View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5762_low_12 (Length: 211)

Name: NF5762_low_12
Description: NF5762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5762_low_12
NF5762_low_12
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (11-205)||(25425073-25425267)
chr5 (11-205)||(11341087-11341281)
chr5 (11-192)||(4201599-4201780)
chr5 (11-192)||(24594965-24595146)
chr5 (11-203)||(19498253-19498445)
chr5 (11-192)||(23327417-23327598)
chr5 (11-192)||(27008476-27008657)
chr5 (10-205)||(9732299-9732493)
chr5 (11-202)||(43445390-43445581)
chr5 (1-176)||(1221355-1221529)
chr5 (1-176)||(10779803-10779977)
chr5 (11-205)||(10802-10995)
chr5 (1-176)||(11213226-11213401)
chr5 (11-205)||(29192251-29192444)
chr5 (1-176)||(110608-110782)
chr5 (11-172)||(22884816-22884976)
chr5 (11-192)||(21075122-21075302)
chr5 (11-192)||(37051449-37051629)
chr5 (11-192)||(25901959-25902139)
chr5 (13-192)||(21933795-21933973)
chr5 (13-192)||(21939965-21940143)
chr5 (1-176)||(22368108-22368282)
chr5 (13-192)||(35580719-35580897)
chr5 (11-192)||(20615077-20615257)
chr5 (13-192)||(37010799-37010977)
chr5 (11-192)||(21235039-21235220)
chr5 (11-172)||(16534791-16534951)
chr5 (81-192)||(7424067-7424178)
chr5 (1-176)||(4863740-4863913)
chr5 (96-176)||(23510395-23510475)
chr5 (1-176)||(27185348-27185521)
chr5 (80-151)||(35792832-35792903)
chr5 (96-176)||(17473566-17473645)
chr5 (81-176)||(21653051-21653145)
chr5 (1-124)||(32967692-32967814)
chr5 (81-176)||(1170320-1170414)
chr5 (96-151)||(18779788-18779843)
chr5 (81-176)||(24470711-24470805)
chr5 (109-176)||(25211623-25211689)
chr5 (109-176)||(25275775-25275841)
chr5 (79-176)||(21661315-21661411)
chr5 (5-121)||(23492532-23492647)
chr5 (81-176)||(21392605-21392699)
chr5 (98-172)||(11582325-11582398)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (11-205)||(17147229-17147423)
chr1 (11-192)||(22034309-22034490)
chr1 (11-192)||(20826744-20826925)
chr1 (11-192)||(7642105-7642286)
chr1 (11-192)||(5073823-5074004)
chr1 (11-192)||(18602566-18602747)
chr1 (11-192)||(51451074-51451254)
chr1 (11-191)||(41392914-41393093)
chr1 (13-192)||(17003286-17003464)
chr1 (1-205)||(22226430-22226632)
chr1 (80-205)||(35935164-35935289)
chr1 (80-205)||(45050135-45050260)
chr1 (81-191)||(21651601-21651712)
chr1 (1-176)||(20444217-20444390)
chr1 (96-192)||(29137281-29137376)
chr1 (1-176)||(37845986-37846159)
chr1 (1-204)||(44036411-44036615)
chr1 (1-176)||(22352604-22352779)
chr1 (1-176)||(20529981-20530155)
chr1 (80-202)||(20929924-20930045)
chr1 (11-56)||(22029293-22029338)
chr1 (80-172)||(15863017-15863108)
chr1 (80-172)||(22250620-22250711)
chr1 (81-176)||(22365158-22365253)
chr1 (81-176)||(49966058-49966152)
chr1 (2-151)||(35053336-35053484)
chr1 (1-173)||(5676121-5676291)
chr1 (81-176)||(9785898-9785992)
chr1 (81-176)||(22407893-22407987)
chr1 (98-176)||(20895406-20895483)
chr1 (81-176)||(2422732-2422826)
chr1 (96-203)||(21857931-21858037)
chr1 (81-121)||(18505816-18505856)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (11-205)||(3433089-3433283)
chr8 (11-192)||(21853409-21853590)
chr8 (13-192)||(21846006-21846185)
chr8 (1-192)||(22089947-22090138)
chr8 (1-192)||(15320563-15320754)
chr8 (1-192)||(15500932-15501123)
chr8 (11-192)||(224676-224857)
chr8 (11-192)||(738299-738480)
chr8 (11-192)||(862194-862375)
chr8 (11-192)||(16675839-16676020)
chr8 (11-180)||(16874452-16874621)
chr8 (11-192)||(701089-701270)
chr8 (11-192)||(24662760-24662940)
chr8 (11-192)||(5236658-5236838)
chr8 (11-192)||(43684117-43684297)
chr8 (13-192)||(642953-643131)
chr8 (80-203)||(23509370-23509493)
chr8 (13-192)||(272718-272896)
chr8 (13-192)||(828759-828937)
chr8 (80-205)||(24547674-24547799)
chr8 (1-203)||(24387213-24387415)
chr8 (1-176)||(16203842-16204016)
chr8 (1-176)||(29758771-29758946)
chr8 (81-176)||(22008138-22008233)
chr8 (81-176)||(24108244-24108338)
chr8 (80-176)||(22909144-22909239)
chr8 (80-169)||(24930700-24930789)
chr8 (81-176)||(13664295-13664390)
chr8 (81-176)||(13723570-13723665)
chr8 (96-175)||(43375200-43375278)
chr8 (79-150)||(270245-270316)
chr8 (79-150)||(645604-645675)
chr8 (79-150)||(831339-831410)
chr8 (81-176)||(19994801-19994895)
chr8 (5-171)||(41244113-41244277)
chr8 (81-175)||(24719076-24719169)
chr8 (81-151)||(25120943-25121013)
chr8 (79-124)||(25294524-25294569)
chr8 (79-124)||(25756513-25756558)
chr8 (103-176)||(37605464-37605536)
chr8 (81-121)||(23116418-23116458)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (11-205)||(34822647-34822841)
chr2 (11-205)||(3800626-3800820)
chr2 (11-205)||(8942095-8942289)
chr2 (11-205)||(12637678-12637872)
chr2 (11-192)||(12726515-12726696)
chr2 (11-192)||(23772999-23773180)
chr2 (1-205)||(21140326-21140529)
chr2 (1-205)||(21276031-21276234)
chr2 (1-192)||(24687172-24687363)
chr2 (11-192)||(17398109-17398290)
chr2 (11-176)||(12643539-12643703)
chr2 (11-205)||(19888292-19888485)
chr2 (11-192)||(14907952-14908132)
chr2 (11-192)||(20013585-20013765)
chr2 (11-192)||(23818642-23818822)
chr2 (13-192)||(28777215-28777393)
chr2 (13-192)||(5889812-5889990)
chr2 (13-192)||(11232767-11232945)
chr2 (13-192)||(22514614-22514792)
chr2 (80-205)||(24828143-24828268)
chr2 (80-205)||(24832595-24832720)
chr2 (1-203)||(22692741-22692943)
chr2 (1-203)||(22697388-22697590)
chr2 (105-202)||(25211332-25211429)
chr2 (1-176)||(8886612-8886785)
chr2 (1-203)||(22282569-22282772)
chr2 (80-203)||(22273336-22273459)
chr2 (1-176)||(43644481-43644654)
chr2 (1-176)||(15631867-15632041)
chr2 (1-141)||(22861993-22862132)
chr2 (79-176)||(25877615-25877711)
chr2 (96-176)||(461142-461221)
chr2 (1-176)||(6877914-6878087)
chr2 (79-176)||(20629014-20629111)
chr2 (96-176)||(24966693-24966772)
chr2 (80-176)||(36892358-36892453)
chr2 (96-175)||(9654505-9654583)
chr2 (1-141)||(25600466-25600605)
chr2 (5-121)||(19658475-19658590)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (1-205)||(16819357-16819561)
chr3 (11-190)||(16745683-16745862)
chr3 (1-192)||(44227888-44228079)
chr3 (11-192)||(27839168-27839349)
chr3 (11-192)||(30151797-30151978)
chr3 (11-192)||(53769121-53769302)
chr3 (11-192)||(8269915-8270096)
chr3 (11-192)||(8277026-8277207)
chr3 (11-192)||(8305835-8306016)
chr3 (11-192)||(45859480-45859661)
chr3 (14-192)||(13956320-13956498)
chr3 (14-192)||(13977153-13977331)
chr3 (11-192)||(41268702-41268883)
chr3 (18-192)||(55314842-55315016)
chr3 (11-205)||(2450840-2451033)
chr3 (11-205)||(18909140-18909333)
chr3 (11-205)||(22273495-22273688)
chr3 (1-176)||(17913755-17913930)
chr3 (11-172)||(49230696-49230856)
chr3 (13-192)||(1469168-1469346)
chr3 (80-205)||(23081746-23081871)
chr3 (83-205)||(15470048-15470170)
chr3 (80-205)||(15574495-15574620)
chr3 (80-205)||(15613514-15613639)
chr3 (96-204)||(18905354-18905462)
chr3 (80-192)||(12266071-12266183)
chr3 (80-194)||(14846243-14846357)
chr3 (1-197)||(15939965-15940161)
chr3 (1-176)||(2048538-2048713)
chr3 (1-151)||(8630342-8630491)
chr3 (1-175)||(19230531-19230704)
chr3 (83-176)||(19262602-19262695)
chr3 (1-176)||(10737036-10737209)
chr3 (80-176)||(30141363-30141458)
chr3 (1-176)||(33340320-33340496)
chr3 (79-176)||(51160065-51160161)
chr3 (1-176)||(319128-319301)
chr3 (80-176)||(17957994-17958090)
chr3 (80-176)||(19945107-19945202)
chr3 (80-176)||(23490983-23491079)
chr3 (81-176)||(25057250-25057345)
chr3 (1-176)||(50113642-50113816)
chr3 (82-178)||(5227193-5227290)
chr3 (80-141)||(16259558-16259619)
chr3 (81-176)||(17099088-17099182)
chr3 (81-176)||(19572429-19572523)
chr3 (81-176)||(15860807-15860901)
chr3 (81-176)||(6148456-6148548)
chr3 (1-151)||(7852303-7852452)
chr3 (81-176)||(16183664-16183758)
chr3 (106-176)||(45581313-45581382)
chr3 (1-121)||(12490253-12490372)
chr3 (1-121)||(15874690-15874809)
chr3 (81-176)||(30204870-30204962)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (11-205)||(23976024-23976218)
chr6 (11-192)||(29870988-29871169)
chr6 (1-192)||(16650749-16650940)
chr6 (11-192)||(16230049-16230230)
chr6 (11-192)||(26088303-26088484)
chr6 (1-192)||(16557519-16557710)
chr6 (6-192)||(16642519-16642705)
chr6 (11-202)||(14628124-14628315)
chr6 (11-177)||(23993644-23993810)
chr6 (11-205)||(25174011-25174204)
chr6 (1-205)||(33316086-33316289)
chr6 (1-176)||(4989381-4989555)
chr6 (11-192)||(27655600-27655780)
chr6 (13-192)||(10487348-10487526)
chr6 (13-192)||(16377801-16377979)
chr6 (13-192)||(16385125-16385303)
chr6 (80-205)||(1659291-1659416)
chr6 (80-205)||(1651530-1651655)
chr6 (80-204)||(11214595-11214720)
chr6 (1-176)||(1554325-1554498)
chr6 (81-189)||(22227260-22227369)
chr6 (1-176)||(19984709-19984884)
chr6 (81-192)||(18088371-18088482)
chr6 (1-176)||(18128757-18128934)
chr6 (81-192)||(19608891-19609002)
chr6 (1-139)||(16827382-16827519)
chr6 (81-176)||(18825419-18825513)
chr6 (1-176)||(25745818-25745991)
chr6 (81-179)||(17343846-17343945)
chr6 (81-176)||(18843480-18843574)
chr6 (1-176)||(31626914-31627087)
chr6 (81-176)||(18004634-18004729)
chr6 (80-150)||(15861243-15861313)
chr6 (1-176)||(16238849-16239022)
chr6 (96-176)||(13622798-13622877)
chr6 (81-176)||(25646517-25646611)
chr6 (1-176)||(18775687-18775860)
chr6 (1-151)||(16105058-16105207)
chr6 (81-176)||(18422210-18422304)
chr6 (1-151)||(22428675-22428824)
chr6 (96-173)||(18740861-18740937)
chr6 (173-205)||(15861210-15861242)
chr6 (1-64)||(23151846-23151909)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-192)||(26010699-26010890)
chr7 (11-192)||(13757044-13757225)
chr7 (11-192)||(10988077-10988258)
chr7 (11-192)||(25293795-25293976)
chr7 (11-192)||(13912630-13912811)
chr7 (1-176)||(369367-369541)
chr7 (11-150)||(42057680-42057819)
chr7 (11-205)||(16416920-16417113)
chr7 (5-172)||(15952606-15952772)
chr7 (59-192)||(15518422-15518555)
chr7 (11-192)||(15443076-15443256)
chr7 (13-192)||(7821390-7821568)
chr7 (13-192)||(7828701-7828879)
chr7 (13-192)||(27175082-27175260)
chr7 (13-192)||(38785158-38785336)
chr7 (11-192)||(11514588-11514768)
chr7 (11-192)||(30263641-30263821)
chr7 (13-192)||(27103066-27103244)
chr7 (13-192)||(27110414-27110592)
chr7 (78-198)||(2436088-2436208)
chr7 (5-88)||(15525997-15526080)
chr7 (1-176)||(15761877-15762050)
chr7 (81-192)||(18981568-18981680)
chr7 (80-179)||(18255409-18255508)
chr7 (81-192)||(15925758-15925869)
chr7 (1-176)||(3893569-3893742)
chr7 (80-176)||(32496143-32496239)
chr7 (81-202)||(2192357-2192479)
chr7 (81-202)||(16480587-16480709)
chr7 (1-151)||(1938287-1938435)
chr7 (1-176)||(112814-112990)
chr7 (96-176)||(7291259-7291337)
chr7 (1-151)||(12753379-12753528)
chr7 (98-176)||(11582551-11582628)
chr7 (1-121)||(3058585-3058703)
chr7 (1-176)||(26071783-26071956)
chr7 (1-176)||(26095570-26095743)
chr7 (144-192)||(42059941-42059989)
chr7 (81-176)||(13867687-13867781)
chr7 (99-172)||(122986-123059)
chr7 (81-173)||(142046-142137)
chr7 (1-124)||(15913952-15914074)
chr7 (96-175)||(36051071-36051149)
chr7 (98-176)||(13038825-13038902)
chr7 (1-118)||(2027095-2027212)
chr7 (81-176)||(44863618-44863712)
chr7 (1-176)||(45453775-45453944)
chr7 (1-65)||(125418-125482)
chr7 (83-176)||(15824105-15824197)
chr7 (81-121)||(9322663-9322703)
chr7 (96-176)||(16210186-16210265)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (11-205)||(47355774-47355968)
chr4 (11-203)||(19998978-19999170)
chr4 (13-205)||(26678493-26678685)
chr4 (11-192)||(13049678-13049859)
chr4 (11-192)||(14950482-14950663)
chr4 (15-200)||(15138077-15138262)
chr4 (11-192)||(26337947-26338128)
chr4 (11-176)||(22356078-22356242)
chr4 (11-176)||(15274274-15274439)
chr4 (11-205)||(18246639-18246832)
chr4 (1-176)||(5684408-5684583)
chr4 (11-192)||(10487133-10487313)
chr4 (11-192)||(16329438-16329618)
chr4 (92-205)||(8372922-8373035)
chr4 (80-205)||(14994649-14994774)
chr4 (81-205)||(18167166-18167291)
chr4 (1-176)||(109960-110133)
chr4 (81-192)||(15288611-15288722)
chr4 (81-192)||(15295778-15295889)
chr4 (81-176)||(10642589-10642684)
chr4 (1-176)||(15211817-15211994)
chr4 (81-176)||(9293927-9294022)
chr4 (1-151)||(21961083-21961232)
chr4 (1-141)||(16521301-16521441)
chr4 (81-176)||(16366360-16366454)
chr4 (1-176)||(12901287-12901459)
chr4 (4-151)||(8874011-8874157)
chr4 (1-124)||(34197689-34197811)
chr4 (81-175)||(53909430-53909523)
chr4 (103-176)||(44054334-44054406)
chr4 (79-176)||(12837919-12838017)
chr4 (1-124)||(37958581-37958703)
chr4 (96-176)||(54119904-54119983)
chr4 (98-176)||(13244768-13244845)
chr4 (109-174)||(7134088-7134152)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-192)||(29814-30005)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (11-192)||(17606-17787)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-192)||(34796-34987)
scaffold0023 (80-205)||(155935-156060)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-205)||(5632-5825)
scaffold0003 (80-203)||(217335-217458)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (11-192)||(25366-25546)
scaffold0141 (11-192)||(21111-21291)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-192)||(3090-3270)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (11-121)||(66955-67065)
scaffold0044 (162-192)||(67062-67092)
scaffold0044 (163-192)||(67093-67122)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (13-192)||(37752-37930)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (1-205)||(15893-16097)
scaffold0396 (1-121)||(13710-13829)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-204)||(4292-4495)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (80-205)||(1371-1497)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (80-204)||(14751-14875)
scaffold0225 (80-204)||(28272-28396)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (83-200)||(1-118)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (1-204)||(6655-6858)
scaffold0022 (1-204)||(58942-59145)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (80-204)||(9511-9635)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (80-204)||(51483-51607)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (80-200)||(128843-128963)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-194)||(106461-106654)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (81-192)||(15530-15641)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-196)||(197610-197803)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-204)||(32698-32902)
scaffold0184 (80-175)||(33756-33850)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (134-205)||(25804-25875)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-204)||(39942-40146)
scaffold0078 (80-175)||(38994-39088)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-175)||(145012-145185)
scaffold0025 (1-175)||(147271-147444)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (110-190)||(24878-24958)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (5-176)||(54119-54288)
scaffold0032 (80-151)||(109667-109738)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (80-198)||(13-132)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (13-176)||(11552-11713)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-176)||(236654-236827)
scaffold0009 (80-176)||(270599-270695)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-176)||(4256-4432)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (1-176)||(558-733)
scaffold0269 (81-175)||(3426-3519)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-176)||(49096-49272)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-176)||(12671-12844)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-176)||(60047-60220)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (1-176)||(138326-138499)
scaffold0021 (80-176)||(76760-76855)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (80-171)||(12786-12876)
scaffold0266 (80-171)||(5184-5274)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-176)||(14149-14324)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (1-151)||(7929-8078)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (80-176)||(2717-2815)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (80-151)||(874-945)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (80-155)||(17071-17146)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-151)||(56436-56585)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (96-171)||(129802-129877)
scaffold0008 (81-174)||(21037-21129)
scaffold0008 (82-174)||(28627-28718)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-139)||(41222-41361)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (1-141)||(3166-3305)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (1-176)||(17778-17953)
scaffold0195 (1-176)||(19862-20037)
scaffold0195 (79-124)||(8247-8292)
scaffold0195 (79-124)||(13636-13681)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-176)||(27045-27220)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (98-175)||(40006-40082)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-176)||(6019-6192)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (96-176)||(125007-125086)
scaffold0011 (80-176)||(256558-256653)
scaffold0011 (82-176)||(72012-72105)
scaffold0011 (82-176)||(76393-76486)
scaffold0011 (81-173)||(192983-193074)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (81-176)||(1510-1604)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (81-176)||(1045-1139)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (96-175)||(6824-6902)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (1-150)||(4627-4775)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-176)||(249055-249231)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-171)||(7465-7635)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (80-176)||(26414-26509)
scaffold0037 (103-151)||(66337-66385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (81-176)||(31211-31305)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (87-142)||(44638-44693)
scaffold0049 (81-175)||(30998-31091)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (81-176)||(20905-20999)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (80-151)||(72104-72175)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (81-173)||(712-803)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (98-170)||(6326-6397)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (96-176)||(77900-77979)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (81-176)||(18058-18152)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (80-151)||(163832-163903)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (82-176)||(7013-7106)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (81-150)||(3706-3775)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-57)||(52781-52837)
scaffold0018 (1-57)||(56733-56789)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25425267 - 25425073
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425267 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 25425168  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425167 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 25425073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11341281 - 11341087
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341281 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 11341182  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11341181 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 11341087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 4201599 - 4201780
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201599 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 4201698  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4201699 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatga 4201780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24595146 - 24594965
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24595146 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 24595047  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24595046 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 24594965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19498445 - 19498253
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498445 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 19498346  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgat 203  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19498345 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgat 19498253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327417
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23327598 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 23327499  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23327498 atgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattcgtgatgaattgaggtgaatga 23327417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27008657 - 27008476
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27008657 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctc 27008558  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27008557 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 27008476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 9732299 - 9732493
Alignment:
Q  10 aactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732299 aactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 9732397  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9732398 catgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 9732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445581
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43445390 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 43445489  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 202  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  43445490 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgatgaaatgagatgaatgactattcatga 43445581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1221355 - 1221529
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1221355 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgttgagat 1221454  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  1221455 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaa-atgtgattggtgat 1221529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10779803 - 10779977
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10779803 aaagggttgagctcttttactttgagattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgttgagat 10779901  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10779902 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 10779977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10802
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10995 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 10898  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 10802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 11213226 - 11213401
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213226 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 11213325  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||| ||||||| ||||    
T  11213326 ttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgat 11213401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 29192251 - 29192444
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192251 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 29192348  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192349 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 29192444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 110608 - 110782
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110608 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 110706  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||  |||  |||||||||| ||||    
T  110707 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 110782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 22884816 - 22884976
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884816 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcaaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 22884915  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||    
T  22884916 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 22884976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 21075122 - 21075302
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21075122 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 21075219  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21075220 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatga 21075302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37051629 - 37051449
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  37051629 actcttttacttcgagattattgtgaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 37051532  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37051531 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 37051449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 25901959 - 25902139
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||     
T  25901959 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttatagagatttggtaccg 25902056  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25902057 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 25902139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 21933795 - 21933973
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933795 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 21933892  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21933893 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 21933973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 21939965 - 21940143
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939965 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 21940062  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21940063 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 21940143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22368108 - 22368282
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||    
T  22368108 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggggtgagcc-ttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgaga 22368205  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22368206 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22368282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35580897 - 35580719
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580897 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 35580800  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35580799 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 35580719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20615257 - 20615077
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||  |  || | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  20615257 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgtgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgtagagatttggtagcg 20615160  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615159 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 20615077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 37010799 - 37010977
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37010799 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagct-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 37010896  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37010897 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatagagaagaatga 37010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 21235039 - 21235220
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagattt-ggtacc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21235039 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagattttggtacc 21235136  T
Q  109 acatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
     ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21235137 gcatacatttatgtgtccataagtgcatatcataacatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 21235220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16534951 - 16534791
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16534951 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 16534854  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16534853 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattgg 16534791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7424178 - 7424067
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  7424178 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 7424080  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  7424079 ttgagatgaatga 7424067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4863913 - 4863740
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  4863913 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 4863816  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  4863815 tttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 4863740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23510475 - 23510395
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  23510475 gagatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgat 23510395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 27185348 - 27185521
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  27185348 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 27185445  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  27185446 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 27185521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Original strand, 35792832 - 35792903
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  35792832 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 35792903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 17473566 - 17473645
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17473566 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 17473645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 21653051 - 21653145
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  21653051 ggtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 21653145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 32967692 - 32967814
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  32967692 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 32967789  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  32967790 ttcggtaccacatgcatttatgcgt 32967814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 1170320 - 1170414
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||| |||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1170320 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 1170414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 151
Target Start/End: Original strand, 18779788 - 18779843
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  18779788 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 18779843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24470805 - 24470711
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||    
T  24470805 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtctta-ctgatatatgtgattgctgat 24470711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211689
Alignment:
Q  109 acatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 25211689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275841
Alignment:
Q  109 acatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 25275841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 21661315 - 21661411
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || |||||| |||||||    
T  21661315 aaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgaatggtgat 21661411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23492647 - 23492532
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | |||| |    
T  23492647 ggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtgattcg 23492550  T
Q  104 gtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23492549 gtaccacatgcatttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21392699 - 21392605
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  21392699 ggtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 21392605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11582398 - 11582325
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  11582398 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatgtatgtgattgg 11582325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17147423 - 17147229
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147423 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 17147324  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147323 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 17147229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22034490 - 22034309
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22034490 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 22034391  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22034390 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 22034309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 20826744 - 20826925
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20826744 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 20826843  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826844 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 20826925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642286
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7642105 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 7642204  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7642205 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgatgaatcgatatgaatga 7642286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 5073823 - 5074004
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5073823 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 5073922  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5073923 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgatttgagatgaatga 5074004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 18602566 - 18602747
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18602566 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 18602665  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18602666 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgatttgagatgaatga 18602747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 51451254 - 51451074
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51451254 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 51451157  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51451156 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 51451074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41393093 - 41392914
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41393093 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 41392996  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatg 191  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41392995 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatg 41392914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17003464 - 17003286
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003464 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 17003367  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17003366 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 17003286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22226632 - 22226430
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||    |  ||||| | |||||||||||| | ||||    
T  22226632 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgga-ggtgacgaccttttggaga 22226536  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22226535 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattga 22226436  T
Q  200 tgatgt 205  Q
    ||||||    
T  22226435 tgatgt 22226430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 35935164 - 35935289
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35935164 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtcaaattcgtgattggtgatgaa 35935263  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  35935264 atgagatgaatgattattgatgatgt 35935289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45050260 - 45050135
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  45050260 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 45050161  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  45050160 atgagatgaatgattattgatgatgt 45050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 21651601 - 21651712
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21651601 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 21651700  T
Q  180 ttgagatgaatg 191  Q
    ||||||||||||    
T  21651701 ttgagatgaatg 21651712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20444390 - 20444217
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||   |   ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  20444390 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 20444293  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20444292 tttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20444217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29137376 - 29137281
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29137376 gagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaattgagatgaatga 29137281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 37845986 - 37846159
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||   |   ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  37845986 aaagggctgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 37846083  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  37846084 tttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 37846159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44036411 - 44036615
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||||  |  ||   |||| | ||||||||||||| | ||    
T  44036411 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatc-agaggtgacgaccttttgga 44036508  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||    
T  44036509 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaaatgtgattaatgattatt 44036608  T
Q  198 gatgatg 204  Q
     ||||||    
T  44036609 catgatg 44036615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22352779 - 22352604
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  22352779 aaagggttgagctctcttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttttggag 22352682  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22352681 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22352604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20530155 - 20529981
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||   |   ||||||| || |||||| || | ||||    
T  20530155 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaagggggacgacgttttggaga 20530057  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20530056 tttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20529981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20930045 - 20929924
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||   |||||    
T  20930045 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgtccatgaa 20929947  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatga 202  Q
     || ||| |||||||||| ||||    
T  20929946 atgtgattaatgattattcatga 20929924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22029338 - 22029293
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029338 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttaca 22029293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 15863017 - 15863108
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||    
T  15863017 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 15863108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 22250620 - 22250711
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| ||||||| || || ||||||||||    
T  22250620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaa-atgtgattgg 22250711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22365253 - 22365158
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  22365253 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 22365158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49966152 - 49966058
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  49966152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 49966058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35053484 - 35053336
Alignment:
Q  2 aagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | |||    
T  35053484 aagggttgaactcttttacttatgagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtgat 35053387  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
      ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  35053386 ccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 35053336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5676121 - 5676291
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  5676121 aaagggttgaactctcttacttcagagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaa-ggtgacgaccttgaggtga 5676218  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggt 173  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || |||||||||||    
T  5676219 tacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggt 5676291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 9785898 - 9785992
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  9785898 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 9785992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 22407893 - 22407987
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22407893 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 22407987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 20895406 - 20895483
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20895406 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20895483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 2422732 - 2422826
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  2422732 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 2422826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21858037 - 21857931
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgatta 195  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || |  |||| || ||| ||||||||    
T  21858037 gagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgacatatgtgactgtttttgaaatgtgattaatgatta 21857939  T
Q  196 ttgatgat 203  Q
    || |||||    
T  21857938 ttcatgat 21857931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18505856 - 18505816
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18505856 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatg 18505816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 3433089 - 3433283
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433089 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 3433188  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3433189 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 3433283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 21853409 - 21853590
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853409 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 21853508  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853509 atgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 21853590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 21846006 - 21846185
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846006 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 21846105  T
Q  113 gcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846106 gcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 21846185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 22089947 - 22090138
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089947 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 22090046  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22090047 ttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 22090138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 15320563 - 15320754
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15320563 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 15320662  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15320663 ttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 15320754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 15500932 - 15501123
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15500932 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 15501031  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15501032 ttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 15501123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 224676 - 224857
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  224676 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 224775  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  224776 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 738299 - 738480
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  738299 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 738398  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  738399 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 738480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 862194 - 862375
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  862194 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 862293  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  862294 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 862375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 16675839 - 16676020
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16675839 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 16675938  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16675939 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgggatgaatga 16676020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 16874452 - 16874621
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16874452 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 16874551  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaat 180  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16874552 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaat 16874621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 701089 - 701270
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  701089 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 701188  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  701189 atgcatttttttgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 701270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 24662760 - 24662940
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24662760 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 24662857  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24662858 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 24662940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5236838 - 5236658
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236838 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 5236741  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5236740 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 5236658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43684297 - 43684117
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  43684297 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtactg 43684200  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43684199 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 43684117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 643131 - 642953
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  643131 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 643034  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  643033 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 642953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23509493 - 23509370
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23509493 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 23509394  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgat 203  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23509393 atgagatgaatgattattgatgat 23509370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 272718 - 272896
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272718 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 272815  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  272816 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 272896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 828937 - 828759
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828937 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 828840  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  828839 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 828759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24547799 - 24547674
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  24547799 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 24547700  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  24547699 atgagatgaatgattattgatgatgt 24547674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24387213 - 24387415
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  ||   |||| | ||||||||||||| ||||    
T  24387213 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatc-agaggtgacgacctt-ttga 24387309  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||| |||||| | ||||| || ||| ||||||||||    
T  24387310 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattgttcatgaaatgtgattaatgattatt 24387409  T
Q  198 gatgat 203  Q
     |||||    
T  24387410 catgat 24387415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16203842 - 16204016
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||   ||||||| |||||||||||| | ||    
T  16203842 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtg-aattgatccatcgaa-ggtgacgaccttttgga 16203938  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16203939 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 16204016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29758946 - 29758771
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaa-gtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||    ||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  29758946 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaa-ggtgacgaccttttggag 29758849  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  29758848 atttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 29758771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 22008138 - 22008233
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22008138 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22008233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 24108244 - 24108338
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24108244 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 24108338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 22909144 - 22909239
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  22909144 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaa-atgtgattgatgat 22909239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 24930700 - 24930789
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgat 169  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||    
T  24930700 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 13664295 - 13664390
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  13664295 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 13664390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 13723570 - 13723665
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  13723570 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 13723665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 43375200 - 43375278
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  43375200 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 43375278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 270316 - 270245
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  270316 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 270245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Original strand, 645604 - 645675
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  645604 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Original strand, 831339 - 831410
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  831339 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 831410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 19994801 - 19994895
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  19994801 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 19994895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41244113
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| |||| |    || |||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtgatttg 41244180  T
Q  104 gtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattg 171  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  ||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  41244179 gtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttat-tgatatatgtgattg 41244113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Original strand, 24719076 - 24719169
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  24719076 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatatgattggtga 24719169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25121013 - 25120943
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  25121013 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtc 25120943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25294569 - 25294524
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25294569 aaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgt 25294524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25756558 - 25756513
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25756558 aaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgt 25756513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37605536 - 37605464
Alignment:
Q  103 ggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||| ||||    
T  37605536 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgatgat 37605464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 23116418 - 23116458
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23116418 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34822841 - 34822647
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822841 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 34822742  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34822741 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 34822647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 3800626 - 3800820
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800626 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 3800725  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3800726 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatggttattgatgatgt 3800820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8942289 - 8942095
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8942289 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaa 8942190  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942189 gtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 8942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 12637678 - 12637872
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637678 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 12637777  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12637778 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 12637872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12726696 - 12726515
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726696 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 12726597  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726596 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 12726515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23773180 - 23772999
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23773180 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 23773081  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23773080 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 23772999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21140529 - 21140326
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21140529 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgttgagat 21140431  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21140430 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgat 21140331  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  21140330 gatgt 21140326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 21276031 - 21276234
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21276031 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgttgagat 21276129  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276130 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgatgaattgagatgaatgattattgat 21276229  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  21276230 gatgt 21276234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 24687172 - 24687363
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24687172 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacgaccttgttgagat 24687271  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24687272 ttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 24687363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 17398109 - 17398290
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17398109 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 17398208  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17398209 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 17398290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 12643539 - 12643703
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643539 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgcgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 12643638  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12643639 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaa-atgtgattggtgat 12643703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 19888292 - 19888485
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888292 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 19888389  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888390 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 19888485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 14907952 - 14908132
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14907952 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 14908049  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14908050 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 14908132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20013765 - 20013585
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20013765 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 20013668  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20013667 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 20013585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23818822 - 23818642
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23818822 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23818725  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23818724 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 23818642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 28777215 - 28777393
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28777215 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 28777312  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28777313 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 28777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 5889812 - 5889990
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5889812 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 5889909  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5889910 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 5889990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 11232767 - 11232945
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232767 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 11232864  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11232865 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 11232945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 22514614 - 22514792
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514614 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 22514711  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22514712 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 22514792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 24828143 - 24828268
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24828143 aggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaa 24828242  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  24828243 atgagatgaatgattattgatgatgt 24828268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 24832595 - 24832720
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24832595 aggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaa 24832694  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  24832695 atgagatgaatgattattgatgatgt 24832720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22692943 - 22692741
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  22692943 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttatggag 22692846  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22692845 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattg 22692746  T
Q  199 atgat 203  Q
    |||||    
T  22692745 atgat 22692741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22697590 - 22697388
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  22697590 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttatggag 22697493  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22697492 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattg 22697393  T
Q  199 atgat 203  Q
    |||||    
T  22697392 atgat 22697388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211332
Alignment:
Q  105 taccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 202  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatga 25211332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8886785 - 8886612
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||| | ||||    
T  8886785 aaagggttgaactcttttacttcagagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 8886688  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  8886687 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatgtgtgattggtgat 8886612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22282772 - 22282569
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  22282772 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 22282675  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||    
T  22282674 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaaatgtgattaatgattatt 22282575  T
Q  198 gatgat 203  Q
     |||||    
T  22282574 catgat 22282569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22273459 - 22273336
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  22273459 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 22273360  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgat 203  Q
     || ||| |||||||||| |||||    
T  22273359 atgtgattaatgattattcatgat 22273336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 43644481 - 43644654
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcga-gattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |   || |||| |||||||| ||| | ||||    
T  43644481 aaagggttgagctcttttacttcgaagattat-gtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaa-ggtgacgatcttttggaga 43644578  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  43644579 tttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtgattggtgat 43644654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15632041 - 15631867
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   |||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |  | ||    
T  15632041 aaagggttaagctcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaagaggcatc-aaaggtgacgacctggaggtga 15631944  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    || |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  15631943 ttcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggtgat 15631867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22862132 - 22861993
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  22862132 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 22862035  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcat 141  Q
    | | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22862034 tctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcat 22861993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 25877615 - 25877711
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25877615 aaggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 25877711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 461221 - 461142
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  461221 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 461142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6878087 - 6877914
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| ||||||||| |||  | ||    
T  6878087 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgactttgaggtga 6877990  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  6877989 tccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 6877914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 20629014 - 20629111
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20629014 aaggtgacgatctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 20629111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24966772 - 24966693
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  24966772 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttat-tgatatatgtgattggtgat 24966693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 36892358 - 36892453
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  36892358 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 36892453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 9654505 - 9654583
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  9654505 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 9654583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25600605 - 25600466
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| |||||||||||||||  |  |    
T  25600605 aaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcg-aaggtgacgaccttgaggtaa 25600508  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcat 141  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||    
T  25600507 tatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcat 25600466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19658590 - 19658475
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcga-gattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttg 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  19658590 ggttgagctcttttacttcgaagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtgatttg 19658493  T
Q  104 gtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19658492 gtaccacatgcatatatg 19658475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16819561 - 16819357
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16819561 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgttgagat 16819462  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16819461 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattactgat 16819362  T
Q  201 gatgt 205  Q
    |||||    
T  16819361 gatgt 16819357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 16745683 - 16745862
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745683 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 16745782  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 190  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16745783 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaat 16745862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44228079 - 44227888
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44228079 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 44227980  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44227979 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaaatgagatgaatga 44227888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27839349 - 27839168
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27839349 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 27839250  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27839249 atgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgatgaattgagatgaatga 27839168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30151978 - 30151797
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30151978 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 30151879  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151878 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 30151797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53769302 - 53769121
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53769302 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 53769203  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769202 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 53769121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 8269915 - 8270096
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8269915 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 8270014  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8270015 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 8270096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 8277026 - 8277207
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8277026 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 8277125  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8277126 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 8277207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 8305835 - 8306016
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8305835 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 8305934  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305935 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 8306016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45859661 - 45859480
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45859661 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 45859562  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45859561 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 45859480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 13956320 - 13956498
Alignment:
Q  14 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13956320 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatg 13956419  T
Q  114 catttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13956420 catttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 13956498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 13977153 - 13977331
Alignment:
Q  14 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13977153 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatg 13977252  T
Q  114 catttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13977253 catttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgatgggtgatgaattgagatgaatga 13977331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41268883 - 41268702
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41268883 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 41268784  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  41268783 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgttttgagatgaatga 41268702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 55315016 - 55314842
Alignment:
Q  18 tacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55315016 tacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatt 55314917  T
Q  118 tatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55314916 tatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgggtgattggtgatgatttgagatgaatga 55314842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 2450840 - 2451033
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450840 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 2450937  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450938 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 2451033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18909333 - 18909140
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909333 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 18909236  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909235 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 18909140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22273688 - 22273495
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273688 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 22273591  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273590 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 22273495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17913755 - 17913930
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913755 aaagggttaagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 17913854  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  17913855 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgat 17913930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 49230856 - 49230696
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49230856 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgttgagatttggtaccac 49230757  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||    
T  49230756 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattgg 49230696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 1469168 - 1469346
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469168 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 1469265  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1469266 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 1469346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 23081746 - 23081871
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  23081746 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgaa 23081845  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  23081846 atgagatgaatgattattgatgatgt 23081871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 205
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470170
Alignment:
Q  83 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattg 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgatgaaatg 15470147  T
Q  183 agatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15470148 agatgaatgattattgatgatgt 15470170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15574620 - 15574495
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15574620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 15574521  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15574520 atgagatgaatgattattgatgatgt 15574495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15613639 - 15613514
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  15613639 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 15613540  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15613539 atgagatgaatgattattgatgatgt 15613514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Original strand, 18905354 - 18905462
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgatta 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18905354 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgatta 18905453  T
Q  196 ttgatgatg 204  Q
    |||||||||    
T  18905454 ttgatgatg 18905462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 192
Target Start/End: Original strand, 12266071 - 12266183
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12266071 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgatgaa 12266170  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
     ||||||||||||    
T  12266171 atgagatgaatga 12266183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Original strand, 14846243 - 14846357
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    
T  14846243 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgataaa 14846342  T
Q  180 ttgagatgaatgatt 194  Q
     ||||||||||||||    
T  14846343 atgagatgaatgatt 14846357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15939965 - 15940161
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  15939965 aaagggctgaacttttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtctatcgga-ggtgacgaccttttggag 15940062  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  15940063 atttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgatgaaatgtggtgaatgattatt 15940161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2048713 - 2048538
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg---catcgaaaggtgacgaccttgttg 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |   ||||||| |||||||||||| |      
T  2048713 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtg--agttgttccatcgaa-ggtgacgaccttttga 2048618  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  2048617 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgat 2048538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8630491 - 8630342
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  | ||    
T  8630491 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaa-ggtgacgacctggaggtga 8630394  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  8630393 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 8630342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19230704 - 19230531
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||   |   ||||||||||||||||| || | ||||    
T  19230704 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaaaggtgacgacgttttggaga 19230606  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  19230605 tttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgataaatgtgattggtga 19230531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262695
Alignment:
Q  83 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 19262695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10737209 - 10737036
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||| ||||||| | ||||    
T  10737209 aaagggttgagctcttctacttcagagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtggcgaccttttggaga 10737113  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  10737112 tttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgat 10737036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30141458 - 30141363
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30141458 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 30141363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33340496 - 33340320
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  33340496 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 33340399  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  33340398 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 33340320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 51160065 - 51160161
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  51160065 aaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcat-tgatatatgtgattggtgat 51160161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 319128 - 319301
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  319128 aaagggttgaactcttttacttcggaaattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 319225  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||| ||||||||||    
T  319226 tctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgcgattggtgat 319301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 17957994 - 17958090
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17957994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgat 17958090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19945202 - 19945107
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  19945202 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 19945107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23491079 - 23490983
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  23491079 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 23490983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25057345 - 25057250
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  25057345 ggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 25057250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 50113642 - 50113816
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||   ||||||| ||||||     | |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  50113642 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttattgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 50113739  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  50113740 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 50113816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5227290 - 5227193
Alignment:
Q  82 gtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatga 178  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||| | | ||| |||||||||| |||||||    
T  5227290 gtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgattagtgatga 5227193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16259619 - 16259558
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcat 141  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16259619 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcat 16259558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17099182 - 17099088
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17099182 ggtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 17099088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 19572429 - 19572523
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  19572429 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgagtggtgat 19572523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 15860807 - 15860901
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||||||  |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15860807 ggtgacgaccctttggagatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 15860901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 6148456 - 6148548
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  6148456 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tg--atatgtgattggtgat 6148548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7852452 - 7852303
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||   ||||||| ||||||    || | |||||| |||||||||||||  | ||    
T  7852452 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttggatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 7852355  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  7852354 tttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtc 7852303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 16183664 - 16183758
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16183664 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 16183758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581313
Alignment:
Q  106 accacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 45581313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 12490253 - 12490372
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| |||||||||||||||    ||    
T  12490253 aaagggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcg-aaggtgacgaccttgagatga 12490350  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  12490351 ttcggtaccacatgcatttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15874809 - 15874690
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| |||||||||||||||  | ||    
T  15874809 aaagggttgagctcttttacttcagtgatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcg-aaggtgacgaccttgaggtga 15874712  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  15874711 ttcggtaccacatgcatttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30204962 - 30204870
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  || ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  30204962 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatt--tgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 30204870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23976218 - 23976024
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976218 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 23976119  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23976118 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 23976024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 29870988 - 29871169
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29870988 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 29871087  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29871088 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 29871169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16650749 - 16650940
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16650749 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 16650848  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16650849 ttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 16650940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16230230 - 16230049
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16230230 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 16230131  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230130 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 16230049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26088484 - 26088303
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088484 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 26088385  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26088384 atgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaaacgaaatgaatga 26088303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16557519 - 16557710
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16557519 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 16557618  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16557619 ttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 16557710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Original strand, 16642519 - 16642705
Alignment:
Q  6 gttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggt 105  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16642519 gttgaattctttgacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacctggttgagatttggt 16642618  T
Q  106 accacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16642619 accgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 16642705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 14628124 - 14628315
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628124 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 14628223  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatga 202  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  14628224 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgactattcatga 14628315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23993810 - 23993644
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23993810 actcttttactttgaaattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 23993711  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatg 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23993710 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatg 23993644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25174204 - 25174011
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174204 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 25174107  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174106 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 25174011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33316086 - 33316289
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  33316086 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 33316183  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattga 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33316184 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattga 33316283  T
Q  200 tgatgt 205  Q
    ||||||    
T  33316284 tgatgt 33316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4989555 - 4989381
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989555 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 4989457  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||  |||  |||||||||| ||||    
T  4989456 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 4989381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 27655600 - 27655780
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655600 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 27655697  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27655698 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatga 27655780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10487526 - 10487348
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487526 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 10487429  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10487428 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 10487348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 16377801 - 16377979
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377801 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 16377898  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16377899 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 16377979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 16385125 - 16385303
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385125 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 16385222  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16385223 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 16385303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 1659291 - 1659416
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1659291 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgatgaa 1659390  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  1659391 ttgagatgaatgcttattgatgatgt 1659416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 1651530 - 1651655
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1651530 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgatgga 1651629  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  1651630 atgagatgaatgattattgatgatgt 1651655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11214720 - 11214595
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatga 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11214720 aggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgatga 11214621  T
Q  179 attgagatgaatgattattgatgatg 204  Q
    | |||||| |||||||||||||||||    
T  11214620 aatgagattaatgattattgatgatg 11214595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1554498 - 1554325
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  1554498 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 1554402  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  1554401 tttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgat 1554325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 22227260 - 22227369
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22227260 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 22227359  T
Q  180 ttgagatgaa 189  Q
      ||||||||    
T  22227360 acgagatgaa 22227369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19984709 - 19984884
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaa-gtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    ||  ||||||| |||||||||||| | ||     
T  19984709 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaa-ggtgacgaccttttggat 19984806  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  19984807 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 19984884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 18088371 - 18088482
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18088371 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 18088469  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  18088470 ttgagatgaatga 18088482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18128934 - 18128757
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcga-gattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaa----aggtgacgaccttgtt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||| || |      
T  18128934 aaagggttgaactcttttacttcgaagattat-gtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaatcgaaggtgacgaactggag 18128836  T
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  18128835 gtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaa--atgtgattggtgat 18128757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19609002 - 19608891
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19609002 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgtatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 19608904  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    ||| |||||||||    
T  19608903 ttgtgatgaatga 19608891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 16827382 - 16827519
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||    
T  16827382 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgttgggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgaga 16827479  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatc 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  16827480 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatc 16827519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 18825419 - 18825513
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18825419 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 18825513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25745818 - 25745991
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||  |||||||||||||  | ||    
T  25745818 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgag-ggtgacgaccttgaggtga 25745915  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  25745916 tttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 25745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Original strand, 17343846 - 17343945
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17343846 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgatgaa 17343945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 18843480 - 18843574
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18843480 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 18843574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31627087 - 31626914
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   |||||||  |||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  31627087 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 31626990  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31626989 tttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 31626914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 18004634 - 18004729
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  18004634 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgat 18004729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15861313 - 15861243
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  15861313 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16239022 - 16238849
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttg-ag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||    |  ||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  16239022 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgga-ggtgacgacctttttggag 16238926  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16238925 attttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 16238849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 13622798 - 13622877
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13622798 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 13622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 25646517 - 25646611
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  25646517 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatttgattggtgat 25646611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18775860 - 18775687
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || | |||||| ||||||||| |||  | ||    
T  18775860 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgtatcgaa-ggtgacgactttgaggtga 18775763  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  18775762 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaa-atgtgaatggtgat 18775687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16105207 - 16105058
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  |  |    
T  16105207 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtta 16105110  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||||||    
T  16105109 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtc 16105058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18422304 - 18422210
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  18422304 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtgat 18422210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22428824 - 22428675
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   | ||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  22428824 aaagggttcaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 22428727  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  22428726 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 22428675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18740937 - 18740861
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggt 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18740937 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggt 18740861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15861242 - 15861210
Alignment:
Q  173 tgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861242 tgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 15861210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23151909 - 23151846
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    
T  23151909 aaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgt 23151846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 26010699 - 26010890
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26010699 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 26010798  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26010799 ttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 26010890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757044
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13757225 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 13757126  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757125 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 13757044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10988258 - 10988077
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10988258 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 10988159  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10988158 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaaatgagatgaatga 10988077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 25293795 - 25293976
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25293795 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 25293894  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293895 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 25293976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 13912630 - 13912811
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13912630 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 13912729  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13912730 atgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattgacgatgaattgagatgaatga 13912811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 369541 - 369367
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369541 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 369443  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  369442 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 369367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Original strand, 42057680 - 42057819
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42057680 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 42057779  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42057780 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16417113 - 16416920
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417113 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgcccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 16417016  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417015 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 16416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 15952606 - 15952772
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttgg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15952606 ggttgaactcttttactttgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacatttgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttgg 15952705  T
Q  105 taccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  15952706 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaa-atgtgattgg 15952772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 15518422 - 15518555
Alignment:
Q  59 cgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15518422 cgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtg 15518521  T
Q  159 aaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15518522 aaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatga 15518555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 15443076 - 15443256
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15443076 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 15443173  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443174 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 15443256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7821568 - 7821390
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821568 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 7821471  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7821470 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 7821390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7828879 - 7828701
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7828879 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 7828782  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7828781 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 7828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27175260 - 27175082
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27175260 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 27175163  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27175162 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 27175082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 38785158 - 38785336
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38785158 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 38785255  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38785256 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagaagaatga 38785336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11514768 - 11514588
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||     
T  11514768 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgtagagatttggtaccg 11514671  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514670 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 11514588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 30263641 - 30263821
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||  |  || | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||     
T  30263641 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttatatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacaaccttgttgagatttggtaccg 30263738  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30263739 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 30263821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 27103066 - 27103244
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27103066 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 27103163  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27103164 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 27103244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 27110414 - 27110592
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27110414 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 27110511  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27110512 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 27110592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2436208 - 2436088
Alignment:
Q  78 aaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2436208 aaaggtgacgacctttttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatg 2436109  T
Q  178 aattgagatgaatgattattg 198  Q
    || || |||||||||||||||    
T  2436108 aaatgggatgaatgattattg 2436088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 15525997 - 15526080
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 88  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15525997 ggttaaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 15526080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 15761877 - 15762050
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  15761877 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 15761973  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  15761974 tttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgat 15762050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 18981568 - 18981680
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18981568 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaa 18981667  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
     ||||||||||||    
T  18981668 atgagatgaatga 18981680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 18255409 - 18255508
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18255409 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 18255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15925869 - 15925758
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15925869 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 15925771  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  15925770 ttgagatgaatga 15925758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3893742 - 3893569
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  3893742 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 3893645  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  3893644 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 3893569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 32496143 - 32496239
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  32496143 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 32496239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 2192357 - 2192479
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||    
T  2192357 ggtgacgacctttttggaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgatgaa 2192456  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatga 202  Q
     |||||||||||| |||| ||||    
T  2192457 atgagatgaatgactattcatga 2192479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 202
Target Start/End: Original strand, 16480587 - 16480709
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||    
T  16480587 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgatgaa 16480686  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatga 202  Q
     |||||||||||| |||| ||||    
T  16480687 atgagatgaatgactattcatga 16480709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 1938287 - 1938435
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||    |  |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  1938287 aaagagttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatc-aaaggtgacgaccttttggaga 1938383  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  1938384 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 1938435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 112814 - 112990
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgac---cttgttg 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||   ||||  |    
T  112814 aaaggattgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgacgaccttgagg 112911  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  112912 tgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaa-atgtgattggtgat 112990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7291337 - 7291259
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  7291337 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa--atgtgattggtgat 7291259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12753528 - 12753379
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||   |||| || ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  12753528 aaagggttgaactcttttacttcggaaattat-gtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 12753431  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  12753430 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 12753379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 11582551 - 11582628
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  11582551 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 11582628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3058703 - 3058585
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  3058703 aaagggttgagctcttttacttcggagattata-taaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 3058607  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3058606 tttggtaccacatgcatttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26071783 - 26071956
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| |||||||||||||||  | ||    
T  26071783 aaagggttgaactcttttacttcagagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcg-aaggtgacgaccttgaggtga 26071880  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  | |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26071881 tccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26071956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 26095570 - 26095743
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| |||||||||||||||  | ||    
T  26095570 aaagggttgaactcttttacttcagagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcg-aaggtgacgaccttgaggtga 26095667  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  | |||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26095668 tccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26095743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 192
Target Start/End: Original strand, 42059941 - 42059989
Alignment:
Q  144 catgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42059941 catgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 42059989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 13867687 - 13867781
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  13867687 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtggttggtgat 13867781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122986
Alignment:
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattgg 172  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgg 122986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 142137 - 142046
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggt 173  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  142137 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggt 142046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 15913952 - 15914074
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  15913952 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 15914049  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  15914050 ttcggtaccacatgcatttatgcgt 15914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36051149 - 36051071
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  36051149 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 36051071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 13038825 - 13038902
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13038825 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttat-tgatatatgtgattggtgat 13038902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2027212 - 2027095
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg---catcgaaaggtgacgaccttgttg 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||||  ||| |   ||||| | |||||||||||| | |    
T  2027212 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtg--agttgttccatcgga-ggtgacgaccttttcg 2027117  T
Q  97 agatttggtaccacatgcattt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2027116 agatttggtaccacatgcattt 2027095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44863712 - 44863618
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  44863712 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtgat 44863618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 45453775 - 45453944
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||   ||||||| |||| |    || |||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  45453775 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacggatgtgaaatcttacatacgatttt---gttgcatcgaa-ggtgatgaccttgaggtga 45453869  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  45453870 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaa--ttgtgattggtgat 45453944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 125482 - 125418
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtg 65  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  125482 aaagggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtg 125418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824197
Alignment:
Q  83 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||| ||||||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgtttggtgat 15824197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 9322663 - 9322703
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  9322663 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16210265 - 16210186
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||| |||||    
T  16210265 gagatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcat-tgatatatgtgatttgtgat 16210186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47355968 - 47355774
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355968 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 47355869  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355868 atgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 47355774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19999170 - 19998978
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999170 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 19999071  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgat 203  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19999070 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgat 19998978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26678685 - 26678493
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678685 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacat 26678586  T
Q  113 gcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26678585 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattgatgatgt 26678493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 13049678 - 13049859
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13049678 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 13049777  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13049778 atgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 13049859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14950663 - 14950482
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950663 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtatgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 14950564  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950563 atgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattggtgatgaattgagatgaatga 14950482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 15138077 - 15138262
Alignment:
Q  15 ttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15138077 ttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgc 15138176  T
Q  115 atttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgat 200  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15138177 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgtgatgaatgattattgat 15138262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26338128 - 26337947
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26338128 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 26338029  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26338028 atacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagttctatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 26337947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 22356078 - 22356242
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356078 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 22356177  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22356178 atgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 22356242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 15274274 - 15274439
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15274274 actcttttacttcgagattattgtaaggtaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacaaccttgttgagatttggtaccac 15274373  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15274374 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15274439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18246832 - 18246639
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246832 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatc-agaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 18246735  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246734 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 18246639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 5684408 - 5684583
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684408 aaagagttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 5684507  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||  |||  |||||||||| ||||    
T  5684508 ttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgat 5684583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10487313 - 10487133
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10487313 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 10487216  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487215 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 10487133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 16329438 - 16329618
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16329438 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 16329535  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16329536 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 16329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8373035 - 8372922
Alignment:
Q  92 tgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8373035 tgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatg 8372936  T
Q  192 attattgatgatgt 205  Q
    ||||||||||||||    
T  8372935 attattgatgatgt 8372922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14994774 - 14994649
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14994774 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgatgaa 14994675  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  14994674 atgagatgaatgattattgatgatgt 14994649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18167291 - 18167166
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18167291 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgatgaa 18167192  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  18167191 atgagatgaatgattattgatgatgt 18167166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 110133 - 109960
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  110133 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 110037  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  110036 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 109960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 15288611 - 15288722
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15288611 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 15288709  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  15288710 ttgagatgaatga 15288722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 15295778 - 15295889
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15295778 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 15295876  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  15295877 ttgagatgaatga 15295889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10642684 - 10642589
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | ||| | ||||||||||||||    
T  10642684 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 10642589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15211994 - 15211817
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttg- 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   |||| | |||||||| |||| |||     
T  15211994 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatc-agaggtgacgtcctttttgg 15211897  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  15211896 atatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 15211817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9294022 - 9293927
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| | | | | | ||||||||||||||    
T  9294022 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgat 9293927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 21961083 - 21961232
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  21961083 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 21961180  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  21961181 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 21961232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16521441 - 16521301
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgt--gcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  ||  ||  ||||| | |||||||||||| |  |    
T  16521441 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttgtc-catcgga-ggtgacgaccttttgaa 16521345  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16521344 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcat 16521301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 16366360 - 16366454
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||    
T  16366360 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattagtgat 16366454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12901287 - 12901459
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    |||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  12901287 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 12901384  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||||| | | ||||  ||||||||||||||    
T  12901385 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaa--atgtgattggtgat 12901459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 8874011 - 8874157
Alignment:
Q  4 gggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagattt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | |||||||  |||||    || |||||||| |||||||||||||  | |||      
T  8874011 gggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtgatcc 8874108  T
Q  103 ggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  8874109 ggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 8874157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 34197689 - 34197811
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  34197689 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 34197786  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  34197787 ttcggtaccacatgcatttatgcgt 34197811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Original strand, 53909430 - 53909523
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  53909430 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 53909523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44054406 - 44054334
Alignment:
Q  103 ggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  44054406 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 44054334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 12837919 - 12838017
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgt--tcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||    ||| |||||||||||  |||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  12837919 aaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtc-tttttgatatatgtgattggtgat 12838017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 37958581 - 37958703
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  37958581 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgatgaccttgaggtga 37958678  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  37958679 ttcggtaccacatgcatttatgcgt 37958703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 54119904 - 54119983
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  54119904 gagatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgatcggtgat 54119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13244845 - 13244768
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13244845 gatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 13244768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134152
Alignment:
Q  109 acatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtg 174  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaa-atgtgattggtg 7134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30005 - 29814
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 29906  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29905 ttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattgtgtgattggtgatgatttgagatgaatga 29814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 17606 - 17787
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17606 actcttttactttgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgc 17705  T
Q  111 atgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17706 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 17787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 34987 - 34796
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34987 aaaggattgaactcttttacttcgatattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagat 34888  T
Q  101 ttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34887 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgattaaatgagatgaatga 34796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 155935 - 156060
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  155935 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgatgaa 156034  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  156035 atgagatgaatgattattgatgatgt 156060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5825 - 5632
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5825 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgcccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 5728  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 5632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217458
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  217335 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaa 217434  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgat 203  Q
     ||  || |||||||||| |||||    
T  217435 atgtaattaatgattattcatgat 217458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25546 - 25366
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25546 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 25449  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 25366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21291 - 21111
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||     
T  21291 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatatggtaccg 21194  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 21111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3270
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3090 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 3187  T
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3188 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Original strand, 66955 - 67065
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66955 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcaacgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctc 67054  T
Q  111 atgcatttatg 121  Q
    |||||||||||    
T  67055 atgcatttatg 67065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 192
Target Start/End: Original strand, 67062 - 67092
Alignment:
Q  162 tatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67062 tatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 67092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 192
Target Start/End: Original strand, 67093 - 67122
Alignment:
Q  163 atgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67093 atgtgattggtgatgaattgagatgaatga 67122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37930 - 37752
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37930 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 37833  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatga 192  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37832 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatgaatggagaagaatga 37752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16097 - 15893
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  16097 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttttggag 16000  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15999 atttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgaatgattattg 15900  T
Q  199 atgatgt 205  Q
    |||||||    
T  15899 atgatgt 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 13710 - 13829
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  13710 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 13807  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatg 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  13808 tttggtaccacatgcatatatg 13829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4495 - 4292
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  4495 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttttggag 4398  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4397 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagattaatgattattg 4298  T
Q  199 atgatg 204  Q
    ||||||    
T  4297 atgatg 4292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 205
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1497
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga-tga 178  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1371 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattga 1470  T
Q  179 attgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  1471 aatgagatgaatgattattgatgatgt 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14875 - 14751
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14875 aggtgacgaccttttggagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 14776  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14775 atgagatgaatgattattgatgatg 14751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28396 - 28272
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28396 aggtgacgaccttttggagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 28297  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  28296 atgagatgaatgattattgatgatg 28272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 1 - 118
Alignment:
Q  83 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattg 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaaatg 100  T
Q  183 agatgaatgattattgat 200  Q
    | ||||||||||||||||    
T  101 aaatgaatgattattgat 118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 6655 - 6858
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  6655 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttttggag 6752  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||    
T  6753 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgattaactattg 6852  T
Q  199 atgatg 204  Q
    ||||||    
T  6853 atgatg 6858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 58942 - 59145
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||  |  || | |||| | |||||||||||| || |     
T  58942 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgacctttttaaa 59039  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  59040 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaaatgagatgattgactattg 59139  T
Q  199 atgatg 204  Q
    ||||||    
T  59140 atgatg 59145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Original strand, 9511 - 9635
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9511 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 9610  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  9611 atgagatgaatgattattgatgatg 9635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51607 - 51483
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  51607 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgatgaa 51508  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgatgatg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  51507 atgagatgaatgattattgatgatg 51483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 128963 - 128843
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  128963 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgatgaa 128864  T
Q  180 ttgagatgaatgattattgat 200  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  128863 atgagatgaatgattattgat 128843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 106654 - 106461
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||  |  || | |||| | |||||||||||| | |||    
T  106654 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtccatcgga-ggtgacgaccttttggag 106557  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgatt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  106556 atttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgatgaaatgtggtgaatgatt 106461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 192
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15641
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaa 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15530 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatgggtgattggtgatgaa 15628  T
Q  180 ttgagatgaatga 192  Q
    |||||||||||||    
T  15629 ttgagatgaatga 15641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 197610 - 197803
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   |  ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  197610 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-cttttatcatcgaa-ggtgacgaccttttggaga 197706  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattat 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||    
T  197707 tttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaaatgtgattaatgattat 197803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 32698 - 32902
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  32698 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 32795  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||    
T  32796 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaaatgtgattaatgattatt 32895  T
Q  198 gatgatg 204  Q
     ||||||    
T  32896 catgatg 32902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33850 - 33756
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33850 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtga 33756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25875 - 25804
Alignment:
Q  134 catatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25875 catatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattattgatgatgt 25804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40146 - 39942
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  40146 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 40049  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaatgattatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||    
T  40048 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattgttcatgaaatgtgattaatgattatt 39949  T
Q  198 gatgatg 204  Q
     ||||||    
T  39948 catgatg 39942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 38994 - 39088
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtga 39088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 145185 - 145012
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg---catcgaaaggtgacgaccttgttg 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||| |   ||||||| |||||||||||| | |    
T  145185 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtg--agttgttccatcgaa-ggtgacgaccttttgg 145090  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  145089 agatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 145012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 147444 - 147271
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg---catcgaaaggtgacgaccttgttg 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| |||||||  ||| |   ||||||| ||||| |||||| | |    
T  147444 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtg--agttgttccatcgaa-ggtgatgaccttttgg 147349  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  147348 agatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 190
Target Start/End: Original strand, 24878 - 24958
Alignment:
Q  110 catgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatgaattgagatgaat 190  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24878 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtggtgaattgagatgaat 24958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54288 - 54119
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttg 103  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||   ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  54288 ggttgagctcttttacttcagagattat-gtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaag-tgacgaccttttggagatttg 54192  T
Q  104 gtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  54191 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgat 54119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Original strand, 109667 - 109738
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  109667 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtc 109738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 13
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgatga 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  132 aggtgacgacctttttggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgatga 33  T
Q  179 attgagatgaatgattattg 198  Q
    | || ||| |||||| ||||    
T  32 aatgtgattaatgatgattg 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 11552 - 11713
Alignment:
Q  13 tcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11552 tcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaa-ggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 11648  T
Q  112 tgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  11649 tgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgat 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 236827 - 236654
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |  | ||    
T  236827 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagtagcatcgaa-ggtgacgacctagaggtga 236730  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  236729 taaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 236654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 270695 - 270599
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  270695 aggtgacgatcttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 270599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4432
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  4256 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 4353  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| | || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  4354 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgat 4432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 558
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  733 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 636  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  635 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3426
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  3519 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 49096 - 49272
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  49096 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 49193  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| | || ||| ||| ||||||||||||||||    
T  49194 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgat 49272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12844 - 12671
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  12844 aaaggcttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 12747  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  12746 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaa-atgtgattggtgat 12671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 60220 - 60047
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  60220 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 60123  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  60122 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 60047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 138326 - 138499
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    |||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  138326 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 138423  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  138424 tttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 76855 - 76760
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  76855 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 76760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Original strand, 12786 - 12876
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattg 171  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  12786 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5274
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattg 171  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  5184 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14324 - 14149
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |   ||||||| ||||||    || |||||||| | |||||||||||  | ||    
T  14324 aaagggttgaattcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-gatgacgaccttgaggtga 14227  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatg-tgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  14226 tttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgat 14149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8078 - 7929
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  8078 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 7981  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  7980 tttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtc 7929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 2717 - 2815
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtg--catatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||  |||||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  2717 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgat 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 874
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  945 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17146 - 17071
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatat 155  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17146 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatat 17071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 56585 - 56436
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||   ||||||| ||||||    || |||||||| | |||||||||| | | ||    
T  56585 aaagggttgaactcttttacttcagagattat-gtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatg-tgacgaccttttggtga 56488  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  56487 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 56436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 129802 - 129877
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  129802 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21129 - 21037
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtg 174  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  21129 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtg 21037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28718 - 28627
Alignment:
Q  82 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtg 174  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  28718 gtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatgtatgtgattggtg 28627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41361 - 41222
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgg--catcgaaaggtgacgaccttgttga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |  ||   ||||| | |||||||||||| | ||    
T  41361 aaagggttgagctcttttacttcgtagattat-gtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcgga-ggtgacgaccttttgga 41264  T
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatc 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  41263 gatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatc 41222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3305 - 3166
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  3305 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 3208  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcat 141  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||    
T  3207 tttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcat 3166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17953 - 17778
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaag-gtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| | ||||||||||||  | |    
T  17953 aaagtgttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtg 17855  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||   ||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  17854 atttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 17778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20037 - 19862
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaag-gtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||    || |||||||| | ||||||||||||  | |    
T  20037 aaagtgttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtg 19939  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||   ||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  19938 atttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 8247 - 8292
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8247 aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgt 8292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13681
Alignment:
Q  79 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgt 124  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13636 aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgt 13681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27220 - 27045
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  27220 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 27123  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatg-tgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |  ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  27122 tccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgat 27045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40082 - 40006
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  40082 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6192 - 6019
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| |||| |    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  6192 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 6095  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  6094 tttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttat-tgatatatgtgattgatgat 6019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 125007 - 125086
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  125007 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 125086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 256558 - 256653
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  256558 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 256653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 72012 - 72105
Alignment:
Q  82 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  72012 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 72105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 76393 - 76486
Alignment:
Q  82 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  76393 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 76486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192983
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggt 173  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  193074 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggt 192983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1510
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1604 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 1045 - 1139
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||| ||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1045 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6902
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  6824 gagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttat-tgatatatatgattggtga 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4775 - 4627
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   |||||||  |||||    || |||||||| |||||||||||||  | ||    
T  4775 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgaccttgaggtga 4678  T
Q  100 tttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  4677 tccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 4627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 249055 - 249231
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgac---cttgttg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| | |||||||  |||||    || |||||||| |||||||||   ||||  |    
T  249055 aaagggttgaactcttttacttaggagattat-gtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaa-ggtgacgacgaccttgagg 249152  T
Q  97 agatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  249153 tgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 249231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7635 - 7465
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgag 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||| |||||| || ||||||  |  || | ||| | |||||| |||||| | |||    
T  7635 aaagggttgaactcttttactttggagattat-gtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttgtccatc-agaggtgatgaccttttggag 7538  T
Q  99 atttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattg 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| ||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7537 atttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 26414 - 26509
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26414 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 26509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 151
Target Start/End: Original strand, 66337 - 66385
Alignment:
Q  103 ggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  66337 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 66385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31305 - 31211
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31305 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtgat 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44693 - 44638
Alignment:
Q  87 gaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcata 142  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  44693 gaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcata 44638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31091 - 30998
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtga 175  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31091 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggtga 30998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 20905 - 20999
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  20905 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtctta-atgatatatgtgattggtgat 20999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Original strand, 72104 - 72175
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  72104 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 72175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 803 - 712
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggt 173  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  803 ggtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattggt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Original strand, 6326 - 6397
Alignment:
Q  98 gatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgatt 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6326 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgatt 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 77979 - 77900
Alignment:
Q  96 gagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||   ||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  77979 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatttggaa-atgtgattggtgat 77900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18152 - 18058
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||    
T  18152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgataaatgtggttggtgat 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 163903 - 163832
Alignment:
Q  80 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtc 151  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  163903 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtc 163832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7106
Alignment:
Q  82 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 176  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  7013 gtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgtttggtgat 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3775
Alignment:
Q  81 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgttcataagtgcatatcatagcatgagt 150  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||  |||||||    
T  3706 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagt 3775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 52781 - 52837
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  52781 aaagggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 56733 - 56789
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacat 57  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  56733 aaagggttgagctcttttacttcggagatta-tgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University