View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5786-Insertion-3 (Length: 790)

Name: NF5786-Insertion-3
Description: NF5786
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5786-Insertion-3
NF5786-Insertion-3
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (469-790)||(23673345-23673667)
chr2 (468-790)||(36326849-36327172)
chr2 (469-765)||(32575685-32575984)
chr2 (467-790)||(16294821-16295145)
chr2 (469-790)||(13709993-13710315)
chr2 (469-790)||(31528311-31528635)
chr2 (539-790)||(31626472-31626726)
chr2 (475-765)||(40017924-40018218)
chr2 (469-564)||(24384925-24385022)
chr2 (469-610)||(29435969-29436113)
chr2 (469-610)||(38315801-38315944)
chr2 (469-607)||(32074156-32074297)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (477-790)||(19664674-19664987)
chr6 (477-790)||(15534979-15535292)
chr6 (469-733)||(32427281-32427544)
chr6 (469-790)||(14790541-14790864)
chr6 (469-790)||(14795569-14795892)
chr6 (467-790)||(1838397-1838722)
chr6 (477-709)||(15540574-15540806)
chr6 (468-738)||(27649077-27649347)
chr6 (573-790)||(20527266-20527486)
chr6 (569-766)||(16883622-16883820)
chr6 (633-790)||(32704420-32704577)
chr6 (469-790)||(13017189-13017513)
chr6 (569-790)||(12980594-12980814)
chr6 (469-790)||(22221646-22221967)
chr6 (469-790)||(22247481-22247802)
chr6 (569-790)||(12983481-12983701)
chr6 (618-790)||(30978360-30978535)
chr6 (673-774)||(7769594-7769695)
chr6 (5-102)||(11195354-11195451)
chr6 (469-610)||(11410983-11411127)
chr6 (5-102)||(11154907-11155004)
chr6 (569-668)||(11183937-11184037)
chr6 (517-610)||(35026936-35027030)
chr6 (732-772)||(15540529-15540569)
chr6 (469-560)||(28974136-28974230)
chr6 (466-610)||(33678938-33679087)
chr6 (194-236)||(11212919-11212961)
chr6 (194-236)||(11279788-11279830)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (477-790)||(26062698-26063016)
chr4 (469-790)||(2541807-2542128)
chr4 (469-790)||(647203-647526)
chr4 (469-790)||(650475-650798)
chr4 (665-790)||(26060510-26060635)
chr4 (469-790)||(12171905-12172218)
chr4 (467-610)||(15851393-15851539)
chr4 (660-724)||(11649426-11649490)
chr4 (469-577)||(19929134-19929242)
chr4 (484-550)||(21217350-21217416)
chr4 (469-585)||(33400075-33400192)
chr4 (467-602)||(2210869-2211004)
chr4 (561-668)||(11649296-11649405)
chr4 (529-610)||(13979355-13979437)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (469-790)||(13495910-13496232)
chr1 (469-790)||(39546165-39546486)
chr1 (469-790)||(13493185-13493508)
chr1 (469-790)||(10764842-10765165)
chr1 (569-790)||(34066267-34066489)
chr1 (469-790)||(32505857-32506177)
chr1 (477-790)||(16190187-16190501)
chr1 (470-790)||(1936549-1936873)
chr1 (544-790)||(27282183-27282430)
chr1 (482-790)||(15297255-15297559)
chr1 (569-790)||(21153178-21153400)
chr1 (569-790)||(22456594-22456814)
chr1 (569-786)||(49147825-49148042)
chr1 (469-610)||(34552438-34552582)
chr1 (469-610)||(49716591-49716735)
chr1 (472-610)||(49720073-49720214)
chr1 (569-668)||(8435280-8435380)
chr1 (469-610)||(6206101-6206245)
chr1 (479-556)||(18392669-18392747)
chr1 (469-557)||(50196715-50196804)
chr1 (747-790)||(22453415-22453458)
chr1 (740-790)||(23990361-23990411)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (468-790)||(14616428-14616751)
chr5 (467-788)||(7649940-7650262)
chr5 (469-790)||(34405771-34406094)
chr5 (458-790)||(22159667-22160003)
chr5 (472-790)||(33575011-33575331)
chr5 (469-790)||(15532200-15532524)
chr5 (471-790)||(15542384-15542706)
chr5 (471-725)||(11988864-11989125)
chr5 (641-790)||(26712516-26712665)
chr5 (641-790)||(26982254-26982403)
chr5 (469-604)||(21680585-21680721)
chr5 (469-610)||(2499762-2499905)
chr5 (469-585)||(33921343-33921459)
chr5 (476-603)||(1810197-1810326)
chr5 (469-573)||(26711464-26711567)
chr5 (469-573)||(26981201-26981304)
chr5 (477-559)||(36330992-36331074)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (469-790)||(36842937-36843260)
chr7 (469-788)||(6967072-6967393)
chr7 (469-790)||(17866353-17866676)
chr7 (469-756)||(9765758-9766046)
chr7 (469-790)||(24783331-24783654)
chr7 (468-790)||(3861906-3862221)
chr7 (633-790)||(17863260-17863417)
chr7 (569-789)||(23313361-23313582)
chr7 (469-790)||(294787-295106)
chr7 (568-765)||(23107935-23108133)
chr7 (525-790)||(46846367-46846635)
chr7 (475-790)||(11279414-11279730)
chr7 (469-789)||(23759609-23759931)
chr7 (539-790)||(36222378-36222631)
chr7 (467-790)||(33312917-33313241)
chr7 (469-610)||(3540924-3541065)
chr7 (468-579)||(17857879-17857991)
chr7 (469-610)||(38431614-38431757)
chr7 (478-612)||(28577687-28577820)
chr7 (476-610)||(6964508-6964644)
chr7 (569-610)||(16547225-16547267)
chr7 (569-610)||(16618395-16618437)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (469-788)||(12575300-12575620)
chr8 (469-733)||(14418445-14418707)
chr8 (634-789)||(13096945-13097099)
chr8 (573-790)||(41778847-41779064)
chr8 (648-763)||(44008245-44008360)
chr8 (469-610)||(39659712-39659856)
chr8 (469-610)||(9467286-9467429)
chr8 (660-724)||(41836415-41836479)
chr8 (469-610)||(453807-453951)
chr8 (492-610)||(13332308-13332429)
chr8 (561-668)||(41836285-41836394)
chr8 (661-700)||(14418396-14418435)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (469-790)||(13979409-13979730)
chr3 (469-790)||(22626312-22626634)
chr3 (469-612)||(46731556-46731699)
chr3 (648-790)||(46731417-46731559)
chr3 (469-790)||(39563510-39563833)
chr3 (469-790)||(11138570-11138892)
chr3 (526-790)||(35366299-35366562)
chr3 (469-663)||(20536333-20536530)
chr3 (469-585)||(19869226-19869343)
chr3 (468-610)||(27055092-27055237)
chr3 (520-766)||(47412129-47412368)
chr3 (469-602)||(25492128-25492263)
chr3 (475-607)||(46542550-46542683)
chr3 (569-668)||(50096825-50096925)
chr3 (469-560)||(26822039-26822130)
chr3 (469-533)||(3306147-3306213)
chr3 (469-533)||(18883509-18883575)
chr3 (469-533)||(30157797-30157863)
chr3 (574-610)||(36036817-36036854)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (469-733)||(11-273)
scaffold0363 (661-700)||(283-322)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (477-790)||(2627-2926)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (652-790)||(5995-6133)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (469-790)||(9785-10109)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (469-790)||(24185-24506)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (648-790)||(7173-7315)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (648-765)||(2641-2758)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (469-610)||(19509-19653)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (469-604)||(33730-33866)
[»] scaffold0766 (1 HSPs)
scaffold0766 (478-607)||(3613-3739)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (469-512)||(10253-10296)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 23673345 - 23673667
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  23673345 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaa 23673444  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673445 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 23673544  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23673545 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaa 23673644  T
Q  768 agtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  23673645 agtaattctacccaatctcttga 23673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 468 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 36327172 - 36326849
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36327172 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatca 36327073  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36327072 aaaaagatgtattaaattcaaagttgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 36326973  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36326972 gagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagattaaca 36326873  T
Q  767 aagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  36326872 aagtaattctacccaatctcttga 36326849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 469 - 765
Target Start/End: Original strand, 32575685 - 32575984
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |     
T  32575685 tgatagatatttggcaagtgaaccaacactattgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcaacgatttcgttataat 32575784  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  32575785 aaatgatgtattaaattcaattgttaccctaggcagttggatt-gtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 32575883  T
Q  667 g--agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32575884 gaaagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaa 32575983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 467 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 16295145 - 16294821
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16295145 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcaaatccacgaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatc 16295046  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaat 662  Q
     ||| |||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||  |||||| |||||||| |||  |||| || ||||| |||||||    
T  16295045 gaaa-ggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgat-tttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaat 16294948  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16294947 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagatt 16294849  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  16294848 aacttagtaattctacccaatctcttga 16294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13710315 - 13709993
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13710315 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 13710218  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| ||||| |   |  ||||  ||| |||||  |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  13710217 aaaaggatgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttg--agttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattt 13710120  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa-gttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13710119 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagatta 13710020  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||||||| || || |||||||||    
T  13710019 acaaagtaattctacccgatctcttga 13709993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31528311
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 31528537  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 662  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  31528536 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 31528439  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 761  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31528438 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 31528340  T
Q  762 taacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  31528339 taacttagtaattctacccaatctcttga 31528311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 539 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 31626726 - 31626472
Alignment:
Q  539 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--a 634  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||| ||| |  |    
T  31626726 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaaaggaattaa 31626628  T
Q  635 aaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 734  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31626627 aaataataaaggattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaat 31626528  T
Q  735 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  31626527 caattattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 31626472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 40018218 - 40017924
Alignment:
Q  475 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 573  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |   |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||    
T  40018218 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttattaaaaagg 40018120  T
Q  574 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagaga 670  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||| | ||||||    
T  40018119 atgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagaga 40018022  T
Q  671 tgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatct---agtttaacgacagattaac 765  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  40018021 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaac 40017924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 469 - 564
Target Start/End: Original strand, 24384925 - 24385022
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttta 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24384925 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaataaaattaaattcgtattcacgatgactgttattaatttctacttagcaatttcttta 24385022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29436113 - 29435969
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  29436113 tgatagataattgacaagtgtatcaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 29436014  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| ||||||  |  |||||| |||||||||||||||    
T  29436013 taaaggatgtagtaaattttatgggttgcactaggcagttggatt 29435969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 38315801 - 38315944
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  38315801 tgataaatatttggtaagtgtatcaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaa-ttctacttagcaagttcgttaaaat 38315899  T
Q  569 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     ||||||||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||    
T  38315900 taaggatgtagtaaattttacggggttgtcctaggcagttggatt 38315944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 607
Target Start/End: Original strand, 32074156 - 32074297
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||| ||||| |   |||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  32074156 tgatagatatttgacaagtataccaaaattatcgaagtaataataataaatttgtatccacgatggttgttgttaatttctacttagaaatttcattaat 32074255  T
Q  567 aaaaaggatgtatt-aaattcaaggttgccctaggcagttgg 607  Q
      |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32074256 gtaaaggatgtattaaaattgtgggttgccctaggcagttgg 32074297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 477 - 790
Target Start/End: Original strand, 19664674 - 19664987
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19664674 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgtttatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggatg 19664773  T
Q  577 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19664774 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttaagaaaattagagagatgtat 19664873  T
Q  676 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |     
T  19664874 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctag-ttcacgacagattaacaaagtaactc 19664972  T
Q  776 tatccaatctcttga 790  Q
    || ||||| ||||||    
T  19664973 tacccaatatcttga 19664987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 477 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 15535292 - 15534979
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 576  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15535292 atttcgcatgtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatg 15535193  T
Q  577 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15535192 tattaaattcaaggttgccctaggcagttgagttgat-tttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggttttacaaaattaaagtgatgtat 15535094  T
Q  676 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 775  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  15535093 ggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactc 15534994  T
Q  776 tatccaatctcttga 790  Q
    || ||||||||||||    
T  15534993 taaccaatctcttga 15534979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 469 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 32427544 - 32427281
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32427544 tgatagatatttggtaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatctacgaggaccgttgttaa-ttctactcagcaatttctttatcaa 32427446  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32427445 aaaagatgtattaaattcaaggttgccctag-cagttggattggtatttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggttttagaaaattagag 32427347  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 733  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32427346 agatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790541
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14790765  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14790764 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14790667  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790666 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14790567  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14790566 caaagtaattctacccaatctcttga 14790541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 14795892 - 14795569
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14795892 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14795793  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14795792 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14795695  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795694 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14795595  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14795594 caaagtaattctacccaatctcttga 14795569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 467 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 1838722 - 1838397
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1838722 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 1838623  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaagg---ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 663  Q
    ||||||||||||| || ||  |     ||  ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||| |||    
T  1838622 aaaaaggatgtataaatttatattgatttttcctagacagttggattggtttttataaagtaaacgtaataaaagaataaaagttggttttaagaatatt 1838523  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1838522 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctat-gtaattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagatta 1838424  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||    
T  1838423 acaaagtaactctacccaatctcttga 1838397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 477 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 15540806 - 15540574
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15540806 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtaaccaatcggaccattgttaacttctactcagcaatttctatatcaaaaaggatg 15540707  T
Q  577 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 675  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  15540706 tattaaattcaaggtttccctaggcagttgagttgat-tttctaaaataaagggattaaaaacaataaaagtttagttttagaaaattaaagagatttat 15540608  T
Q  676 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15540607 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 15540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 468 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 27649347 - 27649077
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||     
T  27649347 atgatagagatttggcaagtgaactaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccacgaggaccgttgttaattcctactcagcaatttctttctcg 27649248  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |  | |||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27649247 aaa-ggatgcattaaatttttggtcgccctaggcagttggattggtttttataacataaacgtagatgaaacaataaaagttggttttaagaaaattaga 27649149  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaat 738  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  27649148 gcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 573 - 790
Target Start/End: Original strand, 20527266 - 20527486
Alignment:
Q  573 gatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacgga--ttaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagag 669  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||  |||||  |  | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||    
T  20527266 gatgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagttggttttaagaatattagagag 20527365  T
Q  670 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 769  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  20527366 aagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaat 20527465  T
Q  770 taattttatccaatctcttga 790  Q
    ||| |||| ||||||||||||    
T  20527466 taactttacccaatctcttga 20527486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 569 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 16883820 - 16883622
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16883820 aaaggatgtattaaattcaagggttccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 16883721  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  16883720 agaagtatggttaagacattcgaatccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaaca 16883622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 633 - 790
Target Start/End: Original strand, 32704420 - 32704577
Alignment:
Q  633 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 732  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32704420 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 32704519  T
Q  733 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  32704520 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttga 32704577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 13017189 - 13017513
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13017189 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattatta 13017287  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 662  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  13017288 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaat 13017385  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 761  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  13017386 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggat 13017484  T
Q  762 taacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  13017485 taacttagtaattctacccaatctcttga 13017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 569 - 790
Target Start/End: Original strand, 12980594 - 12980814
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattc-aaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||||||| |    
T  12980594 aaaggatgtattaaattctaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttct-gaaaattaaa 12980691  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12980692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12980790  T
Q  767 aagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  12980791 aagtaattctacccaatctcttga 12980814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221646
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22221869  T
Q  568 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 663  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22221868 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22221773  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22221772 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22221674  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  22221673 aacttagtaattctacccaatctcttga 22221646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247481
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22247704  T
Q  568 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 663  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22247703 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22247608  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22247607 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22247509  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  22247508 aacttagtaattctacccaatctcttga 22247481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 569 - 790
Target Start/End: Original strand, 12983481 - 12983701
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  12983481 aaaggatgtattaaattcaaatgttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 12983578  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12983579 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtac-ccctattcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12983677  T
Q  767 aagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  12983678 aagtaattctacccaatctcttga 12983701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 618 - 790
Target Start/End: Original strand, 30978360 - 30978535
Alignment:
Q  618 gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggta 714  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30978360 gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggta 30978458  T
Q  715 atttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  30978459 atttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttga 30978535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 673 - 774
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769695
Alignment:
Q  673 tatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  773 tt 774  Q
    ||    
T  7769694 tt 7769695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11195451 - 11195354
Alignment:
Q  5 caactatatgataatttgttcggtgtccttacagatgtatacgagttctgtatatatgttaagattcatgattttcctctttgcaacttgcttaatat 102  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11195451 caactatatgataatttattcaacgtgcttacaaatgtatatgacttctgtatatatgttaagattaatcttttccctctttgcaacttgcttaatat 11195354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11411127 - 11410983
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  11411127 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgagtaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 11411028  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||| ||||    
T  11411027 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttcgatt 11410983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11155004 - 11154907
Alignment:
Q  5 caactatatgataatttgttcggtgtccttacagatgtatacgagttctgtatatatgttaagattcatgattttcctctttgcaacttgcttaatat 102  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| | ||||||| || |||||||||||||| ||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11155004 caactatatgataatttgttcaacgtgcttataaatgtatatgacttctgtatatatgtcaaggttaatcttttccctctttgcaacttgcttaatat 11154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 668
Target Start/End: Original strand, 11183937 - 11184037
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11183937 aaaggatgtattaaattcaagagttccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 11184036  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  11184037 a 11184037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 610
Target Start/End: Original strand, 35026936 - 35027030
Alignment:
Q  517 ttcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35026936 ttcgtatccacaaggaacgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 35027030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 732 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 15540569 - 15540529
Alignment:
Q  732 aatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 772  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15540569 aatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaa 15540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 469 - 560
Target Start/End: Original strand, 28974136 - 28974230
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtg-aaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 560  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||| ||||||||  ||||||||  || |||||||||||||    
T  28974136 tgatagatatttggcaagtgtatccaaaactatcgaagtaataataataaatctgtatccacgaggattgttgttaatgtcaacttagcaatttc 28974230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 466 - 610
Target Start/End: Original strand, 33678938 - 33679087
Alignment:
Q  466 gaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa---ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctt 562  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| ||   || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |    
T  33678938 gaatgataaatatttggcaagtgtaccaaaaaaactatcgaagtagtactaaagttcatatccacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttagt 33679037  T
Q  563 tatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctagg-cagttggatt 610  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  33679038 taaaataaaggatgtatgaaatttatgggttgccctaggacagttggatt 33679087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Original strand, 11212919 - 11212961
Alignment:
Q  194 catcgaaaaccacatcaaacgagcattttcaccgattactcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11212919 catcgaaaaccacatcaaacgtgcattttaaccaattactcat 11212961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 236
Target Start/End: Original strand, 11279788 - 11279830
Alignment:
Q  194 catcgaaaaccacatcaaacgagcattttcaccgattactcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11279788 catcgaaaaccacatcaaacgtgcattttaaccaattactcat 11279830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 477 - 790
Target Start/End: Original strand, 26062698 - 26063016
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggacc--gttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26062698 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaaataataaataaattcgtatccacgaggaccccgttgttaacttctactcaacaatttctttatcaaaaagga 26062797  T
Q  575 tgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag--agat 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26062798 tgtattaaattcaaggttgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagagat 26062897  T
Q  672 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 771  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26062898 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 26062997  T
Q  772 attttatccaatctcttga 790  Q
    | | || ||||||||||||    
T  26062998 actctacccaatctcttga 26063016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541807
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattatta 2542030  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttta-gaaaattag 665  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||  ||||||||     
T  2542029 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 2541930  T
Q  666 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 765  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2541929 agag--gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 2541832  T
Q  766 aaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2541831 aaagtaattttatccaatctcttga 2541807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 647203 - 647526
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  647203 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 647302  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  647303 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 647400  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647401 gagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 647500  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  647501 caaagtaattctacccaatctcttga 647526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 650475 - 650798
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  650475 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctatatca 650574  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  650575 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcataatatta 650672  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650673 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 650772  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  650773 caaagtaattctacccaatctcttga 650798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 665 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 26060635 - 26060510
Alignment:
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  26060635 gagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaa 26060536  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| | || ||||||||||||    
T  26060535 caaagtaactctacccaatctcttga 26060510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171905
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 12172119  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttt-tagaaaatt 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||        
T  12172118 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa---- 12172025  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
            ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12172024 --------gtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 12171933  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  12171932 aacttagtaattctacccaatctcttga 12171905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 467 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15851539 - 15851393
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||      
T  15851539 aatgataaagatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaatagtaaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaa 15851440  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    | |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  15851439 ataaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggctgttggatt 15851393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 660 - 724
Target Start/End: Original strand, 11649426 - 11649490
Alignment:
Q  660 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 724  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11649426 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 19929242 - 19929134
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaataaat-tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |    
T  19929242 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa-taaatatcgt-tccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttctttgac 19929145  T
Q  567 aaaaaggatgt 577  Q
    | |||||||||    
T  19929144 ataaaggatgt 19929134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 484 - 550
Target Start/End: Original strand, 21217350 - 21217416
Alignment:
Q  484 aagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctact 550  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21217350 aagtgtactaaaactatcaaagtaataataaaattcgtattcacgaggaccgttattaatttctact 21217416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 585
Target Start/End: Original strand, 33400075 - 33400192
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  33400075 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaggtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctgcttagcaagttcgttaaaa 33400174  T
Q  568 aaaaggatgtattaaatt 585  Q
     |||||||||| ||||||    
T  33400175 taaaggatgtaataaatt 33400192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 467 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 2211004 - 2210869
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    |||||||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||      
T  2211004 aatgatagatattcagcaagtgtaaataaactatcaaagtaataataaaattcatatccacgagaaccgttgttgaattctactcaacaatttcgttaat 2210905  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggca 602  Q
      ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  2210904 ttaaaggatatattaaattgggggtggccctaggca 2210869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 668
Target Start/End: Original strand, 11649296 - 11649405
Alignment:
Q  561 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 657  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11649296 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 11649394  T
Q  658 aaaattagaga 668  Q
    |||||| ||||    
T  11649395 aaaatttgaga 11649405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 529 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13979437 - 13979355
Alignment:
Q  529 aggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||  || |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  13979437 aggaccgttgttaattcctacttagcaagttcgttgacataaaggatgtagtaaatttatgggttaccctaggcagttggatt 13979355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13496232 - 13495910
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13496232 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaa 13496133  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattag 665  Q
    ||||||||||| || ||  |  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| |||||    
T  13496132 aaaggatgtataaatttatattgattgtcctaggcagttgaattgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattag 13496035  T
Q  666 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 765  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13496034 agagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaag 13495935  T
Q  766 aaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  13495934 aaagtaattatatccaatctcttga 13495910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 39546486 - 39546165
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  39546486 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattattgaagtaataaataagatcgtat-cacgaggaccattgttaacttttactcagcaatttcattatcga 39546388  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaa-attag 665  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  39546387 aa-ggatgtattaaattcaattgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaaacaataaaagtt-ggttttaaaaatattag 39546290  T
Q  666 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 765  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39546289 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaac 39546190  T
Q  766 aaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  39546189 aaagtaactctacccaatctcttga 39546165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13493185
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13493409  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  13493408 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 13493311  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493310 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 13493211  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  13493210 caaagtaattctacccaatctcttga 13493185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 10765165 - 10764842
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10765165 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 10765066  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  10765065 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 10764968  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764967 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 10764868  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  10764867 caaagtaattctacccaatctcttga 10764842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 569 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 34066489 - 34066267
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34066489 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 34066390  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 767  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34066389 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaa 34066290  T
Q  768 agtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  34066289 agtaattctacccaatctcttga 34066267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 32505857 - 32506177
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttg----ttaacttctacttagcaatttcttta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||    ||||||||||||   |||||||||||    
T  32505857 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccattgcatgttaacttctactcgacaatttcttta 32505956  T
Q  565 tcaaaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaat 662  Q
    ||||||||||||||| || ||  |  | |||   |||||||||        ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||    
T  32505957 tcaaaaaggatgtataaatttatattgatgcgtgaggcagttgt-------tttctaacataaacgaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatat 32506049  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506050 tatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatt 32506149  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  32506150 aacaaagtaattctacccaatctcttga 32506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 477 - 790
Target Start/End: Original strand, 16190187 - 16190501
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 576  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |   |||   | |||  | ||||||||    
T  16190187 atttgacaagtgaatcaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggactgttgttaatttttattcgacaaaaacgttaaaataaaggatg 16190286  T
Q  577 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 675  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16190287 tattaaattcaatggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaa-gattggttttagaaaattaaagagaagtat 16190385  T
Q  676 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat-t 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  16190386 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatat 16190485  T
Q  775 ttatccaatctcttga 790  Q
     || ||||||||||||    
T  16190486 atacccaatctcttga 16190501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 470 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 1936873 - 1936549
Alignment:
Q  470 gatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||| | | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  1936873 gatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaataa-ttcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaa 1936775  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||    |||||  |||||| || |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1936774 taacgatgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggttttagaaaatta 1936675  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  1936674 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaa 1936575  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| | || | ||||||||||    
T  1936574 caaagtaactctaccaaatctcttga 1936549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 544 - 790
Target Start/End: Original strand, 27282183 - 27282430
Alignment:
Q  544 ttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaat 641  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |  | |||||||||    
T  27282183 ttctactcagcaatttctttataaaaaaa-atgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaatgtaaataaaacaat 27282281  T
Q  642 aaaagtttggtttta-gaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 740  Q
     |||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27282282 taaa-attggttttatgaatattagagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatga 27282380  T
Q  741 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27282381 ttatctagttcaacgaccgattaacaaagtaattctacccaatctcttga 27282430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 482 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 15297559 - 15297255
Alignment:
Q  482 gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtatta 581  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  15297559 gcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaatgaattcatatccacggggaccgttgttaacttctacaaagcaatttcattatc-aaaatgatgtatta 15297461  T
Q  582 aattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggtta 680  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||  || ||||   || ||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||||  |||| |||    
T  15297460 aattcaaggttgccctaagcagttggattagtttttgt--aacaaactatttgaaaacgataaaaacttggttct-ggaaattaaagagaaatatgatta 15297364  T
Q  681 agaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatcc 780  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15297363 agaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcac-cccaattcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctaccc 15297265  T
Q  781 aatctcttga 790  Q
    ||||||||||    
T  15297264 aatctcttga 15297255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 569 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 21153400 - 21153178
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaacaataaaag-tttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||   |||||||||| |||| |||||||||||||| |||      
T  21153400 aaaggatgtattaaatttatggttgccctaggcagttggattagttttttgtaacattaactatttaaaacaatcaaagctttggttttagaaa-ttaat 21153302  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaaca 21153202  T
Q  767 aagtaattttatccaatctcttga 790  Q
     ||||||| ||  |||||||||||    
T  21153201 cagtaattctactcaatctcttga 21153178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 569 - 790
Target Start/End: Original strand, 22456594 - 22456814
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  22456594 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccataggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 22456691  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  22456692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaaca 22456790  T
Q  767 aagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  22456791 aagtaattctacccaatctcttga 22456814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 569 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 49148042 - 49147825
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||     ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||    
T  49148042 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaataaattattttaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaag 49147944  T
Q  668 agatgta-tggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  49147943 agaaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 49147845  T
Q  767 aagtaattttatccaatctc 786  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  49147844 aagtaattctacccaatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 34552438 - 34552582
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |     
T  34552438 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagtttgttaaaat 34552537  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  34552538 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 34552582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 49716735 - 49716591
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  49716735 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 49716636  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  49716635 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttggatt 49716591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 49720214 - 49720073
Alignment:
Q  472 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 570  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||    
T  49720214 tagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataa 49720115  T
Q  571 aggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||| |||| ||||||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  49720114 agggtgtagtaaattttatgggttgccctaggtagttggatt 49720073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8435380 - 8435280
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaac-ggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||   || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8435380 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 8435281  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  8435280 a 8435280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6206245 - 6206101
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||| |||| ||||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  |     
T  6206245 tgataaatatttagcaagtgtactaaaattatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaat 6206146  T
Q  569 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||| ||||||   || |||||||||||| |||| ||||    
T  6206145 aaaggatgtagtaaatttgacagggttgccctaggtagttcgatt 6206101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18392747 - 18392669
Alignment:
Q  479 ttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 556  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392747 ttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 18392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 469 - 557
Target Start/End: Original strand, 50196715 - 50196804
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaat 557  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50196715 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaaactattgaagtaataataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaatctcaacttagcaat 50196804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 747 - 790
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453458
Alignment:
Q  747 agtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttga 22453458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 740 - 790
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990411
Alignment:
Q  740 attatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttga 23990411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 468 - 790
Target Start/End: Original strand, 14616428 - 14616751
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14616428 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14616527  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | || ||||||| |||||  |||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| ||||    
T  14616528 aaaaggatgtatgaatttatattgattaccctaggaagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatatta 14616625  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616626 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14616725  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  14616726 caaagtaattctacccaatctcttga 14616751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 467 - 788
Target Start/End: Original strand, 7649940 - 7650262
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  7649940 aatgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatc 7650039  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 663  Q
    ||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||   ||| |||| |||    
T  7650040 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttg--ttttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgcttttaagaatatt 7650137  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7650138 agagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagatagatta 7650237  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctctt 788  Q
    |||| |||||| ||  |||||||||    
T  7650238 acaaggtaattctactcaatctctt 7650262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 34406094 - 34405771
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  34406094 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 34405995  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  34405994 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 34405897  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405896 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 34405797  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  34405796 caaagtaattctacccaatctcttga 34405771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 458 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 22160003 - 22159667
Alignment:
Q  458 aagatgatgaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 556  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22160003 aagatgaagcatgatagatatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaa 22159905  T
Q  557 tttctttatcaaaaaggatgtat--taaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggt 652  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  ||||||||||||| || | |    
T  22159904 tttctttgtcaaaaaggatgtatattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaaattggtt 22159805  T
Q  653 tttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttta 752  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |    
T  22159804 ttaagaatattagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttca 22159705  T
Q  753 acgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22159704 acgatagattaacaaagtaactctacccaatctcttga 22159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 472 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 33575331 - 33575011
Alignment:
Q  472 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 570  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  33575331 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaa 33575233  T
Q  571 aggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaattaga 666  Q
    ||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||| ||    
T  33575232 aggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-ga 33575136  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 765  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33575135 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 33575036  T
Q  766 aaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
      ||||||| || ||||||||||||    
T  33575035 ttagtaattctacccaatctcttga 33575011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532524
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 15532298  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 662  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  15532299 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 15532396  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 761  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15532397 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 15532495  T
Q  762 taacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  15532496 taacttagtaattctacccaatctcttga 15532524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 471 - 790
Target Start/End: Original strand, 15542384 - 15542706
Alignment:
Q  471 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaa 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15542384 atagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaa 15542482  T
Q  570 aaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaatta 664  Q
    |||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||     
T  15542483 aaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt- 15542579  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15542580 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagatta 15542679  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||    
T  15542680 acttagtaattctacccaatctcttga 15542706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 471 - 725
Target Start/End: Original strand, 11988864 - 11989125
Alignment:
Q  471 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttcta--cttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |    
T  11988864 atagatatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagta 11988962  T
Q  568 aaaaggatgtat--taaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| | | |||||||||||||  |||   ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11988963 ataaggacgtatattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgattttagaaaatta 11989062  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcc--tatggtaatttgcactcc 725  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11989063 gagagaagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcc 11989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 641 - 790
Target Start/End: Original strand, 26712516 - 26712665
Alignment:
Q  641 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 740  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26712516 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26712615  T
Q  741 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26712616 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 26712665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 641 - 790
Target Start/End: Original strand, 26982254 - 26982403
Alignment:
Q  641 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 740  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26982254 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26982353  T
Q  741 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26982354 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttga 26982403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 21680721 - 21680585
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  21680721 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 21680622  T
Q  569 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 604  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21680621 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 21680585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 2499762 - 2499905
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaac-tatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  2499762 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagatatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 2499861  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  2499862 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaagcagttggatt 2499905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 33921459 - 33921343
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33921459 tgatagatattcggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33921360  T
Q  569 aaaggatgtattaaatt 585  Q
     ||||||||||||||||    
T  33921359 taaggatgtattaaatt 33921343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 603
Target Start/End: Original strand, 1810197 - 1810326
Alignment:
Q  476 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 574  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||    
T  1810197 tatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtattcacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaagga 1810296  T
Q  575 tgtattaaattca-aggttgccctaggcag 603  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  1810297 tgtagtaaatttatgggttgccctaggcag 1810326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 573
Target Start/End: Original strand, 26711464 - 26711567
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26711464 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26711561  T
Q  568 aaaagg 573  Q
    ||||||    
T  26711562 aaaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 573
Target Start/End: Original strand, 26981201 - 26981304
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26981201 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26981298  T
Q  568 aaaagg 573  Q
    ||||||    
T  26981299 aaaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 477 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 36331074 - 36330992
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaattt 559  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36331074 atttgacaagtgtacctaatctatcgaagtaataataaaatttgcatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaattt 36330992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 36842937 - 36843260
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  36842937 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataagatcgaatccacaaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatcga 36843036  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaagg--ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggtttta-gaaaatta 664  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  36843037 aa-ggatgtattaaattcaatggtttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttatgaatatta 36843134  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 36843234  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||    
T  36843235 caaattaactctacccaatctcttga 36843260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 469 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6967072
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 6967294  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  6967293 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 6967196  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6967195 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaa 6967096  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctctt 788  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  6967095 caaagtaattctacccaatctctt 6967072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17866676
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 17866452  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||   ||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  17866453 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 17866550  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866551 gagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 17866650  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  17866651 caaagtaattctacccaatctcttga 17866676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 469 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 9766046 - 9765758
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  9766046 tgatagatatttggcaagttaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccataagggccgttgttaatttctactcagcattttctttatcga 9765947  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  9765946 aaaggatgtattaaatttctggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacataaataaaataataaaagttggttttaagaatattagag 9765847  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacga 756  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9765846 agaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacga 9765758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 24783654 - 24783331
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttt-atca 567  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  24783654 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttttatca 24783555  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||| || |||||||||  |||   ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  24783554 aaaaggatgtataaatttatattgattgtccaaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacttaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 24783457  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24783456 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaa 24783357  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  24783356 caaagtaattatacccaatctcttga 24783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 468 - 790
Target Start/End: Original strand, 3861906 - 3862221
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |  | ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  3861906 atgatagatatttggcaagtgtactagagtcaatcgaagtaataaataattt-gtatccacgaggattgttattaacttctacttagcaatttcattatt 3862004  T
Q  567 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattg-gcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3862005 aaaa-ggatgtattaaattcaatgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttataaaatta 3862103  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3862104 gagagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaa 3862195  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  3862196 caaagtaattctacccaatctcttga 3862221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 633 - 790
Target Start/End: Original strand, 17863260 - 17863417
Alignment:
Q  633 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 732  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17863260 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 17863359  T
Q  733 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17863360 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttga 17863417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 569 - 789
Target Start/End: Original strand, 23313361 - 23313582
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23313361 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggttttagaaaattagag 23313460  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 767  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||     
T  23313461 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacac 23313560  T
Q  768 agtaattttatccaatctcttg 789  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  23313561 tgtaactctacccaatctcttg 23313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 295106 - 294787
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  295106 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 295008  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    ||||||||||| |||||| |   |  ||||| ||||||| |  |||   ||||||| |||| | | |||||| |||  || | ||||||||||||||||     
T  295007 aaaaggatgtaataaatttatattgatgcccgaggcagtag--ttgt--tttgtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggttttagaaaatt- 294913  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 764  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  294912 gagagaagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaa 294813  T
Q  765 caaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  294812 caaagtaattatacccaatctcttga 294787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 568 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 23108133 - 23107935
Alignment:
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23108133 aaaaggatgtatttaattcaaggatgtcctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 23108034  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 765  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23108033 gagaaatgtggttaagaccttcgaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaac 23107935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 525 - 790
Target Start/End: Original strand, 46846367 - 46846635
Alignment:
Q  525 cacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaa 622  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||  ||      
T  46846367 cacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttga-attcttatt 46846465  T
Q  623 ataaacggattaaaa--caataaaagtttgg-ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 719  Q
    |||||| || |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846466 ataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttg 46846564  T
Q  720 cactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  46846565 cactcctagttcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattctacccaatctcttga 46846635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 11279730 - 11279414
Alignment:
Q  475 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 573  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  |||| || | ||| |||||  |  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11279730 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aatttgtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaagg 11279633  T
Q  574 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaac--aataaaagtttggttttagaaaattagagag 669  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||| ||||||||   ||||||  || | |||||||| ||| |||||    
T  11279632 atgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagatt-gagag 11279535  T
Q  670 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 769  Q
    | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  11279534 aagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 11279435  T
Q  770 taattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  11279434 taattctacccaatctcttga 11279414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 469 - 789
Target Start/End: Original strand, 23759609 - 23759931
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || | |    
T  23759609 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aagttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatttt-a 23759706  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 662  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  23759707 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 23759804  T
Q  663 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 761  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  23759805 c-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggat 23759903  T
Q  762 taacaaagtaattttatccaatctcttg 789  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  23759904 taacttagtaattctacccaatctcttg 23759931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 539 - 790
Target Start/End: Original strand, 36222378 - 36222631
Alignment:
Q  539 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaa 636  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  36222378 ttaatttctacgtagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttctaacataaactgattaaa 36222476  T
Q  637 a-caataaaagtttggtttt-agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 734  Q
    | |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  36222477 aacaaagaaagattggtttttagaagatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaat 36222575  T
Q  735 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  36222576 caatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaattttacctaatctcttga 36222631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 467 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 33313241 - 33312917
Alignment:
Q  467 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 565  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33313241 aatgatagatatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttctacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattat 33313145  T
Q  566 caaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaa 661  Q
     ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  33313144 taaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggttttagaaaa 33313046  T
Q  662 ttagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 761  Q
    |  ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  33313045 tctgagagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaat 33312946  T
Q  762 taacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| ||||    
T  33312945 taacttagtaattctacccaatcttttga 33312917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 3540924 - 3541065
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |     
T  3540924 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaacttctacttagcaagttcgttaaaat 3541023  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  3541024 aaaggatgtattaatttatgggttgccctaagcagttggatt 3541065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 579
Target Start/End: Original strand, 17857879 - 17857991
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 566  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17857879 atgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaaatagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 17857978  T
Q  567 aaaaaggatgtat 579  Q
    |||||||||||||    
T  17857979 aaaaaggatgtat 17857991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 38431757 - 38431614
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |    
T  38431757 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccatgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttagttaaaa 38431658  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38431657 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 38431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 612
Target Start/End: Original strand, 28577687 - 28577820
Alignment:
Q  478 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 577  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| || ||| |||||    
T  28577687 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagcaataatcaaattcatatctacgaggaccgttgttaacttctactcaataatttcattaacataaa-gatgt 28577785  T
Q  578 attaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 612  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28577786 attaaatttatggttgtcctagacagtttgattgg 28577820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 476 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6964644 - 6964508
Alignment:
Q  476 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 574  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||||||    
T  6964644 tatttggtaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaatgaagttcgtatccacgagggccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 6964545  T
Q  575 tgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  6964544 tgtagtaaatttatgggttgccctaggtagttggatt 6964508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 569 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 16547267 - 16547225
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16547267 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16547225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 569 - 610
Target Start/End: Original strand, 16618395 - 16618437
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16618395 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16618437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 469 - 788
Target Start/End: Original strand, 12575300 - 12575620
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |    
T  12575300 tgataaatatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattatta 12575398  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12575399 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 12575498  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12575499 gagaagtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaaca 12575598  T
Q  767 aagtaattttatccaatctctt 788  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  12575599 aagtaattctacctaatctctt 12575620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 469 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14418707 - 14418445
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14418707 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 14418610  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  14418609 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 14418512  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 733  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14418511 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 634 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 13097099 - 13096945
Alignment:
Q  634 aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 733  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  13097099 aaaacaataaaagattagttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctat-gtaatttgcactcctaatttaa 13097001  T
Q  734 tcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttg 789  Q
     |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13097000 gcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttg 13096945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 573 - 790
Target Start/End: Original strand, 41778847 - 41779064
Alignment:
Q  573 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagat 671  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||     
T  41778847 gatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt-agaagattaaagagaa 41778945  T
Q  672 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 771  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||    
T  41778946 gtatggttaagaccttcaaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaata 41779045  T
Q  772 attttatccaatctcttga 790  Q
    | | || ||||||||||||    
T  41779046 actctacccaatctcttga 41779064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 648 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 44008360 - 44008245
Alignment:
Q  648 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 747  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  44008360 ttggttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattattta 44008261  T
Q  748 gtttaacgacagatta 763  Q
    |||| |||| ||||||    
T  44008260 gtttcacgatagatta 44008245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 39659712 - 39659856
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  39659712 tgatagatatttggcaagtgtaccgaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 39659811  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  39659812 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 39659856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9467429 - 9467286
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  9467429 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttcttcttagcaagttcgttaaaa 9467330  T
Q  568 aaaaggatgtattaaat---tcaaggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     |||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9467329 taaaggatgtagtaaatttatcaa--ttgccctaggcagttggatt 9467286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 660 - 724
Target Start/End: Original strand, 41836415 - 41836479
Alignment:
Q  660 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 724  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41836415 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 453951 - 453807
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  453951 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaaactatggaagtactaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 453852  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     ||||||| || ||||||  |  |||||||| |||||||||||||    
T  453851 taaaggatttagtaaattttatgggttgccccaggcagttggatt 453807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 492 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13332429 - 13332308
Alignment:
Q  492 caaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa--- 588  Q
    |||||||||| ||||| |||  || || |||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||  |       
T  13332429 caaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccatgaggaccgttgttaatttatacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaattttatgg 13332330  T
Q  589 ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13332329 ggttgccctaggcagttggatt 13332308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 668
Target Start/End: Original strand, 41836285 - 41836394
Alignment:
Q  561 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 657  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41836285 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 41836383  T
Q  658 aaaattagaga 668  Q
    |||||| ||||    
T  41836384 aaaatttgaga 41836394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 14418435 - 14418396
Alignment:
Q  661 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 700  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14418435 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 14418396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 13979730 - 13979409
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13979730 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaaatcgaatccacgaggactgctgttaatttctactcagcaatttctttatcga 13979631  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    || |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  13979630 aa-ggatgtattaaatatctggttgcccaaggcagttggattggttttaataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattagag 13979532  T
Q  668 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 767  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||      
T  13979531 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaactt 13979432  T
Q  768 agtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||||| | ||||||||| |||||    
T  13979431 agtaactctatccaatcccttga 13979409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 22626312 - 22626634
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22626312 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 22626410  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||||     
T  22626411 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggatttagaaaatt- 22626507  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22626508 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 22626607  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22626608 acttagtaattctatccaatctcttga 22626634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 469 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 46731699 - 46731556
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46731699 tgatagagatttggcaagtgaacaaaaactatcgaagtaatgaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttctttatcaa 46731600  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46731599 aaaggatgtattaaactcaaggttgccctaggcagttggattgg 46731556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 648 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 46731559 - 46731417
Alignment:
Q  648 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46731559 ttggttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatcta 46731460  T
Q  748 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  46731459 gttcaacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttga 46731417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 39563510 - 39563833
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39563510 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattataa 39563607  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 663  Q
    |||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||  | |  |||| | |||||| |||||||||||||||     
T  39563608 aaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatc 39563706  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  39563707 tgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagatta 39563806  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||    
T  39563807 acttagtaattctacccaatctcttga 39563833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11138892
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 11138668  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 664  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |   |||| || ||||||||     
T  11138669 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattcagaaaatt- 11138765  T
Q  665 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 763  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11138766 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 11138865  T
Q  764 acaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11138866 acttagtaattctatccaatctcttga 11138892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 526 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 35366562 - 35366299
Alignment:
Q  526 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaata 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||    
T  35366562 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcattat-aaaaaggatgtattaaattttaggttgccctaggcagtcgagttggtatttgtaacata 35366464  T
Q  626 aacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcact 723  Q
    ||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||||||||| |||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||||     
T  35366463 aactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaattaatgagaaaaatatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcac- 35366366  T
Q  724 ccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    || ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||||||    
T  35366365 cccaattcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttga 35366299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 469 - 663
Target Start/End: Original strand, 20536333 - 20536530
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaat--tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 565  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20536333 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaaactattgaagtagtaaataaaagatcgtatccacgaggactgtatttaacttctacttagaaatttcattat 20536432  T
Q  566 caaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 663  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20536433 taaaaaggatgtagtaaattcaagggtgccctaggcagttgggttgacttgtgtaacacaaacgtaataaaacaataaaagttggtttatagaaaatt 20536530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 19869343 - 19869226
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  19869343 tgatagatatttggcaagtgtactaaaatctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 19869244  T
Q  568 aaaaggatgtattaaatt 585  Q
     |||||||||| ||||||    
T  19869243 taaaggatgtagtaaatt 19869226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27055237 - 27055092
Alignment:
Q  468 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  27055237 atgataaatatttggcaagcataccaaaactatcgaagtagtaataaatttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 27055138  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
     ||| |||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  27055137 taaaagatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 27055092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 520 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 47412368 - 47412129
Alignment:
Q  520 gtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgt 619  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| || | |  |||| ||||||    
T  47412368 gtatccacgaggaccgttgttaactt-------gcaatttcattatcaaaa-ggatgtattaaatttcaggttgctctagacaatcgagttggtatttgt 47412277  T
Q  620 aaaataaacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatt 717  Q
    || |||||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||    
T  47412276 aacataaactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaaataatgagaaaaatatgattaagacctttgaatcctctaatgttcttctacggtaatt 47412178  T
Q  718 tgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 766  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  47412177 tgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaaca 47412129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 25492263 - 25492128
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  25492263 tgatagataattgacaagtgtaccaaaagctatcaaaatagtaataaagttcgtatccacgaggatcgttgttaatttctacttagcaagttcattaaaa 25492164  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggca 602  Q
     ||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  25492163 taaaagatgtagtaaatttatgggttgccctaggca 25492128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 46542683 - 46542550
Alignment:
Q  475 atatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaag 572  Q
    |||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||    |||     
T  46542683 atatttggtaagtgcagaaaaattatcaaagtaataaaattaaattcgtatctacgaggactgttattaatttctatttagcaatttcattaatgtaaaa 46542584  T
Q  573 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttgg 607  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  46542583 gatgtattaaatt-ggggttgccctaggcagttgg 46542550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50096925 - 50096825
Alignment:
Q  569 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 667  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||   ||||||| |||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  50096925 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaagcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacagtaaaagttggtttttagaaaattagag 50096826  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  50096825 a 50096825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 469 - 560
Target Start/End: Original strand, 26822039 - 26822130
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 560  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  26822039 tgatagacttttggaaagtgtaccaaaactatcgaagtaataataaaattcgtatccacaaggaccgctgttaatttttactcaacaatttc 26822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3306213 - 3306147
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 533  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3306213 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 3306147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 469 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18883575 - 18883509
Alignment:
Q  469 tgatagatatttg-gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 533  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18883575 tgatagatattttagcaagtgtactaaaactatcaaagtagtaaaataagttcgtattcacgaggac 18883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 469 - 533
Target Start/End: Original strand, 30157797 - 30157863
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 533  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30157797 tgatagaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 30157863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 610
Target Start/End: Original strand, 36036817 - 36036854
Alignment:
Q  574 atgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36036817 atgtattaaattcaatggttgccctaggcagttggatt 36036854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 469 - 733
Target Start/End: Original strand, 11 - 273
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 108  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 666  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  109 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 206  T
Q  667 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 733  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  207 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 700
Target Start/End: Original strand, 283 - 322
Alignment:
Q  661 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 700  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  283 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 477 - 790
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2926
Alignment:
Q  477 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 576  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2627 atttggcaagtggaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttcgttatc-aaaaggatg 2725  T
Q  577 tattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 675  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||| | || |             |||||| |||||| ||||    
T  2726 tattaaattcaattgttgcccaaggaagttggattggtttttgtaacatgaacggattaaaa-actata-------------aaaatttgagagaagtat 2811  T
Q  676 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 775  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||   |||||||     
T  2812 cgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagtaattc 2911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 652 - 790
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6133
Alignment:
Q  652 ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttt 751  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggtt 6094  T
Q  752 aacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
     |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||    
T  6095 cacgacagattaacacaataactctacccaatctcttga 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 10109 - 9785
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| | | |  |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10109 tgatagaaatttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 10010  T
Q  568 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 663  Q
    |||||||||||| || ||  |  | | |||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  10009 aaaaggatgtataaatttatattggtcccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaatt 9912  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  9911 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 9813  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  9812 aacttagtaattctacccaatctcttga 9785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 24185 - 24506
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 567  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  24185 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattatta 24283  T
Q  568 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 663  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  24284 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 24379  T
Q  664 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 762  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  24380 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggatt 24478  T
Q  763 aacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  24479 aacttagtaattctacccaatctcttga 24506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 648 - 790
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7315
Alignment:
Q  648 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 747  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7173 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattattta 7272  T
Q  748 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 790  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  7273 gtttcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttga 7315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 648 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2641
Alignment:
Q  648 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 747  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2758 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattattta 2659  T
Q  748 gtttaacgacagattaac 765  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2658 gtttcacgacagattaac 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 469 - 610
Target Start/End: Original strand, 19509 - 19653
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  19509 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactgtcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 19608  T
Q  569 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 610  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  19609 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 19653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 604
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33866
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33730 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33829  T
Q  569 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 604  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  33830 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 33866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0766 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0766
Description:

Target: scaffold0766; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 478 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3613
Alignment:
Q  478 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 577  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  | ||| |||||    
T  3739 tttggcaagtgtaccaattctatcgaagtaataaa---atttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttaattaagataaatgatgt 3643  T
Q  578 attaaattcaaggttgccctaggcagttgg 607  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3642 attaaattcaggattaccctaagcagttgg 3613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 469 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10296 - 10253
Alignment:
Q  469 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa 512  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10296 tgatagatatttagcaagtgtactaaaactatcaaagtaataaa 10253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University