View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5775-Insertion-13 (Length: 486)

Name: NF5775-Insertion-13
Description: NF5775
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5775-Insertion-13
NF5775-Insertion-13
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (11-414)||(6019952-6020343)
chr4 (11-170)||(34276571-34276729)
chr4 (10-171)||(44984784-44984944)
chr4 (11-171)||(9798489-9798648)
chr4 (11-171)||(21366608-21366767)
chr4 (11-172)||(23437616-23437776)
chr4 (11-172)||(26091256-26091416)
chr4 (11-172)||(54574938-54575098)
chr4 (11-170)||(237501-237659)
chr4 (11-170)||(42085231-42085389)
chr4 (11-170)||(53461816-53461974)
chr4 (11-169)||(32366661-32366818)
chr4 (11-172)||(6285331-6285491)
chr4 (11-172)||(53854428-53854587)
chr4 (11-170)||(2826682-2826839)
chr4 (11-174)||(18462009-18462171)
chr4 (11-174)||(51363031-51363192)
chr4 (11-172)||(31532133-31532293)
chr4 (10-170)||(19387688-19387847)
chr4 (11-170)||(39077569-39077727)
chr4 (11-178)||(45797503-45797669)
chr4 (11-153)||(27373100-27373241)
chr4 (11-168)||(397426-397582)
chr4 (10-171)||(31972335-31972495)
chr4 (11-168)||(41702461-41702617)
chr4 (11-172)||(55519851-55520011)
chr4 (11-171)||(29478384-29478543)
chr4 (11-171)||(41560352-41560511)
chr4 (11-170)||(146429-146587)
chr4 (11-170)||(29777257-29777415)
chr4 (11-171)||(41949406-41949567)
chr4 (11-170)||(42765842-42765999)
chr4 (11-170)||(43471695-43471853)
chr4 (11-170)||(47344680-47344838)
chr4 (11-170)||(55056259-55056417)
chr4 (11-170)||(55776069-55776226)
chr4 (11-170)||(55840247-55840404)
chr4 (24-170)||(31914234-31914379)
chr4 (28-170)||(48657858-48658000)
chr4 (11-171)||(42033199-42033358)
chr4 (11-171)||(54607986-54608145)
chr4 (11-170)||(22618514-22618670)
chr4 (11-173)||(407778-407937)
chr4 (15-180)||(56022988-56023152)
chr4 (15-171)||(23609115-23609270)
chr4 (11-171)||(42222315-42222474)
chr4 (11-172)||(49881057-49881221)
chr4 (11-171)||(54086433-54086591)
chr4 (11-170)||(3170650-3170808)
chr4 (11-170)||(3692210-3692368)
chr4 (11-170)||(47662102-47662260)
chr4 (11-166)||(50534655-50534809)
chr4 (11-170)||(54425006-54425163)
chr4 (44-170)||(36532830-36532956)
chr4 (11-170)||(38591692-38591846)
chr4 (11-173)||(48313581-48313740)
chr4 (11-169)||(53834055-53834212)
chr4 (11-171)||(35446530-35446688)
chr4 (11-168)||(50457812-50457968)
chr4 (11-170)||(2243482-2243640)
chr4 (11-170)||(31070074-31070231)
chr4 (11-174)||(41632003-41632164)
chr4 (11-170)||(50234024-50234182)
chr4 (28-170)||(52728307-52728448)
chr4 (11-174)||(39587777-39587937)
chr4 (24-170)||(1932799-1932945)
chr4 (11-170)||(14017376-14017532)
chr4 (15-166)||(50536628-50536778)
chr4 (11-152)||(22468788-22468928)
chr4 (11-161)||(33897504-33897653)
chr4 (10-170)||(48654837-48655002)
chr4 (11-153)||(48259528-48259668)
chr4 (73-172)||(35595772-35595871)
chr4 (24-173)||(51951718-51951866)
chr4 (10-172)||(9997929-9998079)
chr4 (43-171)||(42509351-42509479)
chr4 (11-170)||(54805614-54805776)
chr4 (11-170)||(45633779-45633926)
chr4 (10-170)||(43890951-43891099)
chr4 (10-170)||(54715058-54715206)
chr4 (11-171)||(22620617-22620765)
chr4 (36-126)||(52396774-52396865)
chr4 (11-171)||(15060288-15060436)
chr4 (71-169)||(35344871-35344968)
chr4 (10-170)||(38547601-38547749)
chr4 (11-170)||(5117438-5117585)
chr4 (11-170)||(37239090-37239237)
chr4 (11-170)||(52688373-52688520)
chr4 (11-171)||(34552343-34552491)
chr4 (10-170)||(34835200-34835348)
chr4 (11-170)||(20351842-20351989)
chr4 (11-170)||(31881314-31881461)
chr4 (11-170)||(52461387-52461534)
chr4 (97-169)||(33048990-33049062)
chr4 (10-172)||(54216734-54216884)
chr4 (14-170)||(4486581-4486725)
chr4 (10-166)||(27398607-27398751)
chr4 (10-166)||(46720048-46720195)
chr4 (10-170)||(47811929-47812077)
chr4 (11-171)||(49014122-49014270)
chr4 (11-170)||(46708741-46708888)
chr4 (11-168)||(54216337-54216482)
chr4 (10-174)||(573826-573978)
chr4 (10-170)||(27580142-27580290)
chr4 (24-171)||(27872615-27872751)
chr4 (11-174)||(33289727-33289877)
chr4 (171-266)||(48583813-48583907)
chr4 (10-183)||(6371236-6371397)
chr4 (10-170)||(14335101-14335249)
chr4 (11-170)||(27873550-27873695)
chr4 (93-170)||(48259704-48259780)
chr4 (10-95)||(1662323-1662407)
chr4 (25-172)||(51981477-51981613)
chr4 (65-170)||(42558270-42558367)
chr4 (10-80)||(3293102-3293171)
chr4 (11-87)||(43231526-43231601)
chr4 (171-213)||(14525999-14526041)
chr4 (11-69)||(42557606-42557663)
chr4 (11-80)||(11972208-11972276)
chr4 (102-170)||(3291805-3291873)
chr4 (11-152)||(33557960-33558089)
chr4 (11-94)||(49057933-49058015)
chr4 (118-170)||(1662261-1662313)
chr4 (221-263)||(14525397-14525439)
chr4 (37-94)||(18206583-18206644)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (11-172)||(18101493-18101653)
chr6 (11-179)||(5882530-5882697)
chr6 (11-170)||(26377204-26377362)
chr6 (11-166)||(14891383-14891537)
chr6 (11-172)||(22551059-22551219)
chr6 (10-170)||(34527862-34528021)
chr6 (11-170)||(11988974-11989132)
chr6 (11-170)||(24168115-24168273)
chr6 (11-168)||(2892212-2892368)
chr6 (11-171)||(8615264-8615423)
chr6 (15-152)||(7345130-7345266)
chr6 (11-170)||(22341788-22341948)
chr6 (11-170)||(7393586-7393744)
chr6 (24-170)||(2593852-2593998)
chr6 (11-172)||(959902-960062)
chr6 (11-172)||(28947111-28947271)
chr6 (11-172)||(33452570-33452730)
chr6 (11-170)||(19415533-19415691)
chr6 (11-161)||(16703390-16703539)
chr6 (11-172)||(24224068-24224228)
chr6 (11-170)||(10507908-10508066)
chr6 (24-170)||(5294801-5294947)
chr6 (24-170)||(5299353-5299499)
chr6 (11-172)||(599916-600076)
chr6 (11-170)||(1970735-1970893)
chr6 (11-169)||(19281056-19281213)
chr6 (11-170)||(30743448-30743606)
chr6 (24-170)||(23261929-23262075)
chr6 (11-115)||(30467658-30467761)
chr6 (11-171)||(28948844-28948992)
chr6 (10-170)||(7167605-7167753)
chr6 (11-170)||(15965457-15965604)
chr6 (11-163)||(13329405-13329545)
chr6 (11-170)||(4487551-4487698)
chr6 (10-170)||(1398576-1398724)
chr6 (11-171)||(3786773-3786921)
chr6 (11-170)||(3291032-3291179)
chr6 (95-171)||(18661830-18661906)
chr6 (41-170)||(24913096-24913216)
chr6 (11-69)||(929683-929740)
chr6 (111-170)||(34262342-34262401)
chr6 (34-84)||(1939579-1939629)
chr6 (111-156)||(375741-375786)
chr6 (10-86)||(375797-375872)
chr6 (29-95)||(13844877-13844943)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (11-173)||(3611160-3611321)
chr1 (11-172)||(45538177-45538337)
chr1 (11-170)||(31308025-31308183)
chr1 (12-172)||(21139410-21139569)
chr1 (11-171)||(25058712-25058871)
chr1 (11-170)||(44661994-44662152)
chr1 (10-164)||(4068689-4068842)
chr1 (11-173)||(25678256-25678417)
chr1 (11-172)||(26085396-26085556)
chr1 (11-170)||(17994951-17995109)
chr1 (11-168)||(43251735-43251891)
chr1 (11-170)||(5981194-5981352)
chr1 (11-166)||(26794328-26794482)
chr1 (11-173)||(26277201-26277362)
chr1 (11-176)||(23984779-23984943)
chr1 (11-171)||(24245024-24245183)
chr1 (11-170)||(6327548-6327705)
chr1 (11-170)||(23932509-23932667)
chr1 (11-170)||(31040733-31040891)
chr1 (30-181)||(36566372-36566523)
chr1 (11-170)||(37620192-37620350)
chr1 (11-170)||(38790197-38790355)
chr1 (11-170)||(39646592-39646750)
chr1 (10-170)||(41999838-41999997)
chr1 (11-171)||(47671610-47671769)
chr1 (11-170)||(33112818-33112975)
chr1 (11-170)||(33884112-33884270)
chr1 (11-170)||(33959982-33960140)
chr1 (11-172)||(35273620-35273780)
chr1 (11-172)||(47317339-47317499)
chr1 (11-171)||(47383731-47383890)
chr1 (11-170)||(35692663-35692822)
chr1 (11-170)||(50774241-50774399)
chr1 (11-171)||(46967040-46967199)
chr1 (11-171)||(49398987-49399146)
chr1 (11-171)||(51057095-51057254)
chr1 (24-171)||(2450530-2450677)
chr1 (11-170)||(5980092-5980250)
chr1 (11-170)||(24885525-24885683)
chr1 (11-170)||(26524889-26525047)
chr1 (11-170)||(38331859-38332017)
chr1 (11-170)||(49253975-49254133)
chr1 (11-172)||(23220933-23221087)
chr1 (11-152)||(42863889-42864029)
chr1 (11-171)||(46784447-46784606)
chr1 (29-173)||(51045593-51045737)
chr1 (11-142)||(31844400-31844530)
chr1 (11-170)||(46616573-46616731)
chr1 (11-169)||(3285426-3285582)
chr1 (24-170)||(42313361-42313507)
chr1 (24-170)||(47187141-47187287)
chr1 (11-167)||(28888605-28888760)
chr1 (11-170)||(36003154-36003315)
chr1 (10-126)||(25518837-25518952)
chr1 (11-170)||(48373528-48373677)
chr1 (42-170)||(4808699-4808827)
chr1 (10-170)||(33073234-33073382)
chr1 (25-147)||(45475866-45475987)
chr1 (11-171)||(27983602-27983745)
chr1 (11-172)||(41467630-41467779)
chr1 (77-171)||(13312530-13312624)
chr1 (11-170)||(2657327-2657474)
chr1 (38-175)||(47772167-47772304)
chr1 (10-170)||(10928090-10928238)
chr1 (11-153)||(51403034-51403165)
chr1 (39-170)||(4156438-4156576)
chr1 (11-169)||(6626025-6626171)
chr1 (10-170)||(2954878-2955026)
chr1 (11-107)||(31979998-31980093)
chr1 (11-164)||(26472185-26472326)
chr1 (10-170)||(26685879-26686027)
chr1 (10-170)||(38716247-38716395)
chr1 (11-170)||(29770694-29770841)
chr1 (10-172)||(1388496-1388646)
chr1 (10-172)||(30289908-30290058)
chr1 (11-170)||(4243490-4243637)
chr1 (11-170)||(4953076-4953223)
chr1 (11-170)||(42234864-42235010)
chr1 (11-146)||(2556879-2557004)
chr1 (15-171)||(41895163-41895307)
chr1 (10-170)||(48683330-48683478)
chr1 (11-172)||(33187364-33187507)
chr1 (10-172)||(10920223-10920373)
chr1 (11-164)||(34752320-34752461)
chr1 (10-170)||(5961267-5961415)
chr1 (11-144)||(13281588-13281709)
chr1 (10-154)||(27924674-27924806)
chr1 (10-171)||(52323961-52324111)
chr1 (15-84)||(13313249-13313317)
chr1 (10-153)||(51155606-51155737)
chr1 (95-174)||(38718163-38718242)
chr1 (24-170)||(44293455-44293590)
chr1 (10-171)||(39475782-39475930)
chr1 (11-164)||(44544052-44544193)
chr1 (10-171)||(7561527-7561690)
chr1 (11-80)||(32448672-32448740)
chr1 (10-95)||(52367906-52367990)
chr1 (10-80)||(46428332-46428401)
chr1 (10-79)||(24649802-24649870)
chr1 (51-170)||(31286504-31286612)
chr1 (117-167)||(32448757-32448807)
chr1 (35-87)||(39637943-39637996)
chr1 (15-153)||(35991616-35991742)
chr1 (101-147)||(24215865-24215911)
chr1 (63-144)||(9779919-9779999)
chr1 (133-170)||(31844818-31844855)
chr1 (109-160)||(39359502-39359553)
chr1 (31-80)||(24215806-24215855)
chr1 (11-47)||(4156188-4156223)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (11-172)||(24253406-24253566)
chr5 (11-172)||(18479666-18479826)
chr5 (11-170)||(5184996-5185154)
chr5 (11-170)||(35626062-35626220)
chr5 (11-170)||(43326379-43326537)
chr5 (11-169)||(15398483-15398640)
chr5 (11-168)||(6901823-6901979)
chr5 (25-170)||(29789295-29789440)
chr5 (11-170)||(27938921-27939080)
chr5 (11-174)||(2484288-2484450)
chr5 (11-170)||(7722073-7722231)
chr5 (11-170)||(39932603-39932761)
chr5 (10-171)||(31938920-31939080)
chr5 (11-172)||(40886026-40886185)
chr5 (11-170)||(3466681-3466839)
chr5 (11-170)||(12648821-12648979)
chr5 (11-170)||(43262183-43262341)
chr5 (11-172)||(27501053-27501213)
chr5 (11-170)||(739704-739862)
chr5 (24-170)||(15683827-15683973)
chr5 (30-172)||(34451292-34451434)
chr5 (11-169)||(27278474-27278635)
chr5 (11-170)||(25831545-25831702)
chr5 (11-173)||(40278855-40279016)
chr5 (11-172)||(13504740-13504900)
chr5 (11-168)||(40110258-40110413)
chr5 (15-170)||(28424795-28424947)
chr5 (11-170)||(890930-891087)
chr5 (11-170)||(5137739-5137897)
chr5 (11-170)||(38756487-38756646)
chr5 (11-170)||(763747-763905)
chr5 (10-170)||(33617608-33617756)
chr5 (11-151)||(4149718-4149847)
chr5 (10-171)||(19295753-19295902)
chr5 (11-170)||(5497297-5497444)
chr5 (11-171)||(27503403-27503551)
chr5 (11-170)||(23195248-23195395)
chr5 (11-172)||(31293987-31294147)
chr5 (11-170)||(38015514-38015661)
chr5 (11-169)||(9424593-9424739)
chr5 (11-161)||(42658671-42658809)
chr5 (14-171)||(3656567-3656712)
chr5 (10-170)||(9374502-9374650)
chr5 (10-132)||(40632522-40632634)
chr5 (11-170)||(6973087-6973234)
chr5 (11-170)||(13957694-13957841)
chr5 (11-171)||(14972002-14972150)
chr5 (24-170)||(27390633-27390768)
chr5 (10-170)||(2585485-2585633)
chr5 (15-147)||(6206912-6207032)
chr5 (24-172)||(38492649-38492785)
chr5 (11-170)||(36365445-36365592)
chr5 (10-172)||(18327171-18327321)
chr5 (10-172)||(24167782-24167932)
chr5 (11-156)||(5120049-5120181)
chr5 (24-169)||(33623940-33624074)
chr5 (24-168)||(36948492-36948623)
chr5 (10-170)||(38637910-38638058)
chr5 (11-99)||(12558090-12558176)
chr5 (13-170)||(612757-612900)
chr5 (10-170)||(1402505-1402653)
chr5 (10-95)||(36472348-36472432)
chr5 (8-170)||(40686920-40687069)
chr5 (11-76)||(42247865-42247929)
chr5 (171-243)||(41312981-41313052)
chr5 (10-79)||(3940411-3940479)
chr5 (11-69)||(9171115-9171172)
chr5 (11-55)||(9527124-9527167)
chr5 (117-170)||(42247791-42247844)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (11-171)||(25893916-25894075)
chr7 (11-170)||(35355913-35356071)
chr7 (11-172)||(22979645-22979805)
chr7 (10-170)||(45690097-45690256)
chr7 (11-170)||(36389381-36389539)
chr7 (11-169)||(33423276-33423433)
chr7 (11-172)||(27018141-27018301)
chr7 (11-170)||(17855453-17855611)
chr7 (11-170)||(33839715-33839873)
chr7 (11-170)||(35328069-35328227)
chr7 (11-170)||(47066977-47067135)
chr7 (11-173)||(33695818-33695979)
chr7 (15-172)||(23393049-23393205)
chr7 (11-170)||(49171362-49171520)
chr7 (11-173)||(33411285-33411446)
chr7 (11-170)||(46913134-46913294)
chr7 (11-173)||(47740328-47740489)
chr7 (11-170)||(2341661-2341820)
chr7 (11-171)||(20165813-20165972)
chr7 (11-170)||(5183825-5183983)
chr7 (11-170)||(31625729-31625886)
chr7 (11-171)||(10028513-10028674)
chr7 (11-170)||(37846016-37846174)
chr7 (11-170)||(40670588-40670746)
chr7 (11-172)||(43499510-43499670)
chr7 (11-172)||(48609675-48609835)
chr7 (10-170)||(29446862-29447020)
chr7 (11-170)||(31586873-31587031)
chr7 (11-170)||(45482683-45482841)
chr7 (11-161)||(15877575-15877724)
chr7 (11-170)||(26579717-26579875)
chr7 (11-170)||(33332814-33332971)
chr7 (32-170)||(35767519-35767657)
chr7 (15-172)||(5712197-5712353)
chr7 (11-170)||(35757020-35757178)
chr7 (11-156)||(41990872-41991016)
chr7 (11-171)||(19563472-19563631)
chr7 (11-169)||(33870270-33870424)
chr7 (33-171)||(28233935-28234073)
chr7 (11-171)||(45063356-45063513)
chr7 (39-170)||(30076527-30076658)
chr7 (11-172)||(31429473-31429633)
chr7 (11-170)||(10618323-10618474)
chr7 (11-136)||(33720070-33720194)
chr7 (54-170)||(41904272-41904388)
chr7 (51-170)||(44405412-44405531)
chr7 (11-170)||(35752034-35752181)
chr7 (11-171)||(43489243-43489391)
chr7 (10-170)||(46898016-46898164)
chr7 (11-146)||(44564363-44564497)
chr7 (11-170)||(37127962-37128109)
chr7 (11-172)||(36816843-36816992)
chr7 (11-170)||(24923024-24923171)
chr7 (10-169)||(33393352-33393499)
chr7 (11-170)||(46817421-46817568)
chr7 (11-172)||(26371074-26371223)
chr7 (10-170)||(44003370-44003518)
chr7 (11-170)||(7876328-7876475)
chr7 (11-170)||(48085883-48086030)
chr7 (10-172)||(2332043-2332193)
chr7 (10-168)||(15643948-15644094)
chr7 (11-161)||(26941541-26941679)
chr7 (11-170)||(24228566-24228713)
chr7 (10-173)||(47460769-47460920)
chr7 (11-169)||(45502817-45502963)
chr7 (10-171)||(7257405-7257554)
chr7 (14-170)||(21718145-21718288)
chr7 (10-169)||(46103145-46103291)
chr7 (11-171)||(498187-498335)
chr7 (11-170)||(29610660-29610807)
chr7 (27-170)||(37443602-37443734)
chr7 (11-172)||(29098776-29098921)
chr7 (11-168)||(35484661-35484807)
chr7 (11-168)||(39453484-39453622)
chr7 (10-95)||(16482847-16482931)
chr7 (11-162)||(25037516-25037655)
chr7 (11-88)||(29863040-29863116)
chr7 (24-170)||(45237533-45237668)
chr7 (11-136)||(32556640-32556753)
chr7 (10-166)||(41855083-41855228)
chr7 (11-170)||(47906758-47906906)
chr7 (24-170)||(44659880-44660015)
chr7 (11-80)||(39323641-39323709)
chr7 (11-80)||(39866690-39866758)
chr7 (102-170)||(39323712-39323779)
chr7 (24-99)||(38448508-38448583)
chr7 (35-96)||(26456157-26456218)
chr7 (11-80)||(33455121-33455189)
chr7 (10-55)||(35557754-35557798)
chr7 (112-156)||(39866762-39866806)
chr7 (10-88)||(7720574-7720651)
chr7 (105-171)||(42272180-42272245)
chr7 (11-52)||(30077043-30077083)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (11-170)||(32984077-32984235)
chr8 (11-180)||(37301316-37301483)
chr8 (11-171)||(24079900-24080059)
chr8 (10-172)||(10646146-10646307)
chr8 (11-168)||(32114273-32114429)
chr8 (11-170)||(41862244-41862402)
chr8 (11-172)||(41653919-41654079)
chr8 (11-170)||(9303574-9303732)
chr8 (11-170)||(33730641-33730799)
chr8 (11-170)||(33981663-33981821)
chr8 (11-170)||(40435153-40435311)
chr8 (11-170)||(43328731-43328889)
chr8 (11-170)||(5946071-5946229)
chr8 (11-170)||(6366010-6366168)
chr8 (11-166)||(31830959-31831113)
chr8 (11-170)||(37956445-37956603)
chr8 (11-170)||(45236565-45236723)
chr8 (14-170)||(13356120-13356275)
chr8 (11-170)||(9734279-9734435)
chr8 (11-170)||(17718722-17718880)
chr8 (11-170)||(25185923-25186081)
chr8 (11-153)||(2714573-2714714)
chr8 (11-173)||(37419964-37420125)
chr8 (11-170)||(35628801-35628959)
chr8 (11-170)||(41231970-41232128)
chr8 (11-170)||(2275937-2276094)
chr8 (11-170)||(9013708-9013865)
chr8 (44-170)||(12032986-12033112)
chr8 (11-170)||(13760646-13760806)
chr8 (11-147)||(29048426-29048561)
chr8 (24-153)||(44088460-44088589)
chr8 (37-171)||(3904126-3904259)
chr8 (11-169)||(22878415-22878572)
chr8 (54-172)||(41981534-41981652)
chr8 (24-170)||(45066592-45066738)
chr8 (11-153)||(45258534-45258675)
chr8 (24-169)||(41639950-41640095)
chr8 (42-170)||(25248087-25248215)
chr8 (10-170)||(4447295-4447443)
chr8 (57-170)||(31336163-31336276)
chr8 (11-156)||(42701303-42701448)
chr8 (10-170)||(10378332-10378480)
chr8 (10-170)||(3211228-3211376)
chr8 (10-172)||(41843276-41843426)
chr8 (11-172)||(31940339-31940487)
chr8 (11-171)||(117328-117476)
chr8 (11-171)||(2379164-2379312)
chr8 (10-164)||(32373733-32373874)
chr8 (11-95)||(39915887-39915970)
chr8 (32-181)||(9713730-9713868)
chr8 (11-172)||(40458770-40458919)
chr8 (11-90)||(41981457-41981535)
chr8 (10-170)||(26196317-26196464)
chr8 (11-174)||(4975403-4975554)
chr8 (11-164)||(40649837-40649978)
chr8 (10-170)||(33896843-33896991)
chr8 (10-170)||(3490399-3490547)
chr8 (11-170)||(9509400-9509547)
chr8 (11-171)||(33622466-33622612)
chr8 (11-80)||(27243218-27243286)
chr8 (11-80)||(27254793-27254861)
chr8 (10-153)||(38631675-38631806)
chr8 (10-97)||(31148953-31149038)
chr8 (105-172)||(39901674-39901741)
chr8 (95-171)||(41425428-41425503)
chr8 (171-209)||(36104476-36104514)
chr8 (11-79)||(164746-164812)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (11-170)||(6594458-6594616)
chr2 (11-171)||(746489-746648)
chr2 (10-170)||(17600858-17601017)
chr2 (11-171)||(23901802-23901961)
chr2 (11-170)||(10244582-10244740)
chr2 (11-170)||(38997124-38997282)
chr2 (11-172)||(45371013-45371173)
chr2 (11-170)||(4034615-4034773)
chr2 (11-170)||(14660469-14660627)
chr2 (11-170)||(34518390-34518548)
chr2 (11-170)||(40635241-40635399)
chr2 (11-164)||(6430496-6430648)
chr2 (11-172)||(13815216-13815376)
chr2 (11-171)||(26710368-26710527)
chr2 (11-170)||(2324889-2325047)
chr2 (11-170)||(11184995-11185153)
chr2 (11-170)||(27651034-27651192)
chr2 (11-173)||(27400426-27400587)
chr2 (11-167)||(10424618-10424773)
chr2 (11-174)||(2914134-2914296)
chr2 (11-170)||(1091951-1092109)
chr2 (11-170)||(32856436-32856594)
chr2 (11-172)||(14697535-14697695)
chr2 (11-172)||(32327384-32327544)
chr2 (11-171)||(4609649-4609808)
chr2 (11-171)||(5726152-5726311)
chr2 (11-170)||(7892688-7892846)
chr2 (11-170)||(33427647-33427805)
chr2 (25-170)||(9444726-9444874)
chr2 (24-170)||(37255337-37255483)
chr2 (11-172)||(32948469-32948628)
chr2 (11-170)||(27024438-27024596)
chr2 (24-170)||(11159656-11159802)
chr2 (11-171)||(37620866-37621028)
chr2 (11-172)||(40735487-40735647)
chr2 (40-167)||(25294886-25295013)
chr2 (15-170)||(40037170-40037323)
chr2 (11-144)||(32608403-32608535)
chr2 (37-155)||(1229675-1229793)
chr2 (11-144)||(8432942-8433074)
chr2 (11-164)||(15925103-15925255)
chr2 (10-169)||(39103069-39103216)
chr2 (11-143)||(12842126-12842257)
chr2 (63-172)||(447631-447740)
chr2 (10-170)||(21734900-21735048)
chr2 (11-113)||(42899938-42900039)
chr2 (11-136)||(41172481-41172605)
chr2 (11-171)||(35158049-35158197)
chr2 (11-171)||(29687064-29687212)
chr2 (11-168)||(145305-145450)
chr2 (11-171)||(19428425-19428573)
chr2 (11-171)||(28641291-28641439)
chr2 (11-170)||(13543624-13543771)
chr2 (11-170)||(27764863-27765009)
chr2 (11-172)||(4258513-4258661)
chr2 (10-170)||(44481850-44481998)
chr2 (60-132)||(28014856-28014928)
chr2 (10-172)||(43898969-43899118)
chr2 (71-150)||(12827145-12827223)
chr2 (11-171)||(12333496-12333642)
chr2 (11-170)||(27331321-27331472)
chr2 (11-170)||(39301197-39301344)
chr2 (24-170)||(3711668-3711803)
chr2 (11-170)||(34249288-34249435)
chr2 (27-171)||(43356134-43356267)
chr2 (11-170)||(12730084-12730231)
chr2 (14-165)||(35126806-35126945)
chr2 (11-165)||(28566703-28566845)
chr2 (95-170)||(2688729-2688804)
chr2 (11-68)||(12814637-12814693)
chr2 (11-170)||(2000339-2000484)
chr2 (11-80)||(3266319-3266387)
chr2 (24-80)||(40544155-40544211)
chr2 (117-168)||(3266404-3266455)
chr2 (24-95)||(38985342-38985412)
chr2 (104-170)||(42900772-42900835)
chr2 (11-85)||(30545844-30545917)
chr2 (67-120)||(17799296-17799349)
chr2 (11-153)||(8056649-8056779)
chr2 (117-171)||(40544084-40544138)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (11-171)||(11132-11291)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (11-170)||(47257817-47257975)
chr3 (10-170)||(38416724-38416883)
chr3 (11-172)||(28048390-28048550)
chr3 (11-179)||(47809587-47809755)
chr3 (11-170)||(7855114-7855272)
chr3 (11-170)||(39634572-39634729)
chr3 (11-170)||(40130959-40131117)
chr3 (11-170)||(49330061-49330219)
chr3 (11-173)||(24100307-24100467)
chr3 (11-169)||(51170034-51170191)
chr3 (11-172)||(22399121-22399280)
chr3 (11-172)||(40643824-40643984)
chr3 (11-171)||(41464376-41464535)
chr3 (10-170)||(48739233-48739392)
chr3 (11-170)||(43612047-43612205)
chr3 (11-168)||(48609747-48609903)
chr3 (11-171)||(52628978-52629136)
chr3 (11-170)||(29625827-29625985)
chr3 (11-170)||(32234398-32234555)
chr3 (11-170)||(40419859-40420017)
chr3 (11-170)||(42291866-42292024)
chr3 (11-170)||(46126011-46126168)
chr3 (24-170)||(35748311-35748457)
chr3 (11-169)||(55453245-55453402)
chr3 (10-171)||(44222852-44223012)
chr3 (11-170)||(2666024-2666182)
chr3 (11-170)||(27066978-27067136)
chr3 (10-172)||(46134379-46134540)
chr3 (11-171)||(37313423-37313582)
chr3 (11-170)||(37324565-37324723)
chr3 (11-170)||(40804510-40804668)
chr3 (11-170)||(51102378-51102536)
chr3 (11-170)||(7755307-7755464)
chr3 (11-170)||(20754393-20754551)
chr3 (11-166)||(35594145-35594299)
chr3 (24-155)||(36368975-36369105)
chr3 (11-169)||(43021738-43021896)
chr3 (11-170)||(43125855-43126012)
chr3 (11-170)||(44806708-44806866)
chr3 (11-170)||(51452751-51452908)
chr3 (10-171)||(41732551-41732711)
chr3 (11-168)||(43183936-43184092)
chr3 (11-168)||(47894822-47894978)
chr3 (11-176)||(52638866-52639030)
chr3 (11-155)||(52215100-52215243)
chr3 (11-170)||(39053418-39053576)
chr3 (11-170)||(41293319-41293476)
chr3 (11-170)||(53943588-53943745)
chr3 (11-168)||(53832486-53832642)
chr3 (11-170)||(18946927-18947085)
chr3 (11-145)||(24376597-24376730)
chr3 (12-170)||(41216480-41216637)
chr3 (11-173)||(51146212-51146373)
chr3 (11-170)||(5560025-5560190)
chr3 (24-158)||(46949410-46949543)
chr3 (48-170)||(52864550-52864671)
chr3 (11-137)||(53637865-53637990)
chr3 (11-168)||(54159000-54159146)
chr3 (55-170)||(33550467-33550582)
chr3 (11-168)||(48546842-48546987)
chr3 (11-181)||(55000167-55000325)
chr3 (11-170)||(25641670-25641817)
chr3 (11-170)||(42589854-42590001)
chr3 (10-172)||(55380008-55380158)
chr3 (11-172)||(34279719-34279868)
chr3 (10-167)||(49130601-49130746)
chr3 (24-134)||(37758965-37759075)
chr3 (11-170)||(38156632-38156779)
chr3 (11-170)||(51415993-51416140)
chr3 (11-170)||(54401211-54401358)
chr3 (11-170)||(54707220-54707367)
chr3 (10-168)||(45058906-45059052)
chr3 (10-172)||(47510938-47511088)
chr3 (10-175)||(53115470-53115623)
chr3 (10-170)||(24688137-24688285)
chr3 (10-170)||(25353577-25353725)
chr3 (11-170)||(39141125-39141273)
chr3 (11-171)||(37028747-37028895)
chr3 (37-115)||(47182049-47182127)
chr3 (11-170)||(31286793-31286940)
chr3 (11-170)||(41635800-41635947)
chr3 (10-169)||(51143840-51143987)
chr3 (10-170)||(30251501-30251649)
chr3 (11-170)||(51224038-51224184)
chr3 (11-145)||(17665549-17665671)
chr3 (24-165)||(40022110-40022240)
chr3 (10-169)||(42998790-42998937)
chr3 (24-172)||(52756065-52756206)
chr3 (95-170)||(48534007-48534082)
chr3 (10-171)||(50731913-50732062)
chr3 (10-171)||(50780794-50780943)
chr3 (24-172)||(40165687-40165824)
chr3 (10-87)||(41882063-41882139)
chr3 (83-170)||(30429227-30429314)
chr3 (24-99)||(41609103-41609178)
chr3 (11-170)||(44945935-44946076)
chr3 (10-170)||(21597148-21597296)
chr3 (10-170)||(43176738-43176886)
chr3 (10-64)||(52434162-52434216)
chr3 (10-99)||(2227995-2228083)
chr3 (31-99)||(8847718-8847786)
chr3 (11-99)||(47402810-47402896)
chr3 (11-87)||(48726070-48726145)
chr3 (24-87)||(28576184-28576247)
chr3 (111-170)||(177273-177332)
chr3 (111-169)||(48752226-48752284)
chr3 (118-170)||(40688431-40688483)
chr3 (128-170)||(41882011-41882053)
chr3 (10-64)||(48752108-48752161)
chr3 (111-164)||(52434291-52434344)
chr3 (129-169)||(37760346-37760386)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (10-171)||(1892-2052)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (11-170)||(39556-39714)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-170)||(13762-13920)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (11-170)||(176678-176836)
scaffold0007 (11-170)||(278030-278190)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (11-170)||(75244-75402)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (11-171)||(2431-2590)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (11-170)||(18854-19012)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (30-171)||(4595-4736)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-142)||(32585-32715)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (42-170)||(3133-3261)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (10-171)||(14767-14916)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-170)||(20477-20625)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (11-171)||(7114-7263)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (10-171)||(4553-4703)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (10-171)||(3415-3565)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (10-171)||(125-273)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (10-136)||(17929-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (37-94)||(19266-19327)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 414
Target Start/End: Original strand, 6019952 - 6020343
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6019952 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 6020050  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020051 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacaatttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtat 6020150  T
Q  211 attnnnnnnncaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattataatattnnnnnnncaatgttaccaaagcaatggtggaggtaaga 310  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6020151 att-aaaaaacaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattat-atatt-aaaaaacaatgttaccaaagcaatggt-gaggtaaga 6020246  T
Q  311 ccacatatataagaccaccgaatgaagannnnnnnattgttttcctcataaggaaatataccgcacaagcaaaatttgtcatttttctattgaatctaaa 410  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||       | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6020247 -cacatatat-agaccaccgaatg-agattttttta-tgtttt-ctcat-aggaaatatacagcacaagcaaaatttgtca-ttttctattgaatctaaa 6020339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 34276571 - 34276729
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276571 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 34276669  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34276670 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 44984784 - 44984944
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984784 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 44984882  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44984883 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44984944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 9798489 - 9798648
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798489 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 9798587  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798588 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9798648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21366767 - 21366608
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366767 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 21366669  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366668 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21366608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 23437616 - 23437776
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23437616 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 23437714  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23437715 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23437776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26091416 - 26091256
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26091416 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 26091318  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26091317 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26091256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54575098 - 54574938
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54575098 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 54575000  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54574999 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 54574938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 237501 - 237659
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  237501 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggct 237599  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  237600 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 42085231 - 42085389
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085231 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 42085329  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42085330 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53461974 - 53461816
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461974 aatggtgggtaaatt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 53461876  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53461875 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32366818 - 32366661
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366818 aatggtgggtaattt-actcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 32366720  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32366719 aatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 6285331 - 6285491
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6285331 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 6285429  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6285430 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtccccat 6285491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 53854587 - 53854428
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854587 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 53854489  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  53854488 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccat 53854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2826839 - 2826682
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2826839 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 2826741  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2826740 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18462171 - 18462009
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18462171 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 18462073  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18462072 aatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccattt 18462009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 51363031 - 51363192
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363031 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 51363129  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51363130 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccattt 51363192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31532293 - 31532133
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532293 aatgatgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31532195  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31532194 aatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 31532133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19387847 - 19387688
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19387847 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 19387749  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19387748 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 39077569 - 39077727
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39077569 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 39077667  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39077668 aatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 45797503 - 45797669
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45797503 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggct 45797601  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttt 178  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  45797602 aatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttttcttt 45797669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 27373100 - 27373241
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373100 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 27373198  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373199 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 397426 - 397582
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  397426 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgact 397524  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  397525 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31972495 - 31972335
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31972495 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 31972397  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31972396 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacca 31972335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41702617 - 41702461
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702617 aatggtgggtaactt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41702519  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41702518 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 55519851 - 55520011
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519851 aatggtggataattt-atccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 55519949  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519950 aatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 55520011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 29478384 - 29478543
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29478384 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggct 29478482  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29478483 aatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 29478543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 41560352 - 41560511
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560352 aatggtggataattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41560450  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41560451 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacca 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 146587 - 146429
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146587 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 146489  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  146488 aatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29777415 - 29777257
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777415 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 29777317  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29777316 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 41949406 - 41949567
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgct--tatgtgg 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41949406 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgtgg 41949504  T
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  41949505 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacca 41949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42765999 - 42765842
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42765999 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctaatgtggct 42765902  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42765901 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43471853 - 43471695
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43471853 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgattatgtggct 43471755  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43471754 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 47344680 - 47344838
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47344680 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggct 47344778  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47344779 aatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55056417 - 55056259
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  55056417 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgact 55056319  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  55056318 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 55776069 - 55776226
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776069 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 55776166  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  55776167 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 55840247 - 55840404
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840247 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 55840344  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  55840345 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 31914234 - 31914379
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31914234 tttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggt 31914332  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31914333 tggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 48657858 - 48658000
Alignment:
Q  28 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48657858 cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggg 48657957  T
Q  128 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48657958 gtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 42033199 - 42033358
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  42033199 aatggtgggtaattt-acccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtagct 42033297  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033298 aatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 42033358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 54607986 - 54608145
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54607986 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatgcttatgtggct 54608084  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  54608085 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacca 54608145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22618670 - 22618514
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618670 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 22618573  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22618572 aatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 407778 - 407937
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  407778 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggct 407875  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  407876 aatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatt 407937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 56023152 - 56022988
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56023152 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatg 56023054  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttttt 180  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  56023053 tgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccattttttttt 56022988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 23609115 - 23609270
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609115 gtgggtaattt-acccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 23609213  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23609214 tgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacca 23609270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 42222315 - 42222474
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222315 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 42222413  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  42222414 aatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacca 42222474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 49881221 - 49881057
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49881221 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 49881123  T
Q  111 aatgtatattggttgggg----taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49881122 aatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcaccat 49881057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 54086433 - 54086591
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54086433 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgcttatgtggct 54086530  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54086531 aatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 54086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 3170650 - 3170808
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3170650 aatggtgtgtaattt-acccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 3170748  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3170749 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3692368 - 3692210
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3692368 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 3692270  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3692269 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47662260 - 47662102
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47662260 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 47662162  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47662161 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 50534655 - 50534809
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50534655 aatggtgggtaactt-acccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 50534753  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50534754 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 54425006 - 54425163
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54425006 aatggtgggtaattt-acccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 54425104  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  54425105 aatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532830
Alignment:
Q  44 aatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  144 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 38591692 - 38591846
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  38591692 aatggtgggtaattt-actcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----aatgtgcttatgtggct 38591786  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38591787 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 48313581 - 48313740
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  48313581 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaa-tatgcttatgtagct 48313677  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48313678 aatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccatt 48313740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53834212 - 53834055
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53834212 aatggtgggtaattt-acccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 53834114  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53834113 aatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 35446530 - 35446688
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35446530 aatggtgggtaattta--ccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatttggct 35446627  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35446628 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgttacca 35446688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50457968 - 50457812
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50457968 aatggtgggtaattt-atccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgttgct 50457870  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50457869 aatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 2243482 - 2243640
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2243482 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtatttatgtggct 2243580  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2243581 tatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31070231 - 31070074
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31070231 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctcatgtgact 31070134  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31070133 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41632164 - 41632003
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  41632164 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgtacttatatggct 41632067  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41632066 aatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcaccattt 41632003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 50234024 - 50234182
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50234024 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 50234122  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  50234123 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  28 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  128 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39587937 - 39587777
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  39587937 aatgatgggtaattt-acctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatataact 39587839  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  39587838 aatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat-ggta-cctaattgtcaccattt 39587777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 1932799 - 1932945
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932799 tttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 1932898  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| ||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  1932899 tgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14017532 - 14017376
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  14017532 aatggtgggtaattt-acccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aagtgtgtttatgtggct 14017436  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14017435 aatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50536778 - 50536628
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  50536778 gtgggtaattt-acccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatatgtttatgtgactaatg 50536680  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50536679 tgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22468928 - 22468788
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22468928 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgtttatgtggct 22468830  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 152  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22468829 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33897653 - 33897504
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  33897653 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatatggct 33897555  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 161  Q
    ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  33897554 aatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 48654837 - 48655002
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48654837 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgtacttatgtggc 48654935  T
Q  110 ta------atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||      |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  48654936 taatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 48259668 - 48259528
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48259668 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaaatgtgcttatgtggct 48259571  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48259570 aatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 172
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595871
Alignment:
Q  73 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 35595871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Original strand, 51951718 - 51951866
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51951718 tttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 51951817  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  51951818 t-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcatcatt 51951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9998079 - 9997929
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  9998079 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 9997992  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9997991 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 9997929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 171
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509479
Alignment:
Q  43 aaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacca 142  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  143 ttcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacca 42509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54805776 - 54805614
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg----cttatgt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||    
T  54805776 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgtttatttatgt 54805678  T
Q  107 ggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  54805677 ggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45633926 - 45633779
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  45633926 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 45633839  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45633838 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 43890951 - 43891099
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  43890951 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 43891038  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  43891039 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 54715058 - 54715206
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  54715058 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 54715145  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54715146 taatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 22620617 - 22620765
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  22620617 aatgatgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 22620704  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  22620705 aatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacca 22620765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  36 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15060436 - 15060288
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||     
T  15060436 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcc 15060349  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15060348 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 15060288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Original strand, 35344871 - 35344968
Alignment:
Q  71 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35344871 atagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtcac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38547749 - 38547601
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  38547749 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 38547661  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  38547660 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5117585 - 5117438
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  5117585 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 5117498  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117497 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37239237 - 37239090
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  37239237 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 37239150  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37239149 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 52688373 - 52688520
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           | |||||||||||||    
T  52688373 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggct 52688460  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52688461 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 34552343 - 34552491
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||           |||||||||| ||||    
T  34552343 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggct 34552430  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34552431 aatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 34552491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 34835200 - 34835348
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| |||              
T  34835200 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaaggtg---------- 34835288  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34835289 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20351989 - 20351842
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  20351989 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 20351902  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20351901 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31881461 - 31881314
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  31881461 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 31881374  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31881373 aatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 52461387 - 52461534
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  52461387 aatggtgtgtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 52461474  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  52461475 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  97 gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54216884 - 54216734
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||      
T  54216884 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgat 54216797  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  54216796 taatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcaccat 54216734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4486725 - 4486581
Alignment:
Q  14 ggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||           ||||||||||||||||||    
T  4486725 ggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaat 4486638  T
Q  114 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||    
T  4486637 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacc 4486581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27398751 - 27398607
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||               
T  27398751 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt----------- 27398664  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  27398663 aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 46720048 - 46720195
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||  |||         
T  46720048 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-atat----- 46720140  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46720141 --atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 47811929 - 47812077
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  47811929 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 47812016  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  47812017 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 49014122 - 49014270
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||| |||||||||||    
T  49014122 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtacttatgtggct 49014209  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49014210 aatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46708888 - 46708741
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||| ||    
T  46708888 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgact 46708801  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  46708800 aatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 54216337 - 54216482
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||| |||    
T  54216337 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgttgct 54216424  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54216425 aatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 573826 - 573978
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  573826 aaatggtgggtaattt-acctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg---------- 573914  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  573915 -aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcaccattt 573978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 27580142 - 27580290
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||              
T  27580142 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg---------- 27580230  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27580231 -aatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 171
Target Start/End: Original strand, 27872615 - 27872751
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| |||||||    
T  27872615 tttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggt 27872703  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  27872704 tggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacca 27872751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 33289727 - 33289877
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||           ||||||||||||||    
T  33289727 aatggtggataattt-atccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-----------gtgcttatgtggct 33289814  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  33289815 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcaccattt 33289877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48583907 - 48583813
Alignment:
Q  171 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattnnnnnnncaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattat 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  48583907 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatatt-aaaaaacaatgttaagcaataactgatatacataacccacttccaatattat 48583813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6371397 - 6371236
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || | || |||||| |||||| |||              
T  6371397 aaatagtgggtaattt-acccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacctaaaaaggtg---------- 6371309  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttggt 183  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6371308 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcaccttttttttttggt 6371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14335249 - 14335101
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||              
T  14335249 aaatggtaggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacctaaaaaggtg---------- 14335161  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14335160 -aatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacc 14335101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27873695 - 27873550
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  27873695 aatggtgggtaattt-atccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 27873608  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27873607 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacc 27873550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  93 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1662407 - 1662323
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1662407 aaatggtgggtaattt-acctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981477
Alignment:
Q  25 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | || |||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 51981525  T
Q  125 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||    
T  51981524 ggggtaaattactcatcattctttcattggtagactagttatcaccat 51981477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  65 gtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3293171 - 3293102
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  3293171 aaatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 43231526 - 43231601
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 87  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43231526 aatggtgggtaattt-atccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14526041 - 14525999
Alignment:
Q  171 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14526041 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatatt 14525999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 42557606 - 42557663
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42557606 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa 42557663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11972276 - 11972208
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  11972276 aatggtgggtaattt-actcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  102 tatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33558089 - 33557960
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||| |||           |||  ||||||||||    
T  33558089 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtatttatgtggct 33558002  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 152  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33558001 aatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 49058015 - 49057933
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 94  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49058015 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662261
Alignment:
Q  118 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14525439 - 14525397
Alignment:
Q  221 caatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatat 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14525439 caatgttaagcaataactgacatacataacccacttccaatat 14525397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18206644 - 18206583
Alignment:
Q  37 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca----aaatagttcatggataccacttaaaa 94  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  18206644 caatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18101653 - 18101493
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101653 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 18101555  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101554 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 18101493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 5882530 - 5882697
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882530 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 5882628  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  5882629 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatttt 5882697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26377362 - 26377204
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377362 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 26377264  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26377263 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14891537 - 14891383
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891537 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 14891439  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14891438 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22551219 - 22551059
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22551219 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgtgcttatgtggct 22551121  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22551120 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22551059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34528021 - 34527862
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34528021 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 34527923  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34527922 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11989132 - 11988974
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11989132 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 11989034  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11989033 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 24168115 - 24168273
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168115 aatggtggataattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 24168213  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24168214 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 2892212 - 2892368
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892212 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 2892310  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2892311 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 8615264 - 8615423
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615264 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 8615362  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8615363 aatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacca 8615423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7345266 - 7345130
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345266 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 7345168  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 152  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345167 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22341948 - 22341788
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccac-caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341948 aatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 22341849  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22341848 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7393744 - 7393586
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393744 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 7393646  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  7393645 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2593998 - 2593852
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2593998 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggt 2593899  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2593898 tgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 960062 - 959902
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  960062 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 959964  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  959963 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 959902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 28947111 - 28947271
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28947111 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 28947209  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28947210 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28947271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33452730 - 33452570
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33452730 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggct 33452632  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452631 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 33452570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19415691 - 19415533
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415691 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 19415593  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19415592 aatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 16703390 - 16703539
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16703390 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 16703488  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16703489 aatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24224228 - 24224068
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24224228 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 24224130  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24224129 aatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcaccat 24224068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10508066 - 10507908
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10508066 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggct 10507968  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  10507967 aatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5294947 - 5294801
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5294947 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgat 5294848  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5294847 tgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5299499 - 5299353
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5299499 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgat 5299400  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5299399 tgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 599916 - 600076
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  599916 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgact 600014  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  600015 aatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 600076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 1970735 - 1970893
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1970735 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtgact 1970833  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1970834 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19281213 - 19281056
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19281213 aatggtgggtaatttg-cccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggct 19281115  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19281114 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30743606 - 30743448
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743606 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 30743508  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||    
T  30743507 aatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacc 30743448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23262075 - 23261929
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  23262075 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtattggt 23261976  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23261975 tggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 30467761 - 30467658
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30467761 aatggtgggtaattt-acccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgtgcttatgtggct 30467663  T
Q  111 aatgt 115  Q
    |||||    
T  30467662 aatgt 30467658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28948992 - 28948844
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||           | |||||||||||||    
T  28948992 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tatgcttatgtggct 28948905  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28948904 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28948844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 7167605 - 7167753
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  7167605 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 7167693  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7167694 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 15965457 - 15965604
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||| |||           |||| ||||||||||    
T  15965457 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaata-----------tgtgtttatgtggct 15965544  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15965545 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Original strand, 13329405 - 13329545
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||           ||| ||||||||||||||||    
T  13329405 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggct 13329492  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagt 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13329493 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 4487551 - 4487698
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||| || ||||||||    
T  4487551 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtactcatgtggct 4487638  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4487639 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 1398576 - 1398724
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||| |||           ||||||||||||||    
T  1398576 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaata-----------tgtgcttatgtggc 1398663  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1398664 taatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 3786773 - 3786921
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  3786773 aatggtggataattt-acctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 3786860  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3786861 aatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3786921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 3291032 - 3291179
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||           ||| ||||||||||||||||    
T  3291032 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggct 3291119  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291120 aatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 171
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661906
Alignment:
Q  95 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 18661906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24913216 - 24913096
Alignment:
Q  41 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccac 140  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||     
T  24913216 gaaaatgagcaatttatttgtggagtcaaaatagttcatgaatat---------atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcat 24913126  T
Q  141 cattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  24913125 cattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 929683 - 929740
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 69  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  929683 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaa 929740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1939629 - 1939579
Alignment:
Q  34 aaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggata 84  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  1939629 aaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375741
Alignment:
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggta 375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 375872 - 375797
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc 86  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  375872 aaatggtgggtaattt-acctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 13844877 - 13844943
Alignment:
Q  29 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844877 ccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 3611160 - 3611321
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611160 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 3611258  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3611259 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 3611321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 45538177 - 45538337
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538177 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 45538275  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45538276 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45538337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 31308025 - 31308183
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308025 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31308123  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31308124 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21139569 - 21139410
Alignment:
Q  12 atggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139569 atggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 21139471  T
Q  112 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21139470 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 21139410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 25058712 - 25058871
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058712 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 25058810  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058811 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25058871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 44661994 - 44662152
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661994 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 44662092  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44662093 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4068842 - 4068689
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068842 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 4068744  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4068743 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25678417 - 25678256
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678417 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 25678319  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25678318 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccatt 25678256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26085556 - 26085396
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085556 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 26085458  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26085457 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17995109 - 17994951
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995109 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 17995011  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17995010 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 43251735 - 43251891
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251735 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 43251833  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43251834 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5981194 - 5981352
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981194 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 5981292  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5981293 aatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 26794328 - 26794482
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26794328 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 26794426  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26794427 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 26277201 - 26277362
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26277201 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgtttatgtggct 26277299  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26277300 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 26277362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 23984779 - 23984943
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23984779 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 23984877  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttct 176  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23984878 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttct 23984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24245183 - 24245024
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24245183 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 24245085  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24245084 aatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 24245024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6327705 - 6327548
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6327705 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat-tgact 6327608  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6327607 aatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23932667 - 23932509
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23932667 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgtgcttatgtggct 23932569  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23932568 aatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 31040733 - 31040891
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31040733 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 31040831  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31040832 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Original strand, 36566372 - 36566523
Alignment:
Q  30 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggt 129  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36566372 caccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggt 36566471  T
Q  130 aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  36566472 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatatgtttttg 36566523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37620350 - 37620192
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37620350 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtggct 37620252  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37620251 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38790355 - 38790197
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38790355 aatggttggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 38790257  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38790256 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 39646592 - 39646750
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39646592 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtaact 39646690  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39646691 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 41999838 - 41999997
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41999838 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 41999936  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41999937 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 47671610 - 47671769
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671610 aatggtggataattt-accgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 47671708  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47671709 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 47671769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33112975 - 33112818
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33112975 aatggtgggtaaatt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 33112877  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  33112876 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 33884112 - 33884270
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33884112 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 33884210  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33884211 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33960140 - 33959982
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33960140 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 33960042  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33960041 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 35273620 - 35273780
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273620 aatggtggataattt-acccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 35273718  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35273719 aatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 35273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 47317339 - 47317499
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47317339 aatggtgggtaattt-attcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 47317437  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47317438 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 47317499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 47383890 - 47383731
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47383890 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 47383792  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  47383791 aatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacca 47383731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35692822 - 35692663
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35692822 aatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgtttatgtggct 35692723  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  35692722 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 50774241 - 50774399
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  50774241 aatggtgggtaatta-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacc 50774339  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50774340 aatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 46967199 - 46967040
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967199 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 46967101  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46967100 aatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 46967040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 49399146 - 49398987
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49399146 aatggtaggtaattt-atccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 49399048  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399047 aatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacca 49398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 51057095 - 51057254
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51057095 aatggtgggtaattt-accaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 51057193  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51057194 aatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 51057254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 171
Target Start/End: Original strand, 2450530 - 2450677
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2450530 tttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggt 2450629  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450630 tggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2450677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5980092 - 5980250
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5980092 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaattagcttatgtggct 5980190  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5980191 aatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 24885525 - 24885683
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  24885525 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggat 24885623  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  24885624 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26525047 - 26524889
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26525047 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatatgcttatgtggct 26524949  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26524948 aatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38332017 - 38331859
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38332017 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggct 38331919  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38331918 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49254133 - 49253975
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49254133 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatatggct 49254035  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  49254034 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacc 49253975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23221087 - 23220933
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221087 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 23220989  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||      || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23220988 aatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgtgaccat 23220933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Original strand, 42863889 - 42864029
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42863889 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggct 42863987  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42863988 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 46784447 - 46784606
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46784447 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 46784545  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46784546 aatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacca 46784606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045593
Alignment:
Q  29 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggg 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  129 taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcaccatt 51045593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 31844400 - 31844530
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844400 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31844498  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccacca 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31844499 aatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 46616573 - 46616731
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46616573 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggct 46616671  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  46616672 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 3285426 - 3285582
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3285426 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggct 3285523  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3285524 aatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42313507 - 42313361
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42313507 tttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggt 42313408  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42313407 tggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 47187141 - 47187287
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47187141 tttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggt 47187240  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |  ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47187241 tatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 28888605 - 28888760
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28888605 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 28888703  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 167  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28888704 aatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 36003154 - 36003315
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003154 aatggtgagtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 36003252  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttc---catgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||    
T  36003253 aatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 25518837 - 25518952
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25518837 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 25518935  T
Q  110 taatgtatattggttgg 126  Q
    |||||| ||||||||||    
T  25518936 taatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 48373528 - 48373677
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  48373528 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg--- 48373623  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  48373624 ------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  42 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 141  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  142 attcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 33073234 - 33073382
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  33073234 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 33073321  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33073322 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475866
Alignment:
Q  25 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  125 ggggtaaattacccaccattctt 147  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45475887 -gggtaaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27983745 - 27983602
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27983745 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 27983663  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27983662 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27983602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41467779 - 41467630
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  41467779 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 41467692  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41467691 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 41467630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312530
Alignment:
Q  77 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 13312530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 2657327 - 2657474
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  2657327 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 2657414  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2657415 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772167
Alignment:
Q  38 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  138 caccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttc 175  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcaccttttc 47772167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 10928090 - 10928238
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  10928090 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 10928177  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10928178 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51403165 - 51403034
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       
T  51403165 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatatg--- 51403071  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
          ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51403070 ------tattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156576
Alignment:
Q  39 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaa-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaa 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  132 attacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6626171 - 6626025
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  6626171 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 6626084  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6626083 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 2954878 - 2955026
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||              
T  2954878 aaatggtgggtaattt-acccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaaggtg---------- 2954966  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2954967 -attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31980093 - 31979998
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31980093 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26472326 - 26472185
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  26472326 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 26472239  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  26472238 aatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 26685879 - 26686027
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  26685879 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg---------- 26685967  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26685968 -aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38716395 - 38716247
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||              
T  38716395 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg---------- 38716307  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38716306 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 29770694 - 29770841
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  29770694 aatggtgggtaattt-atccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 29770781  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  29770782 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 1388496 - 1388646
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  1388496 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 1388584  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1388585 -aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 1388646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30290058 - 30289908
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||           |||||||||||||     
T  30290058 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggt 30289971  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  30289970 taatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcaccat 30289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4243637 - 4243490
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||| |||           |||||||||||||||    
T  4243637 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtggct 4243550  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4243549 aatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 4953076 - 4953223
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||| |    
T  4953076 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggtt 4953163  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  4953164 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 42234864 - 42235010
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||| |    
T  42234864 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggtt 42234951  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42234952 aatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2557004 - 2556879
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||       
T  2557004 aatggtggataattt-atccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgtttatgtg--- 2556909  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 146  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2556908 ------tattggttggggtaaattacccactattct 2556879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41895307 - 41895163
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||    
T  41895307 gtgggtaattt-acccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 41895220  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41895219 tgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48683478 - 48683330
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||              
T  48683478 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg---------- 48683390  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48683389 -aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 33187364 - 33187507
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||| ||               
T  33187364 aatggtggataattt-acacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaatatg----------- 33187451  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33187452 ------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 33187507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 10920223 - 10920373
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  10920223 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 10920311  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  10920312 -aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcaccat 10920373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34752461 - 34752320
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| | || |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  34752461 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 34752374  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  34752373 aatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5961415 - 5961267
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  5961415 aaatggtggataattt-acccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 5961327  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5961326 -aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13281709 - 13281588
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  13281709 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 13281622  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 144  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13281621 aatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27924806 - 27924674
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  27924806 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 27924718  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 154  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27924717 -aatggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 52323961 - 52324111
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||| |||              
T  52323961 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacctaaaaaggtg---------- 52324049  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52324050 aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacca 52324111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13313317 - 13313249
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggata 84  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13313317 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51155737 - 51155606
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||           |||| ||||||| |    
T  51155737 aaatgatgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtgac 51155650  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51155649 taatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718163
Alignment:
Q  95 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccattt 38718163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44293590 - 44293455
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  44293590 tttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggctaatatatattagt 44293502  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  44293501 tggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39475930 - 39475782
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||              
T  39475930 aaatgatgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccacctaaaaatgtg---------- 39475843  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     || || ||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  39475842 -aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 39475782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44544193 - 44544052
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||| |||||||  ||    
T  44544193 aatggtggataattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtacttatgtaact 44544106  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44544105 aatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 44544052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7561690 - 7561527
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |    | ||  |||   | | || ||||||||| ||||    
T  7561690 aaatggtaggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagttcatgaatatgtgcttacgtgg 7561592  T
Q  109 --ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7561591 ggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 32448672 - 32448740
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  32448672 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 52367906 - 52367990
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  52367906 aaattgtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 46428401 - 46428332
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  46428401 aaatggtgggtaattt-acccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24649870 - 24649802
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcat 79  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24649870 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  51 aatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 150  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  151 tgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 167
Target Start/End: Original strand, 32448757 - 32448807
Alignment:
Q  117 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32448757 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 39637943 - 39637996
Alignment:
Q  35 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttc-atggatacca 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39637943 accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35991742 - 35991616
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||||||||     
T  35991742 gtgggtaattt-atccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggctaata 35991655  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991654 tgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 147
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  101 ttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 147  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9779999 - 9779919
Alignment:
Q  63 gggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 144  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  9779999 gggtcaaagtagtttggggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgtt-gggttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844855
Alignment:
Q  133 ttacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31844855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359553
Alignment:
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcct 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatagatatcct 39359553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215855
Alignment:
Q  31 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg 24215855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 4156223 - 4156188
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatg 47  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4156223 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 24253406 - 24253566
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253406 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 24253504  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24253505 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 24253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18479826 - 18479666
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479826 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 18479728  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  18479727 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcaccat 18479666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5184996 - 5185154
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5184996 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 5185094  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185095 aatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 35626062 - 35626220
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626062 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 35626160  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35626161 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43326537 - 43326379
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43326537 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcctatgtggct 43326439  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43326438 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15398640 - 15398483
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398640 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 15398542  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15398541 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 6901823 - 6901979
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901823 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 6901921  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6901922 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  25 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  125 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 27938921 - 27939080
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27938921 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 27939019  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg-tatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27939020 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2484450 - 2484288
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2484450 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgtttatgtggct 2484352  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484351 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 2484288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 7722073 - 7722231
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722073 aatggtgggtaattt-actcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 7722171  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7722172 aatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 39932603 - 39932761
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932603 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 39932701  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39932702 aatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 31938920 - 31939080
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  31938920 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatgac 31939018  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31939019 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacca 31939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40886185 - 40886026
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40886185 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggct 40886088  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40886087 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcaccat 40886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3466839 - 3466681
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3466839 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 3466741  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3466740 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 12648821 - 12648979
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648821 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 12648919  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12648920 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43262341 - 43262183
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262341 aatggtgggtaatta-acctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 43262243  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43262242 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27501213 - 27501053
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501213 aatggtggataattt-atccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 27501115  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27501114 aatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 27501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 739862 - 739704
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  739862 aatggtgagtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 739764  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  739763 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 739704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 15683827 - 15683973
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15683827 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggt 15683926  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15683927 tggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451434
Alignment:
Q  30 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  130 aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 34451434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27278635 - 27278474
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatag----ttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27278635 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttacgt 27278537  T
Q  107 ggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27278536 ggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 25831545 - 25831702
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25831545 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggataccaattaaaaatgtgcttatgtggct 25831642  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  25831643 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40279016 - 40278855
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40279016 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 40278918  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  40278917 aatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcaccatt 40278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13504900 - 13504740
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13504900 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 13504802  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13504801 aatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 13504740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 40110258 - 40110413
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40110258 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 40110355  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40110356 aatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28424947 - 28424795
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28424947 gtgggtaattt-atccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 28424851  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  28424850 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 890930 - 891087
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  890930 aatggtggataattt-atccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggct 891027  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  891028 aatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5137739 - 5137897
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5137739 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 5137837  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||| || | |||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  5137838 aatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38756646 - 38756487
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38756646 aatggtgggtaattt-acccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 38756548  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt-ccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  38756547 aatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 763747 - 763905
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  763747 aatggtgggtaattt-actcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttatgtggct 763845  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  763846 aatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 33617608 - 33617756
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  33617608 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 33617695  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33617696 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 4149718 - 4149847
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4149718 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtta----------tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 4149806  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4149807 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 19295753 - 19295902
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  19295753 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggc 19295840  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19295841 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 19295902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5497297 - 5497444
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  5497297 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 5497384  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5497385 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 27503403 - 27503551
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  27503403 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 27503490  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27503491 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 27503551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23195395 - 23195248
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  23195395 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 23195308  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23195307 aatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31294147 - 31293987
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  31294147 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatatgcttacgtgatt 31294049  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31294048 gatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcaccat 31293987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38015661 - 38015514
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  38015661 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 38015574  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38015573 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9424739 - 9424593
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||           | |||||||||||||    
T  9424739 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggct 9424652  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9424651 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42658809 - 42658671
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || || |||||||||||||    
T  42658809 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggct 42658722  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42658721 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656567
Alignment:
Q  14 ggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaat 3656625  T
Q  114 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3656624 gtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9374650 - 9374502
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||           |||| ||| |||||    
T  9374650 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttaggtggc 9374563  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9374562 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 40632522 - 40632634
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||||||||||    
T  40632522 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc---------ggtgcttatgtggc 40632611  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaa 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  40632612 taatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 6973087 - 6973234
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  6973087 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 6973174  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6973175 aatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 13957694 - 13957841
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           || ||||||||| ||    
T  13957694 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgcgcttatgtgact 13957781  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13957782 aatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 14972002 - 14972150
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||           || ||||||||||||| ||    
T  14972002 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgtgcttatgtgact 14972089  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14972090 aatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 14972150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 27390633 - 27390768
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||  ||||||    
T  27390633 tttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggt 27390721  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27390722 tggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 2585485 - 2585633
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||              
T  2585485 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaaagttg---------- 2585573  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  2585574 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 6206912 - 6207032
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||    
T  6206912 gtgggtaattt-acccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 6206999  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattctt 147  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6207000 tgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Original strand, 38492649 - 38492785
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38492649 tttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggt 38492737  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  38492738 tggggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccaccat 38492785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36365592 - 36365445
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  36365592 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 36365505  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  36365504 aatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacc 36365445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18327321 - 18327171
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  18327321 aaatggtggataattt-acccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 18327233  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18327232 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcaccat 18327171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24167932 - 24167782
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  24167932 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 24167844  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24167843 -aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 24167782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 5120049 - 5120181
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||               
T  5120049 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatg----------- 5120135  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5120136 aatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggta 5120181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33624074 - 33623940
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||           |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33624074 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggta-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggt 33623986  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||||||    
T  33623985 tggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36948623 - 36948492
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36948623 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggt 36948536  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  36948535 aggg-taaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38638058 - 38637910
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||              
T  38638058 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg---------- 38637970  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38637969 -aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12558176 - 12558090
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12558176 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612757
Alignment:
Q  13 tggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||             |||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaacc-accaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaa 612816  T
Q  113 tgtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  612815 tgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1402653 - 1402505
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||              
T  1402653 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacccaaaaaggtg---------- 1402565  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  1402564 -aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 36472432 - 36472348
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  36472432 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Original strand, 40686920 - 40687069
Alignment:
Q  8 agaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 107  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| |||            
T  40686920 agaaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaa-gtg-------- 40687009  T
Q  108 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  40687010 ---aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 42247929 - 42247865
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagtt 76  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  42247929 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Original strand, 41312981 - 41313052
Alignment:
Q  171 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattnnnnnnncaatgttaagcaataactgacat 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  41312981 atttctttatggttattgatgcttttgtatatagtagtatatt-aaaaaacaatgttaagcaataactgacat 41313052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3940479 - 3940411
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcat 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  3940479 aaatggtgggtaattt-acccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9171172 - 9171115
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 69  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9171172 aatggtgggtaattt-atccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 9171115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 9527167 - 9527124
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 55  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527167 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42247844 - 42247791
Alignment:
Q  117 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  42247844 tattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacc 42247791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25894075 - 25893916
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894075 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 25893977  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25893976 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 35355913 - 35356071
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355913 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 35356011  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35356012 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22979805 - 22979645
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22979805 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 22979707  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22979706 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 22979645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45690256 - 45690097
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690256 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 45690158  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45690157 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 36389381 - 36389539
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389381 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 36389479  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36389480 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33423433 - 33423276
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423433 aatgatgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 33423335  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33423334 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 27018141 - 27018301
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018141 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 27018239  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018240 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 27018301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 17855453 - 17855611
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17855453 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggct 17855551  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17855552 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33839873 - 33839715
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839873 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 33839775  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33839774 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35328227 - 35328069
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328227 aatggtgggtaaatt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 35328129  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35328128 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47067135 - 47066977
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067135 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 47067037  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47067036 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33695979 - 33695818
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695979 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 33695881  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33695880 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatt 33695818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23393205 - 23393049
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23393205 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatg 23393107  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23393106 tgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23393049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49171520 - 49171362
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49171520 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 49171422  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49171421 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 33411285 - 33411446
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33411285 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 33411383  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33411384 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccatt 33411446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 46913134 - 46913294
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa--tgtgcttatgtgg 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46913134 aatggtgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtgcttatgtgg 46913232  T
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46913233 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47740489 - 47740328
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47740489 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 47740391  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47740390 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatt 47740328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2341820 - 2341661
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2341820 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgact 2341722  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat-gggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2341721 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20165972 - 20165813
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20165972 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggct 20165874  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20165873 aatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5183983 - 5183825
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5183983 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggct 5183885  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5183884 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 31625729 - 31625886
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31625729 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 31625827  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625828 aatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 10028513 - 10028674
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10028513 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 10028611  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtat--cctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10028612 aatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacca 10028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37846174 - 37846016
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846174 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 37846076  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37846075 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 40670588 - 40670746
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40670588 aatggtggataattt-accaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 40670686  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40670687 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 43499510 - 43499670
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  43499510 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtggcc 43499608  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  43499609 aatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcaccat 43499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48609835 - 48609675
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609835 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 48609737  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48609736 aatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 48609675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 29446862 - 29447020
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  29446862 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgac 29446960  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29446961 taatgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 31586873 - 31587031
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586873 aatggtggataattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31586971  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  31586972 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 45482683 - 45482841
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  45482683 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtgact 45482781  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45482782 gatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 15877575 - 15877724
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877575 aatggtgggtaattt-acccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 15877673  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 161  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15877674 aatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26579875 - 26579717
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26579875 aatggtgggtaattt-acccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 26579777  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26579776 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 33332814 - 33332971
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33332814 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgcttatgcggct 33332911  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33332912 aatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 170
Target Start/End: Original strand, 35767519 - 35767657
Alignment:
Q  32 ccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaa 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35767519 ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaa 35767618  T
Q  132 attacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35767619 attacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 5712197 - 5712353
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5712197 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 5712295  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  5712296 tgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 5712353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35757178 - 35757020
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757178 aatggtggataattt-atccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 35757081  T
Q  111 aatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35757080 aatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41991016 - 41990872
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41991016 aatggtggataattt-acacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41990918  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41990917 aatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta 41990872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 19563472 - 19563631
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19563472 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 19563570  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19563571 aatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacca 19563631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 33870270 - 33870424
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33870270 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 33870368  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||    
T  33870369 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233935
Alignment:
Q  33 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaa 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  133 ttacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 28233935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45063513 - 45063356
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063513 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 45063415  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  45063414 aatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacca 45063356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076527
Alignment:
Q  39 atgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccc 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  139 accattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31429633 - 31429473
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31429633 aatggtgggtgattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgact 31429535  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31429534 aatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 31429473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 10618323 - 10618474
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10618323 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccacttaaaaatatgtttatgtggct 10618414  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10618415 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33720194 - 33720070
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720194 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggct 33720096  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33720095 aatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 170
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904388
Alignment:
Q  54 ttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  154 gtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 170
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405531
Alignment:
Q  51 aatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 150  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  151 tgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35752181 - 35752034
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  35752181 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 35752094  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35752093 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 43489243 - 43489391
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  43489243 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 43489330  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  43489331 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 43489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46898164 - 46898016
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  46898164 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 46898077  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46898076 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 44564363 - 44564497
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  44564363 aatggtggataattt-acccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttatgtgact 44564461  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564462 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 37127962 - 37128109
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||           ||| |||||||||||| |||    
T  37127962 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtagct 37128049  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37128050 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 36816992 - 36816843
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  36816992 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 36816905  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  36816904 aatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 36816843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24923171 - 24923024
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||           |||||||||||||||    
T  24923171 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 24923084  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24923083 aatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 33393352 - 33393499
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||           ||     
T  33393352 aaatagtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-----------ggt 33393439  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33393440 taatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46817568 - 46817421
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  46817568 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 46817481  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  46817480 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 26371074 - 26371223
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  26371074 aatggtgggtaattt-atccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 26371161  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  26371162 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 26371223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44003518 - 44003370
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  44003518 aaatggtgggtaattt-acccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 44003430  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44003429 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7876475 - 7876328
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           ||| |||||||||||    
T  7876475 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggct 7876388  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7876387 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 48085883 - 48086030
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  48085883 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 48085970  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  48085971 aatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacc 48086030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 2332043 - 2332193
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||     
T  2332043 aaatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggt 2332130  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2332131 tactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcaccat 2332193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15644094 - 15643948
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  15644094 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 15644006  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  15644005 -aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26941679 - 26941541
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  26941679 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 26941592  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26941591 aatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 24228566 - 24228713
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || || |||||||||||||    
T  24228566 aatggtgggtaattt-accaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggct 24228653  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24228654 aatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47460920 - 47460769
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||              
T  47460920 aaatggtggataattt-acccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg---------- 47460832  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  47460831 -aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccatt 47460769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45502963 - 45502817
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||           ||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  45502963 aatggtgagtaattt-acctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccatttaaaaatatgcttatgtagct 45502876  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  45502875 aatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 7257405 - 7257554
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||              
T  7257405 aaatgatgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg---------- 7257493  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7257494 -aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacca 7257554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 21718145 - 21718288
Alignment:
Q  14 ggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 113  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||||    
T  21718145 ggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaat 21718232  T
Q  114 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21718233 gtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 46103145 - 46103291
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  46103145 aaatggtgggtaattta--ccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 46103231  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46103232 taatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 498335 - 498187
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  498335 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 498248  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  498247 aatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacca 498187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 29610660 - 29610807
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  29610660 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 29610747  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610748 aatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443602
Alignment:
Q  27 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  127 ggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 29098776 - 29098921
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||               || |||||||||||||    
T  29098776 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat---------------atatgcttatgtggct 29098859  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||| |||||    
T  29098860 aatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttaccat 29098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 35484661 - 35484807
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||| ||    
T  35484661 aatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgact 35484749  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35484750 aatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39453622 - 39453484
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||                  ||||| ||||||| ||    
T  39453622 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt------------------atgtgtttatgtgact 39453542  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39453541 aatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16482931 - 16482847
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  16482931 aaatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25037655 - 25037516
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  25037655 aatggtgagtaattt-acccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 25037568  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctag 162  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  25037567 gatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 29863040 - 29863116
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29863040 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45237668 - 45237533
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||           ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45237668 tttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggt 45237580  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  45237579 tggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32556753 - 32556640
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||           || ||||||||||||| ||    
T  32556753 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgact 32556666  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32556665 aatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 41855083 - 41855228
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||           |||| || ||||||||||||    
T  41855083 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca-----------taaatatatgcttatgtggc 41855170  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta-tcctagttgt 166  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  41855171 taatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47906906 - 47906758
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  47906906 aatggtgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 47906819  T
Q  111 aatgtatattggttggggt-aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  47906818 aatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 44659880 - 44660015
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||           || || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  44659880 tttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggt 44659968  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  44659969 tggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 39323641 - 39323709
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  39323641 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 39866690 - 39866758
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  39866690 aatggtgggtaattt-actcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323779
Alignment:
Q  102 tatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38448583 - 38448508
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  38448583 tttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgtg 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  35 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaat 96  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 33455121 - 33455189
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  33455121 aatggtggataattt-acccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 55
Target Start/End: Original strand, 35557754 - 35557798
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 55  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557754 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 156
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  112 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 7720651 - 7720574
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 88  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  7720651 aaatggtgggtaattt-atccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272245
Alignment:
Q  105 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacca 42272245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 30077083 - 30077043
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 52  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077083 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32984235 - 32984077
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984235 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 32984137  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32984136 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37301483 - 37301316
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37301483 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 37301385  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttttt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37301384 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca-catttcttttt 37301316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24080059 - 24079900
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080059 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 24079961  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24079960 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 24079900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 10646146 - 10646307
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10646146 aaatagtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgttcttatgtggc 10646244  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10646245 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 10646307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 32114273 - 32114429
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32114273 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 32114371  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114372 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 41862244 - 41862402
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41862244 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 41862342  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41862343 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 41653919 - 41654079
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653919 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41654017  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41654018 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 41654079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9303732 - 9303574
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9303732 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 9303634  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9303633 aatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33730799 - 33730641
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730799 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 33730701  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33730700 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33981821 - 33981663
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33981821 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgcggct 33981723  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33981722 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40435311 - 40435153
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435311 aatggtgggtaactt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 40435213  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40435212 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 43328731 - 43328889
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328731 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 43328829  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43328830 aatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 5946071 - 5946229
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946071 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 5946169  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5946170 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 6366010 - 6366168
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366010 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 6366108  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  6366109 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31831113 - 31830959
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831113 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31831015  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31831014 aatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 37956445 - 37956603
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956445 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 37956543  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  37956544 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45236723 - 45236565
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236723 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 45236625  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45236624 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13356275 - 13356120
Alignment:
Q  14 ggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13356275 ggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaat 13356177  T
Q  114 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13356176 gtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 9734279 - 9734435
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9734279 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggct 9734376  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9734377 aatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17718880 - 17718722
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718880 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 17718782  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17718781 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 25185923 - 25186081
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25185923 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 25186021  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  25186022 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacc 25186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 2714573 - 2714714
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714573 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 2714671  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2714672 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 37419964 - 37420125
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  37419964 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtgact 37420062  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37420063 aatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccatt 37420125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 35628801 - 35628959
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35628801 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 35628899  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35628900 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 41231970 - 41232128
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41231970 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgacc 41232068  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41232069 aatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 2275937 - 2276094
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2275937 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgcttatgtggct 2276034  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2276035 aatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 9013708 - 9013865
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9013708 aatggtaggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggct 9013806  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9013807 aatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033112
Alignment:
Q  44 aatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  144 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13760806 - 13760646
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13760806 aatggtgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttctgtggct 13760708  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg--gtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13760707 aatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29048561 - 29048426
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048561 aatggtggataattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 29048463  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048462 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44088589 - 44088460
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44088589 tttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggt 44088490  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088489 tggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 171
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904259
Alignment:
Q  37 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  137 ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 3904259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 22878415 - 22878572
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878415 aatggtgggtaattt-atccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 22878513  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22878514 aatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981652
Alignment:
Q  54 ttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  154 gtatcctagttgtcaccat 172  Q
     || |||||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcaccat 41981652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45066738 - 45066592
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45066738 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgat 45066639  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  45066638 tataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacc 45066592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 45258534 - 45258675
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  45258534 aatggtcggtaattt-acccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtaact 45258632  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45258633 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 41639950 - 41640095
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||    
T  41639950 tttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagt 41640049  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  41640050 tgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 25248087 - 25248215
Alignment:
Q  42 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  25248087 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatc 25248186  T
Q  142 attcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  25248187 attcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4447443 - 4447295
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  4447443 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 4447356  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4447355 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  57 ttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  157 tcctagttgtcacc 170  Q
     |||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42701448 - 42701303
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta---aaaatgtgcttatgtg 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||    
T  42701448 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaatgtgct--tgtg 42701352  T
Q  108 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 156  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42701351 actaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggta 42701303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 10378332 - 10378480
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  10378332 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 10378419  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378420 taatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 3211228 - 3211376
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  3211228 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 3211315  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3211316 taatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 41843276 - 41843426
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  41843276 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 41843363  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  41843364 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcaccat 41843426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 31940339 - 31940487
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  31940339 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 31940426  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  31940427 aatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 31940487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 117476 - 117328
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  117476 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 117389  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  117388 aatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 117328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 2379164 - 2379312
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  2379164 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 2379251  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2379252 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32373874 - 32373733
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||      
T  32373874 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgat 32373787  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  32373786 taatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39915970 - 39915887
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39915970 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 181
Target Start/End: Original strand, 9713730 - 9713868
Alignment:
Q  32 ccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9713730 ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 9713818  T
Q  132 attacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 181  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  9713819 attacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatgtttttg 9713868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40458919 - 40458770
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||| || |||||||    
T  40458919 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttttgtggct 40458832  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  40458831 aatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 40458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 41981457 - 41981535
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 90  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41981457 aatggtaggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26196464 - 26196317
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  26196464 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataataa-caatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 26196377  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26196376 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4975554 - 4975403
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||| |||||    
T  4975554 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatatggct 4975467  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  4975466 aatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgctaccattt 4975403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40649978 - 40649837
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||           |||||||||||||||    
T  40649978 aatgatgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 40649891  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  40649890 aatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33896991 - 33896843
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||  ||              
T  33896991 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaagatg---------- 33896903  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  33896902 -aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3490547 - 3490399
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||| |||              
T  3490547 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacctaaaaaggtg---------- 3490459  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  3490458 -aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9509547 - 9509400
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||           |||| |||||||||     
T  9509547 aatggtgtgtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggca 9509460  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  9509459 aatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33622612 - 33622466
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||           || ||||| ||||||| ||    
T  33622612 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtggttatgtgact 33622526  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  33622525 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacca 33622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27243286 - 27243218
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  27243286 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 27254861 - 27254793
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  27254861 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 38631675 - 38631806
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||           || || |||||||||||     
T  38631675 aaatggtggataattt-acccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggt 38631762  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631763 taatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31149038 - 31148953
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatg 97  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31149038 aaatggtgggtaattt-attcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 172
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901741
Alignment:
Q  105 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcaccat 39901741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425428
Alignment:
Q  95 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacca 41425428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 209
Target Start/End: Original strand, 36104476 - 36104514
Alignment:
Q  171 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36104476 atttctttttggttattgatgcttttgtatattgtagta 36104514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 164746 - 164812
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcat 79  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  164746 aatgatgggtaattt-atccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6594616 - 6594458
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594616 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 6594518  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6594517 aatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 746489 - 746648
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746489 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 746587  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  746588 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 746648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 17600858 - 17601017
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600858 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 17600956  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17600957 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 23901802 - 23901961
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901802 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 23901900  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901901 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23901961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10244740 - 10244582
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10244740 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 10244642  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10244641 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 38997124 - 38997282
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997124 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 38997222  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38997223 aatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 45371013 - 45371173
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371013 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 45371111  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45371112 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45371173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 4034615 - 4034773
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034615 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 4034713  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4034714 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 14660469 - 14660627
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660469 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 14660567  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14660568 aatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 34518390 - 34518548
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518390 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 34518488  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34518489 aatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 40635241 - 40635399
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635241 aatggtgggtaaatt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 40635339  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40635340 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 6430496 - 6430648
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430496 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 6430594  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6430595 aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13815376 - 13815216
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13815376 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 13815278  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13815277 aatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccat 13815216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 26710368 - 26710527
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710368 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 26710466  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26710467 gatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 26710527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2325047 - 2324889
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325047 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 2324949  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2324948 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 11184995 - 11185153
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11184995 aatggtaggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgact 11185093  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11185094 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27651192 - 27651034
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651192 aatggtgggtaattt-acccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 27651094  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27651093 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 27400426 - 27400587
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27400426 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtagct 27400524  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27400525 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatt 27400587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 10424618 - 10424773
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424618 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 10424716  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 167  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10424717 aatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2914296 - 2914134
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914296 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 2914198  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 174  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2914197 gatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcaccattt 2914134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1092109 - 1091951
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1092109 aatggtggataattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 1092011  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1092010 aatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32856594 - 32856436
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32856594 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgcttatgtggct 32856496  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32856495 aatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14697695 - 14697535
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14697695 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 14697597  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14697596 aatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 14697535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 32327384 - 32327544
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327384 aatggtgggtaattt-acccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 32327482  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32327483 aatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcaccat 32327544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 4609649 - 4609808
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4609649 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcct 4609747  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4609748 aatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4609808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 5726152 - 5726311
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5726152 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgtgtttatatggct 5726250  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5726251 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7892846 - 7892688
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7892846 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 7892748  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  7892747 aatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33427805 - 33427647
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427805 aatggtgggtaattt-atccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 33427707  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33427706 aatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Original strand, 9444726 - 9444874
Alignment:
Q  25 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9444726 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 9444825  T
Q  125 ggggtaaattacccacc---attcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9444826 ggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37255483 - 37255337
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37255483 tttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggt 37255384  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37255383 tgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 32948469 - 32948628
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32948469 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 32948566  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32948567 aatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcaccat 32948628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 27024438 - 27024596
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  27024438 aatggtgggtaattt-acccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatgtgact 27024536  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27024537 aatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 11159656 - 11159802
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  11159656 tttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgtgtttatgtggctattgtgtattgga 11159755  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11159756 tggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37621028 - 37620866
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt---caaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37621028 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 37620930  T
Q  108 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37620929 gcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacca 37620866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 40735487 - 40735647
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40735487 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgcggct 40735585  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  40735586 aatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcaccat 40735647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 167
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  40 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  140 ccattcttccatgggtatcctagttgtc 167  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 40037170 - 40037323
Alignment:
Q  15 gtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40037170 gtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatg 40037268  T
Q  115 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40037269 tgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 32608403 - 32608535
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608403 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 32608501  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32608502 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229793
Alignment:
Q  37 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  137 ccaccattcttccatgggt 155  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8433074 - 8432942
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8433074 aatggtggataattt-acctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatatacttatgtggct 8432976  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8432975 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Original strand, 15925103 - 15925255
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15925103 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtagct 15925201  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  15925202 aatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 39103069 - 39103216
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  39103069 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 39103156  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39103157 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 12842126 - 12842257
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12842126 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgtgtttatgtggct 12842224  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12842225 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447631
Alignment:
Q  63 gggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctag 162  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  163 ttgtcaccat 172  Q
    ||||||||||    
T  447640 ttgtcaccat 447631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21735048 - 21734900
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  21735048 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 21734961  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21734960 taatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Original strand, 42899938 - 42900039
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42899938 aatggttggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgcgcttatgtggct 42900036  T
Q  111 aat 113  Q
    |||    
T  42900037 aat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 41172481 - 41172605
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172481 aatgatgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41172579  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41172580 aatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35158197 - 35158049
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  35158197 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 35158110  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35158109 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 35158049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 29687064 - 29687212
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  29687064 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 29687151  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29687152 aatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 29687212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 145305 - 145450
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||           ||||||||||||||    
T  145305 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gtgcttatgtggct 145392  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  145393 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19428573 - 19428425
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  19428573 aatggtgggtaattt-acccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 19428486  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19428485 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 19428425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28641439 - 28641291
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           | || ||||||||||    
T  28641439 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgtttatgtggct 28641352  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28641351 aatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28641291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13543771 - 13543624
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  13543771 aatggtgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 13543684  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13543683 aatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27765009 - 27764863
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||||||    
T  27765009 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggct 27764922  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27764921 aatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 4258513 - 4258661
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  4258513 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 4258599  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  4258600 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcaccat 4258661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 44481850 - 44481998
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  44481850 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 44481938  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44481939 -aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  60 gtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaa 132  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43899118 - 43898969
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  43899118 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 43899031  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  43899030 taatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 43898969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 150
Target Start/End: Original strand, 12827145 - 12827223
Alignment:
Q  71 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12827145 atagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12333642 - 12333496
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  12333642 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgtgcttatgtggct 12333555  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  12333554 aatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacca 12333496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 27331321 - 27331472
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||        | ||||||||||||||||    
T  27331321 aatggtgggtaattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat-------atatgtgcttatgtggct 27331412  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  27331413 aatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39301344 - 39301197
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||| || ||    
T  39301344 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatatgact 39301257  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39301256 aatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 3711668 - 3711803
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3711668 tttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtattggt 3711756  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3711757 tggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 34249288 - 34249435
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||           |||||||||||| ||    
T  34249288 aatggtgagtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtgact 34249375  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34249376 aatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 43356134 - 43356267
Alignment:
Q  27 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43356134 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttg 43356222  T
Q  127 ggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  43356223 agtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 12730084 - 12730231
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||           |||| ||||||||||||| ||    
T  12730084 aatgatgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgtgcttatgtgact 12730171  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  12730172 aatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 35126806 - 35126945
Alignment:
Q  14 ggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |||    
T  35126806 ggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aat 35126893  T
Q  114 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 165  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  35126894 gtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28566845 - 28566703
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  28566845 aatggtggataattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 28566758  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 165  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  28566757 aatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2688804 - 2688729
Alignment:
Q  95 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2688804 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 12814637 - 12814693
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 68  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814637 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2000484 - 2000339
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||           |||| ||||||||| ||||||    
T  2000484 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca-----------taaatatgtgcttacgtggct 2000397  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     || | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2000396 catatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 3266319 - 3266387
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  3266319 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 40544211 - 40544155
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  40544211 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 168
Target Start/End: Original strand, 3266404 - 3266455
Alignment:
Q  117 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3266404 tattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38985412 - 38985342
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38985412 tttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 170
Target Start/End: Original strand, 42900772 - 42900835
Alignment:
Q  104 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42900772 tgtggctaatgtat--tggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacc 42900835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 30545844 - 30545917
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatac 85  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30545844 aatggtggataattt-acctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17799349 - 17799296
Alignment:
Q  67 caaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799349 caaaatagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 8056649 - 8056779
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||| || || ||||||||||           || ||| |||||||| |||    
T  8056649 aatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg-----------aatatgcgcttatgtagct 8056736  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 153  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  8056737 aatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40544138 - 40544084
Alignment:
Q  117 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  40544138 tattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 40544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11291 - 11132
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 11193  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11192 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 11132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 47257817 - 47257975
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257817 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 47257915  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47257916 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38416883 - 38416724
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38416883 aaatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggc 38416785  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38416784 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28048550 - 28048390
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048550 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 28048452  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28048451 aatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28048390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47809755 - 47809587
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47809755 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 47809657  T
Q  111 aatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  47809656 aatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatttt 47809587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7855272 - 7855114
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855272 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 7855174  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7855173 aatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39634729 - 39634572
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634729 aatggtgggta-ttttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 39634632  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39634631 aatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40131117 - 40130959
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131117 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 40131019  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40131018 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 49330061 - 49330219
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330061 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 49330159  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49330160 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 24100307 - 24100467
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24100307 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgcttatgtggct 24100404  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24100405 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 24100467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51170191 - 51170034
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170191 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 51170093  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51170092 aatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 22399121 - 22399280
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22399121 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccacttaaaa-tgtgcttatgtagct 22399218  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22399219 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22399280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 40643824 - 40643984
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40643824 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgtgcttatgtggct 40643922  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40643923 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 40643984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 41464376 - 41464535
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464376 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 41464474  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41464475 aatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacca 41464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48739392 - 48739233
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48739392 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 48739294  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48739293 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43612205 - 43612047
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43612205 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 43612107  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43612106 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 48609747 - 48609903
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609747 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 48609845  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48609846 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 52628978 - 52629136
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52628978 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggct 52629076  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52629077 aatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 52629136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29625985 - 29625827
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29625985 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggtt 29625887  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  29625886 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacc 29625827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32234555 - 32234398
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32234555 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgcttatgtggct 32234458  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32234457 aatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 40419859 - 40420017
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419859 aatgatgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 40419957  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40419958 aatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 42291866 - 42292024
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42291866 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgtacttatgtggct 42291964  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42291965 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 46126011 - 46126168
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46126011 aatggtggataattt-acccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35748457 - 35748311
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35748457 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggt 35748358  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35748357 tgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 55453402 - 55453245
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453402 aatggtgggtaattt-actcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 55453304  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  55453303 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 44222852 - 44223012
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  44222852 aaatagtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 44222950  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44222951 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 2666024 - 2666182
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2666024 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgtgcttatgtggct 2666122  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2666123 aatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27067136 - 27066978
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27067136 aatggtgggtaattt-accaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 27067038  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27067037 aatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 46134379 - 46134540
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134379 aaatggtgggtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 46134477  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  46134478 taatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccat 46134540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 37313423 - 37313582
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37313423 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggct 37313521  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  37313522 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacca 37313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 37324565 - 37324723
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  37324565 aatggtaggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatatttatgtggct 37324663  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37324664 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40804668 - 40804510
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40804668 aatggtgggtaattt-acccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 40804570  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40804569 aatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51102536 - 51102378
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  51102536 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtatttatgtggct 51102438  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  51102437 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7755464 - 7755307
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7755464 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggct 7755367  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7755366 aatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20754551 - 20754393
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20754551 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgtttatgtggct 20754453  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20754452 aatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 35594145 - 35594299
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35594145 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtggct 35594243  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 166  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35594244 aatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Original strand, 36368975 - 36369105
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368975 tttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 36369074  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggt 155  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36369075 tagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Original strand, 43021738 - 43021896
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg-tcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43021738 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 43021836  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  43021837 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 43125855 - 43126012
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43125855 aatggtgggtaattt-acccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 43125953  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||    
T  43125954 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 44806708 - 44806866
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806708 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 44806806  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| | |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44806807 aatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51452908 - 51452751
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51452908 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 51452810  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  51452809 aatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 41732551 - 41732711
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732551 aaatggtggataattt-atccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41732649  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  41732650 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacca 41732711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 43183936 - 43184092
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43183936 aatggtgagtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagct 43184034  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43184035 aatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47894978 - 47894822
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47894978 aatggtggataattt-acctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 47894880  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47894879 aatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 52638866 - 52639030
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52638866 aatggtgggtaattt-accaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttctgtggct 52638964  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttct 176  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52638965 aatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcaccttttct 52639030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 52215100 - 52215243
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215100 aatgatgggtaattt-acccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 52215198  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggt 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52215199 aatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggt 52215243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 39053418 - 39053576
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053418 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 39053516  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||  ||||||||||||    
T  39053517 aatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41293476 - 41293319
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41293476 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccacttaaaa-tgtgcttatgtggct 41293379  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  41293378 aatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53943745 - 53943588
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  53943745 aatggtggataattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtagct 53943647  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  53943646 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 53832642 - 53832486
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  53832642 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggggcttatgtggct 53832544  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  53832543 aatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 18946927 - 18947085
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18946927 aatggtgcgtaattt-acctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgtgcttatgtgact 18947025  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18947026 aatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 24376597 - 24376730
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376597 aatgatgggtaattt-acgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 24376695  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 145  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24376696 tatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 41216480 - 41216637
Alignment:
Q  12 atggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 111  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216480 atggtgggtaattt-atccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 41216578  T
Q  112 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41216579 atgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51146373 - 51146212
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51146373 aatggtaggtaattt-acacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgcttatgtggct 51146275  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 173  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  51146274 aatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccaccatt 51146212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5560190 - 5560025
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5560190 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatg 5560092  T
Q  106 tggc--taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5560091 tgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 46949410 - 46949543
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46949410 tttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggt 46949509  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatc 158  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46949510 t-ggataaattacccaccattcttccatggatatc 46949543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 170
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864671
Alignment:
Q  48 agcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  148 ccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 53637865 - 53637990
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53637865 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 53637963  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacc 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53637964 aatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 54159146 - 54159000
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  54159146 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg--- 54159051  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
          ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54159050 ------tattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  55 tgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 154  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  155 tatcctagttgtcacc 170  Q
    || |||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48546987 - 48546842
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  48546987 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaaa-tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg--- 48546894  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
          ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48546893 ------tattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 55000325 - 55000167
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  55000325 aatggtgggtaattt-acccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 55000238  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  55000237 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttttctttttg 55000167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 25641670 - 25641817
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||           ||| ||||||||||||||||    
T  25641670 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggct 25641757  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25641758 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 42589854 - 42590001
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  42589854 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 42589941  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  42589942 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 55380008 - 55380158
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  55380008 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 55380096  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55380097 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 55380158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 34279868 - 34279719
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  34279868 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 34279781  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  34279780 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccat 34279719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 49130601 - 49130746
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  49130601 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 49130688  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49130689 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 37758965 - 37759075
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37758965 tttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggt 37759064  T
Q  124 tggggtaaatt 134  Q
    |||||||||||    
T  37759065 tggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 38156779 - 38156632
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  38156779 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 38156692  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38156691 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 51415993 - 51416140
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  51415993 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggct 51416080  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51416081 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 54401211 - 54401358
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  54401211 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 54401298  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  54401299 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacc 54401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54707367 - 54707220
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  54707367 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 54707280  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  54707279 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 45058906 - 45059052
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||| ||    
T  45058906 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgttgc 45058993  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45058994 taatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47511088 - 47510938
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  47511088 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 47511001  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47511000 taatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 47510938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 53115470 - 53115623
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||              
T  53115470 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaaggtg---------- 53115558  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttc 175  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  53115559 -aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcaccttttc 53115623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 24688137 - 24688285
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||| |||||||||    
T  24688137 aaattgtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgtttatgtggc 24688224  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24688225 taatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 25353577 - 25353725
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  25353577 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 25353665  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25353666 -aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39141273 - 39141125
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||         | ||||||||||||||||    
T  39141273 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---------atatgtgcttatgtggct 39141184  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  39141183 aatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacc 39141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 37028747 - 37028895
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |||           |||| ||||||||||    
T  37028747 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggct 37028834  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37028835 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 37028895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182127
Alignment:
Q  37 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgt 47182127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31286940 - 31286793
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  31286940 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 31286853  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  31286852 aatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41635947 - 41635800
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  41635947 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 41635860  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41635859 aatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 51143840 - 51143987
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  51143840 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 51143928  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  51143929 -aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30251649 - 30251501
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  30251649 aaatggtgggtaattt-actcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 30251561  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30251560 -aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51224184 - 51224038
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||    
T  51224184 aatggtgggtaattt-acccaccaac-aataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgact 51224098  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  51224097 aatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17665671 - 17665549
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||| |    
T  17665671 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggtt 17665584  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665583 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 40022110 - 40022240
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40022110 tttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggt 40022198  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 165  Q
    | ||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022199 tagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42998937 - 42998790
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  42998937 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg---------- 42998849  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
     ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  42998848 -aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 52756206 - 52756065
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat----gtatat 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||||    || |||    
T  52756206 tttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaattaatgtgtat 52756118  T
Q  120 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52756117 tggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 52756065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534007
Alignment:
Q  95 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 50732062 - 50731913
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||  |||              
T  50732062 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggtg---------- 50731974  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50731973 -aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 50780794 - 50780943
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||  |||              
T  50780794 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggtg---------- 50780882  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50780883 -aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Original strand, 40165687 - 40165824
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggt 123  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| |||||||    
T  40165687 tttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggt 40165775  T
Q  124 tggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 172  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40165776 tggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcaccat 40165824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41882139 - 41882063
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 87  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41882139 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429227
Alignment:
Q  83 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Original strand, 41609103 - 41609178
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609103 tttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44946076 - 44945935
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||                 || ||||||||||||||||    
T  44946076 aatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag-----------------aatatgtgcttatgtggct 44945995  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44945994 aatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21597296 - 21597148
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| |||              
T  21597296 aaatggtgagtaattt-acccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg---------- 21597208  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||    
T  21597207 -aatgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacc 21597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 43176886 - 43176738
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||              
T  43176886 aaatggtggataattt-atccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtgg--------- 43176797  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
      |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43176796 --atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 52434162 - 52434216
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434162 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2228083 - 2227995
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  2228083 aaatggtgggaaattt-accgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8847786 - 8847718
Alignment:
Q  31 accaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8847786 accaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 47402896 - 47402810
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 99  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47402896 aatggtgggtaattt-atccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaatgtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 48726145 - 48726070
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 87  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  48726145 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28576247 - 28576184
Alignment:
Q  24 tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 87  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28576247 tttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 177273 - 177332
Alignment:
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  177273 aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 177332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752284
Alignment:
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtcac 48752284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  118 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882011
Alignment:
Q  128 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacc 41882011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 48752108 - 48752161
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 64  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752108 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434344
Alignment:
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 164  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccctagtt 52434344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  129 taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 1892 - 2052
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1892 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 1990  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1991 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39714 - 39556
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39714 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtt 39616  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39615 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13920 - 13762
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13920 aatggtggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 13822  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13821 aatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 176678 - 176836
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  176678 aatggtgggtaattt-accgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtacttatgtggct 176776  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  176777 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 278030 - 278190
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc--acttaaaaatgtgcttatgtgg 108  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  278030 aatggtgggtaaatt-actcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaatgtgtttatgtgg 278128  T
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  278129 ctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 75402 - 75244
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75402 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgtgtttatgtggct 75304  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  75303 aatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2590 - 2431
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2590 aatggtgggtaaatt-atccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 2492  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2491 aatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacca 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19012 - 18854
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19012 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 18914  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18913 aatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4595
Alignment:
Q  30 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggt 129  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  130 aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 32585 - 32715
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  32585 aatggtgggtaatta-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtggtt 32683  T
Q  111 aatgtatattggttggggtaaattacccacca 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32684 aatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 3133 - 3261
Alignment:
Q  42 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3133 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 3232  T
Q  142 attcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  3233 attcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 14767 - 14916
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||              
T  14767 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg---------- 14855  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14856 -aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20625 - 20477
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||              
T  20625 aaatggtgggtaattt-acccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg---------- 20537  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 170  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20536 -aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 171
Target Start/End: Original strand, 7114 - 7263
Alignment:
Q  11 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  7114 aatggtgggtaattt-acccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 7201  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7202 caatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4703 - 4553
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 108  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||             
T  4703 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaaggtg--------- 4614  T
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
      |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4613 --aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 3415 - 3565
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 108  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||             
T  3415 aaatggtgggtaattt-atccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaaggtg--------- 3504  T
Q  109 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
      |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3505 --aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 125 - 273
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||              
T  125 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg---------- 213  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 171  Q
     |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  214 -aatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 17929 - 18043
Alignment:
Q  10 aaatggtgggtaattttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||| || ||| ||||           |||||||||||||    
T  17929 aaatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac-----------gtgcttatgtggc 18016  T
Q  110 taatgtatattggttggggtaaattac 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18017 taatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 94
Target Start/End: Original strand, 19266 - 19327
Alignment:
Q  37 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca----aaatagttcatggataccacttaaaa 94  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  19266 caatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University