View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5705-Insertion-6 (Length: 968)

Name: NF5705-Insertion-6
Description: NF5705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5705-Insertion-6
NF5705-Insertion-6
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (7-426)||(9254718-9255143)
chr8 (538-929)||(13152430-13152831)
chr8 (613-897)||(28846435-28846724)
chr8 (613-929)||(27190593-27190910)
chr8 (613-929)||(14446647-14446971)
chr8 (538-734)||(9256161-9256356)
chr8 (761-929)||(9256359-9256528)
chr8 (671-923)||(24333586-24333850)
chr8 (809-929)||(30791494-30791615)
chr8 (797-929)||(16532667-16532800)
chr8 (797-929)||(21958518-21958651)
chr8 (813-894)||(10467786-10467867)
chr8 (808-888)||(42446935-42447015)
chr8 (830-929)||(10014471-10014571)
chr8 (613-702)||(23449066-23449148)
chr8 (855-929)||(32372022-32372097)
chr8 (855-929)||(32342880-32342955)
chr8 (855-929)||(32355367-32355442)
chr8 (855-929)||(32359486-32359561)
chr8 (860-929)||(40146046-40146116)
chr8 (425-475)||(9256044-9256098)
chr8 (857-925)||(34228269-34228338)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (538-929)||(14498635-14499036)
chr1 (613-929)||(9636936-9637260)
chr1 (613-891)||(30559080-30559366)
chr1 (615-929)||(48606648-48606971)
chr1 (761-929)||(52753856-52754025)
chr1 (538-729)||(52754029-52754222)
chr1 (797-929)||(25017392-25017525)
chr1 (798-929)||(26272965-26273097)
chr1 (816-929)||(35949014-35949128)
chr1 (797-929)||(40864755-40864888)
chr1 (797-903)||(17127445-17127552)
chr1 (809-929)||(21973824-21973945)
chr1 (797-929)||(32379892-32380021)
chr1 (642-763)||(30054708-30054829)
chr1 (817-929)||(30054847-30054960)
chr1 (613-656)||(30054660-30054703)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (613-929)||(31944432-31944755)
chr4 (795-929)||(53693070-53693205)
chr4 (797-929)||(12211262-12211395)
chr4 (797-929)||(4325418-4325550)
chr4 (797-920)||(27364889-27365013)
chr4 (613-728)||(24104677-24104793)
chr4 (797-929)||(55464696-55464829)
chr4 (836-929)||(3074414-3074508)
chr4 (797-929)||(42843713-42843849)
chr4 (613-665)||(17359270-17359322)
chr4 (672-745)||(51379514-51379587)
chr4 (802-860)||(1147523-1147581)
chr4 (855-929)||(8897962-8898037)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (613-929)||(9230215-9230540)
chr7 (591-897)||(43727788-43728102)
chr7 (613-929)||(23179922-23180251)
chr7 (797-929)||(27387342-27387475)
chr7 (797-929)||(19399984-19400117)
chr7 (805-929)||(26493750-26493875)
chr7 (801-933)||(18375416-18375547)
chr7 (798-929)||(38575325-38575457)
chr7 (797-929)||(45197650-45197782)
chr7 (797-929)||(8638620-8638754)
chr7 (671-763)||(25024455-25024547)
chr7 (621-677)||(5287719-5287775)
chr7 (671-786)||(5287940-5288060)
chr7 (858-929)||(14088815-14088887)
chr7 (858-929)||(14398833-14398905)
chr7 (613-677)||(25024226-25024290)
chr7 (681-763)||(24276438-24276521)
chr7 (797-837)||(23804627-23804667)
chr7 (538-573)||(26782377-26782412)
chr7 (896-929)||(25024629-25024662)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (618-929)||(3055300-3055621)
chr5 (613-929)||(8785597-8785921)
chr5 (614-929)||(27168839-27169155)
chr5 (792-929)||(1280379-1280517)
chr5 (713-929)||(23244606-23244831)
chr5 (816-929)||(203875-203989)
chr5 (671-929)||(11852587-11852854)
chr5 (810-929)||(22541905-22542025)
chr5 (809-929)||(26540691-26540812)
chr5 (809-929)||(22712935-22713048)
chr5 (840-929)||(2228964-2229054)
chr5 (613-677)||(11849702-11849766)
chr5 (855-929)||(19518978-19519053)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (613-929)||(17554-17879)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (618-929)||(12539393-12539712)
chr2 (644-877)||(34317556-34317797)
chr2 (801-929)||(19951867-19951996)
chr2 (797-929)||(35649696-35649829)
chr2 (810-929)||(22483568-22483688)
chr2 (797-929)||(33453224-33453357)
chr2 (809-929)||(34526370-34526491)
chr2 (809-929)||(22464688-22464809)
chr2 (820-914)||(13308745-13308840)
chr2 (830-928)||(34907624-34907723)
chr2 (614-648)||(34318088-34318122)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (613-929)||(12180561-12180886)
chr6 (586-929)||(11970747-11971098)
chr6 (798-929)||(25599159-25599294)
chr6 (795-929)||(32442010-32442142)
chr6 (797-929)||(24074418-24074551)
chr6 (844-929)||(30621226-30621311)
chr6 (830-929)||(3050902-3051002)
chr6 (614-728)||(25340298-25340408)
chr6 (797-929)||(25340451-25340584)
chr6 (613-679)||(8035704-8035770)
chr6 (671-743)||(8035479-8035551)
chr6 (839-925)||(1296557-1296644)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (613-929)||(3856912-3857237)
chr3 (637-929)||(51261817-51262118)
chr3 (694-928)||(15667868-15668111)
chr3 (797-929)||(31989035-31989168)
chr3 (797-929)||(43137133-43137265)
chr3 (797-929)||(53710404-53710537)
chr3 (797-929)||(24908429-24908562)
chr3 (613-697)||(55194863-55194947)
chr3 (797-929)||(37381905-37382038)
chr3 (618-693)||(9741407-9741480)
chr3 (855-929)||(22934835-22934910)
chr3 (810-877)||(43585836-43585903)
chr3 (862-929)||(24988849-24988917)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (805-929)||(134890-135015)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (797-929)||(259924-260057)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (797-929)||(214197-214330)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (825-929)||(1430-1535)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (809-929)||(15832-15953)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (713-929)||(435384-435616)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (809-929)||(197123-197244)
[»] scaffold0726 (1 HSPs)
scaffold0726 (862-929)||(954-1022)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 426
Target Start/End: Original strand, 9254718 - 9255143
Alignment:
Q  7 aacagtagggtatgggaacggaccatatatttttacattaattaattaatataaattgatgaaaagatagtgagggcatgcacatgaacatgtccatgga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9254718 aacagtagggtatgggaacggaccatatatttttacattaattaattaatataaattgatgaaaaaatagtgagggcatgcacatgaacatgtccatgga 9254817  T
Q  107 tatcatgcaaatgcaactacctatgtcctgtcattgccatgccatcaccgcgtgatattgatcttagtgttttattttatggtcccttcttgtttcattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9254818 tatcatgcaaatgcaactacctatgtcctgtcattgccatgccatcaccgcgtgatattgatcttagtgttttattttatggtcccttcttgtttcattt 9254917  T
Q  207 -------ttactcatgtacttgtacttagcacccctacccatgtattacaatttcaatcttataccaaatatgaatgacttcaaaataattgagggtatt 299  Q
           || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9254918 ggatgtattgctcatgtacttgtagttagcaccc-tacccatgtattacaatttcaatcttataccaaatatgaatgacttcaaaataattgagggtatt 9255016  T
Q  300 agagatgagaaaatgggatattcatcgttactatgaattagttaaattagttttacattcacgtctaataaaaatcaaattatgttgcaattatttttaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9255017 agagatgagaaaatgggatattcatcgttactatgaattagttaaattagttttacattcacgtctaataaaaatcaaattatgttgcaattatttttaa 9255116  T
Q  400 aatatcattacaaagtgaacttatatg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9255117 aatatcattacaaagtgaacttatatg 9255143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 538 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 13152831 - 13152430
Alignment:
Q  538 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn-cttacaatcacttctacaacatgg 636  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||  ||    
T  13152831 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatacataaaaaaaacttacaatcactttatacataaaaaaaacttacaatcacttctacaacgggg 13152732  T
Q  637 cataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagt 736  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13152731 tataataaattagattttaacttctaatttgtggatcttcaataatagagggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtacaccagt 13152632  T
Q  737 tatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatga 828  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13152631 tatcaagccatgtcaaaaagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgctgtgtggttcaatgacttgatga 13152532  T
Q  829 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 927  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152531 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttggtattattccaacattcatcgcaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 13152432  T
Q  928 tt 929  Q
    ||    
T  13152431 tt 13152430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 613 - 897
Target Start/End: Original strand, 28846435 - 28846724
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||     
T  28846435 cttacaatcatttctacaacatgacataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatatcgggtgcaccaaagctataaccaacatc 28846534  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||  ||| || ||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  28846535 aacaaaagttgtaagtctaccagttgccaaaccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagtccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 28846634  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  28846635 atgtgtggttcaatgacttgatgat---gtacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaa 28846724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 27190593 - 27190910
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||        |||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  27190593 cttacaatcacttctacaactggacataataaatctgattttaacttctaatttgtagatct--------agcgagtgcaccaaagctattaccaacatc 27190684  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||| | |   | | ||||||||    
T  27190685 aacaaaagttggaagtccaccagttgtcaagccatgtcaacaagctagtaaaataatcttataagcccgcgagaaagaattgttacaaacaagatcaacg 27190784  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||| |||| |||    
T  27190785 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttgcacctagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattactcgaatattcaccgcaaagatgtc 27190884  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  27190885 tcagaaaggacatttacctcctaatt 27190910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 14446647 - 14446971
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||     
T  14446647 cttacaatcacttctacaacataacataataaattagattttaacttctaatttgtggaatttcaacaatattgggtacaccaaagctattaccaacatc 14446746  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaattatga--atatgatcaacga 805  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||||||||||||||     |||||||||||| | | ||||||||||| | |  | | |||||||||    
T  14446747 aacaaaagttggaagtccaccagtagtcaagtcctgtcaataagctagtaaaataatcttataagtctgcgagaaagaattgttaccacaagatcaacga 14446846  T
Q  806 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtct 904  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  || |||||||||    
T  14446847 tttgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccaagagagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattctaacattcactgcaaagaggtct 14446946  T
Q  905 cggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| |||| |||||||||||    
T  14446947 cggaaaggacattcacctcctaatt 14446971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 538 - 734
Target Start/End: Original strand, 9256161 - 9256356
Alignment:
Q  538 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggc 637  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  9256161 cattgctcatttaatttatg-taacaatcacttcatacataaaaataacttacaatcactttatacataaaaaaacttacaatcacttcttcaacatggc 9256259  T
Q  638 ataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaa 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  9256260 ataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaaatacacaa 9256356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 761 - 929
Target Start/End: Original strand, 9256359 - 9256528
Alignment:
Q  761 taatcttataagcccgtgagaaagaattatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 860  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9256359 taatcttataagcacgtgagaaagaattaccaatatgatcaatgatgtgtggtttaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 9256458  T
Q  861 cttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  9256459 cttgatgatgttgatataattcgaacattcatcgcaaagaggtctcgcaaatgacatttacctcctaatt 9256528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 671 - 923
Target Start/End: Original strand, 24333586 - 24333850
Alignment:
Q  671 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 765  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| |||  ||| ||||| | |||||||||||||||||     ||    
T  24333586 atcttcgacaatagcaggtgcaccaaaactattaccaacatcaataaaagttggaagtccaccggttgtcaagtcttgtcaataagctagtaaaataatc 24333685  T
Q  766 ttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcact 862  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   | | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24333686 ttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtatgattcaatgactttatgatatgttacactgagcgggagatattcaagtcact 24333785  T
Q  863 tgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc----aagaggtctcggaaagggcatttacctc 923  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||  || |    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  24333786 tgatgatgttaatattattcgaacattattcaccacaaagaggtctcggaaagagaatttacctc 24333850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 30791615 - 30791494
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30791615 gtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcgg 30791516  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  30791515 aaagggcatttaccacctaatt 30791494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 16532800 - 16532667
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||     
T  16532800 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttataccaagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgca 16532701  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16532700 aagagatatcggaaagggcatttacctcctaatt 16532667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 21958518 - 21958651
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||      
T  21958518 gatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattaactcaa 21958617  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21958618 aagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaatt 21958651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 813 - 894
Target Start/End: Original strand, 10467786 - 10467867
Alignment:
Q  813 ttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10467786 ttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatgcatcg 10467867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 808 - 888
Target Start/End: Original strand, 42446935 - 42447015
Alignment:
Q  808 tgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacat 888  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42446935 tgtggttgaatgacgtgattatatgttacatcgagcggaagatattcaagtcacttgatgacgtttatattatttgaacat 42447015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 830 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 10014571 - 10014471
Alignment:
Q  830 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gcaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 928  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10014571 atgttacaccgagcggaagatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagagattttggaaagggcatttacctcctaat 10014472  T
Q  929 t 929  Q
    |    
T  10014471 t 10014471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 613 - 702
Target Start/End: Original strand, 23449066 - 23449148
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctat 702  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23449066 cttacaatcacttttacaacagggcataataaatcagatttt-------aatttgtggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagctat 23449148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Original strand, 32372022 - 32372097
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32372022 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32372097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Original strand, 32342880 - 32342955
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32342880 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32342955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Original strand, 32355367 - 32355442
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  32355367 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaatt 32355442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Original strand, 32359486 - 32359561
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  32359486 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaagaggtctcaaaaatgtcatttacctcctaatt 32359561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 40146116 - 40146046
Alignment:
Q  860 acttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40146116 acttgatgatgttgatattattcgaacattcacaacaaagaggtctcggaaatggcatctacctcctaatt 40146046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 475
Target Start/End: Original strand, 9256044 - 9256098
Alignment:
Q  425 tgacttaactagaatattatccctat----gaactattataccattcacccaaac 475  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  9256044 tgacttaactagaatattctccctatctatgaactattataccattcacccaaac 9256098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 857 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 34228338 - 34228269
Alignment:
Q  857 gtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcct 925  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | | ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  34228338 gtcacttgatgatgttgatattattcgaacatttaccacaaagaggtcttggaaattgcatttacctcct 34228269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 538 - 929
Target Start/End: Original strand, 14498635 - 14499036
Alignment:
Q  538 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn--cttacaatcacttctacaacatg 635  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| |    
T  14498635 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatacataaaaaaaacttacaatcactttatacataaaaaaaaacttacaatcacttctacaacagg 14498734  T
Q  636 gcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaag 735  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14498735 gcataattaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgtaccaaagctattatcaacatcaacaaaagttggaagtacaccag 14498834  T
Q  736 ttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaaga---attatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatg 827  Q
    | |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||    |||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14498835 tcatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagatttgttaccaacatgatcaacgatttgtgg-tcaatgacttgatg 14498933  T
Q  828 atatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctccta 926  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14498934 atatcttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggtctcagaaaggacatttacctccta 14499033  T
Q  927 att 929  Q
    |||    
T  14499034 att 14499036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 9636936 - 9637260
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||     
T  9636936 cttacaatcacttctacaacaaggcatagtaaatcagattttaacttctaatttttggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagccattactaacatc 9637035  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacga 805  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||    |||||||||  ||||||||| |||| | |   | | |||||| ||    
T  9637036 aacaaaagttgaaagtccaccggttataaagccctgccaataagctagtaaataatcttataagttcgtgagaaataattgttaccaacaagatcaatga 9637135  T
Q  806 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtct 904  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9637136 tgcgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggtgatattcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcaccgcaaagaggtct 9637235  T
Q  905 cggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  9637236 cggaaagggcatttacatcctaatt 9637260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 613 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 30559366 - 30559080
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30559366 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttataatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatc 30559267  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||| ||||||  |||||||||||||||||     |||||||||| || |||||||||   |||| || | ||||||||    
T  30559266 aacaaaagttgaaagtccaccggttgtcaagctttgtcaataagctagtaaaatattcttataagctcgcgagaaagaattgttatcaacaagatcaacg 30559167  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca 891  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  30559166 atgtgtggttctatgacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgctgatattattcgaacattca 30559080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 615 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 48606971 - 48606648
Alignment:
Q  615 tacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaa 714  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | || ||    
T  48606971 tacaatcccttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcaagtgcaccaaagctattaccaaaatcaa 48606872  T
Q  715 caaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaat---tatgaatatgatcaacgat 806  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||  ||||     |||||||||| |  |||| ||||||||   ||  || | ||||||||||    
T  48606871 caaaagttggaagtccactagttatcaaaccctgtcaatattctagtaaaataatcttatatgttcgtgggaaagaattgctaccaacaagatcaacgat 48606772  T
Q  807 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctc 905  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||| ||| ||| |||||||||     
T  48606771 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtaacttgataatgttgatattattcaaacactcaccgcaaagaggtctt 48606672  T
Q  906 ggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  48606671 cgaaagggcatttacctcataatt 48606648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 761 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 52754025 - 52753856
Alignment:
Q  761 taatcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaag 857  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52754025 taatcttataagcctgtgagaaagaattattaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgaacgggagatattcaag 52753926  T
Q  858 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52753925 tcatttgatgatgttgatattattcgaacat---tcgcaaagaggtctcggaaagggtatttacctcctaatt 52753856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 52754222 - 52754029
Alignment:
Q  538 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcatacatnnnnnnnncttacaatcactttatacatnnnnnnn---cttacaatcacttctacaacat 634  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  52754222 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcatac-tgaaagaaacttacaatcactttatacataaaaaaaaaacttacaatcacttctacaacat 52754124  T
Q  635 ggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagta 729  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  52754123 ggcataattaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacattaacaaaagttgaaagta 52754029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 25017392 - 25017525
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||     
T  25017392 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgagcgagagatattcaaatcacttgatgatgttgatattattcgaacgttcaccgca 25017491  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25017492 aagaggtctcagaaagggcatatacctcctaatt 25017525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 798 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 26273097 - 26272965
Alignment:
Q  798 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-a 896  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  26273097 atcaacgatgtgttgttcaatgatttgatgatatgttacatcgagcaggagatattcaagtcacgtgatgatgttaatattattcgaacattcatcgcaa 26272998  T
Q  897 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26272997 acaggtctcggaaagggcaattacctactaatt 26272965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 816 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 35949128 - 35949014
Alignment:
Q  816 aatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg-caagaggtctcggaaagggc 914  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  35949128 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatgttattcgaacattcaccgaaaagaggtctcggaaaggac 35949029  T
Q  915 atttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||    
T  35949028 atttacctcctaatt 35949014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 40864888 - 40864755
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  40864888 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgaacgagggatattcaagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgca 40864789  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40864788 aagaggttttagaaagggcatttacctcctaatt 40864755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 797 - 903
Target Start/End: Original strand, 17127445 - 17127552
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  17127445 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 17127544  T
Q  896 aagaggtc 903  Q
    ||||||||    
T  17127545 aagaggtc 17127552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 21973945 - 21973824
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  21973945 gtggttaaatgatttgatgatatgttacactgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 21973846  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21973845 aaagggcatttacctcctaatt 21973824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 32380021 - 32379892
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||     
T  32380021 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgat---atgttacaccaaacgggagatattcaattcacttgatgatgttgatattattcgaacattta-cgca 32379926  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  32379925 aagaggtatcgaaaatgacatttacctcctaatt 32379892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 642 - 763
Target Start/End: Original strand, 30054708 - 30054829
Alignment:
Q  642 taaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatca 741  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  30054708 taaatcagattttaatttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcattaaaaccattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtca 30054807  T
Q  742 agccatgtcaataagctagtaa 763  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  30054808 agccctaccaataagctagtaa 30054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 817 - 929
Target Start/End: Original strand, 30054847 - 30054960
Alignment:
Q  817 atgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggca 915  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||| |||  ||| ||||||| ||  ||| | ||    
T  30054847 atgacttaatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatcatattgacattattcgaaccttctccgcaaagaggtatcataaatgaca 30054946  T
Q  916 tttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||    
T  30054947 tttacctcctaatt 30054960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 613 - 656
Target Start/End: Original strand, 30054660 - 30054703
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaa 656  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30054660 cttacaattacttctacaacatggcataataaatcagattttaa 30054703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 31944432 - 31944755
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  31944432 cttacaatcacttctacaa--tggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcatgaaagctattaccaacatt 31944529  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  31944530 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 31944629  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  31944630 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgtgagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 31944729  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31944730 tcggaaagggcatttacctcctaatt 31944755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 795 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 53693205 - 53693070
Alignment:
Q  795 atgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg 894  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53693205 atgatcaacggtgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaaggcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcg 53693106  T
Q  895 c-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53693105 caaagaggtctcggaaagggcattcacctcttaatt 53693070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 12211395 - 12211262
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||    
T  12211395 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatttca 12211296  T
Q  897 a-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12211295 atgaggtctcgaaaatgacatttacctcctaatt 12211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 4325418 - 4325550
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4325418 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagataatcaacccacttgatgatgttgatattatttgaacattcacagca 4325517  T
Q  897 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
      | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4325518 gaatgtctcagaaagggcaattacctcctaatt 4325550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 797 - 920
Target Start/End: Original strand, 27364889 - 27365013
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg-c 895  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  27364889 gatcaacagtgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgaa 27364988  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttac 920  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  27364989 aagaggtctcgaaaagggcatttac 27365013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 613 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 24104793 - 24104677
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagc-gggtgcaccaaagctattacctacat 711  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24104793 cttacaattatttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatatgcaacgatagcagggtgcaccaaagctatcaccaacat 24104694  T
Q  712 gaacaaaagttggaagt 728  Q
     ||||||||||| ||||    
T  24104693 caacaaaagttgaaagt 24104677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 55464829 - 55464696
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  55464829 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagaaaatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 55464730  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||   || ||| ||||| ||||||||||||    
T  55464729 aagaggctacgaaaaaggcatctacctcctaatt 55464696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 836 - 929
Target Start/End: Original strand, 3074414 - 3074508
Alignment:
Q  836 catcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  3074414 catcgagcgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggtctcaggaagggcatttatctcctaatt 3074508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 42843713 - 42843849
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 896  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||    
T  42843713 gatcaacaatgtgtggtttaatgagttgatgatatgttatattgagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattaatcgaacattcaccaca 42843812  T
Q  897 a----gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |    ||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  42843813 aagaggaggtctcggggagggcattgacatcctaatt 42843849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 613 - 665
Target Start/End: Original strand, 17359270 - 17359322
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatt 665  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17359270 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatt 17359322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 672 - 745
Target Start/End: Original strand, 51379514 - 51379587
Alignment:
Q  672 tcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagcc 745  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  51379514 tcttcaacaatagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaagcc 51379587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 802 - 860
Target Start/End: Original strand, 1147523 - 1147581
Alignment:
Q  802 acgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtca 860  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1147523 acgatgtttggtttaatgatttgatgataggttacatcgagtggaagatattcaagtca 1147581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 8898037 - 8897962
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  8898037 aagtcactggatgatgttgatattattcgagcattcaccgcaaagaggtctcagaaagactatttacctcctaatt 8897962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 9230215 - 9230540
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  9230215 cttacaatcacttctacaacatgacataattaatcagattttaacatcttatttgtcgatattcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatc 9230314  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||| ||   |||  || ||| ||||||    
T  9230315 aacaaaagttggaaatacatcagttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgttagaaaaaattgttaccaacatggtcaacg 9230414  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||     
T  9230415 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatagagcgggagatactcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggta 9230514  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9230515 tcgaaaagggcatttacctcctaatt 9230540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 591 - 897
Target Start/End: Original strand, 43727788 - 43728102
Alignment:
Q  591 aatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtg 690  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43727788 aatcactttatacatagaaaaacttacaatcacttctacaacaaggcataataaatcagactttaacttctaattcgtggatcttcaacaatagcgggtg 43727887  T
Q  691 caccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaaga 785  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     |||||||||||  |||||||||    
T  43727888 caccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtacaccagttatcaactcatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcctatgagaaaga 43727987  T
Q  786 attatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataattt 882  Q
    ||| | |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  43727988 attgttaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttatatcgaacgggagatattcaagtcagttgatgatgttgatattattc 43728087  T
Q  883 gaacattcatcgcaa 897  Q
     ||||||||||||||    
T  43728088 aaacattcatcgcaa 43728102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 23180251 - 23179922
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcacc--aaagctattacctaca 710  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  | |    | | | |  |||||||||||| |||    
T  23180251 cttacaatcacttctacaacagagcataataaattagaatttaatttttaatttgtggatctacaataacaaaatgggtatcttaaagctattaccaaca 23180152  T
Q  711 tgaacaaaagttggaagtacacaa---gttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgat 799  Q
    | |||||||||||||||||| | |   ||||||||||  || ||||||||||||||     |||||||||| ||||||||| |||| | |   | | |||    
T  23180151 tcaacaaaagttggaagtactccacgggttatcaagctttgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaataattgttaccaacaagat 23180052  T
Q  800 caacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aag 898  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  23180051 caacgatgtgtgtttcaataacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaaggcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgcaaag 23179952  T
Q  899 aggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23179951 aggtcttggaaagggcattta-ctcctaatt 23179922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 27387475 - 27387342
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  27387475 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 27387376  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27387375 aagaggtcgcggaaagagcatttacctcctaatt 27387342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 19399984 - 19400117
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  19399984 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 19400083  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19400084 aagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaatt 19400117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 805 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 26493875 - 26493750
Alignment:
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg-caagaggtc 903  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  26493875 atgtgtggttaaatgacttgatgatacgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgtaaagaggtc 26493776  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26493775 tcggaaagggcatttacctcctaatt 26493750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 801 - 933
Target Start/End: Original strand, 18375416 - 18375547
Alignment:
Q  801 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaagag 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  18375416 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatattacatggagcgggagatattcaaatcactagataatgttgatattattcgaacattcat-gcgaaag 18375514  T
Q  901 gtctcggaaagggcatttacctcctaattcgat 933  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18375515 gtctcgaaaagggcatttacttcctaattcgat 18375547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 798 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 38575457 - 38575325
Alignment:
Q  798 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgca 896  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  38575457 atcaacaatgggtggttgaacgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattaaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcgaa 38575358  T
Q  897 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  38575357 agaggtcgcggaaagaacatttacctcctaatt 38575325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 45197650 - 45197782
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| | |     
T  45197650 gatcaacaatgtgtggttcaatgacttgatgatatatt-catcgagcaggagatattcaagtcacttgacgatgttgatattgttcgaacattcaccaca 45197748  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  45197749 aagaggtctcggggagggcatttacatcctaatt 45197782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 8638620 - 8638754
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||     
T  8638620 gatcaacgacgtgtggtttaattacttgatgatatgttataccgaacaagagatattcaagtcatttgatgatatcgatattattcgaacattcaacgca 8638719  T
Q  896 aaga-ggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8638720 aagagggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 8638754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 671 - 763
Target Start/End: Original strand, 25024455 - 25024547
Alignment:
Q  671 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa 763  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| | || |||| |||||| |||||||||||||    
T  25024455 atcttcaacaatagcggatgcaccaaagctattaccagcatcaacaaaagttggaagtccaccaattgtcaatccatgttaataagctagtaa 25024547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 621 - 677
Target Start/End: Original strand, 5287719 - 5287775
Alignment:
Q  621 cacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 677  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5287719 cacttctacaacaagacataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttca 5287775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 671 - 786
Target Start/End: Original strand, 5287940 - 5288060
Alignment:
Q  671 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 765  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||  | |||||||||||||||||     ||    
T  5287940 atcttcaaaaatagcgggtgtaccaaagctattaccatcatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaaatcctgtcaataagctagtaaaataatc 5288039  T
Q  766 ttataagcccgtgagaaagaa 786  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  5288040 ttacaagctcgtgagaaagaa 5288060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 858 - 929
Target Start/End: Original strand, 14088815 - 14088887
Alignment:
Q  858 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14088815 tcacttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 14088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 858 - 929
Target Start/End: Original strand, 14398833 - 14398905
Alignment:
Q  858 tcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14398833 tcacttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 14398905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 677
Target Start/End: Original strand, 25024226 - 25024290
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  25024226 cttacaatcacttctacaacaaggcatgataaatcaaattttaaattctaatttgtagatcttca 25024290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 681 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 24276521 - 24276438
Alignment:
Q  681 atagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag-ccatgtcaataagctagtaa 763  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |  | |||||||||||||||    
T  24276521 atagcgggtgcaccaaagctataaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttgtcaagactctatcaataagctagtaa 24276438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 23804667 - 23804627
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaca 837  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23804667 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgttgatatattaca 23804627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26782412 - 26782377
Alignment:
Q  538 cattgctcatttaatttatgataacaatcacttcat 573  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26782412 cattgctcatttaatttatggtaacaatcacttcat 26782377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 896 - 929
Target Start/End: Original strand, 25024629 - 25024662
Alignment:
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25024629 aagaggtctcagaaagggcatttacctcctaatt 25024662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 2e-89; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 618 - 929
Target Start/End: Original strand, 3055300 - 3055621
Alignment:
Q  618 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaa 717  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  3055300 aatcacttctacaatatgacataattaatgagattttaacttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatcaacaa 3055399  T
Q  718 aa-gttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgt 808  Q
    |  | | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||||||    
T  3055400 attggtagaagtaaaccagttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgatgt 3055499  T
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcgg 907  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||      
T  3055500 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattccgcgcaatgaggtctcat 3055599  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  3055600 aaatggcatttacctcctaatt 3055621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 8785597 - 8785921
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8785597 cttacaatcacttctacagcatgtcataataaatcagatttaaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatc 8785696  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || ||||||||||     |||||||||||| |  ||||||||||   |||  || | ||||||||    
T  8785697 aacaaaagttggaagtccactagttatcaaaccccgttaataagctagtaaaataatcttataag-caatgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 8785795  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||    
T  8785796 atgtgtggttcaatgacttgataatatattacatcaagcgggagatattcaattcagttgatgatattgatattattcgaacattcaccgcaaataggtc 8785895  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||| ||||||   |||||||||||||    
T  8785896 tcgaaaagggttcttacctcctaatt 8785921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 614 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 27169155 - 27168839
Alignment:
Q  614 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatga 713  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  27169155 ttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatttgtgaatcttcaataatagcgggtgtaccaaagctattaccaacatca 27169056  T
Q  714 acaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacga 805  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||| ||   |||  || | |||||||||    
T  27169055 acaaaagatggaagtccaccagttatcaagtcttgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccatgagaaataattgttacaaacaagatcaacga 27168956  T
Q  806 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtct 904  Q
    |||||||||||        || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||    
T  27168955 tgtgtggttca--------ataatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgaaatgaggtct 27168864  T
Q  905 cggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  27168863 cataaagggcatttacctcctaatt 27168839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 792 - 929
Target Start/End: Original strand, 1280379 - 1280517
Alignment:
Q  792 aatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca 891  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1280379 aataagatcaacaatgtgtggttcaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattca 1280478  T
Q  892 tcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1280479 ccgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaatt 1280517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 713 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 23244831 - 23244606
Alignment:
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||| | ||   ||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||  |||||||||||| | |   | | ||||||||    
T  23244831 aacaaaagttggaattccattcgttgtcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagccaatgagaaagaattgttaccaacaagatcaacg 23244732  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtc 903  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  23244731 atgtgtcgttcaatgacttgatgatatgttatgtcgagcggaagttattctagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattaaccgcaacgaggtc 23244632  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||    
T  23244631 tcagaaagggcatgtacctgctaatt 23244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 816 - 929
Target Start/End: Original strand, 203875 - 203989
Alignment:
Q  816 aatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gcaagaggtctcggaaagggc 914  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |    
T  203875 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccggaaagaggtctcggaaaggac 203974  T
Q  915 atttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||    
T  203975 atttacctcctaatt 203989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 671 - 929
Target Start/End: Original strand, 11852587 - 11852854
Alignment:
Q  671 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tc 765  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||   || | ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||     ||    
T  11852587 atcttcaacaatagtgggtgcaccaaaactattactaacatcaacaaaagtgaaaaatccatcagttgtcaagtcctgtcaataagctagtaaaataatc 11852686  T
Q  766 ttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcact 862  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11852687 ttataagtccgtgagaaagaattattaccaacaagatgaaagatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacgggagatatttaactcact 11852786  T
Q  863 tgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | | | |||||||||  ||||| | |||||||| ||||||    
T  11852787 tgatgatgttgatattattcgaacatttaacacaaagaggtctaagaaagagtatttaccttctaatt 11852854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 810 - 929
Target Start/End: Original strand, 22541905 - 22542025
Alignment:
Q  810 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacatt-catcgcaagaggtctcgga 908  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  22541905 tggttgaatgacttgatgatatgttacatcgaacggaagatattcaagtcactcgatgatgttaatattattcgaacattccctcgaaagaggtcgcgga 22542004  T
Q  909 aagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  22542005 aagggcatttacctcataatt 22542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 26540812 - 26540691
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  26540812 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcag 26540713  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26540712 aaagggcatttacctcctaatt 26540691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 22713048 - 22712935
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||| |    
T  22713048 gtggttcaatgacttgatgatatg--------agcgggggatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtctcag 22712957  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22712956 aaagagcatttacctcctaatt 22712935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 840 - 929
Target Start/End: Original strand, 2228964 - 2229054
Alignment:
Q  840 gagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagagg-tctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2228964 gagcggaagatatttaagtcatttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggttctagg-aagggcatttacctcctaatt 2229054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 613 - 677
Target Start/End: Original strand, 11849702 - 11849766
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttca 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11849702 cttacaatcacttctacaacagggcataataactcaaattttaacttctaatttgtgggtcttca 11849766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 19519053 - 19518978
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  19519053 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtattggaaaggtcatttaccacctaatt 19518978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 160; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Original strand, 17554 - 17879
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||     
T  17554 cttacaatcacttctacaacatggcgtaataaatccgattttagcttctaatttgtggatcttcaacaaaagtgggtgcaccaaaactattaccaacatc 17653  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||     ||||||||||||| | | ||||| ||   |||| || | ||||||||    
T  17654 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaatctctgtcaataagctagtaaaataatcttataagctcattagaaataattgttatcaacaagatcaacg 17753  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  17754 atgtgtggttcaatgacttgatgatacgttacatcgagcgggagatatttaagtcacttgctgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 17853  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  17854 tccgaaaggacatttaactcctaatt 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 618 - 929
Target Start/End: Original strand, 12539393 - 12539712
Alignment:
Q  618 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaa 717  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12539393 aatcacttatacaacacggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaa 12539492  T
Q  718 aagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagt-----aatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtg 809  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||   |||  || | ||||||| ||| |    
T  12539493 aagttggaagtccaccagttatcaagccttgccaataagctagtaaaagaatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacaatgcg 12539592  T
Q  810 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgga 908  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  12539593 tggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcataagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtcttgga 12539691  T
Q  909 aagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  12539692 aagaacatttacctcctaatt 12539712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 644 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 34317797 - 34317556
Alignment:
Q  644 aatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag 743  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34317797 aatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgaaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaag 34317698  T
Q  744 ccatgtcaataagctagt-----aatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 835  Q
    |  |||||||||||||||     ||||||||||  || ||||||||||   |||  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34317697 ctttgtcaataagctagtaaaagaatcttataaatccatgagaaagaattgttaccaacaagatcaatgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 34317598  T
Q  836 catcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 877  Q
    || ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34317597 caccgagtaagagatattcaagtcacttcatgatgttgatat 34317556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 801 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 19951996 - 19951867
Alignment:
Q  801 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aaga 899  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  19951996 aacgatgtatggttcaatgacttgacgatatgtcacactgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaaga 19951897  T
Q  900 ggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19951896 ggtctcgaaaagggcatttaccttctaatt 19951867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 35649829 - 35649696
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  ||     
T  35649829 gatcaacgatgtgttgttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattgaaacattcactgca 35649730  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35649729 aagagatctcgaaaaggacatttacttcctaatt 35649696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 810 - 929
Target Start/End: Original strand, 22483568 - 22483688
Alignment:
Q  810 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgga 908  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  22483568 tggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgga 22483667  T
Q  909 aagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22483668 aagggcatttacctcctaatt 22483688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 33453357 - 33453224
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtt-acatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc 895  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  33453357 gatcaacgatgtgtggt-caatgacttcatcatatgtttacaccgagcgggagatatttaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc 33453259  T
Q  896 -aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
     ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  33453258 aaagaggtatcagaaagagcatttacctcctaatt 33453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Original strand, 34526370 - 34526491
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  34526370 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 34526469  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34526470 aaagggcatttacctcctaatt 34526491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Original strand, 22464688 - 22464809
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||| ||||  |||||     
T  22464688 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattcaccgcaaagaaatctcga 22464787  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22464788 aaagggcatttacctcctaatt 22464809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 820 - 914
Target Start/End: Original strand, 13308745 - 13308840
Alignment:
Q  820 acttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gcaagaggtctcggaaagggc 914  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  13308745 acttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccataaagaggtctcggaaagggc 13308840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 928
Target Start/End: Original strand, 34907624 - 34907723
Alignment:
Q  830 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca-agaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 928  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  34907624 atgttacaccgaacgagagatactcaggtcacttgatggtgttgatataattcaaacattcatcggagagaagtttcgaaaagggcatttacctcctaat 34907723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 614 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 34318122 - 34318088
Alignment:
Q  614 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatca 648  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34318122 ttacaatcacttctacaacagggcataataaatca 34318088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 12180886 - 12180561
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||     
T  12180886 cttacaatcatttctacatcaaagcataatgaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcgccaaagttattacaaacatc 12180787  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagct-----agtaatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacg 804  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||   |||  || | |||||||     
T  12180786 aacaaaagttgaaagtccatcagttatcaagccctgtcaataagctggtaaaataatcttataagcccgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaaca 12180687  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  12180686 ttgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagaaattcaagtcacttgatgttgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 12180587  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  12180586 tcgggaagggcatttaccttctaatt 12180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 586 - 929
Target Start/End: Original strand, 11970747 - 11971098
Alignment:
Q  586 cttacaatcactttatacatnnnnnnncttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagc 685  Q
    ||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||  |||||    
T  11970747 cttacaatcacttcatacataaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaatcaaattttaatttctaatttctagatcttcaaaaatagc 11970846  T
Q  686 gggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgag 780  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| ||| |||| |||| ||   || |||| |||||||     | |||||||   |||||    
T  11970847 gggtgcagcaaagctattaccaacatcagcaaaagtatgaagtccactagttgtcaaaccccatctataatctagtaaaataattttataagtatgtgag 11970946  T
Q  781 aaagaattatga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 877  Q
    |||||||| | |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11970947 aaagaattgttaccaataagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatcatatgttacaccgagcggaagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 11971046  T
Q  878 aatttgaacattcatcgcaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
      |  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11971047 tttgcgaacattcaccgaaagaggtctcagaaagggcatttacctcctaatt 11971098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 798 - 929
Target Start/End: Original strand, 25599159 - 25599294
Alignment:
Q  798 atcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacat---tcatcg 894  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||    
T  25599159 atcaacgacgtgcggttcaatgacttgatggtatgttacatcgagtgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcatcg 25599258  T
Q  895 c-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25599259 caaagaggtctcggaaagggcatttacgtcctaatt 25599294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 795 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 32442142 - 32442010
Alignment:
Q  795 atgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg 894  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  32442142 atgattaacgatgtgtggttcaatgactt-atgatatgttacatcgagcggaagataataa--tcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcc 32442046  T
Q  895 c-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32442045 caaagaggtatcggaaagggcatttacctcttaatt 32442010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 24074418 - 24074551
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc--g 894  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |    
T  24074418 gatcaacaatgtgtggtaaaatgacttgatgatatgttacaccgagggggagatattcaagttacttgatgatgttgatattattcgaacattcaaccgg 24074517  T
Q  895 caagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
     |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  24074518 aaagaggtctcgg-aatgacatttacctcctaatt 24074551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 844 - 929
Target Start/End: Original strand, 30621226 - 30621311
Alignment:
Q  844 gggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30621226 gggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgaaagaggtctcggaaaggacatttacctcctaatt 30621311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 830 - 929
Target Start/End: Original strand, 3050902 - 3051002
Alignment:
Q  830 atgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gcaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 928  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3050902 atgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagaggtctcggaaagagcatttaccacctaat 3051001  T
Q  929 t 929  Q
    |    
T  3051002 t 3051002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 614 - 728
Target Start/End: Original strand, 25340298 - 25340408
Alignment:
Q  614 ttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatga 713  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    |||| |||||||| ||||||| |||| |    
T  25340298 ttacaatcacttctacaacaacgcataataaatcagattttaacttctaattcgtggatcttcaacaa----gggttcaccaaagttattaccaacatca 25340393  T
Q  714 acaaaagttggaagt 728  Q
    |||||||||| ||||    
T  25340394 acaaaagttgaaagt 25340408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 25340451 - 25340584
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gc 895  Q
    |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |       
T  25340451 gatcaatgatgtgtgattaagtgatttgatgatatgttacacccagtggaagatatttaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccata 25340550  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25340551 aagaggtctcagaaagtgcatttacctcctaatt 25340584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 613 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 8035770 - 8035704
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaac 679  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8035770 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcatattttaacttctaatttgtggatcttcaac 8035704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 671 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 8035551 - 8035479
Alignment:
Q  671 atcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaag 743  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  8035551 atcttcaacagtagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccacgagttgtcaag 8035479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 839 - 925
Target Start/End: Original strand, 1296557 - 1296644
Alignment:
Q  839 cgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgcaagaggtctcggaaagggcatttacctcct 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  || |||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1296557 cgagcgggagatattcaagtcacttgatgatattaatattattcaaatattcacaataaagaggtctcggaaaggccatttacctcct 1296644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 613 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 3857237 - 3856912
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatg 712  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||     
T  3857237 cttacaatcacttctacaataagacataataaatcaaattttaacttctaatttttggatcttcaacaatagcaggtgcaccaaagctattacgaacatc 3857138  T
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaattatgaatat---gatcaacg 804  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||   ||||||||    
T  3857137 aacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaataattgttaccatcaagatcaacg 3857038  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtc 903  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||    
T  3857037 atgtgtggttaaatgacttgatgacatgttactcagagtgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtc 3856938  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    || |||||   |||||||||||||||    
T  3856937 tcagaaagaaaatttacctcctaatt 3856912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 637 - 929
Target Start/End: Original strand, 51261817 - 51262118
Alignment:
Q  637 cataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagt 736  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  51261817 cataataaatcagatcttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcaggtgcatcaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagt 51261916  T
Q  737 tatcaagccatgtcaataagctag-----taatcttataagcccgtgagaaagaa---ttatgaatatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatga 828  Q
    | |||| || ||||||||||||||     |||| | |||||| ||||| ||||||   |||  || | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  51261917 tgtcaaaccctgtcaataagctagtaaaataatataataagctcgtgaaaaagaattgttaccaacaagatcaacgaagtgtggtacaatgaattgatga 51262016  T
Q  829 tatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcg-caagaggtctcggaaagggcatttacctcctaa 927  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  51262017 tatgttacactaagcggaagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgtaaagaggtcttgaaaagaacatttacctcctaa 51262116  T
Q  928 tt 929  Q
    ||    
T  51262117 tt 51262118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 694 - 928
Target Start/End: Original strand, 15667868 - 15668111
Alignment:
Q  694 caaagctattacctacatgaacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaatt 788  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15667868 caaacctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccactagttatcaagccctatcaataagcaagtaaaataatcttataaacccatgagaaagaatt 15667967  T
Q  789 atga---atatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaa 885  Q
     | |   | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15667968 gttaccaacaagatcaaggatgtgtggttcaataacttgatgatatgttataccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaa 15668067  T
Q  886 cattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaat 928  Q
    ||| ||   | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15668068 catgcacaacaaagaggtatcggaaaaggcatttacctcctaat 15668111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 31989035 - 31989168
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  31989035 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 31989134  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31989135 aagaggtcgcggaaagggcatttacctcctaatt 31989168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 43137133 - 43137265
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgca 896  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||    
T  43137133 gatcaacgatgtatggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcgccgca 43137232  T
Q  897 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  43137233 agaggtctcagaaaaggtatttacctcctaatt 43137265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 53710404 - 53710537
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  53710404 gatcaacaatggatggttgaatgacttgatgatctgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactcga 53710503  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53710504 aagaggtcacggaaagggcatttacctcctaatt 53710537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 24908562 - 24908429
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||     
T  24908562 gatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccaagcaggagatattcaagtcgcttgaagatgttgatattattcgaacattcactcga 24908463  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24908462 aagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaatt 24908429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 613 - 697
Target Start/End: Original strand, 55194863 - 55194947
Alignment:
Q  613 cttacaatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaa 697  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55194863 cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaa 55194947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 37382038 - 37381905
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||     
T  37382038 gatcaacgatgtgtggttaaatgactcgatgatatattacactgagcatgagatattcaagtcatttgatgatgtttatattattcgaacattcactgca 37381939  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  37381938 aagaggtctcggaaatgacatttgcctcctaatt 37381905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 693
Target Start/End: Original strand, 9741407 - 9741480
Alignment:
Q  618 aatcacttctacaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcac 693  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9741407 aatcacttctacaccagggc-taataaatcagattttaacttt-aatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcac 9741480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 855 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 22934910 - 22934835
Alignment:
Q  855 aagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22934910 aagtcacttgatgatgttgatattattagaacattcaccgcaaagaggtctcggaaaggtcatttacctcttaatt 22934835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 810 - 877
Target Start/End: Original strand, 43585836 - 43585903
Alignment:
Q  810 tggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatat 877  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  43585836 tggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatatccaagttacttgacgatgttaatat 43585903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 862 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 24988917 - 24988849
Alignment:
Q  862 ttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24988917 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcggaaagggcatgtatctcctaatt 24988849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 805 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 135015 - 134890
Alignment:
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatc-gcaagaggtc 903  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||    
T  135015 atgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccggaaagaggtc 134916  T
Q  904 tcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  134915 tcggaaagggcatttacctcctaatt 134890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Original strand, 259924 - 260057
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc- 895  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||     
T  259924 gatcaacaatgagtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggatatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgca 260023  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  260024 aagaggtctcggaaatggcatttaccacctaatt 260057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 797 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 214330 - 214197
Alignment:
Q  797 gatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattca-tcgc 895  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||      
T  214330 gatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattaactcaa 214231  T
Q  896 aagaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  214230 aagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaatt 214197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 825 - 929
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1535
Alignment:
Q  825 atgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcggaaagggcatttacctc 923  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1430 atgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgatgttgatattattcgaacattcattgcaaagaggtctcggaaatggcatttgcctc 1529  T
Q  924 ctaatt 929  Q
    ||||||    
T  1530 ctaatt 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15953
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  15832 gtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgg 15931  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15932 aaagggcatttacctcctaatt 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 713 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 435616 - 435384
Alignment:
Q  713 aacaaaagttggaagtacacaagttatcaagccatgtcaataagctagtaa-----tcttataagcccgtgagaaagaattatga---atatgatcaacg 804  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||     |||||||||| ||||||||| |||| | |   | | ||||||      
T  435616 aacaaaagttcgaagtccaccagttgtcaacccatgtcaataagttagtaaaataatcttataagctcgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaata 435517  T
Q  805 atgtgtggttcaatgacttgatgatatg-----ttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacat--tcatcgc-a 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  | | ||| |    
T  435516 atgtgtggctcaatgacttgatgatatgatatgttacaccgagcggaagatattcaagtcacttgattatgttgatattattagaacatattaaccgcga 435417  T
Q  897 agaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  435416 agaggtctcgaaaaggacatttacctcctaatt 435384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 809 - 929
Target Start/End: Original strand, 197123 - 197244
Alignment:
Q  809 gtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgc-aagaggtctcgg 907  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||| ||||  |||||     
T  197123 gtggttaaatgaattgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattcaccgcaaagaaatctcga 197222  T
Q  908 aaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  197223 aaagggcatttacctcctaatt 197244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0726 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0726
Description:

Target: scaffold0726; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 862 - 929
Target Start/End: Original strand, 954 - 1022
Alignment:
Q  862 ttgatgatgttgatataatttgaacattcatcgcaa-gaggtctcggaaagggcatttacctcctaatt 929  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  954 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctccgaaagggcatttatctcctaatt 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University