View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5744-Insertion-5 (Length: 587)

Name: NF5744-Insertion-5
Description: NF5744
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5744-Insertion-5
NF5744-Insertion-5
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (8-587)||(48912170-48912749)
chr4 (8-551)||(48957955-48958498)
chr4 (8-587)||(48965104-48965680)
chr4 (88-386)||(48961267-48961567)
chr4 (271-418)||(48974062-48974209)
chr4 (317-420)||(48951185-48951288)
chr4 (497-587)||(48967233-48967323)
chr4 (67-194)||(48951399-48951526)
chr4 (281-373)||(33396687-33396779)
[»] scaffold0536 (3 HSPs)
scaffold0536 (8-572)||(6336-6900)
scaffold0536 (20-567)||(10330-10877)
scaffold0536 (271-420)||(1541-1690)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (47-587)||(13448138-13448675)
chr2 (9-587)||(13439975-13440550)
chr2 (106-587)||(13454609-13455087)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (8-422)||(12589994-12590411)
chr6 (20-422)||(12483301-12483706)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (9-587)||(3417356-3417931)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (55-422)||(12641353-12641720)
chr8 (473-572)||(12641771-12641870)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (9-565)||(12540482-12541035)
chr5 (9-587)||(28385109-28385684)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Original strand, 48912170 - 48912749
Alignment:
Q  8 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912170 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccaatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 48912269  T
Q  108 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912270 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagaatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaag 48912369  T
Q  208 aagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912370 aagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactg 48912469  T
Q  308 ttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912470 ttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacagttttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggt 48912569  T
Q  408 ggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggac 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912570 ggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggac 48912669  T
Q  508 agtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48912670 agtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 48912749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48958498 - 48957955
Alignment:
Q  8 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 107  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  48958498 ataactcagtgttgtacatatgctttggaagcatatgttatttatctgataaacaactttatgagattgcgtgtgggatagaagcatcaggtcacgaatt 48958399  T
Q  108 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaag 207  Q
      |||||||||||||||| |||||| |||  ||  | || | |||||||||||||| ||| |||||||| || || || ||||||||||  || ||||||    
T  48958398 tgtatgggttgttcctgagaagaaagggaaagaagacgagagtgaagaggagaaaggaaagtggttgccgaaaggattcgaagagagaaacattggaaag 48958299  T
Q  208 aagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactg 307  Q
    ||||| | | |||| |||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48958298 aagaaaggtttgatcattagggggtgggccccacaagttttgattctgagccacattgccgtgggtgcatttatgacacattgcgggtggaactccactg 48958199  T
Q  308 ttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggt 407  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||||    
T  48958198 tggaggctgttagcgcgggggttccaatgatcacgtggccggtgcatggagaacaattctacaatgagaagttgataactaatgtgcgaggaattggggt 48958099  T
Q  408 ggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggac 507  Q
    |||||| |||||||| || ||| |   ||  ||| ||| ||| | | ||||| | ||  | |  |||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  48958098 ggaggttggtgcaacagagtggtgtgtaaacggttttgaggagaaacagaagattgtgagtaaagatagtatagaaaaggctgtgaagagattgatggac 48957999  T
Q  508 agtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtt 551  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||    
T  48957998 ggtggtgatgaagctgaggaaatcaaacagcgtgctcaagagtt 48957955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 48965680 - 48965104
Alignment:
Q  8 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 107  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||| || ||    
T  48965680 ataactcagtgttgtacataagctttggaagcctctgtcgttatcaggataaacagctttatgagattgcgtgtgcaatagaagcatcgggtcatgattt 48965581  T
Q  108 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaag 207  Q
     ||||||||| ||||    || ||  |||  ||| |||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || ||||||    
T  48965580 tatatgggttattccccttaataacgggaaagaggatgagagtgaagaggagaagcaaaagtggttaccaaagggattcgaagagagaaacattggaaag 48965481  T
Q  208 aagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactg 307  Q
    |||   | | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  48965480 aag---ggtttgattattaggggttgggctccgcaggttctgattctgagccaccccgctgtgggtgcctttatgactcattgtggttggaactccacag 48965384  T
Q  308 ttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggt 407  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || |||||    |||||||||||||| ||||| || ||  |||||||| | ||||  |||||||| ||    
T  48965383 tggaggctgttggtgcgggggttccgatgattacatggccttcacatggagaacaattctacaacgaaaaactgataacagaagtgcgagggattggagt 48965284  T
Q  408 ggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggac 507  Q
    ||| || |||||||| |||||| |    |||||| |||  |||||||||||| ||||  | || ||||  || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  48965283 ggaagttggtgcaacagaatggtgtttgactggttttgaagaaagagagaagctggtgagtagtgatagcatagagaaggctgtgaggagattgatggac 48965184  T
Q  508 agtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||||||| || || |||| ||  || ||| ||||||||||    
T  48965183 agtggtgatgaagctgagaaaattagaagtcgtgctcaagagtttggagaaaaggctagacgagccattcaagaaggtgg 48965104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 48961567 - 48961267
Alignment:
Q  88 gaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttg 187  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||  | | |||| |  |||||||||||||| || |||||||| || || ||||    
T  48961567 gaagcatcgggtcacgaatttgtatgggttgttcctgagaaaaaagggaaagtggatgagagcgaagaggagaaagacaagtggttgccgaaaggatttg 48961468  T
Q  188 aagagagaattatcggaaagaagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacaca 287  Q
    |||||||||  || | ||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  48961467 aagagagaaacattgaaaagaagaagggtttgatcattaaggggtgggccccacaagttatgatcctgggccacacagcggtgggtgtgtttatgacgca 48961368  T
Q  288 ttgtgggtggaa--ttccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataa 385  Q
    ||| ||||||||   |||||  ||||||| | |||||||||| | |||||||| || |||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48961367 ttgcgggtggaactctccaccattgaggctggtagtgcagggatcccaatgataacatggcccgtacatggagaacaattctacaacgagaagttgataa 48961268  T
Q  386 c 386  Q
    |    
T  48961267 c 48961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 271 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48974209 - 48974062
Alignment:
Q  271 ggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttaca 370  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||    
T  48974209 ggtgcattcttgacacattgcgggtggaactccaccgtggaagccgttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccagtgcatgacgaacaattctaca 48974110  T
Q  371 atgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcggtg 418  Q
    | |||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  48974109 acgagaagttgataactcaggtgcggggtattggtgtggaggttggtg 48974062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 48951288 - 48951185
Alignment:
Q  317 ttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcgg 416  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || || |||||||||||| | ||||| || |||| |||||| || ||||| || ||    
T  48951288 ttagtgtaggggttccgatgatcacgtggccggtgcatagtgatcagttctacaatgagaagctcataactcatgtgcgtgggataggagtggaagtagg 48951189  T
Q  417 tgca 420  Q
    ||||    
T  48951188 tgca 48951185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 48967323 - 48967233
Alignment:
Q  497 gattgatggacagtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||| ||  ||| || ||||||||||    
T  48967323 gattgatggacaatgacgatgaagctgagaagatcagacaacgtgctcgagactttggagaaaaggctacacgagcacttcaagaaggtgg 48967233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 48951526 - 48951399
Alignment:
Q  67 tatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaa 166  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| |||  || | ||||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||| | || | ||| |||||||| ||||    
T  48951526 tatgagattgcaagcgcgatagaagaatcaggttatgaattcatatgggttgtcccagaaaagaaggggaaggagaacgagagtgatgaggagaaggaaa 48951427  T
Q  167 aatggttgccaaaggggtttgaagagag 194  Q
    ||||||| || | || ||||||||||||    
T  48951426 aatggttacccagggagtttgaagagag 48951399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33396779 - 33396687
Alignment:
Q  281 tgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatg 373  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | || | ||| ||||||||| | |||||| | || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  33396779 tgacacattgtggatggaattcaacattggaaggagtgagtgcagggttaccaatggtgacatggccaatgtatggtgaacaattttacaatg 33396687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0536
Description:

Target: scaffold0536; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 572
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6900
Alignment:
Q  8 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 107  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  6336 ataactcagtgttgtacatatgctttggaagcttatgccttttcccggataaacaactttacgagattgcatgtgggatagaagcatcgggtcacaaatt 6435  T
Q  108 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6436 catatgggttgttcctgagaagaaagggaaagaagatgagagtgaagaggagaaaggaaaatggttgccaaagggattcgaagagagaaatatcggaaag 6535  T
Q  208 aagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactg 307  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6536 aagaagggtttgattattaggggttgggctccacaagttatgattttgagccacaaagctctgggtgcgtttatgacgcattgtgggtggaattccactg 6635  T
Q  308 ttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggt 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  6636 ttgaggctgttagtgcaggggttccgatgatcacgtggccggtgcatggagaacaattttacaatgaaaagttgataacacaggtgcgacgaattggggt 6735  T
Q  408 ggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggac 507  Q
    || ||| || ||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  6736 ggtggtgggggcagctgagtggagttcaactggtattggggagagagagaaggtggtggggagggatagtattgagaaggctgtgaggagattgatggat 6835  T
Q  508 agtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgc 572  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6836 ggtggtgacgaagctgagaaaatcaaaaagtatgctcgagagtttggggataaggctaaacatgc 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 567
Target Start/End: Original strand, 10330 - 10877
Alignment:
Q  20 tgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgt 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  |||| |||||    
T  10330 tgtacatttgctttggaagcctatgttatttttcagataaacaactttatgagattgcgtgcagggtagaagcatcgggttacgaatttgtatgagttgt 10429  T
Q  120 tcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaagaagaaggctatg 219  Q
    |||||| |||||| |||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||| | || || || |||||||| ||| |||| | ||||||||||| | ||    
T  10430 tcctgagaagaaagggaaagagaatgagagtcaagaggagaaagaaaaatggctaccgaaaggatttgaagaaagagttattgcaaagaagaagggtttg 10529  T
Q  220 attattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagtta 319  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10530 attattaagggttgggcccctcaggttatgattctaagccacactgttgtgggtgcgtttatgacacattgtgggtggaattccaccgtggaggcggtta 10629  T
Q  320 gtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcggtgc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||| || |||||    
T  10630 gtgcaggggttccaatgatcacgtggccaatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacgcaagtgcgggggattgggggggaagtgggtgc 10729  T
Q  420 aacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggacagtggtgatgaa 519  Q
    |   || ||| ||  |  |||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |    
T  10730 agtagagtggtgcttagttggtattggggagaaagagaagttggtcgggagggatggtattgagaaggttgtgaagagattgatggacaatagttatgta 10829  T
Q  520 gctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaa 567  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10830 gctgagataatcagacgacatgctcgagagtttggggataaggctaaa 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0536; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 420
Target Start/End: Original strand, 1541 - 1690
Alignment:
Q  271 ggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttaca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |     ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||| | || ||||| || |    
T  1541 ggtgcatttttgacacattgtgggtggaactctataaccgaggctgttagtgcaggaattccaatgatcacatggccagtacatagtgatcaattctata 1640  T
Q  371 atgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcggtgca 420  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1641 acgaaacgttgataactcaggtgcatgggattggagtggaagtcggtgca 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13448675 - 13448138
Alignment:
Q  47 atttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatga 146  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| || || | ||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  ||||    
T  13448675 atttttctgataaacaactatacgagatggcatgtgcgatagaagcatccggtcacccattcatatgggttgttcctgagaagaaagggaaagaagatga 13448576  T
Q  147 caatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaagaagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggtt 246  Q
     |  ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  13448575 gagcgaagaagagaaagaaaagtggttaccgaagggatttgaagagagaaatatcgg---gaagaagggtttgatcattaggggttgggccccacaggtt 13448479  T
Q  247 atgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggc 346  Q
    | |||  |||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13448478 aagatattgagccaccctgcagtggggggatttatgacgcattgcggggggaactcaaccgtagaggctgttagtgcgggagttccaatgataacgtggc 13448379  T
Q  347 cgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattgg 446  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||  | |  || ||||| || || ||||||||||| |||||| | || | |||| | |     
T  13448378 cggttcatggagatcaattctacaatgagaaactgataacacaattccgaggaattggagttgaagtcggtgcaacagaatggtgtacgagtggtgtcgc 13448279  T
Q  447 ggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggacagtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcga 546  Q
    ||| ||| ||||| | ||  | || ||||  || ||||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | || |||||||    
T  13448278 ggagagaaagaagttagtgagcagagatagcatagagaaggctgtaaggagattgatggacggtggtgatgaagctgaaaatatcaggctacgtgctcga 13448179  T
Q  547 gagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    |||||||| || ||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  13448178 gagtttggagaaaaagctatacaagctattcaagaaggtgg 13448138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13440550 - 13439975
Alignment:
Q  9 taactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattc 108  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||       |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||| ||||||  ||||    
T  13440550 taactcggtgttgtacatatgttttggaagcatcaactatttctctgataaacaactatatgagatggcgtgcgcaatagaagcatctagtcacccattc 13440451  T
Q  109 atatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||  |||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||  |   ||    
T  13440450 atatgggttgttcctgagaagaaagggaaagaagatgagagtgaggaagagaaagaaaagtggttgccaaagggattcgaagagagaaacattag---ga 13440354  T
Q  209 agaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgt 308  Q
     || || | |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| || | |||    
T  13440353 ggatgggtttgatcattaagggttgggccccacaagttaagatattgagccaccctgcggtggggggatttatgacgcattgcggggggaactcaattgt 13440254  T
Q  309 tgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtg 408  Q
     ||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||  || |||||||  | |  || ||||| |||    
T  13440253 agagtctgttagtgcgggagttccaatgataacgtggccggttcatggagatcaattctacaacgagaaactggtaacacaatttcgaggaattggagtg 13440154  T
Q  409 gaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggaca 508  Q
    || |||||||||||||||||| | |  | |||| ||| ||| ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  13440153 gaagtcggtgcaacggaatggtgtaagaatggtgttgcggagagagagaagttggtgagcagggataacatagagaaggctgtgaggagattgatggaga 13440054  T
Q  509 gtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
     ||||||||||||| | || || || | || ||||| ||||||||| || || |||| ||| || ||| ||||||||||    
T  13440053 atggtgatgaagctaaaaatatgaggctacttgctcaagagtttggagaaaaggctacacaagctattcaagaaggtgg 13439975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13455087 - 13454609
Alignment:
Q  106 ttcatatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaa 205  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||  |||| |  |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||       
T  13455087 ttcatatgggttgttccggagaagaaagggaaagaagatgagagcgaagaggagaaacaaaagtggttgccgaagggatttgaagagaaaaacatcg--- 13454991  T
Q  206 agaagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccac 305  Q
    |||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||  |||| ||| | || ||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| || |     
T  13454990 agaaaaagggtttgatcattaggggttgggccccacaagttaagatattgagtcaccctgcagtggggggatttatgacgcattgcggggggaactcaat 13454891  T
Q  306 tgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggg 405  Q
     || ||||| |||||    || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| || |  || |||||     
T  13454890 cgtagaggctgttagcatgggagttccaatgataacgtggccagtccatggagatcaattctacaacgagaaactaataacacaagttcgaggaattgga 13454791  T
Q  406 gtggaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatgg 505  Q
     | || ||||||||||| |||||| | |||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||  | |  ||||  || ||||||| ||||| | |||||||||    
T  13454790 attgaagtcggtgcaacagaatggtgtacaagtggtgttgcggagagagagaagttggtgagcaaagatagcatagagaaggctgtgaggagattgatgg 13454691  T
Q  506 acagtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
     | |||||||||||||| | || |||||   || ||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || |||||||    
T  13454690 gcggtggtgatgaagctaaaaatatcagggtacgtgctcgagagtttggagaaaaggctacacaagctattcaaaaaggtgg 13454609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 422
Target Start/End: Original strand, 12589994 - 12590411
Alignment:
Q  8 ataactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaatt 107  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||  | ||||||||    
T  12589994 ataactctgtgttgtacatatgctttgggagcatatgctatttctcagataaacaactttatgagatttcgtgtggcatagaagcatcaggccacgaatt 12590093  T
Q  108 catatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcgg---a 204  Q
    | |||||||| |||| || || ||| ||| |||  |||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||  || ||   |    
T  12590094 cgtatgggttattcccgagaaaaaagggaaggaagatgagagtgatgaggataaacaaaaatggttgcctagtggatttgaagagagaaacattgggaga 12590193  T
Q  205 aagaagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattcca 304  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  12590194 aagaagaagggtttgatcattaggggttgggccccacaagtaatgattatgagccacaatgcagtgggcgcgtttatgacacattgtggatggaattccg 12590293  T
Q  305 ctgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattgg 404  Q
      || ||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||  || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  12590294 tcgtggaggcggttagtgctggaattccgatgatcacatggccattgaatggtgaacatttttacaatgagaagttgataactgatgtgcatggaattgg 12590393  T
Q  405 ggtggaggtcggtgcaac 422  Q
     ||||| || ||||||||    
T  12590394 agtggaagttggtgcaac 12590411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Original strand, 12483301 - 12483706
Alignment:
Q  20 tgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgt 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  12483301 tgtacatatgctttgggagcctatgcaatttctctgataaacagctttacgaaatttcatgcggaatagaagcatcgggtaaaaaattcatatgggttgt 12483400  T
Q  120 tcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaagaagaag---gct 216  Q
    |||||| || ||| ||| |||  |||| |  || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||  ||| ||| |||   | |    
T  12483401 tcctgagaaaaaagggaaggaagatgagagcgatgaggagaaagaaaagtggttgccgaagggatttgaggagagaaacattagaaggaataagatgggt 12483500  T
Q  217 atgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcag 316  Q
     | || || | ||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| || || |    
T  12483501 ttaatcatcagggggtgggcaccacaggtactgattttgagccaccctgcagtgggtgcatttatgactcactgtggatggaattctgttgtggaagcgg 12483600  T
Q  317 ttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcgg 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||  | |||||  | ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  12483601 ttagtgcagggattccaatgatcacgtggccggttcacggtgaacatttttacaatgagaaactcataactaatgtgcgagggattggtgtggaagtcgg 12483700  T
Q  417 tgcaac 422  Q
    ||||||    
T  12483701 tgcaac 12483706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 587
Target Start/End: Original strand, 3417356 - 3417931
Alignment:
Q  9 taactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattc 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||  |    |||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||| |||||  ||||    
T  3417356 taactcagtgttgtacatatgttttggaagcttaaactatttctctgataaacaactatatgagattgcatacgcaatagaagcatcgggtcacccattc 3417455  T
Q  109 atatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaaga 208  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| | |  ||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||    
T  3417456 atatgggttgttcttgagaagaaaggaaaagaagatgagaacgaagaagagaaagaaaagtggttgccgaagggatttgaggagagaaacattggaaaga 3417555  T
Q  209 agaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgt 308  Q
    ||   | | ||||  ||| ||||||||| |||||||||  |||  |||||||| | || || || | ||||||||||||||||||| |||| ||   |||    
T  3417556 ag---ggtttgatcgttaggggttgggccccacaggttcagatattgagccaccctgcggtagggggatttatgacacattgtggggggaactcatttgt 3417652  T
Q  309 tgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtg 408  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| | |||||||||  | |||||||| || |  || ||||| |||    
T  3417653 tgaggctgttggtgcaggagttccaatgataacgtggccgggtcatggagatcaattgttcaatgagaaactaataacacaagtccgaggaattggagtg 3417752  T
Q  409 gaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggaca 508  Q
    || || |||||||| |||||| |  ||  |||||||||||| ||| ||||| ||||  | || ||| | || |||||||   ||| | ||||||||||||    
T  3417753 gaagtaggtgcaacagaatggcgtgcacatggtattggggagagaaagaagttggtgagcagagatgacatagagaaggcaatgaggagattgatggaca 3417852  T
Q  509 gtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    || ||||||| |||||    || |||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||    
T  3417853 gtagtgatgaggctgaaggtatgagactacgtgctcgagagcttggagagaaggctaaacgagctattcaagaaggtgg 3417931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 422
Target Start/End: Original strand, 12641353 - 12641720
Alignment:
Q  55 gataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattcatatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaag 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||   ||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||   |  |||| | |||||    
T  12641353 gataaacaactttacgagattgcgagcggaatagaaaattcaggtcacgaatttgtatgggttgttcctgagaagaaagggaaaaaagatgagagtgaag 12641452  T
Q  155 aggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaagaagaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattct 254  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||| | | | ||| ||||| | | | || |||| ||  ||||| ||||| || |||||| |    
T  12641453 aggagaaagaaaagtggttgcctaaaggattcgaagagagaaatgttgaaaataagaaaggttttatcattagggagtgggccccacaagtaatgatttt 12641552  T
Q  255 gagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgttgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcat 354  Q
     |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||   || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||     
T  12641553 aagccacgctgctgtgggtgcattcatgacgcattgcgggtcgaactccttggtagaggctgttagtgcagggattccaatgatcacgtggccagtgcaa 12641652  T
Q  355 ggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtggaggtcggtgcaac 422  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||||||    ||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  12641653 ggagaacagttctataatgagaagctgataactgttgtgcgaaggattggggtggaggtgggtgcaac 12641720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 572
Target Start/End: Original strand, 12641771 - 12641870
Alignment:
Q  473 ataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggacagtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgc 572  Q
    ||| ||| ||||| | ||||| | |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  12641771 atagtatagagaaagctgtgaggagattgatggacgatggtgatgaagctaaggaaatcagacaacgtgctcaagagtttgggaaaaaggctacacatgc 12641870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 12541035 - 12540482
Alignment:
Q  9 taactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattc 108  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||  |  |||||| |  || |||||||| ||||||||||| || |   | |||| |  | |||||  ||||    
T  12541035 taactcagtggtgtacatatgttttggaagcataaatcatttctttgacaaacaactatatgagattgcatgtgcagtagaaggaatgggtcacccattc 12540936  T
Q  109 atatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||  ||  |||| | |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||| |    
T  12540935 atatgggttgttcctgagaagagagggaaagaagatgagactgaagaagagaaagaaaagtggatgccgaagggatttgaggagagaaacattggaaaaa 12540836  T
Q  209 agaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgt 308  Q
    ||   | | |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||| | || || | |||    
T  12540835 ag---ggtttgatcattaggggttgggccccacaggttaagatattgagccaccctgcggtggggggatttatgacacattgtgggggaaactcaattgt 12540739  T
Q  309 tgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtg 408  Q
     ||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||   |||||||| || || | ||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||| ||     
T  12540738 agaggctgttggtgcgggagttccaatgataacgtggccgtgtcatggagatcacttattcaacgagaaactaataacacaggtccgaggaattggagta 12540639  T
Q  409 gaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggaca 508  Q
    || || |||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||| | || |||   || ||||||| | ||| | ||||||||||      
T  12540638 gaagtaggtgcaacagaatggtgtacaaatggtaatggggagagaaagaagttggttggcagagatggcatagagaaggctatgaggagattgatggatg 12540539  T
Q  509 gtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagcta 565  Q
    ||||| |||||||||| || || |||| || ||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  12540538 gtggttatgaagctgaaaatatgagactacgtgcacgagagattggagagaaggcta 12540482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28385684 - 28385109
Alignment:
Q  9 taactcggtggtgtacatatgctttggaagccgatgtcatttttcggataaacaactttatgagattgcgtgcgggattgaagcatcgagtcacgaattc 108  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||  |   ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||  |||||  ||||    
T  28385684 taactcagttgtgtacatatgttttggaagcataaaccatttctctgataaacaactatatgagattgcatgcgcagtagaagcatcaggtcacccattc 28385585  T
Q  109 atatgggttgttcctgaaaagaaacggacggagcatgacaatgaagaggagaaagaaaaatggttgccaaaggggtttgaagagagaattatcggaaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||  ||  |||| |  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  || |||   |    
T  28385584 atatgggttgttcctgagaagaaagggaaagaagatgagatcgaagaagagaaagaaaagtggctgccaaagggatttgaggagagaaacattgga---a 28385488  T
Q  209 agaaggctatgattattaagggttgggctccacaggttatgattctgagccacacagccgtgggtgcatttatgacacattgtgggtggaattccactgt 308  Q
    |||||| | | || || | ||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| || | || ||||| | |||| |||||||||| ||  |||| || | |||    
T  28385487 agaagggtttcataatcaggggttgggccccacaagttctgatattgagcaaccctgcggtggggggatttctgacacattgcggagggaactcaattgt 28385388  T
Q  309 tgaggcagttagtgcaggggttccaatgatcacgtggccgatgcatggagaacaattttacaatgagaagttgataacacaggtgcatgggattggggtg 408  Q
     ||||| ||| | || || ||||||||||| ||||||||    |||| ||| || ||   ||||||||| |||||||||   || |   | ||||| |||    
T  28385387 agaggctgttggcgcgggagttccaatgataacgtggccttgtcatgcagatcacttcagcaatgagaaattgataacaacagtccgaagaattggagtg 28385288  T
Q  409 gaggtcggtgcaacggaatggagcacaactggtattggggaaagagagaaggtggtttggagggataatattgagaaggttgtgaagcgattgatggaca 508  Q
    || || |||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||  | || ||||| || ||||||| | ||| |  ||||||||||     
T  28385287 gaagtaggtgtaacggaatggtgtacaaatggtaatggggagagaaagaagttggtgagcagagataacatagagaaggctatgaggaaattgatggacg 28385188  T
Q  509 gtggtgatgaagctgagaaaatcagacaacatgctcgagagtttggggagaaagctaaacatgcaattaaagaaggtgg 587  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  |||||||||||||    
T  28385187 gtggcgatgaagctgaaaatatgagacaacgtgctcgagagttaggagagaaggctacacgagctgttaaagaaggtgg 28385109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University