View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5742_low_5 (Length: 485)

Name: NF5742_low_5
Description: NF5742
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5742_low_5
NF5742_low_5
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (6-478)||(7853913-7854385)
chr3 (55-478)||(54685202-54685625)
chr3 (54-478)||(33341812-33342236)
chr3 (6-447)||(45581591-45582034)
chr3 (6-443)||(17955832-17956274)
chr3 (54-456)||(30152893-30153297)
chr3 (6-435)||(54037976-54038406)
chr3 (6-435)||(3992522-3992953)
chr3 (6-426)||(2844172-2844594)
chr3 (54-435)||(23492346-23492728)
chr3 (54-426)||(53771022-53771397)
chr3 (54-399)||(16261463-16261809)
chr3 (54-426)||(38167896-38168269)
chr3 (6-273)||(55513006-55513273)
chr3 (54-309)||(28558271-28558526)
chr3 (54-296)||(18970034-18970277)
chr3 (146-478)||(19946629-19946962)
chr3 (21-293)||(15550714-15550986)
chr3 (275-423)||(16996172-16996321)
chr3 (275-431)||(19570801-19570957)
chr3 (21-296)||(48421690-48421963)
chr3 (275-419)||(50112164-50112309)
chr3 (249-431)||(22144358-22144542)
chr3 (275-431)||(317621-317778)
chr3 (249-425)||(16182032-16182209)
chr3 (275-403)||(12349843-12349970)
chr3 (275-431)||(13817492-13817646)
chr3 (275-431)||(35123674-35123830)
chr3 (251-431)||(6154419-6154600)
chr3 (249-426)||(53898541-53898719)
chr3 (249-431)||(6146832-6147015)
chr3 (275-431)||(14298399-14298555)
chr3 (275-431)||(14304026-14304182)
chr3 (275-447)||(17523002-17523176)
chr3 (275-431)||(14295415-14295573)
chr3 (339-478)||(47784924-47785064)
chr3 (275-425)||(17100636-17100787)
chr3 (275-425)||(17101321-17101472)
chr3 (275-442)||(17139474-17139643)
chr3 (163-478)||(9303108-9303425)
chr3 (282-435)||(11329081-11329235)
chr3 (275-435)||(14528124-14528286)
chr3 (6-86)||(19232089-19232169)
chr3 (275-435)||(54423986-54424146)
chr3 (334-426)||(28558188-28558282)
chr3 (288-435)||(12560362-12560510)
chr3 (275-426)||(19260952-19261104)
chr3 (11-86)||(15857120-15857195)
chr3 (3-86)||(16743990-16744073)
chr3 (275-431)||(14301042-14301200)
chr3 (275-426)||(12349652-12349809)
chr3 (309-435)||(55440996-55441123)
chr3 (163-249)||(14177019-14177105)
chr3 (272-451)||(12488835-12489017)
chr3 (146-296)||(14285075-14285225)
chr3 (270-332)||(34439451-34439513)
chr3 (163-296)||(8275853-8275986)
chr3 (275-426)||(14059325-14059478)
chr3 (302-441)||(17204667-17204807)
chr3 (109-253)||(17393590-17393735)
chr3 (324-450)||(38811170-38811297)
chr3 (339-451)||(1990759-1990873)
chr3 (101-247)||(11402752-11402898)
chr3 (163-249)||(12539070-12539156)
chr3 (369-450)||(17960520-17960602)
chr3 (163-296)||(8268753-8268886)
chr3 (191-296)||(16934010-16934115)
chr3 (287-398)||(8631801-8631912)
chr3 (275-401)||(17938582-17938708)
chr3 (326-442)||(9590918-9591035)
chr3 (339-456)||(12952915-12953034)
chr3 (275-401)||(16880131-16880258)
chr3 (163-230)||(37915294-37915361)
chr3 (301-442)||(15876034-15876176)
chr3 (339-426)||(3576615-3576703)
chr3 (339-450)||(34559857-34559969)
chr3 (184-264)||(38375718-38375798)
chr3 (184-293)||(10913001-10913111)
chr3 (275-403)||(11061118-11061247)
chr3 (163-296)||(11477199-11477332)
chr3 (50-91)||(13301360-13301401)
chr3 (50-91)||(13312016-13312057)
chr3 (53-86)||(15615137-15615170)
chr3 (367-441)||(17191511-17191583)
chr3 (255-296)||(39656453-39656494)
chr3 (54-91)||(51961031-51961068)
chr3 (54-86)||(2050115-2050147)
chr3 (54-86)||(2449152-2449184)
chr3 (54-86)||(8268650-8268682)
chr3 (54-86)||(8275750-8275782)
chr3 (54-86)||(14842487-14842519)
chr3 (54-86)||(16933869-16933901)
chr3 (54-86)||(17912398-17912430)
chr3 (54-86)||(18911300-18911332)
chr3 (54-86)||(19260749-19260781)
chr3 (249-297)||(38527841-38527889)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (6-443)||(35015009-35015447)
chr6 (6-478)||(18583264-18583720)
chr6 (6-443)||(19983144-19983581)
chr6 (54-426)||(26089718-26090091)
chr6 (54-426)||(23994904-23995279)
chr6 (54-435)||(18002395-18002777)
chr6 (54-435)||(15742120-15742505)
chr6 (55-478)||(4991002-4991427)
chr6 (50-319)||(15889601-15889871)
chr6 (50-296)||(22585441-22585688)
chr6 (50-296)||(22590272-22590519)
chr6 (54-319)||(25640456-25640720)
chr6 (184-478)||(18823417-18823712)
chr6 (78-320)||(15004831-15005072)
chr6 (184-478)||(18839272-18839567)
chr6 (275-419)||(32898779-32898924)
chr6 (280-431)||(25744331-25744483)
chr6 (275-431)||(22440911-22441068)
chr6 (275-431)||(31628245-31628402)
chr6 (275-431)||(13014822-13014979)
chr6 (275-435)||(18777119-18777280)
chr6 (275-425)||(16086001-16086151)
chr6 (275-425)||(18432626-18432777)
chr6 (147-293)||(32276756-32276902)
chr6 (282-456)||(18398890-18399065)
chr6 (282-443)||(18381803-18381965)
chr6 (275-416)||(18570271-18570413)
chr6 (163-293)||(19629447-19629577)
chr6 (367-478)||(17083383-17083496)
chr6 (272-450)||(22361874-22362054)
chr6 (166-291)||(26512260-26512385)
chr6 (166-291)||(26517376-26517501)
chr6 (275-431)||(16106499-16106650)
chr6 (301-426)||(25367376-25367502)
chr6 (184-296)||(16300010-16300122)
chr6 (184-280)||(21931333-21931429)
chr6 (163-253)||(17374928-17375018)
chr6 (327-435)||(28195259-28195367)
chr6 (369-426)||(15740211-15740269)
chr6 (337-442)||(18629786-18629892)
chr6 (301-447)||(25651197-25651345)
chr6 (367-450)||(25919571-25919655)
chr6 (53-86)||(1650020-1650053)
chr6 (184-249)||(19175311-19175376)
chr6 (185-249)||(16136423-16136487)
chr6 (54-86)||(16232199-16232231)
chr6 (54-86)||(19610325-19610357)
chr6 (367-426)||(33324675-33324735)
chr6 (367-426)||(35136217-35136277)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (6-447)||(32493898-32494341)
chr7 (6-456)||(126366-126818)
chr7 (6-435)||(111121-111550)
chr7 (6-443)||(1936869-1937290)
chr7 (54-426)||(42056188-42056563)
chr7 (54-435)||(2028893-2029276)
chr7 (54-426)||(3049565-3049937)
chr7 (54-426)||(2190085-2190460)
chr7 (275-478)||(7284173-7284376)
chr7 (58-193)||(15516765-15516901)
chr7 (279-431)||(39046740-39046893)
chr7 (102-293)||(39291457-39291648)
chr7 (275-435)||(11287390-11287551)
chr7 (56-296)||(13352065-13352306)
chr7 (251-431)||(35094794-35094974)
chr7 (275-431)||(12758965-12759121)
chr7 (275-431)||(15822544-15822701)
chr7 (249-431)||(47289758-47289942)
chr7 (275-435)||(3894998-3895159)
chr7 (275-442)||(16570118-16570287)
chr7 (275-442)||(16595375-16595544)
chr7 (275-426)||(26070377-26070529)
chr7 (275-426)||(26094164-26094316)
chr7 (249-431)||(44865204-44865391)
chr7 (275-435)||(12248233-12248395)
chr7 (301-431)||(45452305-45452435)
chr7 (275-442)||(13274753-13274922)
chr7 (275-442)||(49047786-49047955)
chr7 (249-431)||(143622-143800)
chr7 (13-86)||(3060271-3060344)
chr7 (325-478)||(14272049-14272203)
chr7 (6-85)||(7283908-7283987)
chr7 (275-447)||(12369953-12370127)
chr7 (133-253)||(15977820-15977940)
chr7 (325-443)||(17224101-17224220)
chr7 (301-450)||(16915067-16915217)
chr7 (301-450)||(48356602-48356752)
chr7 (191-296)||(371203-371308)
chr7 (301-451)||(13377485-13377637)
chr7 (184-283)||(8563369-8563468)
chr7 (109-249)||(18151259-18151399)
chr7 (163-233)||(17984757-17984827)
chr7 (13-88)||(13377849-13377924)
chr7 (339-451)||(4484683-4484797)
chr7 (187-233)||(15575874-15575920)
chr7 (372-451)||(4446168-4446249)
chr7 (372-451)||(14935319-14935400)
chr7 (372-451)||(15362912-15362993)
chr7 (54-91)||(25124445-25124482)
chr7 (54-86)||(7293333-7293365)
chr7 (54-86)||(11516544-11516576)
chr7 (54-86)||(13758677-13758709)
chr7 (275-386)||(13863042-13863154)
chr7 (54-86)||(14113903-14113935)
chr7 (54-86)||(15441478-15441510)
chr7 (54-86)||(15862226-15862258)
chr7 (54-86)||(15927875-15927907)
chr7 (54-86)||(16212071-16212103)
chr7 (54-86)||(18979938-18979970)
chr7 (54-86)||(30262043-30262075)
chr7 (367-450)||(34241393-34241477)
chr7 (54-86)||(36052971-36053003)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (6-443)||(31132-31570)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (6-443)||(41274-41712)
scaffold0078 (54-86)||(36980-37012)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-443)||(5941-6373)
scaffold0686 (12-200)||(5735-5923)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (6-426)||(79846-80267)
scaffold0034 (275-403)||(46171-46299)
scaffold0034 (275-403)||(40664-40792)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (6-443)||(22274688-22275125)
chr2 (6-443)||(22283921-22284358)
chr2 (54-435)||(9652796-9653179)
chr2 (54-423)||(21273949-21274319)
chr2 (55-478)||(25212977-25213403)
chr2 (6-296)||(15633327-15633617)
chr2 (249-431)||(23836791-23836975)
chr2 (275-431)||(32465835-32465992)
chr2 (54-319)||(7321607-7321872)
chr2 (249-447)||(25876006-25876206)
chr2 (325-478)||(19433495-19433649)
chr2 (275-431)||(28974026-28974183)
chr2 (275-431)||(271148-271304)
chr2 (275-431)||(4448246-4448402)
chr2 (275-443)||(25601989-25602158)
chr2 (249-431)||(6879414-6879597)
chr2 (275-447)||(36890798-36890972)
chr2 (6-86)||(20627190-20627270)
chr2 (184-478)||(24826748-24827044)
chr2 (315-431)||(27261783-27261900)
chr2 (6-86)||(19794581-19794661)
chr2 (6-86)||(43642833-43642913)
chr2 (275-442)||(22579974-22580140)
chr2 (324-450)||(3403-3529)
chr2 (275-442)||(24571404-24571572)
chr2 (146-296)||(28031230-28031380)
chr2 (132-249)||(20279571-20279688)
chr2 (146-296)||(33128158-33128308)
chr2 (272-478)||(43645824-43646031)
chr2 (367-450)||(722353-722437)
chr2 (191-296)||(17204445-17204550)
chr2 (282-447)||(67952-68119)
chr2 (410-451)||(24884643-24884684)
chr2 (367-437)||(25305416-25305487)
chr2 (50-91)||(19666843-19666884)
chr2 (53-86)||(19689314-19689347)
chr2 (324-447)||(23821767-23821892)
chr2 (324-447)||(23830846-23830971)
chr2 (184-261)||(25595168-25595245)
chr2 (54-86)||(463043-463075)
chr2 (54-86)||(3798520-3798552)
chr2 (54-86)||(8944153-8944185)
chr2 (54-86)||(12635785-12635817)
chr2 (54-86)||(12641559-12641591)
chr2 (54-86)||(12728699-12728731)
chr2 (54-86)||(14906354-14906386)
chr2 (54-86)||(16935900-16935932)
chr2 (54-86)||(17006560-17006592)
chr2 (54-86)||(22863235-22863267)
chr2 (54-86)||(23820388-23820420)
chr2 (271-351)||(24341513-24341593)
chr2 (54-86)||(36982364-36982396)
chr2 (54-86)||(42177886-42177918)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (12-438)||(44034829-44035255)
chr1 (6-435)||(21859984-21860414)
chr1 (55-456)||(15861327-15861728)
chr1 (131-456)||(22366970-22367296)
chr1 (6-140)||(41218674-41218808)
chr1 (275-431)||(49967628-49967784)
chr1 (275-431)||(35522432-35522588)
chr1 (275-431)||(41212046-41212206)
chr1 (249-426)||(22403196-22403375)
chr1 (275-431)||(21718206-21718362)
chr1 (3-86)||(41394527-41394610)
chr1 (275-447)||(35054716-35054890)
chr1 (275-435)||(27329868-27330026)
chr1 (303-442)||(51627805-51627945)
chr1 (367-450)||(27674755-27674838)
chr1 (367-449)||(22829629-22829712)
chr1 (301-403)||(9784239-9784341)
chr1 (301-450)||(17608886-17609036)
chr1 (367-450)||(19603055-19603139)
chr1 (370-450)||(38033882-38033962)
chr1 (184-293)||(20254430-20254539)
chr1 (191-296)||(21650076-21650181)
chr1 (339-443)||(20177140-20177245)
chr1 (13-84)||(27675120-27675191)
chr1 (267-442)||(21194980-21195157)
chr1 (275-349)||(9784177-9784248)
chr1 (367-450)||(20955644-20955728)
chr1 (272-450)||(37233969-37234149)
chr1 (184-260)||(40436291-40436367)
chr1 (325-443)||(13377003-13377122)
chr1 (53-86)||(45051726-45051759)
chr1 (202-293)||(20194140-20194232)
chr1 (54-86)||(37844374-37844406)
chr1 (372-443)||(41229149-41229221)
chr1 (54-86)||(46523695-46523727)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (12-443)||(162036-162469)
scaffold0016 (6-443)||(166116-166547)
scaffold0016 (275-419)||(164204-164349)
scaffold0016 (339-443)||(116690-116795)
scaffold0016 (13-88)||(116410-116485)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (6-443)||(25119059-25119498)
chr4 (54-456)||(14951713-14952117)
chr4 (6-443)||(5682380-5682817)
chr4 (54-426)||(15272211-15272586)
chr4 (50-285)||(19559483-19559719)
chr4 (275-431)||(53704846-53705003)
chr4 (249-443)||(34395222-34395418)
chr4 (275-431)||(44055892-44056049)
chr4 (279-456)||(55376714-55376893)
chr4 (275-431)||(16732146-16732303)
chr4 (249-431)||(23270020-23270204)
chr4 (275-419)||(44346816-44346961)
chr4 (54-156)||(15135907-15136010)
chr4 (275-431)||(30457880-30458037)
chr4 (275-431)||(53907812-53907966)
chr4 (275-416)||(21959576-21959718)
chr4 (275-425)||(820029-820177)
chr4 (13-296)||(34177502-34177781)
chr4 (184-478)||(16522748-16523044)
chr4 (102-296)||(49071800-49071994)
chr4 (275-387)||(8872584-8872699)
chr4 (184-478)||(9295624-9295920)
chr4 (275-426)||(12837313-12837464)
chr4 (275-426)||(30232609-30232761)
chr4 (146-296)||(14500208-14500358)
chr4 (6-86)||(54118120-54118200)
chr4 (301-435)||(18494467-18494602)
chr4 (275-426)||(13809622-13809775)
chr4 (275-403)||(45458968-45459096)
chr4 (302-442)||(27960938-27961078)
chr4 (184-296)||(14996241-14996353)
chr4 (367-450)||(37957230-37957314)
chr4 (175-245)||(21417471-21417541)
chr4 (301-478)||(7185983-7186159)
chr4 (146-267)||(32460699-32460820)
chr4 (184-296)||(8045058-8045170)
chr4 (176-239)||(12133623-12133686)
chr4 (341-450)||(7964890-7965000)
chr4 (272-451)||(15044784-15044966)
chr4 (163-296)||(9795330-9795463)
chr4 (282-403)||(52265628-52265749)
chr4 (367-450)||(19821981-19822065)
chr4 (216-451)||(41256423-41256660)
chr4 (367-443)||(14901197-14901274)
chr4 (272-443)||(41166055-41166228)
chr4 (367-443)||(47535251-47535328)
chr4 (301-451)||(15109488-15109640)
chr4 (202-293)||(16225211-16225301)
chr4 (271-349)||(10104374-10104452)
chr4 (190-296)||(19697408-19697514)
chr4 (190-296)||(19707993-19708099)
chr4 (53-86)||(14996445-14996478)
chr4 (302-450)||(18276392-18276541)
chr4 (54-86)||(7131982-7132014)
chr4 (54-86)||(13246737-13246769)
chr4 (54-86)||(15287162-15287194)
chr4 (54-86)||(15294271-15294303)
chr4 (271-351)||(15675213-15675293)
chr4 (54-86)||(16327840-16327872)
chr4 (54-86)||(16609013-16609045)
chr4 (54-86)||(17145574-17145606)
chr4 (54-86)||(20001030-20001062)
chr4 (54-86)||(26680517-26680549)
chr4 (271-351)||(31115688-31115768)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (54-435)||(41506709-41507091)
chr8 (6-443)||(24716714-24717152)
chr8 (6-416)||(39115267-39115678)
chr8 (6-435)||(274416-274846)
chr8 (6-435)||(641003-641433)
chr8 (6-435)||(826809-827239)
chr8 (54-399)||(24385652-24385988)
chr8 (189-447)||(16038916-16039176)
chr8 (145-295)||(22321437-22321587)
chr8 (54-293)||(21259391-21259630)
chr8 (50-296)||(17502274-17502521)
chr8 (249-431)||(19993141-19993324)
chr8 (249-426)||(22234890-22235068)
chr8 (78-296)||(23217990-23218208)
chr8 (275-431)||(41246635-41246792)
chr8 (102-296)||(4233968-4234162)
chr8 (275-431)||(20573305-20573461)
chr8 (249-403)||(37611675-37611829)
chr8 (275-447)||(20481565-20481739)
chr8 (6-86)||(16404852-16404932)
chr8 (271-419)||(20647938-20648087)
chr8 (275-419)||(20654018-20654163)
chr8 (275-442)||(39446878-39447046)
chr8 (363-431)||(20567200-20567268)
chr8 (339-431)||(20567335-20567427)
chr8 (339-431)||(20573528-20573620)
chr8 (327-431)||(25122513-25122618)
chr8 (288-450)||(38533607-38533770)
chr8 (275-426)||(21680984-21681137)
chr8 (146-286)||(21494452-21494592)
chr8 (346-456)||(29759893-29760005)
chr8 (301-450)||(5854572-5854722)
chr8 (163-293)||(22147555-22147685)
chr8 (146-296)||(22886440-22886590)
chr8 (132-249)||(18118259-18118376)
chr8 (370-450)||(22736046-22736127)
chr8 (189-295)||(2545061-2545167)
chr8 (163-293)||(18612523-18612653)
chr8 (282-443)||(23837163-23837325)
chr8 (184-293)||(18619428-18619537)
chr8 (367-431)||(15969796-15969860)
chr8 (184-293)||(16002113-16002223)
chr8 (301-450)||(26011452-26011602)
chr8 (191-296)||(3431317-3431422)
chr8 (271-335)||(20561740-20561804)
chr8 (372-443)||(21198362-21198434)
chr8 (301-451)||(33528383-33528533)
chr8 (301-450)||(15933256-15933406)
chr8 (6-88)||(31194169-31194251)
chr8 (326-451)||(23226240-23226368)
chr8 (242-319)||(22981281-22981358)
chr8 (325-451)||(23149736-23149865)
chr8 (374-443)||(24929018-24929087)
chr8 (326-443)||(31194488-31194606)
chr8 (367-443)||(17285232-17285309)
chr8 (54-86)||(5238404-5238436)
chr8 (54-86)||(13662182-13662214)
chr8 (54-86)||(13720845-13720877)
chr8 (54-86)||(16872968-16873000)
chr8 (337-451)||(22742717-22742833)
chr8 (54-86)||(22907128-22907160)
chr8 (54-86)||(24661162-24661194)
chr8 (339-442)||(27233244-27233348)
chr8 (54-86)||(43373392-43373424)
chr8 (54-86)||(43685863-43685895)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (54-435)||(2031783-2032165)
chr5 (55-456)||(11342635-11343039)
chr5 (67-435)||(21204898-21205268)
chr5 (54-435)||(21650668-21651050)
chr5 (54-478)||(16105573-16105999)
chr5 (275-477)||(11583982-11584188)
chr5 (275-456)||(1168317-1168500)
chr5 (275-431)||(28261498-28261655)
chr5 (132-284)||(22662653-22662805)
chr5 (58-296)||(25004929-25005165)
chr5 (249-424)||(21397073-21397253)
chr5 (249-431)||(24475560-24475738)
chr5 (249-431)||(21646826-21647009)
chr5 (275-431)||(11337299-11337455)
chr5 (275-431)||(4865239-4865397)
chr5 (275-447)||(20712036-20712210)
chr5 (184-478)||(108862-109158)
chr5 (275-400)||(21906729-21906851)
chr5 (275-403)||(24183245-24183370)
chr5 (275-442)||(19405503-19405672)
chr5 (146-296)||(7529014-7529164)
chr5 (282-450)||(7728378-7728547)
chr5 (309-431)||(23466434-23466557)
chr5 (11-85)||(11584374-11584448)
chr5 (163-293)||(17909622-17909752)
chr5 (282-451)||(3673818-3673989)
chr5 (301-450)||(21616974-21617124)
chr5 (191-296)||(9730419-9730524)
chr5 (288-451)||(23493875-23494040)
chr5 (367-442)||(16595474-16595550)
chr5 (272-434)||(19862183-19862347)
chr5 (367-450)||(32966352-32966436)
chr5 (439-477)||(24225596-24225634)
chr5 (339-451)||(6456580-6456694)
chr5 (339-450)||(37983325-37983434)
chr5 (54-86)||(7425631-7425663)
chr5 (184-351)||(11763526-11763694)
chr5 (54-86)||(20623286-20623318)
chr5 (54-86)||(21233442-21233474)
chr5 (54-86)||(23507270-23507302)
chr5 (54-86)||(25900320-25900352)
chr5 (339-442)||(29917931-29918035)
chr5 (54-86)||(35791015-35791047)
chr5 (54-86)||(37053061-37053093)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (6-443)||(30056-30497)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (6-438)||(304-736)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (54-435)||(12418-12802)
scaffold0039 (302-435)||(19049-19183)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (54-435)||(878-1261)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (54-435)||(55553-55936)
scaffold0032 (54-157)||(108075-108179)
scaffold0032 (363-450)||(93973-94061)
scaffold0032 (339-426)||(104799-104887)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (54-435)||(13285-13669)
scaffold0251 (226-426)||(21432-21634)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-435)||(17304-17686)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (54-426)||(6443-6816)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (53-435)||(193396-193770)
scaffold0004 (188-426)||(186560-186799)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (54-435)||(9882-10248)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (122-435)||(14921-15236)
scaffold0175 (54-86)||(882-914)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (54-300)||(4346-4593)
scaffold0303 (131-426)||(5-301)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (55-478)||(130486-130911)
scaffold0028 (267-426)||(79521-79682)
scaffold0028 (271-348)||(89578-89655)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (6-195)||(42568-42754)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (163-435)||(9516-9789)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (275-478)||(75-278)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (301-478)||(3230-3407)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (275-478)||(21442-21646)
scaffold0120 (275-478)||(31141-31345)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (275-478)||(24890-25092)
scaffold0158 (275-409)||(25212-25345)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (163-435)||(94948-95225)
scaffold0037 (275-435)||(24841-25002)
[»] scaffold0310 (4 HSPs)
scaffold0310 (275-478)||(227-430)
scaffold0310 (402-478)||(6603-6679)
scaffold0310 (11-85)||(6261-6335)
scaffold0310 (49-85)||(5-41)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (50-296)||(44009-44256)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (21-296)||(1371-1643)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (249-431)||(32180-32363)
scaffold0091 (249-431)||(41940-42123)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (131-296)||(219-384)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (275-424)||(11821-11970)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (275-431)||(132363-132520)
scaffold0021 (276-435)||(11660-11821)
scaffold0021 (275-395)||(88289-88409)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (275-431)||(70735-70892)
scaffold0001 (282-431)||(60784-60933)
scaffold0001 (163-296)||(164974-165107)
scaffold0001 (54-86)||(172210-172242)
scaffold0001 (54-86)||(177913-177945)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (249-431)||(6932-7118)
scaffold0673 (275-431)||(935-1092)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (275-431)||(5359-5516)
scaffold0480 (275-435)||(8994-9156)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (275-431)||(22668-22825)
scaffold0008 (54-86)||(128095-128127)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (249-431)||(254900-255084)
scaffold0011 (249-431)||(261506-261690)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (249-431)||(14854-15034)
scaffold0083 (338-431)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (275-424)||(7556-7703)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (282-435)||(109582-109736)
scaffold0035 (275-435)||(118076-118237)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (275-431)||(689-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (275-419)||(38287-38432)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (275-419)||(85321-85466)
scaffold0014 (271-435)||(159275-159438)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (275-443)||(253102-253271)
scaffold0012 (54-86)||(247366-247398)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (275-442)||(9903-10071)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (275-447)||(15584-15761)
scaffold0077 (6-85)||(15319-15398)
scaffold0077 (53-86)||(36836-36869)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (275-435)||(8960-9121)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (275-431)||(631-788)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (50-294)||(3732-3981)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (275-425)||(1300-1451)
scaffold0359 (249-431)||(11740-11921)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (275-431)||(112658-112812)
scaffold0022 (301-442)||(109556-109698)
scaffold0022 (363-450)||(103123-103211)
scaffold0022 (202-293)||(67997-68089)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (163-296)||(5996-6129)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (372-478)||(28466-28573)
scaffold0150 (428-478)||(21637-21687)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (275-447)||(146561-146735)
scaffold0025 (54-86)||(146906-146938)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (275-426)||(3-155)
scaffold0160 (339-435)||(3492-3589)
[»] scaffold1164 (2 HSPs)
scaffold1164 (275-456)||(1332-1515)
scaffold1164 (6-85)||(1701-1780)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (275-443)||(4906-5075)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (275-431)||(11681-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (270-431)||(48124-48286)
scaffold0068 (270-431)||(61572-61734)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (146-296)||(17812-17962)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (275-442)||(33840-34008)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (271-403)||(33668-33800)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (146-293)||(5338-5485)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (6-85)||(19802-19881)
scaffold0122 (337-435)||(24372-24471)
scaffold0122 (6-85)||(24106-24185)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (304-442)||(31010-31149)
scaffold0031 (275-346)||(70676-70748)
scaffold0031 (367-450)||(97403-97487)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (154-296)||(5580-5722)
scaffold0335 (396-447)||(5823-5875)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (324-435)||(1889-2001)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (184-296)||(34442-34554)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (249-343)||(4351-4445)
scaffold0740 (363-431)||(4284-4353)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-85)||(20493-20572)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-85)||(94-164)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (275-419)||(3308-3454)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (282-443)||(76967-77129)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (146-296)||(61218-61368)
scaffold0023 (54-86)||(48903-48935)
scaffold0023 (54-86)||(153924-153956)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (184-292)||(11862-11970)
scaffold0162 (54-86)||(26340-26372)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (339-450)||(43975-44087)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (184-296)||(49877-49989)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (325-447)||(270-393)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (365-435)||(7807-7878)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (362-447)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (301-450)||(69415-69565)
scaffold0009 (183-248)||(244855-244920)
scaffold0009 (54-86)||(272330-272362)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (272-450)||(2483-2663)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (418-475)||(12990-13048)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (191-296)||(6252-6357)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (367-443)||(35444-35520)
scaffold0013 (196-249)||(7112-7165)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (196-296)||(17355-17455)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (386-443)||(1364-1422)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (272-451)||(2425-2607)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (196-293)||(12637-12734)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (438-478)||(12694-12734)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (184-263)||(902-981)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (365-435)||(22715-22786)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (443-478)||(3392-3427)
scaffold0090 (163-239)||(34459-34535)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-88)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (54-88)||(57392-57426)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (187-236)||(10992-11041)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (339-451)||(107967-108080)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (54-86)||(1431-1463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (54-86)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-86)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (54-86)||(2700-2732)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-86)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (54-86)||(1430-1462)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (54-86)||(22857-22889)
scaffold0141 (54-86)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (54-86)||(1496-1528)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (163-239)||(19936-20012)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 7854385 - 7853913
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854385 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 7854286  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854285 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 7854186  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7854185 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgt 7854086  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7854085 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgaatcatgattgt 7853986  T
Q  406 tgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7853985 tgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 478
Target Start/End: Original strand, 54685202 - 54685625
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccca 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54685202 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 54685301  T
Q  155 atctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685302 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 54685401  T
Q  255 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685402 aaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 54685501  T
Q  355 tcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataat 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  54685502 tcatatggttgatgataattcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataat 54685601  T
Q  455 gaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  54685602 gaagaagtttgattttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33341812
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 33342137  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342136 aatctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 33342037  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342036 gaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 33341937  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataa 453  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33341936 gtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataa 33341837  T
Q  454 tgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33341836 tgaagaagtttgattttgattatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 45582034 - 45581591
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaaggggg-ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttct 104  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45582034 agaatcataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttct 45581936  T
Q  105 cttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581935 cttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaat 45581836  T
Q  205 ttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttg 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45581835 ttgatgattaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattg 45581736  T
Q  305 ttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  45581735 ttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 45581636  T
Q  404 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581635 gttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 17955832 - 17956274
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctag----agctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955832 agaatcataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttt 17955931  T
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17955932 tctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgtt 17956031  T
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17956032 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatgg 17956131  T
Q  302 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17956132 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatga 17956231  T
Q  402 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956232 tttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30152893
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 30153198  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153197 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 30153098  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153097 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 30152998  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  30152997 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgat 30152898  T
Q  452 aatga 456  Q
     ||||    
T  30152897 tatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Original strand, 54037976 - 54038406
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037976 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 54038075  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54038076 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaactcaatgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatt 54038175  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54038176 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgt 54038275  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  54038276 tgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttg 54038375  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038376 ttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3992953 - 3992522
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992953 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 3992854  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992853 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcatgaactcaacctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 3992754  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992753 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaggttcatgatgtaggaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 3992654  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--tt 403  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||    
T  3992653 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttt 3992554  T
Q  404 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992553 gttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2844594 - 2844172
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2844594 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctc 2844495  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  2844494 ttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatt 2844395  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2844394 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttct 2844295  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--tt 403  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||    
T  2844294 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttt 2844195  T
Q  404 gttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||| ||| | |||||||||    
T  2844194 gttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492346
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 23492629  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23492628 aatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtat 23492529  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  23492528 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 23492429  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492428 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771022
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 53771298  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771297 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 53771198  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  53771197 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 53771098  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771097 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261463
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16261710  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261709 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 16261610  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  16261609 cgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 16261510  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 399  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261509 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38167896
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 38168170  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168169 aatctttgaaattcgtacttatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 38168070  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  38168069 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 38167970  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167969 gtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55513273 - 55513006
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513273 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 55513174  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513173 ttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 55513074  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513073 cgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttaatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28558526 - 28558271
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28558526 taaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacct 28558427  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558426 aatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 28558327  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558326 gaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18970277 - 18970034
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  18970277 taaggtaagggggttagatttcaatcataaccacttagttagtttcttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacc 18970178  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18970177 caatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgta 18970078  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18970077 tgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 19946962 - 19946629
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | ||||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  19946962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataaatttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 19946863  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttg 343  Q
    | ||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | |||||    
T  19946862 taatgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatgatttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttg 19946764  T
Q  344 ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19946763 ttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 19946664  T
Q  444 gggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946663 gggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15550986 - 15550714
Alignment:
Q  21 aaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa 120  Q
    ||||||||||| | ||||  | ||||  ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||  || |||||||||    
T  15550986 aaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctctttttatgcataa 15550887  T
Q  121 ttgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaat 220  Q
     || | ||  |||||||||| |||  |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15550886 gtgctaatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaat 15550787  T
Q  221 tgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15550786 ttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 15550714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 423
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996321
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 16996271  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996272 catggcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570957
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 19570900  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570901 catggcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48421963 - 48421690
Alignment:
Q  21 aaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt-taattctttttctcttgttctatgcata 119  Q
    ||||||||||||||||||     | ||| ||| ||||||||| | |||||  || |||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| |||| |||    
T  48421963 aaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagagagttagaattcatcataatcatttagtgtaatt---tttcatttgttgtatgaata 48421867  T
Q  120 attgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaa 219  Q
    | || |||   |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  48421866 agtgcttaattgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaa 48421767  T
Q  220 ttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  48421766 ttgttggtgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112309
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 50112263  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112264 catggcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 22144358 - 22144542
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22144358 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgt 22144457  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| || ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144458 tgttaagccatgttgttgatgataatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317778
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 317720  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||| ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317721 catggcttgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 425
Target Start/End: Original strand, 16182032 - 16182209
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  16182032 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgt 16182130  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182131 tttttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349970
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 12349942  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349943 catggcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817492
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataatt 13817550  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817549 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123674
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 35123731  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123730 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Original strand, 6154419 - 6154600
Alignment:
Q  251 tatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6154419 tatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattg 6154518  T
Q  350 tttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    || |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154519 ttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 249 - 426
Target Start/End: Original strand, 53898541 - 53898719
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  53898541 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgt 53898640  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    || |  ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898641 tgatatgtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 6146832 - 6147015
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  6146832 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgt 6146931  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146932 tgttaagtcatgttgttgataataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298399
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||    
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14298456  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298455 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304026
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||    
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14304083  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304082 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523176
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataat 17523101  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523102 tcatggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295415
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||    
T  14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataat 14295474  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295473 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 339 - 478
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  438 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100636
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17100688  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100687 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101321
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17101373  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101372 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17139643 - 17139474
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  17139643 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataat 17139544  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139543 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 478
Target Start/End: Original strand, 9303108 - 9303425
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  9303108 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 9303207  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatat 360  Q
    | |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |    
T  9303208 ttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacatg-ttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgt 9303306  T
Q  361 gtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaga 459  Q
      ||||  || | | ||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9303307 tgttgactatgaattatggcttgggtgttcatataccatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaaga 9303406  T
Q  460 agtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  9303407 agtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 435
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 14528124 - 14528286
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||    
T  14528124 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaat 14528223  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528224 tcatggcttgggtatgaatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19232169 - 19232089
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19232169 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 19232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54423986
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattatt 54424047  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424046 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  334 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 435
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  288 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 387  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  388 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261104
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||    
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaatt 19261051  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261052 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857195
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Original strand, 16743990 - 16744073
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  16743990 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcat 16744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301042
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||    
T  14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattat 14301101  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301100 tcatgtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349809
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaat 12349751  T
Q  375 catggcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349752 catggcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 435
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  309 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 407  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  408 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 14177019 - 14177105
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14177019 aattcgtcctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 451
Target Start/End: Original strand, 12488835 - 12489017
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  12488835 aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 12488934  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488935 aattcatggcttgggtgttcataattcatgatttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14285225 - 14285075
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  14285225 atgaacccaacccttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 14285126  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |  |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14285125 tagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaattgatgaattatg 14285075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  270 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 8275853 - 8275986
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  8275853 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 8275952  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8275953 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 8275986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 14059325 - 14059478
Alignment:
Q  275 tatgctcaattgg-tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| | |||| |||||| |  || || |  |||||||||||    
T  14059325 tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataat 14059424  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059425 tcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  302 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  402 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 441  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393590
Alignment:
Q  109 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattt 206  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||| ||||||  |||  ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaattt 17393637  T
Q  207 gatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    | || ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17393636 gttgataattgaattattgacgatgaaattgcatgttcatgctgtat 17393590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 450
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  324 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 422  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  423 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 436  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  437 gtaaaatgggttgat 451  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11402898 - 11402752
Alignment:
Q  101 ttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgt 200  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||  |||||||||| |||  |||||  |||  ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||| ||| |    
T  11402898 ttctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatat 11402799  T
Q  201 taatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 247  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11402798 gaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatg 11402752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 12539070 - 12539156
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    ||||||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12539070 aattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 12539156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 450
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  369 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 8268753 - 8268886
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||| ||    
T  8268753 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaattgg 8268852  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8268853 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 8268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 16934010 - 16934115
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  16934010 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 16934109  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  16934110 cttatg 16934115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  287 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 386  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  387 ttgcatgattca 398  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17938708 - 17938582
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || |||    
T  17938708 tatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcatt 17938609  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17938608 catggcttgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 442
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  326 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  425 gtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  438 t-aaaatgggttgataatga 456  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16880258 - 16880131
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16880258 tatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataat 16880159  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16880158 tcatggcttgggtgtgcataattcatga 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 37915294 - 37915361
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 230  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37915294 aattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttgatgat 37915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 426
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  438 taaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Original strand, 38375718 - 38375798
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggta 264  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  38375718 gatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaatgggta 38375798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10913111 - 10913001
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 282  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||  |||| |||| ||||| |    
T  10913111 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctcta 10913012  T
Q  283 attggtgaatt 293  Q
    |||| ||||||    
T  10913011 attgttgaatt 10913001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 11061118 - 11061247
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||||    ||||| ||||| | |||||||| || | ||| ||||  ||| |||| ||    
T  11061118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgat 11061217  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  11061218 tcatggcttgggtgttcataattcatgatt 11061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 11477199 - 11477332
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| | | || ||||  || |||||| ||| |||||||||||    
T  11477199 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgatttgtggttaataaaataacatgttcataatgcatgaaaatggg 11477298  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  11477299 ttgttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 11477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Original strand, 13301360 - 13301401
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13301360 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13301401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Original strand, 13312016 - 13312057
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13312016 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 441  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39656494 - 39656453
Alignment:
Q  255 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  39656494 aaaatgggtagtttgtgaattatattcaattggtgaattatg 39656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961068
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 51961068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2050115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 8268650 - 8268682
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8268650 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 8275750 - 8275782
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8275750 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842519
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911300
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260781
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38527889 - 38527841
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgc 297  Q
    ||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38527889 tgtatgaaaatgggtatgtgggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 35015009 - 35015447
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015009 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 35015108  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015109 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 35015208  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015209 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 35015308  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35015309 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 35015408  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015409 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18583720 - 18583264
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583720 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 18583621  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583620 ctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatt 18583521  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583520 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 18583421  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583420 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg----------------ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 18583337  T
Q  406 tgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18583336 tgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 18583264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 19983144 - 19983581
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983144 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 19983243  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983244 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 19983343  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19983344 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt-aaaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgt 19983442  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19983443 tgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttg 19983542  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983543 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26089718
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 26089992  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26089991 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgta 26089892  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||     
T  26089891 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 26089792  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| || |  | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089791 agtgatgttatggatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23994904
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 23995180  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995179 caatatttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 23995080  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  23995079 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 23994980  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994979 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacc 18002494  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002495 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 18002594  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  18002595 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 18002694  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||| |  |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002695 agtgacgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742505
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 15742218  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg-ttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742219 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15742318  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15742319 tgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttg 15742418  T
Q  350 tttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742419 ttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991002
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 4991229  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||    | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  4991228 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 4991130  T
Q  352 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
     ||  || |  ||||| || | |  |||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4991129 gagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttga 4991030  T
Q  451 taatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4991029 taaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 319
Target Start/End: Original strand, 15889601 - 15889871
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||| |||| |||  ||    
T  15889601 taattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtg 15889700  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889701 aacccaacctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcatga 15889800  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 319  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15889801 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 22585441 - 22585688
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||    
T  22585441 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22585540  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22585541 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22585640  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22585641 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatg 22585688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 22590272 - 22590519
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||    
T  22590272 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22590371  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22590372 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22590471  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22590472 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatg 22590519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 319
Target Start/End: Original strand, 25640456 - 25640720
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  |||||||    
T  25640456 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttaggtaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 25640555  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25640556 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtag 25640654  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 319  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  25640655 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 25640720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 18823417 - 18823712
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||| ||    
T  18823417 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaa 18823516  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18823517 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18823615  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823616 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 320
Target Start/End: Original strand, 15004831 - 15005072
Alignment:
Q  78 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgt 177  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15004831 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 15004930  T
Q  178 tgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattat 277  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  15004931 tgtagtgatatgtttgagtatgt-aatttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 15005029  T
Q  278 gctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgata 320  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  15005030 gttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 18839272 - 18839567
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  18839272 gataagtttgagtatgttaactgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 18839371  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| || ||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18839372 ttgatgacttatgacatg-ttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18839470  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839471 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898779
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32898825  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 419  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898824 aatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 431
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  280 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 379  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  380 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22440911
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 22440969  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440968 catggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628245
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 31628303  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628302 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014979
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataatt 13014921  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014922 cgtggcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777119
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18777181  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777180 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086001
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || |||||||||    
T  16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataatt 16086052  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086051 catgacttgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432626
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  ||||||||||||    
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataatt 18432678  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432677 catggcttgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Original strand, 32276756 - 32276902
Alignment:
Q  147 tgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcat 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  32276756 tgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcat 32276855  T
Q  247 gatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  32276856 aatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatt 32276902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 456  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 443
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570271
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18570314  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 416  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570313 catggcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19629577 - 19629447
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  19629577 aattcgtgctcttgttgtggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 19629478  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  19629477 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 19629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 478
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 464  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  465 gaatttgatgatgt 478  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 450
Target Start/End: Original strand, 22361874 - 22362054
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  22361874 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 22361973  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
     ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361974 gattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26512385 - 26512260
Alignment:
Q  166 tcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtag 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||    
T  26512385 tcgtgcttatcttgtagagatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtag 26512286  T
Q  266 tttgtaaattatgctcaattggtgaa 291  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26512285 tttgtgaattatgctcaattgatgaa 26512260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26517501 - 26517376
Alignment:
Q  166 tcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtag 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||    
T  26517501 tcgtgcttatcttgtagagatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtag 26517402  T
Q  266 tttgtaaattatgctcaattggtgaa 291  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26517401 tttgtgaattatgctcaattgatgaa 26517376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106499
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || |||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataatt 16106551  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106550 catgac-----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 426
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  401 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 16300010 - 16300122
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  ||    
T  16300010 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaa 16300109  T
Q  284 ttggtgaattatg 296  Q
    ||| | |||||||    
T  16300110 ttgataaattatg 16300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21931429 - 21931333
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgct 280  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||  |||| |||||||||    
T  21931429 gatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattatgct 21931333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 253
Target Start/End: Original strand, 17374928 - 17375018
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  17374928 aattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgctaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattacatgttcatggtgtat 17375018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  327 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  426 tcggtggttt 435  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  369 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 442
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  337 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  436 tgtaaaa 442  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19175376 - 19175311
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19175376 gatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgat 19175311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16136487 - 16136423
Alignment:
Q  185 atatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16136487 atatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgat 16136423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232199
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19610357 - 19610325
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610357 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 426
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 447
Target Start/End: Original strand, 32493898 - 32494341
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493898 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 32493997  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32493998 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 32494097  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494098 tgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 32494197  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||    
T  32494198 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataattcatggcttgtgtatgcatgattcataatttg 32494297  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494298 ttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 126818 - 126366
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  126818 agaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcta 126719  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  126718 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatt 126619  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126618 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 126519  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  126518 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 126419  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 456  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126418 ttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Original strand, 111121 - 111550
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111121 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 111220  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111221 ttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 111320  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111321 tgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 111420  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 405  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||    
T  111421 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcaaatttgt 111520  T
Q  406 tgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111521 tgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 1936869 - 1937290
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936869 agaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 1936968  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1936969 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 1937068  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1937069 tgatgttaaatgaattgttcatgatgaaattgcaagttcatgat-----aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgt 1937163  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    |||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | ||     
T  1937164 tgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcataatttt 1937251  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937252 ttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056563
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 42056287  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056288 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 42056387  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  42056388 tgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 42056487  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| ||||  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056488 agtgatattatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2028893
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 2029177  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2029176 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtac 2029077  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |    
T  2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaa 2028977  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028976 gtgatgttatggatgctaattcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049565
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 3049838  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049837 aatctttgaaattcgtgtttatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 3049739  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  3049738 gaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 3049639  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049638 gtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Original strand, 2190085 - 2190460
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2190085 taaggtaaggcggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacc 2190184  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190185 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 2190284  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  2190285 tgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgtta 2190384  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190385 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284376
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataatt 7284272  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  7284273 catggcttgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacg 7284372  T
Q  475 atgt 478  Q
    ||||    
T  7284373 atgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 193
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516901
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15516864  T
Q  157 ctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516865 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 279 - 431
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  279 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  379 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 293
Target Start/End: Original strand, 39291457 - 39291648
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 201  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||| |||  |||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39291457 tctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 39291556  T
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39291557 aatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287390
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11287452  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287451 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13352306 - 13352065
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccca 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| ||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||||||||    
T  13352306 aggtaagggggttagatttcaagcataatcacttaattagtttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaaccca 13352207  T
Q  155 atctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 254  Q
    | | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  13352206 acccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttaatttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtata 13352107  T
Q  255 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13352106 taaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35094974 - 35094794
Alignment:
Q  251 tatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35094974 tatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttg 35094877  T
Q  350 tttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094876 tttagtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12758965
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||    
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataatt 12759022  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759021 catggcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822701
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 15822643  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822644 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 47289942 - 47289758
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  47289942 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgc 47289843  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289842 tgttaagtcatgttgatgatgataattcatggcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3894998
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 3895060  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895059 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 16570118 - 16570287
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16570118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataat 16570217  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570218 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16595544 - 16595375
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16595544 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataat 16595445  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595444 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070529
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26070476  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070477 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094316
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26094263  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094264 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44865391 - 44865204
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  44865391 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgt 44865292  T
Q  348 tgttt---agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||    |||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865291 tgttgttaagtcatgtagtttatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248395
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataat 12248332  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248333 gcatgacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 431
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  401 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274753
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||    
T  13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 13274823  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274822 tcatggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 49047786 - 49047955
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||    
T  49047786 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataat 49047885  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047886 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 143800 - 143622
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      |||||||    
T  143800 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgt 143707  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143706 tgttaagtcatgttgttaatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060271
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcat 3060271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 478
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 7283908 - 7283987
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7283908 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370127
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattatt 12370052  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370053 catggcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 253
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15977940
Alignment:
Q  133 ataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatga 232  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||||| ||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatga 15977919  T
Q  233 aattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  15977920 aattgcatgttcatggtgtat 15977940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 443
Target Start/End: Original strand, 17224101 - 17224220
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17224101 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 17224200  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17224201 tgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 371308 - 371203
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  371308 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 371209  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  371208 cttatg 371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13377637 - 13377485
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  13377637 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 13377538  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377537 atttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 283
Target Start/End: Original strand, 8563369 - 8563468
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||  |||| | ||||||||||    
T  8563369 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgagtatattgtgagttatgctcaa 8563468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151399
Alignment:
Q  109 ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttga 208  Q
    |||||||||||| |  ||||  |||||||||| |||  |||||  || | ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||   ||||||||||||     
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttgt 18151358  T
Q  209 tgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  18151359 tgataattgaattgttgatgacgaatttgtatgttcatgat 18151399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 17984757 - 17984827
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 233  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17984757 aattcgtgctcttgttttagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattgttgatgatgaa 17984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377849
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt 13377849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  438 t-aaaatgggttgat 451  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 15575874 - 15575920
Alignment:
Q  187 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15575874 atgtttggatatgttaatttgatgttaattaagttgttgatgatgaa 15575920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124445
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 25124445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13758709 - 13758677
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13758709 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 386
Target Start/End: Original strand, 13863042 - 13863154
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||| | || ||    
T  13863042 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgat 13863141  T
Q  374 tcatggcttgggt 386  Q
     ||||||||||||    
T  13863142 gcatggcttgggt 13863154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15862258 - 15862226
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862258 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15862226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927875
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16212071
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18979970
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052971
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 31132 - 31570
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31132 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctc 31231  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31232 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatt 31331  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31332 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 31431  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  31432 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttg 31531  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31532 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 41712 - 41274
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41712 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctc 41613  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41612 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatt 41513  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41512 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 41413  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  41412 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttg 41313  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41312 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 443
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6373
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttc 6040  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6041 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgt 6140  T
Q  212 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 311  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6141 taaatgatttgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 6240  T
Q  312 attttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttg 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6241 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 6340  T
Q  411 agaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6341 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5923
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttc 5834  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5835 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 80267 - 79846
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80267 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 80168  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  80167 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 80068  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80067 tgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgt 79968  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  79967 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttg 79868  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  79867 ttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46171
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||    
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgatt 46200  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  46199 catggcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40664
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||    
T  40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 40693  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  40692 catggcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22275125 - 22274688
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275125 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctc 22275026  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22275025 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 22274926  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274925 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 22274826  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attg 404  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22274825 tgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattg 22274727  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274726 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22284358 - 22283921
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284358 agaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 22284259  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22284258 ttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcatgaactcaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 22284159  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284158 taatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 22284059  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attg 404  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22284058 tgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatgatacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattg 22283960  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283959 ctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9653179
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 9652895  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652896 aatctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 9652995  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  9652996 gaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaa 9653095  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653096 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 423
Target Start/End: Original strand, 21273949 - 21274319
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21273949 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 21274047  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274048 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 21274147  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  21274148 tgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 21274247  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||| || |  | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274248 agtgatgttatggatgctaattcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 55 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25212977
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 25213205  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  25213204 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 25213106  T
Q  352 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 449  Q
     ||  || |  ||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25213105 gagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttg 25213006  T
Q  450 ataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  25213005 ataaagaagaaatttgattttgatgatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15633617 - 15633327
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15633617 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctc 15633518  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||    
T  15633517 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataatgaacccaattcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatt 15633418  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15633417 gaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 23836791 - 23836975
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23836791 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 23836890  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836891 tgtttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465835
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32465893  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465892 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7321872 - 7321607
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||  |  |||||| | |||||||||  || ||||  |||||||||| |||  |||||||    
T  7321872 taaggtaagggggttagaattcattataatcacttagttaatttctactctcttttcctatgcatacgtgcttatttgaataagtgactattgtgaaccc 7321773  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  7321772 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgatgaaatttcatgtttatgatgtat 7321673  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 319  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  7321672 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 7321607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 249 - 447
Target Start/End: Original strand, 25876006 - 25876206
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |    
T  25876006 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttat 25876104  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgg 445  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||    
T  25876105 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgg 25876204  T
Q  446 gt 447  Q
    ||    
T  25876205 gt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 325 - 478
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974026
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 28974084  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974083 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271148
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 271205  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271204 catagcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448402
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 4448345  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448346 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25601989
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |    
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaat 25602059  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602058 catggcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6879597 - 6879414
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6879597 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgt 6879499  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    | ||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879498 tatttagtcatgttgttgatgataatacatgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890972
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 36890897  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890898 catggcttgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 20627190 - 20627270
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20627190 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcat 20627270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 24826748 - 24827044
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  24826748 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 24826847  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  |  |  ||||| || | | ||||||    
T  24826848 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatacgttgttgattatgaattatggct 24826946  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||||   |||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826947 tgggtgctcatttatcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  315 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 413  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  414 aatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 19794581 - 19794661
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19794581 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 43642833 - 43642913
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43642833 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcat 43642913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 22579974 - 22580140
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||    
T  22579974 tatgctcaattggttgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataat 22580070  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580071 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 450
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  324 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 24571404 - 24571572
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||     
T  24571404 tatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataac 24571503  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571504 tcatg-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Original strand, 28031230 - 28031380
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||| | ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  28031230 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagttttagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 28031329  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28031330 taatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 28031380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279571
Alignment:
Q  132 aataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 231  Q
    ||||||||| |||  |||||  |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatg 20279589  T
Q  232 aaattgcaagttcatgat 249  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20279588 aaattgcatgttcatgat 20279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33128308 - 33128158
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||    ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  33128308 atgaacccaatctttaattttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 33128209  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  33128208 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 33128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 43646031 - 43645824
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||| | || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||  |||    
T  43646031 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgat 43645932  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 470  Q
     ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  43645931 gattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgtgatgtcatttgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgatttt 43645832  T
Q  471 gatgatgt 478  Q
    ||||||||    
T  43645831 gatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17204550 - 17204445
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  17204550 ttgagtatgttaattgcatcataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 17204451  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  17204450 cttatg 17204445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  410 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 451  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666843
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 19666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 447
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  324 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 422  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  423 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 447
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  324 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 422  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  423 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25595245 - 25595168
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 261  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || | |||||||||    
T  25595245 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgg 25595168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 463043
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 3798520 - 3798552
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3798520 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8944185 - 8944153
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944185 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12635785 - 12635817
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635785 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12641559 - 12641591
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12641559 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728699
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16935932 - 16935900
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16935932 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16935900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17006592 - 17006560
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17006592 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863235
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 351
Target Start/End: Original strand, 24341513 - 24341593
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  24341513 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 24341593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982396
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 42177886 - 42177918
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177886 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 42177918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 438
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44035255
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 44034928  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44034929 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgt 44035028  T
Q  212 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035029 ttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatga 44035128  T
Q  312 attttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttg 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  44035129 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatga-taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttg 44035227  T
Q  411 agaaatgagttgttgtcggtggttttgt 438  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035228 agaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21860414 - 21859984
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21860414 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctc 21860315  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21860314 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 21860215  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860214 tgatgttaaatgaattgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgaatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 21860115  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  21860114 tgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggctcgggtttgcatgattcataatttg 21860015  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860014 ttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 55 - 456
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861728
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccca 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 15861426  T
Q  155 atctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861427 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 15861526  T
Q  255 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15861527 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttag 15861624  T
Q  355 tcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgata 452  Q
    ||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||     
T  15861625 tcatattgttgatgatgatgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgatt 15861724  T
Q  453 atga 456  Q
    ||||    
T  15861725 atga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 131 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22366970
Alignment:
Q  131 gaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  231 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  331 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcgg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22367097 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 22366998  T
Q  430 tggttttgt-aaaatgggttgataatga 456  Q
    || ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22366997 tgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41218808 - 41218674
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41218808 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctc 41218709  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41218708 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtga 41218674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967628
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 49967685  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967684 cattgcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522588
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataatt 35522531  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522532 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212046
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgata 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||    
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 41212107  T
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212106 attcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 426
Target Start/End: Original strand, 22403196 - 22403375
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  22403196 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgt 22403295  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403296 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718206
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 21718263  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718262 catggcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394527
Alignment:
Q  3 tggagaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394610 tggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 41394527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054716
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 35054791  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054790 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27330026
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 27329967  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329968 catggcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 442
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  303 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  402 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 449
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 449  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  401 att 403  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 450
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  370 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20254539 - 20254430
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||    
T  20254539 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaa 20254440  T
Q  284 ttggtgaatt 293  Q
    ||| ||||||    
T  20254439 ttgatgaatt 20254430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 21650076 - 21650181
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  21650076 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 21650175  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  21650176 cttatg 21650181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  438 taaaat 443  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatc 84  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21195157 - 21194980
Alignment:
Q  267 ttgtaaattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttg 365  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||| |||||| ||||  |  ||||| | |||   ||||||||||||| ||  ||||  |||    
T  21195157 ttgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatattgttg 21195058  T
Q  366 atgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  21195057 ttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttataaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784248
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 450
Target Start/End: Original strand, 37233969 - 37234149
Alignment:
Q  272 aattatgctc-aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||| || || ||||||||||   ||||| | |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  37233969 aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 37234068  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
     ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234069 gattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagtttttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Original strand, 40436291 - 40436367
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 260  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  40436291 gatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatg 40436367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 443
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20194232 - 20194140
Alignment:
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-aattggtgaatt 293  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  20194232 aatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgataatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaatt 20194140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844406
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 443
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 46523727 - 46523695
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523727 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 443
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162469
Alignment:
Q  12 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttc 162135  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  162136 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatat 162235  T
Q  212 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  162236 taaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatga 162335  T
Q  312 attttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgtt 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  162336 attgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 162435  T
Q  410 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162436 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 166116 - 166547
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166116 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctc 166215  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166216 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatt 166315  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  166316 tgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgt 166415  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  166416 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt-------taatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 166508  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166509 ttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164204
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaatt 164250  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164249 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 443
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  438 taaaat 443  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116485
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattt 116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 25119059 - 25119498
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25119059 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctc 25119158  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25119159 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 25119258  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25119259 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttt 25119358  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--tt 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  25119359 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttt 25119458  T
Q  404 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119459 gttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14951713
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 14952018  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952017 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 14951918  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14951917 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttattta 14951818  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  14951817 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgat 14951718  T
Q  452 aatga 456  Q
     ||||    
T  14951717 tatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 5682380 - 5682817
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5682380 agaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaatt-ttttcctc 5682478  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5682479 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 5682578  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682579 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 5682678  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5682679 tgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgatgatatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttg 5682778  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682779 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15272310  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272311 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15272410  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||     
T  15272411 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgtta 15272510  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272511 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19559719 - 19559483
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| |||    
T  19559719 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 19559620  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
     ||||||  |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19559619 tacccaacttttgaaattcctgctcatgttgtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 19559520  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaatt 285  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19559519 tgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaatt 19559483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53705003
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 53704945  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704946 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 249 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34395418 - 34395222
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  34395418 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 34395319  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395318 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055892
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||    
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataatt 44055950  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055949 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 279 - 456
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376893
Alignment:
Q  279 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatg 55376813  T
Q  379 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376814 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732146
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 16732204  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732203 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 23270020 - 23270204
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  23270020 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgt 23270119  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270120 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346816
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataatt 44346862  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 419  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346861 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15136010
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15136006  T
Q  153 caat 156  Q
    ||||    
T  15136007 caat 15136010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457880
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataatt 30457938  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457937 catggcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907966
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataatt 53907908  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907909 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 416
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959718
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 21959675  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959676 catggcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820177
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 820125  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820126 catggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 34177502 - 34177781
Alignment:
Q  13 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt-taattctttttctcttgttc 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||     | ||| ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||   ||||  |||||     
T  34177502 taggagctaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcatttagtgtaatt---tttcatttgttg 34177597  T
Q  112 tatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgt 211  Q
    |||| |||| || |||   |||||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||     
T  34177598 tatgaataagtgcttaattgaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatga 34177697  T
Q  212 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  34177698 taattgaattgttgatgataaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16523044 - 16522748
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  16523044 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 16522945  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  16522944 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 16522846  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16522845 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 49071994 - 49071800
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 201  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||  ||  ||||||||| | ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  49071994 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtt 49071895  T
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||  || ||  | || |||||||||||| |||||||||    
T  49071894 aatttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatgtatatgaatacttgatgaaatatgctcaattgatgaattatg 49071800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 387
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872699
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 8872683  T
Q  372 attcatggcttgggtt 387  Q
    | ||||||||||||||    
T  8872684 actcatggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9295920 - 9295624
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  9295920 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtaatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9295821  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  9295820 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggct 9295722  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9295721 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837464
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 12837412  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837413 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232761
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 30232708  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232709 catggcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Original strand, 14500208 - 14500358
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||    
T  14500208 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttca 14500307  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14500308 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 54118120 - 54118200
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54118120 agaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 54118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 435
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 13809622 - 13809775
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||    
T  13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataat 13809721  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809722 tcatggcttggatatgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459096
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| ||||||     
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatc 45459067  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45459068 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  302 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  402 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14996353 - 14996241
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  14996353 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaaagaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 14996254  T
Q  284 ttggtgaattatg 296  Q
    ||| |||||||||    
T  14996253 ttgatgaattatg 14996241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21417541 - 21417471
Alignment:
Q  175 tgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21417541 tgttttagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 267
Target Start/End: Original strand, 32460699 - 32460820
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |  |||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  32460699 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggttataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 32460798  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtt 267  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  32460799 taatgtatgaaaaggggtagtt 32460820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8045170 - 8045058
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||    
T  8045170 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 8045071  T
Q  284 ttggtgaattatg 296  Q
    ||| ||| |||||    
T  8045070 ttgatgacttatg 8045058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Original strand, 12133623 - 12133686
Alignment:
Q  176 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 239  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12133623 gttgtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttaatgatgaaattgca 12133686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 450
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  341 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 439  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  440 aaatgggttga 450  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15044966 - 15044784
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  15044966 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 15044867  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044866 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9795463 - 9795330
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||| |    
T  9795463 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattcttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtcaaaatgag 9795364  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||   |||||||| | |||||||||||||||    
T  9795363 tagttgtgaaattatgtttaattggtgaattatg 9795330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 403
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 451
Target Start/End: Original strand, 41256423 - 41256660
Alignment:
Q  216 tgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaatt 314  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||  | | ||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||| ||||||    
T  41256423 tgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga-tatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaatt 41256521  T
Q  315 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgaga 413  Q
     ||||  |   |||| | ||| | ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||    
T  41256522 gtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgaga 41256621  T
Q  414 aatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  41256622 aatgagttgttgttgttggttttataaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 443
Target Start/End: Original strand, 41166055 - 41166228
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||  | |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| ||||    
T  41166055 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgat 41166154  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
     | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41166155 gaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgttgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 451
Target Start/End: Original strand, 15109488 - 15109640
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  15109488 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 15109587  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    | ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109588 atttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Original strand, 16225211 - 16225301
Alignment:
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| || | ||||| || ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16225211 aatttgatggtatttgaattgttgttgtttaaattacatgttcatgaa-tatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaatt 16225301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 349
Target Start/End: Original strand, 10104374 - 10104452
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  10104374 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Original strand, 19697408 - 19697514
Alignment:
Q  190 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtg 289  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19697408 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19697507  T
Q  290 aattatg 296  Q
    |||||||    
T  19697508 aattatg 19697514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Original strand, 19707993 - 19708099
Alignment:
Q  190 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtg 289  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19707993 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19708092  T
Q  290 aattatg 296  Q
    |||||||    
T  19708093 aattatg 19708099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14996478 - 14996445
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14996478 ttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  302 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  402 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 7131982 - 7132014
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131982 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246737
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15287162 - 15287194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287162 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15294271 - 15294303
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294271 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 351
Target Start/End: Original strand, 15675213 - 15675293
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  15675213 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 15675293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145606
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20001062 - 20001030
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20001062 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31115768 - 31115688
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  31115768 aaattatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 31115688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 41506709 - 41507091
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 41506808  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506809 aatctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 41506908  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506909 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 41507008  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507009 gtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Original strand, 24716714 - 24717152
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716714 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctc 24716813  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24716814 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccgatctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatt 24716913  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716914 tgatgttaaatgaattgttgataatgaaattgcaagttcacgatgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 24717013  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24717014 tgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttg 24717113  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717114 ttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 6 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39115678 - 39115267
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115678 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctc 39115579  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39115578 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatt 39115479  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39115478 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgt 39115379  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||     
T  39115378 tgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatgacttgtgtatgcatgattcataattta 39115279  T
Q  405 ttgttgagaaat 416  Q
    ||||||||||||    
T  39115278 ttgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 274846 - 274416
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  274846 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 274747  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  274746 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 274647  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  274646 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 274547  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  274546 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttg 274447  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274446 ttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Original strand, 641003 - 641433
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  641003 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 641102  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  641103 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 641202  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  641203 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 641302  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  641303 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttg 641402  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641403 ttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Original strand, 826809 - 827239
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  826809 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctc 826908  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  826909 ttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatt 827008  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  827009 tgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgt 827108  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  827109 tgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttg 827208  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827209 ttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 54 - 399
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385988
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaaccc 24385751  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385752 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 24385851  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||         | | ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  24385852 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaat---------tgtaatgatcaatagatgttgttgttgttaa 24385942  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 399  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385943 gtgattttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 189 - 447
Target Start/End: Original strand, 16038916 - 16039176
Alignment:
Q  189 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggt 288  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16038916 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagt 16039015  T
Q  289 gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggttt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||| ||||||||| | |    
T  16039016 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatttatggcttggatat 16039115  T
Q  389 gcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039116 gcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321587
Alignment:
Q  145 catgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 22321536  T
Q  245 atgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321537 atgacgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 293
Target Start/End: Original strand, 21259391 - 21259630
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  |||||||    
T  21259391 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 21259490  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21259491 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtat 21259590  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
      ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21259591 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 21259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17502521 - 17502274
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| |||    
T  17502521 taattgagataagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 17502422  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17502421 aacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatga 17502322  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17502321 tgtatataaaagggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 19993141 - 19993324
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  19993141 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgt 19993239  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993240 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 249 - 426
Target Start/End: Original strand, 22234890 - 22235068
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22234890 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 22234988  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22234989 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23218208 - 23217990
Alignment:
Q  78 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgt 177  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  23218208 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgt 23218109  T
Q  178 tgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattat 277  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  23218108 ggtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattat 23218009  T
Q  278 gctcaattggtgaattatg 296  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  23218008 gttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246635
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 41246693  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246692 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4234162 - 4233968
Alignment:
Q  102 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgtt 201  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  4234162 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtt 4234063  T
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  4234062 aatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573461
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 20573404  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573405 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37611829 - 37611675
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37611829 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgt 37611730  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611729 tgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481565
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20481640  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481639 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 16404852 - 16404932
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16404852 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 419
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648087
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgtt 20648037  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648038 aatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654163
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||    
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatt 20654117  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654118 cattgcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 39446878 - 39447046
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| |||||    
T  39446878 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 39446977  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446978 tcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 431
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  363 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 339 - 431
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 339 - 431
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  327 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  425 gtcggtg 431  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  288 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 387  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  388 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21680984
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||    
T  21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataat 21681038  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681037 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 286
Target Start/End: Original strand, 21494452 - 21494592
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | ||||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  21494452 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 21494551  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattg 286  Q
    | ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  21494552 taatgtatgaaaaggggtagttgtgaaattatgcttaattg 21494592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  346 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 443  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  444 gggttgataatga 456  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22147685 - 22147555
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  22147685 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 22147586  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  22147585 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 22147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22886590 - 22886440
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| | |  ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  22886590 atgaatccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtaataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 22886491  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22886490 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactatg 22886440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118376
Alignment:
Q  132 aataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 231  Q
    ||||||||| |||  |||||  |||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatg 18118358  T
Q  232 aaattgcaagttcatgat 249  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18118359 aaattgcatgttcatgat 18118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 450
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  370 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2545167 - 2545061
Alignment:
Q  189 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggt 288  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |    
T  2545167 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatattcataatgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgat 2545068  T
Q  289 gaattat 295  Q
    |||||||    
T  2545067 gaattat 2545061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18612653 - 18612523
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||     
T  18612653 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgga 18612554  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  18612553 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 18612523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18619537 - 18619428
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  18619537 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaa 18619438  T
Q  284 ttggtgaatt 293  Q
    ||| ||||||    
T  18619437 ttgatgaatt 18619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16002223 - 16002113
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 282  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||| |    
T  16002223 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaatgagtatattgtaaattgtgctcta 16002124  T
Q  283 attggtgaatt 293  Q
    |||| ||||||    
T  16002123 attgttgaatt 16002113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 3431317 - 3431422
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||| |||    
T  3431317 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatga 3431416  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  3431417 cttatg 3431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 335  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 443
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 451  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  401 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 88
Target Start/End: Original strand, 31194169 - 31194251
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |   |  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31194169 agaatcataggagcaaaagtgaagcttaagctagtgaattaatctaactaaggtaagggggttagttttcatcataatcattt 31194251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 451
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  326 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  425 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 451  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22981358 - 22981281
Alignment:
Q  242 ttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 319  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  22981358 ttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtactcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 22981281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  424 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 451  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 443
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  326 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  425 gtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13662182 - 13662214
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662182 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13720877
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13720877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16872968 - 16873000
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16872968 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  337 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  436 tgt-aaaatgggttgat 451  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 442
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  438 taaaa 442  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373424
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2032165 - 2031783
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 2032066  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2032065 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 2031966  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031965 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 2031866  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031865 gtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11343039 - 11342635
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccca 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343039 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 11342940  T
Q  155 atctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342939 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 11342840  T
Q  255 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgttta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11342839 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgttta 11342740  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || |||||||||||||    
T  11342739 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgat 11342640  T
Q  452 aatga 456  Q
     ||||    
T  11342639 tatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21205268 - 21204898
Alignment:
Q  67 ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaatt 166  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21205268 ttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatt 21205169  T
Q  167 cgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205168 cgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 21205069  T
Q  267 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttga 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || |    
T  21205068 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttattta 21204969  T
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204968 ttctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21651050 - 21650668
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 21650951  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650950 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 21650851  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  21650850 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 21650751  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650750 gtgatgttatgaatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105573
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16105900  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||    
T  16105899 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgta 16105801  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | |||||||||||     
T  16105800 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgc 16105702  T
Q  351 ttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 449  Q
    | ||  || |  ||||| || | | ||||||| ||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16105701 tgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttg 16105602  T
Q  450 ataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16105601 ataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11583982
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgata 11584089  T
Q  372 attcatggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  11584088 attcatggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgttttt 11583989  T
Q  471 gatgatg 477  Q
    |||||||    
T  11583988 gatgatg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 275 - 456
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168500
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 1168416  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168417 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261498
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataatt 28261556  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261555 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 284
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662805
Alignment:
Q  132 aataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 231  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  232 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaat 284  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaat 22662805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25005165 - 25004929
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatc 157  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||| |||| || | |   |||||||||| |||  |||||||||||    
T  25005165 gtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtttagt--ttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgattattgtgaacccaatc 25005068  T
Q  158 tttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaa 257  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25005067 tttgaaattcgtgctcatgttgaagtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaa 25004968  T
Q  258 atgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  25004967 atgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21397253 - 21397073
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---t 344  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |    
T  21397253 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttat 21397154  T
Q  345 tgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397153 tgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24475738 - 24475560
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||    
T  24475738 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgt 24475645  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475644 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 21646826 - 21647009
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21646826 tgtatgaaaatgggtatgtatgaaaat-atgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgt 21646924  T
Q  348 tgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646925 tgtttagtcatgatg-ttgatgataattcatggcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337455
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataatt 11337398  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337399 catggcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865239
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-t 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatt 4865298  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865297 tcatggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712036
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20712111  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712110 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 478
Target Start/End: Original strand, 108862 - 109158
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  108862 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaattaacatgttcataatgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaa 108961  T
Q  284 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  108962 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 109060  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109061 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906729
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 21906755  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21906754 catggcttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183370
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  |||||    ||||||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcat---gttgatgataatt 24183341  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183342 aatggcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19405672 - 19405503
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  |||||||||||    
T  19405672 tatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataat 19405573  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405572 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7529164 - 7529014
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  7529164 atgaacccaacccttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 7529065  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |  |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7529064 tagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 7529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  309 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 406  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  407 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584374
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17909752 - 17909622
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  17909752 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 17909653  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  17909652 ttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 17909622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 9730419 - 9730524
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  9730419 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 9730518  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  9730519 cttatg 9730524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  288 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 387  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  388 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19862347 - 19862183
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  19862347 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgat 19862248  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 434  Q
     ||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862247 gattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 477
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  439 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  438 ta-aaatgggttgat 451  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  438 taaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7425663 - 7425631
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425663 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 351
Target Start/End: Original strand, 11763526 - 11763694
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-a 282  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||| || |||||||| || |  |||||||||  |||| |||| ||||| |    
T  11763526 gatatgtttgagtagatgaatttgatgataattgagttgatgttgatgaaatttcatgttcatgaggtgtataaatgggtatattgtgaattgtgctcta 11763625  T
Q  283 attggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    |||| |||||| |||   ||||||| ||| || ||||  | |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  11763626 attgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgggattcatgtttaattgttgttgttgttgtt 11763694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507270
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  438 taaaa 442  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791047
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 35791047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 6 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30497 - 30056
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30497 agaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctc 30398  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30397 ttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccctatctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 30298  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta---tgcatggt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |   || |||||    
T  30297 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaattgtatggt 30198  T
Q  303 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga- 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30197 tgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 30098  T
Q  402 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30097 ttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 6 - 438
Target Start/End: Original strand, 304 - 736
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  304 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattctttt-ctc 402  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  403 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatt 502  T
Q  206 tgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  503 tgatgttaaatgaattgtagatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgt 602  T
Q  306 tgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttg 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| || | |||    
T  603 tgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattaataatttg 702  T
Q  405 ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 438  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  703 ttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12802
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaaccc 12517  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatg--aattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 251  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12518 aatctttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 12617  T
Q  252 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 12717  T
Q  352 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12718 tagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 302 - 435
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  302 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  402 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 878 - 1261
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 977  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 1077  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  1078 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 1177  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1178 gtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55553
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 55837  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55836 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtag 55737  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 55637  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55636 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108179
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctctt-gttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 108174  T
Q  153 caatc 157  Q
    |||||    
T  108175 caatc 108179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  363 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 426
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13669
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 13384  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 13484  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  13485 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 13584  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13585 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 426
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21634
Alignment:
Q  226 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  326 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21532 catgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21631  T
Q  424 tgt 426  Q
    |||    
T  21632 tgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17686
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaaccc 17403  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17404 aatctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 17503  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  17504 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 17603  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17604 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 54 - 426
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6816
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaaccc 6542  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 6642  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| |    
T  6643 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaa 6742  T
Q  354 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6743 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 53 - 435
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193770
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 193495  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||| ||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193496 caatcattgaaattcgtgc---------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 193586  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  193587 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 193685  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193686 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 188 - 426
Target Start/End: Original strand, 186560 - 186799
Alignment:
Q  188 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186560 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 186659  T
Q  288 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||||||     
T  186660 tgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggta 186758  T
Q  388 tgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186759 tgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 435
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10248
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacc 9981  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 10081  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 352  Q
    ||||||||||||                 |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10082 tgaaaatgggta-----------------aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtta 10164  T
Q  353 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10165 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 14921
Alignment:
Q  122 tgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 221  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  222 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  322 gtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgag 419  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||    
T  15036 gtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataag 14937  T
Q  420 ttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||| | ||||||    
T  14936 ttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 882 - 914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4593
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacc 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacc 4445  T
Q  153 caatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 252  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446 caatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 4545  T
Q  253 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 131 - 426
Target Start/End: Original strand, 5 - 301
Alignment:
Q  131 gaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  231 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  331 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    |||||   ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  205 tcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 55 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130486
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaaccc 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 130713  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 351  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  130712 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgtt 130614  T
Q  352 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
     ||  || |  ||||| || | | ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  130613 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaa 130514  T
Q  451 taatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  130513 taaagaagaagtttgattttgatgatgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 79682 - 79521
Alignment:
Q  267 ttgtaaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttg 365  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  |||    
T  79682 ttgtgaattatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattg 79583  T
Q  366 atgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
     |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  79582 ttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 348
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89655
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42568
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42754 agaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctc 42658  T
Q  106 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42657 ttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 435
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9789
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9516 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgattgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatggg 9615  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |      
T  9616 tagtttgtaaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgtta 9715  T
Q  363 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9716 tggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 75
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 179  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  178 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 79  T
Q  475 atgt 478  Q
    ||||    
T  78 atgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  401 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21442
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 21547  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21546 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgat 21447  T
Q  474 gatgt 478  Q
    |||||    
T  21446 gatgt 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31141
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 31246  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31245 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgat 31146  T
Q  474 gatgt 478  Q
    |||||    
T  31145 gatgt 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 24890
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataatt 24993  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 474  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24992 catggcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 24894  T
Q  475 atgt 478  Q
    ||||    
T  24893 atgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25212
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataatt 25246  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25245 catggcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 95225 - 94948
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  95225 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaataga 95126  T
Q  263 tagttt----gtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat 358  Q
    ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||    
T  95125 tagtttatttgtaaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgat 95026  T
Q  359 atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
     |  | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95025 gttatggatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 24841 - 25002
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 24940  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    | |||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24941 cttggcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 478
Target Start/End: Original strand, 227 - 430
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 326  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 474  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  327 catagcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 426  T
Q  475 atgt 478  Q
    ||||    
T  427 atgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 478
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  402 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  11 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 85
Target Start/End: Original strand, 5 - 41
Alignment:
Q  49 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 44009 - 44256
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||| |||  ||    
T  44009 taattgaggtaacggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtg 44108  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44109 aacctaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 44208  T
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  44209 tgtatgtaaataagtagtttgtgagttatgctcaattgacgaattatg 44256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1643
Alignment:
Q  21 aaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | |   ||||  ||||| |||| ||||    
T  1371 aaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtagt---tttcatttgttgtatgaataa 1467  T
Q  121 ttgattatgagaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaat 220  Q
     || |||   |||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1468 gtgcttaattgaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaat 1567  T
Q  221 tgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1568 tgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32363 - 32180
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32363 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 32265  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32264 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 41940 - 42123
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41940 tgtatgaaaatgggtatgtttg-aaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 42038  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42039 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  131 gaataagtgaatatcatgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 230  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  231 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 424
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11970
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11920  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11921 catggcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132520
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 132462  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132463 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 276 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11660
Alignment:
Q  276 atgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  ||||||||||||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataatt 11722  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11721 catggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88289
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 88310  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgat 395  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  88309 cttggcttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70892
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 70834  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70835 catgacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60784
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 60834  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60833 tgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 164974 - 165107
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  164974 aattcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggg 165073  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |  ||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  165074 ttcttatgaaattatgcttaattgatgaattatg 165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172210
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177913
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7118
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgt 344  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | ||||||||    
T  6932 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgt 7030  T
Q  345 tgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7031 tgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 935 - 1092
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 1034  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1035 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5516
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 5458  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5459 catggtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9156
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  8994 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataat 9093  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9094 tcatggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22668
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataatt 22726  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22725 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128127
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 254900 - 255084
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  254900 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 254999  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255000 tgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 261506 - 261690
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  261506 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 261605  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261606 tgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14854
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||       
T  15034 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt--- 14939  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14938 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  338 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7556
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 7604  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7603 catggcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 282 - 435
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118237
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 118175  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118176 catggcttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 689 - 846
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 788  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  789 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38287
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 38333  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 419  Q
    |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38332 cataacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85321
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 85367  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85366 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159275
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatga 159342  T
Q  370 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159341 taatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253271
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataatt 253201  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253202 caaggcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247398
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 9903
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattatt 9972  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9971 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15761
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||    
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgcta 15683  T
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15684 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 15319 - 15398
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15319 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 36836 - 36869
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8960
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 9022  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9021 catggcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 631 - 788
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||    
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataatt 730  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  731 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Original strand, 3732 - 3981
Alignment:
Q  50 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgaatatcatg 148  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||    
T  3732 taattgaggtaaaggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtg 3831  T
Q  149 aacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatat----gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 244  Q
    || ||||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||    |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3832 aaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttc 3931  T
Q  245 atgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatta 294  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  3932 atgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1300
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 1352  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1351 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11921
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggta-gtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  11740 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgt 11836  T
Q  348 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11837 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112812
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcat---gttgttgataatt 112754  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112755 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 450
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  363 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 293
Target Start/End: Original strand, 67997 - 68089
Alignment:
Q  202 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctc-aattggtgaatt 293  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  67997 aatttggtgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaatt 68089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6129 - 5996
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg 262  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  6129 aatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaatggg 6030  T
Q  263 tagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  6029 tagtttgtgaattgtgctcaattgatgatttatg 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 372 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  372 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 470  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  471 gatgatgt 478  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  428 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146561
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||    
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaatt 146636  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 447  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146635 catggcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146906
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 3
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataatt 56  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  55 catggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 275 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1332
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||    ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |    
T  1515 tatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaat 1416  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1415 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1701
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1780 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4906
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 4976  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4975 catggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 431
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11837
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 11780  T
Q  375 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11781 catgacttgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48124
Alignment:
Q  270 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
Q  370 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48186 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61572
Alignment:
Q  270 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
Q  370 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61634 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17962 - 17812
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  17962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 17863  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17862 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 442
Target Start/End: Original strand, 33840 - 34008
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| |||||    
T  33840 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 33939  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33940 tcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 271 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33668
Alignment:
Q  271 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 33701  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 403  Q
     |||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  33700 gattcatggctagggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5338
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  5485 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 5386  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  5385 taatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19881
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19802 agaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  337 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 24106 - 24185
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24106 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  304 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 402  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  403 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70676
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 346  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 450
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 296
Target Start/End: Original strand, 5580 - 5722
Alignment:
Q  154 aatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 253  Q
    |||||||| | ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||    
T  5580 aatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtat 5679  T
Q  254 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  5680 gaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattatg 5722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 447
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  396 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 447  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  324 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 422  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  423 ttgtcggtggttt 435  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 34442 - 34554
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  34442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 34541  T
Q  284 ttggtgaattatg 296  Q
    ||| |||||||||    
T  34542 ttgatgaattatg 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4351
Alignment:
Q  249 tgtatgaaaatgggtagtttgt-aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 343  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4445 tgtatgaaaatgggta-tgtgtgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  363 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20493
Alignment:
Q  6 agaagcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20572 agaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  15 ggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggatataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3454 - 3308
Alignment:
Q  275 tatgctcaattggtg-aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 373  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||    
T  3454 tatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaat 3355  T
Q  374 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 419  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3354 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 443
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  282 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 381  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  382 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Original strand, 61218 - 61368
Alignment:
Q  146 atgaacccaatctttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 245  Q
    |||||||||||||||    ||||||||  |||| | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  61218 atgaacccaatctttaattttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 61317  T
Q  246 tgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatg 296  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  61318 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 61368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48903
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 48903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 153924 - 153956
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 153956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11862
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  11970 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 11871  T
Q  284 ttggtgaat 292  Q
    ||| |||||    
T  11870 ttgatgaat 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 450
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 437  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  438 taaaatgggttga 450  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 49877 - 49989
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 283  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || ||    
T  49877 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaa 49976  T
Q  284 ttggtgaattatg 296  Q
    ||| |||||||||    
T  49977 ttgatgaattatg 49989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  325 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 423  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  424 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 447  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  365 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  362 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 447  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  301 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 400  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  401 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 248
Target Start/End: Original strand, 244855 - 244920
Alignment:
Q  183 agatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  244855 agatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattatggatgatgaaattgtatgttcatga 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2483
Alignment:
Q  272 aattatgctc-aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||| || || ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  2663 aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 2564  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 450  Q
     |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2563 gattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 475
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  418 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 475  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 296
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6357
Alignment:
Q  191 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtga 290  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| |||    
T  6252 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatga 6351  T
Q  291 attatg 296  Q
     |||||    
T  6352 cttatg 6357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  367 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7165
Alignment:
Q  196 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 249  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7112 tatgttaacttgttgataattgaattgttgatgatgaatttgcatgttcatgat 7165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17455
Alignment:
Q  196 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 295  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17355 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttat 17454  T
Q  296 g 296  Q
    |    
T  17455 g 17455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  386 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 451
Target Start/End: Original strand, 2425 - 2607
Alignment:
Q  272 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 370  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  ||||||||    
T  2425 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgat 2524  T
Q  371 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 451  Q
     ||||||||||||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2525 gattcatggcttgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 293
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12734
Alignment:
Q  196 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaatt 293  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12637 tatgttaacttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgttatatataaatgaataattgataaattatgctcaattgatgaatt 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  438 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Original strand, 902 - 981
Alignment:
Q  184 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 263  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  902 gatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggt 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  365 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 435  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 478
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  443 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 34459 - 34535
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 239  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  34459 aattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgtgaaattgatgataactgaactgttgatgtggaaattgca 34535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 88
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6024
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 88
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57426
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 57426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11041
Alignment:
Q  187 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaatt 236  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10992 atgtttgagtatgtgaatttgatgttgattgagttgttgatgatgaaatt 11041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  339 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 438  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  439 -aaaatgggttgat 451  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1463
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1431 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1524
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9183
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2700
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2732 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 19936 - 20012
Alignment:
Q  163 aattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 239  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||| || |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19936 aattcgtgctcatgttttagtgttatgtttgggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtggaaattgca 20012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University