View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5711_low_2 (Length: 403)

Name: NF5711_low_2
Description: NF5711
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5711_low_2
NF5711_low_2
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (47-397)||(129908-130258)
scaffold0010 (214-381)||(60649-60818)
scaffold0010 (46-100)||(60482-60536)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (1-397)||(16097331-16097727)
chr3 (46-397)||(15470927-15471277)
chr3 (91-397)||(16103783-16104088)
chr3 (46-393)||(32307684-32308021)
chr3 (46-396)||(13210096-13210444)
chr3 (1-397)||(49667807-49668194)
chr3 (46-396)||(14234491-14234843)
chr3 (46-397)||(9512923-9513261)
chr3 (46-397)||(9520898-9521236)
chr3 (46-393)||(1644451-1644787)
chr3 (169-397)||(12174152-12174377)
chr3 (102-288)||(49389453-49389639)
chr3 (1-235)||(12934034-12934268)
chr3 (46-381)||(37250935-37251270)
chr3 (218-381)||(52523665-52523831)
chr3 (219-396)||(27165251-27165429)
chr3 (46-288)||(1465178-1465419)
chr3 (1-165)||(12171828-12171992)
chr3 (214-382)||(24340657-24340826)
chr3 (222-396)||(53301492-53301668)
chr3 (214-382)||(23274705-23274874)
chr3 (46-381)||(22110119-22110454)
chr3 (214-382)||(37642199-37642368)
chr3 (1-82)||(17248010-17248091)
chr3 (281-396)||(18438538-18438653)
chr3 (274-396)||(12399213-12399335)
chr3 (274-393)||(14572596-14572714)
chr3 (219-396)||(14972858-14973036)
chr3 (274-396)||(17487860-17487982)
chr3 (274-396)||(17499342-17499464)
chr3 (274-396)||(36166599-36166719)
chr3 (274-382)||(42386428-42386536)
chr3 (274-386)||(21618460-21618570)
chr3 (274-396)||(13442278-13442400)
chr3 (274-397)||(14576828-14576950)
chr3 (219-396)||(17463179-17463355)
chr3 (219-396)||(34159327-34159503)
chr3 (219-396)||(45606892-45607068)
chr3 (219-396)||(55476492-55476668)
chr3 (302-396)||(11424783-11424876)
chr3 (219-395)||(16282796-16282971)
chr3 (274-396)||(24153204-24153325)
chr3 (213-381)||(43550457-43550625)
chr3 (246-381)||(43925977-43926114)
chr3 (108-242)||(43927291-43927425)
chr3 (213-396)||(8899095-8899277)
chr3 (222-370)||(22147467-22147616)
chr3 (219-386)||(38961876-38962042)
chr3 (218-338)||(2051137-2051260)
chr3 (281-396)||(20698437-20698552)
chr3 (219-396)||(6469119-6469295)
chr3 (219-396)||(7781332-7781508)
chr3 (219-396)||(9707592-9707768)
chr3 (1-151)||(14665853-14666002)
chr3 (1-151)||(14735366-14735515)
chr3 (219-396)||(16454266-16454442)
chr3 (274-396)||(23083356-23083478)
chr3 (3-82)||(25476111-25476190)
chr3 (219-396)||(28848596-28848772)
chr3 (239-396)||(29172587-29172744)
chr3 (219-386)||(12567571-12567737)
chr3 (219-386)||(13544036-13544202)
chr3 (331-396)||(28194694-28194759)
chr3 (219-396)||(13151775-13151952)
chr3 (219-396)||(13154240-13154417)
chr3 (219-396)||(10247708-10247884)
chr3 (1-151)||(14669008-14669157)
chr3 (278-396)||(25476384-25476502)
chr3 (274-396)||(26686891-26687013)
chr3 (278-396)||(40213720-40213837)
chr3 (274-388)||(43840944-43841058)
chr3 (283-396)||(55500943-55501055)
chr3 (34-151)||(53070455-53070570)
chr3 (214-381)||(53070633-53070799)
chr3 (1-151)||(12340000-12340149)
chr3 (278-396)||(15977516-15977633)
chr3 (219-396)||(17446640-17446815)
chr3 (278-396)||(17672627-17672744)
chr3 (213-386)||(50242833-50243005)
chr3 (1-82)||(14572904-14572985)
chr3 (214-324)||(19775998-19776107)
chr3 (1-82)||(26687202-26687284)
chr3 (214-324)||(37439403-37439512)
chr3 (214-299)||(23413186-23413271)
chr3 (1-82)||(40213445-40213526)
chr3 (219-395)||(41123892-41124064)
chr3 (46-151)||(42386660-42386763)
chr3 (46-153)||(324481-324587)
chr3 (278-393)||(606324-606441)
chr3 (214-324)||(4107164-4107273)
chr3 (214-324)||(4111016-4111125)
chr3 (214-324)||(8489232-8489341)
chr3 (1-82)||(11424487-11424568)
chr3 (1-82)||(13442589-13442671)
chr3 (214-324)||(15965202-15965311)
chr3 (214-324)||(15969126-15969235)
chr3 (214-324)||(15973050-15973159)
chr3 (214-324)||(16749761-16749870)
chr3 (338-396)||(17737237-17737294)
chr3 (219-396)||(8499519-8499697)
chr3 (278-396)||(12119768-12119886)
chr3 (278-396)||(15412430-15412548)
chr3 (46-134)||(52523496-52523582)
chr3 (92-151)||(4588602-4588661)
chr3 (349-396)||(10556986-10557033)
chr3 (249-324)||(16750390-16750464)
chr3 (349-396)||(45577952-45577999)
chr3 (1-82)||(14576557-14576638)
chr3 (1-82)||(17488172-17488254)
chr3 (1-82)||(43841247-43841329)
chr3 (214-324)||(12852300-12852413)
chr3 (47-84)||(23083132-23083169)
chr3 (46-82)||(606136-606172)
chr3 (229-324)||(45797242-45797337)
chr3 (249-324)||(16749994-16750068)
chr3 (349-396)||(44494810-44494857)
chr3 (1-82)||(18438850-18438931)
chr3 (32-82)||(20698192-20698242)
chr3 (46-151)||(2050968-2051071)
chr3 (335-379)||(13919350-13919393)
chr3 (229-324)||(14501198-14501293)
chr3 (13-80)||(14973172-14973239)
chr3 (46-82)||(16839440-16839476)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (46-397)||(45559-45910)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (1-397)||(21565545-21565941)
chr5 (1-397)||(22959257-22959650)
chr5 (46-396)||(19668902-19669251)
chr5 (46-396)||(21329264-21329614)
chr5 (46-397)||(26011803-26012154)
chr5 (25-396)||(19660585-19660952)
chr5 (46-396)||(21501923-21502273)
chr5 (126-381)||(20026787-20027043)
chr5 (214-381)||(22144068-22144236)
chr5 (124-381)||(22178064-22178323)
chr5 (1-151)||(36154552-36154700)
chr5 (46-203)||(21741312-21741469)
chr5 (1-82)||(11580969-11581050)
chr5 (214-382)||(40725871-40726040)
chr5 (274-396)||(23390491-23390613)
chr5 (299-396)||(36314581-36314678)
chr5 (274-396)||(24493573-24493694)
chr5 (267-396)||(8286829-8286960)
chr5 (219-396)||(264753-264929)
chr5 (274-396)||(21729059-21729181)
chr5 (274-396)||(21808384-21808506)
chr5 (1-151)||(22119917-22120066)
chr5 (219-396)||(29329935-29330111)
chr5 (219-396)||(39363385-39363561)
chr5 (274-396)||(13025315-13025436)
chr5 (274-396)||(13095499-13095620)
chr5 (274-396)||(22412188-22412309)
chr5 (292-396)||(21997547-21997651)
chr5 (219-393)||(1096474-1096649)
chr5 (46-134)||(5888944-5889032)
chr5 (218-396)||(11581183-11581360)
chr5 (281-396)||(24529224-24529339)
chr5 (278-396)||(9077956-9078074)
chr5 (239-396)||(10732944-10733101)
chr5 (219-396)||(20909013-20909189)
chr5 (274-396)||(25421536-25421658)
chr5 (212-348)||(29448054-29448192)
chr5 (219-396)||(42245350-42245526)
chr5 (219-396)||(29345981-29346157)
chr5 (214-324)||(21871507-21871616)
chr5 (214-324)||(21875787-21875896)
chr5 (18-151)||(24767077-24767210)
chr5 (46-151)||(22144299-22144402)
chr5 (214-385)||(20901988-20902159)
chr5 (274-384)||(22075035-22075145)
chr5 (219-396)||(29348454-29348630)
chr5 (219-396)||(29350927-29351103)
chr5 (290-396)||(39245137-39245242)
chr5 (214-396)||(2154593-2154775)
chr5 (214-324)||(10753594-10753703)
chr5 (1-78)||(23390220-23390298)
chr5 (276-380)||(25431414-25431518)
chr5 (229-396)||(36154777-36154941)
chr5 (219-396)||(32027394-32027570)
chr5 (338-396)||(20918052-20918109)
chr5 (1-82)||(21985871-21985952)
chr5 (214-324)||(22120131-22120240)
chr5 (1-82)||(1096783-1096864)
chr5 (229-386)||(18319027-18319185)
chr5 (232-288)||(21741486-21741541)
chr5 (349-396)||(10775790-10775837)
chr5 (329-396)||(21293020-21293086)
chr5 (349-396)||(23064512-23064559)
chr5 (330-381)||(26740697-26740747)
chr5 (349-396)||(38619435-38619482)
chr5 (17-82)||(13095810-13095876)
chr5 (1-82)||(24529536-24529618)
chr5 (17-82)||(25421848-25421914)
chr5 (46-196)||(25743924-25744073)
chr5 (328-381)||(37723922-37723975)
chr5 (274-334)||(20766115-20766175)
chr5 (228-300)||(24767287-24767359)
chr5 (340-396)||(31061069-31061124)
chr5 (219-278)||(36314670-36314728)
chr5 (1-82)||(9078268-9078349)
chr5 (17-82)||(13025626-13025692)
chr5 (32-82)||(22107129-22107179)
chr5 (17-82)||(25431710-25431776)
chr5 (330-384)||(26732884-26732937)
chr5 (46-82)||(15796738-15796773)
chr5 (38-82)||(21292732-21292776)
chr5 (38-82)||(22075334-22075378)
chr5 (349-397)||(26704074-26704122)
chr5 (349-397)||(26973807-26973855)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (1-397)||(33681010-33681406)
chr1 (46-397)||(22237630-22237982)
chr1 (41-397)||(52927745-52928088)
chr1 (46-397)||(22921636-22921987)
chr1 (1-397)||(20248282-20248674)
chr1 (46-393)||(21754052-21754388)
chr1 (46-384)||(20918620-20918954)
chr1 (46-381)||(21861337-21861672)
chr1 (108-381)||(21896087-21896358)
chr1 (46-288)||(35981455-35981696)
chr1 (46-293)||(20636956-20637202)
chr1 (49-288)||(49261452-49261690)
chr1 (108-393)||(16368115-16368401)
chr1 (219-397)||(14295495-14295672)
chr1 (94-315)||(12271639-12271852)
chr1 (108-381)||(50686630-50686905)
chr1 (214-381)||(35261015-35261180)
chr1 (212-385)||(16758664-16758839)
chr1 (124-381)||(41049880-41050138)
chr1 (285-397)||(21161719-21161830)
chr1 (213-348)||(22130844-22130976)
chr1 (108-381)||(50613945-50614219)
chr1 (108-381)||(50621773-50622047)
chr1 (278-396)||(50210212-50210330)
chr1 (1-82)||(433323-433404)
chr1 (214-396)||(433013-433193)
chr1 (219-396)||(21475072-21475248)
chr1 (219-396)||(23593719-23593896)
chr1 (281-396)||(34509784-34509899)
chr1 (219-396)||(13988867-13989043)
chr1 (219-396)||(21923276-21923452)
chr1 (229-381)||(45574836-45574989)
chr1 (274-396)||(22532273-22532395)
chr1 (274-396)||(27250724-27250846)
chr1 (219-396)||(29776689-29776865)
chr1 (219-396)||(31612314-31612490)
chr1 (219-332)||(51130632-51130741)
chr1 (219-386)||(16361928-16362095)
chr1 (278-386)||(21840778-21840885)
chr1 (229-396)||(29298138-29298304)
chr1 (1-80)||(22354296-22354376)
chr1 (222-381)||(16093826-16093987)
chr1 (329-396)||(20847205-20847271)
chr1 (274-396)||(21026684-21026806)
chr1 (231-379)||(26064959-26065108)
chr1 (214-324)||(1924896-1925005)
chr1 (214-324)||(20923910-20924019)
chr1 (214-396)||(13212841-13213023)
chr1 (46-151)||(16758900-16759003)
chr1 (46-134)||(26065205-26065292)
chr1 (335-386)||(20454610-20454660)
chr1 (219-396)||(22123052-22123229)
chr1 (214-324)||(41387815-41387924)
chr1 (1-82)||(50209937-50210018)
chr1 (214-396)||(21346962-21347144)
chr1 (1-78)||(34510100-34510177)
chr1 (46-134)||(28194217-28194305)
chr1 (324-372)||(38801433-38801481)
chr1 (349-396)||(21342097-21342144)
chr1 (349-396)||(21707168-21707215)
chr1 (349-396)||(21711710-21711757)
chr1 (32-82)||(38801147-38801197)
chr1 (50-151)||(35260852-35260952)
chr1 (349-397)||(21714545-21714593)
chr1 (349-396)||(15860123-15860170)
chr1 (249-324)||(41388048-41388122)
chr1 (1-82)||(22532585-22532666)
chr1 (249-314)||(39243943-39244008)
chr1 (249-314)||(39247498-39247563)
chr1 (278-396)||(16275407-16275525)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (46-397)||(10309-10659)
[»] chr6 (94 HSPs)
chr6 (1-397)||(19652198-19652592)
chr6 (1-396)||(29808607-29808999)
chr6 (1-396)||(28496197-28496588)
chr6 (92-396)||(1561307-1561609)
chr6 (46-397)||(23019408-23019759)
chr6 (46-385)||(19668386-19668725)
chr6 (124-397)||(20109140-20109417)
chr6 (124-385)||(9098370-9098620)
chr6 (46-341)||(22080506-22080800)
chr6 (1-208)||(27333008-27333214)
chr6 (1-208)||(27393748-27393954)
chr6 (1-397)||(4185547-4185939)
chr6 (299-396)||(27333238-27333335)
chr6 (299-396)||(27393978-27394075)
chr6 (214-385)||(25644335-25644508)
chr6 (108-381)||(35008167-35008442)
chr6 (285-391)||(4186376-4186482)
chr6 (214-393)||(8227445-8227625)
chr6 (108-381)||(23076749-23077024)
chr6 (46-345)||(4667982-4668277)
chr6 (213-396)||(22782228-22782410)
chr6 (278-396)||(29060544-29060662)
chr6 (47-345)||(4674830-4675124)
chr6 (285-397)||(31155403-31155515)
chr6 (213-396)||(20556873-20557053)
chr6 (219-396)||(2291165-2291341)
chr6 (219-396)||(12742318-12742494)
chr6 (274-396)||(16496248-16496370)
chr6 (219-396)||(18334577-18334753)
chr6 (278-396)||(18409826-18409944)
chr6 (219-396)||(19005047-19005223)
chr6 (219-396)||(19858904-19859080)
chr6 (219-396)||(24422548-24422724)
chr6 (219-396)||(33861795-33861971)
chr6 (219-396)||(33864279-33864455)
chr6 (278-396)||(19303540-19303657)
chr6 (294-396)||(20076704-20076805)
chr6 (219-386)||(30676695-30676861)
chr6 (281-396)||(20638285-20638400)
chr6 (219-396)||(1595550-1595726)
chr6 (219-396)||(8055030-8055206)
chr6 (278-396)||(25629354-25629472)
chr6 (219-396)||(26924625-26924801)
chr6 (274-396)||(17287791-17287913)
chr6 (274-388)||(20360955-20361069)
chr6 (18-151)||(21939631-21939764)
chr6 (214-381)||(18456735-18456901)
chr6 (292-396)||(25656630-25656733)
chr6 (213-396)||(25754810-25754992)
chr6 (219-386)||(34963384-34963550)
chr6 (219-396)||(1540896-1541072)
chr6 (278-396)||(20593777-20593895)
chr6 (214-324)||(22949375-22949484)
chr6 (214-324)||(22953331-22953440)
chr6 (214-324)||(23871819-23871928)
chr6 (214-324)||(23875775-23875884)
chr6 (214-324)||(27325370-27325479)
chr6 (47-152)||(4189203-4189307)
chr6 (46-319)||(18204159-18204432)
chr6 (1-82)||(20594089-20594170)
chr6 (46-151)||(25644571-25644674)
chr6 (278-386)||(25688513-25688620)
chr6 (1-82)||(29060856-29060937)
chr6 (281-396)||(16920634-16920747)
chr6 (281-396)||(35245590-35245703)
chr6 (212-319)||(18706387-18706493)
chr6 (214-324)||(16760525-16760634)
chr6 (94-319)||(18199231-18199456)
chr6 (245-381)||(18461895-18462031)
chr6 (338-396)||(25714421-25714478)
chr6 (229-396)||(3852011-3852178)
chr6 (46-319)||(18177439-18177712)
chr6 (34-151)||(18456964-18457079)
chr6 (229-386)||(16448520-16448678)
chr6 (211-319)||(18696569-18696676)
chr6 (335-379)||(22831524-22831568)
chr6 (349-396)||(22780297-22780344)
chr6 (214-300)||(16624583-16624669)
chr6 (32-82)||(18821575-18821625)
chr6 (214-324)||(31477577-31477686)
chr6 (337-390)||(11185515-11185568)
chr6 (1-82)||(25629079-25629160)
chr6 (46-82)||(17106049-17106085)
chr6 (302-379)||(33443068-33443146)
chr6 (338-381)||(18821904-18821946)
chr6 (32-82)||(20360716-20360766)
chr6 (1-82)||(22779951-22780033)
chr6 (249-314)||(16624371-16624436)
chr6 (46-75)||(18199183-18199212)
chr6 (228-293)||(21939488-21939553)
chr6 (353-397)||(4738631-4738675)
chr6 (38-82)||(16920395-16920439)
chr6 (38-82)||(25611485-25611529)
chr6 (46-82)||(35008466-35008502)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-390)||(6822-7208)
scaffold0556 (46-318)||(8097-8368)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-399)||(160685-161082)
scaffold0001 (219-386)||(501095-501261)
scaffold0001 (214-396)||(85559-85741)
scaffold0001 (46-82)||(162868-162904)
[»] chr8 (89 HSPs)
chr8 (1-397)||(26355422-26355816)
chr8 (1-397)||(21673707-21674102)
chr8 (46-397)||(23760609-23760962)
chr8 (46-396)||(38855019-38855368)
chr8 (35-396)||(5866035-5866391)
chr8 (41-396)||(6520372-6520725)
chr8 (35-396)||(21490999-21491355)
chr8 (46-396)||(17140920-17141266)
chr8 (46-386)||(21285611-21285950)
chr8 (35-396)||(21249388-21249744)
chr8 (35-396)||(21255226-21255582)
chr8 (47-381)||(20498581-20498915)
chr8 (125-385)||(983248-983512)
chr8 (108-381)||(37116366-37116641)
chr8 (108-381)||(24353039-24353316)
chr8 (108-381)||(17266821-17267096)
chr8 (214-382)||(13508019-13508188)
chr8 (214-382)||(13597551-13597720)
chr8 (1-151)||(41598433-41598581)
chr8 (226-382)||(17612056-17612213)
chr8 (274-396)||(16092337-16092459)
chr8 (274-396)||(22626740-22626861)
chr8 (212-381)||(17439438-17439609)
chr8 (108-319)||(22364744-22364954)
chr8 (219-396)||(28648983-28649161)
chr8 (274-396)||(22875069-22875190)
chr8 (1-82)||(22875381-22875462)
chr8 (219-396)||(1484403-1484579)
chr8 (219-396)||(5853277-5853453)
chr8 (274-396)||(7372782-7372904)
chr8 (219-396)||(14409429-14409605)
chr8 (219-396)||(20403228-20403404)
chr8 (274-396)||(20536212-20536334)
chr8 (219-396)||(22001754-22001930)
chr8 (281-396)||(31971261-31971375)
chr8 (274-396)||(26219718-26219838)
chr8 (290-396)||(6759262-6759368)
chr8 (281-396)||(16199647-16199761)
chr8 (274-396)||(18818404-18818526)
chr8 (219-396)||(20046180-20046356)
chr8 (274-396)||(21918995-21919117)
chr8 (274-396)||(21923923-21924045)
chr8 (290-396)||(23406383-23406489)
chr8 (214-324)||(21383887-21383996)
chr8 (219-386)||(16413301-16413467)
chr8 (323-396)||(18879276-18879348)
chr8 (214-396)||(41598189-41598370)
chr8 (219-396)||(4483282-4483457)
chr8 (219-396)||(15203216-15203392)
chr8 (1-82)||(20536523-20536605)
chr8 (274-396)||(26225288-26225408)
chr8 (281-396)||(21395984-21396097)
chr8 (281-396)||(21790477-21790590)
chr8 (219-396)||(4542358-4542534)
chr8 (214-324)||(18862412-18862521)
chr8 (214-324)||(21387307-21387416)
chr8 (214-324)||(21411180-21411289)
chr8 (214-324)||(21805672-21805781)
chr8 (214-324)||(21827781-21827890)
chr8 (5-82)||(23406696-23406774)
chr8 (214-381)||(19801362-19801527)
chr8 (219-396)||(19896266-19896445)
chr8 (281-396)||(21389454-21389567)
chr8 (281-396)||(21778780-21778893)
chr8 (46-130)||(39834100-39834184)
chr8 (329-396)||(45131047-45131113)
chr8 (1-82)||(6759572-6759654)
chr8 (1-82)||(18878961-18879043)
chr8 (1-82)||(18818134-18818215)
chr8 (1-82)||(22627051-22627132)
chr8 (349-396)||(25484382-25484429)
chr8 (32-82)||(21918756-21918806)
chr8 (229-396)||(14823775-14823941)
chr8 (262-319)||(40492834-40492891)
chr8 (349-386)||(45290809-45290846)
chr8 (278-384)||(15070571-15070677)
chr8 (46-82)||(19801196-19801232)
chr8 (278-396)||(19937049-19937167)
chr8 (32-79)||(25362896-25362943)
chr8 (46-83)||(2418643-2418680)
chr8 (328-381)||(19154936-19154989)
chr8 (47-99)||(21414997-21415049)
chr8 (46-82)||(21967337-21967373)
chr8 (46-82)||(21980062-21980098)
chr8 (46-82)||(21985045-21985081)
chr8 (46-82)||(22419184-22419220)
chr8 (47-79)||(24353344-24353376)
chr8 (46-82)||(37116665-37116701)
chr8 (46-82)||(44493456-44493492)
[»] chr4 (99 HSPs)
chr4 (47-397)||(8846359-8846725)
chr4 (46-397)||(12774010-12774351)
chr4 (46-396)||(39706056-39706405)
chr4 (108-385)||(43198384-43198661)
chr4 (124-381)||(13695-13953)
chr4 (18-396)||(15551821-15552194)
chr4 (91-362)||(16596686-16596953)
chr4 (125-385)||(12288055-12288316)
chr4 (48-288)||(15190428-15190667)
chr4 (46-288)||(15099461-15099702)
chr4 (108-381)||(46640285-46640558)
chr4 (214-385)||(52243128-52243302)
chr4 (108-381)||(53081979-53082254)
chr4 (1-151)||(44928647-44928795)
chr4 (1-82)||(44102526-44102607)
chr4 (274-396)||(7798778-7798900)
chr4 (278-388)||(16377522-16377630)
chr4 (219-396)||(44615289-44615465)
chr4 (274-396)||(16239965-16240086)
chr4 (213-396)||(18215253-18215435)
chr4 (281-396)||(7088881-7088996)
chr4 (222-396)||(44928866-44929041)
chr4 (219-396)||(15118337-15118513)
chr4 (274-396)||(22636439-22636561)
chr4 (1-151)||(24028989-24029138)
chr4 (219-396)||(44773072-44773248)
chr4 (219-396)||(52312511-52312687)
chr4 (274-396)||(6899895-6900016)
chr4 (274-396)||(16270231-16270352)
chr4 (275-396)||(52873363-52873484)
chr4 (229-396)||(12301-12468)
chr4 (219-396)||(1837494-1837670)
chr4 (274-396)||(12902761-12902883)
chr4 (274-396)||(14280317-14280438)
chr4 (274-396)||(54798749-54798871)
chr4 (224-396)||(19242700-19242872)
chr4 (1-133)||(3332151-3332282)
chr4 (278-386)||(19618216-19618323)
chr4 (229-396)||(50222333-50222500)
chr4 (274-396)||(7893707-7893829)
chr4 (1-151)||(13812533-13812682)
chr4 (219-396)||(18239404-18239580)
chr4 (274-396)||(44052833-44052955)
chr4 (214-324)||(630710-630819)
chr4 (274-396)||(8574864-8574984)
chr4 (278-395)||(14038653-14038770)
chr4 (1-82)||(14038964-14039046)
chr4 (323-396)||(3096297-3096369)
chr4 (274-393)||(23374354-23374473)
chr4 (219-396)||(3515008-3515184)
chr4 (214-324)||(3331961-3332070)
chr4 (214-324)||(14953897-14954006)
chr4 (1-82)||(15091212-15091294)
chr4 (219-386)||(15355309-15355476)
chr4 (214-324)||(25690137-25690246)
chr4 (278-386)||(14970751-14970858)
chr4 (46-151)||(15464698-15464802)
chr4 (335-396)||(17046491-17046552)
chr4 (46-151)||(20157058-20157163)
chr4 (46-151)||(22633981-22634086)
chr4 (213-396)||(51463847-51464029)
chr4 (228-324)||(13812759-13812854)
chr4 (34-114)||(21815388-21815467)
chr4 (46-134)||(52242962-52243048)
chr4 (338-396)||(7641286-7641343)
chr4 (214-324)||(10713083-10713192)
chr4 (214-324)||(10926853-10926962)
chr4 (338-396)||(12610951-12611008)
chr4 (214-324)||(15225308-15225417)
chr4 (338-396)||(23803369-23803426)
chr4 (219-324)||(12487941-12488045)
chr4 (283-396)||(14053306-14053418)
chr4 (229-396)||(44102215-44102382)
chr4 (46-114)||(21815071-21815138)
chr4 (46-114)||(21818493-21818560)
chr4 (32-82)||(7089192-7089242)
chr4 (214-324)||(15868645-15868754)
chr4 (32-82)||(17047828-17047878)
chr4 (214-318)||(15464865-15464970)
chr4 (1-78)||(16377246-16377323)
chr4 (46-82)||(13618-13654)
chr4 (229-324)||(32851450-32851545)
chr4 (142-217)||(14164732-14164807)
chr4 (249-324)||(15225114-15225188)
chr4 (214-382)||(15367708-15367876)
chr4 (214-382)||(15402721-15402889)
chr4 (329-372)||(17333305-17333347)
chr4 (32-82)||(3096958-3097008)
chr4 (335-381)||(6190481-6190527)
chr4 (1-82)||(7799012-7799094)
chr4 (32-82)||(12903072-12903122)
chr4 (278-382)||(15370036-15370140)
chr4 (278-382)||(16223550-16223654)
chr4 (1-82)||(44053144-44053226)
chr4 (290-382)||(15371220-15371311)
chr4 (290-382)||(15373501-15373592)
chr4 (214-258)||(15791916-15791960)
chr4 (228-300)||(20157240-20157312)
chr4 (228-300)||(22634163-22634235)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (46-396)||(6539-6888)
scaffold0621 (46-385)||(8481-8822)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (46-397)||(16219485-16219835)
chr7 (46-397)||(18005649-18005999)
chr7 (46-396)||(67749-68098)
chr7 (46-396)||(47831811-47832161)
chr7 (1-397)||(810853-811249)
chr7 (92-396)||(15754702-15755004)
chr7 (35-396)||(28505059-28505415)
chr7 (1-397)||(44014181-44014571)
chr7 (46-385)||(16056343-16056680)
chr7 (18-396)||(34200790-34201164)
chr7 (18-396)||(11995770-11996144)
chr7 (46-396)||(22072917-22073268)
chr7 (46-315)||(15113028-15113296)
chr7 (94-315)||(15116565-15116785)
chr7 (46-385)||(12901338-12901681)
chr7 (108-381)||(20220018-20220290)
chr7 (46-208)||(16324197-16324358)
chr7 (219-396)||(16495406-16495579)
chr7 (46-174)||(9389464-9389592)
chr7 (214-397)||(2280053-2280238)
chr7 (214-385)||(1867929-1868101)
chr7 (218-372)||(12255729-12255886)
chr7 (1-151)||(17061684-17061832)
chr7 (214-382)||(19486678-19486847)
chr7 (213-385)||(14044761-14044935)
chr7 (213-385)||(14354791-14354965)
chr7 (213-381)||(13647344-13647512)
chr7 (274-396)||(38227485-38227606)
chr7 (278-396)||(3564363-3564481)
chr7 (219-396)||(18430713-18430889)
chr7 (219-396)||(27216861-27217037)
chr7 (274-396)||(18456408-18456529)
chr7 (274-396)||(12698835-12698958)
chr7 (219-396)||(456322-456498)
chr7 (274-396)||(9509193-9509315)
chr7 (219-396)||(11393272-11393448)
chr7 (219-396)||(11972497-11972673)
chr7 (219-396)||(14949107-14949283)
chr7 (219-396)||(15376698-15376874)
chr7 (219-396)||(16232521-16232697)
chr7 (214-396)||(17061895-17062076)
chr7 (219-396)||(20385108-20385284)
chr7 (219-396)||(21189580-21189756)
chr7 (219-396)||(24702239-24702415)
chr7 (219-396)||(32125492-32125668)
chr7 (219-396)||(41522918-41523094)
chr7 (219-396)||(41525380-41525556)
chr7 (214-377)||(15008433-15008597)
chr7 (229-396)||(18640273-18640440)
chr7 (219-396)||(24704689-24704862)
chr7 (278-396)||(48273393-48273511)
chr7 (214-382)||(10063757-10063921)
chr7 (17-82)||(44116821-44116886)
chr7 (214-396)||(44116510-44116691)
chr7 (278-396)||(16410060-16410177)
chr7 (1-151)||(39267370-39267519)
chr7 (46-151)||(2279887-2279990)
chr7 (278-386)||(24275182-24275289)
chr7 (278-397)||(15144037-15144154)
chr7 (274-396)||(16386242-16386365)
chr7 (274-384)||(26212012-26212122)
chr7 (1-82)||(9509504-9509586)
chr7 (229-396)||(3386334-3386501)
chr7 (1-82)||(15143761-15143842)
chr7 (285-396)||(16213685-16213795)
chr7 (1-151)||(9751274-9751423)
chr7 (281-396)||(40443395-40443509)
chr7 (1-151)||(12756441-12756588)
chr7 (214-324)||(18426070-18426179)
chr7 (214-324)||(39267582-39267691)
chr7 (214-324)||(45169773-45169882)
chr7 (46-151)||(12255560-12255663)
chr7 (91-151)||(2529866-2529926)
chr7 (278-396)||(13869347-13869465)
chr7 (279-315)||(16324135-16324171)
chr7 (349-396)||(20110557-20110604)
chr7 (330-396)||(27847881-27847947)
chr7 (1-82)||(38227796-38227877)
chr7 (323-384)||(10589055-10589115)
chr7 (46-82)||(9177433-9177469)
chr7 (228-300)||(9751500-9751572)
chr7 (248-324)||(18425668-18425743)
chr7 (248-324)||(18425870-18425945)
chr7 (38-82)||(26212311-26212355)
chr7 (229-386)||(38898370-38898528)
chr7 (349-396)||(13831374-13831421)
chr7 (1-82)||(18302495-18302575)
chr7 (32-82)||(40443704-40443754)
chr7 (1-82)||(3564088-3564169)
chr7 (231-288)||(9389649-9389705)
chr7 (46-151)||(15008266-15008370)
chr7 (329-381)||(18203831-18203882)
chr7 (47-79)||(21064932-21064964)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-397)||(132-527)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (64-397)||(22459-22788)
scaffold0037 (1-151)||(80056-80205)
scaffold0037 (213-396)||(82073-82255)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (46-397)||(2412-2763)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (90-386)||(1096-1391)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (46-397)||(19267-19618)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (46-397)||(39941-40292)
scaffold0023 (91-397)||(100377-100683)
scaffold0023 (1-216)||(101578-101791)
scaffold0023 (219-396)||(94412-94588)
scaffold0023 (323-397)||(101502-101576)
scaffold0023 (278-396)||(44455-44573)
scaffold0023 (327-396)||(119879-119948)
scaffold0023 (219-386)||(17425-17591)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (46-396)||(5890-6240)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (46-397)||(32538-32888)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (91-396)||(12770-13075)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (46-385)||(10542-10880)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (46-397)||(12942-13292)
scaffold0138 (108-319)||(18066-18277)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-397)||(132661-133050)
scaffold0028 (91-396)||(62202-62503)
scaffold0028 (219-396)||(136681-136857)
scaffold0028 (219-396)||(139150-139326)
scaffold0028 (219-396)||(144088-144264)
scaffold0028 (219-396)||(134212-134388)
scaffold0028 (219-396)||(141619-141795)
[»] chr2 (74 HSPs)
chr2 (46-396)||(22133984-22134323)
chr2 (41-397)||(25175853-25176199)
chr2 (1-395)||(28405981-28406376)
chr2 (46-370)||(7500-7824)
chr2 (46-381)||(23207296-23207631)
chr2 (35-396)||(23071721-23072066)
chr2 (125-385)||(18786748-18787009)
chr2 (234-396)||(7679589-7679750)
chr2 (94-315)||(22459377-22459598)
chr2 (108-381)||(23791292-23791567)
chr2 (214-397)||(23708553-23708738)
chr2 (218-382)||(19671848-19672011)
chr2 (219-396)||(22105413-22105590)
chr2 (108-381)||(25108906-25109181)
chr2 (274-396)||(23060517-23060639)
chr2 (214-381)||(20520127-20520295)
chr2 (274-396)||(298809-298932)
chr2 (219-396)||(18808944-18809120)
chr2 (219-396)||(23130863-23131039)
chr2 (219-396)||(23133330-23133506)
chr2 (219-396)||(23709517-23709693)
chr2 (219-396)||(23711998-23712174)
chr2 (219-396)||(34402507-34402683)
chr2 (219-396)||(39682314-39682490)
chr2 (219-386)||(24367785-24367951)
chr2 (219-396)||(571398-571574)
chr2 (219-396)||(6725996-6726172)
chr2 (274-396)||(22337119-22337241)
chr2 (274-396)||(23076446-23076568)
chr2 (219-396)||(23135591-23135767)
chr2 (274-396)||(23285869-23285987)
chr2 (274-396)||(23654381-23654503)
chr2 (219-396)||(26505380-26505556)
chr2 (219-396)||(26507858-26508034)
chr2 (219-396)||(28577100-28577276)
chr2 (302-396)||(38138-38231)
chr2 (1-79)||(23660341-23660419)
chr2 (219-386)||(21155045-21155211)
chr2 (214-381)||(22413070-22413240)
chr2 (213-396)||(32039477-32039659)
chr2 (219-396)||(24898180-24898357)
chr2 (219-396)||(24900663-24900840)
chr2 (219-396)||(24903140-24903317)
chr2 (219-396)||(24905617-24905794)
chr2 (219-396)||(24908092-24908269)
chr2 (274-396)||(22731229-22731351)
chr2 (274-396)||(23660027-23660148)
chr2 (219-386)||(32214906-32215072)
chr2 (281-396)||(20309112-20309225)
chr2 (336-396)||(23040247-23040306)
chr2 (212-319)||(24697538-24697645)
chr2 (1-82)||(298539-298620)
chr2 (214-324)||(1283657-1283766)
chr2 (278-396)||(23103396-23103512)
chr2 (214-324)||(30344758-30344867)
chr2 (323-396)||(8946661-8946733)
chr2 (17-82)||(23076757-23076822)
chr2 (229-396)||(45029848-45030015)
chr2 (1-80)||(27753892-27753972)
chr2 (229-395)||(43137301-43137467)
chr2 (1-82)||(32451653-32451735)
chr2 (338-386)||(24643054-24643101)
chr2 (349-396)||(22738249-22738296)
chr2 (349-396)||(38967375-38967422)
chr2 (50-112)||(20519964-20520026)
chr2 (1-82)||(22737904-22737986)
chr2 (46-140)||(23708387-23708479)
chr2 (349-396)||(24529643-24529690)
chr2 (47-82)||(31756233-31756268)
chr2 (1-82)||(22337431-22337512)
chr2 (1-78)||(22730957-22731035)
chr2 (329-379)||(23287384-23287433)
chr2 (330-379)||(26392403-26392451)
chr2 (46-82)||(23791592-23791628)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (46-396)||(802-1151)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (46-396)||(6615-6965)
scaffold0333 (46-396)||(13995-14345)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (82-397)||(14500-14815)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (35-396)||(15665-16021)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (91-396)||(11296-11598)
scaffold0046 (161-396)||(2001-2233)
scaffold0046 (281-396)||(28418-28533)
scaffold0046 (344-396)||(4556-4608)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (18-396)||(34127-34501)
scaffold0175 (13-82)||(13407-13477)
scaffold0175 (349-388)||(285-324)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (90-389)||(5654-5952)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-397)||(2527-2924)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (46-385)||(7844-8180)
scaffold0218 (91-353)||(29093-29354)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-397)||(32101-32480)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (124-370)||(53393-53640)
scaffold0075 (1-140)||(8018-8156)
scaffold0075 (214-314)||(8230-8330)
scaffold0075 (46-82)||(53316-53352)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (46-379)||(7826-8161)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (46-243)||(28578-28775)
scaffold0211 (316-397)||(28806-28888)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (91-342)||(2030-2281)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (46-381)||(12587-12921)
scaffold0413 (1-82)||(15339-15420)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (35-342)||(2203-2505)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (46-381)||(136135-136471)
scaffold0021 (46-381)||(144843-145179)
scaffold0021 (330-396)||(121770-121835)
scaffold0021 (328-381)||(174785-174838)
scaffold0021 (3-82)||(124900-124980)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (46-243)||(2070-2267)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (109-381)||(97024-97297)
scaffold0006 (109-381)||(106302-106575)
scaffold0006 (46-82)||(97322-97358)
scaffold0006 (46-82)||(106600-106636)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (118-381)||(128809-129072)
scaffold0022 (108-377)||(78345-78614)
scaffold0022 (274-396)||(116431-116551)
scaffold0022 (46-82)||(128738-128774)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (46-208)||(15599-15761)
scaffold0020 (262-396)||(15760-15894)
scaffold0020 (349-397)||(178897-178945)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (46-381)||(19652-19987)
scaffold0080 (274-396)||(39917-40038)
scaffold0080 (214-324)||(48921-49030)
scaffold0080 (13-82)||(40228-40297)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (219-396)||(38641-38819)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (46-385)||(103406-103737)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (108-381)||(6111-6386)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (219-396)||(1013-1186)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (294-397)||(23898-24001)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (219-396)||(3090-3267)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (114-377)||(38339-38604)
scaffold0139 (46-82)||(38635-38671)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (46-134)||(3196-3284)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (214-372)||(11492-11651)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (214-372)||(38190-38349)
scaffold0124 (214-324)||(21828-21937)
scaffold0124 (214-324)||(24587-24699)
scaffold0124 (18-82)||(24391-24455)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (46-381)||(1565-1900)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (214-382)||(17961-18130)
scaffold0247 (214-386)||(2108-2280)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (214-385)||(27683-27855)
scaffold0165 (46-82)||(27487-27523)
scaffold0165 (32-82)||(3796-3846)
scaffold0165 (32-82)||(7860-7910)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (274-381)||(1051-1158)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (108-319)||(87-298)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (231-385)||(25121-25276)
scaffold0123 (212-319)||(619-725)
scaffold0123 (108-153)||(25353-25398)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (214-385)||(16034-16206)
scaffold0357 (214-381)||(13147-13316)
scaffold0357 (46-151)||(15867-15971)
scaffold0357 (47-149)||(13381-13482)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (274-388)||(39489-39602)
scaffold0141 (214-324)||(13854-13963)
scaffold0141 (13-82)||(39792-39861)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (274-388)||(75210-75323)
scaffold0049 (13-82)||(74951-75020)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (274-396)||(39862-39983)
scaffold0026 (274-388)||(25908-26021)
scaffold0026 (1-81)||(40173-40253)
scaffold0026 (46-82)||(59271-59307)
[»] scaffold1403 (2 HSPs)
scaffold1403 (108-381)||(569-841)
scaffold1403 (48-82)||(866-900)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (274-396)||(1855-1977)
scaffold0016 (1-151)||(207243-207392)
scaffold0016 (1-78)||(2170-2248)
scaffold0016 (226-300)||(207467-207541)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (46-345)||(9133-9428)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (1-82)||(17096-17177)
scaffold0142 (229-396)||(16785-16952)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (278-396)||(3185-3303)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (278-396)||(17214-17334)
scaffold0056 (214-381)||(79264-79430)
scaffold0056 (1-82)||(16939-17020)
scaffold0056 (55-134)||(79107-79184)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (1-134)||(1801-1932)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (219-396)||(20748-20924)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (274-396)||(13215-13337)
scaffold0193 (38-82)||(13526-13570)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (219-396)||(37822-37998)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (274-396)||(44702-44824)
scaffold0122 (278-393)||(26064-26179)
scaffold0122 (1-82)||(25789-25870)
scaffold0122 (1-81)||(33218-33299)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (219-396)||(158435-158611)
scaffold0003 (219-396)||(339889-340064)
scaffold0003 (1-82)||(339675-339756)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (274-396)||(32946-33067)
scaffold0145 (274-396)||(38765-38886)
scaffold0145 (219-396)||(9750-9927)
scaffold0145 (1-82)||(39076-39156)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (274-396)||(32952-33073)
scaffold0120 (274-396)||(45932-46053)
scaffold0120 (278-396)||(16117-16235)
scaffold0120 (338-396)||(17389-17446)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (281-396)||(4853-4968)
scaffold0403 (38-82)||(5163-5207)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (145-381)||(267679-267916)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (219-396)||(4695-4871)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (219-396)||(13393-13569)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (274-396)||(3474-3596)
scaffold0292 (1-82)||(658-739)
scaffold0292 (274-396)||(347-468)
scaffold0292 (1-82)||(3785-3867)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (219-396)||(13948-14124)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (274-396)||(51917-52039)
scaffold0011 (274-396)||(167973-168095)
scaffold0011 (1-82)||(52227-52309)
scaffold0011 (32-82)||(167735-167785)
[»] scaffold0228 (6 HSPs)
scaffold0228 (1-82)||(4823-4905)
scaffold0228 (1-82)||(12405-12487)
scaffold0228 (1-82)||(22357-22439)
scaffold0228 (274-388)||(4520-4633)
scaffold0228 (274-388)||(12102-12215)
scaffold0228 (274-388)||(22054-22167)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (228-381)||(20372-20524)
scaffold0031 (34-151)||(20182-20297)
scaffold0031 (214-324)||(35853-35962)
scaffold0031 (274-396)||(128755-128876)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (278-386)||(10784-10891)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (274-396)||(8528-8646)
scaffold0121 (1-82)||(8256-8338)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (214-342)||(225465-225593)
scaffold0012 (214-324)||(189144-189253)
scaffold0012 (61-151)||(225656-225744)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (281-396)||(1293-1406)
scaffold0106 (281-396)||(7270-7383)
scaffold0106 (335-396)||(15295-15355)
[»] scaffold1842 (2 HSPs)
scaffold1842 (274-396)||(1043-1165)
scaffold1842 (32-82)||(805-855)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (274-396)||(22887-23008)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (281-396)||(15466-15580)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (281-396)||(32071-32184)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (274-382)||(24297-24406)
scaffold0042 (1-82)||(24026-24107)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (274-396)||(6116-6241)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (18-139)||(288-409)
scaffold0347 (228-314)||(6-92)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (18-151)||(9574-9707)
scaffold0166 (228-300)||(9784-9856)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (335-396)||(4890-4950)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (278-386)||(9253-9360)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (281-381)||(51601-51699)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (281-384)||(13513-13615)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (278-396)||(16599-16717)
scaffold0217 (1-82)||(16323-16405)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-151)||(10158-10307)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (219-396)||(40401-40577)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (283-396)||(16286-16397)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-82)||(20718-20800)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (213-396)||(107-289)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (323-396)||(4716-4788)
scaffold0358 (32-80)||(253-301)
scaffold0358 (32-80)||(5029-5077)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (281-396)||(5132-5245)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (281-396)||(8483-8598)
scaffold0639 (32-84)||(8788-8840)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (262-396)||(1956-2091)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (328-396)||(10472-10540)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (213-396)||(12065-12241)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (214-324)||(627-736)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (214-324)||(11268-11377)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (229-384)||(161083-161239)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (219-324)||(32432-32536)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (278-386)||(11299-11406)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (47-258)||(165-374)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (338-386)||(4308-4355)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (281-396)||(1053-1166)
scaffold0598 (38-82)||(814-858)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-63)||(17732-17795)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (214-383)||(29946-30114)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (214-396)||(4215-4396)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (32-78)||(1233-1279)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (294-381)||(2694-2783)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (330-396)||(46999-47065)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (34-99)||(12228-12293)
scaffold0503 (338-381)||(11982-12024)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (278-386)||(12293-12400)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (19-151)||(12550-12681)
scaffold0221 (228-300)||(12758-12830)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (283-394)||(11447-11558)
scaffold0235 (229-324)||(13638-13733)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (349-397)||(23842-23890)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (349-397)||(36453-36501)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (219-318)||(27912-28012)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (281-382)||(20928-21030)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (349-386)||(1395-1432)
[»] scaffold0301 (3 HSPs)
scaffold0301 (46-82)||(11938-11974)
scaffold0301 (46-82)||(15090-15126)
scaffold0301 (46-82)||(16338-16374)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (46-82)||(24529-24565)
scaffold0098 (46-82)||(35399-35435)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (46-82)||(209240-209276)


Alignment Details
Target: scaffold0010 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 47 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 130258 - 129908
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  130258 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 130159  T
Q  147 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  130158 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataatt 130059  T
Q  247 gtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgt 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  130058 gtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgt 129959  T
Q  347 tggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  129958 gtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60818
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtat 60747  T
Q  313 atcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||  || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  60748 atcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 100
Target Start/End: Original strand, 60482 - 60536
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  60482 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaat 60536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16097727 - 16097331
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||  |||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| |||    
T  16097727 ttgaacctgaaaagattttagaatgaatttttgtgaattggacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaat 16097628  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    | ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16097627 gtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagt 16097528  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097527 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 16097428  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097427 cgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15471277 - 15470927
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  15471277 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtt 15471178  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   ||||||  | | ||||||  |||||||||||| |    
T  15471177 agatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataat 15471079  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15471078 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 15470979  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15470978 tctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16104088 - 16103783
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16104088 gttacagactgccttgtttaggttaaatgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 16103989  T
Q  191 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16103988 ttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgtt 16103889  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16103888 ga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatg 16103790  T
Q  391 atgatgt 397  Q
    |||||||    
T  16103789 atgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32308021 - 32307684
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32308021 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 32307922  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||        ||    
T  32307921 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataat--------gt 32307830  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32307829 tgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 32307732  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32307731 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210444
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 13210195  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaatt-gatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||     
T  13210196 agttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataa 13210295  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13210296 ttgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgct 13210392  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13210393 atttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 49667807 - 49668194
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      ||||||||     
T  49667807 ttgaacctggaaagattttagaatgaaatattgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagac 49667905  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49667906 tgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccag 49668005  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatg-ttgatgacttgca 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        | ||||||||| ||| | | |||||| ||||||  ||||||| ||| ||| |||||    
T  49668006 taagactgatgcatatgagttgatgttgtatataat--------gctgtatatactttaaatggattatg-ttgataaatgagatgtttgttga-ttgca 49668095  T
Q  299 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  49668096 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14234843 - 14234491
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||     
T  14234843 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgaacaagttgatgtt 14234744  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttc--cagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||| ||||    | | |  | ||||||||  ||||||||||||    
T  14234743 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatata 14234644  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14234643 attgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 14234544  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||    
T  14234543 tgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9513261 - 9512923
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |      |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  9513261 gaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgagattacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtg 9513162  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  9513161 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gt 9513070  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    | ||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9513069 tttatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga----ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 9512975  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9512974 tttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9521236 - 9520898
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |      |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  9521236 gaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgagattacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtg 9521137  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  9521136 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------gt 9521043  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
      ||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9521042 --tatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga----ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 9520950  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9520949 tttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Original strand, 1644451 - 1644787
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      |||||| | |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1644451 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacaaactgccttgtttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 1644550  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  1644551 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gt 1644642  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1644643 tgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 1644740  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1644741 tt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 169 - 397
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174377
Alignment:
Q  169 taagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattat 268  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  269 gtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcat 368  Q
    |||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12174348  T
Q  369 gagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12174349 gagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 288
Target Start/End: Original strand, 49389453 - 49389639
Alignment:
Q  102 ccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagta 201  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389453 ccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagta 49389552  T
Q  202 agactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389553 agactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12934034 - 12934268
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |      ||||||||     
T  12934034 ttgaacctggaaagattttagaatgaaattttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtacttgtgttacagac 12934132  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12934133 ttccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccag 12934232  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934233 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 37250935 - 37251270
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  |||| || ||| |||| | || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37250935 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 37251033  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||      
T  37251034 agttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaa 37251133  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||    
T  37251134 tgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgc 37251232  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37251233 tgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 381
Target Start/End: Original strand, 52523665 - 52523831
Alignment:
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52523665 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatca 52523764  T
Q  317 tga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52523765 tgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165251
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||   |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27165329 gttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Original strand, 1465178 - 1465419
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1465178 gaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtg 1465277  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || | |  |||||||||| |||     | |    | |||||| | ||||||||||| | |    
T  1465278 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaat 1465377  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1465378 tgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 12171828 - 12171992
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12171828 ttgaacctggagagactttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaa 12171926  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttaga 165  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12171927 tgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340826
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 24340756  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24340757 atcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 396
Target Start/End: Original strand, 53301492 - 53301668
Alignment:
Q  222 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatga 319  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||   | |||  ||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  53301492 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgt 53301591  T
Q  320 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  53301592 tgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23274874 - 23274705
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  23274874 atgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 23274775  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  23274774 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 22110119 - 22110454
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |  ||  ||||||  |||| || ||| | |||| || ||||||||||| | ||| ||||    
T  22110119 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgtt-aggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgatgtg 22110217  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||| |   ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  22110218 agttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaa 22110317  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||  ||||||| ||||| | | ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||    
T  22110318 tgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgc 22110416  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22110417 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642368
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 37642298  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37642299 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 17248010 - 17248091
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17248010 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17248091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14973036 - 14972858
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  14973036 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 14972937  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14972936 gctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  373 tggtctaagt 382  Q
     |||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  374 ggtctaagttgat 386  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 397
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576950
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||     
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatgt 14576950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17463355 - 17463179
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17463355 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17463257  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17463256 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34159503 - 34159327
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34159503 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34159405  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34159404 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 45606892 - 45607068
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  45606892 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 45606990  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45606991 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 55476668 - 55476492
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  55476668 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 55476570  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  55476569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 396
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  302 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 395
Target Start/End: Original strand, 16282796 - 16282971
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16282796 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcat 16282894  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 395  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  16282895 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 381
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550625
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  43550457 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    | ||||| || ||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550556 tgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43925977
Alignment:
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||| |||||||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgc 43926015  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43926014 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43927425 - 43927291
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  43927425 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 43927326  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatat 242  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  43927325 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899095
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 370
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147616
Alignment:
Q  222 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 320  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  321 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 370  Q
    | ||||||||| | ||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatga 22147616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 38961876 - 38962042
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  38961876 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 38961974  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38961975 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 2051137 - 2051260
Alignment:
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2051137 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 2051236  T
Q  317 tga--tgatttgcatactgtctat 338  Q
    |||  || ||||||||||| ||||    
T  2051237 tgaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 6469119 - 6469295
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  6469119 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 6469217  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6469218 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 7781332 - 7781508
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  7781332 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 7781430  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7781431 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 9707592 - 9707768
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  9707592 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcat 9707690  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9707691 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14666002 - 14665853
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||    
T  14666002 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacag 14665907  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14665906 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14665853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14735515 - 14735366
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||    
T  14735515 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacag 14735420  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14735419 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14735366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 16454266 - 16454442
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16454266 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16454364  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16454365 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Original strand, 25476111 - 25476190
Alignment:
Q  3 gaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25476111 gaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcga 25476190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 28848596 - 28848772
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28848596 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28848694  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28848695 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 396
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  239 atatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 336  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  337 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12567737 - 12567571
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12567737 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12567639  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||| ||| | ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12567638 gatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13544202 - 13544036
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13544202 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13544104  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||| ||| | ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544103 gatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28194759 - 28194694
Alignment:
Q  331 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28194759 ctgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 13151775 - 13151952
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13151775 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13151873  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13151874 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 13154240 - 13154417
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13154240 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13154338  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13154339 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 10247708 - 10247884
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10247708 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 10247806  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10247807 gctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14669157 - 14669008
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    ||||||  |||||    
T  14669157 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagc--actagtattacag 14669062  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  14669061 aatgccttgtttaggttaaattcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14669008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     |||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  373 tggtctaagttgatga 388  Q
     ||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  283 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  382 ttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 151
Target Start/End: Original strand, 53070455 - 53070570
Alignment:
Q  34 ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 133  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  53070455 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgca 53070552  T
Q  134 ctagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| | || |||||||    
T  53070553 cgagtcgttgagagttga 53070570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070799
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  53070633 atgatttgatgttgtt-agattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     || || || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12340149 - 12340000
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  ||||     
T  12340149 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctaact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacat 12340054  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12340053 aatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 12340000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 17446640 - 17446815
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  |||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17446640 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17446738  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  17446739 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672627
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  17672646 ctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242833
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  50243005 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50242906 tgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14572985 - 14572904
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaac-tttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14572985 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 14572904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19776107 - 19775998
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  19776107 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 19776008  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  19776007 t-atgatgatt 19775998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26687284 - 26687202
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  26687284 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 26687202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 37439403 - 37439512
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  37439403 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 37439502  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  37439503 t-atgatgatt 37439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Original strand, 23413186 - 23413271
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23413186 atgatttgatgatatttataatgttatatagatggatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcat 23413271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 40213445 - 40213526
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  40213445 ttgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 40213526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41124064 - 41123892
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41124064 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41123966  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 395  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  41123965 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 42386763 - 42386660
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42386763 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat-tttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtg 42386666  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  42386665 agttga 42386660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 324587 - 324481
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  ||||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  324587 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacacctt-gttaggttaaatgtgacctttgtcgtacaagttgatgtg 324489  T
Q  146 agttgatc 153  Q
    ||||||||    
T  324488 agttgatc 324481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606441
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  376 tctaagttg-atgatgatg 393  Q
    | |||| || |||||||||    
T  606423 tataagatgaatgatgatg 606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 4107164 - 4107273
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4107164 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4107263  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  4107264 t-atgatgatt 4107273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 4111016 - 4111125
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4111016 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4111115  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  4111116 t-atgatgatt 4111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 8489232 - 8489341
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |  |||||||||    
T  8489232 atgatttgatgatatttataatgttatatatttagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgtatttgtaattgttata 8489331  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  8489332 t-atgatgatt 8489341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 11424487 - 11424568
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11424487 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaactttttgaactctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 11424568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13442671 - 13442589
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  13442671 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 13442589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15965311 - 15965202
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15965311 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15965212  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  15965211 t-atgatgatt 15965202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15969235 - 15969126
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15969235 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15969136  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  15969135 t-atgatgatt 15969126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15973159 - 15973050
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15973159 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15973060  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  15973059 t-atgatgatt 15973050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 16749761 - 16749870
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16749761 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16749860  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  16749861 t-atgatgatt 16749870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8499697 - 8499519
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||     ||||| | ||| || ||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  8499697 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 8499598  T
Q  317 tgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || || ||| | |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8499597 tgttgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 12119768 - 12119886
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12119768 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaacaaagctgcatgagtcgg 12119865  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  12119866 tctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15412548 - 15412430
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15412548 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgg 15412451  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  15412450 tctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 52523496 - 52523582
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  52523496 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcac 52523582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 4588602 - 4588661
Alignment:
Q  92 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  4588602 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagttga 4588661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556986
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Original strand, 16750390 - 16750464
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750390 atatacattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577999
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 14576557 - 14576638
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaac-tttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14576557 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaacctttggaaatctgacctgaacacgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 14576638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17488254 - 17488172
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  17488254 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtaggattctgacctgaaatcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17488172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43841329 - 43841247
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  43841329 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggaattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcga 43841247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 12852300 - 12852413
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttg----tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgt 309  Q
    |||| |||||| | ||| |||||||||||| |||    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  12852300 atgatttgatgatttttttaatgttatataattggatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgt 12852399  T
Q  310 tatatcatgatgatt 324  Q
    ||||| |||||||||    
T  12852400 tatat-atgatgatt 12852413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 84
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083169
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaat 23083169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 606136 - 606172
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  606136 gaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcga 606172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45797337 - 45797242
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45797337 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Original strand, 16749994 - 16750068
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16749994 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44494857 - 44494810
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  44494857 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18438931 - 18438850
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18438931 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaacttttggaattctgacctgaagttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 18438850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 20698192 - 20698242
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  20698192 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 20698242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 2050968 - 2051071
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||  ||||| || |    
T  2050968 gaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacaaaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcatgagttgttgag 2051065  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  2051066 agttga 2051071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13919393 - 13919350
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13919393 ctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14501293 - 14501198
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14501293 ttataatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14501198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14973239 - 14973172
Alignment:
Q  13 agattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 80  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  14973239 agattttagaa-agaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 14973172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 16839440 - 16839476
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16839440 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 16839476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 45559 - 45910
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45559 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 45658  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45659 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 45758  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  45759 tgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctg 45858  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45859 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21565941 - 21565545
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  || | ||||   ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  21565941 ttgaacctggaaagattttagaatgaattttcgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaat 21565842  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    | ||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21565841 gacttgtttatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagt 21565742  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21565741 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcatt 21565642  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21565641 cgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 22959257 - 22959650
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  22959257 ttgaacctggagagactttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaa 22959355  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22959356 tgccttgtttaggttaaatgcgattcttgttgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccag 22959455  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  22959456 taagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcat 22959552  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22959553 tcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19669251 - 19668902
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||    
T  19669251 gaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgtttaggataaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtg 19669152  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatga--attgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19669151 agttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatata 19669052  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  19669051 attgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgt 19668955  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19668954 tgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 21329264 - 21329614
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21329264 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 21329363  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  21329364 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 21329463  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21329464 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 21329563  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21329564 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 26011803 - 26012154
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26011803 gaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtg 26011901  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||| |  ||||||||||  | |||||||||| |    
T  26011902 agttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataat 26012001  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26012002 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctg 26012101  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  26012102 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 396
Target Start/End: Original strand, 19660585 - 19660952
Alignment:
Q  25 aaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgat 123  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||    
T  19660585 aaaactttggagaatctaacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcaat 19660682  T
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19660683 ctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaat 19660782  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat 323  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   ||  |||||||||  |||||||| |||| |    
T  19660783 gttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttatattcgatatcattatatcaagatggt 19660879  T
Q  324 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  19660880 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 21501923 - 21502273
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  21501923 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttgatgtt 21502020  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaa-ctaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||    
T  21502021 agttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatata 21502120  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  21502121 attgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgc 21502220  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21502221 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 381
Target Start/End: Original strand, 20026787 - 20027043
Alignment:
Q  126 ttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgt 225  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||   |||||  || ||||    
T  20026787 ttgtcgcacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgt 20026886  T
Q  226 tgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgat 323  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |    
T  20026887 tgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgtt 20026985  T
Q  324 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20026986 ttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144068
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttat 22144137  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22144136 atcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 381
Target Start/End: Original strand, 22178064 - 22178323
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||  || |   |||||| | |||    
T  22178064 ctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggat 22178163  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 321  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  22178164 gttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg 22178263  T
Q  322 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 36154552 - 36154700
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||    
T  36154552 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 36154651  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  36154652 g-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 36154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 203
Target Start/End: Original strand, 21741312 - 21741469
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | || ||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21741312 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctaaccagttacataatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 21741411  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaag 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |  ||||||||||    
T  21741412 agttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaag 21741469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 11580969 - 11581050
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11580969 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 11581050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725871
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 40725941  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40725940 atcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  299 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||     
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 396
Target Start/End: Original strand, 8286829 - 8286960
Alignment:
Q  267 atgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 363  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8286829 atgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagc 8286927  T
Q  364 tgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8286928 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 264753 - 264929
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  264753 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 264851  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  264852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22119917 - 22120066
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||    
T  22119917 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacag 22120012  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22120013 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 22120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29330111 - 29329935
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29330111 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29330013  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29330012 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39363561 - 39363385
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39363561 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39363463  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39363462 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||     
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||     
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 396
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997651
Alignment:
Q  292 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  21997646 atgatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1096649 - 1096474
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | ||    
T  1096649 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttat 1096550  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    | || ||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1096549 gttgtttttgcatactacctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 5888944 - 5889032
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5888944 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcac 5889032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 396
Target Start/End: Original strand, 11581183 - 11581360
Alignment:
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||   ||| || |||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||    
T  11581183 attgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 11581281  T
Q  317 tgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11581282 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 396
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  239 atatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtct 336  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  337 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20909189 - 20909013
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20909189 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20909091  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20909090 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29448192 - 29448054
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || || || |||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  29448192 atatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 29448093  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttg 348  Q
    ||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||||    
T  29448092 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttg 29448054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 42245350 - 42245526
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42245350 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 42245448  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42245449 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29346157 - 29345981
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29346157 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29346059  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29346058 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 21871507 - 21871616
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21871507 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21871606  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21871607 t-atgatgatt 21871616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 21875787 - 21875896
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21875787 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21875886  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21875887 t-atgatgatt 21875896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 24767077 - 24767210
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacagaatgccttctttaggat 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  24767077 ttagaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtt 24767173  T
Q  115 aaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24767174 aaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 24767210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22144402 - 22144299
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22144402 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgag 22144305  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  22144304 agttga 22144299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902159
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||    
T  20901988 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  373 tggtctaagttg 384  Q
     |||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29348630 - 29348454
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29348630 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29348532  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29348531 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29348454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29351103 - 29350927
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29351103 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29351005  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | || |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29351004 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29350927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39245242 - 39245137
Alignment:
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 388  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39245242 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39245145  T
Q  389 tgatgatg 396  Q
     |||||||    
T  39245144 agatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154775
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||    
T  2154593 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattatta 2154691  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2154692 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10753703 - 10753594
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10753703 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10753604  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  10753603 t-atgatgatt 10753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 23390220 - 23390298
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23390220 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctc 23390298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  276 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 374  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  375 gtctaa 380  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Original strand, 36154777 - 36154941
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  36154777 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 36154876  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     |||||| || ||||| ||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  36154877 tatactg-ctgtgttgttgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32027570 - 32027394
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  32027570 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 32027472  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32027471 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 21985871 - 21985952
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21985871 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcga 21985952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 22120131 - 22120240
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||    
T  22120131 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttata 22120230  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  22120231 t-atgatgatt 22120240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1096864 - 1096783
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1096864 ttgaatctggaaagattgcagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 1096783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 386
Target Start/End: Original strand, 18319027 - 18319185
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 325  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  18319027 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 18319126  T
Q  326 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18319127 gtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  232 taatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23064559 - 23064512
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 381
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38619482 - 38619435
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13095876 - 13095810
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13095876 tttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggccctcgcctcgcga 13095810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24529618 - 24529536
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  24529618 ttgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaattctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 24529536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25421914 - 25421848
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25421914 tttagaatgaaactttcggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 25421848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25744073 - 25743924
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||| ||||| ||||||  ||||| |  ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  25744073 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgagtgacagactgcctt-gttagggtttatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 25743975  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttc 196  Q
    |||||||| | | ||| | ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25743974 agttgatcatgggggtaataaactaagttgcttatgctgttgttgttgttc 25743924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  328 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766175
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 24767287 - 24767359
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24767287 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 24767359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31061124 - 31061069
Alignment:
Q  340 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31061124 ttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36314728 - 36314670
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatt 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  36314728 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgatatt 36314670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9078349 - 9078268
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  9078349 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaaccttttgaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 9078268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13025692 - 13025626
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  13025692 tttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcaaaggccctcgcctcgcga 13025626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 22107129 - 22107179
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22107129 tgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22107179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25431776 - 25431710
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25431776 tttagaatgaaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcga 25431710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 384
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15796773 - 15796738
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15796773 gaactcgcca-ggcgagtagaggccctcgcctcgcga 15796738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 21292732 - 21292776
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21292732 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 21292776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22075378 - 22075334
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22075378 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22075334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26704122 - 26704074
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26704122 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26704074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26973855 - 26973807
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26973855 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33681406 - 33681010
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |   ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||| |    
T  33681406 ttgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagt 33681307  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33681306 gccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagt 33681207  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33681206 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcatt 33681107  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33681106 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22237982 - 22237630
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22237982 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttttcgcacgagttgatgtg 22237883  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttg-ttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  22237882 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataa 22237783  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  22237782 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgct 22237683  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22237682 gtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 397
Target Start/End: Original strand, 52927745 - 52928088
Alignment:
Q  41 gaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttg 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  52927745 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttg 52927843  T
Q  141 ctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 240  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927844 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 52927943  T
Q  241 atagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927944 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 52928031  T
Q  341 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  52928032 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 22921636 - 22921987
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22921636 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgccttgtttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 22921735  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||     
T  22921736 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 22921835  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22921836 ttgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 22921934  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22921935 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20248674 - 20248282
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||    
T  20248674 ttgaacctggagagactttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaa 20248576  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  20248575 tgccttatttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttg-tccag 20248477  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||   ||||||    
T  20248476 taagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcat 20248380  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20248379 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21754388 - 21754052
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagtt--acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctg 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||| |||  ||||| |||||| || ||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  21754388 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt--acttgttttacagactgccttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatg 21754292  T
Q  144 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  21754291 tgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat-------- 21754200  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21754199 gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgt 21754102  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21754101 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20918954 - 20918620
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaa-ttgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgt 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||  | |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | | ||| |||    
T  20918954 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgt-gttaaagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgacttgatgt 20918857  T
Q  145 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20918856 gagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataa 20918757  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  20918756 ttgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgca 20918660  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20918659 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 21861337 - 21861672
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |      |  |||||||||||| || ||| |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||    
T  21861337 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgtgtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtg 21861435  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||    |||||  |||||||||||||||||| ||||| |    
T  21861436 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataat 21861535  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21861536 tgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgct 21861635  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21861636 gtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 21896087 - 21896358
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||    
T  21896087 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgtt---gtttcagtaagcctg 21896183  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 306  Q
    |    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21896184 aatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatat 21896283  T
Q  307 tgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21896284 tgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Original strand, 35981455 - 35981696
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  35981455 gaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtg 35981554  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||| |||     |||    | |||||| | ||||||||||||| |    
T  35981555 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataat 35981654  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    || |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35981655 tgcatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20637202 - 20636956
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||    
T  20637202 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaatcagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtg 20637103  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||| ||||    |||   || |||||| | ||||||||||||| |    
T  20637102 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataat 20637003  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 293  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20637002 tgtatatacattatatgaattatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49261690 - 49261452
Alignment:
Q  49 ctcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagt 148  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49261690 ctcgccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 49261591  T
Q  149 tgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||| | ||    |||    | |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  49261590 tgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgt 49261491  T
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49261490 atatacattatataaattatg-ttgatatttgagatgttg 49261452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 393
Target Start/End: Original strand, 16368115 - 16368401
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  16368115 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 16368214  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16368215 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatatt 16368312  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatg 393  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16368313 gttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 397
Target Start/End: Original strand, 14295495 - 14295672
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  14295495 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 14295590  T
Q  319 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa---gttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||    
T  14295591 atggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12271852 - 12271639
Alignment:
Q  94 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattg 193  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12271852 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattg 12271754  T
Q  194 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 293  Q
    || |||||||||||       ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||   | ||||   | |   ||||||||||||||||    
T  12271753 tttcagtaagactg-------tgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaatattgagatgttgatgac 12271661  T
Q  294 ttgcattcgatattgttatatc 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  12271660 ttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50686905 - 50686630
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  50686905 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 50686806  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   ||||||   ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  50686805 aattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacatt 50686706  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  |  |||    |||| ||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50686705 gttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261180
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttat 35261111  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261112 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16758839 - 16758664
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||||    
T  16758839 atatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgtta 16758740  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16758739 tatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 381
Target Start/End: Original strand, 41049880 - 41050138
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| |||  |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||     
T  41049880 ctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgac 41049979  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 321  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  41049980 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaacta 41050078  T
Q  322 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     |||  |||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41050079 ttttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21161830 - 21161719
Alignment:
Q  285 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  21161830 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgt-tttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttg 21161732  T
Q  385 atgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||    
T  21161731 atgatgatgatgt 21161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 348
Target Start/End: Original strand, 22130844 - 22130976
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  22130844 tatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattat 22130940  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg 348  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22130941 atcatgatggtttggatactgcctatgttgctgttg 22130976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 50613945 - 50614219
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||   ||| ||  | ||||||| |||    
T  50613945 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50614043  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50614044 aattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 50614143  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50614144 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 50621773 - 50622047
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||   ||| ||  | ||||||| |||    
T  50621773 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50621871  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50621872 aattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 50621971  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50621972 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 433404 - 433323
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  433404 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 433323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433013
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 433094  T
Q  313 atcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     || |||||  |||| |||||| || ||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  433093 gtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 21475072 - 21475248
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21475072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21475170  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21475171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593896
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13989043 - 13988867
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13989043 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13988945  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13988944 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 21923276 - 21923452
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21923276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21923374  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21923375 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Original strand, 45574836 - 45574989
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |    
T  45574836 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 45574935  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45574936 catactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29776865 - 29776689
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29776865 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29776767  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | |  ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29776766 gttatttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31612490 - 31612314
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31612490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 31612392  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  31612391 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51130741 - 51130632
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  51130741 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 51130646  T
Q  319 atgatttgcatact 332  Q
    ||| ||||||||||    
T  51130645 atggtttgcatact 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361928
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  318 gatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || |||   ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtcg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29298304 - 29298138
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  29298304 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttg 29298206  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29298205 tatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 22354296 - 22354376
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22354296 ttgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgc 22354376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 381
Target Start/End: Original strand, 16093826 - 16093987
Alignment:
Q  222 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg-atgacttgcattcgatattgttatatcatga- 319  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  16093826 atgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgag 16093924  T
Q  320 -tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     || |||  |||||| |||||||||| || |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16093925 ctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26065108 - 26064959
Alignment:
Q  231 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 328  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||       
T  26065108 ataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 1924896 - 1925005
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1924896 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1924995  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  1924996 t-atgatgatt 1925005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 20923910 - 20924019
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  20923910 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 20924009  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  20924010 t-atgatgatt 20924019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13213023
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13212841 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 13212939  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13212940 tgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16759003 - 16758900
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16759003 gaactcgccatagcaagtagaggccctcacctcgcgagttgcctagttacagaatg-ctcgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgag 16758906  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  16758905 agttga 16758900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26065292 - 26065205
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| |   |||||||||||||||||    
T  26065292 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagggt-tttgcgatctttgtcgcac 26065205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 386
Target Start/End: Original strand, 20454610 - 20454660
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20454610 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 22123052 - 22123229
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||  | ||| || ||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22123052 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22123150  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | |  ||| | ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  22123151 gctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 41387815 - 41387924
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  41387815 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 41387914  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  41387915 t-atgatgatt 41387924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 50209937 - 50210018
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  50209937 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 50210018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21346962
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21347144 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 21347046  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21347045 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34510177 - 34510100
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  34510177 ttgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 34510100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 28194217 - 28194305
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28194217 gaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacaaaatgtcttgtttaggttacatgcgatctttgtcgcac 28194305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801481
Alignment:
Q  324 ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38801481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21342144 - 21342097
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21342144 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21707215 - 21707168
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21707215 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21711757 - 21711710
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21711757 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 38801147 - 38801197
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38801147 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 38801197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 151
Target Start/End: Original strand, 35260852 - 35260952
Alignment:
Q  50 tcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagtt 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| ||||  |||||||   ||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  35260852 tcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtttcccagttacaaaataccttgcttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagtt 35260950  T
Q  150 ga 151  Q
    ||    
T  35260951 ga 35260952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21714593 - 21714545
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  21714593 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 21714545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 15860123 - 15860170
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  15860123 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 15860170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Original strand, 41388048 - 41388122
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  41388048 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 41388122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22532666 - 22532585
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||||||  |||| |||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  22532666 ttgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaatctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcga 22532585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 39243943 - 39244008
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 314  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39243943 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39244008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 39247498 - 39247563
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 314  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39247498 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39247563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 16275407 - 16275525
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| || |||||| ||    
T  16275407 ttgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgtcgttgttg-ttatttaactaagttgtatgagtcgg 16275504  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  16275505 tctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 10309 - 10659
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  10309 gaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtg 10407  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10408 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 10507  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10508 tgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 10607  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  10608 tttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 94)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19652592 - 19652198
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||    
T  19652592 ttgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaat 19652493  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19652492 accttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagt 19652393  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19652392 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatg-ttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatt 19652295  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652294 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 29808607 - 29808999
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagatttt-agaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      |||||||||    
T  29808607 ttgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaa 29808706  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  29808707 tgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccag 29808805  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   || |||    
T  29808806 taagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacat 29808902  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  29808903 tcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 28496197 - 28496588
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      |||||||||    
T  28496197 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaa 28496295  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  28496296 tgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccag 28496394  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   || |||    
T  28496395 taagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacat 28496491  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28496492 tcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1561609 - 1561307
Alignment:
Q  92 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttat 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1561609 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 1561510  T
Q  192 tgttccagtaagactgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  1561509 tattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat 1561410  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  1561409 ---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaag 1561313  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  1561312 atgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23019759 - 23019408
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  23019759 gaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagttgtccaattacaaaatgc-ttggttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtg 23019661  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | |||| |||  |||||||||||| |    
T  23019660 agttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataat 23019561  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  23019560 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctg 23019461  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    || |||  ||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||    
T  23019460 tttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatgaaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19668725 - 19668386
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||  |||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  19668725 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 19668627  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  19668626 agttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagt 19668527  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  19668526 tgtatatacattacatgaattacgtatgat-gttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgc 19668428  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19668427 tgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20109417 - 20109140
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |  ||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  20109417 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgat 20109318  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagt--tgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 320  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  20109317 gttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgtt 20109218  T
Q  321 gatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  20109217 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 385
Target Start/End: Original strand, 9098370 - 9098620
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||       
T  9098370 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgattt--- 9098466  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 321  Q
             ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  9098467 ---------aatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattg 9098556  T
Q  322 atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
     ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 341
Target Start/End: Original strand, 22080506 - 22080800
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaa-ttgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |  | ||||||  |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  22080506 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtc-tgacagaacaccttgtttaggaataatgcgatccttgtcgcacgagttgatgt 22080604  T
Q  145 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagact-gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| ||  ||  ||||||  | ||| ||||  ||||||||||||    
T  22080605 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatata 22080704  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact-tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 341  Q
      ||||||||||||| |  |||||||   ||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22080705 aatgtatatacattatattaattatg-acgatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 27333008 - 27333214
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||    
T  27333008 ttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaat 27333107  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    || || || ||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  27333108 gctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagt 27333206  T
Q  201 aagactga 208  Q
    ||| ||||    
T  27333207 aagcctga 27333214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 27393748 - 27393954
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||    
T  27393748 ttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaat 27393847  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    || || || ||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  27393848 gctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagt 27393946  T
Q  201 aagactga 208  Q
    ||| ||||    
T  27393947 aagcctga 27393954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 4185547 - 4185939
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||| ||||    
T  4185547 ttgaacctggaaagagtttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaa 4185645  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | |||||||  ||||||||    
T  4185646 tgccttgct-aggttaaatgcgatccttgccgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccag 4185744  T
Q  200 taagactgatgcat--atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgactt 295  Q
    | || || ||   |  ||  | ||||||||   || |||||| | |  |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||    
T  4185745 tgagtctaattgtttaatccaatgatgttg---atgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaatt 4185837  T
Q  296 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  4185838 gcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgat 4185937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 396
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  299 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 396
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  299 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644335
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttat 25644409  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||| | || ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25644408 atcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35008442 - 35008167
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  35008442 ttaggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctg 35008343  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    ||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||  ||| |  || | ||||||    
T  35008342 atatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatatt 35008243  T
Q  308 gttatatcatg--atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     |||||||  |  ||| |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35008242 attatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  285 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  385 atgatga 391  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 393
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227625
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 8227544  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  8227545 atcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23077024 - 23076749
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || |||||| |||  ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  23077024 ttaggataaatgtgacctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 23076925  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    ||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||| ||| |  || | ||||||    
T  23076924 atatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatatt 23076825  T
Q  308 gttatatcatg--atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     |||||||  |  ||| |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076824 attatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 345
Target Start/End: Original strand, 4667982 - 4668277
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  4667982 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtg 4668080  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcat--atgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || || ||   |  ||  | ||||||||   || |||||| | |    
T  4668081 agttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaatccaatgatgttg---atgatgttaaaca 4668177  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 341  Q
      |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4668178 aatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgtt 4668273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782228
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22782410 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 22782312  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22782311 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 345
Target Start/End: Original strand, 4674830 - 4675124
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4674830 aactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtga 4674928  T
Q  147 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcat--atgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || || ||   |  ||  | ||||||||   || |||||| | |     
T  4674929 gttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaatccaatgatgttg---atgatgttaaacaa 4675025  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
     |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4675026 atgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 397
Target Start/End: Original strand, 31155403 - 31155515
Alignment:
Q  285 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg-ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||||||   || |||||    
T  31155403 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagtt 31155501  T
Q  384 gatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||    
T  31155502 gatgatgatgatgt 31155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557053
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20556970  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
      |||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20556971 gccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 2291165 - 2291341
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2291165 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 2291263  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2291264 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12742494 - 12742318
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12742494 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12742396  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12742395 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 18334577 - 18334753
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18334577 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18334675  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18334676 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19005223 - 19005047
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19005223 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19005125  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19005124 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 19858904 - 19859080
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19858904 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19859002  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19859003 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24422724 - 24422548
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24422724 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24422626  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24422625 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33861971 - 33861795
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33861971 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33861873  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33861872 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33864455 - 33864279
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33864455 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33864357  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33864356 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  378 taagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076704
Alignment:
Q  294 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20076707  T
Q  394 atg 396  Q
    |||    
T  20076706 atg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 30676695 - 30676861
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30676695 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcat 30676793  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676794 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1595726 - 1595550
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  1595726 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcat 1595628  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  1595627 gttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8055206 - 8055030
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8055206 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 8055108  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  8055107 gctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttg-taatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 26924625 - 26924801
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26924625 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26924723  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26924724 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  373 tggtctaagttgatga 388  Q
     | |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21939764 - 21939631
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactag--ttacagaatgccttctttaggat 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||  |||||||||| ||| |||||| |    
T  21939764 ttagaataaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga--gcactagtattacagaatgtcttgtttaggtt 21939668  T
Q  115 aaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21939667 aaatgtgatccttgtcgcacgagttgttatgagttga 21939631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456735
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25656733 - 25656630
Alignment:
Q  292 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  25656733 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 25656636  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  25656635 atgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754810
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  25754992 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25754893 tgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34963550 - 34963384
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34963550 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34963452  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34963451 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 1540896 - 1541072
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1540896 ttgatgttgtt-atattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 1540994  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
      || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  1540995 actgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22949484 - 22949375
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22949484 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22949385  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  22949384 t-atgatgatt 22949375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22953440 - 22953331
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22953440 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22953341  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  22953340 t-atgatgatt 22953331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23871928 - 23871819
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23871928 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23871829  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  23871828 t-atgatgatt 23871819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23875884 - 23875775
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23875884 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23875785  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  23875784 t-atgatgatt 23875775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 27325370 - 27325479
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  27325370 atgatttgatgatatttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 27325469  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  27325470 t-atgatgatt 27325479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4189307 - 4189203
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4189307 aactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatcgttgtcgcacgagttgttgtga 4189209  T
Q  147 gttgat 152  Q
    ||||||    
T  4189208 gttgat 4189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18204432 - 18204159
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagtta--cagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | | | ||||  |||| | |||| |||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  18204432 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcatgagct-agt-gttagacagactaccttgtttagggtctatgcgat-tttgtcgcacgagttgttg 18204336  T
Q  144 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  || |||| ||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18204335 tgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgttgttaataatgtgatata 18204236  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 319  Q
      ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18204235 aatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatga 18204159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20594170 - 20594089
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||    
T  20594170 ttgaacctggaaagattgtagaataaacttttggaaatctgacctgaactcgctacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 20594089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25644674 - 25644571
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25644674 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatg-cttgtttagg-tttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgag 25644577  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  25644576 agttga 25644571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 29060937 - 29060856
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  29060937 ttgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcga 29060856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18706493 - 18706387
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  18706493 atatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 18706395  T
Q  312 tatcatga 319  Q
    ||||||||    
T  18706394 tatcatga 18706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16760634 - 16760525
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16760634 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16760535  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  16760534 t-atgatgatt 16760525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 319
Target Start/End: Original strand, 18199231 - 18199456
Alignment:
Q  94 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattg 193  Q
    ||||| |||||| |||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  || |||| |||    
T  18199231 acagactgccttgtttagggtctatgcgat-tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttg 18199329  T
Q  194 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatga 292  Q
    || ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || |||    
T  18199330 tttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttga 18199429  T
Q  293 cttgcattcgatattgttatatcatga 319  Q
     |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18199430 ttatcatttgatattgttatatcatga 18199456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttg 342  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | | |||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttg 18461933  T
Q  343 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18461932 ctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Original strand, 3852011 - 3852178
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||  ||||| | || ||||| || ||| |    
T  3852011 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttg 3852110  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3852111 tatactat-tgtgttgctgttg-ttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 319
Target Start/End: Original strand, 18177439 - 18177712
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagtta--cagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | | | ||||  |||| | |||| |||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  18177439 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcatgagct-agt-gttagacagactaccttgtttagggtctatgcgat-tttgtcgcacgagttgttg 18177535  T
Q  144 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  || |||| ||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  18177536 tgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatata 18177635  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 319  Q
      ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  18177636 aatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatga 18177712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18457079 - 18456964
Alignment:
Q  34 ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 133  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| || |||||   ||||||||||||||||    
T  18457079 ggaagctgacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgttcaggat-tttgcgatctttgtcgca 18456982  T
Q  134 ctagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| | || |||||||    
T  18456981 cgagtcgttgagagttga 18456964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 386
Target Start/End: Original strand, 16448520 - 16448678
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 325  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  16448520 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 16448619  T
Q  326 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16448620 gtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18696676 - 18696569
Alignment:
Q  211 catatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 310  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||||||  ||| |||| || |||||||||    
T  18696676 catatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtt 18696578  T
Q  311 atatcatga 319  Q
    |||||||||    
T  18696577 atatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22831568 - 22831524
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831568 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 22780297 - 22780344
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22780297 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16624669 - 16624583
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  16624669 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatt 16624583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 18821575 - 18821625
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18821575 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 18821625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 31477577 - 31477686
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  31477577 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcataaattttgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 31477676  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  31477677 t-atgatgatt 31477686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  337 atgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 25629079 - 25629160
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||| || | ||||| | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25629079 ttgaacctggaaatattttagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcga 25629160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17106085 - 17106049
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17106085 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcga 17106049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  302 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 381
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18821904 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 20360716 - 20360766
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  20360716 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcga 20360766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 22779951 - 22780033
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||    
T  22779951 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctaaactcgccacggcaagcaaaggctctcgcctcgcga 22780033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16624436 - 16624371
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 314  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  16624436 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 16624371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 75
Target Start/End: Original strand, 18199183 - 18199212
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18199183 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgc 18199212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21939553 - 21939488
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 293  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21939553 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 21939488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Original strand, 4738631 - 4738675
Alignment:
Q  353 tttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  4738631 tttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 16920395 - 16920439
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  16920395 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcga 16920439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 25611485 - 25611529
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  25611485 tctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcga 25611529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35008502 - 35008466
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35008502 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 35008466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7208 - 6822
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  7208 ttgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaa 7110  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7109 tgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccag 7010  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  7009 taagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcat 6913  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6912 tcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8368 - 8097
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| || ||  | |||| || |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  8368 gaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagttgtccagttacataatgctttgttaggtataa-tgtgatctttgtctcacgagttgatgtg 8270  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  8269 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataat 8170  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8169 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 161082 - 160685
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||||    
T  161082 ttgaacctggagagactttagaatgaatttttgtgaa-ctgaacctgaagtcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaa 160984  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    || |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  160983 tgtcttggttaggataaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcgg 160884  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  160883 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcat 160785  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgtcc 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160784 ttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 501261 - 501095
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  501261 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 501163  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501162 gttgtttttgtatattg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85741
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || || ||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  85559 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattatta 85657  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  85658 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 162868 - 162904
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  162868 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 162904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 89)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 26355422 - 26355816
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||||   ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  26355422 ttgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaat 26355521  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26355522 gccttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagt 26355621  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||| |||||   |||||||||| ||| |||||||    
T  26355622 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatg-ttgatggctgagatgttgttga-ttgcatt 26355719  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26355720 cgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21674102 - 21673707
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21674102 ttgaacctggaaagattttagaatgaatatttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaat 21674003  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  21674002 gccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttg-ttatcttgttgttgttgtttcagt 21673904  T
Q  201 aagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    |||  || ||  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21673903 aagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattat-attgatatttgagatgttgttgatttgcat 21673805  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21673804 tcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 23760609 - 23760962
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23760609 gaacttgccaaggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtt-aggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 23760707  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttc---cagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttata 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||    
T  23760708 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtata 23760807  T
Q  242 tagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 341  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23760808 taattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgtt 23760906  T
Q  342 gctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23760907 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 38855019 - 38855368
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38855019 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgccttgcttaggttaaacacgatctttgtcgcacgagttgatgtg 38855118  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  38855119 aattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 38855218  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38855219 tgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 38855317  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38855318 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 5866035 - 5866391
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |    
T  5866035 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttc 5866132  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  5866133 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 5866232  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  5866233 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 5866329  T
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  5866330 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6520725 - 6520372
Alignment:
Q  41 gaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttg 140  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  6520725 gacctgaattcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaaactgcccaattacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatctttgttgcatgagttg 6520627  T
Q  141 ctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 240  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||    
T  6520626 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 6520527  T
Q  241 atagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 340  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6520526 ataattgtatatacattacatgaattatgtt-gatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 6520428  T
Q  341 tgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6520427 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21491355 - 21490999
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||        ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  |    
T  21491355 gaatctgacca-aacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtagttc 21491258  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21491257 gagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataa 21491158  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  21491157 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgc 21491061  T
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21491060 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17140920
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtg 17141168  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  17141167 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat 17141068  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17141067 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctg 17140971  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  17140970 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21285950 - 21285611
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21285950 gaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtg 21285852  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | || |||||  ||||| |||||| |    
T  21285851 agttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataat 21285752  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  21285751 tgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttg 21285652  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21285651 tttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21249744 - 21249388
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |    
T  21249744 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttc 21249647  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21249646 aagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 21249548  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  21249547 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgc 21249451  T
Q  335 ctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21249450 ttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21255582 - 21255226
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga--attgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgc 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  21255582 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagcatttg-ta-ttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgt 21255487  T
Q  133 actagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttat 232  Q
     | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  21255486 tcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttat 21255388  T
Q  233 aatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21255387 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatact 21255291  T
Q  333 gtctatgttgct-gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  21255290 gcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498581
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |  ||  ||||||  |||| || ||| | | || || ||||||| ||| ||||| |||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggtttattgtgacctttgtcacacgagttgatgtga 20498817  T
Q  147 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagtt 246  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20498816 gttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataatt 20498717  T
Q  247 gtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    |||||||||||||  ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||    
T  20498716 gtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctg 20498617  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    || |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20498616 tttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Original strand, 983248 - 983512
Alignment:
Q  125 tttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatc---ttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattg 221  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| |      
T  983248 tttgtcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattga 983347  T
Q  222 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 319  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||      
T  983348 atgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaac 983446  T
Q  320 tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  983447 ttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37116641 - 37116366
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  37116641 ttaggataaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 37116542  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    ||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  37116541 atttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 37116442  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37116441 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24353316 - 24353039
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatct---tgttgttattgttccagtaaga 204  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||| |||||||     
T  24353316 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagc 24353217  T
Q  205 ctgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 304  Q
    ||||   |||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||||||| ||||| | |  ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  24353216 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gat 24353118  T
Q  305 attgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||||||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24353117 attgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 17266821 - 17267096
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||| || |||    
T  17266821 ttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctg 17266920  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  17266921 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 17267020  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||   | |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17267021 gttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508188
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13508118  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13508119 atcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597720
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13597650  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13597651 atcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41598581 - 41598433
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  41598581 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaat 41598482  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| ||||||||   ||||||||||| ||||| ||| | || |||||||    
T  41598481 g-cttgtttaggat-tttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttga 41598433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 382
Target Start/End: Original strand, 17612056 - 17612213
Alignment:
Q  226 tgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||| ||    
T  17612056 tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt 17612155  T
Q  325 tgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17612156 tgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 381
Target Start/End: Original strand, 17439438 - 17439609
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17439438 atatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17439537  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  17439538 tatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22364954 - 22364744
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||   | | | | ||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  22364954 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 22364855  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| || | || ||||||    
T  22364854 aattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatatt 22364756  T
Q  308 gttatatcatga 319  Q
    ||||||||||||    
T  22364755 gttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 28648983 - 28649161
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||||||  ||||||||  || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28648983 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28649082  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28649083 gctgttttcgtatactgcctatgttgcttttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22875462 - 22875381
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  22875462 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcga 22875381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1484579 - 1484403
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1484579 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 1484481  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1484480 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 5853277 - 5853453
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  5853277 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 5853375  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5853376 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 14409429 - 14409605
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14409429 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14409527  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14409528 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20403404 - 20403228
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20403404 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20403306  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20403305 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22001930 - 22001754
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22001930 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22001832  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22001831 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6759368 - 6759262
Alignment:
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 388  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759368 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 6759270  T
Q  389 tgatgatg 396  Q
     |||||||    
T  6759269 agatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||| ||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 20046180 - 20046356
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20046180 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20046278  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20046279 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23406489 - 23406383
Alignment:
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 388  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  389 tgatgatg 396  Q
     |||||||    
T  23406390 agatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21383996 - 21383887
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21383996 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21383897  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21383896 t-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 16413301 - 16413467
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16413301 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16413399  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16413400 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598189
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4483457 - 4483282
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4483457 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4483359  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4483358 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 15203216 - 15203392
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  15203216 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 15203314  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  15203315 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20536605 - 20536523
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20536605 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 20536523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 4542358 - 4542534
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4542358 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4542456  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||  ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4542457 gctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 18862412 - 18862521
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18862412 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18862511  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  18862512 t-atgatgatt 18862521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21387416 - 21387307
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21387416 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21387317  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21387316 t-atgatgatt 21387307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21411289 - 21411180
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21411289 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21411190  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21411189 t-atgatgatt 21411180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21805781 - 21805672
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21805781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21805682  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21805681 t-atgatgatt 21805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 21827781 - 21827890
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21827781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21827880  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21827881 t-atgatgatt 21827890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23406774 - 23406696
Alignment:
Q  5 acctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23406774 acctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 23406696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801527
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||| ||||    
T  19801362 atgacttgatgttgtt-atattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     ||||| || |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19801461 gtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19896445 - 19896266
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata---t 314  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    |    
T  19896445 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgt 19896347  T
Q  315 catgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| || ||| | |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19896346 catgctgtttttgtataccgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39834184 - 39834100
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  39834184 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaataccttgtttaagttaaatgcgatctttgtc 39834100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6759654 - 6759572
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  6759654 ttgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 6759572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 18878961 - 18879043
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  18878961 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccaagacgagcagaggctctcgcctcgcga 18879043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 18818134 - 18818215
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18818134 ttgaacctggaaagattgtaaaatgaaacttttggtttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 18818215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22627132 - 22627051
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| || ||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22627132 ttgaacctcgaaagattgtagaatgaacctttggaaatctgacccgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22627051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484429
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 21918756 - 21918806
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21918756 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 21918806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14823941 - 14823775
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttg 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  14823941 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14823842  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||| | ||||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  14823841 tatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatg 14823775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 319
Target Start/End: Original strand, 40492834 - 40492891
Alignment:
Q  262 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 319  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492834 gaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 45290809 - 45290846
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290809 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15070677 - 15070571
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15070677 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgg 15070580  T
Q  376 tctaagttg 384  Q
    |||||||||    
T  15070579 tctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 19801196 - 19801232
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19801196 gaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcga 19801232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 19937049 - 19937167
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| || |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19937049 ttgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgg 19937146  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||| | |||||||    
T  19937147 tccaagttgattaagatgatg 19937167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Original strand, 25362896 - 25362943
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 79  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25362896 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 25362943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 83
Target Start/End: Original strand, 2418643 - 2418680
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaa 83  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2418643 gaactcgccatagcgagcagaggccctcgcctcgcgaa 2418680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 381
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  328 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 21414997 - 21415049
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||    
T  21414997 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagttgtccaattacagaa 21415049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 21967337 - 21967373
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21967337 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 21967373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 21980062 - 21980098
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21980062 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 21980098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 21985045 - 21985081
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21985045 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 21985081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 22419184 - 22419220
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22419184 gaactcgccatagcgagtagaggccctcacctcgcga 22419220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24353376 - 24353344
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 79  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24353376 aactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcg 24353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 37116701 - 37116665
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37116701 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 37116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 44493456 - 44493492
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44493456 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 44493492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 99)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 8846725 - 8846359
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8846725 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 8846626  T
Q  147 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagtt 246  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8846625 gttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataatt 8846526  T
Q  247 gtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt----------------gttatatcatgatgatttgcata 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||| |||||||||||||||||    
T  8846525 gtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcata 8846426  T
Q  331 ctgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8846425 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12774351 - 12774010
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12774351 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 12774252  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  12774251 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gt 12774160  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12774159 tgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 12774062  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774061 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 39706056 - 39706405
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39706056 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 39706155  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  39706156 agttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataat 39706255  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39706256 tgtatatacattacatgaattatg-ttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 39706354  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39706355 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 385
Target Start/End: Original strand, 43198384 - 43198661
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  43198384 ttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagacta 43198480  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43198481 atgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatat 43198580  T
Q  307 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
     ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198581 ggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 124 - 381
Target Start/End: Original strand, 13695 - 13953
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13695 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgat 13794  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 322  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13795 gttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgt 13894  T
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13895 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15552194 - 15551821
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga--attgactagttacagaatgccttctttaggat 114  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  ||||    |||||| |||| ||| ||||||      
T  15552194 ttagaatcaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgagcattggt--gttacaaaatgtctt-tttaggta 15552099  T
Q  115 aaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcata 214  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  15552098 aaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgctta 15552000  T
Q  215 tgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 314  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || | ||||||||| ||||||    
T  15551999 tgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttaccttcgatattattatat 15551903  T
Q  315 catgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15551902 catgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16596953 - 16596686
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16596953 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 16596855  T
Q  191 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||   ||||||    
T  16596854 atgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgat 16596758  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaag 362  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16596757 gatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Original strand, 12288055 - 12288316
Alignment:
Q  125 tttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 224  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| || |||    
T  12288055 tttgtcgcataagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatg 12288154  T
Q  225 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tga 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||     
T  12288155 ttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgg 12288253  T
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12288254 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15190667 - 15190428
Alignment:
Q  48 actcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgag 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15190667 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 15190568  T
Q  148 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttg 247  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||| |||     |||    | |||||| | ||||||||||||| |||    
T  15190567 ttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattg 15190468  T
Q  248 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15190467 tatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15099702 - 15099461
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15099702 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtg 15099603  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||||||| |||     |||    | |||||| | ||||||||||||| |    
T  15099602 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataat 15099503  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15099502 tgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 46640285 - 46640558
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||  |||    
T  46640285 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctg 46640383  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||  ||| || |||| ||||||    
T  46640384 aattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgagatgttattgattttcatttgatatt 46640482  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46640483 gttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243302
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  | ||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T
Q  313 atcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52243228 atcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 53081979 - 53082254
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggtta-gaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagact 206  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| ||    
T  53081979 ttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 53082078  T
Q  207 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 306  Q
    ||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || |||||    
T  53082079 gaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatat 53082177  T
Q  307 tgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53082178 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 44928647 - 44928795
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   | |||||||||||    
T  44928647 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 44928746  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  44928747 g-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 44928795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44102607 - 44102526
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44102607 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 44102526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 388
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  378 taagttgatga 388  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44615465 - 44615289
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44615465 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44615367  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44615366 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctattg-ttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215435
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 396
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929041
Alignment:
Q  222 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 320  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  321 gattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 15118337 - 15118513
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15118337 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15118435  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15118436 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24029138 - 24028989
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||    
T  24029138 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacag 24029043  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24029042 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 24028989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 44773072 - 44773248
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44773072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44773170  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44773171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 52312687 - 52312511
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  52312687 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 52312589  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  52312588 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||     
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 396
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  275 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12468
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12401 tatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837670
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  1837494 ttgatgttgtt-ataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttg-ttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 19242872 - 19242700
Alignment:
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 322  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  19242872 gttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 19242773  T
Q  323 ttt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| | ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19242772 ttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3332282 - 3332151
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactag--ttacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||  ||||||    
T  3332282 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga--gcactagtattacag 3332187  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3332186 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgca 3332151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618323
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 19618313  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  19618314 ctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Original strand, 50222333 - 50222500
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  50222333 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 50222432  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  50222433 tataatgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 13812533 - 13812682
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactag--ttacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||  ||||||    
T  13812533 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgacta-aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga--gcactagtattacag 13812628  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  13812629 aatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 13812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 18239404 - 18239580
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18239404 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18239502  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18239503 gctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttg-ttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     || |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 630710 - 630819
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  630710 atgatttgatgttatttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 630809  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  630810 t-atgatgatt 630819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgat 395  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14039046 - 14038964
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  14039046 ttgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaaatctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 14038964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 393
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatg 393  Q
     | ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3515184 - 3515008
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  3515184 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 3515086  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3515085 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttt-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3332070 - 3331961
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  3332070 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttata 3331971  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  3331970 t-atgatgatt 3331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 14953897 - 14954006
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  14953897 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 14953996  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  14953997 t-atgatgatt 14954006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15091294 - 15091212
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  15091294 ttgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 15091212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 15355309 - 15355476
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  15355309 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15355407  T
Q  317 tgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    || || ||| | |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15355408 tgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25690246 - 25690137
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  25690246 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 25690147  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  25690146 t-atgatgatt 25690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 15464698 - 15464802
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  15464698 gaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggat-tttgcaatctttgtcgcacaagttgttatg 15464796  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  15464797 agttga 15464802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17046552 - 17046491
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  17046552 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 20157058 - 20157163
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctg 143  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  20157058 gaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagagtgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgtta 20157155  T
Q  144 tgagttga 151  Q
    ||||||||    
T  20157156 tgagttga 20157163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 22633981 - 22634086
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  22633981 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgatttgttatg 22634080  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  22634081 agttga 22634086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51464029
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  51463946 tgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Original strand, 13812759 - 13812854
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13812759 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13812854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 21815388 - 21815467
Alignment:
Q  34 ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggat 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21815388 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat 21815467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Original strand, 52242962 - 52243048
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  52242962 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcac 52243048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10713192 - 10713083
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10713192 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10713093  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  10713092 t-atgatgatt 10713083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10926962 - 10926853
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10926962 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10926863  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  10926862 t-atgatgatt 10926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15225417 - 15225308
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15225417 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15225318  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  15225317 t-atgatgatt 15225308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Original strand, 23803369 - 23803426
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23803369 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12488045 - 12487941
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  12488045 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 12487947  T
Q  319 atgatt 324  Q
    ||||||    
T  12487946 atgatt 12487941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 396
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  283 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  383 tgatgatgatgatg 396  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44102382 - 44102215
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  44102382 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44102283  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     |||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44102282 tatacta-ctgtgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 21815071 - 21815138
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21815071 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat 21815138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 21818493 - 21818560
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21818493 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat 21818560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7089242 - 7089192
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7089242 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 7089192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 15868645 - 15868754
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  ||| || |||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15868645 atgaattgatgatatttataatgttatataattggatatttattgcatgaattatggtcgctgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15868744  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  15868745 t-atgatgatt 15868754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 17047828 - 17047878
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17047828 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17047878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 318
Target Start/End: Original strand, 15464865 - 15464970
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  15464865 atgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 15464964  T
Q  313 atcatg 318  Q
    ||||||    
T  15464965 atcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 16377246 - 16377323
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    |||||||||||  |||  |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  16377246 ttgaacctggaatgatcgtagaatgaacttttgggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctc 16377323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 13618 - 13654
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13618 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcga 13654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32851545 - 32851450
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32851545 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164732
Alignment:
Q  142 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatga 217  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  |||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatga 14164732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15225188 - 15225114
Alignment:
Q  249 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15225188 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15225114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367708
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| | |||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  15367876 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15367778  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15367777 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402721
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| | |||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  15402889 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 15402791  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15402790 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333305
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgttta-ttaactaagctgcatgagt 17333305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3097008 - 3096958
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  3097008 tgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcga 3096958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6190527 - 6190481
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6190527 ctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7799094 - 7799012
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||| | | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  7799094 ttgaacctggaaagtttgtagaatgaaacttgtagtattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 7799012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12903122 - 12903072
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12903122 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcga 12903072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15370140 - 15370036
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  15370140 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcag 15370043  T
Q  376 tctaagt 382  Q
    |||||||    
T  15370042 tctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16223654 - 16223550
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  16223654 ttgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcag 16223557  T
Q  376 tctaagt 382  Q
    |||||||    
T  16223556 tctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44053226 - 44053144
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||| | ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  44053226 ttgaacctgtaaagattataggatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagagactctcgcctcgcga 44053144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15371311 - 15371220
Alignment:
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15371311 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15373592 - 15373501
Alignment:
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15373592 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15791960 - 15791916
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacatta 258  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15791960 atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcatta 15791916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 20157240 - 20157312
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| | | || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  20157240 tttataatgttatataattagatatatactgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 20157312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 22634163 - 22634235
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||  |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  22634163 tttataatgttatataattagatatatattgcataaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 22634235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6888 - 6539
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6888 gaactcgccatggcgagtggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 6789  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||     
T  6788 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 6690  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6689 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 6591  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6590 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8481
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |      |  |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  8822 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 8724  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata-- 243  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  8723 aattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataat 8624  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
     |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttg 8524  T
Q  343 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8523 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 16219485 - 16219835
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  16219485 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtt 16219583  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  16219584 agttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataat 16219683  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16219684 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 16219783  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16219784 tttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18005999 - 18005649
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18005999 gaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataa-tgcgatctttgtcgcacaagttgatatg 18005901  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||     
T  18005900 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 18005801  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  18005800 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgct 18005702  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005701 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 68098 - 67749
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  68098 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtg 67999  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||||||||||     
T  67998 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 67899  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67898 ttgtatatacattatatgaattatg-ttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 67801  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  67800 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47832161 - 47831811
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  47832161 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcggacgagttgatgtg 47832062  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | |||||||   |||||||||||| |    
T  47832061 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataat 47831962  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47831961 tgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttg 47831862  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  47831861 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 810853 - 811249
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctg-accagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      |||||| ||    
T  810853 ttgaacctggaaagaatttagaatgaatttttgtgaa-ctgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtacttatgttacaaaa 810951  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||    
T  810952 tgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcag 811051  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    |||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  811052 taagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcat 811151  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  811152 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Original strand, 15754702 - 15755004
Alignment:
Q  92 ttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttat 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15754702 ttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaa 15754801  T
Q  192 tgttccagtaagactgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15754802 tattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat 15754901  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  15754902 ---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaag 15754998  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  15754999 atgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 28505059 - 28505415
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |    
T  28505059 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttc 28505156  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28505157 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 28505256  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| || ||||   ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  28505257 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 28505353  T
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  28505354 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 44014571 - 44014181
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||  | |   ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||  ||||||||||    
T  44014571 ttgaacctggaaagattttagaatgaatttttgttagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaat 44014472  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  44014471 gccttgtttaggttaaatgcgatcattgtcgcacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagt 44014375  T
Q  201 aagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||| |||| |  ||||||  | ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  44014374 aagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgat---ttgcat 44014279  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44014278 tcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16056680 - 16056343
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  16056680 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtg 16056582  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  16056581 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataat 16056482  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  16056481 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctg 16056383  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16056382 tttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34201164 - 34200790
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataa 116  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||        |||||| |||||||| |||||| |||    
T  34201164 ttagaatgaaaatttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctt-tttaggttaa 34201067  T
Q  117 atgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatg 216  Q
    ||||||||  ||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  34201066 atgcgatccctgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatg 34200967  T
Q  217 aattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  34200966 aattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatca 34200870  T
Q  317 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34200869 tgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Original strand, 11995770 - 11996144
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataa 116  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||| |||    
T  11995770 ttagaatgaaaatttggagaatctgact-gaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaa 11995867  T
Q  117 atgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatg 216  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  11995868 atgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatg 11995967  T
Q  217 aattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||    
T  11995968 aattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgat---ttacattcaatattattatatca 11996064  T
Q  317 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  11996065 tgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22073268 - 22072917
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22073268 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttgtt-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 22073170  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  22073169 agttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataat 22073070  T
Q  246 tgtatatacattacacga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    || |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||     
T  22073069 tgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgt 22072970  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||    
T  22072969 tgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113028
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |      |  |||| ||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacaggatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 15113198  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  15113197 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataat 15113098  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 315  Q
    |||||||| |||||  || |||| | |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15113097 tgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15116785 - 15116565
Alignment:
Q  94 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattg 193  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  15116785 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattg 15116687  T
Q  194 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 293  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  || |||| | |||   ||||||||||||||||    
T  15116686 tttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgac 15116587  T
Q  294 ttgcattcgatattgttatatc 315  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  15116586 ttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12901681 - 12901338
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| | | ||||| ||  ||||  ||||| |||||| ||  ||||||| || ||||| ||||    
T  12901681 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacacctt-gttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatgtg 12901583  T
Q  146 agttgatcttagaggt---ta-gaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttata 241  Q
    |||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||   |||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  12901582 agttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttata 12901483  T
Q  242 tagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatg 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||    
T  12901482 tagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatg 12901384  T
Q  340 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12901383 ttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 20220018 - 20220290
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  20220018 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctg 20220117  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    ||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  20220118 atttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatatt 20220214  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20220215 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16324358 - 16324197
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||  ||||| ||||    
T  16324358 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgccttgcgaactgcccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcatgagttgatgtg 16324260  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  16324259 agttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16495579 - 16495406
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  16495579 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 16495484  T
Q  319 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  16495483 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 9389464 - 9389592
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  9389464 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtg 9389563  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagtt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9389564 agttgatcttggaggttagaaactaagtt 9389592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 397
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280238
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||   ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 2280152  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  2280153 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868101
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttata 1868027  T
Q  314 tcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1868028 tcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 12255729 - 12255886
Alignment:
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||    
T  12255729 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatca 12255828  T
Q  317 tga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12255829 tgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12255886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 17061684 - 17061832
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||    
T  17061684 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 17061783  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  17061784 g-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 17061832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486847
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 19486777  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19486778 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||| ||  || |||   ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647344
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    | ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13647413 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18430889 - 18430713
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18430889 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18430791  T
Q  318 gatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18430790 gatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 27217037 - 27216861
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  27217037 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27216939  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27216938 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatcg-ttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 371  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  372 ttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 456498 - 456322
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  456498 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 456400  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  456399 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 11393272 - 11393448
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11393272 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11393370  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11393371 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11972673 - 11972497
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11972673 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11972575  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11972574 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 14949107 - 14949283
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14949107 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14949205  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14949206 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 15376698 - 15376874
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15376698 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15376796  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15376797 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16232697 - 16232521
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16232697 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16232599  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16232598 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17062076
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||| |  |||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17061994 gtcatgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 20385108 - 20385284
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20385108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20385206  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20385207 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 21189580 - 21189756
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21189580 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21189678  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21189679 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24702415 - 24702239
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24702415 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24702317  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24702316 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32125668 - 32125492
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32125668 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32125570  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32125569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41523094 - 41522918
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41523094 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41522996  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41522995 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41525556 - 41525380
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41525556 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41525458  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41525457 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 377
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008597
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttata 15008531  T
Q  314 tcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||  || |||  |||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15008532 tcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640273
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18640340 tatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 24704862 - 24704689
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  24704862 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 24704764  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | |  |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24704763 gtt--tttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 10063757 - 10063921
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |     ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||    
T  10063757 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgttt-----gaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattat 10063851  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10063852 atcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44116886 - 44116821
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44116886 tttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 44116821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116510
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16410060
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16410080  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  16410079 ctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 39267370 - 39267519
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    ||||||  |||||    
T  39267370 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagc--actagtattacag 39267465  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  39267466 aatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 39267519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 2279887 - 2279990
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  2279887 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcacacgagttgttgag 2279984  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  2279985 agttga 2279990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 397
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144154
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||||||||||  | || | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  373 tggtctaagttg 384  Q
     |||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9509586 - 9509504
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  9509586 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcga 9509504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3386501 - 3386334
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| |    
T  3386501 ttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttg 3386402  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3386401 tatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 15143761 - 15143842
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15143761 ttgaacctggaaagattttagaatgaacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 15143842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  285 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 383  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  384 gatgatgatgatg 396  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 9751274 - 9751423
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||        |||||||||    
T  9751274 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatttgact-gaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagcgcttgtgttacagaa 9751371  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9751372 tgccttgtttagtttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 9751423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 12756441 - 12756588
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||  ||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||| ||     
T  12756441 ttgaacctggatt-atttaagaatgaactttttggaagctgacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca-aaa 12756538  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  12756539 gccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 12756588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18426179 - 18426070
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18426179 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18426080  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  18426079 t-atgatgatt 18426070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 39267582 - 39267691
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  39267582 atgatttgatgatatttataattttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 39267681  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  39267682 t-atgatgatt 39267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 45169773 - 45169882
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  45169773 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 45169872  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  45169873 t-atgatgatt 45169882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 12255560 - 12255663
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  12255560 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcacacgagttgttgag 12255657  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  12255658 agttga 12255663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Original strand, 2529866 - 2529926
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  2529866 gttacagaatgccttaattaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 2529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13869465 - 13869347
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13869465 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgg 13869368  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  13869367 tctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  279 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20110604 - 20110557
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20110604 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 396
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38227877 - 38227796
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttg-ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  38227877 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaactttttggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 38227796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589055
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 9177433 - 9177469
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9177433 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcga 9177469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 9751500 - 9751572
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9751500 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18425743 - 18425668
Alignment:
Q  248 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425743 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18425945 - 18425870
Alignment:
Q  248 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425945 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26212355 - 26212311
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26212355 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 26212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 386
Target Start/End: Original strand, 38898370 - 38898528
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  38898370 ttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 38898469  T
Q  327 c-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
      |||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38898470 atatactg-ctgtgtcgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13831421 - 13831374
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  13831421 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 13831374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18302575 - 18302495
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttggg-aatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18302575 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggataatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 18302495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 40443754 - 40443704
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  40443754 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 40443704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 3564088 - 3564169
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| | | || ||||||||||||    
T  3564088 ttgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacagcgagcaaatgctctcgcctcgcga 3564169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 9389649 - 9389705
Alignment:
Q  231 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9389649 ataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatg-ttgatatatgagatgttg 9389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 15008266 - 15008370
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||  ||||| |||| |||||| |   ||||||||||||||||| || || | ||    
T  15008266 gaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttgtagaataccttgtttagggt-tttgcgatctttgtcgcacgagatgttatg 15008364  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  15008365 agttga 15008370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 79
Target Start/End: Original strand, 21064932 - 21064964
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21064932 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21064964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 527 - 132
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||  |||| || |   ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   | |||||||||||    
T  527 ttgaacttggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 428  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    | |||  ||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||    
T  427 gtcttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagt 329  T
Q  201 aagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  328 gagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcatt 229  T
Q  301 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  228 cgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 64 - 397
Target Start/End: Original strand, 22459 - 22788
Alignment:
Q  64 agaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggtta 163  Q
    |||||| ||||||| ||||||   | |||||||||| | |||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22459 agaggctctcgccttgcgaatgacccagttacagaaagtcttgcttatgctaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta 22558  T
Q  164 gaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacga 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22559 gaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatga 22654  T
Q  264 attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22655 attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagc 22754  T
Q  364 tgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  22755 tgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 80056 - 80205
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    | ||||  |||||    
T  80056 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--aatagtattacag 80151  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  80152 aatgccttgtttaggttaaatgcgatcttcgtcgcacgagttgttatgagttga 80205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82073
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  82255 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  82156 tgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 2412 - 2763
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2412 gaactcgccatggcgagtagaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 2511  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||     
T  2512 agttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 2611  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  2612 ttgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgat 2710  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2711 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 90 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1096
Alignment:
Q  90 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 189  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1391 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgtt 1293  T
Q  190 attgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 289  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1292 gttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttga 1193  T
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1192 tgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19618 - 19267
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   | |||||||||||| |||  ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19618 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtg 19519  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||  | |||||  | ||||||||  ||||| ||||||     
T  19518 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 19419  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19418 ttgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 19320  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19319 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Original strand, 39941 - 40292
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  39941 gaacttgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtg 40040  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| ||||||     
T  40041 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataa 40140  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40141 ttgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgct 40239  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40240 gtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 100683 - 100377
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    |||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  100683 gttacaaaatgccttgtctaagttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttg 100584  T
Q  191 ttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 289  Q
    ||||| ||||||| || | |  ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||     
T  100583 ttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtta-atatttgagatgttgt 100485  T
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgat 389  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  100484 tgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 100385  T
Q  390 gatgatgt 397  Q
    ||||||||    
T  100384 gatgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 101791 - 101578
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| || |      |||| ||| |    
T  101791 ttgaacctggagagactttagaatgaat-tttgtgaacttgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagtacttgtgttatagact 101693  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagt 200  Q
    | ||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | |    
T  101692 gtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgttcaatt 101594  T
Q  201 aagactgatgcatatg 216  Q
    |||||| |||| ||||    
T  101593 aagactaatgcctatg 101578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 94588 - 94412
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  94588 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 94490  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  94489 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 323 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101502
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44455
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttgg 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcgg 44476  T
Q  376 tctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  44475 tctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 17425 - 17591
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17425 ttgatgttgtt-atactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17523  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17524 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 5890 - 6240
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  5890 gaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtt 5989  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  5990 agttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 6089  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6090 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactg 6189  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6190 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 32888 - 32538
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32888 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 32790  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||    
T  32789 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagt 32690  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  32689 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctg 32591  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  32590 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 91 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13075 - 12770
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  13075 gttacaaaatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttg 12976  T
Q  191 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  12975 ttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgat 12876  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12875 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatt 12776  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  12775 atgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10880 - 10542
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10880 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtg 10782  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||| ||||| |    
T  10781 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataat 10682  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10681 tgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttg 10582  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10581 tttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13292 - 12942
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  13292 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtg 13194  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||     || |  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  13193 agttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataat 13094  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13093 tgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttg 12994  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12993 tttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Original strand, 18066 - 18277
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| |||    
T  18066 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctg 18165  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||  |||||||||||  |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18166 aattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T
Q  308 gttatatcatga 319  Q
    || |||||||||    
T  18266 gtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 133050 - 132661
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||| ||  ||||     
T  133050 ttgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt--acttgtcttacat 132954  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttcc 197  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  132953 aatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttcc 132854  T
Q  198 agtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||| || |    
T  132853 agtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttac 132762  T
Q  298 attcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  132761 attcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 62503 - 62202
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  62503 gttactgaatgccttgtttatgttaa-tgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttg 62405  T
Q  191 ttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 289  Q
    ||||| ||||||| |||| |   |||||| | ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||     
T  62404 ttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgt 62306  T
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgat 389  Q
    ||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||    
T  62305 tg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagat 62209  T
Q  390 gatgatg 396  Q
    |||||||    
T  62208 gatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 136857 - 136681
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  136857 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 136759  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  136758 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 139326 - 139150
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  139326 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 139228  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  139227 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 144264 - 144088
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  144264 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 144166  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  144165 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 134388 - 134212
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  134388 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 134290  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  134289 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 141795 - 141619
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  141795 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 141697  T
Q  318 gatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  141696 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 74)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 22133984 - 22134323
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22133984 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 22134083  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||    
T  22134084 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataat--------gt 22134175  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134176 tgtatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 22134273  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  22134274 tt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25176199 - 25175853
Alignment:
Q  41 gaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttg 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||          ||||||||||||| | |||    
T  25176199 gacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgccttgtttag----------atctttgtcgcacgaattg 25176110  T
Q  141 ctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgtta 239  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  25176109 atgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 25176010  T
Q  240 tatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatg 339  Q
    |||| || ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25176009 tataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 25175911  T
Q  340 ttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  25175910 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28406376 - 28405981
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |      |||||| ||    
T  28406376 ttgaacctgtaaagattttagaataaaattttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtacttgtgttacataa 28406278  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
T  28406277 tgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttag 28406178  T
Q  200 taagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgca 298  Q
    |||| || ||  | |||||  |  |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  28406177 taagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgca 28406079  T
Q  299 ttcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28406078 ttcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 370
Target Start/End: Original strand, 7500 - 7824
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  | |  ||  ||||||| | ||  ||||| | |||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  7500 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaatac-ttggttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 7598  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||| ||||| |    
T  7599 agttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataat 7698  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  7699 tgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgct 7798  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatga 370  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||    
T  7799 gtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23207631 - 23207296
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||  |||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  23207631 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 23207533  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||      
T  23207532 agttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaa 23207433  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | | ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||    
T  23207432 tgtatatgcattacatgaattatttataat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgc 23207334  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23207333 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Original strand, 23071721 - 23072066
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        |||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| |||  |    
T  23071721 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacaaaatgcctt-tttaggttgaatgagatctttttcgttc 23071818  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||| ||||||||||||||||||         ||| ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  23071819 gagttgatgtgagttgatcttagag---------taattt--ttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataa 23071907  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||   |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  23071908 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 23072004  T
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  23072005 ctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 385
Target Start/End: Original strand, 18786748 - 18787009
Alignment:
Q  125 tttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| || |   |||||| |  |||    
T  18786748 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatg 18786847  T
Q  225 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tga 322  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  ||     
T  18786848 ttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactgg 18786946  T
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  234 atgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  334 tctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 94 - 315
Target Start/End: Original strand, 22459377 - 22459598
Alignment:
Q  94 acagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattg 193  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| || |||||||  || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22459377 acagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattg 22459475  T
Q  194 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatga 292  Q
    || |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  || |||| | || |||||||||||||||||||    
T  22459476 tttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatga 22459575  T
Q  293 cttgcattcgatattgttatatc 315  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||    
T  22459576 ctttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23791567 - 23791292
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  23791567 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 23791468  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | | || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23791467 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 23791368  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     |||||||||||  || |||   ||||| |||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23791367 tttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 397
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708738
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg-atgatgatgatgt 397  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19672011 - 19671848
Alignment:
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  19672011 attgatgttgtt-ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19671912 gatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22105590 - 22105413
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22105590 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22105492  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22105491 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25109181 - 25108906
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||| | | | | ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  25109181 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 25109082  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| ||| ||   || ||||||    
T  25109081 aattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatatt 25108982  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  |  |||   ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25108981 gttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520295
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttata 20520225  T
Q  314 tcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||  || |||   |||||  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20520226 tcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 18809120 - 18808944
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18809120 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18809022  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18809021 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23131039 - 23130863
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23131039 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23130941  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23130940 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23133506 - 23133330
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23133506 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23133408  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23133407 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 23709517 - 23709693
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23709517 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23709615  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23709616 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 23711998 - 23712174
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23711998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23712096  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23712097 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 34402507 - 34402683
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34402507 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34402605  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  34402606 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39682490 - 39682314
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39682490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39682392  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39682391 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24367951 - 24367785
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24367951 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24367853  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24367852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 571574 - 571398
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  571574 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 571476  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  571475 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6726172 - 6725996
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  6726172 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 6726074  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6726073 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23135767 - 23135591
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23135767 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23135669  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23135668 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26505556 - 26505380
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26505556 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26505458  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | |  ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26505457 gctatttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 26508034 - 26507858
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26508034 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26507936  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | |  ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  26507935 gctatttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28577276 - 28577100
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  28577276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcat 28577178  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28577177 gctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 396
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  302 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23660419 - 23660341
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcg 79  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23660419 ttgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcg 23660341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 21155045 - 21155211
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  21155045 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 21155143  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21155144 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413240
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcg--atattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgtta 22413168  T
Q  312 tatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||  || |||  |||||| |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22413169 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039659
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  32039576 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgttg-ttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 24898180 - 24898357
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24898180 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24898278  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24898279 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 24900663 - 24900840
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24900663 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24900761  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24900762 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 24903140 - 24903317
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24903140 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24903238  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24903239 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 24905617 - 24905794
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24905617 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24905715  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24905716 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 24908092 - 24908269
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24908092 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24908190  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa-gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24908191 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||     
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 386
Target Start/End: Original strand, 32214906 - 32215072
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32214906 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32215004  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | || ||| | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215005 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 396
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  336 tatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 319
Target Start/End: Original strand, 24697538 - 24697645
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||| | | |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24697538 atatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtta 24697637  T
Q  312 tatcatga 319  Q
    ||||||||    
T  24697638 tatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 298539 - 298620
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  298539 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 298620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1283766 - 1283657
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1283766 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1283667  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  1283666 t-atgatgatt 1283657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  378 taagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 30344758 - 30344867
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  30344758 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 30344857  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  30344858 t-atgatgatt 30344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattg-ttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23076822 - 23076757
Alignment:
Q  17 tttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076822 tttagaatgaaactttggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 23076757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Original strand, 45029848 - 45030015
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  45029848 ttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 45029947  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  45029948 tatattgt-tgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27753972 - 27753892
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 80  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  27753972 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 27753892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43137467 - 43137301
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  43137467 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43137368  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgat 395  Q
     ||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  43137367 tatatta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 32451653 - 32451735
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  32451653 ttgaacatggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 32451735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 22738249 - 22738296
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  22738249 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38967422 - 38967375
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38967422 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 112
Target Start/End: Original strand, 20519964 - 20520026
Alignment:
Q  50 tcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttagg 112  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  20519964 tcgccatagcgtgtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagg 20520026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 22737904 - 22737986
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22737904 ttgaacctagaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgaactgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22737986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Original strand, 23708387 - 23708479
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  23708387 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttg 23708479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 396
Target Start/End: Original strand, 24529643 - 24529690
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  24529643 gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756233
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 31756233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22337512 - 22337431
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  || | |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22337512 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 22337431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 22730957 - 22731035
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||| | |||| ||||||||    
T  22730957 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggggagcaaaggctctcgcctc 22731035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23791628 - 23791592
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23791628 gaactcgccatcgcgagtagaggctctcgcctcgcga 23791592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Original strand, 802 - 1151
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  802 gaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtt 901  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaat-tgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||  ||| | ||||||||  ||||||||||||     
T  902 agttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta--aatctaatgttgttgctaatgttatataa 999  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |    
T  1000 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgtt 1099  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  1100 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 6965 - 6615
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6965 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 6866  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  6865 agttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataat 6766  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6765 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttg 6666  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6665 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14345 - 13995
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14345 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 14246  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |    
T  14245 agttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataat 14146  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctg 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14145 tgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttg 14046  T
Q  346 ttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14045 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 397
Target Start/End: Original strand, 14500 - 14815
Alignment:
Q  82 aattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatc 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14500 aattgaccagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatc 14599  T
Q  182 ttgttgttattgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttg 280  Q
    ||| |||| ||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||| ||  ||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  14600 ttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttg 14698  T
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14699 agatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14798  T
Q  381 gttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||    
T  14799 gttgatgatgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16021 - 15665
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |     ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |    
T  16021 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctt-tttaggtggaatgcgatctttgtcgttc 15924  T
Q  135 tagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 234  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||    
T  15923 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataa 15824  T
Q  235 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||     
T  15823 tgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgc 15727  T
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15726 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11296
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11598 gttacagaatgccctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgtta 11499  T
Q  191 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 290  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11498 atgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 11399  T
Q  291 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatg 390  Q
       || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  11398 ---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 11302  T
Q  391 atgatg 396  Q
    ||||||    
T  11301 atgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 161 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2233 - 2001
Alignment:
Q  161 ttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattaca 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2233 ttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 2134  T
Q  261 cgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaacta 360  Q
     || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  2133 tgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaacta 2037  T
Q  361 agctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  2036 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34501 - 34127
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataa 116  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||     |||||| ||| |||| |||||| | |    
T  34501 ttagaatgaaaatttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctt-tttaggttga 34404  T
Q  117 atgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatg 216  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  34403 atgcgatctttgttgttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatg 34304  T
Q  217 aattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  34303 aattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatca 34207  T
Q  317 tgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34206 tgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13477 - 13407
Alignment:
Q  13 agattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  13477 agattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 13407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 324 - 285
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 388  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  324 gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 90 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5952 - 5654
Alignment:
Q  90 agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 189  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5952 agttacagaatgccttatttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgtt 5854  T
Q  190 attgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 288  Q
     ||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5853 gttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttg 5755  T
Q  289 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatga 388  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5754 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Original strand, 2527 - 2924
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      |||||||||    
T  2527 ttgaacctgtaaagattttagaatgaaa-tttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaa 2624  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  2625 tgccttgtttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcag 2724  T
Q  200 taagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttata-tagt-tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttg 296  Q
    |||| |||||  | |||||  |  |||||||  ||||| |||| | || | ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||| ||| |||    
T  2725 taagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtataattgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttg 2823  T
Q  297 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2824 catttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Original strand, 7844 - 8180
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7844 gaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgtt-agggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 7942  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||   |||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  7943 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctg---ttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagt 8039  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||    
T  8040 tgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgc 8138  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8139 tgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 353
Target Start/End: Original strand, 29093 - 29354
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29093 gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtta 29191  T
Q  191 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata---atgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgtt 287  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||   |||    
T  29192 atgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattga---gtt 29288  T
Q  288 gatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttat 353  Q
    | ||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  29289 gctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 32480 - 32101
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctga-ccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |      |||||| ||    
T  32480 ttgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaa-ctgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagtacttgtgttacataa 32382  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccag 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  32381 tgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcactagttg----------atcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccag 32292  T
Q  200 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||| || |||    
T  32291 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacat 32200  T
Q  300 tcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32199 tcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 370
Target Start/End: Original strand, 53393 - 53640
Alignment:
Q  124 ctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 223  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  53393 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgat 53492  T
Q  224 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 322  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  53493 gttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgt 53592  T
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatga 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  53593 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 8018 - 8156
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  |||||    
T  8018 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctaac-agaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtgttacag 8113  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttg 140  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8114 aatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Original strand, 8230 - 8330
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  8230 atgatttgatgatatttataatgttatataattaaatatatattgtatgaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 8329  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  8330 t 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 53316 - 53352
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53316 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcga 53352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 7826 - 8161
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  || ||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  7826 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgccttgct-aggttaaatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtg 7924  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7925 agttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataat 8024  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
    | ||||||||||||  ||||||| | || || ||| |||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  8025 tttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctg 8124  T
Q  343 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    || || ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  8125 ctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Original strand, 28578 - 28775
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28578 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 28677  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28678 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 316 - 397
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28888
Alignment:
Q  316 atgatgatttgcatactgtctatgttgctgttg-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  91 gttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtta 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  191 ttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 289  Q
    ||||| ||||||| |||| |  ||||||    ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||     
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgt 2228  T
Q  290 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2229 tgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12921 - 12587
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | |  ||  ||||||  |||| || ||| |||||| || ||||||||||| ||| | ||||    
T  12921 gaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatgtg 12823  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12822 agttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataat 12723  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgct 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  12722 tgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgct 12624  T
Q  345 gttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12623 gtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 15339 - 15420
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  15339 ttgaatctggatagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcga 15420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 342
Target Start/End: Original strand, 2203 - 2505
Alignment:
Q  35 gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaat-tgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||      
T  2203 gaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgt-gttacagaatgcctt-tttaggttgaatgcgatctttgccgtt 2299  T
Q  134 ctagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttata 233  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  2300 cgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 2399  T
Q  234 atgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  2400 atgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacgg 2496  T
Q  334 tctatgttg 342  Q
    |||| ||||    
T  2497 tctaagttg 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 136135 - 136471
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||| || ||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  136135 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtg 136233  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  |||||||||||||    
T  136234 agttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatag 136333  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |    
T  136334 ttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcg 136432  T
Q  343 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  136433 ctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 144843 - 145179
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| ||||  |||| || ||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  144843 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtg 144941  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatatag 244  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  |||||||||||||    
T  144942 agttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatag 145041  T
Q  245 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||| |||||| |    
T  145042 ttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcg 145140  T
Q  343 ctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  145141 ctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174785
Alignment:
Q  328 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 124980 - 124900
Alignment:
Q  3 gaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  124980 gaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 124900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2267
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |      ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  2070 gaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtg 2169  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2170 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 97297 - 97024
Alignment:
Q  109 taggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga 208  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||| ||||||| ||||    
T  97297 taggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctga 97199  T
Q  209 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 308  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  97198 tatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattg 97099  T
Q  309 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97098 ttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 106575 - 106302
Alignment:
Q  109 taggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga 208  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||| ||||||| ||||    
T  106575 taggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctga 106477  T
Q  209 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 308  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  106476 tatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattg 106377  T
Q  309 ttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||||  || |||   ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106376 ttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 97358 - 97322
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  97358 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 97322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 106636 - 106600
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  106636 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 106600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 381
Target Start/End: Original strand, 128809 - 129072
Alignment:
Q  118 tgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatga 217  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||||  | ||||    
T  128809 tgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatga 128907  T
Q  218 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  128908 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 129007  T
Q  318 ga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||  || |||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  129008 gaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 78614 - 78345
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| | | ||| || |||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| |||    
T  78614 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 78515  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  78514 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatatt 78417  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  78416 gttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 128738 - 128774
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  128738 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 128774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Original strand, 15599 - 15761
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15599 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttatgttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 15698  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  15699 agttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 396
Target Start/End: Original strand, 15760 - 15894
Alignment:
Q  262 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaa 361  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15760 gaattatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 15859  T
Q  362 gctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15860 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 178945 - 178897
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  178945 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 178897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 19652 - 19987
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||  |||| || ||| |||||| || |||||||||||  |||| | ||    
T  19652 gaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgatatg 19750  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||  |||   |||||| |||||||| || ||||||| |||||      
T  19751 agttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaa 19850  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | ||||   |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||    
T  19851 tgtatatgcattacatgagttatttatgat-gctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgc 19949  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19950 tgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 48921 - 49030
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  48921 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 49020  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  49021 t-atgatgatt 49030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 40297 - 40228
Alignment:
Q  13 agattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40297 agattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcga 40228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38819
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||  ||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38741 gttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Original strand, 103406 - 103737
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| | | ||||||||  |||| || ||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  103406 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtg 103504  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  ||||||||| ||||    
T  103505 agttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagt 103604  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||  |||||||||    
T  103605 tgtatatacattacatgaattatgtat---------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgc 103695  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  103696 tgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6386
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| |||    
T  6111 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctg 6210  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  6211 aattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 6310  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    || |||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6311 gtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1186
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  1013 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 1108  T
Q  319 atgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1109 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 397
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24001
Alignment:
Q  294 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatg 23997  T
Q  394 atgt 397  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3267
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3090 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 3189  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3190 gttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38604 - 38339
Alignment:
Q  114 taaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcat 213  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||   ||    
T  38604 taaatgagacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattat 38505  T
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||||||    |||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  38504 atgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcata 38405  T
Q  314 tcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtc 377  Q
    ||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  38404 tcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38671 - 38635
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  38671 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcga 38635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3284 - 3196
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3284 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcac 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11492
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 11552  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  11551 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 11492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38349
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 38289  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  38290 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagt 38349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 21828 - 21937
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||    
T  21828 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgtagatgacgtgcatttgtaattgttata 21927  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  21928 t-atgatgatt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 24587 - 24699
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttg--tatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 310  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  24587 atgatttgatgatatttataatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgtt 24686  T
Q  311 atatcatgatgatt 324  Q
    |||| |||||||||    
T  24687 atat-atgatgatt 24699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 24391 - 24455
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttggg-aatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24391 ttagaatgaaactttggataatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 24455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 1565 - 1900
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  || | | ||||||||  |||| || ||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  1565 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttgtt-aggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 1663  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||| ||||||| |||||      
T  1664 agttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaa 1763  T
Q  246 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgc 343  Q
    ||||||| |||||||  |||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||  |||||||      
T  1764 tgtatatgcattacataaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaa 1862  T
Q  344 tgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1863 tgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18130
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 18060  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    ||||||||| | |||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18061 atcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2280
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  2108 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattatta 2206  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2207 tgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27855
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 27782  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27783 atcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 27487 - 27523
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27487 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcga 27523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3846 - 3796
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  3846 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcga 3796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7910 - 7860
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  7910 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcga 7860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  374 ggtctaag 381  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 87
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||| ||     
T  298 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagccta 199  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   | |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||    
T  198 aattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatatt 99  T
Q  308 gttatatcatga 319  Q
    ||||||||||||    
T  98 gttatatcatga 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25121
Alignment:
Q  231 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 328  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  329 tactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 619
Alignment:
Q  212 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  725 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 627  T
Q  312 tatcatga 319  Q
    ||||||||    
T  626 tatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25398 - 25353
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatc 153  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25398 ttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgttgtgagttgatc 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16206
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |  || | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 16133  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttga 385  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16134 atcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13147
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgata--tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||    ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 13217  T
Q  312 tatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13216 tatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Original strand, 15867 - 15971
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15867 gaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacaagttgttatg 15965  T
Q  146 agttga 151  Q
    ||||||    
T  15966 agttga 15971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13482 - 13381
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtga 146  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  13482 aactcgccatagcgagtataggccctcgcctcatgagttgcctagttacagaatgccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttatga 13384  T
Q  147 gtt 149  Q
    |||    
T  13383 gtt 13381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  374 ggtctaagttgatga 388  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 13854 - 13963
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||    
T  13854 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgaagtgcatttgtaattgttata 13953  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  13954 t-atgatgatt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39861 - 39792
Alignment:
Q  13 agattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39861 agattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 39792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  374 ggtctaagttgatga 388  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 74951 - 75020
Alignment:
Q  13 agattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  74951 agattgtagaatgaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 75020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  374 ggtctaagttgatga 388  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40253 - 40173
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcg 81  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||  ||| ||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  40253 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggtttctaacctgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59307
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 59307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 841 - 569
Alignment:
Q  108 ttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg 207  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||    
T  841 ttaggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctg 743  T
Q  208 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 307  Q
    |   |||||| ||||| || |  ||||| | ||||   ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  742 aattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatatt 645  T
Q  308 gttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  644 gttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 866
Alignment:
Q  48 actcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  900 actcgccatggcgagtagaggccctcacctcgcga 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 207243 - 207392
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactag--ttacag 97  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||  |||||     
T  207243 ttgaacctggaaagactt-agaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga--gcactagtattacac 207338  T
Q  98 aatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  207339 aatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 207392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2248 - 2170
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2248 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctc 2170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Original strand, 207467 - 207541
Alignment:
Q  226 tgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  207467 tgtttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9428 - 9133
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  | | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9428 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtg 9330  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcat--atgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || || ||   |  ||  | ||||||||   || |||||| | |    
T  9329 agttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaatccaatgatgttg---atgatgttaaaca 9233  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtt 341  Q
      |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9232 aatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgtt 9137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17177 - 17096
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17177 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgagaatatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 17096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16952 - 16785
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 326  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  16952 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16853  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  16852 tatacta-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttg 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  375 gtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 381
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79430
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  79264 atgatttgatgttgtt-atattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattat 79362  T
Q  313 atcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     ||||| || |||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  79363 gtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 16939 - 17020
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  16939 ttgaacctggaaagattt-agaatgaaacttttggaattctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcga 17020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 79107 - 79184
Alignment:
Q  55 atggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | |||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  79107 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcac 79184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1801 - 1932
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |   | |||||||||||    
T  1801 ttgaacctggaaagattttagaatgaaactttggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 1900  T
Q  101 gccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcac 134  Q
    | ||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1901 g-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcac 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20924 - 20748
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20924 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20826  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20825 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13570 - 13526
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  13570 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 13526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37998 - 37822
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  37998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 37900  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  37899 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
      |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 393
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  377 ctaagttgatgatgatg 393  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 25789 - 25870
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  25789 ttgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 25870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 33218 - 33299
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaa-tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcg 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  33218 ttgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaagtcttacctgaactcgccacggcgagcaaaggctctcgcctcgcg 33299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 158435 - 158611
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  158435 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 158533  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  158534 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Original strand, 339889 - 340064
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  339889 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcat 339987  T
Q  318 gatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  339988 gttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 339675 - 339756
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  339675 ttgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 339756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |     
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctattg-ttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 9927 - 9750
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 316  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| |||    
T  9927 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtca 9829  T
Q  317 tgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |  || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9828 ttctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 39156 - 39076
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  39156 ttgaacctggaaagatttt-gaatgaaacttgtggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 39076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgttg-ttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| || || ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgttg-ttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5207 - 5163
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  5207 tctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctcttgcctcgcga 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267679
Alignment:
Q  145 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 243  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| |||  || | ||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatg-atatgatttgatggtgttaataatgtgatata 267818  T
Q  244 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgtt 341  Q
      ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||  ||||||    
T  267817 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgtt 267719  T
Q  342 gctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    | |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  267718 gatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4871 - 4695
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4871 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4773  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4772 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13569 - 13393
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13569 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13471  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  13470 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 658
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  739 ttgaacctagaaagaatttagaatgaaacttttggaatctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcga 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||  ||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgttg-ttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3867 - 3785
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  3867 ttgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 3785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14124 - 13948
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14124 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14026  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14025 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 52309 - 52227
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  52309 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 52227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 167735 - 167785
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  167735 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 167785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 6)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4905 - 4823
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagatttt-agaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4905 ttgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12487 - 12405
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagatttt-agaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  12487 ttgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 12405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22439 - 22357
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagatttt-agaataaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22439 ttgaacctggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcga 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  373 tggtctaagttgatga 388  Q
     |||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  373 tggtctaagttgatga 388  Q
     |||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  373 tggtctaagttgatga 388  Q
     |||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 381
Target Start/End: Original strand, 20372 - 20524
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 326  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||    
T  20372 tttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttg 20471  T
Q  327 catactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
     ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20472 tatactga-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 151
Target Start/End: Original strand, 20182 - 20297
Alignment:
Q  34 ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgca 133  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||   |||| |||||||||||    
T  20182 ggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacagaa-gccttgtttaggat-tttgcggtctttgtcgca 20279  T
Q  134 ctagttgctgtgagttga 151  Q
    | ||| | || |||||||    
T  20280 cgagtcgttgagagttga 20297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 35853 - 35962
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  35853 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 35952  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  35953 t-atgatgatt 35962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 128876 - 128755
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |  | | | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  128876 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttg-ttatttaactaagttgcatgagtt 128778  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||| ||||| | |||||||    
T  128777 ggtctaatttgattaagatgatg 128755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagtt 373  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||     
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  374 ggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 8256 - 8338
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgggaat-ctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  8256 ttgaacctggaaagattgtagaatgaaacttttggaattctggcctaaactcgccacggtgagtagaggctctcgcctcgcga 8338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225465
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattat 225495  T
Q  313 atcatgatgatttgcatactgtctatgttg 342  Q
    |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  225494 atcacgctgttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 189144 - 189253
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  189144 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 189243  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  189244 t-atgatgatt 189253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 225744 - 225656
Alignment:
Q  61 agtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  225744 agtagaggcccttgcctcgcgagttacatagttacagaatgc-ttgtttaggattt-tgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 225656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 396
Target Start/End: Original strand, 15295 - 15355
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||    
T  15295 ctatgttgctattg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 805 - 855
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  805 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagt 372  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  373 tggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
     ||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 382
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgag 371  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  372 ttggtctaagt 382  Q
    | |||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 24026 - 24107
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24026 ttgaacctggaaa-attgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacagcgagcagaggctctcgcctcgcga 24107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 396
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  274 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttg--gttatttaactaagctgcatga 370  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | |||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  371 gttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 288
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacagaatgccttctttaggat 114  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  409 ttagaatggaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtt 313  T
Q  115 aaatgcgatctttgtcgcactagtt 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  312 aaatgcgatctttgtcgcacgagtt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 6
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 314  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  92 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Original strand, 9574 - 9707
Alignment:
Q  18 ttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagt--tacagaatgccttctttaggat 114  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  9574 ttagaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtt 9670  T
Q  115 aaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  9671 aaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 9707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 9784 - 9856
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9784 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 396
Target Start/End: Original strand, 4890 - 4950
Alignment:
Q  335 ctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4890 ctatgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| | | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  381 gttg 384  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  377 ctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 16323 - 16405
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaac-tttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16323 ttgaacctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaaatctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 16405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10307 - 10158
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    ||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        |||||||||    
T  10307 ttgaacctggaaagactt-agaaggaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaa 10210  T
Q  100 tgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  10209 tgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgttatgagttga 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 40577 - 40401
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||| | | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  40577 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 40479  T
Q  318 gatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
      || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  40478 cctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  283 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 382  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  383 tgatgatgatgatg 396  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20800 - 20718
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  20800 ttgaacctggaaagattatagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 20718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 107
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  289 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  190 tgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  323 tttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 301 - 253
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 80  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  301 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 5029
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgc 80  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5077 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 5029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | |||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattg-ttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  380 agttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 8840 - 8788
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaat 84  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8840 tgggattctgacctgaactcgccacggccagtagaggctctcgcctcgcgaat 8788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2091 - 1956
Alignment:
Q  262 gaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaact 359  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  2091 gaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg-ttaattaact 1993  T
Q  360 aagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1992 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 396
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10540
Alignment:
Q  328 atactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12065
Alignment:
Q  213 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  12241 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  12142 tgtcatgctgttttagtatactg-ctgtgttgctgtt-------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 627
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  736 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 637  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  636 t-atgatgatt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Original strand, 11268 - 11377
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 313  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  11268 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 11367  T
Q  314 tcatgatgatt 324  Q
    | |||||||||    
T  11368 t-atgatgatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 384
Target Start/End: Original strand, 161083 - 161239
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 325  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||     
T  161083 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgttttt 161182  T
Q  326 gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 384  Q
    | |||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  161183 gtatactg-ctgtgtcgctgttgat-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Original strand, 32432 - 32536
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 318  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  32432 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 32530  T
Q  319 atgatt 324  Q
    ||||||    
T  32531 atgatt 32536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11299
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    |||| |||||    
T  11308 ctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 165
Alignment:
Q  47 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgact-agttacagaatgccttctttaggataaatgcgatctttgtcgcactagttgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  ||| | | |||| ||||||||  ||  ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagct-actgagagacatactaccttgtttaggattcatatgat-tttgtcgcacgagttgttgtg 277  T
Q  146 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 245  Q
    ||| |||| | | |||  ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  276 agtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatataat 178  T
Q  246 tgtatatacatta 258  Q
    ||||||| |||||    
T  177 tgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4308
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4355 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 396
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaa 380  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  381 gttgatgatgatgatg 396  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 814 - 858
Alignment:
Q  38 tctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  814 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcga 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 17732 - 17795
Alignment:
Q  1 ttgaacctggatagattttagaataaaactt-tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagt 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17732 ttgaacctggatagattgtagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagt 17795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 29946
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 312  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||  ||||   ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| ||||    
T  30114 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  313 atcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 383  Q
     ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4215
Alignment:
Q  214 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 311  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  4396 atgatttgatgttgtatat--tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 4299  T
Q  312 tatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    | ||||| || ||| | |||||| || ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4298 tgtcatgctggttttgtatactg-ctgtgtcgctgtcg-ttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1279 - 1233
Alignment:
Q  32 tgggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1279 tgggattctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctc 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  294 ttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||| ||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  330 actgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatg 396  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12293 - 12228
Alignment:
Q  34 ggaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaa 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | | ||||||||    
T  12293 ggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa 12228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 338 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  338 tgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12024 tgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12400
Alignment:
Q  278 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ctgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcataagtcggt 12390  T
Q  377 ctaagttgat 386  Q
    ||||||||||    
T  12391 ctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 12550 - 12681
Alignment:
Q  19 tagaataaaactttgg-gaatctgaccagaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactag--ttacagaatgccttctttaggata 115  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |   |||||  |||||||||| ||| |||||| ||    
T  12550 tagaatgaaactttggagaatctgact-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc--aagcactagtattacagaatg-cttgtttaggtta 12645  T
Q  116 aatgcgatctttgtcgcactagttgctgtgagttga 151  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12646 aatgcgattcttgtcgcacgagttgttatgagttga 12681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 12758 - 12830
Alignment:
Q  228 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  12758 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 394
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  283 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 381  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  382 ttgatgatgatga 394  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13638
Alignment:
Q  229 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13733 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23890 - 23842
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  23890 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 23842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36453
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgatgatgatgt 397  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36501 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 36453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28012 - 27912
Alignment:
Q  219 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 317  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28012 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T
Q  318 g 318  Q
    |    
T  27912 g 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  281 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgctgttggttatttaactaagctgcatgagttggtcta 379  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  380 agt 382  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 1395 - 1432
Alignment:
Q  349 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1395 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 11938 - 11974
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11938 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 15090 - 15126
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15090 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 15126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16374
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16338 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 16374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24565 - 24529
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24565 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 24529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35435 - 35399
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35435 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 35399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 209276 - 209240
Alignment:
Q  46 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  209276 gaactcgccatagcgagtagaggcgctcgcctcgcga 209240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University