View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5746_low_2 (Length: 792)

Name: NF5746_low_2
Description: NF5746
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5746_low_2
NF5746_low_2
[»] chr7 (91 HSPs)
chr7 (299-727)||(15326562-15326997)
chr7 (19-286)||(15326105-15326372)
chr7 (607-742)||(47305130-47305267)
chr7 (604-747)||(28349622-28349766)
chr7 (602-742)||(37144009-37144151)
chr7 (603-737)||(43140697-43140833)
chr7 (607-742)||(8769528-8769665)
chr7 (607-747)||(44486173-44486315)
chr7 (607-738)||(47250796-47250929)
chr7 (607-742)||(22338275-22338413)
chr7 (601-747)||(23472590-23472738)
chr7 (607-742)||(47251143-47251279)
chr7 (601-742)||(473426-473569)
chr7 (625-738)||(47305377-47305492)
chr7 (607-739)||(44485581-44485715)
chr7 (607-738)||(44448162-44448295)
chr7 (603-742)||(21522464-21522603)
chr7 (616-738)||(41758691-41758815)
chr7 (602-747)||(9034556-9034703)
chr7 (599-742)||(8769277-8769422)
chr7 (607-738)||(34568586-34568719)
chr7 (607-742)||(35085986-35086123)
chr7 (632-744)||(36506840-36506954)
chr7 (602-742)||(9230923-9231065)
chr7 (607-747)||(18731022-18731164)
chr7 (607-747)||(31715863-31716004)
chr7 (627-739)||(36507058-36507172)
chr7 (607-739)||(37143767-37143900)
chr7 (627-742)||(2357090-2357207)
chr7 (607-742)||(23472802-23472939)
chr7 (599-738)||(35085734-35085875)
chr7 (617-747)||(47250570-47250702)
chr7 (610-742)||(21522226-21522358)
chr7 (601-742)||(23437149-23437292)
chr7 (599-670)||(43726239-43726310)
chr7 (607-669)||(11679023-11679085)
chr7 (602-742)||(31715631-31715773)
chr7 (607-742)||(10625330-10625467)
chr7 (601-742)||(32706978-32707120)
chr7 (602-742)||(5238449-5238591)
chr7 (607-685)||(22338581-22338659)
chr7 (602-742)||(43726488-43726630)
chr7 (607-742)||(11678706-11678843)
chr7 (627-739)||(24119737-24119851)
chr7 (593-683)||(48704115-48704205)
chr7 (607-738)||(2357305-2357438)
chr7 (603-668)||(40740043-40740108)
chr7 (607-742)||(44447917-44448053)
chr7 (600-742)||(32706728-32706872)
chr7 (616-683)||(28264659-28264726)
chr7 (616-667)||(43704957-43705008)
chr7 (617-671)||(19543503-19543557)
chr7 (604-666)||(39118010-39118072)
chr7 (617-667)||(45457099-45457149)
chr7 (629-670)||(40738218-40738259)
chr7 (644-742)||(9230716-9230816)
chr7 (640-742)||(34568830-34568934)
chr7 (605-697)||(38676059-38676151)
chr7 (617-665)||(42287324-42287372)
chr7 (616-667)||(8090833-8090884)
chr7 (597-723)||(8417264-8417393)
chr7 (699-742)||(10625180-10625223)
chr7 (627-690)||(28263519-28263582)
chr7 (616-667)||(29771033-29771084)
chr7 (616-667)||(29771565-29771616)
chr7 (612-667)||(41691933-41691988)
chr7 (616-667)||(41911288-41911338)
chr7 (616-667)||(48095357-48095408)
chr7 (617-667)||(3217749-3217799)
chr7 (617-667)||(5870278-5870328)
chr7 (617-667)||(7776952-7777002)
chr7 (617-667)||(17489530-17489580)
chr7 (617-667)||(17563634-17563684)
chr7 (617-667)||(18458770-18458820)
chr7 (617-667)||(20493758-20493808)
chr7 (617-667)||(24733642-24733692)
chr7 (617-667)||(27284255-27284305)
chr7 (617-667)||(27284604-27284654)
chr7 (617-667)||(31852077-31852127)
chr7 (617-667)||(37374452-37374502)
chr7 (617-667)||(39143506-39143556)
chr7 (617-667)||(40852155-40852205)
chr7 (617-667)||(42287807-42287857)
chr7 (617-667)||(44332518-44332568)
chr7 (617-667)||(44333012-44333062)
chr7 (617-667)||(45456747-45456797)
chr7 (617-667)||(45995280-45995330)
chr7 (617-667)||(47987340-47987390)
chr7 (605-690)||(4156553-4156638)
chr7 (622-667)||(29414133-29414178)
chr7 (611-727)||(43050391-43050510)
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (600-742)||(44915736-44915879)
chr2 (602-742)||(5720140-5720282)
chr2 (603-747)||(41659977-41660123)
chr2 (607-742)||(41659748-41659885)
chr2 (602-747)||(35408762-35408909)
chr2 (607-742)||(27246229-27246366)
chr2 (604-739)||(27913894-27914031)
chr2 (600-747)||(34820520-34820669)
chr2 (602-739)||(27132509-27132648)
chr2 (607-742)||(27914139-27914276)
chr2 (603-747)||(32503778-32503924)
chr2 (602-742)||(43183829-43183971)
chr2 (633-741)||(44915986-44916096)
chr2 (607-742)||(13354180-13354317)
chr2 (607-742)||(25642514-25642651)
chr2 (607-744)||(4104162-4104301)
chr2 (606-738)||(16350079-16350213)
chr2 (602-738)||(12304404-12304542)
chr2 (602-742)||(16655852-16655994)
chr2 (602-742)||(39454449-39454591)
chr2 (607-742)||(27883471-27883608)
chr2 (607-742)||(41377358-41377494)
chr2 (607-738)||(39912630-39912764)
chr2 (607-747)||(4104400-4104542)
chr2 (607-747)||(37412819-37412961)
chr2 (598-742)||(37744634-37744780)
chr2 (640-747)||(27883698-27883807)
chr2 (607-742)||(31450669-31450806)
chr2 (602-747)||(18565064-18565211)
chr2 (607-742)||(20908514-20908651)
chr2 (615-738)||(12304035-12304160)
chr2 (622-742)||(17856217-17856339)
chr2 (603-742)||(34820278-34820419)
chr2 (627-742)||(40694421-40694538)
chr2 (615-742)||(43183594-43183723)
chr2 (603-691)||(1580140-1580228)
chr2 (608-742)||(16655610-16655746)
chr2 (609-738)||(25642273-25642404)
chr2 (608-742)||(34127570-34127706)
chr2 (605-747)||(38275478-38275622)
chr2 (601-742)||(13354423-13354566)
chr2 (607-739)||(12303788-12303922)
chr2 (607-739)||(20908760-20908894)
chr2 (607-738)||(4120767-4120900)
chr2 (600-739)||(21470291-21470432)
chr2 (615-742)||(21470541-21470669)
chr2 (607-738)||(27132760-27132893)
chr2 (607-742)||(28203106-28203243)
chr2 (615-742)||(28631285-28631414)
chr2 (603-742)||(28631520-28631661)
chr2 (602-741)||(32933589-32933730)
chr2 (607-742)||(32933837-32933974)
chr2 (599-742)||(39912872-39913019)
chr2 (607-742)||(41377600-41377737)
chr2 (602-741)||(14877481-14877620)
chr2 (640-742)||(44612729-44612833)
chr2 (604-741)||(4121010-4121149)
chr2 (602-747)||(5921627-5921774)
chr2 (603-670)||(34484234-34484301)
chr2 (607-739)||(16261119-16261253)
chr2 (607-747)||(27476608-27476750)
chr2 (602-742)||(39150071-39150213)
chr2 (628-697)||(1580030-1580098)
chr2 (607-742)||(16736104-16736241)
chr2 (607-738)||(33819646-33819777)
chr2 (607-742)||(34127811-34127947)
chr2 (607-742)||(38275701-38275840)
chr2 (606-742)||(27476368-27476507)
chr2 (602-692)||(17856487-17856577)
chr2 (607-673)||(36442451-36442517)
chr2 (607-669)||(37412596-37412658)
chr2 (607-738)||(5961672-5961805)
chr2 (631-738)||(15829747-15829856)
chr2 (604-692)||(16350369-16350457)
chr2 (612-742)||(39149852-39149984)
chr2 (601-738)||(36442130-36442269)
chr2 (598-669)||(44610856-44610926)
chr2 (602-738)||(45389129-45389267)
chr2 (617-667)||(2804970-2805020)
chr2 (617-742)||(3603517-3603645)
chr2 (617-667)||(13479427-13479477)
chr2 (617-667)||(15044752-15044802)
chr2 (607-669)||(18565324-18565386)
chr2 (617-667)||(26424819-26424869)
chr2 (607-669)||(28202863-28202925)
chr2 (617-667)||(31557104-31557154)
chr2 (617-667)||(33200041-33200091)
chr2 (617-667)||(34618517-34618567)
chr2 (607-669)||(36211720-36211782)
chr2 (617-667)||(38807180-38807230)
chr2 (600-738)||(33819393-33819532)
chr2 (627-667)||(13479106-13479146)
chr2 (607-683)||(23992213-23992289)
chr2 (627-667)||(25334604-25334644)
chr2 (616-667)||(2822316-2822367)
chr2 (616-667)||(2822676-2822727)
chr2 (616-667)||(15136871-15136922)
chr2 (616-667)||(33200520-33200571)
chr2 (615-670)||(37744460-37744515)
chr2 (617-667)||(677915-677965)
chr2 (617-667)||(2970812-2970862)
chr2 (617-667)||(4602812-4602862)
chr2 (615-669)||(16260882-16260936)
chr2 (617-667)||(16712450-16712500)
chr2 (617-667)||(17978094-17978144)
chr2 (617-667)||(32194824-32194874)
chr2 (596-673)||(8174266-8174343)
chr2 (614-667)||(31557549-31557602)
chr2 (617-666)||(32194455-32194504)
chr2 (622-667)||(39109498-39109543)
chr2 (596-665)||(40694187-40694256)
[»] chr3 (122 HSPs)
chr3 (602-747)||(5348577-5348724)
chr3 (603-747)||(40639116-40639262)
chr3 (601-742)||(47891759-47891902)
chr3 (603-742)||(2078718-2078859)
chr3 (607-742)||(40969258-40969395)
chr3 (602-742)||(40969500-40969642)
chr3 (600-742)||(40639363-40639507)
chr3 (607-727)||(51883862-51883984)
chr3 (600-742)||(51885610-51885754)
chr3 (600-742)||(41208397-41208541)
chr3 (627-742)||(53678679-53678796)
chr3 (607-742)||(5348814-5348951)
chr3 (603-742)||(37133276-37133417)
chr3 (607-747)||(10756949-10757091)
chr3 (598-742)||(34629976-34630122)
chr3 (616-738)||(53678445-53678569)
chr3 (602-742)||(12123325-12123467)
chr3 (603-742)||(21918496-21918636)
chr3 (602-742)||(31514109-31514250)
chr3 (601-740)||(37133463-37133604)
chr3 (601-742)||(46766619-46766763)
chr3 (607-742)||(45171313-45171450)
chr3 (607-742)||(52268350-52268486)
chr3 (602-738)||(46766863-46767002)
chr3 (602-739)||(41208649-41208788)
chr3 (598-742)||(40410706-40410852)
chr3 (622-742)||(47891531-47891653)
chr3 (607-739)||(54107672-54107806)
chr3 (615-742)||(7937809-7937938)
chr3 (604-747)||(54081284-54081428)
chr3 (607-742)||(33773036-33773174)
chr3 (602-747)||(34521264-34521411)
chr3 (602-742)||(4846842-4846984)
chr3 (606-742)||(21169668-21169806)
chr3 (607-739)||(26332322-26332456)
chr3 (602-742)||(40926009-40926151)
chr3 (632-742)||(2078511-2078623)
chr3 (616-747)||(7743006-7743139)
chr3 (607-742)||(19124192-19124329)
chr3 (615-742)||(41997830-41997959)
chr3 (608-743)||(7274888-7275024)
chr3 (605-669)||(17274097-17274161)
chr3 (601-742)||(15862421-15862564)
chr3 (608-737)||(22354946-22355077)
chr3 (600-737)||(28691364-28691503)
chr3 (598-727)||(35580210-35580341)
chr3 (601-688)||(51311820-51311907)
chr3 (617-742)||(52606141-52606268)
chr3 (607-747)||(19124413-19124554)
chr3 (615-747)||(28688231-28688365)
chr3 (606-742)||(29248554-29248692)
chr3 (606-742)||(34521503-34521641)
chr3 (602-742)||(35753677-35753819)
chr3 (602-742)||(45171066-45171208)
chr3 (607-742)||(10756721-10756858)
chr3 (607-742)||(44069369-44069506)
chr3 (602-742)||(9028189-9028331)
chr3 (601-742)||(43899320-43899463)
chr3 (607-739)||(44069126-44069260)
chr3 (609-742)||(53841272-53841407)
chr3 (602-742)||(2829654-2829795)
chr3 (607-747)||(8846317-8846459)
chr3 (602-738)||(12123088-12123226)
chr3 (601-739)||(26332567-26332711)
chr3 (615-739)||(27940283-27940409)
chr3 (600-670)||(41998134-41998204)
chr3 (627-738)||(27254007-27254120)
chr3 (615-742)||(29248330-29248459)
chr3 (607-742)||(40926257-40926393)
chr3 (598-739)||(54108369-54108512)
chr3 (617-667)||(13355188-13355238)
chr3 (607-669)||(45871700-45871762)
chr3 (615-747)||(45871930-45872064)
chr3 (607-669)||(54081605-54081667)
chr3 (605-739)||(2829408-2829545)
chr3 (607-742)||(7950278-7950415)
chr3 (607-742)||(8846079-8846216)
chr3 (601-670)||(14353043-14353112)
chr3 (607-738)||(14353298-14353430)
chr3 (631-742)||(28688017-28688130)
chr3 (607-738)||(31513866-31513999)
chr3 (600-669)||(38911539-38911608)
chr3 (607-692)||(54247275-54247359)
chr3 (627-738)||(588400-588514)
chr3 (607-683)||(13866971-13867047)
chr3 (640-742)||(17102623-17102727)
chr3 (607-683)||(49529127-49529203)
chr3 (622-739)||(15862200-15862319)
chr3 (616-667)||(31049073-31049124)
chr3 (603-670)||(33812723-33812790)
chr3 (607-724)||(43899114-43899233)
chr3 (617-667)||(966993-967043)
chr3 (617-667)||(6098976-6099026)
chr3 (617-667)||(13355722-13355772)
chr3 (627-744)||(33772013-33772133)
chr3 (622-667)||(32309600-32309645)
chr3 (607-656)||(43844433-43844482)
chr3 (608-669)||(49222040-49222101)
chr3 (705-742)||(51311693-51311730)
chr3 (627-667)||(967474-967514)
chr3 (599-667)||(27801484-27801552)
chr3 (602-661)||(588251-588310)
chr3 (607-670)||(7274656-7274719)
chr3 (699-742)||(17273874-17273917)
chr3 (616-683)||(20963596-20963663)
chr3 (607-670)||(44316630-44316693)
chr3 (627-669)||(7937666-7937708)
chr3 (617-667)||(12739891-12739941)
chr3 (617-667)||(12739977-12740027)
chr3 (617-667)||(24242992-24243042)
chr3 (617-667)||(27990267-27990317)
chr3 (617-667)||(32309147-32309197)
chr3 (617-667)||(39198430-39198480)
chr3 (617-667)||(40503727-40503777)
chr3 (617-667)||(45940228-45940278)
chr3 (617-667)||(45940675-45940725)
chr3 (617-667)||(47872529-47872579)
chr3 (617-667)||(50530630-50530680)
chr3 (617-667)||(50531103-50531153)
chr3 (615-669)||(52609683-52609737)
chr3 (618-667)||(5408389-5408438)
chr3 (705-742)||(7742878-7742915)
[»] chr8 (96 HSPs)
chr8 (600-742)||(12873294-12873436)
chr8 (607-747)||(33542387-33542529)
chr8 (602-742)||(37393475-37393617)
chr8 (617-747)||(12873070-12873202)
chr8 (604-747)||(35486104-35486249)
chr8 (632-738)||(410397-410505)
chr8 (600-739)||(30650186-30650327)
chr8 (600-742)||(24456898-24457042)
chr8 (604-742)||(39240265-39240405)
chr8 (603-747)||(40094473-40094620)
chr8 (607-742)||(9495269-9495406)
chr8 (615-742)||(31230624-31230753)
chr8 (604-742)||(23244515-23244655)
chr8 (591-747)||(3869190-3869348)
chr8 (607-742)||(8653939-8654076)
chr8 (603-739)||(39912168-39912306)
chr8 (607-742)||(1826037-1826174)
chr8 (607-742)||(1860482-1860619)
chr8 (603-742)||(8654182-8654323)
chr8 (595-742)||(18017781-18017930)
chr8 (615-742)||(21515446-21515575)
chr8 (607-742)||(37393723-37393860)
chr8 (604-742)||(26736125-26736265)
chr8 (596-742)||(35224013-35224161)
chr8 (601-742)||(11198451-11198594)
chr8 (609-742)||(14920657-14920792)
chr8 (601-742)||(23244761-23244904)
chr8 (607-747)||(18914492-18914634)
chr8 (607-739)||(30568525-30568659)
chr8 (607-742)||(18018032-18018169)
chr8 (600-742)||(28206999-28207143)
chr8 (627-738)||(33542634-33542747)
chr8 (607-742)||(40040165-40040302)
chr8 (615-742)||(40094721-40094850)
chr8 (602-747)||(5416810-5416957)
chr8 (615-742)||(5417059-5417188)
chr8 (597-737)||(11639045-11639187)
chr8 (607-742)||(28206769-28206906)
chr8 (627-742)||(410608-410725)
chr8 (627-738)||(18621997-18622110)
chr8 (615-742)||(31230859-31230988)
chr8 (627-738)||(44254888-44255001)
chr8 (609-747)||(14920416-14920556)
chr8 (601-742)||(758590-758733)
chr8 (607-747)||(26217073-26217214)
chr8 (607-742)||(119120-119256)
chr8 (603-742)||(758343-758484)
chr8 (607-738)||(39240033-39240166)
chr8 (615-742)||(5525882-5526009)
chr8 (601-747)||(29027213-29027357)
chr8 (607-669)||(24456737-24456799)
chr8 (598-738)||(44255112-44255254)
chr8 (602-742)||(6843493-6843637)
chr8 (602-738)||(30872781-30872919)
chr8 (599-742)||(35485866-35486011)
chr8 (606-670)||(36344281-36344345)
chr8 (616-667)||(43633135-43633186)
chr8 (602-742)||(7041875-7042012)
chr8 (617-667)||(14897391-14897441)
chr8 (615-747)||(39911928-39912062)
chr8 (607-669)||(44678534-44678595)
chr8 (627-742)||(26736371-26736488)
chr8 (622-667)||(33098605-33098650)
chr8 (607-692)||(44678320-44678405)
chr8 (699-747)||(11639291-11639339)
chr8 (595-683)||(15740604-15740692)
chr8 (641-738)||(18914296-18914396)
chr8 (602-670)||(21512411-21512478)
chr8 (627-667)||(36032488-36032528)
chr8 (699-747)||(36344058-36344106)
chr8 (616-667)||(3444115-3444166)
chr8 (678-747)||(9495106-9495177)
chr8 (616-667)||(31988526-31988577)
chr8 (616-667)||(40229102-40229153)
chr8 (617-667)||(761406-761456)
chr8 (617-667)||(2221607-2221657)
chr8 (617-667)||(2221961-2222011)
chr8 (623-669)||(7041648-7041694)
chr8 (617-667)||(7116485-7116535)
chr8 (617-667)||(9739780-9739830)
chr8 (617-667)||(11713213-11713263)
chr8 (617-667)||(13089451-13089501)
chr8 (607-669)||(16645869-16645931)
chr8 (617-667)||(22013475-22013525)
chr8 (617-667)||(26060119-26060169)
chr8 (617-667)||(27786480-27786530)
chr8 (617-667)||(31445682-31445732)
chr8 (617-667)||(31988895-31988945)
chr8 (617-667)||(36142560-36142610)
chr8 (617-667)||(37035403-37035453)
chr8 (617-667)||(41154630-41154680)
chr8 (617-667)||(41155009-41155059)
chr8 (617-667)||(42193792-42193842)
chr8 (617-667)||(43086401-43086451)
chr8 (617-667)||(45123233-45123283)
chr8 (617-667)||(45123610-45123660)
[»] chr1 (136 HSPs)
chr1 (602-742)||(4550846-4550988)
chr1 (601-742)||(20260625-20260768)
chr1 (608-747)||(40703106-40703247)
chr1 (607-747)||(24590466-24590608)
chr1 (607-742)||(27209395-27209532)
chr1 (602-738)||(32564200-32564337)
chr1 (603-742)||(34621881-34622022)
chr1 (603-747)||(29256831-29256977)
chr1 (606-742)||(40533927-40534065)
chr1 (597-742)||(27209162-27209309)
chr1 (603-742)||(34621620-34621761)
chr1 (602-742)||(9881550-9881691)
chr1 (600-747)||(23281251-23281400)
chr1 (604-742)||(6181616-6181756)
chr1 (600-742)||(37199167-37199311)
chr1 (600-742)||(33753221-33753365)
chr1 (600-742)||(45305656-45305799)
chr1 (607-747)||(11787743-11787885)
chr1 (602-738)||(13944509-13944647)
chr1 (602-742)||(16267936-16268077)
chr1 (607-739)||(28970422-28970556)
chr1 (603-723)||(36884721-36884843)
chr1 (607-742)||(10923609-10923746)
chr1 (607-742)||(16267718-16267855)
chr1 (600-739)||(25088012-25088153)
chr1 (607-738)||(51691877-51692010)
chr1 (608-739)||(51810141-51810274)
chr1 (604-742)||(1831910-1832050)
chr1 (607-742)||(3569379-3569517)
chr1 (600-742)||(14118526-14118670)
chr1 (607-742)||(51692117-51692253)
chr1 (605-742)||(10654275-10654414)
chr1 (601-742)||(30293010-30293153)
chr1 (615-747)||(18793702-18793836)
chr1 (615-738)||(5463368-5463493)
chr1 (607-742)||(33753462-33753598)
chr1 (608-747)||(36657742-36657883)
chr1 (607-742)||(37198935-37199072)
chr1 (601-739)||(48702130-48702269)
chr1 (623-742)||(49291012-49291133)
chr1 (603-742)||(50574763-50574904)
chr1 (600-742)||(4045095-4045239)
chr1 (604-742)||(42607522-42607662)
chr1 (604-738)||(50118347-50118483)
chr1 (601-742)||(21385182-21385325)
chr1 (602-742)||(10654028-10654169)
chr1 (602-742)||(34028719-34028861)
chr1 (615-747)||(52412839-52412973)
chr1 (602-741)||(6181863-6182004)
chr1 (604-669)||(19886235-19886300)
chr1 (625-740)||(21384958-21385074)
chr1 (607-742)||(35986235-35986372)
chr1 (615-742)||(52412609-52412738)
chr1 (604-738)||(30293263-30293398)
chr1 (602-739)||(44222190-44222329)
chr1 (607-741)||(4054551-4054688)
chr1 (607-669)||(5117996-5118058)
chr1 (607-747)||(11787982-11788123)
chr1 (602-738)||(19986372-19986510)
chr1 (598-742)||(29257069-29257215)
chr1 (602-742)||(34028967-34029109)
chr1 (607-742)||(13944757-13944894)
chr1 (607-738)||(22584602-22584735)
chr1 (602-742)||(25088262-25088403)
chr1 (627-692)||(40534223-40534288)
chr1 (607-742)||(14775981-14776118)
chr1 (604-742)||(24655586-24655726)
chr1 (607-741)||(46949759-46949895)
chr1 (605-747)||(49291224-49291368)
chr1 (602-747)||(9119290-9119437)
chr1 (603-747)||(32517754-32517898)
chr1 (607-738)||(40702871-40703001)
chr1 (641-742)||(46949982-46950085)
chr1 (607-742)||(10923365-10923503)
chr1 (607-747)||(11394901-11395043)
chr1 (610-742)||(22584357-22584491)
chr1 (615-669)||(24590237-24590291)
chr1 (607-739)||(32563962-32564096)
chr1 (607-742)||(34279243-34279380)
chr1 (607-727)||(34279502-34279624)
chr1 (617-667)||(35122275-35122325)
chr1 (607-739)||(46738973-46739106)
chr1 (603-692)||(19885981-19886070)
chr1 (627-692)||(20260451-20260516)
chr1 (627-742)||(21036008-21036125)
chr1 (607-742)||(36657503-36657641)
chr1 (601-727)||(1831661-1831789)
chr1 (627-671)||(6241276-6241320)
chr1 (607-683)||(11797149-11797225)
chr1 (600-669)||(18794012-18794083)
chr1 (601-669)||(24655907-24655975)
chr1 (676-742)||(30792686-30792754)
chr1 (607-742)||(45305412-45305550)
chr1 (617-727)||(50574527-50574639)
chr1 (627-670)||(6242689-6242732)
chr1 (616-667)||(52179366-52179417)
chr1 (617-667)||(6714698-6714748)
chr1 (602-742)||(30611218-30611360)
chr1 (617-667)||(32193530-32193580)
chr1 (617-667)||(34023569-34023619)
chr1 (601-683)||(36077268-36077350)
chr1 (617-667)||(39851187-39851237)
chr1 (617-667)||(46448736-46448786)
chr1 (607-747)||(50921063-50921205)
chr1 (601-669)||(28112718-28112786)
chr1 (616-667)||(7334455-7334506)
chr1 (616-663)||(33784314-33784361)
chr1 (616-667)||(49548134-49548185)
chr1 (617-667)||(3798337-3798387)
chr1 (617-667)||(3798705-3798755)
chr1 (607-669)||(4045420-4045482)
chr1 (622-668)||(6327959-6328005)
chr1 (617-667)||(6714215-6714265)
chr1 (617-667)||(14244555-14244605)
chr1 (597-667)||(23598065-23598135)
chr1 (617-667)||(24332309-24332359)
chr1 (617-667)||(24370128-24370178)
chr1 (607-669)||(30611542-30611604)
chr1 (617-667)||(31488038-31488088)
chr1 (623-669)||(32517624-32517670)
chr1 (617-667)||(33784616-33784666)
chr1 (617-667)||(35368869-35368919)
chr1 (617-667)||(36967247-36967297)
chr1 (617-667)||(37483067-37483117)
chr1 (617-667)||(37483538-37483588)
chr1 (617-667)||(38980049-38980099)
chr1 (617-667)||(39851536-39851586)
chr1 (617-667)||(44114513-44114563)
chr1 (617-667)||(45678725-45678775)
chr1 (625-667)||(45679252-45679294)
chr1 (617-667)||(46448230-46448280)
chr1 (617-667)||(50138508-50138558)
chr1 (617-667)||(50227909-50227959)
chr1 (615-669)||(50921412-50921466)
chr1 (617-655)||(51902271-51902309)
chr1 (602-667)||(5537191-5537256)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (627-742)||(2315602-2315719)
chr6 (607-747)||(24548244-24548386)
chr6 (616-747)||(24548482-24548615)
chr6 (607-742)||(6220302-6220439)
chr6 (607-742)||(12903224-12903361)
chr6 (599-742)||(6220051-6220196)
chr6 (603-742)||(25551582-25551723)
chr6 (603-742)||(24604874-24605014)
chr6 (627-739)||(2814560-2814674)
chr6 (602-742)||(3338475-3338617)
chr6 (603-742)||(31029523-31029664)
chr6 (607-692)||(32283029-32283114)
chr6 (596-742)||(1158837-1158983)
chr6 (607-742)||(3289156-3289293)
chr6 (607-692)||(11524708-11524793)
chr6 (598-742)||(11525012-11525157)
chr6 (607-742)||(29009957-29010094)
chr6 (623-742)||(33346497-33346618)
chr6 (603-738)||(33544821-33544958)
chr6 (600-742)||(33545068-33545212)
chr6 (607-747)||(14337143-14337284)
chr6 (607-739)||(25551350-25551484)
chr6 (615-747)||(1158599-1158735)
chr6 (607-742)||(9173904-9174041)
chr6 (607-742)||(14336905-14337042)
chr6 (600-742)||(2949292-2949431)
chr6 (649-743)||(33972451-33972547)
chr6 (617-738)||(11524778-11524901)
chr6 (607-742)||(3288933-3289070)
chr6 (616-739)||(7537854-7537979)
chr6 (676-742)||(29999485-29999553)
chr6 (627-692)||(29999701-29999766)
chr6 (607-742)||(33329209-33329346)
chr6 (623-742)||(35119057-35119178)
chr6 (598-690)||(17544448-17544539)
chr6 (602-739)||(17544702-17544840)
chr6 (601-742)||(19135692-19135835)
chr6 (607-670)||(33548177-33548240)
chr6 (617-670)||(29467277-29467330)
chr6 (607-742)||(35132604-35132741)
chr6 (616-667)||(3618793-3618844)
chr6 (699-742)||(13156085-13156128)
chr6 (699-742)||(13160941-13160984)
chr6 (607-669)||(3338796-3338858)
chr6 (639-697)||(7162398-7162456)
chr6 (622-667)||(22498402-22498447)
chr6 (607-683)||(17245631-17245707)
chr6 (627-690)||(17971819-17971882)
chr6 (607-669)||(13155842-13155904)
chr6 (607-669)||(13160698-13160760)
chr6 (617-667)||(14527512-14527562)
chr6 (617-667)||(17383748-17383798)
chr6 (617-667)||(18683563-18683613)
chr6 (617-667)||(21271499-21271549)
chr6 (617-667)||(21272114-21272164)
chr6 (617-667)||(22498762-22498812)
chr6 (615-669)||(24605194-24605248)
chr6 (617-667)||(26392840-26392890)
chr6 (617-667)||(31739910-31739960)
chr6 (607-656)||(6229720-6229769)
chr6 (616-661)||(14673684-14673729)
chr6 (617-670)||(29465768-29465821)
chr6 (602-667)||(32993402-32993467)
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (607-742)||(9657670-9657807)
chr4 (607-742)||(9657893-9658030)
chr4 (601-738)||(11102224-11102364)
chr4 (604-742)||(1157452-1157592)
chr4 (603-742)||(22831043-22831185)
chr4 (607-738)||(44169982-44170116)
chr4 (607-747)||(29864416-29864558)
chr4 (604-742)||(45911579-45911719)
chr4 (601-742)||(25058830-25058973)
chr4 (600-739)||(38866394-38866535)
chr4 (604-738)||(2738880-2739016)
chr4 (608-742)||(33882195-33882331)
chr4 (596-742)||(43316872-43317019)
chr4 (607-747)||(45911815-45911957)
chr4 (602-742)||(52914950-52915092)
chr4 (604-742)||(25977768-25977909)
chr4 (607-742)||(27347600-27347737)
chr4 (607-742)||(44170225-44170364)
chr4 (603-742)||(15985465-15985607)
chr4 (607-739)||(9010754-9010888)
chr4 (607-742)||(40067594-40067731)
chr4 (607-742)||(21218093-21218230)
chr4 (609-738)||(22830801-22830933)
chr4 (603-742)||(24504186-24504327)
chr4 (615-742)||(33626110-33626239)
chr4 (616-747)||(53645463-53645596)
chr4 (600-742)||(46620923-46621067)
chr4 (616-742)||(52915189-52915317)
chr4 (622-742)||(4965889-4966011)
chr4 (627-747)||(25218325-25218447)
chr4 (627-747)||(27347838-27347960)
chr4 (606-742)||(29970195-29970332)
chr4 (603-669)||(37515774-37515840)
chr4 (602-742)||(43317125-43317267)
chr4 (607-742)||(21217850-21217987)
chr4 (597-747)||(24503932-24504085)
chr4 (607-742)||(25593337-25593474)
chr4 (607-742)||(32384656-32384793)
chr4 (607-738)||(34958835-34958967)
chr4 (607-742)||(40067351-40067488)
chr4 (603-742)||(46621173-46621314)
chr4 (615-738)||(48209959-48210084)
chr4 (607-742)||(8246772-8246907)
chr4 (604-742)||(25218084-25218224)
chr4 (608-742)||(33625868-33626004)
chr4 (607-739)||(54136340-54136470)
chr4 (604-683)||(1157203-1157282)
chr4 (608-741)||(44432871-44433006)
chr4 (607-742)||(46535526-46535662)
chr4 (603-742)||(4793845-4793985)
chr4 (607-742)||(44710406-44710543)
chr4 (607-738)||(54136094-54136227)
chr4 (605-742)||(8246992-8247131)
chr4 (602-739)||(9010503-9010642)
chr4 (607-742)||(18862686-18862824)
chr4 (602-738)||(32385062-32385199)
chr4 (627-739)||(45683140-45683254)
chr4 (607-727)||(46200487-46200609)
chr4 (607-742)||(46200731-46200868)
chr4 (607-742)||(1205623-1205760)
chr4 (607-738)||(29864179-29864312)
chr4 (607-742)||(45683363-45683500)
chr4 (605-669)||(1205379-1205443)
chr4 (609-747)||(12381295-12381435)
chr4 (603-683)||(23756171-23756251)
chr4 (699-747)||(42779617-42779665)
chr4 (601-742)||(4966114-4966257)
chr4 (607-747)||(8751290-8751432)
chr4 (602-742)||(10014710-10014851)
chr4 (602-742)||(10021851-10021992)
chr4 (617-667)||(20614128-20614178)
chr4 (607-669)||(54191905-54191967)
chr4 (617-667)||(56270557-56270607)
chr4 (607-668)||(10014468-10014529)
chr4 (607-668)||(10021609-10021670)
chr4 (603-738)||(34959081-34959218)
chr4 (604-669)||(38866721-38866786)
chr4 (616-661)||(46579789-46579834)
chr4 (623-667)||(42369146-42369190)
chr4 (699-742)||(44428668-44428711)
chr4 (617-667)||(1098066-1098116)
chr4 (617-667)||(3503483-3503533)
chr4 (617-667)||(17475410-17475460)
chr4 (617-667)||(17475878-17475928)
chr4 (617-667)||(20614611-20614661)
chr4 (617-667)||(22307452-22307502)
chr4 (617-667)||(25618449-25618499)
chr4 (617-667)||(31487991-31488041)
chr4 (603-645)||(33091862-33091904)
chr4 (617-667)||(34237494-34237544)
chr4 (617-667)||(41610140-41610190)
chr4 (617-667)||(42369504-42369554)
chr4 (617-667)||(44303528-44303578)
chr4 (617-667)||(46058708-46058758)
chr4 (617-667)||(46059119-46059169)
chr4 (607-669)||(46535843-46535905)
chr4 (597-667)||(47602936-47603006)
chr4 (617-667)||(48091970-48092020)
chr4 (617-667)||(48453646-48453696)
chr4 (617-667)||(56271211-56271261)
chr4 (602-667)||(24898187-24898252)
chr4 (616-657)||(42855736-42855777)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (600-742)||(12593702-12593846)
chr5 (600-738)||(15476509-15476648)
chr5 (605-742)||(41372404-41372543)
chr5 (607-742)||(334299-334436)
chr5 (607-742)||(5152861-5152998)
chr5 (602-739)||(5152614-5152753)
chr5 (602-742)||(7399075-7399217)
chr5 (607-747)||(42710591-42710733)
chr5 (608-742)||(5087811-5087947)
chr5 (607-742)||(36751905-36752042)
chr5 (608-742)||(12694932-12695068)
chr5 (629-742)||(25923365-25923480)
chr5 (607-742)||(28392015-28392153)
chr5 (606-742)||(5624381-5624519)
chr5 (598-742)||(10656088-10656234)
chr5 (603-747)||(15670392-15670538)
chr5 (607-742)||(9692922-9693058)
chr5 (600-738)||(38416139-38416279)
chr5 (593-747)||(40589295-40589451)
chr5 (593-747)||(40589898-40590054)
chr5 (604-713)||(15476266-15476377)
chr5 (605-742)||(25923119-25923258)
chr5 (603-739)||(19205192-19205330)
chr5 (602-742)||(33699273-33699415)
chr5 (646-742)||(39706093-39706191)
chr5 (607-742)||(3878484-3878621)
chr5 (607-742)||(10656340-10656477)
chr5 (608-747)||(39706292-39706433)
chr5 (608-742)||(15267486-15267622)
chr5 (607-742)||(31908931-31909070)
chr5 (616-736)||(7399330-7399452)
chr5 (602-742)||(16353400-16353542)
chr5 (627-742)||(7210691-7210808)
chr5 (607-692)||(14143803-14143888)
chr5 (607-742)||(38416380-38416517)
chr5 (604-664)||(5460272-5460332)
chr5 (600-742)||(18514284-18514428)
chr5 (601-739)||(35263491-35263631)
chr5 (602-669)||(5088449-5088516)
chr5 (610-669)||(26289341-26289400)
chr5 (607-738)||(29023940-29024070)
chr5 (607-669)||(5460191-5460253)
chr5 (607-669)||(8418505-8418567)
chr5 (617-667)||(25333183-25333233)
chr5 (601-670)||(15267239-15267307)
chr5 (607-742)||(17861042-17861178)
chr5 (601-670)||(19204941-19205010)
chr5 (603-738)||(31909180-31909317)
chr5 (600-742)||(14051885-14052029)
chr5 (611-683)||(26289027-26289099)
chr5 (609-742)||(7210461-7210596)
chr5 (609-738)||(8418206-8418336)
chr5 (607-670)||(43570091-43570154)
chr5 (607-739)||(14143515-14143645)
chr5 (599-669)||(21750805-21750875)
chr5 (615-739)||(40774349-40774474)
chr5 (607-669)||(42710353-42710415)
chr5 (607-692)||(3879310-3879395)
chr5 (622-667)||(6157154-6157199)
chr5 (617-666)||(11079141-11079190)
chr5 (617-690)||(17736547-17736620)
chr5 (616-669)||(31656370-31656423)
chr5 (607-742)||(32272086-32272223)
chr5 (607-742)||(33763154-33763290)
chr5 (599-727)||(37966809-37966940)
chr5 (616-667)||(3722080-3722131)
chr5 (616-667)||(17339807-17339858)
chr5 (616-667)||(25567375-25567426)
chr5 (699-738)||(33763002-33763041)
chr5 (604-671)||(33957375-33957442)
chr5 (699-742)||(35263740-35263783)
chr5 (617-667)||(435567-435617)
chr5 (617-667)||(4959574-4959624)
chr5 (617-667)||(4960098-4960148)
chr5 (601-667)||(11315956-11316021)
chr5 (617-667)||(16670023-16670073)
chr5 (700-742)||(19205041-19205083)
chr5 (617-667)||(24100695-24100745)
chr5 (617-667)||(26888598-26888648)
chr5 (617-667)||(27098553-27098603)
chr5 (617-667)||(27851038-27851088)
chr5 (617-667)||(29961823-29961873)
chr5 (617-667)||(29962176-29962226)
chr5 (617-667)||(30012572-30012622)
chr5 (617-667)||(30112705-30112755)
chr5 (617-667)||(38312338-38312388)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (607-742)||(93191-93330)
scaffold0022 (627-670)||(93534-93577)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (607-742)||(11733-11870)
scaffold0168 (601-747)||(11485-11633)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (598-742)||(4564-4710)
scaffold0809 (603-742)||(4337-4478)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (607-747)||(40593-40735)
scaffold0051 (602-742)||(40350-40492)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (607-742)||(11460-11597)
scaffold0236 (622-742)||(11231-11353)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (610-737)||(90811-90940)
scaffold0016 (653-737)||(91759-91845)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (604-744)||(13785-13927)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (607-742)||(45082-45219)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (603-683)||(10927-11007)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (604-742)||(65739-65879)
scaffold0045 (604-742)||(73071-73211)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (597-667)||(57015-57085)
scaffold0054 (617-667)||(57553-57603)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (617-666)||(300092-300141)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (623-667)||(241681-241725)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (699-742)||(11765-11808)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (627-670)||(6228-6271)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (616-667)||(230884-230935)
scaffold0014 (617-667)||(231253-231303)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (617-667)||(83026-83076)
scaffold0006 (617-667)||(83381-83431)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (617-667)||(1488-1538)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (617-667)||(283169-283219)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 299 - 727
Target Start/End: Original strand, 15326562 - 15326997
Alignment:
Q  299 ttaatgaaagaaacatatttttcaattagcaaaatatattaattagagtaaaaaatgtactcc----cattattaccacattatgccattcataataaag 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326562 ttaatgaaagaaacatatttttcaattagaaaaatatattaattagagtaaaaaatgtattccaacccattattaccacattatgccattcataataaag 15326661  T
Q  395 acaa-cttattgaattgtaataccaataaaaataatttaagatctgattcaacccaataccttcaaaataaaccacctccaagaaacattttaatacgac 493  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326662 acaaacctattgaattgtaacaccaataaaaataatttaagatctgattcaaccctataccttcaaaataaaccacctccaagaaacattttaatacgac 15326761  T
Q  494 aagtatatagttgtgttacaatccatcaccttcccttaaacaattatattttggagtagccaaacagttgaaaggtgatgcatattttaaaatattttaa 593  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15326762 aagtatatagttgtgttacaatccgtcaccttcccttaaacaattatattttggagtagccaaacagttgaaaggtgatgcatattttaaaatattttta 15326861  T
Q  594 gaataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-- 691  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||      
T  15326862 gaataatttaggctaaattgcatttttagttttttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactt 15326961  T
Q  692 tctctccttacatattttggtcttttccgttagttt 727  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15326962 tctctccttacacattttggtcctttccgttagttt 15326997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Original strand, 15326105 - 15326372
Alignment:
Q  19 ataatgatattaatttgacatgatcatattggcatcacattttttattgtttttatatatatttgaaataaaatttgctgcccacaaattatgtttgtca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15326105 ataatgctattaatttgacatgatcatattggcatcacatgttttattgtttttatatatattcgaaataaaatttgttgcccacaaattatgtttgtca 15326204  T
Q  119 gttgaattgtcattgacgcttgataatcaaatatttttcataaaatatatagagtattgtgggaaaaattcgataatcaaatatttcttatataaaataa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15326205 gttgaattgtcattgacgcttgataatcaaatatttttcataaaatatatagagtattgtggggaaaatccgataatcaaatatttctcatataaaataa 15326304  T
Q  219 tagcataaatccccgtaaaacaatagagtatgagattcgaactttaaatttctcatttattcactttg 286  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15326305 tagcataaatctccgtaaaataatagagtatgagattcgaacttcaaatttctcacttattcattttg 15326372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 47305130 - 47305267
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  47305130 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttatctccttacac 47305229  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47305230 attttgatcatttccgttagttttaattcaaagacgtt 47305267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 604 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28349766 - 28349622
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctccttac 702  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  28349766 ggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtattgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaacttttctctttac 28349667  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28349666 acattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 28349622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 37144151 - 37144009
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa--ctctctcct 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||    
T  37144151 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctcct 37144052  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  37144051 tacacattttgatcatttccgttagttttaatttaaatacgtt 37144009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 603 - 737
Target Start/End: Original strand, 43140697 - 43140833
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||  ||    
T  43140697 aggttaaattgcatttttagtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaactcctctctgtt 43140796  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  43140797 acatattttggtcatttctgttagttttaattcaaaa 43140833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 8769665 - 8769528
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  8769665 taaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacatctctctgttacac 8769566  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8769565 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 8769528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 44486315 - 44486173
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||  ||||||  ||||||    
T  44486315 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaatatttaatttattttggtcccttaatttctctctgttacat 44486216  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  44486215 attttggtcctttctgttagtttaaattccaaaacgttagatt 44486173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 47250929 - 47250796
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  47250929 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacat 47250830  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47250829 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 47250796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 22338275 - 22338413
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct---ccttaca 703  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||     |||||    
T  22338275 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtattgctttggtaccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatctgttaca 22338374  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22338375 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 22338413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 601 - 747
Target Start/End: Original strand, 23472590 - 23472738
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| |||||||     
T  23472590 ttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcttttaattaaaattcgattcattttggttctttaacttctctccg 23472689  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23472690 ttacatattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagatt 23472738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 47251279 - 47251143
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctccttacata 705  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| | |||| ||||| |    
T  47251279 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtattgctttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttttctcgttacaca 47251180  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47251179 ttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 47251143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 473569 - 473426
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-c 698  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||| ||||||      
T  473569 ttaggttaaattgcattgttaattctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaatttgatttattttcgtcccttaacttctctcaa 473470  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  473469 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 473426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 625 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 47305492 - 47305377
Alignment:
Q  625 ctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgtt 722  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  47305492 ctttaactatttaattagtatcgttttgctcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaacttcactccattacacattttggtcatttccatt 47305393  T
Q  723 agtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47305392 agttttaattcaaaaa 47305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 44485715 - 44485581
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||     
T  44485715 taaattgcatttttggtcctttaactatttaagtattatcgctttggtcctttaattaatattcaatttattttgatcccttaacttctctccgttacac 44485616  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44485615 attttggtcctttccgttagtttaaattccaaaac 44485581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 44448295 - 44448162
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| | ||||  |||||     
T  44448295 taaattggatttttagtcctttaattatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttttctctgttacac 44448196  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  44448195 attttggtcctttatgttagttttaattcaaaaa 44448162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21522603 - 21522464
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcctta 701  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |     
T  21522603 aggttaaattgtgtttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttctctccgtt 21522505  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21522504 aacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 21522464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 616 - 738
Target Start/End: Original strand, 41758691 - 41758815
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  41758691 ttttttgtcccttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttacacattttggtc 41758790  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||||||||||| ||||||||||    
T  41758791 atttccgttagttttaattcaaaaa 41758815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 9034703 - 9034556
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| | |||  |    
T  9034703 taggctaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttccctctgt 9034604  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  9034603 tacagattttggtccttttcgttagttttaaatcaaaaacgttagatt 9034556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 599 - 742
Target Start/End: Original strand, 8769277 - 8769422
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc 697  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| | ||||||||||| ||  |||||| |  |||||| ||||||    
T  8769277 atttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtccctgaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctc 8769376  T
Q  698 c-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  8769377 cgttacacattttggtcctttccgttagatttaattcaaaaacgtt 8769422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 34568586 - 34568719
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| |||| || |||||     
T  34568586 taaattgtattttttgtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctcttcgttacac 34568685  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  34568686 attttggtccttttcgttagttttaattcaaaaa 34568719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35086123 - 35085986
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||  |||||| |||| |  ||||||    
T  35086123 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattgtggtcccttaacttctctttgttacat 35086024  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35086023 attttggacctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 35085986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 632 - 744
Target Start/End: Original strand, 36506840 - 36506954
Alignment:
Q  632 tatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctc--tccttacatattttggtcttttccgttagtttga 729  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  36506840 tatttaattagtatcgttttgatctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttccatccttacatattttggtcttttatgttagtttta 36506939  T
Q  730 attcaaaaacgttgg 744  Q
    ||| ||||| |||||    
T  36506940 atttaaaaatgttgg 36506954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 9231065 - 9230923
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||| |||||  |    
T  9231065 taggctaagttgtatttttggtcccttaacgatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaagatttgatttattttggtcacttaacttctctctgt 9230966  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9230965 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 9230923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 18731022 - 18731164
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | || || |||||     
T  18731022 taaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatcttcgttacac 18731121  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18731122 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 18731164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31716004 - 31715863
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    |||| ||||||| |||||     
T  31716004 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctataacttctctccgttacac 31715905  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31715904 attttggtcattt-cgttagttttaattcaaaaacgttagatt 31715863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 627 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 36507172 - 36507058
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||  ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  36507172 ttaactatttaattagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttatttcggtatcttaacttctttctgttacacattttggtcatttctgttag 36507073  T
Q  725 tttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| |||||||||||    
T  36507072 ttttaattcaaaaac 36507058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 37143767 - 37143900
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct-ctcc-ttacat 704  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | |||  |||||     
T  37143767 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattt-ggtatcttaacttttctctgttacac 37143865  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  37143866 attttgatcctttccgttagttttaattcaaaaac 37143900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Original strand, 2357090 - 2357207
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  2357090 ttaactatttaaatagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccattacacattttggtcctttctgttag 2357189  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  2357190 ttttaattcaaaaacgtt 2357207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 23472939 - 23472802
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  |||||     
T  23472939 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtttcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttattacac 23472840  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23472839 attttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgtt 23472802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 599 - 738
Target Start/End: Original strand, 35085734 - 35085875
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-t 696  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |    
T  35085734 atttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctt 35085833  T
Q  697 ccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
      ||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  35085834 tgttacacattttgatcctttcagttagttttaattcaaaaa 35085875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 617 - 747
Target Start/End: Original strand, 47250570 - 47250702
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtct 714  Q
    |||| |||| |||| ||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||||     
T  47250570 tttttgtcccttaattatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctccccattacatattttggtcc 47250669  T
Q  715 tttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47250670 tttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 47250702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 610 - 742
Target Start/End: Original strand, 21522226 - 21522358
Alignment:
Q  610 attgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatatt 707  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21522226 attgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcttt--attttggtctcttaacttctctctgttacatatt 21522323  T
Q  708 ttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  21522324 ttggtcttttctgttaattttaattcaaaaacgtt 21522358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Original strand, 23437149 - 23437292
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-c 698  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   |||| |||||||      
T  23437149 ttaggctaaattgcatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacctctctcgg 23437248  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23437249 ttacatattttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgtt 23437292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 599 - 670
Target Start/End: Original strand, 43726239 - 43726310
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43726239 atttaggttaaattgtatttttggtcccttaattatttaagtagtctcgctttggtcccttaattaaaattt 43726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11679085 - 11679023
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11679085 taaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 11679023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 31715631 - 31715773
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | ||||  |    
T  31715631 taggctaaattgtattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttgaccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctctgt 31715730  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31715731 tacagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 31715773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10625467 - 10625330
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  10625467 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 10625368  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10625367 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 10625330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 32707120 - 32706978
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-c 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||   |||||||   ||||| ||||||      
T  32707120 ttaggctaaattgtatttttagtcccttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaactcgatttcttttggtccattaacttctctctg 32707021  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  32707020 ttacatattttggtcctttctgtt-gttttaattcaaaaacgtt 32706978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 5238449 - 5238591
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||  ||||||  |    
T  5238449 taggctaaattgcatttttgatccattaactgtttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaagttctctctgt 5238548  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5238549 tacacattttagtcctttccgttagttttacttcaaaaacgtt 5238591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 22338659 - 22338581
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtat 685  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22338659 taaattgcatttttggtcccttaactaattaattagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttcatttattttggtat 22338581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 43726630 - 43726488
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  | |||| | ||| || | ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||  |    
T  43726630 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtggtattgttttagttccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctat 43726531  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43726530 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 43726488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 11678706 - 11678843
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || ||| |     
T  11678706 taaattgcatttttggtcctttaaatatttagataatatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttatac 11678805  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11678806 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 11678843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 739
Target Start/End: Original strand, 24119737 - 24119851
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||   ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24119737 ttaactatttagatagtatcactttggtctcttaattaaaatttgatttcttttgatcccttaacttctctccgttacaaattttggtcatttccgttag 24119836  T
Q  725 tttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| |||||||||||    
T  24119837 ttttaattcaaaaac 24119851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 48704205 - 48704115
Alignment:
Q  593 agaataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||| |||||| | |||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  48704205 agaaaaatttatgctaaatgatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggt 48704115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 2357438 - 2357305
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  2357438 taaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgggcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 2357339  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  2357338 attttggtcctttttgttagttttaattcaaaaa 2357305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 603 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40740108 - 40740043
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaat 668  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40740108 aggtttaattgttattttagtcccttaattatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaat 40740043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 44447917 - 44448053
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | ||||  |||||     
T  44447917 taaattgcatttttggtccgttaactatttagatagtattgttttggtcc-ttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctcttttacac 44448015  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44448016 attttggccatttctgttagttttaattcaaaaacgtt 44448053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 32706728 - 32706872
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | ||| | || ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||     
T  32706728 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgtttttgacccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctctca 32706827  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32706828 attacacattttagtcctttccgttagttctaattcaaaaacgtt 32706872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28264726 - 28264659
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  28264726 tttttagtccattaactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggt 28264659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 43704957 - 43705008
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43704957 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 43705008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 671
Target Start/End: Original strand, 19543503 - 19543557
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattta 671  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19543503 ttttcgtcccttaactatttatttagtatcgctttgatcccttaattaaaattta 19543557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 666
Target Start/End: Original strand, 39118010 - 39118072
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaa 666  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  39118010 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttgatcccttaattaaa 39118072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45457149 - 45457099
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45457149 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 45457099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 670
Target Start/End: Original strand, 40738218 - 40738259
Alignment:
Q  629 aactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40738218 aactaattaattagtatcgctttggtcccttaattaaaattt 40738259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 644 - 742
Target Start/End: Original strand, 9230716 - 9230816
Alignment:
Q  644 atcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9230716 atcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttgatcatttccgttaattttaattcaaaaacgt 9230815  T
Q  742 t 742  Q
    |    
T  9230816 t 9230816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 640 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34568934 - 34568830
Alignment:
Q  640 tagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||| |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34568934 tagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttatttttgtcccttaacttctctctgttatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaa 34568835  T
Q  738 acgtt 742  Q
    |||||    
T  34568834 acgtt 34568830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 605 - 697
Target Start/End: Original strand, 38676059 - 38676151
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc 697  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| |||| ||| ||  |||||||| |||||||| ||||    
T  38676059 gttaaattatatttttggtcccttaactatttaattgatttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtctcttaactttctc 38676151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 617 - 665
Target Start/End: Original strand, 42287324 - 42287372
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaa 665  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42287324 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaa 42287372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 8090833 - 8090884
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  8090833 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 8090884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 8417393 - 8417264
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct 696  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||||| | |||    
T  8417393 taattttggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttct 8417294  T
Q  697 ---ccttacatattttggtcttttccgtta 723  Q
       | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  8417293 caccgttacatattttggtccttttcgtta 8417264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Original strand, 10625180 - 10625223
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10625180 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 10625223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 28263519 - 28263582
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  28263519 ttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaa 28263582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 29771033 - 29771084
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29771033 tttttggtccattaagtatttaattgatatcgctttggtcctttaattaaaa 29771084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29771616 - 29771565
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29771616 ttttttgtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaattaaaa 29771565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 667
Target Start/End: Original strand, 41691933 - 41691988
Alignment:
Q  612 tgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  41691933 tgtatttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaa 41691988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 41911288 - 41911338
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41911288 tttttagtcctt-aagtatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 41911338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 48095408 - 48095357
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  48095408 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 48095357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3217799 - 3217749
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3217799 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 3217749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5870328 - 5870278
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5870328 ttttggtcccttaactatttaattagtattgctttggtcccttaactaaaa 5870278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7777002 - 7776952
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7777002 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 7776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 17489530 - 17489580
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17489530 ttttggtcccttaactatttaattgatatcgctttggtcccttaattaaaa 17489580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 17563684 - 17563634
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17563684 ttttggtcccttaactatttaattgatatcgctttggtcccttaattaaaa 17563634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 18458820 - 18458770
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18458820 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 18458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 20493758 - 20493808
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20493758 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 20493808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 24733642 - 24733692
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24733642 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24733692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 27284255 - 27284305
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27284255 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27284305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27284654 - 27284604
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27284654 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27284604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31852127 - 31852077
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31852127 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37374502 - 37374452
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  37374502 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37374452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39143556 - 39143506
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39143556 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 39143506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40852205 - 40852155
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  40852205 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 40852155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42287857 - 42287807
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42287857 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 42287807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44332568 - 44332518
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44332568 ttttggtcctttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 44332518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 44333012 - 44333062
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44333012 ttttggtcctttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 44333062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 45456747 - 45456797
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45456747 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45456797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 45995280 - 45995330
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45995280 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45995330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 47987340 - 47987390
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  47987340 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 47987390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 4156638 - 4156553
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||| |||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  4156638 gttaaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatctgtttggtaccctaactaaaatttgatttattttggtctcttaa 4156553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Original strand, 29414133 - 29414178
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  29414133 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 29414178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 727
Target Start/End: Original strand, 43050391 - 43050510
Alignment:
Q  611 ttgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttacatatt 707  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||| || ||  ||||||||  ||||| | ||||    |||||||||    
T  43050391 ttgtctttttggtcccttaactatttaattaatattggtttggtcccctaattaaaaattgatttattttggtcccttaaatttctctttgttacatatt 43050490  T
Q  708 ttggtcttttccgttagttt 727  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  43050491 ttggtgctttccgttagttt 43050510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 44915736 - 44915879
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||    
T  44915736 tttaggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttatctcc 44915835  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44915836 ttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 44915879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 5720140 - 5720282
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcct 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5720140 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattaatattgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctcct 5720239  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5720240 ttcacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 5720282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 41660123 - 41659977
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  41660123 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaattagtatcactttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctctgctt 41660024  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41660023 acacattttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgttagatt 41659977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 41659748 - 41659885
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||  |||||     
T  41659748 taaattatattttttgtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctgttacac 41659847  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41659848 attttgggcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 41659885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 35408909 - 35408762
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||  |    
T  35408909 taggctaaattatgtttttggtccattaactatttaattagtatcgctttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctgt 35408810  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35408809 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 35408762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 27246366 - 27246229
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa--ctctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||||||     
T  27246366 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattaggatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctccttacac 27246267  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  27246266 attttggtcctttcggttatttttaattcaaaaacgtt 27246229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 604 - 739
Target Start/End: Original strand, 27913894 - 27914031
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    ||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  27913894 ggttaaattatgtttttggttccttaactatttaattagtatcgctttagtccctttattaaaatttaatttattttgctatcttaacttctctccgtta 27913993  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27913994 catattttggtcttttatgttagttttaattcaaaaac 27914031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 600 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 34820669 - 34820520
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||||    
T  34820669 tttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtctcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcc 34820570  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34820569 gttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttagatt 34820520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Original strand, 27132509 - 27132648
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| || |    
T  27132509 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctcttcgt 27132608  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  27132609 tacacattttggtcctttccgatagttttaattcaaaaac 27132648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 27914276 - 27914139
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||     
T  27914276 taaattgtatttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggttccttagttaaaatttgatttattttggcatcttaactttctctctttacac 27914177  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27914176 attttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgtt 27914139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 32503924 - 32503778
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||| ||| ||    
T  32503924 aggttaaattgcattcttagtcctttaactatttaggtagtattgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgtt 32503825  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  32503824 acacattttggtcatttccgttagttttaattcgaaaacgttagatt 32503778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 43183971 - 43183829
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  43183971 taggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgt 43183872  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  43183871 tacacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgtt 43183829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 633 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 44916096 - 44915986
Alignment:
Q  633 atttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaa 730  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44916096 atttaattactatcgttttggtcccttaattaaaatttcatttattttggtatcttaacttctctccgttacatattttggtcctttccgttagttttaa 44915997  T
Q  731 ttcaaaaacgt 741  Q
    |||||||||||    
T  44915996 ttcaaaaacgt 44915986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 13354180 - 13354317
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  13354180 taaattgaattttcggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccattacat 13354279  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13354280 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 13354317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25642651 - 25642514
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||| ||| |||||     
T  25642651 taaattgtatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgttacac 25642552  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25642551 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 25642514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 607 - 744
Target Start/End: Original strand, 4104162 - 4104301
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||  ||| |     
T  4104162 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtatcttaacttctctctgttatac 4104261  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttgg 744  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4104262 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaatgttgg 4104301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Original strand, 16350079 - 16350213
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttaca 703  Q
    |||||||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16350079 ttaaattgcatttttggtctcttgactatttaattagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttaca 16350178  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  16350179 cattttggtcatttccatttgttttaattcaaaaa 16350213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 12304542 - 12304404
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||||||| |    
T  12304542 taggctaaattgcattttttgtcccttaacaatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgt 12304443  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12304442 tacacattttggccatttccgttagttttaattcaaaaa 12304404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 16655994 - 16655852
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  16655994 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgt 16655895  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||    
T  16655894 tacacattttggtcctttccactagttttaattaaaaaacgtt 16655852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 39454449 - 39454591
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||| |    
T  39454449 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccgt 39454548  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39454549 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 39454591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 27883471 - 27883608
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  27883471 taaattgcattttttgtcccttaactatttaagtaatatcgctttggtcccttaagtaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 27883570  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27883571 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 27883608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 41377358 - 41377494
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  |||||     
T  41377358 taaattgtatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacag 41377456  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41377457 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 41377494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 39912630 - 39912764
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttaca 703  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||   |||||| ||||    |||||    
T  39912630 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccgttaactttctctctgttaca 39912729  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39912730 cattttggtcttttacgttagttttaattcaaaaa 39912764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 4104542 - 4104400
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||| |     
T  4104542 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctctccgttatac 4104443  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4104442 atttgggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 4104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 37412961 - 37412819
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||   ||||| ||||||  |||||     
T  37412961 taaattgcatttttggccccttaactatttaagtagtatcgcattggtcccttaattaaaattcaatttattttggtccattaacttctctctgttacac 37412862  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37412861 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 37412819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 37744780 - 37744634
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||    
T  37744780 aattaaggttaaattgcatttttgattccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctct 37744681  T
Q  697 c-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37744680 ctcttatagattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 37744634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 640 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27883807 - 27883698
Alignment:
Q  640 tagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27883807 tagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtgacttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaa 27883708  T
Q  738 acgttggatt 747  Q
    ||||| ||||    
T  27883707 acgttagatt 27883698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 31450669 - 31450806
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  31450669 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 31450768  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31450769 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 31450806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Original strand, 18565064 - 18565211
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| |    
T  18565064 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaggcagtatcgctttagtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgt 18565163  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18565164 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 18565211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 20908514 - 20908651
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||| ||  |||||||   || | |||||     
T  20908514 taaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttagttccttaacttcttcccgttacac 20908613  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20908614 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 20908651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 12304160 - 12304035
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||     
T  12304160 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctcttcgttacacattttggc 12304061  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12304060 catttccgttagttttaattcaaaaa 12304035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 622 - 742
Target Start/End: Original strand, 17856217 - 17856339
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcctt---acatattttggtcttttc 718  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  17856217 gtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact-tctccttgttacacattttggtcttttc 17856315  T
Q  719 cgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  17856316 cgttagttttaattcaaaaacgtt 17856339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 34820278 - 34820419
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||  ||    
T  34820278 aggtcaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattagatttattttggtcctttaacttctctctgtt 34820377  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34820378 acacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 34820419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40694538 - 40694421
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40694538 ttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattagatttattttggtcccttaatttctctccgttacacattttggtcatttccgttag 40694439  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  40694438 ttttaattcaaaaacgtt 40694421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 43183594 - 43183723
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggt 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  | |||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  43183594 atttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccataacatctctctgttacacattttggt 43183693  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43183694 cctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 43183723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 603 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1580228 - 1580140
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac 691  Q
    |||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1580228 aggttaaattatgtttttggttccttaactatttaaatagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaac 1580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Original strand, 16655610 - 16655746
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacata 705  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||  || || |    
T  16655610 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctgttgcaca 16655709  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16655710 ttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 16655746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 609 - 738
Target Start/End: Original strand, 25642273 - 25642404
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc--ttacatat 706  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| |   |  ||||| ||    
T  25642273 aattgtatttttagtcccttaactatttaagtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttttatctgttacacat 25642372  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  25642373 tttgatcctttcagttagttttaattcaaaaa 25642404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Original strand, 34127570 - 34127706
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||  |||||| ||| ||| ||||| |    
T  34127570 aaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttatttttgtcgcttaacttctatccattacaca 34127669  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34127670 ttttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 34127706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 605 - 747
Target Start/End: Original strand, 38275478 - 38275622
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttac 702  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| || |||  ||||    
T  38275478 gttaaattgtatttttgatcccttaactatttatgtagtattgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttctttaacttccctctattac 38275577  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  38275578 acattttggtcctttccgttagttttaattcaaagacgttagatt 38275622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 13354566 - 13354423
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcc 698  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| ||     
T  13354566 ttaggctaaattgtaattttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcg 13354467  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13354466 ttacacatattggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 13354423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 12303788 - 12303922
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc-tctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||||| ||||  |||||     
T  12303788 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactcatctctgttacac 12303887  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  12303888 attttggtcctttccgttagttttatttcaaaaac 12303922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 20908894 - 20908760
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||  |||||     
T  20908894 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacac 20908795  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  20908794 attttggtcatttctgttagttttaattcaaaaac 20908760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 4120767 - 4120900
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||   ||||  ||||||| ||||||    
T  4120767 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaatcaaaattcgatttattttggtcctttaatttctctccgttacat 4120866  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  4120867 attttggtcgtttccattagttttaattcaaaaa 4120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 600 - 739
Target Start/End: Original strand, 21470291 - 21470432
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  || ||| ||||||     
T  21470291 tttaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggcagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccctcaacttctctct 21470390  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  21470391 gttacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaac 21470432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21470669 - 21470541
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  21470669 atttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctt-ggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctacgttacacattttggt 21470571  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21470570 cctttccgttagttttaattaaaaaacgtt 21470541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 27132893 - 27132760
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||| ||||||    
T  27132893 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtgtcgatttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctatccgttacat 27132794  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27132793 attttagtcatttccgttagttttaattcaaaaa 27132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28203243 - 28203106
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||  |||||     
T  28203243 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtcgtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctgttacac 28203144  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28203143 attttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgtt 28203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 28631285 - 28631414
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  28631285 atttttggtcccttaactatttaggtagcatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctcctttacacattttggt 28631384  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28631385 catttccgatagttttaattcaaaaacgtt 28631414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28631661 - 28631520
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||  ||    
T  28631661 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttgggtagtatcgctttgctctcttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtt 28631562  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28631561 acacattttcgtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 28631520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 741
Target Start/End: Original strand, 32933589 - 32933730
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||||  ||  |||||||| | ||||| |||| |  |    
T  32933589 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttctctttgt 32933688  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32933689 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgt 32933730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 32933974 - 32933837
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  |||||     
T  32933974 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaaataaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacac 32933875  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32933874 attttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgtt 32933837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 39913019 - 39912872
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaat-tagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc 697  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| ||||    
T  39913019 atttaggctaaattgcatttttggtcccttaactattttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattagatttattttggtcccttaactttctc 39912920  T
Q  698 c---ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
        |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39912919 tctgttacaccttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 39912872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 41377737 - 41377600
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |  |||||     
T  41377737 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacac 41377638  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41377637 attttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 41377600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 602 - 741
Target Start/End: Original strand, 14877481 - 14877620
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcctt 700  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||   |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||| |||    
T  14877481 taggctaaattgcatttttggtcccaaaactatttaggtagtatcgatttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctct-ctt 14877579  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14877580 acacattttggtaatttccgttagttttaattcaaaaacgt 14877620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 640 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 44612833 - 44612729
Alignment:
Q  640 tagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44612833 tagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctatgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 44612734  T
Q  738 acgtt 742  Q
    |||||    
T  44612733 acgtt 44612729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 4121149 - 4121010
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||    
T  4121149 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctatta 4121050  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    || | |||| || ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4121049 cacactttgttcattttcgttagttttaagtcaaaaacgt 4121010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5921774 - 5921627
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   |||| ||  ||||||| ||||   |    
T  5921774 taggctaaattgtgtttttgatcccttaactatttatatagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttttttttgttccttaacttctctttgt 5921675  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5921674 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttggatt 5921627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 670
Target Start/End: Original strand, 34484234 - 34484301
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34484234 aggttaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattt 34484301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16261253 - 16261119
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||  |||| | | ||||| |||||     
T  16261253 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttatttttgtcccttagcttatctccgttacac 16261154  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  16261153 attttggtcattttggttagttttaattcaaaaac 16261119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27476750 - 27476608
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||||    
T  27476750 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacat 27476651  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  27476650 attatggtcctttccgttagttttaaatcaagaacgttagatt 27476608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 39150213 - 39150071
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||| ||| |    
T  39150213 taggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgcttttgtaccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctttccgt 39150114  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||| ||| || | |||| ||| ||||||||||||||    
T  39150113 tacacattttagtccttcctgttaattttaattcaaaaacgtt 39150071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 697
Target Start/End: Original strand, 1580030 - 1580098
Alignment:
Q  628 taactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc 697  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  1580030 taactatttaattagtatcgttttggtcc-ttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctc 1580098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 16736104 - 16736241
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  16736104 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcagttacac 16736203  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||    
T  16736204 attttggtcctttccagtagttttaatttgaaaacgtt 16736241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 33819777 - 33819646
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  33819777 taaattgtattttt-gtctcataactgtttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttctctccgttacat 33819680  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  33819679 attttggctatttccgttagttttaattcaaaaa 33819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34127947 - 34127811
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||  |||||| |  |||||| ||||||  |||||     
T  34127947 taaattgtatttttggacccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaactaaagttcgatttattttgatcccttaacttctctctgttacac 34127848  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34127847 a-tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 34127811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 38275840 - 38275701
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct---ctcc-ttac 702  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  | |||||||   |||  ||||    
T  38275840 taaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccgtaactcttctctctgttac 38275741  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38275740 acattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 38275701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Original strand, 27476368 - 27476507
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt-aactctctcc-ttaca 703  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||| || ||||||| |||||    
T  27476368 ttaaattgtatttttggtccctagactatttaggtagtatcgctttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaaattctctcctttaca 27476467  T
Q  704 ta-ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27476468 catttttggtcctatccgttagttttaattcaaaaacgtt 27476507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 17856577 - 17856487
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  17856577 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaact 17856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 36442517 - 36442451
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaat 673  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36442517 taaattatatttttggtcccttaactatttagatagtattgctttgatcctttaattaaaatttaat 36442451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 37412596 - 37412658
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37412596 taaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgctttggtctcttaattaaaatt 37412658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 5961672 - 5961805
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| || ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  5961672 taaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccataattaaaaattgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 5961771  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  5961772 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaa 5961805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 738
Target Start/End: Original strand, 15829747 - 15829856
Alignment:
Q  631 ctatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttg 728  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||     
T  15829747 ctatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatccgttacacatcttggtcatttccgttagtttt 15829846  T
Q  729 aattcaaaaa 738  Q
    ||||||||||    
T  15829847 aattcaaaaa 15829856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16350457 - 16350369
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16350457 ggttaaattatgtttttgttcccttaactatttaattattattgttttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtatcttaact 16350369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 742
Target Start/End: Original strand, 39149852 - 39149984
Alignment:
Q  612 tgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatatttt 709  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||  |||||| |  ||||||| || |   ||||| |||||    
T  39149852 tgtatttttggttttttaactatttaaatagtatcactttagtcctttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttctatttgttacacatttt 39149951  T
Q  710 ggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39149952 ggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 39149984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 601 - 738
Target Start/End: Original strand, 36442130 - 36442269
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||   ||||| |||| ||     
T  36442130 ttaggctaaattgtatttttgttcccttcactatttaggtagtatcgttttggtctattaataaaaatttgatttattttggttcattaacttctccccg 36442229  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  36442230 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaa 36442269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 598 - 669
Target Start/End: Original strand, 44610856 - 44610926
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  44610856 aatttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgcttt-gtcccttaattaaaatt 44610926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Original strand, 45389129 - 45389267
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct--ctcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||| |   || |    
T  45389129 taggctaaattgcatttttggtccctgaactatttaggtagtgtcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtccattaacttttcttcgt 45389228  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  45389229 tacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaa 45389267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2805020 - 2804970
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2805020 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttgatcctttaactaaaa 2804970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 742
Target Start/End: Original strand, 3603517 - 3603645
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttacatattttggtc 713  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  |   ||||||||| |||| | | ||    ||||||||||| |||    
T  3603517 ttttcgtcccttaactatttatttagtatcgctttggtcccttgattaaaatttgttatgttttggtattttaagtttatctctgttacatattttagtc 3603616  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||    
T  3603617 ctttccgttaaatttaattcaaaaacgtt 3603645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13479477 - 13479427
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  13479477 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 13479427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 15044752 - 15044802
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15044752 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 15044802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18565386 - 18565324
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18565386 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttgggtcccttaattaaaatt 18565324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26424869 - 26424819
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26424869 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 26424819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 28202863 - 28202925
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28202863 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaatt 28202925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 31557104 - 31557154
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31557104 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31557154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 33200041 - 33200091
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  33200041 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 33200091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34618567 - 34618517
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  34618567 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 34618517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 36211782 - 36211720
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36211782 taaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaatt 36211720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 38807230 - 38807180
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  38807230 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 38807180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 738
Target Start/End: Original strand, 33819393 - 33819532
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct--ctc 697  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  ||||| || |||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||  ||||||| |   ||    
T  33819393 tttaggttaaattgcacttttggtccattaactatttaggtagtaccgttttggtctcttaattaaaatttgattta-tttggtcccttaacttttcttc 33819491  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  33819492 gttacagattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaa 33819532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 667
Target Start/End: Original strand, 13479106 - 13479146
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13479106 ttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 13479146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23992289 - 23992213
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  23992289 taaattgtctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 23992213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25334644 - 25334604
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25334644 ttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 25334604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 2822316 - 2822367
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2822316 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 2822367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2822727 - 2822676
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2822727 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 2822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15136922 - 15136871
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  15136922 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 15136871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33200571 - 33200520
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  33200571 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 33200520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 670
Target Start/End: Original strand, 37744460 - 37744515
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37744460 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattt 37744515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 677965 - 677915
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  677965 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 677915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2970862 - 2970812
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2970862 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 2970812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4602862 - 4602812
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  4602862 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 4602812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 669
Target Start/End: Original strand, 16260882 - 16260936
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16260882 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatt 16260936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 16712450 - 16712500
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16712450 ttttggtcctttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 16712500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 17978144 - 17978094
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17978144 ttttggtccattaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 17978094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32194874 - 32194824
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  32194874 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 32194824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 8174343 - 8174266
Alignment:
Q  596 ataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaat 673  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||||| |||||    
T  8174343 ataatttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaat 8174266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 614 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31557602 - 31557549
Alignment:
Q  614 tatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  31557602 tatttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaactaaaa 31557549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 666
Target Start/End: Original strand, 32194455 - 32194504
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaa 666  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  32194455 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaa 32194504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39109543 - 39109498
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39109543 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 39109498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 665
Target Start/End: Original strand, 40694187 - 40694256
Alignment:
Q  596 ataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaa 665  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  40694187 ataattaaggctaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttagtcccttaattaa 40694256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 122)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Original strand, 5348577 - 5348724
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcct 699  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5348577 taggttaaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtccctcaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctcct 5348676  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5348677 tacacattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagatt 5348724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Original strand, 40639116 - 40639262
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctt 700  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  40639116 aggttaaattgcatttttagttctttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctcctt 40639215  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  40639216 acaaattttggtcatttccgttggttttaattcaaaaacgttagatt 40639262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 47891902 - 47891759
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc 698  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  47891902 ttaggttaaattccatttttgttcctttaactatttaattagtattgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggcatcttaactttctctcc 47891803  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47891802 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 47891759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 2078859 - 2078718
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctt 700  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  2078859 aggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaattaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctcttctt 2078760  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2078759 acacattttagtcttttctgttagttttaattcaaacacgtt 2078718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 40969258 - 40969395
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  40969258 taaattgcatttttagtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctcttcttacac 40969357  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40969358 attttggtcatttccgtcagttttaattcaaaaacgtt 40969395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40969642 - 40969500
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcct 699  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| ||    
T  40969642 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttagtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctcttct 40969543  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40969542 tacacattttggtcctttccgtcagttttaattcaaaaacgtt 40969500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40639507 - 40639363
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||     
T  40639507 tttaggctaaattatgtttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtatcttaacttctctct 40639408  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  40639407 gttacatattttggtcatttccgtgtgttttaattcaaaaacgtt 40639363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 607 - 727
Target Start/End: Original strand, 51883862 - 51883984
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||     
T  51883862 taaattgcatttttaatcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctcttcttacac 51883961  T
Q  705 attttggtcttttccgttagttt 727  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  51883962 attttggtcttttatgttagttt 51883984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 51885754 - 51885610
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctc 697  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  |||||     
T  51885754 tttaggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttagctttctctt 51885655  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51885654 cttacatattttgaccctttccgtcagttttaattcaaaaacgtt 51885610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 41208397 - 41208541
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||||    
T  41208397 tttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcc 41208496  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     || || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  41208497 gttgcacattttggtcatttccgttagatttaattcaaaaacgtt 41208541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 53678796 - 53678679
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||| |    
T  53678796 ttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttacacattttggttctttccgttgg 53678697  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  53678696 ttttagttcaaaaacgtt 53678679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 5348951 - 5348814
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  5348951 taaattatgttttttgtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccgtaattaaaatttgatttattttggtattttaacttttctccgttacat 5348852  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5348851 attttggtcctttccgtgtgttttaattcaaaaacgtt 5348814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 37133276 - 37133417
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcctt 700  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| || ||    
T  37133276 aggttaaattatgtttttggtcccttagctatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctcttcgtt 37133375  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  37133376 acacattttggtccttttcgtaagttttaattcaaaaacgtt 37133417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10757091 - 10756949
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||| |||||     
T  10757091 taaattgtattttttgtcctttaactatttaggcagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaatttctctccgttacac 10756992  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10756991 attttgatcttttccgttaattttaattcaaaaacgttagatt 10756949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Original strand, 34629976 - 34630122
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| |||||    
T  34629976 aattaaggttaaattatatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctct 34630075  T
Q  697 cc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34630076 ccgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 34630122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 738
Target Start/End: Original strand, 53678445 - 53678569
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||    
T  53678445 tttttggtcccttaattatttaaatagtatcgctttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtatcttaacttctctccgttacacattttgatc 53678544  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||||||||||| ||||||||||    
T  53678545 atttccgttagttttaattcaaaaa 53678569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12123467 - 12123325
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||| ||| |    
T  12123467 taggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccgt 12123368  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12123367 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaagcgtt 12123325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 21918496 - 21918636
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||   |||| ||||||||||  | |||||||    
T  21918496 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtccctaaattaaaatttgatttttttttgtatcttaactttatctcctt 21918595  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21918596 acacattttgatccttt-cgttagttttaattcaaaaacgtt 21918636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 31514250 - 31514109
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| | ||||| |    
T  31514250 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttttctccgt 31514151  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31514150 tacacagtttggtc-tttccgttagctttaattcaaaaacgtt 31514109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 601 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 37133604 - 37133463
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc--tctcc 698  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  37133604 ttaggctaaattatatttttggtcctttaattatttaattagtattgttttggtcccttacttaaaatatgatttattttggtatcttaactctatctcc 37133505  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacg 740  Q
    ||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||    
T  37133504 ttacacattttggtcctttttattagttttaattcaaaaacg 37133463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Original strand, 46766619 - 46766763
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct---c 697  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||   |    
T  46766619 ttaggttaaattgcatttttggtccttttactattttgctaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatcc 46766718  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46766719 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgtt 46766763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 45171450 - 45171313
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||  ||| ||| |||||     
T  45171450 taaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctttccattacac 45171351  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45171350 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 45171313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 52268486 - 52268350
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||| |||| || |||||     
T  52268486 taaattgcatttttggtccattaactatttagttagtatcgttttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtct-ttaacttctcttcgttacac 52268388  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52268387 attttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 52268350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 46767002 - 46766863
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc- 698  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||     
T  46767002 taggctaaattgtatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgtatcttaactttctctccg 46766903  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  46766902 ttacacattttggtcatttacgttagttttaattaaaaaa 46766863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 41208788 - 41208649
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||| ||||||  |    
T  41208788 taggctaaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaacatctctctgt 41208689  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  41208688 tacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaac 41208649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Original strand, 40410706 - 40410852
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc- 695  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||     
T  40410706 aattaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctct 40410805  T
Q  696 tccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |  ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40410806 ttgttacacattttggttatttccgttagttttaattaaaaaacgtt 40410852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 622 - 742
Target Start/End: Original strand, 47891531 - 47891653
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttcc 719  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||| |||      
T  47891531 gtcccttaacaatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctattcgttacacattttggtccttttt 47891630  T
Q  720 gttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  47891631 gttagttttaattcaaaaacgtt 47891653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 54107672 - 54107806
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||| |||||     
T  54107672 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccgttacac 54107771  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  54107772 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaac 54107806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 7937938 - 7937809
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |   |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  7937938 atttttggtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgaattattttggtctcttaacttctctccgttacacattttggt 7937839  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7937838 ccttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 7937809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 747
Target Start/End: Original strand, 54081284 - 54081428
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||  |||    
T  54081284 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgctttggtcc-ttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtta 54081382  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  54081383 catattttggtcttttctgttagttttaatttaaaaacgttagatt 54081428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33773174 - 33773036
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttaca 703  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||    || ||    
T  33773174 taaattgtgtttttggtcccttaactatttaattagtatcactttgatcccttgattaaaatttgatttattttggtatcttaattttctctctgttcca 33773075  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33773074 tattttggtcgtttccgttggttttaatttaaaaacgtt 33773036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Original strand, 34521264 - 34521411
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |    
T  34521264 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgt 34521363  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  34521364 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaatgttagatt 34521411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4846984 - 4846842
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  |||||||| || |||| ||||||  |    
T  4846984 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtctcataacttctctctgt 4846885  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4846884 tacacattttggccatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 4846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Original strand, 21169668 - 21169806
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttaca 703  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||      
T  21169668 ttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttatc 21169767  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21169768 aattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 21169806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 26332322 - 26332456
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  26332322 taaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaatttcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 26332421  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332422 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 26332456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 40926009 - 40926151
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||| |   ||||| ||||||| |    
T  40926009 taggttaaattgcatttttggtcttttaactatttatgtagtatcgctttgatctcttaattaaaatttgatttattttgatccattaacttctctccgt 40926108  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40926109 tacacattttggtcatttccgttagttttaattgaaaaacgtt 40926151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 632 - 742
Target Start/End: Original strand, 2078511 - 2078623
Alignment:
Q  632 tatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacatattttggtcttttccgttagtttga 729  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||      
T  2078511 tatttaattagtatcgctctggtcccttaaataaaatttgatttattttgatatcttaactttctcttcttacacattttggtcctttccattagttttg 2078610  T
Q  730 attcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||||    
T  2078611 attcaaaaacgtt 2078623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 7743139 - 7743006
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc-tctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||||  ||||| |||||||||    
T  7743139 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtctcataacttatctctgttacacattttggtc 7743040  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7743039 ctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 7743006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 19124192 - 19124329
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||  ||| |||||| | ||||||| |||| || |||||     
T  19124192 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatattgctttggtcccctaattaaaattcgatctattttgatctcttaacttctcttcgttacac 19124291  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19124292 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 19124329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 41997830 - 41997959
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  41997830 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttaatttattttggtcccttaacttctctctattacacattttggt 41997929  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  41997930 catttttgttagttttaattcaaaaacgtt 41997959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 7275024 - 7274888
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctccttacatat 706  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||  ||||| ||    
T  7275024 aaattgcatttttggtccgttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttgttacacat 7274925  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttg 743  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  7274924 tttggtcatttcttttagttttaattcaaaaacgttg 7274888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 605 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 17274161 - 17274097
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17274161 gttaaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcttttaattaaaatt 17274097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 15862564 - 15862421
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||| |||| || ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| ||||       
T  15862564 ttaggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatctcttttgtccctttattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctttg 15862465  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15862464 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 15862421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 737
Target Start/End: Original strand, 22354946 - 22355077
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttacata 705  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | |||   ||||| |    
T  22354946 aaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctgtgttacaca 22355045  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  22355046 ttttggtcctttccgttaattttaattcaaaa 22355077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 28691503 - 28691364
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||| |   ||||| ||||||     
T  28691503 tttaggttaaattgtattttttgtcccttaattatttaggtagtatcgcttttgtccctaaattaaaatttgatttattttgatcatttaacttctctct 28691404  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28691403 gttacacattttggtcttttctgttagttttaattcaaaa 28691364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 35580341 - 35580210
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| |||||    
T  35580341 aattaaggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctct 35580242  T
Q  697 cc-ttacatattttggtcttttccgttagttt 727  Q
    || ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  35580241 ccgttacacattttggtcattttcgttagttt 35580210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 51311907 - 51311820
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt 688  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  51311907 ttaggctaaattacatttttggtctgttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatctt 51311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 617 - 742
Target Start/End: Original strand, 52606141 - 52606268
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtct 714  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||     
T  52606141 ttttggtcccttaactatttatgtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtca 52606240  T
Q  715 tttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||    
T  52606241 tttccgttagttttaaataaaaaacgtt 52606268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 19124554 - 19124413
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| || | ||||  |||||     
T  19124554 taaattatatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttgacttttctctgttacac 19124456  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19124455 attttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 19124413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28688365 - 28688231
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |  |||||  |||||||    
T  28688365 attttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacgttttggt 28688266  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  28688265 cctttccgttaattttaattcaaaaacgttagatt 28688231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 29248692 - 29248554
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttaca 703  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  29248692 ttaaattgtatttatgctcccttaactatttagatagtattactttagtcctttaattaaaatttgatctattttggtcccttaacttctctccgttaca 29248593  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     | |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  29248592 caatttggtcaatttcgttagttttaattcaaaaacgtt 29248554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34521641 - 34521503
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttaca 703  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||  ||| ||| |||||    
T  34521641 ttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaatttctttccgttaca 34521542  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34521541 cattttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgtt 34521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35753819 - 35753677
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||  |||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||| |    
T  35753819 taggttaaattacatttttggtaccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaatttaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccat 35753720  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35753719 cacatattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 35753677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 45171066 - 45171208
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cct 699  Q
    |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||   |    
T  45171066 taggctaaattgtatttctggtcccttaactatttaggtagtattgctttggccccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctaagt 45171165  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45171166 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 45171208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 10756721 - 10756858
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  10756721 taaattgtatttttggtcccttagctatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 10756820  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10756821 attttgttgctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 10756858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 44069506 - 44069369
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||  |||||     
T  44069506 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacac 44069407  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44069406 attttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgtt 44069369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 9028189 - 9028331
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcct-- 699  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||  |||||| | |||||||||  ||||      
T  9028189 taggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtccctaagttaaaatttgatttattttgttctcttaactccttcctgc 9028288  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9028289 tacacattttggtatttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 9028331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 43899463 - 43899320
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||||     
T  43899463 ttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccg 43899364  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||    
T  43899363 ttacatattttggtccttaccgttagttttaattaaacaacgtt 43899320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 44069126 - 44069260
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||||   || | |||||     
T  44069126 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggttccttaacttcttcccgttacac 44069225  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44069226 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 44069260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 53841407 - 53841272
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatat 706  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||   |||||||||||  ||  ||||||||  ||||| | |||||| ||||| ||    
T  53841407 aattgcatttttggtcccttaactatttagctagtattgctttggtctcgtaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctctccgttacacat 53841308  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53841307 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 53841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 2829795 - 2829654
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct-ctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||  || ||| | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| | |||| |    
T  2829795 taggctaaattgcatttttgatcctt-aactatttatgtattattgatttggtcttttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctccgt 2829697  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2829696 tacatattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgtt 2829654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 8846459 - 8846317
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||  ||  |||||||| | ||||| |||| |  |||||     
T  8846459 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcacttaactaaaattccatttattttggtcttttaacttctctttgttacac 8846360  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  8846359 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaatgttagatt 8846317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Original strand, 12123088 - 12123226
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |    
T  12123088 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctcttcgt 12123187  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  12123188 tacacattttggttctttccgttagttttaattcaaaaa 12123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 26332711 - 26332567
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac------tct 694  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||      |||    
T  26332711 ttaggctaaattgcatttttggtcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttaacttct 26332613  T
Q  695 ctc-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332612 ctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 26332567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 615 - 739
Target Start/End: Original strand, 27940283 - 27940409
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||  || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  27940283 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaatttaaatttgatttattttggtccctaaacttctctccgttacacattttggt 27940382  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    | |||||||||| || |||||||||||    
T  27940383 catttccgttaggttcaattcaaaaac 27940409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 600 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 41998204 - 41998134
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41998204 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattt 41998134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 738
Target Start/End: Original strand, 27254007 - 27254120
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||    
T  27254007 ttaactatttaggcagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttctctccgttacacattttgattatttccgttag 27254106  T
Q  725 tttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||||    
T  27254107 ttttaattcaaaaa 27254120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 29248330 - 29248459
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggt 712  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  29248330 atttttagttatttaactatttaggtggtatcgttttagtcccttaattaaaatttaatttattttggttccttaacttctctctgttacacattttggt 29248429  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  29248430 ccttttcattagttttaattcaaaaacgtt 29248459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40926393 - 40926257
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| || |||  |||||     
T  40926393 taaattgcatttttagtcccctaactatttaggtagtatcactttggtccattaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttcactctgttacac 40926295  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  40926294 attttggtcatttccgttaattttaattgaaaaacgtt 40926257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 54108512 - 54108369
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | |||    
T  54108512 aattaaggctaaattgcatttttggtcccttaattatttagctagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttct 54108413  T
Q  697 c-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |  ||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  54108412 ctgttatacattttggttatttccgttagttttaattcaaaaac 54108369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 13355188 - 13355238
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13355188 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 13355238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 45871700 - 45871762
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45871700 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 45871762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 45872064 - 45871930
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt-aactctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||| || ||||||| ||| | |||| |||    
T  45872064 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaaattctctccgttatacatttgggt 45871965  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45871964 cctttccgttagttttaattaaaaagcgttggatt 45871930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 54081667 - 54081605
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  54081667 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaatt 54081605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 605 - 739
Target Start/End: Original strand, 2829408 - 2829545
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtat-cttaact-ctctcc-tta 701  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||  |||||||| |||| ||  |||||||| | ||||||| |||||  |||    
T  2829408 gttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaattaacatttgatttattttggttttcttaacttctctctgtta 2829507  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  2829508 aacattttggtcttttctgctagttttaattcaaaaac 2829545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 7950278 - 7950415
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| | ||||  |||||     
T  7950278 taaattgcatttttagtcccttaactatttatgtagtattgttttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttttctctgttacac 7950377  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7950378 attttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 7950415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 8846079 - 8846216
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||  |||| |||||||  || |||||||||  ||||||| ||||   |||||     
T  8846079 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtctcttaactaaaattcgattaattttggtcccttaacttctctttgttacac 8846178  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8846179 attttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgtt 8846216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 670
Target Start/End: Original strand, 14353043 - 14353112
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14353043 ttaggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattt 14353112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 14353430 - 14353298
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||  || |||||   ||||| ||||||| |||||     
T  14353430 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcattggtcccttaaataaaattcgatttatcttggtcctttaacttctctccgttacac 14353331  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14353330 a-tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 14353298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 742
Target Start/End: Original strand, 28688017 - 28688130
Alignment:
Q  631 ctatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcct-tacatattttggtcttttccgttagtttg 728  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  28688017 ctatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccggtacacattttggtcatttccattagtttt 28688116  T
Q  729 aattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||    
T  28688117 aattcaaaaacgtt 28688130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 31513866 - 31513999
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| |||||   |||||     
T  31513866 taaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttgattctttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctctatgttacac 31513965  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  31513966 attttggtccttccagttagttttaattcaaaaa 31513999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 600 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 38911608 - 38911539
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  38911608 tttaggctaaattgtattttttgtcctttaattatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaatt 38911539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 54247275 - 54247359
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  54247275 taaattgcattttta-tcccttaactatttaaatagtatcgctttggtccattgattaaaatttgatttattttggtcccttaact 54247359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 588514 - 588400
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttacatattttggtcttttccgtta 723  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||||| | ||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  588514 ttaactatttaattaatatcgcttcggttccttaattaaaatttgatttgttttggtatcttaattttctctctgttacacattttggtcctttacgtta 588415  T
Q  724 gtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| |||| |||||    
T  588414 gttttaattaaaaaa 588400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 13867047 - 13866971
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  13867047 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 13866971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 17102727 - 17102623
Alignment:
Q  640 tagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctc-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||   |||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17102727 tagtatcgctttggtccattaaataaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctcttatagattttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 17102628  T
Q  738 acgtt 742  Q
    |||||    
T  17102627 acgtt 17102623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 49529203 - 49529127
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  49529203 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 49529127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 622 - 739
Target Start/End: Original strand, 15862200 - 15862319
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggtcttttcc 719  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||     
T  15862200 gtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggtcatttct 15862299  T
Q  720 gttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  15862300 attagttttaattcaaaaac 15862319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31049124 - 31049073
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31049124 tttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31049073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 670
Target Start/End: Original strand, 33812723 - 33812790
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33812723 aggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttctttaattaaaattt 33812790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 724
Target Start/End: Original strand, 43899114 - 43899233
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  43899114 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtaacatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 43899213  T
Q  705 attttggtcttttccgttag 724  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43899214 attttggtcctttccgttag 43899233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 966993 - 967043
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  966993 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 967043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6099026 - 6098976
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6099026 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 6098976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13355772 - 13355722
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  13355772 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 13355722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Original strand, 33772013 - 33772133
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct---ccttacatattttggtcttttccgtta 723  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||| | |   | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33772013 ttaactatttaattagtattgcttttctttcttaattaaaattttatttattctggtattttaactttatttccgttacacattttggtcttttccgtta 33772112  T
Q  724 gtttgaattcaaaaacgttgg 744  Q
    |||| |||| ||||| |||||    
T  33772113 gttttaattaaaaaatgttgg 33772133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32309645 - 32309600
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  32309645 gtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 32309600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 43844482 - 43844433
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcc 656  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43844482 taaattatttttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcc 43844433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 669
Target Start/End: Original strand, 49222040 - 49222101
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  49222040 aaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgcttcggtcttttaattaaaatt 49222101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 705 - 742
Target Start/End: Original strand, 51311693 - 51311730
Alignment:
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51311693 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 51311730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 967514 - 967474
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  967514 ttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaactaaaa 967474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 667
Target Start/End: Original strand, 27801484 - 27801552
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  27801484 attttggttaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaa 27801552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 661
Target Start/End: Original strand, 588251 - 588310
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaa 661  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  588251 taggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcccttaa 588310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 670
Target Start/End: Original strand, 7274656 - 7274719
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7274656 taaattgcatttttggtcccttaaatatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattt 7274719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Original strand, 17273874 - 17273917
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  17273874 ttacatattttggtctttttcgttagttttaattaaaaaacgtt 17273917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 20963663 - 20963596
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  20963663 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggt 20963596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 670
Target Start/End: Original strand, 44316630 - 44316693
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||    
T  44316630 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaattt 44316693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 669
Target Start/End: Original strand, 7937666 - 7937708
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7937666 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 7937708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 12739891 - 12739941
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12739891 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 12739941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 12739977 - 12740027
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12739977 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 12740027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24243042 - 24242992
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24243042 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24242992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27990317 - 27990267
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27990317 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27990267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 32309147 - 32309197
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  32309147 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttgatcccttaactaaaa 32309197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 39198430 - 39198480
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39198430 ttttggtcccttaattatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 39198480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40503777 - 40503727
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  40503777 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 40503727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 45940228 - 45940278
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45940228 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45940278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45940725 - 45940675
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45940725 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45940675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 47872529 - 47872579
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  47872529 ttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttgctcccttaactaaaa 47872579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 50530630 - 50530680
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  50530630 ttttagtcccttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 50530680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 50531153 - 50531103
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50531153 ttttggtcccttaaatatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 50531103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 52609737 - 52609683
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52609737 atttttggtcccttaactatttaggtactatcgctttggtcccttaattaaaatt 52609683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5408438 - 5408389
Alignment:
Q  618 tttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5408438 tttattcccttaagtatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 5408389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 705 - 742
Target Start/End: Original strand, 7742878 - 7742915
Alignment:
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7742878 attttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgtt 7742915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 96)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12873436 - 12873294
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcct 699  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12873436 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaactctctcct 12873337  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  12873336 tacacattttggtcattttttttagttttaattcaaaaacgtt 12873294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 33542387 - 33542529
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa--ctctctccttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| ||||  |||||||||||||     
T  33542387 taaattgtatttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtattttaactctctctccttacac 33542486  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33542487 attttggtcatttttgttagttttaattcaaaaacgttagatt 33542529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 37393475 - 37393617
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||  |    
T  37393475 taggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctcaat 37393574  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37393575 tacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 37393617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 617 - 747
Target Start/End: Original strand, 12873070 - 12873202
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtct 714  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||     
T  12873070 ttttaatcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttaatttattttggtttcttaacttctctccgttacacattttgatcc 12873169  T
Q  715 tttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  12873170 tttccgttagttttaattcaaaaatgttagatt 12873202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 604 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 35486249 - 35486104
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctta 701  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  35486249 ggttagattgcatttttggtcccctaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttagtatcttaactttctctcctta 35486150  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||  || || || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35486149 caccttgtgctcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagatt 35486104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 632 - 738
Target Start/End: Original strand, 410397 - 410505
Alignment:
Q  632 tatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacatattttggtcttttccgttagtttga 729  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  410397 tatttaattagtatcgcgttggtctcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttacatattttggtcatttccgttagtttta 410496  T
Q  730 attcaaaaa 738  Q
    |||||||||    
T  410497 attcaaaaa 410505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 600 - 739
Target Start/End: Original strand, 30650186 - 30650327
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||||    
T  30650186 tttaggctaaattgcatttttagtcctctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggttccttaacttctctcc 30650285  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  30650286 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaac 30650327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 24457042 - 24456898
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||||    
T  24457042 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgccttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcc 24456943  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24456942 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 24456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 39240405 - 39240265
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  39240405 ggttaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgttttggtctcttaattaaaatttaatttattttggtctcttaacttctttccgtta 39240306  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39240305 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 39240265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Original strand, 40094473 - 40094620
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtattttta-gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  40094473 aggttaaattgcatttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggttccttaacttctctccgt 40094572  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  40094573 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaagaacgttagatt 40094620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 9495406 - 9495269
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||      
T  9495406 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtccgttaattaaagtttgatttattttggtcccttaacttctctccgttactc 9495307  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9495306 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 9495269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 31230624 - 31230753
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  31230624 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggt 31230723  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31230724 cctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 31230753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 23244515 - 23244655
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||    
T  23244515 ggttaaattgcatttttggtccactaaccatttatgtagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgtta 23244614  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23244615 cacattttggtcgtttccgttagttttaattcaaaaacgtt 23244655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 591 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3869348 - 3869190
Alignment:
Q  591 taagaataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||   |||| ||  |||||    
T  3869348 taagattaattaaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttttttttgtcccttaa 3869249  T
Q  691 c-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3869248 cttctctccgttacactttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 3869190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 8653939 - 8654076
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctc--tccttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| ||  |  ||||||    
T  8653939 taaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaactttcatttgttacat 8654038  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8654039 attttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 8654076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 603 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 39912306 - 39912168
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  39912306 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccatt 39912207  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39912206 acacattttagtcatttccgttagttttaattcaaaaac 39912168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1826174 - 1826037
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  1826174 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 1826075  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1826074 attttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgtt 1826037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1860619 - 1860482
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  1860619 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 1860520  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1860519 attttggtcctttacattagttttaattcaaaaacgtt 1860482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 8654323 - 8654182
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| ||||||| ||    
T  8654323 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatattgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttgctcccttaacttctctccgtt 8654224  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8654223 acacattttggtactttccgttagttttaattcaaaaacgtt 8654182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 595 - 742
Target Start/End: Original strand, 18017781 - 18017930
Alignment:
Q  595 aataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tc 693  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||   ||||| ||    
T  18017781 aataatttaggctaaattgcatatttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcacttaattaaaattcaatttattttggtcctttaacttc 18017880  T
Q  694 tctc-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18017881 tctctgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 18017930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21515575 - 21515446
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggt 712  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  21515575 atttttagtcttttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacatattttggt 21515476  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  21515475 catttccgttagctttaattcaaaaacgtt 21515446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 37393860 - 37393723
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  37393860 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 37393761  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37393760 attttggtcatttccgtaagttttaattcaaaaacgtt 37393723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 26736125 - 26736265
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||  |||    
T  26736125 ggttaaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttttttaaaatttaatttattttggtcccttaccttctctctgtta 26736224  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26736225 cacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 26736265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35224161 - 35224013
Alignment:
Q  596 ataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tct 694  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| |||    
T  35224161 ataatataggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagttagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttct 35224062  T
Q  695 c-tccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35224061 ctttgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 35224013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 11198594 - 11198451
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| |||||||     
T  11198594 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccg 11198495  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  11198494 ttacacattttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgtt 11198451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 14920792 - 14920657
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatat 706  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||    
T  14920792 aattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 14920693  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  14920692 tttggtcatttctgttacttttaattcgaaaacgtt 14920657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 23244904 - 23244761
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cc 698  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||||| |  |||||| |||||       
T  23244904 ttaggttagattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttagttaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctatg 23244805  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23244804 ttacatattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 23244761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18914634 - 18914492
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  |||||     
T  18914634 taaattgcatttttggtcccctaactatttaggtagcatcgctcttgtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 18914535  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18914534 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 18914492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 30568659 - 30568525
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||  |||||  | ||||| |||||     
T  30568659 taaattgtatttttggtcccttaactatttagttagtatcgatttggtcccttatttaaaatttgatttattttggtcccttaatttttctccgttacac 30568560  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30568559 attttgatcatttccgttagttttaattcaaaaac 30568525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 18018169 - 18018032
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||   ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  18018169 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtattgctttgctcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 18018070  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18018069 attttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgtt 18018032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28207143 - 28206999
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctc 697  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||   |||||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||| ||    
T  28207143 tttaggctaaattgcatttttgatcccttaattattttgctagtatcgctttgaccccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatc 28207044  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28207043 gttacaaattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaacgtt 28206999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 33542747 - 33542634
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  33542747 ttaattatttaattaatatcgctttggtcatttaattaaaatttgatttattttgatttcttaacttctctccgttacatattttggtcctttatgttag 33542648  T
Q  725 tttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||||    
T  33542647 ttttaattcaaaaa 33542634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 40040165 - 40040302
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||     
T  40040165 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtaccttaattaaaattcgatttattttgttcccttaacttctctccgttacac 40040264  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40040265 attttggccctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 40040302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40094850 - 40094721
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  40094850 atttttggtcccttaactatttaattagtactgttttggtcctttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaacttctctccgttacactttttggt 40094751  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40094750 catttccgttagttttaattcaaaaacgtt 40094721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Original strand, 5416810 - 5416957
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||| | ||||| ||| ||  |    
T  5416810 taggctaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgttttggtcctctaattaaaattcgattgattttggtcttttaacttctttctgt 5416909  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5416910 tacacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagatt 5416957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 5417188 - 5417059
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||  |||||||   |||| || || ||||||||    
T  5417188 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttcttctcgttgcacattttggt 5417089  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5417088 catttccgttagttttatttcaaaaacgtt 5417059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 597 - 737
Target Start/End: Original strand, 11639045 - 11639187
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc 695  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| || ||||||| ||||    
T  11639045 taatataggctaaattgtattttttgtcccttaactatttaggtagcgtcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaacttctc 11639144  T
Q  696 tcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  11639145 tccgttacacattttggtcattttcgtaagttttaattcaaaa 11639187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 28206769 - 28206906
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa--ctctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||| || |||||     
T  28206769 taaattgaatttttggtcccataactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatgtattttggtatcttaattttctatcgttacac 28206868  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  28206869 attttgatcctttatgttagttttaattcaaaaacgtt 28206906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 410725 - 410608
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  410725 ttaactattttattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaccttctctctattacacattttggtccttttcgtttg 410626  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  410625 ttttaattcaaaaacgtt 410608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 18622110 - 18621997
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  18622110 ttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatctgttacacattttgctcttttccgttag 18622011  T
Q  725 tttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||||    
T  18622010 ttttaattcaaaaa 18621997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 31230988 - 31230859
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||||||| ||||   ||||| ||||||||    
T  31230988 atttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaacttctctttgttacacattttggt 31230889  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31230888 cctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 31230859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 738
Target Start/End: Original strand, 44254888 - 44255001
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| || ||  ||||| ||||| || |||||||||||    
T  44254888 ttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttctgttacacattttagtgttttccgttag 44254987  T
Q  725 tttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||||    
T  44254988 ttttaattcaaaaa 44255001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 747
Target Start/End: Original strand, 14920416 - 14920556
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc---ttacata 705  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||   |||||||    
T  14920416 aattgcatttttggttccttaactatttaggtagtattgttttggtcatttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact-tctccctgttacata 14920514  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14920515 ttttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 14920556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 758733 - 758590
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac---tctctc 697  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||  ||||||   |||||     
T  758733 ttaggctaaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtccttaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctctg 758634  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  758633 c-tacacattttagtcatttccattagttttaattcaaaaacgtt 758590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 26217073 - 26217214
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctc-tccttacat 704  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |  |||||     
T  26217073 taaattatttttttggtcccttaactatttaagtagtatcattttggccctttaattaaaatttaatttattttggtcccttaactcctctttgttacac 26217172  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26217173 a-tttcgtcctttccgttagttttaatttaaaaacgttggatt 26217214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 119120 - 119256
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||  ||||||||| || |||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  |||||     
T  119120 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattactttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtc-cttaacttctctctgttacac 119218  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  119219 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 119256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 758343 - 758484
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt-aactctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||| || ||||||  ||    
T  758343 aggttaaattgcatttttggccccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattaaatttattttgatcccttaaattctctctgtt 758442  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  758443 acacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgtt 758484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 39240033 - 39240166
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| |||| || |||||     
T  39240033 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttgattccttaacttctcttcgttacac 39240132  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39240133 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 39240166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 5525882 - 5526009
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctccttacatattttggtc 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||| || | ||| |||| | ||||||| |    
T  5525882 atttttagtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtccctttacttatct-cttatacattttggcc 5525980  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5525981 atttcctttagttttaattcaaaaacgtt 5526009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 29027357 - 29027213
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||||     
T  29027357 ttaggctaaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccg 29027258  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||| |||||||    || ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29027257 ttacacattttgg----tttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 29027213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 24456737 - 24456799
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24456737 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 24456799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 44255254 - 44255112
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||  | | || | |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||| | |||    
T  44255254 aattaaggctaaaatgtatttttgatcctttaactatttaggtgggattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttatct 44255155  T
Q  697 c-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  44255154 ctgttacacattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaa 44255112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 6843493 - 6843637
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatct--taac-tctctc- 697  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||  |||| ||||||     
T  6843493 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactatgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttataacttctctct 6843592  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6843593 gttacacattttggtcatttctgttagttttaattaaaaaacgtt 6843637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Original strand, 30872781 - 30872919
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcctt- 700  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||| ||     
T  30872781 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaact-tctctttg 30872879  T
Q  701 --acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
      ||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  30872880 taacacattttggtcatttctgttagttttaattaaaaaa 30872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 742
Target Start/End: Original strand, 35485866 - 35486011
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc 698  Q
    ||||||| |||||| | |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |  |||||||||| |||||| ||||     
T  35485866 atttaggctaaattatgtttttgatcccttaactattcaattaatatcgctttagtcccttaattaaaatttgttttattttggtatattaact-tctct 35485964  T
Q  699 tt---acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||   | | ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  35485965 ttgtcaaacattttggtcattttcattagttttaattcaaaaacgtt 35486011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 36344345 - 36344281
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36344345 ttaaattgcattttttatcctttaactatttaggtagtattgctttggtcttttaattaaaattt 36344281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 43633135 - 43633186
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43633135 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 43633186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 7042012 - 7041875
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||     |||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |  |    
T  7042012 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttatatagtatcgctttggtccctt-----aaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgt 7041918  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7041917 tacacattttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgtt 7041875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14897441 - 14897391
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14897441 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 14897391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Original strand, 39911928 - 39912062
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||| ||||||  || |||| ||||||||  ||||||||||||   |  ||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  39911928 attttttgtcccttaattatttagatattatctctttggtcgcttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttctctccgttatatattttggt 39912027  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39912028 cctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 39912062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 44678595 - 44678534
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44678595 taaattgtatttttgttcctt-aactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaatt 44678534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 26736488 - 26736371
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcct-tacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||   |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  26736488 ttaactatttagatagtattgatttggtcctttaattaaaattcgatttattgtggtcctttaacttctcttcgatacacattttggtcatttccgttag 26736389  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26736388 ttttaattcaaaaacgtt 26736371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Original strand, 33098605 - 33098650
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  33098605 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 33098650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 44678320 - 44678405
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  44678320 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtttcttaact 44678405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11639339 - 11639291
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  11639339 ttacatattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgttagatt 11639291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 595 - 683
Target Start/End: Original strand, 15740604 - 15740692
Alignment:
Q  595 aataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||||||| || | |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  15740604 aataattttggcttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 15740692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 641 - 738
Target Start/End: Original strand, 18914296 - 18914396
Alignment:
Q  641 agtatcgctttggtcctttaatt-aaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  18914296 agtatcgctttggttctttaattaaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttcagttagttttaattcaaaa 18914395  T
Q  738 a 738  Q
    |    
T  18914396 a 18914396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 670
Target Start/End: Original strand, 21512411 - 21512478
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21512411 taggctaaattgtatttttcgtcccttaactattt-aggagtatcgctttagtccattaattaaaattt 21512478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36032528 - 36032488
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36032528 ttaagtatttaattggtatcgctttggtcctttaattaaaa 36032488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 699 - 747
Target Start/End: Original strand, 36344058 - 36344106
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36344058 ttacacattttggtctttttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 36344106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3444166 - 3444115
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3444166 tttttggtcccttaagtatttaattagtatcgctttggtcccttaactaaaa 3444115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 747
Target Start/End: Original strand, 9495106 - 9495177
Alignment:
Q  678 tttggtatcttaact-ctctc-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9495106 tttggtctcttaacttctctctcttataaattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 9495177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 31988526 - 31988577
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31988526 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31988577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 40229102 - 40229153
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  40229102 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 40229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 761406 - 761456
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  761406 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 761456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 2221607 - 2221657
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2221607 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 2221657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2222011 - 2221961
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  2222011 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 2221961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 669
Target Start/End: Original strand, 7041648 - 7041694
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7041648 tcctctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 7041694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 7116485 - 7116535
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7116485 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 7116535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9739830 - 9739780
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  9739830 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 9739780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 11713213 - 11713263
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  11713213 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 11713263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 13089451 - 13089501
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  13089451 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 13089501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 16645931 - 16645869
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16645931 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaatt 16645869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 22013475 - 22013525
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22013475 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 22013525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 26060119 - 26060169
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26060119 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 26060169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27786530 - 27786480
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27786530 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27786480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 31445682 - 31445732
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31445682 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31445732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31988945 - 31988895
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  31988945 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggccctttaactaaaa 31988895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 36142560 - 36142610
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36142560 ttttggtccattaactatttaattggtatcgctttgatcctttaactaaaa 36142610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 37035403 - 37035453
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  37035403 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37035453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 41154630 - 41154680
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  41154630 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 41154680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 41155059 - 41155009
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  41155059 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 41155009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 42193792 - 42193842
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42193792 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 42193842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 43086401 - 43086451
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  43086401 ttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaactaaaa 43086451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 45123233 - 45123283
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45123233 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45123283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45123660 - 45123610
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  45123660 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcctttaactaaaa 45123610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 136)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4550988 - 4550846
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  4550988 taggctaaattgcatttttggtctcttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctcct 4550889  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  4550888 tacacattttggtcctttccgttaggttaaattcaaaaacgtt 4550846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 20260768 - 20260625
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc--tctcc 698  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  20260768 ttaggctaaattgcatttttagtcccttaattatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatctgatttattttggtatcttaactctctctcc 20260669  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20260668 ttacatattttggtcatttttgttagttttaatttaaaaacgtt 20260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 608 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 40703247 - 40703106
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  40703247 aaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttagttaaaatttgatttattttggcatcttaactttctctccttacaca 40703148  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  40703147 ttttggtccttttcgttagttttaatttaaaaacgttagatt 40703106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24590608 - 24590466
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||  |||||     
T  24590608 taaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttctctctgttacac 24590509  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24590508 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 24590466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 27209532 - 27209395
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||     
T  27209532 taaattgcatttttggtcccttgacaatttaattagtatcgttttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttgcac 27209433  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  27209432 attttggtcctttccgttaattttaattaaaaaacgtt 27209395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 32564337 - 32564200
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcctt 700  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||| || ||    
T  32564337 taggctaaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctatcgtt 32564238  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32564237 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 32564200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34622022 - 34621881
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  34622022 aggttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctttccgtt 34621923  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34621922 acacattttggtcatttcagttagttttaattcaaaaacgtt 34621881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Original strand, 29256831 - 29256977
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||  ||    
T  29256831 aggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgtt 29256930  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29256931 acacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgttagatt 29256977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Original strand, 40533927 - 40534065
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttaca 703  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | ||||||||| | ||||| |||||    
T  40533927 ttaaattgcatttttagtctcttaactatttaattagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttatttcgctatcttaacttttctccattaca 40534026  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40534027 cattttggtcatttccgttagttttaatttaaaaacgtt 40534065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 597 - 742
Target Start/End: Original strand, 27209162 - 27209309
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc-tc 695  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||    
T  27209162 taattaaggctaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttatc 27209261  T
Q  696 tcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | | ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27209262 ttcgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaccgtt 27209309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 34621620 - 34621761
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcctt 700  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||  |||||  |||||||||  | |||||||    
T  34621620 aggttaaattgcatttttgatcctttaattatttaattagtatcgttttggtctcttaattaaaattttatttattttaatatcttaactttttctcctt 34621719  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  34621720 acacattttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgtt 34621761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 9881550 - 9881691
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcctt 700  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||| ||    
T  9881550 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccctaaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcgtt 9881649  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  9881650 acacattttggtcttttccattaattttaattcaaaaacgtt 9881691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 600 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 23281400 - 23281251
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  | |||| ||||||     
T  23281400 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccataacttctctct 23281301  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23281300 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 23281251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 6181616 - 6181756
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tta 701  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||   |||||| |||||| |||    
T  6181616 ggttaaattgcatttttgatcccttaattatttagttagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccatta 6181715  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6181716 catattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 6181756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 37199311 - 37199167
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||| ||||  |||||| |||||||    
T  37199311 tttaggttaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattctggtcccttaacttctctcc 37199212  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37199211 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 37199167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 33753221 - 33753365
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc- 698  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   |||||| |||||     
T  33753221 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaact-tctccc 33753319  T
Q  699 --ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33753320 agttacacatttttgtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33753365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 45305799 - 45305656
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc-c 698  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||||||||      
T  45305799 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaactctctctg 45305700  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  45305699 ttacacattttggtcatttacgttagttttaattaaaaaacgtt 45305656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 11787743 - 11787885
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||  |||||| ||||||| ||| |     
T  11787743 taaattgaatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgaattattttggtcccttaacttctctccgttatac 11787842  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11787843 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 11787885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Original strand, 13944509 - 13944647
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||  |||||| ||||||| |    
T  13944509 taggttaaattgcatttttggtcctttaactatttagctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttatattggtcccttaacttctctccat 13944608  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  13944609 taaacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaa 13944647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 16268077 - 16267936
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  16268077 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggt-ccttaacttctctccgt 16267979  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16267978 tacacattttggttctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 16267936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 28970422 - 28970556
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   | ||| ||||||  |||||     
T  28970422 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccatgaacttctctctgttacac 28970521  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28970522 attttggtcttttccgttagttttaattaaaaaac 28970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 603 - 723
Target Start/End: Original strand, 36884721 - 36884843
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| || |||| ||    
T  36884721 aggttaaattgtatttttgttcctttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttccctccatt 36884820  T
Q  701 acatattttggtcttttccgtta 723  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  36884821 acatattttggtcctttccgtta 36884843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10923746 - 10923609
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |||||     
T  10923746 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtggtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacac 10923647  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10923646 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 10923609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 16267718 - 16267855
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  16267718 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 16267817  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16267818 attttggtcattaccgttggttttaattcaaaaacgtt 16267855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 600 - 739
Target Start/End: Original strand, 25088012 - 25088153
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||     
T  25088012 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctct 25088111  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  25088112 gttacacattttggtcctttcggttagttttaattcaaaaac 25088153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 51691877 - 51692010
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||   ||||| ||||||  |||||     
T  51691877 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatctattttggtccattaacttctctctattacac 51691976  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51691977 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 51692010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 608 - 739
Target Start/End: Original strand, 51810141 - 51810274
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | ||||| ||||| |    
T  51810141 aaattgcatttttagtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgttacaca 51810240  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  51810241 ttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaac 51810274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1832050 - 1831910
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||  ||||| || ||||||| | ||||| |||    
T  1832050 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatatatgtagtatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttcgtctcttaacttttctccgtta 1831951  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1831950 tatattatggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 1831910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 3569379 - 3569517
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttaca 703  Q
    |||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||    |||||    
T  3569379 taaattatgtttttggtcccttaattatttaattagtatcgttttggttccttaattaaaatttgatatattttggtatcttaattttctctctgttaca 3569478  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3569479 cattttggtaatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 3569517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 14118526 - 14118670
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||||  ||||| | |||||    
T  14118526 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggttccttaattaaaattcgatttattttggtactttaacttttctcc 14118625  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14118626 gttacacattttagtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 14118670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 51692253 - 51692117
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctccttacata 705  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  51692253 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttggtccattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcgttacaca 51692154  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51692153 ttttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 51692117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 605 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10654414 - 10654275
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttac 702  Q
    ||||| ||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||    
T  10654414 gttaatttgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttac 10654315  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10654314 acattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 10654275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Original strand, 30293010 - 30293153
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cc 698  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||||       
T  30293010 ttaggttaaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtctctttattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctatg 30293109  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30293110 ttatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 30293153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Original strand, 18793702 - 18793836
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  18793702 atttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctattacacattttggt 18793801  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18793802 cctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 18793836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 5463493 - 5463368
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggt 712  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  5463493 atttttagtcccttaactatttagctagtatcgctttggtccgttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 5463394  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    | | || |||||||| ||||||||||    
T  5463393 cctctctgttagttttaattcaaaaa 5463368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33753598 - 33753462
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| |||||     
T  33753598 taaattgtattttg-gtcccataactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 33753500  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33753499 attttagtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33753462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 608 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 36657883 - 36657742
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacata 705  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||| ||  ||||| |    
T  36657883 aaattgtatttttggtcccttaactatttatgcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctgtctattacaca 36657784  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36657783 ttttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgttagatt 36657742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 37198935 - 37199072
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| || ||  |||||     
T  37198935 taaattgtatttttggtttcttaactatttaggcaatatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctatctgttacac 37199034  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37199035 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 37199072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 601 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 48702269 - 48702130
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc 698  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||  ||| ||     
T  48702269 ttaggctaaattgcatttttagtcccttaattattttgttagtatcgttttggtcctttaattaaaattggatttattttggtattttaactttctatcg 48702170  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  48702169 ttacacattttggtcattt-cgttggttttaattcaaaaac 48702130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 742
Target Start/End: Original strand, 49291012 - 49291133
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggtcttttccg 720  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||| ||||||    
T  49291012 tcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttttgttccttaacttctcttcattacacattttcgtcatttccg 49291111  T
Q  721 ttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  49291112 ttagttttaattcaaaaacgtt 49291133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 50574904 - 50574763
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||    
T  50574904 aggttagattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgtt 50574805  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50574804 acacattttggtcctttcggttagttttaattaaaaaacgtt 50574763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 4045095 - 4045239
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt-aactctctc- 697  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||| |  ||| || ||||||     
T  4045095 tttaggttaaattgtatttttagccccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttgatcccttaaattctctct 4045194  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  4045195 gttacacattttggtcatttccattgattttaattcaaaaacgtt 4045239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 42607522 - 42607662
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tta 701  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  |||    
T  42607522 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagataatatcgttttggtcccttaatttaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgtta 42607621  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42607622 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 42607662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 738
Target Start/End: Original strand, 50118347 - 50118483
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-ctta 701  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||  ||||||  |||    
T  50118347 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattacaattcgatttattttggtctcttaatttctctctgtta 50118446  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    || |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  50118447 cacattttgatcattttcgttagttttaattcaaaaa 50118483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21385325 - 21385182
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cc 698  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |  |||||| |||||       
T  21385325 ttaggctaaattgcacttttaatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttaatttattttgatcccttaacttctctatg 21385226  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21385225 taacacattttggtcatttccgttgattttaattcaaaaacgtt 21385182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 10654028 - 10654169
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| || ||| |    
T  10654028 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagta-cgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctgtccgt 10654126  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10654127 tacacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 10654169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 34028719 - 34028861
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tct-ctcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||| |||  |  |    
T  34028719 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcaatttattttggtcccttaacttctatttgt 34028818  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34028819 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 34028861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 52412973 - 52412839
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  52412973 atttttggtcccttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 52412874  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  52412873 catttccattagttttaattcaaaaacgttagatt 52412839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 6182004 - 6181863
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| |||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |    
T  6182004 taggctaaattgtatttttggtctcataactatttatgtagtatcgctttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgt 6181905  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6181904 tacacattttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgt 6181863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 604 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19886300 - 19886235
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19886300 ggttaaattgtatttttggtcctttaattatttaggtagtatcactttggtcctttaattaaaatt 19886235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 625 - 740
Target Start/End: Original strand, 21384958 - 21385074
Alignment:
Q  625 ctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgtt 722  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||  |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21384958 ctttaactatttatgtagtatcgcttttatcccttaattaaaattcgatttattttggtct-ttaacttctctccattacatattttggtcatttccgtt 21385056  T
Q  723 agtttgaattcaaaaacg 740  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  21385057 agttttaattcaaaaacg 21385074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 35986235 - 35986372
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||| ||  ||||     
T  35986235 taaattgcatttttgttcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctcgccgatacac 35986334  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  35986335 attttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 35986372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Original strand, 52412609 - 52412738
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  52412609 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctttgttacacattttggt 52412708  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  52412709 cctttccattagttttaattccaaaacgtt 52412738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 604 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 30293398 - 30293263
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cctta 701  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||   |||    
T  30293398 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggt-ccttaacttctctatgtta 30293300  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  30293299 cacattttggtattttccattagttttaattcaaaaa 30293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Original strand, 44222190 - 44222329
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||| |    
T  44222190 taggttaaattgcatttttggtcctttaattatttatgtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccgt 44222289  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||||||    
T  44222290 tacacattttgattctttctgttagttttaattcaaaaac 44222329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 741
Target Start/End: Original strand, 4054551 - 4054688
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc-ttaca 703  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| |||  | ||||||||||||||  ||  |||||||| |||| ||  ||||||| |||||    
T  4054551 taaattgtatttttatccccttaactatttagatagtatcgatttaattctttaattaaaattcgatttattttggtctctttactttctctccgttaca 4054650  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4054651 cattttagtcttttacgttagttttaattcaaaaacgt 4054688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 5117996 - 5118058
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5117996 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctttaattaaaatt 5118058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11788123 - 11787982
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | ||||| |||||     
T  11788123 taaattgcatttttggtcttttaattatttaagcagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttatctccattacac 11788024  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11788023 attttgctc-tttctgttagttttaattcaaaaacgttagatt 11787982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 19986510 - 19986372
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||   ||||| ||| || ||    
T  19986510 taggataaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtctcttaaataaaatttgatttattttggtcctttaacttctttctct 19986411  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19986410 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 19986372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 29257215 - 29257069
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctct 696  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||||   ||| ||||  ||||||||||| |||  ||||||||   |||||| ||||    
T  29257215 aatttaggtttaattgcatttttggtctcttaactatttagctagtattaattttgtcccctaattaaaattcaatttattttggtccattaacttctct 29257116  T
Q  697 cc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29257115 ccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 29257069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34029109 - 34028967
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  |    
T  34029109 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgt 34029010  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34029009 tatacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 34028967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 13944894 - 13944757
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactct-ctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||  |||||||| |||| ||| ||||||| ||||  ||  ||||||||  ||||||| | |||| |||||     
T  13944894 taaattgtatttttggtcccttaatcatttaggtagtatcgttttgatcccttaattagaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgttacaa 13944795  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13944794 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 13944757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22584735 - 22584602
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  22584735 taaattatatttttggtcccttaactaattaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 22584636  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  22584635 attttggtcatttccgttagttttaattaaaaaa 22584602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25088403 - 25088262
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc--- 698  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  | || |||  ||||||| |||||       
T  25088403 taggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcc-ttaactaaaattcgatttagttcggtcccttaact-tctccatg 25088306  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25088305 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 25088262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 40534288 - 40534223
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  40534288 ttaactatttaattagtatcgctttggtctcttaattaaaatttgatttatttcggtatcttaact 40534223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 14776118 - 14775981
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc---ttaca 703  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||  |||||||| |||||| | |||||   |||||    
T  14776118 taaattgcatttttggtcacttaactatttaggtagtatcgttttgttcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaaat-tctccctgttaca 14776020  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14776019 cattttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgtt 14775981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 24655586 - 24655726
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcctta 701  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||| |  |||    
T  24655586 ggttaaattgcatatttggtcccttaagtatttaggtagtatcgctttggtctcttaattaaaattcgattcattttggtctcttaacttctctttgtta 24655685  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24655686 cacattttgggcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 24655726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 607 - 741
Target Start/End: Original strand, 46949759 - 46949895
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tct-ctccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||  || |||||     
T  46949759 taaattgcatttttaattcattaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctattcgttacac 46949858  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46949859 attttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgt 46949895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 605 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 49291368 - 49291224
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctct-ccttac 702  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||  |||||   ||||    
T  49291368 gttaaattgcatttttcgtcccttaactatttagatagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaatttctctatgttac 49291269  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  49291268 acattttggtcatttcggttagttttgattcaaaaacgttagatt 49291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 747
Target Start/End: Original strand, 9119290 - 9119437
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cct 699  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| ||| | | |    
T  9119290 taggttaaattatattttttatcccttaactacttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctatacat 9119389  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    || | |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9119390 tatacattttgtttatttccgttagtttcaattcaaaaacgttagatt 9119437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 32517898 - 32517754
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcctt- 700  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||  |||||| |  || |||| ||||| ||     
T  32517898 aggttaaattgcatttttgatcccttatctatttaggtagtatcactttggt--tttaattaaaatttgatttattttgatccctcaacttctctcattt 32517801  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32517800 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 32517754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 40702871 - 40703001
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttacat 704  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||   |||||     
T  40702871 taaattatgtttttggtcccttaactatttaattagtatcac---ggtccctaaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctgagttacac 40702967  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40702968 attttgatctttttcgttagttttaattcaaaaa 40703001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 641 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 46950085 - 46949982
Alignment:
Q  641 agtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46950085 agtatcacattgctcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctcagttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 46949986  T
Q  739 cgtt 742  Q
    ||||    
T  46949985 cgtt 46949982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 10923365 - 10923503
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| |  |||||| | ||||| |||||     
T  10923365 taaattatatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaacttttctccgttacac 10923464  T
Q  705 attttggtcttttccgttagt-ttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  10923465 attttggtcatttcggttagtatttaattcaaaaacgtt 10923503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 11395043 - 11394901
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||| | | |||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  11395043 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagttttgttttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 11394944  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  11394943 attatggttatttccgttagttttaattcaaaaatgttagatt 11394901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 742
Target Start/End: Original strand, 22584357 - 22584491
Alignment:
Q  610 attgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatatt 707  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||    
T  22584357 attgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcacattggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacatt 22584456  T
Q  708 ttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  22584457 ttggtcctttccgttagttttaaatcaaaaacgtt 22584491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 669
Target Start/End: Original strand, 24590237 - 24590291
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24590237 atttttagtcacttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 24590291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 32563962 - 32564096
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| || ||  |||||     
T  32563962 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggctgtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttctgttacac 32564061  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  32564062 attttggtcatttccgttaattttaattcaaaaac 32564096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 34279243 - 34279380
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||   | || ||||      
T  34279243 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttcttttcgttacgc 34279342  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34279343 attttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgtt 34279380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34279624 - 34279502
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  34279624 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 34279525  T
Q  705 attttggtcttttccgttagttt 727  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  34279524 attttggtcctttccgttagttt 34279502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 35122275 - 35122325
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35122275 ttttggtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcccttaactaaaa 35122325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 46739106 - 46738973
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  | ||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  46739106 taaattgtattttt-gtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttactttggtcgcttaacttctctctgttacac 46739008  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46739007 attttagtcatttccgttagttttaattcaaaaac 46738973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 603 - 692
Target Start/End: Original strand, 19885981 - 19886070
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  19885981 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttttgtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaact 19886070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 692
Target Start/End: Original strand, 20260451 - 20260516
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  20260451 ttaactatttaattagtatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtattttaact 20260516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Original strand, 21036008 - 21036125
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||  |||||    
T  21036008 ttaactatttagatagtatcactttggtccattaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttaagttag 21036107  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  21036108 ttttaattaaaaaacgtt 21036125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 36657503 - 36657641
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa---ctctctcc-ttac 702  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||||   |||||||| ||||    
T  36657503 taaattgcatttttcgtcccctaactatttagtttgcatctcttgggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaactcctctctccgttac 36657602  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36657603 atatttt-gtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 36657641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 727
Target Start/End: Original strand, 1831661 - 1831789
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcc 698  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| ||     
T  1831661 ttaggctaaattgaattttcggtctcttaactatttaggtagtatcactttggtcttttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttct 1831760  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagttt 727  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1831761 ttacacattttggtcctttccgttagttt 1831789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 671
Target Start/End: Original strand, 6241276 - 6241320
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattta 671  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6241276 ttaactatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaattta 6241320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 683
Target Start/End: Original strand, 11797149 - 11797225
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  11797149 taaattgcatttttggtcctttaattatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattaaaattcaatttattttggt 11797225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18794083 - 18794012
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattag--tatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18794083 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatatcgctttggtcccttaattaaaatt 18794012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24655975 - 24655907
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  24655975 ttaggctaaattgcatttttagtctcttaactatttaagtagtatcgctttggtctcgtaattaaaatt 24655907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 30792754 - 30792686
Alignment:
Q  676 attttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30792754 attttggtcccttaacttctctccgttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 30792686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 45305412 - 45305550
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc---cttaca 703  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||   |||||| ||||    ||| |    
T  45305412 taaattgcatttttggtcagttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaagattcgatttattttggtcctttaactttctctctgttata 45305511  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45305512 ccttttggtcttttccgttacttttaattcaaaaacgtt 45305550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 727
Target Start/End: Original strand, 50574527 - 50574639
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtct 714  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||||     
T  50574527 tttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctattaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtca 50574626  T
Q  715 tttccgttagttt 727  Q
    |||||||||||||    
T  50574627 tttccgttagttt 50574639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6242732 - 6242689
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6242732 ttaactaattaattagtatcgctttggtcccttaattaaaattt 6242689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 52179417 - 52179366
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  52179417 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 52179366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6714748 - 6714698
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6714748 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 6714698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 30611218 - 30611360
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||  |    
T  30611218 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttagatattatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgt 30611317  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  30611318 tacataatttggtcatttctattagttttaattaaaaaacgtt 30611360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 32193530 - 32193580
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32193530 ttttaatcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 32193580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34023619 - 34023569
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  34023619 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 34023569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 683
Target Start/End: Original strand, 36077268 - 36077350
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  36077268 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcaatttattttggt 36077350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 39851187 - 39851237
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  39851187 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 39851237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 46448786 - 46448736
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  46448786 ttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 46448736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 50921063 - 50921205
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatctt-aactctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||  ||| |  ||||||  |||||     
T  50921063 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatccgatttattttggtcccttgatttctctctgttacac 50921162  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50921163 attttagtttttttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 50921205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Original strand, 28112718 - 28112786
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  28112718 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggttccttaattaaaatt 28112786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 7334455 - 7334506
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7334455 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 7334506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 663
Target Start/End: Original strand, 33784314 - 33784361
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaatt 663  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33784314 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaatt 33784361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 49548134 - 49548185
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  49548134 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 49548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 3798337 - 3798387
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3798337 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 3798387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3798755 - 3798705
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3798755 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 3798705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4045482 - 4045420
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4045482 taaattgcatgtttggtcccttaactatttaagtagtatcactttggtctcttaattaaaatt 4045420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 622 - 668
Target Start/End: Original strand, 6327959 - 6328005
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaat 668  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6327959 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaat 6328005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 6714215 - 6714265
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6714215 ttttggtccgttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 6714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14244605 - 14244555
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14244605 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 14244555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 597 - 667
Target Start/End: Original strand, 23598065 - 23598135
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  23598065 taatttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaa 23598135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24332359 - 24332309
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24332359 ttttggtcctttaactatttatttggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24332309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 24370128 - 24370178
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24370128 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24370178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 30611604 - 30611542
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30611604 taaattgtatttttgatcccttaactatttaggttgtatcgctttggtccctaaattaaaatt 30611542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 31488038 - 31488088
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31488038 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31488088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 669
Target Start/End: Original strand, 32517624 - 32517670
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32517624 tcctctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 32517670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 33784666 - 33784616
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  33784666 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 33784616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 35368869 - 35368919
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35368869 ttttggtcccttaaatatttaattggtatcgctttggtcccttaattaaaa 35368919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36967297 - 36967247
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  36967297 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttgggcccttaactaaaa 36967247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 37483067 - 37483117
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  37483067 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37483117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37483588 - 37483538
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  37483588 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 37483538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 38980099 - 38980049
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  38980099 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 38980049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39851586 - 39851536
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  39851586 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgttttggtcccttaattaaaa 39851536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44114563 - 44114513
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44114563 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 44114513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 45678725 - 45678775
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45678725 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45678775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 625 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45679294 - 45679252
Alignment:
Q  625 ctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  45679294 ctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 45679252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 46448230 - 46448280
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  46448230 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 46448280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 50138508 - 50138558
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  50138508 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 50138558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 50227959 - 50227909
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  50227959 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 50227909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 50921466 - 50921412
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50921466 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaagtaaaatt 50921412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 51902309 - 51902271
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtc 655  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51902309 ttttggtcctttaactatttaattggtatcgctttggtc 51902271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5537256 - 5537191
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  5537256 taggttaaattatatttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaa 5537191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Original strand, 2315602 - 2315719
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2315602 ttaactatttaattagtatcgctttggtcgcttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttacatattttggtcctttccgttag 2315701  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  2315702 ttttaattcaaaaacgtt 2315719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 24548244 - 24548386
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  24548244 taaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcgcttttgagccttagttaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccttacac 24548343  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24548344 attttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 24548386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 616 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24548615 - 24548482
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||    
T  24548615 tttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcctttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctgagttacacattttggtc 24548516  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24548515 cttttcgttagttttaattcaaaaacgttagatt 24548482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6220439 - 6220302
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  6220439 taaattgcatttttaatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccatcaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 6220340  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6220339 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 6220302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 12903224 - 12903361
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| | ||||| |||||     
T  12903224 taaattgtatttttggttctttaattatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttatctccattacac 12903323  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12903324 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 12903361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 599 - 742
Target Start/End: Original strand, 6220051 - 6220196
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc 698  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||    
T  6220051 atttagtttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattaatatcgctttcgtctcttaattaaaatttgatttattttggtcccttaact-tctcc 6220149  T
Q  699 ---ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
       ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6220150 ctgttacacattttggtcctttccgttagttttcattcaaaaacgtt 6220196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25551723 - 25551582
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcctt 700  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || ||    
T  25551723 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgtt 25551624  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25551623 acacatttaggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 25551582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 24604874 - 24605014
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc-ctta 701  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||  ||||||  |||    
T  24604874 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttacttctctctgtta 24604973  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24604974 cacgttttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 24605014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 2814674 - 2814560
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||    
T  2814674 ttaactatttaattagtatcgctttggttctttaattaaaatttgatttattttggtttcttaacttctctctgttacacattttgattctttccgttag 2814575  T
Q  725 tttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| |||||||||||    
T  2814574 ttttaattcaaaaac 2814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 3338475 - 3338617
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |    
T  3338475 taggctaaattgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgt 3338574  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3338575 tacacattttgctcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 3338617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 31029523 - 31029664
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cctt 700  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||| | ||    
T  31029523 aggttaaattgcatttttgatcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctgcgtt 31029622  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31029623 acacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 31029664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 32283029 - 32283114
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  32283029 taaattatatttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaact 32283114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1158983 - 1158837
Alignment:
Q  596 ataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctc 695  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||  ||||| | ||    
T  1158983 ataatttaggctaacttgcatttttggtaccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccttaatt-aaatttgatttattttggtcccttaattatc 1158885  T
Q  696 tcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1158884 tccgttatacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 1158837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 3289293 - 3289156
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  3289293 taaattgcatttttggtccctaaactatttaggtaatatcgctttggtgccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttacac 3289194  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3289193 attttggtgttttctgttagttttaattcaaaaacgtt 3289156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Original strand, 11524708 - 11524793
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||||    
T  11524708 taaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaact 11524793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 11525157 - 11525012
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctc-t 696  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| || |    
T  11525157 aattaaggctaaattgcatttttggtcccttaacaatttaggtagtatcggtttggtcccttatttaaaattcaatttattttggtctcttaactttcct 11525058  T
Q  697 ccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11525057 tgttacacattttggtcatttccgttagttttaattaaaaaacgtt 11525012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 29009957 - 29010094
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |   |||| |||  |||||| |||||||  ||||     
T  29009957 taaattgaatttttggtcccttaactatttacgtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgaattatttcggtcccttaacttctctccgctacac 29010056  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29010057 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 29010094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 742
Target Start/End: Original strand, 33346497 - 33346618
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtcttttccg 720  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  33346497 tcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttgatcctttccg 33346596  T
Q  721 ttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  33346597 ttaattttaattcaaaaacgtt 33346618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 738
Target Start/End: Original strand, 33544821 - 33544958
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||  ||    
T  33544821 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctatctgtt 33544920  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33544921 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 33544958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33545212 - 33545068
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc 698  Q
    |||||| |||||| ||||||| || | |||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||| |    
T  33545212 tttaggctaaattatatttttggtgcattaactatttaggtagtatcactttgatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttc 33545113  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33545112 gttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33545068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 14337284 - 14337143
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||  ||||| | || ||| |||||     
T  14337284 taaattgcattttta-tcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttagttaaaatttgatttattttggtcccttaaattctttccgttacac 14337186  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14337185 attttggtcttttccgttaattttaattcaaaaacgttagatt 14337143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 25551350 - 25551484
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||  |||||| | ||||  |||||     
T  25551350 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattgaaatttgatttattttagtcccttaacttttctctgttacac 25551449  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25551450 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 25551484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 747
Target Start/End: Original strand, 1158599 - 1158735
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacatattttggt 712  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  ||||| || |||||    
T  1158599 atttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacatgttggt 1158698  T
Q  713 cttttcc--gttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    | |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1158699 cctttccgtgttagttttaattcaaaaacgttagatt 1158735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 9173904 - 9174041
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||  |||||     
T  9173904 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacac 9174003  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9174004 attttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgtt 9174041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 14336905 - 14337042
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| |||| |  ||| |     
T  14336905 taaattgcatttttgatcccttaattatttagctagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttgttatac 14337004  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14337005 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 14337042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 2949292 - 2949431
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcct 699  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||||   |  |    
T  2949292 tttaggctaaattgcattttttgtccgttaactatttaagtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaact---ttgt 2949388  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  2949389 tacacattttggtcctttccagtagttttaattcaaaaacgtt 2949431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 649 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 33972547 - 33972451
Alignment:
Q  649 tttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttg 743  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33972547 tttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttg 33972451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 738
Target Start/End: Original strand, 11524778 - 11524901
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacatattttggtct 714  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| |||     
T  11524778 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacctctctccgttacacattttagtcc 11524877  T
Q  715 tttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||    
T  11524878 tttctgttggttttaattcaaaaa 11524901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 3288933 - 3289070
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  | |||| ||||||| |||||     
T  3288933 taaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccctaacttctctccattacac 3289032  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3289033 attttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 3289070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 7537979 - 7537854
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | |||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  7537979 ttttttgtcccttaactatttaagtggtatcgcttttgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccataacttctctcggttacacattttggtc 7537880  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     |||| |||||||| |||||||||||    
T  7537879 ctttctgttagttttaattcaaaaac 7537854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 742
Target Start/End: Original strand, 29999485 - 29999553
Alignment:
Q  676 attttggtatcttaact--ctctccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  29999485 attttggtatcttaactttctctccttacatattttggtcattttcgttagttttaattaaaaaacgtt 29999553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 29999766 - 29999701
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29999766 ttaactatttaattagtatcgctttagtcccgtaattaaaatttgatttattttggtatcttaact 29999701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 33329209 - 33329346
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |||||     
T  33329209 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctccccgttacac 33329308  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33329309 attttggtcctttctattagttttaattcaaaaacgtt 33329346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 623 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35119178 - 35119057
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctcc-ttacatattttggtcttttccg 720  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  35119178 tcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaatttctctccgttacacattttggtcctttctg 35119079  T
Q  721 ttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  35119078 ttaattttaattcaaaaacgtt 35119057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 598 - 690
Target Start/End: Original strand, 17544448 - 17544539
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  17544448 aattttggttaaattgcattttt-gtcccttaactattttgctaatatcgctttggtcctttaattaaaatttgatttattttagtatcttaa 17544539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 17544840 - 17544702
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa--ctctctcct 699  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |   ||| || |    
T  17544840 taggttaaattgcattttt-gtcccgtaactattttgctaatatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttgattttctatcgt 17544742  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||    
T  17544741 tacatattttgatcctttctgttagttttaattcaaaaac 17544702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 19135835 - 19135692
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  |||||||| |||| ||  ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||     
T  19135835 ttaggctaaattgcatttttggtccattaagtatttaggtagtatcgttttgatctcttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccg 19135736  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  19135735 ttacacatgttggtcctttccattagttttaattaaaaaacgtt 19135692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33548240 - 33548177
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33548240 taaattgaatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggccccttaattaaaattt 33548177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 29467330 - 29467277
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29467330 ttttcgtcccttaactatttatttagtattgctttggtcctttaattaaaattt 29467277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 35132604 - 35132741
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||  || ||     
T  35132604 taaattgcatttttggtccattaactatttaggtagtatcgctttggtcccataattaaaattagatttattttggtcctttaacttctctctgttgcac 35132703  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35132704 attttgatcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 35132741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 3618793 - 3618844
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  3618793 tttttagtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 3618844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 13156128 - 13156085
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13156128 ttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 13156085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 13160984 - 13160941
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13160984 ttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 13160941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 3338858 - 3338796
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  3338858 taaattttatttttggtcccttaactatttaagtagtatcgttttgatcccttaattaaaatt 3338796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 697
Target Start/End: Original strand, 7162398 - 7162456
Alignment:
Q  639 ttagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc 697  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7162398 ttagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctc 7162456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Original strand, 22498402 - 22498447
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22498402 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 22498447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 17245707 - 17245631
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  17245707 taaattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 17245631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17971882 - 17971819
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||| ||||    
T  17971882 ttaactattttagtagtatcgctttggtcccttaattcaaatttgttccattttggtattttaa 17971819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 13155842 - 13155904
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13155842 taaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatt 13155904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 13160698 - 13160760
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13160698 taaattatatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatt 13160760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14527562 - 14527512
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14527562 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 14527512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 17383748 - 17383798
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17383748 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 17383798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 18683563 - 18683613
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  18683563 ttttagttccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 18683613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 21271499 - 21271549
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  21271499 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 21271549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21272164 - 21272114
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  21272164 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 21272114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22498812 - 22498762
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22498812 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 22498762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 615 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24605248 - 24605194
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24605248 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatt 24605194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26392890 - 26392840
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26392890 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 26392840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31739960 - 31739910
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31739960 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31739910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 6229769 - 6229720
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcc 656  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6229769 taaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc 6229720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 14673729 - 14673684
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaa 661  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14673729 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaa 14673684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Original strand, 29465768 - 29465821
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  29465768 ttttcgtcccttaactaattaattagtatcactttggccccttaattaaaattt 29465821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32993467 - 32993402
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  32993467 taggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaa 32993402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 9657670 - 9657807
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||  ||||||||||||     
T  9657670 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatatcttaactttctctccttacac 9657769  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9657770 attttagtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 9657807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 9658030 - 9657893
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  9658030 taaattatatttttgatcccttaactatttaattagtatcgttttggtcccctaattaaaatttaatttattttggtatcttaactttctctccttacac 9657931  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9657930 attttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 9657893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 601 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 11102364 - 11102224
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc 698  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||    
T  11102364 ttaggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtatcttaactttctctcc 11102265  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  11102264 gttacacattttggtcatttacgttagttttaattcaaaaa 11102224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1157592 - 1157452
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | ||||| |||    
T  1157592 ggttaaattgtatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctccgtta 1157493  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1157492 cacattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 1157452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 22831185 - 22831043
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct---cct 699  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||   | |    
T  22831185 aggttaaattggatttttggtcccttaactattttgctagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctatccat 22831086  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22831085 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 22831043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 44169982 - 44170116
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctct---ccttaca 703  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||   | |||||    
T  44169982 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgctttggtcccttgattaaaatttgatttattttagtatcttaactttctatccgttaca 44170081  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44170082 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 44170116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 29864558 - 29864416
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| || ||  |||||     
T  29864558 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctatctgttacac 29864459  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29864458 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 29864416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 45911579 - 45911719
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||    
T  45911579 ggttaaattgcatttttggttcattaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgtta 45911678  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45911679 cacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 45911719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Original strand, 25058830 - 25058973
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc- 698  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||       
T  25058830 ttaggttaaattgcattttttgtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctctatg 25058929  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058930 ttacacattttgctcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 25058973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 600 - 739
Target Start/End: Original strand, 38866394 - 38866535
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctc 697  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||  |||||||   || |    
T  38866394 tttaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaactaaaatttgatttattttggttccttaacttcttccc 38866493  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38866494 gttacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaac 38866535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 604 - 738
Target Start/End: Original strand, 2738880 - 2739016
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||    
T  2738880 ggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctatta 2738979  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2738980 cacattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaa 2739016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33882331 - 33882195
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | ||||| ||||| |    
T  33882331 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttttctccgttacaca 33882232  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33882231 ttttggtcctttccgttagtcttaattcaaaaacgtt 33882195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Original strand, 43316872 - 43317019
Alignment:
Q  596 ataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tct 694  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| | |    
T  43316872 ataatttaggctaaattgtatttttggtcctt-aactattaaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattttatttattttggtcccttaacttat 43316970  T
Q  695 c-tccttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43316971 ctttgttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 43317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 45911957 - 45911815
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||| | ||||||  |||||     
T  45911957 taaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtctcttatcttctctctgttacac 45911858  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45911857 attttggtcttttccgttagttttaatttaaaaacgttagatt 45911815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 52914950 - 52915092
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |    
T  52914950 taggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgt 52915049  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  52915050 tacacattttggtcctttcggttaattttaattcaaaaacgtt 52915092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 25977768 - 25977909
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttag-tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  || |||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  25977768 ggttaaattgtattttttggtcccttaactatctaggtactatcgctttggtctctcaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctccgtt 25977867  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25977868 acatattttggtcttttccattagttttaattcaaaaacgtt 25977909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 27347600 - 27347737
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |||||     
T  27347600 taaattatatttttggtcccttgactatttagatagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgttacac 27347699  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27347700 attttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgtt 27347737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 44170364 - 44170225
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||| ||| |||||    
T  44170364 taaattgcatttttgatcccttaactatttaattagtattgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggtattttaactttctatccgtacat 44170265  T
Q  705 a--ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44170264 attttttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgtt 44170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 15985465 - 15985607
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc-ct-- 699  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || ||      
T  15985465 aggttaaattgcatttttggtctcttaactattttgctagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttttctctaa 15985564  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15985565 tacacattttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgtt 15985607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 9010888 - 9010754
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  9010888 taaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatctctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacat 9010789  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  9010788 attttggttacttccgttagttttaattcaaaaac 9010754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 40067731 - 40067594
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc--ttacat 704  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||||   |||  |||||     
T  40067731 taaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttcttcctgttacac 40067632  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40067631 attttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 40067594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 21218230 - 21218093
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  21218230 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 21218131  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21218130 attttggtcatttcagttagttttaattcaaaaacgtt 21218093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 609 - 738
Target Start/End: Original strand, 22830801 - 22830933
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc-ttacata 705  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  22830801 aattggatttttggtcccttaactattttgctagtatagctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctccgttacaca 22830900  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  22830901 ttttggtcctttatgttagttttaattcaaaaa 22830933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 24504327 - 24504186
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  24504327 aggttaaattacatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgttttagtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgtt 24504228  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24504227 acacattttggtcatttccattagttttaattcaaaaacgtt 24504186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 615 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33626239 - 33626110
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  33626239 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggt 33626140  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33626139 cttttccgttagttttaattaaaaaacgtt 33626110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 616 - 747
Target Start/End: Original strand, 53645463 - 53645596
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||   ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  53645463 ttttttgtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaattaaaattcggtttattttggtcctttaacttctctccgttacacattttggtc 53645562  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  53645563 atttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 53645596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 46620923 - 46621067
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| |||||||    
T  46620923 tttaggtcaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctcc 46621022  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46621023 gttacacattttggtcatttccgttatttttaattcaaaaacgtt 46621067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 616 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 52915317 - 52915189
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  52915317 ttttttgtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtc 52915218  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  52915217 ctttttgttagttttaattcaaaaacgtt 52915189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 622 - 742
Target Start/End: Original strand, 4965889 - 4966011
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtcttttcc 719  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  4965889 gtcctttaactatttaggtagtatcgctttgctcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctctgttacacattttggtcatttcc 4965988  T
Q  720 gttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  4965989 gttagttttaattcaaaaacgtt 4966011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 25218447 - 25218325
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||   |||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25218447 ttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtccattaacttctctctgttacacattttggtcatttccgttag 25218348  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  25218347 ttttaattcaaaaacgttagatt 25218325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27347960 - 27347838
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  27347960 ttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacacattttggtcatttccattag 27347861  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  27347860 ttttaattcaaaaacgttagatt 27347838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Original strand, 29970195 - 29970332
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttaca 703  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| | ||||| |||||    
T  29970195 ttaaattgcatttttggtcccataactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaatttgatttattttggt-cattaacttatctccgttaca 29970293  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29970294 cattttggtcttatccgttagttttaattcaaaaacgtt 29970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 37515840 - 37515774
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37515840 aggttaaattttatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 37515774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 43317267 - 43317125
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   ||||| ||||||  |    
T  43317267 taggctaaattgcatttttagtctcctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcctttaacttctctctat 43317168  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  43317167 tacacattttggtcctttccgttaattttaattgaaaaacgtt 43317125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 21217850 - 21217987
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||| ||| |||||     
T  21217850 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctttccgttacac 21217949  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21217950 attttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgtt 21217987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 597 - 747
Target Start/End: Original strand, 24503932 - 24504085
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc 695  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||||    
T  24503932 taattttggctaaattgcatttttaatcccttaattatttaggtagtattgttttggttctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctc 24504031  T
Q  696 tc-cttacatattttggt-cttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||  ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24504032 tctgttacacatcttggtccttttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 24504085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25593474 - 25593337
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| | |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||| ||| |||||     
T  25593474 taaattgtattttttgtcccttaactatttagggagtattgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctttccgttacac 25593375  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25593374 attttggtcatttccgttagttttaatttaaaaacgtt 25593337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 32384656 - 32384793
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||   |||| |||| ||  |||||     
T  32384656 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggttctttaacctctttctgttacac 32384755  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32384756 attttggtcatttatgttagttttaattcaaaaacgtt 32384793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 34958835 - 34958967
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||| | ||||  |||||     
T  34958835 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttatttt-gttccttaacttatctctgttacac 34958933  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34958934 aatttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 34958967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 40067351 - 40067488
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||| ||  |||||     
T  40067351 taaattgtattttttgtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcctctaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctttctgttacac 40067450  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40067451 attttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 40067488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 46621314 - 46621173
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||   ||||  ||||||  ||    
T  46621314 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcctttaatttctctctgtt 46621215  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46621214 acacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaacgtt 46621173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 615 - 738
Target Start/End: Original strand, 48209959 - 48210084
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |   ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  48209959 atttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcctttaacttctctcccttacacattttggt 48210058  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||    
T  48210059 cctttccgttagttttaattcaaaaa 48210084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 8246772 - 8246907
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctccttacata 705  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||  || ||||  |||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  ||||||| ||||| ||||| |    
T  8246772 taaattgtatttttggtcctt-aattatttagataatatcattttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctcgttacaca 8246870  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8246871 ttttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 8246907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 25218084 - 25218224
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctta 701  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| ||||||  |||    
T  25218084 ggttaaatttcatttttggtcccttaactatttaggtaatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctctgtta 25218183  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25218184 cacattttggtcctttctgttagttttaattcaaaaacgtt 25218224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Original strand, 33625868 - 33626004
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| | ||||  ||||| |    
T  33625868 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttatctctgttacaca 33625967  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33625968 ttttggtcatttccgttaattttaattcaaaaacgtt 33626004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 54136470 - 54136340
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctccttacatat 706  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| || | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||  || |||||    
T  54136470 taaattgcaatttttgtcctttaactatttaggtagaattgttttgatcctttaattaaaatttgatttattttggttccttaact-tctg-ttgcatat 54136373  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  54136372 tttggtcatttccgttagttttaattcaaaaac 54136340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 683
Target Start/End: Original strand, 1157203 - 1157282
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  1157203 ggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaagtaatatcgctttggttccttaattaaaatttaatttattttggt 1157282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 44433006 - 44432871
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||  |||||| |||| |  ||||| |    
T  44433006 aaattgcatttttggtcccttaactatttagatagtatcactttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctttgttacaca 44432907  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgt 741  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44432906 ttttggtcctttccgttaattttaattcaaaaacgt 44432871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 46535526 - 46535662
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcct--tacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  |||||||| || | | | ||| ||  | ||     
T  46535526 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggt-tccttagtttcttctcgttcac 46535624  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46535625 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 46535662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4793985 - 4793845
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||||||||||   || |||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  4793985 aggttaaattgtatttttgaccccttat-tatttaggtagtatcgttttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgtt 4793887  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4793886 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 4793845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 44710406 - 44710543
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||     
T  44710406 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtctcttaacaaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctccgttacac 44710505  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  44710506 attttggtcctttctgttaattttaattcaaaaacgtt 44710543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 54136094 - 54136227
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |   ||||  ||||||  |||||     
T  54136094 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcctttaatttctctctgttacac 54136193  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54136194 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 54136227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 8247131 - 8246992
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttac 702  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||| |||||     
T  8247131 gttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtaatatttctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcccttaa 8247032  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  8247031 acattttcgtcatttctgttatttttaattcaaaaacgtt 8246992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Original strand, 9010503 - 9010642
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| |||| |  |    
T  9010503 taggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttgt 9010602  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9010603 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 9010642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 18862824 - 18862686
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctc-cttaca 703  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||||  |||||  |||||    
T  18862824 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttgctctctgttaca 18862725  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
      |||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  18862724 cctttttgtccattccgttagttttaattaaaaaacgtt 18862686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 32385199 - 32385062
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctcct 699  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||  ||||||||  |||||||   || | |    
T  32385199 taggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgcttt-atcccttaactaaaatttgatttattttggttccttaacttcttcccgt 32385101  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  32385100 tacacattttggtcctttccgttagttttaattaaaaaa 32385062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 739
Target Start/End: Original strand, 45683140 - 45683254
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |  |||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||  |||||    
T  45683140 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttttgttag 45683239  T
Q  725 tttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| |||||||||||    
T  45683240 ttttaattcaaaaac 45683254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 727
Target Start/End: Original strand, 46200487 - 46200609
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  46200487 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 46200586  T
Q  705 attttggtcttttccgttagttt 727  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  46200587 attttggtcctttccgttagttt 46200609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 46200868 - 46200731
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||   | || ||||      
T  46200868 taaattgcatttttggtctcttaactatttaggtagtaacgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaacttcttttcgttacgc 46200769  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  46200768 attttggttcttttcgttagttttaattcaaaagcgtt 46200731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 1205760 - 1205623
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||| || || ||| |||||     
T  1205760 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggcagtatcgcttttctcccttaattaaaattcgatttatttttgtcccttaccttctttccgttacac 1205661  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1205660 attttggtcttttccattagttttaattcaaaaacgtt 1205623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 29864179 - 29864312
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| | ||||  |||||     
T  29864179 taaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttttctctgttacac 29864278  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  29864279 atgttggtcctttctgttagttttaattcaaaaa 29864312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 45683500 - 45683363
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc-tctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||  || ||| |||||||| | |||| |||||||| ||  ||||||||   ||||||  ||||| |||||     
T  45683500 taaattgtatttttggttccttaactatttaggtaatattgctttggttccttaactaaaatttgatttattttggtcctttaacttatctccgttacac 45683401  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45683400 attttggtcctttcggttagttttaattcaaaaacgtt 45683363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 669
Target Start/End: Original strand, 1205379 - 1205443
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1205379 gttaaattgcacttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 1205443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 12381435 - 12381295
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatat 706  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||   | |||||||||  ||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| ||||   ||||| ||    
T  12381435 aattgtatttttggtccctaaactatttaggcaatatcgctttcatcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgttacacat 12381336  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12381335 tttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 12381295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 23756251 - 23756171
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  23756251 aggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggt 23756171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 747
Target Start/End: Original strand, 42779617 - 42779665
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42779617 ttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 42779665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 601 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4966257 - 4966114
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||| | | || |||||||||||  | |||||| |||| | | ||||||||||||  ||  ||||| || |||||||| ||||||     
T  4966257 ttagggtaaattgcatttcttgccccttaactatttaggtggtatcgttttgattccttaattaaaattcgatttatttttgtctcttaacttctctcca 4966158  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4966157 ttatacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 4966114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 8751290 - 8751432
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||   |||||||| |||| |||||||  ||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||     
T  8751290 taaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtataattttggtcccttaactaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccgttacac 8751389  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  8751390 attttgatcctttctgttagttttaattaaaaaacgttagatt 8751432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10014851 - 10014710
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| |||| |  |    
T  10014851 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttctctttgt 10014752  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10014751 tacaca-tttggtcatttccgttagttttaattcaaacacgtt 10014710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10021992 - 10021851
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| |||| |  |    
T  10021992 taggctaagttgcattttttgtcccttaactatttaggtagtatcgtattggtcccttaattaaaatttgatttattttgatctcttaacttctctttgt 10021893  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10021892 tacaca-tttggtcatttccgttagttttaattcaaacacgtt 10021851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 20614128 - 20614178
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20614128 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 20614178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 54191967 - 54191905
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  54191967 taaattgtatttttggtcccttaactatttagatagcatcgttttggtcccttaattaaaatt 54191905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 56270557 - 56270607
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  56270557 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 56270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 10014468 - 10014529
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaat 668  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10014468 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat 10014529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 10021609 - 10021670
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaat 668  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10021609 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaat 10021670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 34959218 - 34959081
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||  ||| ||  ||    
T  34959218 aggttaaattgcaattttggtcccttaactatttaggtattatcgctttggttccttaattaaaattcgatttattttggttctttaatttctttctgtt 34959119  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34959118 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 34959081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 38866786 - 38866721
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38866786 ggttaaattgtatttttgattccttaactatttaggtagtatcgctttggtactctaattaaaatt 38866721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 661
Target Start/End: Original strand, 46579789 - 46579834
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaa 661  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46579789 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaa 46579834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 623 - 667
Target Start/End: Original strand, 42369146 - 42369190
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42369146 tcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 42369190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Original strand, 44428668 - 44428711
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44428668 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 44428711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 1098066 - 1098116
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  1098066 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 1098116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 3503483 - 3503533
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  3503483 ttttggtcccttaactatttaatcggtatcgctttggtcctttaactaaaa 3503533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 17475410 - 17475460
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17475410 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 17475460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 17475928 - 17475878
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17475928 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 17475878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 20614661 - 20614611
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  20614661 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 20614611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 22307452 - 22307502
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  22307452 ttttggtccattaactatttaattggtattgctttggtcctttaactaaaa 22307502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 25618449 - 25618499
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  25618449 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 25618499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 31487991 - 31488041
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31487991 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 31488041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33091904 - 33091862
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtat 645  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33091904 aggttaaattacatttttagtcctctaactatttaattagtat 33091862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 34237494 - 34237544
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  34237494 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 34237544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 41610140 - 41610190
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  41610140 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 41610190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42369554 - 42369504
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42369554 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 42369504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 44303528 - 44303578
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44303528 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 44303578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 46058708 - 46058758
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  46058708 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 46058758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 46059169 - 46059119
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  46059169 ttttggtcccttaactatttaattagtatcactttggttccttaattaaaa 46059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 46535905 - 46535843
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  46535905 taaattgtatttttggtcacttaactatttaggtagtattgttttggtcctctaattaaaatt 46535843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 597 - 667
Target Start/End: Original strand, 47602936 - 47603006
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  47602936 taatataggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaa 47603006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 48092020 - 48091970
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  48092020 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 48091970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 48453646 - 48453696
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  48453646 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 48453696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 56271261 - 56271211
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  56271261 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 56271211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 667
Target Start/End: Original strand, 24898187 - 24898252
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||    
T  24898187 taggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaa 24898252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 616 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 42855777 - 42855736
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcct 657  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42855777 tttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcct 42855736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12593846 - 12593702
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||     
T  12593846 tttaggttaaattacatttttagtcctttaactatttaggtagtattgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctct 12593747  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12593746 gttacacattttggtcctttccgttagttttaatttaaaaacgtt 12593702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 600 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15476648 - 15476509
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tc 697  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  15476648 tttaggttaaattgcatttt-agtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtctcttaacttctcttc 15476550  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15476549 gttacacattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaa 15476509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 605 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 41372543 - 41372404
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttac 702  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  41372543 gttaaattatgtttttggtcccttaactatttaattaatatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaacttctctctattac 41372444  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41372443 acattttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 41372404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 334299 - 334436
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||     
T  334299 taaattgcatttttagtcctttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctcctttacac 334398  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  334399 attttggtccttcccattagttttaattcaaaaacgtt 334436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 5152998 - 5152861
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctc-tccttacat 704  Q
    |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |  |||||     
T  5152998 taaattatgtttttggtcccttaactatttatttagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaatttctctttgttacac 5152899  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5152898 attttggtcatttccgttggttttaattcaaaaacgtt 5152861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 739
Target Start/End: Original strand, 5152614 - 5152753
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactc--tctcct 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  5152614 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatgtaattagtatgactttggccccttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactctatcttct 5152713  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  5152714 tacacattttggtcctttttgttagttttaattcaaaaac 5152753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 7399075 - 7399217
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-t 699  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  7399075 taggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgt 7399174  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  7399175 tacacattttggtccttttcgttatttttaattcaaaaacgtt 7399217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42710733 - 42710591
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |  |||||| |||| |  ||| |     
T  42710733 taaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttgatcccttaacttctctttgttataa 42710634  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42710633 attttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 42710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Original strand, 5087811 - 5087947
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact--ctctccttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||||   || | ||||| |    
T  5087811 aaattgaatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcaatttattttggttccttaacttcttcccgttacaca 5087910  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5087911 ttttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 5087947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 36751905 - 36752042
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||  |||||| ||||||  ||| |     
T  36751905 taaattgtatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgatttggtcccttaattaaaatttgatttattttagtcccttaacttctctctgttaaac 36752004  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36752005 attttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 36752042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12695068 - 12694932
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||| ||| ||||| |    
T  12695068 aaattgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctttccattacaca 12694969  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12694968 ttttggttatttctgttagttttaattcaaaaacgtt 12694932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 629 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 25923480 - 25923365
Alignment:
Q  629 aactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtt 726  Q
    |||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25923480 aactatttatgtagtattgttttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtctcttaatttctctccgttacatattttggtcatttccgttagtt 25923381  T
Q  727 tgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||||||||    
T  25923380 ttaattcaaaaacgtt 25923365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28392153 - 28392015
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac--tctctcc-ttaca 703  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   |||||  ||||||| |||||    
T  28392153 taaattctatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtccattaaccttctctccgttaca 28392054  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28392053 cattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 28392015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Original strand, 5624381 - 5624519
Alignment:
Q  606 ttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttaca 703  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| |||      
T  5624381 ttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctccgttatc 5624480  T
Q  704 tattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5624481 aattttggtccttttcgttagttttaattcaaaaacgtt 5624519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Original strand, 10656088 - 10656234
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||| |   ||||| | |||    
T  10656088 aattaaggctaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttattttgctcctttaacttatct 10656187  T
Q  697 cc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10656188 ccgttacacattttggtcatttcggttagttttaattcaaaaacgtt 10656234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 603 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 15670538 - 15670392
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-cctt 700  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||| | ||    
T  15670538 aggttaaattgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggttatttaattaaaattttatttattttggtcccttaacttctctgcatt 15670439  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15670438 acacatgttggtcctttcgattagttttaattcaaaaacgttagatt 15670392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 9692922 - 9693058
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||| || ||||||| |||||     
T  9692922 taaattgtatttttggtccct-aactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttgacttctctccgttacac 9693020  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9693021 attttggtcatttccgttagttttaattcaataacgtt 9693058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 738
Target Start/End: Original strand, 38416139 - 38416279
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc- 697  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| | ||||||| ||||||     
T  38416139 tttaggctaaattgcatttttaatctcttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttgttttcttaacttctctcg 38416238  T
Q  698 cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
     ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  38416239 gttacacattttgatcatttccgttagttttaattcaaaaa 38416279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 593 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 40589451 - 40589295
Alignment:
Q  593 agaataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac- 691  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   |||||     
T  40589451 agaaaaatttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaact 40589352  T
Q  692 tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  40589351 tctctccgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttagatt 40589295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 593 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 40590054 - 40589898
Alignment:
Q  593 agaataatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac- 691  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   |||||     
T  40590054 agaaaaatttaggctaaattgcatttttggttccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcctttaact 40589955  T
Q  692 tctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  40589954 tctctccgttacatattctggtcctttccattagttttaattcaaaaatgttagatt 40589898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 713
Target Start/End: Original strand, 15476266 - 15476377
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tta 701  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  15476266 ggttaaattatatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattttatttattttggtctcttaacttctctccgtta 15476365  T
Q  702 catattttggtc 713  Q
    || |||||||||    
T  15476366 cacattttggtc 15476377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 605 - 742
Target Start/End: Original strand, 25923119 - 25923258
Alignment:
Q  605 gttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttac 702  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| |||||| |||     
T  25923119 gttaaattgtatttttgatcccttaactatttaggtagtatcggtttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtctcttaacttctctccgttat 25923218  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | |||||   | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25923219 acatttttaccatttctgttagttttaattcaaaaacgtt 25923258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 603 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 19205330 - 19205192
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||    |||||| ||||||| ||    
T  19205330 aggttaaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttgaccccttaacttctctccgtt 19205231  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19205230 acacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaac 19205192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 33699273 - 33699415
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ct 699  Q
    |||| ||||||| |||| | |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||   |  ||||||||  |||||| ||||||  |    
T  33699273 taggctaaattgcatttatggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaattcggtttattttggtcccttaacttctctctgt 33699372  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33699373 tacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 33699415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 646 - 742
Target Start/End: Original strand, 39706093 - 39706191
Alignment:
Q  646 cgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39706093 cgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctcagttagatattttggtcttttccgttagttttaattcaaaaacgtt 39706191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 3878484 - 3878621
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||  || ||     
T  3878484 taaattgtatttttggtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcgtttaattaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctctattgcac 3878583  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878584 attttgatcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 3878621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 10656477 - 10656340
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||  |||||| ||||||  |||||     
T  10656477 taaattgcatttttgatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaagtaaaatttgatttattttagtcccttaacttctctctgttacac 10656378  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  10656377 attttggtcctttttgttagttttaattcaaaaacgtt 10656340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 39706433 - 39706292
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| |    
T  39706433 aaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattcttttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctccgttacaca 39706334  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39706333 ttttggtcatttttgttagtttcaattcaaaaacgttggatt 39706292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 608 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 15267622 - 15267486
Alignment:
Q  608 aaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacata 705  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||| ||||| |    
T  15267622 aaattgcatttttgatcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctccgttacaca 15267523  T
Q  706 ttttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  15267522 ttttggtcctttatgttagttttaattcaaaaacgtt 15267486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 31908931 - 31909070
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactat--ttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttac 702  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||  |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||  || |    
T  31908931 taaattgtatttttggtgccttaactatatttaggtagtatcgctttgatcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctattgc 31909030  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31909031 acattttggtcatttccgttagtttcaattcaaaaacgtt 31909070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 616 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 7399452 - 7399330
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatattttggtc 713  Q
    ||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  7399452 ttttttgtcccttaattatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtc 7399353  T
Q  714 ttttccgttagtttgaattcaaa 736  Q
     |||||||||||||  |||||||    
T  7399352 ctttccgttagtttttattcaaa 7399330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 16353542 - 16353400
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcct 699  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| || |    
T  16353542 taggctaaattgcatttttgatcccttaactatttaagtagtatcgctttggtcccctaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctcttcgt 16353443  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16353442 tacacattttggtcctttttgttagttttaattaaaaaacgtt 16353400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 7210808 - 7210691
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttccgttag 724  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| | |||||| || |   ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7210808 ttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcttttaacttctttatgttacacattttggtcctttccgttag 7210709  T
Q  725 tttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7210708 ttttaattcaaaaacgtt 7210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 14143888 - 14143803
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  14143888 taaattgcatttttggtcctttaactatttaagtagtattactttggtctcttcattaaaatttaatttattttggtctcttaact 14143803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 38416517 - 38416380
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| || ||| |||||     
T  38416517 taaattgtatttttggtctcttaattatttaggtagtatcgctttgctcacttaattaaaattcgatttattttggttccttaacttctttccgttacac 38416418  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38416417 attttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 38416380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 604 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5460332 - 5460272
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaatta 664  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  5460332 ggttaaattgtatttttggtcccttaactatttagatagtatcgctttggtcccttaatta 5460272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 18514284 - 18514428
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc 698  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||   |||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||||||||  ||||||| ||||      
T  18514284 tttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggaagtatccctttggtcgcttagttaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctat 18514383  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18514384 gttacacattttggtcgtttccattagttttaattcaaaaacgtt 18514428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 601 - 739
Target Start/End: Original strand, 35263491 - 35263631
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcc 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||   ||||| |||| |      
T  35263491 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaattcgatttattttggtcctttaacttctctttg 35263590  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  35263591 ttacatattttggtcctttccgttaattttaattaaaaaac 35263631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5088516 - 5088449
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5088516 taggctaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtagtatcgctttggtcctctaattaaaatt 5088449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 26289400 - 26289341
Alignment:
Q  610 attgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26289400 attgcatttttggtcctttaactatttaaatagtatcgttttggtcccttaattaaaatt 26289341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Original strand, 29023940 - 29024070
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa-ctctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||   |||||||  |||||  ||||||  ||||||    
T  29023940 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggttccttaattaaaattcgat---ttttggtcccttaatttctctctgttacat 29024036  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29024037 attttggtcatttccgttaattttaattcaaaaa 29024070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 5460191 - 5460253
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5460191 taaattgtatttttggtcccttaactatttagacagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 5460253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8418567 - 8418505
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8418567 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccgttaattaaaatt 8418505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25333233 - 25333183
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25333233 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaattaaaa 25333183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 670
Target Start/End: Original strand, 15267239 - 15267307
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15267239 ttaggttaaattgcatttttggtcccttaactatt-aggtagtatcgttttggtcctttaattaaaattt 15267307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 17861042 - 17861178
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  || | | |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| ||  ||||     
T  17861042 taaattatatttttggtcctttaactatttaggtaatgttgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggt-ccttaacttctcttcggtacac 17861140  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17861141 attttggtccattccgttagttttaattcaaaaacgtt 17861178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 670
Target Start/End: Original strand, 19204941 - 19205010
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19204941 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaattt 19205010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 603 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 31909317 - 31909180
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-ctt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| ||| ||  ||    
T  31909317 aggttaaattgcatttttggtcccttaactgtttaggtagtatcgttttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggtcccttaacttctatctttt 31909218  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||    
T  31909217 acatattttggtcattttcgttaattttaattaaaaaa 31909180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 742
Target Start/End: Original strand, 14051885 - 14052029
Alignment:
Q  600 tttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc 698  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  || ||| | ||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||  || ||| | |||||    
T  14051885 tttaggttaaattgtatttttggtctcttaactatttaggtaatattgttttggttttttaattaaaattcgatttattttggttcctgaacttttctcc 14051984  T
Q  699 -ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
     ||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14051985 gttacacattttggtcctttcaattagttttaattcaaaaacgtt 14052029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 683
Target Start/End: Original strand, 26289027 - 26289099
Alignment:
Q  611 ttgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  26289027 ttgtatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttcgtcccttaattaaaatttgatttattttggt 26289099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 742
Target Start/End: Original strand, 7210461 - 7210596
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatat 706  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||||  || ||||| |||||||| || |||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||    
T  7210461 aattgcatttttggtcccttaaatatttaggtactatcgttttggtcccttgattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacat 7210560  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7210561 tttgatcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 7210596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 738
Target Start/End: Original strand, 8418206 - 8418336
Alignment:
Q  609 aattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatat 706  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||    
T  8418206 aattgcatttttggtccattaattatttaggtagtatcgttttggtcacttaattaaaattcgatttattttggt-tcttaacttctctctgttacacat 8418304  T
Q  707 tttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8418305 ttttgtcatttccgttagttttaattcaaaaa 8418336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 43570154 - 43570091
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43570154 taaattgtattttttgtcccttaactatttagatagcatcgctttgttcccttaattaaaattt 43570091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 739
Target Start/End: Original strand, 14143515 - 14143645
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacat 704  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||| | | | |||| ||  ||||||| |||||| |||||     
T  14143515 taaattatattttt-gtcccttaactatttagatagtatcgttttggtt-tttaattaaaattgattta-ttttagtc-cttaacttctctccgttacac 14143610  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14143611 attttggtcttttccgttagttttaattcaaaaac 14143645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 599 - 669
Target Start/End: Original strand, 21750805 - 21750875
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21750805 atttaggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcccttaattaaaatt 21750875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 739
Target Start/End: Original strand, 40774349 - 40774474
Alignment:
Q  615 atttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctc-cttacatattttggt 712  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| | ||| |||| |||||||||||  | | | |||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  40774349 attttttgtcccttaactatttaggtagtattgttttagtcccttaattaaaatcgattta-ttttggtcccttaacttctctctcttacacattttggt 40774447  T
Q  713 cttttccgttagtttgaattcaaaaac 739  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  40774448 catttccgttagttttaattcaaaaac 40774474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 669
Target Start/End: Original strand, 42710353 - 42710415
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42710353 taaattgcatttttagtcatttaactatttcggtagtatcgctttagttctttaattaaaatt 42710415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 3879395 - 3879310
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact 692  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  3879395 taaattgcatttttggtcccttaactatttaagtagtatgactttggttcattatttaaaatttgatttattttggtctcttaact 3879310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 667
Target Start/End: Original strand, 6157154 - 6157199
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6157154 gtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 6157199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 666
Target Start/End: Original strand, 11079141 - 11079190
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaa 666  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11079141 ttttagtccattaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaa 11079190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17736620 - 17736547
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaa 690  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||    
T  17736620 ttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtccattaattaaaattcgatttattttggtctcttaa 17736547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 669
Target Start/End: Original strand, 31656370 - 31656423
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatt 669  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31656370 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaatt 31656423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 32272223 - 32272086
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct-ccttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||||   ||| ||    
T  32272223 taaattgcatttttggtctcttaactatttagataatatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctatgttatat 32272124  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32272123 attttgttcattttcgttagttttaatttaaaaacgtt 32272086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33763290 - 33763154
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||| |||  |||||| ||||||| |||||     
T  33763290 taaattgcatttttggtcccttaactatttagt-agtatcgctttggttccttaattaaaattcgatttatttcggtcccttaacttctctccgttacac 33763192  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||  | ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  33763191 attttgtacatttcctttggttttaattcaaaaacgtt 33763154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 727
Target Start/End: Original strand, 37966809 - 37966940
Alignment:
Q  599 atttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctc- 697  Q
    ||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||  ||  ||||||||| |||| | | ||     
T  37966809 atttaggcttaattgttattttcgtcccttaactatttaattagtattactttggtcccataattaaaatttgttccgttttggtattttaaatttatct 37966908  T
Q  698 --cttacatattttggtcttttccgttagttt 727  Q
       ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37966909 cggttacatattttggtcattttcgttagttt 37966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 3722131 - 3722080
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3722131 tttttggtcccttaaatatttaattggtatcgctttggtcctttaactaaaa 3722080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 17339807 - 17339858
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17339807 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 17339858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25567426 - 25567375
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||    
T  25567426 tttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaa 25567375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 738
Target Start/End: Original strand, 33763002 - 33763041
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaa 738  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33763002 ttacatattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaa 33763041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 33957442 - 33957375
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattta 671  Q
    |||||||||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  33957442 ggttaaattgttattttcgtctcttaactttttaattagtatcactttggtcccataattaaaattta 33957375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35263783 - 35263740
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35263783 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 35263740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 435567 - 435617
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  435567 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 435617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 4959574 - 4959624
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  4959574 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 4959624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4960148 - 4960098
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  4960148 ttttagtcccttaactatttaattaatatcactttggtcccttaactaaaa 4960098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 601 - 667
Target Start/End: Original strand, 11315956 - 11316021
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  11315956 ttaggttaaattattttttt-gtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaa 11316021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 16670073 - 16670023
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  16670073 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 16670023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 700 - 742
Target Start/End: Original strand, 19205041 - 19205083
Alignment:
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19205041 tacacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 19205083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24100745 - 24100695
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  24100745 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 24100695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 26888598 - 26888648
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  26888598 ttttggtcccttaactatttaatttgtatcgctttggtcccttaactaaaa 26888648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 27098553 - 27098603
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27098553 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27098603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27851088 - 27851038
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  27851088 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 27851038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 29961823 - 29961873
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  29961823 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtccattaactaaaa 29961873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29962226 - 29962176
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  29962226 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 29962176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 30012572 - 30012622
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  30012572 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 30012622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 30112755 - 30112705
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  30112755 ttttagtcccttaagtatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 30112705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 38312338 - 38312388
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  38312338 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 38312388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Original strand, 93191 - 93330
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaactctctcc----ttac 702  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||     ||||    
T  93191 taaattgtatttttggtcccttaactatttaattagtatcgttttagtcacttaattaaaatttgatttattttggtatcttaactttctctctgtttac 93290  T
Q  703 atattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  93291 acattttggtcctttacgttagttttaattcaaaaacgtt 93330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 93577 - 93534
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  93577 ttaactatttaattagtatcgctttggtctcttaactaaaattt 93534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 11870 - 11733
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| ||||||  ||| ||    
T  11870 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttatat 11771  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11770 attttggttatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 11733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 601 - 747
Target Start/End: Original strand, 11485 - 11633
Alignment:
Q  601 ttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc- 698  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||| ||  |||||| |||||||     
T  11485 ttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttagaaagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttagtcccttaacttctctccg 11584  T
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11585 ttgcatattttggtctttttcgttagttttaatttaaaaacgttagatt 11633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4564
Alignment:
Q  598 aatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctct 696  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| |  |||||| |||||    
T  4710 aatttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctct 4611  T
Q  697 c-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4610 ctgtcacagattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 4564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 603 - 742
Target Start/End: Original strand, 4337 - 4478
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-tt 700  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||| ||||||| | |||||| |||||| ||  |||||||| ||||||| || |||| ||    
T  4337 aggttaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtactatcactttggttccttaattgaaatttgatttattttggtctcttaacttcactccgtt 4436  T
Q  701 acatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4437 acacattttggtcatttccgttagttttaattcaaaaacgtt 4478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 40735 - 40593
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctcc-ttacat 704  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||   ||||| ||||||| |||||     
T  40735 taaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtattgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggttcattaacttctctccgttacac 40636  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttggatt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40635 attttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgttagatt 40593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 742
Target Start/End: Original strand, 40350 - 40492
Alignment:
Q  602 taggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctct-cct 699  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||| |||  ||||| | |||| | |    
T  40350 taggctaaattgtatttttggtcccttaattatttagatagtatcgctttagtcccttaattaaaatttgatttatttcggtcccttaattactctacgt 40449  T
Q  700 tacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40450 tacagattttggttctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 40492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 11597 - 11460
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacat 704  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||||||  |||||     
T  11597 taaattgcattttttatcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcaatttattttggtcccttaacttctctctgttacac 11498  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11497 attttggtcctttccattagttttaattcaaaaacgtt 11460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 622 - 742
Target Start/End: Original strand, 11231 - 11353
Alignment:
Q  622 gtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-ttacatattttggtcttttcc 719  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  11231 gtcccttaactatttaggtagtattgctttcgtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctctgttacacattttggtcctttcc 11330  T
Q  720 gttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  11331 gttagttttaattcaaaaacgtt 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 610 - 737
Target Start/End: Original strand, 90811 - 90940
Alignment:
Q  610 attgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctctc-cttacatatt 707  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| ||| || |||||| |||    
T  90811 attgcatttttagtcccttaactatttaggtagtatcgcttttgtcccttaattgaaatttgatttattttggtaacttaacttctttctcttacacatt 90910  T
Q  708 ttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  90911 ttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 90940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 653 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 91845 - 91759
Alignment:
Q  653 gtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctc-cttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaa 737  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| || || ||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  91845 gtcccttaattaaaatttgatttattttggtaacttaacttctttctcttgcacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaa 91759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 604 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13927 - 13785
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tcctta 701  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||  |||||| |||| |  |||    
T  13927 ggttaaattgtatttttggtcccctaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaattaaaattcgatttattttggtcccttaacttctctttgtta 13828  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgttgg 744  Q
    || ||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  13827 cacattttggttatttccgttgattttaattcaaaaacgttgg 13785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 45219 - 45082
Alignment:
Q  607 taaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaac-tctc-tccttacat 704  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||| ||||  |||||| |||| |  |||||     
T  45219 taaattgcatttttagtcccttaactatttaggtattatcgctttgctcccttaattaaaaattgatttattgtggtcccttaacttctctttgttacac 45120  T
Q  705 attttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45119 attttggtcattttcgttagttttaattcaaaaacgtt 45082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 11007 - 10927
Alignment:
Q  603 aggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggt 683  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||    
T  11007 aggtttaattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggt 10927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 65739 - 65879
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tta 701  Q
    ||||||| || |||||| |||  |||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||  ||  |||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  65739 ggttaaactgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccatta 65838  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  65839 cacattttggtcatttccgttagttttaattccaaaacgtt 65879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 742
Target Start/End: Original strand, 73071 - 73211
Alignment:
Q  604 ggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaatttaatcaattttggtatcttaact-ctctcc-tta 701  Q
    ||||||| || |||||| |||  |||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||  ||  |||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  73071 ggttaaactgcatttttggtctcttaactatttaggtaatattgctttggtctcttaattaaaattcgatttattttgatcccttaacttctctccatta 73170  T
Q  702 catattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  73171 cacattttggtcatttccgttagttttaattccaaaacgtt 73211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 667
Target Start/End: Original strand, 57015 - 57085
Alignment:
Q  597 taatttaggttaaattgtatttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  57015 taatttaggcttaattgttcttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 57085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 57603 - 57553
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  57603 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 57553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 666
Target Start/End: Original strand, 300092 - 300141
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaa 666  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  300092 ttttggtcccttaagtatttaattggtatcgctttggtcctttaattaaa 300141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 623 - 667
Target Start/End: Original strand, 241681 - 241725
Alignment:
Q  623 tcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  241681 tcctttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 241725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 742
Target Start/End: Original strand, 11765 - 11808
Alignment:
Q  699 ttacatattttggtcttttccgttagtttgaattcaaaaacgtt 742  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11765 ttacacattttggtcctttccgttagttttaattcaaaaacgtt 11808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6271 - 6228
Alignment:
Q  627 ttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaattt 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  6271 ttaactatttaattagtatcgctttgatcccataattaaaattt 6228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 230884 - 230935
Alignment:
Q  616 tttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  230884 tttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 230935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 231303 - 231253
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  231303 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggccctttaactaaaa 231253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 83026 - 83076
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  83026 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 83076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 83431 - 83381
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  83431 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 83381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Original strand, 1488 - 1538
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  1488 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 617 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 283219 - 283169
Alignment:
Q  617 ttttagtcctttaactatttaattagtatcgctttggtcctttaattaaaa 667  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  283219 ttttggtcccttaactatttaattggtatcgctttggtcccttaactaaaa 283169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University