-302)||(5440217-5440492)
chr7 (15-302)||(5449227-5449502)
chr7 (165-275)||(4181347-4181457)
chr7 (15-110)||(11056625-11056720)
chr7 (15-123)||(4181478-4181585)
chr7 (13-122)||(37459938-37460047)
chr7 (165-280)||(37459802-37459917)
chr7 (165-317)||(35352222-35352375)
chr7 (15-76)||(35352434-35352495)
chr7 (13-57)||(5436692-5436736)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (15-325)||(21275773-21276083)
chr6 (13-299)||(21936606-21936886)
chr6 (13-304)||(21937568-21937855)
chr6 (15-317)||(24509703-24510005)
chr6 (15-130)||(20752207-20752322)
chr6 (15-130)||(24508917-24509032)
chr6 (165-317)||(24508762-24508914)
chr6 (15-121)||(2887490-2887596)
chr6 (165-317)||(20752040-20752192)
chr6 (15-122)||(11183263-11183370)
chr6 (15-121)||(2889212-2889318)
chr6 (194-302)||(11183104-11183212)
chr6 (233-304)||(20751994-20752065)
chr6 (233-304)||(24508716-24508787)
chr6 (252-317)||(21936529-21936594)
chr6 (235-279)||(12909533-12909577)
chr6 (235-279)||(12934640-12934684)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (15-325)||(35096028-35096338)
chr4 (15-325)||(35090915-35091225)
chr4 (15-317)||(32429195-32429487)
chr4 (15-317)||(30019750-30020054)
chr4 (13-317)||(18670838-18671132)
chr4 (165-317)||(3409510-3409662)
chr4 (15-317)||(14643647-14643934)
chr4 (165-317)||(54859079-54859232)
chr4 (15-125)||(18716489-18716599)
chr4 (15-125)||(18737162-18737272)
chr4 (162-317)||(25618209-25618357)
chr4 (165-305)||(34279427-34279567)
chr4 (15-122)||(34279588-34279695)
chr4 (165-317)||(47071535-47071693)
chr4 (14-123)||(34128333-34128442)
chr4 (15-122)||(54859254-54859361)
chr4 (15-121)||(47071408-47071514)
chr4 (233-318)||(32429135-32429220)
chr4 (165-317)||(22118855-22119009)
chr4 (233-319)||(18671107-18671193)
chr4 (233-318)||(3424214-3424299)
chr4 (15-232)||(3424697-3424904)
chr4 (233-318)||(18716757-18716842)
chr4 (165-245)||(34128234-34128314)
chr4 (233-318)||(3409450-3409535)
chr4 (233-318)||(18737430-18737515)
chr4 (233-304)||(25618163-25618234)
chr4 (233-317)||(18716698-18716782)
chr4 (233-317)||(18737371-18737455)
chr4 (196-292)||(34601965-34602061)
chr4 (267-317)||(34279356-34279406)
chr4 (233-279)||(54859058-54859104)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (15-325)||(28574297-28574607)
chr1 (15-325)||(28598309-28598619)
chr1 (15-325)||(3468067-3468378)
chr1 (17-317)||(43358755-43359045)
chr1 (15-317)||(10186483-10186783)
chr1 (15-153)||(3465473-3465611)
chr1 (17-318)||(19310826-19311116)
chr1 (15-279)||(44523971-44524226)
chr1 (26-315)||(21431585-21431865)
chr1 (13-317)||(1187826-1188113)
chr1 (15-133)||(17414621-17414740)
chr1 (15-124)||(35626172-35626281)
chr1 (165-317)||(16051335-16051487)
chr1 (174-304)||(13654468-13654598)
chr1 (15-138)||(13654335-13654461)
chr1 (15-76)||(16051206-16051267)
chr1 (156-226)||(3701491-3701561)
chr1 (233-318)||(43359020-43359104)
chr1 (165-300)||(35653172-35653307)
chr1 (233-302)||(10185907-10185976)
chr1 (233-304)||(10186437-10186508)
chr1 (167-226)||(17414561-17414620)
chr1 (13-57)||(29681588-29681632)
chr1 (13-57)||(48366213-48366257)
chr1 (267-319)||(3696231-3696283)
chr1 (234-302)||(35626398-35626465)
chr1 (233-304)||(21431537-21431608)
chr1 (179-221)||(10185832-10185874)
chr1 (233-281)||(17414473-17414521)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (15-325)||(9877433-9877743)
chr5 (15-325)||(9872318-9872628)
chr5 (15-325)||(39908958-39909268)
chr5 (15-325)||(39903845-39904155)
chr5 (15-304)||(13556219-13556509)
chr5 (15-317)||(2022964-2023255)
chr5 (15-317)||(35368803-35369095)
chr5 (15-131)||(4555653-4555769)
chr5 (233-318)||(2023230-2023315)
chr5 (167-226)||(4555772-4555831)
chr5 (165-303)||(43540699-43540834)
chr5 (37-109)||(25184114-25184186)
chr5 (50-121)||(43540857-43540928)
chr5 (15-66)||(43378437-43378488)
chr5 (183-317)||(43379556-43379685)
chr5 (233-317)||(35368744-35368828)
chr5 (94-144)||(43378491-43378541)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (15-325)||(17720420-17720730)
chr2 (15-325)||(14917276-14917586)
chr2 (15-325)||(45120386-45120697)
chr2 (15-325)||(30283344-30283645)
chr2 (15-317)||(42780184-42780475)
chr2 (162-317)||(20892252-20892406)
chr2 (15-123)||(716267-716375)
chr2 (163-304)||(716402-716543)
chr2 (263-325)||(39178847-39178909)
chr2 (15-123)||(16284437-16284546)
chr2 (283-325)||(17720093-17720135)
chr2 (234-304)||(716532-716602)
chr2 (197-276)||(16286003-16286082)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (15-325)||(1913-2223)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (15-317)||(173358-173645)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (174-304)||(144229-144359)
scaffold0006 (15-138)||(144096-144222)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10673142 - 10672832
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10673142 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10673043  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10673042 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10672943  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672942 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10672843  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  10672842 ttattaataat 10672832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 4049807 - 4050118
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049807 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4049906  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049907 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4050006  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050007 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 4050106  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  4050107 attattaataat 4050118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31076606 - 31076298
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076606 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31076507  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31076506 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31076407  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076406 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31076307  T
Q  315 ttattaata 323  Q
    |||||||||    
T  31076306 ttattaata 31076298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10591499 - 10591189
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10591499 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10591400  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591399 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10591300  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591299 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttaccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 10591200  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  10591199 ttattaataat 10591189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31081711 - 31081401
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081711 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 31081612  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31081611 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatgttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttataatgcattatatgactcttcacatg 31081512  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081511 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 31081412  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  31081411 ttattaataat 31081401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1302449 - 1302138
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302449 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 1302350  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302349 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 1302250  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302249 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 1302150  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  1302149 attattaataat 1302138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 8458311 - 8458622
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8458311 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8458410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgccc-aaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458411 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 8458510  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8458511 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaccacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgttatggttc 8458610  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  8458611 attattaataat 8458622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6858259 - 6857949
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6858259 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6858160  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858159 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6858060  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858059 agagaaatcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6857960  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  6857959 ttattaataat 6857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10585062 - 10584752
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10585062 tattttacagatttatggttctagctattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaggaattatgttgttaatgtaa 10584963  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584962 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 10584863  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10584862 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatatttgaatcaatgtcatggttca 10584763  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  10584762 ttattaataat 10584752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10678257 - 10677945
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678257 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 10678158  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattata--tgactcttcaca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10678157 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgtgactcttcaca 10678058  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 312  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678057 tgaaagaaagcacctttttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 10677958  T
Q  313 cattattaataat 325  Q
    |||||||||||||    
T  10677957 cattattaataat 10677945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 4054941 - 4055252
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4054941 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4055040  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055041 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 4055140  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055141 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 4055240  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  4055241 attattaataat 4055252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6853156 - 6852846
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6853156 tattttacagatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 6853057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853056 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 6852957  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6852956 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatcaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 6852857  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  6852856 ttattaataat 6852846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 8464750 - 8465060
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8464750 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 8464849  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464850 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 8464949  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8464950 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatatacttgagtcaatgtcatggttca 8465049  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  8465050 ttattaataat 8465060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33702804 - 33702493
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702804 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33702705  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702704 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtctattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33702605  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33702604 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccttatatacttgaatcaatgtcatggttc 33702505  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  33702504 attattaataat 33702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5481692 - 5481382
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5481692 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5481593  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481592 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 5481493  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481492 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 5481393  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  5481392 ttattaataat 5481382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5458216 - 5457905
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5458216 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 5458117  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgt-attttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458116 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggttttttttatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 5458017  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458016 gagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaagggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 5457917  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  5457916 attattaataat 5457905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 33703299 - 33703506
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703299 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 33703398  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgg-tttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703399 caaaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 33703498  T
Q  214 gagagaaa 221  Q
    ||||||||    
T  33703499 gagagaaa 33703506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 318
Target Start/End: Original strand, 49784494 - 49784789
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||  |  |||||||||||||||||     
T  49784494 aatattttccagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatagatgatttaaagtaaaagaatgagggggaattatgttgttaatgc 49784593  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    |||||||||||||||||| |         |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49784594 aacaaaattctgtccaaaat---------tgtgtg-ttgttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 49784683  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 312  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  49784684 tgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaagcacccatttgccaaagcttatgatcatatacacttgaatcaatgatatggtt 49784783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Original strand, 29827551 - 29827705
Alignment:
Q  162 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaac 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  29827551 aactaatgcccaaatgccaagcatttataatgcattatatgact-ttcacatgatagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 29827649  T
Q  262 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||  | |||||||||    
T  29827650 accattttgccaaagattatgaccatacacacttgaatcaatgctaaggttcatta 29827705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3187660 - 3187551
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3187660 aatattttacagatttatggttcgagcaattcactcatgcattaaagaattgatagatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 3187561  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
     |||||||||    
T  3187560 cacaaaattc 3187551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 20891059 - 20891162
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  20891059 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagcgaatgagggagaattatgttgtttatgtaa 20891158  T
Q  115 caaa 118  Q
    ||||    
T  20891159 caaa 20891162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18024354 - 18024246
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  18024354 aatattttacagatttattgttctaacaattcattcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgt 18024255  T
Q  113 aacaaaatt 121  Q
    |||||||||    
T  18024254 aacaaaatt 18024246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18024228 - 18024167
Alignment:
Q  171 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctcttta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18024228 ccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacctcttta 18024167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 49784763 - 49784848
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49784763 acttgaatcaatgatatggtttattatgcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcattat 49784848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 20891182 - 20891243
Alignment:
Q  170 cccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctcttt 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20891182 cccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccttt 20891243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 29827429 - 29827532
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  | ||||||| ||| |||||| ||    
T  29827429 tattttacagatttat-----cagcaattcactcatgcattagagaattgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattaggttattaatgcaa 29827523  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  29827524 caaaattct 29827532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 20891354 - 20891402
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20891354 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaggttat 20891402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18023607 - 18023560
Alignment:
Q  183 catttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctcttt 231  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18023607 catttataatgtattatatgac-cttcacatgagagaaaacacctcttt 18023560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18024137 - 18024085
Alignment:
Q  229 tttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18024137 tttaacttgaatcaatgttatggtttattaaacacccttttgccaaagattat 18024085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Original strand, 29827680 - 29827764
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  29827680 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcaccaatttgtcaaatgttataatcatatacacttgaatcaatgcaaaggttcatta 29827764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18023525 - 18023466
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatata 292  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18023525 acttgaatcaatgatatgattcattaagcacccctttaccaacggttatgaccatatata 18023466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26987193 - 26986883
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26987193 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26987094  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26987093 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26986994  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986993 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26986894  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  26986893 ttattaataat 26986883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14315115 - 14314805
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315115 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14315016  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14314916  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314915 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14314816  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  14314815 ttattaataat 14314805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14318819 - 14318509
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318819 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 14318720  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318719 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14318620  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318619 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14318520  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  14318519 ttattaataat 14318509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26982080 - 26981769
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982080 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26981981  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981980 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcacat 26981881  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26981880 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccgtatatacttgaatcaatgtcatggttc 26981781  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  26981780 attattaataat 26981769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18494380 - 18494071
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 18494281  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494280 caaaattctatccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 18494181  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494180 agagaaagcacct-tttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 18494082  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  18494081 ttattaataat 18494071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 34108229 - 34108541
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34108229 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 34108328  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattt--tcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108329 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 34108428  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108429 tgagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 34108528  T
Q  313 cattattaataat 325  Q
    |||||||||||||    
T  34108529 cattattaataat 34108541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43957051 - 43956764
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43957051 ttttacaaatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgcaaca 43956952  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43956951 aaattatgtccaaattgtgtgtagttgtgtg-tttttgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 43956853  T
Q  217 agaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgt 305  Q
    ||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  43956852 agaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacatttgaatcaatgt 43956764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10341163 - 10340869
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||     
T  10341163 aatattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagaatttatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 10341064  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    |||||||||||||||||| |         ||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10341063 aacaaaattctgtccaaaat---------tgtatg-tttttatatgtccaactaatgcccaaatgccaagcatttatggtgcattatatgactcttcaca 10340974  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 312  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  10340973 tgagaaaaagcacctctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgatt 10340874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25953363 - 25953090
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25953363 tattgtacatatttatggttcaagcaattcactcatgcattagacaattgatggatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 25953264  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||         | |||||| ||| |||| | | ||| |        |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25953263 caaaattctgtccaa---------aattgtgttgttattgtttgtccaaat-------taatgccaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatg 25953180  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgcc-aaaggttataaccatatatacttgaatcaat 303  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||   ||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25953179 agagaaaacacccatttgacttaaatcaattttatggttcattaagcatccttttgccaaaatgttatgatcatatacacttgaatcaat 25953090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18608703 - 18608554
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  18608703 taatgcctaaatgccaaacatttgtagtgcattatatgac-cttcacatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 18608605  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcat 315  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  18608604 cctttgccaaaggttatgaacatatacacttgaatcactgctatggttcat 18608554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18608832 - 18608724
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  18608832 tattttacagatttatcgttccgtcaattaactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 18608733  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  18608732 caaaattct 18608724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 18885065 - 18885136
Alignment:
Q  16 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18885065 attttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaa 18885136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 1781968 - 1782117
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||     
T  1781968 taatgtccaaatgtcaaacatttatagtgcagtatacgacctttcacatgagagaaaatactattttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacg 1782067  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | ||| | ||| |||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1782068 cattttctaaatgttat---catatacacttgaatcaatgttatggttcatta 1782117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10340867 - 10340819
Alignment:
Q  270 gccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10340867 gccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatgtcatggttcattat 10340819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 246
Target Start/End: Original strand, 18616167 - 18616203
Alignment:
Q  210 acatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18616167 acatgagagaaaacacccctttaacttgaatcaatgc 18616203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 1781869 - 1781939
Alignment:
Q  45 actcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaac 115  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  1781869 actcatgaattagagaattggtggatgattttgagtaagagaatgagggataattatgttgttaatgtaac 1781939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 12856789 - 12857099
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856789 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 12856888  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856889 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 12856988  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856989 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 12857088  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  12857089 ttattaataat 12857099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 26051021 - 26051331
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051021 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26051120  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051121 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26051220  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051221 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26051320  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  26051321 ttattaataat 26051331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 26060380 - 26060690
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060380 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26060479  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060480 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26060579  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060580 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26060679  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  26060680 ttattaataat 26060690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 26056134 - 26056444
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056134 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26056233  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056234 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26056333  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056334 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26056433  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||| ||||||    
T  26056434 ttatcaataat 26056444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 26065493 - 26065803
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065493 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 26065592  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065593 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcctaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 26065692  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065693 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 26065792  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||| ||||||    
T  26065793 ttatcaataat 26065803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 12851674 - 12851986
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12851674 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 12851773  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattt--tcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851774 caaaattttgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtatatcttcaactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcaca 12851873  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 312  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851874 tgagagaaagcacctatttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggtt 12851973  T
Q  313 cattattaataat 325  Q
    |||||||||||||    
T  12851974 cattattaataat 12851986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 14610364 - 14610506
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14610364 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14610463  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610464 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtat 14610506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 14610512 - 14610639
Alignment:
Q  198 atatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610512 atatgactcttcacatgagagaaagcacctctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttga 14610611  T
Q  298 atcaatgtcatggttcattattaataat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610612 atcaatgtcatggttcattattaataat 14610639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5440492 - 5440217
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  5440492 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5440393  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaact-aatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | | ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5440392 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5440306  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaa 302  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  5440305 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5440217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5449502 - 5449227
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  5449502 tattttacagatgtatggttccagcaatttactcaagctttagagaattgatcgatgatttagagtaagggaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 5449403  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaact-aatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
     |||| |   ||    ||||      |  ||| |||||||| | | ||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5449402 taaaaat---tc----ttgt------tcttgttgtttttgtgtgtccaaattaaagcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgacccttcacat 5449316  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaa 302  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  5449315 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaatcacccctttcccaaaagttatgaccatatacacttaaatcaa 5449227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4181457 - 4181347
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||    
T  4181457 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgactcttcatatgagagaaaacaccattttgacttgaatcaatgttaaggttcattaagcacc 4181358  T
Q  265 cttttgccaaa 275  Q
    | |||||||||    
T  4181357 cctttgccaaa 4181347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 11056625 - 11056720
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  11056625 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgataaagaattatgttgttaat 11056720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4181585 - 4181478
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  4181585 tattttacgggtttatggttcgagcaat-cactcatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 4181487  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  4181486 caaaattct 4181478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37460047 - 37459938
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  37460047 aatattttacagatatatggtttcagcaattcgctaatgcatcagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgtgggagaattatgttgttcatgt 37459948  T
Q  113 aacaaaattc 122  Q
    |||| |||||    
T  37459947 aacataattc 37459938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37459917 - 37459802
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||   ||| | ||||||  |||  ||| ||||||||||||     
T  37459917 taatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgtccattcacatgagagaaaacacgcatttgatttgaattgatgttatggttcattaaacact 37459818  T
Q  265 cttttgccaaaggtta 280  Q
    | ||||||||||||||    
T  37459817 catttgccaaaggtta 37459802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35352375 - 35352222
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttc-acatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacac 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||| |||||| |||| |   || |||||||| |||    
T  35352375 taatgcccaaatgtcaagcatatatggtgcattatatgacccttcaaaatgagagaaaatgtctctttgacttgattcaacgatttggttcattaagcac 35352276  T
Q  264 ccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    || |||  |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  35352275 ccatttatcaaaggttatgattatatacacttgaatcaatgttatgattcatta 35352222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35352495 - 35352434
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgattta 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35352495 tattttatagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatggttta 35352434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5436736 - 5436692
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5436736 aatattttacagatttatggttcaagcaattcactaatgcattag 5436692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 21275773 - 21276083
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275773 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 21275872  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275873 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 21275972  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275973 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 21276072  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  21276073 ttattaataat 21276083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21936886 - 21936606
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21936886 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatagatgatttagagtatgagaatgatggagaattatgttgttaatgt 21936787  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||     ||| ||| |||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21936786 aacaaagttcagtccaaaattgtgtgt-----tgttgttgttg--tgttaaactaatgcccaaatgttaagcatttatagtgcattatatgacccttcac 21936694  T
Q  212 atgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaat 299  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21936693 atgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggtttattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaat 21936606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Original strand, 21937568 - 21937855
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  21937568 aatattatacaaatttatggttccagcaattcactcatgcatttgagaattgatggatgttttagaataagagagtgatggaaaattatgttgttaatgt 21937667  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21937668 a-caaaattatgtccaaaattgtgtgttgttgtt--gttgttgtgtta--aactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcgttatatgacccttcac 21937762  T
Q  212 atgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  21937763 atgagagaaaatacccctttgacttgaatcaatgtgatggttcattaaacacccttttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatg 21937855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 24509703 - 24510005
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24509703 tattttacaaatttatggttccaacaattcactaatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24509802  T
Q  115 caaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    || |||| ||| |||| || ||| || ||||   ||| | || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24509803 cataattttgtacaaaattatgtataattgtt--gttgtcgtgtta--aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgaaccttcacat 24509898  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggtt---ataaccatatatacttgaatcaatgtcatgg 310  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||| |||   || | |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  24509899 gagagaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaaacacacttttgtcaaatgttatgatcatcatatacacttgaattaatgttaagg 24509998  T
Q  311 ttcatta 317  Q
    |||||||    
T  24509999 ttcatta 24510005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20752322 - 20752207
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20752322 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcatcagagaattgatggatgacttatagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 20752223  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20752222 caaaattctttccaaa 20752207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24509032 - 24508917
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24509032 tattttacaaatttatgattccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaaaagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 24508933  T
Q  115 caaaattctgtccaaa 130  Q
    || |||| ||| ||||    
T  24508932 cataattttgtacaaa 24508917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24508914 - 24508762
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  24508914 taatgcccaaatgccaaacatttacagtacataatatgacccttctcatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 24508815  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||  | |||||||||    
T  24508814 cttttgccaaaggttatgatcttatacacttgaattaatgctaaggttcatta 24508762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2887490 - 2887596
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||| ||||| ||    
T  2887490 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2887589  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2887590 caaaatt 2887596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20752192 - 20752040
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  20752192 taatgcctaaatgccaagtatttatagtgcattagatgacctttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacc 20752093  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
     ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  20752092 attttgtcaaaggttatggccatatacacttgaatcaatgctaaggttcatta 20752040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11183370 - 11183263
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||| ||| |||||    
T  11183370 tattttacaggtttatggtttcagcaatttactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaatgagagagaattatgttattattgtaa 11183271  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  11183270 caaaattc 11183263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 2889212 - 2889318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||| ||||| ||    
T  2889212 tattttacagatttatgattccagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttggtaatggaa 2889311  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  2889312 caaaatt 2889318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11183212 - 11183104
Alignment:
Q  194 cattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatac 293  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||| ||    
T  11183212 cattatatgagccttcacatgggagaacacacccatttgacttgaatcagtgttatggttcattaaacatccctttgtcaaaggttatgatcatatacac 11183113  T
Q  294 ttgaatcaa 302  Q
    |||||||||    
T  11183112 ttgaatcaa 11183104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20752065 - 20751994
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  20752065 acttgaatcaatgctaaggttcattaaacacccctttgtcaaaggttataataatatacacttgaaccaatg 20751994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24508787 - 24508716
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  24508787 acttgaattaatgctaaggttcattaaacacccctttaccaaaggtcatgatcatatacacttgaatcaatg 24508716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21936594 - 21936529
Alignment:
Q  252 ttcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  21936594 ttcactaaacacccctttgccaaaggtcatgatcatataaacttgaatcaatgcaaaggttcatta 21936529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Original strand, 12909533 - 12909577
Alignment:
Q  235 ttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12909533 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggtt 12909577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Original strand, 12934640 - 12934684
Alignment:
Q  235 ttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12934640 ttgaatcaatgctaaggttcattaaacacctttttgccaaaggtt 12934684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 35096028 - 35096338
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096028 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 35096127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096128 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35096227  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096228 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35096327  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  35096328 ttattaataat 35096338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 35090915 - 35091225
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  35090915 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattttgatgaattatgttgttaatgtaa 35091014  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091015 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtatggtttttgtctcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 35091114  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091115 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 35091214  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  35091215 ttattaataat 35091225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32429487 - 32429195
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||  ||    
T  32429487 tattttacagatttatggttccaacaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatccaa 32429388  T
Q  115 caaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||           | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32429387 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcacaaatgccaagcatttatagtgcattatatgactcttcaaat 32429299  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  32429298 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattc 32429199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30020054 - 30019750
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30020054 tatttcacatatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 30019955  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggt--ttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | || | | |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30019954 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgttgttctgttctctgtcaaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacccttcac 30019855  T
Q  212 atgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggt 311  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||  | |||    
T  30019854 atgagagaaagcacccatttgacttgaatc-atgttatggttcattaagcacctttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgcaaaggt 30019756  T
Q  312 tcatta 317  Q
    ||||||    
T  30019755 tcatta 30019750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Original strand, 18670838 - 18671132
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||||||||     
T  18670838 aatattttacagatttatggttccaacaagtcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 18670937  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaact-aatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    |||| |||||||        || | || |||| |  || |||| | | ||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18670938 aacataattctg--------gtttcta-ttgtct--ttgttgtgtgtccaaattaattcccaaatgccaagcatttatagtccattatatgacccttcac 18671026  T
Q  212 atgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggt 311  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18671027 atgagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatggttcattaagccctcttttaccaaaggttatcttcatatacacttgaatcaatgttatggt 18671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3409662 - 3409510
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3409662 taatgcccaaatgtcaaatatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcctttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacc 3409563  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3409562 cctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 3409510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14643934 - 14643647
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  14643934 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 14643835  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||| |      | | ||||         ||||  ||| || || |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14643834 caaaattcttt------tttctgta---------ttttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatg 14643750  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  14643749 atagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttca 14643650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54859232 - 54859079
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaaca-cctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacac 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||     
T  54859232 taatgcccaaatatcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacaccccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcat 54859133  T
Q  264 ccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  54859132 ccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgtttcatta 54859079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18716489 - 18716599
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  18716489 tattttacagatttatggttccagcaattcactcttgtattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgggggagaattatgttgttaatgcaa 18716588  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18716589 caaaattctgt 18716599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 125
Target Start/End: Original strand, 18737162 - 18737272
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  18737162 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgaattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaa 18737261  T
Q  115 caaaattctgt 125  Q
    |||||||||||    
T  18737262 caaaattctgt 18737272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25618357 - 25618209
Alignment:
Q  162 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaac 261  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25618357 aactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgac-------atgagagaaaacacctctgtgacttgaatcaatgttatgattcattaagc 25618265  T
Q  262 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | ||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25618264 atccagttgcgaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 25618209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34279567 - 34279427
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||| || ||| ||||||    
T  34279567 taatgctcaaatgtcgagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatggttaattgaacacc 34279468  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgt 305  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  34279467 cttttaccaaaggttatgatcatatacacttaaatcaatgt 34279427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34279695 - 34279588
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  34279695 tattttacagatttatggtttcaggaattcactcatgcattagagaattgatggttgatttagagtaagagaacgaggaagaattatgttgttaatgtaa 34279596  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  34279595 caaaattc 34279588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 47071535 - 47071693
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat------gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcatta 258  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||      |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  47071535 taatgcccaaatgttaaacatttatagtacattatatgacccttcacatgaacatgagagaaaacacttttttgacttgaatcaatgcaatggttcatta 47071634  T
Q  259 aacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | || || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47071635 agcatccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 47071693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34128442 - 34128333
Alignment:
Q  14 atattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||||| |    
T  34128442 atattttacagatttatggtttcaacaattcactcatgcattagaaaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgatgttaatgca 34128343  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  34128342 acaaaattct 34128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54859361 - 54859254
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||  | ||||| ||||||||||||| |    
T  54859361 tattttacggatttatggttccagcaattcactcgtgcattagagaattgatggatgatttagagcaagagaatgagggagaatcatgttgttaatgtga 54859262  T
Q  115 caaaattc 122  Q
    ||||||||    
T  54859261 caaaattc 54859254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 47071408 - 47071514
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  47071408 tattttacaaatttatggttcaaacaattcactcattcattagagaattgatagataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 47071507  T
Q  115 caaaatt 121  Q
    |||||||    
T  47071508 caaaatt 47071514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32429220 - 32429135
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32429220 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcattgtcatggttcattat 32429135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 22118855 - 22119009
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa--acacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaaca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||   ||| |||||||| ||    
T  22118855 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtatattatatgacccttcacatgagagaaaatacacccctttgacttgaatgaataatatggttcattaagca 22118954  T
Q  263 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    ||| |||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  22118955 cccctttgccgaaggttgcgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcatta 22119009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Original strand, 18671107 - 18671193
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatt 319  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18671107 acttgaatcaatgttatggttcattaagcaccattttgccaaaggttataaccatatacacttaaatcaatgtcatggttcattatt 18671193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3424299 - 3424214
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3424299 acttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacatttgaatcaatgtcatggttcattat 3424214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3424904 - 3424697
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaaga-attatgttgttaatgta 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | |||  |||||||||||| |||    
T  3424904 tattttacagatttatgtttccagtaactcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaagagaatgagggagatcttatgttgttaaagta 3424805  T
Q  114 ac-aaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcaca 212  Q
    || |||||| ||| ||       ||| |||||   |||| | ||     || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3424804 acaaaaattttgttca-------tgttgttgttctgtttgtcta-----aattaatgcccaaatatcaaatatttatagtgcattatatgacccttcaca 3424717  T
Q  213 tgagagaaaacacctcttta 232  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  3424716 tgagagaaaacaccccttta 3424697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 18716757 - 18716842
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18716757 acttgaatcaatgttatggttcattaagcactatttggccaaaggttataaccatatacacttgaatcaatgtcatggttcattat 18716842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34128314 - 34128234
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  34128314 taatggccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacattagagaaaacactcatttgacttgaatcaatg 34128234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3409535 - 3409450
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3409535 acttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgccaaaggttataactatacacatttgaatcaatgtcatggttcattat 3409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 18737430 - 18737515
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18737430 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacaatttagccaaaggttataacaatatacacttgaatcaatgtcatggttcattat 18737515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25618234 - 25618163
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25618234 acttgaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatg 25618163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Original strand, 18716698 - 18716782
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| | | ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18716698 acttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 18716782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Original strand, 18737371 - 18737455
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| | | ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18737371 acttgaatcaatgatatggttcattaagctctcttttaccaaaagttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 18737455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34602061 - 34601965
Alignment:
Q  196 ttatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatata 292  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||||    
T  34602061 ttatatgaccattcacatgagaaaaaacactcatttgacttgaatcaatgctatagttcattaaacatccatttgtcaaaggttatgatcatatata 34601965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34279406 - 34279356
Alignment:
Q  267 tttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  34279406 tttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcatta 34279356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 54859104 - 54859058
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  54859104 acttgaatcaatgttatgtttcattaagcacccttttgccaaaggtt 54859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 28574297 - 28574607
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574297 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28574396  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574397 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28574496  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574497 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28574596  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  28574597 ttattaataat 28574607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 28598309 - 28598619
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598309 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 28598408  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598409 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 28598508  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598509 agagaaaacacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 28598608  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  28598609 ttattaataat 28598619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 3468067 - 3468378
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468067 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3468166  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468167 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 3468266  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468267 gagagaaagcacatctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 3468366  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  3468367 attattaataat 3468378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Original strand, 43358755 - 43359045
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  43358755 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggataatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaaca 43358854  T
Q  117 aaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatga 215  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||           | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43358855 aaattcagtccaaaattgtgtgttgtagtgtg-----------tccaactaatgcccaaatgccaagcatttatagtgcattataggactcttcacatga 43358943  T
Q  216 gagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcat 315  Q
    |||||| |||   ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43358944 gagaaagcactcatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacccctttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcat 43359043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10186783 - 10186483
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10186783 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgtaa 10186684  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttc-aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||  | | ||| || | | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10186683 caaaattctgtccaaaat-tatgttgt--tattgttcttctgtgttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacat 10186587  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  10186586 gagagaaagcacccatttgacttgaaccaatgctatggttcattaagcacccctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttc 10186487  T
Q  314 atta 317  Q
    ||||    
T  10186486 atta 10186483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Original strand, 3465473 - 3465611
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465473 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 3465572  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465573 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt 3465611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 19310826 - 19311116
Alignment:
Q  17 ttttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  19310826 ttttacagatttatggttccagcaattcattcatgcattagagaattgatggatgatttatagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgtaaca 19310925  T
Q  117 aaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgag 216  Q
    ||| |||||||||| |         | ||| | |||||| |    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19310926 aaactctgtccaaaat---------tatgttgcttttgtgtca--aattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattacatgacccttcacatgag 19311014  T
Q  217 agaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatt 316  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||  | ||||||||    
T  19311015 agaaagcacccctttgacttgaatcaatgttatagttcattaagcacccttttaccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttcatt 19311114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44524226 - 44523971
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  44524226 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttaaagtaagagaatgatggagaattatgttgttaatgcaa 44524127  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac--a 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||          ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  44524126 caatattctgttcaaattgtgtgttgttgt-tg----------ttcaaattaatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgacccttcacata 44524038  T
Q  213 tgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggtt 279  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  44524037 tgagggaaaacacccatttgacttgaatcaatgttatggttcattaagcacccctttgacaaaggtt 44523971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21431865 - 21431585
Alignment:
Q  26 tttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaattctgt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  21431865 tttatggttccatcaattcactgatgcattagagaattgatggatgatttagattaagagaatgagggagaattatgttgttaatgcaacaaaattct-- 21431768  T
Q  126 ccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaaca- 224  Q
          ||| | | ||| | || || || | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  21431767 ------tgt-tcttgttttctg-ttgttctctgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaagcac 21431676  T
Q  225 cctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcat 315  Q
    || |||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  21431675 cccctttgacttaaatcaatgttatggttcattaagcacccttttgccaaaggttatgatcatacacacttgaatcaatgttaaggttcat 21431585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 317
Target Start/End: Original strand, 1187826 - 1188113
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||||||||    
T  1187826 aatattttacagatttatggttctaccaattcactcatgcattaaagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagga-gatttatgttgttaatgt 1187924  T
Q  113 aacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaact-aatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcac 211  Q
    ||||||||||               | ||| ||||  ||||||  | |||| | |||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||| |||    
T  1187925 aacaaaattc---------------ttgttctgtg--ttttgttgtgtcaaattaatgcccaaatggcaagcacttattatggattatatgactctacac 1188007  T
Q  212 atgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggt 311  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  | |||    
T  1188008 atgagagtaaacacccctttgacttgaattaatgttatggttcattaaacacccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgtatcaatgctaaggt 1188107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17414740 - 17414621
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17414740 tattttccagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 17414641  T
Q  115 caaaattc-tgtccaaattg 133  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  17414640 caaaattcatgtccaaattg 17414621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 35626172 - 35626281
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  35626172 tattttatagatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgagggagaattatgttgttaatgtaa 35626271  T
Q  115 caaaattctg 124  Q
    ||||||||||    
T  35626272 caaaattctg 35626281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 317
Target Start/End: Original strand, 16051335 - 16051487
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||     
T  16051335 taatgcccaaatgtcaaacatttatagtgcattatatgaccattcacatgagtgaaaacacccttttgacttgaatcaatgatatggttcattaagcact 16051434  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16051435 catttgccaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctatggttcatta 16051487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Original strand, 13654468 - 13654598
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgcca 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  13654468 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 13654567  T
Q  274 aaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    | |||||| | |||| | |||||| ||||||    
T  13654568 agggttatgatcatacacacttgagtcaatg 13654598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 13654335 - 13654461
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaat--aatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    || ||||||  | ||||||||||||||||||     
T  13654335 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 13654434  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13654435 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 13654461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 16051206 - 16051267
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgattta 76  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16051206 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgattta 16051267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3701561 - 3701491
Alignment:
Q  156 attttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacc 226  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3701561 attttaaactcaggcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatgtgactcttcacatgagagaaaacacc 3701491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 43359020 - 43359104
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43359020 acttgaatcaatgttatggttcattag-cacccttttgccaaatgttataaccatatacacttgaatcaatatcatggttcattat 43359104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35653307 - 35653172
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||  ||| |||||||| |||     
T  35653307 taatgcccaaatgtcaagtgtttataaggctatatatgacccttcacatgagagaaaacactcatttgaattgaatcaatgatatggttcattaagcact 35653208  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatc 300  Q
    | |||| |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35653207 cctttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatc 35653172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 302
Target Start/End: Original strand, 10185907 - 10185976
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaa 302  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10185907 acttgaatcaatgatatggttcattaagcacctttttgccaaaggttataaccatatacacttgaatcaa 10185976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10186508 - 10186437
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  10186508 acttgaatcaatgctatggttcattaagcacccttttgccaaaagttacaaccatataaacttcaatcaatg 10186437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17414620 - 17414561
Alignment:
Q  167 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacc 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  17414620 atgcccaaatgccaagcatttatagtgcattatatgaccattcacatgagagaaaccacc 17414561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 29681588 - 29681632
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29681588 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 29681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 48366257 - 48366213
Alignment:
Q  13 aatattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattag 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48366257 aatattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattag 48366213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3696283 - 3696231
Alignment:
Q  267 tttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattatt 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  3696283 tttgccaaaggttatgactatataaacttgaatcaatattatggttcattatt 3696231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Original strand, 35626398 - 35626465
Alignment:
Q  234 cttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaa 302  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35626398 cttgaatcaatgctaaggttcattaaatacc-ttttgtcaaaggttataatcatatacacttgaatcaa 35626465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21431608 - 21431537
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||||||||  | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21431608 acttgaatcaatgttaaggttcatcaagcacccatttgccaaaggttataattatatacacttgaatcaatg 21431537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Original strand, 10185832 - 10185874
Alignment:
Q  179 caagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  10185832 caagcatttatagtgcattatatgaccattcatatgagagaaa 10185874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17414521 - 17414473
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttat 281  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17414521 acttgaataaatgctatgaatcattaaacacctctttgccaaaggttat 17414473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9877743 - 9877433
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877743 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 9877644  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877643 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9877544  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877543 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9877444  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  9877443 ttattaataat 9877433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9872628 - 9872318
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9872628 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaattgtgaagaattatgttgttaatgtaa 9872529  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872528 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 9872429  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872428 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 9872329  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  9872328 ttattaataat 9872318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 39908958 - 39909268
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39908958 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39909057  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909058 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtgatttttgttttttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39909157  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909158 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39909257  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  39909258 ttattaataat 39909268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 39903845 - 39904155
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903845 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 39903944  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903945 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgttttttcaactaatgccaaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 39904044  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39904045 agagaaagcacctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcactattttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 39904144  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  39904145 ttattaataat 39904155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13556509 - 13556219
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13556509 tattttacatatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 13556410  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttt-tgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13556409 caaacttctgtccaaattgtgtgtagttgtgtccttttctgtatgtccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 13556310  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13556309 gagagaaagcacccatttgacttgaatcaatgctatgattcattaagcacctttttgccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatg 13556219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 2022964 - 2023255
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2022964 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataagagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 2023063  T
Q  115 caaaattctgtcc-aaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||           | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023064 caaaattctgtccaaaattatgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccatatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 2023152  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  2023153 gagagaaagcacc-ctttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacccatttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatgattc 2023251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35369095 - 35368803
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| || ||| ||    
T  35369095 tattttacagatttatggttacaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaggaagaattatgtttttgatgcaa 35368996  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||        ||| | | |||||||| || |||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35368995 caaaattct--------tgttttt-gttgtgtg-ttgttgtgtgtcaaattaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgacttttcacatg 35368906  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| | |||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  35368905 agagaaaacactcatttgacttgaatcaatgttatgattcattaaacacctttttatcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgctaaggttca 35368806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 4555653 - 4555769
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4555653 tattttacagatttatggtaccaataattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagtaatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 4555752  T
Q  115 caaaattctgtccaaat 131  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4555753 caaaattgtgtccaaat 4555769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 2023230 - 2023315
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattat 318  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2023230 acttgaatcaatgttatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatacacacttgaatcaatgtcatggttcattat 2023315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 226
Target Start/End: Original strand, 4555772 - 4555831
Alignment:
Q  167 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4555772 atgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactattaacatgagagaaaacacc 4555831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43540834 - 43540699
Alignment:
Q  165 taatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacc 264  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||   ||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |    
T  43540834 taatgcccagatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagag--aacactcatttgacttgagtcaatgttatggttcattaagca-c 43540738  T
Q  265 cttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaat 303  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  43540737 cttttgtcaaaggttatgatcatatacacttgaatcaat 43540699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Original strand, 25184114 - 25184186
Alignment:
Q  37 agcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaa 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25184114 agcaattcactaatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaaatatgttgttaa 25184186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43540928 - 43540857
Alignment:
Q  50 tgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaacaaaatt 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43540928 tgcattagagaattgatagatgatttagagtaagagaatgatggagaactatgttgttaatgtaacaaaatt 43540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 43378437 - 43378488
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgat 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43378437 tattttacagatttatggttccagcaattcactaatgcattaaagaattgat 43378488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 317
Target Start/End: Original strand, 43379556 - 43379685
Alignment:
Q  183 catttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttata 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||   ||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||     
T  43379556 catttatagtgcattatatgacccttcacat-----aaaacactcattttacttgaatcaatgttatgattcactaagcactcttttaccaaagtttatg 43379650  T
Q  283 accatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    | |||||| |||||||||||||  | |||||||||    
T  43379651 atcatatacacttgaatcaatgctacggttcatta 43379685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35368828 - 35368744
Alignment:
Q  233 acttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  | |||||||||    
T  35368828 acttgaatcaatgctaaggttcattaagcacctctttgtcaaaggttataatcatatacacttaaatcaatgctaaggttcatta 35368744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Original strand, 43378491 - 43378541
Alignment:
Q  94 agaattatgttgttaatgtaacaaaattctgtccaaattgtgtgtagttgt 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  43378491 agaattatgttgataatgtaacaatattgtgtccaaattatgtgttgttgt 43378541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17720730 - 17720420
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720730 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 17720631  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720630 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 17720531  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17720530 agagaaagcacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttcaatcaatgtcatggttca 17720431  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  17720430 ttattaataat 17720420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14917586 - 14917276
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14917586 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 14917487  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917486 caaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatcttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 14917387  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917386 agagaaaacagctatttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 14917287  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  14917286 ttattaataat 14917276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 45120386 - 45120697
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45120386 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattggagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 45120485  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttt-gtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120486 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggttttttgtatatccaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 45120585  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120586 gagagaaagcacctctttaacttgaatcaatgtcatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 45120685  T
Q  314 attattaataat 325  Q
    ||||||||||||    
T  45120686 attattaataat 45120697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30283645 - 30283344
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||||    
T  30283645 tattttacagatttatggttctagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagagtaagagaaggatggagaattatgttgttaatgtaa 30283546  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30283545 caaaattctgtccaaattgtgtttagttgtgtg---------ttttcaactaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgactcttcacatg 30283455  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30283454 aaagaaaacacccctttaacttgaatcaatattatggttcattaagcacccttttgccaaagattataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 30283355  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
     ||| ||||||    
T  30283354 gtatcaataat 30283344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 42780184 - 42780475
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42780184 tattttacaaatttatggttccaacaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatggtgaagaattatgtagt-aatgtaa 42780282  T
Q  115 caaaattctgtccaaa-ttgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacat 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||           | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780283 caaaattctgtccaaaattgtgtgttgttgtgtg-----------tccaactaatgcccaactgtcaatcatttatagtgcattatatgactcttcacat 42780371  T
Q  214 gagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttc 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |  || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42780372 gagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagccaccatttgccaaaggttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttc 42780471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20892406 - 20892252
Alignment:
Q  162 aactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaac 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| | |||||||||||   || |||||||| |    
T  20892406 aactaatgcccaaatgtcaagtatttatagtgcattatatgactcttcacacgagagaaaacactcatttgatttgaatcaatg-tttggttcattaagc 20892308  T
Q  262 acccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcatta 317  Q
    ||| ||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20892307 acctttttggcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttatggttcatta 20892252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 716267 - 716375
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||| | |     
T  716267 tattttacagatttagggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagagtaagagaatgaaggagaattatgttgttaaagaag 716366  T
Q  115 caaaattct 123  Q
    |||||||||    
T  716367 caaaattct 716375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 304
Target Start/End: Original strand, 716402 - 716543
Alignment:
Q  163 actaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaaca 262  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||  | | | |||||||||    
T  716402 actaatgcccaaatgccaaacatttatagtgcattatatgacctttcatatgagagaaaacatccctttgacttgaatcaatgttacggtccattaaaca 716501  T
Q  263 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    || |||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||    
T  716502 cctttttgccaaaggttatgatcatacactcttgaatcaatg 716543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 39178847 - 39178909
Alignment:
Q  263 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39178847 cccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataat 39178909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 16284437 - 16284546
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatga-tttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgta 113  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||  | |||||||| ||||||||| |    
T  16284437 tattttactgatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagagttgatgaatgattttagagtaagagaatgagggagaattatattgttaatgca 16284536  T
Q  114 acaaaattct 123  Q
    ||||||||||    
T  16284537 acaaaattct 16284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17720135 - 17720093
Alignment:
Q  283 accatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720135 accatatatacttgaatcaatgtcatggttcattattaataat 17720093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 304
Target Start/End: Original strand, 716532 - 716602
Alignment:
Q  234 cttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  716532 cttgaatcaatgctaagcttcattaagcacccctttaccaaaggttataatcatatacacttgaatcaatg 716602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 276
Target Start/End: Original strand, 16286003 - 16286082
Alignment:
Q  197 tatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaag 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  ||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16286003 tatatgacccttcacatgagagaaaacacccatttaacttcaatcaacgttatagttcattaaacaccattttaccaaag 16286082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2223 - 1913
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2223 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgatggatgatttagaataatagaatgatgaagaattatgttgttaatgtaa 2124  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2123 taaaattctgtccaagttgtgtgtagttgtgtggtttttgtatattcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 2024  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaagcacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 1924  T
Q  315 ttattaataat 325  Q
    |||||||||||    
T  1923 ttattaataat 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 317
Target Start/End: Original strand, 173358 - 173645
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaataatagaatggtgaagaattatgttgttaatgtaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  173358 tattttagagatttatggttccagcaattcacctatacattagagaattgatggatgatttagagtaagagaattaggaagaattatgttgttgatgtaa 173457  T
Q  115 caaaattctgtccaaattgtgtgtagttgtgtggtttttgtattttcaactaatgcccaaatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatg 214  Q
    ||||||||| |      | | ||||         ||||  ||| || || |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  173458 caaaattcttt------tttctgta---------ttttgttatgttaaattaatgcacaaatatcaaacatttatagcgcattatatgacccttcacatg 173542  T
Q  215 agagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgccaaaggttataaccatatatacttgaatcaatgtcatggttca 314  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| | |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  173543 atagaaaacacccatttgacttgaatcaatgctaaggttcattaaacactcctttgtcaaatgttatgatcatatacacttgaatcaatgttaaggttca 173642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Original strand, 144229 - 144359
Alignment:
Q  174 aatgtcaagcatttatagtgcattatatgactcttcacatgagagaaaacacctctttaacttgaatcaatgccatgattcattaaacacccttttgcca 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  144229 aatgccaagtatttatagtgcattatatgacccttcacatgagagaaaacacccctttgacttgaatcaatgttatggttcattaagtacccttttgcca 144328  T
Q  274 aaggttataaccatatatacttgaatcaatg 304  Q
    | |||||| | |||| | |||||| ||||||    
T  144329 agggttatgatcatacacacttgagtcaatg 144359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 144096 - 144222
Alignment:
Q  15 tattttacagatttatggttccagcaattcactcatgcattagagaattgattgatgatttagaat--aatagaatggtgaagaattatgttgttaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    || ||||||  | ||||||||||||||||||     
T  144096 tattttacagatttatggtttcagcaattcactcatgcattagagaattaatggatgatttagagagcaagagaatgagggagaattatgttgttaatgc 144195  T
Q  113 aacaaaattctgtcc-aaattgtgtgt 138  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  144196 aacaaaattctatccaaaattgtgtgt 144222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University