View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5721_high_4 (Length: 656)

Name: NF5721_high_4
Description: NF5721
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5721_high_4
NF5721_high_4
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (344-645)||(37544169-37544470)
chr2 (177-344)||(40635226-40635400)
chr2 (179-343)||(13815218-13815389)
chr2 (179-343)||(26710355-26710526)
chr2 (179-343)||(27400413-27400584)
chr2 (179-346)||(6430483-6430657)
chr2 (179-345)||(6594456-6594629)
chr2 (179-345)||(33427645-33427818)
chr2 (179-352)||(34518377-34518557)
chr2 (179-343)||(746476-746647)
chr2 (179-347)||(17600846-17601021)
chr2 (179-343)||(23901789-23901960)
chr2 (179-343)||(38997111-38997282)
chr2 (179-346)||(4034602-4034776)
chr2 (179-343)||(10244582-10244753)
chr2 (179-343)||(11184982-11185153)
chr2 (179-351)||(27651026-27651205)
chr2 (179-343)||(45371000-45371171)
chr2 (179-345)||(2324887-2325060)
chr2 (179-337)||(10424605-10424770)
chr2 (183-344)||(14660460-14660628)
chr2 (179-345)||(1091949-1092122)
chr2 (179-343)||(4609636-4609807)
chr2 (179-351)||(27024425-27024604)
chr2 (179-347)||(32608390-32608560)
chr2 (179-343)||(32948456-32948626)
chr2 (179-343)||(2914138-2914309)
chr2 (179-343)||(5726139-5726310)
chr2 (179-343)||(32327371-32327542)
chr2 (183-351)||(32856428-32856603)
chr2 (179-346)||(7892685-7892859)
chr2 (179-345)||(40037153-40037325)
chr2 (179-343)||(37620867-37621041)
chr2 (179-343)||(14697537-14697708)
chr2 (179-343)||(11159632-11159802)
chr2 (179-341)||(15925090-15925259)
chr2 (179-348)||(40735474-40735650)
chr2 (179-287)||(42899925-42900033)
chr2 (202-344)||(37255336-37255485)
chr2 (179-316)||(12842113-12842257)
chr2 (209-344)||(9444730-9444875)
chr2 (221-337)||(25294887-25295010)
chr2 (179-345)||(44481838-44482000)
chr2 (177-337)||(145290-145446)
chr2 (177-343)||(35158050-35158212)
chr2 (179-317)||(8432942-8433087)
chr2 (177-343)||(28641292-28641454)
chr2 (177-337)||(3266304-3266451)
chr2 (179-344)||(1229645-1229810)
chr2 (177-287)||(41172466-41172576)
chr2 (179-337)||(35126790-35126944)
chr2 (177-342)||(39103055-39103216)
chr2 (177-260)||(39301276-39301359)
chr2 (177-347)||(21734896-21735062)
chr2 (177-343)||(29687049-29687211)
chr2 (177-260)||(12333574-12333657)
chr2 (177-259)||(2000417-2000499)
chr2 (177-345)||(13543622-13543786)
chr2 (243-343)||(447633-447740)
chr2 (179-248)||(12814624-12814693)
chr2 (20-167)||(37544039-37544177)
chr2 (177-343)||(40544085-40544238)
chr2 (183-337)||(19428432-19428582)
chr2 (177-345)||(27331306-27331474)
chr2 (177-260)||(27764941-27765024)
chr2 (177-259)||(12730069-12730151)
chr2 (177-343)||(4258498-4258659)
chr2 (177-347)||(34249273-34249439)
chr2 (177-346)||(2688726-2688891)
chr2 (177-260)||(43899049-43899132)
chr2 (177-260)||(43356107-43356187)
chr2 (240-287)||(28014881-28014928)
chr2 (177-260)||(28566777-28566860)
chr2 (177-260)||(8056634-8056717)
chr2 (290-347)||(3711750-3711807)
chr2 (189-344)||(30545841-30545992)
chr2 (243-317)||(12827137-12827217)
chr2 (190-275)||(38985342-38985426)
chr2 (200-260)||(3711664-3711724)
chr2 (179-235)||(10176569-10176625)
chr2 (290-337)||(28566704-28566751)
chr2 (290-349)||(39301191-39301250)
chr2 (290-337)||(43898977-43899023)
chr2 (290-347)||(12730178-12730235)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (179-345)||(47066975-47067148)
chr7 (177-343)||(25893917-25894090)
chr7 (179-343)||(22979647-22979818)
chr7 (179-346)||(17855440-17855614)
chr7 (177-344)||(35328068-35328242)
chr7 (179-342)||(33423276-33423446)
chr7 (184-350)||(5183818-5183991)
chr7 (179-345)||(33839713-33839886)
chr7 (177-343)||(45690097-45690270)
chr7 (189-345)||(36389378-36389541)
chr7 (179-345)||(2341659-2341833)
chr7 (179-345)||(49171360-49171533)
chr7 (179-344)||(35355900-35356072)
chr7 (179-345)||(46913121-46913296)
chr7 (179-343)||(23393051-23393222)
chr7 (179-343)||(33695821-33695992)
chr7 (179-354)||(33411272-33411454)
chr7 (179-345)||(45482670-45482843)
chr7 (179-340)||(15877562-15877730)
chr7 (179-344)||(37846015-37846187)
chr7 (179-343)||(20165814-20165985)
chr7 (179-343)||(27018128-27018299)
chr7 (179-343)||(43499497-43499668)
chr7 (179-343)||(47740331-47740502)
chr7 (179-343)||(48609677-48609848)
chr7 (179-350)||(33332801-33332978)
chr7 (179-345)||(35757018-35757191)
chr7 (179-346)||(40670575-40670749)
chr7 (179-345)||(31586860-31587033)
chr7 (177-349)||(5712178-5712357)
chr7 (179-343)||(45063357-45063526)
chr7 (177-345)||(26579715-26579890)
chr7 (179-343)||(10028500-10028673)
chr7 (179-344)||(31625716-31625887)
chr7 (179-343)||(19563459-19563630)
chr7 (179-343)||(31429475-31429646)
chr7 (192-343)||(29446863-29447020)
chr7 (182-342)||(33870260-33870424)
chr7 (179-345)||(41990857-41991029)
chr7 (179-342)||(33393340-33393499)
chr7 (179-344)||(10618310-10618475)
chr7 (221-343)||(28233936-28234065)
chr7 (212-345)||(35767519-35767659)
chr7 (177-349)||(7876322-7876490)
chr7 (177-344)||(44003369-44003532)
chr7 (179-287)||(33720099-33720207)
chr7 (177-345)||(35752032-35752196)
chr7 (179-343)||(47460772-47460932)
chr7 (179-337)||(15643952-15644106)
chr7 (221-344)||(30076526-30076656)
chr7 (177-344)||(37127947-37128110)
chr7 (177-344)||(48085868-48086031)
chr7 (177-343)||(43489228-43489390)
chr7 (179-343)||(7257393-7257553)
chr7 (177-346)||(24923021-24923186)
chr7 (177-260)||(26941611-26941694)
chr7 (177-260)||(36816924-36817007)
chr7 (209-346)||(37443599-37443732)
chr7 (234-347)||(41904272-41904392)
chr7 (177-337)||(46817427-46817583)
chr7 (177-345)||(46898014-46898178)
chr7 (177-260)||(24228551-24228634)
chr7 (231-353)||(44405412-44405541)
chr7 (189-319)||(44564360-44564497)
chr7 (177-337)||(26371059-26371215)
chr7 (177-259)||(29098761-29098843)
chr7 (179-275)||(16482847-16482943)
chr7 (177-260)||(498267-498350)
chr7 (177-260)||(29610645-29610728)
chr7 (177-260)||(32556685-32556768)
chr7 (177-260)||(39323626-39323709)
chr7 (177-256)||(39453558-39453637)
chr7 (177-260)||(39866675-39866758)
chr7 (177-260)||(44659854-44659936)
chr7 (177-260)||(47906838-47906921)
chr7 (177-347)||(45237529-45237695)
chr7 (177-260)||(21718127-21718210)
chr7 (177-260)||(25037587-25037670)
chr7 (177-344)||(33455106-33455260)
chr7 (179-268)||(29863027-29863116)
chr7 (179-345)||(38448446-38448608)
chr7 (177-343)||(2332029-2332191)
chr7 (177-260)||(46103131-46103213)
chr7 (177-259)||(41855069-41855151)
chr7 (179-268)||(7720574-7720663)
chr7 (177-260)||(35484646-35484730)
chr7 (179-232)||(30077043-30077096)
chr7 (177-230)||(35823300-35823353)
chr7 (181-235)||(35557744-35557798)
chr7 (179-253)||(45502902-45502976)
chr7 (215-276)||(26456157-26456218)
chr7 (293-337)||(39453488-39453532)
chr7 (290-337)||(36816851-36816898)
chr7 (290-329)||(39866767-39866806)
chr7 (290-345)||(39323727-39323781)
chr7 (290-344)||(24228660-24228714)
chr7 (290-335)||(25037516-25037561)
chr7 (290-334)||(26941541-26941585)
[»] chr4 (130 HSPs)
chr4 (179-345)||(237488-237661)
chr4 (177-345)||(34276556-34276731)
chr4 (177-347)||(53461812-53461989)
chr4 (179-344)||(55056258-55056430)
chr4 (179-344)||(42085218-42085390)
chr4 (179-343)||(9798476-9798647)
chr4 (179-343)||(21366609-21366780)
chr4 (179-342)||(6019939-6020109)
chr4 (177-343)||(44984770-44984943)
chr4 (179-343)||(23437603-23437774)
chr4 (179-343)||(53854430-53854600)
chr4 (179-326)||(27373087-27373241)
chr4 (179-342)||(32366661-32366831)
chr4 (179-343)||(41949393-41949566)
chr4 (179-337)||(397413-397578)
chr4 (179-337)||(6285318-6285483)
chr4 (189-343)||(26091258-26091419)
chr4 (177-335)||(41560337-41560502)
chr4 (189-343)||(54574940-54575101)
chr4 (179-345)||(55776056-55776228)
chr4 (179-345)||(55840234-55840406)
chr4 (183-344)||(2826681-2826848)
chr4 (179-348)||(31532130-31532306)
chr4 (179-344)||(39077556-39077728)
chr4 (179-343)||(18462013-18462184)
chr4 (179-347)||(22618510-22618683)
chr4 (179-343)||(31972336-31972507)
chr4 (179-343)||(51363018-51363188)
chr4 (179-346)||(2243469-2243643)
chr4 (179-346)||(31070071-31070244)
chr4 (179-344)||(31914209-31914380)
chr4 (179-345)||(146427-146600)
chr4 (179-337)||(41702465-41702630)
chr4 (179-345)||(42765840-42766012)
chr4 (179-344)||(43471694-43471866)
chr4 (179-343)||(407765-407934)
chr4 (179-343)||(29478371-29478542)
chr4 (179-347)||(29777253-29777428)
chr4 (179-343)||(42222302-42222473)
chr4 (179-343)||(47344667-47344838)
chr4 (179-346)||(19387685-19387859)
chr4 (179-346)||(50234011-50234185)
chr4 (179-346)||(50457807-50457981)
chr4 (184-343)||(54086425-54086590)
chr4 (179-345)||(45797490-45797663)
chr4 (179-343)||(23609098-23609269)
chr4 (179-343)||(55519838-55520009)
chr4 (179-343)||(56022998-56023169)
chr4 (179-345)||(1932774-1932947)
chr4 (179-337)||(35446517-35446681)
chr4 (179-337)||(50534642-50534807)
chr4 (179-344)||(3170637-3170809)
chr4 (179-348)||(3692205-3692381)
chr4 (179-336)||(54607973-54608137)
chr4 (179-343)||(42033186-42033357)
chr4 (209-345)||(48657859-48658002)
chr4 (179-352)||(49881050-49881234)
chr4 (179-345)||(14017374-14017545)
chr4 (179-347)||(38591679-38591850)
chr4 (189-343)||(54425003-54425163)
chr4 (179-348)||(47662097-47662273)
chr4 (179-343)||(41632007-41632177)
chr4 (179-343)||(48313568-48313737)
chr4 (179-342)||(53834055-53834225)
chr4 (179-317)||(22468796-22468941)
chr4 (179-337)||(50536630-50536795)
chr4 (179-276)||(33897569-33897666)
chr4 (179-326)||(39587796-39587950)
chr4 (209-343)||(52728307-52728447)
chr4 (179-346)||(48259509-48259681)
chr4 (179-344)||(38547600-38547761)
chr4 (179-347)||(34835188-34835352)
chr4 (224-345)||(36532828-36532956)
chr4 (179-337)||(27398609-27398763)
chr4 (179-344)||(14335100-14335261)
chr4 (179-346)||(46720036-46720202)
chr4 (179-345)||(48654825-48655004)
chr4 (177-343)||(45633779-45633941)
chr4 (177-337)||(37239096-37239252)
chr4 (179-284)||(54805684-54805789)
chr4 (179-345)||(6371247-6371409)
chr4 (179-343)||(573814-573974)
chr4 (179-345)||(1662259-1662419)
chr4 (177-345)||(54715044-54715208)
chr4 (177-343)||(9997931-9998093)
chr4 (179-334)||(51951693-51951854)
chr4 (177-260)||(5117517-5117600)
chr4 (177-343)||(15060289-15060451)
chr4 (223-343)||(42509351-42509478)
chr4 (179-275)||(27580130-27580226)
chr4 (177-343)||(54216736-54216898)
chr4 (177-346)||(20351839-20352004)
chr4 (177-260)||(31881393-31881476)
chr4 (177-334)||(33289712-33289865)
chr4 (184-267)||(43231518-43231601)
chr4 (177-260)||(46708820-46708903)
chr4 (177-345)||(43890937-43891101)
chr4 (196-343)||(27872607-27872750)
chr4 (177-343)||(34552328-34552490)
chr4 (177-343)||(49014107-49014269)
chr4 (177-260)||(3293102-3293185)
chr4 (177-260)||(11972208-11972291)
chr4 (177-337)||(22620602-22620758)
chr4 (177-260)||(27873627-27873710)
chr4 (253-343)||(35595772-35595869)
chr4 (177-260)||(54216322-54216405)
chr4 (177-337)||(52688358-52688514)
chr4 (179-252)||(42557593-42557666)
chr4 (216-287)||(52396774-52396846)
chr4 (177-260)||(4486660-4486743)
chr4 (177-260)||(33558021-33558104)
chr4 (245-347)||(42558270-42558371)
chr4 (191-337)||(52461386-52461528)
chr4 (177-346)||(47811915-47812080)
chr4 (179-274)||(49057933-49058028)
chr4 (290-342)||(33049010-33049062)
chr4 (248-342)||(35344868-35344968)
chr4 (290-346)||(48259701-48259756)
chr4 (290-350)||(51981472-51981532)
chr4 (179-274)||(18206583-18206682)
chr4 (290-347)||(3291801-3291858)
chr4 (179-219)||(17555617-17555657)
chr4 (290-345)||(27873548-27873601)
chr4 (290-345)||(4486579-4486634)
chr4 (290-325)||(33557960-33557995)
chr4 (290-337)||(54216431-54216478)
chr4 (184-219)||(54710013-54710048)
chr4 (290-344)||(46708740-46708794)
chr4 (290-343)||(5117438-5117491)
chr4 (290-347)||(31881310-31881367)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (179-343)||(24079901-24080072)
chr8 (179-345)||(32984075-32984248)
chr8 (179-345)||(33981661-33981834)
chr8 (179-345)||(37956432-37956605)
chr8 (179-344)||(5946058-5946230)
chr8 (179-343)||(41653906-41654077)
chr8 (179-342)||(37301326-37301496)
chr8 (179-345)||(9303572-9303745)
chr8 (179-344)||(6365997-6366169)
chr8 (179-344)||(43328718-43328890)
chr8 (179-343)||(10646134-10646305)
chr8 (179-343)||(40435153-40435324)
chr8 (179-334)||(25185910-25186072)
chr8 (179-337)||(31830961-31831126)
chr8 (179-345)||(33730639-33730812)
chr8 (179-344)||(45236564-45236736)
chr8 (179-343)||(41862231-41862402)
chr8 (179-345)||(17718720-17718893)
chr8 (179-337)||(32114260-32114425)
chr8 (179-345)||(41231957-41232130)
chr8 (179-343)||(9734266-9734435)
chr8 (179-343)||(37419951-37420122)
chr8 (179-326)||(2714560-2714714)
chr8 (179-345)||(13356118-13356291)
chr8 (179-346)||(9013695-9013868)
chr8 (179-343)||(35628788-35628959)
chr8 (179-345)||(13760644-13760819)
chr8 (179-346)||(2275924-2276097)
chr8 (179-342)||(22878402-22878572)
chr8 (179-320)||(29048426-29048574)
chr8 (224-351)||(12032986-12033120)
chr8 (179-344)||(45258521-45258692)
chr8 (179-326)||(44088460-44088614)
chr8 (179-287)||(45066655-45066763)
chr8 (221-343)||(3904130-3904258)
chr8 (177-345)||(3490397-3490561)
chr8 (179-343)||(25248050-25248215)
chr8 (177-275)||(39915887-39915985)
chr8 (234-343)||(41981534-41981650)
chr8 (179-331)||(42701301-42701461)
chr8 (179-346)||(33896840-33897002)
chr8 (179-342)||(41639925-41640095)
chr8 (189-270)||(41981454-41981535)
chr8 (177-344)||(4447294-4447457)
chr8 (177-343)||(41843262-41843424)
chr8 (177-260)||(117408-117491)
chr8 (237-347)||(31336163-31336280)
chr8 (177-260)||(31940324-31940407)
chr8 (177-260)||(32373805-32373888)
chr8 (178-260)||(40458851-40458933)
chr8 (177-260)||(4975486-4975569)
chr8 (177-260)||(27243218-27243301)
chr8 (177-260)||(27254793-27254876)
chr8 (177-344)||(9509399-9509562)
chr8 (177-343)||(10378318-10378480)
chr8 (179-350)||(26196310-26196476)
chr8 (177-346)||(3211215-3211379)
chr8 (179-277)||(31148953-31149050)
chr8 (177-343)||(2379149-2379311)
chr8 (177-337)||(9713698-9713851)
chr8 (180-338)||(40649836-40649990)
chr8 (177-260)||(38631661-38631744)
chr8 (179-259)||(164733-164812)
chr8 (177-233)||(33622571-33622627)
chr8 (290-337)||(40458778-40458825)
chr8 (290-337)||(4975413-4975460)
chr8 (290-337)||(31940433-31940479)
chr8 (290-343)||(117329-117382)
chr8 (290-338)||(32373732-32373779)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (179-346)||(31308012-31308186)
chr1 (177-343)||(3611145-3611318)
chr1 (179-353)||(45538164-45538345)
chr1 (179-345)||(44661981-44662154)
chr1 (179-345)||(48373515-48373679)
chr1 (179-343)||(24245025-24245196)
chr1 (179-338)||(4068688-4068854)
chr1 (179-350)||(17994944-17995122)
chr1 (179-345)||(6327546-6327718)
chr1 (179-343)||(21139412-21139583)
chr1 (179-343)||(25678259-25678430)
chr1 (179-343)||(37620192-37620363)
chr1 (179-345)||(5981181-5981354)
chr1 (179-337)||(43251722-43251887)
chr1 (179-343)||(25058699-25058870)
chr1 (179-343)||(33112818-33112988)
chr1 (179-347)||(49253971-49254146)
chr1 (177-344)||(50774226-50774400)
chr1 (179-345)||(23932507-23932680)
chr1 (179-345)||(23984766-23984939)
chr1 (189-343)||(26085398-26085559)
chr1 (179-345)||(31040720-31040893)
chr1 (183-349)||(39646583-39646756)
chr1 (179-344)||(33884099-33884271)
chr1 (179-344)||(33959981-33960153)
chr1 (179-344)||(38790196-38790368)
chr1 (179-344)||(41999826-41999998)
chr1 (179-343)||(26277188-26277359)
chr1 (177-337)||(26794313-26794480)
chr1 (179-343)||(36566341-36566512)
chr1 (179-343)||(46967041-46967212)
chr1 (179-343)||(47317326-47317497)
chr1 (179-343)||(47383732-47383903)
chr1 (179-343)||(47671597-47671768)
chr1 (179-326)||(51403034-51403178)
chr1 (179-335)||(5980079-5980242)
chr1 (179-347)||(26524885-26525060)
chr1 (179-346)||(35692660-35692835)
chr1 (179-334)||(3285413-3285574)
chr1 (179-287)||(23220992-23221100)
chr1 (179-345)||(24885512-24885685)
chr1 (177-343)||(35273605-35273778)
chr1 (179-345)||(38331857-38332030)
chr1 (177-343)||(51057080-51057253)
chr1 (179-319)||(2556879-2557017)
chr1 (179-343)||(49398988-49399159)
chr1 (179-345)||(47187116-47187289)
chr1 (177-345)||(36003139-36003317)
chr1 (181-330)||(42863878-42864034)
chr1 (179-344)||(46616560-46616732)
chr1 (179-315)||(31844387-31844530)
chr1 (179-343)||(46784434-46784605)
chr1 (179-287)||(25518825-25518933)
chr1 (179-337)||(28888592-28888757)
chr1 (179-345)||(2954866-2955028)
chr1 (179-288)||(31979997-31980106)
chr1 (179-346)||(26685867-26686030)
chr1 (179-343)||(33187351-33187505)
chr1 (201-345)||(42313359-42313510)
chr1 (179-343)||(38716247-38716407)
chr1 (222-346)||(4808699-4808830)
chr1 (177-343)||(2657312-2657474)
chr1 (177-343)||(41467632-41467794)
chr1 (177-342)||(6626025-6626186)
chr1 (177-350)||(29770679-29770848)
chr1 (177-337)||(32448657-32448804)
chr1 (206-343)||(51045596-51045740)
chr1 (203-343)||(2450529-2450676)
chr1 (180-343)||(48683330-48683489)
chr1 (177-346)||(33073220-33073385)
chr1 (177-347)||(42234849-42235014)
chr1 (177-345)||(26472177-26472341)
chr1 (179-343)||(1388484-1388644)
chr1 (179-343)||(27983603-27983758)
chr1 (179-327)||(27924674-27924818)
chr1 (177-345)||(10928076-10928240)
chr1 (209-322)||(45475864-45475983)
chr1 (179-343)||(52323949-52324110)
chr1 (181-343)||(39475783-39475940)
chr1 (179-344)||(5961266-5961427)
chr1 (181-264)||(13313249-13313332)
chr1 (177-345)||(4953061-4953225)
chr1 (179-343)||(10920211-10920371)
chr1 (179-275)||(52367894-52367990)
chr1 (177-338)||(34752319-34752476)
chr1 (177-260)||(35991678-35991761)
chr1 (177-260)||(44544125-44544208)
chr1 (177-343)||(41895164-41895326)
chr1 (177-256)||(4243573-4243652)
chr1 (177-260)||(13281641-13281724)
chr1 (177-260)||(30289989-30290072)
chr1 (177-260)||(46428332-46428415)
chr1 (179-259)||(24649802-24649882)
chr1 (257-343)||(13312531-13312624)
chr1 (177-260)||(44293534-44293617)
chr1 (177-260)||(51155668-51155751)
chr1 (231-343)||(31286504-31286612)
chr1 (221-344)||(4156440-4156577)
chr1 (221-345)||(47772170-47772301)
chr1 (177-249)||(7561632-7561704)
chr1 (179-267)||(39637911-39637996)
chr1 (179-227)||(4156188-4156236)
chr1 (290-343)||(7561528-7561581)
chr1 (306-346)||(31844818-31844858)
chr1 (177-207)||(12891408-12891438)
chr1 (290-343)||(4243490-4243543)
chr1 (211-260)||(24215806-24215855)
chr1 (290-343)||(30289910-30289963)
chr1 (290-343)||(44544046-44544099)
chr1 (290-346)||(44293452-44293508)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (179-345)||(5882517-5882690)
chr6 (177-347)||(26377200-26377377)
chr6 (179-350)||(34527855-34528033)
chr6 (179-345)||(7393584-7393757)
chr6 (183-337)||(14891385-14891546)
chr6 (179-344)||(24168102-24168274)
chr6 (179-343)||(22551061-22551232)
chr6 (181-344)||(11988973-11989143)
chr6 (179-337)||(2892199-2892364)
chr6 (179-343)||(599903-600074)
chr6 (179-343)||(959904-960075)
chr6 (179-343)||(8615251-8615422)
chr6 (179-343)||(18101495-18101666)
chr6 (181-348)||(22341783-22341959)
chr6 (179-347)||(19415529-19415704)
chr6 (179-347)||(30743444-30743619)
chr6 (179-344)||(10507907-10508079)
chr6 (179-343)||(28947098-28947269)
chr6 (180-343)||(24224070-24224240)
chr6 (179-345)||(2593850-2594023)
chr6 (179-325)||(7345130-7345283)
chr6 (179-344)||(1970722-1970894)
chr6 (179-343)||(33452572-33452743)
chr6 (179-334)||(16703377-16703539)
chr6 (179-342)||(19281056-19281226)
chr6 (179-345)||(5294799-5294972)
chr6 (179-345)||(5299351-5299524)
chr6 (179-287)||(30467666-30467774)
chr6 (179-343)||(7167593-7167753)
chr6 (200-345)||(23261927-23262079)
chr6 (177-343)||(28948845-28949007)
chr6 (177-344)||(15965442-15965605)
chr6 (189-337)||(4487548-4487692)
chr6 (177-336)||(13329390-13329545)
chr6 (179-250)||(929670-929741)
chr6 (177-259)||(3291017-3291099)
chr6 (177-256)||(1398562-1398641)
chr6 (177-264)||(1939579-1939666)
chr6 (231-347)||(34262293-34262405)
chr6 (179-331)||(375739-375884)
chr6 (177-260)||(3786758-3786841)
chr6 (290-343)||(18661852-18661905)
chr6 (290-337)||(3786867-3786914)
chr6 (290-345)||(24913094-24913149)
chr6 (290-343)||(1398671-1398724)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (179-343)||(24253393-24253564)
chr5 (177-344)||(35626047-35626221)
chr5 (179-337)||(43326385-43326550)
chr5 (179-344)||(3466680-3466852)
chr5 (179-342)||(15398483-15398653)
chr5 (179-344)||(39932590-39932762)
chr5 (179-343)||(27501055-27501226)
chr5 (179-343)||(40886028-40886198)
chr5 (179-350)||(43262176-43262354)
chr5 (179-337)||(6901810-6901975)
chr5 (183-344)||(7722064-7722232)
chr5 (179-336)||(18479675-18479839)
chr5 (179-343)||(5184983-5185154)
chr5 (179-343)||(31938908-31939079)
chr5 (189-343)||(27938918-27939080)
chr5 (179-344)||(739703-739875)
chr5 (179-344)||(25831532-25831703)
chr5 (179-343)||(12648808-12648979)
chr5 (189-343)||(13504742-13504903)
chr5 (179-343)||(15683802-15683973)
chr5 (179-342)||(27278474-27278648)
chr5 (209-346)||(29789292-29789436)
chr5 (179-343)||(2484292-2484463)
chr5 (179-345)||(28424793-28424964)
chr5 (178-343)||(40278858-40279030)
chr5 (179-287)||(5137726-5137834)
chr5 (210-343)||(34451292-34451432)
chr5 (179-344)||(890917-891088)
chr5 (179-347)||(38756483-38756659)
chr5 (179-287)||(40110245-40110352)
chr5 (177-346)||(13957679-13957844)
chr5 (179-347)||(1402501-1402665)
chr5 (189-347)||(763744-763909)
chr5 (179-330)||(5120036-5120182)
chr5 (179-343)||(31293989-31294160)
chr5 (177-343)||(27503388-27503550)
chr5 (179-344)||(36472284-36472444)
chr5 (179-345)||(38637908-38638070)
chr5 (179-344)||(27390608-27390769)
chr5 (177-345)||(23195246-23195410)
chr5 (179-343)||(24167784-24167944)
chr5 (179-351)||(2585473-2585642)
chr5 (177-346)||(38015511-38015676)
chr5 (179-266)||(40632510-40632597)
chr5 (177-337)||(42247797-42247944)
chr5 (177-334)||(42658671-42658824)
chr5 (179-343)||(18327173-18327333)
chr5 (177-345)||(33617594-33617758)
chr5 (179-279)||(12558090-12558189)
chr5 (177-343)||(19295739-19295901)
chr5 (177-337)||(6973072-6973228)
chr5 (177-342)||(9424593-9424754)
chr5 (177-337)||(9374508-9374664)
chr5 (179-345)||(40686910-40687071)
chr5 (179-320)||(4149705-4149843)
chr5 (177-260)||(36365524-36365607)
chr5 (177-345)||(5497282-5497446)
chr5 (177-253)||(9171111-9171187)
chr5 (177-256)||(14971987-14972066)
chr5 (195-337)||(3656574-3656712)
chr5 (192-259)||(3940411-3940478)
chr5 (177-260)||(6206893-6206976)
chr5 (194-264)||(36948564-36948633)
chr5 (179-235)||(9527124-9527180)
chr5 (177-261)||(33624017-33624101)
chr5 (194-256)||(612839-612900)
chr5 (202-326)||(38492647-38492767)
chr5 (201-267)||(20207088-20207154)
chr5 (179-250)||(15300962-15301033)
chr5 (290-324)||(6207002-6207036)
chr5 (290-343)||(14972096-14972149)
[»] chr3 (116 HSPs)
chr3 (179-350)||(47257804-47257982)
chr3 (177-345)||(47809594-47809770)
chr3 (179-347)||(38416720-38416895)
chr3 (177-348)||(28048387-28048565)
chr3 (179-346)||(49330048-49330222)
chr3 (179-345)||(7855112-7855285)
chr3 (179-345)||(40130957-40131130)
chr3 (179-344)||(29625826-29625998)
chr3 (179-344)||(40419846-40420018)
chr3 (179-346)||(43612044-43612218)
chr3 (179-342)||(51170034-51170204)
chr3 (179-353)||(22399108-22399288)
chr3 (179-337)||(48609734-48609899)
chr3 (179-344)||(2666011-2666183)
chr3 (179-343)||(24100294-24100464)
chr3 (179-343)||(41464363-41464534)
chr3 (179-346)||(44806695-44806869)
chr3 (179-345)||(32234396-32234568)
chr3 (177-343)||(37324550-37324723)
chr3 (177-343)||(40643809-40643982)
chr3 (179-345)||(42291853-42292026)
chr3 (179-337)||(54159004-54159159)
chr3 (179-347)||(39634568-39634742)
chr3 (179-342)||(43021725-43021896)
chr3 (179-343)||(51102378-51102549)
chr3 (179-343)||(52628965-52629135)
chr3 (179-346)||(43125842-43126015)
chr3 (180-347)||(55453240-55453414)
chr3 (179-344)||(27066977-27067149)
chr3 (179-344)||(48739232-48739404)
chr3 (179-343)||(46134367-46134538)
chr3 (191-346)||(46126010-46126171)
chr3 (179-346)||(48546837-48547000)
chr3 (179-345)||(39053405-39053578)
chr3 (179-337)||(43183923-43184088)
chr3 (177-343)||(44222838-44223011)
chr3 (179-345)||(53943586-53943758)
chr3 (177-346)||(20754390-20754566)
chr3 (179-344)||(35748310-35748482)
chr3 (179-344)||(40804509-40804681)
chr3 (179-349)||(24376584-24376754)
chr3 (179-335)||(37313410-37313573)
chr3 (179-345)||(7755305-7755477)
chr3 (179-337)||(47894826-47894991)
chr3 (179-345)||(51452749-51452921)
chr3 (179-345)||(52215087-52215260)
chr3 (179-345)||(52638853-52639026)
chr3 (179-343)||(36368950-36369120)
chr3 (179-343)||(41732539-41732710)
chr3 (179-354)||(35594132-35594314)
chr3 (179-345)||(41216466-41216639)
chr3 (179-345)||(41293317-41293489)
chr3 (179-343)||(5560025-5560203)
chr3 (179-344)||(25353565-25353726)
chr3 (179-337)||(51146221-51146386)
chr3 (179-337)||(53832490-53832655)
chr3 (179-344)||(18946914-18947086)
chr3 (179-343)||(55379996-55380156)
chr3 (179-345)||(53115458-53115620)
chr3 (179-287)||(53637852-53637960)
chr3 (179-342)||(51143828-51143987)
chr3 (177-337)||(37028732-37028888)
chr3 (177-347)||(51415978-51416144)
chr3 (181-345)||(30251499-30251659)
chr3 (177-346)||(42589839-42590004)
chr3 (179-329)||(47402764-47402909)
chr3 (177-337)||(25641655-25641811)
chr3 (177-334)||(54401196-54401349)
chr3 (177-337)||(34279727-34279883)
chr3 (177-337)||(54707226-54707382)
chr3 (177-343)||(38156632-38156794)
chr3 (189-287)||(37758950-37759048)
chr3 (177-345)||(39141123-39141288)
chr3 (179-342)||(42998790-42998948)
chr3 (179-343)||(43176738-43176898)
chr3 (193-287)||(46949399-46949493)
chr3 (179-343)||(50731914-50732074)
chr3 (179-343)||(50780782-50780942)
chr3 (228-345)||(52864550-52864673)
chr3 (177-345)||(55000176-55000340)
chr3 (177-347)||(31286789-31286955)
chr3 (177-347)||(49130587-49130753)
chr3 (177-260)||(17665603-17665686)
chr3 (235-345)||(33550465-33550582)
chr3 (177-260)||(41635879-41635962)
chr3 (177-260)||(45058892-45058975)
chr3 (177-260)||(47511019-47511102)
chr3 (221-287)||(47182053-47182119)
chr3 (177-267)||(48726070-48726160)
chr3 (177-254)||(44946014-44946091)
chr3 (179-267)||(41882063-41882151)
chr3 (177-343)||(24688123-24688285)
chr3 (179-344)||(21597147-21597308)
chr3 (177-260)||(40022083-40022166)
chr3 (177-260)||(51224117-51224199)
chr3 (199-343)||(40165682-40165822)
chr3 (179-279)||(2227995-2228095)
chr3 (179-267)||(28576184-28576272)
chr3 (179-344)||(177172-177333)
chr3 (199-344)||(41609098-41609239)
chr3 (177-279)||(8847718-8847820)
chr3 (240-340)||(52434251-52434347)
chr3 (290-343)||(52756067-52756120)
chr3 (179-219)||(37741446-37741486)
chr3 (294-346)||(48534004-48534056)
chr3 (196-260)||(52756150-52756214)
chr3 (291-346)||(40688431-40688486)
chr3 (290-337)||(51224044-51224091)
chr3 (179-244)||(48752096-48752161)
chr3 (302-342)||(37760346-37760386)
chr3 (290-346)||(41635797-41635853)
chr3 (290-337)||(45059001-45059048)
chr3 (179-244)||(52434150-52434216)
chr3 (290-347)||(44945931-44945988)
chr3 (290-343)||(47510940-47510993)
chr3 (224-264)||(48534082-48534122)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (179-347)||(13758-13933)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (179-345)||(39554-39727)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (179-343)||(11133-11303)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (179-343)||(2432-2603)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (179-343)||(1880-2051)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (180-344)||(176666-176837)
scaffold0007 (179-345)||(278017-278192)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (179-345)||(75242-75415)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (179-351)||(18846-19025)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (179-315)||(32572-32715)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (179-343)||(14755-14915)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (179-343)||(20477-20637)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (179-343)||(4554-4715)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (179-343)||(3403-3564)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (222-343)||(4596-4724)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (179-344)||(3099-3262)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (179-343)||(113-272)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (177-343)||(7099-7262)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (177-249)||(17915-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (179-274)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 344 - 645
Target Start/End: Original strand, 37544169 - 37544470
Alignment:
Q  344 ttaattttattgcaagttcctttttcaaatgtttaaattttactgtcacacctcgtttaatttgcgggtgttacatcgtcctgaccgtcatcttcaccac 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37544169 ttaattttattgcaagttcctttttcaaatgtttaaattttactgtcacacctcgtttaatttgcgggtgttacatcgtcctgaccgtcatcttcaccgc 37544268  T
Q  444 catttcaatttatgaaatctatacttgaggtgggttcttcatccaaatcccctcctatgcatgagtgtgattcggttttaaattagagattttgaataac 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37544269 catttcaatttatgaaatctatacttgaggtgggttcttcatccaaatcccctcctatgcatgagtgtgatttggttttaaattagagattttgaataac 37544368  T
Q  544 aagcagtggttttcatgattcttgagtataatgggtagaggggagaggaacctgtcatatcatgcattcacttgctaattggttaaattagtgtgatgat 643  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37544369 aaacagtggttttcatgattcttgagtataatgggtagaggggagaggaacctgtcatatcatgcactcacttgctaattggttaaattagtgtgatgat 37544468  T
Q  644 gt 645  Q
    ||    
T  37544469 gt 37544470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 40635226 - 40635400
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635226 aaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 40635325  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40635326 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13815389 - 13815218
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815389 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13815290  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13815289 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 26710355 - 26710526
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710355 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26710454  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26710455 gcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 27400413 - 27400584
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400413 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27400512  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     ||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27400513 acttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 6430483 - 6430657
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430483 attaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6430582  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6430583 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttattacctta 6430657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6594629 - 6594456
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594629 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6594530  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  6594529 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33427818 - 33427645
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33427818 attacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 33427719  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427718 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 33427645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 352
Target Start/End: Original strand, 34518377 - 34518557
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518377 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34518476  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttta 352  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34518477 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattttta 34518557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 746476 - 746647
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  746476 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 746575  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  746576 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 17600846 - 17601021
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600846 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 17600945  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17600946 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 17601021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 23901789 - 23901960
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901789 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23901888  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23901889 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 38997111 - 38997282
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997111 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38997210  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38997211 gcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 4034602 - 4034776
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034602 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4034701  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4034702 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 4034776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10244753 - 10244582
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244753 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10244654  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  10244653 gcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 11184982 - 11185153
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11184982 attacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 11185081  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||| || |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11185082 gcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27651205 - 27651026
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651205 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27651106  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttt 351  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27651105 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctaaatttt 27651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 45371000 - 45371171
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371000 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45371099  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45371100 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2325060 - 2324887
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325060 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2324961  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  2324960 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 2324887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 10424605 - 10424770
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10424704  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10424705 gcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 10424770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Original strand, 14660460 - 14660628
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660460 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 14660559  T
Q  283 atgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  14660560 atgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1092122 - 1091949
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092122 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 1092023  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  1092022 gtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 1091949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 4609636 - 4609807
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609636 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4609735  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4609736 gcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 351
Target Start/End: Original strand, 27024425 - 27024604
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27024425 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 27024524  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttt 351  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27024525 gattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaatttt 27024604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 32608390 - 32608560
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32608390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 32608489  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||| |||||||||||||||    
T  32608490 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt-----atgggtaccttagttatcaccttaa 32608560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 32948456 - 32948626
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32948456 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgt 32948554  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  32948555 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2914309 - 2914138
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914309 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2914210  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  2914209 gcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 5726139 - 5726310
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5726139 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgt 5726238  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | |||| || |       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  5726239 gtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 32327371 - 32327542
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32327371 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 32327470  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  32327471 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 183 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856428
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  283 atgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttt 351  Q
    ||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttattttt 32856428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7892859 - 7892685
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892859 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 7892760  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    | ||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  7892759 gtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacctta 7892685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 40037153 - 40037325
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40037153 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40037252  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||       ||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40037253 gcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37621041 - 37620867
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtgggg---tcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37621041 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620942  T
Q  276 tgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||||| |       |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  37620941 tgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14697708 - 14697537
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697708 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 14697609  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  14697608 gcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 11159632 - 11159802
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11159632 attacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgt 11159730  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  11159731 gtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 341
Target Start/End: Original strand, 15925090 - 15925259
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15925090 attacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 15925189  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatca 341  Q
    |||||||       ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15925190 gcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagttatca 15925259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Original strand, 40735474 - 40735650
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40735474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 40735573  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
     ||||||       ||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||    
T  40735574 acttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcaccataat 40735650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Original strand, 42899925 - 42900033
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42899925 attaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgc 42900024  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  42900025 gcttatgtg 42900033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37255485 - 37255336
Alignment:
Q  202 aatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-------tgcctattg 294  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||||    
T  37255485 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattg 37255386  T
Q  295 gttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  37255385 gttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 316
Target Start/End: Original strand, 12842113 - 12842257
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12842113 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgt 12842212  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccat 316  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12842213 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 344
Target Start/End: Original strand, 9444730 - 9444875
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttgggg 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||    
T  9444730 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg 9444829  T
Q  302 taaattacccacc---attctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9444830 taaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacct 9444875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 337
Target Start/End: Original strand, 25294887 - 25295010
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       |||||||||||||||||||||||     
T  25294887 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccat 25294986  T
Q  314 cattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  25294987 cattcttccatgagtaccctagtt 25295010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 44481838 - 44482000
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  44481838 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 44481937  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |   | ||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||    
T  44481938 g--aaagt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacctt 44482000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 145290 - 145446
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac-cacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||    |    
T  145290 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatacgtgctt----a 145385  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  145386 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 145446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35158212 - 35158050
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  35158212 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 35158117  T
Q  276 tgtg-cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35158116 tgtgactaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8433087 - 8432942
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8433087 attatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatat 8432988  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccatt 317  Q
     |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8432987 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28641454 - 28641292
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    ||    ||    
T  28641454 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgtt---tat 28641358  T
Q  277 gt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28641357 gtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 3266304 - 3266451
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||           || ||    
T  3266304 aaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatat 3266392  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3266393 gtgcttatgtg--tattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 3266451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 1229645 - 1229810
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||        || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1229645 attacctttaaagaatggtaggtaatttgtc--------aatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 1229736  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatggg-taccctagttatcacct 344  Q
    |||||| || |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||    
T  1229737 gcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacct 1229810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 287
Target Start/End: Original strand, 41172466 - 41172576
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  41172466 aaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaat 41172565  T
Q  277 gtgcttatgtg 287  Q
    |||||||||||    
T  41172566 gtgcttatgtg 41172576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 35126790 - 35126944
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  35126790 attacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 35126889  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |   ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  35126890 g--aatgt--ttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagtt 35126944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Original strand, 39103055 - 39103216
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  39103055 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatatgtgctt----a 39103150  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39103151 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39301359 - 39301276
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39301359 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39301276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21735062 - 21734896
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||           || ||    
T  21735062 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg-----------aatat 21734974  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21734973 gtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttaa 21734896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 29687049 - 29687211
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  29687049 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 29687144  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29687145 tgtggctaatgtg--tattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12333657 - 12333574
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12333657 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 12333574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2000499 - 2000417
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2000499 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcat 2000417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13543786 - 13543622
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  13543786 aaattacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 13543691  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13543690 tgtggctaatgtg--tattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  243 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctag 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  336 ttatcacc 343  Q
    || |||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Original strand, 12814624 - 12814693
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814624 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 37544039 - 37544177
Alignment:
Q  20 ggatttattattaatatatttgacttcttatctaatgtccctgaaacatctgtttaggataacccttattatttttgcactcttgtatgtgtatgacaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||        ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  37544039 ggatttattattaatatatttgacttcttatctaatgtctcggaagcacctgttta-------tcttattatttttgta--cttttatgtgtatgacaat 37544129  T
Q  120 attttatnnnnnnngtttgatctgtaattcaattttaatttaatttta 167  Q
    |||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37544130 attttataagaaaggtttgacctgtaattcaattttaatttaatttta 37544177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40544238 - 40544085
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  40544238 aaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 40544150  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     ||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  40544149 atgcttatgtg--tattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 40544085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428432
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaatgt-gc 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||    |||    |||| ||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----atgtggc 19428487  T
Q  281 ttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19428486 taatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 19428432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 27331306 - 27331474
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||        | ||    
T  27331306 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat-------atat 27331398  T
Q  277 gtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| |||       || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  27331399 gtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 27331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27765024 - 27764941
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  27765024 aaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 27764941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 12730069 - 12730151
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12730069 aaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 12730151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 4258498 - 4258659
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  4258498 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 4258592  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  4258593 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Original strand, 34249273 - 34249439
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||    |||    |    
T  34249273 aaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtgctt----a 34249368  T
Q  276 tgtg-cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||| || |||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34249369 tgtgactaatgtg--tattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaa 34249439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2688891 - 2688726
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  2688891 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 2688796  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  2688795 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctta 2688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43899132 - 43899049
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  43899132 aaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 43899049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 43356107 - 43356187
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43356107 aaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014881
Alignment:
Q  240 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 28014881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28566860 - 28566777
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28566860 aaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg 28566777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 8056634 - 8056717
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| || |||| || |||||||||||||    
T  8056634 aaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 3711750 - 3711807
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  3711750 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttaa 3711807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Original strand, 30545841 - 30545992
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||   |||| |    
T  30545841 aagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaatatg--aatgttc 30545938  T
Q  289 ctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
      |||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||| ||||||    
T  30545939 --attggttcaggtaaattacccatcattcctccatagataccctagttgtcacct 30545992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827217
Alignment:
Q  243 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccatt 317  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 12827217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38985426 - 38985342
Alignment:
Q  190 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38985426 agaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatatg-tcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 260
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711724
Alignment:
Q  200 gtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3711724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Original strand, 10176569 - 10176625
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaattt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  10176569 attacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28566751 - 28566704
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  28566751 tattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 28566704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39301250 - 39301191
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatt 349  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  39301250 tattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcaccctaatt 39301191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43899023 - 43898977
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43899023 tattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 43898977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Original strand, 12730178 - 12730235
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  12730178 tattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccttaa 12730235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47067148 - 47066975
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067148 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47067049  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47067048 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25894090 - 25893917
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894090 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 25893991  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25893990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22979818 - 22979647
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22979818 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 22979719  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22979718 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 17855440 - 17855614
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17855440 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 17855539  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17855540 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 17855614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35328242 - 35328068
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328242 aaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 35328143  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35328142 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33423446 - 33423276
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423446 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33423347  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33423346 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183818
Alignment:
Q  184 ctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  284 tgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    |||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcaccttcattt 5183818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33839886 - 33839713
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839886 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33839787  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  33839786 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45690270 - 45690097
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690270 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 45690171  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45690170 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 345
Target Start/End: Original strand, 36389378 - 36389541
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  36389378 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 36389477  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36389478 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2341833 - 2341659
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2341833 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgt 2341734  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcat-gggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  2341733 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctt 2341659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 49171533 - 49171360
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49171533 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 49171434  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  49171433 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 49171360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 35355900 - 35356072
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35355900 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 35355999  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  35356000 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 46913121 - 46913296
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa--t 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  46913121 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46913220  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46913221 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 46913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23393222 - 23393051
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393222 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23393123  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23393122 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33695992 - 33695821
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695992 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33695893  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  33695892 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 354
Target Start/End: Original strand, 33411272 - 33411454
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33411272 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33411371  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattttatt 354  Q
    | ||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  33411372 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccattattttatt 33411454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 45482670 - 45482843
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45482670 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 45482769  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  45482770 gcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 340
Target Start/End: Original strand, 15877562 - 15877730
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877562 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15877661  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatc 340  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15877662 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaattatc 15877730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37846187 - 37846015
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37846187 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgt 37846088  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37846087 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20165985 - 20165814
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165985 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 20165886  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||| |       ||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20165885 acttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 27018128 - 27018299
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018128 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27018227  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27018228 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 43499497 - 43499668
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43499497 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 43499596  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||| |       |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  43499597 acttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47740502 - 47740331
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47740502 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 47740403  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  47740402 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48609848 - 48609677
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48609848 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgt 48609749  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48609748 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 33332801 - 33332978
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33332801 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatat 33332899  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    |||||||       ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33332900 gcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctttattt 33332978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35757191 - 35757018
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35757191 attaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgt 35757093  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggtt-ggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35757092 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 35757018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 40670575 - 40670749
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670575 attacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40670674  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  40670675 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctta 40670749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 31586860 - 31587033
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586860 attacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31586959  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  31586960 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacctt 31587033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 5712178 - 5712357
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5712178 aaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaat 5712277  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatt 349  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5712278 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccataatt 5712357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45063526 - 45063357
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063526 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45063427  T
Q  279 gcttatgtgcctattg-----gttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| ||| ||     |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  45063426 gcttatgtggctaatgtgtatgttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26579890 - 26579715
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26579890 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaat 26579791  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  26579790 gtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 10028500 - 10028673
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10028500 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 10028599  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatggg--taccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  10028600 gtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 31625716 - 31625887
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625716 attaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31625815  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31625816 gcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 19563459 - 19563630
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19563459 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 19563558  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  19563559 gcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31429646 - 31429475
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31429646 attatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgt 31429547  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31429546 gtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 343
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  192 aatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-- 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |      
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  290 -----tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
         |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Original strand, 33870260 - 33870424
Alignment:
Q  182 acctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgct 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33870260 acctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgct 33870359  T
Q  282 tatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    |||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  33870360 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41991029 - 41990857
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41991029 attacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 41990930  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  41990929 gcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta-cctaattatcacctt 41990857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 33393340 - 33393499
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  33393340 attacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 33393439  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
      | |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33393440 --taatgttc--attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 10618310 - 10618475
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10618310 attacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccacttaaaaatat 10618402  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | ||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10618403 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28234065 - 28233936
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||| |||||||    
T  28234065 gaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaactacccac 28233966  T
Q  314 cattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28233965 ctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 345
Target Start/End: Original strand, 35767519 - 35767659
Alignment:
Q  212 ccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaa 304  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |       |||||||||||||||    
T  35767519 ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaa 35767618  T
Q  305 attacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  35767619 attacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 35767659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7876490 - 7876322
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||   ||||    |    
T  7876490 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtactt----a 7876395  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatt 349  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  7876394 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcaccttaatt 7876322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 44003532 - 44003369
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  44003532 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaag 44003433  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  44003432 gtg--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33720207 - 33720099
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33720207 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33720108  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
     ||||||||    
T  33720107 acttatgtg 33720099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35752196 - 35752032
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  35752196 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 35752101  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35752100 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47460932 - 47460772
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  47460932 attacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagat 47460833  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47460832 g--aatgt--ttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15644106 - 15643952
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  15644106 attatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggt 15644007  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |   ||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15644006 g--aatgt--ttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagtt 15643952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30076656 - 30076526
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccac 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||| ||||||||||||     
T  30076656 gaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattacccat 30076557  T
Q  314 cattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30076556 cattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 37127947 - 37128110
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||    |||    |    
T  37127947 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatgtgctt----a 37128042  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37128043 tgtagctaatgtg--tattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 48085868 - 48086031
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  48085868 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 48085963  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48085964 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 43489228 - 43489390
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  43489228 aaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 43489323  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  43489324 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 7257393 - 7257553
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  7257393 attaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggt 7257492  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |      ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  7257493 g----aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24923186 - 24923021
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||    |||    |    
T  24923186 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatgtgctt----a 24923091  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24923090 tgtggctaatgtg--tattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacctta 24923021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26941694 - 26941611
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26941694 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26941611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36817007 - 36816924
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36817007 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36816924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37443732 - 37443599
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttggggtaaatta 308  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||   ||||   |||||||||||||||||||    
T  37443732 ccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtga--atgtt--tattggttggggtaaatta 37443637  T
Q  309 cccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37443636 cccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacctta 37443599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904392
Alignment:
Q  234 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  327 gtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcaccttaa 41904392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 46817583 - 46817427
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  46817583 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 46817488  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46817487 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 46817427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46898178 - 46898014
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  46898178 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatatgtgctt----a 46898083  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  46898082 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 46898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 24228551 - 24228634
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24228551 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 24228634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 353
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405541
Alignment:
Q  231 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttca 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  324 tgggtaccctagttatcaccttaattttat 353  Q
    ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacctttattttat 44405541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 319
Target Start/End: Original strand, 44564360 - 44564497
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  44564360 aagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttatgtga 44564459  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattct 319  Q
    |       ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564460 ctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 26371059 - 26371215
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  26371059 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgctt----a 26371154  T
Q  276 tgtg-cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||| || |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  26371155 tgtgactaatgtg--tattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26371215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 29098761 - 29098843
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29098761 aaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16482943 - 16482847
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16482943 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 498350 - 498267
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  498350 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 498267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 29610645 - 29610728
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  29610645 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 29610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32556768 - 32556685
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  32556768 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg 32556685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 39323626 - 39323709
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39323626 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39453637 - 39453558
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 256  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39453637 aaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 39866675 - 39866758
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39866675 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 44659854 - 44659936
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  44659854 aaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47906921 - 47906838
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47906921 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45237695 - 45237529
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||    |||    |    
T  45237695 aaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaatatgtgctt----a 45237600  T
Q  276 tgtgctt-atgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||| || |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  45237599 tgtggttaatgtg--tattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcaccttaa 45237529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 21718127 - 21718210
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21718127 aaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 21718210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25037670 - 25037587
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25037670 aaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 25037587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 33455106 - 33455260
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  33455106 aaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 33455194  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  33455195 gtgcttatgtg--tattggtttgggtaaattgtccatcattctttcataggtagcctagttgtcacct 33455260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 29863027 - 29863116
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 268  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  29863027 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448446
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |  |||     ||||| ||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||| || |||||||    
T  38448508 gaatat----ttattgattggggtaaattatccaccatttttccataagtaccctaattgtcacctt 38448446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 2332029 - 2332191
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  2332029 aaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 2332124  T
Q  276 tgtgctta-tgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  2332125 tgtggttactgtg--tattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 46103131 - 46103213
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  46103131 aaattacctttgaaaaatggtgggtaattta-ccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 46103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 41855069 - 41855151
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41855069 aaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcat 41855151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7720663 - 7720574
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 268  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||||||||||||    
T  7720663 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 35484646 - 35484730
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaa-tttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  35484646 aaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 35484730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30077096 - 30077043
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  30077096 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Original strand, 35823300 - 35823353
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagc 230  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35823300 aaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 35557744 - 35557798
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaattt 235  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35557744 tacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45502976 - 45502902
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 253  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45502976 attaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagata 45502902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  215 accaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39453532 - 39453488
Alignment:
Q  293 tggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39453532 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 39453488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36816898 - 36816851
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36816898 tattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 36816851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 329
Target Start/End: Original strand, 39866767 - 39866806
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39866767 tattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Original strand, 39323727 - 39323781
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  39323727 tattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 39323781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Original strand, 24228660 - 24228714
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  24228660 tattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25037561 - 25037516
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctag 335  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  25037561 tattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26941585 - 26941541
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  26941585 tattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 130)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 237488 - 237661
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  237488 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgt 237587  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  237588 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 34276556 - 34276731
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276556 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 34276655  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34276656 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34276731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53461989 - 53461812
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461989 aaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 53461890  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53461889 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccttaa 53461812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 55056430 - 55056258
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55056430 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgt 55056331  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  55056330 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 42085218 - 42085390
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085218 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 42085317  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  42085318 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 9798476 - 9798647
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798476 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9798575  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9798576 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21366780 - 21366609
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366780 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 21366681  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21366680 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 6019939 - 6020109
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6019939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6020038  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6020039 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 44984770 - 44984943
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984770 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 44984869  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44984870 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 23437603 - 23437774
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437603 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23437702  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23437703 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 53854600 - 53854430
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854600 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53854501  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  53854500 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Original strand, 27373087 - 27373241
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27373087 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 27373186  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27373187 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32366831 - 32366661
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366831 attatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 32366732  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32366731 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 41949393 - 41949566
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949393 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41949492  T
Q  279 gct--tatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||  |||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41949493 gcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 397413 - 397578
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397413 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 397512  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  397513 gtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagtt 397578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285483
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6285483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26091419 - 26091258
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26091419 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgg 26091320  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26091319 ctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 41560337 - 41560502
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560337 aaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 41560436  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctag 335  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41560437 gtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctag 41560502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 54575101 - 54574940
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg--- 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  54575101 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 54575002  T
Q  286 ----tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54575001 ttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 55776056 - 55776228
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776056 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55776154  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  55776155 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55776228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 55840234 - 55840406
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840234 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55840332  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  55840333 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2826848 - 2826681
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2826848 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctt 2826749  T
Q  283 atgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  2826748 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31532306 - 31532130
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532306 attacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31532207  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31532206 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccataat 31532130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 39077556 - 39077728
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077556 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39077655  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39077656 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18462184 - 18462013
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18462184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 18462085  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  18462084 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22618683 - 22618510
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618683 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22618585  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22618584 gcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 22618510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31972507 - 31972336
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31972507 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 31972408  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31972407 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 51363018 - 51363188
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363018 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 51363117  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  51363118 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 2243469 - 2243643
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243469 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2243568  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
      ||||||| |       |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  2243569 atttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctta 2243643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31070244 - 31070071
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31070244 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgt 31070146  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31070145 gctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 31070071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 31914209 - 31914380
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914209 attacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31914308  T
Q  279 gcttatg------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||      ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31914309 gcttatgggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 146600 - 146427
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146600 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 146501  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||    
T  146500 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacctt 146427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41702630 - 41702465
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702630 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41702531  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41702530 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagtt 41702465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42766012 - 42765840
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42766012 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgt 42765914  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  42765913 gctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 42765840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43471866 - 43471694
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471866 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43471767  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  43471766 gattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 407765 - 407934
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  407765 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgt 407863  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  407864 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 29478371 - 29478542
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478371 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 29478470  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||| || |       |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  29478471 gcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29777428 - 29777253
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29777428 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgt 29777329  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  29777328 gcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttaa 29777253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 42222302 - 42222473
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42222302 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgt 42222401  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42222402 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 47344667 - 47344838
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47344667 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 47344766  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47344767 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19387859 - 19387685
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19387859 attacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 19387760  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19387759 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 19387685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 50234011 - 50234185
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50234011 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgt 50234110  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||    
T  50234111 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctta 50234185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50457981 - 50457807
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457981 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 50457882  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||||       ||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  50457881 gcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatctta 50457807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Original strand, 54086425 - 54086590
Alignment:
Q  184 ctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54086425 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgctta 54086523  T
Q  284 tgtgcct-------attggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54086524 tgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 45797490 - 45797663
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45797490 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45797589  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
     |||||||| |       ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  45797590 acttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 45797663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 23609098 - 23609269
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23609098 attatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgt 23609197  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23609198 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 55519838 - 55520009
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519838 attacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 55519937  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  55519938 gcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56023169 - 56022998
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023169 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 56023070  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  56023069 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 1932774 - 1932947
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1932774 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 1932873  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1932874 gcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacctt 1932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 35446517 - 35446681
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35446517 attaccttttaagaatggtgggtaattta-ccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 35446615  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||| || |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35446616 gcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagtt 35446681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 50534642 - 50534807
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50534642 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 50534741  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50534742 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagtt 50534807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 3170637 - 3170809
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3170637 attacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 3170736  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  3170737 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacct 3170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3692381 - 3692205
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3692381 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgt 3692282  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
    | ||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3692281 gtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaat 3692205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 336
Target Start/End: Original strand, 54607973 - 54608137
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  54607973 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 54608072  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagt 336  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  54608073 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagt 54608137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 42033186 - 42033357
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033186 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 42033285  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | |||||       ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42033286 gtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 209 - 345
Target Start/End: Original strand, 48657859 - 48658002
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttgggg 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||    
T  48657859 ccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgggg 48657958  T
Q  302 taaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48657959 taaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 48658002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49881234 - 49881050
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881234 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 49881135  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggtt----ggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttta 352  Q
    | ||||||| |       ||||||||    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  49881134 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcaccataaattta 49881050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14017545 - 14017374
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  14017545 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aagtgt 14017448  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | ||||||| |       ||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14017447 gtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 14017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 38591679 - 38591850
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||    
T  38591679 attacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----aatgt 38591774  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38591775 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 38591850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 54425003 - 54425163
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg--- 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  54425003 aagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtga 54425102  T
Q  286 ----tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
        || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||    
T  54425103 ctaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 47662273 - 47662097
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  47662273 attacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatat 47662174  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47662173 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccttaat 47662097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41632177 - 41632007
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41632177 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgt 41632079  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     ||||| || |       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41632078 acttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 48313568 - 48313737
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  48313568 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatat 48313665  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||  |       |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  48313666 gcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 53834225 - 53834055
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53834225 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53834126  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  53834125 gcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22468941 - 22468796
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22468941 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatat 22468842  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccatt 317  Q
    | ||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22468841 gtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatt 22468796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50536795 - 50536630
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50536795 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatat 50536696  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    | ||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50536695 gtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagtt 50536630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33897666 - 33897569
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33897666 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 33897569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39587950 - 39587796
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587950 attacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39587851  T
Q  279 gcttat-------gtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||        ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39587850 gcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52728447 - 52728307
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-------tgcctattggttgggg 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||    
T  52728447 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgagg 52728348  T
Q  302 taaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  52728347 taaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48259681 - 48259509
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48259681 attacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaaatgt 48259583  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  48259582 gcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcacctta 48259509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38547761 - 38547600
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  38547761 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 38547662  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  38547661 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacct 38547600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 34835188 - 34835352
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||    
T  34835188 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaaggt 34835287  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  34835288 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 34835352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532828
Alignment:
Q  224 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  317 tctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacctt 36532828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27398763 - 27398609
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27398763 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatg- 27398665  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
       ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27398664 ---taaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagtt 27398609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14335261 - 14335100
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  14335261 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacctaaaaaggt 14335162  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |      |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14335161 g----aatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacct 14335100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 46720036 - 46720202
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  46720036 attaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 46720135  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |  ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
T  46720136 g-atatatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgttacctta 46720202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 48654825 - 48655004
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48654825 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgt 48654924  T
Q  279 gcttatgtgcc-------------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
     |||||||| |             ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  48654925 acttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacctt 48655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45633941 - 45633779
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  45633941 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 45633846  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45633845 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37239252 - 37239096
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  37239252 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 37239157  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37239156 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 37239096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54805789 - 54805684
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54805789 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 54805690  T
Q  279 gcttat 284  Q
    | ||||    
T  54805689 gtttat 54805684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6371409 - 6371247
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||| |||||| ||    
T  6371409 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacctaaaaaggt 6371310  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  6371309 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 6371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 573814 - 573974
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  573814 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagt 573913  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||| |||||    
T  573914 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacc 573974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1662419 - 1662259
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||       
T  1662419 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa--- 1662323  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
       ||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  1662322 -gatatgttc--attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacctt 1662259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 54715044 - 54715208
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  54715044 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaatatgtgctt----a 54715139  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54715140 tgtggctaatgtg--tattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 54715208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9998093 - 9997931
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  9998093 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 9997998  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9997997 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 334
Target Start/End: Original strand, 51951693 - 51951854
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  51951693 attacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgt 51951792  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    ||||||||| |       |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51951793 gcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggatacccta 51951854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5117600 - 5117517
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5117600 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 5117517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15060451 - 15060289
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  15060451 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 15060363  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15060362 gtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509478
Alignment:
Q  223 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccacca 315  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       |||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  316 ttctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacc 42509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Original strand, 27580130 - 27580226
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27580130 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 54216898 - 54216736
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  54216898 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 54216803  T
Q  276 tgtgctt-atgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| || |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  54216802 tgtgattaatgtg--tattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacc 54216736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20352004 - 20351839
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  20352004 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 20351909  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  20351908 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacctta 20351839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31881476 - 31881393
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31881476 aaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31881393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 334
Target Start/End: Original strand, 33289712 - 33289865
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac-cacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||   |||    |    
T  33289712 aaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatacgtgctt----a 33289807  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33289808 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 33289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 267
Target Start/End: Original strand, 43231518 - 43231601
Alignment:
Q  184 ctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43231518 ctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46708903 - 46708820
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  46708903 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 46708820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 43890937 - 43891101
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  43890937 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaatatgtgctt----a 43891032  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  43891033 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacctt 43891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872750
Alignment:
Q  196 gtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattgg 295  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||   ||||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg--aatgt--ttattgg 27872702  T
Q  296 ttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  27872703 ttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 34552328 - 34552490
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||    |||    |    
T  34552328 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 34552423  T
Q  276 tg-tgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||  ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34552424 tgcggctaatgtg--tattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 49014107 - 49014269
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||    |    
T  49014107 aaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtactt----a 49014202  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49014203 tgtggctaatgtg--tattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3293185 - 3293102
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3293185 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11972291 - 11972208
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11972291 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 22620602 - 22620758
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |    
T  22620602 aaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------t 22620690  T
Q  277 gtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22620691 gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagtt 22620758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27873710 - 27873627
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  27873710 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg 27873627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 343
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595869
Alignment:
Q  253 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 54216322 - 54216405
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  54216322 aaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 54216405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 52688358 - 52688514
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||    |||    |    
T  52688358 aaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatatatgctt----a 52688453  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52688454 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 52688514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 252
Target Start/End: Original strand, 42557593 - 42557666
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagat 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42557593 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396846
Alignment:
Q  216 ccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtg 52396846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4486743 - 4486660
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  4486743 aaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg 4486660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33558104 - 33558021
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  33558104 aaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 347
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558371
Alignment:
Q  245 gtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtggctaatgtg--tattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtcacc 42558367  T
Q  344 ttaa 347  Q
    ||||    
T  42558368 ttaa 42558371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461528
Alignment:
Q  191 gaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaatgt-gcttatgtgc 288  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |||| ||| |||||     
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----atgtggctaatgtg- 52461480  T
Q  289 ctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  52461481 -tattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagtt 52461528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 47811915 - 47812080
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||    |||    |    
T  47811915 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 47812010  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||    
T  47812011 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacctta 47812080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49058028 - 49057933
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| || ||| || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  49058028 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 33049010 - 33049062
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33049010 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  248 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattg---gttgg---ggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    ||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtca 35344967  T
Q  342 c 342  Q
    |    
T  35344968 c 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48259756 - 48259701
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  48259756 tattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctta 48259701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51981532 - 51981472
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  51981532 tattggttggggtaaattactcatcattctttcattggtagactagttatcaccataattt 51981472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 274  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |   ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3291858 - 3291801
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  3291858 tattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcaccttaa 3291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17555657 - 17555617
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaa 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17555657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27873601 - 27873548
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  27873601 tattggttggggtaaattacccatcattcttt--tgggtagcctagttgtcacctt 27873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4486634 - 4486579
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||| |||||||    
T  4486634 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33557995 - 33557960
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33557995 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 54216431 - 54216478
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  54216431 tattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagtt 54216478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54710048 - 54710013
Alignment:
Q  184 ctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaa 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54710048 ctttaaataatggtgggtaatttatccaccaaccaa 54710013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46708794 - 46708740
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  46708794 tattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacct 46708740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5117491 - 5117438
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||| |||||    
T  5117491 tattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31881367 - 31881310
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  31881367 tattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttaa 31881310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24080072 - 24079901
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080072 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24079973  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24079972 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32984248 - 32984075
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984248 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 32984149  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32984148 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33981834 - 33981661
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981834 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33981735  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  33981734 gcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 33981661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 37956432 - 37956605
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956432 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 37956531  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  37956532 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacctt 37956605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 5946058 - 5946230
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946058 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5946157  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5946158 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 41653906 - 41654077
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41653906 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgt 41654005  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41654006 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37301496 - 37301326
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301496 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 37301397  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37301396 gtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9303745 - 9303572
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303745 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9303646  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | ||||||| |       ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9303645 gtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 6365997 - 6366169
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6365997 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 6366096  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6366097 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 43328718 - 43328890
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328718 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43328817  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  43328818 gcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 10646134 - 10646305
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646134 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10646233  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10646234 tcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40435324 - 40435153
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435324 attacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40435225  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  40435224 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 334
Target Start/End: Original strand, 25185910 - 25186072
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25185910 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 25186009  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25186010 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtacccta 25186072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31831126 - 31830961
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831126 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31831027  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31831026 gcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagtt 31830961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33730812 - 33730639
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730812 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33730713  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  33730712 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 33730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45236736 - 45236564
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236736 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45236637  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  45236636 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 41862231 - 41862402
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41862231 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 41862330  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  41862331 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17718893 - 17718720
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718893 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 17718794  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  17718793 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacctt 17718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 32114260 - 32114425
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114260 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 32114359  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32114360 gcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 32114425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 41231957 - 41232130
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41231957 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41232056  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  41232057 gcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacctt 41232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 9734266 - 9734435
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9734266 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgt 9734364  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9734365 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 37419951 - 37420122
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37419951 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 37420050  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  37420051 gcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Original strand, 2714560 - 2714714
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714560 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2714659  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2714660 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13356291 - 13356118
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13356291 attacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13356192  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  13356191 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 9013695 - 9013868
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013695 attacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 9013794  T
Q  279 gcttatgtgcctattg---gttgg---ggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
     |||||||| ||| ||    ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9013795 acttatgtggctaatgtgtattggttaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 9013868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 35628788 - 35628959
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35628788 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgt 35628887  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  35628888 gcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13760819 - 13760644
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13760819 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 13760720  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg--gtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||| |||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  13760719 gcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacctt 13760644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 2275924 - 2276097
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2275924 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatat 2276022  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  2276023 gcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacctta 2276097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 22878402 - 22878572
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878402 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22878501  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  22878502 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29048574 - 29048426
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048574 attatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 29048475  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctt 320  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048474 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 351
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033120
Alignment:
Q  224 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccat 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  317 tctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttt 351  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcaccttcatttt 12033120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 45258521 - 45258692
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45258521 attacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 45258620  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | |||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  45258621 gtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttatcacct 45258692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44088614 - 44088460
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088614 attacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44088515  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44088514 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45066763 - 45066655
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45066763 attacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45066664  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  45066663 gcttatgtg 45066655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 343
Target Start/End: Original strand, 3904130 - 3904258
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||    
T  3904130 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattacccac 3904228  T
Q  314 cattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3904229 cattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3490561 - 3490397
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||     
T  3490561 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacctaaaaag 3490462  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||   ||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  3490461 gtg--aatgt--ttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 3490397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 25248050 - 25248215
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25248050 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgt 25248143  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  25248144 gcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39915985 - 39915887
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39915985 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981650
Alignment:
Q  234 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  327 gtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||||| |||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42701461 - 42701301
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta---aaaa 275  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  42701461 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaa 42701362  T
Q  276 tgtgcttatg-----tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacc 331  Q
    ||||||| ||     ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  42701361 tgtgcttgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33897002 - 33896840
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |    
T  33897002 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaagat 33896904  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |   ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33896903 g--aatgt--ttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacctta 33896840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 41639925 - 41640095
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  41639925 attacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatat 41640024  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    | ||||||| |       |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  41640025 gtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 270
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 270  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4447457 - 4447294
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           || ||    
T  4447457 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 4447369  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4447368 gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 41843262 - 41843424
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||    |||    |    
T  41843262 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaatatgtgctt----a 41843357  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41843358 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcacc 41843424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 117491 - 117408
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  117491 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 237 - 347
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336280
Alignment:
Q  237 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||       |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  330 ccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||||||| |||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcaccttaa 31336280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 31940324 - 31940407
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31940324 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31940407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32373888 - 32373805
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32373888 aaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 32373805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40458933 - 40458851
Alignment:
Q  178 aattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40458933 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40458851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4975569 - 4975486
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4975569 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27243301 - 27243218
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27243301 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27254876 - 27254793
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27254876 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9509562 - 9509399
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||           || ||    
T  9509562 aaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-----------aatat 9509474  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||| ||||||| |       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9509473 gtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacct 9509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 10378318 - 10378480
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           || ||    
T  10378318 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 10378406  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10378407 gtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26196476 - 26196310
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  26196476 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataa-caatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggt 26196378  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||||||| ||||    
T  26196377 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctttattt 26196310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 3211215 - 3211379
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    |||    |    
T  3211215 aaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaatatgtgctt----a 3211309  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3211310 tgtggctaatgtg--tattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacctta 3211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31149050 - 31148953
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31149050 attacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 2379149 - 2379311
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| |||    |||    |    
T  2379149 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatatgtgctt----a 2379244  T
Q  276 tgtg-cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  2379245 tgtgactaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 9713698 - 9713851
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  9713698 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 9713790  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9713791 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 9713851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649836
Alignment:
Q  180 ttacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| |||    |||    ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaatatgtgctt----atgt 40649895  T
Q  279 -gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtta 338  Q
     ||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40649894 ggctaatgtg--tattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtta 40649836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 38631661 - 38631744
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38631661 aaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 259
Target Start/End: Original strand, 164733 - 164812
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  164733 attacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33622627 - 33622571
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaat 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33622627 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 33622571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40458825 - 40458778
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40458825 tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40458778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4975460 - 4975413
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4975460 tattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 4975413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 31940433 - 31940479
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31940433 tattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 31940479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 117382 - 117329
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  117382 tattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32373779 - 32373732
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtta 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  32373779 tattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtta 32373732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 31308012 - 31308186
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308012 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31308111  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31308112 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 31308186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 3611145 - 3611318
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611145 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 3611244  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3611245 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 353
Target Start/End: Original strand, 45538164 - 45538345
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538164 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45538263  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattttat 353  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  45538264 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatatttttat 45538345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 44661981 - 44662154
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44661981 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 44662080  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44662081 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 48373515 - 48373679
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373515 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 48373614  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  48373615 gcttatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24245196 - 24245025
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245196 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24245097  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24245096 gcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4068854 - 4068688
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068854 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 4068755  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtta 338  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4068754 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtta 4068688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17995122 - 17994944
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17995122 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 17995023  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  17995022 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctttattt 17994944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6327718 - 6327546
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327718 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 6327619  T
Q  279 gcttat------gtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||       ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6327618 gcttattgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 6327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21139583 - 21139412
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139583 attacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 21139484  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  21139483 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25678430 - 25678259
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678430 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25678331  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  25678330 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37620363 - 37620192
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37620363 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 37620264  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  37620263 ccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 5981181 - 5981354
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981181 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5981280  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5981281 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5981354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 43251722 - 43251887
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251722 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43251821  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43251822 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 43251887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 25058699 - 25058870
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058699 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 25058798  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25058799 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33112988 - 33112818
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112988 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33112889  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33112888 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49254146 - 49253971
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49254146 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 49254047  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||||| || |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49254046 gcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcaccttaa 49253971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 50774226 - 50774400
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774226 aaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 50774325  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
     |||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50774326 atgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23932680 - 23932507
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23932680 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgt 23932581  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23932580 gcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 23984766 - 23984939
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23984865  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||       ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23984866 gcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23984939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26085559 - 26085398
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26085559 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 26085460  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26085459 ctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 31040720 - 31040893
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31040720 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 31040819  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  31040820 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctt 31040893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 349
Target Start/End: Original strand, 39646583 - 39646756
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39646583 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgctt 39646682  T
Q  283 atg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatt 349  Q
    |||       ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39646683 atgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctaaatt 39646756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 33884099 - 33884271
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33884099 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgt 33884198  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||    
T  33884199 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33960153 - 33959981
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33960153 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgt 33960054  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||    
T  33960053 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38790368 - 38790196
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38790368 attacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatat 38790269  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38790268 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 41999826 - 41999998
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41999826 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 41999925  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41999926 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 26277188 - 26277359
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26277188 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaattt 26277287  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26277288 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 26794313 - 26794480
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26794313 aaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaat 26794412  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||||||| |       |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26794413 gtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagtt 26794480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 36566341 - 36566512
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566341 attacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36566440  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36566441 gcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46967212 - 46967041
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967212 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46967113  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46967112 gcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317497
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383732
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||       ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 47671597 - 47671768
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671597 attacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47671696  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47671697 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51403178 - 51403034
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51403178 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgt 51403080  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    |||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  51403079 gcttatatg--tattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Original strand, 5980079 - 5980242
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  5980079 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatta 5980178  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctag 335  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  5980179 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctag 5980242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26525060 - 26524885
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  26525060 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatat 26524961  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  26524960 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcaccttaa 26524885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35692835 - 35692660
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatcc-accaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35692835 attacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatg 35692736  T
Q  278 tgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    || ||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  35692735 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacctta 35692660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 334
Target Start/End: Original strand, 3285413 - 3285574
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285413 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgt 3285511  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    ||||||||| |       ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3285512 gcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 3285574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23221100 - 23220992
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221100 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 23221001  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  23221000 gcttatgtg 23220992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 24885512 - 24885685
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24885512 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 24885611  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | |||||       ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  24885612 gtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 24885685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 35273605 - 35273778
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273605 aaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 35273704  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35273705 gtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38332030 - 38331857
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  38332030 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatat 38331931  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  38331930 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 51057080 - 51057253
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51057080 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaat 51057179  T
Q  277 gtgcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||       ||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  51057180 gtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2557017 - 2556879
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2557017 attacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 2556918  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattct 319  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2556917 gtttatgtg--tattggttggggtaaattacccactattct 2556879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 49399159 - 49398988
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49399159 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 49399060  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | |||||       || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  49399059 gtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 47187116 - 47187289
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47187116 attacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 47187215  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47187216 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacctt 47187289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 36003139 - 36003317
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003139 aaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 36003238  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccacca---ttctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| |       |||||||| || ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36003239 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacctt 36003317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 330
Target Start/End: Original strand, 42863878 - 42864034
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 280  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42863878 tacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgc 42863977  T
Q  281 ttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtac 330  Q
    ||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  42863978 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 46616560 - 46616732
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46616560 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 46616659  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  46616660 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Original strand, 31844387 - 31844530
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844387 attacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31844486  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccacca 315  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||    
T  31844487 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 46784434 - 46784605
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46784434 attacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46784533  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  46784534 gcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Original strand, 25518825 - 25518933
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25518825 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 25518924  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  25518925 gcttatgtg 25518933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 28888592 - 28888757
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888592 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28888691  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    | ||||||| |       ||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28888692 gtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagtt 28888757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 2954866 - 2955028
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2954866 attacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaaggt 2954965  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | |    ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  2954966 gat----tgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 2955028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31980106 - 31979997
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31980106 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31980007  T
Q  279 gcttatgtgc 288  Q
     |||||||||    
T  31980006 ccttatgtgc 31979997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 26685867 - 26686030
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  26685867 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagt 26685966  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |   ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26685967 g--aatgt--ttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 26686030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 33187351 - 33187505
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  33187351 attatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaatat 33187450  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33187451 g----------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42313510 - 42313359
Alignment:
Q  201 taatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tatt 293  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |       ||||    
T  42313510 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtatt 42313411  T
Q  294 ggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  42313410 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38716407 - 38716247
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  38716407 attatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggt 38716308  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  38716307 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 346
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808830
Alignment:
Q  222 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccacc 314  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  315 attctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctta 4808830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 2657312 - 2657474
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  2657312 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 2657407  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2657408 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41467794 - 41467632
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  41467794 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 41467699  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41467698 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6626186 - 6626025
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  6626186 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 6626091  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6626090 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Original strand, 29770679 - 29770848
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  29770679 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 29770774  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29770775 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccaccttaattt 29770848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 32448657 - 32448804
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  32448657 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 32448745  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32448746 gtgcttaagtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 32448804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51045740 - 51045596
Alignment:
Q  206 tatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |       ||||| ||     
T  51045740 tatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatta 51045641  T
Q  299 gggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||    
T  51045640 gggtaaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 343
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  203 atttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattgg 295  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |       ||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  296 ttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683330
Alignment:
Q  180 ttacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  280 cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
       ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  48683389 --aatgt--ttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 33073220 - 33073385
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||           || ||    
T  33073220 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 33073308  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33073309 gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 33073385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Original strand, 42234849 - 42235014
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  42234849 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 42234944  T
Q  276 tgtgctt-atgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||| || |||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42234945 tgtggttaatgtg--tattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaa 42235014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 26472341 - 26472177
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  26472341 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 26472253  T
Q  277 gtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||||| |||       |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26472252 gtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttaccacctt 26472177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 1388484 - 1388644
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  1388484 attacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 1388583  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  1388584 g--aatgt--ttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27983758 - 27983603
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||                |||||||| ||||||||||    
T  27983758 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccatttaaaaatgt 27983675  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27983674 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27924818 - 27924674
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  27924818 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 27924719  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatggg 327  Q
    |      ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27924718 g----aatggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 10928076 - 10928240
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  10928076 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 10928171  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  10928172 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45475983 - 45475864
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttgggg 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |       |||||||| |||    
T  45475983 ccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggg 45475885  T
Q  302 taaattacccaccattctttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45475884 taaattacccaccattctttc 45475864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 52323949 - 52324110
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||    
T  52323949 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacctaaaaaggt 52324048  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   |||| |  |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  52324049 g-aaatgttc--attgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39475940 - 39475783
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 280  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  39475940 tacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccacctaaaaatgtg- 39475843  T
Q  281 ttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
      | ||   ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39475842 -aacgt--ttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 39475783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5961427 - 5961266
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  5961427 attacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 5961328  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   ||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  5961327 g--aatgt--ttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacct 5961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313249
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 4953061 - 4953225
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    |||    |    
T  4953061 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 4953156  T
Q  276 tgtgctt-atgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  4953157 tgtggttaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 4953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 10920211 - 10920371
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  10920211 attatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 10920310  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||||    
T  10920311 g--aatgt--ttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacc 10920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Original strand, 52367894 - 52367990
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52367894 attacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34752476 - 34752319
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||    |||    |    
T  34752476 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaatatgtgctt----a 34752381  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtta 338  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34752380 tgtggctaatgtg--tattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtta 34752319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35991761 - 35991678
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35991761 aaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44544208 - 44544125
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44544208 aaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41895326 - 41895164
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  41895326 aaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 41895231  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41895230 tgtggctaatgtg--tattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4243652 - 4243573
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 256  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  4243652 aaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtt 4243573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13281724 - 13281641
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  13281724 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 13281641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30290072 - 30289989
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30290072 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg 30289989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46428415 - 46428332
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46428415 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24649882 - 24649802
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24649882 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  257 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44293617 - 44293534
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44293617 aaattacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51155751 - 51155668
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51155751 aaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg 51155668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  231 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtac 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtga--atgtt--tattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtac 31286517  T
Q  331 cctagttatcacc 343  Q
    ||||||| |||||    
T  31286516 cctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 344
Target Start/End: Original strand, 4156440 - 4156577
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgccta-------ttggttggggtaaat 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||       |||||||||||||||    
T  4156440 gaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaat 4156539  T
Q  307 tacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||| |||| || ||||||||| |||||| ||||||    
T  4156540 tacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47772301 - 47772170
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccac 313  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| |       |||||||||| ||||||||| |||    
T  47772301 gaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattacacac 47772202  T
Q  314 cattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  47772201 cattcttccatgggtaccttaattgtcacctt 47772170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7561704 - 7561632
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 249  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7561704 aaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 267
Target Start/End: Original strand, 39637911 - 39637996
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc-atggatacca 267  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39637911 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaa----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4156236 - 4156188
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4156236 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7561581 - 7561528
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7561581 tattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844858
Alignment:
Q  306 ttacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 31844858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 207
Target Start/End: Original strand, 12891408 - 12891438
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaattta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891408 aaattacctttaaagaatggtgggtaattta 12891438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4243543 - 4243490
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4243543 tattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215855
Alignment:
Q  211 accaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg 24215855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30289963 - 30289910
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  30289963 tattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44544099 - 44544046
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44544099 tattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttaccacc 44544046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44293508 - 44293452
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  44293508 tattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacctta 44293452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 5882517 - 5882690
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882517 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5882616  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5882617 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5882690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26377377 - 26377200
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377377 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 26377278  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26377277 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 26377200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34528033 - 34527855
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34528033 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 34527934  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34527933 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctttattt 34527855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7393757 - 7393584
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393757 attacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 7393658  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  7393657 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacctt 7393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 183 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14891546 - 14891385
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891546 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 14891447  T
Q  283 atgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14891446 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 14891385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 24168102 - 24168274
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168102 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24168201  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24168202 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22551232 - 22551061
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22551232 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgt 22551133  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22551132 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988973
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  281 ttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 2892199 - 2892364
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892199 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2892298  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  2892299 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagtt 2892364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 599903 - 600074
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 600002  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  600003 gtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 960075 - 959904
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  960075 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgt 959976  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  959975 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 8615251 - 8615422
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615251 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 8615350  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8615351 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18101666 - 18101495
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101666 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 18101567  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  18101566 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341783
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccacca--accaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcaccttaat 22341783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19415704 - 19415529
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19415704 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgt 19415605  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19415604 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 19415529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30743619 - 30743444
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30743619 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 30743520  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30743519 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcaccttaa 30743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10508079 - 10507907
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508079 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 10507980  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||| ||| |       |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  10507979 gcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 28947098 - 28947269
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28947098 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgt 28947197  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28947198 gtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224070
Alignment:
Q  180 ttacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  280 cttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||| |       ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2594023 - 2593850
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2594023 attatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2593924  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  2593923 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7345283 - 7345130
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345283 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 7345184  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatg 325  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7345183 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 1970722 - 1970894
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1970722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 1970821  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  1970822 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33452743 - 33452572
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452743 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 33452644  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |||||||| |       |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33452643 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 334
Target Start/End: Original strand, 16703377 - 16703539
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16703377 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 16703476  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    |||||||       ||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  16703477 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19281226 - 19281056
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19281226 attacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatat 19281127  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  19281126 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5294972 - 5294799
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294972 attacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5294873  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5294872 gcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5299524 - 5299351
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299524 attacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5299425  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  5299424 gcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30467774 - 30467666
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30467774 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgt 30467675  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  30467674 gcttatgtg 30467666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 7167593 - 7167753
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  7167593 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 7167692  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  7167693 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261927
Alignment:
Q  200 gtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-------tgcctat 292  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |   |||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  293 tggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacctt 23261927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28949007 - 28948845
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||    |||    |    
T  28949007 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatatgctt----a 28948912  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28948911 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 15965442 - 15965605
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| |||    ||    ||    
T  15965442 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaatatgtgtt---tat 15965538  T
Q  277 gt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15965539 gtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Original strand, 4487548 - 4487692
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt-gcttatgtg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||   |  ||   |||| ||| |||||    
T  4487548 aagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---atgtactcatgtggctaatgtg 4487644  T
Q  288 cctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4487645 --tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 4487692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 336
Target Start/End: Original strand, 13329390 - 13329545
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||           |||| ||    
T  13329390 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatat 13329478  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagt 336  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13329479 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Original strand, 929670 - 929741
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 250  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  929670 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 3291017 - 3291099
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  3291017 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat 3291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 256
Target Start/End: Original strand, 1398562 - 1398641
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 256  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  1398562 aaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagtt 1398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1939666 - 1939579
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 264  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1939666 aaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 347
Target Start/End: Original strand, 34262293 - 34262405
Alignment:
Q  231 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtac 330  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||   ||||   ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||    
T  34262293 aatttattggtggggtcaacatagtttatggataccatctaaaaaggtga--atgtt--tattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtac 34262388  T
Q  331 cctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||| |||||||||    
T  34262389 cctagttgtcaccttaa 34262405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 375884 - 375739
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||| ||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||  |    
T  375884 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc---taaaaagat 375788  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacc 331  Q
    |   ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  375787 g--aatgt--ttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacc 375739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 3786758 - 3786841
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  3786758 aaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg 3786841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 18661852 - 18661905
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18661852 tattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 3786867 - 3786914
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3786867 tattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 3786914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24913149 - 24913094
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  24913149 tattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacctt 24913094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 1398671 - 1398724
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  1398671 tattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 24253393 - 24253564
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253393 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24253492  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24253493 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 344
Target Start/End: Original strand, 35626047 - 35626221
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626047 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaat 35626146  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  35626147 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43326550 - 43326385
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326550 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43326451  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    || |||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43326450 gcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 43326385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3466852 - 3466680
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3466852 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 3466753  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3466752 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15398653 - 15398483
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398653 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15398554  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||    
T  15398553 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 39932590 - 39932762
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932590 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39932689  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  39932690 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 39932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27501226 - 27501055
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501226 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 27501127  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27501126 gcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40886198 - 40886028
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40886198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgt 40886100  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40886099 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262176
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctaaattt 43262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 6901810 - 6901975
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6901810 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 6901909  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6901910 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6901975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Original strand, 7722064 - 7722232
Alignment:
Q  183 cctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722064 cctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 7722163  T
Q  283 atgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  7722164 atgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18479839 - 18479675
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479839 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 18479740  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagt 336  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  18479739 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagt 18479675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 5184983 - 5185154
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5184983 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 5185082  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  5185083 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939079
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | |||| || |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 27938918 - 27939080
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg--- 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27938918 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 27939017  T
Q  286 ----tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatggg-taccctagttatcacc 343  Q
        ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27939018 ttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 739875 - 739703
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739875 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 739776  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||       ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  739775 gcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 25831532 - 25831703
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25831532 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaaatgt 25831630  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  25831631 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 12648808 - 12648979
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648808 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 12648907  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  12648908 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13504903 - 13504742
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13504903 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtga 13504804  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |       |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  13504803 ctaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 15683802 - 15683973
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683802 attacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 15683901  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||| || |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  15683902 gcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27278648 - 27278474
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag----ttcatggataccacttaaaa 274  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  27278648 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaa 27278549  T
Q  275 atgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  27278548 atgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 209 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29789436 - 29789292
Alignment:
Q  209 ccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttgggg 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       |||||||||||     
T  29789436 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggga 29789337  T
Q  302 taaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29789336 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 29789292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2484463 - 2484292
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2484463 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgt 2484364  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    | ||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  2484363 gtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28424964 - 28424793
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28424964 attacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 28424867  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  28424866 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctt 28424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40279030 - 40278858
Alignment:
Q  178 aattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40279030 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatg 40278931  T
Q  278 tgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||| |       ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  40278930 tgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Original strand, 5137726 - 5137834
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137726 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 5137825  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    | |||||||    
T  5137826 gtttatgtg 5137834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 343
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451432
Alignment:
Q  210 caccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggt 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  303 aaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 890917 - 891088
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  890917 attacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgt 891015  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  891016 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38756659 - 38756483
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38756560  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctt-tcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    | ||||||| |       |||| |||| | |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  38756559 gtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcaccttaa 38756483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110352
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  40110344 gcttatgtg 40110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 13957679 - 13957844
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  | |||    |    
T  13957679 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgcgctt----a 13957774  T
Q  276 tgtg-cttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13957775 tgtgactaatgtg--tattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 13957844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1402665 - 1402501
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||    
T  1402665 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacccaaaaaggt 1402566  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |   ||||   |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1402565 g--aatgt--ttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcaccttaa 1402501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 763744 - 763909
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgc 288  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  763744 aagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttatgtgg 763843  T
Q  289 c-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |       |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  763844 ctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcaccttaa 763909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 330
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120182
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatat 5120134  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtac 330  Q
    |   ||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5120135 g--aatgt--ttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggtac 5120182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31294160 - 31293989
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||||| |    
T  31294160 attacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatat 31294061  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||| |       ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31294060 gcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 27503388 - 27503550
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  27503388 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 27503483  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27503484 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36472444 - 36472284
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  36472444 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaaaagt 36472345  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |  |||     |||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36472344 gaatat----ttattggttagaataaattacccaccattttttcat-ggtaccctagttgtcacct 36472284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38638070 - 38637908
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  38638070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaactaaaaaggt 38637971  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |   ||||   |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  38637970 g--aatgt--ttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 38637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 27390608 - 27390769
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  27390608 attacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 27390707  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27390708 g--aatgttc--attggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 27390769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23195410 - 23195246
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  23195410 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 23195315  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23195314 tgtggctaatgtg--tattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24167944 - 24167784
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24167944 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 24167845  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  24167844 g--aatgt--ttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacc 24167784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 351
Target Start/End: Original strand, 2585473 - 2585642
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |    
T  2585473 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaaagtt 2585572  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatca-ccttaatttt 351  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  2585573 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacccttaatttt 2585642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38015676 - 38015511
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  38015676 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 38015581  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  38015580 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 38015511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 266
Target Start/End: Original strand, 40632510 - 40632597
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 266  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40632510 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42247944 - 42247797
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || ||    
T  42247944 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatat 42247856  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  42247855 gtgcttatgtg--tattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagtt 42247797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42658824 - 42658671
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  42658824 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgctt----a 42658729  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42658728 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18327333 - 18327173
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  18327333 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 18327234  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  18327233 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcacc 18327173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 33617594 - 33617758
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  33617594 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 33617689  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  33617690 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12558189 - 12558090
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12558189 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgt 12558091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 19295739 - 19295901
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||    |||    |    
T  19295739 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtatatgtgctt----a 19295834  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19295835 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 6973072 - 6973228
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||    
T  6973072 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatat 6973160  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6973161 gtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 6973228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9424754 - 9424593
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  9424754 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatatgctt----a 9424659  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9424658 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9374664 - 9374508
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||    ||  |  |    
T  9374664 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtgtt-taggt 9374566  T
Q  277 gtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9374565 g-gctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 9374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 40686910 - 40687071
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||    
T  40686910 attacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaa-gt 40687008  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || |||||||    
T  40687009 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacctt 40687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149843
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggg----------ttatggataccacttaaaaatgt 4149794  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctt 320  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4149795 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattctt 4149843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36365607 - 36365524
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36365607 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36365524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 5497282 - 5497446
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||    |||    |    
T  5497282 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgctt----a 5497377  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5497378 tgtggctaatgtg--tattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 5497446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9171187 - 9171111
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagata 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9171187 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 256
Target Start/End: Original strand, 14971987 - 14972066
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 256  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14971987 aaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 14972066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656574
Alignment:
Q  195 ggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaatgt-gcttatgtgcctat 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||    |||    |||| ||| |||||  |||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----atgtggctaatgtg--tat 3656619  T
Q  293 tggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3656618 tggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 3656574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  192 aatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 6206893 - 6206976
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  6206893 aaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg 6206976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948564
Alignment:
Q  194 tggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 264  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata 36948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9527180 - 9527124
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaattt 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9527180 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33624101 - 33624017
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgg 261  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||    
T  33624101 aaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgg 33624017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612839
Alignment:
Q  194 tggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaaccat-gaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtt 612839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492767
Alignment:
Q  202 aatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca-cttaaaaatgtg-cttatgtgcctattggttgg 299  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    ||||    |||| || |||||  ||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctta----tgtgactaatgtg--tattggttgg 38492740  T
Q  300 ggtaaattacccaccattctttcatgg 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38492741 ggtaaattacccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207088
Alignment:
Q  201 taatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 267  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag 250  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Original strand, 6207002 - 6207036
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6207002 tattggttggggtaaattacccatcattctttcat 6207036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 14972096 - 14972149
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14972096 tattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 116)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 47257804 - 47257982
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47257804 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgt 47257903  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattt 350  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47257904 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctttattt 47257982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 47809770 - 47809594
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809770 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 47809671  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggtt-ggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||||||| |       |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47809670 gtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47809594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38416895 - 38416720
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416895 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38416796  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||| ||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  38416795 gcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 38416720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28048565 - 28048387
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048565 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 28048466  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaat 348  Q
    ||||||||||| |       ||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28048465 gtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataat 28048387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 49330048 - 49330222
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330048 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 49330147  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  49330148 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 49330222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7855285 - 7855112
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7855285 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgt 7855186  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7855185 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40131130 - 40130957
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131130 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40131031  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  40131030 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29625998 - 29625826
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29625998 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 29625899  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29625898 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 40419846 - 40420018
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419846 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40419945  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40419946 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43612218 - 43612044
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612218 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43612119  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43612118 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 43612044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51170204 - 51170034
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170204 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 51170105  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  51170104 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 353
Target Start/End: Original strand, 22399108 - 22399288
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22399108 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaaatgt 22399206  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattttat 353  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22399207 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatatttttat 22399288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 48609734 - 48609899
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609734 attaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 48609833  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48609834 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 48609899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 2666011 - 2666183
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2666011 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgt 2666110  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2666111 gcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 24100294 - 24100464
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24100294 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatat 24100392  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24100393 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 41464363 - 41464534
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464363 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41464462  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  41464463 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 44806695 - 44806869
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806695 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44806794  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44806795 gcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 44806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32234568 - 32234396
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32234568 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatat 32234470  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32234469 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32234396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 37324550 - 37324723
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37324550 aaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaat 37324649  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
     |  ||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37324650 atatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 40643809 - 40643982
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  40643809 aaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaat 40643908  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40643909 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 42291853 - 42292026
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42291853 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgt 42291952  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
     |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  42291953 acttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 42292026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54159159 - 54159004
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54159159 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 54159060  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  54159059 gcttatgtg--tattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagtt 54159004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39634742 - 39634568
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634742 attacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgt 39634644  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39634643 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 39634568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 43021725 - 43021896
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggt-ggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43021725 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatg 43021824  T
Q  278 tgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    |||||||||  |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43021825 tgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51102549 - 51102378
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51102549 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 51102450  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
      ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  51102449 atttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 52628965 - 52629135
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52628965 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 52629064  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  52629065 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Original strand, 43125842 - 43126015
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125842 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43125941  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  43125942 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacctta 43126015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55453414 - 55453240
Alignment:
Q  180 ttacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453414 ttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 55453315  T
Q  280 cttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    |||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  55453314 cttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcactttaa 55453240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27067149 - 27066977
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27067149 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 27067050  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27067049 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48739404 - 48739232
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48739404 attacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgt 48739305  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48739304 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 46134367 - 46134538
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134367 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 46134466  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  46134467 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126171
Alignment:
Q  191 gaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc- 289  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  290 ------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctta 46126171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48547000 - 48546837
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48547000 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgt 48546903  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  48546902 gcttatgtg--tattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatctta 48546837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 39053405 - 39053578
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053405 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39053504  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  39053505 gcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Original strand, 43183923 - 43184088
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43183923 attacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43184022  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    |||||||       ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43184023 gcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagtt 43184088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 44222838 - 44223011
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44222838 aaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaat 44222937  T
Q  277 gtgcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44222938 gtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 53943758 - 53943586
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53943758 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 53943659  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
     ||||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  53943658 acttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacctt 53943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20754566 - 20754390
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20754566 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaat 20754467  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
     || ||||||| |       ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  20754466 atgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacctta 20754390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35748482 - 35748310
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35748482 attagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 35748383  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35748382 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40804681 - 40804509
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40804681 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40804582  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    | ||||||| |       |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  40804581 gtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 349
Target Start/End: Original strand, 24376584 - 24376754
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376584 attacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 24376683  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatt 349  Q
    ||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  24376684 gcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc-------ggtaccctagttatcaccttaatt 24376754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Original strand, 37313410 - 37313573
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37313410 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgt 37313509  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctag 335  Q
    | ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313510 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctag 37313573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7755477 - 7755305
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  7755477 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaaatgt 7755379  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  7755378 gcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacctt 7755305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47894991 - 47894826
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47894991 attacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47894892  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       |||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47894891 gcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagtt 47894826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 51452921 - 51452749
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51452921 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 51452822  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||       ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||    
T  51452821 gcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacctt 51452749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 52215087 - 52215260
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215087 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 52215186  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || || ||||||||||    
T  52215187 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacctt 52215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 52638853 - 52639026
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52638853 attacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 52638952  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||| |||| |       ||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  52638953 gcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacctt 52639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 36368950 - 36369120
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368950 attacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36369049  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  36369050 gcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtgctctagttatcacc 36369120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 41732539 - 41732710
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732539 attacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41732638  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  41732639 gcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 354
Target Start/End: Original strand, 35594132 - 35594314
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35594132 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 35594231  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaattttatt 354  Q
    ||||||||| |       |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||    
T  35594232 gcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttaccttgaatttatt 35594314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 41216466 - 41216639
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216466 attacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgt 41216565  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       ||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  41216566 gcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacctt 41216639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41293489 - 41293317
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  41293489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaaatgt 41293391  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||||||||| |       |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  41293390 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacctt 41293317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5560203 - 5560025
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacga-----aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5560203 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaa 5560104  T
Q  274 aatgtgcttatg---------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||||||||         || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  5560103 aatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 25353565 - 25353726
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25353565 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 25353664  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25353665 g--aatgttc--attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 51146386 - 51146221
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||  || ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51146386 attatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaattt 51146287  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51146286 gcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 51146221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 53832655 - 53832490
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |     
T  53832655 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggg 53832556  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  53832555 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagtt 53832490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 18946914 - 18947086
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18946914 attatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgt 18947013  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  18947014 gcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 55379996 - 55380156
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  55379996 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 55380095  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  55380096 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 53115458 - 53115620
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  53115458 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaaggt 53115557  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |   ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  53115558 g--aatgt--ttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacctt 53115620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Original strand, 53637852 - 53637960
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53637852 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgt 53637951  T
Q  279 gcttatgtg 287  Q
    |||||||||    
T  53637952 gcttatgtg 53637960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 51143828 - 51143987
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  51143828 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaaggt 51143927  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    |   ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51143928 g--aatgt--ttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 37028732 - 37028888
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||    ||    ||    
T  37028732 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaatatgtgtt---tat 37028828  T
Q  277 gt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37028829 gtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 37028888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Original strand, 51415978 - 51416144
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  51415978 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtatatgtgctt----a 51416073  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51416074 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaa 51416144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30251659 - 30251499
Alignment:
Q  181 tacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 280  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||     
T  30251659 tacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg- 30251561  T
Q  281 ttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
      |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30251560 -aatgttc--attggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 30251499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 42589839 - 42590004
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  42589839 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 42589934  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  42589935 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 42590004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47402909 - 47402764
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47402909 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaatgt 47402811  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggta 329  Q
    |   ||||   |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47402810 g--gatgt--ttattagttgtggtaaattacccaccattattttatgggta 47402764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Original strand, 25641655 - 25641811
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||           |||| ||    
T  25641655 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatat 25641743  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25641744 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 25641811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 334
Target Start/End: Original strand, 54401196 - 54401349
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  54401196 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 54401291  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccta 334  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  54401292 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 54401349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34279883 - 34279727
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  34279883 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 34279788  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  34279787 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagtt 34279727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54707382 - 54707226
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  54707382 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 54707287  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  54707286 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 54707226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38156794 - 38156632
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  38156794 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 38156699  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38156698 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 287
Target Start/End: Original strand, 37758950 - 37759048
Alignment:
Q  189 aagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37758950 aagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttatgtg 37759048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39141288 - 39141123
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  |  |    ||    
T  39141288 aaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-tatgtgcttat 39141190  T
Q  277 gt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    || ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39141189 gtggctaatgtg--tattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacctt 39141123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42998948 - 42998790
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  42998948 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 42998850  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    |      ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||    
T  42998849 g----aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43176898 - 43176738
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  43176898 attacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 43176799  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||    
T  43176798 g--gatgt--ttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 287
Target Start/End: Original strand, 46949399 - 46949493
Alignment:
Q  193 atggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 287  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46949399 atggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtg 46949493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 50732074 - 50731914
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  ||    
T  50732074 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggt 50731975  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   |||| |   |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50731974 g--aatgttc--gttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 50780782 - 50780942
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  ||    
T  50780782 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggt 50780881  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   |||| |   |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50780882 g--aatgttc--gttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864673
Alignment:
Q  228 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||       ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  321 tcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacctt 52864673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 55000340 - 55000176
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  55000340 aaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 55000245  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  55000244 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 55000176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31286955 - 31286789
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  31286955 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 31286860  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31286859 tgtggctaatgtg--tattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcaccttaa 31286789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 347
Target Start/End: Original strand, 49130587 - 49130753
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    |||    |    
T  49130587 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaatatgtgctt----a 49130682  T
Q  276 tgt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||    
T  49130683 tgtggctaatgtg--tattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctccttaa 49130753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17665686 - 17665603
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17665686 aaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 17665603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550465
Alignment:
Q  235 tgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatggg 327  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  328 taccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||||| |||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacctt 33550465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41635962 - 41635879
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41635962 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 41635879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 45058892 - 45058975
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45058892 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47511102 - 47511019
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47511102 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 47511019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 287
Target Start/End: Original strand, 47182053 - 47182119
Alignment:
Q  221 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47182053 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtg 47182119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48726160 - 48726070
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  48726160 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44946091 - 44946014
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag 254  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44946091 aaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41882151 - 41882063
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 267  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41882151 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 24688123 - 24688285
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||    ||    ||    
T  24688123 aaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgtt---tat 24688219  T
Q  277 gt-gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    || ||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24688220 gtggctaatgt--ctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21597308 - 21597147
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  21597308 attacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaactaaaaaggt 21597209  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   ||||   |||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||  ||||| ||||||    
T  21597208 g--aatgt--ttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacct 21597147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Original strand, 40022083 - 40022166
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40022083 aaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40022166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51224199 - 51224117
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51224199 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 51224117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 343
Target Start/End: Original strand, 40165682 - 40165822
Alignment:
Q  199 ggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttg 298  Q
    ||||||||| ||||||| |||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||   |||||||||    
T  40165682 ggtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg--aatgt--ttattggttg 40165777  T
Q  299 gggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  40165778 gggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2228095 - 2227995
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  2228095 attacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaaatgt 2227996  T
Q  279 g 279  Q
    |    
T  2227995 g 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28576272 - 28576184
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 267  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28576272 attacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 177172 - 177333
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  | || ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||    
T  177172 attacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaacctaaaaaggt 177271  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |   ||||   |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||||||    
T  177272 g--aatgt--ttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacct 177333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 344
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609239
Alignment:
Q  199 ggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttg 298  Q
    ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |  ||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg--aatgttc--attggttg 41609193  T
Q  299 gggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
     ||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  41609194 aggtaaattatccgtcattcttccatgggtacattagttgtcacct 41609239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8847820 - 8847718
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||   |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  8847820 aaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaat 8847721  T
Q  277 gtg 279  Q
    |||    
T  8847720 gtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 340
Target Start/End: Original strand, 52434251 - 52434347
Alignment:
Q  240 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttat 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  52434251 gtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtga--atgtt--tattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccctagttat 52434346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52756120 - 52756067
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52756120 tattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Original strand, 37741446 - 37741486
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37741446 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 37741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48534056 - 48534004
Alignment:
Q  294 ggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  48534056 ggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 48534004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756150
Alignment:
Q  196 gtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 260  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52756150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 346
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688486
Alignment:
Q  291 attggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctta 40688486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 51224091 - 51224044
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  51224091 tattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagtt 51224044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 244
Target Start/End: Original strand, 48752096 - 48752161
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggg 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752096 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  302 taaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcac 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41635853 - 41635797
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctta 346  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  41635853 tattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacctta 41635797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 45059001 - 45059048
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagtt 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  45059001 tattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagtt 45059048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 244
Target Start/End: Original strand, 52434150 - 52434216
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaattt-atccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggg 244  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  52434150 attacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44945988 - 44945931
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  44945988 tattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcaccttaa 44945931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47510993 - 47510940
Alignment:
Q  290 tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47510993 tattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534082
Alignment:
Q  224 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 264  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 48534082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13933 - 13758
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 13834  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaa 347  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13833 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaa 13758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39727 - 39554
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 39628  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39627 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11303 - 11133
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303 attacctttaa-gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 11205  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11204 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2603 - 2432
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2603 attacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 2504  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2503 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2051
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1880 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 1979  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1980 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 344
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176837
Alignment:
Q  180 ttacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  280 cttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    |||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Original strand, 278017 - 278192
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata--ccacttaaaaat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  278017 attacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaat 278116  T
Q  277 gtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    ||| ||||||| |       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  278117 gtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 75415 - 75242
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  75415 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgt 75316  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 345  Q
    | ||||||| |       |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  75315 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacctt 75242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19025 - 18846
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19025 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgt 18926  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcaccttaatttt 351  Q
    ||||||||| |       |||| |||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18925 gcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattttt 18846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Original strand, 32572 - 32715
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32572 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgt 32671  T
Q  279 gcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccacca 315  Q
    | |||||       ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32672 gtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 14755 - 14915
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  14755 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggt 14854  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  14855 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20637 - 20477
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  20637 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggt 20538  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  20537 g--aatgt--ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4554
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaa-tgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4715 attacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaagg 4616  T
Q  278 tgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||   |||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  4615 tg--aatgttc--attggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3564
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaa-tgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 277  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3403 attacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaagg 3502  T
Q  278 tgcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    ||   |||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  3503 tg--aatgttc--attggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4596
Alignment:
Q  222 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-------tgcctattggttggggtaaattacccacc 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  4724 aaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 4625  T
Q  315 attctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4624 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 344
Target Start/End: Original strand, 3099 - 3262
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3099 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 3189  T
Q  279 gcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacct 344  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||    
T  3190 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 113 - 272
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  113 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggt 212  T
Q  279 gcttatgtgcctattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |   ||||    |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  213 g--aatgt--taattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 7099 - 7262
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacg-aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || |    
T  7099 aaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aata 7187  T
Q  276 tgtgcttatgtgcc-------tattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 343  Q
    |||||||||||| |       ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7188 tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 17915 - 17987
Alignment:
Q  177 aaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 249  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||| |||||    
T  17915 aaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaa 17987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  179 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 274  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |   ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University