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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5690_high_5 (Length: 435)

Name: NF5690_high_5
Description: NF5690
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5690_high_5
NF5690_high_5
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (1-421)||(2326019-2326439)
chr2 (35-422)||(2329768-2330155)
chr2 (1-418)||(2320165-2320582)
chr2 (1-418)||(2292845-2293262)
chr2 (1-418)||(2309176-2309593)
chr2 (25-418)||(2302488-2302881)
chr2 (35-418)||(2350068-2350451)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 2326019 - 2326439
Alignment:
Q  1 tcttcctcgtcaaagccattctctcctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccg 100  Q
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T  2326019 tcttcctcgtcaaagccattctctcctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcacaagcatacaatggctccg 2326118  T
Q  101 aaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2326119 aaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatc 2326218  T
Q  201 tccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaacc 300  Q
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T  2326219 tccgaccgtgctctggcccaccacgccctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccagtcacaaactcatatctagcaacc 2326318  T
Q  301 agcacaacatcagcgccgctttttatggcccaacatggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctc 400  Q
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T  2326319 agcacaacatcagcgccgctttttatggcccaacatggtgtaccctccgtcgtaacctcgcctctgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctc 2326418  T
Q  401 tgaaattcggaagtgggttct 421  Q
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T  2326419 tgaaattcggaagtgggttct 2326439  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 35 - 422
Target Start/End: Original strand, 2329768 - 2330155
Alignment:
Q  35 aaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccgaaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaa 134  Q
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T  2329768 aaccaccgcaaccctcccccctggtccaccacatataccaatcatcacaagcatccaatggcttcgaaaatcattcgcccagcttgaaccttttctcaga 2329867  T
Q  135 actctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatctccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttc 234  Q
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T  2329868 actcttcatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggttctcgaccttccattttcatcgccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttc 2329967  T
Q  235 aaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaaccagcacaacatcagcgccgctttttatggcccaac 334  Q
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T  2329968 aaaactcctccgtcttctctgatcgtcctaaagcacttcccactaacaaactcatgtccagcaaccagcacaatatcagctccgctttttatggaccaac 2330067  T
Q  335 atggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctctgaaattcggaagtgggttctg 422  Q
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T  2330068 atggcgtactctccgtcgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatctaagatcaaatcattctctgaaattcggaagtgggttctg 2330155  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 2320165 - 2320582
Alignment:
Q  1 tcttcctcgtcaaagccattctctcctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccg 100  Q
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T  2320165 tcttccttatcagagccatcctctccttcttcacaaccaccgtacccctccctcccggccctctacacatccccatcatcacaaacttccaattgctcca 2320264  T
Q  101 aaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatc 200  Q
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T  2320265 aaaatcaatctcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcactgtccatatcggttctcgaccttccattttcatc 2320364  T
Q  201 tccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaacc 300  Q
      ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |  ||||||| ||||| ||   ||| ||||| | |  || | |  | || |||||||    
T  2320365 aacgaccatgctctggctcaccatgttctcgttcaaaactcagccatcttctcggatcgccccgtagctcttcctacttccataatgttgtccagcaacc 2320464  T
Q  301 agcacaacatcagcgccgctttttatggcccaacatggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctc 400  Q
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T  2320465 aacacaacatcagctccgctttttatggcccaacatggcgtaccctccgtcgtaaccttgcttccgagatgcttcatccatccaaaaccaaatcgttctc 2320564  T
Q  401 tgaaattcggaagtgggt 418  Q
     |||||||||||||||||    
T  2320565 agaaattcggaagtgggt 2320582  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 2292845 - 2293262
Alignment:
Q  1 tcttcctcgtcaaagccattctctcctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccg 100  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||     
T  2292845 tcttccttatcagagccatcctctccttattcacaaccaccatacccctccctcccggccctctacacatccccatcatcacaaacttccaattgctcca 2292944  T
Q  101 aaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatc 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||  |||||||||||| |||     
T  2292945 aaaatcaatctcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcactgtccatatcggttctcgaccttccattttcatt 2293044  T
Q  201 tccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaacc 300  Q
      ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||| ||| ||||| | |  |||| |  | || |||||||    
T  2293045 aacgaccatactctggcccaccatgttctcgttcaaaactcatccatcttctctgatcgccctacagctcttcctacttccaaaatgttgtccagcaacc 2293144  T
Q  301 agcacaacatcagcgccgctttttatggcccaacatggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctc 400  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2293145 aacacaacatcaacaccgcttattatggcccaacatggcgtacccttcgtcgtaaccttgcttccgagatgcttcatccatccaaactcaaatcgttctc 2293244  T
Q  401 tgaaattcggaagtgggt 418  Q
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T  2293245 agaaattcggaagtgggt 2293262  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 2309176 - 2309593
Alignment:
Q  1 tcttcctcgtcaaagccattctctcctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccg 100  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || | | |||| |||||     
T  2309176 tcttccttatcagagccatgctctccttcttcacaaccactgtacccctccctcccggccctctacacatccccatcatcacaaacttccaattgctcca 2309275  T
Q  101 aaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatc 200  Q
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T  2309276 aaaatcaatctcccaacttgaaccttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcattgtccatatcggttctcaaccttccattttcatc 2309375  T
Q  201 tccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaacc 300  Q
      ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |  |  |||| ||||| |||| ||| ||||| | |  |||| |  | || |||||||    
T  2309376 aacgaccatgctctggctcaccatgttctcgttcaaaactcagccataatctctgatcgccctacagctcttcctacttccaaaatgttgtccagcaacc 2309475  T
Q  301 agcacaacatcagcgccgctttttatggcccaacatggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctc 400  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2309476 aacacaacatcaacaccgctttttatggcccaacatggcgtaccctccgtcgtaaccttgctttcgagatgcttcatccatccaaactcaaatcgttctc 2309575  T
Q  401 tgaaattcggaagtgggt 418  Q
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T  2309576 agaaattcagaagtgggt 2309593  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Original strand, 2302488 - 2302881
Alignment:
Q  25 cctccttcacaaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccgaaaatcattttcccaacttgaacc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| || ||| || | |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  2302488 cctccttcacaaccaccgtacccttccctcctggccctccacacatccccatcctcacaaacattcagttgctccgaaaaccatcctcccaacttgaacc 2302587  T
Q  125 ttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatctccgaccgtgctctggcccaccac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||  |||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||     
T  2302588 ttttctcaaaactctccatgccaaacatggtcctatcatcactctccacatcggttctcgaccttccattttcatcgatgaccatgctctggcccaccat 2302687  T
Q  225 gctctcgttcaaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaaccagcacaacatcagcgccgcttttt 324  Q
    | |||||||||||| |||    ||| ||| ||||| ||||||||  |||| | |  |||| |  | || |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  2302688 gttctcgttcaaaactcagacatctactctgatcgccctaaagcttttcctacttccaaaatgttgtccagcaaccaacacaacatcagctccggttttt 2302787  T
Q  325 atggcccaacatggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctctgaaattcggaagtgggt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2302788 atggcccaacatggcgtaccctccgtcgtaaccttgcttccgagatacttcatccttccaaaaccaaatcgttctcagaaattcggaagtgggt 2302881  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 418
Target Start/End: Original strand, 2350068 - 2350451
Alignment:
Q  35 aaccaccgtacccctccctcccagcccaccacacatccccatcatcataagcatacaatggctccgaaaatcattttcccaacttgaaccttttctcaaa 134  Q
    |||||||| | ||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  2350068 aaccaccgcaaccctccctcccggtccaccgcatatccccattatcacaagtatcctatggctccgaaaatcatcgtcccaactcgaaccttttatcaaa 2350167  T
Q  135 actctccatgccaaacatggtcctatcatcaatcttaatatcggctccagaccttccatttacatctccgaccgtgctctggcccaccacgctctcgttc 234  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || ||| | | | |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  2350168 accctccacaccaaatatggtcctatcatcactctcaaaatcagttaccgaccttccattttcatctccgaccatactctcgcccaccacgctctcgttc 2350267  T
Q  235 aaaattcatctctcttctccgatcgtcctaaagcacttcccaatcacaaactcatatctagcaaccagcacaacatcagcgccgctttttatggcccaac 334  Q
    |||| ||| |  ||||||| ||||| |||| ||| |||||||    |||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  2350268 aaaactcagccatcttctctgatcgccctagagctcttcccaccgccaaaatcatctccagcaaccaacacaacatcagctccgctttttatggtgcaac 2350367  T
Q  335 atggcgtaccctctgttgtaacctcgcctccgagatgcttcatccatccaagatcaaatcattctctgaaattcggaagtgggt 418  Q
    ||||||| ||||| || | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  2350368 atggcgtgccctccgtcgaaaccttgcttctgagatgcttcatccatctaagatcaaatctttctcagaaatccgtaagtgggt 2350451  T

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