View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5760-Insertion-3 (Length: 834)

Name: NF5760-Insertion-3
Description: NF5760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5760-Insertion-3
NF5760-Insertion-3
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (374-834)||(39445292-39445751)
chr1 (374-834)||(1054845-1055304)
chr1 (374-834)||(25444922-25445382)
chr1 (374-834)||(44023707-44024163)
chr1 (374-834)||(43988292-43988759)
chr1 (374-825)||(41398032-41398479)
chr1 (479-812)||(41390483-41390811)
chr1 (681-834)||(25439729-25439882)
chr1 (427-756)||(24787285-24787617)
chr1 (373-483)||(41386542-41386650)
chr1 (584-677)||(24202770-24202865)
chr1 (584-677)||(19358844-19358939)
chr1 (584-677)||(19361433-19361528)
chr1 (584-677)||(19380073-19380168)
chr1 (584-677)||(26644898-26644994)
chr1 (583-668)||(47703946-47704034)
chr1 (584-645)||(19072928-19072990)
chr1 (584-645)||(19120818-19120880)
chr1 (583-645)||(9476260-9476323)
chr1 (584-645)||(3281708-3281770)
chr1 (583-677)||(16124516-16124614)
chr1 (583-677)||(27104372-27104470)
chr1 (583-668)||(13598397-13598485)
chr1 (583-668)||(29651810-29651898)
chr1 (583-645)||(775671-775734)
chr1 (583-645)||(47098859-47098922)
chr1 (584-641)||(37069770-37069828)
chr1 (584-645)||(13604658-13604720)
chr1 (584-645)||(21536604-21536666)
chr1 (762-805)||(24202591-24202634)
chr1 (583-645)||(32889438-32889501)
chr1 (587-645)||(47102876-47102935)
chr1 (588-645)||(9459419-9459477)
chr1 (588-645)||(9463246-9463304)
chr1 (588-645)||(16226388-16226446)
chr1 (762-812)||(24787176-24787226)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (374-834)||(155-614)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (374-834)||(18855519-18855978)
chr4 (374-833)||(3813816-3814274)
chr4 (372-834)||(45357129-45357590)
chr4 (372-834)||(45347649-45348111)
chr4 (374-834)||(5732458-5732916)
chr4 (374-825)||(9224248-9224698)
chr4 (372-825)||(9229035-9229486)
chr4 (404-825)||(51520280-51520701)
chr4 (403-714)||(56146664-56146974)
chr4 (427-756)||(24741788-24742116)
chr4 (404-756)||(29760470-29760818)
chr4 (584-645)||(28468564-28468625)
chr4 (583-677)||(10047378-10047476)
chr4 (583-677)||(39245993-39246091)
chr4 (583-677)||(36315230-36315327)
chr4 (583-677)||(36329439-36329536)
chr4 (584-677)||(31985635-31985730)
chr4 (583-668)||(38152449-38152537)
chr4 (584-645)||(5396706-5396768)
chr4 (583-677)||(16623293-16623391)
chr4 (585-643)||(5143260-5143319)
chr4 (583-645)||(5269226-5269289)
chr4 (584-677)||(3796519-3796616)
chr4 (583-668)||(24333808-24333896)
chr4 (585-642)||(5147678-5147736)
chr4 (585-677)||(3777550-3777645)
chr4 (762-825)||(18712607-18712670)
chr4 (762-805)||(24742175-24742218)
chr4 (589-668)||(6743425-6743507)
chr4 (583-677)||(16630680-16630778)
chr4 (588-645)||(16931789-16931847)
chr4 (588-645)||(16934143-16934201)
chr4 (588-645)||(22780373-22780431)
chr4 (588-645)||(44599838-44599896)
chr4 (583-652)||(54867183-54867252)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (374-834)||(6438294-6438752)
chr6 (374-834)||(28155403-28155861)
chr6 (374-834)||(6005209-6005672)
chr6 (374-834)||(33330275-33330740)
chr6 (374-833)||(16838536-16838998)
chr6 (372-834)||(33335772-33336239)
chr6 (374-825)||(14737418-14737866)
chr6 (374-784)||(28184297-28184707)
chr6 (374-812)||(14742291-14742725)
chr6 (402-825)||(22010538-22010960)
chr6 (374-825)||(11856765-11857218)
chr6 (374-629)||(5343272-5343527)
chr6 (585-677)||(5674771-5674865)
chr6 (732-833)||(5343628-5343731)
chr6 (584-677)||(5757479-5757575)
chr6 (584-645)||(21356036-21356098)
chr6 (583-645)||(10077200-10077263)
chr6 (583-645)||(31086508-31086571)
chr6 (583-645)||(31979512-31979575)
chr6 (584-645)||(4629954-4630016)
chr6 (583-677)||(5572241-5572339)
chr6 (583-645)||(31936586-31936649)
chr6 (596-645)||(21801379-21801429)
chr6 (427-530)||(30125940-30126044)
chr6 (583-645)||(5017504-5017567)
chr6 (762-805)||(5674589-5674632)
chr6 (606-645)||(22709041-22709080)
chr6 (588-645)||(12195515-12195573)
chr6 (583-677)||(22963699-22963796)
chr6 (583-677)||(23824597-23824694)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (374-834)||(19992104-19992566)
chr7 (373-834)||(21812070-21812533)
chr7 (371-826)||(31109424-31109875)
chr7 (374-825)||(24024168-24024618)
chr7 (399-825)||(12406150-12406575)
chr7 (374-834)||(24266032-24266496)
chr7 (373-825)||(12396709-12397155)
chr7 (374-833)||(24261154-24261617)
chr7 (374-833)||(16879864-16880327)
chr7 (374-822)||(16884720-16885172)
chr7 (399-672)||(4866548-4866820)
chr7 (427-756)||(20357468-20357797)
chr7 (404-677)||(2057786-2058061)
chr7 (584-756)||(1533364-1533540)
chr7 (584-677)||(18408764-18408859)
chr7 (584-677)||(21639809-21639904)
chr7 (584-677)||(18413641-18413735)
chr7 (584-677)||(21646007-21646102)
chr7 (583-677)||(29159802-29159900)
chr7 (585-645)||(21983285-21983346)
chr7 (583-645)||(9190043-9190106)
chr7 (583-645)||(20284088-20284151)
chr7 (583-677)||(46516310-46516408)
chr7 (583-677)||(49091660-49091758)
chr7 (584-677)||(44848685-44848781)
chr7 (583-645)||(2580389-2580452)
chr7 (583-645)||(33332485-33332548)
chr7 (583-677)||(2647696-2647794)
chr7 (583-645)||(9185200-9185263)
chr7 (587-645)||(28617260-28617319)
chr7 (583-677)||(55947-56044)
chr7 (763-825)||(4873310-4873372)
chr7 (762-812)||(20357359-20357409)
chr7 (583-643)||(35960815-35960876)
chr7 (762-805)||(1533263-1533306)
chr7 (762-805)||(2058203-2058246)
chr7 (584-645)||(47263678-47263738)
chr7 (588-645)||(31155911-31155969)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (371-834)||(28807407-28807871)
chr5 (373-834)||(37561278-37561741)
chr5 (374-834)||(37556456-37556918)
chr5 (374-834)||(2785167-2785630)
chr5 (374-834)||(33791108-33791571)
chr5 (374-833)||(31396822-31397286)
chr5 (374-833)||(31401679-31402143)
chr5 (404-825)||(1457003-1457423)
chr5 (374-834)||(33767971-33768439)
chr5 (404-825)||(43592102-43592523)
chr5 (374-825)||(15044484-15044930)
chr5 (404-825)||(43598547-43598968)
chr5 (404-825)||(43604039-43604460)
chr5 (404-825)||(43609531-43609952)
chr5 (404-825)||(27444793-27445214)
chr5 (404-825)||(27449637-27450058)
chr5 (404-756)||(30631231-30631582)
chr5 (504-755)||(31180138-31180388)
chr5 (584-677)||(38192174-38192269)
chr5 (584-677)||(38219399-38219494)
chr5 (584-677)||(35387663-35387758)
chr5 (584-644)||(24135849-24135909)
chr5 (584-677)||(9353333-9353429)
chr5 (584-677)||(36932351-36932447)
chr5 (584-677)||(10281751-10281848)
chr5 (584-677)||(15464532-15464628)
chr5 (583-645)||(17003995-17004058)
chr5 (585-645)||(11917007-11917068)
chr5 (583-645)||(28832258-28832321)
chr5 (584-677)||(14520230-14520326)
chr5 (762-825)||(30631641-30631704)
chr5 (583-645)||(42127445-42127508)
chr5 (583-677)||(3880298-3880396)
chr5 (588-645)||(4410243-4410301)
chr5 (762-812)||(31180448-31180498)
chr5 (587-677)||(12084176-12084269)
chr5 (584-677)||(19588746-19588843)
chr5 (583-645)||(31300631-31300694)
chr5 (588-645)||(15552466-15552524)
chr5 (762-796)||(24136081-24136115)
chr5 (588-641)||(27910675-27910729)
chr5 (588-645)||(31179371-31179429)
chr5 (588-645)||(31542955-31543013)
chr5 (588-645)||(31545301-31545359)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (374-834)||(39784656-39785114)
chr8 (374-834)||(35745183-35745646)
chr8 (374-833)||(25328112-25328568)
chr8 (374-834)||(10684094-10684558)
chr8 (404-825)||(7289767-7290188)
chr8 (404-756)||(6311121-6311472)
chr8 (404-756)||(36979205-36979553)
chr8 (427-756)||(30655488-30655822)
chr8 (427-756)||(33037728-33038056)
chr8 (427-677)||(4760076-4760325)
chr8 (427-756)||(18853088-18853418)
chr8 (427-756)||(18870482-18870809)
chr8 (404-677)||(10689144-10689412)
chr8 (584-645)||(26287902-26287963)
chr8 (584-645)||(26301159-26301220)
chr8 (584-645)||(26313153-26313214)
chr8 (584-677)||(1261955-1262050)
chr8 (749-833)||(25327986-25328070)
chr8 (583-668)||(26403240-26403328)
chr8 (584-677)||(31071230-31071326)
chr8 (584-677)||(4456028-4456124)
chr8 (586-645)||(9765854-9765914)
chr8 (583-645)||(4696631-4696694)
chr8 (587-677)||(7412344-7412437)
chr8 (584-677)||(19175755-19175851)
chr8 (583-677)||(23799577-23799675)
chr8 (583-645)||(5702518-5702581)
chr8 (583-645)||(19752429-19752492)
chr8 (587-677)||(6127224-6127318)
chr8 (762-812)||(6311533-6311583)
chr8 (762-812)||(18870373-18870423)
chr8 (762-812)||(30655881-30655931)
chr8 (762-805)||(1261776-1261819)
chr8 (762-805)||(10688959-10689002)
chr8 (762-805)||(33037627-33037670)
chr8 (762-812)||(18852979-18853029)
chr8 (588-645)||(43079879-43079937)
chr8 (588-645)||(43082250-43082308)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (374-834)||(32246577-32247040)
chr2 (374-834)||(19344212-19344677)
chr2 (374-834)||(19349070-19349535)
chr2 (374-825)||(39811830-39812278)
chr2 (402-716)||(44312575-44312887)
chr2 (404-756)||(11098848-11099196)
chr2 (429-677)||(14291337-14291584)
chr2 (427-677)||(9296402-9296651)
chr2 (584-677)||(3491751-3491846)
chr2 (584-677)||(25398496-25398591)
chr2 (584-677)||(25403634-25403729)
chr2 (583-668)||(8040059-8040147)
chr2 (584-645)||(40738844-40738904)
chr2 (587-677)||(13569331-13569425)
chr2 (583-677)||(21629943-21630040)
chr2 (583-677)||(14699008-14699105)
chr2 (584-677)||(28259178-28259274)
chr2 (583-645)||(10445479-10445542)
chr2 (583-645)||(34682369-34682432)
chr2 (583-677)||(17865202-17865300)
chr2 (583-677)||(20522219-20522317)
chr2 (585-677)||(34388859-34388955)
chr2 (614-677)||(25407653-25407718)
chr2 (585-677)||(10707252-10707348)
chr2 (587-645)||(8390185-8390244)
chr2 (584-645)||(31056044-31056106)
chr2 (587-641)||(1345580-1345635)
chr2 (587-645)||(2838065-2838124)
chr2 (762-805)||(11098746-11098789)
chr2 (583-645)||(33118135-33118198)
chr2 (583-645)||(39482930-39482993)
chr2 (762-796)||(14291723-14291757)
chr2 (584-645)||(23078505-23078567)
chr2 (583-677)||(33528621-33528719)
chr2 (588-645)||(35215586-35215644)
chr2 (588-645)||(35217963-35218021)
chr2 (584-645)||(36757797-36757859)
chr2 (584-645)||(42039704-42039766)
chr2 (762-791)||(9296235-9296264)
chr2 (588-644)||(45332181-45332238)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (374-834)||(18656228-18656686)
chr3 (8-296)||(40369086-40369375)
chr3 (374-834)||(2676917-2677382)
chr3 (374-834)||(2672761-2673226)
chr3 (373-834)||(8512006-8512472)
chr3 (374-834)||(8516887-8517352)
chr3 (373-825)||(22173036-22173485)
chr3 (431-834)||(24967957-24968362)
chr3 (374-833)||(32475276-32475738)
chr3 (374-833)||(32480133-32480596)
chr3 (374-632)||(10207725-10207983)
chr3 (423-756)||(28503785-28504108)
chr3 (404-756)||(7167072-7167420)
chr3 (427-677)||(2671587-2671836)
chr3 (566-756)||(8738984-8739176)
chr3 (566-756)||(9091222-9091414)
chr3 (566-677)||(40372796-40372908)
chr3 (564-677)||(8477343-8477458)
chr3 (627-756)||(28501618-28501750)
chr3 (584-677)||(26928592-26928687)
chr3 (584-677)||(1305949-1306044)
chr3 (584-677)||(8370477-8370573)
chr3 (584-677)||(27974943-27975039)
chr3 (584-677)||(32143321-32143417)
chr3 (583-677)||(18552873-18552971)
chr3 (584-645)||(27986471-27986533)
chr3 (583-677)||(21711222-21711319)
chr3 (584-677)||(16264350-16264446)
chr3 (584-677)||(27452958-27453054)
chr3 (585-677)||(36029094-36029190)
chr3 (587-677)||(1736295-1736389)
chr3 (583-677)||(3715992-3716090)
chr3 (584-645)||(25795781-25795843)
chr3 (584-645)||(30709815-30709877)
chr3 (584-645)||(33386691-33386753)
chr3 (583-677)||(40592772-40592870)
chr3 (583-645)||(1417515-1417578)
chr3 (583-677)||(26298987-26299085)
chr3 (583-677)||(48438213-48438311)
chr3 (583-677)||(6794704-6794801)
chr3 (583-645)||(37466290-37466353)
chr3 (583-645)||(47923931-47923994)
chr3 (762-812)||(28501509-28501559)
chr3 (762-805)||(2671405-2671448)
chr3 (583-645)||(3328381-3328444)
chr3 (584-650)||(4386947-4387014)
chr3 (762-805)||(8477599-8477642)
chr3 (762-805)||(40372615-40372658)
chr3 (762-796)||(8738891-8738925)
chr3 (762-796)||(9091129-9091163)
chr3 (762-812)||(28503676-28503726)
chr3 (588-645)||(38210571-38210629)
chr3 (584-645)||(39040017-39040079)
chr3 (588-645)||(50494200-50494258)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (374-796)||(9514-9930)
scaffold0355 (669-825)||(3690-3845)
scaffold0355 (375-552)||(3-170)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (374-834)||(148786-149249)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (374-833)||(18996-19458)
scaffold0197 (374-834)||(14139-14603)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (374-834)||(2081-2544)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (372-825)||(34903-35354)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (374-656)||(181976-182258)
scaffold0009 (707-834)||(176807-176936)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (374-466)||(13141-13233)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (373-483)||(34132-34240)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (584-677)||(17953-18048)
scaffold0188 (584-677)||(24046-24141)
scaffold0188 (762-796)||(17783-17817)
scaffold0188 (762-796)||(23876-23910)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (427-616)||(300-487)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (584-677)||(8420-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (585-645)||(85684-85745)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (584-677)||(43962-44058)
scaffold0087 (584-643)||(36869-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (583-668)||(5682-5770)
scaffold0006 (583-668)||(2491-2579)
scaffold0006 (584-645)||(133315-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (583-645)||(10728-10791)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (584-645)||(45253-45315)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (588-645)||(271-329)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 39445292 - 39445751
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39445292 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggctt 39445391  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39445392 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 39445490  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445491 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 39445590  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445591 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 39445690  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445691 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 39445751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 1055304 - 1054845
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1055304 tgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtctt 1055205  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1055204 ccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 1055106  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1055105 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 1055006  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055005 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 1054906  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054905 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 1054845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 25445382 - 25444922
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445382 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 25445283  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25445282 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 25445184  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtta 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25445183 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 25445084  T
Q  673 caagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgat 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25445083 caagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgat 25444984  T
Q  773 tacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444983 tacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 25444922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 44024163 - 44023707
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024163 tgttgtgaatccgattc--caaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 44024066  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  44024065 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaa--ggaaagaacaa 44023968  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44023967 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 44023868  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023867 aagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 44023768  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023767 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 44023707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 43988759 - 43988292
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  43988759 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggct 43988660  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa-cggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  | ||||| |||||    
T  43988659 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaaga 43988563  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43988562 acaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 43988463  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatg--aacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatccca 765  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  43988462 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatccca 43988363  T
Q  766 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43988362 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 43988292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Original strand, 41398032 - 41398479
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  41398032 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtct 41398129  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaa----acagtcctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaa 566  Q
     |||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||        ||||||    
T  41398130 ccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-------aaggaa 41398221  T
Q  567 agaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaa 665  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  41398222 -gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 41398319  T
Q  666 aaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatccc 764  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41398320 aaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 41398418  T
Q  765 aaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  41398419 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 41398479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 479 - 812
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390811
Alignment:
Q  479 caaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaa 574  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||        |||||| |||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-------aaggaa-gaacaaa 41390573  T
Q  575 acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttac 673  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41390574 acatcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 41390672  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgat 772  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41390673 aagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 41390771  T
Q  773 tacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  41390772 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 41390811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 681 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 25439882 - 25439729
Alignment:
Q  681 tagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgt 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25439882 tagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgt 25439783  T
Q  781 ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439782 ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 25439729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787285
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaa-----acaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaacca 521  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||| || |||||||     ||||||| |||||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  522 cacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 620  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||| |   |||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaagg--aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 24787424  T
Q  621 tgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga- 716  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||     
T  24787423 tgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagcattacacaagaacaaatcctagat 24787325  T
Q  717 actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  24787324 tctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccc 24787285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 373 - 483
Target Start/End: Original strand, 41386542 - 41386650
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  41386542 ctgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtc 41386639  T
Q  473 ttcaagcaaac 483  Q
    | |||||||||    
T  41386640 tccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24202865 - 24202770
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  24202865 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24202770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358844
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19358844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361433
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19361433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380073
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19380073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703946
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19072990
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 19072990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120880
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 19120880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476323
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatc 9476323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281770
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 3281770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124516
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104372
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598485
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651898
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775734
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatc 775734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098859
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatc 47098859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 641
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069828
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 641  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 37069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604658
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 13604658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536604
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21536604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 24202634 - 24202591
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  24202634 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24202591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889501
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatc 32889501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102876
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatc 47102876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459477
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 9459477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463304
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 9463304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226388
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 16226388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787176
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 24787176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 155 - 614
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  155 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggctt 254  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  255 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 353  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  354 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 453  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  454 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 553  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  554 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855978
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 18855618  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 18855717  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18855718 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 18855817  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18855818 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtgatt 18855917  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18855918 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcaaacaccccataggctcccc 18855978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Original strand, 3813816 - 3814274
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  3813816 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 3813915  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || || | ||||||    
T  3813916 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagc---aagaaaggaagaac 3814012  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3814013 aaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggt 3814112  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 770  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3814113 tacaagactctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 3814211  T
Q  771 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3814212 attacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccc 3814274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 372 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 45357590 - 45357129
Alignment:
Q  372 tctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  45357590 tctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggt 45357492  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45357491 cttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-ggaaaga 45357394  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  45357393 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 45357295  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45357294 gttacaagactctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaag 45357196  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357195 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 45357129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 372 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 45348111 - 45347649
Alignment:
Q  372 tctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  45348111 tctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggt 45348013  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45348012 cttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-ggaaaga 45347915  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  45347914 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 45347816  T
Q  669 gttacaagac-tctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45347815 gttacaagacctctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaa 45347717  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347716 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 45347649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 5732458 - 5732916
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5732458 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtct 5732553  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5732554 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa--ggaaagaac 5732649  T
Q  572 aaaa----caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaa 666  Q
    ||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  5732650 aaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 5732749  T
Q  667 aggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5732750 aggttacaagactctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaa 5732848  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732849 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 5732916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 9224698 - 9224248
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9224698 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtct 9224600  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  9224599 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg--aagaac 9224503  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggt 670  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  9224502 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 9224404  T
Q  671 tacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9224403 tagaagaactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 9224305  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  9224304 tgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 9224248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 372 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 9229486 - 9229035
Alignment:
Q  372 tctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9229486 tctgttgtgaatccggttaaaaaaaa-aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 9229389  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||    
T  9229388 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg--aaga 9229292  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  9229291 acaaaacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 9229193  T
Q  669 gttacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9229192 gttagaagaactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaa 9229094  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  9229093 ggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 9229035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520701
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  51520280 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 51520378  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51520379 ctagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 51520475  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  51520476 ctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 51520574  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  51520575 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 51520674  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  51520675 cactctcaacaaagacactcaacccat 51520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 403 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146664
Alignment:
Q  403 ttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaa 501  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| ||||     
T  56146974 ttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 56146876  T
Q  502 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  56146875 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagt 56146779  T
Q  601 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttac 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  56146778 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttac 56146680  T
Q  699 acatgaacaaacccta 714  Q
    ||||||||||||||||    
T  56146679 acatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Original strand, 24741788 - 24742116
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  24741788 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 24741885  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741886 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 24741980  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-ac 718  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  24741981 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattc 24742078  T
Q  719 taccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  24742079 taccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 24742116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760818
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||| || ||||||| |||||||||| ||  ||||      
T  29760470 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacaaccctaga 29760564  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29760565 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 29760659  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tgaa-gtgttacaaaaggttacaagactc--tagcttatcaagcttta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||  |  |||| |  ||||||| |    
T  29760660 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctg-caagctt-a 29760757  T
Q  698 cacatgaa-caaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||| ||| |||  ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29760758 cacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccc 29760818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468564
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatc 28468564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047476
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246091
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315230
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329439
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985635
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31985635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152449
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatat-gtg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396706
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatc 5396706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623293
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 643
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143319
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 643  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 5143319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269226
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 5269226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333896
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 642
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147736
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 642  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctcca 5147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 677
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 18712670 - 18712607
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  18712670 cccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 18712607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Original strand, 24742175 - 24742218
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  24742175 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 24742218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  589 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630680
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931847
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 16931847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934201
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 16934201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780431
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 22780431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599896
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 44599896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 652
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867252
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg 652  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatg 54867252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 6438294 - 6438752
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6438294 tgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggctt 6438392  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaa 573  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6438393 ccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaagaacaa 6438491  T
Q  574 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 673  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6438492 aacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggttac 6438591  T
Q  674 aagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 773  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438592 aagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 6438691  T
Q  774 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438692 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 6438752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 28155861 - 28155403
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  28155861 tgttgtgaatccggttctaaacaa-aaccttcacaccaatgcaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtct 28155764  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28155763 tcaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaat-ggaaagaac 28155666  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  28155665 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 28155566  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 770  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28155565 tacaagaatttagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtg 28155467  T
Q  771 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155466 attacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 28155403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 6005209 - 6005672
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  6005209 tgttgtaaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 6005308  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  6005309 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 6005405  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  6005406 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 6005504  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6005505 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 6005604  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6005605 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 6005672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 33330740 - 33330275
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  33330740 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 33330641  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||    
T  33330640 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaaga 33330543  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33330542 acaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 33330444  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33330443 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaag 33330344  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33330343 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 33330275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Original strand, 16838536 - 16838998
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  16838536 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 16838635  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || |||    
T  16838636 ttcaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaa 16838732  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  16838733 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 16838831  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16838832 gttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaagg 16838931  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16838932 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 16838998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 372 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 33336239 - 33335772
Alignment:
Q  372 tctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatgg 470  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  33336239 tctgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgg 33336140  T
Q  471 ctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaa 567  Q
    | | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||    
T  33336139 cctccaaactaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaa 33336042  T
Q  568 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaa 666  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33336041 gaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 33335943  T
Q  667 ag-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatccca 765  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  33335942 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatccca 33335843  T
Q  766 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33335842 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 33335772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 14737866 - 14737418
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14737866 tgttgtgaatccggttt--caaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 14737770  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  14737769 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaa--gaaagaa 14737673  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaagg 669  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  14737672 caaaacaccgag-aagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 14737574  T
Q  670 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14737573 ttacaagactctagcct-tcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 14737475  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  14737474 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 14737418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 374 - 784
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184707
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaa--tggc 471  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  28184297 tgttgtgaatccggttt--caaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggt 28184394  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28184395 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaag-aaaga 28184492  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  28184493 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaag 28184591  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28184592 gttacaacactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 28184690  T
Q  768 gtgattacaatgttttt 784  Q
    |||||||| ||||||||    
T  28184691 gtgattactatgttttt 28184707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 374 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742291
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14742725 tgttgtgaatccggttt--caaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 14742629  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     |||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14742628 ccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaa--gaaagaac 14742532  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  14742531 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 14742433  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 769  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  14742432 tacaagactctagcct-tcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagt 14742334  T
Q  770 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  14742333 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 14742291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 402 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010538
Alignment:
Q  402 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | | ||||    
T  22010960 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 22010862  T
Q  501 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 599  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22010861 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 22010766  T
Q  600 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagcttta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  22010765 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagcttta 22010667  T
Q  698 cacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22010666 cacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 22010567  T
Q  797 aactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
     || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  22010566 gacactctcaacaaagacactcaacccat 22010538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Original strand, 11856765 - 11857218
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  11856765 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtct 11856863  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaagga-aagaa 570  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| || || ||||| | | || ||    
T  11856864 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaa 11856962  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaagg 669  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  11856963 aaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 11857061  T
Q  670 ttacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  11857062 ttacaagaactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaag 11857160  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  11857161 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 11857218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 629
Target Start/End: Original strand, 5343272 - 5343527
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  5343272 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 5343371  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    || ||    
T  5343372 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacga 5343468  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343469 acaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 585 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674771
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 5674771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 732 - 833
Target Start/End: Original strand, 5343628 - 5343731
Alignment:
Q  732 tttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccatagga 829  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5343628 tttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaagga 5343727  T
Q  830 tccc 833  Q
    ||||    
T  5343728 tccc 5343731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356098
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatc 21356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077200
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 10077200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086508
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatc 31086508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979575
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatc 31979575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630016
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatc 4630016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572241
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936649
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatc 31936649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801379
Alignment:
Q  596 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatc 21801379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125940
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||  | ||||| ||| ||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  525 aaagag 530  Q
    ||||||    
T  30125945 aaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017504
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatc 5017504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 5674632 - 5674589
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5674632 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 5674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 645
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709080
Alignment:
Q  606 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatc 22709080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195573
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 12195573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963796
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatct-ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824597
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatct-ggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 19992104 - 19992566
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacg-aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992104 tgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 19992203  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaaca 572  Q
    | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19992204 tccaagcttacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaaca 19992302  T
Q  573 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19992303 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 19992402  T
Q  672 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992403 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 19992502  T
Q  772 ttacaatgttttt-cccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19992503 ttacaatgtttttccccaacctaagaaacactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccc 19992566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 373 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 21812533 - 21812070
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21812533 ctgttgtgaatccgattcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 21812434  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21812433 ttccaagctaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggt-aaaagaaaagaac 21812335  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggtt 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21812334 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtgaagtcttacaaaaggtt 21812235  T
Q  672 acaagactctagcttatc-aagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 770  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21812234 ccaagactctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggtg 21812135  T
Q  771 attacaatgttttt-cccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21812134 attacaatgtttttccccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 21812070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 371 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 31109875 - 31109424
Alignment:
Q  371 atctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatgg 470  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109875 atctgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatgg 31109779  T
Q  471 ctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaag 568  Q
      | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   | ||| | |||    
T  31109778 tctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaac--aagaaaaggaag 31109683  T
Q  569 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaa 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  31109682 aacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa 31109583  T
Q  668 ggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  31109582 ggttacaagactctagcct-tcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaa 31109484  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccata 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || ||||||    
T  31109483 ggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccata 31109424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024168
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaa-aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtct 24024521  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||    
T  24024520 ccaagcaaacaacaacaaaacag-cctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaagg--aagaac 24024424  T
Q  572 aaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaagg 669  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  24024423 aaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatg 24024324  T
Q  670 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  24024323 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacgg 24024225  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  24024224 tgattacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 24024168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 825
Target Start/End: Original strand, 12406150 - 12406575
Alignment:
Q  399 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtc 497  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |    
T  12406150 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcc 12406248  T
Q  498 ctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 596  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12406249 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaa--gaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacc 12406344  T
Q  597 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagct 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  12406345 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagct 12406443  T
Q  695 ttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaaccta 793  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12406444 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttcccaaccca 12406543  T
Q  794 agaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  12406544 agagacactctcaacaaagacactcaacccat 12406575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 24266496 - 24266032
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  24266496 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24266397  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    || ||    
T  24266396 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacga 24266301  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24266300 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 24266201  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24266200 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 24266101  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24266100 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 24266032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Original strand, 12396709 - 12397155
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  12396709 ctgttgtgaatccggttc---aaa--aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtc 12396802  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||  || |||||    
T  12396803 tccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaa--gggaagaa 12396899  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaagg 669  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12396900 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 12396998  T
Q  670 ttacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  12396999 ttacaagaactctagcct-ttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaag 12397097  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  12397098 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 12397155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 24261617 - 24261154
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  24261617 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24261518  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  24261517 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 24261422  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24261421 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 24261322  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24261321 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 24261222  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24261221 atgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 24261154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Original strand, 16879864 - 16880327
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  16879864 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 16879963  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  16879964 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 16880059  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||      
T  16880060 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaaga 16880159  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggt-attttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16880160 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 16880259  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16880260 atgattacaatgttgtttttccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 16880327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 374 - 822
Target Start/End: Original strand, 16884720 - 16885172
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  16884720 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 16884819  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  16884820 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 16884915  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||      
T  16884916 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaaga 16885015  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggt-attttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16885016 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 16885115  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccc 822  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  16885116 atgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccc 16885172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 399 - 672
Target Start/End: Original strand, 4866548 - 4866820
Alignment:
Q  399 aaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtc 497  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  4866548 aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtc 4866646  T
Q  498 ctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 595  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4866647 ctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 4866742  T
Q  596 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggtta 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  4866743 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357468
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  | ||||| ||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||| |   |||| |  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20357698 aaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaagg--aagaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgg 20357604  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-act 719  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||||||||||| |||||  |||||||  ||    
T  20357603 gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagctttacacaagaacatgccctagattct 20357505  T
Q  720 accctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20357504 acccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 20357468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 404 - 677
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058061
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaaca--gtcctaa 501  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |  | ||||     
T  2057786 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctag 2057881  T
Q  502 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaa----caagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 596  Q
     || || || ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||    |||||||| |  ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2057882 acttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaagg--aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacc 2057978  T
Q  597 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  2057979 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 2058061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 584 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 1533540 - 1533364
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--act 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||     
T  1533540 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 1533441  T
Q  680 ctagcttatcaagctttacacatg-aacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
     ||||||  ||||| ||||||| | |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1533440 atagctt-gcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccc 1533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408859
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18408859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639904
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatat-gtg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaaga 21639904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413735
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18413735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646102
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||| ||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaaga 21646102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159900
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 645
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983346
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21983346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190043
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatc 9190043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284151
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 20284151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516310
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091758
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580452
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatc 2580452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332485
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 33332485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647696
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185200
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatc 9185200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617260
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatc 28617260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56044
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 763 - 825
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873372
Alignment:
Q  763 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 4873372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 20357409 - 20357359
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  20357409 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 20357359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 643
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960876
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 643  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaa 35960876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 1533306 - 1533263
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  1533306 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 1533263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Original strand, 2058203 - 2058246
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  2058203 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2058246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263738
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggg--gagagcagctctccaatc 47263738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155969
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 31155969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 371 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 28807871 - 28807407
Alignment:
Q  371 atctgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatg 469  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807871 atctgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatg 28807772  T
Q  470 gctttcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaa 567  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28807771 gcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaa-ggaaa 28807673  T
Q  568 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaa 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28807672 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaa 28807573  T
Q  668 ggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807572 ggttacaagaatctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 28807474  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28807473 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 28807407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 373 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 37561741 - 37561278
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaa-cgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatgg 470  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37561741 ctgttgtgaatccggttcaactaatcaaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatgg 37561642  T
Q  471 ctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaag 568  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  37561641 cctccaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaat-ggaaag 37561544  T
Q  569 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37561543 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaa 37561444  T
Q  668 ggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561443 ggttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 37561344  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37561343 gtgattacaatg-ttttcccaacctaagaaacactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccc 37561278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 37556918 - 37556456
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaa-cgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    ||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37556918 tgttgtgaatccggttcaactaatcaaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggc 37556819  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | ||||| |||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37556818 ctccaagctaacaacaacaaaacag-cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaat-ggaaaga 37556721  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37556720 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag 37556621  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556620 gttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 37556521  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37556520 tgattacaatg-ttttcccaacctaagaaacactcacatcaaaggaacacaccccataggatcccc 37556456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 2785167 - 2785630
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  2785167 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 2785266  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2785267 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 2785363  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  2785364 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 2785462  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2785463 gttacaagaatctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 2785562  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2785563 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 2785630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 33791108 - 33791571
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  33791108 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 33791207  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  33791208 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 33791304  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  33791305 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33791403  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791404 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 33791503  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33791504 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 33791571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 31397286 - 31396822
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  31397286 tgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 31397187  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
    | ||||| ||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||| ||     
T  31397186 tccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaa-gaaaacaaa 31397090  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag-g 669  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  31397089 caaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 31396990  T
Q  670 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatg--aacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31396989 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaag 31396890  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31396889 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 31396822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 31402143 - 31401679
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  31402143 tgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 31402044  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || |||    
T  31402043 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaa 31401947  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  31401946 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 31401848  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatg--aacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31401847 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaa 31401748  T
Q  767 ggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31401747 ggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 31401679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457003
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  1457423 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 1457325  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1457324 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa---gaaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 1457229  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1457228 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 1457130  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1457129 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 1457030  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1457029 cactctcaacaaagacactcaacccat 1457003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 33767971 - 33768439
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |     
T  33767971 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacc 33768070  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| | ||||||    
T  33768071 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaa 33768167  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  33768168 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33768266  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactacccttt--ggtattttccc-actc--tcacactatgaacccaaaatcc 763  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| || |   ||||||||||||| | |||||    
T  33768267 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcc 33768366  T
Q  764 caaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33768367 caaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 33768439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 43592102 - 43592523
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  43592102 tcacatcaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43592200  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43592201 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 43592297  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  43592298 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 43592396  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43592397 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 43592496  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  43592497 cactctcaacaaagacactcaacccat 43592523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Original strand, 15044484 - 15044930
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  15044484 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtct 15044578  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||| | |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| |  ||||||    
T  15044579 ccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaagg--aagaac 15044675  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15044676 aaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 15044774  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 769  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15044775 tacaagactctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 15044873  T
Q  770 gattacaatgtttttccc-aacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  15044874 gattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 15044930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598968
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  43598547 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43598645  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43598646 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagtt 43598742  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  43598743 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 43598841  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43598842 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 43598941  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  43598942 cactctcaacaaagacactcaacccat 43598968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604460
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  43604039 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43604137  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43604138 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagtt 43604234  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  43604235 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 43604333  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43604334 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 43604433  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  43604434 cactctcaacaaagacactcaacccat 43604460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609952
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  43609531 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43609629  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  43609630 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagtt 43609726  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  43609727 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 43609825  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43609826 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 43609925  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  43609926 cactctcaacaaagacactcaacccat 43609952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445214
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| | ||| ||||      
T  27444793 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27444891  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27444892 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 27444988  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27444989 caggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 27445087  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27445088 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 27445187  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  27445188 cactctcaacaaagacactcaacccat 27445214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27450058
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| | ||| ||||      
T  27449637 tcacaccaatgaaataaac-aatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27449735  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27449736 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 27449832  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27449833 cagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 27449931  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27449932 catgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 27450031  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  27450032 cactctcaacaaagacactcaacccat 27450058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631582
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||      
T  30631231 tcacacaaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaa-caacaacaaaacagccctaga 30631328  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||| |||| | | || |||||| |||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  30631329 ctagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataa---gtaagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagtt 30631424  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttac 698  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  30631425 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagcct-tcaagctttac 30631523  T
Q  699 acatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  30631524 acatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 30631582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 504 - 755
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180388
Alignment:
Q  504 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | || || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa---gaaagaaagaaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 31180233  T
Q  603 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  31180234 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagcct-tcaagctttaca 31180332  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacc 755  Q
    || | ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31180333 caag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacc 31180388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192269
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 38192269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219494
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 38219494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387758
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 35387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 644
Target Start/End: Original strand, 24135849 - 24135909
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24135849 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaat 24135909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003995
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatc 17003995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11917007
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 11917007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832321
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 28832321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 825
Target Start/End: Original strand, 30631641 - 30631704
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  30631641 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 30631704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127445
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatc 42127445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880396
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410243
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatc 4410243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Original strand, 31180448 - 31180498
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  31180448 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 31180498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300631
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatc 31300631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552466
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 15552466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Original strand, 24136081 - 24136115
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24136081 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 24136115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 641  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179429
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 31179429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542955
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 31542955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545301
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 31545301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 39785114 - 39784656
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39785114 tgttgtgaatctggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39785017  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39785016 ccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-ggaaagaac 39784919  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaaggtt 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39784918 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaagtgttacaaaaggtt 39784819  T
Q  672 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784818 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 39784719  T
Q  772 ttacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784718 ttacaatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 39784656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 35745183 - 35745646
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  35745183 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 35745282  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  35745283 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 35745379  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  35745380 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 35745478  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35745479 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 35745578  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35745579 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 35745646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 25328568 - 25328112
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25328568 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 25328471  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaag-cataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  25328470 ccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaag-gaaaagaac 25328374  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  25328373 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 25328275  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 769  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  25328274 tacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggt 25328176  T
Q  770 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25328175 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccc 25328112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 10684558 - 10684094
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  10684558 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 10684459  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  10684458 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 10684363  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10684362 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 10684263  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10684262 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 10684163  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10684162 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 10684094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 404 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289767
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||| ||||      
T  7290188 tcacaccaatgaaataaac-attgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctaga 7290090  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagc-ataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  | ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7290089 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 7289993  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagctttaca 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  7289992 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagctttaca 7289894  T
Q  700 catgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaa 798  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7289893 catgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagaga 7289794  T
Q  799 ctctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    | |||||| ||||| ||| || |||||    
T  7289793 cactctcaacaaagacactcaacccat 7289767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311472
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||      
T  6311121 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 6311219  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |   || || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6311220 ctagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 6311315  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttac 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  6311316 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagcct-tcaagctttac 6311414  T
Q  699 acatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||| | ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6311415 acaag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 6311472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979553
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaa 501  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  36979205 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctag 36979299  T
Q  502 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 600  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36979300 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagt 36979394  T
Q  601 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagcttt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||    
T  36979395 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-tt 36979492  T
Q  697 acacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  36979493 acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 36979553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655822
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaa--acaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| || |||||||  ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30655586  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaa-aggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 622  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||| |   |||  | |||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655587 atagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 30655685  T
Q  623 ggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-a 717  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  30655686 ggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaaaccctagatt 30655783  T
Q  718 ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  30655784 ctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 30655822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037728
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaa--acaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| || |||||||  ||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 33037958  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||| |   ||||    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037957 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag---aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 33037863  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-act 719  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  33037862 gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattct 33037765  T
Q  720 accctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  33037764 acccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 33037728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4760076
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |   || || | |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgg 4760132  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  4760131 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 4760076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18853088
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaaca--gtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| ||| |  | ||||  || || || |||||||||||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 18853320  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853319 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 18853225  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatat-gtg-aagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-a 717  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  18853224 gggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcat-tcaagc-ttacacaagaacaaaccctagatt 18853127  T
Q  718 ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18853126 ttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccc 18853088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18870809 - 18870482
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa 526  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||| | ||||  || || || |||||||||||||||    
T  18870809 gatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaaaaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaa 18870712  T
Q  527 agagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 625  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18870711 agagataccaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggg 18870617  T
Q  626 gagagagcagctctccaatcaaatat-gtg-aagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-act 719  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  18870616 gagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcat-tcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattct 18870519  T
Q  720 accctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18870518 accctttggtatttccccactctcacaatatgaaccc 18870482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 404 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10689144
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaa 501  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||||| ||||||||||  ||  ||||     
T  10689412 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctag 10689318  T
Q  502 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 600  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||   |||| || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10689317 tgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa---gtaagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagt 10689223  T
Q  601 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  10689222 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaaga 10689144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287963
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 26287963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301220
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 26301220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313214
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 26313214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261955
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1261955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 749 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327986
Alignment:
Q  749 atgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccc 25327986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403240
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071230
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31071230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765854
Alignment:
Q  586 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 9765854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696631
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 4696631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 677
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412437
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799577
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702518
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatc 5702518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752429
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatc 19752429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 677
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Original strand, 6311533 - 6311583
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  6311533 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 6311583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 18870423 - 18870373
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18870423 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 18870373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Original strand, 30655881 - 30655931
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  30655881 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 30655931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 1261819 - 1261776
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  1261819 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctc 1261776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 10689002 - 10688959
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  10689002 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 10688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 33037670 - 33037627
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  33037670 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 33037627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 18853029 - 18852979
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18853029 cccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 18852979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079879
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 43079879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082250
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 43082250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 32246577 - 32247040
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  32246577 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtct 32246676  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacg-gtaaaaaggaaagaa 570  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |  | ||||| | |||||    
T  32246677 ccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaa 32246775  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaagg 669  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  32246776 caaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 32246875  T
Q  670 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaac-taccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32246876 ttacaagactctagctt-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaagg 32246974  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32246975 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggaccccc 32247040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344677
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19344311  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  19344312 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 19344408  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  19344409 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 19344508  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19344509 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 19344608  T
Q  769 tgattacaa---tgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19344609 tgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 19344677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 19349070 - 19349535
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  19349070 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19349169  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  19349170 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaa 19349266  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  19349267 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 19349366  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19349367 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 19349466  T
Q  769 tgattacaa---tgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19349467 tgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 19349535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 374 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 39812278 - 39811830
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39812278 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39812181  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39812180 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa--gaaagaac 39812084  T
Q  572 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggt 670  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  39812083 aaaacaccgag-aagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 39811985  T
Q  671 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 769  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39811984 tacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 39811886  T
Q  770 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39811885 gattacaatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 39811830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 402 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312575
Alignment:
Q  402 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtccta 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | | ||||    
T  44312887 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 44312789  T
Q  501 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 599  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44312788 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 44312693  T
Q  600 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag-actctagcttatcaagcttta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  44312692 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcct-tcaagcttta 44312594  T
Q  698 cacatgaacaaaccctaga 716  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44312593 cacatgaacaaaccctaga 44312575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098848
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaa 501  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| || ||||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  11099196 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctag 11099102  T
Q  502 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 600  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11099101 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa--ggaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagt 11099007  T
Q  601 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagcttt 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  ||||||  ||||| ||    
T  11099006 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagctt-gcaagc-tt 11098909  T
Q  697 acacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11098908 acacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 11098848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 429 - 677
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291584
Alignment:
Q  429 tgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa 526  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  527 agagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 625  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 14291530  T
Q  626 gagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  14291531 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 14291584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 9296651 - 9296402
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9296651 gatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacac 9296553  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| || |   || || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9296552 aaagagataacaaagca-aaacaagaaaagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgg 9296458  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  9296457 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 9296402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491846
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 3491846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398591
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25398591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403729
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25403729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040147
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738904
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatc 40738904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 587 - 677
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569425
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 13569425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630040
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699008
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tgaagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaaggttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445479
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 10445479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682369
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatc 34682369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865300
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522317
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaa-ggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 585 - 677
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 614 - 677
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407718
Alignment:
Q  614 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390185
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatc 8390185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056106
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatc 31056106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345580
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 641  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctcc 1345580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838065
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatc 2838065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 11098789 - 11098746
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  11098789 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 11098746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118198
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatc 33118198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39482993
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatc 39482993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Original strand, 14291723 - 14291757
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14291723 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 14291757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078505
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatc 23078505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528621
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215644
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35215644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218021
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 35218021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757797
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatc 36757797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039704
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatc 42039704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 9296264 - 9296235
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296264 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacc 9296235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 644
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 644  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 18656228 - 18656686
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  18656228 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtct 18656323  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaac 571  Q
     ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18656324 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa--ggaaagaac 18656419  T
Q  572 aaaa----caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaa 666  Q
    ||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18656420 aaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 18656519  T
Q  667 aggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18656520 aggttacaagactctagcat-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaa 18656618  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656619 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 18656686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40369375 - 40369086
Alignment:
Q  8 atctactcgtgtgggtctaccaacacttattactcacacaaatatcaatcacattcagaatcagaattcagaacataaactctcgttgatatcatccatc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40369375 atctactcgtgtgggtctaccaacacttattactcacacaaatatcaatcacattcagaatcagaattcagaacataaactctcgttgatatcatccatc 40369276  T
Q  108 cttatttgtgtttgtgcgtgatccaccagtagccttcaactcaaaaatcatttaataaataaatgtccaccgcaactaatactatatgcccgtgctttcc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40369275 cttatttgtgtttgtgcgtgatccaccagtagccttcaactcaaaaatcatttaataaataaatgtccaccgcaactaatactatatgcccgtgctttcc 40369176  T
Q  208 tttcacggaccaattctcatgttccatttcacttttactagtaaataaataagtactcgccactat-tattcaccacattaacacttaat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40369175 tttcacggaccaattctcatgttccatttcacttttactagtaaataaataagtactcaccactatatattcaccacattaacacttaat 40369086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2677382 - 2676917
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  2677382 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 2677283  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||    
T  2677282 ctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaaga 2677185  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2677184 acaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 2677086  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2677085 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaag 2676986  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2676985 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 2676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2673226 - 2672761
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaa-ccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  2673226 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggc 2673127  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||    
T  2673126 ctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaaga 2673029  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2673028 acaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 2672930  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  2672929 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaag 2672830  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2672829 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 2672761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 373 - 834
Target Start/End: Original strand, 8512006 - 8512472
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8512006 ctgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 8512105  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaa-g 568  Q
    || ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||  |  ||| | ||| |    
T  8512106 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacg 8512202  T
Q  569 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaa 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8512203 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 8512302  T
Q  668 g-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8512303 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaa 8512402  T
Q  767 ggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8512403 ggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 8512472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Original strand, 8516887 - 8517352
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  8516887 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggct 8516986  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaa-ga 569  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||  |  ||| | ||| ||    
T  8516987 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacga 8517083  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8517084 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 8517183  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8517184 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 8517283  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8517284 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 8517352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 373 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 22173485 - 22173036
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  22173485 ctgttgtgaatccggttt--caaacaaatcttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtc 22173389  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||| |||||||| |  |||||    
T  22173388 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaagg--aagaa 22173292  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaagg 669  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  22173291 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 22173193  T
Q  670 ttacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||| ||||||    
T  22173192 ttacaagaactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaag 22173094  T
Q  768 gtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  22173093 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 22173036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 431 - 834
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968362
Alignment:
Q  431 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaag 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  529 agctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggag 628  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  24968056 agctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggag 24968152  T
Q  629 agagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactacccttt 726  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24968153 agagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctacccttt 24968252  T
Q  727 ggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacacccca 824  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  24968253 ggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacacccca 24968352  T
Q  825 taggatcccc 834  Q
     |||||||||    
T  24968353 aaggatcccc 24968362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Original strand, 32475276 - 32475738
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  32475276 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 32475375  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||| | || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  32475376 tccaaactaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 32475471  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaagg 669  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  |    
T  32475472 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtttacaaagag 32475571  T
Q  670 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggt-attttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  32475572 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaga 32475671  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32475672 tgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 32475738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Original strand, 32480133 - 32480596
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaa-ccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||    
T  32480133 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 32480232  T
Q  472 tttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaag 568  Q
     | ||| | || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || |    
T  32480233 ctccaaactaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacg 32480328  T
Q  569 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||      
T  32480329 aacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtttacaaaga 32480428  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggt-attttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32480429 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 32480528  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  32480529 atgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 32480596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 374 - 632
Target Start/End: Original strand, 10207725 - 10207983
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  10207725 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 10207824  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||    
T  10207825 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaa 10207922  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 632  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207923 caaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 423 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503785
Alignment:
Q  423 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaacca 521  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  522 cacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 620  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||           |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaaagcataaacaaga-----------aaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 28503924  T
Q  621 tgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga- 716  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  28503923 tggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagcct-tcaagctttacacaagaataaaccctagat 28503825  T
Q  717 actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28503824 tctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 28503785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 404 - 756
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167420
Alignment:
Q  404 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaag 502  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||      
T  7167072 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagccctaga 7167166  T
Q  503 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 601  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7167167 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 7167262  T
Q  602 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaag--actctagcttatcaagcttta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||| |||    
T  7167263 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-tta 7167360  T
Q  698 cacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7167361 cacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccc 7167420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 427 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671587
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagcaaacaacaacaaa--cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| || ||||||||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  525 aaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 623  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |   || || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagca-aaacaagataagc---aagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 2671643  T
Q  624 gggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  2671642 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 2671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 566 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 8739176 - 8738984
Alignment:
Q  566 aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttac 663  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  8739176 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 8739078  T
Q  664 aaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8739077 aaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccc 8738984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 566 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9091414 - 9091222
Alignment:
Q  566 aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttac 663  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  9091414 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9091316  T
Q  664 aaaaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||| |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9091315 aaagggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccc 9091222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 566 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372796
Alignment:
Q  566 aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttac 663  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  664 aaaaggttacaaga 677  Q
    ||| ||||||||||    
T  40372809 aaagggttacaaga 40372796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 564 - 677
Target Start/End: Original strand, 8477343 - 8477458
Alignment:
Q  564 gaaagaacaaa-acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgt 660  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  8477343 gaaagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 8477441  T
Q  661 tacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8477442 tacaaagggttacaaga 8477458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 627 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501618
Alignment:
Q  627 agagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctacc 722  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagcct-tcaagctttacacaagaataaaccctagattctacc 28501652  T
Q  723 ctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 756  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28501651 ctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 28501618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928592
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 26928592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306044
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || | || |||||||||||| ||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1306044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143417
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 32143417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552873
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986471
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 27986471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711319
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453054
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 27453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 677
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 587 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  587 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715992
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795843
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 25795843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709815
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatc 30709815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386691
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 33386691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592772
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417515
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatc 1417515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299085
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438311
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag-gttacaaga 677  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 583 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794704
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466353
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatc 37466353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923931
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatc 47923931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 28501559 - 28501509
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  28501559 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 28501509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 2671448 - 2671405
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  2671448 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 2671405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328381
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatc 3328381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaata 650  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Original strand, 8477599 - 8477642
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  8477599 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 8477642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 40372658 - 40372615
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  40372658 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctc 40372615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 8738925 - 8738891
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8738925 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 8738891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 9091163 - 9091129
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9091163 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 9091129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 28503726 - 28503676
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 812  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  28503726 cccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 28503676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210571
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatc 38210571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39040017
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatc 39040017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494200
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 50494200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 374 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9514
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 473  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  9930 tgttgtgaatccggttt--caaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtct 9833  T
Q  474 tcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaaca 572  Q
     ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || || | |||||||    
T  9832 ccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagc---aagaaaggaagaaca 9737  T
Q  573 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtt 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  9736 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 9638  T
Q  672 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 771  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9637 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 9539  T
Q  772 ttacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9538 ttacaatgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 669 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3690
Alignment:
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3845 gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  769 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  3746 tgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 375 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 3
Alignment:
Q  375 gttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttt 474  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||  |     
T  170 gttgtgaatccggttt--caaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctc 79  T
Q  475 caagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 552  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  78 caagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 149249 - 148786
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  149249 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 149150  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    || |||    
T  149149 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaa 149053  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  149052 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 148954  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  148953 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagg 148854  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  148853 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 148786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 374 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 19458 - 18996
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||     
T  19458 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 19359  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || |||    
T  19358 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaa 19262  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||     
T  19261 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaaga 19163  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19162 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattccaagg 19063  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatccc 833  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19062 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatccc 18996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 14603 - 14139
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  14603 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 14504  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  14503 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 14408  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14407 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 14308  T
Q  669 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaag 767  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14307 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 14208  T
Q  768 gtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14207 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 374 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2081
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||     
T  2544 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcc 2445  T
Q  473 ttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaa 570  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    || |||    
T  2444 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaa 2348  T
Q  571 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa-gtgttacaaaag- 668  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  2347 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 2249  T
Q  669 gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 768  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2248 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagg 2149  T
Q  769 tgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2148 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 2081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 372 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 35354 - 34903
Alignment:
Q  372 tctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 471  Q
    ||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  35354 tctgttgtgaatccggttaaaaaaaa-aaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 35257  T
Q  472 tttcaagcaaacaacaacaaa-cagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||    
T  35256 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg--aaga 35160  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtg-aagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  35159 acaaaacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 35061  T
Q  669 gttacaag-actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaa 766  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35060 gttagaagaactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaa 34962  T
Q  767 ggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 825  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  34961 ggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 34903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 374 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 182258 - 181976
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||     
T  182258 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 182159  T
Q  473 ttcaagcaaa-caacaacaaa-cagtcctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaaga 569  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   || ||    
T  182158 tccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacga 182063  T
Q  570 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatgtgaa 656  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  182062 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa 181976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 707 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 176936 - 176807
Alignment:
Q  707 aaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagaaactctct 804  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  176936 aaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactct 176837  T
Q  805 catcaaaggcacacaccccataggatcccc 834  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  176836 catcaaaggaacacaccccaaaggatcccc 176807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 374 - 466
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13233
Alignment:
Q  374 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13141 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 373 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 34240 - 34132
Alignment:
Q  373 ctgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 472  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34240 ctgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtc 34143  T
Q  473 ttcaagcaaac 483  Q
    | |||||||||    
T  34142 tccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17953
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 17953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24046
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 17817 - 17783
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17817 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 17783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 762 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 23910 - 23876
Alignment:
Q  762 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaaga 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23910 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 23876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 300
Alignment:
Q  427 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctttcaagca--aacaacaacaaacagtcctaagctagtgtatagcaaaaccacac 524  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  487 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacac 388  T
Q  525 aaagagctaa-caagcataaacaagataaacggtaaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 616  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  | || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  387 aaagagataataaagca-aaacaagataa--gctagaaa-gaaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 645
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85745
Alignment:
Q  585 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatc 85745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttacaaga 677  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 584 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36869
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 643  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaa 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5770
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2579
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcaaatatg-tg-aagtgttacaaaag 668  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133315
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatc 133315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 645
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10791
Alignment:
Q  583 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatc 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 645
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45315
Alignment:
Q  584 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 45315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 271
Alignment:
Q  588 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 645  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatc 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University