View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5686-Insertion-3 (Length: 985)

Name: NF5686-Insertion-3
Description: NF5686
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5686-Insertion-3
NF5686-Insertion-3
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (193-744)||(23853397-23853942)
chr8 (746-979)||(23854221-23854459)
chr8 (755-949)||(43643394-43643589)
chr8 (755-951)||(37970318-37970515)
chr8 (746-951)||(1149421-1149628)
chr8 (755-951)||(7890756-7890953)
chr8 (755-939)||(35459510-35459694)
chr8 (755-951)||(4132485-4132682)
chr8 (755-951)||(16446674-16446871)
chr8 (755-947)||(27082637-27082830)
chr8 (746-939)||(8803605-8803800)
chr8 (755-939)||(33906419-33906601)
chr8 (761-951)||(16223057-16223248)
chr8 (755-951)||(36694765-36694962)
chr8 (747-951)||(1205121-1205327)
chr8 (755-951)||(5299745-5299942)
chr8 (7-152)||(23853249-23853394)
chr8 (746-930)||(34895178-34895363)
chr8 (746-950)||(40862614-40862821)
chr8 (763-951)||(6098320-6098514)
chr8 (755-951)||(1953787-1953984)
chr8 (755-951)||(11727218-11727415)
chr8 (755-939)||(38644185-38644369)
chr8 (747-931)||(10554994-10555179)
chr8 (426-687)||(40588949-40589222)
chr8 (755-949)||(31933685-31933880)
chr8 (426-729)||(8451315-8451630)
chr8 (755-920)||(35859160-35859325)
chr8 (755-951)||(44869691-44869888)
chr8 (755-919)||(466059-466223)
chr8 (792-951)||(1149756-1149912)
chr8 (755-948)||(30654382-30654576)
chr8 (746-919)||(34951846-34952020)
chr8 (755-916)||(12587812-12587973)
chr8 (755-951)||(39098918-39099115)
chr8 (755-951)||(12876303-12876501)
chr8 (756-898)||(24823194-24823336)
chr8 (785-951)||(9864342-9864509)
chr8 (746-881)||(33198067-33198203)
chr8 (426-738)||(478239-478563)
chr8 (746-904)||(18259321-18259480)
chr8 (436-723)||(7126913-7127212)
chr8 (755-845)||(41362723-41362813)
chr8 (832-951)||(13307817-13307936)
chr8 (624-744)||(13414913-13415033)
chr8 (761-846)||(43025974-43026059)
chr8 (825-916)||(34463704-34463792)
chr8 (7-70)||(23851117-23851179)
chr8 (889-951)||(41910921-41910984)
chr8 (889-951)||(43025896-43025959)
chr8 (161-215)||(23851198-23851252)
chr8 (284-341)||(23851617-23851674)
chr8 (870-939)||(7998485-7998554)
chr8 (746-794)||(13307931-13307980)
chr8 (436-513)||(43318448-43318525)
chr8 (664-716)||(9496747-9496799)
chr8 (653-749)||(37711998-37712094)
chr8 (234-272)||(23851555-23851593)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (435-744)||(53496733-53497042)
chr3 (746-950)||(48355128-48355334)
chr3 (755-951)||(46297555-46297752)
chr3 (755-939)||(11357174-11357358)
chr3 (755-951)||(40552052-40552249)
chr3 (755-939)||(26941053-26941237)
chr3 (746-951)||(42505858-42506065)
chr3 (755-951)||(4761441-4761638)
chr3 (755-951)||(22622511-22622708)
chr3 (755-951)||(53228945-53229142)
chr3 (756-935)||(22451171-22451350)
chr3 (755-951)||(4015646-4015842)
chr3 (755-951)||(39282838-39283035)
chr3 (755-951)||(52040715-52040912)
chr3 (755-948)||(21009594-21009789)
chr3 (790-951)||(46994489-46994651)
chr3 (755-934)||(51212570-51212743)
chr3 (755-948)||(47481711-47481906)
chr3 (755-948)||(54505996-54506191)
chr3 (755-951)||(37157893-37158091)
chr3 (755-951)||(1089880-1090076)
chr3 (755-951)||(24707908-24708105)
chr3 (746-951)||(3362441-3362648)
chr3 (755-937)||(33378578-33378760)
chr3 (755-951)||(7327275-7327472)
chr3 (755-951)||(33698339-33698536)
chr3 (755-959)||(2008109-2008322)
chr3 (755-951)||(37203253-37203451)
chr3 (755-939)||(22445858-22446042)
chr3 (755-950)||(44891684-44891880)
chr3 (755-926)||(29099558-29099729)
chr3 (747-939)||(40936172-40936365)
chr3 (746-930)||(44186300-44186485)
chr3 (746-939)||(24488744-24488939)
chr3 (785-951)||(34133121-34133288)
chr3 (756-930)||(43975686-43975863)
chr3 (755-933)||(21193812-21193990)
chr3 (755-951)||(32373656-32373852)
chr3 (807-951)||(54828546-54828691)
chr3 (755-919)||(14586473-14586636)
chr3 (755-939)||(3654992-3655179)
chr3 (746-951)||(25579925-25580132)
chr3 (755-951)||(36012324-36012523)
chr3 (755-953)||(11356951-11357142)
chr3 (755-939)||(27480151-27480343)
chr3 (757-928)||(50475021-50475199)
chr3 (755-951)||(20373056-20373234)
chr3 (426-743)||(55199200-55199520)
chr3 (761-926)||(29164021-29164179)
chr3 (455-744)||(42340454-42340754)
chr3 (785-939)||(38591897-38592051)
chr3 (755-951)||(11467010-11467193)
chr3 (823-948)||(45174695-45174821)
chr3 (24-116)||(3158070-3158160)
chr3 (615-736)||(48227294-48227415)
chr3 (832-951)||(43348443-43348563)
chr3 (825-933)||(53811597-53811701)
chr3 (623-744)||(46007190-46007312)
chr3 (650-744)||(647388-647482)
chr3 (161-218)||(3139830-3139887)
chr3 (449-605)||(36310824-36310980)
chr3 (431-605)||(1070697-1070872)
chr3 (823-948)||(11835494-11835614)
chr3 (244-329)||(3157513-3157607)
chr3 (7-59)||(3158159-3158211)
chr3 (161-220)||(3157596-3157655)
chr3 (654-744)||(27941171-27941261)
chr3 (624-744)||(2615383-2615503)
chr3 (520-583)||(27747790-27747853)
chr3 (746-808)||(35844577-35844640)
chr3 (668-729)||(36310732-36310793)
chr3 (755-796)||(43348556-43348597)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (435-744)||(44526954-44527263)
chr1 (756-949)||(10922920-10923114)
chr1 (755-951)||(2959939-2960136)
chr1 (755-935)||(14758240-14758420)
chr1 (745-939)||(37451489-37451684)
chr1 (755-951)||(8222319-8222516)
chr1 (755-951)||(32216246-32216443)
chr1 (762-937)||(16415852-16416027)
chr1 (755-948)||(19899556-19899751)
chr1 (755-951)||(15383124-15383322)
chr1 (746-950)||(32267226-32267432)
chr1 (746-948)||(23999541-23999746)
chr1 (755-939)||(15168300-15168484)
chr1 (755-948)||(46931603-46931798)
chr1 (746-951)||(27266979-27267185)
chr1 (746-930)||(28564561-28564746)
chr1 (755-951)||(47279380-47279577)
chr1 (745-951)||(51129050-51129256)
chr1 (761-951)||(25160823-25161015)
chr1 (752-951)||(27227270-27227470)
chr1 (755-939)||(30254627-30254811)
chr1 (755-951)||(238301-238498)
chr1 (755-935)||(11742156-11742336)
chr1 (755-949)||(27532770-27532964)
chr1 (767-951)||(30326751-30326937)
chr1 (755-951)||(9902842-9903039)
chr1 (746-937)||(27763088-27763281)
chr1 (755-951)||(28769844-28770041)
chr1 (772-950)||(1359740-1359919)
chr1 (755-930)||(34012170-34012345)
chr1 (755-949)||(47682282-47682477)
chr1 (747-939)||(40885017-40885211)
chr1 (755-951)||(4330472-4330669)
chr1 (755-939)||(27563693-27563877)
chr1 (755-950)||(48353735-48353930)
chr1 (755-937)||(7078851-7079033)
chr1 (755-951)||(10181795-10181993)
chr1 (747-951)||(42721230-42721432)
chr1 (755-948)||(38823408-38823602)
chr1 (755-951)||(22170902-22171099)
chr1 (761-951)||(15752220-15752411)
chr1 (759-939)||(3309357-3309538)
chr1 (755-924)||(3535142-3535311)
chr1 (755-898)||(1547516-1547659)
chr1 (755-939)||(31621336-31621526)
chr1 (746-948)||(39393578-39393782)
chr1 (426-738)||(51112995-51113319)
chr1 (564-744)||(52109284-52109464)
chr1 (813-951)||(18422842-18422981)
chr1 (762-922)||(41926378-41926537)
chr1 (767-922)||(37618705-37618856)
chr1 (762-929)||(21289817-21289981)
chr1 (426-741)||(36733373-36733703)
chr1 (490-744)||(4394903-4395169)
chr1 (755-908)||(31962851-31963005)
chr1 (755-951)||(33725399-33725585)
chr1 (607-738)||(48949907-48950038)
chr1 (426-729)||(5609019-5609334)
chr1 (606-738)||(25682523-25682655)
chr1 (497-735)||(24538260-24538511)
chr1 (830-951)||(38759724-38759846)
chr1 (654-746)||(48166157-48166249)
chr1 (612-729)||(16816991-16817108)
chr1 (746-810)||(48620922-48620987)
chr1 (755-787)||(38759846-38759878)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (435-738)||(18345669-18345972)
chr2 (755-951)||(19289134-19289331)
chr2 (747-951)||(35959091-35959293)
chr2 (755-951)||(2325189-2325386)
chr2 (755-939)||(41465709-41465893)
chr2 (755-948)||(11366191-11366386)
chr2 (746-939)||(43648046-43648240)
chr2 (755-951)||(44913859-44914059)
chr2 (755-951)||(41961035-41961232)
chr2 (755-939)||(18494092-18494276)
chr2 (761-951)||(4763826-4764017)
chr2 (432-746)||(12130813-12131139)
chr2 (755-951)||(31862047-31862244)
chr2 (755-939)||(7006749-7006933)
chr2 (747-951)||(26357772-26357978)
chr2 (747-951)||(4167117-4167323)
chr2 (755-951)||(3177134-3177331)
chr2 (755-948)||(33709043-33709237)
chr2 (450-738)||(88263-88563)
chr2 (759-926)||(5881750-5881917)
chr2 (747-951)||(37905905-37906112)
chr2 (755-926)||(43770659-43770830)
chr2 (755-951)||(19500727-19500923)
chr2 (755-930)||(39167180-39167355)
chr2 (761-951)||(33550800-33550994)
chr2 (755-951)||(31570545-31570742)
chr2 (746-925)||(33660178-33660358)
chr2 (753-951)||(29241954-29242146)
chr2 (794-951)||(4263926-4264085)
chr2 (755-951)||(19424453-19424636)
chr2 (755-935)||(13711671-13711851)
chr2 (785-926)||(27349789-27349930)
chr2 (795-949)||(4478562-4478717)
chr2 (426-729)||(34696094-34696409)
chr2 (426-729)||(34718506-34718821)
chr2 (812-951)||(44286144-44286284)
chr2 (812-930)||(19314061-19314182)
chr2 (756-881)||(41051112-41051237)
chr2 (842-939)||(45327928-45328025)
chr2 (853-951)||(17071646-17071745)
chr2 (755-866)||(41463401-41463512)
chr2 (853-951)||(17054005-17054104)
chr2 (755-844)||(33902317-33902406)
chr2 (842-948)||(36642186-36642293)
chr2 (751-859)||(18257344-18257453)
chr2 (623-729)||(44017510-44017616)
chr2 (755-809)||(45328028-45328082)
chr2 (871-951)||(18258214-18258295)
chr2 (426-503)||(39826285-39826362)
chr2 (623-729)||(26198576-26198688)
chr2 (889-935)||(41463795-41463841)
chr2 (894-951)||(33902261-33902319)
chr2 (773-818)||(17053960-17054005)
chr2 (773-818)||(17071601-17071646)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (755-939)||(24886295-24886479)
chr5 (464-744)||(4267829-4268109)
chr5 (747-951)||(5830087-5830293)
chr5 (755-939)||(22973865-22974049)
chr5 (745-939)||(31705384-31705579)
chr5 (755-951)||(33908428-33908624)
chr5 (755-950)||(699346-699542)
chr5 (745-951)||(35504560-35504768)
chr5 (755-949)||(22255379-22255574)
chr5 (755-951)||(38528020-38528217)
chr5 (761-939)||(22981001-22981179)
chr5 (755-948)||(31786429-31786623)
chr5 (747-939)||(2888219-2888412)
chr5 (755-951)||(12910550-12910747)
chr5 (755-950)||(35826269-35826463)
chr5 (755-949)||(7208647-7208842)
chr5 (746-939)||(27330512-27330706)
chr5 (755-951)||(15992323-15992520)
chr5 (439-744)||(27292139-27292444)
chr5 (745-951)||(17157803-17158011)
chr5 (755-930)||(35511265-35511440)
chr5 (746-933)||(25889584-25889772)
chr5 (755-948)||(35934094-35934288)
chr5 (747-951)||(40133580-40133786)
chr5 (755-951)||(8437160-8437357)
chr5 (755-951)||(19120054-19120251)
chr5 (755-919)||(43308443-43308607)
chr5 (426-738)||(8387766-8388090)
chr5 (755-948)||(8741668-8741863)
chr5 (755-926)||(25669797-25669968)
chr5 (755-951)||(27318271-27318467)
chr5 (755-936)||(14409124-14409305)
chr5 (746-926)||(42342942-42343123)
chr5 (747-951)||(36860619-36860825)
chr5 (747-951)||(36866957-36867163)
chr5 (755-951)||(23116013-23116202)
chr5 (426-735)||(30222985-30223306)
chr5 (755-898)||(39573060-39573203)
chr5 (755-951)||(5837750-5837947)
chr5 (755-939)||(13956147-13956329)
chr5 (426-738)||(27533089-27533414)
chr5 (755-926)||(22019844-22020015)
chr5 (426-738)||(22767440-22767764)
chr5 (431-741)||(41940917-41941237)
chr5 (755-949)||(30969107-30969302)
chr5 (755-926)||(32563361-32563532)
chr5 (755-951)||(25500709-25500906)
chr5 (812-939)||(1429002-1429129)
chr5 (755-926)||(9200445-9200616)
chr5 (755-937)||(14919322-14919493)
chr5 (761-926)||(7693442-7693607)
chr5 (755-947)||(15724687-15724880)
chr5 (435-738)||(20204645-20204959)
chr5 (450-744)||(15988926-15989232)
chr5 (755-881)||(28416334-28416460)
chr5 (761-951)||(21088558-21088746)
chr5 (450-744)||(12660048-12660326)
chr5 (755-939)||(8466935-8467118)
chr5 (746-848)||(43254154-43254257)
chr5 (755-939)||(23954585-23954756)
chr5 (746-881)||(26269075-26269211)
chr5 (604-738)||(26597640-26597774)
chr5 (614-744)||(25730688-25730818)
chr5 (820-951)||(6824329-6824459)
chr5 (435-561)||(25730530-25730656)
chr5 (435-646)||(34653867-34654089)
chr5 (889-949)||(26268271-26268332)
chr5 (653-746)||(11375688-11375781)
chr5 (667-729)||(34652445-34652507)
chr5 (655-744)||(37448046-37448135)
chr5 (463-561)||(16074454-16074551)
chr5 (604-673)||(16074606-16074675)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (755-949)||(18797499-18797694)
chr7 (746-951)||(7334964-7335170)
chr7 (755-951)||(9355620-9355817)
chr7 (755-951)||(37110044-37110241)
chr7 (745-951)||(17842367-17842575)
chr7 (755-939)||(31578858-31579042)
chr7 (747-951)||(37703283-37703489)
chr7 (755-951)||(27283914-27284112)
chr7 (755-951)||(32820847-32821044)
chr7 (746-948)||(30055700-30055904)
chr7 (755-939)||(35353291-35353475)
chr7 (755-948)||(24211914-24212109)
chr7 (746-951)||(41764862-41765069)
chr7 (755-940)||(29173705-29173889)
chr7 (426-738)||(16731613-16731937)
chr7 (426-738)||(17709747-17710071)
chr7 (755-951)||(23111362-23111559)
chr7 (755-939)||(31520535-31520719)
chr7 (755-939)||(46480923-46481107)
chr7 (426-738)||(22288921-22289245)
chr7 (755-951)||(10481775-10481972)
chr7 (426-738)||(16098163-16098494)
chr7 (755-950)||(37347192-37347388)
chr7 (755-951)||(5657274-5657472)
chr7 (755-951)||(10359008-10359205)
chr7 (755-951)||(15612553-15612750)
chr7 (747-936)||(48928082-48928272)
chr7 (755-947)||(8861459-8861652)
chr7 (755-951)||(32432622-32432819)
chr7 (755-951)||(6546689-6546886)
chr7 (755-939)||(32593001-32593184)
chr7 (755-930)||(44411334-44411509)
chr7 (747-951)||(4583089-4583295)
chr7 (755-951)||(25691338-25691535)
chr7 (767-951)||(11071376-11071558)
chr7 (746-939)||(12390433-12390625)
chr7 (435-738)||(1581304-1581619)
chr7 (755-950)||(15672553-15672752)
chr7 (755-951)||(26587886-26588075)
chr7 (755-939)||(26980489-26980673)
chr7 (755-898)||(22687455-22687598)
chr7 (758-937)||(43925286-43925459)
chr7 (432-738)||(9328785-9329102)
chr7 (755-951)||(21991806-21991994)
chr7 (787-926)||(12165939-12166078)
chr7 (746-917)||(37704387-37704559)
chr7 (755-951)||(44598836-44599033)
chr7 (851-951)||(38258715-38258816)
chr7 (436-744)||(29201132-29201448)
chr7 (832-939)||(38053644-38053751)
chr7 (816-933)||(33688117-33688234)
chr7 (755-906)||(34361970-34362123)
chr7 (832-951)||(43686210-43686330)
chr7 (755-834)||(38258867-38258946)
chr7 (426-737)||(17877093-17877411)
chr7 (661-746)||(34578453-34578538)
chr7 (866-936)||(48928469-48928539)
chr7 (892-951)||(37704327-37704387)
chr7 (450-604)||(11745970-11746124)
chr7 (815-879)||(27421219-27421283)
chr7 (626-727)||(30824668-30824769)
chr7 (894-951)||(27421313-27421371)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (755-949)||(25184310-25184505)
chr4 (747-951)||(1815496-1815701)
chr4 (761-949)||(879373-879562)
chr4 (755-951)||(33816335-33816532)
chr4 (745-951)||(3042814-3043022)
chr4 (438-749)||(28537957-28538280)
chr4 (755-951)||(47253935-47254132)
chr4 (746-951)||(37663550-37663757)
chr4 (755-924)||(19440467-19440636)
chr4 (755-951)||(28002805-28003002)
chr4 (436-744)||(2064543-2064863)
chr4 (761-951)||(55477716-55477907)
chr4 (755-951)||(6864230-6864427)
chr4 (755-950)||(7703705-7703901)
chr4 (746-948)||(19089262-19089466)
chr4 (755-949)||(33341595-33341790)
chr4 (755-948)||(34361310-34361505)
chr4 (746-939)||(29584009-29584203)
chr4 (755-951)||(17167908-17168105)
chr4 (755-951)||(17173485-17173682)
chr4 (755-936)||(32579657-32579838)
chr4 (755-951)||(49376162-49376359)
chr4 (755-948)||(32912398-32912593)
chr4 (756-951)||(35020851-35021051)
chr4 (746-939)||(17272172-17272366)
chr4 (746-950)||(36493498-36493704)
chr4 (755-951)||(37287923-37288121)
chr4 (755-939)||(50697449-50697634)
chr4 (755-949)||(55240924-55241119)
chr4 (764-937)||(34947923-34948096)
chr4 (746-926)||(37775879-37776060)
chr4 (755-928)||(50764939-50765112)
chr4 (755-935)||(23761283-23761463)
chr4 (426-738)||(51259713-51260037)
chr4 (746-926)||(30002450-30002631)
chr4 (755-932)||(46887977-46888154)
chr4 (436-746)||(56065319-56065641)
chr4 (755-939)||(5047785-5047969)
chr4 (755-939)||(7152023-7152207)
chr4 (435-738)||(18442328-18442642)
chr4 (746-948)||(42199927-42200132)
chr4 (755-915)||(4205216-4205376)
chr4 (755-919)||(39400236-39400400)
chr4 (746-951)||(25700865-25701072)
chr4 (751-881)||(35025381-35025511)
chr4 (426-738)||(55734689-55735013)
chr4 (746-926)||(4598203-4598384)
chr4 (482-744)||(49951049-49951323)
chr4 (746-948)||(26896285-26896490)
chr4 (449-744)||(29655843-29656149)
chr4 (747-912)||(32592319-32592485)
chr4 (755-939)||(46883933-46884112)
chr4 (755-911)||(9139465-9139619)
chr4 (435-744)||(51735148-51735470)
chr4 (761-951)||(27396811-27397000)
chr4 (426-738)||(32577231-32577553)
chr4 (755-876)||(23431826-23431947)
chr4 (832-936)||(38012065-38012169)
chr4 (520-744)||(43840484-43840720)
chr4 (755-949)||(4934031-4934216)
chr4 (489-738)||(21321270-21321531)
chr4 (606-743)||(41835489-41835626)
chr4 (755-841)||(38012568-38012654)
chr4 (604-738)||(37246035-37246169)
chr4 (426-702)||(49119606-49119894)
chr4 (426-702)||(28425875-28426164)
chr4 (870-951)||(35025530-35025612)
chr4 (843-906)||(56050171-56050234)
chr4 (426-585)||(37246204-37246364)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (755-951)||(3879731-3879928)
chr6 (755-948)||(6090974-6091169)
chr6 (761-948)||(1946032-1946221)
chr6 (755-951)||(20768277-20768474)
chr6 (755-936)||(7234824-7235008)
chr6 (755-937)||(5627601-5627784)
chr6 (755-926)||(33892804-33892975)
chr6 (426-723)||(29368252-29368543)
chr6 (746-939)||(33619033-33619235)
chr6 (451-744)||(28106844-28107149)
chr6 (761-951)||(21016916-21017101)
chr6 (755-951)||(29182359-29182553)
chr6 (767-939)||(4318626-4318798)
chr6 (755-948)||(8513426-8513613)
chr6 (757-939)||(6089111-6089286)
chr6 (426-708)||(14679838-14680133)
chr6 (755-894)||(7054564-7054704)
chr6 (426-749)||(15606166-15606508)
chr6 (431-605)||(30802298-30802472)
chr6 (449-605)||(19364273-19364429)
chr6 (650-744)||(15053352-15053446)
chr6 (861-951)||(30353256-30353347)
chr6 (889-948)||(7055141-7055201)
chr6 (766-821)||(33724062-33724117)
chr6 (450-561)||(11732018-11732133)
chr6 (607-685)||(11731885-11731963)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (746-951)||(8082-8289)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (756-939)||(408223-408406)
scaffold0002 (758-951)||(329-517)
scaffold0002 (754-918)||(93893-94056)
scaffold0002 (910-951)||(94331-94373)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (755-951)||(12104-12300)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (755-951)||(44152-44348)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (755-951)||(154439-154635)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (746-948)||(145798-146003)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (755-951)||(267479-267668)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (604-746)||(56-198)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (805-926)||(100948-101055)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 193 - 744
Target Start/End: Original strand, 23853397 - 23853942
Alignment:
Q  193 ttccatacatcgattcaactttcaatacnnnnnnnnnngttgacaaaattcaactttcaatacttaactattgtaattataattcatataataaaatatg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853397 ttccatacatcgattcaactttcaatactttttttttttttgacaaaattcaactttcaatatttaactattgtaattataattcatataataaaatatg 23853496  T
Q  293 catcagatatctctttgcttattcataaagatatttgcatgaattcttgnnnnnnnnaaactaaaatatttgcgttgactcgattatttttaaattaaaa 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23853497 catcagatatctctttgcttattcataaagatatttgcatgaattcttgttttttttagactaaaatatttgcgttgcctcaattatttttaaattaaaa 23853596  T
Q  393 ctcattttaaataagcttctctattcactggtcgtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctca 492  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |   ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23853597 ctcattttatataagcttctctgttcaccggtcat---gtggcttaacttctttaccaaatttgggctgcacgtaataatgtcatttggaatgatgctca 23853693  T
Q  493 tcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcat 592  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  23853694 tcacacttcaacga---ttgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacattattcaccacaggttgtgcaacacaggcat 23853790  T
Q  593 aatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgct 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23853791 aatagagtgcaagtttgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcgatgtggacgccgcgttccatgaccgtaactatattacatcttttgcgtgtt 23853890  T
Q  693 gtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23853891 atgttagagactcccgtgggcaatttattcgggttcaaacgaaatgacagcg 23853942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 746 - 979
Target Start/End: Original strand, 23854221 - 23854459
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854221 gaaattgattttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 23854320  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23854321 gcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacact 23854420  T
Q  945 ttgtg-ggtg-tacac-tataac-aggtaagataaaatt 979  Q
    || || |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23854421 ttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaatt 23854459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 43643394 - 43643589
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643394 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 43643493  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43643494 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 43643589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 37970318 - 37970515
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37970318 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac 37970417  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37970418 atcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 37970515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 1149421 - 1149628
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149421 gaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 1149520  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1149521 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacac 1149620  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  1149621 tttgtggg 1149628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 7890756 - 7890953
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7890756 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 7890855  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  7890856 attttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggg 7890953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 35459510 - 35459694
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35459510 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 35459609  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35459610 attttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgt 35459694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 4132485 - 4132682
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132485 tttttggaaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 4132584  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4132585 atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggg 4132682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 16446674 - 16446871
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446674 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 16446773  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16446774 atcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggg 16446871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 947
Target Start/End: Original strand, 27082637 - 27082830
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082637 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27082736  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttg 947  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27082737 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttg 27082830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Original strand, 8803605 - 8803800
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8803605 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggta 8803704  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8803705 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgt 8803800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 33906601 - 33906419
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906601 tttttgaaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 33906504  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33906503 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 33906419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 16223248 - 16223057
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223248 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 16223149  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  16223148 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggg 16223057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 36694765 - 36694962
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36694765 tttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac 36694864  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36694865 atcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 36694962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 1205327 - 1205121
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205327 aaattgacttttttaaaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 1205228  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1205227 acttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacact 1205128  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  1205127 ttgtggg 1205121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 5299745 - 5299942
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299745 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 5299844  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5299845 atcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggg 5299942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 23853249 - 23853394
Alignment:
Q  7 attttgcctctcggtttgaaatcatgtttgaaaattttagtgcatcaaaacgatgatgtattaacaccactctcattcaatatggaagatttcagtaatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853249 attttgcctctcggtttgaaatcatgtttgaaaattttagtgtatcaaaacgatgatgtattaacaccactctcattcaatatggaagatttcagtaatt 23853348  T
Q  107 aacgacacgcgttacacattatagtatatagtttgaatcagtttat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23853349 aacgacacgcattacatattatagtttattgtttgaatcagtttat 23853394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 746 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 34895363 - 34895178
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34895363 gaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaa 34895264  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34895263 tgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34895178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 746 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 40862821 - 40862614
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcattttt-aaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40862821 gaaattgacttttttgaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagta 40862722  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40862721 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 40862622  T
Q  943 ctttgtgg 950  Q
    ||||||||    
T  40862621 ctttgtgg 40862614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 763 - 951
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098514
Alignment:
Q  763 aaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 862  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  863 cttacatgtactattttatt-----gtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||| |||||||| ||||     || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 6098514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 1953787 - 1953984
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  1953787 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaa 1953886  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || |  | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1953887 atcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 1953984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 11727415 - 11727218
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727415 tttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 11727316  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11727315 atcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 11727218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 38644369 - 38644185
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644369 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 38644270  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  38644269 atcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgt 38644185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 747 - 931
Target Start/End: Original strand, 10554994 - 10555179
Alignment:
Q  747 aaattgactttttg--aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagt--aattcatctagt 842  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10554994 aaattgacttttttgaaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagt 10555090  T
Q  843 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10555091 aatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc 10555179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 426 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 40589222 - 40588949
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||    
T  40589222 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggttgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgctcatcatacttcaacaagcattgggaggacgacact 40589123  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||            ||||||||||    
T  40589122 agatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccctcaccaccggttgtgcaacacgggcataacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggag 40589023  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgc 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  40589022 aaaccgagtgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatataacaacttttgc 40588949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 31933685 - 31933880
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  31933685 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaat 31933784  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  31933785 atcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtg 31933880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 426 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8451630 - 8451315
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  | |||| | ||||    
T  8451630 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgttatttggaatgatgttcatcatacttcaacaggcatcagaagaacagcact 8451531  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||            ||||||||    
T  8451530 agaggcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccatcaccacaggttgtgcaacaccagcaaaatagagtgcaaggtcatagttcaatttgggag 8451431  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||    
T  8451430 aaaccgtgcgagacgtggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccattttacatcttttggatgttgtgttagagactcttgtggac 8451331  T
Q  714 aatttattcgggctca 729  Q
    ||||||||||||||||    
T  8451330 aatttattcgggctca 8451315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 755 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 35859325 - 35859160
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35859325 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaac 35859226  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 920  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859225 atctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 44869888 - 44869691
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44869888 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat 44869789  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44869788 atcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtggg 44869691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 755 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 466223 - 466059
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466223 tttttgaataagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 466124  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  466123 atcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 466059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 792 - 951
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149912
Alignment:
Q  792 catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatc 891  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  892 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 30654382 - 30654576
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  30654382 tttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaa 30654480  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30654481 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 30654576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 746 - 919
Target Start/End: Original strand, 34951846 - 34952020
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34951846 gaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaa 34951945  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951946 gacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 12587973 - 12587812
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12587973 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaa 12587874  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatga 916  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587873 atctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 39098918 - 39099115
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39098918 tttttaaaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 39099017  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39099018 attttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtggg 39099115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 12876501 - 12876303
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||| ||| | |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12876501 tttttaaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaac 12876402  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12876401 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggg 12876303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 756 - 898
Target Start/End: Original strand, 24823194 - 24823336
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823194 ttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 24823293  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaaca 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24823294 tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 785 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864342
Alignment:
Q  785 tttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgt 884  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  885 cggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 9864342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 746 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 33198203 - 33198067
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33198203 gaaattgacttttttgaaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtga 33198104  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 881  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33198103 tgcttgcaacattttagacttacatgtactattttat 33198067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 478563 - 478239
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |   ||||    
T  478563 gtcgggtggctttacttcactggaaaatttgggttgcacgtaatgatatcatttggaatgacgctcatcatacttcaacaagcattggaaggacggcact 478464  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||            ||||||||    
T  478463 agatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcaccagtggttgtgcaacacaggcaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggag 478364  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||| |  |||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| | || ||| |    
T  478363 aaaccaagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcaacgttccatgaccacaaccatctaacatcttttgtgtgttgtgttagagatttccatggtc 478264  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||||| |||||||| || |||||    
T  478263 aatttatccgggctcaaacaaaatg 478239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 746 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 18259480 - 18259321
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  18259480 gaaattgacttttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaa 18259381  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaa 904  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  18259380 tgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaa 18259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 436 - 723
Target Start/End: Original strand, 7126913 - 7127212
Alignment:
Q  436 tttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatga 535  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || | | | ||  |||||||     
T  7126913 tttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacactcatcatacttcaacaagcattggaaggacagctctggatgcatgg 7127012  T
Q  536 caacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggagaaaccgaatg 623  Q
    || ||||| || |||||||||||||||   |||| | |||||||||||||| | || ||||| | |||            |||||||||||| ||||  |    
T  7127013 cagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgcaacacagccagaatagggggcaaggtaacaacttagtttgggagaagccgagcg 7127112  T
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||| || |||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  7127113 agacatggttgaagtggaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactctcgggggaaatttattcg 7127212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 755 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 41362813 - 41362723
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362813 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 832 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307817
Alignment:
Q  832 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  932 ttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggg 13307817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 624 - 744
Target Start/End: Original strand, 13414913 - 13415033
Alignment:
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||  || || |||||||||||    
T  13414913 agacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgtgtgtttttttagagactttcgcgggcaatttattcg 13415012  T
Q  724 ggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  13415013 ggctcaaacgaaatggcagcg 13415033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 761 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 43026059 - 43025974
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 846  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026059 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 825 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463704
Alignment:
Q  825 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatga 916  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| | ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaaca---tggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 23851117 - 23851179
Alignment:
Q  7 attttgcctctcggtttgaaatcatgtttgaaaattttagtgcatcaaaacgatgatgtattaa 70  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23851117 attttgcttctcgatttgaaatcatgtttgcaa-ttttagtacatcaaaacgatgatgtattaa 23851179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 889 - 951
Target Start/End: Original strand, 41910921 - 41910984
Alignment:
Q  889 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41910921 atctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggg 41910984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 889 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 43025959 - 43025896
Alignment:
Q  889 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  43025959 atctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggg 43025896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 23851198 - 23851252
Alignment:
Q  161 gatatttaggcacaaatcaagcagtgcataccttccatacatcgattcaactttc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  23851198 gatatttaggcacaaatcaagcagtgcatacatgtcatacatcgtttcaactttc 23851252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Original strand, 23851617 - 23851674
Alignment:
Q  284 taaaatatgcatcagatatctctttgcttattcataaagatatttgcatgaattcttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  23851617 taaaatatgcatcagatatctctttccttattcaaaaagataattgcattaactcttg 23851674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 870 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 7998554 - 7998485
Alignment:
Q  870 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7998554 gtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgt 7998485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13307980 - 13307931
Alignment:
Q  746 gaaattgact-ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcat 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13307980 gaaattgactattttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43318525 - 43318448
Alignment:
Q  436 tttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgg 513  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  43318525 tttacttctttggcaaatttgtgctgcaagtaatgatatcatttgaaatgatgctcatcatacttcaagaagcattgg 43318448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 664 - 716
Target Start/End: Original strand, 9496747 - 9496799
Alignment:
Q  664 ccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaat 716  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  9496747 ccgtaactatcttacatcttttgcgtgttgtattagagacttccgtggacaat 9496799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 653 - 749
Target Start/End: Original strand, 37711998 - 37712094
Alignment:
Q  653 gcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgagaaa 749  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||    
T  37711998 gcgtaccatgactgtaattatcttacattttttgcgtgttgtgttagaaactcgtgtgggcaatttatttgagctaaaacgaaatgacagcgggaaa 37712094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 272
Target Start/End: Original strand, 23851555 - 23851593
Alignment:
Q  234 gacaaaattcaactttcaatacttaactattgtaattat 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23851555 gacataattcaactttcaatacttagctattgtaattat 23851593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 53496733 - 53497042
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  53496733 ctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatg 53496832  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttg 634  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||     
T  53496833 gcagcaatgacaagaggttcataaaaatcgttcaccatcggttgtgcaacacgggcagaacagagtgcaagtttgggagaaaccgaccgagtcatggtta 53496932  T
Q  635 aagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacga 734  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |    
T  53496933 aagtgcaatgtggacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaa 53497032  T
Q  735 aatgacagcg 744  Q
    ||||||||||    
T  53497033 aatgacagcg 53497042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 746 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 48355334 - 48355128
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48355334 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaa 48355235  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48355234 tacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 48355135  T
Q  944 tttgtgg 950  Q
    |||||||    
T  48355134 tttgtgg 48355128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 46297555 - 46297752
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297555 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 46297654  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46297655 atcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 46297752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 11357174 - 11357358
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357174 tttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 11357273  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357274 atcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 11357358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 40552052 - 40552249
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552052 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 40552151  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||    
T  40552152 atcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtggg 40552249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 26941053 - 26941237
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941053 tttttgaaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 26941152  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26941153 atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgt 26941237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 42505858 - 42506065
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505858 gaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 42505957  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42505958 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 42506057  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  42506058 tttgtggg 42506065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 4761441 - 4761638
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4761441 ttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaac 4761540  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4761541 attttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtggg 4761638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 22622511 - 22622708
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622511 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 22622610  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22622611 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggg 22622708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 53228945 - 53229142
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53228945 tttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac 53229044  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53229045 atcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 53229142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 756 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 22451350 - 22451171
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22451350 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaaca 22451251  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22451250 tcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaa 22451171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4015842 - 4015646
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015842 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 4015743  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4015742 atcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggg 4015646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 39283035 - 39282838
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39283035 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 39282936  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39282935 attttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 39282838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 52040715 - 52040912
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  52040715 tttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaac 52040814  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  52040815 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggg 52040912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 21009594 - 21009789
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21009594 tttttaaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 21009693  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21009694 catcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 21009789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 790 - 951
Target Start/End: Original strand, 46994489 - 46994651
Alignment:
Q  790 ctcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaa 889  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46994489 ctcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaa 46994588  T
Q  890 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46994589 tctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 46994651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 755 - 934
Target Start/End: Original strand, 51212570 - 51212743
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212570 tttttgaaaaagttaattttgatcttaattt------catttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 51212663  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctta 934  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51212664 atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 47481906 - 47481711
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47481906 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 47481807  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481806 catcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 47481711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 54506191 - 54505996
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54506191 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 54506092  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||| ||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54506091 cattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 54505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37158091 - 37157893
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37158091 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgac 37157992  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37157991 atattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 37157893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 1090076 - 1089880
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1090076 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaa 1089977  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1089976 atcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 1089880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 24707908 - 24708105
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24707908 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaac 24708007  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  24708008 ttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggg 24708105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 3362648 - 3362441
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3362648 gaaattgacttttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaa 3362549  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3362548 tgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacac 3362449  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  3362448 tttgtggg 3362441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 937
Target Start/End: Original strand, 33378578 - 33378760
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33378578 tttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 33378677  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33378678 atcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagt 33378760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 7327275 - 7327472
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327275 tttttaaaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 7327374  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7327375 atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 7327472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 33698536 - 33698339
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33698536 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaat 33698437  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33698436 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggg 33698339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 2008322 - 2008109
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgattt-------ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgc 847  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2008322 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgc 2008223  T
Q  848 ttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacacttt 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2008222 ttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 2008123  T
Q  947 gtgg-gtgtacact 959  Q
    |||| |||||||||    
T  2008122 gtggagtgtacact 2008109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37203451 - 37203253
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  37203451 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgat 37203352  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37203351 atattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 37203253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 22445858 - 22446042
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22445858 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaac 22445957  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || ||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22445958 attttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgt 22446042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 44891880 - 44891684
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44891880 tttttaaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac 44891781  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44891780 atcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 44891684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 29099729 - 29099558
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29099729 tttttgaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaac 29099630  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29099629 atcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 747 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 40936365 - 40936172
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40936365 aaattgacttttttgaaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaat 40936266  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  40936265 gcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgt 40936172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 746 - 930
Target Start/End: Original strand, 44186300 - 44186485
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44186300 gaaattgattttttcgaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaa 44186399  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  44186400 tgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagt 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Original strand, 24488744 - 24488939
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt--tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  24488744 gaaattgacttttatttaaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagta 24488843  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24488844 atgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgt 24488939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 785 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133121
Alignment:
Q  785 tttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgt 884  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  885 cggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 34133121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 756 - 930
Target Start/End: Original strand, 43975686 - 43975863
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  43975686 ttttgaaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaa 43975785  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43975786 tcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt 43975863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 21193990 - 21193812
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21193990 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaac 21193891  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 933  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  21193890 atcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctt 21193812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 32373852 - 32373656
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |  | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32373852 tttttgaaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac 32373754  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32373753 atcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtggg 32373656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 807 - 951
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828691
Alignment:
Q  807 gatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 906  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  907 tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtggg 54828691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 919
Target Start/End: Original strand, 14586473 - 14586636
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14586473 tttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaac 14586572  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14586573 atcttggacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatat 14586636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 3654992 - 3655179
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactc-atttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcat--ctagtaatgcttgc 851  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3654992 tttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgc 3655091  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3655092 aacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgt 3655179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 25580132 - 25579925
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580132 gaaattgacttttttaaaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 25580033  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  25580032 tgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacac 25579933  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  25579932 tttgtggg 25579925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 36012523 - 36012324
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaa-ttttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36012523 tttttgaaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcag 36012424  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||| || || |||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36012423 cattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtggg 36012324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 755 - 953
Target Start/End: Original strand, 11356951 - 11357142
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||        ||||||||||||    
T  11356951 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaatt--------aatgcttgcaac 11357042  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgggtg 953  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  | || || |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11357043 atcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtgggtg 11357142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 27480151 - 27480343
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg---- 850  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||        
T  27480151 ttttttaaaaatataattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaat 27480250  T
Q  851 caacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaac----atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27480251 taacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 27480343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 757 - 928
Target Start/End: Complemental strand, 50475199 - 50475021
Alignment:
Q  757 tttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgctt 849  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50475199 tttgaaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgctt 50475100  T
Q  850 gcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 928  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50475099 gcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 20373056 - 20373234
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||                   |    
T  20373056 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt-------------------c 20373136  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  20373137 atcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggg 20373234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 426 - 743
Target Start/End: Original strand, 55199200 - 55199520
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  55199200 gtcgggtggctttacttctttgacaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacactcatcacacttcaacaagcatcgggaggacaacact 55199299  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | ||||||| ||          ||||||||||||||    ||| || || |||||||||||  ||| |||| ||||||||            ||||||||    
T  55199300 agatgcatggcag---------gaggttcataaacagccctcatcatcgattgtgcaacacatgcagaataaagtgcaagctaacaactcagtttgggag 55199390  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||||  ||||| |||||||| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  55199391 aaaccgcgtgagatgtggttgacgtgcaatgtggatgccacgtttcatgaccgtcaatatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggc 55199490  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatgacagc 743  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  55199491 aattcattcgggctcaaacgaaatgacagc 55199520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 761 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 29164179 - 29164021
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29164179 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctta 29164087  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29164086 gacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 29164021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 455 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 42340754 - 42340454
Alignment:
Q  455 tgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttc 554  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || | |||| |  |||||||||||||||| |||||| |||    
T  42340754 tgggctgcacgcaatgatgtcatttggaatgatgcccatcatacttgaacaagcattggaaggacaacaatggatgcatgacaacaatggcaagagattc 42340655  T
Q  555 ataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagt-----gca-------agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaa 642  Q
    |||||||    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||     |||       |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  42340654 ataaacagccctcaccaccggttgtgcaacacgtgcagaatagagtctaaggcaacaactcagtttgagagaaaccgtgcgagacgtggttgaagtgcaa 42340555  T
Q  643 tgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacag 742  Q
    |||| | |  | |||| ||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  42340554 tgtggatgttg-gttctatgtcggcaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtggacaatttattcgggctcaaacaaaatggcag 42340456  T
Q  743 cg 744  Q
    ||    
T  42340455 cg 42340454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 785 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591897
Alignment:
Q  785 tttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgt 884  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  885 cggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
     |  |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 38591897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 11467193 - 11467010
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  11467193 tttttgaaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaac 11467108  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| | || || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11467107 atcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 11467010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 823 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174695
Alignment:
Q  823 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 922  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  923 gtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgt 45174695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3158160 - 3158070
Alignment:
Q  24 gaaatcatgtttgaaaattttagtgcatcaaaacgatgatgtattaacaccactctcattcaatatggaagatttcagtaattaacgacacgc 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3158160 gaaattatgtttgaaaattttagtacatcaaaacgatgatttattaacacca--ctcattcaatacggaagatttcagtaattaacgacacgc 3158070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 615 - 736
Target Start/End: Original strand, 48227294 - 48227415
Alignment:
Q  615 aaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggaca 714  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  48227294 aaccgaatgaaacgtggttgaagtacaatgtggatgccgcatttcattaccgtaaccatgttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgcgggca 48227393  T
Q  715 atttattcgggctcagacgaaa 736  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  48227394 atttattcgggcttaaacgaaa 48227415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 832 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348443
Alignment:
Q  832 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  932 ttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatggg 43348443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 825 - 933
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  825 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 924  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  925 gatagtctt 933  Q
    |||||||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 623 - 744
Target Start/End: Original strand, 46007190 - 46007312
Alignment:
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgtt-agagactcccgtggacaatttatt 721  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  46007190 gagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccattattgtaaccatcttatatcttttgcgtgttttgtttagagactctcgtggaaaatttatt 46007289  T
Q  722 cgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  46007290 cgggctcaaacgaaatggcagcg 46007312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 650 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 647482 - 647388
Alignment:
Q  650 gccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | |||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  647482 gccgcgttccatgagcgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttctctaggcaatttttccgggctcaaacgaaatggcagcg 647388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3139887 - 3139830
Alignment:
Q  161 gatatttaggcacaaatcaagcagtgcataccttccatacatcgattcaactttcaat 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3139887 gatattcaggcacaaatcaagcagtgcataccttccatacatcgtttcaaatttcaat 3139830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 449 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 36310980 - 36310824
Alignment:
Q  449 caaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaag 548  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || || | |  |||| || |||  || ||||| ||||    
T  36310980 caaatttgggttgtacgtaatgatgttatttggaatgacactcatcatacttcaacaagcatcggaaggacataactagatacattgcagcaatggcaag 36310881  T
Q  549 aggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag 605  Q
    |||||||||||||    |||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36310880 aggttcataaacaaccctcacaactgattgtgcaacacggccataatagagtgcaag 36310824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 605
Target Start/End: Original strand, 1070697 - 1070872
Alignment:
Q  431 gtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatg 530  Q
    ||||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || | | ||||| |||    
T  1070697 gtgactttaattctttggccaatttgggttgcacgtaatgatatcatttggaatgacgctcatcatacttcaacaatcattggaaggacatcactagatg 1070796  T
Q  531 catgacaacaatgacaagaggttcat-aaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag 605  Q
    | ||| | ||||||||||||  |||| |||||    |||||| || |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  1070797 cctgatagcaatgacaagagaatcataaaacaactatcaccaccgcttgtacaacacggacataatagagagcaag 1070872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 823 - 948
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835614
Alignment:
Q  823 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 922  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    ||      |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacat------catgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  923 gtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgt 11835614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3157607 - 3157513
Alignment:
Q  244 aactttcaatacttaactattgtaattataattcatataataaa---------atatgcatcagatatctctttgcttattcataaagatatttg 329  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3157607 aactttcgatacttagctattgtaattataattcaaataataaagtaaaattaatatgcatcagatatttctttccttattcataaagatatttg 3157513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3158211 - 3158159
Alignment:
Q  7 attttgcctctcggtttgaaatcatgtttgaaaattttagtgcatcaaaacga 59  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3158211 attttgcttctcggtttgaaatcatgtttgaaaatattagtacatcaaaacga 3158159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3157655 - 3157596
Alignment:
Q  161 gatatttaggcacaaatcaagcagtgcataccttccatacatcgattcaactttcaatac 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  3157655 gataattaagcacaaatcaagcagtgcataccttccatacatcgtttaaactttcgatac 3157596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 27941261 - 27941171
Alignment:
Q  654 cgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  27941261 cgtttcatgatcgtaaccatattatattttttgcgtgttgtattagagattctcgaggacaatttattcggactcaaacaaaatggcagcg 27941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 624 - 744
Target Start/End: Original strand, 2615383 - 2615503
Alignment:
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    ||||||||||||| || |||||| |  ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||   |||| ||||| |||||    
T  2615383 agacgtggttgaaatgcaatgtggataccgcgtttcatgatcataaccatattacattttttgtgcgttgtgttagaggcttttgtgggcaattcattcg 2615482  T
Q  724 ggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||| ||||| || |||||    
T  2615483 ggctcaaacgaattggcagcg 2615503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 520 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 27747853 - 27747790
Alignment:
Q  520 aacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaa 583  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||    
T  27747853 aacactagatgcatggcaacaatgacaagaggttcataaaaagcactcaccaccggttgtgcaa 27747790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 746 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 35844640 - 35844577
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattga 808  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  35844640 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 36310793 - 36310732
Alignment:
Q  668 aaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctca 729  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||    
T  36310793 aaccattttacatcttttgcgtgttgtgttagagaagcatgtggacaatttattcgagctca 36310732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 755 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 43348597 - 43348556
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcattt 796  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  43348597 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Original strand, 44526954 - 44527263
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  44526954 ctttatttctttggcaaatttggactgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatg 44527053  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttg 634  Q
     |||||||| ||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||     
T  44527054 gcaacaatggcaagaggttcataaaaatagtttaccatcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaccgagtcatggtta 44527153  T
Q  635 aagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacga 734  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |    
T  44527154 aagtgcaatgtggacgccgcgttccatgactgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaa 44527253  T
Q  735 aatgacagcg 744  Q
    |||| |||||    
T  44527254 aatggcagcg 44527263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 756 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 10923114 - 10922920
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10923114 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 10923015  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10923014 ttttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtg 10922920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 2960136 - 2959939
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960136 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 2960037  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2960036 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtggg 2959939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 14758420 - 14758240
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758420 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 14758321  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14758320 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa 14758240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 745 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 37451684 - 37451489
Alignment:
Q  745 agaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451684 agaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 37451585  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451584 atgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 37451489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 8222516 - 8222319
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8222516 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaa 8222418  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8222417 catcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 8222319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 32216443 - 32216246
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32216443 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac 32216344  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32216343 atcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 32216246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 762 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415852
Alignment:
Q  762 aaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 861  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 16415928  T
Q  862 acttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415927 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 16415852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 19899556 - 19899751
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19899556 tttttggaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 19899655  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19899656 catcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 19899751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 15383322 - 15383124
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383322 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 15383223  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15383222 catcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 15383124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 746 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 32267432 - 32267226
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32267432 gaaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaa 32267333  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32267332 tgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacac 32267233  T
Q  944 tttgtgg 950  Q
    |||||||    
T  32267232 tttgtgg 32267226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 23999746 - 23999541
Alignment:
Q  746 gaaattgac-tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23999746 gaaattgacctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagta 23999647  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23999646 atgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 23999547  T
Q  943 ctttgt 948  Q
    ||||||    
T  23999546 ctttgt 23999541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 15168484 - 15168300
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15168484 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac 15168385  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15168384 atcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgt 15168300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 46931798 - 46931603
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46931798 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaa 46931699  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46931698 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 46931603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 27266979 - 27267185
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27266979 gaaactgactttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaat 27267078  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27267079 gcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcact 27267178  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  27267179 ttgtggg 27267185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 746 - 930
Target Start/End: Original strand, 28564561 - 28564746
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564561 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 28564660  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28564661 tgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagt 28564746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 47279577 - 47279380
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47279577 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaac 47279478  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47279477 atcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggg 47279380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 745 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 51129256 - 51129050
Alignment:
Q  745 agaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129256 agaaattgacttttttgaaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 51129159  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  51129158 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttaca 51129059  T
Q  943 ctttgtggg 951  Q
    |||||||||    
T  51129058 ctttgtggg 51129050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160823
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 859  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  860 ggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggg 25160823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 752 - 951
Target Start/End: Original strand, 27227270 - 27227470
Alignment:
Q  752 gactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 851  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227270 gactttttggaaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 27227369  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27227370 aacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgg 27227469  T
Q  951 g 951  Q
    |    
T  27227470 g 27227470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 30254811 - 30254627
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254811 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 30254712  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30254711 atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgt 30254627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 238301 - 238498
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238301 tttttgaaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 238400  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  238401 atcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 238498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 755 - 935
Target Start/End: Original strand, 11742156 - 11742336
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742156 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 11742255  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11742256 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa 11742336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 27532770 - 27532964
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532770 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 27532868  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27532869 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtg 27532964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 767 - 951
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326937
Alignment:
Q  767 ttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 865  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  866 acatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 30326937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 9902842 - 9903039
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9902842 tttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagc 9902941  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9902942 atcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 9903039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 746 - 937
Target Start/End: Original strand, 27763088 - 27763281
Alignment:
Q  746 gaaattgac-tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27763088 gaaattgacatttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagta 27763187  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27763188 atgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagt 27763281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 28770041 - 28769844
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28770041 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaac 28769942  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28769941 atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtggg 28769844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 772 - 950
Target Start/End: Original strand, 1359740 - 1359919
Alignment:
Q  772 tttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgt 871  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  1359740 tttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggt 1359839  T
Q  872 actattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1359840 actattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 755 - 930
Target Start/End: Original strand, 34012170 - 34012345
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34012170 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac 34012269  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34012270 atcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 34012345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 47682282 - 47682477
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47682282 tttttgaacaagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaac 47682381  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47682382 atcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtg 47682477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 747 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 40885211 - 40885017
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaa-gttaa-ttttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885211 aaattgacttttttaaaaatgttaacttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 40885112  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885111 tgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 40885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4330669 - 4330472
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4330669 tttttggaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaac 4330570  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4330569 atattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 4330472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 27563693 - 27563877
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27563693 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaac 27563792  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27563793 atcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgt 27563877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 48353930 - 48353735
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  48353930 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaat 48353831  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48353830 atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 755 - 937
Target Start/End: Original strand, 7078851 - 7079033
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7078851 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaat 7078950  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7078951 atcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagt 7079033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 10181795 - 10181993
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181795 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 10181894  T
Q  855 atcttggacttac-atgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || |||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10181895 attttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 10181993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 42721432 - 42721230
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 846  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42721432 aaattgattttttaaaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaata 42721333  T
Q  847 cttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactt 945  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||    
T  42721332 attgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactt 42721236  T
Q  946 tgtggg 951  Q
    ||||||    
T  42721235 tgtggg 42721230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 38823602 - 38823408
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823602 tttttaaaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 38823503  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    || || |||||||| ||| |||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38823502 attttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 38823408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 22171099 - 22170902
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22171099 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaac 22171000  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22170999 atcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 22170902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 15752411 - 15752220
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  15752411 aaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttg 15752312  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15752311 gacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggg 15752220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 759 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 3309538 - 3309357
Alignment:
Q  759 tgaaaaagttaattttga-tcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 857  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3309538 tgaaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatc 3309439  T
Q  858 ttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  3309438 ttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgt 3309357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 755 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 3535311 - 3535142
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535311 ttttttaaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 3535212  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 924  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  3535211 atcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 1547659 - 1547516
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1547659 tttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaac 1547560  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaaca 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  1547559 atcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca 1547516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 31621336 - 31621526
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcattttt-aaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31621336 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaa 31621435  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31621436 catattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgt 31621526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 39393782 - 39393578
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39393782 gaaattgacttttttaaaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 39393683  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  39393682 tgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacac 39393583  T
Q  944 tttgt 948  Q
    |||||    
T  39393582 tttgt 39393578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 51112995 - 51113319
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||||    
T  51112995 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggttgcacgtaatgatgtcatttgaaatgacgttcatcacacttcaacaagcatcgggaggacagcact 51113094  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||            ||||||||||    
T  51113095 agatgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacagccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggag 51113194  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  51113195 aaatcgtgtgagacgtggttaaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggc 51113294  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||    
T  51113295 aattcattcggactcaaacgaaatg 51113319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 564 - 744
Target Start/End: Original strand, 52109284 - 52109464
Alignment:
Q  564 attcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatga 663  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  52109284 attcaccaccggttgtgcagcacgggcataatagagtgtgagtttgggagaaaccgacaaagacgtggttgaagtgtaatgtggacgttgtgttccatga 52109383  T
Q  664 ccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  52109384 ccgtaatcatcttatatcttttgcatgttgtgttagagactcctgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcg 52109464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 813 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422842
Alignment:
Q  813 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||  || ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  913 atgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 18422842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 762 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926378
Alignment:
Q  762 aaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 861  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  862 acttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 922  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 41926378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 767 - 922
Target Start/End: Original strand, 37618705 - 37618856
Alignment:
Q  767 ttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 866  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |    |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618705 ttaattttgattttaatgtttgaat----tttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 37618800  T
Q  867 catgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 922  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37618801 catgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 37618856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 762 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289817
Alignment:
Q  762 aaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 861  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 21289882  T
Q  862 acttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 929  Q
    ||||| | ||  |||||||| || || |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  21289881 acttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 426 - 741
Target Start/End: Original strand, 36733373 - 36733703
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||| || || | ||||||    
T  36733373 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaacaaacatcggaaggacaacact 36733472  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacat-tattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttggga 612  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||| || || |||||| ||||            ||||| |||    
T  36733473 agatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatcccctcactaccggttgtgcaacaaggccaaaatagaatgcaaggtaataactgagtttcgga 36733572  T
Q  613 gaaaccgaatgagacgtggttgaagtgta--atgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtg 710  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||| | |||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  36733573 gaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatatgtggatgccgcgtttcatgactataaccatcttacaccttttgtgtgttgtgttagagactctcgtg 36733672  T
Q  711 gacaatttattcgggctcagacgaaatgaca 741  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36733673 gacaatttattcgggctcaaacaaaatgaca 36733703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 490 - 744
Target Start/End: Original strand, 4394903 - 4395169
Alignment:
Q  490 tcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacggg 589  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || | | ||||  ||||||||  |    
T  4394903 tcatcatacatcaacgagcattgggaggacggcactagatgcatgacaacaatggcaagaggtttataaacatccctcgctaccggtaatgcaacacatg 4395002  T
Q  590 cataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatatta 677  Q
    ||||| ||||||||||            |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4395003 cataacagagtgcaagacaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgtggctgaagtgcaatgtggaagccgcgttccatgaccgtaaccatatca 4395102  T
Q  678 catcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  4395103 caacttttgcatgctgtgttagagactctcgtgggcaatttatccgggctcaatcgaaatggcagcg 4395169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 755 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 31963005 - 31962851
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaa-ttattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31963005 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaa 31962906  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacata 908  Q
    ||||||  |||||||| || |||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  31962905 catcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 33725399 - 33725585
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcattttta-aattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||            | ||||||    
T  33725399 tttttgaaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat------------gtttgcaa 33725486  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  33725487 cattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggg 33725585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 48950038 - 48949907
Alignment:
Q  607 ttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcc 706  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48950038 ttgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcc 48949939  T
Q  707 cgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48949938 cgttggcaattcattcgggctcaaacgaaatg 48949907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 426 - 729
Target Start/End: Original strand, 5609019 - 5609334
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | | || |||   ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||| |  |||||    
T  5609019 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcatgcaatgatactatttggaattatgctcatcatacatcattgagcattgggaggacgacact 5609118  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | |||||||  | ||||| ||||||||||||||||    | ||| | ||||  | |||||| ||||||||||||||||||            ||||||||    
T  5609119 agatgcatggtagcaatggcaagaggttcataaacggcctccactatcggtaatacaacacaggcataatagagtgcaaggcaacaactcagtttgggag 5609218  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |  |    
T  5609219 aaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgttccatgactgtaaccatattacaactttcgcgtgctgtgctagagactcacacgagc 5609318  T
Q  714 aatttattcgggctca 729  Q
    ||||||||||||||||    
T  5609319 aatttattcgggctca 5609334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Original strand, 25682523 - 25682655
Alignment:
Q  606 tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactc 705  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25682523 tttgggagaaaccgtgtgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactc 25682622  T
Q  706 ccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  25682623 ccgtgggcaatttatctgggctcaaacgaaatg 25682655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 735
Target Start/End: Original strand, 24538260 - 24538511
Alignment:
Q  497 acttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggtt-cataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataat 595  Q
    |||||||| |||||||| || | | || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||| | |||||||||||  |||| |||    
T  24538260 acttcaacaagcattggaaggacatcattagatgcatgacaacaatggcaagaggtttcataaacatccctcaccaccagttgtgcaacataggcagaat 24538359  T
Q  596 agagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatctt 683  Q
    ||||||||||            |||| |||||||| | |||||| |||| ||| || |||||| | ||||||||| || ||||||||||  ||| |||||    
T  24538360 agagtgcaaggtaacatctcagtttgagagaaaccaagtgagacctggtcgaaatgcaatgtggatgccgcgttctataaccgtaaccaagttagatctt 24538459  T
Q  684 ttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaa 735  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24538460 ttgtgtgttgtgttagagactcccgtggataatttattcgggctcaaacgaa 24538511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 830 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759724
Alignment:
Q  830 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 929  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  930 tcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggg 38759724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 654 - 746
Target Start/End: Original strand, 48166157 - 48166249
Alignment:
Q  654 cgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  48166157 cgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtggtcaatttattcgggctcaaatgaaatggcagcgag 48166249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 612 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16817108 - 16816991
Alignment:
Q  612 agaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtgg 711  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| || |     
T  16817108 agaaaccgagtgagatgtggttgaagtgcaatgcggacgccgcgttccatgtctgtaaccatattacatcttttgtgtattgttttagagactctcgcgt 16817009  T
Q  712 acaatttattcgggctca 729  Q
     ||||||||||| |||||    
T  16817008 gcaatttattcgagctca 16816991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 746 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 48620987 - 48620922
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatt 810  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  48620987 gaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgatt 48620922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 755 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 38759878 - 38759846
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttt 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38759878 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttt 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 435 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 18345972 - 18345669
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18345972 ctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgttcatcacacttcaacgagcattgcgaggacaacactaaatgcatg 18345873  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttg 634  Q
     ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  18345872 gcagtaatggcaagaggttcataaacatcattcaccaccggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagtttggaagaaaccgaacgagacatggttg 18345773  T
Q  635 aagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacga 734  Q
    ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |  |||| ||||    
T  18345772 aagtgcaatgtggacgcaacgttccatgagcgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagacttccgtgggtaatttatttgaactcaaacga 18345673  T
Q  735 aatg 738  Q
    ||||    
T  18345672 aatg 18345669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 19289134 - 19289331
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19289134 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat 19289233  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19289234 atcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 19289331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 35959293 - 35959091
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959293 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 35959194  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35959193 gcttgcaacatcttgg----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacact 35959098  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  35959097 ttgtggg 35959091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 2325189 - 2325386
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325189 ttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 2325288  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2325289 atcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 2325386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 41465893 - 41465709
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41465893 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaac 41465794  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41465793 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 41465709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 11366191 - 11366386
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11366191 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 11366290  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11366291 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 11366386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Original strand, 43648046 - 43648240
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648046 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 43648145  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || |||| |||||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648146 tgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 43648240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 44914059 - 44913859
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcat---ctagtaatgcttgc 851  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  44914059 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgc 44913960  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44913959 aacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 44913860  T
Q  951 g 951  Q
    |    
T  44913859 g 44913859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 41961232 - 41961035
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961232 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 41961133  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41961132 atcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 41961035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 18494092 - 18494276
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18494092 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaac 18494191  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  18494192 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgt 18494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763826
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 4763826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 432 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 12131139 - 12130813
Alignment:
Q  432 tgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgc 531  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  12131139 tgactttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttgaaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgc 12131040  T
Q  532 atgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccg 619  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||            ||||||||||| ||    
T  12131039 atggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaatcg 12130940  T
Q  620 aatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaattta 719  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||    
T  12130939 agcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggcaaatta 12130840  T
Q  720 ttcgggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12130839 ttcgggctcaaacgaaatgacagcgag 12130813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 31862244 - 31862047
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  31862244 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaat 31862145  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  31862144 atcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggg 31862047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 7006749 - 7006933
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7006749 tttttgaaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac 7006848  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7006849 atcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaagtgt 7006933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 26357978 - 26357772
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357978 aaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 26357879  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  26357878 gcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaat 26357779  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  26357778 ttgtggg 26357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4167323 - 4167117
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4167323 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaat 4167224  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4167223 gcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 4167124  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  4167123 ttgtggg 4167117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 3177331 - 3177134
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3177331 tttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaat 3177232  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3177231 atcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 3177134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 33709043 - 33709237
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709043 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 33709142  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgt 948  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33709143 atcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgt 33709237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 450 - 738
Target Start/End: Original strand, 88263 - 88563
Alignment:
Q  450 aaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaaga 549  Q
    |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  88263 aaatttgggctgcacgtaatgataccatttggaatgacgctcatcatagatcaacgagcattgggaggacgacactagatgcatgacaacaatggcaaga 88362  T
Q  550 ggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaag 637  Q
     ||||||||||||   |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  88363 tgttcataaacatccctcactaccggttgtacaacacgagcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaag 88462  T
Q  638 tgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaat 737  Q
    || |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  88463 tgcaatgtggatgctgcgttccatgaccgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcgggctcaaatgaaat 88562  T
Q  738 g 738  Q
    |    
T  88563 g 88563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 759 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 5881917 - 5881750
Alignment:
Q  759 tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 858  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881917 tgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 5881818  T
Q  859 tggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  5881817 tagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37906112 - 37905905
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37906112 aaattgacttttttgaaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaa 37906013  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  37906012 ttcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacac 37905913  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  37905912 tttgtggg 37905905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Original strand, 43770659 - 43770830
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43770659 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac 43770758  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  43770759 atcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 19500727 - 19500923
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500727 tttttgaaaaaat-aattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 19500825  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||    |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19500826 atcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 930
Target Start/End: Original strand, 39167180 - 39167355
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39167180 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaac 39167279  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39167280 aatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt 39167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33550994
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatga----tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  857 cttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     |||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggg 33550994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 31570545 - 31570742
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31570545 ttttttaaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaac 31570644  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  31570645 atcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggg 31570742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 746 - 925
Target Start/End: Original strand, 33660178 - 33660358
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660178 gaaactgacttttctgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 33660277  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtg 925  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33660278 tgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtg 33660358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 753 - 951
Target Start/End: Original strand, 29241954 - 29242146
Alignment:
Q  753 actttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 852  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||           
T  29241954 actttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaat------- 29242046  T
Q  853 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29242047 tcatcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggg 29242146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 794 - 951
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264085
Alignment:
Q  794 tttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctt 893  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  894 taacatgcaaacatagttgatgatattatg-tgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggg 4264085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 19424453 - 19424636
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424453 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 19424552  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||| || |||||              |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19424553 atcttagacttgcaggtact--------------atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggg 19424636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 755 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 13711851 - 13711671
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13711851 tttttgaaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaac 13711752  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13711751 atcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaa 13711671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 785 - 926
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27349930
Alignment:
Q  785 tttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgt 884  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  885 cggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 795 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478562
Alignment:
Q  795 ttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 894  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  | || ||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  895 aacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg 4478562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 426 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 34696409 - 34696094
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || | ||||||    
T  34696409 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcaagtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaggacaacact 34696310  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    ||||||  |   ||||| ||||  ||||||||| ||||            ||||||||||    
T  34696309 agatgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgcatcacgaacataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggag 34696210  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||| |   ||| ||||||||||||  || ||| | ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  34696209 aaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggc 34696110  T
Q  714 aatttattcgggctca 729  Q
    ||||||||||||||||    
T  34696109 aatttattcgggctca 34696094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 426 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 34718821 - 34718506
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || | ||||||    
T  34718821 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcaagtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaggacaacact 34718722  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    ||||||  |   ||||| ||||  ||||||||| ||||            ||||||||||    
T  34718721 agatgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgcatcacgaacataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggag 34718622  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||| |   ||| ||||||||||||  || ||| | ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  34718621 aaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccataagcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggc 34718522  T
Q  714 aatttattcgggctca 729  Q
    ||||||||||||||||    
T  34718521 aatttattcgggctca 34718506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 812 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 44286284 - 44286144
Alignment:
Q  812 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagtt 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  44286284 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  912 gatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 44286144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 812 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 19314182 - 19314061
Alignment:
Q  812 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt---acatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacata 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||    
T  19314182 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacata 19314083  T
Q  909 gttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  19314082 gttgctgatatcatgtgatagt 19314061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 756 - 881
Target Start/End: Original strand, 41051112 - 41051237
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41051112 ttttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaaca 41051211  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttat 881  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41051212 tcttgaacttacaggtactattttat 41051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 842 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327928
Alignment:
Q  842 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgt 45327928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 853 - 951
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071745
Alignment:
Q  853 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 866
Target Start/End: Original strand, 41463401 - 41463512
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  41463401 ttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaac 41463500  T
Q  855 atcttggactta 866  Q
    ||||| ||||||    
T  41463501 atcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 853 - 951
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054104
Alignment:
Q  853 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 755 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 33902406 - 33902317
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902406 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 842 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642186
Alignment:
Q  842 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-ta 940  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  941 cactttgt 948  Q
    ||||||||    
T  36642193 cactttgt 36642186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 751 - 859
Target Start/End: Original strand, 18257344 - 18257453
Alignment:
Q  751 tgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 849  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||  || | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18257344 tgacttttgtgaaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgctt 18257443  T
Q  850 gcaacatctt 859  Q
    ||||||||||    
T  18257444 gcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 44017616 - 44017510
Alignment:
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattc 722  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||| | | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44017616 gagacatggttgaagtgcaatgcgaattccgcgttctgtgatcatgaccatcttacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattc 44017517  T
Q  723 gggctca 729  Q
    |||||||    
T  44017516 gggctca 44017510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 755 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 45328082 - 45328028
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgat 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45328082 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 871 - 951
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258295
Alignment:
Q  871 tactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggg 18258295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39826362 - 39826285
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaa 503  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39826362 gtcgagtggctttacttctttggcaaatttgggctgctcgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaa 39826285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 623 - 729
Target Start/End: Original strand, 26198576 - 26198688
Alignment:
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatg------accgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaat 716  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||       ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  26198576 gagacgtggttgaagtgtattgtggatgtcgcgttccattttcattaccataatcatattgcatcttttgtgtgctgtgttagagactcatgtgggcaat 26198675  T
Q  717 ttattcgggctca 729  Q
    ||||||| |||||    
T  26198676 ttattcgagctca 26198688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 889 - 935
Target Start/End: Original strand, 41463795 - 41463841
Alignment:
Q  889 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41463795 atctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaa 41463841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 894 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902261
Alignment:
Q  894 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggg 33902261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 818
Target Start/End: Original strand, 17053960 - 17054005
Alignment:
Q  773 ttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgatta 818  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  17053960 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 773 - 818
Target Start/End: Original strand, 17071601 - 17071646
Alignment:
Q  773 ttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgatta 818  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  17071601 ttgatcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 24886479 - 24886295
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886479 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 24886380  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886379 atcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 24886295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 464 - 744
Target Start/End: Original strand, 4267829 - 4268109
Alignment:
Q  464 cgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacatt 563  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||     
T  4267829 cgtaatgatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgaacattgggaggacagcactagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaaaatc 4267928  T
Q  564 attcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatga 663  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||| |||||||||| | |||    
T  4267929 gttcaccatcggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagtttgggagaaaccgaacgagtcatggttaaagtgcaacgtggacgccgcgtttcttga 4268028  T
Q  664 ccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  4268029 ttgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaatttattcaggctcaaacaaaatggcagcg 4268109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 5830293 - 5830087
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgact-catttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830293 aaattgacattttggaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 5830194  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5830193 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 5830094  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  5830093 ttgtggg 5830087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 22973865 - 22974049
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973865 ttttttaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 22973964  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22973965 atcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgt 22974049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 745 - 939
Target Start/End: Original strand, 31705384 - 31705579
Alignment:
Q  745 agaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705384 agaaattgacttttttgaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 31705483  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31705484 atgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgt 31705579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 33908624 - 33908428
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33908624 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaac 33908526  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33908525 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggg 33908428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 699542 - 699346
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699542 tttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 699443  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-gtacactttgtgg 950  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  699442 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtgg 699346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 745 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 35504768 - 35504560
Alignment:
Q  745 agaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35504768 agaaattgacttttttgaaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagta 35504669  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35504668 atacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttaca 35504569  T
Q  943 ctttgtggg 951  Q
    |||||||||    
T  35504568 ctttgtggg 35504560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 22255574 - 22255379
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22255574 ttttttaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaac 22255475  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22255474 atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtg 22255379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 38528020 - 38528217
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528020 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 38528119  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38528120 atcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 38528217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 761 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 22981179 - 22981001
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22981179 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttg 22981080  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22981079 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt 22981001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 31786429 - 31786623
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786429 tttttgaaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 31786528  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31786529 atcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 31786623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 747 - 939
Target Start/End: Original strand, 2888219 - 2888412
Alignment:
Q  747 aaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2888219 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 2888318  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2888319 gcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgt 2888412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 12910747 - 12910550
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910747 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 12910648  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12910647 atcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggg 12910550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Original strand, 35826269 - 35826463
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826269 ttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 35826368  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  35826369 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtgg 35826463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 7208647 - 7208842
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7208647 ttttttaaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaac 7208746  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7208747 atcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 7208842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 27330706 - 27330512
Alignment:
Q  746 gaaattgactt-tttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330706 gaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 27330607  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  27330606 tgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 27330512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 15992323 - 15992520
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992323 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 15992422  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15992423 atcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggg 15992520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 744
Target Start/End: Original strand, 27292139 - 27292444
Alignment:
Q  439 acttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaa 538  Q
    ||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |  |||| ||||||| |||    
T  27292139 acttctttggcaaatttgagcagcacgtaatgatgtcatctggagtgatgatcatcacacttcaatgagcatcgggaggacaggactagatgcatgtcaa 27292238  T
Q  539 caatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagt 638  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  27292239 caatggcaagaggttcataaacattgttcaccattagttgtgcaacacaggtagaatagcgtgcaagtttgggagaaaccgaacgagtcatggttgaagt 27292338  T
Q  639 gtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    | |||||| | | | ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27292339 gcaatgtggatgtcacgttccatgatagtaaccatattacatattttgcatgttgtgttagagactctcgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatg 27292438  T
Q  739 acagcg 744  Q
     |||||    
T  27292439 gcagcg 27292444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 745 - 951
Target Start/End: Original strand, 17157803 - 17158011
Alignment:
Q  745 agaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17157803 agaaattgacttttttgaaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagta 17157902  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17157903 atgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttaca 17158002  T
Q  943 ctttgtggg 951  Q
    |||||||||    
T  17158003 ctttgtggg 17158011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 930
Target Start/End: Original strand, 35511265 - 35511440
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35511265 tttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac 35511364  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35511365 atcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt 35511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 746 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 25889772 - 25889584
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25889772 gaaactgacttttctggaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 25889673  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtctt 933  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25889672 tgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 35934288 - 35934094
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35934288 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaac 35934189  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35934188 atcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 35934094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 40133786 - 40133580
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40133786 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaat 40133687  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40133686 gcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 40133587  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  40133586 ttgtggg 40133580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 8437357 - 8437160
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8437357 tttttgaaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaac 8437258  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  8437257 atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggg 8437160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 19120251 - 19120054
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120251 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 19120152  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19120151 atcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 19120054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 919
Target Start/End: Original strand, 43308443 - 43308607
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308443 tttttgaaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 43308542  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43308543 atcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 8387766 - 8388090
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8387766 gtcgggtggctttacttctttggaaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcaccacacttcaacaagcattgggaggaaaacact 8387865  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||            ||| ||||||    
T  8387866 agatgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtctgggag 8387965  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  8387966 aaaccgcgtgagacgtggttgaagtacaatgtggatgccgcgtttcatgaccgttaaaatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactctcgtgggc 8388065  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||    
T  8388066 aattcattcaggctcaaacgaaatg 8388090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 8741668 - 8741863
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8741668 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaac 8741767  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8741768 attttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8741863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 25669968 - 25669797
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669968 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 25669869  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    || || ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25669868 attttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 27318271 - 27318467
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaa-ttattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27318271 tttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaa 27318370  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||  |||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27318371 catcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 27318467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 936
Target Start/End: Original strand, 14409124 - 14409305
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14409124 tttttgaaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaac 14409223  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14409224 atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 14409305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 746 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 42343123 - 42342942
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42343123 gaaactgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaa 42343024  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42343023 tgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtga 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 36860825 - 36860619
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36860825 aaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaat 36860726  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36860725 gcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 36860626  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  36860625 ttgtggg 36860619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 36867163 - 36866957
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36867163 aaattgacttttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaat 36867064  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    | |||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36867063 gtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 36866964  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  36866963 ttgtggg 36866957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 23116013 - 23116202
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||    
T  23116013 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaac 23116104  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23116105 atcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 23116202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 426 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 30223306 - 30222985
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||  | |||||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||| ||||||    
T  30223306 gtcgggtggctttgcttctttggcaaatttgggaagcacgtaatgaagtcatttagaatgacgctcatcatacttcaacaattattggaagaacaacact 30223207  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaa------------gtttgggag 613  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||    
T  30223206 agatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacagccctcaccaacagttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggag 30223107  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||||   ||||||||||  ||||| ||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |    
T  30223106 aaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaacatggacgtcgcgttccatgactgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttccatgggc 30223007  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaa 735  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  30223006 aatttattcgggctcaaacgaa 30222985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 39573203 - 39573060
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573203 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 39573104  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaaca 898  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  39573103 atcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 39573060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 5837947 - 5837750
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5837947 tttttgaaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac 5837848  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | || |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5837847 atcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 5837750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 13956147 - 13956329
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   | ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956147 tttttgaaaatgttaattttgattttaatgtttgaaaaagtt--aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 13956244  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13956245 atcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgt 13956329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 27533414 - 27533089
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |  | ||||||    
T  27533414 gtcgggtgactttacttctttggcaaatttgggctgcatgtaattatgttatttggaatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaagacaacact 27533315  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||            ||||||||||    
T  27533314 agatgcatggcaacaatgacaagaggttcataaacatccctcaccaccggttgtgcaacacagacagaatatagtgcaaggtaatagtttagtttgggag 27533215  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatc-ttttgcgtgctgtgttagagactcccgtgga 712  Q
    ||| ||   |||||| |  |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27533214 aaatcgcgcgagacgcgactgaagtgtaatgtggatgtcgcgttccatgatcgtaaccagtttacatctttttgcgtgttgtgttagagactcccgtggg 27533115  T
Q  713 caatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27533114 caatttattcgggctcaaacgaaatg 27533089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 22020015 - 22019844
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22020015 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac 22019916  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22019915 atcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22767764 - 22767440
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||| |  | |||| |    
T  22767764 gtcgagtggctttacttctttggcaaatttgggctgctcgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaaaaggcattggaatgacaacatt 22767665  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||| |||||| || |||||||||||||            ||||||||    
T  22767664 agatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactactggttgtgccacacggccaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggag 22767565  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  22767564 aaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgacagtaatcatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattcccgggggc 22767465  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  22767464 aatttattcgggctcaaacgaaatg 22767440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 431 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 41941237 - 41940917
Alignment:
Q  431 gtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatg 530  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||| ||     
T  41941237 gtgaatttacttctttgacatatttgggctacacgtaatgatgtcatttggaatgtcgctcatcatatttcaacg--cattggaaggacaacactagata 41941140  T
Q  531 catgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaacc 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||    
T  41941139 catgacaataatggcaagaggttcataaacaaccctcgccaccggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaaggtatcaacccaatttgggagaaacc 41941040  T
Q  619 gaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaattt 718  Q
    ||  |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||  |||||    
T  41941039 gagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaactatcttacatcttttgtgtgtagtgttaaagactcccgtgggaaattt 41940940  T
Q  719 attcgggctcagacgaaatgaca 741  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  41940939 attcgagctcaaacgaaatgaca 41940917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 30969107 - 30969302
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  30969107 tttttaaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagc 30969206  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30969207 atcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 30969302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 32563532 - 32563361
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  32563532 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaac 32563433  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  32563432 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 25500709 - 25500906
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25500709 tttttgaaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaac 25500808  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  25500809 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggg 25500906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 812 - 939
Target Start/End: Original strand, 1429002 - 1429129
Alignment:
Q  812 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagtt 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||    
T  1429002 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtt 1429101  T
Q  912 gatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  1429102 tatgatattatgtgatagtcttaagtgt 1429129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 9200616 - 9200445
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200616 tttttgaaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 9200517  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||| |||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  9200516 atcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 755 - 937
Target Start/End: Original strand, 14919322 - 14919493
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||      || ||||||     
T  14919322 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatc------tgattgcaat 14919414  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919415 atcttggactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 14919493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 761 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 7693607 - 7693442
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7693607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7693508  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  7693507 gacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 755 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 15724880 - 15724687
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15724880 tttttgaaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaat 15724781  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttg 947  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||||    
T  15724780 attttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 15724687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 435 - 738
Target Start/End: Original strand, 20204645 - 20204959
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  20204645 ctttacttctttgacgaatttgggttgcacgtaatgatgtcatt-ggtatgacgctcatcatacttcaacgagcattgggaggacagcactagatgcatg 20204743  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaat 622  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    |||||   |||||||||||||  ||| ||||||||| |||            ||||||||||||| |||    
T  20204744 gcaacaatggcaagaggttcataaacaaccctcacccttggttgtgcaacacaagcaaaatagagtgtaaggtaataactcagtttgggagaaaccaaat 20204843  T
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattc 722  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||  ||||||| |    
T  20204844 gagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccataaccatattacatcttttacattttgtgctagagactcccgcgggaaatttatcc 20204943  T
Q  723 gggctcagacgaaatg 738  Q
     |||||| ||||||||    
T  20204944 aggctcaaacgaaatg 20204959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 15989232 - 15988926
Alignment:
Q  450 aaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaaga 549  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| |   || || ||||||| |||||||| |||||    
T  15989232 aaatttgggatgcacgtaatgatgccatttaaaatgacactcatcatacatcaacgagcattgggaggacggcattagatgcatggcaacaatggcaaga 15989133  T
Q  550 ggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaag 637  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15989132 ggttcataaacaaccttcactagcggttgtgcaacacgagcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgttgttgaag 15989033  T
Q  638 tgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaat 737  Q
    || ||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||  || |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15989032 tgaaatatggatgtcgcgttccatgaccgcaaccatattacaacttttgcgtgttatgtcagagactttcgcgagcaatttattcgggctcaaacgaaat 15988933  T
Q  738 gacagcg 744  Q
    | |||||    
T  15988932 ggcagcg 15988926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 755 - 881
Target Start/End: Original strand, 28416334 - 28416460
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28416334 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaac 28416433  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttat 881  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    
T  28416434 atcttggacttaaaagtactattttat 28416460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Original strand, 21088558 - 21088746
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21088558 aaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgattattt---attcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 21088654  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || |||||  |  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21088655 gatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 21088746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 450 - 744
Target Start/End: Original strand, 12660048 - 12660326
Alignment:
Q  450 aaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaaga 549  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| ||| || |||| ||  |||| |||||    
T  12660048 aaatttgggttgcacgtaatgatgtcatttggaatgaagctcatcatacttcaagaagcattgggaggacaactctagatacatggcagtaatggcaaga 12660147  T
Q  550 ggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaac 649  Q
    | ||||||||||    | |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |            |||     |||||||||||| |||||| |     
T  12660148 gattcataaacaggcattaccaccggttgtgcaacatggacataatagagtgcaaggt------------aata----gtggttgaagtgcaatgtggat 12660231  T
Q  650 gccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12660232 gccgcgttccatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactttcatggacaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcg 12660326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 8467118 - 8466935
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8467118 ttttttaaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 8467019  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || |||||||||||  || |||||||| ||    | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  8467018 attttggacttacaaataatattttatcgt-tacacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgt 8466935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 746 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 43254257 - 43254154
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254257 gaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 43254158  T
Q  845 tgct 848  Q
    ||||    
T  43254157 tgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 23954585 - 23954756
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| |     |    
T  23954585 tttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----c 23954672  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||| |||||||  || |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954673 atcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 23954756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 746 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 26269211 - 26269075
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  26269211 gaaactgacttttatgaaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtat 26269112  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 881  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26269111 tgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttat 26269075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 604 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 26597774 - 26597640
Alignment:
Q  604 agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagac 703  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26597774 agtttgggagaaatcgtgtaagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgatcatcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagac 26597675  T
Q  704 tcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26597674 tcccgtggacaattcattcgggctcaaacgaaatg 26597640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 614 - 744
Target Start/End: Original strand, 25730688 - 25730818
Alignment:
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||| ||| || ||      
T  25730688 aaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggattccgcgttccatgaccgtaaccatattacaattttcacgtgttgtgttagagtctcacgcggga 25730787  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25730788 aatttattcgagctcaaacgaaatggcagcg 25730818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 820 - 951
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824459
Alignment:
Q  820 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | | |  |||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgtttta-tcttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  920 tatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 6824459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 435 - 561
Target Start/End: Original strand, 25730530 - 25730656
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |   || || |||||||    
T  25730530 ctttacttctttggcaaatttgagctgcacgtaatgataccatttggaatgatgctcatcatacatcaacgagcattgggaagacggcattatatgcatg 25730629  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaaca 561  Q
     || ||||| |||||||||||||||||    
T  25730630 gcagcaatgccaagaggttcataaaca 25730656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 34654089 - 34653867
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |  | | ||||| |||||||    
T  34654089 ctttacttctttgacaaattttggctacacgcaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatactttatcaagcattggaaagacatcactagatgcatg 34653990  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgc-----------aagtttgggagaaaccgaatg 623  Q
     |||||||| ||| || ||||||||||    ||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||           ||||||||||||||||| | |    
T  34653989 gcaacaatggcaaaagattcataaacaaccctcaacaccagttgtgcaacacgtgcagaatagagtgcaggcaacaactaagtttgggagaaaccgcacg 34653890  T
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  34653889 agacgtggttgaagtgcaatgtg 34653867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 889 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268271
Alignment:
Q  889 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 26268271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 11375781 - 11375688
Alignment:
Q  653 gcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||  |   |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  11375781 gcgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcaggtgatttattcggactcaaacgaaatggcagcgag 11375688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 34652507 - 34652445
Alignment:
Q  667 taaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctca 729  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  34652507 taaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttatccggtctca 34652445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 655 - 744
Target Start/End: Original strand, 37448046 - 37448135
Alignment:
Q  655 gttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||   || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||    
T  37448046 gttccatgaccataaccatcttacatcgtttatatgttgtgttagagactctcgtggacaatgtattcggactcaaacaaaatggcagcg 37448135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 561
Target Start/End: Original strand, 16074454 - 16074551
Alignment:
Q  463 acgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaaca 561  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||| |||| | | | ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16074454 acgtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaagaagcatt-ggaggacagctctagatgcttggcaacaatgacaagagattcataaaca 16074551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 604 - 673
Target Start/End: Original strand, 16074606 - 16074675
Alignment:
Q  604 agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccat 673  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  16074606 agtttaggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccat 16074675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 4e-87; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 18797694 - 18797499
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797694 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 18797595  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797594 atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 18797499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 7335170 - 7334964
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7335170 gaaattgacttttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaa 7335071  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  7335070 tgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacac 7334972  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    | ||||||    
T  7334971 tctgtggg 7334964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 9355620 - 9355817
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9355620 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac 9355719  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9355720 atcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 9355817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37110241 - 37110044
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110241 tttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 37110142  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37110141 atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggg 37110044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 745 - 951
Target Start/End: Original strand, 17842367 - 17842575
Alignment:
Q  745 agaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17842367 agaaattgacttttttggaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaata 17842466  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17842467 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttaca 17842566  T
Q  943 ctttgtggg 951  Q
    |||||||||    
T  17842567 ctttgtggg 17842575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 31578858 - 31579042
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578858 tttttgaaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 31578957  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578958 atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 31579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Original strand, 37703283 - 37703489
Alignment:
Q  747 aaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703283 aaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 37703382  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-gtacact 944  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37703383 gtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacact 37703482  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  37703483 ttgtggg 37703489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 27284112 - 27283914
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactc-atttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284112 tttttgaaaagattaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 27284013  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27284012 catcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 27283914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 32820847 - 32821044
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820847 ttttttaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 32820946  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32820947 atcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggg 32821044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 30055904 - 30055700
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055904 gaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 30055805  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30055804 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 30055705  T
Q  944 tttgt 948  Q
    |||||    
T  30055704 tttgt 30055700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 35353475 - 35353291
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35353475 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaac 35353376  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35353375 atcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgt 35353291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 24212109 - 24211914
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24212109 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 24212010  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24212009 catcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgt 24211914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 41764862 - 41765069
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41764862 gaaattgacttttttgaaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaa 41764961  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41764962 tgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 41765061  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||| ||||    
T  41765062 tttctggg 41765069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 29173889 - 29173705
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173889 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 29173790  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgta 940  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173789 atcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgta 29173705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 16731613 - 16731937
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16731613 gtcgggtggctttacttcttttgcaaatttggactgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcgtacttcaacgagcattgggaggacaacact 16731712  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||            ||||||||||    
T  16731713 agaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgcaacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggag 16731812  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  16731813 aaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggc 16731912  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  16731913 aatttattcgggctcaaacgaaatg 16731937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 17709747 - 17710071
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17709747 gtcgggtggctttacttcttttgcaaatttggactgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcgtacttcaacgagcattgggaggacaacact 17709846  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||            ||||||||||    
T  17709847 agaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgcaacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggag 17709946  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  17709947 aaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaaccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggc 17710046  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17710047 aatttattcgggctcaaacgaaatg 17710071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 23111559 - 23111362
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23111559 tttttaaaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaac 23111460  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23111459 atctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 23111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 31520535 - 31520719
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31520535 tttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaac 31520634  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520635 atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 31520719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 46480923 - 46481107
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46480923 tttttgaaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 46481022  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46481023 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgt 46481107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 22288921 - 22289245
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  22288921 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttggactgcacgtaacgatgtcatttggaattacgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacact 22289020  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||            ||||||||||    
T  22289021 agatgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggag 22289120  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    || |||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  22289121 aagccgcgtgagacgtggtttaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagattcccgtgggc 22289220  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  22289221 aattcattcggactcagacgaaatg 22289245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 10481972 - 10481775
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10481972 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaac 10481873  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10481872 atcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 10481775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 16098163 - 16098494
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |   ||||    
T  16098163 gtcgggtgactttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgcttgtcacacttcaatgaacattgggaggactgcact 16098262  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggaga----------- 614  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||               
T  16098263 agatgcatggcatcaatggcaagaggttcctaaacatcattcaccaccggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagcttgcaagaaaccaaacgat 16098362  T
Q  615 --------aaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcc 706  Q
            |||| || || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16098363 acgtggttaaccaaacgatacgtggttgaagtgcaatgtggacgcatcgttccatgaccgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagactcc 16098462  T
Q  707 cgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    | | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16098463 cataggcaatttattcgggctcaaacgaaatg 16098494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 37347388 - 37347192
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  37347388 tttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaat 37347289  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37347288 atcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgg 37347192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 5657274 - 5657472
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatctt-aatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657274 tttttgaaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 5657373  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-gtacactttgtggg 951  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  5657374 catcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtggg 5657472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 10359008 - 10359205
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  10359008 tttttgaaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaa 10359107  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10359108 atcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 10359205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 15612553 - 15612750
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15612553 ttttttaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaac 15612652  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15612653 atcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 15612750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 747 - 936
Target Start/End: Original strand, 48928082 - 48928272
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaag-ttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48928082 aaattgacttttttaaaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 48928181  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48928182 gtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 48928272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 947
Target Start/End: Complemental strand, 8861652 - 8861459
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8861652 tttttgaaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaac 8861553  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttg 947  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8861552 atcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttg 8861459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 32432819 - 32432622
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32432819 tttttaaaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaac 32432720  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32432719 accttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 32432622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 6546886 - 6546689
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6546886 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctc 6546787  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  6546786 atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggg 6546689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 32593001 - 32593184
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||    
T  32593001 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaac 32593099  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593100 atcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgt 32593184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 755 - 930
Target Start/End: Original strand, 44411334 - 44411509
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44411334 tttttggaaaggttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaac 44411433  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 930  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411434 atcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 4583295 - 4583089
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4583295 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaat 4583196  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacact 944  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||| || || |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4583195 gcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacact 4583096  T
Q  945 ttgtggg 951  Q
    |||||||    
T  4583095 ttgtggg 4583089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 25691338 - 25691535
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25691338 tttttaaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 25691437  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    || ||| ||||||||||  |||||||| ||    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25691438 attttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggg 25691535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 767 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 11071558 - 11071376
Alignment:
Q  767 ttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 866  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071558 ttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 11071459  T
Q  867 catgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    || ||| |||||||| || |   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11071458 caggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggg 11071376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Original strand, 12390433 - 12390625
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12390433 gaaattgacttttttggaaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaa 12390532  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12390533 tggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtg--agtcttaagtgt 12390625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 435 - 738
Target Start/End: Original strand, 1581304 - 1581619
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||    
T  1581304 ctttatttctttggcaaatttgggctgcacgaaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaacgagcattgcgagaacgacactagatgcttg 1581403  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggagaaaccgaat 622  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||  || | || ||||||            |||||||||||||| ||      
T  1581404 gcaacaatggcaagaggttcataaacatccctcaccatcggttgtacaacacgaacaaagtatagtgcaacgtaacaactcagtttgggagaaactgagc 1581503  T
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattc 722  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| | ||||| |    
T  1581504 gagatgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccataaccatattacatcttttgcgtgttgtgctagagactccagcggatagtttatcc 1581603  T
Q  723 gggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1581604 gggctcaaacgaaatg 1581619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Original strand, 15672553 - 15672752
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15672553 tttttgaaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 15672652  T
Q  855 atcttggacttacatgtac---tattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    || ||||||||||| ||||   |||||||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15672653 attttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 15672752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 26587886 - 26588075
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26587886 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaac 26587985  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||        |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26587986 atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatcttt--------aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggg 26588075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 26980673 - 26980489
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26980673 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaac 26980574  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26980573 atcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 26980489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 755 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 22687598 - 22687455
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22687598 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaac 22687499  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaaca 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  22687498 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca 22687455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 758 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 43925459 - 43925286
Alignment:
Q  758 ttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 857  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925459 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 43925360  T
Q  858 ttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||||      ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43925359 ttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagt 43925286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 432 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 9329102 - 9328785
Alignment:
Q  432 tgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgc 531  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||   ||||||| || | |||| || ||||    
T  9329102 tgactttacttctttagcaaatttgggctgctcataatgatgtcatttggagtgacgctcatcatacttcaaaaggcattggaaggacaacattagatgc 9329003  T
Q  532 atgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccg 619  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||   |||| |  |||||||| ||||||  | |||||||||||||            ||||||||||||||    
T  9329002 atggcagcaatggcaagatgttcataaacatccatcactactggttgtgccacacggctagaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccg 9328903  T
Q  620 aatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaattta 719  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9328902 agcgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcatttgcgtgttgtgttagagattcccg-ggacaattta 9328804  T
Q  720 ttcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  9328803 ttcgagctcaaacgaaatg 9328785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 21991994 - 21991806
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    | | |||||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  21991994 tttttgaaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt----aatgatgatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaac 21991904  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21991903 atcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 21991806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 787 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 12166078 - 12165939
Alignment:
Q  787 tgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcg 886  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  12166078 tgactcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttg 12165979  T
Q  887 gaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12165978 tcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga 12165939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 746 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 37704559 - 37704387
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37704559 gaaattgacttttttggaaaaactaatcttgattttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaa 37704460  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 917  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704459 tgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 44599033 - 44598836
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttct---gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 851  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  44599033 tttttgaaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgt 44598937  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44598936 aacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtgg 44598837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 851 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258715
Alignment:
Q  851 caacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  950 gg 951  Q
    ||    
T  38258716 gg 38258715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 436 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29201448 - 29201132
Alignment:
Q  436 tttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagc--attgggagaaaaacactaaatgcat 533  Q
    |||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||  ||||| || | ||||||| ||||||    
T  29201448 tttacttctttggcaaatttggattgcacgtaatgatgtcatttggaatgacactcatcatacttcaacaagcatattggaaggacaacactagatgcat 29201349  T
Q  534 gacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggagaaaccgaa 621  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||            |||||||||||||||| |    
T  29201348 gacagcaatgacaagaggttcataaacagccctcaccatcggttgtgcaacacggacaaaatacagtgcaaggtaatagctcagtttgggagaaaccgca 29201249  T
Q  622 tgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactc--ccgtggacaattta 719  Q
     ||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||        |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||    |||| || ||||    
T  29201248 cgagacgtggttgaagtgcaatgttgatgccgctttccat--------ccatattatatcttttgcatgttgtattagagactcatgtgtggccagttta 29201157  T
Q  720 ttcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  29201156 ttcgggctcaaacgaaatgacagcg 29201132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 832 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053644
Alignment:
Q  832 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  932 ttaagtgt 939  Q
    ||||||||    
T  38053651 ttaagtgt 38053644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 816 - 933
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688234
Alignment:
Q  816 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatg 915  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  916 atattatgtgatagtctt 933  Q
    |||| || ||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtctt 33688234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 755 - 906
Target Start/End: Original strand, 34361970 - 34362123
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttga-tctt-aatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgca 852  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34361970 tttttgaaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgca 34362069  T
Q  853 acatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 906  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||| || |  || |||||||||||||||    
T  34362070 atatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 832 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686210
Alignment:
Q  832 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  932 ttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggg 43686210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 38258946 - 38258867
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaatt 834  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38258946 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 426 - 737
Target Start/End: Original strand, 17877093 - 17877411
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggat----gtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaa 521  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| |||    ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |     
T  17877093 gtcgggtgactttacttctttgacaaatttgggctacacgtaatgatatatgtcatttagaatgacactcatcatacttcaacgagcattgggaggacag 17877192  T
Q  522 cactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttg 609  Q
    ||||| ||||||| ||||||||          ||||||||   |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||            ||||    
T  17877193 cactagatgcatggcaacaatg---------gcataaacagccttcatcaacggttttgaaacacgggcataatcgagtgcaaggtaacaactcaatttg 17877283  T
Q  610 ggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgt 709  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||  | |||| |||||||| |    
T  17877284 ggagaaaccgagcgagacgtggttgaaatgcaatgtggatgtcgcgttccatgattgtaaccatattacatttgttgcgtgtggcgttatagactcccat 17877383  T
Q  710 ggacaatttattcgggctcagacgaaat 737  Q
    ||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  17877384 gggaagttcattcgtgctcaaacgaaat 17877411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 661 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34578538 - 34578453
Alignment:
Q  661 tgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34578538 tgaccgttaacatattacatcttttgcgtgttgtgttcgaaattcccgtgggcaatttattcgggctcagacgaaatgacaacgag 34578453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 866 - 936
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928539
Alignment:
Q  866 acatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 48928539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 892 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704327
Alignment:
Q  892 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggg 37704327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 450 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 11746124 - 11745970
Alignment:
Q  450 aaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaaga 549  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| | ||||||||| |   ||| | ||||||||||| |||| ||| |    
T  11746124 aaatttgggttgcacgtaacaatgtcatttggcatgacactcatcatacttcaacaaccattgggaggacggcaccagatgcatgacaataatggcaaca 11746025  T
Q  550 ggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaa 604  Q
    ||| ||||||||    |||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  11746024 ggtgcataaacaaccctcaccaccggttgtgcaacacagacagaatagagtgcaa 11745970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 815 - 879
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  815 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 879  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 626 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30824769 - 30824668
Alignment:
Q  626 acgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcggg 725  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||  | || |||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  30824769 acgtgattgaagtgcaatgtggatgctacatttcatgactgtagtcatattacatcttttgcatgttgtgttagagactgccgcgaataatttattcggg 30824670  T
Q  726 ct 727  Q
    ||    
T  30824669 ct 30824668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 894 - 951
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421371
Alignment:
Q  894 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtggg 27421371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 25184505 - 25184310
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184505 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 25184406  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25184405 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 25184310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 747 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 1815701 - 1815496
Alignment:
Q  747 aaattgactttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 846  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1815701 aaattgactttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatg 1815602  T
Q  847 cttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactt 945  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1815601 tttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 1815502  T
Q  946 tgtggg 951  Q
    ||||||    
T  1815501 tgtggg 1815496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 761 - 949
Target Start/End: Original strand, 879373 - 879562
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879373 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 879472  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  879473 gacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtg 879562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 33816335 - 33816532
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33816335 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 33816434  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33816435 atcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggg 33816532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 745 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 3043022 - 3042814
Alignment:
Q  745 agaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagta 843  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3043022 agaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagta 3042923  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3042922 atgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 3042823  T
Q  943 ctttgtggg 951  Q
    |||||||||    
T  3042822 ctttgtggg 3042814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 438 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28538280 - 28537957
Alignment:
Q  438 tacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgaca 537  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || | ||||||| ||||||| ||    
T  28538280 tacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaacgagcatgggaaggacaacactagatgcatgtca 28538181  T
Q  538 acaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgag 625  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||            |||||||||||||||| |||    
T  28538180 acaatggcaagaggttcataaacaccactcaccaccgattgtacaacacgggcacagtagagtgcaaggtaacaattcagtttgggagaaaccgaacgag 28538081  T
Q  626 acgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcggg 725  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28538080 acgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgatcgtaaccatattacatattttgcgtgttgtgttagagactcccacgggcaatttattcggg 28537981  T
Q  726 ctcagacgaaatgacagcgagaaa 749  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||    
T  28537980 ctcaaacgaaatggcagcgggaaa 28537957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 47254132 - 47253935
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47254132 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 47254033  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47254032 atcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 47253935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 37663550 - 37663757
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaa-aaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663550 gaaattgacttttttaataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 37663649  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37663650 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 37663749  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  37663750 tttgtggg 37663757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 924
Target Start/End: Original strand, 19440467 - 19440636
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440467 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 19440566  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 924  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19440567 atcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 19440636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 28002805 - 28003002
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28002805 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaac 28002904  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28002905 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggg 28003002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 436 - 744
Target Start/End: Original strand, 2064543 - 2064863
Alignment:
Q  436 tttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatga 535  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | | |  || ||||||||    
T  2064543 tttacttttttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaatgagcattgggaggacatctttagatgcatga 2064642  T
Q  536 caacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatg 623  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||            |||||||||||| ||  |    
T  2064643 caacaatggcaagaggttcgtaaacaaccttcaccatcggttgtgcaacacggacaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgagcg 2064742  T
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2064743 agtcgtggttgaagtgcaatgtggacgccacgttccatgaccgtaaccatattacatcctctgcgtgttgtgttagagactcccgcggataatttattcg 2064842  T
Q  724 ggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  2064843 ggctcaaacaaaatgacagcg 2064863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55477907
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggg 55477907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 6864427 - 6864230
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864427 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 6864328  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt-gtacactttgtggg 951  Q
    |||||| |||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6864327 atcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggg 6864230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 950
Target Start/End: Complemental strand, 7703901 - 7703705
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703901 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 7703802  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtgg 950  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7703801 atcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtgg 7703705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Original strand, 19089262 - 19089466
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089262 gaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 19089361  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19089362 tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 19089461  T
Q  944 tttgt 948  Q
    |||||    
T  19089462 tttgt 19089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 33341790 - 33341595
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33341790 tttttaaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac 33341691  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33341690 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 33341595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 34361310 - 34361505
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34361310 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 34361409  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34361410 catcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgt 34361505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Original strand, 29584009 - 29584203
Alignment:
Q  746 gaaattgactt-tttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584009 gaaattgacttgtttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 29584108  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  29584109 tgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 29584203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 17168105 - 17167908
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17168105 tttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac 17168006  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17168005 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17167908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 17173682 - 17173485
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17173682 tttttgaaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac 17173583  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17173582 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17173485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 32579838 - 32579657
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32579838 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac 32579739  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32579738 atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaag 32579657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 49376359 - 49376162
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49376359 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaac 49376260  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  49376259 ttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggg 49376162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 32912398 - 32912593
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32912398 tttttgaaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaa 32912497  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32912498 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 32912593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 756 - 951
Target Start/End: Original strand, 35020851 - 35021051
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaata----gtaattcatctagtaatgcttgc 851  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  35020851 ttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgc 35020950  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtgg 950  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35020951 aatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg 35021050  T
Q  951 g 951  Q
    |    
T  35021051 g 35021051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 17272366 - 17272172
Alignment:
Q  746 gaaattgactt-tttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272366 gaaattgacttatttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 17272267  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17272266 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgt 17272172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 746 - 950
Target Start/End: Original strand, 36493498 - 36493704
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36493498 gaaattgacttttttgaaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaa 36493597  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36493598 tgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacac 36493697  T
Q  944 tttgtgg 950  Q
    |||||||    
T  36493698 tttgtgg 36493704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 37288121 - 37287923
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttga-tcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37288121 tttttgaaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaa 37288022  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  37288021 catcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtggg 37287923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 50697634 - 50697449
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50697634 tttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac 50697535  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaaca-tgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697534 atcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 50697449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 55240924 - 55241119
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55240924 tttttgaaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaac 55241023  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55241024 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 55241119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 764 - 937
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948096
Alignment:
Q  764 aagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 863  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  864 ttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagt 34948096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 746 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 37776060 - 37775879
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37776060 gaaattgacttttttaaaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 37775961  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  37775960 tgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 928
Target Start/End: Complemental strand, 50765112 - 50764939
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50765112 tttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 50765013  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgata 928  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50765012 atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgata 50764939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 23761463 - 23761283
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23761463 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaac 23761364  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaa 935  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23761363 atcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaa 23761283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 51260037 - 51259713
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  51260037 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaaagatgtcatttggaatgacgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacact 51259938  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttgggag 613  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    ||| || || ||| |||||||||||| |||||||||||            ||||||||||    
T  51259937 agatgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgcgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggag 51259838  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| |    
T  51259837 aaaccgcgtgagacgtggttgaactgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgtatgttgtgttagagactctcgtgggc 51259738  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  51259737 aattcattcgggctcaaacgaaatg 51259713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 746 - 926
Target Start/End: Original strand, 30002450 - 30002631
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002450 gaaattgacttttctgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 30002549  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  30002550 tgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga 30002631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 932
Target Start/End: Original strand, 46887977 - 46888154
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46887977 tttttgaaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaac 46888076  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtct 932  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  46888077 atcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtct 46888154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 436 - 746
Target Start/End: Original strand, 56065319 - 56065641
Alignment:
Q  436 tttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatga 535  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  56065319 tttacttctttggcaaatttgggctgcccgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacactagatgcatgg 56065418  T
Q  536 caacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatg 623  Q
    || ||||| || ||||||||||||||    ||  || || |||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||| |  ||    
T  56065419 cagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcgtcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtg 56065518  T
Q  624 agacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  56065519 agacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaattcattcg 56065618  T
Q  724 ggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  56065619 ggctcaaacgaaatgacaacgag 56065641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 5047785 - 5047969
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  5047785 tttttgaaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaac 5047884  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5047885 atcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgt 5047969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 7152023 - 7152207
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7152023 tttttgaaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaa 7152122  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7152123 atcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgt 7152207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 435 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 18442642 - 18442328
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  18442642 ctttacttctttggaaaatttgggctacacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatactttaatgagcattgggaggacaacactatatgcatg 18442543  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaat 622  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||   | || || ||||||||||| || | || |||||||||||||            |||||||||||||||      
T  18442542 gcaacaatggcaagatgttcataaacaacct-catcaccggttgtgcaatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaaccgagc 18442444  T
Q  623 gagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattc 722  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18442443 gagacgtggttgaagtgcaatgcggatgtcgcgttccatgaccgcaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactcccatgggcaatttattc 18442344  T
Q  723 gggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18442343 gggctcaaacgaaatg 18442328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 42200132 - 42199927
Alignment:
Q  746 gaaattgac-tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  42200132 gaaattgacctttttgaaaaagttaattt-gattttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagta 42200034  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatg-tactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tac 941  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42200033 atgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttac 42199934  T
Q  942 actttgt 948  Q
    |||||||    
T  42199933 actttgt 42199927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 755 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 4205376 - 4205216
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4205376 tttttgaaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac 4205277  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatg 915  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205276 atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 755 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 39400400 - 39400236
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39400400 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaac 39400301  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 919  Q
    |||||| ||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400300 atcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Original strand, 25700865 - 25701072
Alignment:
Q  746 gaaattgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25700865 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaa 25700964  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||| ||||| || ||||   ||||||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  25700965 tgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacac 25701064  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  25701065 tttgtggg 25701072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 751 - 881
Target Start/End: Original strand, 35025381 - 35025511
Alignment:
Q  751 tgactttt-tgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 849  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025381 tgacttttatgaaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 35025479  T
Q  850 gcaacatcttggacttacatgtactattttat 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025480 gcaacatcttggacttacatgtactattttat 35025511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Original strand, 55734689 - 55735013
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55734689 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatatcatttagaatgacgctcatcatacttcaatgagcattgggaggacaacact 55734788  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaa------------gtttgggag 613  Q
    | ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||    ||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||            |||||||||    
T  55734789 agatgtatggcaacaatggcaagatgttcataaacaaccatcatcatcggttgtgcaatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactcggtttgggag 55734888  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||| | | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  55734889 aaaccgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgctccatgatctcaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcccatgagc 55734988  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  55734989 aatttgttcgggctcaaacgaaatg 55735013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 746 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 4598384 - 4598203
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4598384 gaaactgactttttgtaaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataa 4598285  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4598284 tgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 744
Target Start/End: Original strand, 49951049 - 49951323
Alignment:
Q  482 aatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgc 581  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||| | |||||||    
T  49951049 aatgacgctcatcatacttcaacgagcattgaaaggacaacactagaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacgctcaccaccagttgtgc 49951148  T
Q  582 aacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaa 669  Q
    ||||| ||||||||||||||||||            ||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  49951149 aacacaggcataatagagtgcaaggtaacaactcagttttggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcattccatgaccgcaa 49951248  T
Q  670 ccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  49951249 ccatattacatcttttgcatgctgtgttagagattctcgcggccaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcg 49951323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 26896490 - 26896285
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttgaaaaa-gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26896490 gaaattgacttttttaaaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagta 26896391  T
Q  844 atgcttgcaacatctt-ggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tac 941  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  26896390 atgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttac 26896292  T
Q  942 actttgt 948  Q
    |||||||    
T  26896291 actttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 449 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29656149 - 29655843
Alignment:
Q  449 caaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaag 548  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||| ||||||||||   |||||| |||||||  |||||||| || | ||||||| ||||||| || |||||  |||    
T  29656149 caaatttgggcagcacataatgatgtcgtttggaatgacagtcatcatacttcaaaaagcattggaaggacaacactagatgcatggcagcaatggaaag 29656050  T
Q  549 aggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaa 636  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||            ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  29656049 aggttcataaacattcatcaccaccgggtgtgcaacatgggcataatagaatgcaaggtaatatctcagtttggaagaaaccgagtgagacatggttgaa 29655950  T
Q  637 gtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaa 736  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  29655949 gtgtaatgtggatgccgcgttccatgatcgtaaccctcttacatcttttg-ttgttgtgttagaggctcccgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaa 29655851  T
Q  737 tgacagcg 744  Q
    || |||||    
T  29655850 tggcagcg 29655843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 747 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 32592485 - 32592319
Alignment:
Q  747 aaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 845  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32592485 aaattgacttttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaat 32592386  T
Q  846 gcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttg 912  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  32592385 gctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 755 - 939
Target Start/End: Original strand, 46883933 - 46884112
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46883933 tttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 46884032  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||  |||||||||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  46884033 atc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatagt-ttaagtgt 46884112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 755 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 9139619 - 9139465
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9139619 tttttggaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaac 9139522  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagtt 911  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  9139521 atcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9139465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 435 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 51735470 - 51735148
Alignment:
Q  435 ctttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatg 534  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||| |||  |     
T  51735470 ctttacttctttgacaaatttgagctgcacataatgatgtcatttggaatgatgctcatcatacttcaacaagcattggaaggataacactagatgtcta 51735371  T
Q  535 acaacaatgacaagaggttcataaacattattcacc-agcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaa------------gtttgggagaaaccgaa 621  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||   || || | || ||||||||||  |||| ||||| ||||||            ||||||| ||||||||     
T  51735370 gcagcaatggcaagaggttcataaacatccctcccccatcgattgtgcaacataggcagaatagggtgcaatgtaacatctcagtttgggcgaaaccgag 51735271  T
Q  622 tgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttatt 721  Q
     ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51735270 cgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgattgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagacttccgttgacaatttatt 51735171  T
Q  722 cgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  51735170 cgggcttaaacgaaatgacagcg 51735148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396811
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    |||||| | |||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatggg 27396811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 426 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 32577553 - 32577231
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   ||||||| || | |||| |    
T  32577553 gtcgagtgactttacttctttggaaaatttaggctgctcgtaatgatgtcatttggaatgacgcttatcatacttcaaaaggcattggaaggacaacatt 32577454  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||| | || ||||||||||||| || |||| ||||||||            ||||||||    
T  32577453 agatgcatggcggcaatggcaagaggttcataaacatccgtcactaccgtttgtgcaacacggccagaatatagtgcaaggtaacaactcagtttgggag 32577354  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggac 713  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  32577353 aaaccgag-gagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccttaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattcccg-gggc 32577256  T
Q  714 aatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  32577255 aatttattcgggctcaaacgaaatg 32577231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 755 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 23431947 - 23431826
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23431947 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaac 23431848  T
Q  855 atcttggacttacatgtactat 876  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  23431847 atcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 832 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38012065
Alignment:
Q  832 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 931  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  932 ttaag 936  Q
    |||||    
T  38012069 ttaag 38012065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 520 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 43840720 - 43840484
Alignment:
Q  520 aacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tt 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||            ||    
T  43840720 aacactagatgcatgacaacaatgacaagagattcataaaaagccctcaccaccgattatgcaacactagcataatagagtgcaagacaacaacttagtt 43840621  T
Q  608 tgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactccc 707  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43840620 tgggagagaccgcacgagacgtggttgaagttcaacgtggatgccgcgttctatgagcataaccatcttacatcttttgcgttttgtgttagagactccc 43840521  T
Q  708 gtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  43840520 gtggacaatttattcggggtcaaacgaaatggcagcg 43840484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 755 - 949
Target Start/End: Original strand, 4934031 - 4934216
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaa-ttattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4934031 tttttgaacaagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaa 4934130  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtg 949  Q
    |||           | |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4934131 cat-----------aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtg 4934216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 489 - 738
Target Start/End: Original strand, 21321270 - 21321531
Alignment:
Q  489 ctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgg 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||   |||| | ||||||| |||||||     
T  21321270 ctcatcatacatcaacgagcattgggaggacagcactagatgcttggcagcaatggcaagatgttcataaacatccctcactaccggttgtacaacacga 21321369  T
Q  589 gcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatatt 676  Q
    |||||||||||||||||            ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  21321370 gcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaatcgagcgaaacgtggttgaagtgcaatgtggatgttgcgttccatgaccgtaaccatatt 21321469  T
Q  677 acatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  21321470 acaacttttgcatgttgtattagagactctcgcgggaaatttattcgggctcaaacgaaatg 21321531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 41835626 - 41835489
Alignment:
Q  606 tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactc 705  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41835626 tttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccacgttccttgaacgtaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactc 41835527  T
Q  706 ccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagc 743  Q
     ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41835526 tcgcagacaatttattcgggctcaaacaaaatgacagc 41835489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 755 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 38012654 - 38012568
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctag 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012654 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 604 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 37246169 - 37246035
Alignment:
Q  604 agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagac 703  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  37246169 agtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaatcgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagac 37246070  T
Q  704 tcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  37246069 tcccgagggaaatttattcgggcacaaacgaaatg 37246035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 426 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 49119894 - 49119606
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| |||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||    |||||| || | | || |    
T  49119894 gtcgagtggctttccttctttggcaaatttaggctgctcgtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaaaagtcattggaaggacagcatt 49119795  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggag 613  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||| |||||| || ||||||||| |||            |||||||     
T  49119794 agatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgccacacggccagaatagagtgtaaggtaacaacccagtttgggat 49119695  T
Q  614 aaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagaga 702  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  49119694 aaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagaga 49119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 426 - 702
Target Start/End: Original strand, 28425875 - 28426164
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| |||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||    |||||| || | | || |    
T  28425875 gtcgagtggctttccttctttggcaaatttaggctgctcgtaatgatgtcatttggaatgacgttcatcatacttcaaaagtcattggaaggacagcatt 28425974  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag-------------tttggga 612  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||| |||||| || ||||||||| |||             |||||||    
T  28425975 agatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgccacacggccagaatagagtgtaaggtaacaaccccagtttggga 28426074  T
Q  613 gaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagaga 702  Q
     ||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28426075 taaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagaga 28426164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 870 - 951
Target Start/End: Original strand, 35025530 - 35025612
Alignment:
Q  870 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35025530 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggg 35025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 843 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050171
Alignment:
Q  843 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 37246364 - 37246204
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcaca-cttcaacgagcattgggagaaaaacac 524  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||||| | | ||||||| |||||||| || | | | |    
T  37246364 gtcgtgtggctttacttctttggaaaatttgggctgcatgtaatgatgtcatttggaaggacgctcattataccttcaacaagcattggaaggacagctc 37246265  T
Q  525 taaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaaca 585  Q
    |  ||||||| || ||||| || |||||||||||||||   |||| | |||||||||||||    
T  37246264 tggatgcatggcagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgcaaca 37246204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 3879731 - 3879928
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879731 tttttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 3879830  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3879831 atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 3879928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Original strand, 6090974 - 6091169
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090974 tttttaaaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 6091073  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6091074 atcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgt 6091169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 761 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 1946221 - 1946032
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 859  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1946221 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatctt 1946122  T
Q  860 ggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1946121 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 1946032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 20768474 - 20768277
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20768474 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 20768375  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  20768374 accttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatggg 20768277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 755 - 936
Target Start/End: Original strand, 7234824 - 7235008
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctg---attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc 851  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7234824 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgc 7234923  T
Q  852 aacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7234924 aacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 7235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 755 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 5627784 - 5627601
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5627784 tttttaaaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaa 5627685  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 937  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627684 catcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagt 5627601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 755 - 926
Target Start/End: Original strand, 33892804 - 33892975
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33892804 tttttgaaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaac 33892903  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtga 926  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  33892904 atcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 426 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 29368543 - 29368252
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| || | || |||||||||||| | ||||||    
T  29368543 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctggacgtaatgatgtcacttgaaatgatgttcatcatacctgaatgagcattgggaggacaacact 29368444  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaagtttgggagaaaccgaatgag 625  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||     
T  29368443 agatgcatgacagcaatggcaagaggttcataaacatcattcattatcggttgtgtaacacgagcacaatagagtgcaaatttgggagaaatcgaacgaa 29368344  T
Q  626 acgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcg 723  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| ||  | |||||||||||      || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29368343 atgtggttgaagtgaaatgtggacgctgcagttcatgaccgtaa------taaatcttttgcgtgttgtgtttgagactctcgtggacaatttattcg 29368252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 746 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 33619235 - 33619033
Alignment:
Q  746 gaaattgactttttg-aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgat---taatgatcaatagtaattcatctag 841  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33619235 gaaattgactttttttaaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctag 33619136  T
Q  842 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 936  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33619135 taatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaag 33619036  T
Q  937 tgt 939  Q
    |||    
T  33619035 tgt 33619033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 451 - 744
Target Start/End: Original strand, 28106844 - 28107149
Alignment:
Q  451 aatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaagag 550  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||| || | || |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  28106844 aatttgggctgcatataatgatgtcatttcaaatgatgcttatcatacttcaacaagcattggaaggacaatactagatgcatggcaacaatggcaagag 28106943  T
Q  551 gttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagt 638  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||            ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28106944 gttcataaacatctttcaccattggttgtgcaacacatgcaaaatagagtgcaaggtaacatctcagtttgggagaaaccaaacgagacgtggttgaagt 28107043  T
Q  639 gtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatg 738  Q
    | || | | | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28107044 gcaacgaggaagccacgttccatgatcgtaaccatcttacatctttcgtgtgttgtgttagagactcccgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatg 28107143  T
Q  739 acagcg 744  Q
     |||||    
T  28107144 gcagcg 28107149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 761 - 951
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017101
Alignment:
Q  761 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 860  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||      |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 21017101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 29182553 - 29182359
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29182553 tttttgaaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaac 29182457  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29182456 atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggg 29182359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 767 - 939
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318798
Alignment:
Q  767 ttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 866  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  867 catgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |  ||||||||| || || |  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 4318798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 755 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 8513613 - 8513426
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8513613 tttttgaaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaag 8513521  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8513520 attttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 8513426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 757 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 6089286 - 6089111
Alignment:
Q  757 tttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 856  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6089286 tttgaaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatt-------aatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacat 6089194  T
Q  857 cttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
     ||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6089193 tttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgt 6089111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 426 - 708
Target Start/End: Original strand, 14679838 - 14680133
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacact-tcaacgagcattgggagaaaaacac 524  Q
    |||| ||| ||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||| ||| | |||||    
T  14679838 gtcgggtggctttacttcttttacaaatttggcctgcacgtaatgatgtcatttggaatgatgatcatcatactaaaaacgagcattgagaggacaacac 14679937  T
Q  525 taaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgca------------agtttggga 612  Q
    || ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||    ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||    
T  14679938 tagatgcatggccacaatggaaagaggttcataaacaactctcaccactagttgtgcaacacgagcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttggga 14680037  T
Q  613 gaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccg 708  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14680038 gaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggataccgcgttccatgaccgcaaccacattacatcttttgcatgttgtgttagagactcccg 14680133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 755 - 894
Target Start/End: Original strand, 7054564 - 7054704
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  7054564 tttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaa 7054663  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatcttt 894  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  7054664 catcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 426 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15606508 - 15606166
Alignment:
Q  426 gtcgtgtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacact 525  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| || | | ||||    
T  15606508 gtcgggtggctttacttctttggcaaatttgggctgcacgtaatgatgttatttggaatgacgatcatcatacttcaacaagtattggtaggacatcact 15606409  T
Q  526 aaatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag-------------------t 606  Q
    | || |||| |||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| |  ||||||||||||                   |    
T  15606408 agattcatggcaacaatggcaggaggttcataaacaacactcaccaccggctatgcaacacgggaaacatagagtgcaaggtaacaactaacaactcagt 15606309  T
Q  607 ttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcc 706  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15606308 ttgggagaaaccgcacgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcatttcacgatcgtaaccatattacatctttttcgtgttgtgttagagactcc 15606209  T
Q  707 cgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgagaaa 749  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15606208 catgggcaacttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggaaa 15606166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 431 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 30802472 - 30802298
Alignment:
Q  431 gtgactttacttcattgtcaaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatg 530  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || | ||||||| |||    
T  30802472 gtgactttacttctttggcaaatttgggttgcacgtaatgatgtcatttggaatgacgctcatcatacttcaacaagtattggaaggacaacactagatg 30802373  T
Q  531 catgacaacaatgacaagaggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag 605  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||    |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30802372 catgacaacaatggtaagacattcataaacagccctcaccaacggttgtggaacacaggcagaatagagtgcaag 30802298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 449 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19364429 - 19364273
Alignment:
Q  449 caaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaacaatgacaag 548  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  19364429 caaatttgggctgcacgtaatgatgtcattttgaacgacgttcatcatacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatgacaacaatggcgag 19364330  T
Q  549 aggttcataaacattattcaccagcggttgtgcaacacgggcataatagagtgcaag 605  Q
    |||||||||||||    |||||| ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  19364329 aggttcataaacaaccctcaccaacgcatgtgcaacacgagcaaaatcgagtgcaag 19364273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 650 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 15053446 - 15053352
Alignment:
Q  650 gccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagactcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcg 744  Q
    |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  15053446 gccgcgtttcatgtcggtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagacttcagtggacaatttattcgggctcaaacaagatgacagcg 15053352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 861 - 951
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353347
Alignment:
Q  861 gacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 30353347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 889 - 948
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055201
Alignment:
Q  889 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgt 948  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 7055201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 766 - 821
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  766 gttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatg 821  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 450 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 11732133 - 11732018
Alignment:
Q  450 aaatttgggctgtacgtaaggatgtcatttggaatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggagaaaaacactaaatgcatgacaac----aatgac 545  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||  | |    ||||||    
T  11732133 aaatttgtgctgcacgtaatgatgtcattgggaatgacgttcaacatacttcaatgagcattgggaggacaacaatagatgcatgggagcaattaatgac 11732034  T
Q  546 aagaggttcataaaca 561  Q
    ||||||||||||||||    
T  11732033 aagaggttcataaaca 11732018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 607 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 11731963 - 11731885
Alignment:
Q  607 ttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatctttt 685  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11731963 ttgggagaaactgagcgagacgtggtggaagtgcaatgtagatgacgcattccatgactgtaacaatattacatctttt 11731885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 746 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 8289 - 8082
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 844  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8289 gaaattgacttttttgataaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 8190  T
Q  845 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacac 943  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8189 tgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacac 8090  T
Q  944 tttgtggg 951  Q
    ||||||||    
T  8089 tttgtggg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 756 - 939
Target Start/End: Original strand, 408223 - 408406
Alignment:
Q  756 ttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 855  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408223 ttttgaaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaca 408322  T
Q  856 tcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 939  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  408323 tcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgt 408406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 758 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 329
Alignment:
Q  758 ttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 857  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  517 ttgaaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 418  T
Q  858 ttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||      |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  417 ttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggg 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 754 - 918
Target Start/End: Original strand, 93893 - 94056
Alignment:
Q  754 ctttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 853  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  93893 ctttttaaaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaa 93991  T
Q  854 catcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 918  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93992 catcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 910 - 951
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94373
Alignment:
Q  910 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggg 94373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 12300 - 12104
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300 tttttaaaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 12202  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-acactttgtggg 951  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12201 atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggg 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 44348 - 44152
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44348 tttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaac 44249  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44248 aacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggg 44152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Original strand, 154439 - 154635
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  154439 tttttgaaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaac 154538  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  154539 aacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggg 154635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 746 - 948
Target Start/End: Original strand, 145798 - 146003
Alignment:
Q  746 gaaattgacttttt-gaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagta-attcatctagta 843  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  145798 gaaattgacttttttgaaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagta 145897  T
Q  844 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtg-taca 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  145898 atgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 145997  T
Q  943 ctttgt 948  Q
    ||||||    
T  145998 ctttgt 146003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 95; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 755 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 267668 - 267479
Alignment:
Q  755 tttttgaaaaagttaattttgatcttaatgtttgactcatttttaaattattgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac 854  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |         |||||||||||||||| |||||| |    
T  267668 tttttgaaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattcttgcagc 267578  T
Q  855 atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc-ttaagtg-tacactttgtggg 951  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  267577 atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggg 267479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 604 - 746
Target Start/End: Original strand, 56 - 198
Alignment:
Q  604 agtttgggagaaaccgaatgagacgtggttgaagtgtaatgtgaacgccgcgttccatgaccgtaaccatattacatcttttgcgtgctgtgttagagac 703  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||||||| | |||||   |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  56 agtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtcaacatatacnatctttcgcgtgttgttttagagac 155  T
Q  704 tcccgtggacaatttattcgggctcagacgaaatgacagcgag 746  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  156 tcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgag 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 805 - 926
Target Start/End: Complemental strand, 101055 - 100948
Alignment:
Q  805 ttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaa 904  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||            || || |||||||||||||||||||    
T  101055 ttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttac------------atcgttggaatctttaacatgcaaa 100970  T
Q  905 catagttgatgatattatgtga 926  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  100969 cagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University