View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5775-Insertion-2 (Length: 791)

Name: NF5775-Insertion-2
Description: NF5775
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5775-Insertion-2
NF5775-Insertion-2
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (470-791)||(23673345-23673667)
chr2 (469-791)||(36326849-36327172)
chr2 (470-766)||(32575685-32575984)
chr2 (468-791)||(16294821-16295145)
chr2 (470-791)||(13709993-13710315)
chr2 (470-791)||(31528311-31528635)
chr2 (540-791)||(31626472-31626726)
chr2 (476-766)||(40017924-40018218)
chr2 (470-565)||(24384925-24385022)
chr2 (470-611)||(29435969-29436113)
chr2 (470-611)||(38315801-38315944)
chr2 (470-608)||(32074156-32074297)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (478-791)||(19664674-19664987)
chr6 (478-791)||(15534979-15535292)
chr6 (470-734)||(32427281-32427544)
chr6 (470-791)||(14790541-14790864)
chr6 (470-791)||(14795569-14795892)
chr6 (468-791)||(1838397-1838722)
chr6 (478-710)||(15540574-15540806)
chr6 (469-739)||(27649077-27649347)
chr6 (574-791)||(20527266-20527486)
chr6 (570-767)||(16883622-16883820)
chr6 (634-791)||(32704420-32704577)
chr6 (470-791)||(13017189-13017513)
chr6 (570-791)||(12980594-12980814)
chr6 (470-791)||(22221646-22221967)
chr6 (470-791)||(22247481-22247802)
chr6 (570-791)||(12983481-12983701)
chr6 (619-791)||(30978360-30978535)
chr6 (674-775)||(7769594-7769695)
chr6 (6-103)||(11195354-11195451)
chr6 (470-611)||(11410983-11411127)
chr6 (6-103)||(11154907-11155004)
chr6 (570-669)||(11183937-11184037)
chr6 (518-611)||(35026936-35027030)
chr6 (733-773)||(15540529-15540569)
chr6 (470-561)||(28974136-28974230)
chr6 (467-611)||(33678938-33679087)
chr6 (195-237)||(11212919-11212961)
chr6 (195-237)||(11279788-11279830)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (478-791)||(26062698-26063016)
chr4 (470-791)||(2541807-2542128)
chr4 (470-791)||(647203-647526)
chr4 (470-791)||(650475-650798)
chr4 (666-791)||(26060510-26060635)
chr4 (470-791)||(12171905-12172218)
chr4 (468-611)||(15851393-15851539)
chr4 (661-725)||(11649426-11649490)
chr4 (470-578)||(19929134-19929242)
chr4 (485-551)||(21217350-21217416)
chr4 (470-586)||(33400075-33400192)
chr4 (468-603)||(2210869-2211004)
chr4 (562-669)||(11649296-11649405)
chr4 (530-611)||(13979355-13979437)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (470-791)||(13495910-13496232)
chr1 (470-791)||(39546165-39546486)
chr1 (470-791)||(13493185-13493508)
chr1 (470-791)||(10764842-10765165)
chr1 (570-791)||(34066267-34066489)
chr1 (470-791)||(32505857-32506177)
chr1 (478-791)||(16190187-16190501)
chr1 (471-791)||(1936549-1936873)
chr1 (545-791)||(27282183-27282430)
chr1 (483-791)||(15297255-15297559)
chr1 (570-791)||(21153178-21153400)
chr1 (570-791)||(22456594-22456814)
chr1 (570-787)||(49147825-49148042)
chr1 (470-611)||(34552438-34552582)
chr1 (470-611)||(49716591-49716735)
chr1 (473-611)||(49720073-49720214)
chr1 (570-669)||(8435280-8435380)
chr1 (470-611)||(6206101-6206245)
chr1 (480-557)||(18392669-18392747)
chr1 (470-558)||(50196715-50196804)
chr1 (748-791)||(22453415-22453458)
chr1 (741-791)||(23990361-23990411)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (469-791)||(14616428-14616751)
chr5 (468-789)||(7649940-7650262)
chr5 (470-791)||(34405771-34406094)
chr5 (459-791)||(22159667-22160003)
chr5 (473-791)||(33575011-33575331)
chr5 (470-791)||(15532200-15532524)
chr5 (472-791)||(15542384-15542706)
chr5 (472-726)||(11988864-11989125)
chr5 (642-791)||(26712516-26712665)
chr5 (642-791)||(26982254-26982403)
chr5 (470-605)||(21680585-21680721)
chr5 (470-611)||(2499762-2499905)
chr5 (470-586)||(33921343-33921459)
chr5 (477-604)||(1810197-1810326)
chr5 (470-574)||(26711464-26711567)
chr5 (470-574)||(26981201-26981304)
chr5 (478-560)||(36330992-36331074)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (470-791)||(36842937-36843260)
chr7 (470-789)||(6967072-6967393)
chr7 (470-791)||(17866353-17866676)
chr7 (470-757)||(9765758-9766046)
chr7 (470-791)||(24783331-24783654)
chr7 (469-791)||(3861906-3862221)
chr7 (634-791)||(17863260-17863417)
chr7 (570-790)||(23313361-23313582)
chr7 (470-791)||(294787-295106)
chr7 (569-766)||(23107935-23108133)
chr7 (526-791)||(46846367-46846635)
chr7 (476-791)||(11279414-11279730)
chr7 (470-790)||(23759609-23759931)
chr7 (540-791)||(36222378-36222631)
chr7 (468-791)||(33312917-33313241)
chr7 (470-611)||(3540924-3541065)
chr7 (469-580)||(17857879-17857991)
chr7 (470-611)||(38431614-38431757)
chr7 (479-613)||(28577687-28577820)
chr7 (477-611)||(6964508-6964644)
chr7 (570-611)||(16547225-16547267)
chr7 (570-611)||(16618395-16618437)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (470-789)||(12575300-12575620)
chr8 (470-734)||(14418445-14418707)
chr8 (635-790)||(13096945-13097099)
chr8 (574-791)||(41778847-41779064)
chr8 (649-764)||(44008245-44008360)
chr8 (470-611)||(39659712-39659856)
chr8 (470-611)||(9467286-9467429)
chr8 (661-725)||(41836415-41836479)
chr8 (470-611)||(453807-453951)
chr8 (493-611)||(13332308-13332429)
chr8 (562-669)||(41836285-41836394)
chr8 (662-701)||(14418396-14418435)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (470-791)||(13979409-13979730)
chr3 (470-791)||(22626312-22626634)
chr3 (470-613)||(46731556-46731699)
chr3 (649-791)||(46731417-46731559)
chr3 (470-791)||(39563510-39563833)
chr3 (470-791)||(11138570-11138892)
chr3 (527-791)||(35366299-35366562)
chr3 (470-664)||(20536333-20536530)
chr3 (470-586)||(19869226-19869343)
chr3 (469-611)||(27055092-27055237)
chr3 (521-767)||(47412129-47412368)
chr3 (470-603)||(25492128-25492263)
chr3 (476-608)||(46542550-46542683)
chr3 (570-669)||(50096825-50096925)
chr3 (470-561)||(26822039-26822130)
chr3 (470-534)||(3306147-3306213)
chr3 (470-534)||(18883509-18883575)
chr3 (470-534)||(30157797-30157863)
chr3 (575-611)||(36036817-36036854)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (470-734)||(11-273)
scaffold0363 (662-701)||(283-322)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (478-791)||(2627-2926)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (653-791)||(5995-6133)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (470-791)||(9785-10109)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (470-791)||(24185-24506)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (649-791)||(7173-7315)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (649-766)||(2641-2758)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (470-611)||(19509-19653)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (470-605)||(33730-33866)
[»] scaffold0766 (1 HSPs)
scaffold0766 (479-608)||(3613-3739)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (470-513)||(10253-10296)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 23673345 - 23673667
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  23673345 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaa 23673444  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673445 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 23673544  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23673545 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaa 23673644  T
Q  769 agtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  23673645 agtaattctacccaatctcttga 23673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 469 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 36327172 - 36326849
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36327172 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatca 36327073  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36327072 aaaaagatgtattaaattcaaagttgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 36326973  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36326972 gagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagattaaca 36326873  T
Q  768 aagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  36326872 aagtaattctacccaatctcttga 36326849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 470 - 766
Target Start/End: Original strand, 32575685 - 32575984
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |     
T  32575685 tgatagatatttggcaagtgaaccaacactattgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcaacgatttcgttataat 32575784  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  32575785 aaatgatgtattaaattcaattgttaccctaggcagttggatt-gtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 32575883  T
Q  668 g--agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32575884 gaaagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaa 32575983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 468 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 16295145 - 16294821
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16295145 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcaaatccacgaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatc 16295046  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaat 663  Q
     ||| |||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||  |||||| |||||||| |||  |||| || ||||| |||||||    
T  16295045 gaaa-ggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgat-tttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaat 16294948  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16294947 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagatt 16294849  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  16294848 aacttagtaattctacccaatctcttga 16294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 13710315 - 13709993
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13710315 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 13710218  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| ||||| |   |  ||||  ||| |||||  |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  13710217 aaaaggatgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttg--agttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattt 13710120  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa-gttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13710119 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagatta 13710020  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||||||| || || |||||||||    
T  13710019 acaaagtaattctacccgatctcttga 13709993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31528311
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 31528537  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  31528536 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 31528439  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 762  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31528438 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 31528340  T
Q  763 taacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  31528339 taacttagtaattctacccaatctcttga 31528311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 540 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31626726 - 31626472
Alignment:
Q  540 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--a 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||| ||| |  |    
T  31626726 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaaaggaattaa 31626628  T
Q  636 aaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 735  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31626627 aaataataaaggattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaat 31626528  T
Q  736 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  31626527 caattattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 31626472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 476 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 40018218 - 40017924
Alignment:
Q  476 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 574  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |   |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||    
T  40018218 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttattaaaaagg 40018120  T
Q  575 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagaga 671  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||| | ||||||    
T  40018119 atgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagaga 40018022  T
Q  672 tgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatct---agtttaacgacagattaac 766  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  40018021 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaac 40017924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 565
Target Start/End: Original strand, 24384925 - 24385022
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttta 565  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24384925 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaataaaattaaattcgtattcacgatgactgttattaatttctacttagcaatttcttta 24385022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 29436113 - 29435969
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  29436113 tgatagataattgacaagtgtatcaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 29436014  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| ||||||  |  |||||| |||||||||||||||    
T  29436013 taaaggatgtagtaaattttatgggttgcactaggcagttggatt 29435969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 38315801 - 38315944
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  38315801 tgataaatatttggtaagtgtatcaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaa-ttctacttagcaagttcgttaaaat 38315899  T
Q  570 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     ||||||||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||    
T  38315900 taaggatgtagtaaattttacggggttgtcctaggcagttggatt 38315944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 608
Target Start/End: Original strand, 32074156 - 32074297
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||| ||||| |   |||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  32074156 tgatagatatttgacaagtataccaaaattatcgaagtaataataataaatttgtatccacgatggttgttgttaatttctacttagaaatttcattaat 32074255  T
Q  568 aaaaaggatgtatt-aaattcaaggttgccctaggcagttgg 608  Q
      |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32074256 gtaaaggatgtattaaaattgtgggttgccctaggcagttgg 32074297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 478 - 791
Target Start/End: Original strand, 19664674 - 19664987
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19664674 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgtttatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggatg 19664773  T
Q  578 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19664774 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttaagaaaattagagagatgtat 19664873  T
Q  677 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |     
T  19664874 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctag-ttcacgacagattaacaaagtaactc 19664972  T
Q  777 tatccaatctcttga 791  Q
    || ||||| ||||||    
T  19664973 tacccaatatcttga 19664987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 478 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15535292 - 15534979
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 577  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15535292 atttcgcatgtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatg 15535193  T
Q  578 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15535192 tattaaattcaaggttgccctaggcagttgagttgat-tttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggttttacaaaattaaagtgatgtat 15535094  T
Q  677 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  15535093 ggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactc 15534994  T
Q  777 tatccaatctcttga 791  Q
    || ||||||||||||    
T  15534993 taaccaatctcttga 15534979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 470 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 32427544 - 32427281
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32427544 tgatagatatttggtaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatctacgaggaccgttgttaa-ttctactcagcaatttctttatcaa 32427446  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32427445 aaaagatgtattaaattcaaggttgccctag-cagttggattggtatttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggttttagaaaattagag 32427347  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 734  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32427346 agatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790541
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14790765  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14790764 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14790667  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790666 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14790567  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14790566 caaagtaattctacccaatctcttga 14790541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14795892 - 14795569
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14795892 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14795793  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14795792 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14795695  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795694 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14795595  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14795594 caaagtaattctacccaatctcttga 14795569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 468 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 1838722 - 1838397
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1838722 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 1838623  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaagg---ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 664  Q
    ||||||||||||| || ||  |     ||  ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||| |||    
T  1838622 aaaaaggatgtataaatttatattgatttttcctagacagttggattggtttttataaagtaaacgtaataaaagaataaaagttggttttaagaatatt 1838523  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1838522 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctat-gtaattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagatta 1838424  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||    
T  1838423 acaaagtaactctacccaatctcttga 1838397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 478 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 15540806 - 15540574
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15540806 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtaaccaatcggaccattgttaacttctactcagcaatttctatatcaaaaaggatg 15540707  T
Q  578 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 676  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  15540706 tattaaattcaaggtttccctaggcagttgagttgat-tttctaaaataaagggattaaaaacaataaaagtttagttttagaaaattaaagagatttat 15540608  T
Q  677 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15540607 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 15540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 469 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 27649347 - 27649077
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||     
T  27649347 atgatagagatttggcaagtgaactaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccacgaggaccgttgttaattcctactcagcaatttctttctcg 27649248  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |  | |||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27649247 aaa-ggatgcattaaatttttggtcgccctaggcagttggattggtttttataacataaacgtagatgaaacaataaaagttggttttaagaaaattaga 27649149  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaat 739  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  27649148 gcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 574 - 791
Target Start/End: Original strand, 20527266 - 20527486
Alignment:
Q  574 gatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacgga--ttaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagag 670  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||  |||||  |  | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||    
T  20527266 gatgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagttggttttaagaatattagagag 20527365  T
Q  671 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 770  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  20527366 aagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaat 20527465  T
Q  771 taattttatccaatctcttga 791  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  20527466 taactttacccaatctcttga 20527486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 570 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16883820 - 16883622
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16883820 aaaggatgtattaaattcaagggttccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 16883721  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  16883720 agaagtatggttaagacattcgaatccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaaca 16883622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 634 - 791
Target Start/End: Original strand, 32704420 - 32704577
Alignment:
Q  634 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 733  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32704420 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 32704519  T
Q  734 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  32704520 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttga 32704577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 13017189 - 13017513
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13017189 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattatta 13017287  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  13017288 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaat 13017385  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 762  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  13017386 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggat 13017484  T
Q  763 taacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  13017485 taacttagtaattctacccaatctcttga 13017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 570 - 791
Target Start/End: Original strand, 12980594 - 12980814
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattc-aaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||||||| |    
T  12980594 aaaggatgtattaaattctaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttct-gaaaattaaa 12980691  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12980692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12980790  T
Q  768 aagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  12980791 aagtaattctacccaatctcttga 12980814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221646
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22221869  T
Q  569 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 664  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22221868 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22221773  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22221772 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22221674  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  22221673 aacttagtaattctacccaatctcttga 22221646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247481
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22247704  T
Q  569 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 664  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22247703 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22247608  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22247607 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22247509  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  22247508 aacttagtaattctacccaatctcttga 22247481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 570 - 791
Target Start/End: Original strand, 12983481 - 12983701
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  12983481 aaaggatgtattaaattcaaatgttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 12983578  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12983579 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtac-ccctattcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12983677  T
Q  768 aagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  12983678 aagtaattctacccaatctcttga 12983701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 619 - 791
Target Start/End: Original strand, 30978360 - 30978535
Alignment:
Q  619 gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggta 715  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30978360 gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggta 30978458  T
Q  716 atttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  30978459 atttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttga 30978535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 674 - 775
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769695
Alignment:
Q  674 tatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  774 tt 775  Q
    ||    
T  7769694 tt 7769695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11195451 - 11195354
Alignment:
Q  6 caactatatgataatttgttcggtgtccttacagatgtatacgagttctgtatatatgttaagattcatgattttcctctttgcaacttgcttaatat 103  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11195451 caactatatgataatttattcaacgtgcttacaaatgtatatgacttctgtatatatgttaagattaatcttttccctctttgcaacttgcttaatat 11195354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 11411127 - 11410983
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  11411127 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgagtaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 11411028  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||| ||||    
T  11411027 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttcgatt 11410983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11155004 - 11154907
Alignment:
Q  6 caactatatgataatttgttcggtgtccttacagatgtatacgagttctgtatatatgttaagattcatgattttcctctttgcaacttgcttaatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| | ||||||| || |||||||||||||| ||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11155004 caactatatgataatttgttcaacgtgcttataaatgtatatgacttctgtatatatgtcaaggttaatcttttccctctttgcaacttgcttaatat 11154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 669
Target Start/End: Original strand, 11183937 - 11184037
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11183937 aaaggatgtattaaattcaagagttccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 11184036  T
Q  669 a 669  Q
    |    
T  11184037 a 11184037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 611
Target Start/End: Original strand, 35026936 - 35027030
Alignment:
Q  518 ttcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35026936 ttcgtatccacaaggaacgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 35027030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 733 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 15540569 - 15540529
Alignment:
Q  733 aatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 773  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15540569 aatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaa 15540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 561
Target Start/End: Original strand, 28974136 - 28974230
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtg-aaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 561  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||| ||||||||  ||||||||  || |||||||||||||    
T  28974136 tgatagatatttggcaagtgtatccaaaactatcgaagtaataataataaatctgtatccacgaggattgttgttaatgtcaacttagcaatttc 28974230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 467 - 611
Target Start/End: Original strand, 33678938 - 33679087
Alignment:
Q  467 gaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa---ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctt 563  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| ||   || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |    
T  33678938 gaatgataaatatttggcaagtgtaccaaaaaaactatcgaagtagtactaaagttcatatccacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttagt 33679037  T
Q  564 tatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctagg-cagttggatt 611  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  33679038 taaaataaaggatgtatgaaatttatgggttgccctaggacagttggatt 33679087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Original strand, 11212919 - 11212961
Alignment:
Q  195 catcgaaaaccacatcaaacgagcattttcaccgattactcat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11212919 catcgaaaaccacatcaaacgtgcattttaaccaattactcat 11212961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Original strand, 11279788 - 11279830
Alignment:
Q  195 catcgaaaaccacatcaaacgagcattttcaccgattactcat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11279788 catcgaaaaccacatcaaacgtgcattttaaccaattactcat 11279830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 478 - 791
Target Start/End: Original strand, 26062698 - 26063016
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggacc--gttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26062698 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaaataataaataaattcgtatccacgaggaccccgttgttaacttctactcaacaatttctttatcaaaaagga 26062797  T
Q  576 tgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag--agat 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26062798 tgtattaaattcaaggttgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagagat 26062897  T
Q  673 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 772  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26062898 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 26062997  T
Q  773 attttatccaatctcttga 791  Q
    | | || ||||||||||||    
T  26062998 actctacccaatctcttga 26063016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541807
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattatta 2542030  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttta-gaaaattag 666  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||  ||||||||     
T  2542029 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 2541930  T
Q  667 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 766  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2541929 agag--gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 2541832  T
Q  767 aaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2541831 aaagtaattttatccaatctcttga 2541807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 647203 - 647526
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  647203 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 647302  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  647303 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 647400  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647401 gagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 647500  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  647501 caaagtaattctacccaatctcttga 647526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 650475 - 650798
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  650475 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctatatca 650574  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  650575 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcataatatta 650672  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650673 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 650772  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  650773 caaagtaattctacccaatctcttga 650798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 666 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 26060635 - 26060510
Alignment:
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  26060635 gagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaa 26060536  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| | || ||||||||||||    
T  26060535 caaagtaactctacccaatctcttga 26060510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171905
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 12172119  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttt-tagaaaatt 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||        
T  12172118 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa---- 12172025  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
            ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12172024 --------gtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 12171933  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  12171932 aacttagtaattctacccaatctcttga 12171905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 15851539 - 15851393
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||      
T  15851539 aatgataaagatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaatagtaaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaa 15851440  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    | |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  15851439 ataaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggctgttggatt 15851393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 661 - 725
Target Start/End: Original strand, 11649426 - 11649490
Alignment:
Q  661 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 725  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11649426 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19929242 - 19929134
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaataaat-tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |    
T  19929242 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa-taaatatcgt-tccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttctttgac 19929145  T
Q  568 aaaaaggatgt 578  Q
    | |||||||||    
T  19929144 ataaaggatgt 19929134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 485 - 551
Target Start/End: Original strand, 21217350 - 21217416
Alignment:
Q  485 aagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctact 551  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21217350 aagtgtactaaaactatcaaagtaataataaaattcgtattcacgaggaccgttattaatttctact 21217416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Original strand, 33400075 - 33400192
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  33400075 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaggtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctgcttagcaagttcgttaaaa 33400174  T
Q  569 aaaaggatgtattaaatt 586  Q
     |||||||||| ||||||    
T  33400175 taaaggatgtaataaatt 33400192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 468 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 2211004 - 2210869
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    |||||||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||      
T  2211004 aatgatagatattcagcaagtgtaaataaactatcaaagtaataataaaattcatatccacgagaaccgttgttgaattctactcaacaatttcgttaat 2210905  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggca 603  Q
      ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  2210904 ttaaaggatatattaaattgggggtggccctaggca 2210869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 669
Target Start/End: Original strand, 11649296 - 11649405
Alignment:
Q  562 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 658  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11649296 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 11649394  T
Q  659 aaaattagaga 669  Q
    |||||| ||||    
T  11649395 aaaatttgaga 11649405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 530 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 13979437 - 13979355
Alignment:
Q  530 aggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||  || |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  13979437 aggaccgttgttaattcctacttagcaagttcgttgacataaaggatgtagtaaatttatgggttaccctaggcagttggatt 13979355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 13496232 - 13495910
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13496232 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaa 13496133  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattag 666  Q
    ||||||||||| || ||  |  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| |||||    
T  13496132 aaaggatgtataaatttatattgattgtcctaggcagttgaattgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattag 13496035  T
Q  667 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 766  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13496034 agagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaag 13495935  T
Q  767 aaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  13495934 aaagtaattatatccaatctcttga 13495910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 39546486 - 39546165
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  39546486 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattattgaagtaataaataagatcgtat-cacgaggaccattgttaacttttactcagcaatttcattatcga 39546388  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaa-attag 666  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  39546387 aa-ggatgtattaaattcaattgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaaacaataaaagtt-ggttttaaaaatattag 39546290  T
Q  667 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 766  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39546289 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaac 39546190  T
Q  767 aaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  39546189 aaagtaactctacccaatctcttga 39546165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13493185
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13493409  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  13493408 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 13493311  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493310 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 13493211  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  13493210 caaagtaattctacccaatctcttga 13493185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 10765165 - 10764842
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10765165 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 10765066  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  10765065 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 10764968  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764967 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 10764868  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  10764867 caaagtaattctacccaatctcttga 10764842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 570 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 34066489 - 34066267
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34066489 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 34066390  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 768  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34066389 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaa 34066290  T
Q  769 agtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  34066289 agtaattctacccaatctcttga 34066267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 32505857 - 32506177
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttg----ttaacttctacttagcaatttcttta 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||    ||||||||||||   |||||||||||    
T  32505857 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccattgcatgttaacttctactcgacaatttcttta 32505956  T
Q  566 tcaaaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaat 663  Q
    ||||||||||||||| || ||  |  | |||   |||||||||        ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||    
T  32505957 tcaaaaaggatgtataaatttatattgatgcgtgaggcagttgt-------tttctaacataaacgaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatat 32506049  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506050 tatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatt 32506149  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  32506150 aacaaagtaattctacccaatctcttga 32506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 478 - 791
Target Start/End: Original strand, 16190187 - 16190501
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 577  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |   |||   | |||  | ||||||||    
T  16190187 atttgacaagtgaatcaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggactgttgttaatttttattcgacaaaaacgttaaaataaaggatg 16190286  T
Q  578 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 676  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16190287 tattaaattcaatggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaa-gattggttttagaaaattaaagagaagtat 16190385  T
Q  677 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat-t 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  16190386 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatat 16190485  T
Q  776 ttatccaatctcttga 791  Q
     || ||||||||||||    
T  16190486 atacccaatctcttga 16190501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 471 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 1936873 - 1936549
Alignment:
Q  471 gatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||| | | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  1936873 gatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaataa-ttcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaa 1936775  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||    |||||  |||||| || |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1936774 taacgatgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggttttagaaaatta 1936675  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  1936674 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaa 1936575  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| | || | ||||||||||    
T  1936574 caaagtaactctaccaaatctcttga 1936549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 545 - 791
Target Start/End: Original strand, 27282183 - 27282430
Alignment:
Q  545 ttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaat 642  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |  | |||||||||    
T  27282183 ttctactcagcaatttctttataaaaaaa-atgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaatgtaaataaaacaat 27282281  T
Q  643 aaaagtttggtttta-gaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 741  Q
     |||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27282282 taaa-attggttttatgaatattagagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatga 27282380  T
Q  742 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27282381 ttatctagttcaacgaccgattaacaaagtaattctacccaatctcttga 27282430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 483 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15297559 - 15297255
Alignment:
Q  483 gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtatta 582  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  15297559 gcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaatgaattcatatccacggggaccgttgttaacttctacaaagcaatttcattatc-aaaatgatgtatta 15297461  T
Q  583 aattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggtta 681  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||  || ||||   || ||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||||  |||| |||    
T  15297460 aattcaaggttgccctaagcagttggattagtttttgt--aacaaactatttgaaaacgataaaaacttggttct-ggaaattaaagagaaatatgatta 15297364  T
Q  682 agaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatcc 781  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15297363 agaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcac-cccaattcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctaccc 15297265  T
Q  782 aatctcttga 791  Q
    ||||||||||    
T  15297264 aatctcttga 15297255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 570 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 21153400 - 21153178
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaacaataaaag-tttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||   |||||||||| |||| |||||||||||||| |||      
T  21153400 aaaggatgtattaaatttatggttgccctaggcagttggattagttttttgtaacattaactatttaaaacaatcaaagctttggttttagaaa-ttaat 21153302  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaaca 21153202  T
Q  768 aagtaattttatccaatctcttga 791  Q
     ||||||| ||  |||||||||||    
T  21153201 cagtaattctactcaatctcttga 21153178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 570 - 791
Target Start/End: Original strand, 22456594 - 22456814
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  22456594 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccataggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 22456691  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  22456692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaaca 22456790  T
Q  768 aagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  22456791 aagtaattctacccaatctcttga 22456814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 570 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 49148042 - 49147825
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||     ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||    
T  49148042 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaataaattattttaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaag 49147944  T
Q  669 agatgta-tggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  49147943 agaaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 49147845  T
Q  768 aagtaattttatccaatctc 787  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  49147844 aagtaattctacccaatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 34552438 - 34552582
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |     
T  34552438 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagtttgttaaaat 34552537  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  34552538 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 34552582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 49716735 - 49716591
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  49716735 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 49716636  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  49716635 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttggatt 49716591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 473 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 49720214 - 49720073
Alignment:
Q  473 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 571  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||    
T  49720214 tagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataa 49720115  T
Q  572 aggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||| |||| ||||||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  49720114 agggtgtagtaaattttatgggttgccctaggtagttggatt 49720073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8435380 - 8435280
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaac-ggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||   || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8435380 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 8435281  T
Q  669 a 669  Q
    |    
T  8435280 a 8435280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 6206245 - 6206101
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||| |||| ||||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  |     
T  6206245 tgataaatatttagcaagtgtactaaaattatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaat 6206146  T
Q  570 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||| ||||||   || |||||||||||| |||| ||||    
T  6206145 aaaggatgtagtaaatttgacagggttgccctaggtagttcgatt 6206101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18392747 - 18392669
Alignment:
Q  480 ttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 557  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392747 ttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 18392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 558
Target Start/End: Original strand, 50196715 - 50196804
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaat 558  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50196715 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaaactattgaagtaataataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaatctcaacttagcaat 50196804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 748 - 791
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453458
Alignment:
Q  748 agtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttga 22453458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 741 - 791
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990411
Alignment:
Q  741 attatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttga 23990411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 469 - 791
Target Start/End: Original strand, 14616428 - 14616751
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14616428 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14616527  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | || ||||||| |||||  |||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| ||||    
T  14616528 aaaaggatgtatgaatttatattgattaccctaggaagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatatta 14616625  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616626 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14616725  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14616726 caaagtaattctacccaatctcttga 14616751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 468 - 789
Target Start/End: Original strand, 7649940 - 7650262
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  7649940 aatgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatc 7650039  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 664  Q
    ||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||   ||| |||| |||    
T  7650040 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgcttttaagaatatt 7650137  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7650138 agagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagatagatta 7650237  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctctt 789  Q
    |||| |||||| ||  |||||||||    
T  7650238 acaaggtaattctactcaatctctt 7650262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 34406094 - 34405771
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  34406094 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 34405995  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  34405994 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 34405897  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405896 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 34405797  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  34405796 caaagtaattctacccaatctcttga 34405771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 459 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 22160003 - 22159667
Alignment:
Q  459 aagatgatgaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 557  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22160003 aagatgaagcatgatagatatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaa 22159905  T
Q  558 tttctttatcaaaaaggatgtat--taaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggt 653  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  ||||||||||||| || | |    
T  22159904 tttctttgtcaaaaaggatgtatattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaaattggtt 22159805  T
Q  654 tttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttta 753  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |    
T  22159804 ttaagaatattagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttca 22159705  T
Q  754 acgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22159704 acgatagattaacaaagtaactctacccaatctcttga 22159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 473 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33575331 - 33575011
Alignment:
Q  473 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 571  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  33575331 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaa 33575233  T
Q  572 aggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaattaga 667  Q
    ||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||| ||    
T  33575232 aggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-ga 33575136  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 766  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33575135 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 33575036  T
Q  767 aaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
      ||||||| || ||||||||||||    
T  33575035 ttagtaattctacccaatctcttga 33575011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532524
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 15532298  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  15532299 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 15532396  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 762  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15532397 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 15532495  T
Q  763 taacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  15532496 taacttagtaattctacccaatctcttga 15532524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 791
Target Start/End: Original strand, 15542384 - 15542706
Alignment:
Q  472 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaa 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15542384 atagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaa 15542482  T
Q  571 aaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaatta 665  Q
    |||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||     
T  15542483 aaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt- 15542579  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15542580 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagatta 15542679  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||    
T  15542680 acttagtaattctacccaatctcttga 15542706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 472 - 726
Target Start/End: Original strand, 11988864 - 11989125
Alignment:
Q  472 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttcta--cttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |    
T  11988864 atagatatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagta 11988962  T
Q  569 aaaaggatgtat--taaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| | | |||||||||||||  |||   ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11988963 ataaggacgtatattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgattttagaaaatta 11989062  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcc--tatggtaatttgcactcc 726  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11989063 gagagaagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcc 11989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 642 - 791
Target Start/End: Original strand, 26712516 - 26712665
Alignment:
Q  642 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 741  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26712516 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26712615  T
Q  742 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26712616 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 26712665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 642 - 791
Target Start/End: Original strand, 26982254 - 26982403
Alignment:
Q  642 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 741  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26982254 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26982353  T
Q  742 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26982354 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 26982403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 470 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 21680721 - 21680585
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  21680721 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 21680622  T
Q  570 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 605  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21680621 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 21680585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 2499762 - 2499905
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaac-tatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  2499762 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagatatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 2499861  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  2499862 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaagcagttggatt 2499905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33921459 - 33921343
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33921459 tgatagatattcggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33921360  T
Q  570 aaaggatgtattaaatt 586  Q
     ||||||||||||||||    
T  33921359 taaggatgtattaaatt 33921343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 477 - 604
Target Start/End: Original strand, 1810197 - 1810326
Alignment:
Q  477 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 575  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||    
T  1810197 tatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtattcacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaagga 1810296  T
Q  576 tgtattaaattca-aggttgccctaggcag 604  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  1810297 tgtagtaaatttatgggttgccctaggcag 1810326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 574
Target Start/End: Original strand, 26711464 - 26711567
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26711464 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26711561  T
Q  569 aaaagg 574  Q
    ||||||    
T  26711562 aaaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 574
Target Start/End: Original strand, 26981201 - 26981304
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26981201 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26981298  T
Q  569 aaaagg 574  Q
    ||||||    
T  26981299 aaaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 478 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 36331074 - 36330992
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaattt 560  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36331074 atttgacaagtgtacctaatctatcgaagtaataataaaatttgcatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaattt 36330992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 36842937 - 36843260
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  36842937 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataagatcgaatccacaaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatcga 36843036  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaagg--ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggtttta-gaaaatta 665  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  36843037 aa-ggatgtattaaattcaatggtttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttatgaatatta 36843134  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 36843234  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||    
T  36843235 caaattaactctacccaatctcttga 36843260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 470 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6967072
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 6967294  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  6967293 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 6967196  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6967195 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaa 6967096  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctctt 789  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  6967095 caaagtaattctacccaatctctt 6967072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17866676
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 17866452  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||   ||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  17866453 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 17866550  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866551 gagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 17866650  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  17866651 caaagtaattctacccaatctcttga 17866676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 470 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 9766046 - 9765758
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  9766046 tgatagatatttggcaagttaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccataagggccgttgttaatttctactcagcattttctttatcga 9765947  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  9765946 aaaggatgtattaaatttctggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacataaataaaataataaaagttggttttaagaatattagag 9765847  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacga 757  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9765846 agaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacga 9765758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 24783654 - 24783331
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttt-atca 568  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  24783654 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttttatca 24783555  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||| || |||||||||  |||   ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  24783554 aaaaggatgtataaatttatattgattgtccaaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacttaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 24783457  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24783456 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaa 24783357  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  24783356 caaagtaattatacccaatctcttga 24783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 469 - 791
Target Start/End: Original strand, 3861906 - 3862221
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |  | ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  3861906 atgatagatatttggcaagtgtactagagtcaatcgaagtaataaataattt-gtatccacgaggattgttattaacttctacttagcaatttcattatt 3862004  T
Q  568 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattg-gcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3862005 aaaa-ggatgtattaaattcaatgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttataaaatta 3862103  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3862104 gagagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaa 3862195  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  3862196 caaagtaattctacccaatctcttga 3862221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 634 - 791
Target Start/End: Original strand, 17863260 - 17863417
Alignment:
Q  634 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 733  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17863260 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 17863359  T
Q  734 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17863360 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttga 17863417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 570 - 790
Target Start/End: Original strand, 23313361 - 23313582
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23313361 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggttttagaaaattagag 23313460  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 768  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||     
T  23313461 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacac 23313560  T
Q  769 agtaattttatccaatctcttg 790  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  23313561 tgtaactctacccaatctcttg 23313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 295106 - 294787
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  295106 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 295008  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    ||||||||||| |||||| |   |  ||||| ||||||| |  |||   ||||||| |||| | | |||||| |||  || | ||||||||||||||||     
T  295007 aaaaggatgtaataaatttatattgatgcccgaggcagtag--ttgt--tttgtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggttttagaaaatt- 294913  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 765  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  294912 gagagaagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaa 294813  T
Q  766 caaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  294812 caaagtaattatacccaatctcttga 294787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 569 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 23108133 - 23107935
Alignment:
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23108133 aaaaggatgtatttaattcaaggatgtcctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 23108034  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 766  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23108033 gagaaatgtggttaagaccttcgaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaac 23107935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 526 - 791
Target Start/End: Original strand, 46846367 - 46846635
Alignment:
Q  526 cacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaa 623  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||  ||      
T  46846367 cacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttga-attcttatt 46846465  T
Q  624 ataaacggattaaaa--caataaaagtttgg-ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 720  Q
    |||||| || |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846466 ataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttg 46846564  T
Q  721 cactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  46846565 cactcctagttcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattctacccaatctcttga 46846635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 11279730 - 11279414
Alignment:
Q  476 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 574  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  |||| || | ||| |||||  |  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11279730 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aatttgtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaagg 11279633  T
Q  575 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaac--aataaaagtttggttttagaaaattagagag 670  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||| ||||||||   ||||||  || | |||||||| ||| |||||    
T  11279632 atgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagatt-gagag 11279535  T
Q  671 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 770  Q
    | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  11279534 aagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 11279435  T
Q  771 taattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  11279434 taattctacccaatctcttga 11279414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 790
Target Start/End: Original strand, 23759609 - 23759931
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || | |    
T  23759609 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aagttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatttt-a 23759706  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  23759707 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 23759804  T
Q  664 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 762  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  23759805 c-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggat 23759903  T
Q  763 taacaaagtaattttatccaatctcttg 790  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  23759904 taacttagtaattctacccaatctcttg 23759931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 540 - 791
Target Start/End: Original strand, 36222378 - 36222631
Alignment:
Q  540 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaa 637  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  36222378 ttaatttctacgtagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttctaacataaactgattaaa 36222476  T
Q  638 a-caataaaagtttggtttt-agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 735  Q
    | |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  36222477 aacaaagaaagattggtttttagaagatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaat 36222575  T
Q  736 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  36222576 caatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaattttacctaatctcttga 36222631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 468 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33313241 - 33312917
Alignment:
Q  468 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 566  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33313241 aatgatagatatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttctacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattat 33313145  T
Q  567 caaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaa 662  Q
     ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  33313144 taaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggttttagaaaa 33313046  T
Q  663 ttagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 762  Q
    |  ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  33313045 tctgagagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaat 33312946  T
Q  763 taacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| ||||    
T  33312945 taacttagtaattctacccaatcttttga 33312917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 3540924 - 3541065
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |     
T  3540924 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaacttctacttagcaagttcgttaaaat 3541023  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  3541024 aaaggatgtattaatttatgggttgccctaagcagttggatt 3541065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 580
Target Start/End: Original strand, 17857879 - 17857991
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17857879 atgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaaatagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 17857978  T
Q  568 aaaaaggatgtat 580  Q
    |||||||||||||    
T  17857979 aaaaaggatgtat 17857991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 38431757 - 38431614
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |    
T  38431757 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccatgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttagttaaaa 38431658  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38431657 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 38431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 479 - 613
Target Start/End: Original strand, 28577687 - 28577820
Alignment:
Q  479 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 578  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| || ||| |||||    
T  28577687 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagcaataatcaaattcatatctacgaggaccgttgttaacttctactcaataatttcattaacataaa-gatgt 28577785  T
Q  579 attaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 613  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28577786 attaaatttatggttgtcctagacagtttgattgg 28577820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 6964644 - 6964508
Alignment:
Q  477 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 575  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||||||    
T  6964644 tatttggtaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaatgaagttcgtatccacgagggccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 6964545  T
Q  576 tgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  6964544 tgtagtaaatttatgggttgccctaggtagttggatt 6964508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 570 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 16547267 - 16547225
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16547267 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16547225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 570 - 611
Target Start/End: Original strand, 16618395 - 16618437
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16618395 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16618437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 470 - 789
Target Start/End: Original strand, 12575300 - 12575620
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |    
T  12575300 tgataaatatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattatta 12575398  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12575399 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 12575498  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12575499 gagaagtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaaca 12575598  T
Q  768 aagtaattttatccaatctctt 789  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  12575599 aagtaattctacctaatctctt 12575620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 470 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 14418707 - 14418445
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14418707 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 14418610  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  14418609 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 14418512  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 734  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14418511 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 635 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13097099 - 13096945
Alignment:
Q  635 aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 734  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  13097099 aaaacaataaaagattagttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctat-gtaatttgcactcctaatttaa 13097001  T
Q  735 tcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttg 790  Q
     |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13097000 gcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttg 13096945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 574 - 791
Target Start/End: Original strand, 41778847 - 41779064
Alignment:
Q  574 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagat 672  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||     
T  41778847 gatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt-agaagattaaagagaa 41778945  T
Q  673 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 772  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||    
T  41778946 gtatggttaagaccttcaaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaata 41779045  T
Q  773 attttatccaatctcttga 791  Q
    | | || ||||||||||||    
T  41779046 actctacccaatctcttga 41779064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 649 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 44008360 - 44008245
Alignment:
Q  649 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 748  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  44008360 ttggttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattattta 44008261  T
Q  749 gtttaacgacagatta 764  Q
    |||| |||| ||||||    
T  44008260 gtttcacgatagatta 44008245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 39659712 - 39659856
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  39659712 tgatagatatttggcaagtgtaccgaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 39659811  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  39659812 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 39659856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 9467429 - 9467286
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  9467429 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttcttcttagcaagttcgttaaaa 9467330  T
Q  569 aaaaggatgtattaaat---tcaaggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     |||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9467329 taaaggatgtagtaaatttatcaa--ttgccctaggcagttggatt 9467286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 661 - 725
Target Start/End: Original strand, 41836415 - 41836479
Alignment:
Q  661 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 725  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41836415 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 453951 - 453807
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  453951 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaaactatggaagtactaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 453852  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     ||||||| || ||||||  |  |||||||| |||||||||||||    
T  453851 taaaggatttagtaaattttatgggttgccccaggcagttggatt 453807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 13332429 - 13332308
Alignment:
Q  493 caaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa--- 589  Q
    |||||||||| ||||| |||  || || |||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||  |       
T  13332429 caaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccatgaggaccgttgttaatttatacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaattttatgg 13332330  T
Q  590 ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13332329 ggttgccctaggcagttggatt 13332308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 669
Target Start/End: Original strand, 41836285 - 41836394
Alignment:
Q  562 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 658  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41836285 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 41836383  T
Q  659 aaaattagaga 669  Q
    |||||| ||||    
T  41836384 aaaatttgaga 41836394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 14418435 - 14418396
Alignment:
Q  662 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 701  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14418435 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 14418396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 13979730 - 13979409
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13979730 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaaatcgaatccacgaggactgctgttaatttctactcagcaatttctttatcga 13979631  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    || |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  13979630 aa-ggatgtattaaatatctggttgcccaaggcagttggattggttttaataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattagag 13979532  T
Q  669 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 768  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||      
T  13979531 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaactt 13979432  T
Q  769 agtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  13979431 agtaactctatccaatcccttga 13979409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 22626312 - 22626634
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22626312 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 22626410  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||||     
T  22626411 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggatttagaaaatt- 22626507  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22626508 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 22626607  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22626608 acttagtaattctatccaatctcttga 22626634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 470 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 46731699 - 46731556
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46731699 tgatagagatttggcaagtgaacaaaaactatcgaagtaatgaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttctttatcaa 46731600  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46731599 aaaggatgtattaaactcaaggttgccctaggcagttggattgg 46731556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 649 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 46731559 - 46731417
Alignment:
Q  649 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 748  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46731559 ttggttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatcta 46731460  T
Q  749 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  46731459 gttcaacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttga 46731417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 39563510 - 39563833
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39563510 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattataa 39563607  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 664  Q
    |||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||  | |  |||| | |||||| |||||||||||||||     
T  39563608 aaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatc 39563706  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  39563707 tgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagatta 39563806  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||    
T  39563807 acttagtaattctacccaatctcttga 39563833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11138892
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 11138668  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 665  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |   |||| || ||||||||     
T  11138669 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattcagaaaatt- 11138765  T
Q  666 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 764  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11138766 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 11138865  T
Q  765 acaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11138866 acttagtaattctatccaatctcttga 11138892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 527 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 35366562 - 35366299
Alignment:
Q  527 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaata 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||    
T  35366562 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcattat-aaaaaggatgtattaaattttaggttgccctaggcagtcgagttggtatttgtaacata 35366464  T
Q  627 aacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcact 724  Q
    ||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||||||||| |||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||||     
T  35366463 aactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaattaatgagaaaaatatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcac- 35366366  T
Q  725 ccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    || ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||||||    
T  35366365 cccaattcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttga 35366299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 470 - 664
Target Start/End: Original strand, 20536333 - 20536530
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaat--tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 566  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20536333 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaaactattgaagtagtaaataaaagatcgtatccacgaggactgtatttaacttctacttagaaatttcattat 20536432  T
Q  567 caaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 664  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20536433 taaaaaggatgtagtaaattcaagggtgccctaggcagttgggttgacttgtgtaacacaaacgtaataaaacaataaaagttggtttatagaaaatt 20536530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19869343 - 19869226
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  19869343 tgatagatatttggcaagtgtactaaaatctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 19869244  T
Q  569 aaaaggatgtattaaatt 586  Q
     |||||||||| ||||||    
T  19869243 taaaggatgtagtaaatt 19869226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 469 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 27055237 - 27055092
Alignment:
Q  469 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  27055237 atgataaatatttggcaagcataccaaaactatcgaagtagtaataaatttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 27055138  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
     ||| |||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  27055137 taaaagatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 27055092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 521 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 47412368 - 47412129
Alignment:
Q  521 gtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgt 620  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| || | |  |||| ||||||    
T  47412368 gtatccacgaggaccgttgttaactt-------gcaatttcattatcaaaa-ggatgtattaaatttcaggttgctctagacaatcgagttggtatttgt 47412277  T
Q  621 aaaataaacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatt 718  Q
    || |||||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||    
T  47412276 aacataaactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaaataatgagaaaaatatgattaagacctttgaatcctctaatgttcttctacggtaatt 47412178  T
Q  719 tgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 767  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  47412177 tgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaaca 47412129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25492263 - 25492128
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  25492263 tgatagataattgacaagtgtaccaaaagctatcaaaatagtaataaagttcgtatccacgaggatcgttgttaatttctacttagcaagttcattaaaa 25492164  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggca 603  Q
     ||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  25492163 taaaagatgtagtaaatttatgggttgccctaggca 25492128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 476 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 46542683 - 46542550
Alignment:
Q  476 atatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaag 573  Q
    |||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||    |||     
T  46542683 atatttggtaagtgcagaaaaattatcaaagtaataaaattaaattcgtatctacgaggactgttattaatttctatttagcaatttcattaatgtaaaa 46542584  T
Q  574 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttgg 608  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  46542583 gatgtattaaatt-ggggttgccctaggcagttgg 46542550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 570 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 50096925 - 50096825
Alignment:
Q  570 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 668  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||   ||||||| |||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  50096925 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaagcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacagtaaaagttggtttttagaaaattagag 50096826  T
Q  669 a 669  Q
    |    
T  50096825 a 50096825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 561
Target Start/End: Original strand, 26822039 - 26822130
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 561  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  26822039 tgatagacttttggaaagtgtaccaaaactatcgaagtaataataaaattcgtatccacaaggaccgctgttaatttttactcaacaatttc 26822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 3306213 - 3306147
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 534  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3306213 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 3306147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 18883575 - 18883509
Alignment:
Q  470 tgatagatatttg-gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 534  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18883575 tgatagatattttagcaagtgtactaaaactatcaaagtagtaaaataagttcgtattcacgaggac 18883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 534
Target Start/End: Original strand, 30157797 - 30157863
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 534  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30157797 tgatagaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 30157863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 611
Target Start/End: Original strand, 36036817 - 36036854
Alignment:
Q  575 atgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36036817 atgtattaaattcaatggttgccctaggcagttggatt 36036854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 470 - 734
Target Start/End: Original strand, 11 - 273
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 108  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 667  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  109 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 206  T
Q  668 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 734  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  207 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 701
Target Start/End: Original strand, 283 - 322
Alignment:
Q  662 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 701  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  283 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 478 - 791
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2926
Alignment:
Q  478 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 577  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2627 atttggcaagtggaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttcgttatc-aaaaggatg 2725  T
Q  578 tattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 676  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||| | || |             |||||| |||||| ||||    
T  2726 tattaaattcaattgttgcccaaggaagttggattggtttttgtaacatgaacggattaaaa-actata-------------aaaatttgagagaagtat 2811  T
Q  677 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 776  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||   |||||||     
T  2812 cgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagtaattc 2911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 653 - 791
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6133
Alignment:
Q  653 ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttt 752  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggtt 6094  T
Q  753 aacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
     |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||    
T  6095 cacgacagattaacacaataactctacccaatctcttga 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 10109 - 9785
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| | | |  |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10109 tgatagaaatttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 10010  T
Q  569 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | | |||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  10009 aaaaggatgtataaatttatattggtcccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaatt 9912  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  9911 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 9813  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  9812 aacttagtaattctacccaatctcttga 9785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 470 - 791
Target Start/End: Original strand, 24185 - 24506
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 568  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  24185 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattatta 24283  T
Q  569 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 664  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  24284 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 24379  T
Q  665 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 763  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  24380 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggatt 24478  T
Q  764 aacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  24479 aacttagtaattctacccaatctcttga 24506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 649 - 791
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7315
Alignment:
Q  649 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 748  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7173 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattattta 7272  T
Q  749 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 791  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  7273 gtttcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttga 7315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 649 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2641
Alignment:
Q  649 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 748  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2758 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattattta 2659  T
Q  749 gtttaacgacagattaac 766  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2658 gtttcacgacagattaac 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 611
Target Start/End: Original strand, 19509 - 19653
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  19509 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactgtcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 19608  T
Q  570 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 611  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  19609 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 19653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 470 - 605
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33866
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33730 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33829  T
Q  570 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 605  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  33830 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 33866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0766 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0766
Description:

Target: scaffold0766; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 479 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3613
Alignment:
Q  479 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 578  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  | ||| |||||    
T  3739 tttggcaagtgtaccaattctatcgaagtaataaa---atttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttaattaagataaatgatgt 3643  T
Q  579 attaaattcaaggttgccctaggcagttgg 608  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3642 attaaattcaggattaccctaagcagttgg 3613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10296 - 10253
Alignment:
Q  470 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa 513  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10296 tgatagatatttagcaagtgtactaaaactatcaaagtaataaa 10253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University