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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF5689-Insertion-3 (Length: 610)
Name: NF5689-Insertion-3
Description: NF5689
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5689-Insertion-3 |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 589; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 604
Target Start/End: Original strand, 1559656 - 1560252
Alignment:
| Q |
8 |
ttcctgcctgtcattgaattattttttatttgactgtcattgtcctgtatgcaaactcaatgatagttatatcaaatgtgggagacttggataactatca |
107 |
Q |
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| T |
1559656 |
ttcctgcctgtcattgaattattttttatttgactgtcattgtcctgtatgcaaagtcaatgatagttatatcaaatgtgggagacttggataactatca |
1559755 |
T |
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| Q |
108 |
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207 |
Q |
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| T |
1559756 |
agcatattaataccacaaaatcagaagtattatacccaaaaacatctttaagaagttactaaattgggatttataaacaatcaactcaaatattacaagc |
1559855 |
T |
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| Q |
208 |
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307 |
Q |
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| T |
1559856 |
taatatcaagtcatttcaaggtactttggcatacatatgaaaagagtcacattcacaagagtaataacaatgaggtaaggtgggcatgatagtaatgccc |
1559955 |
T |
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| Q |
308 |
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407 |
Q |
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| T |
1559956 |
catcgagtgaaaactcataccctataggtgtccgaaattggatcctctcaatcgccatatgcggtatatattagtctgtggacatgtgattggatgttat |
1560055 |
T |
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| Q |
408 |
tgggtaggatactacttctcactttgtggtaacaatgcgtagttaccaactctcctatgtttatgcaaattggattggataaaaagaatgagaaatattg |
507 |
Q |
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| T |
1560056 |
tgggtaggatactacttctcactttgtggtaacaatgcgtagttaccaactctcctatgtttatgcaaattggattggataaaaagaatgagaaatattg |
1560155 |
T |
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| Q |
508 |
tttatagcaatacacaaaaaagaaataaagaatacaatatagtataaaggagtttaaaaaccatcatttagagccactaatagaggttaacaaccat |
604 |
Q |
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| T |
1560156 |
tttatagcaatacacaaaaaagaaataaagaatacaatatagtataaaggagtttaaaaaccatcatttagagccactaatagaggttaacaaccat |
1560252 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 609
Target Start/End: Original strand, 2089585 - 2090166
Alignment:
| Q |
18 |
tcattgaattattttttatttgactgtcattgtcctgtatgcaaactcaatgatagttatatcaaatgtgggagacttggataactatcaagcatattaa |
117 |
Q |
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| T |
2089585 |
tcattgtattattttttatttgattgtcattgtcctgtatacaaactcaatgatagttatatcaaatgtgggagagttggataactaccaagcat--tat |
2089682 |
T |
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| Q |
118 |
taccacaaaatcagaagtattatacccaaaaacatctttaagaagttactaaattgggatttataaacaatcaactcaaatattacaagctaatatcaag |
217 |
Q |
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| T |
2089683 |
taccacaaaatca---------tacccgaaatcatctttaagaagttgctaaattgggatttataaacaatcaactcaaatattacaagctaatatcaag |
2089773 |
T |
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| Q |
218 |
tcatttcaaggtactttggcatacatatgaaaagagtcacattcacaagagtaataacaatgaggtaaggtgggcatgatagtaatgccccatcgagtga |
317 |
Q |
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| T |
2089774 |
tcatttcaaggtactttggtatacatatgaa--gagttacattctcaagagtaataacaacgaggtaaggttggcatgatagtaacaccccatcgagtgg |
2089871 |
T |
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| Q |
318 |
aaactcataccctatgggtgtccgaaattggatcctctcaatcgccatatgcggtatatattagtctgtggacatgtgattggatgttattgggtaggat |
417 |
Q |
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| T |
2089872 |
aaactcataccctatgggtgtccgaaattggatcctctcaatcaccatatgcggtatatattagtgtgtgaacatgtgattggatatttttgggtaggat |
2089971 |
T |
|
| Q |
418 |
actacttctcactttgtggtaacaatgc---gtagttaccaactctcctatgtttatgcaaattggattggataaaaagaatgagaaatattgtttatag |
514 |
Q |
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| T |
2089972 |
actacttctcactttgtggtaacaatgcttggtagttaccaactctcccatgtttatgcaaattggattcgataaaaagaatgagaaatgttgtttatag |
2090071 |
T |
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| Q |
515 |
caatacacaaaaaagaaataaagaatacaatatagtataaaggagtttaaaaaccatcatttagagccactaatagaggttaacaaccatccaga |
609 |
Q |
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| T |
2090072 |
caatacactaaaaagaaataaagaatacaatatagtataaaggagtttaaaaaccatcatttagagccactaatagaggtgcacaaccatgcaga |
2090166 |
T |
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