View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5721_low_26 (Length: 255)

Name: NF5721_low_26
Description: NF5721
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5721_low_26
NF5721_low_26
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (5-246)||(66286-66527)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (5-246)||(53559-53800)
scaffold0031 (83-219)||(36041-36171)
scaffold0031 (64-130)||(36352-36419)
scaffold0031 (166-219)||(65838-65891)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (5-246)||(11312642-11312883)
chr7 (5-230)||(12318137-12318362)
chr7 (8-228)||(13635343-13635563)
chr7 (5-226)||(15605143-15605365)
chr7 (8-228)||(16583268-16583487)
chr7 (7-230)||(15580701-15580924)
chr7 (7-219)||(70638-70850)
chr7 (7-219)||(74747-74959)
chr7 (5-225)||(9593361-9593580)
chr7 (7-219)||(33128-33340)
chr7 (8-219)||(12714885-12715097)
chr7 (8-219)||(12718689-12718901)
chr7 (8-219)||(16114262-16114474)
chr7 (8-219)||(16117415-16117627)
chr7 (8-219)||(16907074-16907286)
chr7 (8-219)||(18283387-18283599)
chr7 (54-219)||(39722287-39722452)
chr7 (8-219)||(18279424-18279636)
chr7 (8-219)||(26292416-26292628)
chr7 (5-225)||(18929-19148)
chr7 (7-219)||(12704531-12704744)
chr7 (8-219)||(12723600-12723812)
chr7 (5-227)||(11987225-11987447)
chr7 (13-243)||(14429883-14430120)
chr7 (5-163)||(9644384-9644543)
chr7 (13-243)||(12321620-12321858)
chr7 (5-228)||(8917439-8917661)
chr7 (5-228)||(13149167-13149389)
chr7 (81-246)||(2832389-2832561)
chr7 (81-243)||(9751703-9751871)
chr7 (5-228)||(13461773-13461996)
chr7 (64-228)||(13918710-13918872)
chr7 (64-228)||(1859016-1859178)
chr7 (7-221)||(2760153-2760375)
chr7 (7-243)||(3271823-3272067)
chr7 (64-228)||(25927433-25927595)
chr7 (89-224)||(16457312-16457446)
chr7 (106-225)||(7519331-7519447)
chr7 (5-228)||(16724502-16724723)
chr7 (5-228)||(17701516-17701737)
chr7 (13-224)||(6801229-6801439)
chr7 (85-228)||(2530342-2530484)
chr7 (81-243)||(39267847-39268016)
chr7 (5-228)||(15728337-15728559)
chr7 (5-228)||(14216927-14217149)
chr7 (189-246)||(14152048-14152105)
chr7 (106-228)||(18425450-18425566)
chr7 (31-99)||(2530040-2530108)
chr7 (5-85)||(16438905-16438985)
chr7 (83-219)||(45169961-45170091)
chr7 (7-221)||(9446031-9446253)
chr7 (13-217)||(18556996-18557199)
chr7 (5-52)||(48593327-48593374)
chr7 (13-157)||(20569474-20569619)
chr7 (50-228)||(35151618-35151795)
chr7 (169-228)||(16275504-16275563)
chr7 (7-70)||(42205284-42205347)
chr7 (167-243)||(19649530-19649606)
chr7 (173-220)||(42204017-42204064)
chr7 (60-130)||(45170268-45170339)
chr7 (184-230)||(24054477-24054523)
chr7 (184-220)||(15211484-15211520)
chr7 (167-243)||(17138101-17138177)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (5-246)||(17804191-17804432)
chr6 (5-246)||(25767039-25767280)
chr6 (7-226)||(22429903-22430122)
chr6 (7-219)||(14472292-14472503)
chr6 (7-219)||(18955636-18955848)
chr6 (7-219)||(22862967-22863179)
chr6 (8-219)||(19870611-19870823)
chr6 (27-219)||(1644726-1644918)
chr6 (8-219)||(11566883-11567095)
chr6 (3-225)||(12706705-12706926)
chr6 (8-219)||(23395089-23395301)
chr6 (8-219)||(23989941-23990153)
chr6 (27-219)||(8243882-8244074)
chr6 (27-219)||(18917159-18917351)
chr6 (8-225)||(16741222-16741438)
chr6 (8-219)||(12618718-12618929)
chr6 (13-243)||(18907111-18907349)
chr6 (5-228)||(5616685-5616908)
chr6 (64-228)||(23414658-23414820)
chr6 (64-228)||(27556416-27556578)
chr6 (5-224)||(2685190-2685407)
chr6 (13-224)||(19662787-19662996)
chr6 (106-246)||(27325581-27325730)
chr6 (5-228)||(9482164-9482386)
chr6 (79-243)||(16523330-16523500)
chr6 (6-93)||(27415814-27415901)
chr6 (7-243)||(20907854-20908098)
chr6 (9-216)||(22592679-22592884)
chr6 (5-216)||(12496333-12496543)
chr6 (13-220)||(19790657-19790873)
chr6 (27-163)||(21834782-21834916)
chr6 (5-228)||(1587602-1587824)
chr6 (7-243)||(18180494-18180736)
chr6 (8-228)||(20803427-20803647)
chr6 (64-226)||(27416124-27416278)
chr6 (106-243)||(21766695-21766839)
chr6 (83-228)||(16624144-16624283)
chr6 (83-219)||(31477765-31477895)
chr6 (64-157)||(31478076-31478169)
chr6 (16-132)||(15894310-15894427)
chr6 (167-243)||(15894479-15894555)
chr6 (83-219)||(16760316-16760446)
chr6 (83-219)||(22949129-22949259)
chr6 (83-219)||(22953085-22953215)
chr6 (83-219)||(23871573-23871703)
chr6 (83-219)||(23875529-23875659)
chr6 (111-228)||(1644300-1644415)
chr6 (111-228)||(31478209-31478324)
chr6 (165-245)||(19848034-19848114)
chr6 (13-132)||(21739900-21740020)
chr6 (184-243)||(22432249-22432308)
chr6 (184-243)||(22438799-22438858)
chr6 (64-149)||(1644462-1644548)
chr6 (165-243)||(15041589-15041667)
chr6 (167-221)||(27553612-27553666)
chr6 (166-243)||(19873120-19873197)
chr6 (165-245)||(23992429-23992509)
chr6 (184-243)||(19862978-19863037)
chr6 (13-221)||(22408183-22408398)
chr6 (7-218)||(23657293-23657513)
chr6 (13-62)||(16523281-16523330)
chr6 (50-228)||(21702300-21702477)
chr6 (16-146)||(25642064-25642196)
chr6 (173-221)||(27567656-27567704)
chr6 (64-130)||(16760068-16760135)
chr6 (64-130)||(22948881-22948948)
chr6 (64-130)||(22952837-22952904)
chr6 (64-130)||(23871325-23871392)
chr6 (64-130)||(23875281-23875348)
chr6 (184-238)||(16929647-16929701)
chr6 (184-238)||(16965367-16965421)
chr6 (96-221)||(22074174-22074307)
chr6 (167-220)||(25603425-25603478)
chr6 (167-220)||(25611763-25611816)
chr6 (166-243)||(25642227-25642304)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (5-246)||(20461371-20461612)
chr3 (5-246)||(7793220-7793462)
chr3 (5-246)||(327035-327277)
chr3 (13-228)||(15482675-15482890)
chr3 (7-246)||(2897696-2897935)
chr3 (5-228)||(31097425-31097649)
chr3 (7-219)||(30065970-30066182)
chr3 (7-219)||(11854757-11854969)
chr3 (7-219)||(11070092-11070304)
chr3 (7-219)||(11165402-11165614)
chr3 (7-219)||(55022891-55023103)
chr3 (8-219)||(15617398-15617610)
chr3 (9-219)||(14499349-14499559)
chr3 (8-219)||(7109722-7109934)
chr3 (8-219)||(7113657-7113869)
chr3 (8-219)||(22336743-22336955)
chr3 (8-219)||(27409517-27409729)
chr3 (8-219)||(28949748-28949960)
chr3 (8-219)||(22321688-22321900)
chr3 (7-228)||(15849958-15850176)
chr3 (7-162)||(11300384-11300539)
chr3 (13-243)||(18383795-18384032)
chr3 (5-228)||(16797925-16798147)
chr3 (13-220)||(19725790-19726004)
chr3 (13-243)||(322592-322829)
chr3 (5-228)||(16808752-16808974)
chr3 (5-224)||(17241990-17242207)
chr3 (13-243)||(12496257-12496495)
chr3 (81-246)||(14665398-14665570)
chr3 (81-246)||(14668554-14668726)
chr3 (13-243)||(11862793-11863031)
chr3 (13-243)||(11298407-11298644)
chr3 (9-220)||(3402830-3403050)
chr3 (64-228)||(5223077-5223239)
chr3 (64-228)||(15464878-15465040)
chr3 (22-243)||(11851581-11851810)
chr3 (7-220)||(3389808-3390030)
chr3 (5-216)||(38814409-38814619)
chr3 (53-243)||(12037871-12038068)
chr3 (64-228)||(12339479-12339641)
chr3 (5-216)||(3833699-3833909)
chr3 (13-221)||(1982689-1982905)
chr3 (120-228)||(8489459-8489564)
chr3 (64-224)||(11300696-11300854)
chr3 (13-220)||(11595017-11595233)
chr3 (110-228)||(11854430-11854545)
chr3 (83-228)||(16750543-16750682)
chr3 (167-243)||(12172796-12172872)
chr3 (83-219)||(4111204-4111334)
chr3 (83-219)||(15964993-15965123)
chr3 (83-219)||(15968917-15969047)
chr3 (83-219)||(15972841-15972971)
chr3 (83-219)||(19775789-19775919)
chr3 (83-219)||(4107352-4107482)
chr3 (7-219)||(11557257-11557477)
chr3 (53-132)||(12172924-12173004)
chr3 (167-239)||(23053128-23053200)
chr3 (83-219)||(37439591-37439721)
chr3 (13-220)||(42325964-42326180)
chr3 (64-149)||(4589039-4589125)
chr3 (111-228)||(4589172-4589287)
chr3 (111-228)||(19775360-19775475)
chr3 (64-157)||(19775515-19775608)
chr3 (7-73)||(26190881-26190947)
chr3 (13-117)||(15060427-15060532)
chr3 (5-216)||(15941775-15941985)
chr3 (165-243)||(23408428-23408506)
chr3 (167-245)||(46822267-46822345)
chr3 (167-220)||(12511084-12511137)
chr3 (13-113)||(15051655-15051756)
chr3 (13-117)||(16909885-16909990)
chr3 (167-243)||(15878092-15878168)
chr3 (167-243)||(23077518-23077594)
chr3 (184-243)||(14878574-14878633)
chr3 (169-228)||(16696798-16696857)
chr3 (54-118)||(23052996-23053061)
chr3 (167-243)||(856140-856216)
chr3 (130-216)||(1598477-1598560)
chr3 (195-243)||(26196500-26196548)
chr3 (64-130)||(15964745-15964812)
chr3 (64-130)||(15968669-15968736)
chr3 (64-130)||(15972593-15972660)
chr3 (165-220)||(30029867-30029922)
chr3 (167-220)||(15051531-15051584)
chr3 (167-220)||(15060307-15060360)
chr3 (167-220)||(16369423-16369476)
chr3 (13-117)||(16369543-16369648)
chr3 (5-102)||(16865004-16865101)
chr3 (167-220)||(16909765-16909818)
chr3 (184-220)||(17525216-17525252)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (5-246)||(24735397-24735638)
chr2 (7-219)||(10101518-10101730)
chr2 (8-157)||(19688630-19688779)
chr2 (8-219)||(12901385-12901597)
chr2 (27-219)||(24649378-24649570)
chr2 (8-219)||(27379306-27379518)
chr2 (8-219)||(27383352-27383564)
chr2 (8-219)||(27601817-27602029)
chr2 (8-219)||(24628352-24628564)
chr2 (8-219)||(41530883-41531089)
chr2 (11-243)||(22811787-22812028)
chr2 (13-243)||(25963595-25963832)
chr2 (13-224)||(22461068-22461277)
chr2 (64-228)||(31344890-31345052)
chr2 (8-132)||(15477711-15477836)
chr2 (5-216)||(19928373-19928583)
chr2 (7-220)||(25961407-25961628)
chr2 (5-216)||(18855332-18855541)
chr2 (7-243)||(24716403-24716645)
chr2 (13-228)||(23187088-23187302)
chr2 (13-228)||(23598351-23598565)
chr2 (7-220)||(40428486-40428708)
chr2 (7-221)||(21327439-21327662)
chr2 (104-243)||(21916069-21916215)
chr2 (7-221)||(21318508-21318731)
chr2 (5-228)||(60829-61050)
chr2 (7-221)||(24174822-24175044)
chr2 (13-221)||(37524697-37524905)
chr2 (21-132)||(24673697-24673809)
chr2 (5-228)||(27263285-27263508)
chr2 (83-219)||(30344946-30345076)
chr2 (110-228)||(41666962-41667078)
chr2 (7-221)||(24655211-24655433)
chr2 (83-219)||(1283410-1283540)
chr2 (13-102)||(21918194-21918284)
chr2 (167-243)||(22799167-22799243)
chr2 (173-221)||(24869902-24869950)
chr2 (173-243)||(24673569-24673639)
chr2 (16-133)||(22758596-22758715)
chr2 (167-243)||(23019747-23019823)
chr2 (165-220)||(25616212-25616267)
chr2 (16-146)||(22740841-22740973)
chr2 (167-243)||(40622251-40622327)
chr2 (173-240)||(24680191-24680258)
chr2 (166-243)||(22741004-22741081)
chr2 (186-243)||(45678189-45678246)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (9-246)||(36133837-36134074)
chr4 (7-219)||(17810293-17810505)
chr4 (7-219)||(14757295-14757507)
chr4 (8-219)||(9556551-9556763)
chr4 (5-225)||(1951632-1951851)
chr4 (8-219)||(27534047-27534258)
chr4 (8-219)||(4561207-4561419)
chr4 (5-225)||(18222249-18222468)
chr4 (8-219)||(5756811-5757023)
chr4 (81-228)||(22634369-22634516)
chr4 (1-225)||(17152354-17152576)
chr4 (8-219)||(33742399-33742610)
chr4 (5-225)||(18228724-18228943)
chr4 (13-243)||(16487956-16488194)
chr4 (5-216)||(26243536-26243746)
chr4 (6-228)||(3412811-3413030)
chr4 (13-243)||(16356831-16357068)
chr4 (5-228)||(18236904-18237127)
chr4 (5-228)||(16243271-16243493)
chr4 (5-216)||(23139296-23139505)
chr4 (64-228)||(43256343-43256505)
chr4 (5-216)||(19757472-19757682)
chr4 (5-216)||(19782124-19782334)
chr4 (13-243)||(16348543-16348780)
chr4 (81-246)||(20157407-20157579)
chr4 (81-243)||(13812966-13813135)
chr4 (6-93)||(43256033-43256120)
chr4 (8-228)||(2014791-2015010)
chr4 (7-221)||(5338853-5339076)
chr4 (5-215)||(9530460-9530668)
chr4 (7-221)||(15353179-15353402)
chr4 (16-132)||(12570142-12570259)
chr4 (13-157)||(25555599-25555744)
chr4 (83-219)||(10712874-10713004)
chr4 (83-219)||(10926644-10926774)
chr4 (13-220)||(11250439-11250655)
chr4 (5-228)||(28569314-28569537)
chr4 (167-243)||(12570014-12570090)
chr4 (83-219)||(14954122-14954252)
chr4 (83-219)||(25689891-25690021)
chr4 (110-228)||(14708611-14708727)
chr4 (13-104)||(18602624-18602715)
chr4 (101-216)||(45938173-45938284)
chr4 (14-122)||(44675762-44675872)
chr4 (111-228)||(15224807-15224922)
chr4 (13-85)||(18609218-18609290)
chr4 (50-228)||(42997366-42997543)
chr4 (83-219)||(12487732-12487862)
chr4 (21-122)||(23843608-23843711)
chr4 (173-220)||(25555503-25555550)
chr4 (165-243)||(15093775-15093853)
chr4 (83-157)||(15224962-15225035)
chr4 (170-228)||(18602766-18602824)
chr4 (172-228)||(18609340-18609396)
chr4 (64-130)||(14954433-14954500)
chr4 (7-149)||(16351721-16351864)
chr4 (64-130)||(25689643-25689710)
chr4 (53-110)||(15125071-15125130)
chr4 (184-220)||(23843501-23843537)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (8-228)||(12916-13136)
scaffold0044 (8-228)||(19200-19420)
scaffold0044 (113-228)||(62273-62386)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (5-226)||(16080315-16080536)
chr1 (5-228)||(36819179-36819403)
chr1 (7-246)||(24782973-24783212)
chr1 (7-219)||(1010744-1010956)
chr1 (8-219)||(20228682-20228894)
chr1 (8-219)||(16375331-16375543)
chr1 (8-219)||(21407376-21407588)
chr1 (5-225)||(19211883-19212102)
chr1 (8-219)||(52639562-52639774)
chr1 (5-219)||(23819170-23819383)
chr1 (13-243)||(18181999-18182237)
chr1 (1-225)||(20138099-20138322)
chr1 (13-243)||(22449144-22449382)
chr1 (64-228)||(33797295-33797457)
chr1 (13-224)||(12646888-12647097)
chr1 (5-215)||(18882393-18882602)
chr1 (6-93)||(33797680-33797767)
chr1 (13-243)||(3472804-3473039)
chr1 (7-220)||(18393836-18394059)
chr1 (7-221)||(8761505-8761728)
chr1 (8-214)||(46975494-46975699)
chr1 (7-220)||(45310239-45310462)
chr1 (183-246)||(21313122-21313185)
chr1 (7-243)||(17678460-17678702)
chr1 (13-124)||(21022767-21022879)
chr1 (13-220)||(45489621-45489837)
chr1 (83-219)||(1925084-1925214)
chr1 (83-219)||(20924098-20924228)
chr1 (13-132)||(22831256-22831375)
chr1 (7-221)||(3704937-3705159)
chr1 (83-228)||(39244096-39244235)
chr1 (83-228)||(39247651-39247790)
chr1 (83-228)||(41388196-41388335)
chr1 (13-132)||(6151976-6152096)
chr1 (64-149)||(20229075-20229161)
chr1 (16-122)||(42865092-42865200)
chr1 (106-243)||(21788014-21788159)
chr1 (111-228)||(20229208-20229323)
chr1 (168-219)||(33050067-33050118)
chr1 (173-243)||(21022631-21022701)
chr1 (186-243)||(6151848-6151905)
chr1 (165-246)||(22468735-22468816)
chr1 (186-243)||(22831446-22831503)
chr1 (167-246)||(20135188-20135267)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (8-228)||(2547-2766)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (7-228)||(18505-18726)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (5-228)||(173304-173525)
scaffold0001 (7-243)||(422404-422648)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (12-215)||(13365-13568)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (5-228)||(23535460-23535681)
chr5 (79-246)||(17410434-17410601)
chr5 (7-219)||(15236653-15236865)
chr5 (8-219)||(20295868-20296080)
chr5 (8-219)||(19472593-19472805)
chr5 (5-225)||(18774219-18774439)
chr5 (5-225)||(42805436-42805655)
chr5 (13-243)||(21366544-21366781)
chr5 (5-224)||(26742617-26742835)
chr5 (5-225)||(18784062-18784282)
chr5 (9-224)||(20232568-20232781)
chr5 (5-224)||(26666002-26666219)
chr5 (5-224)||(26937599-26937816)
chr5 (64-228)||(20911101-20911263)
chr5 (5-224)||(24532919-24533136)
chr5 (81-246)||(24767493-24767665)
chr5 (5-216)||(33409253-33409463)
chr5 (64-228)||(18355970-18356132)
chr5 (6-216)||(17718311-17718520)
chr5 (6-93)||(18356474-18356561)
chr5 (13-243)||(20805552-20805788)
chr5 (7-220)||(23451371-23451590)
chr5 (8-216)||(16674177-16674384)
chr5 (14-148)||(20910680-20910813)
chr5 (7-243)||(23458592-23458834)
chr5 (7-243)||(23462853-23463095)
chr5 (5-224)||(21340638-21340855)
chr5 (16-243)||(20766974-20767207)
chr5 (13-220)||(12028443-12028659)
chr5 (7-238)||(123178-123417)
chr5 (28-157)||(22757219-22757349)
chr5 (5-228)||(21885059-21885282)
chr5 (5-228)||(25229277-25229499)
chr5 (5-228)||(25293433-25293655)
chr5 (83-219)||(10753385-10753515)
chr5 (85-243)||(1858929-1859093)
chr5 (154-219)||(40723607-40723672)
chr5 (5-228)||(4036232-4036455)
chr5 (5-217)||(26172488-26172700)
chr5 (64-157)||(10753111-10753204)
chr5 (9-220)||(17919026-17919245)
chr5 (7-221)||(24221899-24222121)
chr5 (173-221)||(26680604-26680652)
chr5 (173-221)||(26952211-26952259)
chr5 (111-228)||(10752956-10753071)
chr5 (16-122)||(14079278-14079386)
chr5 (5-41)||(17410646-17410682)
chr5 (165-245)||(17517240-17517320)
chr5 (167-243)||(23572084-23572160)
chr5 (173-221)||(31342169-31342217)
chr5 (167-243)||(23512098-23512174)
chr5 (85-157)||(31342219-31342291)
chr5 (64-130)||(11220521-11220588)
chr5 (64-130)||(11228930-11228997)
chr5 (64-130)||(11230919-11230986)
chr5 (184-243)||(21873254-21873313)
chr5 (65-130)||(11226940-11227006)
chr5 (167-220)||(23201383-23201436)
chr5 (186-243)||(23501415-23501472)
chr5 (184-243)||(14079149-14079208)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-228)||(228244-228466)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (7-219)||(3748-3960)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (5-228)||(19888-20110)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (8-219)||(65401-65613)
scaffold0029 (27-219)||(61505-61697)
scaffold0029 (7-219)||(80736-80945)
scaffold0029 (111-228)||(80307-80422)
scaffold0029 (167-243)||(12763-12839)
scaffold0029 (85-157)||(80462-80533)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (7-219)||(12443-12655)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (5-228)||(9536-9759)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (5-225)||(16231346-16231565)
chr8 (8-219)||(19278156-19278368)
chr8 (8-219)||(21972458-21972670)
chr8 (8-219)||(21976543-21976755)
chr8 (27-219)||(43251834-43252026)
chr8 (8-225)||(22044900-22045116)
chr8 (8-187)||(22111904-22112084)
chr8 (5-225)||(23834188-23834408)
chr8 (5-162)||(18619555-18619713)
chr8 (13-243)||(20465917-20466157)
chr8 (5-149)||(22028647-22028792)
chr8 (5-228)||(30308625-30308846)
chr8 (13-243)||(30643169-30643408)
chr8 (13-243)||(17926585-17926822)
chr8 (21-221)||(15602903-15603111)
chr8 (13-220)||(16410133-16410347)
chr8 (5-216)||(23846886-23847096)
chr8 (21-221)||(15611355-15611563)
chr8 (64-228)||(14398039-14398201)
chr8 (5-216)||(15538473-15538683)
chr8 (15-220)||(20856305-20856518)
chr8 (83-228)||(21387086-21387228)
chr8 (5-216)||(15531914-15532123)
chr8 (90-228)||(21383666-21383801)
chr8 (7-243)||(16861199-16861441)
chr8 (13-117)||(377414-377519)
chr8 (16-132)||(24755842-24755959)
chr8 (83-219)||(18862600-18862730)
chr8 (83-219)||(21827969-21828099)
chr8 (7-221)||(22010551-22010769)
chr8 (8-216)||(17828457-17828663)
chr8 (13-117)||(19259460-19259565)
chr8 (50-228)||(32605223-32605400)
chr8 (167-243)||(24755714-24755790)
chr8 (88-219)||(21410971-21411096)
chr8 (88-219)||(21805463-21805588)
chr8 (85-220)||(39094875-39095018)
chr8 (50-228)||(32598691-32598868)
chr8 (165-245)||(18678141-18678221)
chr8 (106-243)||(23776807-23776952)
chr8 (165-220)||(32121759-32121814)
chr8 (16-122)||(19983223-19983331)
chr8 (167-243)||(377271-377347)
chr8 (168-228)||(17055412-17055472)
chr8 (167-246)||(23648554-23648633)
chr8 (16-122)||(19899225-19899333)
chr8 (167-243)||(16184720-16184796)
chr8 (167-243)||(17353984-17354060)
chr8 (167-243)||(21162099-21162175)
chr8 (167-243)||(21168772-21168848)
chr8 (64-130)||(18862911-18862978)
chr8 (64-130)||(21828280-21828347)
chr8 (16-118)||(16184862-16184966)
chr8 (167-220)||(19259632-19259685)
chr8 (7-51)||(39094814-39094858)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (27-219)||(4994-5186)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (8-219)||(58592-58804)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (5-225)||(3401-3620)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (8-219)||(35816-36027)
scaffold0109 (8-228)||(6957-7176)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (5-225)||(18231-18450)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (8-139)||(10458-10589)
scaffold0004 (166-243)||(69794-69871)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (7-243)||(4430-4674)
scaffold0676 (83-219)||(471-602)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (5-225)||(24839-25059)
scaffold0012 (83-219)||(189332-189462)
scaffold0012 (64-130)||(189643-189710)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (13-243)||(159-398)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (13-243)||(393-631)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-243)||(42627-42860)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (13-243)||(1494-1731)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (6-167)||(1-163)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (10-221)||(5608-5826)
scaffold0476 (10-221)||(6803-7021)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (53-243)||(6227-6425)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (7-243)||(15087-15330)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (5-225)||(23232-23451)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (79-243)||(17056-17228)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (8-228)||(6131-6350)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (13-243)||(18534-18774)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (13-220)||(46605-46820)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (7-221)||(1362-1584)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (5-228)||(9916-10138)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (21-243)||(9513-9741)
scaffold0104 (21-243)||(1830-2059)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (13-220)||(1962-2178)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (81-246)||(9990-10162)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (5-228)||(18367-18589)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (5-216)||(63878-64088)
scaffold0042 (5-216)||(75762-75972)
scaffold0042 (16-132)||(34791-34908)
scaffold0042 (167-243)||(34960-35036)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (13-163)||(21447-21597)
scaffold0037 (111-228)||(80754-80869)
scaffold0037 (85-149)||(80642-80706)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (64-228)||(6693-6855)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (13-243)||(44081-44318)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (64-228)||(30897-31059)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-228)||(5871-6093)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (6-93)||(71460-71547)
scaffold0003 (5-216)||(139736-139945)
scaffold0003 (85-226)||(71083-71215)
scaffold0003 (7-243)||(413923-414167)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-243)||(897-1126)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (54-140)||(928-1014)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (91-243)||(73725-73883)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (81-235)||(2913-3074)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (64-228)||(20395-20557)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (7-160)||(19164-19317)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (64-228)||(207768-207942)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (10-243)||(289-520)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (13-220)||(6294-6508)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-216)||(9445-9655)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (11-220)||(35387-35605)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (5-216)||(36331-36540)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (7-154)||(4097-4245)
scaffold0184 (173-220)||(4273-4320)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (13-220)||(8583-8799)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (7-243)||(30617-30859)
scaffold0008 (110-228)||(1889-2005)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (7-220)||(19604-19826)
scaffold0017 (7-220)||(15082-15304)
scaffold0017 (184-220)||(193034-193070)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (7-243)||(7471-7715)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (8-228)||(77044-77264)
scaffold0043 (184-243)||(18236-18295)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (6-228)||(381-587)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (6-93)||(15290-15376)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (7-157)||(192189-192340)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (13-117)||(6956-7061)
scaffold0311 (167-243)||(7128-7204)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (83-219)||(11456-11586)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (83-219)||(14042-14172)
scaffold0141 (64-130)||(14353-14420)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (106-243)||(38451-38596)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (120-243)||(4790-4921)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (27-132)||(13969-14075)
scaffold0056 (167-243)||(14127-14203)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (16-122)||(3872-3980)
scaffold0149 (16-122)||(8303-8411)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (53-132)||(2960-3040)
scaffold0158 (53-132)||(6626-6706)
scaffold0158 (168-243)||(2832-2907)
scaffold0158 (168-243)||(6498-6573)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (167-243)||(6095-6171)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (10-221)||(2311-2531)
scaffold0439 (10-221)||(10171-10391)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (7-133)||(1909-2035)
scaffold1220 (167-218)||(1817-1868)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (169-228)||(9347-9406)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (83-198)||(439-548)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (110-228)||(8512-8628)
scaffold0111 (110-228)||(15656-15772)
scaffold0111 (53-133)||(32554-32636)
scaffold0111 (187-219)||(32459-32491)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (110-228)||(16640-16756)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (7-220)||(7143-7364)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (16-133)||(15550-15669)
scaffold0297 (184-243)||(15737-15796)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (167-243)||(21844-21920)
scaffold0210 (167-243)||(29736-29812)
scaffold0210 (13-69)||(21684-21740)
scaffold0210 (13-69)||(29576-29632)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (83-219)||(32615-32745)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (167-243)||(14664-14740)
scaffold0081 (167-243)||(23679-23755)
scaffold0081 (167-243)||(39103-39179)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (169-228)||(15350-15409)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (104-221)||(33569-33694)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (167-220)||(16389-16442)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (85-157)||(11472-11544)
scaffold0410 (173-220)||(2191-2238)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (16-148)||(174871-175005)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (186-243)||(280950-281007)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (167-243)||(1881-1957)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (167-243)||(26828-26904)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (16-133)||(18334-18453)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (167-243)||(9004-9080)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 66286 - 66527
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66286 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 66385  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66386 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 66485  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  66486 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 66527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 53800 - 53559
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53800 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 53701  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53700 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 53601  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53600 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 53559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 36041 - 36171
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  36041 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 36134  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  36135 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 36171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 36352 - 36419
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36352 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Original strand, 65838 - 65891
Alignment:
Q  166 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11312883 - 11312642
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312883 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 11312784  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312783 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 11312684  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11312683 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 11312642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12318362 - 12318137
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318362 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattga 12318263  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318262 ttgcattacttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 12318163  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12318162 ctaagttgcatgagtctgaataagat 12318137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 13635343 - 13635563
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635343 gaaccttaggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 13635442  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635443 cattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 13635542  T
Q  208 agttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13635543 agttgcatgagtctgaataag 13635563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 15605143 - 15605365
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605143 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattga 15605242  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605243 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 15605342  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaata 226  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  15605343 actaaaatgcatgagtctgaata 15605365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16583487 - 16583268
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16583487 gaaccttaggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattg 16583389  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16583388 cattacttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 16583289  T
Q  208 agttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16583288 cgttgcatgagtctgaataag 16583268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15580924 - 15580701
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15580924 ggaactttaggttatagtgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgatt 15580825  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15580824 gcattacttgaattattattgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaact 15580725  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataagat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15580724 aagttgcatgagtctgaataagat 15580701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 70638 - 70850
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  70638 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 70737  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  70738 gcattacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 70837  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  70838 aagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 74747 - 74959
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  74747 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 74846  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  74847 gcattacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 74946  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  74947 aagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9593580 - 9593361
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||    
T  9593580 aaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattga 9593481  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  9593480 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattta 9593383  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9593382 actaagttgcatgagtctgaat 9593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33340 - 33128
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33340 ggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 33241  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33240 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaact 33141  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
     ||||||||||||    
T  33140 cagttgcatgagt 33128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12715097 - 12714885
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12715097 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12714998  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12714997 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12714898  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  12714897 aagttacatgagt 12714885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12718901 - 12718689
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12718901 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12718802  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12718801 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12718702  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  12718701 aagttacatgagt 12718689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16114474 - 16114262
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16114474 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16114375  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16114374 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16114275  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  16114274 aagttacatgagt 16114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16117627 - 16117415
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16117627 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16117528  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16117527 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16117428  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  16117427 aagttacatgagt 16117415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 16907074 - 16907286
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16907074 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16907173  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16907174 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16907273  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  16907274 aagttacatgagt 16907286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18283599 - 18283387
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18283599 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 18283500  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18283499 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 18283400  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  18283399 aagttacatgagt 18283387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722287
Alignment:
Q  54 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 153  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 39722353  T
Q  154 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39722352 gttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18279636 - 18279424
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18279636 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 18279537  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18279536 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 18279437  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  18279436 aagttacatgagt 18279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26292628 - 26292416
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26292628 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 26292529  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26292528 gcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 26292429  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  26292428 aagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 18929 - 19148
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  18929 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 19028  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  19029 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 19126  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19127 actaagttgcatgagtctgaat 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 12704531 - 12704744
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12704531 ggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaa 12704630  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12704631 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaac 12704730  T
Q  206 taagttgcatgagt 219  Q
    |||||| |||||||    
T  12704731 taagttacatgagt 12704744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12723812 - 12723600
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12723812 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12723713  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12723712 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaact 12723613  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  12723612 aagttacatgagt 12723600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11987447 - 11987225
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaa-gatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||| |||||    
T  11987447 aaggaaccttaggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattg 11987348  T
Q  104 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  11987347 attgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 11987250  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataa 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11987249 aactaagttgcatgagtctgaataa 11987225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14430120 - 14429883
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14430120 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 14430021  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14430020 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaa 14429922  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  14429921 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 14429883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9644543 - 9644384
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||    
T  9644543 aaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattga 9644444  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644443 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 12321620 - 12321858
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12321620 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 12321719  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12321720 acttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 12321818  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||    
T  12321819 actacgttgcatgagtctatacaagatgattaagaagatg 12321858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8917661 - 8917439
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  8917661 aaggaactttgggtgctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 8917562  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |    
T  8917561 ttgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaa 8917464  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8917463 actaagttgcatgagtatgaataag 8917439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13149389 - 13149167
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  13149389 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 13149290  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  13149289 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 13149192  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  13149191 actaagttgcatgtgtatgaataag 13149167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832561
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751871
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 173  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  174 gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 9751871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13461996 - 13461773
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| | ||| | |||| |||||    
T  13461996 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattg 13461897  T
Q  104 attg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||| | |     
T  13461896 attgtttttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaatta 13461799  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13461798 aactaatttgcatgagtatgaataag 13461773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918872
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 13918872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859178
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1859115 aagct--tgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 1859178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2760375 - 2760153
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  2760375 ggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 2760277  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  2760276 tgcattacttgagatattattgaatgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgt 2760177  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  2760176 tatttaactaagttgcatgagtct 2760153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3272067 - 3271823
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  3272067 ggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaat 3271968  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3271967 tgcattacttgaa-tattattgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttg 3271870  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  3271869 ttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 3271823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927595
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttatt 25927531  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25927532 aagtt--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 25927595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 16457312 - 16457446
Alignment:
Q  89 gtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 187  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16457312 gtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  188 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 16457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 7519331 - 7519447
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  7519331 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 7519427  T
Q  206 taagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  7519428 taagttggatgagtctgaat 7519447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16724502 - 16724723
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||     
T  16724502 aaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 16724600  T
Q  104 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||||| |     
T  16724601 attatatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttatta 16724697  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16724698 aactaagttgcatgagtatgaataag 16724723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 17701516 - 17701737
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||     
T  17701516 aaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 17701614  T
Q  104 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||||| |     
T  17701615 attatatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttatta 17701711  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17701712 aactaagttgcatgagtatgaataag 17701737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6801439 - 6801229
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-cat 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |    
T  6801439 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgccct 6801340  T
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  6801339 tacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 6801243  T
Q  211 tgcatgagtctgaa 224  Q
    |||||| |||||||    
T  6801242 tgcatgggtctgaa 6801229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 2530342 - 2530484
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttga-tgtgatctgat 183  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||    
T  2530342 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgattatgatttgat 2530439  T
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2530440 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 2530484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39268016
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgatcaagatgatg 39268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15728559 - 15728337
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| |||||     
T  15728559 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattga 15728461  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  15728460 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 15728363  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15728362 aactaagttgcatgaatatgaataag 15728337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14217149 - 14216927
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||     
T  14217149 aaggaactgtaggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattga 14217051  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  14217050 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattg 14216953  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14216952 aactaagttgcatgaatatgaataag 14216927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152105
Alignment:
Q  189 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 14152105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18425566 - 18425450
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  18425566 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaac 18425473  T
Q  206 taagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| || | ||||||||    
T  18425472 taagttgcaagaatatgaataag 18425450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  31 tatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattg 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 16438905 - 16438985
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 85  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  16438905 aaggaactttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattat 16438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 45169961 - 45170091
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  45169961 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 45170054  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  45170055 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 45170091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 9446031 - 9446253
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  9446031 ggaactttaggtagtaatgaaacatatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 9446130  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
T  9446131 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgt 9446229  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  9446230 tatttaactaagttgcatgagtct 9446253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18557199 - 18556996
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-t 110  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||  |  ||| ||||   |||| ||| | |    
T  18557199 ttaggtgctagtgagacctattaaagatattatctgagaactgtgaagc-cttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatt 18557101  T
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  18557100 tacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 18557003  T
Q  211 tgcatga 217  Q
    |||||||    
T  18557002 tgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Original strand, 48593327 - 48593374
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa 52  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593327 aaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaa 48593374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Original strand, 20569474 - 20569619
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |  ||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  20569474 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 20569573  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  20569574 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 20569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35151795 - 35151618
Alignment:
Q  50 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  35151795 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttgcttgaattattgttgaatgatgaagaagctattga 35151697  T
Q  148 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
      |||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35151696 gtatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 35151618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275504
Alignment:
Q  169 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16275504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42205347 - 42205284
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaa 70  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42205347 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaa 42205284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649606
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42204064 - 42204017
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  42204064 tgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtc 42204017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Original strand, 45170268 - 45170339
Alignment:
Q  60 gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  45170268 gctattatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 45170339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24054523 - 24054477
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagat 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  24054523 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagat 24054477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15211520 - 15211484
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15211520 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 17138101 - 17138177
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  17138101 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17804432 - 17804191
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804432 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 17804333  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804332 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 17804233  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17804232 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 17804191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 25767039 - 25767280
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25767039 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattga 25767138  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25767139 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaa 25767238  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25767239 ctaagttgcatgagtctgaataagatatttgaaatgatgatg 25767280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 22429903 - 22430122
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429903 ggaactttaggttatggtgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 22430002  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22430003 gcattacttgaattattattaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaact 22430102  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaata 226  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22430103 aagttgcatgagtctgaata 22430122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14472503 - 14472292
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14472503 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 14472404  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14472403 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtt-attaact 14472305  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  14472304 aagttgcatgagt 14472292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 18955636 - 18955848
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18955636 ggaactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgatt 18955735  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  18955736 gcattacttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaact 18955835  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  18955836 aagttgcatgagt 18955848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22863179 - 22862967
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22863179 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22863080  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22863079 gcattacttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 22862980  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  22862979 aagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19870823 - 19870611
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19870823 gaactttaggtacatagtgtgacctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19870724  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870723 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19870624  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  19870623 aagttacatgagt 19870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1644918 - 1644726
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644918 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 1644819  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1644818 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 1644726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11567095 - 11566883
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11567095 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11566996  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11566995 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 11566896  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  11566895 aagttacatgagt 11566883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12706926 - 12706705
Alignment:
Q  3 ggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||||    
T  12706926 ggaagaaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggatt 12706827  T
Q  103 gattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  12706826 gattgcatttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 12706729  T
Q  202 taactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12706728 taactaagttgcatgagtctgaat 12706705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23395301 - 23395089
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23395301 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 23395202  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23395201 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 23395102  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  23395101 aagttacatgagt 23395089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23990153 - 23989941
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23990153 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 23990054  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23990053 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 23989954  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  23989953 aagttacatgagt 23989941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8244074 - 8243882
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8244074 gacctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 8243975  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8243974 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 8243882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 18917159 - 18917351
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18917159 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattatt 18917258  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18917259 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18917351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16741438 - 16741222
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16741438 gaactttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 16741339  T
Q  108 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||    
T  16741338 catttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaact 16741241  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaat 225  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  16741240 aagttgcatgtgtctgaat 16741222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 12618718 - 12618929
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12618718 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgatt 12618817  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12618818 gcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12618916  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  12618917 aagttacatgagt 12618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18907349 - 18907111
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18907349 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcatt 18907250  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18907249 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 18907151  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  18907150 actaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 5616685 - 5616908
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  5616685 aaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattg 5616784  T
Q  104 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  5616785 attgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 5616882  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5616883 aactaagttgcatgagtatgaataag 5616908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414658
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 23414658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556416
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 27556416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 2685190 - 2685407
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  2685190 aaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga 2685289  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  2685290 ttgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaa 2685386  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  2685387 actatgttgcatgagtctgaa 2685407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19662996 - 19662787
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 111  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  19662996 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 19662897  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  19662896 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 19662800  T
Q  212 gcatgagtctgaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  19662799 gcatgagtctgaa 19662787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 246
Target Start/End: Original strand, 27325581 - 27325730
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27325581 tgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattg 27325680  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27325681 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattgaaatgatgatg 27325730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 9482164 - 9482386
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| ||||||    
T  9482164 aaggaactttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattga 9482263  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||    
T  9482264 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttattta 9482361  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  9482362 actaagttgcatgtgtatgaataag 9482386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523500
Alignment:
Q  79 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tg 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |  ||       ||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  172 atgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16523500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 27415814 - 27415901
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27415814 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 20907854 - 20908098
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |    
T  20907854 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaa 20907952  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  20907953 atgcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctg 20908051  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  20908052 ttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 20908098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 22592679 - 22592884
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  22592679 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 22592777  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||| | | ||||| |||||||    
T  22592778 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaacta 22592875  T
Q  208 agttgcatg 216  Q
    |||||||||    
T  22592876 agttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12496543 - 12496333
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  12496543 aaggaactttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattga 12496444  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||   ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  12496443 ttgcctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgt---tgtgatctgattatgctgcaaatgttattt 12496347  T
Q  203 aactaagttgcatg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  12496346 aactaagttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 19790657 - 19790873
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  19790657 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 19790756  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19790757 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 19790856  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  19790857 actaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 21834782 - 21834916
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 125  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  21834782 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattat 21834879  T
Q  126 tgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 163  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834880 tgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 1587602 - 1587824
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| |||||     
T  1587602 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattga 1587700  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  1587701 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 1587798  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  1587799 aactaagttgcatgaatatgaataag 1587824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18180736 - 18180494
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||| || | || || ||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  18180736 ggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 18180638  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18180637 tgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 18180539  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  18180538 atttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 18180494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 20803427 - 20803647
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--at 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    
T  20803427 gaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaat 20803526  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
        || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  20803527 atacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 20803624  T
Q  206 taagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| ||||||| | ||||||||    
T  20803625 taagctgcatgaatatgaataag 20803647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416278
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 27416222  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 226  Q
    ||||  |||||      |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27416223 aagc--ttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 27416278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766695
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16624283 - 16624144
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||   ||||| |||  |||    
T  16624283 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaag--tttgatatgaattga 16624190  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16624189 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 16624144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 31477765 - 31477895
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  31477765 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 31477858  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  31477859 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 31477895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 15894310 - 15894427
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 114  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15894310 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15894409  T
Q  115 tgaattattattgaatga 132  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  15894410 tgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894555
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 15894555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16760446 - 16760316
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  16760446 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 16760353  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||    
T  16760352 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcacgagt 16760316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22949259 - 22949129
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  22949259 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 22949166  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22949165 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 22949129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22953215 - 22953085
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  22953215 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 22953122  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22953121 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 22953085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23871703 - 23871573
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  23871703 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 23871610  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  23871609 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 23871573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23875659 - 23875529
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  23875659 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 23875566  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  23875565 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 23875529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1644415 - 1644300
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1644415 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 1644318  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  1644317 tgcaagagtatgaataag 1644300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 31478209 - 31478324
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31478209 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 31478306  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  31478307 tgcaagagtatgaataag 31478324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848114
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 21739900 - 21740020
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21739900 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcatt 21739999  T
Q  112 acttgaattattattgaatga 132  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  21740000 acttgaaatgttaatgaatga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22432308 - 22432249
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  22432308 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22438858 - 22438799
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  22438858 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1644548 - 1644462
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1644548 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaa 1644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041667
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtctttataagatgaacaagatgatg 15041667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553666
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtct 27553666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19873120
Alignment:
Q  166 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992429
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19862978
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 22408183 - 22408398
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| || | |||| |||||||||| |||| ||| | ||||||  || || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  22408183 ttaggtagtagtaagacttatttaagatgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 22408281  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||   ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  22408282 acttgaaatattcttgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatactgcttttgttattta 22408380  T
Q  204 actaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||| ||||||    
T  22408381 accaagttgcacgagtct 22408398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 23657293 - 23657513
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||| | |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||   || ||||||||||||  |||| | |    
T  23657293 ggaactttaggtagtaatatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaat 23657392  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaag-ttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |   | | ||||||||||||||||| |        ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||    
T  23657393 gcattacttgatttattcttgaataaccttaatgattgttgaaaatgaattgttctgatgaaattataatgctgctgtgatctgattatgctgctgctgt 23657492  T
Q  198 taattaactaagttgcatgag 218  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23657493 tatttaactaagttgcatgag 23657513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 16523281 - 16523330
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagct 62  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16523281 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagct 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21702477 - 21702300
Alignment:
Q  50 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | || |||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  21702477 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactttcttgaatttttgttgaatgatcaagaaactattga 21702379  T
Q  148 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
      |||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  21702378 gtatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataag 21702300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 25642064 - 25642196
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25642064 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 25642163  T
Q  114 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 146  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  25642164 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 27567656 - 27567704
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27567656 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagtct 27567704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16760135 - 16760068
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16760135 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 16760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948881
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952837
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22952837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871325
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875281
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 16929647 - 16929701
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 238  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  16929647 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaaga 16929701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 16965367 - 16965421
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 238  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  16965367 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaaga 16965421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Original strand, 22074174 - 22074307
Alignment:
Q  96 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattat 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || |    
T  22074174 attgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaaatgttgctg-aaatgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgt 22074272  T
Q  187 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    |||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  22074273 gctgttattattatttaactatgatgcatgagtct 22074307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 25603425 - 25603478
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25603425 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 25611763 - 25611816
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25611763 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 243
Target Start/End: Original strand, 25642227 - 25642304
Alignment:
Q  166 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  25642227 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 25642304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 20461371 - 20461612
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461371 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 20461470  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461471 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 20461570  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20461571 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 20461612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 7793220 - 7793462
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7793220 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattga 7793319  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctg-attatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7793320 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaatta 7793419  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7793420 actaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 7793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 327035 - 327277
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327035 aaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 327134  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga-ttatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  327135 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaatta 327234  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  327235 actaagttgcatgagtctgaataagataattaaattgatgatg 327277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15482890 - 15482675
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482890 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 15482791  T
Q  113 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482790 cttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 15482691  T
Q  213 catgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  15482690 catgagtctgaataag 15482675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 2897696 - 2897935
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897696 ggaactttaggtaatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 2897795  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2897796 gcattactggaattattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 2897895  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2897896 aagttgcatgagtctgaataagataatcaagttgatgatg 2897935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 31097425 - 31097649
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  31097425 aaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattg 31097524  T
Q  104 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31097525 attccactacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaatta 31097624  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31097625 actatgttgcatgagtctgaataag 31097649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30066182 - 30065970
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30066182 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 30066083  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30066082 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 30065983  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  30065982 aagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11854969 - 11854757
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11854969 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11854870  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11854869 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaact 11854770  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  11854769 aagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11070304 - 11070092
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11070304 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11070205  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11070204 gcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 11070105  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  11070104 aagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 11165402 - 11165614
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11165402 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11165501  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11165502 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 11165601  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  11165602 aagttacatgagt 11165614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55023103 - 55022891
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55023103 ggaactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 55023004  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  55023003 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaact 55022904  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  55022903 aagttacatgagt 55022891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15617610 - 15617398
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15617610 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 15617511  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617510 acattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 15617411  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  15617410 aagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14499559 - 14499349
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14499559 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgc 14499460  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  14499459 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaa 14499360  T
Q  209 gttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||    
T  14499359 gttgcatgagt 14499349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7109934 - 7109722
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7109934 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 7109835  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7109834 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 7109735  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  7109734 aagttacatgagt 7109722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7113869 - 7113657
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7113869 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 7113770  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7113769 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 7113670  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  7113669 aagttacatgagt 7113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22336955 - 22336743
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22336955 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22336856  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22336855 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 22336756  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  22336755 aagttacatgagt 22336743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 27409517 - 27409729
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27409517 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27409616  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27409617 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27409716  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  27409717 aagttacatgagt 27409729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28949960 - 28949748
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28949960 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 28949861  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28949860 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 28949761  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  28949760 aagttacatgagt 28949748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22321900 - 22321688
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22321900 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22321801  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22321800 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 22321701  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  22321700 aagttacatgagt 22321688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 15849958 - 15850176
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15849958 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgatt 15850057  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15850058 gcataacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaattgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaact 15850154  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  15850155 aagttgcatgagactgaataag 15850176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 11300384 - 11300539
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11300384 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11300483  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11300484 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 18383795 - 18384032
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18383795 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcatt 18383894  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18383895 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 18383993  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  18383994 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16797925 - 16798147
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  16797925 aaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 16798024  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||| | |    
T  16798025 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaa 16798122  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||    
T  16798123 actatgttgcatgagtatgaataag 16798147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 19725790 - 19726004
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| | ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19725790 ttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacatt 19725889  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-------aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19725890 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 19725988  T
Q  205 ctaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  19725989 ctaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 322829 - 322592
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  322829 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 322730  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  322729 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaa 322631  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||    
T  322630 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattatgatgatg 322592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16808752 - 16808974
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  16808752 aaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 16808851  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||| | |    
T  16808852 ttgtatttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaa 16808949  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||    
T  16808950 actatattgcatgagtatgaataag 16808974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17242207 - 17241990
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  17242207 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga 17242108  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  17242107 ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaa 17242011  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  17242010 actatgttgcatgagtctgaa 17241990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12496495 - 12496257
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  12496495 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 12496397  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12496396 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 12496298  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  12496297 aactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 12496257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665398
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668554
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 172  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttga 14668628  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14668627 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11863031 - 11862793
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  11863031 ttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcatt 11862932  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgat------gtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||      |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11862931 acttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttattta 11862833  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  11862832 actaagttgcatgagtctttacaagatgattaagatgatg 11862793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 11298407 - 11298644
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11298407 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 11298505  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  11298506 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 11298604  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  11298605 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 3402830 - 3403050
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  3402830 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 3402929  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3402930 cattccttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgtta 3403029  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtc 220  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  3403030 tttaactaagttgcatgagtc 3403050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223077
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 5223141  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5223140 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatgagtatgaataag 5223077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464878
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 15464878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11851810 - 11851581
Alignment:
Q  22 aatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatt 120  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11851810 aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11851711  T
Q  121 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11851710 attattgaatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttg 11851612  T
Q  213 catgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  11851611 catgagtctatacaagatgattaagatgatg 11851581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 3389808 - 3390030
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  3389808 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 3389907  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3389908 tgcattacttgatttattcttgaaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgt 3390007  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  3390008 tatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38814619 - 38814409
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||    
T  38814619 aaggaactttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatga 38814520  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  38814519 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 38814422  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  38814421 actaagttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038068
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 151  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaat 12037969  T
Q  152 gaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||        ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtttatataagatgattaagatgatg 12038068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339479
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 12339543  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    || |  |||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12339542 aaac--ttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 12339479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3833909 - 3833699
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  3833909 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 3833810  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  3833809 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 3833712  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  3833711 actaagttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 1982689 - 1982905
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 112  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  1982689 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 1982788  T
Q  113 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1982789 cttgaactatttttgaatgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 1982888  T
Q  205 ctaagttgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  1982889 ctaagttgcatgagtct 1982905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489564
Alignment:
Q  120 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T
Q  220 ctgaataag 228  Q
     ||||||||    
T  8489556 atgaataag 8489564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 11300696 - 11300854
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  11300696 ttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 11300794  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    || | ||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11300795 aaac-gtt-atgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaa 11300854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11595017 - 11595233
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11595017 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11595116  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  11595117 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 11595216  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  11595217 actaagttgcatgagtc 11595233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854430
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  11854448 ttgcatgagtatgaataag 11854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 16750543 - 16750682
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  16750543 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 16750636  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16750637 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 16750682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172796
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattatgatgatg 12172796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 4111204 - 4111334
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  4111204 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 4111297  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  4111298 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 4111334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15965123 - 15964993
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15965123 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15965030  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15965029 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15969047 - 15968917
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15969047 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15968954  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15968953 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15968917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15972971 - 15972841
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15972971 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15972878  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15972877 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19775919 - 19775789
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  19775919 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 19775826  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  19775825 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 19775789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 4107352 - 4107482
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  4107352 tatactgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 4107445  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  4107446 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 4107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 11557257 - 11557477
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  11557257 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 11557356  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||| || ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  11557357 tgcattacttgaattattcttgaataaattagatgttgatg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgt 11557455  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagt 219  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  11557456 tatttaactaagttgcatgagt 11557477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12173004 - 12172924
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12173004 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 239
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053200
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagat 239  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatataagatgattaagat 23053200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 37439591 - 37439721
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  37439591 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 37439684  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  37439685 ttatgctacaattgttgttaaactaagttgcatgagt 37439721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325964
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa-gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||| || |||  || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtttttta 42325981  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  42325980 actaagttgcatgagtc 42325964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 4589172 - 4589287
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4589172 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 4589269  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  4589270 tgcaagagtatgaataag 4589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19775475 - 19775360
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19775475 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 19775378  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  19775377 tgcaagagtatgaataag 19775360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 26190881 - 26190947
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatg 73  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  26190881 ggaactttaggtagtaatgagacctatttaagatgttaactgaaaattgtgaacctattttgaaatg 26190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15060532 - 15060427
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15060532 ttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 15060433  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  15060432 acttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 15941775 - 15941985
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt-g 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || || | |||| || || ||||| | ||||||| || |||  ||| || | ||||  ||| |||| |    
T  15941775 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagaggtaatgactgtgagctttgaagattttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggatttg 15941874  T
Q  104 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||||| || |||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  15941875 attgcctttacttgatttattgctaattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 15941971  T
Q  203 aactaagttgcatg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  15941972 aactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23408506 - 23408428
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  23408506 gctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822267
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 245  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511084
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 12511084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15051756 - 15051655
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15051756 ttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 15051657  T
Q  112 ac 113  Q
    ||    
T  15051656 ac 15051655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16909990 - 16909885
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||    
T  16909990 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattttatt 16909891  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  16909890 acttga 16909885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878168
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 23077518 - 23077594
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  23077518 tgttgttgtgatctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878633
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696798
Alignment:
Q  169 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16696798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 23052996 - 23053061
Alignment:
Q  54 tgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 118  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23052996 tgtgaagctattatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaa 23053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 856216 - 856140
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  856216 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Original strand, 1598477 - 1598560
Alignment:
Q  130 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  1598477 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgc-aatgttatttaactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 243
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  195 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964745
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15964745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968669
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972593
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15972593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30029922 - 30029867
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029922 gctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 30029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051531
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060307
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16369476 - 16369423
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16369476 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtc 16369423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16369648 - 16369543
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||   |  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  16369648 ttaggtagtaatgtgatctatataagatgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcatt 16369549  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  16369548 acttga 16369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 16865004 - 16865101
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | | |  ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||||||| ||||    
T  16865004 aaggaactttaggtactaatgtgacctatcaaagataatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaagagattatgaaatgatttatggatt 16865101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16909818 - 16909765
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16909818 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 16909765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525252
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 17525252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24735638 - 24735397
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735638 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 24735539  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735538 tcgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 24735439  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24735438 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaaagtgatgatg 24735397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 10101518 - 10101730
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10101518 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 10101617  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10101618 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 10101717  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  10101718 aagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 19688630 - 19688779
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688630 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 19688729  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688730 cattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 12901385 - 12901597
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12901385 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12901484  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12901485 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaact 12901584  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  12901585 aagttgcatgagt 12901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24649570 - 24649378
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649570 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 24649471  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24649470 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 27379306 - 27379518
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27379306 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27379405  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27379406 gcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27379505  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  27379506 aagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 27383352 - 27383564
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27383352 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27383451  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383452 gcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27383551  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  27383552 aagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27602029 - 27601817
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27602029 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27601930  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27601929 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27601830  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  27601829 aagttacatgagt 27601817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 24628352 - 24628564
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24628352 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 24628451  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24628452 gcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaact 24628551  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  24628552 aagttacatgagt 24628564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 41530883 - 41531089
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41530883 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 41530982  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  41530983 gcattacttgaattattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 41531076  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  41531077 aagttgcatgagt 41531089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 22811787 - 22812028
Alignment:
Q  11 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattga-ttgc 108  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  22811787 ctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgc 22811886  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  22811887 attacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttat 22811985  T
Q  201 ttaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  22811986 ttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 25963595 - 25963832
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  25963595 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 25963693  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  25963694 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattga 25963792  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  25963793 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 25963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 22461068 - 22461277
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 111  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  22461068 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 22461167  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  22461168 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 22461264  T
Q  212 gcatgagtctgaa 224  Q
    |||||||||||||    
T  22461265 gcatgagtctgaa 22461277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31345052 - 31344890
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31345052 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 31344954  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31344953 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatgagtatgaataag 31344890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15477836 - 15477711
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15477836 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 15477737  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15477736 gcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 19928373 - 19928583
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || || | |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  19928373 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattga 19928472  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  19928473 ttgtctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 19928570  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  19928571 actaagttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 25961407 - 25961628
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||| | |    
T  25961407 ggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaat 25961506  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25961507 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgtt 25961606  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  25961607 atttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 18855332 - 18855541
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |  |||  |||  | |||    
T  18855332 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtga 18855431  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||  |||    
T  18855432 ttgcctttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgttta 18855528  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  18855529 actaagttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 24716403 - 24716645
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| |     
T  24716403 ggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 24716501  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24716502 tgcattactagacatattattgaatgattatgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 24716600  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  24716601 atttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 24716645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23187302 - 23187088
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | ||    
T  23187302 ttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattt 23187203  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  23187202 acttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23187105  T
Q  212 gcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||||| ||||||||    
T  23187104 ccatgagtatgaataag 23187088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23598565 - 23598351
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | ||    
T  23598565 ttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattt 23598466  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  23598465 acttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23598368  T
Q  212 gcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||||| ||||||||    
T  23598367 ccatgagtatgaataag 23598351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40428708 - 40428486
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  40428708 ggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 40428609  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  40428608 tgcattacttgatttattcttaaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgt 40428509  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  40428508 tattgaactaagttgcatgagtc 40428486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 21327439 - 21327662
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||    
T  21327439 ggaactttaagtagtagtgagacatatttaaaatgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaat 21327538  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  21327539 tgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttg 21327637  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21327638 ttatttaaccaagttgcatgagtct 21327662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 243
Target Start/End: Original strand, 21916069 - 21916215
Alignment:
Q  104 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||    
T  21916069 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  196 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21916215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 21318508 - 21318731
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||| |||    |||||||||  |||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||    
T  21318508 ggaactttaagtagtagtgagacatatttaagatgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaat 21318607  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  21318608 tgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttg 21318706  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21318707 ttatttaaccaagttgcatgagtct 21318731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 61050 - 60829
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||     
T  61050 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 60952  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  60951 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgat-tgattatgctgcaattgttatta 60855  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  60854 aactaagttgcatgaatatgaataag 60829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24175044 - 24174822
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  24175044 ggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 24174945  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  24174944 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgt 24174846  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24174845 tatttaactaagttgcatgagtct 24174822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37524905 - 37524697
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||   ||||||||||  |||||| || || | ||||||||||||||||||       ||||||||    
T  37524905 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgattta-------attgcatt 37524814  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||| |         |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37524813 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaa-tgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttattta 37524715  T
Q  204 actaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||    
T  37524714 accaagttgcatgagtct 37524697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24673809 - 24673697
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 119  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  24673809 taatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaa 24673710  T
Q  120 tattattgaatga 132  Q
    | ||| |||||||    
T  24673709 tgttaatgaatga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27263508 - 27263285
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||| | | || ||| ||||||| | |||| |||| |||||     
T  27263508 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatggattga 27263410  T
Q  104 -attgcattacttgaa-ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
     ||    || |||||| ||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  27263409 aatatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 27263312  T
Q  202 taactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27263311 aaactaagttgcatgaatatgaataag 27263285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 30344946 - 30345076
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  30344946 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 30345039  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  30345040 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 30345076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666962
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  41666980 ttgcatgattatgaataag 41666962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 24655211 - 24655433
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  24655211 ggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 24655310  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  |||    
T  24655311 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgt 24655409  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24655410 tatttaactaagttgcatgagtct 24655433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1283540 - 1283410
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  1283540 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1283447  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||    
T  1283446 ttatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatgagt 1283410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 21918194 - 21918284
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21918194 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 22799167 - 22799243
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  22799167 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869902
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 24869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24673639 - 24673569
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24673639 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctgtacaagatgattaagatgatg 24673569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 22758596 - 22758715
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22758596 ggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22758695  T
Q  114 ttgaattattattgaatgat 133  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  22758696 ttgaattatgaatgaatgat 22758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 23019747 - 23019823
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23019747 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616212
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtc 25616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 22740841 - 22740973
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22740841 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22740940  T
Q  114 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 146  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  22740941 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 40622251 - 40622327
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  40622251 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24680258 - 24680191
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatg 240  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  24680258 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcttgagtctgtacaagatgattaagatg 24680191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 243
Target Start/End: Original strand, 22741004 - 22741081
Alignment:
Q  166 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  22741004 ctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 22741081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 45678189 - 45678246
Alignment:
Q  186 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||    
T  45678189 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtccatacaagatgattaagatgatg 45678246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 246
Target Start/End: Original strand, 36133837 - 36134074
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133837 aactttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 36133936  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133937 attacttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 36134036  T
Q  209 gttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36134037 gttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 36134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17810505 - 17810293
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17810505 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 17810406  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17810405 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 17810306  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  17810305 aagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 14757295 - 14757507
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14757295 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 14757394  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14757395 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 14757494  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  14757495 aagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9556763 - 9556551
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9556763 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 9556664  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9556663 gcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 9556564  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  9556563 aagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 1951632 - 1951851
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||    
T  1951632 aaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattga 1951731  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  1951732 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattta 1951829  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1951830 actaagttgcatgagtctgaat 1951851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27534258 - 27534047
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27534258 gaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattg 27534159  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||    
T  27534158 cattacttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaacta 27534059  T
Q  208 agttgcatgagt 219  Q
    ||||||||||||    
T  27534058 agttgcatgagt 27534047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 4561207 - 4561419
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4561207 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 4561306  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4561307 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 4561406  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  4561407 aagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 18222249 - 18222468
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  18222249 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 18222348  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  18222349 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattta 18222446  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18222447 actaagttgcatgagtctgaat 18222468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 5756811 - 5757023
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5756811 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 5756910  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5756911 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaact 5757010  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  5757011 aagttacatgagt 5757023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634516
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 180  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  181 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtctgaataag 22634516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17152354 - 17152576
Alignment:
Q  1 agggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||    
T  17152354 agggaaggaactttaggtgttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatgga 17152453  T
Q  101 ttgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  17152454 ttgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtta 17152550  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  17152551 tttaactaagttgcatgagtctgaat 17152576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33742610 - 33742399
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33742610 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgatt 33742511  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33742510 gcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 33742412  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  33742411 aagttacatgagt 33742399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 18228724 - 18228943
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  18228724 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 18228823  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  18228824 ttgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatttttattta 18228921  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18228922 actaagttgcatgagtctgaat 18228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 16487956 - 16488194
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16487956 ttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 16488055  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16488056 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttattta 16488154  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  16488155 actaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 26243536 - 26243746
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||    
T  26243536 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatga 26243635  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  26243636 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 26243733  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  26243734 actaagttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3413030 - 3412811
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-a 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |    
T  3413030 aggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaa 3412933  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||  |||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  3412932 ttatatttattgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaa 3412835  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  3412834 ctaagttgcatgagtatgaataag 3412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 16356831 - 16357068
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16356831 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16356929  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  16356930 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16357028  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  16357029 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18237127 - 18236904
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  18237127 aaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattg 18237028  T
Q  104 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  18237027 attgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 18236930  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18236929 aactaagttgcatgagtatgaataag 18236904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 16243271 - 16243493
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||||    
T  16243271 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattga 16243370  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  16243371 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 16243468  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  16243469 actaagttgcatgtgtatgaataag 16243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23139505 - 23139296
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  23139505 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga 23139406  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  23139405 ttgcccatacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 23139309  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  23139308 actaagttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256505
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 43256441  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43256442 aagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 43256505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 19757472 - 19757682
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  19757472 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 19757571  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  19757572 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 19757669  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  19757670 actaagttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19782334 - 19782124
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  19782334 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 19782235  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  19782234 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 19782137  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  19782136 actaagttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 16348543 - 16348780
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16348543 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16348641  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  16348642 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16348740  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  16348741 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157579
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813135
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 13813135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 43256033 - 43256120
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43256033 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2015010 - 2014791
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  ||||| |  |||  ||| |||||||||    
T  2015010 gaactttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattgattg 2014911  T
Q  108 catt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    | || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2014910 cctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 2014813  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  2014812 aagttgcatgtgtatgaataag 2014791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 5338853 - 5339076
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5338853 ggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaat 5338952  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  5338953 tgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattg 5339051  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  5339052 ttatttaactatgatgcatgagtct 5339076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9530668 - 9530460
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||  |  |||  ||| || |||    
T  9530668 aaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtga 9530569  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | ||||| |||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||| | |||    
T  9530568 ttgcctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcattta 9530472  T
Q  204 actaagttgcat 215  Q
    ||||||||||||    
T  9530471 actaagttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 15353179 - 15353402
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  15353179 ggaactttaggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 15353278  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  15353279 tgcattacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctg 15353377  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  15353378 ttatttaactaagttgcatgagtct 15353402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12570259 - 12570142
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 114  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12570259 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 12570160  T
Q  115 tgaattattattgaatga 132  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  12570159 tgaaatgttaatgaatga 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25555744 - 25555599
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  25555744 ttaggtagtaatgaaacttatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 25555645  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  25555644 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 25555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10713004 - 10712874
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10713004 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10712911  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10712910 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10712874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10926774 - 10926644
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10926774 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10926681  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10926680 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10926644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11250439 - 11250655
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11250439 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11250538  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    || ||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  11250539 acatgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttattta 11250638  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  11250639 actaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 28569314 - 28569537
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||    
T  28569314 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 28569412  T
Q  104 a-ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    | ||  | | ||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  28569413 aattatactcacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 28569510  T
Q  202 taactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28569511 taactaagttgcatgattatgaataag 28569537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12570014
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12570014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 14954122 - 14954252
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  14954122 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14954215  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14954216 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 14954252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25690021 - 25689891
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  25690021 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 25689928  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  25689927 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 25689891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 14708611 - 14708727
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||  | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14708611 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 14708708  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  14708709 ttgcatgattatgaataag 14708727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 18602624 - 18602715
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  18602624 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45938284 - 45938173
Alignment:
Q  101 ttgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  45938284 ttgattgccttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 45938189  T
Q  201 ttaactaagttgcatg 216  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45938188 ttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44675872 - 44675762
Alignment:
Q  14 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  44675872 taggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcatt 44675773  T
Q  112 acttgaattat 122  Q
    |||||| ||||    
T  44675772 acttgagttat 44675762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15224922 - 15224807
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15224922 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 15224825  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| || | ||||||||    
T  15224824 tgcaagaatatgaataag 15224807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 18609218 - 18609290
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 85  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  18609218 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattat 18609290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 42997366 - 42997543
Alignment:
Q  50 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||  | ||||    
T  42997366 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 42997464  T
Q  148 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  42997465 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataag 42997543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12487862 - 12487732
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  |||    
T  12487862 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 12487769  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  12487768 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagt 12487732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23843711 - 23843608
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 118  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||     
T  23843711 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgag 23843612  T
Q  119 ttat 122  Q
    ||||    
T  23843611 ttat 23843608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555503
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 25555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15093853 - 15093775
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||    
T  15093853 gctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15225035 - 15224962
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  15225035 tataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgtt-aaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 18602766 - 18602824
Alignment:
Q  170 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18602766 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18602824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609396
Alignment:
Q  172 atgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18609396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954500
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 16351721 - 16351864
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  |  ||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  16351721 ggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 16351820  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||    
T  16351821 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa 16351864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689643
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 25689643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 110
Target Start/End: Original strand, 15125071 - 15125130
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15125071 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843501
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 23843501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13136 - 12916
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 13037  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13036 cattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaacta 12937  T
Q  208 agttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12936 agttgcatgagtctgaataag 12916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19420 - 19200
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19420 gaactttcggtactaatgagatatatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 19321  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19320 cattactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaacta 19221  T
Q  208 agttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19220 agttgcatgagtctgaataag 19200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62273
Alignment:
Q  113 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  213 catgagtctgaataag 228  Q
    ||||| | ||||||||    
T  62288 catgattatgaataag 62273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 16080315 - 16080536
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080315 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 16080414  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16080415 ttgcattacttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaa 16080514  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaata 226  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16080515 ctaagttgcatgagtctgaata 16080536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 36819179 - 36819403
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36819179 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattga 36819278  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819279 ttgcatttcttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 36819378  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36819379 actaagttgcatgagtctgaataag 36819403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 24782973 - 24783212
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24782973 ggaactttaagttatagtgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaatt 24783072  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24783073 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 24783172  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24783173 aagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1010956 - 1010744
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1010956 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 1010857  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1010856 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 1010757  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  1010756 aagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 20228682 - 20228894
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20228682 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 20228781  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  20228782 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaact 20228881  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  20228882 aagttgcatgagt 20228894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 16375331 - 16375543
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16375331 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16375430  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16375431 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16375530  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  16375531 aagttacatgagt 16375543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21407588 - 21407376
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21407588 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21407489  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21407488 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21407389  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  21407388 aagttacatgagt 21407376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19212102 - 19211883
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19212102 aaggaactttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 19212003  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  19212002 ttgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattta 19211905  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19211904 actaagttgcatgagtctgaat 19211883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52639774 - 52639562
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52639774 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 52639675  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52639674 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaact 52639575  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  52639574 aagttacatgagt 52639562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Original strand, 23819170 - 23819383
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  23819170 aaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattga 23819269  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  23819270 ttgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaa 23819367  T
Q  204 actaagttgcatgagt 219  Q
    || |||||||||||||    
T  23819368 acgaagttgcatgagt 23819383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 18181999 - 18182237
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  18181999 ttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcatt 18182098  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18182099 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 18182197  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  18182198 actaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20138322 - 20138099
Alignment:
Q  1 agggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||    
T  20138322 agggaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatgga 20138223  T
Q  101 ttgattgcatta-cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20138222 ttggttgcctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtta 20138125  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  20138124 tttaactaagttgcatgagtctgaat 20138099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 22449144 - 22449382
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  22449144 ttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 22449243  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  22449244 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaa 22449343  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  22449344 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22449382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797295
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 33797295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12647097 - 12646888
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 111  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  12647097 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 12646998  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||    
T  12646997 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 12646901  T
Q  212 gcatgagtctgaa 224  Q
    |||||| ||||||    
T  12646900 gcatgaatctgaa 12646888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18882602 - 18882393
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||| |||||| |   ||  ||| || | |    
T  18882602 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaataa 18882503  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  18882502 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttattta 18882405  T
Q  204 actaagttgcat 215  Q
    ||||||||||||    
T  18882404 actaagttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33797767 - 33797680
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797767 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3473039
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | || ||    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaa-tgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaat 3472901  T
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat------gtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||      |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3472902 tacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaag-tgatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 3473000  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||    
T  3473001 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagttgatg 3473039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 18393836 - 18394059
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  18393836 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 18393935  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat-gaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |        ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||    
T  18393936 tgcattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctg 18394035  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  18394036 ttatttaactaagttgcatgagtc 18394059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 8761505 - 8761728
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  8761505 ggaactttaggtagtagtgaaacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaat 8761604  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  8761605 tgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattg 8761703  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  8761704 ttatttaactatgatgcatgagtct 8761728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46975699 - 46975494
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||  || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||    
T  46975699 gaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattg 46975600  T
Q  108 -cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  46975599 tctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 46975502  T
Q  207 aagttgca 214  Q
    ||||||||    
T  46975501 aagttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 45310239 - 45310462
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  45310239 ggaactttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 45310338  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| | |    
T  45310339 tgcattgcttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcg 45310438  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  45310439 ttatttaactaagttgcatgagtc 45310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313122
Alignment:
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 21313122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 17678460 - 17678702
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||| || |||| || ||||| | || |||||| ||||| ||||| |     
T  17678460 ggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaa 17678558  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17678559 tgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 17678657  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  17678658 atttaaccaagttgcatgagtcgttataagatgaataagatgatg 17678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21022879 - 21022767
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21022879 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcatt 21022780  T
Q  112 acttgaattatta 124  Q
    ||||||| |||||    
T  21022779 acttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 45489621 - 45489837
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  45489621 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 45489720  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  45489721 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattattta 45489820  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  45489821 actaagttgcatgagtc 45489837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 1925084 - 1925214
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  1925084 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1925177  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  1925178 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 1925214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 20924098 - 20924228
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  20924098 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 20924191  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  20924192 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 20924228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 22831256 - 22831375
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22831256 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatta 22831355  T
Q  113 cttgaattattattgaatga 132  Q
    |||||| | ||| |||||||    
T  22831356 cttgaaatgttaatgaatga 22831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 3704937 - 3705159
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| |  ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  3704937 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 3705036  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| | ||| |         ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  3705037 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgt 3705135  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  3705136 tatttaactaagttgcatgagtct 3705159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 39244096 - 39244235
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  |||    
T  39244096 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattga 39244189  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  39244190 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 39244235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 39247651 - 39247790
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  |||    
T  39247651 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattga 39247744  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  39247745 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 39247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 41388196 - 41388335
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||||  |||||  ||  |||    
T  41388196 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagc--ttgatacgaattga 41388289  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  41388290 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 41388335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6152096 - 6151976
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6152096 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcatt 6151997  T
Q  112 acttgaattattattgaatga 132  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  6151996 acttgaaatgttagtgaatga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 42865092 - 42865200
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42865092 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 42865191  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  42865192 ttgagttat 42865200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 21788014 - 21788159
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  21788014 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggt 21788113  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21788114 tatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229323
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  20229306 tgcaagagtatgaataag 20229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 33050067 - 33050118
Alignment:
Q  168 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  33050067 gttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 33050118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21022701 - 21022631
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21022701 tgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21022631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6151905 - 6151848
Alignment:
Q  186 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  6151905 tgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6151848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 246
Target Start/End: Original strand, 22468735 - 22468816
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  22468735 gctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 22831446 - 22831503
Alignment:
Q  186 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  22831446 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135188
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 2547 - 2766
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2547 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattg 2646  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2647 gattacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaacta 2745  T
Q  208 agttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2746 agttgcatgagtctgaataag 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18726
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18505 ggaactttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 18604  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18605 gcattacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacct 18704  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18705 aagttgcatgagtctgaataag 18726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 173525 - 173304
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  173525 aaggaactttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattga 173426  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  173425 ttgcattacttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaa 173328  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  173327 ctaagttgcatgagtctgaataag 173304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 422404 - 422648
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||| ||| |  ||||| | || ||||||||||||  || | |    
T  422404 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaa 422502  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 196  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  422503 atgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctg 422601  T
Q  197 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  422602 ttatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 422648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 13365 - 13568
Alignment:
Q  12 tttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13365 tttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 13464  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  13465 actttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagtt 13564  T
Q  212 gcat 215  Q
    ||||    
T  13565 gcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23535460 - 23535681
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  23535460 aaggaaccttaggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattatac-gtgatttattgataga 23535558  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23535559 ttgcattactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 23535657  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23535658 ctaagttgcatgagtctgaataag 23535681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410434
Alignment:
Q  79 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  179 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaaatgatgatg 17410434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 15236653 - 15236865
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15236653 ggaacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgatt 15236752  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15236753 gcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 15236852  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  15236853 aagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20296080 - 20295868
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20296080 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 20295981  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20295980 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 20295881  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  20295880 aagttacatgagt 20295868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 19472593 - 19472805
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19472593 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19472692  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19472693 gcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19472792  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  19472793 aagttacatgagt 19472805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18774439 - 18774219
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| |||||    
T  18774439 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattg 18774340  T
Q  104 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  18774339 attgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 18774242  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18774241 aactatgttgcatgagtctgaat 18774219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42805655 - 42805436
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  42805655 aaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 42805556  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  42805555 ttttatttacttgaattattattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 42805458  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  42805457 accaagttgcatgagtctgaat 42805436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 21366544 - 21366781
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21366544 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 21366643  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21366644 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 21366742  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  21366743 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21366781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 26742617 - 26742835
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  26742617 aaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttga 26742716  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  26742717 ttgtatttactcgaattattattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagc--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 26742814  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26742815 actaagttgcatgagtctgaa 26742835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18784282 - 18784062
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| |||||    
T  18784282 aaggaactttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattg 18784183  T
Q  104 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  18784182 attgtatttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 18784085  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  18784084 aactatgttgcatgagtctgaat 18784062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20232781 - 20232568
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  20232781 aactttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 20232682  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 207  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||    
T  20232681 ctttacttgaattattgttgattgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 20232585  T
Q  208 agttgcatgagtctgaa 224  Q
     ||||||| ||||||||    
T  20232584 tgttgcataagtctgaa 20232568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 26666002 - 26666219
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  26666002 aaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga 26666101  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  26666102 ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaa 26666198  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  26666199 actatgttgcatgagtctgaa 26666219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 26937599 - 26937816
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  26937599 aaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattga 26937698  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  26937699 ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaa 26937795  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  26937796 actatgttgcatgagtctgaa 26937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911263
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 20911199  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20911200 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 20911263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 24532919 - 24533136
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  24532919 aaggaactctaggtgcttgtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattga 24533018  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | |    
T  24533019 ttgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaa 24533115  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  24533116 actatgttgcatgagtctgaa 24533136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767665
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 24767665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33409463 - 33409253
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  33409463 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 33409364  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  33409363 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 33409266  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  33409265 actaagttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355970
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 18356034  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    || |  |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18356033 aaac--ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 18355970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Original strand, 17718311 - 17718520
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga- 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || | || |||||| |  |||  |||  |||||     
T  17718311 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgat 17718410  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| | |   ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||    
T  17718411 ttcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaa 17718508  T
Q  205 ctaagttgcatg 216  Q
    ||||||||||||    
T  17718509 ctaagttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18356561 - 18356474
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18356561 aggaaccttagatactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20805788 - 20805552
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20805788 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 20805690  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |         ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  20805689 acttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 20805592  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  20805591 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23451590 - 23451371
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||| ||||||||  |||| |     
T  23451590 ggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaa 23451492  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23451491 tgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 23451393  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  23451392 atttaaccaagttgcatgagtc 23451371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16674384 - 16674177
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| | ||||||| || |||| || ||| |  |||  ||| |||||||||    
T  16674384 gaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattgattg 16674285  T
Q  108 catt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16674284 cctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 16674187  T
Q  207 aagttgcatg 216  Q
    ||||||||||    
T  16674186 aagttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 20910680 - 20910813
Alignment:
Q  14 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||    
T  20910680 taggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgatataatgtttta-tgcattac 20910778  T
Q  114 tt--gaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 148  Q
    ||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20910779 ttaagaattat--ttgaatgttcaagatgttgttgaa 20910813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23458834 - 23458592
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| |     
T  23458834 ggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 23458736  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23458735 tgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgtt 23458637  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23458636 atttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23458592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23463095 - 23462853
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| |     
T  23463095 ggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 23462997  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  23462996 tgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgtt 23462898  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23462897 atttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23462853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 21340638 - 21340855
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  || |||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||    
T  21340638 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtga 21340737  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || ||| |||||||| || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  21340738 ttgcctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 21340834  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21340835 actaagttgcatgagtctgaa 21340855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20766974
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcattact 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| | ||||||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  115 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||        ||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaact 20767011  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  20767010 aagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 12028443 - 12028659
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  12028443 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 12028542  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  12028543 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 12028642  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  12028643 actaagttgcatgagtc 12028659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 123178 - 123417
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||   || ||||||||||||  |||| | |    
T  123178 ggaaccttaggtagtaatatgacctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaat 123277  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  123278 gcattacttgaattattcttgaataactttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 123377  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaaga 238  Q
    | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  123378 atttaactaagttgcatgagtcattataagataaataaga 123417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22757349 - 22757219
Alignment:
Q  28 acctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22757349 acctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattatt 22757250  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757249 gaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 21885059 - 21885282
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||    
T  21885059 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataattattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 21885157  T
Q  104 a-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    | ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  21885158 aattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 21885255  T
Q  202 taactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21885256 taactaagttgcatgattatgaataag 21885282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 25229277 - 25229499
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||     
T  25229277 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattga 25229375  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  25229376 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 25229473  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25229474 aactaagttgcatgaatatgaataag 25229499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 25293433 - 25293655
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||     
T  25293433 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattga 25293531  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  25293532 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 25293629  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25293630 aactaagttgcatgaatatgaataag 25293655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10753515 - 10753385
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10753515 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10753422  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10753421 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10753385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Original strand, 1858929 - 1859093
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtga 177  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||    
T  1858929 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtga 1859027  T
Q  178 tctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  1859028 tctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1859093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723672
Alignment:
Q  154 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 40723672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4036455 - 4036232
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| ||||||    
T  4036455 aaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattga 4036357  T
Q  105 --ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagt-tgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
      |    || ||||||||||| |||||||||||||||   | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  4036356 aatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 4036259  T
Q  202 taactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4036258 aaactaagttgcatgaatatgaataag 4036232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26172700 - 26172488
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg 103  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||    
T  26172700 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 26172602  T
Q  104 a-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| || || ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  26172601 aattacacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 26172504  T
Q  202 taactaagttgcatga 217  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26172503 taactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 17919026 - 17919245
Alignment:
Q  9 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| || || | ||||  ||||||  || ||||||| || |||||  || ||||||||||||  |||| | |||    
T  17919026 aactttaggtagtaaggaaacctatttaatatgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttgttgtaatgtgatttaaagattaaatgc 17919125  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 200  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||||     
T  17919126 attacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttat 17919225  T
Q  201 ttaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17919226 ttaactaagttgcatgagtc 17919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24222121 - 24221899
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  24222121 ggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagacgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 24222022  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  24222021 tgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgt 24221923  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  24221922 tatttaactaggttgcatgagtct 24221899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680604
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26680604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952211
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26952211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10753071 - 10752956
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10753071 tacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 10752974  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  10752973 tgcaagagtatgaataag 10752956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14079386 - 14079278
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14079386 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 14079287  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  14079286 ttgagttat 14079278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 17410682 - 17410646
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagata 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410682 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagata 17410646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517320
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23572084
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342169
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 31342169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512098
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31342291 - 31342219
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  31342291 taatgtgatttaacgattaattgcattacttgaattatccttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 31342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11220588 - 11220521
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11220588 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11228997 - 11228930
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11228997 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11228930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11230986 - 11230919
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11230986 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873254
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226940
Alignment:
Q  65 tatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11226940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201383
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 23201383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 23501415 - 23501472
Alignment:
Q  186 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  23501415 tgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079149
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctga-ataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgaat-tgatataagatgattaagatgatg 14079149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 228244 - 228466
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  228244 aaggaaccttaggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattga 228343  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  228344 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgctgcaattgttattta 228441  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  228442 actaagttgcatgagtctgaataag 228466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 3748 - 3960
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3748 ggaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 3847  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3848 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 3947  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  3948 aagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 19888 - 20110
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888 aaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattga 19987  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  19988 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaa 20085  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  20086 actaagttgcatgaatctgaataag 20110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 65401 - 65613
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65401 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 65500  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65501 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 65600  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  65601 aagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 61505 - 61697
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61505 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 61604  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61605 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 80945 - 80736
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  80945 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgatt 80846  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  80845 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaact 80749  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  80748 aagttgcatgagt 80736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 80422 - 80307
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  80422 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 80325  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  80324 tgcaagagtatgaataag 80307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12763
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 80533 - 80462
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80533 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12655 - 12443
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12655 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12556  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12555 gcattacttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 12456  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  12455 aagttacatgagt 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9759
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9536 aaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattga 9635  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9636 tcgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaatt 9733  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9734 aactatgttgcatgagtctaaataag 9759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 16231346 - 16231565
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  16231346 aagggactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 16231445  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  16231446 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattta 16231543  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16231544 actaagttgcatgagtctgaat 16231565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 19278156 - 19278368
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19278156 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19278255  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19278256 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19278355  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  19278356 aagttacatgagt 19278368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 21972458 - 21972670
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21972458 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21972557  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21972558 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21972657  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  21972658 aagttacatgagt 21972670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 21976543 - 21976755
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21976543 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21976642  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21976643 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21976742  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  21976743 aagttacatgagt 21976755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43252026 - 43251834
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43252026 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 43251927  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43251926 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22045116 - 22044900
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22045116 gaactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattg 22045017  T
Q  108 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||    
T  22045016 catttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaact 22044919  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaat 225  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22044918 aagttgcatgagtctgaat 22044900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22112084 - 22111904
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22112084 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22111985  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22111984 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23834408 - 23834188
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| || ||    
T  23834408 aaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactg 23834309  T
Q  104 attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |     
T  23834308 attgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgactatgatgcaattgttatta 23834211  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23834210 aactatgttgcatgagtctgaat 23834188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18619713 - 18619555
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  18619713 aaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattga 18619614  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619613 ttgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 20465917 - 20466157
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20465917 ttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 20466016  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  20466017 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttattta 20466115  T
Q  204 actaagttgcatgagtc--tgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||    
T  20466116 actaagttgcatgagtctatatataagatgattaagatgatg 20466157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22028792 - 22028647
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  22028792 aaggaactttaagtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattga 22028693  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22028692 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 30308625 - 30308846
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  30308625 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 30308724  T
Q  105 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||| ||| |||||||| ||| ||||||| | ||    
T  30308725 ttgtattacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaa 30308822  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||||    
T  30308823 ctaatttgcatgagtatgaataag 30308846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 30643169 - 30643408
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30643169 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcat 30643268  T
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30643269 tacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 30643367  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||    
T  30643368 aactaagttgcatgagtctattcaagatgattaagatgatg 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 17926585 - 17926822
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17926585 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 17926683  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| ||||||||| |||    
T  17926684 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttattta 17926782  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  17926783 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 15602903 - 15603111
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15602903 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15603001  T
Q  119 ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15603002 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagt 15603100  T
Q  211 tgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||    
T  15603101 tgcatgagtct 15603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 16410133 - 16410347
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16410133 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16410231  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  16410232 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttc 16410330  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  16410331 actaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 23846886 - 23847096
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  23846886 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 23846985  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||   |||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  23846986 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgt---tgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 23847082  T
Q  203 aactaagttgcatg 216  Q
    ||||||||||||||    
T  23847083 aactaagttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 15611355 - 15611563
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15611355 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15611453  T
Q  119 ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  15611454 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagt 15611552  T
Q  211 tgcatgagtct 221  Q
    |||||||||||    
T  15611553 tgcatgagtct 15611563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398201
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttg-aaatgaattgttatt 14398137  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14398138 aagc--tttatgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 14398201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15538683 - 15538473
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| |||| |||||| | ||||||| || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||    
T  15538683 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattga 15538584  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  15538583 ttgcctttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 15538486  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  15538485 actaagttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Original strand, 20856305 - 20856518
Alignment:
Q  15 aggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20856305 aggtagtaatgtgacctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 20856404  T
Q  114 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    |||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20856405 ttgaattattcttgaataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaac 20856503  T
Q  206 taagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||    
T  20856504 taagttgcatgagtc 20856518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387086
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||  | ||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttga 21387132  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21387131 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 21387086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15532123 - 15531914
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| ||||| | |||| || || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||    
T  15532123 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattga 15532025  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  15532024 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 15531927  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  15531926 actaagttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383666
Alignment:
Q  90 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 189  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgtt 21383705  T
Q  190 gctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21383704 gcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 21383666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 16861199 - 16861441
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||| |||| | |||| | ||| || |||| || ||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  16861199 ggaactttaggtagtagtgagacatatttaagaggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 16861297  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16861298 tacattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaatataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 16861396  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | |||||  |||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  16861397 atttaaccgagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16861441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 377519 - 377414
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  377519 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcatt 377420  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  377419 acttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24755959 - 24755842
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 114  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755959 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 24755860  T
Q  115 tgaattattattgaatga 132  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  24755859 tgaaatgttaatgaatga 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 18862600 - 18862730
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  18862600 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 18862693  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  18862694 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 18862730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 21827969 - 21828099
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  21827969 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 21828062  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21828063 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21828099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 22010551 - 22010769
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| | | || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  22010551 ggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 22010649  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    |||||||   ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22010650 tgcattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttg----aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgt 22010745  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  22010746 tatttaaccaagttgcatgagtct 22010769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Original strand, 17828457 - 17828663
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt-gatt 106  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||| | ||||||  || |||| ||| || |  |||  ||| |||| ||||    
T  17828457 gaactttaggtgctaacgagacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgatt 17828556  T
Q  107 g-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    | | |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  17828557 gtctttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaac 17828652  T
Q  206 taagttgcatg 216  Q
    |||||||||||    
T  17828653 taagttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 19259460 - 19259565
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19259460 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 19259559  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  19259560 acttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32605400 - 32605223
Alignment:
Q  50 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32605400 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32605302  T
Q  148 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32605301 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 32605223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755714
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 24755714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21410971
Alignment:
Q  88 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 187  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21411003  T
Q  188 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21411002 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21410971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805463
Alignment:
Q  88 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 187  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21805495  T
Q  188 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21805494 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21805463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 39094875 - 39095018
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtg 176  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         ||||| ||||    
T  39094875 taatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatgttgttgtg 39094974  T
Q  177 atctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39094975 atctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 39095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32598868 - 32598691
Alignment:
Q  50 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32598868 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32598770  T
Q  148 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
     ||||| ||| ||||   ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32598769 gaatgatttgttatttgact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 32598691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678221
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgat 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 23776807 - 23776952
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||        ||| || |||||||||  ||||||||||| ||    
T  23776807 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagt 23776906  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  23776907 tatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121759
Alignment:
Q  165 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 32121759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19983331 - 19983223
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19983331 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 19983232  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  19983231 ttgagttat 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 377271
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtatatacaagatgattaagatgatg 377271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Original strand, 17055412 - 17055472
Alignment:
Q  168 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17055412 gttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 17055472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23648633 - 23648554
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||    
T  23648633 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19899333 - 19899225
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19899333 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattac 19899234  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  19899233 ttgagttat 19899225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16184796 - 16184720
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  16184796 tgttgttgtgatatgcttatgctgctattgttgtttaaccaacttgcatgattctatataagatgattaagatgatg 16184720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354060
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162175
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21162175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21168848
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21168848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862978
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 21828280 - 21828347
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21828280 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21828347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16184966 - 16184862
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  16184966 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgc 16184867  T
Q  114 ttgaa 118  Q
    |||||    
T  16184866 ttgaa 16184862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259685
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 19259685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Original strand, 39094814 - 39094858
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaga 51  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39094814 ggaacttaaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaga 39094858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5186
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 126  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 5093  T
Q  127 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5094 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 58592 - 58804
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58592 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 58691  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  58692 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 58791  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    ||||| |||||||    
T  58792 aagttacatgagt 58804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 3401 - 3620
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||    
T  3401 aaggaactttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattga 3500  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  3501 ttgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttattta 3598  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3599 actaagttgcatgagtctgaat 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 35816 - 36027
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35816 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 35915  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  35916 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg-aaattaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaact 36014  T
Q  207 aagttgcatgagt 219  Q
    |||||||||||||    
T  36015 aagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7176 - 6957
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  7176 gaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattg 7077  T
Q  108 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  7076 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 6979  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    | ||||||||||  ||||||||    
T  6978 atgttgcatgagcatgaataag 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 18231 - 18450
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||| |||| ||||||    
T  18231 aaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattga 18330  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  18331 ttgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattta 18428  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18429 actaagttgcatgagtctgaat 18450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 10458 - 10589
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10458 gaactttaagtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattg 10557  T
Q  108 cattacttgaattattattgaatgatcaagaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10558 cattacttgaattattattgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69794
Alignment:
Q  166 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4674 - 4430
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4674 ggaactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaat 4575  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4574 tgcattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgt 4476  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  4475 tatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 471
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  602 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 509  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaact-aagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  508 ttatgctgctattgttatttaactaaagttgcatgagt 471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 24839 - 25059
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24839 aaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattga 24938  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatc-aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  24939 ttgcatttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 25036  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  25037 aactgagttgcatgagtctgaat 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 189332 - 189462
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  189332 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 189425  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  189426 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 189462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 189643 - 189710
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  189643 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 159
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  398 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcatt 299  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  298 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 199  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  198 actaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 393
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  631 ttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 532  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  531 acttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 433  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  432 actaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42627
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 42665  T
Q  206 taagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  42664 taagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 42627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1731 - 1494
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1731 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 1632  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1631 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 1533  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  1532 ctaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 1
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  163 aggaactttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 64  T
Q  106 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagct 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  63 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5826 - 5608
Alignment:
Q  10 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5826 actttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgc 5728  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5727 attacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatt 5628  T
Q  202 taactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5627 taactaagttgcatgagtct 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7021 - 6803
Alignment:
Q  10 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  7021 actttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgc 6923  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6922 attacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatt 6823  T
Q  202 taactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6822 taactaagttgcatgagtct 6803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6425
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6227 ctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttg-aaat 6325  T
Q  152 gaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  6326 gaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15330 - 15087
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15330 ggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaat 15231  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15230 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgtt 15132  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||    
T  15131 atttaactaagttgcatgagtgtatacaagatgattaagatgatg 15087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23451 - 23232
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  23451 aaggaaccttagttactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 23352  T
Q  105 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | |    
T  23351 ttgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaa 23254  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaat 225  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  23253 actatgtttcatgagtctgaat 23232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17228
Alignment:
Q  79 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgtt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||    
T  17056 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgtt 17155  T
Q  171 gatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  17156 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtctatacaagatgattaagatgatg 17228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 6131 - 6350
Alignment:
Q  8 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 107  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  6131 gaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattg 6230  T
Q  108 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 206  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  6231 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 6328  T
Q  207 aagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    | ||||||||||  ||||||||    
T  6329 atgttgcatgagcatgaataag 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 18534 - 18774
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18534 ttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccatt 18633  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  18634 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 18732  T
Q  204 actaagttgcatgagtc--tgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||    
T  18733 actaagttgcatgagtctatatataagatgattaagatgatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 46605 - 46820
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46605 ttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 46704  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  46705 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgta 46803  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  46804 actaagttgcatgagtc 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 1362 - 1584
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||  || | ||    
T  1362 ggaactttagttagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataat 1461  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  1462 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggt 1560  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  1561 tatttaactaagttgcatgagtct 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10138 - 9916
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  10138 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 10039  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  10038 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 9941  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  9940 actaagttgcatgtgtatgaataag 9916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9513
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 119  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  9741 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 9643  T
Q  120 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata-------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  9642 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttg 9544  T
Q  213 catgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  9543 catgagtcattataagatgaataagatgatg 9513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1830
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 119  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  2059 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 1961  T
Q  120 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1960 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagtt 1862  T
Q  212 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  1861 gcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2178
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatg-aaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcat 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| ||||| ||||| | |||||    
T  1962 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcat 2061  T
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2062 tacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttg-aaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 2160  T
Q  203 aactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2161 aactaagttgcatgagtc 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10162
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatgatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataaatctatataagatgattaagatgatgatg 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18589 - 18367
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| || |||    
T  18589 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactga 18490  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||    
T  18489 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttattta 18392  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  18391 actaagttgcatgtgtatgaataag 18367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 64088 - 63878
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||  ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||    
T  64088 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattga 63989  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  63988 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 63891  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  63890 actaagttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 75972 - 75762
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||| ||    
T  75972 aaggaaatttcggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggataga 75873  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  75872 ttgcctttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgaaaatgttattta 75775  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  75774 actaagttgcatg 75762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 34791 - 34908
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 114  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  115 tgaattattattgaatga 132  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35036
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataaaatgattaagatgatg 35036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 21447 - 21597
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21447 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtatt 21546  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21547 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 80754 - 80869
Alignment:
Q  111 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  80754 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 80851  T
Q  211 tgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  80852 tgcaagagtatgaataag 80869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Original strand, 80642 - 80706
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 149  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80642 taatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 80706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6693
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 6693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44318 - 44081
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  44318 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 44220  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  44219 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 44121  T
Q  204 actaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  44120 actaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30897
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 30961  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30960 aagc--ttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 30897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 5871 - 6093
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg- 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||     
T  5871 aaggaactttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattga 5969  T
Q  104 -attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 202  Q
     ||    |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| |     
T  5970 aatatacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatta 6067  T
Q  203 aactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6068 aactaagttgcatgagtatgaataag 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 71547 - 71460
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  71547 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 139945 - 139736
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||    
T  139945 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtga 139846  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| | ||||| ||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  139845 ttgcctttactcgaattattgattattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 139749  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  139748 actaagttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 71215 - 71083
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgatt 184  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||      |||||    
T  71215 taatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgat------tgatt 71125  T
Q  185 atgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 226  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  71124 atgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 71083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 413923 - 414167
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| |     
T  413923 ggaaccttaggtagtaaagaaacatatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaa 414022  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  414023 tgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaac-gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgt 414121  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || |||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||||||||    
T  414122 tatttaactaagttgcatgcgtctatacatgatgattaagatgatg 414167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 897
Alignment:
Q  21 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 119  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||  |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||     
T  1126 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaa 1028  T
Q  120 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  1027 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagtt 929  T
Q  212 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  928 gcatgagtcattataagatgaataagatgatg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Original strand, 928 - 1014
Alignment:
Q  54 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaag 140  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 243
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73883
Alignment:
Q  91 gatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgat 183  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| |||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 73883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2913
Alignment:
Q  81 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataatta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtctatataagattatta 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20557
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 162  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  163 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 20557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 19164 - 19317
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19164 ggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaat 19263  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19264 tgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207942
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttg-ttgaaaatgaattgatat 161  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  162 taag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    || |        |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 207942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 520 - 289
Alignment:
Q  10 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||| |           ||| | |||||    
T  520 actttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca-----------tgaataattgc 432  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa----ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  431 attactttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtta 333  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  332 tttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 6294 - 6508
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| || |||| |||||| | | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  6294 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 6392  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||| |||    
T  6393 actcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttattta 6491  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6492 actatgttgcatgagtc 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9655 - 9445
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | | ||||| || |||| |||||| |  |||  |||  |||||    
T  9655 aaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattga 9556  T
Q  105 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || | |||| | ||||| |||| | ||||| |||    
T  9555 ttgcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgttattta 9458  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    |||||||||||||    
T  9457 actaagttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 35387 - 35605
Alignment:
Q  11 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 109  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  35387 ctttatgtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 35486  T
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 201  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  35487 ttacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatt 35586  T
Q  202 taactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35587 taactaagttgcatgagtc 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36540 - 36331
Alignment:
Q  5 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  36540 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattga 36441  T
Q  105 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    ||| ||||||   |||| || || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  36440 ttgccattacccaaattgttgttaattgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 36344  T
Q  204 actaagttgcatg 216  Q
    | |||||||||||    
T  36343 attaagttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4245
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  4097 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 4196  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4197 tgcattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4320
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4273 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8799 - 8583
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  8799 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 8700  T
Q  112 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 203  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  8699 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 8600  T
Q  204 actaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  8599 actaagttgcatgagtc 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 30617 - 30859
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| | || |||| | |||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  30617 ggaactttaggtagttgtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 30715  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| | ||| |        ||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  30716 tgcattacttgaaatattattgaatgataaagatgtagttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgtt 30814  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||    
T  30815 atttaaccaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 30859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1889
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  1907 ttgcatgattatgaataag 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 19604 - 19826
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| |     
T  19604 ggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaa 19703  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19704 tgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgt 19803  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  19804 tatttaactaagttgcatgagtc 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 15082 - 15304
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| |     
T  15082 ggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaa 15181  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15182 tgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgt 15281  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  15282 tatttaactaagttgcatgagtc 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 193034 - 193070
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193034 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7715 - 7471
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||| ||||||  || | |     
T  7715 ggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaa 7616  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  7615 tgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgt 7517  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || |||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  7516 tatttaactaagttgcatgagtctatacatgatgattaagatgatg 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 77044 - 77264
Alignment:
Q  8 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-t 105  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| |    
T  77044 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaat 77142  T
Q  106 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 204  Q
    |  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  77143 tatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaa 77240  T
Q  205 ctaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  77241 ctaagttgcatgattatgaataag 77264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18236
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  18295 tatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 18236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 587 - 381
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||         
T  587 aggaaccttaggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga----- 494  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 205  Q
            |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||| | || | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  493 --------ttgaattattgttgaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaat 404  T
Q  206 taagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  403 taagttgcatgattatgaataag 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 15290 - 15376
Alignment:
Q  6 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 93  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15290 aggaacctttggtactaatgagacatattaaa-atgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 192189 - 192340
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| |     
T  192189 ggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 192288  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192289 tgcattacttgatttattcttgaattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 6956 - 7061
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 111  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6956 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcatt 7055  T
Q  112 acttga 117  Q
    ||||||    
T  7056 acttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 7128 - 7204
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  7128 tgttgttgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 7204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11586
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  11456 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 11549  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  11550 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 14042 - 14172
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  14042 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14135  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14136 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 130
Target Start/End: Original strand, 14353 - 14420
Alignment:
Q  64 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 130  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14353 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 243
Target Start/End: Original strand, 38451 - 38596
Alignment:
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 197  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||         ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  38451 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgt 38550  T
Q  198 taattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  38551 tatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4921
Alignment:
Q  120 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 211  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4790 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagtt 4889  T
Q  212 gcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  4890 gcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Original strand, 13969 - 14075
Alignment:
Q  27 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 125  Q
    ||||||| || ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||     
T  13969 gacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaa 14068  T
Q  126 tgaatga 132  Q
    |||||||    
T  14069 tgaatga 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14203
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3980 - 3872
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3980 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 3881  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  3880 ttgagttat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8411 - 8303
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8411 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 8312  T
Q  114 ttgaattat 122  Q
    |||| ||||    
T  8311 ttgagttat 8303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2960
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3040 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6706 - 6626
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 132  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6706 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2832
Alignment:
Q  168 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 2832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6498
Alignment:
Q  168 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6095
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2531
Alignment:
Q  10 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |    
T  2311 actttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatac 2410  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  2411 attacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 2509  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtct 221  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  2510 tttaactaaattgcatgagtct 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 10171 - 10391
Alignment:
Q  10 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 108  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |    
T  10171 actttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatac 10270  T
Q  109 attacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  10271 attacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 10369  T
Q  200 attaactaagttgcatgagtct 221  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  10370 tttaactaaattgcatgagtct 10391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2035 - 1909
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgat 105  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| |     
T  2035 ggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 1937  T
Q  106 tgcattacttgaattattattgaatgat 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1936 tgcattacttgaaatattattgaatgat 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1817
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  1868 tgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatgag 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9347
Alignment:
Q  169 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 439
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  548 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 455  T
Q  183 ttatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||| ||||||    
T  454 ttatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8512
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  8628 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 8531  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  8530 ttgcatgattatgaataag 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15772 - 15656
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  15772 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 15675  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  15674 ttgcatgattatgaataag 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32554
Alignment:
Q  53 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 133  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32636 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32491 - 32459
Alignment:
Q  187 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32491 gctgctattgttaattaactatgttgcatgagt 32459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16756
Alignment:
Q  110 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  210 ttgcatgagtctgaataag 228  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  16738 tcgcatgattatgaataag 16756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Original strand, 7143 - 7364
Alignment:
Q  7 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 106  Q
    ||||||||||||| || |  || |||| | |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||    || ||||||||||||  |||| | |    
T  7143 ggaactttaggtagtattatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactgttgtaatgtgatttaaagattaaat 7242  T
Q  107 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 198  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |    || |||||||||||||||||| |        ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  7243 gcattacttgatttattcttgaataactttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgtt 7342  T
Q  199 aattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  7343 atttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 15550 - 15669
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15550 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattac 15649  T
Q  114 ttgaattattattgaatgat 133  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  15650 ttgaattatgaatgaatgat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15796
Alignment:
Q  184 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 21844 - 21920
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29812
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 21684 - 21740
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 69  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  21684 ttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 21740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 29576 - 29632
Alignment:
Q  13 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 69  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  29576 ttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 29632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 32615 - 32745
Alignment:
Q  83 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 182  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  |||    
T  32615 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 32708  T
Q  183 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 219  Q
    ||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  32709 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagt 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14664
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23679
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 39103
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15350
Alignment:
Q  169 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcataattatgaataag 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33694 - 33569
Alignment:
Q  104 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 194  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||    
T  33694 attgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttat 33596  T
Q  195 tgttaattaactaagttgcatgagtct 221  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||    
T  33595 tgttatttaactatgatggatgagtct 33569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Original strand, 16389 - 16442
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16389 tgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11544 - 11472
Alignment:
Q  85 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 157  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11544 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2191
Alignment:
Q  173 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 220  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 2191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 175005 - 174871
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    ||| ||| | ||||| || || ||  |||||||||    
T  175005 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattac 174906  T
Q  114 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 148  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  174905 ttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaa 174871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 280950 - 281007
Alignment:
Q  186 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  280950 tgctgctattgttatttaactatgtcgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 281007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1881
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  1957 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26904 - 26828
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||| ||||||    
T  26904 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 18334 - 18453
Alignment:
Q  16 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||   | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  18334 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattac 18433  T
Q  114 ttgaattattattgaatgat 133  Q
    |||| |||| | ||||||||    
T  18434 ttgagttatgaatgaatgat 18453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 9004 - 9080
Alignment:
Q  167 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataagataattaagatgatg 243  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||    
T  9004 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 9080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University