View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5714-Insertion-2 (Length: 969)

Name: NF5714-Insertion-2
Description: NF5714
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5714-Insertion-2
NF5714-Insertion-2
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (8-968)||(188283-189239)
chr5 (707-968)||(3887032-3887294)
chr5 (708-968)||(2474315-2474576)
chr5 (708-968)||(22556446-22556707)
chr5 (708-968)||(2473869-2474130)
chr5 (708-957)||(3886588-3886837)
chr5 (723-968)||(22556894-22557140)
chr5 (709-960)||(1821817-1822068)
chr5 (796-968)||(8642009-8642182)
chr5 (797-968)||(34867789-34867961)
chr5 (797-968)||(17445430-17445602)
chr5 (797-968)||(2193815-2193987)
chr5 (797-968)||(21886121-21886293)
chr5 (797-968)||(34371611-34371783)
chr5 (797-960)||(10927387-10927550)
chr5 (797-968)||(34372067-34372239)
chr5 (797-968)||(42788621-42788793)
chr5 (797-960)||(10926930-10927093)
chr5 (797-960)||(27646819-27646982)
chr5 (793-960)||(39146934-39147101)
chr5 (708-953)||(30719796-30720041)
chr5 (792-959)||(20039460-20039626)
chr5 (792-968)||(8391297-8391473)
chr5 (708-953)||(30684547-30684792)
chr5 (730-878)||(22975076-22975224)
chr5 (797-961)||(15512995-15513160)
chr5 (798-968)||(18304431-18304602)
chr5 (812-968)||(18750171-18750328)
chr5 (808-960)||(29680091-29680236)
chr5 (792-944)||(4657993-4658144)
chr5 (852-960)||(20858525-20858633)
chr5 (797-959)||(42429145-42429306)
chr5 (797-941)||(5066894-5067038)
chr5 (782-936)||(2058664-2058819)
chr5 (798-968)||(24182221-24182391)
chr5 (878-959)||(11757266-11757347)
chr5 (800-920)||(16370732-16370852)
chr5 (847-949)||(4673466-4673568)
chr5 (803-931)||(11160694-11160822)
chr5 (836-968)||(32574633-32574765)
chr5 (800-913)||(43356651-43356762)
chr5 (798-912)||(32136274-32136387)
chr5 (797-886)||(4102811-4102895)
chr5 (898-951)||(5785901-5785954)
chr5 (875-908)||(39801498-39801531)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (708-968)||(107438-107699)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (708-968)||(30966600-30966861)
chr2 (708-960)||(30966144-30966396)
chr2 (708-968)||(24818236-24818497)
chr2 (708-968)||(29259595-29259856)
chr2 (708-960)||(5399801-5400053)
chr2 (793-968)||(41754284-41754460)
chr2 (793-968)||(25337972-25338148)
chr2 (797-961)||(29804681-29804845)
chr2 (797-960)||(33174957-33175119)
chr2 (797-960)||(33174504-33174665)
chr2 (806-968)||(8256534-8256697)
chr2 (797-960)||(16379392-16379555)
chr2 (799-960)||(16378938-16379099)
chr2 (797-968)||(11388188-11388358)
chr2 (797-960)||(25434040-25434203)
chr2 (793-968)||(33771005-33771172)
chr2 (797-944)||(18098878-18099025)
chr2 (730-956)||(82952-83175)
chr2 (793-960)||(1912520-1912686)
chr2 (708-919)||(1953067-1953276)
chr2 (797-960)||(27882910-27883073)
chr2 (798-959)||(38898897-38899058)
chr2 (797-961)||(1707041-1707204)
chr2 (797-959)||(15619897-15620059)
chr2 (800-968)||(30963238-30963407)
chr2 (817-968)||(11394554-11394704)
chr2 (723-968)||(30961858-30962111)
chr2 (807-960)||(30963704-30963857)
chr2 (800-941)||(20502023-20502165)
chr2 (797-908)||(18447954-18448065)
chr2 (842-961)||(13191018-13191137)
chr2 (808-960)||(8073902-8074054)
chr2 (845-960)||(15639781-15639896)
chr2 (809-901)||(8181394-8181486)
chr2 (847-968)||(16542034-16542157)
chr2 (849-913)||(36924453-36924519)
chr2 (808-959)||(37552578-37552726)
chr2 (904-968)||(32377691-32377756)
chr2 (808-920)||(9909102-9909214)
chr2 (855-909)||(26864851-26864905)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (708-968)||(105630-105891)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (708-968)||(35871538-35871798)
chr4 (706-968)||(23350252-23350515)
chr4 (708-968)||(44471294-44471555)
chr4 (707-968)||(49998545-49998807)
chr4 (732-968)||(44470844-44471080)
chr4 (797-968)||(12691968-12692140)
chr4 (708-959)||(15306070-15306326)
chr4 (797-960)||(50398516-50398679)
chr4 (731-957)||(14571702-14571928)
chr4 (797-960)||(50398971-50399134)
chr4 (797-960)||(51331259-51331422)
chr4 (797-945)||(4127430-4127578)
chr4 (731-968)||(14572123-14572357)
chr4 (797-960)||(1645727-1645890)
chr4 (797-960)||(23942767-23942930)
chr4 (797-968)||(24628946-24629121)
chr4 (797-968)||(24629402-24629574)
chr4 (797-968)||(4127858-4128030)
chr4 (797-960)||(3169205-3169368)
chr4 (797-960)||(31817830-31817993)
chr4 (708-959)||(27578436-27578683)
chr4 (814-968)||(7678591-7678746)
chr4 (797-956)||(9423840-9423999)
chr4 (797-960)||(53996093-53996256)
chr4 (792-959)||(14351789-14351956)
chr4 (797-960)||(21067281-21067444)
chr4 (797-960)||(29628646-29628808)
chr4 (797-968)||(21220300-21220472)
chr4 (708-959)||(13266002-13266247)
chr4 (708-914)||(41869830-41870034)
chr4 (781-969)||(17028858-17029046)
chr4 (864-968)||(50814794-50814899)
chr4 (797-968)||(1464146-1464318)
chr4 (772-968)||(8467777-8467963)
chr4 (791-960)||(17029323-17029492)
chr4 (847-960)||(23943220-23943333)
chr4 (797-960)||(31817376-31817539)
chr4 (792-961)||(27026498-27026665)
chr4 (792-960)||(13613876-13614043)
chr4 (819-961)||(21067755-21067894)
chr4 (852-955)||(27029331-27029434)
chr4 (709-960)||(27578887-27579137)
chr4 (847-968)||(17628560-17628682)
chr4 (800-968)||(4185717-4185886)
chr4 (803-956)||(33764865-33765018)
chr4 (809-968)||(43928933-43929092)
chr4 (792-944)||(52048661-52048813)
chr4 (859-968)||(23091480-23091590)
chr4 (858-968)||(20306133-20306241)
chr4 (800-913)||(23976244-23976357)
chr4 (807-944)||(4186176-4186313)
chr4 (802-959)||(42838628-42838787)
chr4 (804-913)||(45682209-45682318)
chr4 (800-937)||(24271552-24271690)
chr4 (797-887)||(53854858-53854948)
chr4 (781-968)||(17628951-17629138)
chr4 (847-944)||(44831046-44831143)
chr4 (836-932)||(53391925-53392021)
chr4 (802-897)||(17506389-17506484)
chr4 (781-936)||(26200287-26200444)
chr4 (789-861)||(2682707-2682779)
chr4 (852-936)||(34554483-34554567)
chr4 (873-921)||(39902470-39902518)
chr4 (797-869)||(10165953-10166025)
chr4 (731-862)||(20309594-20309722)
chr4 (914-960)||(11828463-11828509)
chr4 (796-850)||(35477801-35477855)
chr4 (894-959)||(33294871-33294936)
chr4 (781-826)||(33987183-33987227)
chr4 (805-885)||(2499647-2499727)
chr4 (926-969)||(14571656-14571700)
chr4 (726-767)||(27029182-27029223)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (708-968)||(10210-10471)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (708-968)||(13492699-13492960)
chr6 (708-968)||(16519879-16520139)
chr6 (723-968)||(7912235-7912481)
chr6 (707-968)||(9351972-9352233)
chr6 (722-968)||(17731084-17731335)
chr6 (732-968)||(7911812-7912049)
chr6 (703-968)||(13191488-13191754)
chr6 (790-968)||(17027506-17027685)
chr6 (797-968)||(20850320-20850492)
chr6 (797-968)||(20896663-20896835)
chr6 (797-959)||(6330897-6331059)
chr6 (797-968)||(23986292-23986464)
chr6 (797-959)||(21311514-21311676)
chr6 (797-954)||(2681206-2681363)
chr6 (797-944)||(3652485-3652632)
chr6 (795-960)||(20126166-20126331)
chr6 (793-938)||(27334156-27334301)
chr6 (793-938)||(27394896-27395041)
chr6 (781-968)||(9440284-9440472)
chr6 (797-960)||(17851373-17851536)
chr6 (797-961)||(2890822-2890985)
chr6 (793-960)||(21311966-21312133)
chr6 (793-968)||(23776436-23776611)
chr6 (797-960)||(11062285-11062447)
chr6 (797-960)||(17850917-17851080)
chr6 (797-951)||(15929581-15929735)
chr6 (806-960)||(2720547-2720702)
chr6 (792-932)||(31821704-31821844)
chr6 (859-968)||(13492393-13492503)
chr6 (797-953)||(14771710-14771866)
chr6 (781-887)||(9440485-9440591)
chr6 (797-960)||(33774986-33775151)
chr6 (761-968)||(9440832-9441037)
chr6 (817-937)||(15929218-15929338)
chr6 (799-944)||(20735696-20735841)
chr6 (772-968)||(32292860-32293054)
chr6 (836-944)||(1991591-1991699)
chr6 (732-856)||(13490055-13490179)
chr6 (836-960)||(20732616-20732740)
chr6 (800-959)||(28065820-28065982)
chr6 (848-942)||(28583013-28583107)
chr6 (792-957)||(12194324-12194487)
chr6 (897-968)||(28780209-28780281)
chr6 (797-939)||(17205338-17205479)
chr6 (800-870)||(3652981-3653051)
chr6 (837-968)||(3885065-3885194)
chr6 (836-941)||(10964342-10964447)
chr6 (836-968)||(30729814-30729947)
chr6 (842-959)||(33470882-33470998)
chr6 (809-883)||(9441061-9441135)
chr6 (722-767)||(21311871-21311916)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (708-968)||(31284251-31284512)
chr3 (734-968)||(8067216-8067451)
chr3 (711-961)||(41472214-41472463)
chr3 (732-968)||(27187305-27187542)
chr3 (708-960)||(25248021-25248273)
chr3 (793-968)||(28561741-28561917)
chr3 (708-960)||(7493792-7494043)
chr3 (708-959)||(7477102-7477352)
chr3 (797-968)||(16811380-16811552)
chr3 (793-968)||(39653159-39653335)
chr3 (708-960)||(41473907-41474159)
chr3 (806-968)||(11180009-11180172)
chr3 (797-968)||(14813948-14814120)
chr3 (797-968)||(50347745-50347917)
chr3 (797-968)||(13150074-13150246)
chr3 (793-960)||(30529682-30529849)
chr3 (797-968)||(32227196-32227368)
chr3 (797-968)||(32227500-32227671)
chr3 (797-960)||(39640936-39641099)
chr3 (798-960)||(25230232-25230394)
chr3 (798-960)||(25237819-25237981)
chr3 (797-968)||(16810924-16811096)
chr3 (842-968)||(13150529-13150656)
chr3 (798-960)||(25230689-25230851)
chr3 (798-960)||(25238276-25238438)
chr3 (836-968)||(32386709-32386842)
chr3 (708-864)||(12820554-12820710)
chr3 (797-960)||(14820153-14820316)
chr3 (798-960)||(20885101-20885263)
chr3 (797-960)||(2911094-2911257)
chr3 (797-960)||(37045034-37045197)
chr3 (797-951)||(25239070-25239224)
chr3 (707-827)||(32388848-32388968)
chr3 (850-960)||(4067344-4067454)
chr3 (842-960)||(25238668-25238786)
chr3 (807-960)||(25802532-25802685)
chr3 (797-943)||(32796936-32797082)
chr3 (800-968)||(29224326-29224495)
chr3 (797-960)||(25802988-25803151)
chr3 (809-941)||(31103961-31104095)
chr3 (845-944)||(26309989-26310088)
chr3 (866-968)||(3899868-3899971)
chr3 (866-914)||(3890046-3890094)
chr3 (831-936)||(47518330-47518432)
chr3 (858-920)||(15392570-15392632)
chr3 (858-920)||(15405606-15405668)
chr3 (858-920)||(15411015-15411077)
chr3 (858-920)||(15417431-15417493)
chr3 (887-968)||(53150787-53150869)
chr3 (858-920)||(15388203-15388265)
chr3 (888-934)||(43736731-43736777)
chr3 (723-764)||(13150302-13150343)
chr3 (856-885)||(25238816-25238845)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (707-968)||(13125111-13125373)
chr7 (708-944)||(11517389-11517624)
chr7 (708-958)||(9124869-9125119)
chr7 (708-960)||(42515002-42515254)
chr7 (707-968)||(18833195-18833457)
chr7 (732-968)||(2941732-2941969)
chr7 (797-968)||(28495853-28496025)
chr7 (797-968)||(42515543-42515715)
chr7 (708-968)||(5406563-5406823)
chr7 (797-960)||(6719058-6719221)
chr7 (797-968)||(2193255-2193427)
chr7 (797-968)||(34405566-34405738)
chr7 (722-888)||(13124757-13124923)
chr7 (797-968)||(2189143-2189315)
chr7 (797-968)||(36422251-36422423)
chr7 (797-960)||(46425740-46425903)
chr7 (795-959)||(6747583-6747747)
chr7 (797-968)||(28495583-28495755)
chr7 (793-960)||(679812-679978)
chr7 (838-968)||(2465773-2465904)
chr7 (836-969)||(2465962-2466096)
chr7 (756-960)||(25182320-25182523)
chr7 (797-960)||(35474105-35474268)
chr7 (793-960)||(2611636-2611803)
chr7 (797-960)||(35527105-35527268)
chr7 (793-959)||(29357441-29357606)
chr7 (792-960)||(29039004-29039172)
chr7 (797-960)||(22529219-22529382)
chr7 (741-954)||(31406574-31406787)
chr7 (822-951)||(26421753-26421882)
chr7 (792-960)||(9623202-9623369)
chr7 (786-934)||(31743834-31743982)
chr7 (798-944)||(36015411-36015557)
chr7 (797-919)||(43233412-43233534)
chr7 (800-944)||(26421305-26421449)
chr7 (797-898)||(26957603-26957704)
chr7 (802-944)||(20966055-20966197)
chr7 (882-968)||(13122480-13122567)
chr7 (801-944)||(1628719-1628859)
chr7 (848-944)||(11372501-11372597)
chr7 (894-968)||(7646453-7646528)
chr7 (847-936)||(16192368-16192457)
chr7 (797-882)||(3305374-3305459)
chr7 (897-968)||(7646514-7646586)
chr7 (842-959)||(37672204-37672321)
chr7 (912-968)||(43776265-43776322)
chr7 (870-951)||(7461344-7461424)
chr7 (836-895)||(2490077-2490136)
chr7 (800-959)||(11372901-11373060)
chr7 (792-961)||(33316721-33316886)
chr7 (845-898)||(6585655-6585708)
chr7 (836-890)||(16811900-16811954)
chr7 (800-968)||(37671736-37671900)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (708-968)||(34308454-34308715)
chr8 (708-968)||(34308910-34309175)
chr8 (708-968)||(25147446-25147707)
chr8 (708-968)||(12100602-12100862)
chr8 (708-968)||(25144682-25144943)
chr8 (723-968)||(25147892-25148138)
chr8 (708-960)||(21316093-21316345)
chr8 (797-958)||(10844882-10845043)
chr8 (797-968)||(27925898-27926070)
chr8 (797-960)||(22026378-22026541)
chr8 (801-961)||(10844598-10844758)
chr8 (803-968)||(17103086-17103252)
chr8 (705-959)||(27819231-27819484)
chr8 (797-968)||(12827229-12827401)
chr8 (797-968)||(22548970-22549142)
chr8 (798-968)||(22548524-22548695)
chr8 (797-968)||(27022313-27022485)
chr8 (797-968)||(41659080-41659252)
chr8 (793-960)||(8080326-8080493)
chr8 (797-960)||(32292396-32292559)
chr8 (797-960)||(2044057-2044220)
chr8 (797-960)||(6464894-6465057)
chr8 (707-908)||(22705089-22705282)
chr8 (809-956)||(28375042-28375189)
chr8 (793-960)||(33852242-33852409)
chr8 (793-943)||(22840530-22840680)
chr8 (794-960)||(28453334-28453500)
chr8 (836-961)||(41913008-41913133)
chr8 (808-919)||(27021904-27022015)
chr8 (801-968)||(3745104-3745272)
chr8 (876-968)||(31283626-31283719)
chr8 (792-960)||(15567540-15567708)
chr8 (797-961)||(30334891-30335055)
chr8 (847-937)||(15819022-15819112)
chr8 (836-937)||(3744676-3744777)
chr8 (793-944)||(30527482-30527630)
chr8 (836-961)||(1297045-1297170)
chr8 (798-909)||(17429501-17429611)
chr8 (810-913)||(15568036-15568139)
chr8 (798-908)||(6466711-6466820)
chr8 (793-895)||(29971450-29971552)
chr8 (796-961)||(6466255-6466419)
chr8 (708-784)||(31283356-31283432)
chr8 (708-854)||(9250913-9251057)
chr8 (843-905)||(36968434-36968496)
chr8 (894-961)||(10729669-10729736)
chr8 (887-960)||(25307855-25307926)
chr8 (843-944)||(28912850-28912951)
chr8 (792-862)||(25307759-25307829)
chr8 (855-892)||(3508790-3508827)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (708-960)||(162662-162914)
scaffold0022 (781-958)||(69801-69978)
scaffold0022 (897-968)||(163109-163181)
scaffold0022 (894-968)||(163167-163242)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (708-960)||(35759592-35759844)
chr1 (722-944)||(20061191-20061413)
chr1 (708-944)||(2328225-2328461)
chr1 (710-968)||(35760889-35761148)
chr1 (797-968)||(20054511-20054683)
chr1 (797-968)||(20054967-20055139)
chr1 (797-968)||(20055423-20055595)
chr1 (797-968)||(20055879-20056051)
chr1 (797-968)||(20056335-20056507)
chr1 (797-968)||(20057238-20057410)
chr1 (731-968)||(46693710-46693950)
chr1 (797-958)||(20054066-20054227)
chr1 (793-968)||(20057694-20057870)
chr1 (797-968)||(38340905-38341077)
chr1 (797-960)||(20845645-20845808)
chr1 (797-968)||(50002260-50002432)
chr1 (797-960)||(43057507-43057670)
chr1 (797-968)||(16451908-16452080)
chr1 (797-968)||(16461061-16461233)
chr1 (797-968)||(50002682-50002854)
chr1 (797-961)||(52250205-52250369)
chr1 (808-968)||(51372849-51373010)
chr1 (797-968)||(50003050-50003222)
chr1 (782-960)||(2634909-2635086)
chr1 (836-968)||(20056791-20056924)
chr1 (797-959)||(43057050-43057211)
chr1 (797-961)||(12883523-12883687)
chr1 (716-960)||(23180649-23180892)
chr1 (797-960)||(30872934-30873097)
chr1 (853-960)||(20060324-20060431)
chr1 (798-960)||(31822647-31822809)
chr1 (797-960)||(12727990-12728154)
chr1 (792-960)||(7548085-7548253)
chr1 (772-968)||(16907210-16907405)
chr1 (797-960)||(10820591-10820756)
chr1 (781-960)||(2634449-2634628)
chr1 (896-961)||(52250641-52250706)
chr1 (896-961)||(52250978-52251043)
chr1 (836-958)||(16440565-16440687)
chr1 (867-931)||(31823097-31823161)
chr1 (809-959)||(842918-843068)
chr1 (836-920)||(16410747-16410831)
chr1 (880-968)||(7229918-7230007)
chr1 (836-913)||(2739560-2739637)
chr1 (723-766)||(43057266-43057309)
chr1 (922-960)||(35009980-35010018)
chr1 (867-905)||(46411173-46411211)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (708-968)||(2185-2446)
scaffold0040 (706-759)||(2555-2608)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (707-913)||(142305-142511)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (790-968)||(18958-19137)
scaffold0322 (726-862)||(18203-18339)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (731-957)||(245448-245674)
scaffold0005 (731-968)||(245019-245253)
scaffold0005 (926-969)||(245676-245720)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (797-968)||(2026-2198)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (797-968)||(1219-1391)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (797-968)||(2741-2913)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (797-968)||(4560-4732)
scaffold0333 (797-968)||(5015-5192)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (797-968)||(154756-154928)
scaffold0002 (723-764)||(154659-154700)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (793-960)||(18119-18285)
scaffold0047 (797-960)||(17582-17745)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (796-925)||(4001-4130)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (797-910)||(23672-23785)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (847-957)||(2154-2264)
scaffold0557 (797-829)||(749-781)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (797-960)||(14740-14903)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (884-968)||(13508-13593)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (798-909)||(45387-45497)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (802-960)||(26074-26230)
scaffold0036 (802-913)||(16038-16151)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (897-968)||(14677-14749)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (858-920)||(44745-44807)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (909-957)||(421-469)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 803; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 803; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 968
Target Start/End: Original strand, 188283 - 189239
Alignment:
Q  8 aaactcatccacatttgttgcagaagcagaactagtaccactagtatttctggtaccaatcagctcaacatctagatcaagtggtgnnnnnnngaacaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  188283 aaactcatccacatttgttgcagatgcagaactagtaccactagtatttctggtaccaatcagctcaacatctagatcaagtggtgaaaaaaagaacaat 188382  T
Q  108 cccttgtaactattgtagtctcggagcacttttgtctataaaaacgcaatcattgttgtgaaatattagtcaaatcgtcatcttgcttaatttcaagttc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188383 cccttgtaactattgtagtctcggagcacttttgtctataaaaacgcaatcattgttgtgaaatattagtcaaatcgtcatcttgcttaatttcaagttc 188482  T
Q  208 gctaacacagtctttaatttccaaatagtttctttttatcgctccctgataatacgagtaaatcattattcgagggatgtaatattgtcaatgatattca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  188483 gctaacacagtctttaatttccaaatagtttctttttatcgctccctgataatatgagtaaatcattattcgagggatgtaatgttgtcaatgatattca 188582  T
Q  308 attctatcatttcaaatttctaagtagacaaattcagtagcaagttttagtattcattagaactttcaataatataaggcaaatagttgagatttttct- 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  188583 attctatcatttcaaatttctaagtggacaaattcagtagcaagttttagtattcattagaactttcaataatataaggcaaatagttgagatttttctt 188682  T
Q  407 -tgtgtgttaaggtgcgtgggtgactttacaccaaatttataaccagcatatcatacnnnnnnngacagaaccaacatatcatac-----ttataactgc 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||     ||||||||||    
T  188683 gtgtgtgttaaggtgcgtgggtgactttacaccaaatttataaccagcatatcatactttttttgaccgaaccaacatatcatacttatattataactgc 188782  T
Q  501 acaaataaggtattaccctgacttaagagagatacatatgatatacatctaacctgaccataaatagaagaatattgttgcaaggaagttatatatgatg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188783 acaaataaggtattaccctgacttaagagagatacatatgatatacatctaacctgaccataaatagaagaatattgttgcaaggaagttatatatgatg 188882  T
Q  601 gcatgatgccaaatattttgagtggatatgacatttcattcattatgcgcgcacatccactttatgagttcgagagacaagaattaatgtagcaaaggcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188883 gcatgatgccaaatattttgagtggatatgacatttcattcattatgcgcgcgcatccactttatgagttcgagagacaagaattaatgtagcaaaggcc 188982  T
Q  701 tagttagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaat 800  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||    
T  188983 tagttagtgtaacgcctccgcttggtgggcatataacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccgg------------ttctaggcaaaactgaat 189070  T
Q  801 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189071 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 189170  T
Q  901 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  189171 tgtatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattt 189239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 707 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 3887294 - 3887032
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3887294 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatc 3887195  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887194 ggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatc 3887095  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3887094 ttcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 3887032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 2474315 - 2474576
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2474315 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2474414  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474415 gaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2474514  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2474515 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2474576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 22556446 - 22556707
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 22556545  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556546 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22556645  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  22556646 tcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagcgtggctgacttggagcaattt 22556707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 2473869 - 2474130
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2473869 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaagctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacatcg 2473968  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2473969 gaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 2474068  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2474069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2474130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 708 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 3886837 - 3886588
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3886837 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 3886738  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886737 gaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3886638  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3886637 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgac 3886588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 723 - 968
Target Start/End: Original strand, 22556894 - 22557140
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 822  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  22556894 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttca 22556993  T
Q  823 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 922  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556994 tgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 22557093  T
Q  923 attccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  22557094 attctttaagaacttcacagttaagcgtgcctgacttggagcaattt 22557140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 709 - 960
Target Start/End: Original strand, 1821817 - 1822068
Alignment:
Q  709 gtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 808  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||  | |||||||| ||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  1821817 gtaatgcctctgcttggtgggcatgtaacgtctgaggctgacgagggtggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcgg 1821916  T
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    |||||||| |||| | ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1821917 aatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 1822016  T
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1822017 ctttttggtagcccattccataagaactccacatttaagcgtgcttgacttg 1822068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 796 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8642009
Alignment:
Q  796 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 895  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8642082 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 8642009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 34867789 - 34867961
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867789 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 34867888  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  34867889 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactttgagcaattt 34867961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 17445602 - 17445430
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445602 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17445503  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17445502 aagatgcatcttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 17445430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 2193815 - 2193987
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2193815 gaatcacgccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2193914  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2193915 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2193987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 21886293 - 21886121
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21886293 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaac 21886194  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21886193 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattt 21886121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 34371611 - 34371783
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371611 gaatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34371710  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34371711 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 34371783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 10927550 - 10927387
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927550 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10927451  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10927450 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttg 10927387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 34372067 - 34372239
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34372067 gaatcacaccagaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaac 34372166  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34372167 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 34372239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 42788793 - 42788621
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788793 gaatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 42788694  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42788693 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 42788621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 10927093 - 10926930
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927093 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10926994  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10926993 aagatgcatcttccttttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttg 10926930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 27646982 - 27646819
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27646982 gaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaac 27646883  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27646882 aagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttg 27646819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Original strand, 39146934 - 39147101
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39146934 aactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatat 39147033  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39147034 taacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 39147101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 708 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 30720041 - 30719796
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |  | |||||||||  ||||| || |||| | |||||||| ||||||||||     
T  30720041 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgtccgagactgacaagggcatgtagtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatca 30719942  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30719941 gaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatct 30719842  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgct 953  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  30719841 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgct 30719796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 792 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 20039626 - 20039460
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039626 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 20039527  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20039526 tcaacaagatgcattttctttt-ggtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgactt 20039460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 792 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 8391473 - 8391297
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8391473 aaaccgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgta 8391375  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8391374 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 8391297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 708 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 30684792 - 30684547
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| | || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30684792 tgtaatgcctctgcttggtggtcatgtaacgtccgagactgacaagggcaggtagtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcg 30684693  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||| ||||||||||||  || || |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30684692 gaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaagggaggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatct 30684593  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgct 953  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30684592 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgct 30684547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 730 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 22975224 - 22975076
Alignment:
Q  730 catgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 829  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22975224 catgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 22975125  T
Q  830 gtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 878  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22975124 gtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 15513160 - 15512995
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtttggtactacctatatca 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15513160 gaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatca 15513062  T
Q  895 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  15513061 acaagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttga 15512995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 798 - 968
Target Start/End: Original strand, 18304431 - 18304602
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||| | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18304431 aatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaaca 18304530  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  18304531 agatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattt 18304602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 812 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750171
Alignment:
Q  812 gagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 911  Q
    ||||| |||||||| | ||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T
Q  912 ttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||| |||||||| |||||||||    
T  18750228 ttcggtagcttattccataagaactccataattaatcgtacttgacttggagcaattt 18750171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 808 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29680091
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatct 29680144  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29680143 tctttttggtagcccattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 29680091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 792 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 4658144 - 4657993
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| || ||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4658144 aaactgaatcacatcgaaataagagggatcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctata 4658046  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4658045 acaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataagaacttcacagtt 4657993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 852 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858525
Alignment:
Q  852 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  952 cttgacttg 960  Q
    |||||||||    
T  20858533 cttgacttg 20858525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 797 - 959
Target Start/End: Original strand, 42429145 - 42429306
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  | ||||| ||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42429145 gaatcacatcggaataagagg-atcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaac 42429243  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    || |||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  42429244 aatatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaagggtgcttgactt 42429306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 797 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 5067038 - 5066894
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5067038 gaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaac 5066939  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    ||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| |||||||||    
T  5066938 aagatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaactccaca 5066894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 782 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 2058819 - 2058664
Alignment:
Q  782 cttctaggcaaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 880  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| | | | ||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2058819 cttctaggcaaaaaccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttgg 2058720  T
Q  881 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 936  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  2058719 tactacctatatcaacaagatgcaaattctgttaaatagcacattccataagaact 2058664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 798 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182221
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| || ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  24182291 agatgcatcttc-tttcggtaccccaaaccataataacttaacagttaagcgtggttgacttggagcaattt 24182221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 878 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757266
Alignment:
Q  878 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 11757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 800 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370732
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| |  | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaag 16370753  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    | | |||||||||| ||||||    
T  16370752 acgtatcttctttttggtagc 16370732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 847 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673466
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttca 946  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  947 gcg 949  Q
    |||    
T  4673468 gcg 4673466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 803 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 11160822 - 11160694
Alignment:
Q  803 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 902  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||  | |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11160822 catcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatg 11160723  T
Q  903 catcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
    ||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  11160722 catattctttcacgtagttcattccataa 11160694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 836 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 32574765 - 32574633
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||| |||||| ||  | |||| |||    
T  32574765 gtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaactataataac 32574667  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    | || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32574666 ttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 32574633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 800 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 43356762 - 43356651
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||     
T  43356762 tcacatcggaatgagaggg-tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataagaattgtttggtacaacctaaaccaacaat 43356665  T
Q  900 atgcatcttctttt 913  Q
    ||||||||||||||    
T  43356664 atgcatcttctttt 43356651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 798 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 32136387 - 32136274
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||| |||||| |||||| |||| || |||  ||||||| |||||||||||  ||  | ||||||||    
T  32136387 aatcacatcgaaataagagagatcttaagaccgtacaagtatgg-actgcaaggttaaatgaatacttataaaaattgtttggtgttatttgtatcaaca 32136289  T
Q  898 agatgcatcttcttt 912  Q
    |||||||||||||||    
T  32136288 agatgcatcttcttt 32136274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 886
Target Start/End: Original strand, 4102811 - 4102895
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 886  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| || ||||| |||||     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4102811 gaatcacatctgaatgagagggattctgataccgtgcaggtatgagactg-----ttgaaagaatgcttataagaattgtttggtactac 4102895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 898 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 5785954 - 5785901
Alignment:
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5785954 agatgcatcatctttttggtagctcgttccgtaagaactccacagttaagcgtg 5785901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 875 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 39801531 - 39801498
Alignment:
Q  875 gtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801531 gtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 39801498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 107699 - 107438
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  107699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 107600  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  107599 gaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatct 107500  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  107499 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 107438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 30966600 - 30966861
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966600 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966699  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966700 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966799  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  30966800 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattt 30966861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Original strand, 30966144 - 30966396
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30966144 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966243  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966244 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966343  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30966344 tcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttg 30966396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 24818236 - 24818497
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24818236 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 24818335  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818336 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 24818435  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24818436 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 24818497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 29259856 - 29259595
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29259856 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcg 29259757  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29259756 gaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 29259657  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29259656 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 29259595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 5400053 - 5399801
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5400053 tgtaacgcctccgcttggtgagcatgtaatgcctgaggctgatgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 5399954  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399953 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 5399854  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  5399853 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttg 5399801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Original strand, 41754284 - 41754460
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41754284 aactgaatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatat 41754383  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41754384 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 41754460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 25338148 - 25337972
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25338148 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatat 25338049  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25338048 caacaagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 25337972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Original strand, 29804681 - 29804845
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29804681 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 29804780  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29804781 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 29804845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 33174957 - 33175119
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174957 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33175056  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33175057 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttg 33175119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 33174504 - 33174665
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174504 gaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 33174601  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33174602 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttg 33174665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 806 - 968
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256697
Alignment:
Q  806 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  906 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8256634 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 8256697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 16379392 - 16379555
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16379392 gaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaac 16379491  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16379492 aagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 16379555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 799 - 960
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379099
Alignment:
Q  799 atcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 898  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  899 gatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 16379099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 11388188 - 11388358
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11388188 gaatcacatcggaatgagagg-atcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaac 11388285  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11388286 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 11388358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25434203 - 25434040
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  25434203 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaac 25434104  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25434103 aagatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 25434040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Original strand, 33771005 - 33771172
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||         |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771005 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgagg---------tatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 33771095  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33771096 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattt 33771172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 797 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 18099025 - 18098878
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099025 gaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 18098926  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18098925 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagtt 18098878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 730 - 956
Target Start/End: Original strand, 82952 - 83175
Alignment:
Q  730 catgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 829  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||       
T  82952 catgtaacgcccgaagctgacgagggcggagagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaa--ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagatt 83048  T
Q  830 gtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccat 929  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  83049 gtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccat 83148  T
Q  930 aagaactccacagttcagcgtgcttga 956  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  83149 aagaactctacagttaagcgtgtttga 83175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Original strand, 1912520 - 1912686
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  | ||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1912520 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatat 1912619  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1912620 caacaagatgcatcttctttt-ggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttg 1912686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 708 - 919
Target Start/End: Original strand, 1953067 - 1953276
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |  | |||||||||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||    
T  1953067 tgtaacgtccccgcttggtgggcatgtagcactcgaggatgatgagggcaaggagtggtccggcttctgaca-gctttt-ggcaaaaccgaatcacatcg 1953164  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1953165 gaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaactagatgcatct 1953264  T
Q  908 tcttttcggtag 919  Q
    |||||| |||||    
T  1953265 tctttttggtag 1953276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882910
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  27882973 aagatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttg 27882910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 798 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 38899058 - 38898897
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38899058 aatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38898959  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38898958 agatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 38898897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Original strand, 1707041 - 1707204
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  | ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1707041 gaatcacatcggaatgagagg-atcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1707139  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  1707140 aagatgcatcttctttttggtagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttga 1707204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 797 - 959
Target Start/End: Original strand, 15619897 - 15620059
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619897 gaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 15619996  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||| ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15619997 aagatacatcttctttttggaaacccaatccataagaactccacaattaagcgtgcttgactt 15620059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 800 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963238
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||   |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30963307 atgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 30963238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 817 - 968
Target Start/End: Original strand, 11394554 - 11394704
Alignment:
Q  817 ggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 916  Q
    ||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394554 ggatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 11394652  T
Q  917 tagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11394653 tagct-attccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 11394704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 723 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 30962111 - 30961858
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 822  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||  ||| |||||| | | |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  30962111 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgtcaagggtggggagtggttcagctcctggca-gcttctaggaaaaatcgaatcacatcagaatgagagagatcc 30962013  T
Q  823 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaagga--------aggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 914  Q
    ||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||        || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30962012 tgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttc 30961913  T
Q  915 ggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||  |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  30961912 ggtagccgaaaccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttagagcaattt 30961858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 807 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963704
Alignment:
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||  |||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30963757 ttctttctggtagcccaaaccataataactccacagttaagcgtgcttgacttg 30963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 800 - 941
Target Start/End: Original strand, 20502023 - 20502165
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctga--ggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20502023 tcacaccggaatgagagggatcccaaaaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaaca 20502122  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  20502123 agatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaacttcaca 20502165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 797 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 18448065 - 18447954
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18448065 gaatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaac 18447966  T
Q  897 aagatgcatctt 908  Q
    ||||||||||||    
T  18447965 aagatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 842 - 961
Target Start/End: Original strand, 13191018 - 13191137
Alignment:
Q  842 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||| |    
T  13191018 gactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataagaactccata 13191117  T
Q  942 gttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||  | |||||||||||||    
T  13191118 gttatgtgtgcttgacttga 13191137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 808 - 960
Target Start/End: Original strand, 8073902 - 8074054
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||| ||||   || || ||||||| ||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8073902 gaatgagagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8074001  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||   ||||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||||    
T  8074002 tctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagccttcttgacttg 8074054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 845 - 960
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15639896
Alignment:
Q  845 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | || |||| |||||||||||| ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  945 cagcgtgcttgacttg 960  Q
     |||||||||||||||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttg 15639896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 809 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181394
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 901  Q
    |||||||||||||| ||| || || | ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 8181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 847 - 968
Target Start/End: Original strand, 16542034 - 16542157
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg-tagctcattccataagaactccacagttc 945  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16542034 catggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaacaagatgtatcttttttttttatagctcattccataaaaactctacagtta 16542133  T
Q  946 agcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |  ||| ||||||| |||||||||    
T  16542134 aatgtgtttgacttggagcaattt 16542157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 849 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924453
Alignment:
Q  849 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac--ctatatcaacaagatgcatcttctttt 913  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttctttt 36924453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 808 - 959
Target Start/End: Original strand, 37552578 - 37552726
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||  ||||||| || | || |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||    
T  37552578 gaatgagaggattcctgagaccatgcaagtatgggactgcatggtcaaacga-gacttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tct 37552674  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  37552675 tctttttggcagcgcattccgtaagaattccacagttaagcatgcttgactt 37552726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 904 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377691
Alignment:
Q  904 atcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattt 32377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 808 - 920
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909214
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||  |||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaact 9909201  T
Q  908 tcttttcggtagc 920  Q
    |||||| ||||||    
T  9909202 tctttttggtagc 9909214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 855 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 26864905 - 26864851
Alignment:
Q  855 aaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 909  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26864905 aaggaaggcttgtaagaactctttggtactacctacatcgacaagatgcatcttc 26864851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 105630 - 105891
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105630 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 105729  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  105730 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 105829  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  105830 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 105891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 35871538 - 35871798
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871538 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 35871637  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35871638 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-t 35871736  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35871737 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 35871798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 706 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 23350515 - 23350252
Alignment:
Q  706 agtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 805  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23350515 agtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 23350416  T
Q  806 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23350415 cggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcat 23350316  T
Q  906 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23350315 cttcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 23350252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 44471555 - 44471294
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44471555 tgtaacacctctgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 44471456  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471455 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44471356  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  44471355 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattt 44471294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 707 - 968
Target Start/End: Original strand, 49998545 - 49998807
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||  | | |||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49998545 gtgtaacgcctccccttggtgggcatgtaaagctcaaggctgatgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatc 49998644  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998645 ggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 49998744  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  49998745 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 49998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 732 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 44471080 - 44470844
Alignment:
Q  732 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 831  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  44471080 tgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgt 44470981  T
Q  832 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  44470980 acaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctgttc-gtaactcattccataa 44470882  T
Q  932 gaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44470881 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 44470844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 12692140 - 12691968
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692140 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12692041  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12692040 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 12691968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 708 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 15306326 - 15306070
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||     
T  15306326 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaaccacatca 15306228  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattg------tttggtactacctatatcaacaagat 901  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||      ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15306227 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagat 15306128  T
Q  902 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15306127 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 15306070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 50398679 - 50398516
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398679 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50398580  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50398579 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttg 50398516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 731 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 14571928 - 14571702
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 830  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  14571928 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 14571829  T
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 930  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||    
T  14571828 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 14571729  T
Q  931 agaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14571728 agaactccacagttaagcgtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 50399134 - 50398971
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50399134 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50399035  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50399034 acgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 50398971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 51331422 - 51331259
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51331422 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 51331323  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51331322 aagatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 51331259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 4127578 - 4127430
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127578 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127479  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttc 945  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttc 4127430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 731 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 14572357 - 14572123
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 830  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14572357 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 14572258  T
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 930  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  14572257 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 14572159  T
Q  931 agaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||    
T  14572158 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattt 14572123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 1645890 - 1645727
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1645890 gaatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaac 1645791  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1645790 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 1645727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 23942930 - 23942767
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23942930 gaatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23942831  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23942830 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 23942767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 24629121 - 24628946
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaa---ggcttataagaattgtttggtactacctatatc 893  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629121 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatc 24629022  T
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24629021 aacaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 24628946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 24629574 - 24629402
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629574 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 24629475  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24629474 aagatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 24629402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127858
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  4127930 aagatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattt 4127858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 3169205 - 3169368
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3169205 gaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 3169304  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3169305 aagatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttg 3169368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 31817993 - 31817830
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31817993 gaatcacatcggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaac 31817894  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  31817893 aagatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttg 31817830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 708 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 27578683 - 27578436
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  27578683 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagcggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaaccgaatcatatca 27578585  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||| ||   |||| | |||  | || || |||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27578584 gaatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgtggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 27578488  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27578487 tcttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcgtgcttgactt 27578436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 814 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 7678746 - 7678591
Alignment:
Q  814 gagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 913  Q
    |||||||| ||||||| |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678746 gagggatcttgaggccttgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 7678647  T
Q  914 cggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  7678646 cggtagcttattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattt 7678591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 797 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 9423999 - 9423840
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9423999 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaac 9423900  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttga 956  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| | |||| || || ||||||||    
T  9423899 aagatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttga 9423840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 53996256 - 53996093
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53996256 gaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaac 53996157  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53996156 aagattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttg 53996093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 792 - 959
Target Start/End: Original strand, 14351789 - 14351956
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  14351789 aaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctata 14351888  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14351889 tcaacaagatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgactt 14351956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 21067281 - 21067444
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21067281 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaac 21067380  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  21067381 aagatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttg 21067444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 29628808 - 29628646
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29628808 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 29628709  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||  |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29628708 aagatgtgtctt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 29628646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 21220472 - 21220300
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21220472 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 21220373  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  21220372 aagatgcatcttctttttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 21220300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 959
Target Start/End: Original strand, 13266002 - 13266247
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||      |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||      
T  13266002 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctggtgaggg-----agtggtccgacttctggcaa-cttctgggcaaaattgaatcacatta 13266095  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13266096 gaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatct 13266195  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    | ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13266196 tattttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgactt 13266247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 708 - 914
Target Start/End: Original strand, 41869830 - 41870034
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| | | |||||| ||| |  |||| ||||| ||  |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41869830 tgtaacgcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctggtgacgggggga-gtggtacgtctcctgtaa-gcttctaggcaaaactaaatcacatcg 41869927  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41869928 gagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatct 41870027  T
Q  908 tcttttc 914  Q
    |||||||    
T  41870028 tcttttc 41870034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 781 - 969
Target Start/End: Original strand, 17028858 - 17029046
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 880  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  17028858 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttagg 17028956  T
Q  881 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaatttc 969  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  17028957 tgctacctatatcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttc 17029046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 864 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814794
Alignment:
Q  864 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gag 962  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  963 caattt 968  Q
    ||||||    
T  50814799 caattt 50814794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 1464146 - 1464318
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | ||||  | ||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1464146 gaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 1464245  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  1464246 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattt 1464318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 772 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 8467963 - 8467777
Alignment:
Q  772 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 871  Q
    |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467963 tcctggca-gcttctaggcaa--ccgaaccacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataaga 8467867  T
Q  872 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8467866 attgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagccc--------agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 8467777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 791 - 960
Target Start/End: Original strand, 17029323 - 17029492
Alignment:
Q  791 aaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 890  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  17029323 aaaactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctat 17029422  T
Q  891 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  17029423 atcaacaagatgcatattacttttggtaccttattccataagaactccacagttaagagtgcttaacttg 17029492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 847 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943220
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttca 946  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  947 gcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttg 23943220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 31817539 - 31817376
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31817539 gaatcacatcgaaataagagggatcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaac 31817440  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    || ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  31817439 aaaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaactctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 792 - 961
Target Start/End: Original strand, 27026498 - 27026665
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  || | | || || |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27026498 aaaccgaatcacatcagaatgagagggatattg-gacggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctata 27026596  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  27026597 tcaacaagatgcatctt-tttttggtagcccattccataagaactacgtagttaagcgtgcttgacttga 27026665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 792 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 13614043 - 13613876
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13614043 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 13613944  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13613943 tcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 13613876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 819 - 961
Target Start/End: Original strand, 21067755 - 21067894
Alignment:
Q  819 atcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggta 918  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||    
T  21067755 atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagataca---tttttttggta 21067851  T
Q  919 gctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21067852 gtccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttga 21067894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 852 - 955
Target Start/End: Original strand, 27029331 - 27029434
Alignment:
Q  852 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27029331 ttgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtg 27029430  T
Q  952 cttg 955  Q
    ||||    
T  27029431 cttg 27029434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 709 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 27579137 - 27578887
Alignment:
Q  709 gtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgg 808  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||  ||| |||||||||  || || || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27579137 gtaacgccttcgtttggtgggcatgtaatgctcgaggctggtgagggtggggagtggtccgactcttgaca-gcttctaggtaaaaccgaatcacatcgg 27579039  T
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    ||| ||||||||| | | | |||  | |||||  ||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  27579038 aataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatctt 27578939  T
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27578938 cttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaacttg 27578887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 847 - 968
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628682
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttca 946  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||| |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  947 gcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattt 17628682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 800 - 968
Target Start/End: Original strand, 4185717 - 4185886
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||| | || ||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  4185717 tcacatcaaaatgagagggttcatgaggccatgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaag 4185816  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  4185817 atgcatcttctttttggtagctcattctacaagaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattt 4185886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 803 - 956
Target Start/End: Original strand, 33764865 - 33765018
Alignment:
Q  803 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 902  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||| | |||||  |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33764865 catcagaatgtgagggatcctgggaccgtgcgtgtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatg 33764964  T
Q  903 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttga 956  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  33764965 catcttcttttttgtagctcattttataagaacttcacacttaagcgtgcttga 33765018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 809 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928933
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  43928992 ctttttggtag-ttatttcataagaaatccacaattaaacgtgcttgactttgagcaattt 43928933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 792 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 52048813 - 52048661
Alignment:
Q  792 aaactgaat-cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 890  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||    
T  52048813 aaactgaattcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtat 52048714  T
Q  891 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |  |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52048713 actaacaagatgcatcttcattt-tgtaagtcattccataagaactccacagtt 52048661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 859 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 23091590 - 23091480
Alignment:
Q  859 aaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  23091590 aaggcgtataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgact 23091491  T
Q  959 tg-agcaattt 968  Q
    || ||||||||    
T  23091490 tgtagcaattt 23091480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 858 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306133
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| | |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgca---tctttttggtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  958 tt-gagcaattt 968  Q
    || |||||||||    
T  20306144 ttggagcaattt 20306133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 800 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 23976357 - 23976244
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||| |  | ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23976357 tcacatcgaaatgagaggtttcctggggccatgtaggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 23976258  T
Q  900 atgcatcttctttt 913  Q
    ||||||||||||||    
T  23976257 atgcatcttctttt 23976244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 807 - 944
Target Start/End: Original strand, 4186176 - 4186313
Alignment:
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    |||||||||||| || | ||||| | || ||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4186176 ggaatgagagggttcgtaaggccatgcacgtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatc 4186275  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  4186276 ttctttttggtagcccattgcataagaactacacagtt 4186313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 802 - 959
Target Start/End: Original strand, 42838628 - 42838787
Alignment:
Q  802 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 901  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||  | ||||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42838628 acatcagaatgagagg-atcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaat 42838726  T
Q  902 gcatctt--cttttcggtagctcattccataagaac-tccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  42838727 gcatctttctttttcgatagttcattccataagaactttcacagttaagcgtgtttgactt 42838787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 804 - 913
Target Start/End: Original strand, 45682209 - 45682318
Alignment:
Q  804 atcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgc 903  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45682209 atcggaatgagagagatcttgaggccatgcatatatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgc 45682308  T
Q  904 atcttctttt 913  Q
    || |||||||    
T  45682309 attttctttt 45682318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 800 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271552
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgta--catgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||| |||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 937  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24271590 agatgcatatt-ttttgggtagcccattccataagaactc 24271552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 797 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 53854948 - 53854858
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacc 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  | ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53854948 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 781 - 968
Target Start/End: Original strand, 17628951 - 17629138
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatc-acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttg 879  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| || ||||| || || |||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  17628951 gcttctaggcaaatc-gaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattgtttg 17629049  T
Q  880 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||||  | ||| || |||| ||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  17629050 gtactacctatactaataagatgcctcttctttttagaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggagcaattt 17629138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 847 - 944
Target Start/End: Original strand, 44831046 - 44831143
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  44831046 catggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagcccatttcatatgaacttcacagtt 44831143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 836 - 932
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392021
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 932  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtagttcagaccataag 53392021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 897
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  802 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 26200444 - 26200287
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaat-cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtt 877  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||  | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26200444 gcttctaggcaaa-ctgaattcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtt 26200346  T
Q  878 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 936  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||  |  |||||||||||    
T  26200345 tgatactaactatacaaacaagatgcatattctttgtggtagccgaaaccataagaact 26200287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 789 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 2682779 - 2682707
Alignment:
Q  789 gcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaag 861  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  2682779 gcaaaattgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaaaccgtgcatgtatgtgattgcatgattgaaggaag 2682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 852 - 936
Target Start/End: Original strand, 34554483 - 34554567
Alignment:
Q  852 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 936  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||    
T  34554483 ttgaaagaatgcttataagaattgtttgacactacctataccagcaagatgcattttatttttggtagaccattccataagaact 34554567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 873 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 39902518 - 39902470
Alignment:
Q  873 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 921  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39902518 ttgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagct 39902470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 797 - 869
Target Start/End: Original strand, 10165953 - 10166025
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataa 869  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10165953 gaatcacatcggaatgagaaagatcatgaggcattgcaggtatgggactgcattgttgaatgaaggcttataa 10166025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 731 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 20309722 - 20309594
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 830  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| |||| | ||||| || || || || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |      
T  20309722 atgtaacaccaaaggctgacgagggcggggattggtctggctcatgaca-gcttctagg--aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgagactt 20309626  T
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 862  Q
    | || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20309625 tgcaggtatgtgactacatggttgaaggaagg 20309594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 914 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 11828509 - 11828463
Alignment:
Q  914 cggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11828509 cggtagctccttccataagaactccacagttaagcgtgctttacttg 11828463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 796 - 850
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477855
Alignment:
Q  796 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatg 850  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgcaagtacgagactgcatg 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 894 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 33294936 - 33294871
Alignment:
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  33294936 aacaaaatgcatcttcttttttgtagttcactccataagaactccacagtaaagcgtgctcgactt 33294871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 781 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 33987227 - 33987183
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgag 826  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33987227 gcttctaggcaaa-ctgaatcacatcggaatgagagggatcatgag 33987183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  805 tcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacta 885  Q
    |||||||||||||||| || |  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 926 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 14571700 - 14571656
Alignment:
Q  926 ccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaatttc 969  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14571700 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttc 14571656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 726 - 767
Target Start/End: Original strand, 27029182 - 27029223
Alignment:
Q  726 tgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 767  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  27029182 tgggcatgtaacacccgaggctgacgagggcggggagtggtc 27029223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10471
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10210 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 10309  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10310 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 10409  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10410 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 10471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 13492699 - 13492960
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13492699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13492798  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492799 gaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13492898  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13492899 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagcaattt 13492960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 16519879 - 16520139
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16519879 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaatcacatcg 16519977  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16519978 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 16520077  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16520078 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 16520139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 723 - 968
Target Start/End: Original strand, 7912235 - 7912481
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 822  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7912235 tggtgggcatgtaacgcccgacgcagatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatct 7912334  T
Q  823 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 922  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7912335 cgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctc 7912434  T
Q  923 attccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  7912435 attccataagaactccatagttaaacgtgcttgacttggagcaattt 7912481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 707 - 968
Target Start/End: Original strand, 9351972 - 9352233
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9351972 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacataatcacatc 9352070  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9352071 gaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatc 9352170  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9352171 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 9352233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 722 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 17731335 - 17731084
Alignment:
Q  722 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 821  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17731335 ttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcggaatgagagggatc 17731236  T
Q  822 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca----agatgcatcttcttttcggt 917  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  17731235 ctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatgcatcttcttttcggt 17731136  T
Q  918 agctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  17731135 agctcattctttaagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagcaattt 17731084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 732 - 968
Target Start/End: Original strand, 7911812 - 7912049
Alignment:
Q  732 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 831  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7911812 tgtaacacccgaggctgatgagagcggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgt 7911911  T
Q  832 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7911912 gcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 7912011  T
Q  932 gaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  7912012 gaactccacagttatgcttgcttgacttggagcaattt 7912049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 703 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13191754 - 13191488
Alignment:
Q  703 gttagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatca 802  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  13191754 gttactgtaatgcctccgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggcgagtagtccggctcttggtatgcttcgaggaaaaactaaatca 13191655  T
Q  803 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 902  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191654 catcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 13191555  T
Q  903 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13191554 catcttcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 13191488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 790 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 17027685 - 17027506
Alignment:
Q  790 caaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027685 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 17027586  T
Q  890 tatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17027585 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 17027506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 20850320 - 20850492
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20850320 gaatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaac 20850419  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20850420 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20850492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20896835 - 20896663
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896835 gaatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20896736  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  20896735 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattt 20896663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 797 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 6331059 - 6330897
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331059 gaatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6330960  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6330959 aatatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 6330897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 23986464 - 23986292
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23986464 gaatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaac 23986365  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  23986364 aagatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattt 23986292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 797 - 959
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311676
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21311614 aagatccatcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgactt 21311676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 797 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 2681363 - 2681206
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2681363 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaac 2681264  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgctt 954  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2681263 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgctt 2681206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 944
Target Start/End: Original strand, 3652485 - 3652632
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3652485 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaac 3652584  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3652585 aagatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagtt 3652632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 795 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20126331 - 20126166
Alignment:
Q  795 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 894  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20126331 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatca 20126232  T
Q  895 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20126231 acaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttg 20126166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 793 - 938
Target Start/End: Original strand, 27334156 - 27334301
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334156 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27334255  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 938  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334256 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 793 - 938
Target Start/End: Original strand, 27394896 - 27395041
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394896 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27394995  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 938  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394996 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 781 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 9440472 - 9440284
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 880  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  9440472 gcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcgg 9440373  T
Q  881 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  9440372 tactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaattt 9440284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 17851373 - 17851536
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17851373 gaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851472  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17851473 aagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttg 17851536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890822
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  2890985 gaatcacattagaatgagagg-atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaa 2890887  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2890886 aagatgcttcttcttttcagtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 2890822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Original strand, 21311966 - 21312133
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21311966 aactgaatcacaccagaatgagagggttcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatat 21312065  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  21312066 caacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaaatccatagttaaacgtgcttgacttg 21312133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Original strand, 23776436 - 23776611
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23776436 aactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatat 23776535  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  23776536 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattt 23776611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 11062285 - 11062447
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||  | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11062285 gaatcacatcgacatgagagg-atcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaac 11062383  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11062384 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 11062447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 17850917 - 17851080
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17850917 gaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaac 17851016  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17851017 aagatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 17851080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 797 - 951
Target Start/End: Original strand, 15929581 - 15929735
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| | ||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15929581 gaatcacatcagaataagagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaac 15929680  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15929681 aaaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtg 15929735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 806 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 2720702 - 2720547
Alignment:
Q  806 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  2720702 cggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacat 2720603  T
Q  906 c-ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2720602 ctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttg 2720547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 792 - 932
Target Start/End: Complemental strand, 31821844 - 31821704
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31821844 aaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactata 31821745  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 932  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31821744 tcaacaagatgcatcttttttttggtagctcattccataag 31821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 859 - 968
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492503
Alignment:
Q  859 aaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  959 t-gagcaattt 968  Q
    | |||||||||    
T  13492493 tggagcaattt 13492503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 797 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771710
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgct 953  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||    |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14771766 aagatccatattctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgct 14771710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 781 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 9440591 - 9440485
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 880  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9440591 gcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttgg 9440492  T
Q  881 tactacc 887  Q
    |||||||    
T  9440491 tactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 33775151 - 33774986
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33775151 gaatcacactggaatgagagtgatcgcgaggccgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaac 33775052  T
Q  897 a--agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  33775051 aagagatgcatcttctttttgatagtccattccataagaactccacagttaagtgtgtttgacttg 33774986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 761 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 9441037 - 9440832
Alignment:
Q  761 agtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaa 860  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| |   ||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  9441037 agtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaactgaatcacatcaaaatagaagggatcctaat--cgtgcaggcatggaactacatggttgaaggaa 9440941  T
Q  861 ggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-tt 959  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||    
T  9440940 tgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacagttaagtgtgtttgacttt 9440841  T
Q  960 gagcaattt 968  Q
    |||||||||    
T  9440840 gagcaattt 9440832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 817 - 937
Target Start/End: Original strand, 15929218 - 15929338
Alignment:
Q  817 ggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 916  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15929218 ggatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttcgg 15929317  T
Q  917 tagctcattccataagaactc 937  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15929318 tagctcattccataagaactc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 799 - 944
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735841
Alignment:
Q  799 atcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 898  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| | ||  | ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  899 gatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||    
T  20735796 gatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaaactccatagtt 20735841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 772 - 968
Target Start/End: Original strand, 32292860 - 32293054
Alignment:
Q  772 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 871  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32292860 tcctggcat-cttctaggcaaaccaaattcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataaga 32292958  T
Q  872 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||| | ||||  |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  32292959 attgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttttagtaacacatt--ataagaactccatagttaagcgaacttgactttgagcaattt 32293054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 836 - 944
Target Start/End: Original strand, 1991591 - 1991699
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1991591 gtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaac 1991690  T
Q  936 tccacagtt 944  Q
    | |||||||    
T  1991691 ttcacagtt 1991699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 732 - 856
Target Start/End: Original strand, 13490055 - 13490179
Alignment:
Q  732 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 831  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  13490055 tgtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgt 13490154  T
Q  832 acatgtatgggactgcatggttgaa 856  Q
     || |||| ||||||||||||||||    
T  13490155 gcaggtataggactgcatggttgaa 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 836 - 960
Target Start/End: Original strand, 20732616 - 20732740
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  20732616 gtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaaaac 20732715  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    || || ||| || ||||||||||||    
T  20732716 tctacggttaagagtgcttgacttg 20732740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 800 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065820
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |   ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  900 atgcatc---ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||   || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  28065882 atgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactt 28065820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 848 - 942
Target Start/End: Original strand, 28583013 - 28583107
Alignment:
Q  848 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacag 942  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28583013 atggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacag 28583107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 792 - 957
Target Start/End: Original strand, 12194324 - 12194487
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||| | || ||||| |||| |||||    
T  12194324 aaaccgaatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcagatatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctata 12194421  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  12194422 tcaacaagatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacagttaagcatgtttgac 12194487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 897 - 968
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780281
Alignment:
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 28780281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 797 - 939
Target Start/End: Original strand, 17205338 - 17205479
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |    |||||  |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17205338 gaatcacatcggaattagagggattttgagaccatggtggtatgaaactgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaac 17205437  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcca 939  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17205438 aagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaactcca 17205479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 800 - 870
Target Start/End: Original strand, 3652981 - 3653051
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataag 870  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3652981 tcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 837 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3885065
Alignment:
Q  837 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 936  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||   |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaataca---tctttttggtagcttattccataagaact 3885098  T
Q  937 ccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
     || |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3885097 tcaaagttgaacgtgcttgacttggagcaattt 3885065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 836 - 941
Target Start/End: Original strand, 10964342 - 10964447
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  10964342 gtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaaaac 10964441  T
Q  936 tccaca 941  Q
    ||||||    
T  10964442 tccaca 10964447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 836 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 30729947 - 30729814
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||| |||||   |||| ||||||||    
T  30729947 gtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtagtcaattctataagaac 30729848  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttg-acttgagcaattt 968  Q
    |  | |||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  30729847 tttatagttaagcgttcttgaatttgagcaattt 30729814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 842 - 959
Target Start/End: Original strand, 33470882 - 33470998
Alignment:
Q  842 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33470882 gacttcatggttaaaggaagacttattaga-ttacttggtattacctatactaacaagatgcatattcttttttgtagttcattacataagaattccaca 33470980  T
Q  942 gttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||  ||||| |||||||    
T  33470981 gttatgcgtgtttgactt 33470998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 809 - 883
Target Start/End: Original strand, 9441061 - 9441135
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtac 883  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9441061 aatgagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 722 - 767
Target Start/End: Original strand, 21311871 - 21311916
Alignment:
Q  722 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtc 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21311871 ttggtgggcatgtaacacccaaggctgacgagggcgggaagtggtc 21311916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 31284512 - 31284251
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284512 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtatcgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 31284413  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284412 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 31284313  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31284312 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 31284251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 734 - 968
Target Start/End: Original strand, 8067216 - 8067451
Alignment:
Q  734 taacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtac 833  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8067216 taacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgc 8067315  T
Q  834 atgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 933  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8067316 aggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataaga 8067415  T
Q  934 actccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8067416 actccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 8067451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 711 - 961
Target Start/End: Original strand, 41472214 - 41472463
Alignment:
Q  711 aacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaa 810  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41472214 aacgcctctgattggtgggcatgtaacgcccaaggctgaagagggtggtgagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaa 41472313  T
Q  811 tgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 910  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41472314 tgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaa-gcttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttct 41472412  T
Q  911 tttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41472413 tttcggtagatcattccataagaactccacggttaaacgtgcttgacttga 41472463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 732 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 27187542 - 27187305
Alignment:
Q  732 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 831  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27187542 tgtaacgcccgaggctgatgagggcggcaagtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgt 27187443  T
Q  832 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187442 gcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataa 27187343  T
Q  932 gaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27187342 gaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 27187305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Original strand, 25248021 - 25248273
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| ||| ||||   ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248021 tgtaacgcctccgcttgatgggttagtaacgcccgaggctaatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatcg 25248120  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248121 gaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 25248220  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25248221 tctttttggtagcccattccataataactccacggttcagcgtgcttgacttg 25248273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Original strand, 28561741 - 28561917
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28561741 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 28561840  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28561841 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 28561917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Original strand, 7493792 - 7494043
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  7493792 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccggcttctggcg-gcttctaggcaaaacataatcacatcg 7493890  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7493891 gaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatct 7493990  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7493991 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttg 7494043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 708 - 959
Target Start/End: Original strand, 7477102 - 7477352
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  7477102 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 7477200  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||| | | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7477201 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 7477300  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  7477301 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgactt 7477352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 16811380 - 16811552
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16811380 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaac 16811479  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16811480 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 16811552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Original strand, 39653159 - 39653335
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39653159 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatat 39653258  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  39653259 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattt 39653335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Original strand, 41473907 - 41474159
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41473907 tgtaacgcctccgcttgatgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcg 41474006  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
     ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |    
T  41474007 aaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatat 41474106  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  41474107 tctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagcgtgcttgacttg 41474159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 806 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11180009
Alignment:
Q  806 cggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  906 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11180072 cttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 11180009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 14813948 - 14814120
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14813948 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaat 14814047  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14814048 aagatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 14814120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 50347745 - 50347917
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50347745 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 50347844  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50347845 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 50347917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13150246 - 13150074
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13150246 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 13150147  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13150146 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 13150074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Original strand, 30529682 - 30529849
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30529682 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatat 30529781  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  30529782 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttg 30529849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 32227368 - 32227196
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32227368 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227269  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32227268 aagatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 32227196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 32227500 - 32227671
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32227500 gaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaac 32227598  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32227599 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 32227671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 39640936 - 39641099
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  39640936 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaat 39641035  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39641036 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 39641099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25230394 - 25230232
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25230394 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25230295  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25230294 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttg 25230232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25237981 - 25237819
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25237981 aatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaaca 25237882  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25237881 agatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttg 25237819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 16810924 - 16811096
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  16810924 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctac 16811023  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg-agcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  16811024 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattt 16811096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 842 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13150656 - 13150529
Alignment:
Q  842 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150656 gactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 13150557  T
Q  942 gttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13150556 gttaagcgtgcttgacttggagcaattt 13150529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25230851 - 25230689
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230851 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25230752  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25230751 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttg 25230689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25238438 - 25238276
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238438 aatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 25238339  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25238338 agatgcattttctttttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttg 25238276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 836 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 32386842 - 32386709
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32386842 gtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattccataagaac 32386743  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32386742 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 32386709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 708 - 864
Target Start/End: Original strand, 12820554 - 12820710
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12820554 tgtaacgctcccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 12820653  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggct 864  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12820654 gaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaagaaaggct 12820710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 14820153 - 14820316
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14820153 gaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaac 14820252  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14820253 aagatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 14820316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20885263 - 20885101
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20885263 aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 20885164  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20885163 agatgcatcttctttttagtagcacattccataagaactccacaattaagcgtgcttgacttg 20885101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 2911094 - 2911257
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  2911094 gaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaac 2911193  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2911194 aagatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 2911257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 37045034 - 37045197
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37045034 gaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaac 37045133  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37045134 aaggtgcatcttctttttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 37045197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 797 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239070
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25239124 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtg 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 707 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 32388968 - 32388848
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32388968 gtgtaacgcctccgcttagtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatc 32388869  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgagg 827  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32388868 ggaatgagagggatcctgagg 32388848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 850 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067344
Alignment:
Q  850 ggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcg 949  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  950 tgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||    
T  4067354 tgcttgacttg 4067344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 842 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25238786 - 25238668
Alignment:
Q  842 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25238786 gactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccaca 25238687  T
Q  942 gttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25238686 gttaagcgtgcttgacttg 25238668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 807 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25802685 - 25802532
Alignment:
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||| || |||| |  | ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25802685 ggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 25802586  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  25802585 ttcttttcgatagcccattccataagaaatccacagttaagcgtgtttgacttg 25802532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 797 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796936
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |  | |||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 943  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32796982 aagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagt 32796936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 800 - 968
Target Start/End: Original strand, 29224326 - 29224495
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||||| |  |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  29224326 tcacatcagaatgaaagggttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 29224425  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  29224426 atgcatcttcttttcggtagcccaaaccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattt 29224495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 25803151 - 25802988
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| | | |||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25803151 gaatcatatcggaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaac 25803052  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  25803051 aagatgtatcttcttttcggtatcccatttcataagaactccgtagttaagcgtgcttgacttg 25802988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 809 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 31104095 - 31103961
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    ||||| ||||||| | |||  ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  31104095 aatgatagggatcttaaggttgtacaggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcatttt 31103996  T
Q  909 cttttcggtag--ctcattccataagaactccaca 941  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  31103995 ctttttggtagctctcattccataagaacttcaca 31103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 845 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309989
Alignment:
Q  845 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 866 - 968
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3899971
Alignment:
Q  866 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagca 964  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  | | ||   ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagca 3899967  T
Q  965 attt 968  Q
    ||||    
T  3899968 attt 3899971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 866 - 914
Target Start/End: Original strand, 3890046 - 3890094
Alignment:
Q  866 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttc 914  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3890046 ataagaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatctttttttc 3890094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 831 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 47518432 - 47518330
Alignment:
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 930  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||| || ||    |||||||||||||||    
T  47518432 tacaggtatggaattgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcattttttta---gtagctcattccata 47518336  T
Q  931 agaact 936  Q
    | ||||    
T  47518335 ataact 47518330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392632
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 15392632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405668
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 15405668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411077
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 15411077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417493
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 15417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 887 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 53150869 - 53150787
Alignment:
Q  887 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  53150869 ctatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattt 53150787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388265
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 15388265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 888 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 43736777 - 43736731
Alignment:
Q  888 tatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaa 934  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  43736777 tatatcaacaatatgcatcttcttgttggtagctcatttcataagaa 43736731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 723 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 13150343 - 13150302
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtg 764  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  13150343 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 13150302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 856 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 25238845 - 25238816
Alignment:
Q  856 aggaaggcttataagaattgtttggtacta 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238845 aggaaggcttataagaattgtttggtacta 25238816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 707 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13125373 - 13125111
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13125373 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggcggatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatc 13125274  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13125273 ggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatc 13125174  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13125173 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 13125111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 708 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 11517624 - 11517389
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517624 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggttgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 11517525  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517524 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatgg-tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 11517426  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11517425 acttttcggtagctcattccataagaactccgcagtt 11517389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 708 - 958
Target Start/End: Original strand, 9124869 - 9125119
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124869 tgtaacgccttcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 9124968  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124969 gaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 9125068  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9125069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 9125119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Original strand, 42515002 - 42515254
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515002 tgtaacgtctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 42515101  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42515102 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 42515201  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42515202 tctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 42515254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 707 - 968
Target Start/End: Original strand, 18833195 - 18833457
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18833195 gtgtaacgcccccgcttggtgggcatgtaacgctcagggctgatgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 18833294  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18833295 ggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatc 18833394  T
Q  907 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18833395 ttcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagcgtgtttgactttgagcaattt 18833457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 732 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 2941969 - 2941732
Alignment:
Q  732 tgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgt 831  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || | ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2941969 tgtaacgcccaaggctgatgagggcgaggagtggcccggctcccgccatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgt 2941870  T
Q  832 acatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2941869 acaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 2941770  T
Q  932 gaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2941769 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2941732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 28495853 - 28496025
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28495853 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaac 28495952  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28495953 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 28496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 42515543 - 42515715
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42515543 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaac 42515642  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42515643 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 42515715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 5406823 - 5406563
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||  |||||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5406823 tgtaacgcctccgcttcgtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcatgaca-gcttctaagcaaaactgaatcacatcg 5406725  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||| ||||||||| | | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5406724 gaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 5406625  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    | |||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5406624 tatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 5406563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 6719221 - 6719058
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719221 gaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6719122  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6719121 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttg 6719058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 2193255 - 2193427
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193255 gaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2193354  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  2193355 aagatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattt 2193427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 34405738 - 34405566
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34405738 gaatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 34405639  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34405638 aggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 34405566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 722 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 13124923 - 13124757
Alignment:
Q  722 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13124923 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatc 13124824  T
Q  822 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacct 888  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13124823 ttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 2189143 - 2189315
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2189143 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaac 2189242  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2189243 aagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2189315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422423
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36422351 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 36422423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425903
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46425840 aagatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 46425903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 795 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 6747747 - 6747583
Alignment:
Q  795 ctgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 894  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747747 ctgaatcacattggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatca 6747648  T
Q  895 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6747647 acaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgactt 6747583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495583
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28495655 aagatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 28495583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Original strand, 679812 - 679978
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  679812 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatat 679910  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  679911 caacaagatgcatattctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 679978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 838 - 968
Target Start/End: Original strand, 2465773 - 2465904
Alignment:
Q  838 atgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 937  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2465773 atgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 2465872  T
Q  938 cacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2465873 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2465904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 836 - 969
Target Start/End: Original strand, 2465962 - 2466096
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2465962 gtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 2466061  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaatttc 969  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2466062 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttc 2466096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 756 - 960
Target Start/End: Original strand, 25182320 - 25182523
Alignment:
Q  756 cgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttga 855  Q
    |||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||    
T  25182320 cggggagtggtcaggctcctagca-gcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttga 25182418  T
Q  856 aggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttg 955  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  25182419 aggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagtgtgtttg 25182518  T
Q  956 acttg 960  Q
    |||||    
T  25182519 acttg 25182523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35474105
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35474168 aagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 35474105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 2611803 - 2611636
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2611803 aactgaatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataa 2611704  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2611703 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttg 2611636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 35527268 - 35527105
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35527268 gaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaac 35527169  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35527168 aagatgcatattcttttcagtagtccattccataggaactccacagttaagcatgcttgacttg 35527105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 793 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 29357606 - 29357441
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29357606 aactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatat 29357508  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  29357507 caacaagatgcatcttcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagttaaccgtgtttgactt 29357441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 792 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 29039172 - 29039004
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29039172 aaaccgaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctata 29039073  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  29039072 tcaacaacatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttg 29039004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 22529382 - 22529219
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  22529382 gaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaac 22529283  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  22529282 aagatgcatcttcttttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttg 22529219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 741 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 31406787 - 31406574
Alignment:
Q  741 cgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtat 839  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| | | || ||| | |||||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  | |    
T  31406787 cgaggctgatgagggcggggagtggttcagctcttggaa-gcttctaaacaaaaatcgaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatct 31406689  T
Q  840 gggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcca 939  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31406688 gggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactcca 31406589  T
Q  940 cagttcagcgtgctt 954  Q
    ||||| |||||||||    
T  31406588 cagttaagcgtgctt 31406574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 822 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 26421882 - 26421753
Alignment:
Q  822 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 921  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  26421882 ctgaggccgtgcatgtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcc 26421783  T
Q  922 cattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26421782 cattccataagaactacacagttaagcgtg 26421753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 792 - 960
Target Start/End: Original strand, 9623202 - 9623369
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9623202 aaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctata 9623301  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9623302 tcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccacagttaagcgtgtttgacttg 9623369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 786 - 934
Target Start/End: Complemental strand, 31743982 - 31743834
Alignment:
Q  786 taggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacta 885  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||   ||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  31743982 taggaaaaactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgcta 31743883  T
Q  886 cctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaa 934  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31743882 tctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 798 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 36015557 - 36015411
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||| || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36015557 aatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaaca 36015458  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36015457 agatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagtt 36015411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 797 - 919
Target Start/End: Original strand, 43233412 - 43233534
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43233412 gaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaac 43233511  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtag 919  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  43233512 aagatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 800 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 26421449 - 26421305
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||||||| |  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26421449 tcacatcagaatgatagggttcttgaggccatgtaggtatgggtcagtatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaag 26421350  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26421349 atgcatatttttttcggtagtccattccataagaactccacagtt 26421305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 797 - 898
Target Start/End: Complemental strand, 26957704 - 26957603
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957704 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 26957605  T
Q  897 aa 898  Q
    ||    
T  26957604 aa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 802 - 944
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966197
Alignment:
Q  802 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 901  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |  | ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  902 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20966155 gtatattattttcggtagctcattccataagaacttcacagtt 20966197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 882 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122480
Alignment:
Q  882 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattt 13122480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 801 - 944
Target Start/End: Original strand, 1628719 - 1628859
Alignment:
Q  801 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 900  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1628719 cacattggaatgagagggatgttgaagccgtgcagatatgggattgcatggttgaagaaaggcttataa---ttgtttggtactatcgatatcaacaaga 1628815  T
Q  901 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  1628816 tgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactccatagtt 1628859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 848 - 944
Target Start/End: Original strand, 11372501 - 11372597
Alignment:
Q  848 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11372501 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatgatgcatgttatttttggtagctcaaaccataagaactccaaagtt 11372597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 894 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646453
Alignment:
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 7646453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 847 - 936
Target Start/End: Original strand, 16192368 - 16192457
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 936  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16192368 catgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataagaact 16192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 797 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 3305459 - 3305374
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggta 882  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3305459 gaatcacatcgaaatgagggggatcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttggta 3305374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 897 - 968
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646586
Alignment:
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 7646586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 842 - 959
Target Start/End: Original strand, 37672204 - 37672321
Alignment:
Q  842 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 941  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| | ||||    
T  37672204 gactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttttgttagttgatttcataagaaatacaca 37672303  T
Q  942 gttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  37672304 gttaagcgtgtttgactt 37672321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 912 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 43776322 - 43776265
Alignment:
Q  912 ttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43776322 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 43776265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 870 - 951
Target Start/End: Complemental strand, 7461424 - 7461344
Alignment:
Q  870 gaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtg 951  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7461424 gaattgtttgatactaactatataaacaagatacatcttctttttggtagttcatt-cataagaactctacagttaagcgtg 7461344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 895
Target Start/End: Original strand, 2490077 - 2490136
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 895  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2490077 gtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 800 - 959
Target Start/End: Original strand, 11372901 - 11373060
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||| |  | ||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || || ||||| |||||||    
T  11372901 tcacatcaaaatgagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaag 11373000  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||  |||||||||  |||||  |  ||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  11373001 atgagtcttctttttcgtagcctaaaccataagaactacacaattaagtgtgcttgactt 11373060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 792 - 961
Target Start/End: Original strand, 33316721 - 33316886
Alignment:
Q  792 aaactgaatc-acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 890  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||| |||    
T  33316721 aaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttat 33316820  T
Q  891 atcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||     ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  33316821 atcaacaagatg-----tcttttcggtagcccaaactataagaactccacaattaaacgtgtttgacttga 33316886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 845 - 898
Target Start/End: Original strand, 6585655 - 6585708
Alignment:
Q  845 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 898  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6585655 tgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaa 6585708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 836 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 16811954 - 16811900
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctat 890  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16811954 gtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtactatctat 16811900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 800 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 37671900 - 37671736
Alignment:
Q  800 tcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||   |||||| |||||||| || ||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37671900 tcacaccggaatgagagggatcttgataccgtgtgtgtatgtgactgcattgtggaatgaagatttataaaaattg-ttggtactacctatgccaacaag 37671802  T
Q  900 atgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    || |||    |||| || | |||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||    
T  37671801 atacat----tttttggcaactcatttcatatgaaatccacatttaagcgtgcttgaattggagcaattt 37671736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 34308715 - 34308454
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308715 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgataagggcggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34308616  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34308615 gaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34308516  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  34308515 tcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttggcttggagcaattt 34308454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 34309175 - 34308910
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34309175 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34309076  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacct----atatcaacaagatgc 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  34309075 gaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatgc 34308976  T
Q  904 atcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  34308975 atcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagttaagcgtgcttggcttggagcaattt 34308910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 25147446 - 25147707
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25147446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 25147545  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| |||||| || | ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25147546 gaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 25147645  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  25147646 tcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatcgtgcttgacttggagcaattt 25147707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 12100602 - 12100862
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12100602 tgtaacgcctccgctcggtgtgcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 12100701  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12100702 aaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatgcatct 12100800  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12100801 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 12100862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Original strand, 25144682 - 25144943
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| || ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25144682 tgtaacacccccgcttggtaggcatgtaacgttcgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatca 25144781  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25144782 gaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatct 25144881  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25144882 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 25144943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 723 - 968
Target Start/End: Original strand, 25147892 - 25148138
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcc 822  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25147892 tggtgggcatgtaacgctcgagtatgatgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcc 25147991  T
Q  823 tgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 922  Q
     |||| |||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25147992 cgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctc 25148091  T
Q  923 attccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25148092 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 25148138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 21316345 - 21316093
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  21316345 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatcg 21316246  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
      |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21316245 cgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcg 21316146  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21316145 tcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagtgtgcttgacttg 21316093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 797 - 958
Target Start/End: Original strand, 10844882 - 10845043
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844882 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 10844981  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10844982 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 27925898 - 27926070
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27925898 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaac 27925997  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27925998 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 27926070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 22026378 - 22026541
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026378 gaatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22026477  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22026478 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 22026541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 801 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844598
Alignment:
Q  801 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 900  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  901 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 10844598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 803 - 968
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103252
Alignment:
Q  803 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 902  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  903 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17103186 catcttcttttcggtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattt 17103252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 705 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 27819484 - 27819231
Alignment:
Q  705 tagtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcaca 804  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||   ||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  27819484 tagtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaaggctcgaggttgatgagggtaggaagtggtccgactcctggaa-gcttttaggcaaaaccgaatcaca 27819386  T
Q  805 tcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca 904  Q
    || |||||||||||||| ||| | | | || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27819385 tcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgca 27819286  T
Q  905 tcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  27819285 tcttcttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactt 27819231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 12827401 - 12827229
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12827401 gaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 12827302  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12827301 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 12827229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 22549142 - 22548970
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549142 gaatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 22549043  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22549042 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 22548970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 798 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 22548695 - 22548524
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548695 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22548596  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22548595 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 22548524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 27022485 - 27022313
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022485 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 27022386  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27022385 aacatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 27022313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 41659252 - 41659080
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659252 gaatcacaccggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 41659153  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  41659152 aagatgcatcttcttttcgatagctcattacataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 41659080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 8080493 - 8080326
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8080493 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatat 8080394  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8080393 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttg 8080326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 32292396 - 32292559
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32292396 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaac 32292495  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32292496 aagttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 32292559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 2044057 - 2044220
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2044057 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaac 2044156  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2044157 aagatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttg 2044220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464894
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6464957 aagatgcattttctttttggtagctcattccataacaactccacagttaagcgtgcttgacttg 6464894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 707 - 908
Target Start/End: Original strand, 22705089 - 22705282
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||           
T  22705089 gtgtaacgcctccgctcggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggtcaggctcctggca-gcttcaaggcaaaaccgaa------- 22705180  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 22705280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 809 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 28375189 - 28375042
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28375189 aatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatctt 28375090  T
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttga 956  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || || |||| |||||||||||    
T  28375089 cttttcggtagctctttccataacagcttcatagttaagcgtgcttga 28375042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 33852409 - 33852242
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33852409 aactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 33852310  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  33852309 taacaagatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttg 33852242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 793 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 22840680 - 22840530
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  | ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22840680 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatat 22840581  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 943  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840580 caacaagatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccacagt 22840530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 794 - 960
Target Start/End: Original strand, 28453334 - 28453500
Alignment:
Q  794 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatc 893  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  28453334 actgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatatt 28453433  T
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28453434 aacaagatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttg 28453500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 836 - 961
Target Start/End: Original strand, 41913008 - 41913133
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41913008 gtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattccataagaac 41913107  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41913108 tccgcagttaagcgtgcttgacttga 41913133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 808 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 27022015 - 27021904
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27022015 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27021916  T
Q  908 tcttttcggtag 919  Q
    ||||||||||||    
T  27021915 tcttttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 801 - 968
Target Start/End: Original strand, 3745104 - 3745272
Alignment:
Q  801 cacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 900  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  3745104 cacatcgaaatgagagggatcctaaggtcgtgcaggctaaggactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaata 3745203  T
Q  901 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3745204 tgcatcttctttttggtagcccattccataataactccacagtcaagcgtgcttgacttagagcaattt 3745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 876 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283626
Alignment:
Q  876 tttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaattt 31283626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 792 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 15567708 - 15567540
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  || ||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15567708 aaactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatata 15567609  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  15567608 ccaacaagatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaatcgtgtttgacttg 15567540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334891
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || |||| |  ||| |||||||||    
T  30334955 aagatacatcttcttttcgatagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttga 30334891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 847 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 15819112 - 15819022
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 937  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15819112 catggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactc 15819022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 836 - 937
Target Start/End: Original strand, 3744676 - 3744777
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  3744676 gtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacatttcataagaac 3744775  T
Q  936 tc 937  Q
    ||    
T  3744776 tc 3744777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 793 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 30527630 - 30527482
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  30527630 aactgaatcacactggaatgagagggattccgaggccgtac--gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacat 30527534  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30527533 caataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaactccacagtt 30527482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 836 - 961
Target Start/End: Original strand, 1297045 - 1297170
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  1297045 gtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatataagaac 1297144  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||    
T  1297145 tccatagttaagtgtgtttgacttga 1297170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 798 - 909
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429611
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  898 agatgcatcttc 909  Q
    ||||| ||||||    
T  17429600 agatgtatcttc 17429611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 810 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15568036
Alignment:
Q  810 atgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 909  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatcttt 15568040  T
Q  910 tttt 913  Q
    ||||    
T  15568039 tttt 15568036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 798 - 908
Target Start/End: Original strand, 6466711 - 6466820
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| | || |  |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6466711 aatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcgggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaaattgtttggtactacctataccaaca 6466809  T
Q  898 agatgcatctt 908  Q
    |||||||||||    
T  6466810 agatgcatctt 6466820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 793 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 29971552 - 29971450
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29971552 aactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatat 29971453  T
Q  893 caa 895  Q
    |||    
T  29971452 caa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 796 - 961
Target Start/End: Original strand, 6466255 - 6466419
Alignment:
Q  796 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 895  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||   || ||||||||||||| |||| || || | |  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  6466255 tgaatcacatcagaatgagaggaattctgagagagtgcatgtatgggactacatgtttaaaagtatactaatatgaattgtttggtactacttataccaa 6466354  T
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||  |||  | |||||||||||||    
T  6466355 caagttgcatcttccttttggtag-tcatttcataagaaatccattgttaggtgtgcttgacttga 6466419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 708 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 31283432 - 31283356
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgctt 784  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  31283432 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctagcatgctt 31283356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 708 - 854
Target Start/End: Original strand, 9250913 - 9251057
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||   |||||||||||| | || | ||||||| |  |||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||     
T  9250913 tgtaacacctccgcttggtggatatgtaacgttcgaggctgatgaaggcgaggagtggtctgcctcctagcaa-cttttaggcaaaaccgaatcacatca 9251011  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttg 854  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  9251012 gaatgagagggatcctgaagcc-tagaggtatgggactgcatggttg 9251057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 843 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 36968496 - 36968434
Alignment:
Q  843 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36968496 actgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcat 36968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 894 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729669
Alignment:
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||    
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttga 10729669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 887 - 960
Target Start/End: Original strand, 25307855 - 25307926
Alignment:
Q  887 ctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25307855 ctatatcaacaagatacatctttttt--ggtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttg 25307926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 843 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 28912951 - 28912850
Alignment:
Q  843 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacag 942  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||| |||| | || | ||||| |||| ||||||||||    
T  28912951 actgcatgattgaaagaagtcatataagaattgtctgatattatctgtatcgacaagatgcatcttatttttgatatcccattctataataactccacag 28912852  T
Q  943 tt 944  Q
    ||    
T  28912851 tt 28912850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 792 - 862
Target Start/End: Original strand, 25307759 - 25307829
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 862  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25307759 aaactgaatcacactggaatgagagcgattccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagg 25307829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 855 - 892
Target Start/End: Original strand, 3508790 - 3508827
Alignment:
Q  855 aaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3508790 aaggaaggtttataagaattatttggtactacctatat 3508827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 162914 - 162662
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  162914 tgtaacgcctcctcttggtggacatgtaatgcccgaggctgatgagggtggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatcg 162815  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162814 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 162715  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  162714 tcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttg 162662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 781 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 69978 - 69801
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgg 880  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||  ||||||||||||||| || |  | || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  69978 gcttctaggtaaagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttgg 69879  T
Q  881 tactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  69878 tactacctatatcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactccacagttatgcgggcttgact 69801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 897 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 163109
Alignment:
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 163109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 894 - 968
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163242
Alignment:
Q  894 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 163242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 7e-95; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 708 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 35759844 - 35759592
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35759844 tgtaacgcctccacttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgacggcggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 35759745  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759744 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 35759645  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  35759644 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttgacttg 35759592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 722 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 20061413 - 20061191
Alignment:
Q  722 ttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20061413 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatc 20061314  T
Q  822 ctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 921  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061313 ctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 20061214  T
Q  922 cattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20061213 cattccataagaactccacagtt 20061191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 708 - 944
Target Start/End: Original strand, 2328225 - 2328461
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2328225 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattg 2328324  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2328325 gaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 2328424  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagtt 944  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2328425 tctttttggtagcacattccataagaactccacagtt 2328461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 710 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 35761148 - 35760889
Alignment:
Q  710 taacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcgga 809  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35761148 taacgcctccgcttggtgggtatgtaacgtccgaggctgatgagggtggcgagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcgga 35761049  T
Q  810 atgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 909  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35761048 atgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 35760949  T
Q  910 ttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35760948 tttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 35760889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20054683 - 20054511
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054683 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054584  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20054583 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20054511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20055139 - 20054967
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055139 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055040  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20055039 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20054967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20055595 - 20055423
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055595 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055496  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20055495 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20055423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20056051 - 20055879
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056051 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20055952  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20055951 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20055879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20056507 - 20056335
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056507 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20056408  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20056407 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20056335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20057410 - 20057238
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057410 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20057311  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20057310 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20057238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 731 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 46693950 - 46693710
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaact-gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 829  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  || || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  46693950 atgtaacacccgaggctgatgagggctaggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtc 46693851  T
Q  830 gtacatgtatgggactgc-atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcca 928  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  46693850 gtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttca 46693751  T
Q  929 taagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46693750 taataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 46693710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 797 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 20054227 - 20054066
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054227 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20054128  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20054127 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 20054066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 793 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20057870 - 20057694
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057870 aactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 20057771  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20057770 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 20057694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 38340905 - 38341077
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38340905 gaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 38341004  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38341005 aagatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 38341077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20845808 - 20845645
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20845808 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaac 20845709  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20845708 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 20845645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 50002432 - 50002260
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50002432 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaac 50002333  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  50002332 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggagcaattt 50002260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 43057670 - 43057507
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43057670 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaac 43057571  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43057570 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttg 43057507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 16452080 - 16451908
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16452080 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16451981  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16451980 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 16451908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 16461233 - 16461061
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16461233 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 16461134  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16461133 aagatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 16461061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002682
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  50002754 aagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 50002682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Original strand, 52250205 - 52250369
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52250205 gaatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 52250304  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250305 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 52250369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 808 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 51373010 - 51372849
Alignment:
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 51372849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 50003222 - 50003050
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50003222 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaac 50003123  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50003122 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 50003050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 782 - 960
Target Start/End: Original strand, 2634909 - 2635086
Alignment:
Q  782 cttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggt 881  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  2634909 cttctaggcaaatc-gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggt 2635007  T
Q  882 actacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2635008 actacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttg 2635086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 836 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 20056924 - 20056791
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056924 gtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 20056825  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20056824 tccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 20056791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 797 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 43057211 - 43057050
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43057211 gaatcacatcagaatgag-gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaac 43057113  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43057112 aagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgactt 43057050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 797 - 961
Target Start/End: Original strand, 12883523 - 12883687
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12883523 gaatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 12883622  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||    
T  12883623 aagatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttga 12883687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 716 - 960
Target Start/End: Original strand, 23180649 - 23180892
Alignment:
Q  716 ctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgaga 815  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| | |||| |||||||||  |||| | | |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  23180649 ctccgcttggtgggcatgtaacgctcgtggctgatgaaggcggggagtggtccgactcctagta-gcttataggaaaaattgaatcacattggaatgaga 23180747  T
Q  816 gggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcg 915  Q
    |||||| ||| |||||  | | |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23180748 gggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcg 23180847  T
Q  916 gtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23180848 ctagcccattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttg 23180892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 30873097 - 30872934
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30873097 gaatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaac 30872998  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  30872997 aagatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttg 30872934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 853 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060324
Alignment:
Q  853 tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgc 952  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  953 ttgacttg 960  Q
    ||||||||    
T  20060331 ttgacttg 20060324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 798 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822647
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  898 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  31822709 atatgcatcttcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttg 31822647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 12727990 - 12728154
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggt-actacctatatcaa 895  Q
    ||||||||| | ||||| |||||| ||||| | ||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12727990 gaatcacattgaaatgaaagggattctgagactgtgtaggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaa 12728089  T
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12728090 caagatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttg 12728154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 792 - 960
Target Start/End: Original strand, 7548085 - 7548253
Alignment:
Q  792 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  7548085 aaactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactata 7548184  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  7548185 tcaacaagatgcatattctttttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttg 7548253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 772 - 968
Target Start/End: Original strand, 16907210 - 16907405
Alignment:
Q  772 tcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataaga 871  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||  ||||||||||||  |||| | || || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16907210 tcctggca-gcttctaggcaaacca-aatcatatcaaaatgagagggattttgagactgtgcaggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataaga 16907307  T
Q  872 attgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  16907308 attgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattt 16907405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 10820591 - 10820756
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10820591 gaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaat 10820690  T
Q  897 aagatgcatc--ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||| ||||  || |||||| |  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  10820691 aagatacatctttttttttcgatgactcatttcataagaaattcacagttaagcgtgcttgacttg 10820756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 781 - 960
Target Start/End: Original strand, 2634449 - 2634628
Alignment:
Q  781 gcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagaggg-atcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttg 879  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||  ||||||| || |||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  2634449 gcttctagg-aaaaccgaatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttg 2634547  T
Q  880 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  2634548 gtactagctatacaaacaagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttg 2634628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 896 - 961
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250706
Alignment:
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 52250706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 896 - 961
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251043
Alignment:
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttga 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttga 52251043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 836 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 16440687 - 16440565
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 935  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  16440687 gtatgggaatacatggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagctcattctataataac 16440588  T
Q  936 tccacagttcagcgtgcttgact 958  Q
    | || |||| || ||| ||||||    
T  16440587 ttcaaagttaagtgtgattgact 16440565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 867 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823097
Alignment:
Q  867 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataa 931  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagctcattccataa 31823097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 809 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 843068 - 842918
Alignment:
Q  809 aatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 908  Q
    ||||||||||||| ||||  |||  | ||||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||    
T  843068 aatgagagggatcatgagatcgtgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtactatccattccaacaagatgcatgtt 842969  T
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt 959  Q
    ||||| | ||| || |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  842968 ctttttgatagatcgtcacataagaactcaacagttgaacgtgcttgactt 842918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 836 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410747
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagc 16410747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 880 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 7230007 - 7229918
Alignment:
Q  880 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||| || ||||||| |||||||||    
T  7230007 gtactaactatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattt 7229918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 913
Target Start/End: Original strand, 2739560 - 2739637
Alignment:
Q  836 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 913  Q
    ||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2739560 gtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttctttt 2739637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 43057309 - 43057266
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggt 766  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  43057309 tggtgggcatgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggt 43057266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 922 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 35010018 - 35009980
Alignment:
Q  922 cattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35010018 cattccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttg 35009980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 867 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 46411211 - 46411173
Alignment:
Q  867 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 905  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46411211 taagaattatttggtactacctatatcaataagatgcat 46411173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 708 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2185
Alignment:
Q  708 tgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 807  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2446 tgtaatgcctccgcttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2347  T
Q  808 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 907  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2346 gaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2247  T
Q  908 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2246 tcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2608 - 2555
Alignment:
Q  706 agtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggg 759  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2608 agtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggg 2555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 167; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 707 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 142511 - 142305
Alignment:
Q  707 gtgtaacgcctccgtttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatc 806  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  142511 gtgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatc 142412  T
Q  807 ggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142411 ggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 142312  T
Q  907 ttctttt 913  Q
    |||||||    
T  142311 ttctttt 142305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 790 - 968
Target Start/End: Original strand, 18958 - 19137
Alignment:
Q  790 caaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 889  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 19057  T
Q  890 tatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19058 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 19137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 726 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18339 - 18203
Alignment:
Q  726 tgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctga 825  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18339 tgggcatgtaacgctcgaggcggatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccaga 18240  T
Q  826 ggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaagg 862  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18239 ggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 731 - 957
Target Start/End: Original strand, 245448 - 245674
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 830  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||    
T  245448 atgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccg 245547  T
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 930  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||    
T  245548 tgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccata 245647  T
Q  931 agaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  245648 agaactccacagttaagcgtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 731 - 968
Target Start/End: Original strand, 245019 - 245253
Alignment:
Q  731 atgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccg 830  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  245019 atgtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcca 245118  T
Q  831 tacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 930  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  245119 tgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccata 245217  T
Q  931 agaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||    |||||||||||||| |||||||||    
T  245218 agaactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattt 245253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 926 - 969
Target Start/End: Original strand, 245676 - 245720
Alignment:
Q  926 ccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaatttc 969  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  245676 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttc 245720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 2026
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2198 gaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2099  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2098 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1391
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1219 gaatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaac 1318  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1319 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 2741 - 2913
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2741 gaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 2840  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2841 aagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 4560 - 4732
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560 gaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaac 4659  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  4660 aagatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaattt 4732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 5015 - 5192
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggctt-----ataagaattgtttggtactacctata 891  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||    
T  5015 gaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctata 5114  T
Q  892 tcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  5115 ttaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 797 - 968
Target Start/End: Original strand, 154756 - 154928
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  154756 gaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaac 154855  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  154856 aagatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 154928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 723 - 764
Target Start/End: Original strand, 154659 - 154700
Alignment:
Q  723 tggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacgggaagtg 764  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  154659 tggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg 154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 793 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 18285 - 18119
Alignment:
Q  793 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18285 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatat 18186  T
Q  893 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18185 caacaagatgcatctt-tttttggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 18119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 17745 - 17582
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17745 gaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17646  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17645 aggatgtatcttctttttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 17582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 796 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 4001
Alignment:
Q  796 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 895  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  896 caagatgcatcttcttttcggtagctcatt 925  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4030 caagatgcatcttctttttggtagcccatt 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 797 - 910
Target Start/End: Original strand, 23672 - 23785
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23672 gaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 23771  T
Q  897 aagatgcatcttct 910  Q
    ||||||||||||||    
T  23772 aagatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 83; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 847 - 957
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2264
Alignment:
Q  847 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttca 946  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  947 gcgtgcttgac 957  Q
    || ||||||||    
T  2254 gcatgcttgac 2264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 797 - 829
Target Start/End: Original strand, 749 - 781
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggcc 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 797 - 960
Target Start/End: Original strand, 14740 - 14903
Alignment:
Q  797 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 896  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14740 gaatcacatcggaacaagagggatcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaat 14839  T
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  14840 aagatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaacttcacagttaagcatgtttgacttg 14903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 884 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13508
Alignment:
Q  884 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac-ttgagcaattt 968  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13593 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattt 13508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 798 - 909
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45497
Alignment:
Q  798 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 897  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagagg-atcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  898 agatgcatcttc 909  Q
    ||||| ||||||    
T  45486 agatgtatcttc 45497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 802 - 960
Target Start/End: Original strand, 26074 - 26230
Alignment:
Q  802 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 901  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||| || || || |||| |||||||| |  | ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  26074 acatcagaaagagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgat 26173  T
Q  902 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgacttg 960  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  26174 gcatcttctttttggtagctcattttataagaactc--cagttaagtgtgcttgacttg 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 802 - 913
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16151
Alignment:
Q  802 acatcggaatgagagggatcctgaggccgtacat--gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 899  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||  ||||| || ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16038 acatcagaatgagagggatcctgatatcgtgcataggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaacatg 16137  T
Q  900 atgcatcttctttt 913  Q
    |||| |||| ||||    
T  16138 atgcctcttttttt 16151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 897 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14677
Alignment:
Q  897 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgactt-gagcaattt 968  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 14677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44745
Alignment:
Q  858 gaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagc 44745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 909 - 957
Target Start/End: Original strand, 421 - 469
Alignment:
Q  909 cttttcggtagctcattccataagaactccacagttcagcgtgcttgac 957  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgac 469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University