View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5777-Insertion-3 (Length: 414)

Name: NF5777-Insertion-3
Description: NF5777
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5777-Insertion-3
NF5777-Insertion-3
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (7-400)||(6019950-6020343)
chr4 (168-398)||(48583677-48583907)
chr4 (7-167)||(34276569-34276729)
chr4 (7-168)||(9798487-9798648)
chr4 (7-168)||(21366608-21366769)
chr4 (9-168)||(44984785-44984944)
chr4 (7-169)||(23437614-23437776)
chr4 (7-169)||(26091256-26091418)
chr4 (7-169)||(54574938-54575100)
chr4 (7-167)||(237499-237659)
chr4 (7-167)||(42085229-42085389)
chr4 (7-167)||(53461816-53461976)
chr4 (7-166)||(32366661-32366820)
chr4 (7-169)||(6285329-6285491)
chr4 (7-169)||(53854428-53854589)
chr4 (7-167)||(2826682-2826841)
chr4 (7-171)||(18462009-18462173)
chr4 (7-171)||(51363029-51363192)
chr4 (7-169)||(31532133-31532295)
chr4 (7-167)||(39077567-39077727)
chr4 (7-175)||(45797501-45797669)
chr4 (7-150)||(27373098-27373241)
chr4 (7-165)||(397424-397582)
chr4 (9-167)||(19387688-19387846)
chr4 (7-165)||(41702461-41702619)
chr4 (7-169)||(55519849-55520011)
chr4 (7-168)||(29478382-29478543)
chr4 (7-168)||(41560350-41560511)
chr4 (7-167)||(146429-146589)
chr4 (7-167)||(29777257-29777417)
chr4 (7-168)||(41949404-41949567)
chr4 (7-167)||(42765842-42766001)
chr4 (7-167)||(43471695-43471855)
chr4 (7-167)||(47344678-47344838)
chr4 (7-167)||(55056259-55056419)
chr4 (7-167)||(55776067-55776226)
chr4 (7-167)||(55840245-55840404)
chr4 (9-168)||(31972335-31972494)
chr4 (7-168)||(42033197-42033358)
chr4 (7-168)||(54607984-54608145)
chr4 (7-167)||(22618514-22618672)
chr4 (7-167)||(31914220-31914379)
chr4 (7-170)||(407776-407937)
chr4 (7-177)||(56022988-56023158)
chr4 (7-168)||(23609109-23609270)
chr4 (7-168)||(42222313-42222474)
chr4 (7-169)||(49881057-49881223)
chr4 (7-168)||(54086431-54086591)
chr4 (7-167)||(3170648-3170808)
chr4 (7-163)||(50534653-50534809)
chr4 (7-167)||(54425004-54425163)
chr4 (7-167)||(38591690-38591846)
chr4 (7-170)||(48313579-48313740)
chr4 (7-166)||(53834055-53834214)
chr4 (9-167)||(3692210-3692368)
chr4 (9-167)||(47662102-47662260)
chr4 (25-167)||(48657858-48658000)
chr4 (7-165)||(50457812-50457970)
chr4 (7-168)||(35446528-35446688)
chr4 (7-167)||(2243480-2243640)
chr4 (7-167)||(31070074-31070233)
chr4 (7-171)||(41632003-41632166)
chr4 (7-167)||(50234022-50234182)
chr4 (7-171)||(39587777-39587939)
chr4 (41-167)||(36532830-36532956)
chr4 (7-167)||(14017376-14017534)
chr4 (7-167)||(1932785-1932945)
chr4 (7-163)||(50536628-50536784)
chr4 (7-149)||(22468788-22468930)
chr4 (25-167)||(52728307-52728448)
chr4 (7-158)||(33897504-33897655)
chr4 (7-150)||(48259528-48259670)
chr4 (9-167)||(48654838-48655002)
chr4 (70-169)||(35595772-35595871)
chr4 (7-170)||(51951704-51951866)
chr4 (7-167)||(54805614-54805778)
chr4 (9-169)||(9997929-9998078)
chr4 (7-167)||(45633779-45633928)
chr4 (40-168)||(42509351-42509479)
chr4 (9-167)||(43890952-43891099)
chr4 (9-167)||(54715059-54715206)
chr4 (7-168)||(22620615-22620765)
chr4 (7-168)||(15060288-15060438)
chr4 (7-167)||(5117438-5117587)
chr4 (7-167)||(37239090-37239239)
chr4 (7-167)||(52688371-52688520)
chr4 (9-167)||(38547601-38547748)
chr4 (254-398)||(2359940-2360084)
chr4 (7-168)||(34552341-34552491)
chr4 (7-167)||(20351842-20351991)
chr4 (7-167)||(31881314-31881463)
chr4 (68-166)||(35344871-35344968)
chr4 (8-167)||(52461386-52461534)
chr4 (9-167)||(34835201-34835348)
chr4 (7-168)||(49014120-49014270)
chr4 (33-123)||(52396774-52396865)
chr4 (7-167)||(4486581-4486730)
chr4 (7-167)||(46708741-46708890)
chr4 (9-169)||(54216734-54216883)
chr4 (9-163)||(27398607-27398750)
chr4 (94-166)||(33048990-33049062)
chr4 (9-163)||(46720049-46720195)
chr4 (9-167)||(47811930-47812077)
chr4 (7-165)||(54216335-54216482)
chr4 (7-171)||(33289725-33289877)
chr4 (9-171)||(573827-573978)
chr4 (9-167)||(27580143-27580290)
chr4 (7-167)||(27873550-27873697)
chr4 (13-180)||(6371236-6371392)
chr4 (13-168)||(27872607-27872751)
chr4 (9-167)||(14335101-14335248)
chr4 (90-167)||(48259704-48259780)
chr4 (9-92)||(1662323-1662406)
chr4 (260-398)||(7247265-7247393)
chr4 (7-84)||(43231524-43231601)
chr4 (9-77)||(3293102-3293170)
chr4 (62-167)||(42558270-42558367)
chr4 (7-66)||(42557604-42557663)
chr4 (7-77)||(11972208-11972278)
chr4 (205-259)||(14525397-14525451)
chr4 (168-213)||(14525996-14526041)
chr4 (92-169)||(51981477-51981554)
chr4 (7-149)||(33557960-33558091)
chr4 (7-91)||(49057933-49058017)
chr4 (99-167)||(3291805-3291873)
chr4 (115-167)||(1662261-1662313)
chr4 (7-91)||(18206583-18206671)
chr4 (7-36)||(17555617-17555646)
chr4 (254-295)||(40333161-40333202)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (7-169)||(18101493-18101655)
chr6 (7-176)||(5882528-5882697)
chr6 (7-167)||(26377204-26377364)
chr6 (7-163)||(14891383-14891539)
chr6 (7-169)||(22551059-22551221)
chr6 (7-167)||(11988974-11989134)
chr6 (7-167)||(24168113-24168273)
chr6 (7-165)||(2892210-2892368)
chr6 (9-167)||(34527862-34528020)
chr6 (7-168)||(8615262-8615423)
chr6 (7-149)||(7345130-7345272)
chr6 (7-167)||(7393586-7393746)
chr6 (7-167)||(22341788-22341950)
chr6 (7-169)||(959902-960064)
chr6 (7-169)||(28947109-28947271)
chr6 (7-169)||(33452570-33452732)
chr6 (7-167)||(2593852-2594012)
chr6 (7-167)||(19415533-19415693)
chr6 (7-158)||(16703388-16703539)
chr6 (7-169)||(24224068-24224230)
chr6 (7-167)||(10507908-10508068)
chr6 (7-169)||(599914-600076)
chr6 (7-167)||(1970733-1970893)
chr6 (7-167)||(5294801-5294961)
chr6 (7-167)||(5299353-5299513)
chr6 (7-166)||(19281056-19281215)
chr6 (7-167)||(30743448-30743608)
chr6 (17-167)||(23261929-23262079)
chr6 (7-112)||(30467658-30467763)
chr6 (7-168)||(28948844-28948994)
chr6 (7-167)||(15965455-15965604)
chr6 (9-167)||(7167606-7167753)
chr6 (7-160)||(13329403-13329545)
chr6 (7-167)||(4487549-4487698)
chr6 (9-167)||(1398577-1398724)
chr6 (7-168)||(3786771-3786921)
chr6 (7-167)||(3291030-3291179)
chr6 (92-168)||(18661830-18661906)
chr6 (7-66)||(929681-929740)
chr6 (92-167)||(24913096-24913171)
chr6 (108-167)||(34262342-34262401)
chr6 (7-81)||(1939579-1939653)
chr6 (9-83)||(375797-375871)
chr6 (108-153)||(375741-375786)
chr6 (9-92)||(13844860-13844943)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (7-170)||(3611158-3611321)
chr1 (7-169)||(45538175-45538337)
chr1 (7-167)||(31308023-31308183)
chr1 (7-168)||(25058710-25058871)
chr1 (7-167)||(44661992-44662152)
chr1 (10-169)||(21139410-21139569)
chr1 (7-170)||(25678256-25678419)
chr1 (7-169)||(26085396-26085558)
chr1 (9-161)||(4068689-4068841)
chr1 (7-167)||(17994951-17995111)
chr1 (7-165)||(43251733-43251891)
chr1 (7-167)||(5981192-5981352)
chr1 (7-163)||(26794326-26794482)
chr1 (7-170)||(26277199-26277362)
chr1 (7-173)||(23984777-23984943)
chr1 (7-168)||(24245024-24245185)
chr1 (7-167)||(6327548-6327707)
chr1 (7-167)||(23932509-23932669)
chr1 (7-167)||(31040731-31040891)
chr1 (7-167)||(37620192-37620352)
chr1 (7-167)||(38790197-38790357)
chr1 (7-167)||(39646590-39646750)
chr1 (7-168)||(47671608-47671769)
chr1 (7-167)||(33112818-33112977)
chr1 (7-167)||(33884110-33884270)
chr1 (7-167)||(33959982-33960142)
chr1 (7-178)||(36566352-36566523)
chr1 (7-169)||(35273618-35273780)
chr1 (9-167)||(41999839-41999997)
chr1 (7-169)||(47317337-47317499)
chr1 (7-168)||(47383731-47383892)
chr1 (7-167)||(50774239-50774399)
chr1 (7-168)||(46967040-46967201)
chr1 (7-168)||(49398987-49399148)
chr1 (7-168)||(51057093-51057254)
chr1 (7-167)||(5980090-5980250)
chr1 (7-167)||(24885523-24885683)
chr1 (7-167)||(26524889-26525049)
chr1 (7-167)||(38331859-38332019)
chr1 (7-167)||(49253975-49254135)
chr1 (7-169)||(23220933-23221089)
chr1 (7-149)||(42863887-42864029)
chr1 (7-167)||(35692663-35692824)
chr1 (7-167)||(46616571-46616731)
chr1 (8-168)||(46784446-46784606)
chr1 (7-166)||(3285424-3285582)
chr1 (8-139)||(31844399-31844530)
chr1 (7-164)||(28888603-28888760)
chr1 (20-168)||(2450529-2450677)
chr1 (17-167)||(47187137-47187287)
chr1 (7-167)||(36003152-36003315)
chr1 (18-167)||(42313361-42313510)
chr1 (26-170)||(51045593-51045737)
chr1 (7-167)||(48373526-48373677)
chr1 (9-123)||(25518838-25518952)
chr1 (7-168)||(27983602-27983747)
chr1 (9-167)||(33073235-33073382)
chr1 (39-167)||(4808699-4808827)
chr1 (7-169)||(41467630-41467781)
chr1 (7-167)||(2657325-2657474)
chr1 (22-144)||(45475866-45475987)
chr1 (7-150)||(51403034-51403167)
chr1 (74-168)||(13312530-13312624)
chr1 (9-167)||(10928091-10928238)
chr1 (7-166)||(6626025-6626173)
chr1 (35-172)||(47772167-47772304)
chr1 (7-104)||(31979998-31980095)
chr1 (7-143)||(2556879-2557006)
chr1 (9-167)||(2954879-2955026)
chr1 (7-161)||(26472185-26472328)
chr1 (7-167)||(29770692-29770841)
chr1 (63-167)||(4156472-4156576)
chr1 (9-167)||(26685880-26686027)
chr1 (9-167)||(38716247-38716394)
chr1 (9-169)||(1388497-1388646)
chr1 (7-167)||(4953074-4953223)
chr1 (9-169)||(30289908-30290057)
chr1 (7-167)||(42234862-42235010)
chr1 (9-167)||(4243490-4243637)
chr1 (7-168)||(41895163-41895313)
chr1 (7-169)||(33187362-33187507)
chr1 (7-161)||(34752320-34752463)
chr1 (9-167)||(48683330-48683477)
chr1 (9-169)||(10920224-10920373)
chr1 (9-167)||(5961267-5961414)
chr1 (7-141)||(13281588-13281711)
chr1 (7-81)||(13313249-13313323)
chr1 (9-151)||(27924674-27924805)
chr1 (7-161)||(44544052-44544195)
chr1 (9-168)||(52323962-52324111)
chr1 (9-150)||(51155606-51155736)
chr1 (7-77)||(32448670-32448740)
chr1 (7-167)||(44293455-44293604)
chr1 (9-168)||(39475782-39475929)
chr1 (92-171)||(38718163-38718242)
chr1 (9-168)||(7561527-7561689)
chr1 (13-92)||(52367911-52367990)
chr1 (9-77)||(46428332-46428400)
chr1 (9-76)||(24649802-24649869)
chr1 (7-150)||(35991616-35991748)
chr1 (7-84)||(39637922-39637996)
chr1 (108-167)||(31286504-31286563)
chr1 (114-164)||(32448757-32448807)
chr1 (7-44)||(4156188-4156225)
chr1 (98-144)||(24215865-24215911)
chr1 (60-141)||(9779919-9779999)
chr1 (130-167)||(31844818-31844855)
chr1 (106-157)||(39359502-39359553)
chr1 (9-37)||(10919313-10919341)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (7-169)||(24253404-24253566)
chr5 (7-169)||(18479666-18479828)
chr5 (7-167)||(5184994-5185154)
chr5 (7-167)||(35626060-35626220)
chr5 (7-167)||(43326379-43326539)
chr5 (7-166)||(15398483-15398642)
chr5 (7-165)||(6901821-6901979)
chr5 (7-167)||(27938919-27939080)
chr5 (7-171)||(2484288-2484452)
chr5 (7-167)||(7722071-7722231)
chr5 (7-167)||(39932601-39932761)
chr5 (7-169)||(40886026-40886187)
chr5 (7-167)||(3466681-3466841)
chr5 (7-167)||(12648819-12648979)
chr5 (7-167)||(43262183-43262343)
chr5 (9-168)||(31938921-31939080)
chr5 (7-169)||(27501053-27501215)
chr5 (22-167)||(29789295-29789440)
chr5 (7-167)||(739704-739864)
chr5 (7-166)||(27278474-27278637)
chr5 (7-167)||(15683813-15683973)
chr5 (7-167)||(25831543-25831702)
chr5 (7-170)||(40278855-40279018)
chr5 (7-169)||(13504740-13504902)
chr5 (27-169)||(34451292-34451434)
chr5 (7-165)||(40110256-40110413)
chr5 (7-167)||(890928-891087)
chr5 (13-167)||(28424795-28424947)
chr5 (7-167)||(5137737-5137897)
chr5 (7-167)||(38756487-38756648)
chr5 (7-167)||(763745-763905)
chr5 (7-148)||(4149716-4149847)
chr5 (9-167)||(33617609-33617756)
chr5 (7-167)||(5497295-5497444)
chr5 (9-168)||(19295754-19295902)
chr5 (7-168)||(27503401-27503551)
chr5 (7-167)||(23195248-23195397)
chr5 (7-169)||(31293987-31294149)
chr5 (7-167)||(38015514-38015663)
chr5 (7-166)||(9424593-9424741)
chr5 (7-158)||(42658671-42658811)
chr5 (12-168)||(3656567-3656712)
chr5 (7-167)||(6973085-6973234)
chr5 (7-167)||(13957692-13957841)
chr5 (9-167)||(9374502-9374649)
chr5 (9-129)||(40632523-40632634)
chr5 (7-168)||(14972000-14972150)
chr5 (168-239)||(41312981-41313052)
chr5 (7-144)||(6206906-6207032)
chr5 (7-167)||(36365445-36365594)
chr5 (9-167)||(2585486-2585633)
chr5 (9-167)||(27390621-27390768)
chr5 (8-153)||(5120048-5120181)
chr5 (9-169)||(18327171-18327320)
chr5 (9-169)||(24167782-24167931)
chr5 (7-96)||(12558090-12558178)
chr5 (11-165)||(36948492-36948633)
chr5 (19-169)||(38492647-38492785)
chr5 (9-167)||(38637910-38638057)
chr5 (9-166)||(33623940-33624086)
chr5 (11-167)||(612757-612900)
chr5 (9-167)||(1402505-1402652)
chr5 (9-92)||(36472348-36472431)
chr5 (7-73)||(42247865-42247931)
chr5 (9-167)||(40686923-40687069)
chr5 (9-76)||(3940411-3940478)
chr5 (7-66)||(9171115-9171174)
chr5 (7-50)||(9527126-9527169)
chr5 (114-167)||(42247791-42247844)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (7-168)||(25893916-25894077)
chr7 (7-167)||(35355911-35356071)
chr7 (7-169)||(22979645-22979807)
chr7 (7-167)||(36389379-36389539)
chr7 (7-166)||(33423276-33423435)
chr7 (7-169)||(27018139-27018301)
chr7 (9-167)||(45690097-45690255)
chr7 (7-167)||(17855451-17855611)
chr7 (7-167)||(33839715-33839875)
chr7 (7-167)||(35328069-35328229)
chr7 (7-167)||(47066977-47067137)
chr7 (7-170)||(33695818-33695981)
chr7 (7-169)||(23393049-23393211)
chr7 (7-167)||(49171362-49171522)
chr7 (7-170)||(33411283-33411446)
chr7 (7-167)||(46913132-46913294)
chr7 (7-170)||(47740328-47740491)
chr7 (7-167)||(2341661-2341822)
chr7 (7-168)||(20165813-20165974)
chr7 (7-167)||(5183825-5183985)
chr7 (7-167)||(31625727-31625886)
chr7 (7-168)||(10028511-10028674)
chr7 (7-167)||(37846016-37846176)
chr7 (7-167)||(40670586-40670746)
chr7 (7-169)||(43499508-43499670)
chr7 (7-169)||(48609675-48609837)
chr7 (7-167)||(31586871-31587031)
chr7 (7-167)||(45482681-45482841)
chr7 (7-158)||(15877573-15877724)
chr7 (9-167)||(29446863-29447020)
chr7 (7-167)||(26579717-26579877)
chr7 (7-167)||(33332812-33332971)
chr7 (7-169)||(5712191-5712353)
chr7 (7-167)||(35757020-35757180)
chr7 (7-153)||(41990872-41991018)
chr7 (7-168)||(19563470-19563631)
chr7 (7-166)||(33870268-33870424)
chr7 (29-167)||(35767519-35767657)
chr7 (7-168)||(45063356-45063515)
chr7 (7-169)||(31429473-31429635)
chr7 (7-167)||(10618321-10618474)
chr7 (30-168)||(28233935-28234073)
chr7 (36-167)||(30076527-30076658)
chr7 (7-133)||(33720070-33720196)
chr7 (52-167)||(41904273-41904388)
chr7 (7-167)||(35752034-35752183)
chr7 (54-167)||(44405418-44405531)
chr7 (9-168)||(43489243-43489391)
chr7 (7-143)||(44564361-44564497)
chr7 (9-167)||(46898016-46898163)
chr7 (7-167)||(37127960-37128109)
chr7 (7-169)||(36816843-36816994)
chr7 (7-167)||(24923024-24923173)
chr7 (7-167)||(46817421-46817570)
chr7 (7-169)||(26371072-26371223)
chr7 (13-166)||(33393357-33393499)
chr7 (7-167)||(7876328-7876477)
chr7 (7-167)||(48085881-48086030)
chr7 (7-158)||(26941541-26941681)
chr7 (9-167)||(44003370-44003517)
chr7 (9-169)||(2332044-2332193)
chr7 (9-165)||(15643948-15644093)
chr7 (7-167)||(24228564-24228713)
chr7 (7-166)||(45502817-45502965)
chr7 (9-170)||(47460769-47460919)
chr7 (9-168)||(7257406-7257554)
chr7 (12-167)||(21718145-21718288)
chr7 (7-168)||(498187-498337)
chr7 (9-166)||(46103146-46103291)
chr7 (7-167)||(29610658-29610807)
chr7 (7-169)||(29098774-29098921)
chr7 (7-165)||(39453484-39453624)
chr7 (7-159)||(25037516-25037657)
chr7 (7-85)||(29863038-29863116)
chr7 (7-133)||(32556640-32556755)
chr7 (9-92)||(16482847-16482930)
chr7 (260-398)||(43681994-43682122)
chr7 (7-167)||(47906758-47906908)
chr7 (7-167)||(45237533-45237682)
chr7 (24-167)||(37443602-37443734)
chr7 (9-163)||(41855084-41855228)
chr7 (7-77)||(39323639-39323709)
chr7 (7-77)||(39866688-39866758)
chr7 (7-167)||(44659867-44660015)
chr7 (7-165)||(35484659-35484807)
chr7 (7-77)||(33455119-33455189)
chr7 (9-50)||(35557755-35557796)
chr7 (99-167)||(39323712-39323779)
chr7 (288-398)||(12308166-12308266)
chr7 (13-96)||(38448508-38448591)
chr7 (7-49)||(30077043-30077085)
chr7 (7-47)||(35823313-35823353)
chr7 (32-93)||(26456157-26456218)
chr7 (9-85)||(7720574-7720650)
chr7 (180-224)||(13066759-13066802)
chr7 (109-153)||(39866762-39866806)
chr7 (102-168)||(42272180-42272245)
chr7 (255-295)||(13066665-13066705)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (7-167)||(32984077-32984237)
chr8 (7-177)||(37301316-37301485)
chr8 (7-168)||(24079900-24080061)
chr8 (7-165)||(32114271-32114429)
chr8 (13-169)||(10646151-10646307)
chr8 (7-167)||(41862242-41862402)
chr8 (7-169)||(41653917-41654079)
chr8 (7-167)||(9303574-9303734)
chr8 (7-167)||(33730641-33730801)
chr8 (7-167)||(33981663-33981823)
chr8 (7-167)||(40435153-40435313)
chr8 (7-167)||(43328729-43328889)
chr8 (7-167)||(5946069-5946229)
chr8 (7-167)||(6366008-6366168)
chr8 (7-163)||(31830959-31831115)
chr8 (7-167)||(37956443-37956603)
chr8 (7-167)||(45236565-45236725)
chr8 (7-167)||(9734277-9734435)
chr8 (7-167)||(13356120-13356280)
chr8 (7-167)||(17718722-17718882)
chr8 (7-167)||(25185921-25186081)
chr8 (7-150)||(2714571-2714714)
chr8 (7-170)||(37419962-37420125)
chr8 (7-167)||(35628799-35628959)
chr8 (7-167)||(41231968-41232128)
chr8 (7-167)||(2275935-2276094)
chr8 (7-167)||(9013706-9013865)
chr8 (7-167)||(13760646-13760808)
chr8 (7-144)||(29048426-29048563)
chr8 (7-166)||(22878413-22878572)
chr8 (41-167)||(12032986-12033112)
chr8 (18-150)||(44088460-44088592)
chr8 (7-150)||(45258532-45258675)
chr8 (52-169)||(41981535-41981652)
chr8 (18-167)||(45066592-45066741)
chr8 (34-168)||(3904126-3904259)
chr8 (7-166)||(41639936-41640095)
chr8 (7-167)||(25248061-25248215)
chr8 (9-167)||(4447295-4447442)
chr8 (9-153)||(42701303-42701448)
chr8 (54-167)||(31336163-31336276)
chr8 (9-167)||(10378333-10378480)
chr8 (9-167)||(3211229-3211376)
chr8 (7-169)||(31940337-31940487)
chr8 (7-168)||(117328-117478)
chr8 (9-169)||(41843277-41843426)
chr8 (7-168)||(2379162-2379312)
chr8 (7-92)||(39915887-39915972)
chr8 (7-169)||(40458770-40458921)
chr8 (7-87)||(41981455-41981535)
chr8 (7-178)||(9713711-9713868)
chr8 (7-171)||(4975403-4975556)
chr8 (9-161)||(32373733-32373873)
chr8 (9-167)||(26196317-26196463)
chr8 (7-161)||(40649837-40649980)
chr8 (9-167)||(33896843-33896990)
chr8 (7-167)||(9509400-9509549)
chr8 (9-167)||(3490399-3490546)
chr8 (7-168)||(33622466-33622614)
chr8 (7-77)||(27243218-27243288)
chr8 (7-77)||(27254793-27254863)
chr8 (260-324)||(36105764-36105828)
chr8 (9-150)||(38631676-38631806)
chr8 (9-94)||(31148953-31149037)
chr8 (102-169)||(39901674-39901741)
chr8 (8-76)||(164745-164812)
chr8 (92-168)||(41425428-41425503)
chr8 (168-206)||(36104476-36104514)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (7-167)||(6594458-6594618)
chr2 (7-168)||(746487-746648)
chr2 (7-168)||(23901800-23901961)
chr2 (7-167)||(10244582-10244742)
chr2 (7-167)||(38997122-38997282)
chr2 (9-167)||(17600859-17601017)
chr2 (7-169)||(45371011-45371173)
chr2 (7-167)||(4034613-4034773)
chr2 (7-167)||(14660467-14660627)
chr2 (7-167)||(34518388-34518548)
chr2 (7-167)||(40635239-40635399)
chr2 (7-161)||(6430494-6430648)
chr2 (7-169)||(13815216-13815378)
chr2 (7-168)||(26710366-26710527)
chr2 (7-167)||(2324889-2325049)
chr2 (7-167)||(11184993-11185153)
chr2 (7-167)||(27651034-27651194)
chr2 (7-170)||(27400424-27400587)
chr2 (7-164)||(10424616-10424773)
chr2 (7-171)||(2914134-2914298)
chr2 (7-167)||(1091951-1092111)
chr2 (7-167)||(32856436-32856596)
chr2 (7-169)||(14697535-14697697)
chr2 (7-169)||(32327382-32327544)
chr2 (7-168)||(4609647-4609808)
chr2 (7-168)||(5726150-5726311)
chr2 (7-167)||(7892688-7892848)
chr2 (7-169)||(32948467-32948628)
chr2 (9-167)||(33427647-33427805)
chr2 (7-167)||(27024436-27024596)
chr2 (7-168)||(37620866-37621030)
chr2 (19-167)||(37255337-37255485)
chr2 (16-167)||(11159651-11159802)
chr2 (22-167)||(9444726-9444874)
chr2 (7-169)||(40735485-40735647)
chr2 (7-167)||(40037164-40037323)
chr2 (7-141)||(32608401-32608535)
chr2 (37-164)||(25294886-25295013)
chr2 (7-141)||(8432942-8433076)
chr2 (7-161)||(15925101-15925255)
chr2 (7-140)||(12842124-12842257)
chr2 (9-166)||(39103070-39103216)
chr2 (34-152)||(1229675-1229793)
chr2 (7-110)||(42899936-42900039)
chr2 (7-133)||(41172479-41172605)
chr2 (60-169)||(447631-447740)
chr2 (9-167)||(21734900-21735047)
chr2 (7-168)||(35158049-35158199)
chr2 (7-168)||(29687062-29687212)
chr2 (7-165)||(145303-145450)
chr2 (7-168)||(19428425-19428575)
chr2 (7-168)||(28641291-28641441)
chr2 (7-167)||(13543624-13543773)
chr2 (7-167)||(27764863-27765011)
chr2 (7-169)||(4258511-4258661)
chr2 (9-167)||(44481851-44481998)
chr2 (7-168)||(12333496-12333644)
chr2 (7-167)||(27331319-27331472)
chr2 (7-167)||(39301197-39301346)
chr2 (9-169)||(43898969-43899117)
chr2 (260-398)||(42444014-42444152)
chr2 (57-129)||(28014856-28014928)
chr2 (68-147)||(12827145-12827223)
chr2 (7-167)||(34249286-34249435)
chr2 (17-167)||(3711664-3711803)
chr2 (7-167)||(12730082-12730231)
chr2 (7-162)||(28566703-28566847)
chr2 (12-162)||(35126806-35126945)
chr2 (7-167)||(2688729-2688878)
chr2 (7-65)||(12814635-12814693)
chr2 (7-168)||(43356120-43356267)
chr2 (7-167)||(2000339-2000486)
chr2 (7-77)||(3266317-3266387)
chr2 (7-77)||(40544155-40544225)
chr2 (7-82)||(30545842-30545917)
chr2 (7-150)||(8056647-8056779)
chr2 (7-92)||(38985342-38985426)
chr2 (280-328)||(10589562-10589610)
chr2 (114-165)||(3266404-3266455)
chr2 (101-167)||(42900772-42900835)
chr2 (64-117)||(17799296-17799349)
chr2 (114-168)||(40544084-40544138)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (7-168)||(11132-11293)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (7-167)||(47257815-47257975)
chr3 (7-169)||(28048390-28048552)
chr3 (9-167)||(38416724-38416882)
chr3 (7-176)||(47809587-47809757)
chr3 (7-167)||(7855114-7855274)
chr3 (7-167)||(40130959-40131119)
chr3 (7-167)||(49330059-49330219)
chr3 (7-170)||(24100305-24100467)
chr3 (7-166)||(51170034-51170193)
chr3 (7-169)||(22399119-22399280)
chr3 (7-169)||(40643822-40643984)
chr3 (7-168)||(41464374-41464535)
chr3 (7-167)||(39634572-39634731)
chr3 (7-167)||(43612047-43612207)
chr3 (7-165)||(48609745-48609903)
chr3 (9-167)||(48739233-48739391)
chr3 (7-168)||(52628976-52629136)
chr3 (7-167)||(29625827-29625987)
chr3 (7-167)||(32234398-32234557)
chr3 (7-167)||(40419857-40420017)
chr3 (7-167)||(42291864-42292024)
chr3 (8-167)||(46126010-46126168)
chr3 (7-166)||(55453245-55453404)
chr3 (7-167)||(2666022-2666182)
chr3 (7-167)||(27066978-27067138)
chr3 (7-167)||(35748311-35748471)
chr3 (13-168)||(44222857-44223012)
chr3 (7-168)||(37313421-37313582)
chr3 (7-167)||(37324563-37324723)
chr3 (7-167)||(40804510-40804670)
chr3 (9-169)||(46134380-46134540)
chr3 (7-167)||(51102378-51102538)
chr3 (7-167)||(7755307-7755466)
chr3 (7-167)||(20754393-20754553)
chr3 (7-163)||(35594143-35594299)
chr3 (7-166)||(43021736-43021896)
chr3 (7-167)||(43125853-43126012)
chr3 (7-167)||(44806706-44806866)
chr3 (7-167)||(51452751-51452910)
chr3 (7-165)||(43183934-43184092)
chr3 (7-165)||(47894822-47894980)
chr3 (7-173)||(52638864-52639030)
chr3 (7-152)||(36368961-36369105)
chr3 (7-152)||(52215098-52215243)
chr3 (7-167)||(39053416-39053576)
chr3 (7-167)||(41293319-41293478)
chr3 (7-167)||(53943588-53943747)
chr3 (9-168)||(41732552-41732711)
chr3 (7-165)||(53832486-53832644)
chr3 (7-167)||(18946925-18947085)
chr3 (7-142)||(24376595-24376730)
chr3 (7-170)||(51146212-51146375)
chr3 (10-167)||(41216480-41216637)
chr3 (7-167)||(5560025-5560192)
chr3 (10-155)||(46949399-46949543)
chr3 (7-134)||(53637863-53637990)
chr3 (7-165)||(54159000-54159148)
chr3 (7-165)||(48546842-48546989)
chr3 (45-167)||(52864550-52864671)
chr3 (7-178)||(55000167-55000327)
chr3 (52-167)||(33550467-33550582)
chr3 (7-167)||(25641668-25641817)
chr3 (7-167)||(42589852-42590001)
chr3 (7-169)||(34279719-34279870)
chr3 (7-167)||(38156632-38156781)
chr3 (7-167)||(51415991-51416140)
chr3 (7-167)||(54401209-54401358)
chr3 (7-167)||(54707220-54707369)
chr3 (9-169)||(55380009-55380158)
chr3 (9-164)||(49130602-49130746)
chr3 (7-131)||(37758951-37759075)
chr3 (9-165)||(45058907-45059052)
chr3 (9-169)||(47510938-47511087)
chr3 (9-172)||(53115471-53115623)
chr3 (13-167)||(24688142-24688285)
chr3 (9-167)||(25353578-25353725)
chr3 (7-167)||(39141125-39141275)
chr3 (7-168)||(37028745-37028895)
chr3 (7-167)||(31286793-31286942)
chr3 (7-167)||(41635800-41635949)
chr3 (9-166)||(51143841-51143987)
chr3 (9-167)||(30251501-30251648)
chr3 (34-112)||(47182049-47182127)
chr3 (7-167)||(51224038-51224186)
chr3 (7-142)||(17665549-17665673)
chr3 (7-162)||(40022096-40022240)
chr3 (9-166)||(42998790-42998936)
chr3 (9-168)||(50731913-50732061)
chr3 (9-168)||(50780795-50780943)
chr3 (13-169)||(52756065-52756214)
chr3 (16-169)||(40165682-40165824)
chr3 (9-84)||(41882063-41882138)
chr3 (92-167)||(48534007-48534082)
chr3 (7-167)||(44945935-44946078)
chr3 (7-96)||(47402810-47402898)
chr3 (7-84)||(48726070-48726147)
chr3 (9-167)||(21597148-21597295)
chr3 (16-96)||(41609098-41609178)
chr3 (9-167)||(43176738-43176885)
chr3 (9-96)||(2227995-2228082)
chr3 (80-167)||(30429227-30429314)
chr3 (14-84)||(28576184-28576254)
chr3 (18-96)||(8847718-8847796)
chr3 (9-167)||(177185-177332)
chr3 (108-166)||(48752226-48752284)
chr3 (115-167)||(40688431-40688483)
chr3 (9-61)||(48752109-48752161)
chr3 (7-37)||(37741457-37741487)
chr3 (125-167)||(41882011-41882053)
chr3 (9-61)||(52434163-52434216)
chr3 (108-161)||(52434291-52434344)
chr3 (126-166)||(37760346-37760386)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (7-167)||(39556-39716)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (7-167)||(13762-13922)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (9-168)||(1893-2052)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (7-167)||(176676-176836)
scaffold0007 (7-167)||(278028-278190)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (7-167)||(75244-75404)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-168)||(2431-2592)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (7-167)||(18854-19014)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-139)||(32583-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (27-168)||(4595-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (39-167)||(3133-3261)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (9-168)||(14768-14916)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (7-168)||(7112-7263)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (9-167)||(20477-20624)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (9-168)||(4553-4702)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (9-168)||(3416-3565)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (9-168)||(126-273)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (260-324)||(3881-3945)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (9-133)||(17930-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (7-91)||(19239-19327)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 400
Target Start/End: Original strand, 6019950 - 6020343
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6019950 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 6020049  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020050 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacaatttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagta 6020149  T
Q  207 tattaaaaaacaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020150 tattaaaaaacaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacac 6020249  T
Q  307 atatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcataggaaatatacagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaattgg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020250 atatatagaccaccgaatgagatttttttatgttttctcataggaaatatacagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaattgg 6020343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 168 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 48583907 - 48583677
Alignment:
Q  168 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaaaaacaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatattatatatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  48583907 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaaaaacaatgttaagcaataactgatatacataacccacttccaatattatgaatt 48583808  T
Q  268 aaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcataggaaatatacagcacaagc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||| |||       ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  48583807 aaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacgcgtgtttagaccaccaaataagatgtttttatgatttctcatagaaaatatacagcacaagc 48583708  T
Q  368 aaaatttgtcattttctattgaatctaaatt 398  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  48583707 aaaatttatcattttatattgaatccaaatt 48583677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 34276569 - 34276729
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276569 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 34276668  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34276669 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 9798487 - 9798648
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798487 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 9798586  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798587 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9798648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21366769 - 21366608
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366769 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 21366670  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366669 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21366608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 44984785 - 44984944
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984785 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 44984884  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44984885 atgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44984944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 23437614 - 23437776
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23437614 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 23437713  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23437714 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23437776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26091418 - 26091256
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26091418 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 26091319  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26091318 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26091256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 54575100 - 54574938
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54575100 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 54575001  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54575000 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 54574938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 237499 - 237659
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  237499 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggc 237598  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  237599 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 42085229 - 42085389
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42085229 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 42085328  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42085329 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53461976 - 53461816
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53461976 agaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 53461877  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53461876 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32366820 - 32366661
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366820 agaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 32366721  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32366720 taatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 6285329 - 6285491
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6285329 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 6285428  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6285429 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtccccat 6285491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53854589 - 53854428
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854589 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 53854490  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  53854489 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccat 53854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2826841 - 2826682
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2826841 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 2826742  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2826741 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18462173 - 18462009
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18462173 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 18462074  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18462073 taatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccattt 18462009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 51363029 - 51363192
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363029 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 51363128  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51363129 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccattt 51363192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31532295 - 31532133
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532295 agaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 31532196  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31532195 taatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 31532133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 39077567 - 39077727
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39077567 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 39077666  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39077667 taatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 45797501 - 45797669
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45797501 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggc 45797600  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttt 175  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  45797601 taatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttttcttt 45797669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 27373098 - 27373241
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373098 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 27373197  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373198 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 397424 - 397582
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  397424 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgac 397523  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  397524 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19387846 - 19387688
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19387846 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtta 19387747  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19387746 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41702619 - 41702461
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702619 agaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41702520  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41702519 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 55519849 - 55520011
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519849 agaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 55519948  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55519949 taatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 55520011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 29478382 - 29478543
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29478382 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggc 29478481  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29478482 taatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 29478543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 41560350 - 41560511
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560350 agaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41560449  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41560450 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacca 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 146589 - 146429
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146589 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 146490  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  146489 taatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29777417 - 29777257
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777417 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 29777318  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29777317 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 41949404 - 41949567
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgct--tatgtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41949404 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgtg 41949503  T
Q  105 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  41949504 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacca 41949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42766001 - 42765842
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42766001 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctaatgtggc 42765903  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42765902 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43471855 - 43471695
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43471855 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgattatgtggc 43471756  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43471755 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 47344678 - 47344838
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47344678 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggc 47344777  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47344778 taatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 55056419 - 55056259
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55056419 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgac 55056320  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  55056319 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 55776067 - 55776226
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55776067 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 55776165  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  55776166 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 55840245 - 55840404
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55840245 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 55840343  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  55840344 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31972494 - 31972335
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31972494 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 31972395  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31972394 atgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacca 31972335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 42033197 - 42033358
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  42033197 agaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtagc 42033296  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033297 taatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 42033358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 54607984 - 54608145
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54607984 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatgcttatgtggc 54608083  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  54608084 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacca 54608145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22618672 - 22618514
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618672 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 22618574  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22618573 taatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 31914220 - 31914379
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31914220 agaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-ggc 31914318  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31914319 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 407776 - 407937
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  407776 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggc 407874  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  407875 taatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatt 407937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 56023158 - 56022988
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56023158 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 56023059  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttttt 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  56023058 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccattttttttt 56022988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 23609109 - 23609270
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609109 agaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 23609208  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23609209 taatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacca 23609270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 42222313 - 42222474
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42222313 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 42222412  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  42222413 taatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacca 42222474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49881223 - 49881057
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49881223 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 49881124  T
Q  107 taatgtatattggttgggg----taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49881123 taatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcaccat 49881057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 54086431 - 54086591
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54086431 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgcttatgtggc 54086529  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54086530 taatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 54086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 3170648 - 3170808
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3170648 agaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 3170747  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  3170748 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 50534653 - 50534809
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50534653 agaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 50534752  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50534753 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 54425004 - 54425163
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54425004 agaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 54425103  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  54425104 taatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 38591690 - 38591846
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  38591690 agaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----aatgtgcttatgtggc 38591785  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38591786 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 48313579 - 48313740
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  48313579 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaa-tatgcttatgtagc 48313676  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48313677 taatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccatt 48313740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53834214 - 53834055
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53834214 agaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 53834115  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53834114 taatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3692368 - 3692210
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3692368 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgtgtttatgtggcta 3692269  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3692268 atgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47662260 - 47662102
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47662260 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatatgcttatgtggcta 47662161  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47662160 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 48657858 - 48658000
Alignment:
Q  25 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48657858 cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggg 48657957  T
Q  125 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48657958 gtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 50457970 - 50457812
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50457970 agaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgttgc 50457871  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50457870 taatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 35446528 - 35446688
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35446528 agaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatttggc 35446626  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35446627 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgttacca 35446688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 2243480 - 2243640
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2243480 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtatttatgtggc 2243579  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2243580 ttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31070233 - 31070074
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31070233 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctcatgtgac 31070135  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31070134 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41632166 - 41632003
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  41632166 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgtacttatatggc 41632068  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41632067 taatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcaccattt 41632003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 50234022 - 50234182
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50234022 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 50234121  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  50234122 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39587939 - 39587777
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  39587939 agaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatataac 39587840  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  39587839 taatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat-ggta-cctaattgtcaccattt 39587777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532830
Alignment:
Q  41 aatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  141 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14017534 - 14017376
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  14017534 agaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aagtgtgtttatgtggc 14017437  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14017436 taatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 1932785 - 1932945
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932785 agaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 1932884  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  1932885 taatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50536784 - 50536628
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  50536784 agaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatatgtttatgtgac 50536685  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50536684 taatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22468930 - 22468788
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  22468930 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgtttatgtggc 22468831  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 149  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22468830 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  25 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  125 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33897655 - 33897504
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  33897655 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatatggc 33897556  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 158  Q
    |||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  33897555 taatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 48259670 - 48259528
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48259670 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaaatgtgcttatgtggc 48259572  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48259571 taatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 48654838 - 48655002
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48654838 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgtacttatgtggcta 48654937  T
Q  109 ------atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
          |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  48654938 atgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595871
Alignment:
Q  70 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 35595871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 51951704 - 51951866
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51951704 agaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgtgcttatgtggc 51951803  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  51951804 taatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcatcatt 51951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 54805778 - 54805614
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg----cttatg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||     |||||    
T  54805778 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgtttatttatg 54805679  T
Q  103 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  54805678 tggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9998078 - 9997929
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  9998078 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 9997990  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9997989 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 9997929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45633928 - 45633779
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  45633928 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 45633840  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45633839 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509479
Alignment:
Q  40 aaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacca 139  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  140 ttcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacca 42509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 43890952 - 43891099
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  43890952 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 43891040  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  43891041 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 54715059 - 54715206
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  54715059 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 54715147  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54715148 atgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 22620615 - 22620765
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  22620615 agaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 22620703  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  22620704 taatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacca 22620765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15060438 - 15060288
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  15060438 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 15060350  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15060349 caatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 15060288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5117587 - 5117438
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  5117587 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 5117499  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117498 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37239239 - 37239090
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  37239239 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 37239151  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37239150 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 52688371 - 52688520
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||           | ||||||||||||    
T  52688371 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggc 52688459  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52688460 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38547748 - 38547601
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  38547748 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 38547660  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  38547659 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Original strand, 2359940 - 2360084
Alignment:
Q  254 caatattatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcataggaaa 353  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||       ||| ||||||| ||||||    
T  2359940 caatagtatatattagaaaacaatggtaccaaagcaatggtgaagtaagacacatatttagagcaccgaatgagatgtttttatgatttctcaaaggaaa 2360039  T
Q  354 tatacagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaatt 398  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2360040 tttacaggacaagccaaatttgtcattttctgttgaatccaaatt 2360084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 34552341 - 34552491
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||||| |||           |||||||||| |||    
T  34552341 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggc 34552429  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34552430 taatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 34552491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20351991 - 20351842
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  20351991 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 20351903  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20351902 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31881463 - 31881314
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  31881463 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 31881375  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31881374 taatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Original strand, 35344871 - 35344968
Alignment:
Q  68 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35344871 atagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtcac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461534
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggct 52461474  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  52461475 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 34835201 - 34835348
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| |||           |    
T  34835201 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaaggtg-----------a 34835289  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34835290 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 49014120 - 49014270
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||| ||||||||||    
T  49014120 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtacttatgtggc 49014208  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49014209 taatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 123
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  33 ccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4486730 - 4486581
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||| |||           ||||||||||||||    
T  4486730 agaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 4486642  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||    
T  4486641 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacc 4486581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46708890 - 46708741
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||| |    
T  46708890 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgac 46708802  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  46708801 taatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 54216883 - 54216734
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||  ||    
T  54216883 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgatta 54216795  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  54216794 atgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcaccat 54216734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27398750 - 27398607
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||            |    
T  27398750 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt-----------aa 27398662  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  27398661 atgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  94 gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 46720049 - 46720195
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||  |||           
T  46720049 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-atat------- 46720140  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46720141 atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 47811930 - 47812077
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | | ||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  47811930 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 47812018  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  47812019 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 54216335 - 54216482
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||           || |||||||||||| ||    
T  54216335 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgttgc 54216423  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54216424 taatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 33289725 - 33289877
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || || || |||| |||||||||| ||||           |||||||||||||    
T  33289725 agaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-----------gtgcttatgtggc 33289813  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  33289814 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcaccattt 33289877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 171
Target Start/End: Original strand, 573827 - 573978
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  573827 aatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg-----------a 573915  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  573916 atgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcaccattt 573978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 27580143 - 27580290
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||           |    
T  27580143 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------a 27580231  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27580232 atgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27873697 - 27873550
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||| || |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  27873697 agaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 27873609  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27873608 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacc 27873550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6371392 - 6371236
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| || | || |||||| |||||| |||           |||||    
T  6371392 gtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacctaaaaaggtg-----------aatgt 6371304  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttggt 180  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6371303 ttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcaccttttttttttggt 6371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872751
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacca 27872751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14335248 - 14335101
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||           |    
T  14335248 aatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacctaaaaaggtg-----------a 14335160  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14335159 atgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacc 14335101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  90 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1662406 - 1662323
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1662406 aatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 398
Target Start/End: Original strand, 7247265 - 7247393
Alignment:
Q  260 tatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcatagga--aatata 357  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||    || ||  ||| ||    
T  7247265 tatatatcataaaacaatggtaccaaagcaatgatgaggtaagacacatatttagaccaccgaatgag--------atgtttt----tatgattaattta 7247352  T
Q  358 cagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaatt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7247353 cagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatccaaatt 7247393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 43231524 - 43231601
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 84  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43231524 agaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3293170 - 3293102
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  3293170 aatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  62 gtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 42557604 - 42557663
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42557604 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa 42557663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11972278 - 11972208
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  11972278 agaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14525451 - 14525397
Alignment:
Q  205 tatattaaaaaacaatgttaagcaataactgacatgcataacctacttccaatat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14525451 tatattaaaaaacaatgttaagcaataactgacatacataacccacttccaatat 14525397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14526041 - 14525996
Alignment:
Q  168 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14526041 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaa 14525996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981477
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcattggtagactagttatcaccat 51981477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33558091 - 33557960
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||| ||||||||||           || ||||  |||||||||    
T  33558091 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-----------aatatgtatttatgtggc 33558003  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 149  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33558002 taatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 49058017 - 49057933
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49058017 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  99 tatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662261
Alignment:
Q  115 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18206671 - 18206583
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtca----aaatagttcatggataccacttaaaa 91  Q
    |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  18206671 agaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 17555646 - 17555617
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555646 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 295
Target Start/End: Original strand, 40333161 - 40333202
Alignment:
Q  254 caatattatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40333161 caatagtatatattaaaaaacaatgctaccaaaggaatggtg 40333202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18101655 - 18101493
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101655 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 18101556  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18101555 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 18101493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 5882528 - 5882697
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882528 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 5882627  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  5882628 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatttt 5882697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26377364 - 26377204
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377364 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 26377265  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26377264 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14891539 - 14891383
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891539 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 14891440  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14891439 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22551221 - 22551059
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22551221 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgtgcttatgtggc 22551122  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22551121 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22551059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11989134 - 11988974
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11989134 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 11989035  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11989034 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 24168113 - 24168273
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168113 agaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 24168212  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24168213 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 2892210 - 2892368
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2892210 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2892309  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2892310 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34528020 - 34527862
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34528020 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgacta 34527921  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34527920 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 8615262 - 8615423
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615262 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 8615361  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8615362 taatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacca 8615423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7345272 - 7345130
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345272 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 7345173  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345172 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7393746 - 7393586
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7393746 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 7393647  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  7393646 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22341950 - 22341788
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341950 agaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 22341851  T
Q  105 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22341850 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 960064 - 959902
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  960064 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 959965  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  959964 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 959902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 28947109 - 28947271
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28947109 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 28947208  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28947209 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28947271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33452732 - 33452570
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33452732 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggc 33452633  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33452632 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 33452570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2594012 - 2593852
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2594012 agaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2593913  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2593912 taatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19415693 - 19415533
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415693 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 19415594  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19415593 taatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 16703388 - 16703539
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16703388 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 16703487  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 158  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16703488 taatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24224230 - 24224068
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24224230 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 24224131  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24224130 taatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcaccat 24224068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10508068 - 10507908
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10508068 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggc 10507969  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  10507968 taatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 599914 - 600076
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  599914 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgac 600013  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  600014 taatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 600076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 1970733 - 1970893
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1970733 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtgac 1970832  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1970833 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5294961 - 5294801
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5294961 agaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 5294862  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5294861 taatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5299513 - 5299353
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5299513 agaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 5299414  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5299413 taatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19281215 - 19281056
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19281215 agaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggc 19281116  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19281115 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30743608 - 30743448
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743608 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 30743509  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||    
T  30743508 taatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacc 30743448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261929
Alignment:
Q  17 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  117 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30467763 - 30467658
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30467763 agaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgtgcttatgtggc 30467664  T
Q  107 taatgt 112  Q
    ||||||    
T  30467663 taatgt 30467658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28948994 - 28948844
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||| |||           | ||||||||||||    
T  28948994 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tatgcttatgtggc 28948906  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28948905 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28948844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 15965455 - 15965604
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||| |||||| |||           |||| |||||||||    
T  15965455 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaata-----------tgtgtttatgtggc 15965543  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15965544 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 7167606 - 7167753
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  7167606 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 7167694  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7167695 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 13329403 - 13329545
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||| || |||||||||           ||| |||||||||||||||    
T  13329403 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggc 13329491  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13329492 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 4487549 - 4487698
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||| || |||||||    
T  4487549 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtactcatgtggc 4487637  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4487638 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 1398577 - 1398724
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||| ||| |||           ||||||||||||||||    
T  1398577 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 1398665  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    || | |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1398666 atatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 3786771 - 3786921
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  3786771 agaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 3786859  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3786860 taatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3786921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 3291030 - 3291179
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||| || ||||||||           |||| |||||||||||||||    
T  3291030 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgtgcttatgtggc 3291118  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291119 taatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661906
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 18661906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 929681 - 929740
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaa 66  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  929681 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaa 929740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913096
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1939653 - 1939579
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggata 81  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  1939653 agaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 375871 - 375797
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc 83  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  375871 aatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375741
Alignment:
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggta 375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Original strand, 13844860 - 13844943
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844860 aatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 3611158 - 3611321
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611158 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 3611257  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3611258 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 3611321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 45538175 - 45538337
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538175 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 45538274  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45538275 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45538337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 31308023 - 31308183
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308023 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 31308122  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31308123 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 25058710 - 25058871
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058710 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 25058809  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058810 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25058871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 44661992 - 44662152
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661992 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 44662091  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44662092 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21139569 - 21139410
Alignment:
Q  10 atggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139569 atggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 21139470  T
Q  110 tgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21139469 tgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 21139410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25678419 - 25678256
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678419 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 25678320  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25678319 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccatt 25678256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26085558 - 26085396
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085558 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 26085459  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26085458 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4068841 - 4068689
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068841 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 4068742  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4068741 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17995111 - 17994951
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995111 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 17995012  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17995011 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 43251733 - 43251891
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251733 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 43251832  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43251833 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5981192 - 5981352
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981192 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 5981291  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5981292 taatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 26794326 - 26794482
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26794326 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 26794425  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26794426 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 26277199 - 26277362
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26277199 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgtttatgtggc 26277298  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26277299 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 26277362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 23984777 - 23984943
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23984777 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 23984876  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttct 173  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23984877 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttct 23984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24245185 - 24245024
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24245185 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 24245086  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24245085 taatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 24245024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6327707 - 6327548
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  6327707 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat-tgac 6327609  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6327608 taatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23932669 - 23932509
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23932669 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgtgcttatgtggc 23932570  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23932569 taatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 31040731 - 31040891
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31040731 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 31040830  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31040831 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37620352 - 37620192
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37620352 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtggc 37620253  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37620252 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38790357 - 38790197
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38790357 agaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 38790258  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38790257 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 39646590 - 39646750
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39646590 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtaac 39646689  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39646690 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 47671608 - 47671769
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671608 agaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 47671707  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47671708 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 47671769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33112977 - 33112818
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33112977 agaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 33112878  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  33112877 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 33884110 - 33884270
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33884110 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggc 33884209  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33884210 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33960142 - 33959982
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33960142 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggc 33960043  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  33960042 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 36566352 - 36566523
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566352 agaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 36566451  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 178  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  36566452 taatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatatgtttttg 36566523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 35273618 - 35273780
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273618 agaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 35273717  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35273718 taatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 35273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 41999839 - 41999997
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41999839 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtta 41999938  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41999939 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 47317337 - 47317499
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47317337 agaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 47317436  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47317437 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 47317499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47383892 - 47383731
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47383892 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 47383793  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  47383792 taatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacca 47383731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 50774239 - 50774399
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50774239 agaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgac 50774338  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50774339 caatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46967201 - 46967040
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967201 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 46967102  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46967101 taatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 46967040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49399148 - 49398987
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49399148 agaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 49399049  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399048 taatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacca 49398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 51057093 - 51057254
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51057093 agaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 51057192  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51057193 taatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 51057254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5980090 - 5980250
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5980090 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaattagcttatgtggc 5980189  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5980190 taatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 24885523 - 24885683
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  24885523 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtgga 24885622  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  24885623 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26525049 - 26524889
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26525049 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatatgcttatgtggc 26524950  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26524949 taatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38332019 - 38331859
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38332019 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggc 38331920  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38331919 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49254135 - 49253975
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49254135 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatatggc 49254036  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  49254035 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacc 49253975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23221089 - 23220933
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221089 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 23220990  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||      || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23220989 taatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgtgaccat 23220933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 149
Target Start/End: Original strand, 42863887 - 42864029
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42863887 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggc 42863986  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42863987 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35692824 - 35692663
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35692824 agaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgtttatgtgg 35692725  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  35692724 ctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 46616571 - 46616731
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46616571 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggc 46616670  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  46616671 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 46784446 - 46784606
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46784446 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgact 46784545  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46784546 aatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacca 46784606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 3285424 - 3285582
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3285424 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggc 3285522  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3285523 taatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 139
Target Start/End: Original strand, 31844399 - 31844530
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844399 gaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 31844498  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccacca 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31844499 aatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Original strand, 28888603 - 28888760
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28888603 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 28888702  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 164  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28888703 taatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450677
Alignment:
Q  20 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattgg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  120 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2450677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 47187137 - 47187287
Alignment:
Q  17 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatat 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47187137 gtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 47187236  T
Q  117 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47187237 tggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 36003152 - 36003315
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36003152 agaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 36003251  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttc---catgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||    
T  36003252 taatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42313510 - 42313361
Alignment:
Q  18 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42313510 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtatt 42313411  T
Q  118 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42313410 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045593
Alignment:
Q  26 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggg 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  126 taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcaccatt 51045593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 48373526 - 48373677
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48373526 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg-- 48373623  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  48373624 -------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 25518838 - 25518952
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25518838 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggcta 25518937  T
Q  109 atgtatattggttgg 123  Q
    |||| ||||||||||    
T  25518938 atgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27983747 - 27983602
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27983747 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccatttaaaaatgtgcttatgtggc 27983664  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27983663 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27983602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 33073235 - 33073382
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  33073235 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 33073323  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33073324 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  39 aaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 138  Q
    ||||||| |||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  139 attcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41467781 - 41467630
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  41467781 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 41467693  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41467692 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 41467630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 2657325 - 2657474
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  2657325 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 2657413  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2657414 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475866
Alignment:
Q  22 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  122 ggggtaaattacccaccattctt 144  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  45475887 -gggtaaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 51403167 - 51403034
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  51403167 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatatg-- 51403071  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
           ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51403070 -------tattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312530
Alignment:
Q  74 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 13312530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 10928091 - 10928238
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  10928091 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 10928179  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10928180 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6626173 - 6626025
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  6626173 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 6626085  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6626084 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772167
Alignment:
Q  35 aatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacc 134  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  135 caccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttc 172  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcaccttttc 47772167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31980095 - 31979998
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31980095 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2557006 - 2556879
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  2557006 agaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgtttatgtg-- 2556909  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 143  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2556908 -------tattggttggggtaaattacccactattct 2556879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 2954879 - 2955026
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||           |    
T  2954879 aatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaaggtg-----------a 2954967  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2954968 ttgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26472328 - 26472185
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  26472328 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 26472240  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  26472239 taatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 29770692 - 29770841
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  29770692 agaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 29770780  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  29770781 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 4156472 - 4156576
Alignment:
Q  63 tcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 162  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  4156472 tcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatttttccatgggtactctagttg 4156571  T
Q  163 tcacc 167  Q
    |||||    
T  4156572 tcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 26685880 - 26686027
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  26685880 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg-----------a 26685968  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26685969 atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38716394 - 38716247
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||           |    
T  38716394 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 38716306  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38716305 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 1388497 - 1388646
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  1388497 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 1388585  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1388586 atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 1388646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 4953074 - 4953223
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||| |||           |||||||||||||     
T  4953074 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggt 4953162  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  4953163 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30290057 - 30289908
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||           ||||||||||||| ||    
T  30290057 aatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggtta 30289969  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  30289968 atgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcaccat 30289908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 42234862 - 42235010
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||     
T  42234862 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggt 42234950  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42234951 taatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4243637 - 4243490
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||| ||| |||           ||||||||||||||||    
T  4243637 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 4243549  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4243548 atgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41895313 - 41895163
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | || ||| |||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  41895313 agaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 41895225  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41895224 taatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 33187362 - 33187507
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||| ||              
T  33187362 agaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaatatg---------- 33187451  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33187452 -------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 33187507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34752463 - 34752320
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||| | || |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  34752463 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 34752375  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  34752374 taatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48683477 - 48683330
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||           |    
T  48683477 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------a 48683389  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48683388 atgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 10920224 - 10920373
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  10920224 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 10920312  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  10920313 atgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcaccat 10920373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5961414 - 5961267
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  5961414 aatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 5961326  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5961325 atgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13281711 - 13281588
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  13281711 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 13281623  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 141  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13281622 taatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13313323 - 13313249
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggata 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13313323 agaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27924805 - 27924674
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  27924805 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 27924717  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 151  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27924716 atggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44544195 - 44544052
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||| |||||||  |    
T  44544195 agaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtacttatgtaac 44544107  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44544106 taatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 44544052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 52323962 - 52324111
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||| |||           |    
T  52323962 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacctaaaaaggtg----------aa 52324051  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52324052 atgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacca 52324111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 51155736 - 51155606
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||           || ||||| ||||||| |||    
T  51155736 aatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttatgtgacta 51155648  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51155647 atgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 32448670 - 32448740
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  32448670 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44293604 - 44293455
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||| ||||||||||    
T  44293604 agaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggc 44293516  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  44293515 taatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39475929 - 39475782
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||           |    
T  39475929 aatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccacctaaaaatgtg-----------a 39475842  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  39475841 acgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 39475782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718163
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccattt 38718163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7561689 - 7561527
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg-- 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |    | ||  |||   | | || ||||||||| ||||      
T  7561689 aatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagttcatgaatatgtgcttacgtgggg 7561590  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7561589 ctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 52367911 - 52367990
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  52367911 gtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 46428400 - 46428332
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  46428400 aatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24649869 - 24649802
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcat 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||    
T  24649869 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35991748 - 35991616
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||||    
T  35991748 agaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggc 35991660  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991659 taatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Original strand, 39637922 - 39637996
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttc-atggatacca 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39637922 agaatggtgggtaatttacccaccaa----taaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31286563 - 31286504
Alignment:
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31286563 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 164
Target Start/End: Original strand, 32448757 - 32448807
Alignment:
Q  114 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32448757 tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 4156225 - 4156188
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156225 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  98 ttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 144  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9779999 - 9779919
Alignment:
Q  60 gggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 141  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
T  9779999 gggtcaaagtagtttggggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgtt-gggttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 167
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844855
Alignment:
Q  130 ttacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31844855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359553
Alignment:
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcct 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatagatatcct 39359553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 10919341 - 10919313
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919341 aatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 24253404 - 24253566
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253404 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 24253503  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24253504 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 24253566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18479828 - 18479666
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18479828 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 18479729  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  18479728 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcaccat 18479666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5184994 - 5185154
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5184994 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 5185093  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185094 taatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 35626060 - 35626220
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35626060 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 35626159  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35626160 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43326539 - 43326379
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43326539 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcctatgtggc 43326440  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43326439 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15398642 - 15398483
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398642 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 15398543  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15398542 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 6901821 - 6901979
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901821 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 6901920  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6901921 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 27938919 - 27939080
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27938919 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 27939018  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg-tatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27939019 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2484452 - 2484288
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2484452 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgtttatgtggc 2484353  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484352 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 2484288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 7722071 - 7722231
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722071 agaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 7722170  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7722171 taatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 39932601 - 39932761
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932601 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 39932700  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39932701 taatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40886187 - 40886026
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40886187 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggc 40886089  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40886088 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcaccat 40886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3466841 - 3466681
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3466841 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 3466742  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  3466741 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 12648819 - 12648979
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648819 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 12648918  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12648919 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43262343 - 43262183
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262343 agaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 43262244  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43262243 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 31938921 - 31939080
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  31938921 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatgacta 31939020  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31939021 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacca 31939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27501215 - 27501053
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501215 agaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 27501116  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27501115 taatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 27501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  22 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  122 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 739864 - 739704
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  739864 agaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 739765  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  739764 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 739704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27278637 - 27278474
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatag----ttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27278637 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttacg 27278538  T
Q  103 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27278537 tggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 15683813 - 15683973
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15683813 agaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggc 15683912  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  15683913 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 25831543 - 25831702
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25831543 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggataccaattaaaaatgtgcttatgtggc 25831641  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  25831642 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40279018 - 40278855
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40279018 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 40278919  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  40278918 taatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcaccatt 40278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13504902 - 13504740
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13504902 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 13504803  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13504802 taatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 13504740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451434
Alignment:
Q  27 caccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  127 aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 34451434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 40110256 - 40110413
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40110256 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 40110354  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40110355 taatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 890928 - 891087
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  890928 agaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggc 891026  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  891027 taatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28424947 - 28424795
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28424947 gtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 28424850  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  28424849 gtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5137737 - 5137897
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5137737 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 5137836  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||| || | |||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||    
T  5137837 taatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38756648 - 38756487
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38756648 agaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 38756549  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt-ccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  38756548 taatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 763745 - 763905
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  763745 agaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttatgtggc 763844  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  763845 taatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 148
Target Start/End: Original strand, 4149716 - 4149847
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4149716 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtta----------tggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 4149805  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4149806 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 33617609 - 33617756
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  33617609 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 33617697  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33617698 atgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5497295 - 5497444
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  5497295 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 5497383  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5497384 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 19295754 - 19295902
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  19295754 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggcta 19295842  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19295843 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 19295902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 27503401 - 27503551
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  27503401 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 27503489  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27503490 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 27503551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23195397 - 23195248
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  23195397 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 23195309  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23195308 taatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31294149 - 31293987
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||    |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||      
T  31294149 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatatgcttacgtgat 31294050  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31294049 tgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcaccat 31293987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38015663 - 38015514
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  38015663 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 38015575  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38015574 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9424741 - 9424593
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |||           | ||||||||||||    
T  9424741 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggc 9424653  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9424652 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42658811 - 42658671
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||||    
T  42658811 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggc 42658723  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42658722 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656567
Alignment:
Q  12 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  112 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 6973085 - 6973234
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||| |    
T  6973085 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgac 6973173  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6973174 taatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 13957692 - 13957841
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||| ||||||||| |    
T  13957692 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgcgcttatgtgac 13957780  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13957781 taatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9374649 - 9374502
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||           || ||||| ||| |||||||    
T  9374649 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttaggtggcta 9374561  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9374560 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 40632523 - 40632634
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  40632523 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc---------ggtgcttatgtggcta 40632613  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  40632614 atgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 14972000 - 14972150
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||           || ||||||||||||| |    
T  14972000 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgtgcttatgtgac 14972088  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14972089 taatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 14972150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 239
Target Start/End: Original strand, 41312981 - 41313052
Alignment:
Q  168 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaaaaacaatgttaagcaataactgacat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41312981 atttctttatggttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaaaaacaatgttaagcaataactgacat 41313052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 6206906 - 6207032
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  6206906 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 6206994  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6206995 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36365594 - 36365445
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  36365594 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 36365506  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  36365505 taatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacc 36365445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 2585486 - 2585633
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||           |    
T  2585486 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaaagttg-----------a 2585574  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  2585575 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 27390621 - 27390768
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  27390621 aatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 27390709  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27390710 atgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 5120048 - 5120181
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||               
T  5120048 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatg----------- 5120135  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5120136 aatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggta 5120181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18327320 - 18327171
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  18327320 aatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 18327232  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18327231 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcaccat 18327171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24167931 - 24167782
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  24167931 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 24167843  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24167842 atgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 24167782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12558178 - 12558090
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12558178 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948492
Alignment:
Q  11 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  111 gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  36948545 gtgtattgg-tagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492785
Alignment:
Q  19 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||||||| |||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  119 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccaccat 38492785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38638057 - 38637910
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||           |    
T  38638057 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg-----------a 38637969  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38637968 atgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33624086 - 33623940
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  33624086 aatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggta-----------tgtgcttatgtggcta 33623998  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||||||    
T  33623997 atgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612757
Alignment:
Q  11 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| || ||||             ||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaat 612815  T
Q  111 gtatattggttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  612814 gtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1402652 - 1402505
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||           |    
T  1402652 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacccaaaaaggtg-----------a 1402564  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  1402563 atgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36472431 - 36472348
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  36472431 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 42247931 - 42247865
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagtt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  42247931 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 40686923 - 40687069
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| |||           |    
T  40686923 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaa-gtg-----------a 40687010  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  40687011 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcat 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9171174 - 9171115
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaa 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  9171174 agaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 9171115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 9527169 - 9527126
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9527169 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaat 9527126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42247844 - 42247791
Alignment:
Q  114 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  42247844 tattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacc 42247791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25894077 - 25893916
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894077 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 25893978  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25893977 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 35355911 - 35356071
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35355911 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 35356010  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35356011 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22979807 - 22979645
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22979807 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 22979708  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22979707 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 22979645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 36389379 - 36389539
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389379 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 36389478  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36389479 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33423435 - 33423276
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423435 agaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 33423336  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33423335 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 27018139 - 27018301
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018139 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 27018238  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018239 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 27018301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45690255 - 45690097
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690255 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 45690156  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45690155 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 17855451 - 17855611
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17855451 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggc 17855550  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17855551 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33839875 - 33839715
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839875 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 33839776  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33839775 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35328229 - 35328069
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35328229 agaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 35328130  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35328129 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47067137 - 47066977
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067137 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 47067038  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47067037 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33695981 - 33695818
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695981 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 33695882  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33695881 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatt 33695818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23393211 - 23393049
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23393211 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 23393112  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23393111 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23393049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49171522 - 49171362
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49171522 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 49171423  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49171422 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 33411283 - 33411446
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33411283 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 33411382  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33411383 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccatt 33411446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 46913132 - 46913294
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa--tgtgcttatgtg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46913132 agaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtgcttatgtg 46913231  T
Q  105 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46913232 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47740491 - 47740328
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47740491 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 47740392  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47740391 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccatt 47740328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2341822 - 2341661
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2341822 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgac 2341723  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccat-gggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2341722 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20165974 - 20165813
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20165974 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggc 20165875  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20165874 taatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5183985 - 5183825
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5183985 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggc 5183886  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5183885 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 31625727 - 31625886
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31625727 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 31625826  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31625827 taatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 10028511 - 10028674
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10028511 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 10028610  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtat--cctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10028611 taatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacca 10028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37846176 - 37846016
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846176 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 37846077  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37846076 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 40670586 - 40670746
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40670586 agaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 40670685  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40670686 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 43499508 - 43499670
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43499508 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtggc 43499607  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  43499608 caatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcaccat 43499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48609837 - 48609675
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609837 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 48609738  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48609737 taatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 48609675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 31586871 - 31587031
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586871 agaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 31586970  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  31586971 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 45482681 - 45482841
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  45482681 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtgac 45482780  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45482781 tgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 15877573 - 15877724
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877573 agaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 15877672  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 158  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15877673 taatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26579877 - 26579717
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26579877 agaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 26579778  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26579777 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 33332812 - 33332971
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33332812 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatgcttatgcggc 33332910  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33332911 taatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 5712191 - 5712353
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5712191 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 5712290  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  5712291 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 5712353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35757180 - 35757020
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757180 agaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 35757082  T
Q  107 taatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35757081 taatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41991018 - 41990872
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41991018 agaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41990919  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41990918 taatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta 41990872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 19563470 - 19563631
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19563470 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 19563569  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19563570 taatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacca 19563631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 33870268 - 33870424
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33870268 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgcttatgtggc 33870367  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||    
T  33870368 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 35767519 - 35767657
Alignment:
Q  29 ccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaa 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35767519 ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaa 35767618  T
Q  129 attacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35767619 attacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45063515 - 45063356
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063515 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 45063416  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  45063415 taatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacca 45063356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31429635 - 31429473
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31429635 agaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgac 31429536  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31429535 taatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 31429473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 10618321 - 10618474
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  10618321 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccacttaaaaatatgtttatgtggc 10618413  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10618414 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233935
Alignment:
Q  30 caaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  130 ttacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
     |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 28233935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076527
Alignment:
Q  36 atgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccc 135  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  136 accattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33720196 - 33720070
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33720196 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggc 33720097  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  33720096 taatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 41904273 - 41904388
Alignment:
Q  52 tgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 151  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  41904273 tgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataag 41904372  T
Q  152 tatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  41904373 tatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35752183 - 35752034
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  35752183 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 35752095  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35752094 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 44405418 - 44405531
Alignment:
Q  54 ttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44405418 ttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttccatgggta 44405517  T
Q  154 tcctagttgtcacc 167  Q
    | ||||||||||||    
T  44405518 ttctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 43489243 - 43489391
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  43489243 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 43489331  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  43489332 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 43489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 44564361 - 44564497
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  44564361 agaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttatgtgac 44564460  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564461 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46898163 - 46898016
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  46898163 aatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 46898075  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46898074 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 37127960 - 37128109
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||           |||| |||||||||||| ||    
T  37127960 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgtgcttatgtagc 37128048  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37128049 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36816994 - 36816843
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  36816994 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 36816906  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  36816905 taatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 36816843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24923173 - 24923024
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||| |||           ||||||||||||||    
T  24923173 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 24923085  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24923084 taatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46817570 - 46817421
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  46817570 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 46817482  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  46817481 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 26371072 - 26371223
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||           || ||||||||||||| |    
T  26371072 agaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgac 26371160  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  26371161 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 26371223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 33393357 - 33393499
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||           || ||||||    
T  33393357 gtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-----------ggttaatgt 33393445  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33393446 tcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7876477 - 7876328
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||| |||           ||| ||||||||||    
T  7876477 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggc 7876389  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7876388 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 48085881 - 48086030
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  48085881 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 48085969  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  48085970 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacc 48086030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26941681 - 26941541
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  26941681 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 26941593  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatccta 158  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26941592 taatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44003517 - 44003370
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  44003517 aatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 44003429  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44003428 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 2332044 - 2332193
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||| ||    
T  2332044 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggtta 2332132  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2332133 ctgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcaccat 2332193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15644093 - 15643948
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  15644093 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 15644005  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  15644004 atgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 24228564 - 24228713
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||||    
T  24228564 agaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggc 24228652  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24228653 taatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45502965 - 45502817
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||           ||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  45502965 agaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccatttaaaaatatgcttatgtagc 45502877  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  45502876 taatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47460919 - 47460769
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||           |    
T  47460919 aatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------a 47460831  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  47460830 atgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccatt 47460769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 7257406 - 7257554
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||           |    
T  7257406 aatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg-----------a 7257494  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7257495 atgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacca 7257554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 21718145 - 21718288
Alignment:
Q  12 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||||||||||||||||||||    
T  21718145 ggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 21718233  T
Q  112 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21718234 tgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 498337 - 498187
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  498337 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 498249  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  498248 taatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacca 498187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 46103146 - 46103291
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||||    
T  46103146 aatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggcta 46103233  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46103234 atgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 29610658 - 29610807
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  29610658 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 29610746  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610747 taatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 29098774 - 29098921
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||               || ||||||||||||    
T  29098774 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat---------------atatgcttatgtggc 29098858  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || |||| || ||||| || ||||||||| |||||    
T  29098859 taatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttaccat 29098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39453624 - 39453484
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||                  ||||| ||||||| |    
T  39453624 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt------------------atgtgtttatgtgac 39453543  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39453542 taatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25037657 - 25037516
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  25037657 agaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 25037569  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctag 159  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  25037568 tgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 29863038 - 29863116
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29863038 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32556755 - 32556640
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||           || ||||||||||||| |    
T  32556755 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgac 32556667  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32556666 taatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16482930 - 16482847
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  16482930 aatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43682122 - 43681994
Alignment:
Q  260 tatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcatagga--aatata 357  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||    || ||  ||| ||    
T  43682122 tatatatcataaaacaatggtaccaaagcaatgatgaggtaagacacatatttagaccaccgaatgag--------atgtttt----tatgattaattta 43682035  T
Q  358 cagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaatt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43682034 cagcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatccaaatt 43681994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47906908 - 47906758
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  47906908 agaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 47906820  T
Q  107 taatgtatattggttggggt-aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  47906819 taatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45237682 - 45237533
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| ||| |||||| |||           |||||||||||||     
T  45237682 agaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggt 45237594  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  45237593 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443602
Alignment:
Q  24 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  124 ggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 41855084 - 41855228
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||           |||| || ||||||||||||||    
T  41855084 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca-----------taaatatatgcttatgtggcta 41855172  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta-tcctagttgt 163  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  41855173 atgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 39323639 - 39323709
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  39323639 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 39866688 - 39866758
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  39866688 agaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 44659867 - 44660015
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||||    
T  44659867 agaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggc 44659954  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  44659955 taatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 35484659 - 35484807
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||     
T  35484659 agaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtga 35484747  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35484748 ctaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 33455119 - 33455189
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  33455119 agaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 35557755 - 35557796
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557755 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 35557796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323779
Alignment:
Q  99 tatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12308266 - 12308166
Alignment:
Q  288 caatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcatagga--aatatacagcacaagcaaaatttgtcattttcta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||    || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12308266 caatggtgaggtaagacacatatttagaccaccgaatgaga--------tgtttt----tatgattaatttacagcacaagcaaaatttgtcattttcta 12308179  T
Q  386 ttgaatctaaatt 398  Q
    ||||||| |||||    
T  12308178 ttgaatccaaatt 12308166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38448591 - 38448508
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  38448591 gtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgtg 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 30077085 - 30077043
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077085 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 35823313 - 35823353
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 47  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823313 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  32 accaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaat 93  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7720650 - 7720574
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 85  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| | | | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  7720650 aatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggataccac 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13066802 - 13066759
Alignment:
Q  180 ttattgatgcttttgtatatagtagtatattaaaaaacaatgtta 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13066802 ttattgatgcttttgtttatagta-tatattaaaaaacaatgtta 13066759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272245
Alignment:
Q  102 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacca 42272245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13066705 - 13066665
Alignment:
Q  255 aatattatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtg 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13066705 aatagtatatattaaaaaacaatgctaccaaagaaatggtg 13066665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32984237 - 32984077
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984237 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 32984138  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32984137 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37301485 - 37301316
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37301485 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 37301386  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttcttttt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37301385 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtca-catttcttttt 37301316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24080061 - 24079900
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080061 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 24079962  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24079961 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 24079900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 32114271 - 32114429
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32114271 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 32114370  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32114371 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 10646151 - 10646307
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10646151 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgttcttatgtggctaatgt 10646250  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10646251 gtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 10646307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 41862242 - 41862402
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41862242 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 41862341  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41862342 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 41653917 - 41654079
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653917 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41654016  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41654017 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 41654079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9303734 - 9303574
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9303734 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 9303635  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9303634 taatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33730801 - 33730641
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730801 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 33730702  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33730701 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33981823 - 33981663
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33981823 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgcggc 33981724  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33981723 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40435313 - 40435153
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435313 agaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 40435214  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40435213 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 43328729 - 43328889
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328729 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 43328828  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43328829 taatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 5946069 - 5946229
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946069 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 5946168  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5946169 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 6366008 - 6366168
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366008 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 6366107  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  6366108 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31831115 - 31830959
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831115 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 31831016  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31831015 taatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 37956443 - 37956603
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956443 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 37956542  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  37956543 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45236725 - 45236565
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236725 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 45236626  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45236625 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 9734277 - 9734435
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9734277 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggc 9734375  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9734376 taatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13356280 - 13356120
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13356280 agaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 13356181  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13356180 taatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17718882 - 17718722
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718882 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 17718783  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17718782 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 25185921 - 25186081
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25185921 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 25186020  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  25186021 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacc 25186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 2714571 - 2714714
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714571 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2714670  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2714671 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 37419962 - 37420125
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37419962 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtgac 37420061  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37420062 taatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccatt 37420125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 35628799 - 35628959
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  35628799 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 35628898  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35628899 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 41231968 - 41232128
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41231968 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 41232067  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41232068 caatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 2275935 - 2276094
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2275935 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgcttatgtggc 2276033  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2276034 taatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 9013706 - 9013865
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9013706 agaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggc 9013805  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9013806 taatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13760808 - 13760646
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13760808 agaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttctgtggc 13760709  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg--gtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13760708 taatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29048563 - 29048426
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048563 agaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 29048464  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29048463 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 22878413 - 22878572
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878413 agaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 22878512  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22878513 taatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033112
Alignment:
Q  41 aatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccat 140  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  141 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44088592 - 44088460
Alignment:
Q  18 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44088592 taatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtatt 44088493  T
Q  118 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088492 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 45258532 - 45258675
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  45258532 agaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtaac 45258631  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45258632 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 41981535 - 41981652
Alignment:
Q  52 tgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41981535 tgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgga 41981634  T
Q  152 tatcctagttgtcaccat 169  Q
    || |||||||||||||||    
T  41981635 taccctagttgtcaccat 41981652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45066741 - 45066592
Alignment:
Q  18 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45066741 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 45066642  T
Q  118 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | ||    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  45066641 gattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacc 45066592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 168
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904259
Alignment:
Q  34 caatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  134 ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 3904259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 41639936 - 41640095
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||    
T  41639936 agaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatatgtttatgtggc 41640035  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  41640036 taatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 25248061 - 25248215
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25248061 agaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgtgcttatgttgc 25248154  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  25248155 taatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4447442 - 4447295
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  4447442 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 4447354  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4447353 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42701448 - 42701303
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta---aaaatgtgcttatgtgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||     
T  42701448 aatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaatgtgct--tgtga 42701351  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42701350 ctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggta 42701303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  54 ttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  154 tcctagttgtcacc 167  Q
     |||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 10378333 - 10378480
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  10378333 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 10378421  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378422 atatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 3211229 - 3211376
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  3211229 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 3211317  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3211318 atgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 31940337 - 31940487
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  31940337 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 31940425  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  31940426 taatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 31940487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 117478 - 117328
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  117478 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 117390  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  117389 taatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 117328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 41843277 - 41843426
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  41843277 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 41843365  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  41843366 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcaccat 41843426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 2379162 - 2379312
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||| |    
T  2379162 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgac 2379250  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2379251 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 39915972 - 39915887
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39915972 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40458921 - 40458770
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || ||||| || ||||||    
T  40458921 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttttgtggc 40458833  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  40458832 taatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 40458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 87
Target Start/End: Original strand, 41981455 - 41981535
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 87  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41981455 agaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 9713711 - 9713868
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  9713711 agaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 9713796  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  9713797 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatgtttttg 9713868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4975556 - 4975403
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||| ||||    
T  4975556 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatatggc 4975468  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  4975467 taatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgctaccattt 4975403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32373873 - 32373733
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||  ||    
T  32373873 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgatta 32373785  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  32373784 atgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26196463 - 26196317
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  26196463 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataa-caatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 26196376  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26196375 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40649980 - 40649837
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||| |||           ||||||||||||||    
T  40649980 agaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 40649892  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  40649891 taatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33896990 - 33896843
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||  ||           |    
T  33896990 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaagatg-----------a 33896902  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  33896901 atgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9509549 - 9509400
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||           |||| |||||||||    
T  9509549 agaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggc 9509461  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  9509460 aaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3490546 - 3490399
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||| |||           |    
T  3490546 aatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacctaaaaaggtg-----------a 3490458  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  3490457 atgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33622614 - 33622466
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||           || ||||| ||||||| |    
T  33622614 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtggttatgtgac 33622527  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  33622526 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacca 33622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27243288 - 27243218
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||    
T  27243288 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27254863 - 27254793
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||    
T  27254863 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Original strand, 36105764 - 36105828
Alignment:
Q  260 tatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaat 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36105764 tatatattaaaaaataatgttaccaaagcaatagtaaggtaaggcacatatatagaccaccgaat 36105828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 38631676 - 38631806
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||           || || ||||||||||| ||    
T  38631676 aatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggtta 38631764  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631765 atatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31149037 - 31148953
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatg 94  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31149037 aatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901741
Alignment:
Q  102 gtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcaccat 39901741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 164745 - 164812
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcat 76  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  164745 gaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtctaaatagttcat 164812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425428
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacca 41425428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 36104476 - 36104514
Alignment:
Q  168 atttctttttggttattgatgcttttgtatatagtagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36104476 atttctttttggttattgatgcttttgtatattgtagta 36104514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6594618 - 6594458
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594618 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 6594519  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6594518 taatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 746487 - 746648
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  746487 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 746586  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  746587 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 746648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 23901800 - 23901961
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901800 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 23901899  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901900 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23901961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10244742 - 10244582
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10244742 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 10244643  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10244642 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 38997122 - 38997282
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997122 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 38997221  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38997222 taatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 17600859 - 17601017
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600859 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 17600958  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17600959 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 45371011 - 45371173
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371011 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 45371110  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45371111 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45371173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 4034613 - 4034773
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034613 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 4034712  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4034713 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 14660467 - 14660627
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660467 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 14660566  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14660567 taatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 34518388 - 34518548
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518388 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 34518487  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34518488 taatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 40635239 - 40635399
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40635239 agaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 40635338  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40635339 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 6430494 - 6430648
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6430494 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 6430593  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6430594 taatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13815378 - 13815216
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13815378 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 13815279  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13815278 taatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccat 13815216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 26710366 - 26710527
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710366 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 26710465  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26710466 tgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 26710527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2325049 - 2324889
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325049 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2324950  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2324949 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 11184993 - 11185153
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11184993 agaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgac 11185092  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11185093 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27651194 - 27651034
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651194 agaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 27651095  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27651094 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 27400424 - 27400587
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27400424 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtagc 27400523  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27400524 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatt 27400587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Original strand, 10424616 - 10424773
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424616 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 10424715  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 164  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10424716 taatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2914298 - 2914134
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914298 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2914199  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccattt 171  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2914198 tgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcaccattt 2914134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1092111 - 1091951
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1092111 agaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 1092012  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1092011 taatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32856596 - 32856436
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32856596 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgcttatgtggc 32856497  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32856496 taatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14697697 - 14697535
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14697697 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 14697598  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14697597 taatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccat 14697535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 32327382 - 32327544
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327382 agaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 32327481  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32327482 taatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcaccat 32327544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 4609647 - 4609808
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4609647 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcc 4609746  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4609747 taatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4609808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 5726150 - 5726311
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5726150 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgtgtttatatggc 5726249  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5726250 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7892848 - 7892688
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7892848 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 7892749  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  7892748 taatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 32948467 - 32948628
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32948467 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 32948565  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32948566 taatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcaccat 32948628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33427805 - 33427647
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427805 aatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 33427706  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33427705 atgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 27024436 - 27024596
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  27024436 agaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatgtgac 27024535  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27024536 taatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37621030 - 37620866
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggt---caaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37621030 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 37620931  T
Q  104 ggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37620930 ggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacca 37620866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37255485 - 37255337
Alignment:
Q  19 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37255485 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattg 37255386  T
Q  119 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37255385 gttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 11159651 - 11159802
Alignment:
Q  16 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtata 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  11159651 ggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgtgtttatgtggctattgtgta 11159750  T
Q  116 ttggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11159751 ttggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 9444726 - 9444874
Alignment:
Q  22 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9444726 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 9444825  T
Q  122 ggggtaaattacccacc---attcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9444826 ggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 40735485 - 40735647
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40735485 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgcggc 40735584  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  40735585 taatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcaccat 40735647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 40037164 - 40037323
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  40037164 agaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 40037263  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40037264 taatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 32608401 - 32608535
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608401 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 32608500  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32608501 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  37 tgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  137 ccattcttccatgggtatcctagttgtc 164  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8433076 - 8432942
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8433076 agaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatatacttatgtggc 8432977  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccatt 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8432976 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Original strand, 15925101 - 15925255
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15925101 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtagc 15925200  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  15925201 taatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 12842124 - 12842257
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12842124 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgtgtttatgtggc 12842223  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccat 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12842224 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 39103070 - 39103216
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  39103070 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 39103158  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39103159 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 152
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229793
Alignment:
Q  34 caatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  134 ccaccattcttccatgggt 152  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Original strand, 42899936 - 42900039
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42899936 agaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgcgcttatgtggc 42900035  T
Q  107 taat 110  Q
    ||||    
T  42900036 taat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 41172479 - 41172605
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41172479 agaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41172578  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41172579 taatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447631
Alignment:
Q  60 gggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctag 159  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  160 ttgtcaccat 169  Q
    ||||||||||    
T  447640 ttgtcaccat 447631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21735047 - 21734900
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  21735047 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 21734959  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21734958 atgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35158199 - 35158049
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| |    
T  35158199 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgac 35158111  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  35158110 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 35158049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 29687062 - 29687212
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  29687062 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 29687150  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29687151 taatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 29687212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 145303 - 145450
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| ||||           |||||||||||||    
T  145303 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gtgcttatgtggc 145391  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  145392 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19428575 - 19428425
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  19428575 agaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 19428487  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19428486 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 19428425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28641441 - 28641291
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || || || |||||||||    
T  28641441 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgtttatgtggc 28641353  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28641352 taatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28641291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13543773 - 13543624
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  13543773 agaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 13543685  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13543684 taatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27765011 - 27764863
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  27765011 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 27764923  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27764922 taatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 4258511 - 4258661
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  4258511 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 4258598  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  4258599 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcaccat 4258661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 44481851 - 44481998
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  44481851 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 44481939  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  44481940 aagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12333644 - 12333496
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  12333644 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgtgcttatgtggc 12333556  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  12333555 taatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacca 12333496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 27331319 - 27331472
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||| |       || | |||||||||||||||    
T  27331319 agaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa-------tatatatgtgcttatgtggc 27331411  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  27331412 taatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39301346 - 39301197
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||| || |    
T  39301346 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatatgac 39301258  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39301257 taatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43899117 - 43898969
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  43899117 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 43899029  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  43899028 atgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 43898969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42444152 - 42444014
Alignment:
Q  260 tatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgagannnnnnnatgttttctcataggaaatataca 359  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||    
T  42444152 tatatgttaaaaaataatgttaccaaagcaatagtaaggtaagacatatatatagaccaccgaatgagatgtttgtatgatttctcatagaaaatataca 42444053  T
Q  360 gcacaagcaaaatttgtcattttctattgaatctaaatt 398  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  42444052 gcagaggcaagatttgtcattttctgttggatccaaatt 42444014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  57 gtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaa 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 12827145 - 12827223
Alignment:
Q  68 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttcca 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12827145 atagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 34249286 - 34249435
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||| |||           |||||||||||| |    
T  34249286 agaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtgac 34249374  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34249375 taatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 167
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711803
Alignment:
Q  17 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatat 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||| ||||||||| |||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  117 tggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 12730082 - 12730231
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||           |||| ||||||||||||| |    
T  12730082 agaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgtgcttatgtgac 12730170  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  12730171 taatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28566847 - 28566703
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| |    
T  28566847 agaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgac 28566759  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 162  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  28566758 taatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 35126806 - 35126945
Alignment:
Q  12 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||    
T  35126806 ggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatg 35126894  T
Q  112 tatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 162  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||    
T  35126895 tttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2688878 - 2688729
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||| | || || ||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  2688878 agaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 2688790  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2688789 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 65
Target Start/End: Original strand, 12814635 - 12814693
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtca 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12814635 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 43356120 - 43356267
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  43356120 agaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 43356205  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| | |||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  43356206 taatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2000486 - 2000339
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||           |||| ||||||||| |||||    
T  2000486 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca-----------taaatatgtgcttacgtggc 2000398  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    | || | |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2000397 tcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 3266317 - 3266387
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||    
T  3266317 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 40544225 - 40544155
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatg 77  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  40544225 agaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Original strand, 30545842 - 30545917
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatac 82  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30545842 agaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 8056647 - 8056779
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||| || || ||||||||||           || ||| |||||||| ||    
T  8056647 agaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg-----------aatatgcgcttatgtagc 8056735  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 150  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  8056736 taatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38985426 - 38985342
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaa 92  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |   ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38985426 agaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 328
Target Start/End: Original strand, 10589562 - 10589610
Alignment:
Q  280 taccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaatgaga 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  10589562 taccaaagcaatggtgaggtaagacacatatttagaccatcaaatgaga 10589610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 3266404 - 3266455
Alignment:
Q  114 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3266404 tattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Original strand, 42900772 - 42900835
Alignment:
Q  101 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42900772 tgtggctaatgtat--tggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacc 42900835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17799349 - 17799296
Alignment:
Q  64 caaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799349 caaaatagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40544138 - 40544084
Alignment:
Q  114 tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  40544138 tattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 40544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11293 - 11132
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11293 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 11194  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11193 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 11132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 47257815 - 47257975
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257815 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 47257914  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47257915 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28048552 - 28048390
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048552 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 28048453  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28048452 taatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 28048390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38416882 - 38416724
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38416882 aatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggcta 38416783  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38416782 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47809757 - 47809587
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47809757 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 47809658  T
Q  107 taatgtatattggtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttt 176  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  47809657 taatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatttt 47809587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7855274 - 7855114
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855274 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 7855175  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7855174 taatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40131119 - 40130959
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131119 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 40131020  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40131019 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 49330059 - 49330219
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330059 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 49330158  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49330159 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 24100305 - 24100467
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24100305 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgcttatgtggc 24100403  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24100404 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatt 24100467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 51170193 - 51170034
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51170193 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 51170094  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51170093 taatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 22399119 - 22399280
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22399119 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaaatgtgcttatgtagc 22399217  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22399218 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 22399280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 40643822 - 40643984
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40643822 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgtgcttatgtggc 40643921  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40643922 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 40643984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 41464374 - 41464535
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464374 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 41464473  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41464474 taatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacca 41464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39634731 - 39634572
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634731 agaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 39634633  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39634632 taatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43612207 - 43612047
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43612207 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 43612108  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43612107 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 48609745 - 48609903
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609745 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 48609844  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48609845 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48739391 - 48739233
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48739391 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggtta 48739292  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48739291 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 52628976 - 52629136
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52628976 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 52629075  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52629076 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 52629136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29625987 - 29625827
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29625987 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggt 29625888  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  29625887 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacc 29625827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32234557 - 32234398
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32234557 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgcttatgtggc 32234459  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32234458 taatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 40419857 - 40420017
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419857 agaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 40419956  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40419957 taatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 42291864 - 42292024
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42291864 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgtacttatgtggc 42291963  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42291964 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126168
Alignment:
Q  8 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 55453404 - 55453245
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55453404 agaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 55453305  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  55453304 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 2666022 - 2666182
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2666022 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgtgcttatgtggc 2666121  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2666122 taatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27067138 - 27066978
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27067138 agaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggc 27067039  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27067038 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35748471 - 35748311
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35748471 agaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggc 35748372  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35748371 taatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 44222857 - 44223012
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44222857 gtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgt 44222956  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44222957 gtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 37313421 - 37313582
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37313421 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggc 37313520  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  37313521 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacca 37313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 37324563 - 37324723
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  37324563 agaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatatttatgtggc 37324662  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37324663 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40804670 - 40804510
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40804670 agaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 40804571  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40804570 taatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 46134380 - 46134540
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46134380 aatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 46134479  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  46134480 atgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccat 46134540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51102538 - 51102378
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  51102538 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtatttatgtggc 51102439  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  51102438 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7755466 - 7755307
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7755466 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaaatgtgcttatgtggc 7755368  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7755367 taatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20754553 - 20754393
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20754553 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgtttatgtggc 20754454  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20754453 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 35594143 - 35594299
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35594143 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtggc 35594242  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgt 163  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35594243 taatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 43021736 - 43021896
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtgggg-tcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  43021736 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtag 43021835  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  43021836 ctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 43125853 - 43126012
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43125853 agaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 43125952  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||    
T  43125953 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 44806706 - 44806866
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806706 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 44806805  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| | |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44806806 taatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51452910 - 51452751
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51452910 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 51452811  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  51452810 taatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 43183934 - 43184092
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43183934 agaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagc 43184033  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43184034 taatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47894980 - 47894822
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47894980 agaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 47894881  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47894880 taatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 52638864 - 52639030
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52638864 agaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttctgtggc 52638963  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttct 173  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52638964 taatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcaccttttct 52639030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 36368961 - 36369105
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36368961 agaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 36369060  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36369061 taatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 52215098 - 52215243
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215098 agaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 52215197  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggt 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52215198 taatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggt 52215243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 39053416 - 39053576
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053416 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 39053515  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||  ||||||||||||    
T  39053516 taatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41293478 - 41293319
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41293478 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaaatgtgcttatgtggc 41293380  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  41293379 taatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53943747 - 53943588
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  53943747 agaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtagc 53943648  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  53943647 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 41732552 - 41732711
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41732552 aatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 41732651  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  41732652 atgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacca 41732711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53832644 - 53832486
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  53832644 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggggcttatgtggc 53832545  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  53832544 taatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 18946925 - 18947085
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18946925 agaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgtgcttatgtgac 18947024  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18947025 taatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 24376595 - 24376730
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376595 agaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 24376694  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 142  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24376695 ttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 51146375 - 51146212
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51146375 agaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgcttatgtggc 51146276  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatt 170  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  51146275 taatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccaccatt 51146212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Original strand, 41216480 - 41216637
Alignment:
Q  10 atggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216480 atggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 41216579  T
Q  110 tgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41216580 tgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5560192 - 5560025
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5560192 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttat 5560093  T
Q  102 gtggc--taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5560092 gtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 46949399 - 46949543
Alignment:
Q  10 atggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46949399 atggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaa 46949498  T
Q  110 tgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatc 155  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46949499 tgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatggatatc 46949543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Original strand, 53637863 - 53637990
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53637863 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 53637962  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacc 134  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53637963 taatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 54159148 - 54159000
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  54159148 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg-- 54159051  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
           ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54159050 -------tattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 48546989 - 48546842
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48546989 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtc-aaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg-- 48546894  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
           ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48546893 -------tattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 167
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864671
Alignment:
Q  45 agcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  145 ccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55000327 - 55000167
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  55000327 agaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 55000239  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttctttttg 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  55000238 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttttctttttg 55000167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  52 tgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggg 151  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  152 tatcctagttgtcacc 167  Q
    || |||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 25641668 - 25641817
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||           ||| |||||||||||||||    
T  25641668 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggc 25641756  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25641757 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 42589852 - 42590001
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  42589852 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 42589940  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  42589941 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34279870 - 34279719
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  34279870 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 34279782  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  34279781 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccat 34279719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38156781 - 38156632
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  38156781 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 38156693  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38156692 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 51415991 - 51416140
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  51415991 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggc 51416079  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51416080 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 54401209 - 54401358
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  54401209 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 54401297  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  54401298 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacc 54401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 54707369 - 54707220
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||    
T  54707369 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggc 54707281  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  54707280 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 55380009 - 55380158
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  55380009 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 55380097  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55380098 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 55380158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 49130602 - 49130746
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||    
T  49130602 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 49130690  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtc 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49130691 atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 37758951 - 37759075
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37758951 agaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttatgtggc 37759050  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaatt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  37759051 taatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 45058907 - 45059052
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||| ||||    
T  45058907 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgttgcta 45058995  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45058996 atgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47511087 - 47510938
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||||    
T  47511087 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggcta 47510999  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47510998 atgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 47510938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 53115471 - 53115623
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||           |    
T  53115471 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaaggtg-----------a 53115559  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccatttc 172  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  53115560 atgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcaccttttc 53115623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 24688142 - 24688285
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||           || ||||| |||||||||||||||    
T  24688142 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgtttatgtggctaatgt 24688230  T
Q  113 atattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
     || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24688231 ctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 25353578 - 25353725
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  25353578 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 25353666  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25353667 atgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39141275 - 39141125
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| ||         | |||||||||||||||    
T  39141275 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---------atatgtgcttatgtggc 39141185  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  39141184 taatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacc 39141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 37028745 - 37028895
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||| |||           |||| |||||||||    
T  37028745 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggc 37028833  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37028834 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 37028895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31286942 - 31286793
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  31286942 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 31286854  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  31286853 taatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41635949 - 41635800
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  41635949 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 41635861  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41635860 taatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Original strand, 51143841 - 51143987
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  51143841 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 51143929  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  51143930 atgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30251648 - 30251501
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  30251648 aatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 30251560  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30251559 atgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182127
Alignment:
Q  34 caatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgt 47182127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51224186 - 51224038
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| |    
T  51224186 agaatggtgggtaatttacccaccaac-aataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgac 51224099  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  51224098 taatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17665673 - 17665549
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || || |||||||||||     
T  17665673 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggt 17665585  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattc 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665584 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 40022096 - 40022240
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||           || |||||||||||||||    
T  40022096 agaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggc 40022184  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttg 162  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022185 taatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42998936 - 42998790
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           |    
T  42998936 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 42998848  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  42998847 atgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50732061 - 50731913
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||  |||           |    
T  50732061 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggtg-----------a 50731973  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50731972 atgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 50780795 - 50780943
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||  |||           |    
T  50780795 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaacggtg-----------a 50780883  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50780884 atgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756065
Alignment:
Q  13 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat-- 110  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||||      
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  111 --gtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
      || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 52756065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 40165682 - 40165824
Alignment:
Q  16 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtata 115  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||    
T  40165682 ggtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttta 40165770  T
Q  116 ttggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40165771 ttggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcaccat 40165824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41882138 - 41882063
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41882138 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534007
Alignment:
Q  92 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44946078 - 44945935
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||                 || |||||||||||||||    
T  44946078 agaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag-----------------aatatgtgcttatgtggc 44945996  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44945995 taatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 47402898 - 47402810
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47402898 agaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaatgtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 48726147 - 48726070
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  48726147 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21597295 - 21597148
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| |||           |    
T  21597295 aatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg-----------a 21597207  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||    
T  21597206 atgtttattggtttgggtaaattatccactatttttccatgggtactttagttgtcacc 21597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609178
Alignment:
Q  16 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43176885 - 43176738
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||| | ||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||                
T  43176885 aatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtgg----------- 43176797  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43176796 atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2228082 - 2227995
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  2228082 aatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429227
Alignment:
Q  80 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 28576254 - 28576184
Alignment:
Q  14 tgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 84  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28576254 tgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 8847796 - 8847718
Alignment:
Q  18 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtg 96  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8847796 taatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 177185 - 177332
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||| | |||||||| |||| ||| || |||||||| || |||||| |||           |    
T  177185 aatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaacctaaaaaggtg-----------a 177273  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  177274 atgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 177332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752284
Alignment:
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtcac 48752284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  115 attggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 48752109 - 48752161
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggg 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||    
T  48752109 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 37
Target Start/End: Original strand, 37741457 - 37741487
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37741457 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882011
Alignment:
Q  125 gtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacc 41882011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 52434163 - 52434216
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggg 61  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  52434163 aatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434344
Alignment:
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagtt 161  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccctagtt 52434344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 166
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  126 taaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcac 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39716 - 39556
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39716 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggt 39617  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39616 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13922 - 13762
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13922 agaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 13823  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13822 taatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 1893 - 2052
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1893 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggcta 1992  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1993 atgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 176676 - 176836
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  176676 agaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtacttatgtggc 176775  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  176776 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 278028 - 278190
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc--acttaaaaatgtgcttatgtg 104  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  278028 agaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaatgtgtttatgtg 278127  T
Q  105 gctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  278128 gctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 75404 - 75244
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  75404 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgtgtttatgtggc 75305  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  75304 taatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2592 - 2431
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2592 agaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 2493  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2492 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacca 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19014 - 18854
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19014 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgac 18915  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||||| |||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18914 taatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Original strand, 32583 - 32715
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  32583 agaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtggt 32682  T
Q  107 taatgtatattggttggggtaaattacccacca 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32683 taatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4595
Alignment:
Q  27 caccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  127 aaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 3133 - 3261
Alignment:
Q  39 aaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccacc 138  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3133 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 3232  T
Q  139 attcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  3233 attcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 14768 - 14916
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||           |    
T  14768 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg-----------a 14856  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14857 atgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7263
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||    
T  7112 agaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgg 7200  T
Q  106 ctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7201 ccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20624 - 20477
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||           |    
T  20624 aatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg-----------a 20536  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20535 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4702 - 4553
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||               
T  4702 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaaggtg----------- 4614  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4613 aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 3416 - 3565
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||               
T  3416 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaaggtg----------- 3504  T
Q  108 aatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    |||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3505 aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 126 - 273
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||           |    
T  126 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg-----------a 214  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 168  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  215 atgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 324
Target Start/End: Original strand, 3881 - 3945
Alignment:
Q  260 tatatattaaaaaacaatgttaccaaagcaatggtgaggtaagacacatatatagaccaccgaat 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3881 tatatattaaaaaataatgttaccaaagcaatagtaaggtaaggcacatatatagaccaccgaat 3945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 17930 - 18043
Alignment:
Q  9 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||||| || ||| ||||           |||||||||||||||    
T  17930 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac-----------gtgcttatgtggcta 18018  T
Q  109 atgtatattggttggggtaaattac 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18019 atgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Original strand, 19239 - 19327
Alignment:
Q  7 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtca----aaatagttcatggataccacttaaaa 91  Q
    |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||    
T  19239 agaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University