View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5725-Insertion-11 (Length: 522)

Name: NF5725-Insertion-11
Description: NF5725
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5725-Insertion-11
NF5725-Insertion-11
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (8-522)||(6167998-6168512)
chr8 (8-522)||(35000023-35000537)
chr8 (17-510)||(34999807-35000300)
chr8 (17-516)||(6168235-6168734)
chr8 (11-522)||(35000251-35000762)
chr8 (11-522)||(6167773-6168284)
chr8 (17-507)||(6168463-6168953)
chr8 (14-507)||(6168688-6169181)
chr8 (17-405)||(6168919-6169307)
chr8 (170-507)||(33774963-33775300)
chr8 (191-510)||(6167725-6168044)
chr8 (17-405)||(34999684-35000072)
chr8 (179-510)||(35000491-35000822)
chr8 (65-279)||(33775086-33775300)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (11-522)||(36294387-36294898)
chr4 (8-522)||(35110570-35111084)
chr4 (8-522)||(36294156-36294670)
chr4 (17-522)||(35109658-35110163)
chr4 (17-522)||(35109886-35110391)
chr4 (17-522)||(35110114-35110619)
chr4 (17-522)||(35110342-35110847)
chr4 (17-522)||(35109430-35109935)
chr4 (11-522)||(35110798-35111309)
chr4 (17-510)||(35109214-35109707)
chr4 (11-522)||(36293931-36294442)
chr4 (17-510)||(36294621-36295114)
chr4 (6-513)||(31287653-31288160)
chr4 (11-516)||(31259915-31260420)
chr4 (11-522)||(31259681-31260192)
chr4 (11-522)||(31287188-31287699)
chr4 (11-522)||(31286960-31287471)
chr4 (17-507)||(35108989-35109479)
chr4 (17-522)||(36294849-36295354)
chr4 (11-510)||(31287428-31287927)
chr4 (6-510)||(31260149-31260653)
chr4 (11-288)||(31306343-31306620)
chr4 (8-405)||(36295068-36295465)
chr4 (14-405)||(35108863-35109254)
chr4 (8-510)||(31287884-31288386)
chr4 (23-405)||(35100471-35100853)
chr4 (8-387)||(31259588-31259967)
chr4 (8-324)||(31286930-31287246)
chr4 (179-510)||(35111038-35111369)
chr4 (203-510)||(31306349-31306656)
chr4 (191-522)||(36293883-36294214)
chr4 (251-507)||(35100597-35100853)
chr4 (11-213)||(35101766-35101968)
chr4 (272-381)||(27909521-27909630)
chr4 (17-177)||(35100471-35100631)
chr4 (191-462)||(35101745-35102016)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (11-405)||(47989910-47990304)
chr7 (11-510)||(47989682-47990181)
chr7 (179-507)||(47989622-47989950)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (8-507)||(24039369-24039867)
chr6 (11-510)||(24039144-24039643)
chr6 (11-405)||(24039600-24039993)
chr6 (248-522)||(24039153-24039427)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (32-516)||(28610445-28610929)
chr1 (173-387)||(28610814-28611028)
chr1 (53-132)||(25948570-25948649)
chr1 (8-108)||(28610877-28610977)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (272-360)||(40492896-40492984)
chr5 (14-159)||(14677105-14677250)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 522
Target Start/End: Original strand, 6167998 - 6168512
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167998 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 6168097  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168098 gcagaaccttggctgattacaacatccagaaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgcggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 6168197  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168198 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 6168297  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168298 atttttgctggaaagcaacttgaagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 6168397  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168398 tgcagatttttgttaagaccctaactggaaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 6168497  T
Q  508 gggcattcccccaga 522  Q
     ||||||||||||||    
T  6168498 aggcattcccccaga 6168512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35000537 - 35000023
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35000537 tctgacaccattgacaatgtcaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagatcagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 35000438  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35000437 gcagaaccttggctgattataacattcagaaagagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgtgaagacccttacagg 35000338  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  35000337 aaagacaattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggctaagatacaggacaaagagggtatccccccagaccagcagaggctc 35000238  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  35000237 atttttgctggaaagcagctcgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtggta 35000138  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35000137 tgcagattttcgtgaagactcttactggcaaaacaattactttggaggtagagagctcagacactattgacaatgtgaaggctaaaattcaggacaagga 35000038  T
Q  508 gggcattcccccaga 522  Q
    |||||||||||||||    
T  35000037 gggcattcccccaga 35000023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35000300 - 34999807
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||      
T  35000300 attgacaatgtgaaggctaagatacaggacaaagagggtatccccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaagcagctcgaagatggcagaactc 35000201  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||    
T  35000200 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtggtatgcagattttcgtgaagactcttactggcaaaacaat 35000101  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35000100 tactttggaggtagagagctcagacactattgacaatgtgaaggctaaaattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcaacgattgatttttgct 35000001  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||  |  | || ||||||||||| |    
T  35000000 ggaaagcagctcgaagatggccggactcttgctgattacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtttgaggggaggtatgcagatct 34999901  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||| |||||  | || || || || |||||  | ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34999900 ttgtgaagacattgaccggaaagaccattaccctagaggtagaaagttcagacacaattgataacgtaaaggcaaaaatacaggacaaggaggg 34999807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 516
Target Start/End: Original strand, 6168235 - 6168734
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || |||||||||||  ||||      
T  6168235 attgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaacttgaagatggtcgaactc 6168334  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  6168335 tagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggaaaaacgat 6168434  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6168435 tactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaaggcattcccccagaccagcaaaggttgatttttgct 6168534  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    |||||||| || | ||||||  ||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||  |  | || || |||||||| |    
T  6168535 ggaaagcagcttgaagatggcagaaccttggcagattataacatccagaaagaatccactcttcatcttgtccttcgtttgaggggaggcatgcagatct 6168634  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||  | || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  6168635 ttgtgaagactttgacaggaaagaccattacattggaggtggaaagctcagacaccatcgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaattcc 6168734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35000762 - 35000251
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| || || |||||      
T  35000762 gataccatagacaatgttaaggccaagattcaagacaaggaagggatcccacctgatcagcagcgtctcatttttgctggcaaacaactggaggatgggc 35000663  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | || ||||| ||||||||  ||||||| || || ||| | ||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  35000662 gtacccttgcggattataacatccaaaaggagtctacccttcatttggtgctccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcacaggaaa 35000563  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| |||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||     
T  35000562 gacaattacccttgaggtggagagctctgacaccattgacaatgtcaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagatcagcagaggctcatc 35000463  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||| || || | ||||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35000462 tttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgattataacattcagaaagagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgc 35000363  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35000362 agatttttgtgaagacccttacaggaaagacaattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggctaagatacaggacaaagaggg 35000263  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
     || ||||||||    
T  35000262 tatccccccaga 35000251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Original strand, 6167773 - 6168284
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||||| || |||||      
T  6167773 gataccatagacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccaccagaccagcagcgactgatttttgctggcaagcagctggaggatgggc 6167872  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  6167873 gtacccttgctgattataacatccaaaaggaatccactctccatttggtgctccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaa 6167972  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| |||||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||     
T  6167973 gacgattacccttgaggtggagagctctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatc 6168072  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||| || || | ||||||  ||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6168073 tttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgattacaacatccagaaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgcggtggtatgc 6168172  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  6168173 agatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggaggg 6168272  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
     || ||||||||    
T  6168273 tatccccccaga 6168284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 507
Target Start/End: Original strand, 6168463 - 6168953
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6168463 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaaggcattcccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcagcttgaagatggcagaacct 6168562  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||  | ||  |  | || || |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||    
T  6168563 tggcagattataacatccagaaagaatccactcttcatcttgtccttcgtttgaggggaggcatgcagatctttgtgaagactttgacaggaaagaccat 6168662  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  6168663 tacattggaggtggaaagctcagacaccatcgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaattccacctgatcagcagaggttgatctttgct 6168762  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    || ||||| || | |||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || || |||||||| |    
T  6168763 gggaagcagcttgaagatggccggactttggctgattacaacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggcatgcagatct 6168862  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    |||| |||||  | || ||||| || || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6168863 ttgtgaagacgttgaccggtaagaccatcaccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaagga 6168953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Original strand, 6168688 - 6169181
Alignment:
Q  14 accattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaa 113  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| | |    
T  6168688 accatcgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaattccacctgatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatggccgga 6168787  T
Q  114 ccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagac 213  Q
    | ||||||||||||||||| ||| | ||||| || || || |||||  | || ||  | || || |||||||| ||||| |||||  | || || |||||    
T  6168788 ctttggctgattacaacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggcatgcagatctttgtgaagacgttgaccggtaagac 6168887  T
Q  214 tattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgattttt 313  Q
     || || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  6168888 catcaccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatcttt 6168987  T
Q  314 gctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcaga 413  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||||||||    
T  6168988 gctgggaagcagcttgaagatggccggactttggctgattacaacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcaga 6169087  T
Q  414 tttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    | ||||| |||||  | || ||||| || || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6169088 tctttgtaaagacgttgaccggtaagaccatcaccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaagga 6169181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Original strand, 6168919 - 6169307
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| | || |    
T  6168919 attgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatggccggactt 6169018  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || || || |||||  | || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || || ||||| ||    
T  6169019 tggctgattacaacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatctttgtaaagacgttgaccggtaagaccat 6169118  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
     || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  6169119 caccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgct 6169218  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    || |||||| | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  6169219 gggaagcaattggaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtgg 6169307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 507
Target Start/End: Original strand, 33774963 - 33775300
Alignment:
Q  170 cgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatac 269  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||  | ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  33774963 cgtggtggcatgcagatcttcgttaagaccctcaccggcaagaccaccacccttgaggtcgaaagctccgacaccatcgacaacgtcaaagccaagatcc 33775062  T
Q  270 aagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaaga 369  Q
    | || ||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||||||||||| ||    
T  33775063 aggataaggaaggaattcccctggaccagcagaggttgatcttcgccggaaagcagctcgaggacggccgcacccttgctgattacaacatccagaagga 33775162  T
Q  370 gtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagac 469  Q
    ||| || |||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| || || || || ||  |  | |||||| | ||||| |||    
T  33775163 gtctacccttcatcttgtcctccgtctacgtggtggtatgcagatctttatcaagacccttaccggaaagaccatcccccttgaggtgtaaagctctgac 33775262  T
Q  470 acaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  33775263 accattgacaatgtcaaggccaagatccaggacaagga 33775300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 510
Target Start/End: Original strand, 6167725 - 6168044
Alignment:
Q  191 gttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccc 290  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||| | || || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  6167725 gttaagaccctcactggcaagaccatcactctcgaagttgagagttcagataccatagacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccac 6167824  T
Q  291 cagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtctt 390  Q
    ||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| || |  ||||| || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||  |    
T  6167825 cagaccagcagcgactgatttttgctggcaagcagctggaggatgggcgtacccttgctgattataacatccaaaaggaatccactctccatttggtgct 6167924  T
Q  391 gcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggct 490  Q
     || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  6167925 ccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaagacgattacccttgaggtggagagctctgataccattgacaatgttaaggcc 6168024  T
Q  491 aagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  6168025 aagatacaagacaaagaggg 6168044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 35000072 - 34999684
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||||||  |  | || ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||      
T  35000072 attgacaatgtgaaggctaaaattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcaacgattgatttttgctggaaagcagctcgaagatggccggactc 34999973  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||| ||| | ||||| || || || |||||  | ||  |  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||    
T  34999972 ttgctgattacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtttgaggggaggtatgcagatctttgtgaagacattgaccggaaagaccat 34999873  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||  | |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  34999872 taccctagaggtagaaagttcagacacaattgataacgtaaaggcaaaaatacaggacaaggagggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgct 34999773  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    || |||||  | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34999772 gggaagcagttagaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctacacttcaccttgtattgcgtcttcgtggtgg 34999684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35000822 - 35000491
Alignment:
Q  179 atgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaagg 278  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||| | || || ||||| || || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35000822 atgcaaattttcgttaagaccctcactggcaagaccatcactctcgaagttgagagttcagataccatagacaatgttaaggccaagattcaagacaagg 35000723  T
Q  279 agggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactct 378  Q
    | || ||||| || || |||||  |  | ||||||||||| || ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35000722 aagggatcccacctgatcagcagcgtctcatttttgctggcaaacaactggaggatgggcgtacccttgcggattataacatccaaaaggagtctaccct 35000623  T
Q  379 tcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgac 478  Q
    |||| | ||  | || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35000622 tcatttggtgctccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcacaggaaagacaattacccttgaggtggagagctctgacaccattgac 35000523  T
Q  479 aatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  35000522 aatgtcaaggccaagatacaagacaaagaggg 35000491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 279
Target Start/End: Original strand, 33775086 - 33775300
Alignment:
Q  65 gaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgc 164  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || || ||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||  | |    
T  33775086 gaccagcagaggttgatcttcgccggaaagcagctcgaggacggccgcacccttgctgattacaacatccagaaggagtctacccttcatcttgtcctcc 33775185  T
Q  165 gacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaa 264  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  |  | |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33775186 gtctacgtggtggtatgcagatctttatcaagacccttaccggaaagaccatcccccttgaggtgtaaagctctgacaccattgacaatgtcaaggccaa 33775285  T
Q  265 gatacaagacaagga 279  Q
    ||| || ||||||||    
T  33775286 gatccaggacaagga 33775300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Original strand, 36294387 - 36294898
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36294387 gatacgattgacaatgtaaaggcaaagattcaggacaaagagggtattcccccagatcagcagaggctcatttttgctggaaagcagcttgaagatggca 36294486  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    ||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  36294487 gaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtgaagactcttactggcaa 36294586  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36294587 gacaattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtattcccccagaccagcaaaggttgatt 36294686  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36294687 tttgctggaaagcaacttgaagacggtcgaactctggctgattataatatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcggcttcgtggtggtatgc 36294786  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36294787 agatttttgttaagaccctaactggaaaaacgattactttggaggttgagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattctggacaaggaggg 36294886  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
    |||||| |||||    
T  36294887 cattcctccaga 36294898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35111084 - 35110570
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35111084 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 35110985  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35110984 gcagaacattggccgattataacatccagaaagagtcaactcttcatctcgttttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacagg 35110885  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |     
T  35110884 aaagacaattactttggaggtagagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctc 35110785  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35110784 atttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggta 35110685  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35110684 tgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 35110585  T
Q  508 gggcattcccccaga 522  Q
    |||||||||||||||    
T  35110584 gggcattcccccaga 35110570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 522
Target Start/End: Original strand, 36294156 - 36294670
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294156 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaggacaaagaaggtattccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 36294255  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36294256 gcagaaccttggctgactacaacatccagaaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgcggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacagg 36294355  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |     
T  36294356 aaagacaattactttggaggtagagagctcagatacgattgacaatgtaaaggcaaagattcaggacaaagagggtattcccccagatcagcagaggctc 36294455  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36294456 atttttgctggaaagcagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggta 36294555  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  36294556 tgcagatttttgtgaagactcttactggcaagacaattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaagga 36294655  T
Q  508 gggcattcccccaga 522  Q
    ||| |||||||||||    
T  36294656 gggtattcccccaga 36294670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35110163 - 35109658
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35110163 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactc 35110064  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35110063 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaat 35109964  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  35109963 tactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgct 35109864  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    ||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35109863 ggaaaacagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagattt 35109764  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35109763 ttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 35109664  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  35109663 cccaga 35109658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35110391 - 35109886
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35110391 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactc 35110292  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35110291 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaat 35110192  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  35110191 tactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgct 35110092  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    ||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35110091 ggaaaacagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagattt 35109992  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35109991 ttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 35109892  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  35109891 cccaga 35109886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35110619 - 35110114
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35110619 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactc 35110520  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35110519 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaat 35110420  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  35110419 tactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgct 35110320  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    ||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35110319 ggaaaacagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagattt 35110220  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35110219 ttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 35110120  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  35110119 cccaga 35110114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35110847 - 35110342
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35110847 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactc 35110748  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35110747 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaat 35110648  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  35110647 tactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgct 35110548  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    ||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35110547 ggaaaacagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagattt 35110448  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35110447 ttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 35110348  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  35110347 cccaga 35110342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35109935 - 35109430
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35109935 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaaacagcttgaagatggcagaactc 35109836  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35109835 ttgctgattacaacatccagaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgtcttcgtggtggtatgcagatttttgtaaagacccttacaggaaagacaat 35109736  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  35109735 tactttggaggttgagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgct 35109636  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    |||||||| || | ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35109635 ggaaagcagcttgaagatggcagaactcttgctgattacaacatccagaaagagtcgactcttcaccttgtcttgcgtcttcgcggtggtatgcagattt 35109536  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  35109535 ttgttaagacactcacaggcaaaacaattactttggaggtagagagctcggacactattgataatgtcaaggccaagatacaggacaaggagggtatccc 35109436  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  35109435 cccaga 35109430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35111309 - 35110798
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| || ||||| || ||| |      
T  35111309 gatacaattgacaatgttaaggccaagattcaagacaaagaagggatccctccagaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagctggaggataggc 35111210  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||  ||||||| || |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  35111209 gtacccttgctgattataacatccaaaaggagtccaccctccatttggtgctccgtcttcgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaa 35111110  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||     
T  35111109 gacaatcacccttgaggtggagagctctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatc 35111010  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||| || || | ||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35111009 tttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacattggccgattataacatccagaaagagtcaactcttcatctcgttttgcgacttcgtggtggtatgc 35110910  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35110909 agatttttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggtagagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 35110810  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
    ||||||||||||    
T  35110809 cattcccccaga 35110798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35109707 - 35109214
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  35109707 attgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaagcagcttgaagatggcagaactc 35109608  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  35109607 ttgctgattacaacatccagaaagagtcgactcttcaccttgtcttgcgtcttcgcggtggtatgcagatttttgttaagacactcacaggcaaaacaat 35109508  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35109507 tactttggaggtagagagctcggacactattgataatgtcaaggccaagatacaggacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 35109408  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    |||||||| || | ||||||  | ||  | |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||  | ||  |  | || || |||||||| |    
T  35109407 ggaaagcagcttgaagatggcaggacattggctgattataacattcagaaggaatcaacccttcatcttgttcttcgtttgaggggaggcatgcagatct 35109308  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||| |||||  | || || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  35109307 ttgtgaagactttgacaggaaagaccattacattggaggtggaaagctcagacaccattgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggaggg 35109214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Original strand, 36293931 - 36294442
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| || |||||      
T  36293931 gataccatagacaatgttaaggcaaagattcaagacaaggaaggaatcccacctgaccagcagcgtctgatttttgctggaaagcagctggaggatgggc 36294030  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| | ||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  36294031 gtacccttgctgattataacatccagaaggagtccaccctccatttggtgctccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaa 36294130  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||| | ||     
T  36294131 gacaatcacccttgaggtggagagctctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaggacaaagaaggtattccaccagaccagcagaggctcatc 36294230  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||| || || | ||||||  ||||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36294231 tttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgactacaacatccagaaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgcggtggtatgc 36294330  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36294331 agatttttgtaaagacccttacaggaaagacaattactttggaggtagagagctcagatacgattgacaatgtaaaggcaaagattcaggacaaagaggg 36294430  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
     |||||||||||    
T  36294431 tattcccccaga 36294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 510
Target Start/End: Original strand, 36294621 - 36295114
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || |||||||| ||  ||||      
T  36294621 attgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtattcccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaacttgaagacggtcgaactc 36294720  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  36294721 tggctgattataatatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcggcttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggaaaaacgat 36294820  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36294821 tactttggaggttgagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattctggacaaggagggcattcctccagaccagcaaaggttgatttttgct 36294920  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    |||||||| || | ||||||  | ||  |  | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||| | || ||  | || || |||||||| |    
T  36294921 ggaaagcagcttgaagatggaaggaccttgtcagattataacatccagaaggaatcaacccttcatcttgtccttcgtctgaggggaggcatgcagatct 36295020  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||| |||||  | || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  36295021 ttgtgaagactttgacaggaaagaccattacattggaggtggaaagctctgacaccattgataatgttaaggctaaaatacaggataaggaggg 36295114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31288160 - 31287653
Alignment:
Q  6 catctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaaga 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||    
T  31288160 catctgatacaattgataatgtcaaggccaagatccaagacaaagagggtatccctcctgatcagcagaggcttatctttgcagggaaacagctcgagga 31288061  T
Q  106 tggcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttaca 205  Q
    ||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||| || || || ||||| ||| |  || |  | ||||| |||||||||||||| |||||  | ||     
T  31288060 tggaagaaccctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatctggtgcttagattaagaggtggaatgcagatttttgtaaagactttgact 31287961  T
Q  206 ggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  31287960 ggaaagactattactttggaggtggagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctccagatcagcagaggc 31287861  T
Q  306 tgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    | || || || || |||||| | | ||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| | || ||||| |||||||||||    
T  31287860 ttatcttcgccggtaagcaattggaagacgggcgcacgctcgctgattacaacattcaaaaggagtccacccttcatttggttttgcggcttcgtggtgg 31287761  T
Q  406 tatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaag 505  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  31287760 tatgcaaatttttgtaaagacccttaccggaaaaactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaggataag 31287661  T
Q  506 gagggcat 513  Q
    || |||||    
T  31287660 gaaggcat 31287653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 31260420 - 31259915
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  31260420 gataccattgataatgtcaaggccaagatacaggacaaagagggtatccctcctgatcagcagaggcttatctttgcagggaaacaactagaagatggaa 31260321  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||| |||| || || || ||| | ||| |  || |  | || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||    
T  31260320 ggaccctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatttggtgcttagattgagaggcggaatgcaaatttttgttaagactttaactggaaa 31260221  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||| | ||     
T  31260220 aactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctcctgatcaacagaggcttatc 31260121  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||  | || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||| | |||||||| |||||||    
T  31260120 tttgctggtaagcagcttgaagatggaaggacacttgccgattataacatccagaaggagtccactctccatttggttttgaggcttcgtgggggtatgc 31260021  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  31260020 agatttttgttaagacccttactggaaagaccataactttggaggttgagagttctgatacaattgataatgtgaaggcaaaaattcaggataaagaggg 31259921  T
Q  511 cattcc 516  Q
    ||||||    
T  31259920 cattcc 31259915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31260192 - 31259681
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  31260192 gatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctcctgatcaacagaggcttatctttgctggtaagcagcttgaagatggaa 31260093  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||  | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31260092 ggacacttgccgattataacatccagaaggagtccactctccatttggttttgaggcttcgtgggggtatgcagatttttgttaagacccttactggaaa 31259993  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| || || || |||||||| ||  | |||    
T  31259992 gaccataactttggaggttgagagttctgatacaattgataatgtgaaggcaaaaattcaggataaagagggcattcctcctgaccagcagagactaatt 31259893  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||||||  | |  |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || || ||| | ||| | || ||| | ||||||||||| ||||    
T  31259892 tttgctggaaagcagttggaggatggtcgtactttggccgattataatatccagaaggaatctactttgcatttggttttgaggcttcgtggtggcatgc 31259793  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||    
T  31259792 aaatatttgtgaagacacttactgggaagactattaccttggaggtggaaagctctgatactattgataatgtgaaagcaaagatacaagataaggaggg 31259693  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
     |||||||||||    
T  31259692 tattcccccaga 31259681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31287699 - 31287188
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  31287699 gatactattgataatgtgaaagctaagattcaggataaggaaggcatccctcctgatcagcagagacttatctttgcagggaaacaacttgaagatggaa 31287600  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| || |||||  |||| || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  31287599 ggacccttgctgattataatatccaaaaggaatccactctgcatttggttttgcggcttcgtggtggtatgcaaatttttgtaaagacccttaccggaaa 31287500  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| | ||     
T  31287499 aactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctcccgatcagcagaggcttatc 31287400  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||  | || || |||||||||||||| || || || ||||| || ||| | || ||| | ||||||||||||||||    
T  31287399 tttgctggtaagcagcttgaagatggaaggacccttgctgattataacattcaaaaggaatcgaccctccatttggttttgaggcttcgtggtggtatgc 31287300  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  31287299 agatttttgtgaagactcttaccggaaagacaataactttggaggttgaaagttctgatacaattgacaacgtgaaagcaaagattcaggacaaagaggg 31287200  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
    |||||| |||||    
T  31287199 cattcctccaga 31287188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31287471 - 31286960
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  31287471 gatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctcccgatcagcagaggcttatctttgctggtaagcagcttgaagatggaa 31287372  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||| ||  |||| || || |||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  31287371 ggacccttgctgattataacattcaaaaggaatcgaccctccatttggttttgaggcttcgtggtggtatgcagatttttgtgaagactcttaccggaaa 31287272  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | |||    
T  31287271 gacaataactttggaggttgaaagttctgatacaattgacaacgtgaaagcaaagattcaggacaaagagggcattcctccagaccagcagaggctaatt 31287172  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    || || || |||||  | | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  31287171 ttcgcgggcaagcagttggaagatggccgtactctggctgattataatatccagaaagaatctactctgcatttggttttgaggcttcgaggtgggatgc 31287072  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    | || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  31287071 aaatatttgtgaagactcttaccgggaagactattaccttggaggtggaaagctctgatacgattgataacgtgaaagcgaagatacaggataaggaggg 31286972  T
Q  511 cattcccccaga 522  Q
     ||||| |||||    
T  31286971 tattccaccaga 31286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 35109479 - 35108989
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  35109479 attgataatgtcaaggccaagatacaggacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcagcttgaagatggcaggacat 35109380  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||  | ||  |  | || || |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||    
T  35109379 tggctgattataacattcagaaggaatcaacccttcatcttgttcttcgtttgaggggaggcatgcagatctttgtgaagactttgacaggaaagaccat 35109280  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||    
T  35109279 tacattggaggtggaaagctcagacaccattgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaatcccacctgatcagcagaggttgatctttgct 35109180  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    || ||||| || | |||||| || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||||||||| |    
T  35109179 gggaagcagcttgaagatggccggactttggccgattacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatct 35109080  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    |||| |||||  | || ||||| || || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  35109079 ttgtgaagacgttgaccggtaagaccatcaccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaagga 35108989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 522
Target Start/End: Original strand, 36294849 - 36295354
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  36294849 attgacaatgtaaaggctaagattctggacaaggagggcattcctccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcagcttgaagatggaaggacct 36294948  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactat 216  Q
    || | ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||  | || ||  | || || |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||    
T  36294949 tgtcagattataacatccagaaggaatcaacccttcatcttgtccttcgtctgaggggaggcatgcagatctttgtgaagactttgacaggaaagaccat 36295048  T
Q  217 tactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgct 316  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  36295049 tacattggaggtggaaagctctgacaccattgataatgttaaggctaaaatacaggataaggagggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgct 36295148  T
Q  317 ggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagattt 416  Q
    || ||||| || | |||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||||||||| |    
T  36295149 gggaagcagcttgaagatggccggactttggctgattataacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatct 36295248  T
Q  417 ttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    |||| |||||  | || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  36295249 ttgtgaagacattgaccggaaagaccatcaccttagaggtggaaagttcagacactatcgataatgtcaaggcaaaaatccaggacaaggagggaatccc 36295348  T
Q  517 cccaga 522  Q
    ||||||    
T  36295349 cccaga 36295354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31287927 - 31287428
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||  | ||||| ||      
T  31287927 gatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggagggtatccctccagatcagcagaggcttatcttcgccggtaagcaattggaagacgggc 31287828  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||  | |||||||||||||| ||  ||||||| || || ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  31287827 gcacgctcgctgattacaacattcaaaaggagtccacccttcatttggttttgcggcttcgtggtggtatgcaaatttttgtaaagacccttaccggaaa 31287728  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||  | ||     
T  31287727 aactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaggataaggaaggcatccctcctgatcagcagagacttatc 31287628  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||| || || ||||| | ||||||  | || || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  31287627 tttgcagggaaacaacttgaagatggaaggacccttgctgattataatatccaaaaggaatccactctgcatttggttttgcggcttcgtggtggtatgc 31287528  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  31287527 aaatttttgtaaagacccttaccggaaaaactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataaggaggg 31287428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31260653 - 31260149
Alignment:
Q  6 catctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaaga 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  31260653 catcagatacaattgataatgtcaaggccaagattcaagacaaagagggaatccctcctgatcagcagaggcttatctttgctgggaaacaactcgagga 31260554  T
Q  106 tggcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttaca 205  Q
    ||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||| || || || ||| | ||| |  || |  | ||||| |||||||| || || |||||  | ||     
T  31260553 tggaagaaccctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatttggtgcttagattgagaggtggaatgcagatattcgtaaagactttgact 31260454  T
Q  206 ggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggt 305  Q
    ||||| || || || || ||||| ||   |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||     
T  31260453 ggaaaaaccatcaccttagaggttgaatcctcggataccattgataatgtcaaggccaagatacaggacaaagagggtatccctcctgatcagcagaggc 31260354  T
Q  306 tgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    | || ||||| || || ||||| | ||||||  | || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||  |  || |  | || ||    
T  31260353 ttatctttgcagggaaacaactagaagatggaaggaccctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatttggtgcttagattgagaggcgg 31260254  T
Q  406 tatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaag 505  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  31260253 aatgcaaatttttgttaagactttaactggaaaaactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataag 31260154  T
Q  506 gaggg 510  Q
    |||||    
T  31260153 gaggg 31260149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31306620 - 31306343
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  31306620 gatacaattgataatgtcaaggccaagatccaagacaaagagggtatccctcctgatcagcagaggcttatctttgcaggtaaacagctcgaggatggaa 31306521  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    ||| | | |||||||| ||||||||| |||| || || || ||| | ||| |  || |  | ||||| |||||||| |||||||||||  | || |||||    
T  31306520 gaatcctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatttggtgcttagattgagaggtggaatgcagatatttgttaagactttgactggaaa 31306421  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccc 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31306420 gactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagacaaggagggtatccc 31306343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 405
Target Start/End: Original strand, 36295068 - 36295465
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  36295068 tctgacaccattgataatgttaaggctaaaatacaggataaggagggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatg 36295167  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    || | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || || || |||||  | || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || ||    
T  36295168 gccggactttggctgattataacattcagaaagagtccacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatctttgtgaagacattgaccgg 36295267  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    |||||| || || || ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  36295268 aaagaccatcaccttagaggtggaaagttcagacactatcgataatgtcaaggcaaaaatccaggacaaggagggaatccccccagatcagcagaggttg 36295367  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    || |||||||| |||||| | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  36295368 atctttgctgggaagcaattggaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtgg 36295465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 35109254 - 35108863
Alignment:
Q  14 accattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaa 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| | |    
T  35109254 accattgataatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaatcccacctgatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatggccgga 35109155  T
Q  114 ccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagac 213  Q
    | ||||| ||||||||||| ||| | ||||| || || || |||||  | || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || || |||||    
T  35109154 ctttggccgattacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatctttgtgaagacgttgaccggtaagac 35109055  T
Q  214 tattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgattttt 313  Q
     || || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  35109054 catcaccttagaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatcttt 35108955  T
Q  314 gctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    ||||| |||||| | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  35108954 gctgggaagcaattggaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtgg 35108863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31288386 - 31287884
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||  | |||||||    
T  31288386 tctgataccatagacaacgttaaagctaagattcaagacaaggaaggtattcctcccgatcagcaaaggcttatatttgctggtaaacaattggaagatg 31288287  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    || | ||| | || ||||||||||||||  |||| || || || || |||||| ||||| |  | ||||| |||||||| ||||| |||||  | || ||    
T  31288286 gccgcacccttgcggattacaacatccaaaaggaatccacccttcaccttgtgctgcgattgagaggtggcatgcagatatttgtgaagacattgaccgg 31288187  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    ||| || || ||  | ||||| ||    || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| |     
T  31288186 aaaaacaatcacccttgaggttgaatcatctgatacaattgataatgtcaaggccaagatccaagacaaagagggtatccctcctgatcagcagaggctt 31288087  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    || ||||| || || || ||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||  |  || |  | ||||| |    
T  31288086 atctttgcagggaaacagctcgaggatggaagaaccctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatctggtgcttagattaagaggtggaa 31287987  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31287986 tgcagatttttgtaaagactttgactggaaagactattactttggaggtggagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagataagga 31287887  T
Q  508 ggg 510  Q
    |||    
T  31287886 ggg 31287884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 35100853 - 35100471
Alignment:
Q  23 aatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctg 122  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |    
T  35100853 aatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaatcccacctgatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatggccggactttggccg 35100754  T
Q  123 attacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattacttt 222  Q
    |||||||||| ||| | ||||| || || || |||||  | || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || || ||||| || || ||    
T  35100753 attacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatctttgtgaagacgttgaccggtaagaccatcacctt 35100654  T
Q  223 ggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaag 322  Q
     |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  35100653 agaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgctgggaag 35100554  T
Q  323 caactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    ||| | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  35100553 caattggaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtgg 35100471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31259967 - 31259588
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| ||| | || ||||    
T  31259967 tctgatacaattgataatgtgaaggcaaaaattcaggataaagagggcattcctcctgaccagcagagactaatttttgctggaaagcagttggaggatg 31259868  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    |  | || ||||| ||||| || |||||| |||| || ||| | ||| | || ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  31259867 gtcgtactttggccgattataatatccagaaggaatctactttgcatttggttttgaggcttcgtggtggcatgcaaatatttgtgaagacacttactgg 31259768  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |     
T  31259767 gaagactattaccttggaggtggaaagctctgatactattgataatgtgaaagcaaagatacaagataaggagggtattcccccagatcagcagaggctt 31259668  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgt 387  Q
    ||||||||||| |||||  | |  |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  31259667 atttttgctggcaagcagttggaggatggtcgtactctggcagattacaatattcagaaagaatctaccctgcatcttgt 31259588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31287246 - 31286930
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || ||| | |||||||    
T  31287246 tctgatacaattgacaacgtgaaagcaaagattcaggacaaagagggcattcctccagaccagcagaggctaattttcgcgggcaagcagttggaagatg 31287147  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    || | ||  |||||||||| || |||||| | || || ||||| ||| | || ||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  31287146 gccgtactctggctgattataatatccagaaagaatctactctgcatttggttttgaggcttcgaggtgggatgcaaatatttgtgaagactcttaccgg 31287047  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| |     
T  31287046 gaagactattaccttggaggtggaaagctctgatacgattgataacgtgaaagcgaagatacaggataaggagggtattccaccagaccagcaaaggctt 31286947  T
Q  308 atttttgctggaaagca 324  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31286946 atttttgctggcaagca 31286930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35111369 - 35111038
Alignment:
Q  179 atgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaagg 278  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  35111369 atgcaaatctttgtgaagactctcacaggaaagacaatcacccttgaggtggagagctccgatacaattgacaatgttaaggccaagattcaagacaaag 35111270  T
Q  279 agggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactct 378  Q
    | || ||||| |||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| || |  ||| | || || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  35111269 aagggatccctccagaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagctggaggataggcgtacccttgctgattataacatccaaaaggagtccaccct 35111170  T
Q  379 tcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgac 478  Q
     ||| | ||  | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || || ||  | |||||||||||||| || || ||||||    
T  35111169 ccatttggtgctccgtcttcgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaagacaatcacccttgaggtggagagctctgataccattgac 35111070  T
Q  479 aatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  35111069 aatgttaaggccaagatacaagacaaagaggg 35111038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31306656 - 31306349
Alignment:
Q  203 acaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaa 302  Q
    |||||||| || || ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  31306656 acaggaaaaaccatcactcttgaggtagagagttccgatacaattgataatgtcaaggccaagatccaagacaaagagggtatccctcctgatcagcaga 31306557  T
Q  303 ggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtgg 402  Q
    || | || ||||| || || || ||||  |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||  |  || |  | ||    
T  31306556 ggcttatctttgcaggtaaacagctcgaggatggaagaatcctagctgattataacatccagaaggaatctacccttcatttggtgcttagattgagagg 31306457  T
Q  403 tggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggac 502  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  31306456 tggaatgcagatatttgttaagactttgactggaaagactattactttggaggttgagagttcagatactattgataatgtgaaagctaagattcaagac 31306357  T
Q  503 aaggaggg 510  Q
    ||||||||    
T  31306356 aaggaggg 31306349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 522
Target Start/End: Original strand, 36293883 - 36294214
Alignment:
Q  191 gttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccc 290  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| | || || ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  36293883 gttaagaccctcactggaaagaccatcactctcgaagttgagagttcagataccatagacaatgttaaggcaaagattcaagacaaggaaggaatcccac 36293982  T
Q  291 cagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtctt 390  Q
    | ||||||||  |  ||||||||||||||||||| || |  ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | ||  |    
T  36293983 ctgaccagcagcgtctgatttttgctggaaagcagctggaggatgggcgtacccttgctgattataacatccagaaggagtccaccctccatttggtgct 36294082  T
Q  391 gcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggct 490  Q
     || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || || ||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
T  36294083 ccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaagacaatcacccttgaggtggagagctctgataccattgacaatgttaaggcc 36294182  T
Q  491 aagattcaggacaaggagggcattcccccaga 522  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  36294183 aagatacaggacaaagaaggtattccaccaga 36294214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 35100853 - 35100597
Alignment:
Q  251 aatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctg 350  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| || ||| | || |    
T  35100853 aatgttaaggcaaaaatacaggataaggagggaatcccacctgatcagcagaggttgatctttgctgggaagcagcttgaagatggccggactttggccg 35100754  T
Q  351 attataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattacttt 450  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||  | || ||||| || || || ||    
T  35100753 attacaacattcagaaagagtctacccttcaccttgtccttcgtctgaggggaggtatgcagatctttgtgaagacgttgaccggtaagaccatcacctt 35100654  T
Q  451 ggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
     ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  35100653 agaggtagaaagttcagacacaattgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaagga 35100597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35101968 - 35101766
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || ||| | || |||||      
T  35101968 gataccatagacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccaccagaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagttggaggatgggc 35101869  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||  |||| || || |||||| | ||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  35101868 gtacccttgctgattataacatccaaaaggaatccaccctccatttggtgctccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaa 35101769  T
Q  211 gac 213  Q
    |||    
T  35101768 gac 35101766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 381
Target Start/End: Original strand, 27909521 - 27909630
Alignment:
Q  272 gacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagt 371  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |    
T  27909521 gacaaggaaggcatccctcctgaccagcagaggttgattttcgctggtaagcaactggaagatggtcgcactcttgctgattacaacatacaaaaggaat 27909620  T
Q  372 cgactcttca 381  Q
    | ||||||||    
T  27909621 caactcttca 27909630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35100631 - 35100471
Alignment:
Q  17 attgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacct 116  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||  | || ||||| || |||     
T  35100631 attgataatgtgaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcagcagaggttgatctttgctgggaagcaattggaggatggaaggaccc 35100532  T
Q  117 tggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtgg 177  Q
    | ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  35100531 ttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgtcttcgtggtgg 35100471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35102016 - 35101745
Alignment:
Q  191 gttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccc 290  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||| | || || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  35102016 gttaagaccctcactggcaagaccatcactctcgaagttgagagttcagataccatagacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccac 35101917  T
Q  291 cagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtctt 390  Q
    ||||||||||  |  ||||||||||||| |||||  | |  ||||| || || || ||||||||||||||||| || || || || || ||| | ||  |    
T  35101916 cagaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagttggaggatgggcgtacccttgctgattataacatccaaaaggaatccaccctccatttggtgct 35101817  T
Q  391 gcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagag 462  Q
     || || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||||    
T  35101816 ccgtctccgtggtggtatgcaaatatttgtgaagactctcactggaaagacgatcacccttgaggtggagag 35101745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 405
Target Start/End: Original strand, 47989910 - 47990304
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47989910 gatacaattgacaatgtcaaggccaagattcaagacaaggaagggatcccacctgaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 47990009  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47990010 gaacattggccgattataacatccagaaagagtcaactcttcatctcgttttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgtaaaaacccttacaggaaa 47990109  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  47990110 gacaattactttggaggtagagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaaaatacaggacaaggagggaatcccaccagatcagcagaggttgatc 47990209  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    |||||||| |||||| | |  |||||  | || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  47990210 tttgctgggaagcaattggaggatggaaggacccttgctgactacaacattcagaaggagtctactcttcaccttgttttgcgccttcgtggtgg 47990304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Original strand, 47989682 - 47990181
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||| | || || ||||| || || ||||| ||||| ||      
T  47989682 gatacaattgacaatgttaaggccaagattcaagacaaggaagggatccctccagaccagcagcgtctaatttttgccggcaagcagctggaagacgggc 47989781  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | || ||||||||||||||  ||||||| || |||||  | ||| | || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  47989782 gtacccttgcagattacaacatccaaaaggagtccacactccacttggtgctccgtcttcgtggtgggatgcaaatctttgtgaagactctcacaggaaa 47989881  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
     || || ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||     
T  47989882 aacaatcactcttgaggtggagagctccgatacaattgacaatgtcaaggccaagattcaagacaaggaagggatcccacctgaccagcagaggctcatc 47989981  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    ||||||||||| || || | ||||||  ||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47989982 tttgctggaaaacagcttgaagatggcagaacattggccgattataacatccagaaagagtcaactcttcatctcgttttgcgacttcgtggtggtatgc 47990081  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  47990082 agatttttgtaaaaacccttacaggaaagacaattactttggaggtagagagctcggacacgattgacaatgtaaaggctaaaatacaggacaaggaggg 47990181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 507
Target Start/End: Original strand, 47989622 - 47989950
Alignment:
Q  179 atgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaagg 278  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47989622 atgcaaatctttgtgaagactctcacaggaaagacaatcacccttgaggtggagagctccgatacaattgacaatgttaaggccaagattcaagacaagg 47989721  T
Q  279 agggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactct 378  Q
    | || ||||| |||||||||||  |  | |||||||| || ||||| || | ||| || || || || || ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  47989722 aagggatccctccagaccagcagcgtctaatttttgccggcaagcagctggaagacgggcgtacccttgcagattacaacatccaaaaggagtccacact 47989821  T
Q  379 tcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgac 478  Q
     ||  | ||  | || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||||    
T  47989822 ccacttggtgctccgtcttcgtggtgggatgcaaatctttgtgaagactctcacaggaaaaacaatcactcttgaggtggagagctccgatacaattgac 47989921  T
Q  479 aatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  47989922 aatgtcaaggccaagattcaagacaagga 47989950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 507
Target Start/End: Original strand, 24039369 - 24039867
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24039369 tctgatactattgataatgtcaaagccaagattcaggacaaggagggtatccccccagaccagcagaggctcatttttgctggaaagcagcttgaagatg 24039468  T
Q  108 gcagaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacagg 207  Q
    |||||||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  24039469 gcagaactcttgccgattacaacatccaaaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgccttcgtggtggtatgcagatttttgtgaagaccctcaccgg 24039568  T
Q  208 aaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttg 307  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24039569 aaaaacaattactttggaggtagagagctcagatactattgacaatgtgaaggccaagatacaggacaaggagggtat-cccccagaccagcaaaggttg 24039667  T
Q  308 atttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggta 407  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||  | ||  | ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||  | ||  |  | || ||||    
T  24039668 attttcgctggaaagcagcttgaagatggcaggacattggctgattataatatccagaaggaatccacccttcatcttgttcttcgtttgaggggaggta 24039767  T
Q  408 tgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaagga 507  Q
    ||||||| ||||| |||||  | || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24039768 tgcagatctttgtgaagactttgacaggaaagaccattacattggaggtggaaagttcagacaccattgataatgttaaggcaaaaatccaggacaagga 24039867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Original strand, 24039144 - 24039643
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || |||||||| || ||||| || |||||      
T  24039144 gataccatagacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccacctgaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagctggaggatgggc 24039243  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | ||| | |||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||| | || || |||||||| ||||| || || || ||||| || || |||||    
T  24039244 gtacccttgctgattacaacatccaaaaggagtccaccctccatttggtgctccgtctccgtggtgggatgcaaatcttcgtcaagactctcactggaaa 24039343  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| || ||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  24039344 gacaatcacccttgaggtggagagctctgatactattgataatgtcaaagccaagattcaggacaaggagggtatccccccagaccagcagaggctcatt 24039443  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgc 410  Q
    |||||||||||||| || | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24039444 tttgctggaaagcagcttgaagatggcagaactcttgccgattacaacatccaaaaagagtcaactcttcaccttgtcttgcgccttcgtggtggtatgc 24039543  T
Q  411 agatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggaggg 510  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24039544 agatttttgtgaagaccctcaccggaaaaacaattactttggaggtagagagctcagatactattgacaatgtgaaggccaagatacaggacaaggaggg 24039643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 405
Target Start/End: Original strand, 24039600 - 24039993
Alignment:
Q  11 gataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggca 110  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24039600 gatactattgacaatgtgaaggccaagatacaggacaaggagggtatccc-ccagaccagcaaaggttgattttcgctggaaagcagcttgaagatggca 24039698  T
Q  111 gaaccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaa 210  Q
    | || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||||||  | ||  |  | || ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||    
T  24039699 ggacattggctgattataatatccagaaggaatccacccttcatcttgttcttcgtttgaggggaggtatgcagatctttgtgaagactttgacaggaaa 24039798  T
Q  211 gactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatt 310  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||     
T  24039799 gaccattacattggaggtggaaagttcagacaccattgataatgttaaggcaaaaatccaggacaaggaaggaatcccaccagatcaacagaggttgatc 24039898  T
Q  311 tttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtgg 405  Q
    |||||||| |||||| | |  |||||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24039899 tttgctgggaagcaattggaggatggaagaacccttgctgactacaacattcagaaagagtctactcttcaccttgttttacgtcttcgtggtgg 24039993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 522
Target Start/End: Original strand, 24039153 - 24039427
Alignment:
Q  248 gacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctag 347  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||  |  ||||||||||||| ||||| || |  ||||| || || || |    
T  24039153 gacaatgttaaggcaaaaattcaagacaaggaaggaatcccacctgaccagcagcgtctgatttttgctggcaagcagctggaggatgggcgtacccttg 24039252  T
Q  348 ctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaactggtaaaacgattac 447  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || ||| | ||  | || || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || || ||    
T  24039253 ctgattacaacatccaaaaggagtccaccctccatttggtgctccgtctccgtggtgggatgcaaatcttcgtcaagactctcactggaaagacaatcac 24039352  T
Q  448 tttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcccccaga 522  Q
      | |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24039353 ccttgaggtggagagctctgatactattgataatgtcaaagccaagattcaggacaaggagggtatccccccaga 24039427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 516
Target Start/End: Original strand, 28610445 - 28610929
Alignment:
Q  32 gccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgattacaaca 131  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |    
T  28610445 gccaaaatccaagacaaagaaggaattccacctgaccaacaacgtctcatcttcgccggaaaacagctagaagacggtagaactcttgcggattacaata 28610544  T
Q  132 tccaggaggagtcaactctccatcttgtgttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtaga 231  Q
    ||||| | ||||| || || || |||||  | || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| || ||    
T  28610545 tccagaaagagtccacgcttcaccttgttctccgtctccgtggtggcatgcaaatctttgtcaaaaccctaacagggaaaaccataaccctggaagttga 28610644  T
Q  232 gagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaagacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcgga 331  Q
        || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||| | ||||| ||||| || |||||  | | |    
T  28610645 atcttctgacacaatcgacaacgtgaaggcgaagattcaagacaaggaaggcattccaccggatcagcaacgattgatctttgcagggaagcagttggaa 28610744  T
Q  332 gatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtcgactcttcatcttgtcttgcgacttcgtggtggtatgcagatttttgttaagaccctaa 431  Q
    |||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||   || |||||||| ||  || |  | || ||||| |||||||| ||||| |||||  | |    
T  28610745 gatggaagaactcttgcggattataatatccagaaagagagtacgcttcatctagttctgaggttgcgcggtgggatgcagatatttgtgaagacgttga 28610844  T
Q  432 ctggtaaaacgattactttggaggtggagagctcagacacaattgacaatgtaaaggctaagattcaggacaaggagggcattcc 516  Q
    | || || || |||||| | ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28610845 ccgggaagacaattactctagaggtggagagttctgatactattgataacgtgaaggccaagattcaggataaggagggcattcc 28610929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 387
Target Start/End: Original strand, 28610814 - 28611028
Alignment:
Q  173 ggtggtatgcagatttttgttaagacccttacaggaaagactattactttggaggtagagagctcggacacaattgacaatgtgaaggccaagatacaag 272  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||| |||||| | ||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || |    
T  28610814 ggtgggatgcagatatttgtgaagacgttgaccgggaagacaattactctagaggtggagagttctgatactattgataacgtgaaggccaagattcagg 28610913  T
Q  273 acaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacatccagaaagagtc 372  Q
    | |||||||| || || || || |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28610914 ataaggagggcattccaccggatcagcagcgattgatctttgctggaaaacaacttgaggatgggaggactctcgctgattataatattcagaaagagtc 28611013  T
Q  373 gactcttcatcttgt 387  Q
     || |||||||||||    
T  28611014 tacgcttcatcttgt 28611028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 132
Target Start/End: Original strand, 25948570 - 25948649
Alignment:
Q  53 ggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaaccttggctgattacaacat 132  Q
    ||||||||||| || |||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  25948570 ggtatcccaccggatcagcagcgtttgatttttgctggaaaacagcttgaagatggaagaaccctagctgattacaacat 25948649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Original strand, 28610877 - 28610977
Alignment:
Q  8 tctgataccattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatg 107  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| |  | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28610877 tctgatactattgataacgtgaaggccaagattcaggataaggagggcattccaccggatcagcagcgattgatctttgctggaaaacaacttgaggatg 28610976  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  28610977 g 28610977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40492984 - 40492896
Alignment:
Q  272 gacaaggagggtatccccccagaccagcaaaggttgatttttgctggaaagcaactcggagatggtcgaactctagctgattataacat 360  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  40492984 gacaaagaaggtatccctcctgaccagcaaaggttgatttttgcgggtaagcaactggaagatggacgtactcttgctgattacaacat 40492896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 14677105 - 14677250
Alignment:
Q  14 accattgacaatgttaaggccaagatacaagacaaagagggtatcccaccagaccagcagaggctcatctttgctggaaaacagcttgaagatggcagaa 113  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |    
T  14677105 accatcgacaatgtgaaagccaagatccaagacaaagaaggaatcccaccggaccaacaacgtctcatcttcgccggaaaacagctggaagacggccgca 14677204  T
Q  114 ccttggctgattacaacatccaggaggagtcaactctccatcttgt 159  Q
    |  | || || |||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  14677205 ctctcgccgactacaacatccagaaggaatccactcttcaccttgt 14677250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University