View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5788-Insertion-2 (Length: 1005)
Name: NF5788-Insertion-2
Description: NF5788
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5788-Insertion-2 |
 | |
|
| [»] scaffold0400 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0365 (2 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0289 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 836; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 836; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 998
Target Start/End: Complemental strand, 15037335 - 15036346
Alignment:
| Q |
8 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15037335 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtattatgactatgaaaggtgccacccgatgttgagcaaggctctaggccag |
15037236 |
T |
|
| Q |
108 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
207 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15037235 |
agacattaccacataagcctttgttatttgtcaatgcttcaattggagctcttttgaaagctgtaatgtttggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
15037136 |
T |
|
| Q |
208 |
tacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
307 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15037135 |
tatatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttaagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
15037036 |
T |
|
| Q |
308 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15037035 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
15036936 |
T |
|
| Q |
408 |
taaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgc |
507 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15036935 |
caagcttattatggctcaaattcaactgcaataacctagacaacataccaagtttttccaggatgaagccacttaagttatttgttgcaagctccaatgc |
15036836 |
T |
|
| Q |
508 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
607 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15036835 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
15036736 |
T |
|
| Q |
608 |
tttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattac |
707 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15036735 |
tttggaatttttcccattagatcgtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattac |
15036636 |
T |
|
| Q |
708 |
cggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttgg |
807 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15036635 |
cggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaagatgaccataaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttgg |
15036536 |
T |
|
| Q |
808 |
atacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactag |
907 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15036535 |
atacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttggttaagcctcaatctctcaaggcttgagcaattcttcaaactctct-ggaactag |
15036437 |
T |
|
| Q |
908 |
gcctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggt-aatgacccaataaatttattatca |
998 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15036436 |
gcctctgaactggttaagtgcagcagtgaatgtttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaaatga-ccaataaatttattatca |
15036346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 791; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 15011313 - 15010348
Alignment:
| Q |
10 |
tagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccagaa |
109 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15011313 |
tagagggcctagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgataatgaaatttgccaccagatgttgagcaaggctctaggccagag |
15011214 |
T |
|
| Q |
110 |
acattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagata |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15011213 |
acattaccacataagcctttgttatttgtcaatgcttcaattggagctcttttgaaagctgtaacatttggaatcggaccctccaattggttgtaagata |
15011114 |
T |
|
| Q |
210 |
catcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactg |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15011113 |
tatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttgagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactg |
15011014 |
T |
|
| Q |
310 |
gccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccctta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15011013 |
gccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaagattttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccctca |
15010914 |
T |
|
| Q |
410 |
aacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcag |
509 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15010913 |
aacttattttggctcaaatttaactgcaataacatagacaacataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcag |
15010814 |
T |
|
| Q |
510 |
ttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcctt |
609 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
15010813 |
ttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaaggagagtttgaacaacaaagataagtattctaactcctt |
15010714 |
T |
|
| Q |
610 |
tggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccg |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15010713 |
tggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgcacttcctagttctggtggtattcttcctgttaaattattacca |
15010614 |
T |
|
| Q |
710 |
gagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggat |
809 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15010613 |
gagatttttaggcttgtgagaatcttgcactttccccaatttggagaaagatgaccataaaaattattatcactcaattccatgtagtccaagtttggat |
15010514 |
T |
|
| Q |
810 |
acacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactaggc |
909 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15010513 |
acacaccaaaactctctgttatatttccagtaagttggttttgatcaagcctcagtctcgtaaggcttgagcaattcttcaaactctct-ggaactaggc |
15010415 |
T |
|
| Q |
910 |
ctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
976 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15010414 |
ctgtgaactggttaagtgcagcagtgaatgtttttaacttcccaccaacacaaatattgtgaggtaa |
15010348 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 775; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 15002422 - 15001430
Alignment:
| Q |
8 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccag |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15002422 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtattatgactatgaaaggtgccacccgatgttgagcaaggctctaggccag |
15002323 |
T |
|
| Q |
108 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15002322 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtttggagtcggaccctccaactggttgtaaga |
15002223 |
T |
|
| Q |
208 |
tacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
307 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15002222 |
tatatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagctttagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
15002123 |
T |
|
| Q |
308 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15002122 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
15002023 |
T |
|
| Q |
408 |
taaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgc |
507 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15002022 |
caaacttattttggctcaaatttaactgcaataacatagacaacataccaagtttttcagggatgaatccactcaaattatttgttgcaagctccaatgc |
15001923 |
T |
|
| Q |
508 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
607 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||| |
|
|
| T |
15001922 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtactggaacttctccataaagatgattgttacttaacgagagtttgatcaacaaagataagttttctaactcc |
15001823 |
T |
|
| Q |
608 |
tttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattac |
707 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
15001822 |
tttggaatttttcgcattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtatgcttcctgtcaaattattgt |
15001723 |
T |
|
| Q |
708 |
cggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttgg |
807 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
15001722 |
tggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaagatgaccataaaaattattatcactcaaatccatgtattccaaatttgg |
15001623 |
T |
|
| Q |
808 |
atacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactag |
907 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15001622 |
atacacaccaaagctgtctgttatatttccagtcagttggttttgttgaagtctcactctcgtaaggcttgagcaattcttcaaactctct-ggaactag |
15001524 |
T |
|
| Q |
908 |
gcctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggt-aatgacccaataaatttattatcagat |
1001 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15001523 |
gcctgtgaactggttaagtgcaacagtgaacatttttaacttcccaccgttacaaatattgtgaggtaaatga-ccaacaaaattattatcagat |
15001430 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 711; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 15032771 - 15031806
Alignment:
| Q |
10 |
tagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccagaa |
109 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15032771 |
tagagggcctagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgattatgaaatttgccaccagatgttgagcaaggctctaggccagag |
15032672 |
T |
|
| Q |
110 |
acattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagata |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15032671 |
acattaccacataagcctttgttatttgtcaatgcttcaattggagcttttttgaaagctgtaatgtttggaattggaccctccaactggttgtaagata |
15032572 |
T |
|
| Q |
210 |
catcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactg |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15032571 |
tatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttgagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagcgatttaactg |
15032472 |
T |
|
| Q |
310 |
gccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccctta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15032471 |
cccaagcattgatggtatggttccattcataaaattcccactaagatcaagattttcaataacattcaattgggcaaactcagcaggaatgttcccctca |
15032372 |
T |
|
| Q |
410 |
aacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcag |
509 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15032371 |
aacttattttggctcaaatttaactgcaataacctagataacctaccaagtcttttagggatgaagccactcaaattatttgttgcaagctccaatgcag |
15032272 |
T |
|
| Q |
510 |
ttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcctt |
609 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
15032271 |
ttagctcgtgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaaggtgattgttacttaacgagagtttgatcaacaaagataagttttctagctcctt |
15032172 |
T |
|
| Q |
610 |
tggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccg |
709 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15032171 |
tggaatttttcccgttagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgcgctgcctagctctggtggtattcttcctgttaaattattacca |
15032072 |
T |
|
| Q |
710 |
gagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggat |
809 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15032071 |
gagattttaaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaagatgaccataaaaattattatcattcaagtccatgtagtacaagtttggat |
15031972 |
T |
|
| Q |
810 |
acacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactaggc |
909 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
15031971 |
acacaccaaaactatttgttatatttccagtcagttggttttgatcaagcctcactcttttaaggcttaagcaattcttcaaactctct-ggaactaagc |
15031873 |
T |
|
| Q |
910 |
ctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
976 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15031872 |
cagtgaactggttaagtccagcagtgaatttttttatcttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
15031806 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 695; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 15017428 - 15016463
Alignment:
| Q |
10 |
tagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccagaa |
109 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15017428 |
tagaggacctagagtgagtgatagaactagcacccaaattttgtttgtcttatgattatgaaacttgccaccagatattgagcaaggctctaggccagag |
15017329 |
T |
|
| Q |
110 |
acattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagata |
209 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15017328 |
atattaccacacaagcccttgttatttgtcaatgcttcaattggagctcttccgaaagctgtaatgtttggagtcggaccctccaactggttgtaagata |
15017229 |
T |
|
| Q |
210 |
catcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactg |
309 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15017228 |
catcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttgagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactg |
15017129 |
T |
|
| Q |
310 |
gccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccctta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15017128 |
gccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaagattttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccctca |
15017029 |
T |
|
| Q |
410 |
aacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcag |
509 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15017028 |
aacttattttggctcaaatttaacttcaataacctagacaacataccaagtttttcagggatgaagccactgaaattatttgctgcaagctccaatgcag |
15016929 |
T |
|
| Q |
510 |
ttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcctt |
609 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
15016928 |
ttaattcgtgcaatgattcaatttgttcaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgatcaacaaagataagttttctagctcctt |
15016829 |
T |
|
| Q |
610 |
tggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccg |
709 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
15016828 |
tggaattttccccgtaagatggtttgaagacaagttaagttcatgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtatgcttcctgtcaaattattgttg |
15016729 |
T |
|
| Q |
710 |
gagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggat |
809 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15016728 |
gagattttaaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatttgaccatacaaattattatcactcaattccatgtagtccaagtttggat |
15016629 |
T |
|
| Q |
810 |
acacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactaggc |
909 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15016628 |
acacaccaaaactatttgttatatttccagtcagttggttttgttcaagcctcagtctcttaaggcttgagcaattcttcaaactctct-ggaactaggc |
15016530 |
T |
|
| Q |
910 |
ctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
976 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15016529 |
ctgtgaactggttaagagcagcagagaatttttccaacttcccaccgacacaaatattatgaggtaa |
15016463 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 203 - 976
Target Start/End: Complemental strand, 15025237 - 15024465
Alignment:
| Q |
203 |
taagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgat |
302 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15025237 |
taagatatatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttgagggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagcgat |
15025138 |
T |
|
| Q |
303 |
ttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgtt |
402 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15025137 |
ttaactgcccaagcattgatggtatggttccattcataaaattcccactaagatcaagattttcaataacattcaattgggcaaactcagcaggaatgtt |
15025038 |
T |
|
| Q |
403 |
ccccttaaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctcc |
502 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15025037 |
cccctcaaacttattttggctcaaatttaactgcaataacctagataacctaccaagtcttttagggatgaagccactcaaattatttgttgcaagctcc |
15024938 |
T |
|
| Q |
503 |
aatgcagttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatatttta |
602 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |
|
|
| T |
15024937 |
aatgcagttagctcgtgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaaggtgattgttacttaacgagagtttgatcaacaaagataagttttcta |
15024838 |
T |
|
| Q |
603 |
gctcctttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaatt |
702 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15024837 |
gctcctttggaatttttcccgttagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgcgctgcctagctctggtggtattcttcctgttaaatt |
15024738 |
T |
|
| Q |
703 |
attaccggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaag |
802 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15024737 |
attaccagagattttaaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaagatgaccataaaaattattatcattcaagtccatgtagtacaag |
15024638 |
T |
|
| Q |
803 |
tttggatacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctggga |
902 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15024637 |
tttggatacacaccaaaactatttgttatatttccagtcagttggttttgatcaagcctcactcttttaaggcttaagcaattcttcaaactctct-gga |
15024539 |
T |
|
| Q |
903 |
actaggcctgtgaactggttaagtgcagcagtgaattcttttaacttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
976 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15024538 |
actaagccagtgaactggttaagtccagcagtgaatttttttatcttcccaccgacacaaatattgtgaggtaa |
15024465 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 900
Target Start/End: Original strand, 14522421 - 14523313
Alignment:
| Q |
8 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccag |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14522421 |
aataaagggcctagagtgagggataaaactagcaccaaaattttgttagttttatgactatggaagtttccacctgatgttgagcaaggctctaggccag |
14522520 |
T |
|
| Q |
108 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14522521 |
agacattaccgcacaagcctttgttatttctaaatgcttcaactggagctctttggaatgctgtaatgtttggaattggaccctccaaccggttgtaaga |
14522620 |
T |
|
| Q |
208 |
tacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
307 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14522621 |
tatatcaacagttgtcaaacttaacatatcaaaaaagcttaagggaatgttaccatagagattattatgtgagagattcaatgtttctaagcgatttaac |
14522720 |
T |
|
| Q |
308 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
407 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
14522721 |
tgtccaagcattgttggtatggttccattcaaaaaattcccgctaagatcaagatcttcaataacattcaattgaccaagttcaacaggaatgtttcctt |
14522820 |
T |
|
| Q |
408 |
taaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgc |
507 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14522821 |
caaacttattttggctcaaattcaactgcaataacctagacaaccttccaagtttttcagggataaaaccacttaaattatttgttgcaagatccaatgt |
14522920 |
T |
|
| Q |
508 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
607 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||| | | ||| ||| |
|
|
| T |
14522921 |
agttagttcatgcaatgatgcaatctgcataggaacttctcccgaaagatgattattacttatcgagagttggatcagtgcagataagtttcctagatcc |
14523020 |
T |
|
| Q |
608 |
tttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgc-tctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattatta |
706 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14523021 |
tttggaatttttcctataagttgatttgaggacaagtcaagtatatgtaaattggttgcttcagcc-aattctggtggtatgcttcctattaaattatta |
14523119 |
T |
|
| Q |
707 |
ccggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttg |
806 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14523120 |
ttggagattttaaggcttgtcagattcttgcacttcccccaatttggagaaagataaccataaaaattattatcacttaattctatgtagtccaaatttg |
14523219 |
T |
|
| Q |
807 |
gatacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgg |
900 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| | ||| || | ||| ||||| | || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14523220 |
gatacacaccaaaactatctgttatatttcctgtcattttgttttggttaagtctcaatcttataaggctagaacagttcttcaaactctctgg |
14523313 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 819
Target Start/End: Original strand, 14532554 - 14533353
Alignment:
| Q |
20 |
agagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccagaaacattaccac |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14532554 |
agagtgaggggtaaaactagcaccaaaatattgctagtcttatgactatgaaagttgccacctgatgttgagcaacacactaggccagagacattaccac |
14532653 |
T |
|
| Q |
120 |
acaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagatacatcaacagt |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | |
|
|
| T |
14532654 |
acaagcctttgttatttctaagtgcttcaattggagctttttggaaggctgtaatgcttggaattggaccctccaattggttgtatgatatatcaacaat |
14532753 |
T |
|
| Q |
220 |
tgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactggccaagcatt |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | | |||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14532754 |
tgtcaagcttaacatcttaccgtagctcaaaggaatggttccagaaagattattatgtgaaagattcaatgtttgtaagtgatttaactgtccaagcatt |
14532853 |
T |
|
| Q |
320 |
gctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttccccttaaacttatttt |
419 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
14532854 |
gatggtatggttccactcataacattttcactaagatcaagatcttcaataacctttaattggtcaaactcaacaggaatgtttccttcgaacttatttt |
14532953 |
T |
|
| Q |
420 |
ggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcagttagttgatg |
519 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || | |||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
14532954 |
ggctcaaattcaaatgtattaactcagacaaccttccaagtcttctagggatgaagccacttaaattatttttttcaagctccaaggcagttagtgcctg |
14533053 |
T |
|
| Q |
520 |
caatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcctttggaattttt |
619 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14533054 |
cagtgatgcaatttgtacaggaacttctcccaaaagattattgttatttatcgagagtttgattaacaaagataagtttcctagctcctctggaattttt |
14533153 |
T |
|
| Q |
620 |
cccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccggagattttta |
719 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
14533154 |
ccagtaagatggtttgaagacagattaagttcttgtaattgtgttgctccacctagttcttgaggtatgcttccagttaaattattgttggagatttgaa |
14533253 |
T |
|
| Q |
720 |
ggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggatacacaccaaa |
819 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14533254 |
gacttgtgagtttcttgcacttaccccaatttggtgatatatggccataaaaattattatcactcaattccatgtagtccaaatttggatacacgccaaa |
14533353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 14468034 - 14467204
Alignment:
| Q |
92 |
caaggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccct |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14468034 |
caaggctttaggctagaagcattaccacacaagtctttgttgtttctcagtgcttcaattggagcctgttggaaggctggaatgcttggaatcggaccct |
14467935 |
T |
|
| Q |
192 |
ccaactggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgt |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14467934 |
ccaactggttgtacgatatatctacagttgtcaagcttaacatatcaactgagctgaagagaatggtaccagaaagattattatgtgagagattcaatgt |
14467835 |
T |
|
| Q |
292 |
ttctaagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactca |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14467834 |
ttctaagtgatttaactgtccaaacattgctggaatggttccgttcaaaaaattctcactaagatcaagatcttcaagaacatttaattggccaaactcg |
14467735 |
T |
|
| Q |
392 |
acaggaatgttccccttaaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattattta |
491 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||| |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14467734 |
acaggaatgtttccttcaaacatatttttgcttaaattcaagtgtaataacattgacaaacttccaagttgttttgggattgaaccacttaaattatttg |
14467635 |
T |
|
| Q |
492 |
ttgcaagctccaatgcagttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaaga |
591 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
14467634 |
ttgaaagctccaaggtatctagtttttgcaatgatgcaacttgtgcaggaacttctcctgaaagatgattgttacttaccgagagttggatcaacaaaga |
14467535 |
T |
|
| Q |
592 |
taaatattttagctcctttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattctt |
691 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14467534 |
taagctttctagctcctttggaatttttcccgtaagatggtttgaagacaggtttagttcatgtaaatttgttgctcggcctagttctggcggtatgctt |
14467435 |
T |
|
| Q |
692 |
ccagttaaattattaccggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtcca |
791 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| || || | ||| || || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14467434 |
cctgttaaattgttattgaagattttaaggcatgtgagattcatgcattttccccaattcggtgatagatggccatacaaattattatcactcaattcca |
14467335 |
T |
|
| Q |
792 |
tgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaa |
891 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||| ||| | |||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
14467334 |
tgtagtccaattttggatgcacgccaaaggcatcagttatattgtcagttagttgattttgttgaagccttactctataaaggctagagcagttcttcaa |
14467235 |
T |
|
| Q |
892 |
actctctgggaactaggcctgtgaactggtta |
923 |
Q |
| |
|
||||| | |||| | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14467234 |
actct-ttggaattgggcctgtgaattggtta |
14467204 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 14504213 - 14503409
Alignment:
| Q |
92 |
caaggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccct |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14504213 |
caaggctttaggctagatgcattaccacacaagtctttgttgtttctcagtgcttcaattggagcttgttggaaggctggaatgcttggaatcggaccct |
14504114 |
T |
|
| Q |
192 |
ccaactggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgt |
291 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14504113 |
ccaattggttgtatgatatatcaataattgtcaagcttaacatatcaccagagctaaaggggatcgtaccagacagattattatgtgagagattcaatgt |
14504014 |
T |
|
| Q |
292 |
ttctaagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactca |
391 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14504013 |
ttctaaatgatttaacactccaaacattgaaggtatcgttccattcataaaatttccactgagatcaagatcttcaataacatttaatcggccaaactca |
14503914 |
T |
|
| Q |
392 |
acaggaatgttccccttaaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattattta |
491 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14503913 |
acgggaatgtttccttcaaacttattttggctcaaattcaaatgtattaactcagacaaccttccaagtcttctagggatgaagccacttaaattatttg |
14503814 |
T |
|
| Q |
492 |
ttgcaagctccaatgcagttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaaga |
591 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14503813 |
ttgcaagctccaaggtagttagtgcttgcaatgatgcaatttgtataggaacctctccagaaagatgattgttacttatcgagagtttgatcaacaaaga |
14503714 |
T |
|
| Q |
592 |
taaatattttagctcctttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttg-ctctgcctagttctggtggtattct |
690 |
Q |
| |
|
|| | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||| | |||| ||||||| | |
|
|
| T |
14503713 |
caagtttcctagatcctttggaatttttccagtaagatggtttgatgacaagttaagttcatgtaaattaattgtctcagcc-aattcttgtggtatatt |
14503615 |
T |
|
| Q |
691 |
tccagttaaattattaccggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtcc |
790 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| || || |||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
14503614 |
tcctgttaaattgttattggagattttaaggcttgtgagactcttgcactttccccaatttggtgatagatggccatacaaattattttcactcaattcc |
14503515 |
T |
|
| Q |
791 |
atgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttca |
890 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||| | ||| ||||| | ||||||||||| | |
|
|
| T |
14503514 |
atgtagtccaaatgtggataaacaccaaaaccatctgttatatttccagttaattgatttttttgaagcctaactctaataaggctggagcaattcttta |
14503415 |
T |
|
| Q |
891 |
aactct |
896 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
14503414 |
aactct |
14503409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 40 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 15041029 - 15040183
Alignment:
| Q |
40 |
caccaaaattttgttagtcttatga--ctatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttc |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15041029 |
caccaaaattgtgttagtattatgagactatgaaagttgccaccagatgttgagcaatgctctaggccagagacattaccacacaagcctttgttatttc |
15040930 |
T |
|
| Q |
138 |
tcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatc |
237 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||| ||| | ||| | || ||| | |||||| ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
15040929 |
ttaatgcttcaaatggggcttgtaggaaggatgaaatttttggaattggacccttcaattggttgcatgatatatcaacagttgtcaagcctgacatctc |
15040830 |
T |
|
| Q |
238 |
aacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattc |
337 |
Q |
| |
|
| || || | | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15040829 |
accataggtcaagggaatggtacaaaaaagatt---------------caatgtttctaagcgatttaactgtccaagcattgttggtatggttccattc |
15040745 |
T |
|
| Q |
338 |
atagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttccccttaaacttattttggctcaaattcaactgca |
437 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| || || | |
|
|
| T |
15040744 |
aaagaattcccactaagatcaagattttcaataacttttaactgtccaatctcatcaggaatgtttccttcaaacttattttggctcatatttaagtgta |
15040645 |
T |
|
| Q |
438 |
ataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcagttagttgatgcaatgatgcaatttgtac |
537 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || | || | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15040644 |
ataacatagataatcttccaagttgttttgggacgaagccacttaaattatttgttgccagctccaagatagcaacttccttcaatgaggcaatttgtac |
15040545 |
T |
|
| Q |
538 |
aggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgaga---gtttgaacaacaaagataaatattttagctcctttggaatttttcccattagatggttt |
634 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| | |||| |||||| ||||| ||| || ||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||| || || |
|
|
| T |
15040544 |
aggaacttcccctgaaaagtaattgctacttatcgagagttgttggatcaatgaagataagttgcctagctccattggaatttctcctgttagttgattc |
15040445 |
T |
|
| Q |
635 |
gaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccggagatttttaggcttgtgagattct |
734 |
Q |
| |
|
|| ||||| | ||| |||||||| ||||| | | | |||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15040444 |
gaggacaaatcaagtaaatgtaaattggttgccccaaccaattctagtggtatactccctgttaaattattgttggagattttaaggcttatgagattct |
15040345 |
T |
|
| Q |
735 |
tgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatt |
834 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || |||||||| || || | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
15040344 |
tgcgttttccccaattaggtgaaatatggccaaaatatttattaccactcaattccatgtagtacaagtttggacacacaccaaagctatctgttatatt |
15040245 |
T |
|
| Q |
835 |
tccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactct |
896 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| || |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15040244 |
tccagcaagttggttttgttcaagtctcactctctttagacttgaacaattcttcaaactct |
15040183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14482216 - 14481859
Alignment:
| Q |
92 |
caaggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccct |
191 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14482216 |
caaggctttaggctagaggcattaccacacaagtctttgttgtttctcagtgcttcaattggagttttctggaaggctggaatgcttggaatcggaccct |
14482117 |
T |
|
| Q |
192 |
ccaactggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgt |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| | | || | || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14482116 |
ccaactggttgtacgatatatctacagttatcaagcttaacatctaaccatatctgaagggaatggtaccagaaagattattatgtgagagattcaatgt |
14482017 |
T |
|
| Q |
292 |
ttctaagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactca |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14482016 |
ttctaagtgatttaactgtccaaacattgctggaatggttccgttcaaaaaattctcactaagatcaagatcttcaagaacatttaattggccaaactcg |
14481917 |
T |
|
| Q |
392 |
acaggaatgttccccttaaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagaca |
449 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | |||| |||||| ||| |||||||| || |||||||| |||| |
|
|
| T |
14481916 |
acaggaatgtttccttcaaacatatttttgcttaaattcaagtgtaataacattgaca |
14481859 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0400 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:
Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 13091 - 12207
Alignment:
| Q |
20 |
agagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtg---------ccacccgattttgagcaaggctctaggccagaaa |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13091 |
agagtgaggggtaaaactagatccaaaattttgttagtcttatgactatgaaagttatgaaagtttccacctgatgttgagcaaggctctagaccagaga |
12992 |
T |
|
| Q |
111 |
cattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagatac |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12991 |
cattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagcttttaggaaggctggaatgttaggaatcggaccctccaattggttgtatgatat |
12892 |
T |
|
| Q |
211 |
atcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactgg |
310 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| | | | |||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
12891 |
atcaacaattgtcaagcttaacatcttaccgtagctcaaaggaatggttccagaaagattattatgtgaaagattcaatgtttgtatgtgatttaactgt |
12792 |
T |
|
| Q |
311 |
ccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttccccttaa |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || | || |
|
|
| T |
12791 |
ccaagcattgatggtatggttccgttcaaaaaatttccactaaggtcaagatcttcaataacttctaattggccaaactcaatgggaatgtttccttcaa |
12692 |
T |
|
| Q |
411 |
acttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcagt |
510 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12691 |
acctattttggctcaaattcaaatgtattaactcagacaaccttccaagtcttctagggatgaagccacttaaattatttttttcaagctccaaggcagt |
12592 |
T |
|
| Q |
511 |
tagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctccttt |
610 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
12591 |
tagtgcctgcagtgatgcaatttgtacaggaacttctcccaaaagattattgttatttatcgagagtttgattaacaaagataagtttcctagctccttt |
12492 |
T |
|
| Q |
611 |
ggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccgg |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12491 |
ggaatttttccagtaagatggtttgaagacagattaagttcttgtaattgtgttgctccacctagttcttgcggtatgcttccagttaaattattgttgg |
12392 |
T |
|
| Q |
711 |
agatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggata |
810 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
12391 |
agatttgaagacttgtgagtttcttgcacttaccccaatttggtgatatatggccataaaaattattatcacttaattccatgtagaccaaatgtggata |
12292 |
T |
|
| Q |
811 |
cacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactc |
895 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12291 |
aacaccaaaaccatctgttatatttccagttaattgatttttttgaagcctaactctaataaggctggagcaattcttcaaactc |
12207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 6803 - 5892
Alignment:
| Q |
8 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccag |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| || || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6803 |
aatagagtgcctagagtgatgggtaaaacaaccaccaaaatgtgtttagtcttatgactatgaaagttaccacctaatgttgagcaaggctctaagccag |
6704 |
T |
|
| Q |
108 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| || || |||||||| || |
|
|
| T |
6703 |
ag---ttaccacacaagcctttgttatttcttaatgcttcaattggagcatttttgaaggctggaatgtttggaattggaccttcaaattggttgtatga |
6607 |
T |
|
| Q |
208 |
tacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
307 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |||||| |||| ||| || || | | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6606 |
tatatcaatagttgttaagcttgacatctcaccataggtcaagggaatggtaccagaaaaattattatgtgagagattcaatgtttctaagcgatttaac |
6507 |
T |
|
| Q |
308 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
407 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
6506 |
tctccaagcattgttggtatggttccattcaaaacattctcgctaagatcaagattttcaataattttcaattgtccaaactcagcaggaatgtctcctt |
6407 |
T |
|
| Q |
408 |
taaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgc |
507 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6406 |
caaacttattttggctcaaattcaagtccaataaattaggtaatcttccaagttgttctgggatgaagccactgaaattatttgttgcaagctccaagat |
6307 |
T |
|
| Q |
508 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
607 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| | || ||| | ||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
6306 |
agttattttatgcaataatgcaatttgttcaggaacttctcctacaagatgattgctacttatcaagagctggatcaatgaggataagtttcctagctcc |
6207 |
T |
|
| Q |
608 |
tttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattac |
707 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || || || || || | || || |||||| |||||| | | | ||| |||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
6206 |
tttggaatttctcctgtgagttgattcgaggaaaggtccagtatagttaaattggttgcttcggccaattcgggtggtatgcttcctgatatattattat |
6107 |
T |
|
| Q |
708 |
cggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttgg |
807 |
Q |
| |
|
| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |
|
|
| T |
6106 |
tgaaaactttaaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagagagatgaccataaaaattattatcactcaattccatatattccaaattcgg |
6007 |
T |
|
| Q |
808 |
atacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactag |
907 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
6006 |
atacacaccaaagctatctgttatatttgcagtcagttggttttgttgaagtctcactctcttaaggcttgagcaattttttaaactct-ttggaactag |
5908 |
T |
|
| Q |
908 |
gcctgtgaactggtta |
923 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
5907 |
accaatgaactggtta |
5892 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0365 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:
Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 13734 - 12850
Alignment:
| Q |
20 |
agagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtg---------ccacccgattttgagcaaggctctaggccagaaa |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
13734 |
agagtgaggggtaaaactagatccaaaattttgttagtcttatgactatgaaagttatgaaagtttccacctgatgttgagcaaggctctagaccagaga |
13635 |
T |
|
| Q |
111 |
cattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaagatac |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
13634 |
cattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagcttttaggaaggctggaatgttaggaatcggaccctccaattggttgtatgatat |
13535 |
T |
|
| Q |
211 |
atcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactgg |
310 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| | | | |||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13534 |
atcaacaattgtcaagcttaacatcttaccgtagctcaaaggaatggttccagaaagattattatgtgaaagattcaatgtttgtatgtgatttaactgt |
13435 |
T |
|
| Q |
311 |
ccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttccccttaa |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || | || |
|
|
| T |
13434 |
ccaagcattgatggtatggttccgttcaaaaaatttccactaaggtcaagatcttcaataacttctaattggccaaactcaatgggaatgtttccttcaa |
13335 |
T |
|
| Q |
411 |
acttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgcagt |
510 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||| | | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13334 |
acctattttggctcaaattcaaatgtattaactcagacaaccttccaagtcttctagggatgaagccacttaaattatttttttcaagctccaaggcagt |
13235 |
T |
|
| Q |
511 |
tagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctccttt |
610 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
13234 |
tagtgcctgcagtgatgcaatttgtacaggaacttctcccaaaagattattgttatttatcgagagtttgattaacaaagataagtttcctagctccttt |
13135 |
T |
|
| Q |
611 |
ggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattaccgg |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13134 |
ggaatttttccagtaagatggtttgaagacagattaagttcttgtaattgtgttgctccacctagttcttgcggtatgcttccagttaaattattgttgg |
13035 |
T |
|
| Q |
711 |
agatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggata |
810 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
13034 |
agatttgaagacttgtgagtttcttgcacttaccccaatttggtgatatatggccataaaaattattatcacttaattccatgtagaccaaatgtggata |
12935 |
T |
|
| Q |
811 |
cacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactc |
895 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12934 |
aacaccaaaaccatctgttatatttccagttaattgatttttttgaagcctaactctaataaggctggagcaattcttcaaactc |
12850 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 7447 - 6536
Alignment:
| Q |
8 |
aatagagggccgagagtgagggatagaactagcaccaaaattttgttagtcttatgactatgaaaggtgccacccgattttgagcaaggctctaggccag |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| || || ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7447 |
aatagagtgcctagagtgatgggtaaaacaaccaccaaaatgtgtttagtcttatgactatgaaagttaccacctaatgttgagcaaggctctaagccag |
7348 |
T |
|
| Q |
108 |
aaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctccaactggttgtaaga |
207 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| || || |||||||| || |
|
|
| T |
7347 |
ag---ttaccacacaagcctttgttatttcttaatgcttcaattggagcatttttgaaggctggaatgtttggaattggaccttcaaattggttgtatga |
7251 |
T |
|
| Q |
208 |
tacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaac |
307 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |||||| |||| ||| || || | | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7250 |
tatatcaatagttgttaagcttgacatctcaccataggtcaagggaatggtaccagaaaaattattatgtgagagattcaatgtttctaagcgatttaac |
7151 |
T |
|
| Q |
308 |
tggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttcccct |
407 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
7150 |
tctccaagcattgttggtatggttccattcaaaacattctcgctaagatcaagattttcaataattttcaattgtccaaactcagcaggaatgtctcctt |
7051 |
T |
|
| Q |
408 |
taaacttattttggctcaaattcaactgcaataacatagacagcataccaagttttttagggatgaagccactcaaattatttattgcaagctccaatgc |
507 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7050 |
caaacttattttggctcaaattcaagtccaataaattaggtaatcttccaagttgttctgggatgaagccactgaaattatttgttgcaagctccaagat |
6951 |
T |
|
| Q |
508 |
agttagttgatgcaatgatgcaatttgtacaggaacttctccagaaagatgattgttacttaacgagagtttgaacaacaaagataaatattttagctcc |
607 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| | || ||| | ||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
6950 |
agttattttatgcaataatgcaatttgttcaggaacttctcctacaagatgattgctacttatcaagagctggatcaatgaggataagtttcctagctcc |
6851 |
T |
|
| Q |
608 |
tttggaatttttcccattagatggtttgaagacaagttaagctcctgtaaatttgttgctctgcctagttctggtggtattcttccagttaaattattac |
707 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | || || || || || | || || |||||| |||||| | | | ||| |||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
6850 |
tttggaatttctcctgtgagttgattcgaggaaaggtccagtatagttaaattggttgcttcggccaattcgggtggtatgcttcctgatatattattat |
6751 |
T |
|
| Q |
708 |
cggagatttttaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttgg |
807 |
Q |
| |
|
| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |
|
|
| T |
6750 |
tgaaaactttaaggcttgtgagattcttgcactttccccaatttggagagagatgaccataaaaattattatcactcaattccatatattccaaattcgg |
6651 |
T |
|
| Q |
808 |
atacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactag |
907 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||| || ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
6650 |
atacacaccaaagctatctgttatatttgcagtcagttggttttgttgaagtctcactctcttaaggcttgagcaattttttaaactct-ttggaactag |
6552 |
T |
|
| Q |
908 |
gcctgtgaactggtta |
923 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |
|
|
| T |
6551 |
accaatgaactggtta |
6536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14606126 - 14605822
Alignment:
| Q |
95 |
ggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctcca |
194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
14606126 |
ggctctaagccagagacattaccacacaagcctttattatttctcaccacttcaattgtagcgttgctgaaagctcgaatattggggagtggaccctcca |
14606027 |
T |
|
| Q |
195 |
actggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttc |
294 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||| |||||||| ||| ||||| ||||| | | | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14606026 |
attggttatatgatatatcaacagatgttaagctgaacatctgatcgaagctagagggaataaaaccagaaagattattatgtgagatattcaatgtttc |
14605927 |
T |
|
| Q |
295 |
taagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaaca |
394 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
14605926 |
caagtatttcaactgtgtaagcattgatggtattgttccatccaaaaaatttccactgagatctaggatttcaaggacattaaattgtccaaattcaata |
14605827 |
T |
|
| Q |
395 |
ggaat |
399 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
14605826 |
ggaat |
14605822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16103108 - 16102867
Alignment:
| Q |
95 |
ggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctcca |
194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||| ||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
16103108 |
ggctctaagccagagacattaccacacaagtctttattatttctcaacacttcgattgtagcgtttctgaaagctcgaatgttggggagtggaccctcca |
16103009 |
T |
|
| Q |
195 |
actggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttc |
294 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16103008 |
attggttatatgatatatcaacagatgtcaagcttaacatttgatcaaagctagagggaataaagccagaaagattattatgtgagatattcaatgtttc |
16102909 |
T |
|
| Q |
295 |
taagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccatt |
336 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16102908 |
caagtatttcaactgtgtaagcattgatggtattgttccatt |
16102867 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16025303 - 16024999
Alignment:
| Q |
95 |
ggctctaggccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctcagtgcttcaattggagctctttcgaaagctgtaatgtgtggaatcggaccctcca |
194 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
16025303 |
ggctctaagccagagacattaccacacaagcctttattatttctcaccacttcaattgtagcgttgctgaaagctcgaatattggggagtggaccctcca |
16025204 |
T |
|
| Q |
195 |
actggttgtaagatacatcaacagttgtcaagcttaacatatcaacaaagcttatgggaatggtaccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttc |
294 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||| |||||||| || ||||| ||||| | | | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16025203 |
attggttatatgatatatcaacagacgttaagctgaacatctgatcgaagctagagggaataaaaccagaaagattattatgtgagatattcaatgtttc |
16025104 |
T |
|
| Q |
295 |
taagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaaca |
394 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
16025103 |
caagtatttcaactgtgtaagcattgatggtattgttccatccaaaaaatttccactgagatctaggatttcaaggacattaaattgtccaaattcaata |
16025004 |
T |
|
| Q |
395 |
ggaat |
399 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16025003 |
ggaat |
16024999 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 737 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 16102468 - 16102283
Alignment:
| Q |
737 |
cactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatttc |
836 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16102468 |
cactttccccaattcgatgaaaggtgtccgtaaaaattgttttcacttaagtctatgtaattcaaatttggataaacactaaaatcttgtgttatatttc |
16102369 |
T |
|
| Q |
837 |
cagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactaggcctgtgaactggtta |
923 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16102368 |
cagtaagttggttttggtcaagtctaagtcttataatgctagagcaattcttcaaactct-taggaactcggccggtgaagtggtta |
16102283 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 737 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 16172146 - 16171961
Alignment:
| Q |
737 |
cactttccccaatttggagaaatatgaccgtaaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatttc |
836 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16172146 |
cactttccccaattcgatgaaaggtgtccgtaaaaattgttttcacttaagtctatgtaattcaaatttggataaacactaaaatcttgtgttatatttc |
16172047 |
T |
|
| Q |
837 |
cagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactctctgggaactaggcctgtgaactggtta |
923 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16172046 |
cagtaagttggttttggtcaagtctaagtcttataatgctagagcaattcttcaaactct-taggaactcggccggtgaagtggtta |
16171961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 767 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 17848087 - 17847959
Alignment:
| Q |
767 |
taaaaattattatcactcaagtccatgtagtccaagtttggatacacaccaaaactctctgttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtc |
866 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
17848087 |
taaaaattattttgactcaaatgcatgtaatccaaattcggatacacaccaaagaaatctgttatatttccagaaagttggttttgttcaagcctaattc |
17847988 |
T |
|
| Q |
867 |
tcttaagggttgagcaattcttcaaactc |
895 |
Q |
| |
|
| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17847987 |
ttacaatgcttgagcaattcttcaaactc |
17847959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17848512 - 17848423
Alignment:
| Q |
342 |
aattcccactaagatcaaggttttcaataacattcaattggccaaactcaacaggaatgttccccttaaacttattttggctcaaattca |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17848512 |
aattcccactaagatcaagactttgaaggactttaaattggccaaactcaacaggaatatttcctttaaatttgttatggctcaaattca |
17848423 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16172620 - 16172519
Alignment:
| Q |
260 |
ccagagagattgttatgtgagagattcaatgtttctaagtgatttaactggccaagcattgctggtatggttccattcatagaattcccactaagatcaa |
359 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| | | |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16172620 |
ccagaaagattattatgtgagatattcaatgtttccaagtatttcaactgtgtaagcattgatggtattgttccatttaaaaaatttccactcagatcaa |
16172521 |
T |
|
| Q |
360 |
gg |
361 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16172520 |
gg |
16172519 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 16024577 - 16024508
Alignment:
| Q |
827 |
gttatatttccagtcagttggttttgatcaagccttagtctcttaagggttgagcaattcttcaaactct |
896 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16024577 |
gttatatttccagtaagttggttttgttcaagtcgaagtcttataatgctagagcaattcttcaaactct |
16024508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0289 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:
Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 140
Target Start/End: Original strand, 5466 - 5503
Alignment:
| Q |
103 |
gccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctca |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
5466 |
gccagaaacattaccacacaagcctgtattatttctca |
5503 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 140
Target Start/End: Original strand, 14299 - 14336
Alignment:
| Q |
103 |
gccagaaacattaccacacaagcctttgttatttctca |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
14299 |
gccagaaacattaccacacaagcctgtattatttctca |
14336 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University