View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5794_1D_high_8 (Length: 290)

Name: NF5794_1D_high_8
Description: NF5794_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5794_1D_high_8
NF5794_1D_high_8
[»] chr4 (128 HSPs)
chr4 (18-287)||(21686075-21686344)
chr4 (19-287)||(2520786-2521054)
chr4 (18-290)||(13634119-13634391)
chr4 (35-290)||(22611187-22611442)
chr4 (18-289)||(32766519-32766790)
chr4 (18-290)||(19853345-19853617)
chr4 (18-290)||(56040479-56040751)
chr4 (18-285)||(24098902-24099167)
chr4 (26-290)||(53811032-53811295)
chr4 (18-290)||(26633504-26633776)
chr4 (18-290)||(43510201-43510472)
chr4 (29-290)||(53444122-53444383)
chr4 (20-287)||(10496342-10496610)
chr4 (18-290)||(35348311-35348583)
chr4 (20-290)||(17949158-17949429)
chr4 (20-290)||(17953010-17953281)
chr4 (36-290)||(56156493-56156747)
chr4 (18-290)||(4142597-4142860)
chr4 (18-258)||(21662473-21662713)
chr4 (18-258)||(21671237-21671477)
chr4 (28-290)||(8670489-8670751)
chr4 (23-236)||(29960787-29961000)
chr4 (20-288)||(54021866-54022133)
chr4 (25-290)||(9178357-9178622)
chr4 (33-208)||(47320260-47320435)
chr4 (23-290)||(33921055-33921325)
chr4 (37-290)||(51888063-51888319)
chr4 (20-290)||(26090745-26091021)
chr4 (18-290)||(44596668-44596935)
chr4 (30-290)||(12199539-12199798)
chr4 (18-288)||(43095634-43095904)
chr4 (33-202)||(31891135-31891304)
chr4 (79-290)||(52944312-52944526)
chr4 (18-288)||(10258734-10258999)
chr4 (51-290)||(36194706-36194951)
chr4 (30-290)||(28857403-28857665)
chr4 (18-181)||(48257465-48257628)
chr4 (30-289)||(36161713-36161975)
chr4 (31-289)||(22038655-22038909)
chr4 (45-290)||(22300850-22301099)
chr4 (33-242)||(18935834-18936043)
chr4 (33-202)||(27652036-27652204)
chr4 (30-186)||(43853551-43853707)
chr4 (30-227)||(6155065-6155268)
chr4 (30-197)||(36204224-36204391)
chr4 (33-227)||(9713979-9714171)
chr4 (39-289)||(11299864-11300095)
chr4 (63-290)||(37030265-37030492)
chr4 (37-288)||(52060775-52061026)
chr4 (40-283)||(9048672-9048918)
chr4 (76-197)||(45418609-45418730)
chr4 (61-145)||(37465631-37465715)
chr4 (36-228)||(1621362-1621547)
chr4 (92-289)||(48351093-48351291)
chr4 (30-193)||(21554635-21554798)
chr4 (30-145)||(52933794-52933909)
chr4 (30-289)||(31359591-31359854)
chr4 (30-203)||(42032374-42032546)
chr4 (176-288)||(5119345-5119456)
chr4 (30-290)||(9643389-9643640)
chr4 (82-181)||(29120276-29120375)
chr4 (30-192)||(9145736-9145898)
chr4 (101-223)||(33332485-33332607)
chr4 (33-193)||(2069429-2069588)
chr4 (178-290)||(40066048-40066160)
chr4 (48-138)||(7008852-7008942)
chr4 (30-115)||(53616475-53616560)
chr4 (30-114)||(4644038-4644122)
chr4 (61-128)||(36184697-36184764)
chr4 (30-128)||(44947577-44947676)
chr4 (80-146)||(22305516-22305582)
chr4 (35-128)||(52097746-52097840)
chr4 (30-115)||(9645349-9645434)
chr4 (36-128)||(56199261-56199354)
chr4 (18-154)||(52978884-52979020)
chr4 (30-128)||(3335989-3336088)
chr4 (30-128)||(9528702-9528801)
chr4 (30-128)||(10359374-10359472)
chr4 (30-128)||(25274048-25274147)
chr4 (30-128)||(49410388-49410487)
chr4 (46-128)||(12493459-12493541)
chr4 (46-207)||(22806629-22806784)
chr4 (30-115)||(2115413-2115498)
chr4 (30-115)||(21090321-21090406)
chr4 (30-115)||(47417841-47417926)
chr4 (36-128)||(51318150-51318243)
chr4 (30-98)||(29966522-29966590)
chr4 (30-193)||(35964801-35964965)
chr4 (30-128)||(1532073-1532172)
chr4 (30-128)||(10389579-10389678)
chr4 (30-101)||(19896468-19896539)
chr4 (30-128)||(34024263-34024362)
chr4 (102-193)||(38166147-38166238)
chr4 (30-128)||(38706535-38706634)
chr4 (63-223)||(47158296-47158456)
chr4 (37-115)||(35261371-35261449)
chr4 (33-128)||(43153845-43153938)
chr4 (45-115)||(43444571-43444641)
chr4 (30-115)||(20569436-20569521)
chr4 (88-193)||(36700377-36700482)
chr4 (53-137)||(37684014-37684098)
chr4 (38-128)||(6972975-6973066)
chr4 (30-128)||(45227866-45227965)
chr4 (91-186)||(55228086-55228181)
chr4 (63-128)||(18138772-18138838)
chr4 (63-128)||(27593687-27593753)
chr4 (63-128)||(49125985-49126051)
chr4 (30-115)||(9284090-9284175)
chr4 (33-82)||(33332438-33332487)
chr4 (37-118)||(38165894-38165975)
chr4 (30-115)||(50766337-50766422)
chr4 (37-128)||(46990963-46991055)
chr4 (213-287)||(2624512-2624589)
chr4 (30-128)||(12265627-12265725)
chr4 (159-289)||(18048885-18049018)
chr4 (30-128)||(37188420-37188519)
chr4 (80-174)||(26123380-26123474)
chr4 (33-74)||(7393418-7393459)
chr4 (63-104)||(13965877-13965918)
chr4 (63-104)||(14346750-14346791)
chr4 (63-104)||(29266649-29266690)
chr4 (47-104)||(46775596-46775653)
chr4 (63-104)||(51646416-51646457)
chr4 (38-106)||(1657295-1657363)
chr4 (46-86)||(13863309-13863349)
chr4 (34-106)||(18502559-18502631)
chr4 (81-121)||(35395551-35395591)
chr4 (260-288)||(47320469-47320497)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (18-290)||(7883072-7883344)
chr8 (18-285)||(23230634-23230901)
chr8 (18-290)||(37971269-37971545)
chr8 (18-269)||(31013439-31013690)
chr8 (80-290)||(20553134-20553344)
chr8 (33-290)||(10377675-10377932)
chr8 (80-290)||(20559637-20559847)
chr8 (80-290)||(20571199-20571409)
chr8 (18-290)||(45445642-45445914)
chr8 (18-290)||(27110296-27110568)
chr8 (25-290)||(7677121-7677386)
chr8 (18-223)||(16928588-16928793)
chr8 (18-289)||(17693444-17693716)
chr8 (23-289)||(3673428-3673694)
chr8 (18-290)||(16247055-16247326)
chr8 (18-290)||(25190896-25191170)
chr8 (18-290)||(40211131-40211405)
chr8 (33-288)||(15344294-15344551)
chr8 (33-288)||(15433359-15433616)
chr8 (33-288)||(15524663-15524920)
chr8 (18-290)||(14544726-14545006)
chr8 (36-288)||(1236546-1236800)
chr8 (18-290)||(28086643-28086916)
chr8 (33-202)||(43833842-43834011)
chr8 (18-289)||(9637240-9637511)
chr8 (18-264)||(33214502-33214748)
chr8 (18-290)||(40618904-40619176)
chr8 (18-201)||(30568152-30568335)
chr8 (33-202)||(14585751-14585920)
chr8 (33-228)||(18890545-18890740)
chr8 (33-228)||(42046269-42046464)
chr8 (73-288)||(1239283-1239500)
chr8 (46-289)||(29617133-29617379)
chr8 (33-195)||(7198041-7198203)
chr8 (30-287)||(471007-471266)
chr8 (38-250)||(14916039-14916250)
chr8 (18-289)||(24186492-24186762)
chr8 (25-290)||(36948276-36948540)
chr8 (18-288)||(27498197-27498465)
chr8 (36-242)||(41896551-41896757)
chr8 (30-252)||(21237814-21238034)
chr8 (63-290)||(28897695-28897922)
chr8 (30-277)||(33347364-33347610)
chr8 (84-289)||(5333413-5333621)
chr8 (30-197)||(8867884-8868054)
chr8 (30-197)||(24099099-24099260)
chr8 (87-195)||(39657535-39657643)
chr8 (103-289)||(8443427-8443616)
chr8 (39-288)||(3240365-3240617)
chr8 (81-224)||(29939352-29939495)
chr8 (63-285)||(5046744-5046966)
chr8 (81-290)||(34609816-34610031)
chr8 (18-154)||(41684504-41684631)
chr8 (20-99)||(8412355-8412434)
chr8 (80-290)||(8826195-8826407)
chr8 (30-133)||(41060106-41060209)
chr8 (36-115)||(43889955-43890034)
chr8 (35-128)||(11267168-11267262)
chr8 (30-193)||(26468993-26469152)
chr8 (30-129)||(11725839-11725939)
chr8 (66-186)||(12184379-12184499)
chr8 (66-186)||(12428807-12428927)
chr8 (30-146)||(34493132-34493248)
chr8 (37-128)||(37565711-37565803)
chr8 (59-171)||(18846334-18846450)
chr8 (30-115)||(2656044-2656129)
chr8 (30-115)||(4809138-4809223)
chr8 (30-115)||(9498424-9498509)
chr8 (30-115)||(9619182-9619267)
chr8 (30-115)||(11464345-11464430)
chr8 (30-115)||(29777393-29777478)
chr8 (40-128)||(33342594-33342683)
chr8 (37-128)||(42447859-42447951)
chr8 (30-129)||(8094859-8094956)
chr8 (30-128)||(14906748-14906847)
chr8 (30-128)||(44099761-44099860)
chr8 (30-115)||(28240015-28240100)
chr8 (30-115)||(33896260-33896345)
chr8 (30-193)||(43135404-43135569)
chr8 (85-128)||(14913236-14913279)
chr8 (53-182)||(33298960-33299090)
chr8 (62-115)||(11197057-11197110)
chr8 (30-128)||(9072878-9072977)
chr8 (30-128)||(34611964-34612063)
chr8 (30-128)||(43192172-43192271)
chr8 (30-128)||(8441345-8441443)
chr8 (148-258)||(8981181-8981291)
chr8 (37-192)||(23851326-23851483)
chr8 (35-127)||(27746945-27747038)
chr8 (30-115)||(32724306-32724391)
chr8 (80-157)||(35283256-35283333)
chr8 (53-180)||(15047000-15047128)
chr8 (45-128)||(16794451-16794535)
chr8 (80-128)||(25238486-25238534)
chr8 (62-128)||(6394228-6394294)
chr8 (235-289)||(8412451-8412505)
chr8 (34-104)||(11162220-11162290)
chr8 (260-290)||(14585685-14585715)
chr8 (34-104)||(28296840-28296910)
chr8 (183-245)||(44091749-44091811)
chr8 (47-104)||(10338569-10338626)
chr8 (63-124)||(39646064-39646125)
chr8 (30-115)||(43431913-43431998)
chr8 (54-102)||(15665862-15665910)
chr8 (34-94)||(17019429-17019489)
chr8 (84-124)||(17427093-17427133)
chr8 (84-124)||(17430743-17430783)
chr8 (34-94)||(17549866-17549926)
chr8 (84-128)||(20227175-20227219)
chr8 (205-289)||(41684412-41684496)
chr8 (65-128)||(44578190-44578254)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (19-290)||(8001380-8001651)
chr7 (18-290)||(39171423-39171695)
chr7 (25-290)||(48316652-48316917)
chr7 (18-290)||(37837291-37837563)
chr7 (46-290)||(9449998-9450242)
chr7 (18-290)||(34899440-34899712)
chr7 (18-290)||(12141140-12141413)
chr7 (20-290)||(47590297-47590567)
chr7 (19-290)||(42978596-42978867)
chr7 (18-285)||(48061413-48061680)
chr7 (18-290)||(45349632-45349904)
chr7 (46-290)||(19296856-19297100)
chr7 (18-251)||(28044589-28044822)
chr7 (25-290)||(30756659-30756924)
chr7 (26-290)||(38798767-38799031)
chr7 (18-283)||(19404590-19404855)
chr7 (18-290)||(39328627-39328895)
chr7 (18-242)||(40993191-40993415)
chr7 (18-288)||(46700023-46700292)
chr7 (63-290)||(13796807-13797037)
chr7 (18-290)||(9977043-9977311)
chr7 (18-289)||(24770233-24770502)
chr7 (18-290)||(25287021-25287291)
chr7 (30-290)||(41553280-41553542)
chr7 (33-228)||(35132995-35133190)
chr7 (30-290)||(26623634-26623895)
chr7 (33-228)||(22742992-22743187)
chr7 (36-290)||(28476206-28476466)
chr7 (63-288)||(5348470-5348695)
chr7 (30-227)||(35664980-35665177)
chr7 (38-289)||(39229002-39229251)
chr7 (81-290)||(24069290-24069502)
chr7 (33-290)||(25255213-25255470)
chr7 (30-252)||(11343834-11344055)
chr7 (18-128)||(28407751-28407861)
chr7 (33-186)||(48930797-48930950)
chr7 (105-289)||(5792783-5792967)
chr7 (118-223)||(28062156-28062261)
chr7 (27-290)||(3267059-3267317)
chr7 (37-193)||(35261385-35261542)
chr7 (93-290)||(38880485-38880686)
chr7 (30-228)||(4999874-5000072)
chr7 (30-193)||(22927695-22927860)
chr7 (30-135)||(46822588-46822692)
chr7 (36-193)||(13592340-13592498)
chr7 (30-133)||(29617545-29617647)
chr7 (37-115)||(46822182-46822260)
chr7 (30-193)||(433516-433681)
chr7 (30-193)||(21266477-21266642)
chr7 (30-129)||(32684820-32684920)
chr7 (33-193)||(43369602-43369762)
chr7 (116-289)||(3224342-3224517)
chr7 (33-115)||(31235612-31235694)
chr7 (37-290)||(969321-969555)
chr7 (113-202)||(24350767-24350856)
chr7 (30-191)||(26610625-26610785)
chr7 (159-290)||(41553753-41553887)
chr7 (79-138)||(3398328-3398387)
chr7 (30-128)||(17222825-17222924)
chr7 (30-128)||(23085674-23085773)
chr7 (30-120)||(2407751-2407841)
chr7 (33-157)||(25068181-25068300)
chr7 (30-115)||(2843066-2843151)
chr7 (30-115)||(34773878-34773963)
chr7 (30-115)||(35496000-35496085)
chr7 (30-128)||(26492518-26492617)
chr7 (81-128)||(27341698-27341745)
chr7 (30-205)||(38050911-38051086)
chr7 (33-119)||(3222952-3223038)
chr7 (113-203)||(5078342-5078432)
chr7 (148-289)||(3394458-3394604)
chr7 (116-289)||(4530064-4530236)
chr7 (30-111)||(7640600-7640681)
chr7 (30-95)||(37849026-37849091)
chr7 (162-290)||(41554101-41554232)
chr7 (30-193)||(45198858-45199023)
chr7 (63-127)||(31481977-31482041)
chr7 (45-128)||(32521769-32521853)
chr7 (30-128)||(23425198-23425297)
chr7 (30-89)||(24351178-24351237)
chr7 (81-128)||(49148011-49148058)
chr7 (30-193)||(1485081-1485247)
chr7 (30-128)||(3861093-3861191)
chr7 (176-290)||(22087303-22087417)
chr7 (36-128)||(42311433-42311524)
chr7 (36-94)||(42408525-42408583)
chr7 (82-128)||(46244149-46244195)
chr7 (76-125)||(17773416-17773465)
chr7 (46-128)||(1448673-1448754)
chr7 (37-128)||(6559030-6559122)
chr7 (30-128)||(26583862-26583962)
chr7 (53-128)||(14046688-14046765)
chr7 (53-128)||(14356718-14356795)
chr7 (34-104)||(21990996-21991066)
chr7 (260-290)||(24350919-24350949)
chr7 (34-104)||(38649083-38649153)
chr7 (63-104)||(10574698-10574739)
chr7 (38-111)||(21603785-21603858)
chr7 (36-128)||(23786728-23786821)
chr7 (47-104)||(46918718-46918775)
chr7 (30-129)||(20083490-20083590)
chr7 (35-115)||(20116749-20116828)
chr7 (84-128)||(44311688-44311732)
chr7 (59-103)||(44527074-44527118)
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (18-284)||(9797367-9797633)
chr3 (21-290)||(6954532-6954801)
chr3 (18-290)||(45568278-45568550)
chr3 (18-287)||(52922950-52923219)
chr3 (18-290)||(21533642-21533914)
chr3 (18-288)||(48650567-48650837)
chr3 (18-290)||(36461270-36461536)
chr3 (18-290)||(33579863-33580135)
chr3 (18-290)||(9998450-9998722)
chr3 (18-290)||(43488424-43488695)
chr3 (20-290)||(40487308-40487578)
chr3 (20-290)||(10229459-10229729)
chr3 (18-290)||(10108219-10108491)
chr3 (18-290)||(10233053-10233325)
chr3 (18-290)||(40556695-40556957)
chr3 (21-290)||(38545782-38546051)
chr3 (18-277)||(32701487-32701746)
chr3 (18-252)||(21431634-21431870)
chr3 (18-249)||(46304354-46304584)
chr3 (18-288)||(54148976-54149246)
chr3 (22-251)||(7448751-7448980)
chr3 (22-251)||(7456893-7457122)
chr3 (29-290)||(12050492-12050753)
chr3 (25-290)||(47896135-47896399)
chr3 (20-289)||(21313020-21313289)
chr3 (18-290)||(47041881-47042154)
chr3 (53-290)||(38859980-38860225)
chr3 (20-289)||(20464805-20465074)
chr3 (33-288)||(53807706-53807963)
chr3 (18-290)||(20608736-20609004)
chr3 (31-289)||(14859474-14859732)
chr3 (63-290)||(12149662-12149889)
chr3 (33-290)||(51923703-51923967)
chr3 (18-289)||(44959806-44960056)
chr3 (64-290)||(23799789-23800015)
chr3 (18-172)||(4711583-4711737)
chr3 (33-249)||(628771-628986)
chr3 (33-202)||(8914783-8914952)
chr3 (37-202)||(51303495-51303660)
chr3 (19-290)||(19339159-19339429)
chr3 (33-202)||(7546686-7546856)
chr3 (33-242)||(21289662-21289871)
chr3 (30-263)||(29922067-29922299)
chr3 (30-263)||(29971220-29971452)
chr3 (18-287)||(37040755-37041023)
chr3 (30-227)||(50194180-50194377)
chr3 (33-197)||(42460825-42460989)
chr3 (30-288)||(35175386-35175647)
chr3 (33-202)||(16235497-16235666)
chr3 (114-290)||(43016838-43017014)
chr3 (148-290)||(35864895-35865037)
chr3 (18-139)||(43017022-43017143)
chr3 (103-287)||(45425578-45425762)
chr3 (62-290)||(53099773-53099999)
chr3 (24-290)||(18011003-18011269)
chr3 (30-249)||(48199801-48200024)
chr3 (30-258)||(4821822-4822049)
chr3 (23-258)||(26275657-26275892)
chr3 (33-290)||(27706074-27706338)
chr3 (103-287)||(45424785-45424968)
chr3 (33-288)||(41818194-41818455)
chr3 (30-172)||(9173849-9173990)
chr3 (185-290)||(36910640-36910746)
chr3 (18-204)||(19619783-19619968)
chr3 (33-146)||(38142652-38142765)
chr3 (33-145)||(27856293-27856405)
chr3 (58-251)||(44805052-44805243)
chr3 (18-167)||(46220769-46220918)
chr3 (52-287)||(26739224-26739462)
chr3 (63-186)||(3085179-3085302)
chr3 (18-288)||(31271665-31271910)
chr3 (18-133)||(20987589-20987703)
chr3 (33-193)||(53508306-53508462)
chr3 (30-193)||(3848744-3848909)
chr3 (115-289)||(20987729-20987903)
chr3 (61-154)||(7792063-7792156)
chr3 (63-155)||(12946845-12946937)
chr3 (61-221)||(52115897-52116057)
chr3 (30-128)||(29503611-29503710)
chr3 (18-112)||(35864799-35864893)
chr3 (36-129)||(49552055-49552149)
chr3 (30-115)||(22803194-22803279)
chr3 (30-115)||(36906286-36906371)
chr3 (30-98)||(24175976-24176044)
chr3 (30-128)||(25631351-25631450)
chr3 (22-133)||(42455657-42455768)
chr3 (30-115)||(12116262-12116347)
chr3 (30-119)||(13458985-13459074)
chr3 (30-128)||(25162586-25162685)
chr3 (30-115)||(32607633-32607718)
chr3 (30-111)||(38440416-38440497)
chr3 (30-115)||(44907224-44907309)
chr3 (131-290)||(29239323-29239485)
chr3 (159-288)||(12947248-12947380)
chr3 (35-128)||(38854866-38854960)
chr3 (30-115)||(17237969-17238054)
chr3 (38-202)||(25460851-25461016)
chr3 (30-99)||(46934819-46934888)
chr3 (37-128)||(39917230-39917322)
chr3 (60-128)||(47176038-47176106)
chr3 (30-128)||(21916623-21916722)
chr3 (92-223)||(26716014-26716145)
chr3 (30-128)||(30648544-30648643)
chr3 (63-193)||(46178653-46178784)
chr3 (30-128)||(50611243-50611342)
chr3 (30-200)||(3656027-3656196)
chr3 (53-151)||(7887320-7887417)
chr3 (53-115)||(25849973-25850035)
chr3 (45-145)||(32246551-32246648)
chr3 (101-151)||(51487217-51487267)
chr3 (244-288)||(9320042-9320086)
chr3 (34-106)||(34960653-34960725)
chr3 (30-89)||(2342638-2342697)
chr3 (159-289)||(4396308-4396441)
chr3 (30-117)||(20911434-20911521)
chr3 (80-182)||(36734568-36734671)
chr3 (34-104)||(913041-913111)
chr3 (34-104)||(1074619-1074689)
chr3 (102-228)||(44647606-44647732)
chr3 (260-290)||(51487086-51487116)
chr3 (39-127)||(6903071-6903160)
chr3 (38-115)||(14464674-14464751)
chr3 (30-115)||(37169393-37169478)
chr3 (47-103)||(11819417-11819473)
chr3 (260-288)||(21431610-21431638)
chr3 (38-126)||(30830122-30830210)
chr3 (37-97)||(46979832-46979892)
chr3 (35-87)||(51202094-51202146)
chr3 (33-85)||(51487270-51487322)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (18-290)||(38597780-38598052)
chr5 (18-290)||(13007212-13007484)
chr5 (18-290)||(24229617-24229889)
chr5 (18-280)||(34945386-34945648)
chr5 (18-290)||(9113558-9113830)
chr5 (18-289)||(6011971-6012242)
chr5 (20-288)||(25980143-25980410)
chr5 (20-290)||(26825413-26825683)
chr5 (18-288)||(38007343-38007612)
chr5 (18-289)||(13421917-13422188)
chr5 (18-289)||(14726294-14726565)
chr5 (20-290)||(35850782-35851050)
chr5 (18-290)||(11976768-11977040)
chr5 (23-290)||(8096336-8096602)
chr5 (19-290)||(6216882-6217152)
chr5 (46-290)||(31391614-31391858)
chr5 (66-290)||(7930160-7930384)
chr5 (18-282)||(10722752-10723016)
chr5 (141-290)||(11073856-11074005)
chr5 (33-202)||(28540754-28540923)
chr5 (18-265)||(26877942-26878188)
chr5 (33-288)||(14211205-14211467)
chr5 (63-285)||(41630490-41630712)
chr5 (33-242)||(2979154-2979363)
chr5 (36-288)||(8088063-8088317)
chr5 (18-203)||(14082229-14082414)
chr5 (51-277)||(7036215-7036440)
chr5 (33-202)||(19103315-19103484)
chr5 (30-290)||(10332392-10332656)
chr5 (18-247)||(1409524-1409755)
chr5 (34-258)||(35920845-35921069)
chr5 (37-222)||(39567321-39567506)
chr5 (30-290)||(19120893-19121155)
chr5 (37-290)||(37985965-37986218)
chr5 (18-248)||(15571511-15571741)
chr5 (30-128)||(7241939-7242038)
chr5 (30-128)||(7247114-7247213)
chr5 (30-193)||(4954081-4954246)
chr5 (18-289)||(11867652-11867904)
chr5 (30-128)||(19259637-19259736)
chr5 (30-128)||(43148882-43148981)
chr5 (30-115)||(34881886-34881971)
chr5 (30-109)||(41184265-41184344)
chr5 (30-193)||(7150160-7150325)
chr5 (30-128)||(11768154-11768253)
chr5 (30-128)||(27266684-27266783)
chr5 (30-128)||(30298999-30299098)
chr5 (30-128)||(3271227-3271326)
chr5 (30-129)||(7886764-7886863)
chr5 (30-128)||(20257521-20257620)
chr5 (63-173)||(13468708-13468818)
chr5 (30-115)||(16981461-16981546)
chr5 (53-128)||(15571062-15571138)
chr5 (30-102)||(42580070-42580142)
chr5 (30-128)||(781543-781642)
chr5 (30-128)||(7612883-7612982)
chr5 (235-290)||(14082423-14082478)
chr5 (30-128)||(18677291-18677389)
chr5 (30-128)||(27752080-27752179)
chr5 (54-121)||(32691109-32691176)
chr5 (30-128)||(35475163-35475262)
chr5 (37-127)||(43008147-43008238)
chr5 (37-91)||(8772013-8772067)
chr5 (45-115)||(8984845-8984915)
chr5 (81-186)||(8514548-8514653)
chr5 (63-128)||(16758685-16758749)
chr5 (34-111)||(27241382-27241459)
chr5 (80-145)||(31078314-31078379)
chr5 (63-193)||(19280804-19280935)
chr5 (40-128)||(28235740-28235831)
chr5 (30-128)||(9762300-9762396)
chr5 (63-106)||(18654114-18654157)
chr5 (30-128)||(21060108-21060207)
chr5 (37-128)||(24549521-24549612)
chr5 (37-104)||(24874698-24874765)
chr5 (81-128)||(28097304-28097351)
chr5 (260-290)||(2979388-2979418)
chr5 (81-127)||(11192525-11192571)
chr5 (34-104)||(11734562-11734632)
chr5 (260-290)||(28540988-28541018)
chr5 (30-128)||(30298362-30298463)
chr5 (79-121)||(31280881-31280923)
chr5 (259-288)||(19349679-19349708)
chr5 (66-127)||(41749472-41749533)
chr5 (66-115)||(42886647-42886696)
chr5 (36-104)||(39531131-39531199)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (18-290)||(3913407-3913679)
chr6 (18-290)||(32327053-32327322)
chr6 (18-269)||(12170474-12170725)
chr6 (18-290)||(33053001-33053273)
chr6 (18-290)||(23128603-23128875)
chr6 (18-290)||(606189-606461)
chr6 (20-290)||(29319712-29319983)
chr6 (20-289)||(67836-68105)
chr6 (19-290)||(7515037-7515307)
chr6 (20-290)||(30608350-30608619)
chr6 (18-290)||(29255279-29255550)
chr6 (18-280)||(30894595-30894855)
chr6 (37-290)||(127655-127905)
chr6 (23-290)||(34018545-34018812)
chr6 (30-289)||(30493515-30493777)
chr6 (33-202)||(14801900-14802070)
chr6 (30-289)||(26588317-26588579)
chr6 (33-195)||(546111-546273)
chr6 (33-242)||(8102759-8102968)
chr6 (33-290)||(1933540-1933800)
chr6 (33-228)||(30776710-30776905)
chr6 (30-289)||(7976032-7976284)
chr6 (30-184)||(31296911-31297065)
chr6 (18-121)||(21426519-21426622)
chr6 (30-290)||(28981159-28981422)
chr6 (18-129)||(9341484-9341595)
chr6 (18-157)||(14174904-14175043)
chr6 (18-157)||(14179440-14179579)
chr6 (38-192)||(9380106-9380260)
chr6 (30-223)||(20225903-20226096)
chr6 (30-223)||(22119887-22120080)
chr6 (100-289)||(3355103-3355292)
chr6 (76-192)||(1523491-1523607)
chr6 (30-258)||(34185538-34185766)
chr6 (103-285)||(4010430-4010611)
chr6 (84-290)||(528249-528458)
chr6 (53-224)||(31852062-31852232)
chr6 (33-193)||(29743079-29743242)
chr6 (77-157)||(14846113-14846193)
chr6 (84-203)||(32191629-32191748)
chr6 (40-145)||(32802676-32802781)
chr6 (30-121)||(8497129-8497220)
chr6 (30-193)||(27097487-27097650)
chr6 (18-121)||(32060030-32060133)
chr6 (30-203)||(679181-679353)
chr6 (30-193)||(35001677-35001842)
chr6 (30-128)||(4088613-4088712)
chr6 (35-182)||(23947147-23947297)
chr6 (38-193)||(10228766-10228923)
chr6 (39-128)||(33110764-33110854)
chr6 (30-115)||(7880927-7881012)
chr6 (30-115)||(8196232-8196317)
chr6 (30-193)||(16419245-16419410)
chr6 (30-115)||(17334920-17335005)
chr6 (30-115)||(25064403-25064488)
chr6 (30-115)||(28634938-28635023)
chr6 (30-128)||(8027943-8028042)
chr6 (30-128)||(12059598-12059697)
chr6 (30-128)||(12653097-12653196)
chr6 (30-128)||(17237111-17237210)
chr6 (30-115)||(7875869-7875954)
chr6 (149-290)||(24227696-24227837)
chr6 (36-128)||(33740409-33740502)
chr6 (177-289)||(11321461-11321573)
chr6 (30-128)||(6957297-6957386)
chr6 (84-144)||(13546600-13546660)
chr6 (178-290)||(13546657-13546768)
chr6 (30-128)||(4984392-4984491)
chr6 (112-181)||(34222886-34222958)
chr6 (63-128)||(30879596-30879661)
chr6 (30-128)||(4468711-4468804)
chr6 (254-290)||(32059894-32059930)
chr6 (247-290)||(20220863-20220906)
chr6 (247-290)||(22114847-22114890)
chr6 (176-289)||(22571457-22571574)
chr6 (37-115)||(16892648-16892726)
chr6 (34-104)||(21507571-21507641)
chr6 (47-104)||(19402582-19402639)
chr6 (81-125)||(1704028-1704072)
chr6 (88-128)||(8046842-8046882)
chr6 (49-89)||(22571576-22571616)
[»] chr1 (128 HSPs)
chr1 (18-290)||(7337496-7337768)
chr1 (18-290)||(35484224-35484496)
chr1 (18-290)||(45415545-45415817)
chr1 (18-288)||(14872629-14872898)
chr1 (46-290)||(5983823-5984067)
chr1 (18-287)||(21947451-21947720)
chr1 (18-290)||(44915626-44915898)
chr1 (20-290)||(10776296-10776566)
chr1 (18-290)||(32394985-32395256)
chr1 (18-290)||(34878111-34878383)
chr1 (27-290)||(7836637-7836901)
chr1 (18-287)||(3228259-3228528)
chr1 (18-251)||(29738497-29738730)
chr1 (18-224)||(49504428-49504634)
chr1 (18-290)||(27579961-27580233)
chr1 (63-290)||(23291520-23291747)
chr1 (33-288)||(49626900-49627157)
chr1 (30-290)||(47132887-47133150)
chr1 (18-290)||(1742268-1742546)
chr1 (25-290)||(13144652-13144917)
chr1 (33-288)||(24582937-24583194)
chr1 (33-288)||(44543259-44543516)
chr1 (18-271)||(31918994-31919248)
chr1 (33-223)||(48750239-48750429)
chr1 (29-252)||(35461898-35462116)
chr1 (18-194)||(16989454-16989630)
chr1 (18-181)||(4413210-4413373)
chr1 (91-290)||(8211817-8212015)
chr1 (33-228)||(36775558-36775753)
chr1 (18-157)||(11462315-11462454)
chr1 (18-191)||(31984247-31984420)
chr1 (33-288)||(19060896-19061153)
chr1 (33-202)||(34412940-34413107)
chr1 (30-279)||(45789539-45789787)
chr1 (18-202)||(15431499-15431683)
chr1 (40-228)||(37720004-37720192)
chr1 (30-192)||(31317821-31317983)
chr1 (146-290)||(21686860-21687004)
chr1 (33-145)||(24583278-24583390)
chr1 (45-223)||(18939373-18939552)
chr1 (18-145)||(51373691-51373818)
chr1 (30-290)||(12635154-12635417)
chr1 (25-285)||(51916515-51916761)
chr1 (51-258)||(16262880-16263087)
chr1 (18-133)||(21687522-21687637)
chr1 (30-203)||(32678988-32679159)
chr1 (18-226)||(39888233-39888441)
chr1 (39-154)||(16161951-16162066)
chr1 (30-146)||(14489403-14489519)
chr1 (18-130)||(19596293-19596405)
chr1 (18-139)||(50377461-50377582)
chr1 (171-290)||(27456527-27456646)
chr1 (30-284)||(31692312-31692568)
chr1 (80-285)||(9341716-9341923)
chr1 (83-191)||(15492373-15492481)
chr1 (199-285)||(11462462-11462548)
chr1 (101-227)||(43412424-43412550)
chr1 (30-193)||(50165924-50166089)
chr1 (79-224)||(6217717-6217866)
chr1 (178-280)||(36894262-36894365)
chr1 (33-197)||(13075504-13075667)
chr1 (63-203)||(25564072-25564212)
chr1 (30-128)||(25406109-25406208)
chr1 (30-128)||(51868470-51868569)
chr1 (30-128)||(51872020-51872119)
chr1 (179-289)||(940351-940460)
chr1 (27-113)||(27456648-27456734)
chr1 (30-193)||(7342813-7342978)
chr1 (30-115)||(7997960-7998045)
chr1 (30-115)||(31130418-31130503)
chr1 (40-145)||(34529206-34529311)
chr1 (30-162)||(50616520-50616652)
chr1 (30-162)||(50624347-50624479)
chr1 (30-113)||(5701432-5701515)
chr1 (30-128)||(9687030-9687129)
chr1 (109-290)||(41994411-41994595)
chr1 (188-290)||(50377315-50377417)
chr1 (30-115)||(19715720-19715805)
chr1 (30-115)||(31837005-31837090)
chr1 (30-115)||(50271965-50272050)
chr1 (33-128)||(45425894-45425990)
chr1 (84-239)||(32873763-32873918)
chr1 (30-128)||(39927380-39927479)
chr1 (63-172)||(41081562-41081672)
chr1 (30-193)||(9172581-9172746)
chr1 (30-193)||(9180563-9180728)
chr1 (35-108)||(9919566-9919639)
chr1 (30-115)||(38520360-38520445)
chr1 (30-115)||(50148541-50148626)
chr1 (79-194)||(7311980-7312096)
chr1 (18-94)||(8211140-8211216)
chr1 (37-128)||(19723470-19723562)
chr1 (103-203)||(24597242-24597342)
chr1 (123-223)||(26535403-26535503)
chr1 (18-98)||(26535515-26535595)
chr1 (30-128)||(5324384-5324482)
chr1 (30-157)||(40163286-40163411)
chr1 (30-128)||(40880838-40880937)
chr1 (36-115)||(48217608-48217687)
chr1 (205-290)||(15434895-15434980)
chr1 (63-115)||(3871579-3871631)
chr1 (80-128)||(5856058-5856106)
chr1 (30-94)||(11454129-11454193)
chr1 (37-128)||(11709539-11709631)
chr1 (30-115)||(27914932-27915014)
chr1 (38-128)||(33291251-33291342)
chr1 (30-115)||(28035310-28035393)
chr1 (35-128)||(34519285-34519379)
chr1 (30-115)||(40646845-40646931)
chr1 (38-193)||(45805662-45805818)
chr1 (38-128)||(27872894-27872985)
chr1 (53-128)||(28053585-28053660)
chr1 (80-123)||(30712196-30712239)
chr1 (178-288)||(34528716-34528829)
chr1 (55-193)||(48365616-48365755)
chr1 (30-105)||(50730795-50730870)
chr1 (246-288)||(15836181-15836223)
chr1 (63-145)||(41740507-41740589)
chr1 (54-128)||(49648744-49648818)
chr1 (142-203)||(1602163-1602224)
chr1 (79-128)||(4397116-4397165)
chr1 (30-115)||(18569136-18569221)
chr1 (30-103)||(34479589-34479661)
chr1 (80-193)||(39987480-39987593)
chr1 (63-104)||(42276689-42276730)
chr1 (30-118)||(5600924-5601012)
chr1 (260-288)||(34413172-34413200)
chr1 (40-88)||(35584457-35584505)
[»] chr2 (120 HSPs)
chr2 (18-285)||(1421675-1421941)
chr2 (20-290)||(7677709-7677979)
chr2 (18-290)||(31788451-31788722)
chr2 (18-276)||(33585569-33585827)
chr2 (18-290)||(4778747-4779019)
chr2 (18-290)||(38445160-38445432)
chr2 (18-289)||(18763463-18763734)
chr2 (18-290)||(27097241-27097512)
chr2 (18-285)||(33923704-33923971)
chr2 (18-290)||(5427703-5427974)
chr2 (18-290)||(7646467-7646744)
chr2 (18-290)||(1415551-1415823)
chr2 (18-290)||(37876440-37876712)
chr2 (18-290)||(36942956-36943227)
chr2 (19-290)||(9169092-9169364)
chr2 (23-290)||(19062187-19062458)
chr2 (18-290)||(4041428-4041700)
chr2 (18-290)||(36691868-36692140)
chr2 (84-290)||(31210507-31210713)
chr2 (18-290)||(25508902-25509174)
chr2 (18-290)||(4903979-4904251)
chr2 (18-288)||(11985067-11985334)
chr2 (35-290)||(43396970-43397225)
chr2 (33-289)||(10929656-10929916)
chr2 (18-288)||(30399863-30400139)
chr2 (33-288)||(17248996-17249253)
chr2 (18-290)||(29279404-29279676)
chr2 (18-285)||(35220324-35220594)
chr2 (18-223)||(12677285-12677489)
chr2 (23-290)||(31128624-31128886)
chr2 (18-258)||(29173551-29173793)
chr2 (110-290)||(7448241-7448421)
chr2 (23-286)||(8809278-8809540)
chr2 (33-228)||(10237065-10237260)
chr2 (30-257)||(24461470-24461697)
chr2 (24-290)||(19028754-19029020)
chr2 (63-288)||(32448495-32448725)
chr2 (33-223)||(3309006-3309196)
chr2 (25-212)||(4100417-4100594)
chr2 (39-290)||(12554036-12554287)
chr2 (30-269)||(28871634-28871873)
chr2 (18-197)||(17994560-17994743)
chr2 (33-277)||(17151430-17151675)
chr2 (30-227)||(33760039-33760236)
chr2 (30-197)||(37994371-37994538)
chr2 (59-256)||(19595775-19595975)
chr2 (159-290)||(42698676-42698807)
chr2 (33-195)||(14955618-14955780)
chr2 (37-285)||(18107603-18107848)
chr2 (77-255)||(23933512-23933690)
chr2 (63-290)||(29574507-29574737)
chr2 (21-289)||(39310703-39310957)
chr2 (30-242)||(14423367-14423583)
chr2 (33-285)||(34128533-34128788)
chr2 (51-228)||(37416766-37416943)
chr2 (30-202)||(41694703-41694874)
chr2 (38-193)||(16376030-16376185)
chr2 (92-289)||(4264467-4264664)
chr2 (207-290)||(4099097-4099180)
chr2 (80-282)||(6436609-6436811)
chr2 (76-228)||(12647004-12647153)
chr2 (66-290)||(6358763-6358982)
chr2 (30-139)||(28533800-28533909)
chr2 (30-128)||(8806023-8806122)
chr2 (40-105)||(280977-281042)
chr2 (30-128)||(84006-84105)
chr2 (30-128)||(8971453-8971552)
chr2 (55-140)||(19597984-19598068)
chr2 (30-128)||(4228280-4228379)
chr2 (30-128)||(9986167-9986266)
chr2 (30-128)||(21570233-21570332)
chr2 (46-125)||(41327898-41327977)
chr2 (18-92)||(31193170-31193244)
chr2 (36-128)||(7015542-7015635)
chr2 (30-115)||(27248976-27249061)
chr2 (35-115)||(31580485-31580565)
chr2 (169-265)||(36175481-36175577)
chr2 (30-128)||(2808298-2808396)
chr2 (30-162)||(21612360-21612493)
chr2 (30-128)||(34600371-34600470)
chr2 (30-113)||(40659757-40659840)
chr2 (30-193)||(20046907-20047072)
chr2 (39-167)||(22538162-22538290)
chr2 (30-102)||(30420853-30420925)
chr2 (159-258)||(11833503-11833602)
chr2 (30-128)||(41431185-41431284)
chr2 (35-128)||(4192994-4193088)
chr2 (46-128)||(18114025-18114107)
chr2 (40-126)||(25087196-25087282)
chr2 (46-128)||(32190820-32190902)
chr2 (169-223)||(41327564-41327618)
chr2 (54-115)||(3268684-3268745)
chr2 (35-193)||(32678941-32679100)
chr2 (45-128)||(32913397-32913481)
chr2 (30-128)||(27949583-27949682)
chr2 (62-128)||(10548343-10548409)
chr2 (38-128)||(32445367-32445457)
chr2 (46-115)||(38575326-38575395)
chr2 (21-121)||(42698558-42698661)
chr2 (54-126)||(18056331-18056403)
chr2 (30-94)||(36234190-36234254)
chr2 (37-121)||(39641138-39641222)
chr2 (30-89)||(6174013-6174072)
chr2 (80-127)||(13014819-13014866)
chr2 (38-174)||(17319431-17319568)
chr2 (35-94)||(22421920-22421979)
chr2 (159-193)||(3240977-3241011)
chr2 (37-115)||(3725351-3725429)
chr2 (34-104)||(5754616-5754686)
chr2 (37-91)||(7558647-7558701)
chr2 (30-128)||(11189468-11189566)
chr2 (76-221)||(14416223-14416369)
chr2 (34-104)||(25622769-25622839)
chr2 (34-104)||(43473862-43473932)
chr2 (260-289)||(12647999-12648028)
chr2 (53-106)||(34471292-34471345)
chr2 (53-130)||(37628855-37628932)
chr2 (62-106)||(15673721-15673765)
chr2 (30-94)||(40625882-40625946)
chr2 (84-124)||(42577268-42577308)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (18-289)||(15476-15748)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-290)||(32580-32852)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (18-290)||(1328-1600)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (18-290)||(71703-71969)
[»] scaffold0884 (1 HSPs)
scaffold0884 (19-285)||(1807-2073)
[»] scaffold0136 (3 HSPs)
scaffold0136 (22-288)||(9879-10145)
scaffold0136 (23-275)||(38052-38306)
scaffold0136 (53-128)||(34630-34705)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (18-290)||(65875-66147)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (38-265)||(50785-51012)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (18-290)||(31107-31379)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-290)||(71140-71405)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (63-290)||(8496-8723)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (30-258)||(57933-58161)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (30-287)||(6014-6274)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (18-290)||(36814-37082)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (30-290)||(7700-7960)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (89-273)||(1723-1907)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (29-290)||(93087-93351)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (18-196)||(14704-14881)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (30-251)||(92341-92562)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (40-228)||(1533-1721)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (31-203)||(3891-4058)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (38-193)||(5485-5642)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (85-173)||(4273-4361)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (40-193)||(8778-8933)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (46-128)||(26936-27018)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (46-228)||(18944-19117)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (30-115)||(16145-16230)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (33-102)||(83264-83333)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (109-249)||(25315-25455)
scaffold0154 (19-87)||(25468-25536)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (30-115)||(361624-361709)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (37-128)||(201205-201297)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (183-245)||(8099-8161)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (64-129)||(6457-6523)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 128)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 21686075 - 21686344
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21686075 acatcagatacaaacatcgctacaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacatacagcggcaaaatgcctacaaata 21686174  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21686175 atatgataaaacctaaatcaccaaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaactgattgatgtagatctt 21686274  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21686275 tcaataggaactgaacaaacaccgcggcaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 21686344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2521054 - 2520786
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521054 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 2520955  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520954 tacgataaaatctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgctttaatttgtaattgattgatgtagatcttt 2520855  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520854 caataggaattgaacaaacatcgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 2520786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13634391 - 13634119
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13634391 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctccgaacaaattcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaataactacaaata 13634292  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13634291 ataagataaaacctaaatcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 13634192  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13634191 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatctaacctcgcacaagacgacgaacaacacaacg 13634119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22611442 - 22611187
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22611442 cgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaatttaataccatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaag 22611343  T
Q  135 tcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaaca 234  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22611342 tcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaactgaaca 22611243  T
Q  235 aacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22611242 aacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 22611187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32766790 - 32766519
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32766790 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgcaaagggtgaatctgagaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 32766691  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766690 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtagatctt 32766591  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32766590 ttaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 32766519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 19853345 - 19853617
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19853345 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaata 19853444  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19853445 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgtagatctt 19853544  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  19853545 tcaataggaactgaacaaacaccgtgataaaacgcaaaatcaaatgccacataagacgacgaacaacacaacg 19853617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 56040479 - 56040751
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56040479 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 56040578  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56040579 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgccgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 56040678  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56040679 ccaataggaactaaacaaacactgcgacaagacgcaaaattaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 56040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Original strand, 24098902 - 24099167
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24098902 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagagtggatctgcgaacaaactcacagcacc-aagttaatagcat-caacggcaaaatgcctacaaata 24098999  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24099000 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 24099099  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24099100 tcaataggaactgaacaaactccgcgacaagacgcgaaatcaatcgccgcacaagacgacgaacaaca 24099167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53811295 - 53811032
Alignment:
Q  26 tacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53811295 tacatacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaa-ctcacaacacccaagttaatagcatacaacgccaaaatgcctacaaataatatgata 53811197  T
Q  126 aaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  53811196 aaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatagg 53811097  T
Q  226 aactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53811096 aactgaacaaaccccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 53811032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 26633504 - 26633776
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||    
T  26633504 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagctaatagcatacaacggtaaaatgcctatattta 26633603  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26633604 atatgataaaacctaagtcacagaaatattcatgcttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatcgactgatgtagatctt 26633703  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26633704 tcaataggaactgaacaaacactgcgacaagacgcgaagtccaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 26633776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43510472 - 43510201
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43510472 acatcaaatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatgacatacaacgacaaaatgcctacaaata 43510373  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43510372 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttcaggatctgcaacattgacgtccaaatcattagtttaatttgtaa-tgactgatgtagatctt 43510274  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43510273 tcaagaggaattgaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgcacaagacgacaaataacacaacg 43510201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53444383 - 53444122
Alignment:
Q  29 aaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  53444383 aaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggaaaaatatctacaaataatatgataaaa 53444284  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||     
T  53444283 cctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacattgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaa 53444184  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  53444183 taaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaataccgcacaagacgacgaacaacacaacg 53444122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10496610 - 10496342
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggt-aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10496610 atcaaatacaaatatcgctaaaaacgttaaaggatgaatctgcgaacaaactcaaagcacccaagttaatagcatacgacagcaaaatgcctacaaataa 10496511  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  10496510 tatgataaaacctaactcaccgaaatacccatgcttacggatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatcttt 10496411  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  10496410 caataggaactaaacgaacactgcgacaagacgcaaaatcaaacgtcacacaagacgacgaacaacaca 10496342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35348583 - 35348311
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35348583 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaata 35348484  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |   |  ||||||    
T  35348483 atatgataaaacctaagtcattgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacatccagatcattggttgaatttgtaattgactatcgccgatctt 35348384  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||  |||| ||| |||||| | ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35348383 tcaatagtaactaaacgaacaccacaacaagaaacgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 35348311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 17949158 - 17949429
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaag-gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||| ||||    
T  17949158 atcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataa 17949257  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17949258 tatgataaaacctaagtcatcaaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatcttt 17949357  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17949358 caataggaattaaacgaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaacacgacaaacaacacaacg 17949429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 17953010 - 17953281
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaag-gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||| ||||    
T  17953010 atcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataa 17953109  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17953110 tatgataaaacctaagtcatcaaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatcttt 17953209  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17953210 caataggaattaaacgaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaacacgacaaacaacacaacg 17953281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 290
Target Start/End: Original strand, 56156493 - 56156747
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  56156493 gctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaggtaaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataaattgataaaacataagt 56156592  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaa 235  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| ||| |    
T  56156593 caccgaaattcacatgcttccagatctgcaatgttgacgccccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgttaatctttcaagaggaactaaacga 56156692  T
Q  236 acaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56156693 acaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 56156747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 4142597 - 4142860
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||            | |||||||||||||||| |||||||||    
T  4142597 acatcaaatacaaacattgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagca------------gtatacaacggcaaaatgtctacaaata 4142684  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4142685 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 4142784  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaa---cgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4142785 tcaagaggaattgaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 4142860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21662713 - 21662473
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  21662713 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21662614  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  21662613 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgttgatctt 21662514  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  21662513 tcaataggaactaaacgaataccgcgacaagacgcgaaatc 21662473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21671477 - 21671237
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  21671477 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21671378  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  21671377 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgttgatctt 21671278  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  21671277 tcaataggaactaaacgaataccgcgacaagacgcgaaatc 21671237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8670751 - 8670489
Alignment:
Q  28 caaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||  |||||||| || |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8670751 caaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacaacagccaagttaattgcacaaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 8670652  T
Q  128 acctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||    
T  8670651 tcctaagtcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaa 8670552  T
Q  228 ctgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     | ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8670551 ataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagatgactaacaacacaacg 8670489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 29960787 - 29961000
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29960787 agatacaaatatcgctaaaaacataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaaaagcatacaacggcaaaatgcctacaaatagtatg 29960886  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    |||||| ||||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||| |||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29960887 ataaaatctaaatcactaaaatatttatgtttccggatctgcaacgttgatgccaaaatcatcggttgaatttataattgattgatgtagatctttcaat 29960986  T
Q  223 atgaactgaacaaa 236  Q
    | ||||| ||||||    
T  29960987 acgaactaaacaaa 29961000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54022133 - 54021866
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | | |||||| ||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  54022133 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaataatgaatctacgaacaaattcataacattcaagttaataacatacaacgacaaa-tgtctacaaataat 54022035  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||  |||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54022034 atgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgttttcggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattcaatttgtaattgactgatgtcgatctttc 54021935  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54021934 aataggaactaaacgaacaccgcgacaagacacgaaatcaaacgccgcacaagacgactaacaacacaa 54021866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9178622 - 9178357
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9178622 ataccaacatcgttaaaaacataaagggtgaaactgcgaacaaactcacgtcacacaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 9178523  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||||| || || |  ||||||   |||||||  ||||||||| |||| |  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  9178522 aaaaccgaagtctctgaaatacttttgcttccagatctgcaacgttgatgctcaaattattgattggatttgtaattgattgatgtcgatctttcaatag 9178423  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  9178422 gaactaaacgaacaacgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagatgacgaacaatacaacg 9178357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Original strand, 47320260 - 47320435
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47320260 atcgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 47320359  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgat 208  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  47320360 aatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgat 47320435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33921325 - 33921055
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  33921325 agatacacacatcgctgaaaacataaagggagaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaactatacaatgcctacaaataatatg 33921226  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt----aattgattgatgtagatcttt 218  Q
    |||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||    ||||||  ||||| |||||||    
T  33921225 ataaaatctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaattattgattgaatttgtttgtaattgac-gatgtcgatcttt 33921127  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  33921126 caataggaactaaacgaacactgcgacaagacgtgaaatcaaacgtcgcataagacggcgaacaacacaacg 33921055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 51888063 - 51888319
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51888063 ctaaaaatgtaaagggtggatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaatggcaaaacgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 51888162  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    |||| ||||| ||||||| |  || |||||| || || || ||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||    
T  51888163 accagaatactcatgctttcagatatgcaacgttaacatcaaaatcattgattaaatttgtgattgattgaagttgatctttcaatatgaaccaaacgaa 51888262  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||| || |||||    |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  51888263 caccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcataagacgatgaacaacacaacg 51888319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 26090745 - 26091021
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||    
T  26090745 atcagatacaaacaacgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaattcacagcatccaaattaatagcatacaacgacaatatatctgcaaataat 26090844  T
Q  120 atgataaaac----ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    |||||||||     |||| ||||| ||||||  ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  26090845 atgataaaatatatctaagtcaccgaaataccaatgcttccgaatttgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttataattgactgatgtcgatc 26090944  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgc--aaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  26090945 tttcaagatgaactaaacgaacaccgtgataagacgcaaaaaatcaaacgccgcacaaaacggcgaacaacagaacg 26091021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44596935 - 44596668
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  44596935 acatcaaatacaaacatcacaaaaaatataaaggc-gaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatagctacaaata 44596837  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||  ||| || || ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  44596836 atatgataaaatgtaaatcatcgaaatacctatgttttcgaatcagcaacgttgacgtc--aatcattgattgaatttgtaa-tgactgatgtagatttt 44596740  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||| ||||| ||| ||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44596739 ttaataggaactaaacgaacgctgccacaagacgc-aaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacg 44596668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 12199539 - 12199798
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||      
T  12199539 aacatcgctacaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt-aataacatacaacagtaaaatacctacaaataatatgataaatt 12199637  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||| || ||||||| | |||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  12199638 ctaagtcgccaaaattctcatgcttccgaatctgtaacgtcgacgctcaaatctttgattgaatctgtaactgactgaagttgatatttcaatatgaact 12199737  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||    
T  12199738 aaacgaacaccgcaacaagacgcaaaatcaaaagctgcacaaaacgatgaacaacacaacg 12199798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43095904 - 43095634
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||     
T  43095904 acatcagatataaacatccctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatagcatacaactacaaaatacctacaaatg 43095805  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| |||   |||| | |||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  43095804 atatgataaaatctaagtcagtgaaattctcatgcttccggatctgcactgttgacggccaaatcattgatttaacttgtaattgactgatgtcgatctt 43095705  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
     ||||| ||||| ||  |||| || |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  43095704 ccaataggaactaaatgaacatcgtgacaagacgcgaaatcaaacaccgtacaagacgactaacaacacaa 43095634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 31891135 - 31891304
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  31891135 atcgctaaaaacgtatagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatataatgaaatcta 31891234  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | || |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  31891235 aatcaccagaatactcatgcttctggatttgcaacgttgacgcccaaatcatggtttgaatttgtgattg 31891304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 52944526 - 52944312
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtcca 178  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52944526 ccaagttaatagcatataactacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtcca 52944427  T
Q  179 aatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaat---ctaacgccgcacaagacg 275  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||     |||||||||||| |||    
T  52944426 aatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaaacaaacgaacaccgcaacaagacgcaaaattaaacaacgccgcacaaaacg 52944327  T
Q  276 acgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||    
T  52944326 acgaacaacacaacg 52944312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 10258734 - 10258999
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |   |||||||||||| |||  |||||     |||||||| |||||||| |||||||||    
T  10258734 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaggataaatctatgaacaaactcacaacactaaagtt-----catacaacagcaaaatgtctacaaata 10258828  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||  | |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  10258829 atatgataaaatctaagtcaccaaaatattcatgcttccgggtatgcaacgttggcgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactaatgtcgatctt 10258928  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||  | || ||||| || ||||||||||    
T  10258929 tcaacatgaactaaacgaacaccgcgtcaagacgcgaaatcaaacatcacataagaccactaacaacacaa 10258999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36194951 - 36194706
Alignment:
Q  51 ggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacat 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  36194951 ggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccat 36194852  T
Q  151 gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccg--cgacaa- 247  Q
    | ||| | ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||  | ||||     
T  36194851 gtttctggatctgcaactttgatgt-caaatcattgattgaatttgtgattgtttgaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaacaccgcacaacaaa 36194753  T
Q  248 -gacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     || || |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36194752 ggatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 36194706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28857665 - 28857403
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  28857665 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagctgccaagttaatagcatataagggcaaaatacctacaaaaaatatgatgaaat 28857566  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||   |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||      
T  28857565 ctaaatcaccagaaaac-catgcttccggatctgaaacgttggcgtccaaatcatcaattgaatatgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaaac 28857467  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| |||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28857466 aaacgaacaccgcaactagacgcggaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacg 28857403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 48257465 - 48257628
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48257465 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaaatccaagttaatagcatacaacggcaaaatacctacaaata 48257564  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaat 181  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||| |||| || || ||||| ||| |||||||||||||    
T  48257565 atatgataaaactcaagtcaccgaaatacccatgttttcggatctgtaacgttgacgtccaaat 48257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36161975 - 36161713
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  36161975 aacatcgttaaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacgaccaaatgcctacaaataatatgataaaat 36161876  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || || ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||     ||||||| ||||||||     
T  36161875 ctaaatcacgaaaatactcatgttttcggatctgtaacgttggcgtccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaaactaatctttcgatatgaaca 36161776  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||| |||||||| |||| ||| ||||||    |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  36161775 aaacgaacaccgcaacaaaacgtaaaatcaaacaacgacgcacaagacaacgaacaaaacaac 36161713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 289
Target Start/End: Original strand, 22038655 - 22038909
Alignment:
Q  31 acatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa-tgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||| || |||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  22038655 acatcgctaaaaacgtaaagggtaaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaa--------aacggcaaaaatgcctacaaatattatgataaaat 22038746  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  22038747 ttaaatcaccgaaatacacatgcttctggatctgcaacattgatgtcaaaatcatttattgaatatgtgattgactgaagtagatctttcaatatgaacc 22038846  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||| | |||| | ||||||||| |||||    |||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  22038847 aaacgagcaccacaacaagacgcgaaatcaaacaacgccacacaaaaggacgaacaacacaac 22038909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22301099 - 22300850
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta-caaataatatgataaaacctaaatcaccaaaa 143  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  22301099 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatagcggcaaaatacctatgaaaaaatataatgaaatctaaatcaccaaaa 22301000  T
Q  144 tacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcg 243  Q
    ||| |||| || || ||||||||| | | |||||||||||| | |||||| ||| ||||| | | |  |||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  22300999 tactcatgatttcggatctgcaacgtcggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactaaagctgatctttcaagatgagctaaacaaacaccgca 22300900  T
Q  244 acaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300899 acaggacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 22300850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18936043 - 18935834
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18936043 atcgctaaaaacatatagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaataacgtacaatagcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 18935944  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| |||||  ||||||  | ||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||| | ||||  ||| ||  ||||||||||| ||||  ||    
T  18935943 aatcaccagaatacctatgcttttggatctgcaacgttgatgcccaaatcattaattgaatttttgattgtctgaagttaatctttcaatacgaaccaaa 18935844  T
Q  233 caaacaccgc 242  Q
    | ||||||||    
T  18935843 cgaacaccgc 18935834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27652204 - 27652036
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  27652204 atcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatgaaatcta 27652105  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    || ||| | ||||| |||||||| | ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27652104 aa-cactagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattg 27652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43853707 - 43853551
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||     
T  43853707 aacatcgctaaaaatgtaaatggttaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaatgctgacaaataatatgataaaat 43853608  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattg 186  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43853607 ctaaatcatcttaatacgcatgcttccgaatctgcaacgttgacgtacaaatcattg 43853551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 6155065 - 6155268
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacag---cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6155065 aacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatag 6155164  T
Q  127 aacctaaatcaccaaaatacaca---tgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    || ||||||||||| ||||   |   |||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||||  ||| ||||| |||    ||||||||||||    
T  6155165 aatctaaatcaccagaatatctatgttgcttccggatctgcaacgtttacgtctaaatcatcgattgaacatgtgattgactgaaactgatctttcaata 6155264  T
Q  224 tgaa 227  Q
    ||||    
T  6155265 tgaa 6155268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 36204224 - 36204391
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| || |||| |||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  36204224 aacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatccaaattaataacatataatggcaaaatatctacaaataatatgataaaat 36204323  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    ||||||||||| ||||  |   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36204324 ctaaatcaccagaatattctctcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgt 36204391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9714171 - 9713979
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9714171 atcgttaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacactcaagttaacaacatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 9714072  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    | |||| | |||| ||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |  |||||| |||||||||    
T  9714071 attcactagaatatac--gcttccagatctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaatttgtgattgtttgaagctgatcttccaatatgaa 9713979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 11299864 - 11300095
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11299864 aaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacataaaacgccaaaatgcctacgaataatatgataaaacataagtcac 11299963  T
Q  139 caaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaaca 238  Q
    | |||| |||||                | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |   ||||||||||||  || ||||  ||||    
T  11299964 cgaaattcacat----------------cgttgacgcccaaatcattgtttgaatttgtaatcgactgct---gatctttcaatagaaaatgaatgaaca 11300044  T
Q  239 ccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11300045 ccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaac 11300095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37030492 - 37030265
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||  |||||| |||| ||    ||||    
T  37030492 aacaaatttacagcacccaagttaatagcatacaatggctaaatgtctacaaataatatgataatttctaagtcactgaaatacccatgtttttcgatct 37030393  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||  |||  |||  |||  |||||||||||||||   ||||| |||    
T  37030392 gcaacgtcgatgtccaaatcattgattgaatctgtatttgattgaagttgatcttttgatagaaaccaaacgtacaccgcgacaagacatgaaatcaaac 37030293  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  37030292 gccatacaagacgacgaacaacacaacg 37030265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 52060775 - 52061026
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  | || ||    
T  52060775 ctaaaaatgtaaaatgtgaatctgcaaacaaactcataacattcaaattaatagtatacaacaacaaaatgcctacaaaaaatatgataaattcaaagtc 52060874  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    |   |||||  ||||||||   |||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| | ||| ||    
T  52060875 attgaaatatccatgcttctagatctacaacatcaacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaataggaattaaacgaa 52060974  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| | ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  52060975 cacctcaacaagacacataatcaaacgccgtacaagacgacgaacatcacaa 52061026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9048918 - 9048672
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  9048918 aaaacgtaaagggtgaatctgtaaacaaactcacaacacccaagtttatagcacatgacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatttaaatcatc 9048819  T
Q  140 aaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacac 239  Q
    | ||||| |||| || |  || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | ||| |   ||||||||| |  |||  ||| |||||    
T  9048818 agaatacccatgttttcagatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtgattaactgaagcttatctttcaaaagaaaccaaacgaacac 9048719  T
Q  240 cgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaa 283  Q
    ||| ||||||| | |||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  9048718 cgcaacaagacccgaaatcagacaacgccgcacaagacgacaaacaa 9048672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45418730 - 45418609
Alignment:
Q  76 cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgt 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||   ||||| || ||||||||| |||| |     
T  45418730 cacccatgttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatactagtgctttcggatctgcaacgttgatgc 45418631  T
Q  176 ccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  45418630 ccaaatcattgattgaatttgt 45418609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37465715 - 37465631
Alignment:
Q  61 caaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37465715 caaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaata 37465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Original strand, 1621362 - 1621547
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1621362 gctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaattgcatacaacgg--aaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaat 1621459  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    ||||| |||||     |||| | ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  1621460 caccagaatac----ccttctggatctgcaacgtt-acgcccaaatcattgattgaatttatgattgtttgaagctgatctttcaatacgaac 1621547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 289
Target Start/End: Original strand, 48351093 - 48351291
Alignment:
Q  92 atacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||   |||||||||||||| | ||||    
T  48351093 atacaacgacaaaatgcatacaaataacatgatacaatctaaatcaccgtaatactcatgcttccagatctgcaacgcggacgtccaaatcataggttga 48351192  T
Q  192 atttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac--gccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    || ||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  48351193 atatgtgattgactgaagctgatctttcaatataaaccaaacgaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacaagcc-cacaagacgataaacaacacaac 48351291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 21554635 - 21554798
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21554635 aacattgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcattgcatccaagttaatagcaaacaagggcaaaatgcctacaaataataagataaaat 21554734  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
      |||| | || ||||| ||| |||  | |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  21554735 taaaatgatcagaatactcatccttttggatctacaatattgacgttcaaatcattgattgaat 21554798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 52933794 - 52933909
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  52933794 aacatcgctaaaaatgtaaagcgtaaatctgcgcacaaactcacatcactcaagttaataacatacaaaagcaaaatacctacaaataatatgataaaat 52933893  T
Q  130 ctaaatcaccaaaata 145  Q
    ||||||||||| ||||    
T  52933894 ctaaatcaccataata 52933909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Original strand, 31359591 - 31359854
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||  ||||||||| ||| | | |||||||||||||  || | ||||||   |||||||||||||| ||||     
T  31359591 aacatcgttaaaaatgtacaaggtgaatatgtgaacaaactcgcagtatctaagttaatagcatgtaatgacaaaatatttacaaataatatgagaaaat 31359690  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcatt-gcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||  || | |||||| ||| ||||| | | || ||||||| |||| ||||    
T  31359691 ctaaatcaccagattacacatgcttcggaatctgcaacgttgacttccaaattgtttgattgaatctgtgattgactaaagttgatctttaaataggaac 31359790  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatct---aacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
      | ||||||| || ||||||||  |||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31359791 caagcaaacactgcaacaagacgtgaaatcatacaacgtcgcacaagacgacgaataacacaac 31359854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 42032374 - 42032546
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| ||||||  ||||||   ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  42032374 aacatcgttaaaaacataaaggtgaaatttgcaaacaaactcacaacattcaagttaatagcatacaacggcaaaatggctaccaataatatgataacat 42032473  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| | |||| |||| ||| |  ||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  42032474 ctaaatca-caagatactcatgcttctggatcttcaacgttggcacccaaatcatttattgaatatgtgattga 42032546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5119456 - 5119345
Alignment:
Q  176 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacg 275  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  5119456 ccaaatcaatgattaaatttgta-ttgattgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgataagacacaaaatcaaacgccgcaaaagaca 5119358  T
Q  276 acgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||||||    
T  5119357 acgaacaacacaa 5119345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9643640 - 9643389
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||  |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||             |||||||||     
T  9643640 aacatcgataaaagtgtaaagagtaaatttgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatataacggcaaaat------------aatgataaaat 9643553  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||  |||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||     
T  9643552 ttaaatcaccagaatactcatacttccggatctataacattgatgttcaaatcattaattgaatatgtgattgactgaagttgatcttttaatatgaacc 9643453  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| ||||| || |||||| |  |||||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9643452 aaacgaacactgcaacaagatgagaaatcaaacaacgtcgctcaagacgacgaacaacacaacg 9643389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 29120276 - 29120375
Alignment:
Q  82 agttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaat 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||    
T  29120276 agttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagttaccgaaatactcatgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaat 29120375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Original strand, 9145736 - 9145898
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  9145736 aacatcgatgaaaatgtaaaaggtgaatctgcgaacgaactcacaacacctaaattaatagcatacaaaagtaaaatgcctataaacaatatgatacaat 9145835  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaa 192  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || |  ||| |||| ||| ||||||||| |||||    
T  9145836 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatatataacgttgatgtctaaatcattgattgaa 9145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 33332485 - 33332607
Alignment:
Q  101 caaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  33332485 caaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaatgcccattcttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgat 33332584  T
Q  201 tgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    ||  ||| || ||||||||||||    
T  33332585 tgtctgaagttgatctttcaata 33332607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 2069429 - 2069588
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| || || ||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  2069429 atcgctaaaaacgtagagagtaaatttgcgaacaatctcaaagcatccaagttaataacata-aacggtaaaatgcatacaaataatatgataaaatata 2069527  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   || |||||| |||||  |||||| |||| ||||||    
T  2069528 aatcaccataatacccatgcttctaaatttgcaacgttgacacccaaataattgattgaat 2069588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Original strand, 40066048 - 40066160
Alignment:
Q  178 aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  |||| |||||| | |||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  40066048 aaattattgattgaatttgtaattgattaatgtcgatctttccatagaaactaaacaaatatcgcgacaagaggcgaaatcaaacgctgcataagacgac 40066147  T
Q  278 gaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||    
T  40066148 gaacaacacaacg 40066160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 138
Target Start/End: Original strand, 7008852 - 7008942
Alignment:
Q  48 aagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7008852 aagggtgaatctacgaacgaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgtccacaaataatatgataaaatttaaatcac 7008942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 53616475 - 53616560
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53616475 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 53616560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4644122 - 4644038
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaa 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4644122 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaa 4644038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36184764 - 36184697
Alignment:
Q  61 caaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36184764 caaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctagaaatagtatgataaaa 36184697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44947676 - 44947577
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  44947676 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcacaatgcctacaaaaatatatgataaaa 44947577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 146
Target Start/End: Original strand, 22305516 - 22305582
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatac 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22305516 caagttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaagtcatcaaaatac 22305582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 52097746 - 52097840
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  52097746 cgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaataaactcacaacatccaagttaataccatataacgtcataatgcctacaaagatatatgataaaa 52097840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 9645349 - 9645434
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  9645349 aacaccgcaaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaa 9645434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 56199354 - 56199261
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  56199354 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatgtaacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 56199261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 52979020 - 52978884
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||||| ||| |  ||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||||  |||||||||    
T  52979020 acatcagatataaacattgttaaaaacaaaaagggtgaatctgcgacaaaactcacaccatccaagttaataaaatacaatgacaaaataactacaaata 52978921  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgctt 154  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||    
T  52978920 atataataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 52978884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 3335989 - 3336088
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  3335989 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcaaaacattcaagttattagcatataacggcgtaatgcctacaaatatatatgataaaa 3336088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 9528702 - 9528801
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  9528702 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 9528801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 10359374 - 10359472
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10359374 aacaccgctaaaaacgtaaaga-tgaatttgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 10359472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25274147 - 25274048
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  25274147 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 25274048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49410487 - 49410388
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  49410487 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 49410388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12493541 - 12493459
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12493541 taaaggatgaatatacgaacaaactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatgagaaaa 12493459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22806784 - 22806629
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    ||||| |||||| | | |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||    
T  22806784 taaagagtgaatctacgaacaaattcatagcatccaagttaataacatacaacaacaaaatgcttacaaataatatgataatatataagtcaccgaaata 22806685  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattga 207  Q
       |||||      ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  22806684 tttatgct------tctacaacattgatgtccaaatcattgattgaatctataattgattga 22806629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 2115413 - 2115498
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  2115413 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 2115498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21090406 - 21090321
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  21090406 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacactatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaa 21090321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 47417926 - 47417841
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  47417926 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcattcaagttaataacatataacggcataatgcctacaaa 47417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51318243 - 51318150
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  51318243 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 51318150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 29966590 - 29966522
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaac 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29966590 aacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaac 29966522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 35964801 - 35964965
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| | ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||  || ||| |||||||| | |||||||||||    
T  35964801 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgagtttgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacaacataattcctacaaaaatatatgataaaa 35964900  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || | ||  |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  35964901 ttaaagtgactgaaatactcatgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 35964965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1532172 - 1532073
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  1532172 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 1532073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 10389579 - 10389678
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| |||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  10389579 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatccacgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 10389678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 101
Target Start/End: Original strand, 19896468 - 19896539
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggc 101  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  19896468 aacatcgttaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcatatcatccaagttaatagcatacaacggc 19896539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 34024263 - 34024362
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  34024263 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcttacaaaaatatatgataaaa 34024362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 38166147 - 38166238
Alignment:
Q  102 aaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||   |||||| || ||||| ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38166147 aaaatgcatacaaataatattataaaattaaaatcaacagaatactcatgtctccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgcttgaat 38166238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 38706535 - 38706634
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | |||||||||||    
T  38706535 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgtctacaaaaatatatgataaaa 38706634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47158456 - 47158296
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||| ||| ||| |  ||||    
T  47158456 aacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaacgataaagtgcatacaaataa-atgataatatctaaatcagcagaatactcatactttcagatct 47158358  T
Q  163 gcaacat--tgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||| ||  ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| ||  |||||||||||    
T  47158357 gcaa-atgatgacggccaaatcattgattgaatctgtgattgtctgaagttaatctttcaata 47158296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35261449 - 35261371
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||    
T  35261449 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataagtgcataatgtctacaaa 35261371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Original strand, 43153845 - 43153938
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||   | |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  43153845 atcgctaaaaacgtaaaggatgaat---cgaacaaactcacaacatccaagttaacagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 43153938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43444641 - 43444571
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43444641 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaaattaatagcatataacggcataatgcctacaaa 43444571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20569521 - 20569436
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  20569521 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaa 20569436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36700482 - 36700377
Alignment:
Q  88 tagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgc 187  Q
    |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| || ||||||  || |||||| |||||| |||||||||||     
T  36700482 tagcatacaacgacaaaatgcttttaaataatatgataaaatttaagtcatcgaaatacccacgcttccagatttgcaacgttgacgcccaaatcattga 36700383  T
Q  188 ttgaat 193  Q
    ||||||    
T  36700382 ttgaat 36700377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37684098 - 37684014
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  37684098 tgaatctgcgaataaactcacaacacctaggttaatagcacacaacgacaaaatgtcaacaaataatatgatataatctaaatca 37684014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6973066 - 6972975
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| || |||| ||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  6973066 taaaaatgtgaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaaaatatatgataaaa 6972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 45227866 - 45227965
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  45227866 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataaccgcataatgcccacaaaaatatatgataaaa 45227965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55228181 - 55228086
Alignment:
Q  91 catacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattg 186  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | || || ||||||| || || | |||| ||||||  ||||||||||    
T  55228181 catacaacgacaaaatgtctacaaataatatgattaaatctaaatcacgagaacactcatgctttcggatatacaacgttgacgcgcaaatcattg 55228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 18138772 - 18138838
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  18138772 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaa 18138838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 27593687 - 27593753
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||    
T  27593687 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataattcctacaaaaatatatgataaaa 27593753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 49125985 - 49126051
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  49125985 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaa 49126051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9284175 - 9284090
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| | | |||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9284175 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctacgaacaaactcacaacatccatgataatagcatataacggcataatgcctacaaa 9284090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 33332438 - 33332487
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaa 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  33332438 atcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaa 33332487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Original strand, 38165894 - 38165975
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||   ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38165894 ctaaaaacgtaaagagtgaatctgcaaacaaactcatgacattcaagtaaataacatacaatggcaaaatgcatacaaataa 38165975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 50766337 - 50766422
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||| | | ||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  50766337 aacaccgctaaaaacgtagatgatgaatctacgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 50766422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 46990963 - 46991055
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  46990963 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaacagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 46991055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2624589 - 2624512
Alignment:
Q  213 atctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||  ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2624589 atctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacgggaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacaca 2624512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12265725 - 12265627
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||| ||  |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  12265725 aacatcgctaaaaacgtaatga-tgaatctgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggcataatgcctaaaaaaatatatgataaaa 12265627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18049018 - 18048885
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || | |||||| | | ||||| ||| |   |||||||||||||||   ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  18049018 atctgcaacattgatgtcaaaattatcgattgaatctatgattgactgaagcttatctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatc 18048919  T
Q  259 taac---gccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     |||   ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18048918 aaacaacgccacacaagacgacaaacaacacaac 18048885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 37188420 - 37188519
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac-aaataatatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| | ||| | | ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37188420 aacaccgctaaaaacgcaaaagataaatctgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataatgacacaatgcctacaaaattatatgataaaa 37188519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26123474 - 26123380
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacg 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||   || | || | ||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  26123474 caagttaatagcatacaacaacaatatatctacaaataatatgataaaattaaagtgacaataatactcatgcctccggatttgcaacattgacg 26123380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7393459 - 7393418
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcaca 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7393459 atcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcgaacaaattcaca 7393418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13965918 - 13965877
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  13965918 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 13965877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14346791 - 14346750
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14346791 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 14346750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Original strand, 29266649 - 29266690
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  29266649 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 29266690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 46775596 - 46775653
Alignment:
Q  47 aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| |||| ||||    
T  46775596 aaaggctgaatatgcaaacaaactcacaacatctatgttaatagcataaaacgacaaa 46775653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 51646457 - 51646416
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  51646457 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 51646416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 1657295 - 1657363
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  1657295 taaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcaactatgttaatagcataaaacggcaaaat 1657363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13863349 - 13863309
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagtta 86  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13863349 taaaggatgaatctgcaaacaaattcacagcacccaagtta 13863309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 18502559 - 18502631
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18502559 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagaatccatgttaatagcataaaacggcaaaat 18502631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 121
Target Start/End: Original strand, 35395551 - 35395591
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  35395551 aagttaatagcatacgacgacaaaatgcatacaaataatat 35395591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 288
Target Start/End: Original strand, 47320469 - 47320497
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47320469 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 47320497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 7883072 - 7883344
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7883072 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaata 7883171  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7883172 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgctgacgtccaaattattgcttgaatttgtaattgattaatgtagatctt 7883271  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7883272 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 7883344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23230901 - 23230634
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23230901 acatcagatacaaacatcgctaaaagtgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 23230802  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23230801 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 23230702  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23230701 ccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 23230634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37971545 - 37971269
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaa----aaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37971545 acatcagatacaaacatcgctaattaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 37971446  T
Q  114 aataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtaga 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37971445 aataatgtgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtaga 37971346  T
Q  214 tctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37971345 tctttcaataggaactgaacaaacaccacgaaaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 37971269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 31013439 - 31013690
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31013439 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31013538  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  31013539 atatgataaaacttaagtcactgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttttaattgactgatgtagatatt 31013638  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcac 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31013639 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgccgcac 31013690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 290
Target Start/End: Original strand, 20553134 - 20553344
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20553134 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20553233  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20553234 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgccgcataagacgacga 20553333  T
Q  280 acaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||    
T  20553334 acaacaaaacg 20553344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10377932 - 10377675
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10377932 atcgctaaaaacgtgaatggtgaatctgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaactta 10377833  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    | || || |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10377832 agtcgccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgtagatctttcaataggaactgaa 10377733  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10377732 caaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacggcgaacaacacaacg 10377675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 290
Target Start/End: Original strand, 20559637 - 20559847
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20559637 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20559736  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  20559737 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgccaagacacaaaatcaaaggccgcacaagacgacga 20559836  T
Q  280 acaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||    
T  20559837 acaacaaaacg 20559847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 290
Target Start/End: Original strand, 20571199 - 20571409
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20571199 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20571298  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  20571299 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgccaagacacaaaatcaaaggccgcacaagacgacga 20571398  T
Q  280 acaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||    
T  20571399 acaacaaaacg 20571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 45445642 - 45445914
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45445642 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaaatgcctacaaata 45445741  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  45445742 atatgataaaatctaagtcaccaaaattcacatgcttccggattttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 45445841  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45445842 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacg 45445914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 27110296 - 27110568
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  27110296 acatcagatacaaacatcactaaaaatgcaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 27110395  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||  |||||    
T  27110396 atatgataaaatctaagtcactaaaatacacatgcttccagatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtagttgtctgatgtcaatctt 27110495  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27110496 tcaacatgaactaaacgaacactgcgacaagacgcaaaatcaaacgccacacaagacgactaccaacacaacg 27110568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 7677121 - 7677386
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7677121 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaagtcacagcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcttacaaataatatgat 7677220  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  7677221 aaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattggtcgaatctgtaattgactgatgttgatatttcagtag 7677320  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7677321 gaaccaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgcagcacaagacgacgaacaacacaacg 7677386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 16928588 - 16928793
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16928588 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 16928687  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16928688 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccacgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 16928787  T
Q  218 tcaata 223  Q
    ||||||    
T  16928788 tcaata 16928793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 17693444 - 17693716
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa-tgcctacaaat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  17693444 acatcaaatacaaacatcgctaaaaatgtaaagagtgaatctacgaccaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaaatgcctacaaat 17693543  T
Q  117 aatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17693544 aatatgataaaacataagtcatcgaaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 17693643  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17693644 tttaataggaactaaacaaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagaagacgaacaatacaac 17693716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3673694 - 3673428
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673694 agatataaacaacgctaaaaacgtaaagggtgaaactgcaaacaaactcacagcatccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 3673595  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    || |||| ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3673594 attaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaagcattgatttgatttgtaattgactgatgtcgatctttcaat 3673495  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | ||||| ||  |||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3673494 aggaactaaaggaacaccgcaacaagacacgaaatcaaacaccgcataagacgacgaacaacacaac 3673428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 16247055 - 16247326
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaag-gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaat 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16247055 acatcagatacaaacatcaataaaaaacgtaaagggtgaatatg--aacaaacttactacacccgagttaatagcatacaacggcaaaatgccttcaaat 16247152  T
Q  117 aatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    |||||||| ||| |||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16247153 aatatgatcaaatctaagtcagcgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgcccaaatcattgattgaatttgtaattaattgatgtcgatct 16247252  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16247253 ttccataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgtcgcacaagacgatgaacaacacaacg 16247326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 25190896 - 25191170
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  25190896 acatcagatacaaacattgctaaaatcgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaatagaaaaatgcctacaaata 25190995  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa--atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  ||||||| |||||||  ||||||| |||||  ||||    
T  25190996 atatgataaaacctaagtcatcgcaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatatcattggttgaattcataattgactgatgctgatc 25191095  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191096 tttcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 25191170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 40211131 - 40211405
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaagg--taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40211131 acatcagatataaacatcgctaaaaacgcgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacatcacccagattaatagcatacaacggcataatgcttacaaa 40211230  T
Q  116 taatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    ||||||||||||| | || ||| | |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  40211231 taatatgataaaatccaagtcaacgaaatactcatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaatcgactgatgtagatc 40211330  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  40211331 tttcaatagaaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacactgcataagacgacgaacaacacaacg 40211405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15344551 - 15344294
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15344551 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 15344452  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||  ||    
T  15344451 aatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatgaac-caa 15344353  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatcta---acgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| |||||| |  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15344352 cgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15344294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15433616 - 15433359
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15433616 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 15433517  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||  ||    
T  15433516 aatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatgaac-caa 15433418  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatcta---acgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| |||||| |  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15433417 cgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15433359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15524920 - 15524663
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15524920 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 15524821  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||  ||    
T  15524820 aatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatgaac-caa 15524722  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatcta---acgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| |||||| |  ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15524721 cgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15524663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 14544726 - 14545006
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac----- 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||         
T  14544726 acatcagatagaaacatcgctaaaaacgtaatggatgaatctgcaaacaaactcacaccatccaagttaatagcaaacaacggcaaaatgcctacaagac 14544825  T
Q  113 ---aaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatg 209  Q
       ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  14544826 tacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaaattcccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaataattgatttaacttgtaattgattgatg 14544925  T
Q  210 tagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14544926 tcgatctttcaataggaactaaatgaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccacacaagacgactaacaaaacaacg 14545006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 288
Target Start/End: Original strand, 1236546 - 1236800
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  1236546 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaatagtatgatataatctaaat 1236645  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaa 235  Q
    ||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||| |    
T  1236646 caccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccagatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaatatgaac-caacga 1236744  T
Q  236 acaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    ||||||| |||||| || |||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1236745 acaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaa 1236800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 28086643 - 28086916
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||  |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28086643 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtagatgatgaatatgtgaacaaactcatagtacttaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 28086742  T
Q  118 atatgataaaacct-aaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||  ||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||    
T  28086743 atatgataaaatctaaaatcactgaaataccaatgtttacggatctgcaacgttgacttccaaatcattgattgaatttgtaattaactgaagtcgatct 28086842  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| | ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  28086843 ttcaacaagaattgaatgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaatgctgcacaagatgacgaacaacacaacg 28086916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 43833842 - 43834011
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43833842 atcgctaaaaaagtaaatggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaacta 43833941  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  43833942 aatcaccagaatactcatgcttctagatctgcaacgttgacgtctaaatcattgattgaatttgtgattg 43834011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 9637240 - 9637511
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9637240 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtgaaactacgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaaaaata 9637339  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  |||  ||||||||| | |||||| ||||||    
T  9637340 atatgataaaacctaagttaccgaaatactcatgtttccgaatctgcaacgttgacgctcaaatcattaattgtgtttgtaattaactgatgttgatctt 9637439  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||||| ||| || || || | ||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  9637440 tcaataggaactaaacgaatactgcaataagacgcgaaatcaaatgtcgtacaagacgacgaacaacacaac 9637511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Original strand, 33214502 - 33214748
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33214502 acattagatataaacgtcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactaacagcaccaaagttaatagcataaaacggcaaaatgtctaaaaata 33214601  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  33214602 atatgataaaacataagtcatcgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgacgccgatctt 33214701  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgc 264  Q
    |||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  33214702 tcaataggaactaaaagaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgc 33214748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 40618904 - 40619176
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  || ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40618904 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaattgtagatctgcgaacaaacgcacaacccccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacacata 40619003  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||  | |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  40619004 atatgataaaatttaagtctgcgaaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaatttgtaattgactattgtcgatctt 40619103  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||| ||||| ||  |||||||||| ||||| | ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  40619104 tgaataagaactaaatgaacaccgcgataagacacgaaatcaaacgtcacacaagacgacaaacaacacaacg 40619176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 30568152 - 30568335
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30568152 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 30568251  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaatt 201  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||   |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  30568252 acatgataaaacctaagtcatcgaaattcacatgcttcaagatcttcaacgttgacgctcaaatcattggttgaatttgtaatt 30568335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14585920 - 14585751
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  14585920 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaacgcctacaaataatatgatgaaatcta 14585821  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14585820 aatcaccaggatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcaatgattgaatttgtgattg 14585751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 18890545 - 18890740
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18890545 atcgctaaaaacggatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 18890644  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||| |||||  ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  18890645 aatcaccataatacctatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaac 18890740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42046464 - 42046269
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42046464 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgatgtcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 42046365  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  42046364 aatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaac 42046269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 288
Target Start/End: Original strand, 1239283 - 1239500
Alignment:
Q  73 cagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattga 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| ||||    
T  1239283 cagcacccaagttaatagcatacaacgtcaaaatgcctacaaatagtatgatataatctaaatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttga 1239382  T
Q  173 cgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcac 269  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| || |||||    ||||||||||    
T  1239383 cgtccagatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaatatgaac-caacgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcac 1239481  T
Q  270 aagacgacgaacaacacaa 288  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1239482 aagacgatgaacaacacaa 1239500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 289
Target Start/End: Original strand, 29617133 - 29617379
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29617133 taaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacatttaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaata 29617232  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
       ||| ||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || | |||||||||| ||||  ||| |||||||| ||    
T  29617233 acaatgtttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttggtctttcaataagaaccaaacgaacaccgcaac 29617332  T
Q  246 aagacgcaaaatctaa---cgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29617333 aagacgcgaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacacaac 29617379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Original strand, 7198041 - 7198203
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  7198041 atcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacacccaaattaatagcatacaacgacaaaattcctgcaaataatatgataaaatcta 7198140  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaattt 195  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7198141 aatcaccaaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattgaattt 7198203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 471007 - 471266
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa--tgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| | | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  471007 aacatcgctaaaaacataaaatgtgaatctacgaacaaaatcacatcacccaagttaataacatacatcgacaaaaaatgcctacaaataatatgataaa 471106  T
Q  128 acctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| | | ||||| ||| |  |||||||||||| |||    
T  471107 atctaaatcatcagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcacaaatcattgattgaatctatgattgagtgaagatgatctttcaataagaa 471206  T
Q  228 ctgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |  ||| | |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  471207 ccaaacgagcaccgcaacaagacacaaaatcaaacgtcgcaccagacgacgaacaacaca 471266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 250
Target Start/End: Original strand, 14916039 - 14916250
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14916039 taaaaacgtaaatggtgaatctgcgaaaaaactcaatgcactcaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatca 14916138  T
Q  138 ccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaac 237  Q
     | |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| || | |||||||||||||||  ||| |||    
T  14916139 ac-aaatattcatgcttccggatctgcaacatggacgtccaaatcattgattgaatctctgattgattgaagttggtctttcaatatgaaccaaacgaac 14916237  T
Q  238 accgcgacaagac 250  Q
    ||||| |||||||    
T  14916238 accgcaacaagac 14916250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 24186492 - 24186762
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  24186492 acatcatatacaaacatcgataaaaacgtaaaagatgaatctgctaacaaactcataacacctaagttaatagtatacgacggcaaaatgcctataaata 24186591  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||  ||| |    
T  24186592 atatgataaaatttaagtcactgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaacttataattgactgatgtcaatc-t 24186690  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||    
T  24186691 tcaataggaactaaacgaacatcacgacaaaacgcgaaatcaaatgccacacaagacaactaacaacacaac 24186762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 36948276 - 36948540
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| || | | | | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||  ||||||||||||    
T  36948276 atacaaacattgcaaaaaatgtaaagagttagtttacgaacaaactcacaacacccaagttaatagcctacaacagataaatgtctggaaataatatgat 36948375  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtcc-aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||| ||||  | || |||||| |||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  36948376 aaaatctaag-cgccgaaatactcatgcttccggatttgcaacattg-catcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtcaatttttcaata 36948473  T
Q  224 tgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36948474 ggaattaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaggacgacaaacaacacaacg 36948540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 27498197 - 27498465
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||| || | ||||||| ||| |||||    
T  27498197 acatcagatacaaacatcattaaaatcgtaaagggtgaatctgcaaacaagctcataacacccaagttcataacatataaagacaaaatgtctataaata 27498296  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||  ||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||| | | | ||| || ||||||    
T  27498297 atatgataaaatctaaatcactgaaatac-catgtttccaaatctgcaatgttgacgcccaaatcattaattgaatttgt-actaactgaagttgatctt 27498394  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||| | ||  |||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  27498395 tcaataggaattaaatgaacaccacgacaagacgcgaaatcaaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaa 27498465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41896757 - 41896551
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  41896757 gctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaat 41896658  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaa 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||| |    
T  41896657 caccagaatactcatgcttctagatctgcaacgttgatgcctaaatcattaattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaacga 41896558  T
Q  236 acaccgc 242  Q
    |||||||    
T  41896557 acaccgc 41896551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21238034 - 21237814
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||  |||||||     
T  21238034 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccatgttaataggatacaacgacaaaaatcctacaaacaat--gataaaat 21237937  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    | |||||||||||||||     
T  21237936 ctaaatcaacagagtacacatgcttctggatctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaatatgggattgattgaaactggtctttcaatatgaacc 21237837  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgc 252  Q
     ||| ||||| || |||||||||    
T  21237836 aaacgaacactgcaacaagacgc 21237814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28897922 - 28897695
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||    || |||||| ||||    
T  28897922 aacaaactcacaacacccacgttaatagcatagaatgacaaaatgactacaaataatatgataaaatctaagtcatcgaaatttcaatacttccgtatct 28897823  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| || ||| ||||||||||  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28897822 gcaacgtttacgcccaaatcattaattgaacttataattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccacgacaagacgcgaaatcaaac 28897723  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  28897722 gccacacacgatgactaacaacacaacg 28897695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 33347364 - 33347610
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  33347364 aacatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacacctaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaatt 33347463  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    || | ||||| |||||| ||||||| || ||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||| || |     
T  33347464 ctgagtcaccgaaatacccatgctttcggatccgcaacgtcgacgcctaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttgatctttcaataggatc- 33347562  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
     ||  |||||||| |||||||   ||||| |||||| |||||||||||    
T  33347563 aaatgaacaccgcaacaagacatgaaatcaaacgccacacaagacgac 33347610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5333621 - 5333413
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatca 183  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||| |||| |||||| |||||| |    
T  5333621 ttaatagcatacaacaacaaaatgcatacaaataatatgacaaaatctaaatcactagaatactcatgcttctggatctacaacgttgacgcccaaataa 5333522  T
Q  184 ttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaa 280  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||  ||| |||||||  |||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  5333521 ttgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaataggaaccaaacgaacaccggaacaagacgcaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaa 5333422  T
Q  281 caacacaac 289  Q
    |||||||||    
T  5333421 caacacaac 5333413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8868054 - 8867884
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagtta---atagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8868054 aacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagttataaataacatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataa 8867955  T
Q  127 aacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    || ||||||||||| ||||  || ||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  8867954 aatctaaatcaccagaatatccaagcttccagatcttcaactttgatgcccaaatcattgattgaatttgt 8867884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 24099099 - 24099260
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||     
T  24099099 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataatt------tgcctacaaataatatgataaaat 24099192  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  24099193 ctaaatcaccaaaatattctttcttccggatctgcaacgttgacgtacaaatcattgaatgaatttgt 24099260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39657643 - 39657535
Alignment:
Q  87 atagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattg 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39657643 atagaatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattg 39657544  T
Q  187 cttgaattt 195  Q
     ||||||||    
T  39657543 attgaattt 39657535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 289
Target Start/End: Original strand, 8443427 - 8443616
Alignment:
Q  103 aaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  8443427 aaatgtctacaaataatatgatcaaatctaaatcaccataataccagtgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattg 8443526  T
Q  203 attgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | ||| || ||||||||||  |||||  ||| ||||| || |||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8443527 actgaagttgatctttcaaattgaaccaaacgaacactgcaacaagacgcggaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 8443616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3240617 - 3240365
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataata--tgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||||  | ||||||    
T  3240617 aaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgc-tacaaaaaaaaaatgataattc-taaatc 3240520  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    |||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||  ||||||    
T  3240519 accagaatacccatacttctggatctgcaacattggcgtccaaatcatcgattgaatatgtgattgactgaagccgatctttcaatattaaccaaacaaa 3240420  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| | |||| |||| |||||    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  3240419 caccacaacaacacgcgaaatcaaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacacaa 3240365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29939495 - 29939352
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||  | || |||||| || ||| |||||    
T  29939495 aagttaatatcatacaacggcaaaatgactacaaataatatgataaaacctaagtcactgaaatactcatgcttatggatatgcaacgttaacgcccaaa 29939396  T
Q  181 tcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||    
T  29939395 tcattggttgaattagtaattgactgagatcgatctttcaatat 29939352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5046966 - 5046744
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||  |||| ||  | ||||    
T  5046966 aacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaattctaagtcactgaaatattcatgtttatgaatct 5046867  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||  | ||| |||||||| ||||  ||| || |||   |||||  |  ||||| |||    
T  5046866 gcaacgtcgacgtccaaattattgattgaatctgtaattgactgaatttgatttttcaataggaaccaaacgaataccaaaacaaggtgtgaaatcaaac 5046767  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5046766 gccgcacaatacgacgaacaaca 5046744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34610031 - 34609816
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaa 180  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |  || ||||||||| || ||| |||||    
T  34610031 aagttaatagcattcaacgccaaaatgcctattaataatatgataaaacctaaatcaccggaatactcatgttctcgaatctgcaacgttcacgcccaaa 34609932  T
Q  181 tcattgcttgaatttgta----attgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaaga 273  Q
    |||||| ||| |||||||    ||||| ||| || |||||||||||  |||   ||| |||||||| ||||||| |||||||   ||||| |||||||||    
T  34609931 tcattgattgcatttgtaactgattgactgaagttgatctttcaat-ggaaacaaacgaacaccgcaacaagacacaaaatcaaataacgtcgcacaaga 34609833  T
Q  274 cgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  34609832 cgaggaacaacccaacg 34609816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41684631 - 41684504
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||         | | ||||||||||||||||    
T  41684631 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcaaacaaacacacagctcccaagttaat---------cagtaaaatgcctacaaata 41684541  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgctt 154  Q
    ||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||    
T  41684540 atatgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgctt 41684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Original strand, 8412355 - 8412434
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8412355 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacg 8412434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8826407 - 8826195
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||  || |||||| |||| | ||||    
T  8826407 caagttaatagcatgcaacgataaaatgcctacaagtaatatgataaaaacaaaatcaccagaacacacatgcttccaaatatgcaacgttgatgcccaa 8826308  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacga 276  Q
    ||||||| ||||||   | ||| ||||| || ||| |||||||||||| | ||  |||||||| ||||||| | || ||    |||||| ||||||||||    
T  8826307 atcattgattgaatcgatgattcattgaagttgatatttcaatatgaa-tcaaagaacaccgcaacaagacacgaattcacacaacgccacacaagacga 8826209  T
Q  277 cgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||| ||||    
T  8826208 cgaacaacataacg 8826195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Original strand, 41060106 - 41060209
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41060106 aacatcactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaaattgatagcatacaacaacaaaatggctacaaataatatgataaaat 41060205  T
Q  130 ctaa 133  Q
    ||||    
T  41060206 ctaa 41060209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 43889955 - 43890034
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43889955 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaaatcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 43890034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11267262 - 11267168
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11267262 cgctaaaaacgtaaaggatgaaactgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 11267168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 26468993 - 26469152
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||| | || ||||||||    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  26468993 aacattgctaaaaacgtaaatggtgaatctgtaaataaactcacaacgcctaagttaat----tataacgacaaaatacctacaaataatatgataaaat 26469088  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |  ||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  26469089 ctaaatcaccagaatacacatgcattcagatgcacaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 26469152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11725939 - 11725839
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11725939 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 11725840  T
Q  129 c 129  Q
    |    
T  11725839 c 11725839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12184499 - 12184379
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgca 165  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||| ||| |||    
T  12184499 aaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaataatatgataaaattaaaatgtccagaatacatatgcctccgaatcagca 12184400  T
Q  166 acattgacgtccaaatcattg 186  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  12184399 acggtgacgcccaaatcattg 12184379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12428927 - 12428807
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgca 165  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||| |||| |||| ||| |||    
T  12428927 aaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaataatatgataaaattaaaatgtccagaatacatatgcctccgaatcagca 12428828  T
Q  166 acattgacgtccaaatcattg 186  Q
    ||  ||||| |||||||||||    
T  12428827 acggtgacgcccaaatcattg 12428807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34493248 - 34493132
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| | | ||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  34493248 aacatcgctaaaaacaaaaagggtgaatctacgaacaaactcacaaaactcaagttaataacatgcaacgacaaaatgcctatatataatatcataaaat 34493149  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatac 146  Q
    |||| ||||||||||||    
T  34493148 ctaattcaccaaaatac 34493132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 37565711 - 37565803
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  37565711 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 37565803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 171
Target Start/End: Original strand, 18846334 - 18846450
Alignment:
Q  59 tgcaaacaaactcacagcacccaagttaata----gcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgctt 154  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  18846334 tgcaaacaaactcacaacaatcaagttaatatatagcatacaatagcaaaatgcctacaaataatataataaaatctaaatcaccataatactcatgttt 18846433  T
Q  155 ccgcatctgcaacattg 171  Q
    |||  ||| ||||||||    
T  18846434 ccgggtctacaacattg 18846450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2656129 - 2656044
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  2656129 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 2656044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4809223 - 4809138
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4809223 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 4809138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 9498424 - 9498509
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  9498424 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaa 9498509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 9619182 - 9619267
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  9619182 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacttacaaa 9619267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11464430 - 11464345
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11464430 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 11464345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29777478 - 29777393
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  29777478 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctccaaa 29777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33342683 - 33342594
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33342683 aaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaatatatatgataaaa 33342594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 42447859 - 42447951
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  42447859 ctaaaaacgtaaagaatgaatatgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 42447951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 8094859 - 8094956
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8094859 aacatcgttgaaaacgtaaagggtgaatctgctaacaaactcataacatccaggttaatagcata-aacgacaaaatg-ctacaaataatatgataaaac 8094956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 14906748 - 14906847
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  14906748 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 14906847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 44099761 - 44099860
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  44099761 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgctaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaa 44099860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28240100 - 28240015
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  28240100 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatctaagttaatagaatataacggcataatgcttacaaa 28240015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 33896345 - 33896260
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  33896345 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 33896260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 43135404 - 43135569
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac-aaataatatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  43135404 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacatactcacaacatccaagttaataacatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaa 43135503  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || | |||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  43135504 ttaaagtgaccagaatatacatggcttccggatctgaaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 43135569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14913279 - 14913236
Alignment:
Q  85 taatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14913279 taatagcatacaacggcaaaatacctacaaataatatgataaaa 14913236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33299090 - 33298960
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatg 151  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||   || | || | ||||| ||||    
T  33299090 tgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgactagaatactcatg 33298991  T
Q  152 cttccgcatctgcaacattgacgtccaaatc 182  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  33298990 catccgtatctgcaacgttgacgaccaaatc 33298960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11197110 - 11197057
Alignment:
Q  62 aaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  11197110 aaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 11197057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9072977 - 9072878
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| | |||||||||||    
T  9072977 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgtgagcaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggaataatgcatacaaaaatatatgataaaa 9072878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34612063 - 34611964
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||   | |||||||||||| | |||||||||||    
T  34612063 aacatcactaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaagataatgcctacaaaaatatatgataaaa 34611964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 43192172 - 43192271
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| | |||||||||||    
T  43192172 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataatggatacaaaaatatatgataaaa 43192271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8441443 - 8441345
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||| | || | || ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8441443 aacattgctaagaacgtaaaagatgaatttgcaaataaactcatatcatctaaattaatagcatacaacgataaaatacctgcaaataatatgataaaa 8441345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8981291 - 8981181
Alignment:
Q  148 catgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaa 247  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||   ||| |||||||| ||||    
T  8981291 catgcttccggatctgtaacgttgacgtccaaatcatcaattgaatctgtgattgactgacgctgatctttcaatatcaaacaaacgaacaccgcaacaa 8981192  T
Q  248 gacgcaaaatc 258  Q
    ||||| |||||    
T  8981191 gacgcgaaatc 8981181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Original strand, 23851326 - 23851483
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaat 135  Q
    ||||||| ||||| | | ||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| |||   || |    
T  23851326 ctaaaaaagtaaaagataaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagt 23851425  T
Q  136 caccaaaatacaca-tgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaa 192  Q
     ||| |||||  || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  23851426 taccgaaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaa 23851483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 27746945 - 27747038
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaa 127  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||| | ||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  27746945 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcaaataaatttacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa 27747038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 32724306 - 32724391
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| | | |||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  32724306 aacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatgcctacaaa 32724391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Original strand, 35283256 - 35283333
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||| |||| | | | |||||| ||||||||||    
T  35283256 caagttaatagcatacaacgataaaatatatacaaataatatgataaaatctaagtgatcgaaatactcatgcttccg 35283333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15047128 - 15047000
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatg 151  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||   || | | |  ||||||||||    
T  15047128 tgaatctgcgaacaaacttacaacattcaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaatacacatg 15047029  T
Q  152 cttccgcatctgcaacattgacgtccaaa 180  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||||    
T  15047028 cctctggatctgcaacgttgacgtccaaa 15047000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16794535 - 16794451
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||| | |||||||||||    
T  16794535 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataccatataacgtcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 16794451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 128
Target Start/End: Original strand, 25238486 - 25238534
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25238486 caagtttataacatacaacggcaaaatgtctataaataatatgataaaa 25238534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 128
Target Start/End: Original strand, 6394228 - 6394294
Alignment:
Q  62 aaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  6394228 aaacaaactcacatcactcaaattaataacataaaacatcaaaatacatacaaataatatgataaaa 6394294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 289
Target Start/End: Original strand, 8412451 - 8412505
Alignment:
Q  235 aacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  8412451 aacaccgggacaagactcgaaatcaaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaac 8412505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11162290 - 11162220
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  11162290 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatatgggaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgacaaa 11162220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14585715 - 14585685
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14585715 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 14585685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 28296840 - 28296910
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28296840 tcgctaaaaacaaaaaggttgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 28296910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 44091749 - 44091811
Alignment:
Q  183 attgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||    
T  44091749 attgattgaatttgtatttgattgatgtcgatctttcaacaggaactaaacgaacaccacgac 44091811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 10338569 - 10338626
Alignment:
Q  47 aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10338569 aaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaa 10338626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 124
Target Start/End: Original strand, 39646064 - 39646125
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  39646064 aacaaactcacaacacccaagttaacaacatataacaacaaaatagctacaaataatatgat 39646125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43431998 - 43431913
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| | || || | ||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  43431998 aacatcgctaaaaatgaaatggattaatctgctaacaaattcacaacatccaagttaatagcatatgacggtaaaatgcttacaaa 43431913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15665910 - 15665862
Alignment:
Q  54 gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggca 102  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  15665910 gaatctgcaaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggca 15665862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17019489 - 17019429
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  17019489 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcata 17019429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Original strand, 17427093 - 17427133
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17427093 ttaatagcatacaacgacaaaacgcctataaataatatgat 17427133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Original strand, 17430743 - 17430783
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17430743 ttaatagcatacaacgacaaaacgcctataaataatatgat 17430783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17549926 - 17549866
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  17549926 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcata 17549866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Original strand, 20227175 - 20227219
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20227175 ttaatagcatacaacaacgaaatgtctacaaataatatgataaaa 20227219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41684496 - 41684412
Alignment:
Q  205 tgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||    
T  41684496 tgatgtcggtctttcaataggaactaaatggacaccgcgacaagacgcgaattcaaatgtcgtacaagacgatgaacaacacaac 41684412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44578254 - 44578190
Alignment:
Q  65 caaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  44578254 caaacttacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 44578190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 8001380 - 8001651
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8001380 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataa 8001479  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8001480 tatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgattccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 8001579  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8001580 caataggaactgaacaaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 8001651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 39171423 - 39171695
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39171423 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcatagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 39171522  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39171523 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 39171622  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  39171623 tcaattggaactgaacaaacatcgtgacaagacgtaaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaacg 39171695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 48316652 - 48316917
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48316652 atacaaacatcgctaaaaacctaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 48316751  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48316752 aaaacctaaatcgccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatag 48316851  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48316852 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacg 48316917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 37837291 - 37837563
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  37837291 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaagta 37837390  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37837391 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 37837490  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37837491 tcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 37837563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Original strand, 9449998 - 9450242
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9449998 taaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacctaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcactaaaata 9450097  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9450098 cccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgac 9450197  T
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9450198 aaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 9450242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 34899440 - 34899712
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34899440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 34899539  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34899540 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccgaatttgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 34899639  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34899640 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 34899712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 12141140 - 12141413
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagca-cccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12141140 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacaacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaat 12141239  T
Q  117 aatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12141240 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatct 12141339  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12141340 tccaataggaactaaacaaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacaaacaacaaaacg 12141413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47590567 - 47590297
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47590567 atcagatataaacatcgctgaaaacgtaaagggtaaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcttacaacggcaaaatgcctacaaataat 47590468  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47590467 atgataaaacctaagtcgccgaaatactcatgcttccggatgtgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgacggatgtagatctttc 47590368  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47590367 aataggaattatacaaacaccgcggcaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 47590297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42978867 - 42978596
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42978867 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacatataa 42978768  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  42978767 tatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatccttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgttattgactgatgtcgatcttt 42978668  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42978667 caataagaactaaacgaacaccgcgataaaacgagaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 42978596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48061680 - 48061413
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48061680 acatcaggtacaaacatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 48061581  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48061580 atatgataaaacctaaatcaccgaaatactcatgcttaaggatctgcaacgttgacgctcaaaccattggttgaatttgtaattgactaatgtagatctt 48061481  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  48061480 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgtcgcataagacgacgaacaaca 48061413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 45349632 - 45349904
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45349632 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 45349731  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||    
T  45349732 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttccagatctgcaatgttgacgccaaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccaatctt 45349831  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45349832 tcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaaaacgacgaacaacacaacg 45349904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19297100 - 19296856
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  19297100 taaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagttaccgaaata 19297001  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19297000 cccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaagaggaactgaacaaacaccgcgac 19296901  T
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19296900 aaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 19296856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 28044589 - 28044822
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28044589 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcataacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaaaaata 28044688  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28044689 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcaatgcttgaatttataattgattgatatagatctt 28044788  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28044789 tcaataagaactgaacaaacaccgcgacaagacg 28044822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 30756659 - 30756924
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30756659 atacaaacatctctaaaaacgtaaaggctgaatctgcgaactaacttacaacacctaagttaacagcataaaacgacaaaatgcctataaataatatgat 30756758  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  30756759 aaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaattattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatag 30756858  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30756859 aaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 30756924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38799031 - 38798767
Alignment:
Q  26 tacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38799031 tacaaacatcgttaaaaacgtacaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataagacggcaaaatgcctacaaataatatgata 38798932  T
Q  126 aaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatg 225  Q
    ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |    
T  38798931 aaatctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaatagg 38798832  T
Q  226 aactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38798831 aaataaacaaacactgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38798767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 19404590 - 19404855
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  19404590 acatcagatacgaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcgtgcaacggcaaaaagcctacaaata 19404689  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  19404690 atatgataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgacagatgtcaatctt 19404789  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaa 283  Q
    |||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  19404790 tcaagaggaactaaaagaacaccgcgacaagatgcaaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaa 19404855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 39328627 - 39328895
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39328627 acatcaaatacaaacatcgctaaaacg-taaaaggtaaatctgcgaacaaattcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 39328725  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
       ||||||||||||| ||||| | || ||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  39328726 ---tgataaaacctaagtcaccgagattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 39328822  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39328823 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 39328895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40993415 - 40993191
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40993415 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacaaata 40993316  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||  |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40993315 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctgaatatgcaacgttgaaatccaaatcttttgttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 40993216  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgc 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  40993215 tcaataggaactgaacaaacaccgc 40993191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46700292 - 46700023
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46700292 acatcaggtacaaaaatcgttaaaaacataaagggtgaatctgcaa-caaactcacaacaccctagttaatagcatataacggcaaaatgcctataaata 46700194  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||    
T  46700193 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgctgatgcccaaatcattgattgaatttgtagttgactgatgtcgatatt 46700094  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46700093 tcaataggaactaaacgaacaccacgacaagacgtgaaatcaaacgccgcagaagacgacgaacaacacaa 46700023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 13796807 - 13797037
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13796807 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcacctaaatactcatgcttccggatct 13796906  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  13796907 gcaacgttgacggtcaaatcattggttgactttgttattgactgatgtcgatctttcaatatgaactaaacgaacaccgagacaagacacgaaatcaaac 13797006  T
Q  263 gccgcacaag---acgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||||||   || |||||||||||||||    
T  13797007 gtcgcacaagatcacaacgaacaacacaacg 13797037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 9977043 - 9977311
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  9977043 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaaaaaattcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaaaaata 9977142  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| ||    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  9977143 atatgataaaatctaactcatcaaaatacacataattccggat----aacgttgacgcccaaatcattgtttgaatttgtaattgactgaagtcgatctt 9977238  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  9977239 tcaataggaactaaatgagcaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccaaacaagacgacgaacaatacaacg 9977311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24770502 - 24770233
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||   ||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  24770502 acatcagatacaaacatcgctaacaacgtaaagggtgaatttacgaacaaag--acatcattcaagttaataacataaaacggcaaaatgtctaccaata 24770405  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||    
T  24770404 atatgataaaacctaagtctccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtgattgactgatgccgatctt 24770305  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24770304 tcaataagaaataaacgaacaccgcgacaagacacgaaatcaaacgtcgcataagacgacgaacaacacaac 24770233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 25287021 - 25287291
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||||   ||||| |||||| |  |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25287021 acatcagatataaagatcgttaaaaatgtaaaaaatgaatctgcaaata--ctcacaacatccgagttaatagcatacaacagcaaaatggctacaaata 25287118  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||| |  ||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25287119 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgctttcagatctgtaatattgacgctcaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcaatctt 25287218  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25287219 tcaataagaagtaaatgaacaccgcgacaagatgtgaaatcaaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaacg 25287291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 41553280 - 41553542
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||     
T  41553280 aacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctaggaacaaactcacagcacc-aagttaatagcatacaacggcaaaatacgtataaatgatatgataaaat 41553378  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||     
T  41553379 ctaaatcaccaaaatatctatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatctttcaatatgaacc 41553478  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| ||||||   ||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41553479 aaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaataacgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41553542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35133190 - 35132995
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  35133190 atcgttaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaataatatgatgaaatcta 35133091  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||| | ||||| |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  35133090 aatcactagaatactcatgcttttggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaac 35132995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 26623634 - 26623895
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||      
T  26623634 aacatcgcttaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacgctcaagttaatagtatagaacgacaaaatgcctaaaactaatatgataaatt 26623733  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgat-tgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
     |||  |||| |||||| |||||||||| || ||||| ||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  26623734 ataagccaccgaaatactcatgcttccggatttgcaatatccacgcccatatcattaattgaatatgcaattgacctgaagttgatctttcaataggaac 26623833  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26623834 caaacaaacaccgcaacaagatgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacg 26623895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22743187 - 22742992
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  22743187 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaaaaaactcccaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaatcta 22743088  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  22743087 aatcaccagaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtgattggctgaagctgatctttcaatacgaac 22742992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28476466 - 28476206
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28476466 gctaaaaacgtaaatggtgaatctgcaaacaaactcacagcactcaagttaataacattgcacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaat 28476367  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaa 235  Q
    ||||  ||||| ||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||| |    
T  28476366 cacc-gaatacccatacttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaacga 28476268  T
Q  236 acaccgc----gacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||     | |||| || |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28476267 acaccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 28476206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 288
Target Start/End: Original strand, 5348470 - 5348695
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  ||||||||||  || || ||||    
T  5348470 aacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataatatggtaaattctaagtcactgaaatacacatattttcgaatct 5348569  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||  ||||| |||    
T  5348570 gcaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgattgaaattgatctttcaataggaaccaaacgaacaccgcaataagacgataaatcaaac 5348669  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
     |||||||| || |||||||||||||    
T  5348670 accgcacaaaacaacgaacaacacaa 5348695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 35664980 - 35665177
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||     
T  35664980 aacatcgctaaaaacgtaaaggagaaatctgtgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaaaaataatatgataaaat 35665079  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | || || ||| || |||||||| |||||||    
T  35665080 ctaaatcactaaaatacacatgcttatgggtctgcaacattgacgttcaaatcattgattgaatctctgatcgactgaagttgatctttcgatatgaa 35665177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39229251 - 39229002
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||     
T  39229251 taaaaacgtaaacgttgaatctgcaagcaaactcacaacatccaaattaa-agcatacaacggaaaaatgcctacaaattatatgataaattctaagtcc 39229153  T
Q  138 ccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaac 237  Q
    |  ||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||| |||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||  |||  |||  ||    
T  39229152 ctgaaatacacatgcttccagatctgcaacgtcgacgcccaagtcatcggttgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaatagaaaccaaac-gac 39229054  T
Q  238 accgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39229053 atcacaacaagacgcgaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 39229002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 290
Target Start/End: Original strand, 24069290 - 24069502
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaa 180  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  24069290 aagttaatagcatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatcctcatgcttccgggtctgcaacgttgacgttcaaa 24069389  T
Q  181 tcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgac 277  Q
    |||||| |||||  ||| |||||| || |  ||| ||||||||||||   ||| |||||||| |||| |||| |||||    ||||||||||||||| ||    
T  24069390 tcattgattgaacctgtgattgatcgaagctgatatttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaatacgccaaatcaaaaaacgccgcacaagacaac 24069489  T
Q  278 gaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||    
T  24069490 gaacaacacaacg 24069502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25255470 - 25255213
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  25255470 atcgctaaaaacgtaaagggtgtatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaatgatattataaactcta 25255371  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    | |||| ||||| | |||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||  |||| ||| ||||| ||    
T  25255370 agtcactaaaatgcccatgcttcaggatctgcaacatcgatgcccaaataattgattgaatctataattgattgaagttgacatttcgataggaactaaa 25255271  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      |||||||| || ||||   ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  25255270 tgaacaccgcaacgagacatgaaatcaaacgctgcacaagacggcgaataacacaacg 25255213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11344055 - 11343834
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||| |   |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||     
T  11344055 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcatacaaacttaagacacctaagttaatagcatacaacatcaaaatacctacaaataatattgtaaaat 11343956  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||||||||||||| |||  || || ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||     
T  11343955 ataaatcaccaaaatactcat-ttttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattaattaaatttgtaattgactgaatttaatctttcaatatgaacc 11343857  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgc 252  Q
     |||||||||||| |||||||||    
T  11343856 aaacaaacaccgcaacaagacgc 11343834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 28407751 - 28407861
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28407751 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 28407850  T
Q  118 atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||    
T  28407851 atatgataaaa 28407861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48930950 - 48930797
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  48930950 atcgctaaaaacgtataggttgaatctgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaatcta 48930851  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattg 186  Q
    |||||||| |||||  ||| ||| | ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  48930850 aatcaccagaataccaatgtttctggatctgcaacgttgacacccaaatcattg 48930797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5792967 - 5792783
Alignment:
Q  105 atgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgat 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| | |||| |  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||     
T  5792967 atgcctataaataatatgataaaatataagtcatcgaaattcttatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgatttaacttgtaattgac 5792868  T
Q  205 tgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5792867 tgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacactgtgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagatgactaacaacacaac 5792783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 28062156 - 28062261
Alignment:
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||   || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28062156 atatgataaaacataaatcaccgaaatatctatactttcggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttataattgattgatgtagatctt 28062255  T
Q  218 tcaata 223  Q
    ||||||    
T  28062256 tcaata 28062261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Original strand, 3267059 - 3267317
Alignment:
Q  27 acaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    |||||||||| |||||| || ||  |||||| | | |||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  3267059 acaaacatcgataaaaacgtcaaatgtgaatttacgaacaaactcacaacttctaagttaatagcatatagcggtaacatgcctaaaaatagtatgataa 3267158  T
Q  127 aacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatga 226  Q
    ||  ||| ||||| ||||   ||||||| || || |||||  |||||| | |||||||||     |||||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  3267159 aatataagtcaccgaaatctccatgctttcggatgtgcaatgttgacgcctaaatcattg-----atttgtaattgactggagtcgatctttcaatatga 3267253  T
Q  227 actgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | | ||| ||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3267254 attaaacgaacaccgtgataagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaacg 3267317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35261542 - 35261385
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || |    
T  35261542 ctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 35261443  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
     |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  35261442 gaccggaatacacatgcctccggatctgcaacattgacgtctaaatctttgattgaat 35261385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 290
Target Start/End: Original strand, 38880485 - 38880686
Alignment:
Q  93 tacaacggcaaaatgcctacaaataa-tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||    
T  38880485 tacaacgacaaaatgtctacagataagtatgataaaatctaaataactaaaatacgcatgcttccagatctgcaacgttggcacccaaatcattgattga 38880584  T
Q  192 atttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaa---cgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||||| ||| |  |||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||||| ||   || || |||||||| | ||||||||||    
T  38880585 atttgtgattgactgaagctgatctttcaataagaaccaaacgaacaccgcaacaagatgcaaaatcaaacagcgtcgtacaagacggcaaacaacacaa 38880684  T
Q  289 cg 290  Q
    ||    
T  38880685 cg 38880686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 4999874 - 5000072
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| ||||||  |||||  |||||| || ||  ||||| || ||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  4999874 aacatcgataaaaacataaagaatgaataagcgaatgaactcgcaacacccaagtcaataacatacaacgaaaaaatgtctataaataatatgataaaat 4999973  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
     |||||||||| ||||  |||||||||  ||| ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||  | ||| ||| |||||||||    
T  4999974 ttaaatcaccagaatattcatgcttccagatcagcaacgttgaagtccaaataattgattgaatttgtaattgactgaaattgatattttaatatgaac 5000072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 22927695 - 22927860
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22927695 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcaaccaagttgatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 22927794  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22927795 ttaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 22927860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 46822588 - 46822692
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  46822588 aacatcgctacaaacgtaaaaagtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaatgacaaaatg-ctacaaataatatgataaaat 46822686  T
Q  130 ctaaat 135  Q
    ||||||    
T  46822687 ctaaat 46822692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Original strand, 13592340 - 13592498
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaa 134  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||   ||     
T  13592340 gctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatcgaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaag 13592439  T
Q  135 tcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    | |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||    
T  13592440 tgaccagaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaat 13592498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Original strand, 29617545 - 29617647
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29617545 aacaacgctaaaaacgtaaatggtgaatctgcaaacaaactcacaacacc-aagttaatagcactcaacaacaaaatgtctacaaataatatgataaaat 29617643  T
Q  130 ctaa 133  Q
    ||||    
T  29617644 ctaa 29617647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 46822260 - 46822182
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46822260 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 46822182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 433516 - 433681
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  433516 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 433615  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  ||| || |||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  433616 ttaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaat 433681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21266642 - 21266477
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  21266642 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 21266543  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |  || ||||| |||||  ||| || |||| ||||||||| |||| |  |||||| ||| ||||||    
T  21266542 ctaaagtcaccgaaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaat 21266477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32684920 - 32684820
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  32684920 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 32684821  T
Q  129 c 129  Q
    |    
T  32684820 c 32684820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 43369602 - 43369762
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||| |||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  43369602 atcgctgaaaacgtaaaggataaatttgtaaacaaacttacatcatacaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctataaataatatgataaaattaa 43369701  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    | | || | ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| | | ||| ||||| ||||||    
T  43369702 agtgactagaatactcatgcatccggatctgcaacgttgatgacaaaaccattgattgaat 43369762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 289
Target Start/End: Original strand, 3224342 - 3224517
Alignment:
Q  116 taatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||  || ||||| ||| || ||||    
T  3224342 taatatgataaaatctaaatcaccataatactcattcttccggatctacaac-ttgacgtcaaaatcattaattgaatccgtgattgactgaagttgatc 3224440  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||||||||||||  ||| |||| ||| |||| |||  |||||   ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  3224441 cttcaatatgaaccaaacgaacatcgcaacaaaacgtgaaatcaaataatgtcgcacaagactacgaacaacacaac 3224517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 31235612 - 31235694
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31235612 atcgctaaaaacgtaaagaatgaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31235694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 969321 - 969555
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||          |||||||||||| |||||||    
T  969321 ctaaaaacataaaaggtaaatatgcaaacaaactcata-cacccatgttaataacatacaacggtaaaata---------aatatgataaaatctaaatc 969410  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    || | ||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||            |||||| | | |  ||| |||||||||||||  ||||||    
T  969411 actagaatactcatgcttatgaatctgcaatattgacgtccaaatcatt------------aattgactaaagatgatttttcaatatgaaccaaacaaa 969498  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| | |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  969499 caccgcaataagacgcaaaatcaaacaacgccgcaaaagacgacgaacaacacaacg 969555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Original strand, 24350767 - 24350856
Alignment:
Q  113 aaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24350767 aaataatatgatgaaatttaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 24350856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Original strand, 26610625 - 26610785
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||   | |||||||||||||||      
T  26610625 aacatcgttaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagtaccaaagttaatagtatac-acggaaaaatgtgaagaaataatatgataaatt 26610723  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
     ||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || | || ||||||||||| ||||    
T  26610724 ataagtcacccaaataaccatgtttccggatctgcaatatcggcgcccaaatcattgattga 26610785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 290
Target Start/End: Original strand, 41553753 - 41553887
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||| |||||    
T  41553753 atctgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatctttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatc 41553852  T
Q  259 ---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
       ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41553853 aaataacgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41553887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3398387 - 3398328
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3398387 ccaagttaataacatacaacggtaaaatgcctaaaaataatatgataaaatctaaatcac 3398328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 17222825 - 17222924
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  17222825 aacaccgctaaaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttactagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 17222924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23085773 - 23085674
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  23085773 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 23085674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2407841 - 2407751
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataata 120  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  2407841 aacatcgttaaaaacgtaaagagtgaatctgcgaacaaactcacaacacctatgttagtagcatacaacggcaaaatacttaaaaataata 2407751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25068300 - 25068181
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac-aaataatatgataaaacct 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||      || ||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  25068300 atcgctaaaaacgtaaatggtgaatctgcaaaca------caacactcaagttaatggtatacaacgacaaaatgcttactaaataatatgataaaatct 25068207  T
Q  132 aaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||    
T  25068206 aaatcatcaaaacacccatgcttccg 25068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 2843066 - 2843151
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  2843066 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatctaagctaatagcatataacgacataatgcctacaaa 2843151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 34773963 - 34773878
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||    
T  34773963 aacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagtatataacgatataatgcctacaaa 34773878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 35496000 - 35496085
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35496000 aacaccgctaaaaacgtaagggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 35496085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26492617 - 26492518
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  26492617 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 26492518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27341745 - 27341698
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27341745 aagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaataatattataaaa 27341698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Original strand, 38050911 - 38051086
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||| || |||| | ||||| |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  38050911 aacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttacaaataaattcacaacatccaaatcaatagaatacaacaataaaatgtctacatataatatgataaaat 38051010  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgatt 205  Q
     ||| | |||| |||||| ||| || || || | ||| ||||||  |||||| |||| ||  || |||||||||||    
T  38051011 ataagtaaccataatacatatgttttcggatatacaatattgactcccaaattattgattagatctgtaattgatt 38051086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 3222952 - 3223038
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| |   |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3222952 atcgctaaaaacgtaaaggataaatctatgaacaaactcacaacacacaagttaataacatacaacggcaaaatgtctataaataat 3223038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 5078342 - 5078432
Alignment:
Q  113 aaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || |||||  |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5078342 aaatagtatgataaaatctaaatcatcaaaatactcatgctttcggatatgcaaagttgacgtccaaatcatttattgaacttgtgattga 5078432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3394604 - 3394458
Alignment:
Q  148 catgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaa 247  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||||  ||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||| |||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  3394604 catgctttcggatctacaacatcgacgtagaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatcattcaatatgatctaaacaaacaccgcaagaa 3394505  T
Q  248 gacgca--aaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||| ||  |||||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3394504 gacacacgaaatcaaacaacaccacacaagacgacgaacaacacaac 3394458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4530236 - 4530064
Alignment:
Q  116 taatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||| | || | |||| || ||| | ||||| | | |||||||||||| ||| ||| || ||||    
T  4530236 taatatgataaaatctaagttacaaaaatacccatgcttctggatatccaacgtttacgcctaaatcttggattgaatttgtaactgactgaagttgatc 4530137  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| |  |||| |   |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  4530136 tttcaacagtaactaattgaacaccgcaacaagacgcaaaatcaaacgccacacaa-atgacgaataacacaac 4530064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 7640600 - 7640681
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta 111  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  7640600 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgccta 7640681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 37849091 - 37849026
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatac 95  Q
    |||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37849091 aacaccgctaaaaatgtaaagaataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagcatac 37849026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 290
Target Start/End: Original strand, 41554101 - 41554232
Alignment:
Q  162 tgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc--- 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| |||  | ||| |||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||| |||||       
T  41554101 tgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatatttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaa 41554200  T
Q  259 taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41554201 taacgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41554232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 45198858 - 45199023
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| | |||||||||||    
T  45198858 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaa 45198957  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
     | || | |||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  45198958 tcaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 45199023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 127
Target Start/End: Original strand, 31481977 - 31482041
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  31481977 aacaaacatacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatacttataaataacatgataaa 31482041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 32521769 - 32521853
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  32521769 gtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 32521853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 23425198 - 23425297
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |   |||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  23425198 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctatgaacatactaacagcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 23425297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24351237 - 24351178
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaata 89  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  24351237 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcatagcatccaagttaata 24351178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 128
Target Start/End: Original strand, 49148011 - 49148058
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49148011 aagttaatagcatacaacgacaaaatgccaacaattaatatgataaaa 49148058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 1485081 - 1485247
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  | ||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  1485081 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagtttacaacatccaagttaatagcatataagggcataatgcctacaaaaatatatgaaaaaa 1485180  T
Q  129 cctaaa-tcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
      |||| |||||  ||||  ||| || |||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  1485181 attaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaat 1485247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3861191 - 3861093
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||||| |||||   ||||||||  |||||||||| | || ||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3861191 aacatcactaaaaacgtaaattatgaatatgtgaacaaactcataacatccaagttgataacatataatggcaaaaagcctacacataatatgataaaa 3861093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22087417 - 22087303
Alignment:
Q  176 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacg 275  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| | |   ||||||||| || ||||||| | ||||| |||  || |||||||     
T  22087417 ccaagtcattgattgaatttgtaattgactgaagttgatctttcaataggtatcaaacaaacacagcaacaagacacgaaatcaaacatcgtacaagaca 22087318  T
Q  276 acgaacaacacaacg 290  Q
    ||| |||||||||||    
T  22087317 acggacaacacaacg 22087303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42311524 - 42311433
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  42311524 gctagaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactca--gcatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaa 42311433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 42408583 - 42408525
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42408583 gctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 42408525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 128
Target Start/End: Original strand, 46244149 - 46244195
Alignment:
Q  82 agttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46244149 agttaataacatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaa 46244195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 125
Target Start/End: Original strand, 17773416 - 17773465
Alignment:
Q  76 cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  17773416 caccaaagttaatagcatacaacagtaaaatgcttacaaataatatgata 17773465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 1448673 - 1448754
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  1448673 taaaggatgaatctgcgaacaaac--acaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 1448754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6559122 - 6559030
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||| | |||||||||||    
T  6559122 ctaaaaacgtaaatgatgaatatgtgaacaaactcatagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcttgcaaaaatatatgataaaa 6559030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26583962 - 26583862
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaa-gttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaa 127  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| || || |||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  26583962 aacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataagctcacagcattcaaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa 26583863  T
Q  128 a 128  Q
    |    
T  26583862 a 26583862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 14046688 - 14046765
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagtta--atagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14046688 tgaatctgcaaacaaactcacattatccaagttataatagcatataacaacaaaatacctacaaacaatatgataaaa 14046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 14356718 - 14356795
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagtta--atagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14356718 tgaatctgcaaacaaactcacattatccaagttataatagcatataacaacaaaatacctacaaacaatatgataaaa 14356795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21991066 - 21990996
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21991066 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaa 21990996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 290
Target Start/End: Original strand, 24350919 - 24350949
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24350919 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 24350949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 38649083 - 38649153
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||||||    
T  38649083 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcaaaaaacggcaaa 38649153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10574739 - 10574698
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  10574739 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 10574698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21603858 - 21603785
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta 111  Q
    |||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21603858 taaaaagaaaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcgtaaaacggcaaaataccta 21603785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23786821 - 23786728
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||  || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  23786821 gctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatctaagttgatagcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaa 23786728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 46918775 - 46918718
Alignment:
Q  47 aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  46918775 aaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatacatgttaatagcataaaacggcaaa 46918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20083590 - 20083490
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | | || | ||||||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  20083590 aacatcgctacaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactaataacatcaaagttaatagcgtataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 20083491  T
Q  129 c 129  Q
    |    
T  20083490 c 20083490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20116828 - 20116749
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  20116828 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata-tacgacataatgcctacaaa 20116749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Original strand, 44311688 - 44311732
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44311688 ttaatagcatacaacaacgaaatgtctacaaataatatgataaaa 44311732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Original strand, 44527074 - 44527118
Alignment:
Q  59 tgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaa 103  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44527074 tgcaaacaatcttgcagcacctaagttaatagcatacaacggcaa 44527118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 284
Target Start/End: Original strand, 9797367 - 9797633
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9797367 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatatacaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 9797466  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797467 atatgataaaacataaatcacttaaatacccatgcttccggatctgcaacgttaacgttcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 9797566  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaac 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9797567 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaac 9797633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 6954532 - 6954801
Alignment:
Q  21 tcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6954532 tcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatt 6954631  T
Q  121 tgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttca 220  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6954632 tgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcagcattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttca 6954731  T
Q  221 atatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6954732 ataggaactgaacaaacaccgtgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacg 6954801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 45568278 - 45568550
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45568278 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 45568377  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45568378 atatgataaaacctaaatcacccaaatatccatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattgtttgaatttgtaattgattgatgtagttatt 45568477  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45568478 tcaacaggaactgaacaaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 45568550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 52922950 - 52923219
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52922950 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcagccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaata 52923049  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  52923050 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactaatatagatctt 52923149  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52923150 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 52923219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 21533642 - 21533914
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533642 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtaaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 21533741  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||    
T  21533742 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaattattggttgaatttgtagtcgactgatgtagatctt 21533841  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21533842 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaaccaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacg 21533914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 48650567 - 48650837
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48650567 acatcagatacaaatatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 48650666  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48650667 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcattctttcagatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatttgtaattgattgatgcagatctt 48650766  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  48650767 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacaacgaacaacacaa 48650837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 36461270 - 36461536
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||||||||    
T  36461270 acattagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgctaacaaactcacagcactcaagttaatagcatacaa------aatggctacaaata 36461363  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36461364 atatgataaaacctaaatcgccgaaatactcatgcttccagatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 36461463  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36461464 tcaataggaacagaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 36461536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33580135 - 33579863
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33580135 acatcaaatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 33580036  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33580035 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacgtgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 33579936  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33579935 tcaatatgaaataaacgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaacacaacg 33579863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9998722 - 9998450
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998722 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 9998623  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9998622 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgtcatcgtgcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 9998523  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998522 tcaagaggaactaaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 9998450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 43488424 - 43488695
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43488424 acattagatacaaacatcgctaaaacg-taaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaaagcctaaaaata 43488522  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  43488523 atatgataaaacctaaatcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgcttgaatttataattgattaatgcagatatt 43488622  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43488623 tcaatagaaactgaacaaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 43488695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40487578 - 40487308
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40487578 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaataat 40487479  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40487478 atgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggctgaatttgt-attgactgatgtagatctttc 40487380  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc-taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40487379 aataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 40487308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10229729 - 10229459
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10229729 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 10229630  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||  | ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10229629 atgataaaacttaagtcaccgaaataatcatgcttttggatctgcaacgttatcgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 10229530  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10229529 aagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagatgacgaacaacacaacg 10229459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10108491 - 10108219
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108491 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10108392  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||| ||||| || | ||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10108391 atatgataaaacttaagtcgccgaaatactcatgcatctggatctgcaacgttatcgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 10108292  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10108291 tcaagaggaactgagcaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 10108219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10233325 - 10233053
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10233325 acatcaaatacaaacatagataaaaacataaagggtgaatgtacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10233226  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10233225 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttatcgtctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 10233126  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10233125 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 10233053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40556957 - 40556695
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40556957 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtgcatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 40556858  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40556857 atatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttacaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 40556758  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | |||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40556757 tcaagaggaactgaacaaacaccgcg----------aaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 40556695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38546051 - 38545782
Alignment:
Q  21 tcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38546051 tcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcccaccacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataata 38545952  T
Q  121 tgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttca 220  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38545951 tgataaaacctaagtcacctaaattcgcatgttttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctttca 38545852  T
Q  221 atatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||   || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38545851 atggaaaataaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38545782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32701746 - 32701487
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32701746 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttcatagcatacaacggcaaaatgcctacagata 32701647  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||| ||||||| ||| || || |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32701646 atatcataaaacttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattggttgatgtagatctt 32701547  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32701546 tcaataggaactgaacaaacatcgcaacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgac 32701487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21431870 - 21431634
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaaca--tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21431870 acatcagatacaaacacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaatctcacagcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaa 21431771  T
Q  116 taatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21431770 taatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgtagatc 21431671  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgc 252  Q
    ||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  21431670 tttcaatagaaattgaacaaacaccacgacaaaacgc 21431634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 46304354 - 46304584
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  46304354 acatcagatacaaacat-gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaacatgcctacatata 46304452  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  46304453 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaatgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatatt 46304552  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaaga 249  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46304553 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaaga 46304584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54149246 - 54148976
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54149246 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaactaactcacatcacccaggttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 54149147  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  54149146 atatgataaaatccaagtcaccgaaatagccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtgaaatttgtaa-tgattgatgtagatctt 54149048  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcac-aagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  54149047 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaatgccgcacttagacgacgaacaacacaa 54148976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Original strand, 7448751 - 7448980
Alignment:
Q  22 cagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7448751 cagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatat 7448850  T
Q  122 gataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaa 221  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7448851 gatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttaaa 7448950  T
Q  222 tatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7448951 caggaactgaacaaacaccgagacaagacg 7448980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Original strand, 7456893 - 7457122
Alignment:
Q  22 cagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7456893 cagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatat 7456992  T
Q  122 gataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaa 221  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7456993 gatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttaaa 7457092  T
Q  222 tatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7457093 caggaactgaacaaacaccgagacaagacg 7457122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Original strand, 12050492 - 12050753
Alignment:
Q  29 aaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12050492 aaacatctctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacactattcaagttaataacatacaacgacaaaatgcttacaaataatatgataaaa 12050591  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    ||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||    
T  12050592 cctaagtccccgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattgaccgatgtagatattccaataggaac 12050691  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12050692 taaacaaacaccgcgacaagaggagaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 12050753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47896399 - 47896135
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| |||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  47896399 atacaaacatccctaaaaacttaaagggagaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgc-tacaaataataagat 47896301  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    ||||||||| | | | |||||  |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  47896300 aaaacctaagttatcgaaatattcatgcttccggatatgcaacatttacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtaaatctttcaatag 47896201  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47896200 gaactaaacaaataccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacg 47896135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21313289 - 21313020
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21313289 atcagatacaaacaccgctaaaaatgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatggctacaaataat 21313190  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| |||| || |  || ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||| ||||    
T  21313189 atgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgatttcagatatgctacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgataccgatatttc 21313090  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||  |||| ||| ||||||||||||| |||  ||||| || | |  ||||||||||||||||||||||    
T  21313089 aatagaaactaaacgaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaaagtcagacaagacgacgaacaacacaac 21313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 47041881 - 47042154
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  47041881 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcatatcacctaagttaatagcataaaacgataaaacgcctacaaata 47041980  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||    
T  47041981 atatgatgaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaactgactgatgctgatctt 47042080  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgac-aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||  |||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47042081 tcaataggaaataaatgaacaccgctacaaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 47042154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 290
Target Start/End: Original strand, 38859980 - 38860225
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaa--atacacat 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  38859980 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaatatacccat 38860079  T
Q  151 gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga------ttgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcga 244  Q
    | || || ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||      | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38860080 gttttcggatctgcaacgttgacgaccaagtcattggttgaatttgtaatcgactgatgtagatgtagatcttccaataggaactaaacaaacaccgcga 38860179  T
Q  245 caagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38860180 caagacgcgaaatcaatcgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 38860225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 289
Target Start/End: Original strand, 20464805 - 20465074
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  20464805 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagagcaaatctgcgaacaaactcatatcacacaagttaatagcatacgacgacaaaatgcacacaaataat 20464904  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  20464905 atgataaaatttaagtcaccgaaatactcatgctttcaaatctgcaacattgacgcccaaatcatttattgaatttgtaattgactgaaatcgatctttc 20465004  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||| ||  | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20465005 aataggatttaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaac 20465074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Original strand, 53807706 - 53807963
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  53807706 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 53807805  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  ||    
T  53807806 aatcaccagaatactcttgcttctggatatgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttgatctttcaatatgaac-caa 53807904  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | ||||| || |||||| || ||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  53807905 cgaacacagcaacaagatgccaaatcaaacaatgccgcagaagacgacgaacaacacaa 53807963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 20608736 - 20609004
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||    
T  20608736 acatcagatacaaaattcgctagaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacc----ttaatagcatacaacggaaaaatgtctgcaagta 20608831  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| |||||| ||| | |||| ||| ||    
T  20608832 atataataaaatctaaatcaccgaaattctcatgcttccggatctgcaactttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaaatgactaatgttgatatt 20608931  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20608932 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaatgccgcacaagacgactaacaacacaacg 20609004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14859732 - 14859474
Alignment:
Q  31 acatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacc 130  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |    
T  14859732 acatcgctaaaaatgtatagggtgaatctgctaacaatctcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaccaataatacgataaaatc 14859633  T
Q  131 taaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactg 230  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||      
T  14859632 taaattaccaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattgattgaagctgatctttcaatatgaacca 14859533  T
Q  231 aacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||  || | | ||||||| |||||||||||||||    
T  14859532 aatgaacaccgcaacaagatgcaaaattaaatgtcacacaagatgacgaacaacacaac 14859474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 12149662 - 12149889
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||  ||||    
T  12149662 aacaaactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgattaatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatct 12149761  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  12149762 gcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaac 12149861  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  12149862 gctgcacaagacgatgaacaatacaacg 12149889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51923967 - 51923703
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  51923967 atcgctaaaaacgtataggatggatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 51923868  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  51923867 aatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgcgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaa 51923768  T
Q  233 caaacaccg--cgacaa--gacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||||||  | ||||  || ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51923767 cgaacaccgcacaacaaatgatgcaaaatcaaataacgccgcacaagatgacgaacaacacaacg 51923703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 44959806 - 44960056
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44959806 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaataaactcacagcatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 44959905  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||                     ||||  || |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44959906 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgattccg---------------------aatctatggttgaatttgtaattaactgatgtagatctt 44959984  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44959985 tcaataaaaactgaacaaacaccacgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaataatacaac 44960056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Original strand, 23799789 - 23800015
Alignment:
Q  64 acaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| |||| || || |||||    
T  23799789 acaaactcacaacacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcattgaaatactcatgttttcggatctg 23799888  T
Q  164 caacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacg 263  Q
    |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||| | ||||| | | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  23799889 caacgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtaattgactggtgtcgttctttcaacaggaactaagcgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaacg 23799988  T
Q  264 ccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||| || |||||||||    
T  23799989 ccgcacaagacgactaagaacacaacg 23800015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4711737 - 4711583
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4711737 acatcagatacaaacatcactaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 4711638  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattga 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  4711637 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttga 4711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 628771 - 628986
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  628771 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagaatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 628870  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||    
T  628871 aatcaccagaatactcttgcttctggatctacaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac-caa 628969  T
Q  233 caaacaccgcgacaaga 249  Q
    | |||||||| ||||||    
T  628970 cgaacaccgcaacaaga 628986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8914952 - 8914783
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8914952 atcgctaaaaacgtataaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 8914853  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8914852 aatcaccagaatacacattcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 8914783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 51303495 - 51303660
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51303495 ctaaaaacgtatatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatc 51303594  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51303595 accagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 51303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19339429 - 19339159
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||| | ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19339429 catcaaatacaaagatcactacaaacgtaaaagatgaatctgagaacaaacttaaagtacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacagataa 19339330  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  19339329 tatgataaaatctaagtcacgaaa-tacccatgcttctggatctgcaacattgacacctaaatcattgattgaatttgtaattgactaaagttgatcttt 19339231  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||  ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19339230 caataggaactaaacgaacgccacgacaagacgtgaaattaaacgccgcacaagttgacgaacaacacaacg 19339159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7546856 - 7546686
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggta-aagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacct 131  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7546856 atcgctaaaaacgtataagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatct 7546757  T
Q  132 aaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7546756 aaatcaccagaatacccatgcttttggatcggcaacgttgacgctcaaatcattgactgaatttgtgattg 7546686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Original strand, 21289662 - 21289871
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21289662 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 21289761  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    ||| |||| ||||  ||||||||   ||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  21289762 aattaccagaatatccatgcttctagatctgcaacgttgacaccaaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaa 21289861  T
Q  233 caaacaccgc 242  Q
    | ||||||||    
T  21289862 cgaacaccgc 21289871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29922299 - 29922067
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29922299 aacatcgttaaaaacgtaatggg-gaatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaat 29922201  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| || |  |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||||     
T  29922200 ctaaatcaccagaacaatcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattggttgaagttgatctttcaatatgaacg 29922101  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacg 263  Q
     || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  29922100 aaatatacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacg 29922067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29971452 - 29971220
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29971452 aacatcgttaaaaacgtaatggg-gaatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaat 29971354  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| || |  |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||||     
T  29971353 ctaaatcaccagaacaatcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattggttgaagttgatctttcaatatgaacg 29971254  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacg 263  Q
     || | ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  29971253 aaatatacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacg 29971220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37041023 - 37040755
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| ||||| ||    
T  37041023 acatcagatacaaaaatcgctagaaacgtaaagggtaaaactgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacataaaatgacaaaatgc-tacaacta 37040925  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||| |||   ||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||  |||||    
T  37040924 atatgattaaatctaagtcaccgaaatactcatgtttctagatcggcaacattcacacccaaatcattgattggatttataattgaccgatgtcaatctt 37040825  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    ||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37040824 tcaatagaaactaaacgaacgccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaccaacaca 37040755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 50194180 - 50194377
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  50194180 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgatat 50194279  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||    
T  50194280 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctggtctttcaatatgaa 50194377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42460989 - 42460825
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42460989 atcgctataaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 42460890  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    |||||||| |||   |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42460889 aatcaccagaatgttcatgcttctgtatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgt 42460825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35175647 - 35175386
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  35175647 aacatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgatgaaat 35175548  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     ||||||| || ||||| |||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||| |||     
T  35175547 ataaatcatcagaatactcatgttttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagctgatctttcaatataaacc 35175448  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
     ||| |||||||| |||||||   |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35175447 aaacgaacaccgcaacaagacatgaaatcaaacaacgctgcacaagacgatgaacaacacaa 35175386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16235666 - 16235497
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  16235666 atcgctaaaaacgtatagggtaaatctgcgaacaaactcacaccatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaagtaatatgatgaaatcta 16235567  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16235566 aatcaccagaatacccatgcttcttgatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 16235497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43017014 - 43016838
Alignment:
Q  114 aataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtaga 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  43017014 aataatatgataacacctaagtcaccgaaatgcacatgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactaacgtcga 43016915  T
Q  214 tctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  43016914 tctttcacaaggaactaaacaaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgccacacaagataacgaacaacacaacg 43016838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 290
Target Start/End: Original strand, 35864895 - 35865037
Alignment:
Q  148 catgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaa 247  Q
    |||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  35864895 catgcttccagatctgcaatgttaacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgaaaa 35864994  T
Q  248 gacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35864995 gacgcaaaatcaaacgccacacaagacgactaacaacacaacg 35865037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43017143 - 43017022
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43017143 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 43017044  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  43017043 atatgataacacctaagtcacc 43017022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45425762 - 45425578
Alignment:
Q  103 aaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45425762 aaatgcctgcaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaaatacttatggttccggatctgcaatgttgaagcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45425663  T
Q  203 attgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  45425662 attgatttcgatctttcaatgggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacgccgcataggacgacggacaacaca 45425578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53099999 - 53099773
Alignment:
Q  62 aaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatc 161  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||| |||||||||||| ||     
T  53099999 aaacaaactcacaacacc-aagttaataacatacaacgacaaaatgc-tacaaataatatgctaaaatctaagtcactggaattcacatgcttccggata 53099902  T
Q  162 tgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaa 261  Q
    || ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||  || || |||||||||||  ||||| ||    
T  53099901 tgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactcatgctgatctttcaataggaactaaatgaatacggcgacaagacgtgaaatcaaa 53099802  T
Q  262 cgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53099801 cgccgcacaagatgactaacaacacaacg 53099773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18011269 - 18011003
Alignment:
Q  24 gatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatga 123  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  18011269 gatacaaagatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaacttaaagaacccaaattagtagcatacaaccgcaagatacctacaaataatatga 18011170  T
Q  124 taaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    | | | |||| ||||  |||||  |||||||| | ||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||| ||||| | | || ||||||||||||    
T  18011169 ttatatctaagtcactgaaatattcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaagtgattgattgaaattgttattgactaaagtcgatctttcaata 18011070  T
Q  224 tgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      |||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18011069 gaaactaaacgaacaccgtgacaagatgtgaaatcaaacgccgcacaagatgatgaacaacacaacg 18011003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48200024 - 48199801
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcaccc----aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||     || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48200024 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacgcctgcctaaattaatagcatataaaggcaaaatgcctacagataatatgata 48199925  T
Q  126 aaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatg 225  Q
    ||  |||| ||||| |||| |||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |    
T  48199924 aattctaagtcaccgaaatgcacatgcttctggatttgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatttataattgattgaagttgatctttcaatagg 48199825  T
Q  226 aactgaacaaacaccgcgacaaga 249  Q
    |||  ||| |||||| | ||||||    
T  48199824 aaccaaacgaacaccacaacaaga 48199801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4822049 - 4821822
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||     
T  4822049 aacattgctaaaaacataaagaatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaa- 4821951  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||||||| ||||| ||||| |||| || || ||| |||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||| | | |  |||||||||||||||||     
T  4821950 ttaaatcaccagaatacccatgcctccggatttgtaacgttggtgtccaaatcatggattgaatatgtgattgactcaagctgatctttcaatatgaacc 4821851  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4821850 aaacgaacaccgcaacaagacgcaaaatc 4821822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 26275657 - 26275892
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||| ||||||| ||| || ||||| | ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26275657 agatacaaacaacgttaaaaatataaatggtgaatttgcgaataaacttaaagcgccaaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatg 26275756  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    ||||||  ||| ||||  |||||| |||| || || ||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |    
T  26275757 ataaaatataagtcactgaaatactcatgttttcgaatctgcaacgttaacaacaaaatcattgattgaatttgtatatgactgatgtcgatctttcact 26275856  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    | ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  26275857 aggaactaaacgaacatcgcgacaagacgcgaaatc 26275892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Original strand, 27706074 - 27706338
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27706074 atcgctaaaaacgtatagggcgaatctgggaacaaactaacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 27706173  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    ||| ||||  |||| |||||||  | || |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |  | |  |||||||||||| ||||  ||    
T  27706174 aataaccaggatacccatgcttgtggatatgcaacgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtgattgttaaaagctgatctttcaatacgaaccaaa 27706273  T
Q  233 caaacaccgcg----acaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||||||     | |||| || ||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706274 cgaacaccgcacaacaaaagatgcgaaattaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 27706338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45424968 - 45424785
Alignment:
Q  103 aaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45424968 aaatgcctacaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaagtacccatgattccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45424869  T
Q  203 attgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |  ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| || |||| |||||| |||||||||    
T  45424868 accgatgtcgatttttcaataggaactaaacaaacaccgcaacaatacgcgaaatcaaac-ccacacaggacgacaaacaacaca 45424785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41818455 - 41818194
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||  | | |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  41818455 atcgctaaaaatataaagggtgaaactacgaacaaactcacatcaccaatgttaatagcatgcaacaacaaaatgcctacaaataatacgataaaatcaa 41818356  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgta----attgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    || ||||| |||||  ||| ||  | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  41818355 aaccaccataataccaatgtttttggatctgcaacattgacattcaaatcattgattgaatttgtaaatgattgattgaagttgatctttcaataggaac 41818256  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
      ||| |||| | | ||||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||||||||    
T  41818255 -aaacgaacatcacaacaagacgcgaaatcaaacaataccgcacaagacgacgaacaacacaa 41818194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9173990 - 9173849
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9173990 aacatcgctgaaaacgtaaagggtgaatatgcgaa-aaactcacggaacctaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatcaaat 9173892  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattga 172  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||    
T  9173891 ctaaataaccaaaatattcatacttccgggtctgcaacattga 9173849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Original strand, 36910640 - 36910746
Alignment:
Q  185 tgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcg-acaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36910640 tgcttgaatttgtaattgattgatgtacatctttcaataggaactgaacagacaccgcgaacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaa 36910739  T
Q  284 cacaacg 290  Q
    || ||||    
T  36910740 caaaacg 36910746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19619968 - 19619783
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||| | ||||| ||| | |||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19619968 acatcagaaacagacttcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgatcaaactcaaaacatcttagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 19619869  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgat 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||| || |||| |||| |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19619868 atatgataaaatctaagtcaccgaaattctcatgctt-cggatctacaacgttgacacctaaatcattgattgaacttgtaattgat 19619783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38142765 - 38142652
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38142765 atcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcattcaagttaatagtatacaacaataaaatgcctacaaataatatgataagatcta 38142666  T
Q  133 aatcaccaaaatac 146  Q
    ||||| || |||||    
T  38142665 aatcatcagaatac 38142652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27856405 - 27856293
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27856405 atcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatgcaacggaaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 27856306  T
Q  133 aatcaccaaaata 145  Q
    |||||||| ||||    
T  27856305 aatcaccagaata 27856293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44805243 - 44805052
Alignment:
Q  58 atgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  44805243 atgcgaacaaactcacat-acccaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccataatacccatgctctcg 44805145  T
Q  158 catctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     || |||||| |||| |||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||| |  ||| |||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44805144 gatttgcaacgttga-gtccaaattattgattgcatatgtgattgactgaggatgatatttcaatatgcaccaaacgaacaccgcaacaagacg 44805052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46220918 - 46220769
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |||| |   ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46220918 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatataaaagaaaaatttgcgaacaaactcgcagcacccaaattaatggcatacaacggtaaaatgcctacaaata 46220819  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaac 167  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||| || |||||||||    
T  46220818 atatgataaaatctaaatcactgaaataccaatgctttcggatctgcaac 46220769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Original strand, 26739224 - 26739462
Alignment:
Q  52 gtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatg 151  Q
    |||||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| || |    
T  26739224 gtgaatatgtcaacaaacttacgacactcaagttaatagcatacaacgccaaaatgcttacaaataatatgataaaatctaaattatcataatacccacg 26739323  T
Q  152 cttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     |||   |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| || ||  ||||||||||| ||||  |||| ||| | | |||||| |    
T  26739324 attcttgatctgcaacgctgacgtcaaaatcattggttgaatctatgattgatcgaagttaatctttcaataggaaccaaacagacatcacaacaagatg 26739423  T
Q  252 caaaatcta---acgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    ||||||| |   |||||||||||||| | ||||||||||    
T  26739424 caaaatcaaacgacgccgcacaagacaatgaacaacaca 26739462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 186
Target Start/End: Original strand, 3085179 - 3085302
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||| | | ||| || ||||    
T  3085179 aacaaactcactgcacccaatttaatagcctacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaattctaaatcatcagaatacccctactttcgaatct 3085278  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattg 186  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  3085279 gcaacgttgacgttcaaatcattg 3085302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 31271665 - 31271910
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    ||||||||||         
T  31271665 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacctaagttattagcatacaac----aaatgcctac----- 31271755  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
                  || ||||  || ||| |||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||||  || | ||| || ||||||    
T  31271756 --------------aagtcactgaactacccatgcttccggatctgcattgttgacgcccaaatctttgattgaatttgt--ttaactgaagtcgatctt 31271839  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    || ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31271840 tccatatgaactaaacgaatgccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaa 31271910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 20987589 - 20987703
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||  ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20987589 acatcaaatacagacatcgctaaagacgtaaaga-tgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaata 20987687  T
Q  118 atatgataaaacctaa 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  20987688 atatgataaaatctaa 20987703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53508462 - 53508306
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53508462 atcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacatccaagttaatagca----acgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 53508367  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||||    ||||| |||||||  | || |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  53508366 aatcattgtaatactcatgcttttggatgtgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaat 53508306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 3848744 - 3848909
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3848744 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatatagcggcataatgcctacaaatatatatgataaaa 3848843  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||   || || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3848844 ttaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 3848909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 289
Target Start/End: Original strand, 20987729 - 20987903
Alignment:
Q  115 ataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagat 214  Q
    |||||||||||||| |||| | ||  |||| |  ||||||||  ||||| ||| |||||  ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| |||    
T  20987729 ataatatgataaaatctaagttactgaaattcttatgcttccagatctgtaacgttgactcccaaatcattgatgtaacttgtaattgaccgatgtcgat 20987828  T
Q  215 ctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20987829 ctttcaataggaactaaacaaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaatgccacacaagacgactaagaacacaac 20987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 7792063 - 7792156
Alignment:
Q  61 caaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgctt 154  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  7792063 caaacaaactcttaacacctaagttaatagcttacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcactagaatactcatgctt 7792156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 12946845 - 12946937
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttc 155  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12946845 aacaaattcacaacacccaagttaatagcatataagggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccagaatactcatacttc 12946937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 221
Target Start/End: Original strand, 52115897 - 52116057
Alignment:
Q  61 caaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcat 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||| ||  | ||    
T  52115897 caaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacaacaaaatgactacaaataatatgatacaatctaaatcattagaatacccatgattttggat 52115996  T
Q  161 ctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaa 221  Q
    ||||||  ||||||   ||||||||| |||||| ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  52115997 ctgcaatgttgacgcttaaatcattgattgaatatgtgattgtttgaagttgatctttcaa 52116057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29503710 - 29503611
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  29503710 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatatgcgaacatactcacagaatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 29503611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 35864799 - 35864893
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35864799 acatcagatacaaacatctctaaaaacgtaaaaaatgaatttgcgaacaacctcacaacatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctac 35864893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 129
Target Start/End: Original strand, 49552055 - 49552149
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaac 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  49552055 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaac 49552149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22803279 - 22803194
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22803279 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 22803194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 36906371 - 36906286
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36906371 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 36906286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Original strand, 24175976 - 24176044
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaac 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24175976 aacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcaaacaaactcacaatacccaatttaatagcatacaac 24176044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 25631351 - 25631450
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  25631351 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 25631450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 42455657 - 42455768
Alignment:
Q  22 cagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  42455657 cagatacaaacatcattacaaacgtaaatggtaaatctgcgaacaaactcacaacatcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgactacaactaatat 42455756  T
Q  122 gataaaacctaa 133  Q
    ||| ||| ||||    
T  42455757 gattaaatctaa 42455768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 12116347 - 12116262
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |   |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12116347 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctaagaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 12116262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13459074 - 13458985
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13459074 aacatcgctaaaaacggaaaaggtgattccacaaacaaactcacaacacctaagttaatatcatacaacggaaaaatgcctacaaataat 13458985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25162685 - 25162586
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  25162685 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatccgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 25162586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 32607718 - 32607633
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  32607718 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaggttaatagcatataatggcataatgcctacaaa 32607633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 38440416 - 38440497
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta 111  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  38440416 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgccta 38440497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 44907224 - 44907309
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  44907224 aacaacgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaa 44907309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29239485 - 29239323
Alignment:
Q  131 taaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactg 230  Q
    |||| ||||||||||  |||| || || |||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |  |||||| ||||| ||||      
T  29239485 taaaccaccaaaataaccatgttttcggatctacaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatctgtgattgactgaagctgatcttccaatacgaacca 29239386  T
Q  231 aacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| |||||| | ||||||||  ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29239385 aacgaacaccacaacaagacgtgaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 29239323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 288
Target Start/End: Original strand, 12947248 - 12947380
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| | | ||||| ||| || ||| |||||||||||||  ||| |||||| | |||||| || |||||    
T  12947248 atctgcaatgttggcgtccaaatcatcgattgaatctatgattgactgaagttgatatttcaatatgaaccaaacgaacaccacaacaagatgcgaaatc 12947347  T
Q  259 taac---gccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  12947348 aaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 12947380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 38854866 - 38854960
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||| | |||||||||||    
T  38854866 cgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaaaaaactcacatcatccaagttaataacatataacggtataatgactacaaaaatatatgataaaa 38854960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17238054 - 17237969
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  17238054 aacaccgctaaaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 17237969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 25460851 - 25461016
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaat-aatatgataaaacctaaatc 136  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||| | ||| | ||||||||||||| |||| |    
T  25460851 taaaaacgtaaagcgtgaacatgcaaacaaacccacgtcacccaagttaatagcatagaatgataaaatgcattcaagtaaatatgataaaacttaaacc 25460950  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||  ||||  |||| |||||  |||||| | || |||  ||||||| || |||||||||| ||||    
T  25460951 accggaatatccatgtttccggttctgcagcgtttacgctcaaatcaatgattgaatttgttattg 25461016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46934888 - 46934819
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  46934888 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg 46934819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 39917230 - 39917322
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||  || ||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  39917230 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataaaggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 39917322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Original strand, 47176038 - 47176106
Alignment:
Q  60 gcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  47176038 gcaaacaaactcacaacattcaagttaatagcattcaacgactaattacctacaaataatatgataaaa 47176106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21916722 - 21916623
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||| | |||||||||||    
T  21916722 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgagaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaggggcataatatctacaaaaatatatgataaaa 21916623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Original strand, 26716014 - 26716145
Alignment:
Q  92 atacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||  ||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  26716014 atacaacgaaaaaatgcttacaaataatatgataaaatataaatcattatagtacctatgattccggatctgcaacgttgacgccaaaatcattgattga 26716113  T
Q  192 atttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||| | ||||| ||| |   |||||||||||    
T  26716114 atttatgattgactgaagctaatctttcaata 26716145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 30648544 - 30648643
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || | |||||| ||| | |||||||||||    
T  30648544 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacatattgcctataaaaatatatgataaaa 30648643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46178784 - 46178653
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatc 161  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| | |||||||||||   || | |||  ||||| ||||| |||| |||    
T  46178784 aacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaataaaagtgaccggaatacccatgcctccggatc 46178685  T
Q  162 tgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||||| |||||| |||| || ||| ||||||    
T  46178684 tgcaacgttgacgcccaattctttgattgaat 46178653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 50611243 - 50611342
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| || | || |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| | |||||||||||    
T  50611243 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacccatatcatccaagttaatagcatataactgtataatgcctacaaaaacatatgataaaa 50611342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3656196 - 3656027
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||   ||||| |||  |||||||||||||| |     
T  3656196 aacatcgtaaaaaacgtaaatggcgactatgcaaacaaactcacaacacccaagttta-aacatacaacattaaaatacctgtaaataatatgataagat 3656098  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaat 200  Q
    |||| ||||| ||||||  ||| ||| | |||  |||  || || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  3656097 ctaagtcaccgaaatacctatgtttcaggatcaacaatctttacatccaaattattgattgaatttgtaat 3656027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Original strand, 7887320 - 7887417
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatg 151  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7887320 tgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagtaaataacatataatgacaaaatgc-tacaaatgatatgactaaaactaaatcaccaaaatacacatg 7887417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25850035 - 25849973
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||    
T  25850035 tgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagtatataacgacataatgcttacaaa 25849973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32246648 - 32246551
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaat 144  Q
    |||||||||||| |||| | ||| || || ||||| |||||||||   || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32246648 gtaaagggtgaacatgcgagcaatcttaccgcacctaagttaata---tataatagcaaattgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaat 32246552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 51487267 - 51487217
Alignment:
Q  101 caaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatg 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  51487267 caaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatactcatg 51487217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9320086 - 9320042
Alignment:
Q  244 acaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9320086 acaaaacgcaaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaa 9320042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 34960653 - 34960725
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  34960653 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtaaacaaactcacagcttccatgttaataacataaaacggcaaaat 34960725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2342697 - 2342638
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaata 89  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2342697 aacaccgctaaagacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaata 2342638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 289
Target Start/End: Original strand, 4396308 - 4396441
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || | |||||| | | ||||| ||| |   |||||||||||||||   ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  4396308 atctgcaacattgatgtcaaaattatcgattgaatctatgattgactgaagcttatctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatc 4396407  T
Q  259 ---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
        |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4396408 aaacaacgccacacaagacgacaaacaacacaac 4396441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Original strand, 20911434 - 20911521
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| ||||| | | || |||| |||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  20911434 aacatcactaaaaacgtaaaagtttaacatgcgaacaaacttacaacatccaagttaatatcatacaatgtcaaaatacctacaaata 20911521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 182
Target Start/End: Original strand, 36734568 - 36734671
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtcca 178  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||   || | ||| |||||| ||||| |||  ||||||||| |||||| |||    
T  36734568 caagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaatactcatgcctccagatctgcaacgttgacgccca 36734667  T
Q  179 aatc 182  Q
    ||||    
T  36734668 aatc 36734671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 913041 - 913111
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  913041 tcgctaaaaacgaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 913111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 1074619 - 1074689
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  1074619 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 1074689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44647732 - 44647606
Alignment:
Q  102 aaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaatt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | || | ||| ||||| | || ||||| ||  |||||| | || ||||||  ||||||| |||||    
T  44647732 aaaatgcatacaaataatatgataaaatcaaaatgatcagagtactcatgcatacggatctgtaatgttgacgcctaagtcattgagtgaatttttaatt 44647633  T
Q  202 gattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||    
T  44647632 gattgaagttgatattttaatatgaac 44647606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51487116 - 51487086
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51487116 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 51487086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6903160 - 6903071
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatg-cctacaaataatatgataaa 127  Q
    ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| | ||||||| | || ||| |||||||||||    
T  6903160 aaaaatgtaaaggatgaatttacaaacaaactcacaatatctaagttaatagcatacaatgacaaaatgacttataaacaatatgataaa 6903071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14464751 - 14464674
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||| |||| || ||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14464751 taaaaacgtaacggatgaatctgcgaacaaactcagaacatccaagttaatagtatataacagcataatgcctacaaa 14464674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37169478 - 37169393
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||  || || ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37169478 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatccgcgaagaaactcacaaccttcaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 37169393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11819473 - 11819417
Alignment:
Q  47 aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaa 103  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  11819473 aaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaa 11819417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21431638 - 21431610
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21431638 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 21431610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 30830210 - 30830122
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||   ||||| | |||||||||||||||||    
T  30830210 taaaaatgtaaaagatgaatatgcgaataaactcacatcatacaaattaatagtatacaactataaaatccgtacaaataatatgataa 30830122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 97
Target Start/End: Original strand, 46979832 - 46979892
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaa 97  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  46979832 ctaaaaacgtaaaggattaatctgcaaacaaactcataacatccaagttaatagtatacaa 46979892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 51202094 - 51202146
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaa 87  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  51202094 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaa 51202146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51487322 - 51487270
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagtt 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  51487322 atcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaattcacaacactcaagtt 51487270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38598052 - 38597780
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598052 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 38597953  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38597952 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 38597853  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38597852 tcaataggaactgaacaaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38597780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13007484 - 13007212
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007484 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 13007385  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13007384 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 13007285  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007284 tcaagaggaactaaacaaacaccgcgacaaaacacaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 13007212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 24229617 - 24229889
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229617 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 24229716  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24229717 atatgataaaacctaagtcacagaaatatccatgctaccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 24229816  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  24229817 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcacacaagacgacgaacaacaaaacg 24229889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34945648 - 34945386
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34945648 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctataaata 34945549  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34945548 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 34945449  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaa 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34945448 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaa 34945386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 9113558 - 9113830
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9113558 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcagaacacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctacaaata 9113657  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9113658 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 9113757  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9113758 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacagaacg 9113830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 6011971 - 6012242
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  6011971 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcataaaacggtagaatgcctacaaata 6012070  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||| |||| ||| ||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6012071 atatgatcaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctacaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 6012170  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6012171 ttaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 6012242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25980410 - 25980143
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25980410 atcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaataat 25980311  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  25980310 atgataaaacttaagtcacgaaa-tacccatgcttccgaatctgcaactttgacgcccaaatcattggttgaatttgtagttgactgatgttgatctttc 25980212  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25980211 aataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaattaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 25980143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26825683 - 26825413
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26825683 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 26825584  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26825583 atgataaaacttaagtcaccgaaataaacatgcttatggatctgcaacgtaatcgtacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 26825484  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26825483 aagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagaagacgaacaacacaacg 26825413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38007612 - 38007343
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38007612 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaa-ggcaaaatgcctacaaata 38007514  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||    
T  38007513 atatgataaaacctaattcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgtccaaatcattggttaaatttgtaattgactgatgccgatctt 38007414  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38007413 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgcacaagacgatgaacagcacaa 38007343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13422188 - 13421917
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  13422188 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacatata 13422089  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13422088 atatgataaaatataagtcaccgaaatacacatgcttcagaatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 13421989  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||||| ||  |||||  |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13421988 tcaataggaactaaatgaacacaacgacaatacgcgaaatcaaataccgcacaagacgacgaacaacacaac 13421917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 14726294 - 14726565
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  14726294 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatattataaaacgacaaaatgcctacaaata 14726393  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||    
T  14726394 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtgattgactgatgccgatctt 14726493  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14726494 tcaataagaaataaactaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacatcgcacaagacgacgaacaacacaac 14726565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35851050 - 35850782
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  35851050 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatttgtgaacaaactca--gcacccaagttaatagcataaaacggcaaagtgcctgcaaataat 35850953  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  35850952 atgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttc 35850853  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35850852 aataggaaataaacaaacaccgcgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 35850782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 11976768 - 11977040
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11976768 acatcagatgcaaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacataaaacgggaaaatgcctacaaata 11976867  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||     
T  11976868 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccagatcttcaacgttcacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctc 11976967  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  11976968 tcaatagaaaataaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgtacaagacgacgaacaatacaacg 11977040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Original strand, 8096336 - 8096602
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8096336 agatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaataatatg 8096435  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||  |||||||  ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  8096436 ataaaacctaaatcactgaaat-cacatggctccggttctgcaatgttgacgctcaaatcattggttgaaattgtaattgattgatgccaatctttcaat 8096534  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  8096535 aggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgctcaaaacaacgaacaacacaacg 8096602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6217152 - 6216882
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggca-aaatgcctacaaata 117  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  6217152 catcaaatacaaacgtcactaaaaacgcaaagg-tgaatctgcgaacaaactcacagcactcaagttaatagcatacaatgacttaaatgcctacaaata 6217054  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6217053 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtagatctt 6216954  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6216953 tcaatagaaactaaacaaacactgcgacaagatg-taaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacataacg 6216882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Original strand, 31391614 - 31391858
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31391614 taaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacatataatatgataaaacctaagtcaccgaaata 31391713  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    | ||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  31391714 ctcatccttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataaaaactaaacaaacactgcgac 31391813  T
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31391814 aagatgcgaaatcaaatgccgcacaagacgaagaacaacacaacg 31391858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7930384 - 7930160
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgca 165  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  7930384 aaactcacagcatccaggttaatggtatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagaaacctaaatactcatgcttccggatctgca 7930285  T
Q  166 acattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgcc 265  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| |    
T  7930284 acattgacgctcaaatcattggttgaatttgtaattgactgacgtcgatctttccataggaactaaacaaacactgcgaccagatgcgaaatcaaacgac 7930185  T
Q  266 gcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7930184 gcacaagacgacgaacaacacaacg 7930160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10723016 - 10722752
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10723016 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaataacatacagcggaaaaatgcctacaaata 10722917  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||  | |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| || ||||||    
T  10722916 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttttggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttttaaatgactgaagtcgatctt 10722817  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaaca 282  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10722816 tcaataggaactaaacgaacaccgagataagacacaaaatcaaacgccgcacaagacgacaaaca 10722752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 141 - 290
Target Start/End: Original strand, 11073856 - 11074005
Alignment:
Q  141 aaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacacc 240  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11073856 aaatacccatgctttcggatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatatttcaataggaactgaacaaacacc 11073955  T
Q  241 gcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11073956 gcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaaacaacg 11074005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 28540754 - 28540923
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  28540754 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgtctacaaataatatgatgaaatcta 28540853  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28540854 aatcaccaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 28540923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Original strand, 26877942 - 26878188
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  26877942 acatcatatacaaacattggtaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatag-atacaacgacaaagtgcctacaaata 26878040  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  26878041 atatgataaaatctaagtcaccaaaatacccatgcttctggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatatctaattgactgatgtcgatctt 26878140  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgcc 265  Q
    |||| |  || | ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26878141 tcaagagaaattaaacgaacaccgcgacaagacacgaaatcaaacgcc 26878188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14211467 - 14211205
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14211467 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 14211368  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  14211367 aatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgcatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaa 14211268  T
Q  233 caaacaccg--cgacaa--gacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||  | ||||  || || |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14211267 cgaacaccgcacaacaaaggatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 14211205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41630712 - 41630490
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |    
T  41630712 aacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtcacggaaatacacatgcttctggatgt 41630613  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| || || |||    
T  41630612 gcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgaagtcgatcttttaataggaactaaacgaacaccgtgacaagacgcgaagtcaaac 41630513  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    | || |||||| ||| |||||||    
T  41630512 gtcgtacaagatgacaaacaaca 41630490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Original strand, 2979154 - 2979363
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2979154 atcgctaaaaatgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcacaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 2979253  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||    
T  2979254 aatcaccagaatacccgtgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatcttttaatacgaaccaaa 2979353  T
Q  233 caaacaccgc 242  Q
    | ||||||||    
T  2979354 cgaacaccgc 2979363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 288
Target Start/End: Original strand, 8088063 - 8088317
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8088063 gctaaaaaggtaaaagatgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaaaggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaat 8088162  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaa 235  Q
    ||||| ||||| | || ||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| |    
T  8088163 caccagaatactcttgtttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac-caacga 8088261  T
Q  236 acaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||| || |||||| || |||||    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8088262 acactgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacgataaacaacacaa 8088317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 14082229 - 14082414
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14082229 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcccatcatcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 14082328  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14082329 atatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttggttggatttgtaattga 14082414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7036440 - 7036215
Alignment:
Q  51 ggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacat 150  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||  | |||||| |||    
T  7036440 ggtgaatctgcaaacaaactcaaa-caaccaatttaatagcatacaacagcaaaattcctacaaacaatatgataaaatctaagtcctcgaaatacccat 7036342  T
Q  151 gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagac 250  Q
    |||| || ||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  7036341 gctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcatagattcaatttgtaattgacttatgtcgatcttttaacatgaactaaacgaacaccatgacaagac 7036242  T
Q  251 gcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  7036241 gcgaaatcaaacgccgcacaagacgac 7036215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 19103315 - 19103484
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  19103315 atcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcatagcaccaaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctataaataatatgatgaaatcta 19103414  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||  ||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19103415 aatcaccggaatactcatgcttctggatctgcaatattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 19103484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 10332392 - 10332656
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  10332392 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataaagacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 10332491  T
Q  130 ct-aaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||| | | |||| ||| ||||| |||     |||||||||||||||     
T  10332492 ctaaaatcatcagaatactcatgcttccggatctgcaacgttggtgtctaaatcatcgatcgaatatgtgattgactgagcctaatctttcaatatgaat 10332591  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      ||||||||| || ||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10332592 caaacaaacactgcaacaagacgcgaaatcaaacaatgccgcacaagacgacaaacaacacaacg 10332656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1409755 - 1409524
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaa--gttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |   || ||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  1409755 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaaagctgaatctatgaataaattcacaccatccaaaagttaatagcgtacaacggcaaaatatcttcaaa 1409656  T
Q  116 taatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatc 215  Q
    ||||||||| ||| |||| |||| ||||||  |||| || || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1409655 taatatgattaaatctaagtcactaaaatattcatgttttcggatctgcaacattgacgcataaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcgatc 1409556  T
Q  216 tttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaa 247  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  1409555 ttttaatatgaactaaacgaacatcgcgacaa 1409524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 258
Target Start/End: Original strand, 35920845 - 35921069
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaa 133  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35920845 tcgctaaaaacataaagtgtgaatctgcaaacaaatttacaacaccaaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcaaa 35920944  T
Q  134 atcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaac 233  Q
    ||||| | ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||| |||| |||   ||     
T  35920945 atcactagaatatcgatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgattgaatctgtgattgattgaatttgatcttttaataggaaacaaat 35921044  T
Q  234 aaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
     |||||||| ||||||||| |||||    
T  35921045 gaacaccgcaacaagacgcgaaatc 35921069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39567506 - 39567321
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| ||| | ||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39567506 ctaaaaacgtatatggtgaatctacgaacaaactcacaacacccaaggtaataacatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaatc 39567407  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    |||| ||||| |||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||    
T  39567406 accagaatacccatgtttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaat 39567321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19121155 - 19120893
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19121155 aacatctctgaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatatcatacaagagcaaaacgtctacaaataatatgataaaac 19121056  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||| ||||| |||||  |||| |||   ||||||| | ||||||   || |||||| | |||||||||||||| ||| |  |||| ||||| | |||      
T  19121055 ctaagtcaccgaaatattcatgtttctagatctgcagcgttgacgcttaagtcattgatagaatttgtaattgactgaagctgatc-ttcaaaaggaaac 19120957  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||||||||||||||||    
T  19120956 aaacaaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacaatgcctcataagacgacgaacaacacaacg 19120893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Original strand, 37985965 - 37986218
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  37985965 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcaaacaaactcacatcattcaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatgtgataaattctaagtc 37986064  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    || |||||||  ||  ||| | | ||| ||| | |||   |||||||||| |||||| ||||| |||   | || |||||||||||| |||   ||| ||    
T  37986065 actaaaatacctataattctggacctgtaacttcgacactcaaatcattgattgaatctgtaaatgacaaaagttgatctttcaataagaatcaaacgaa 37986164  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37986165 cgccgcaacaagatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaacacaacg 37986218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15571741 - 15571511
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaac-ggcaaaatgcctacaaat 116  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||   ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  15571741 acatcagatataaacatcactaaaacg-taaaggacaaatctacgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaactggaaaaatgtctataaat 15571643  T
Q  117 aatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    ||||||||||||  ||| ||||  || ||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| || | | | || |||||    
T  15571642 aatatgataaaatttaagtcactgaactactcatgcttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattgattgaatttgtagtttactaaagtcgatct 15571543  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaag 248  Q
    |||||||  |||| ||| |||| | |||||||    
T  15571542 ttcaatagtaactaaacgaacatctcgacaag 15571511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7242038 - 7241939
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7242038 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 7241939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7247213 - 7247114
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7247213 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 7247114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4954246 - 4954081
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4954246 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4954147  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4954146 ttaaagtcaccggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 4954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11867904 - 11867652
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||  ||||| ||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11867904 acatcatatacaaacgtcgataaaaacataaagaatgaatctgcgaacaagctcacaatacccaaattaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaata 11867805  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||| |||||| |||| | ||  |||||| |||| ||  | |||||||||                    |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11867804 atataataaaatctaagtaacagaaatacccatgtttttggatctgcaac-------------------gttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 11867724  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | |||| ||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11867723 ttaataggaactaaacgaacaatgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgtacaagacgactaacaacacaac 11867652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 19259637 - 19259736
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  19259637 aacatcgctaaaaacgtaaagaataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 19259736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 43148981 - 43148882
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  43148981 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 43148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 34881971 - 34881886
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34881971 aacaccgctaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 34881886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 41184265 - 41184344
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcc 109  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41184265 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcc 41184344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 7150160 - 7150325
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||    ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  7150160 aacaccgctaaaaacgtaaagaacaaatctgcgaacaaactcacagcatccaaattaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaa 7150259  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgct-tccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  7150260 ttaaagtcaccgaaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 7150325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11768253 - 11768154
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  11768253 aacatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagataatagcatataacggcataatggctacaaaaatatatgataaaa 11768154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 27266684 - 27266783
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  27266684 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 27266783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30299098 - 30298999
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  30299098 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 30298999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 3271227 - 3271326
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  3271227 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcataacatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaa 3271326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 7886764 - 7886863
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||| |||||| || ||||| | ||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7886764 aacaccgctaagaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacagaataatgcctacaaaaaatatgataaaac 7886863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 20257521 - 20257620
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  20257521 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 20257620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13468818 - 13468708
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || | | ||||||||  ||| ||||| ||||    
T  13468818 aacaaactcacaaaatcaaagttaatagcatatgacgacaaaatgcctacacataatatgataaaactaaagtgatcaaaatactgatgtttccgaatct 13468719  T
Q  163 gcaacattgac 173  Q
    ||||| |||||    
T  13468718 gcaacgttgac 13468708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16981546 - 16981461
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16981546 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgatataatgcctacaaa 16981461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15571138 - 15571062
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15571138 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 15571062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 42580142 - 42580070
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggca 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  42580142 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctataaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacggca 42580070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 781642 - 781543
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| || |||| ||||| ||| || | ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  781642 aacaccgctaaaaacgtgaaggatgaatctgcgaatatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 7612883 - 7612982
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  7612883 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacattcaatttaatagcatagaacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 7612982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 290
Target Start/End: Original strand, 14082423 - 14082478
Alignment:
Q  235 aacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14082423 aacaccgcgacaagatacgaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacg 14082478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 18677291 - 18677389
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  18677291 aacaccgctaaaaacgtaa-ggatgaatctgcgaacaaacacacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaa 18677389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27752179 - 27752080
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||||| | |||||||||||    
T  27752179 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctacgaacatactcacagcatccaagttaatagcatataatggtataatgcctacaaaaatatatgataaaa 27752080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32691176 - 32691109
Alignment:
Q  54 gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32691176 gaatctgcaaacaaactcacaacacttaacttaatagtatacaacggcaaaatgtctataaataatat 32691109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 35475163 - 35475262
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| |   ||||||||||| | |||||||||||    
T  35475163 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatatacgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacgacgttatgcctacaaaaatatatgataaaa 35475262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 43008147 - 43008238
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaa 127  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  43008147 ctaaaaacgtaaaggataaatttgagaacaaactcataacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 43008238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Original strand, 8772013 - 8772067
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagc 91  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8772013 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaaactcatagcatccaagttaatagc 8772067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Original strand, 8984845 - 8984915
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  8984845 gtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagtatataacgacaaaatgcctacaaa 8984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Original strand, 8514548 - 8514653
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||   || | ||||||||| |  ||| |||| |||| | | |||||||||||||    
T  8514548 aagttaataacatacaacgacaaaatatttacaaataatatgataaaataaaagtgaccaaaatatatgtgcctccgtatctactagattgacgtccaaa 8514647  T
Q  181 tcattg 186  Q
    ||||||    
T  8514648 tcattg 8514653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758685
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16758749 aacaaactcacaacatccaagtcaataacatgcaacggcaaaatg-ttacaaataatatgataaaa 16758685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27241459 - 27241382
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccta 111  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27241459 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccacgttaatagcataaaacggcaaaataccta 27241382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 145
Target Start/End: Original strand, 31078314 - 31078379
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  31078314 caagttaatagcatacaatgacaaaatgtctataaataatattataaaatttaaatcacctaaata 31078379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Original strand, 19280804 - 19280935
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcat 160  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |   || |||||  ||||  ||| || |||| ||    
T  19280804 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatataac-gcataatgcctacaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatagcctccggat 19280902  T
Q  161 ctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19280903 ctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 19280935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28235831 - 28235740
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagc--atacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  28235831 aaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 28235740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 9762300 - 9762396
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| |||||||| |||| | ||||| ||  |||||||||| | || |||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9762300 aacatcactaaaaagataaatgatgaatctg--aacaaactcataacatccaagttaatagctaacaacgacaaagtgtctacaaataatataataaaa 9762396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18654157 - 18654114
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18654157 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaaat 18654114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 21060108 - 21060207
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| | | |||| ||||||| || ||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  21060108 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacatactcacaacatccaagttgatagaatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 21060207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24549612 - 24549521
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | |||||||| | |||||| | ||||||| || |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24549612 ctaaaaacgtaaatgatgaatttacaaacaaatttacagcatctaagttaacagtatacaaagataaaatgcctacatataatatgataaaa 24549521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24874765 - 24874698
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24874765 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaattcacatcacccaagttaataacatacaacgacaaa 24874698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28097351 - 28097304
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28097351 aagttaatagcatacaacagtaaaataactacaaataatatgataaaa 28097304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 290
Target Start/End: Original strand, 2979388 - 2979418
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2979388 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 2979418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11192571 - 11192525
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11192571 aagttaataacatacaacgacaaaatgcttacaaataatacgataaa 11192525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 11734562 - 11734632
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  11734562 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacaaccatgttaatagcataaaacggcaaa 11734632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 290
Target Start/End: Original strand, 28540988 - 28541018
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28540988 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 28541018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30298463 - 30298362
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagc--atacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataa 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  30298463 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataa 30298364  T
Q  127 aa 128  Q
    ||    
T  30298363 aa 30298362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31280923 - 31280881
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31280923 ccaagttaatagcataaaacgataaaatgcctacaaataatat 31280881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19349708 - 19349679
Alignment:
Q  259 taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349708 taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 19349679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41749533 - 41749472
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41749533 aaactcataacacccaagttaattgcatacaatgacaaaatgtctacatttaatatgataaa 41749472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 42886696 - 42886647
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42886696 aaactcacaacattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 42886647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 39531131 - 39531199
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  39531131 gctaaaaacgaaaaggatgaatttgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 39531199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 3913407 - 3913679
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3913407 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgcatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 3913506  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913507 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtctaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 3913606  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3913607 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacg 3913679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 32327053 - 32327322
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32327053 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatac---ggcaaaatgcctacaaata 32327149  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327150 atatgataaaacctaaatcaccaaactactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtcaaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 32327249  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32327250 tcaatagaaattgaataaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 32327322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12170725 - 12170474
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12170725 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 12170626  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12170625 atatgatcaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 12170526  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcac 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12170525 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcac 12170474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 33053001 - 33053273
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33053001 acatcaaatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 33053100  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33053101 atatgataaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 33053200  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33053201 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 33053273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23128875 - 23128603
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128875 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 23128776  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23128775 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 23128676  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23128675 tcaataagaactgaacaaacactgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 23128603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 606461 - 606189
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  606461 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 606362  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  606361 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgtagatctt 606262  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  606261 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagatgacgaacaacacaacg 606189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 29319712 - 29319983
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa-taa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  29319712 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacaaccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcttacaaaataa 29319811  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29319812 tatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatcttt 29319911  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29319912 caatatgaagttaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcataagaggacgaacaacacaacg 29319983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 289
Target Start/End: Original strand, 67836 - 68105
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  67836 atcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataat 67935  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||| ||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  67936 atgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttaacgtacaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 68035  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  68036 attaggaactgaacaaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacggtgaataacacaac 68105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 7515037 - 7515307
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  7515037 catcagatataaa-atcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacagaaaccaagttaatagcatacagcagaaaaatgcctacaaataa 7515135  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  7515136 tatgataaaacctaagtcaccgacatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgtagatattc 7515235  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7515236 caataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcccaagacgacgaacaacaaaacg 7515307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 30608350 - 30608619
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30608350 atcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataat 30608449  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  30608450 atgataaaatataagtcaccgaaatacccatgattccagatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattgacttatgtcgatctttc 30608549  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| ||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30608550 aataggaactaaatgaacacagcgacaa-acgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 30608619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 29255279 - 29255550
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29255279 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaatgggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagtgaaatgcctacaaata 29255378  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29255379 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgaagatctt 29255478  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29255479 tcaataggaactaaacgaacaccgcgataagacac-aaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacg 29255550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30894855 - 30894595
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30894855 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaat-aaactcacagcatccaagttgatagcatacaacagcaaaatgactacaaata 30894757  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30894756 atatgataaaacctaattcatcgaaatac-catgcttctggatctgtaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 30894658  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaa 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  30894657 tcaatatgaactaaacgaacaccgcggcaagacgcgaaatcaaacgtcgcaaaagacgacgaa 30894595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 127905 - 127655
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  127905 ctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcaaccaagttaatagca--caacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 127808  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||    
T  127807 accgaaatactcatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgatcgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaatgaa 127708  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  127707 caccgcgacaa-acgcgaaatcaaatgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 127655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34018812 - 34018545
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34018812 agatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtaaatctgcagacaaactcacaacacccaagataataatatacaacagtaaaatgcctacaaataatatg 34018713  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  34018712 ataaaacataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttgtaattaactgatctcgatctttcaat 34018613  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34018612 aggaactaaacgaacaccgcgacaagacatgaaatcaaacgtctcacaagacgacgaacaacacaacg 34018545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30493777 - 30493515
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  30493777 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaattcacaacacccaggttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaacatgataaaat 30493678  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     
T  30493677 ataaatcaccaaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgagattgactgaagttgatctttcaatatgaacc 30493578  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||| ||||||   ||||||  | |||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30493577 aaacgaacaccagaacaagatacgaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacacaac 30493515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14802070 - 14801900
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaa-agggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacct 131  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14802070 atcgctaaaaacgtaatagagtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatct 14801971  T
Q  132 aaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14801970 aaatcaccaaaatacacattcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 14801900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Original strand, 26588317 - 26588579
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  26588317 aacatcgctaaaaacttaaagggtgaagctgcaaacaaactcacgacatccaagttaagagcatacaacagcaaaatgtctaaaaataatatgataaaat 26588416  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    | |||||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||     
T  26588417 caaaatcacccaaatactcatgcttctggatttgcaacgttgacatccaaatcattaattgaatgtgtgattgactgaagttgatctttcaatatgaacc 26588516  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||| |||||||| ||||||||  |||||    |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26588517 aaacgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaatcaacacaac 26588579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 546273 - 546111
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  546273 atcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 546174  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaattt 195  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  546173 aaccaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaattt 546111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8102968 - 8102759
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8102968 atcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaataacattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 8102869  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    ||||| || ||||  |||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||  ||    
T  8102868 aatcatcagaatattcatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaa 8102769  T
Q  233 caaacaccgc 242  Q
    ||||||||||    
T  8102768 caaacaccgc 8102759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Original strand, 1933540 - 1933800
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||  ||    
T  1933540 atcgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcatagtaccgaaattaatagcatacaacagaaaaatgcatatagataatatgataaaatata 1933639  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||  ||    
T  1933640 aatcaccagaataatcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgattgaagttgatcttttgatatgaaccaaa 1933739  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1933740 caaacaccgcaaccagacacaaaatcaaacaatgccgcacaagacgactagcaacacaacg 1933800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30776905 - 30776710
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30776905 atcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatcta 30776806  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   || |||||| || ||| |||||||||||  ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  30776805 aatcaccagaatacccatgcttctagatttgcaacgttcacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaac 30776710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 289
Target Start/End: Original strand, 7976032 - 7976284
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||     
T  7976032 aacattgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacggtatgataaaat 7976131  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||| |||          ||||||| ||||||||||    
T  7976132 ttaaatcaccagaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaataattaattgaatctgtgatt----------gatcttttaatatgaact 7976221  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaat---ctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
     ||| |||||| | |||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7976222 aaacgaacaccacaacaagacgcataattaaaaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 7976284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31297065 - 31296911
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31297065 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaaatgcgaacaaactcaaatcatccaaattaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaat 31296966  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcat 184  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  31296965 ataaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtctaaatcat 31296911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Original strand, 21426519 - 21426622
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21426519 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaacggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 21426618  T
Q  118 atat 121  Q
    ||||    
T  21426619 atat 21426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28981422 - 28981159
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||     
T  28981422 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgtgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatacaacaacaaaattcctacaagcaatatgataaaat 28981323  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| || ||||||||  |||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||| | |     |||||| |||||||||     
T  28981322 ctaaatgaccaaaatacccatactttcggatctgcaatgttgacgtcaagatcattgattgaatctgtgattgactaaaactaatctttgaatatgaacc 28981223  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| |||||| | ||||||  |||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28981222 aaacgaacaccacaacaagatacaaaatcaaacaacaccgcagaagacgacgaacaacacaacg 28981159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Original strand, 9341484 - 9341595
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9341484 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaaca 9341583  T
Q  118 atatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||    
T  9341584 atatgataaaac 9341595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 14174904 - 14175043
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14174904 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14175003  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14175004 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccg 14175043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 14179440 - 14179579
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14179440 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14179539  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  14179540 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccg 14179579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9380260 - 9380106
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9380260 taaaaatgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagataatagaatacaacgacaaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatca 9380161  T
Q  138 ccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaa 192  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||   |||||||||| |||||    
T  9380160 ccaaaatacccatgcttctgaatctacaacattgacacacaaatcattgattgaa 9380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20226096 - 20225903
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  20226096 aacatcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaatt 20225997  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||| | ||||||||| | | || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||    
T  20225996 ctaactcatcgaaatactcatgcttcagaatctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaactgaatgaagttgatcttccaata 20225903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22120080 - 22119887
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  22120080 aacatcgctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaatt 22119981  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||| | ||||||||| | | || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||    
T  22119980 ctaactcatcgaaatactcatgcttcagaatctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaactgaatgaagttgatcttccaata 22119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3355292 - 3355103
Alignment:
Q  100 gcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaa 199  Q
    |||||||| || |||| |||| ||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  3355292 gcaaaatgtctccaaacaataggataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattcattgaatttataa 3355193  T
Q  200 ttgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  3355192 ttgactgatgtcgacctttcaataggaactaaacgaacaccacaacaagacgcgaaatcaaacgtcacacaagaggacgaacaacacaac 3355103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1523607 - 1523491
Alignment:
Q  76 cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgt 175  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  1523607 cacccaagttaatagcattccacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgt 1523508  T
Q  176 ccaaatcattgcttgaa 192  Q
     |||||||||| |||||    
T  1523507 tcaaatcattgattgaa 1523491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 34185538 - 34185766
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||| ||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  34185538 aacatcgctaaaaaagtaaaaggtgaatctacgaataaagtcacatcacccaagttgatagtacataacgacaaaatacctacaaataatatgataaaat 34185637  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||    | |||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||    ||| || ||||||||||||||||||    
T  34185638 ctaaatcaccagaatacccatgattctagttttgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaattcgtgatcacctgaagttgatctttcaatatgaact 34185737  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
     ||  |||||| | |||||||||||||||    
T  34185738 aaaagaacaccacaacaagacgcaaaatc 34185766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 285
Target Start/End: Original strand, 4010430 - 4010611
Alignment:
Q  103 aaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4010430 aaatgcctataaataatatgataaattctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgtcaacacccaaatcattgattgaatatgtaattg 4010529  T
Q  203 attgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||||||| ||| ||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  4010530 attgatat-gatctttcaataggaatcaaacaaacatcgcaacatgacgcaaaatcaaatgatgcacaagacgacgaacaaca 4010611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Original strand, 528249 - 528458
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatca 183  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  || |||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  528249 ttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcactagaatacttatacttcagaatctgcaacgttgacgcccaaataa 528348  T
Q  184 ttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaa 280  Q
    ||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||||| |||||||    |||||||||||||| ||| ||    
T  528349 ttgattaaatatgtaatttactgaagctgatctttcgataagaacgaaacaaacactgcaacaagacacaaaatcaaacaacgccgcacaagatgacaaa 528448  T
Q  281 caacacaacg 290  Q
     |||||||||    
T  528449 taacacaacg 528458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 224
Target Start/End: Original strand, 31852062 - 31852232
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  31852062 tgaatctgcaaacaaactcacatcacttga-ttaatagcatacaacaacaaaatgtctataaataatatgataaaatttaaatcaccagaatactcatgc 31852160  T
Q  153 ttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||  |||| ||| || |||||||||||||    
T  31852161 ttccggatctgcaactttgacgttcaaatcattgatttaatctgtggttgactgaagttgatctttcaatat 31852232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29743242 - 29743079
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata---caacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  29743242 atcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgagaacaaactcacaacaaccaagttaataacatattacaacgacaaaatgcctataaataatatgataagat 29743143  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||    
T  29743142 ctaaatcaccagaatactctagcttccggatctgcaacgttgacgcccacgtcattgattgaat 29743079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Original strand, 14846113 - 14846193
Alignment:
Q  77 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14846113 acccaagttaatagcataaaacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccg 14846193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Original strand, 32191629 - 32191748
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatca 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| || || |||||| ||| |||||||||||    
T  32191629 ttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaattgtatgataaaatctaaatcaccagaatgctcatgctttcggatatgcaacgttggcgtccaaatca 32191728  T
Q  184 ttgcttgaatttgtaattga 203  Q
    ||| |||||| ||| |||||    
T  32191729 ttgattgaatatgtgattga 32191748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32802781 - 32802676
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  32802781 aaaacgtaaagggtgaatatgcgatcaaactcacagcacccaatttaatatcatacaacgataaaatacctacaaataatatgataaaatttaagtcacc 32802682  T
Q  140 aaaata 145  Q
     |||||    
T  32802681 gaaata 32802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8497220 - 8497129
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  8497220 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaaatat 8497129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 27097487 - 27097650
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||| ||  |||||| |||||  || ||||||||||||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||     
T  27097487 aacatcgttaaaaacgtaaaatgtgaatttgtgaacaaagtcacaatactcaagttaatagcatacgctggtaaaatgcctagagataatatgataaaat 27097586  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    ||||||||||||||||  |||| || || || |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  27097587 ctaaatcaccaaaatatccatgttttcggatttgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaat 27097650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32060133 - 32060030
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  32060133 acatcagatacaaacttcgctaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaacttacaacatccaatttaatagcataaaatgacaaaatgcctacaaata 32060034  T
Q  118 atat 121  Q
    ||||    
T  32060033 atat 32060030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 679353 - 679181
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||     
T  679353 aacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaac-gcaaaatgtttgcgaataatatgataaaat 679255  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    |||||||  || ||||  |||||||||  || |||||  ||| ||  |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  679254 ctaaatcgtcagaatattcatgcttccagatttgcaaagttggcgctcaaatcattgattgaatatgtgattga 679181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35001842 - 35001677
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  35001842 aacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 35001743  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatg-cttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  |||| | | || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  35001742 ttaaagtcaccggaatattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 35001677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4088712 - 4088613
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4088712 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatggcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4088613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Original strand, 23947147 - 23947297
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaa 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||    
T  23947147 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaatttaa 23947246  T
Q  134 a-tcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatc 182  Q
    | | |||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23947247 agtgaccagaatatccatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatc 23947297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10228923 - 10228766
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatc 136  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||    
T  10228923 taaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtc 10228824  T
Q  137 accaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10228823 accggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 10228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33110854 - 33110764
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  33110854 aaaaacgtaaaggatgaatatgcaaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 33110764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 7880927 - 7881012
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7880927 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 7881012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 8196232 - 8196317
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  8196232 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 8196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16419410 - 16419245
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  16419410 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacaatcaagttaatagcatatgacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 16419311  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacaca-tgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16419310 ttaaagtcaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 16419245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17335005 - 17334920
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17335005 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 17334920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25064488 - 25064403
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  25064488 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 25064403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 28634938 - 28635023
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28634938 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatcgcatataacggcataatgcctacaaa 28635023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 8027943 - 8028042
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  8027943 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacatcatcaaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 8028042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 12059598 - 12059697
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac-aaataatatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  12059598 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataattcctacaaaaaaatatgataaaa 12059697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12653196 - 12653097
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  12653196 aacaccgctaaaaacgtacaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaa 12653097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 17237111 - 17237210
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  17237111 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacacactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 17237210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 7875869 - 7875954
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  7875869 aacaccgctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatccaagttaatagcatataactgcataatgcctacaaa 7875954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 290
Target Start/End: Original strand, 24227696 - 24227837
Alignment:
Q  149 atgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaag 248  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||| | ||  ||||||| || |||    
T  24227696 atgcttcaggatctggaacgttgaggttcaaatcattgattgaaattgtaattgactgaagtcgatatttcaatatgaattaaatgaacaccgtgataag 24227795  T
Q  249 acgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||  ||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  24227796 acgtgaaatcaaacgccacacaacacaacaaacaacacaacg 24227837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 33740409 - 33740502
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  33740409 gctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaa 33740502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 289
Target Start/End: Original strand, 11321461 - 11321573
Alignment:
Q  177 caaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacga 276  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||  ||||| |||| |   || ||| |    
T  11321461 caaataattgattgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccacaacaagacgtgaaatcaaacgtcatgcaggacca 11321560  T
Q  277 cgaacaacacaac 289  Q
    |||||||||||||    
T  11321561 cgaacaacacaac 11321573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6957386 - 6957297
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6957386 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacaccca---------catacaacggcaaaatgcctacaaatcatgtgataaaa 6957297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 13546600 - 13546660
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaat 144  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  13546600 ttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaattctaagtcacctaaat 13546660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Original strand, 13546657 - 13546768
Alignment:
Q  178 aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| || || || |||||||||| |||| |  ||| |||||  | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13546657 aaatcattgattgagtctgtaattaat-gaagttgatctttcaaaatgatccaaacgaacactacaacaaggcgcaaaatcaaacgccgcataagacgac 13546755  T
Q  278 gaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||||    
T  13546756 gaacaacacaacg 13546768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 4984392 - 4984491
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||| || | |||||||||||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  4984392 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacatcatctaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4984491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34222958 - 34222886
Alignment:
Q  112 caaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcat---ctgcaacattgacgtccaaat 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  34222958 caaataatatgataaaatctaaatcgccagaatacacaggcttccggatctgctgcaactttgacgtccaaat 34222886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Original strand, 30879596 - 30879661
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||    
T  30879596 aacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacaaaataccaataaataatatgataaaa 30879661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4468804 - 4468711
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4468804 aacaccgctaaaagtgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcac------caagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4468711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32059930 - 32059894
Alignment:
Q  254 aaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32059930 aaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 32059894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20220906 - 20220863
Alignment:
Q  247 agacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20220906 agacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 20220863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22114890 - 22114847
Alignment:
Q  247 agacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22114890 agacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 22114847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22571574 - 22571457
Alignment:
Q  176 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt-caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac---gccgcacaa 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  ||| ||| |||||| |||  ||| ||||||   |||| |||||||||| |||   |||||||||    
T  22571574 ccaaatcattggttgaatttgtaatcgactgaagctgattttttcaatattaaccaaacgaacaccataacaaaacgcaaaatcaaacaacgccgcacaa 22571475  T
Q  272 gacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22571474 gacgacgaacaacacaac 22571457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Original strand, 16892648 - 16892726
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16892648 ctaaaaacgtaaatgatgattctgcgaacaaacttacgacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 16892726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 21507571 - 21507641
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  21507571 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 21507641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 19402582 - 19402639
Alignment:
Q  47 aaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  19402582 aaaggatgaatatgtgaacaaactcacagtatccatgttaatagcataaaacggcaaa 19402639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 1704028 - 1704072
Alignment:
Q  81 aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  1704028 aagttaatagcgtacaacgacaaaatgtctataaataatatgata 1704072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Original strand, 8046842 - 8046882
Alignment:
Q  88 tagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  8046842 tagcatacaacagcaaaatgcctaaagataatatgataaaa 8046882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22571616 - 22571576
Alignment:
Q  49 agggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaata 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  22571616 agggtgaatatgctaacaaactcacatcatccaagttaata 22571576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 128)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 7337496 - 7337768
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7337496 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacagccaagttaatagcatgcaacagcaaaatgcctacaaata 7337595  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7337596 atatgataaaaccaaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtgcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 7337695  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7337696 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacg 7337768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 35484224 - 35484496
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35484224 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcttacaaata 35484323  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35484324 atatgataaaaccgaaatcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 35484423  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35484424 tcaataggaattgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaagcaaatgacgcacaagacgacgaacaacacaacg 35484496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 45415817 - 45415545
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45415817 acatcatatacacatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaaattaatattatacaacggcaaaatgcctacaaata 45415718  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45415717 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgagtttgtaattgattgatgtagatctt 45415618  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  45415617 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaacaaaacg 45415545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14872898 - 14872629
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14872898 acatcacatacaaacatcgcagaagaagtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 14872799  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14872798 atatgataaaacctaagtcaccaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 14872699  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14872698 tcaata-gaactaaatgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 14872629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5984067 - 5983823
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5984067 taaagggtgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacataagtcaccgaaata 5983968  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    | |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5983967 cccatgcttccggatctgcagcgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaactaaacaaacaccgcgac 5983868  T
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5983867 aagacacgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 5983823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 21947451 - 21947720
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21947451 acatcatatacaaatatcgttaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataaaatacaacggcaaaatgcctacaaata 21947550  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21947551 atatgataaaacttaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 21947650  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  21947651 tcaataagaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgtccgagacgacgaacaacaca 21947720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44915898 - 44915626
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44915898 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagtcgatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 44915799  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| ||||   ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44915798 atatgataaaatctaagaaaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 44915699  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  44915698 tcaatatgaactaaacgaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaatgccgcacaatatgactaacatcacaacg 44915626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 10776296 - 10776566
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  10776296 atcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaattgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagaatacaacagcaaaatgcctacaaataaa 10776395  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10776396 atgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattggatttgtaattgactgatgtcgatctttc 10776495  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10776496 aaaaggaagtaaacgaacaccgcgacaagacgcacaatcaaacgccgcataagacgacgaacaacacaacg 10776566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32395256 - 32394985
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32395256 acatcaaatacaaacaccgttaaaaacgtaaagggtgaatc-gcgaacaaacttacagcacccaagttaatagcatacagcggcaaaatgcctataaata 32395158  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32395157 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgaatgatgtagatctt 32395058  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  32395057 tcaataggaactgaacaaacaccgcgataaaacgggaaatcaaacgttgcacaagacgatgagcaacacaacg 32394985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 34878111 - 34878383
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34878111 acatcagatggaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 34878210  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||   |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  34878211 atatgataaaacctaagtcactgaatatcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 34878310  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34878311 tcaataggaaattaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacg 34878383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Original strand, 7836637 - 7836901
Alignment:
Q  27 acaaacatcgctaaaaagg-taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7836637 acaaacatcgctaaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 7836736  T
Q  126 aaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatg 225  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| |||  || | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  7836737 aaacctaagtcaccgaaattcacatgcctccagatattcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcgatagg 7836836  T
Q  226 aactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7836837 aaataaacgaacgccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacg 7836901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3228528 - 3228259
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||   || ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3228528 acatcaaatataaacgtcgctaaaaacgtaaagagtgaaaccgcgaacaaacacacatcacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaata 3228429  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  3228428 atatgataaaacctaaatcatcgaaatatccatgatttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgtatttgtaattgactgatatcgatctt 3228329  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3228328 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacaca 3228259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 29738497 - 29738730
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  29738497 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggccaaatgccaataaata 29738596  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29738597 atatgataacacctaagtcactgaaatacacatgcttccggatttgcaacattgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 29738696  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     |||||  |||| |||||||| |||| |||||||    
T  29738697 ccaatagaaactaaacaaacatcgcggcaagacg 29738730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 49504428 - 49504634
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  49504428 acataagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaaaaata 49504527  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
     |||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49504528 ttatgttaaaacccaaatcaccgaaacactcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgtttgagtttgtaattgattgatgtagatctt 49504627  T
Q  218 tcaatat 224  Q
    |||||||    
T  49504628 tcaatat 49504634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 27579961 - 27580233
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||    
T  27579961 acatcatatacaaacaacgctaaaatgataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcttatgaata 27580060  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  27580061 atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgctttcgaatctgcaatgttgacgcccaaatcatttattgaatttgtaatttactgaagtcgatctt 27580160  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  27580161 tcaataggaactaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaatgccacacgatacgacgaacaacacaacg 27580233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 23291520 - 23291747
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  23291520 aacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatacctccaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatct 23291619  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
     |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| || ||||| |||    
T  23291620 tcaacgttgatgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagaagcgaaatcaaac 23291719  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||    
T  23291720 gtcgcacaagataatgaacaacacaacg 23291747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49627157 - 49626900
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||    
T  49627157 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataagatgatataatcta 49627058  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||    
T  49627057 aatcatcagaatactcttgcttctgcatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac-caa 49626959  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| |||||| |  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49626958 cgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 49626900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47133150 - 47132887
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  47133150 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 47133051  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||      
T  47133050 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaagc 47132951  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaat---ctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||| |||||||| ||||||||| ||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47132950 aaacgaacaccgcaacaagacgcgaaattaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacacaacg 47132887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1742546 - 1742268
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaata---gcat-----acaacggcaaaatgcc 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||    | ||     | ||| ||||||||||    
T  1742546 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaataaactcacatcacccaagttaatctgtgaatcactaaaaacagcaaaatgcc 1742447  T
Q  110 tacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1742446 tacaaataatatgataaaacctg--tcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgattgatg 1742349  T
Q  210 tagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      |||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1742348 ccgatctttcaataggaaataaacgaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacg 1742268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 13144652 - 13144917
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13144652 atacaaacatcgttaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaatattatgat 13144751  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||| |||| ||||  |||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||||    
T  13144752 aaaatctaagtcactgaaatactcatgctttcagatctgcaaaattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgattaaagtcggtctttcaatat 13144851  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||   ||  |||||  ||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||    
T  13144852 gaatcaaatgaacactacgacaagacgcgaaatcaaatgttgcacaagacaacagacaacacaacg 13144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24583194 - 24582937
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24583194 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 24583095  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||  | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||    
T  24583094 aatcaccagaatattcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac-caa 24582996  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| |||||| || |||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24582995 cgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaaggcgatgaacaacacaa 24582937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44543516 - 44543259
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  44543516 atcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 44543417  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||| | ||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | | |  |||||||||||||||||  ||    
T  44543416 aatcactagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactaaagctgatctttcaatatgaac-caa 44543318  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | |||||||| | |||| || |||||    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44543317 cgaacaccgcaataagatgccaaatcaaacaacgccgcataatacgacgaacaacacaa 44543259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31919248 - 31918994
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31919248 acatcatatacaaacttcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 31919149  T
Q  118 atatgataaaa-cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||   |||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  31919148 atatgataaaaccctaagtcactgaaattttcatgcttctggatctgcaacgttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatct 31919049  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaa 271  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31919048 ttcaacaggaactaaacgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaa 31918994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48750429 - 48750239
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48750429 atcgctaaaaacgtatagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 48750330  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||||||| ||||| |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||  ||| |  ||||||||||||    
T  48750329 aatcaccagaatacccatgcttatggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattaaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaata 48750239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 252
Target Start/End: Original strand, 35461898 - 35462116
Alignment:
Q  29 aaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgg-caaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||      |||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  35461898 aaacatcactaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatag------acggacaaaatacctattaataatatgataaa 35461991  T
Q  128 acctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||    
T  35461992 acttaagtcaccgaaatacacatgcttccggatctgcaacgttgacgtccgaatcattggtttaatttgtaattgactgatatagatctctcaagaggaa 35462091  T
Q  228 ctgaacaaacaccgcgacaagacgc 252  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  35462092 atgaacaaacaccgcgacaaaacgc 35462116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16989630 - 16989454
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16989630 acatcatatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtaaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 16989531  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatt 194  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||    
T  16989530 atatgataaaacctaagtcactgaaattcacatgattccggatcttcaaccttgacgctcaaattattggttgaatt 16989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4413373 - 4413210
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413373 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaattcacagcactcaatttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 4413274  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaat 181  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  4413273 atatgataaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 4413210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 290
Target Start/End: Original strand, 8211817 - 8212015
Alignment:
Q  91 catacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttg 190  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  8211817 catataacgacaaaatacctacaaataatatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgacg-ccagatcattggttg 8211915  T
Q  191 aatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8211916 aatttgtatttgactgatgtagatctttcaatagtaactaaatgaacatcgcgacaagacgtggaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaacacaacg 8212015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 36775558 - 36775753
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36775558 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 36775657  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||   |||| |||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  36775658 aatcaccgggatacccatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagccgatctttcaatacgaac 36775753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Original strand, 11462315 - 11462454
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11462315 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaattcctacaaata 11462414  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  11462415 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccg 11462454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31984420 - 31984247
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31984420 acatcaaatacacacattgttaaaaacgtaaagggtaaatctgcgaacaaagtcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttaaaaata 31984321  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  31984320 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattga 31984247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19061153 - 19060896
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  19061153 atcgctaaaaacataaaagatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 19061054  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | | |||| | |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||  ||    
T  19061053 aatcaccagaatactcttccttctggatctacaacattgatgtccaaattattgattgaacctgtgattgactgaagctaatctttcaatatgaac-caa 19060955  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    | ||||| || |||||| |  |||||    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19060954 cgaacactgcaacaagatgtcaaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacacaa 19060896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 202
Target Start/End: Original strand, 34412940 - 34413107
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34412940 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaaccgcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 34413039  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||  || |||| |||||||||| ||||    
T  34413040 aatcaccagaatacccatgcttctggatctacaacgttgacgtcc--attattgattgaatttgtgattg 34413107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45789787 - 45789539
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||      
T  45789787 aacatcgctaaaaatgtaaagggtgattttgagaacaaac-cacaacacccaagttaatagcatacaatgacaaaattcctacaaataatataataaatt 45789689  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||| |||   |||| |||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||| |||||||| ||||     
T  45789688 ctaagtcaaagaaatgcacatgcttccggatctacaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgattaaagttgatatttcaataggaacc 45789589  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacga 279  Q
     |||||||| ||| |||| ||| |||||| | ||| |||||||| |||||    
T  45789588 aaacaaacatcgcaacaacacgtaaaatcaagcgctgcacaagatgacga 45789539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 15431499 - 15431683
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  15431499 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtgaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 15431598  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||||||| |||  ||||  |||||   ||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15431599 atatgataaaatctatgtcactgaaatatcaatgctgccagatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 15431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 228
Target Start/End: Original strand, 37720004 - 37720192
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37720004 aaaacgtaaaaggtgaatttgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacagaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaataacc 37720103  T
Q  140 aaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    | ||||| |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  37720104 agaatacccatgcttttggatctgcaacgttgacgcccaaatcattaaatgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaac 37720192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31317983 - 31317821
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||      
T  31317983 aacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacatcacccaagttaataggatgcaacgataaaatgcctacaaataatatgataaatt 31317884  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaa 192  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  31317883 ctaaatcaccgaaatatccatgcttccgggtctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 31317821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21687004 - 21686860
Alignment:
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21687004 cacatgcttccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttttaattgagtgatgcctatctttcaataggaaattaacaaacaccgcgac 21686905  T
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21686904 aaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 21686860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24583390 - 24583278
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24583390 atcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatcta 24583291  T
Q  133 aatcaccaaaata 145  Q
    |||||||| ||||    
T  24583290 aatcaccagaata 24583278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18939552 - 18939373
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa-tgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaa 143  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  18939552 gtaaatggtgaatctgcgaacaaactcaaattatccaagttaatagcatacaacgacaaaaatgcctgcaaataatttgataaattctaagtcaccaaaa 18939453  T
Q  144 tacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  18939452 tacacatgcttccagatctgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatctgtaattgactgaagttgatctttcaata 18939373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 51373691 - 51373818
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  51373691 acattagatacaaacatcgataaaaacgtaaagggtgaatctccaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgacgacaaaatgcctacaaata 51373790  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  51373791 atatgataaaatataagtcaccgaaata 51373818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12635417 - 12635154
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| | | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  12635417 aacatcgctaaaaacataaaaggtgaatctccgaacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccttaaaaaaatatgataaaat 12635318  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||   || || ||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||| | | | || |||||||||||||||||     
T  12635317 ataaatcgccagaatacccatgcttcgtgatatgaaaggctgacgtgcaaatcattgattgaatttgtgatttactaaagttgatctttcaatatgaacc 12635218  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||  |||||| | |||| ||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635217 aaatgaacaccactacaaaacgtaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 12635154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 51916515 - 51916761
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||        ||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  51916515 atacaaacatcgctaaaaatgtaaatgatgaatttgggaacaaactcacaacacccaagtta--------caacgacaaaatgcatgcaaata-tatgat 51916605  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||| |||| |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||     
T  51916606 aaaatctaagtcacgaaa-tactcatgcttccgtatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtaattgactgacgt--ttctttcaatag 51916702  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  51916703 gaactaaacga--accgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgactaacaaca 51916761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16263087 - 16262880
Alignment:
Q  51 ggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacat 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  16263087 ggtgaatctgctaacaaactcacaacactcatgttaatagcataaaacggcaaaatgcatacgaataacatgataaaatctaaatcatcagaatactcat 16262988  T
Q  151 gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagac 250  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||| |||||| ||| ||||| ||  || ||| ||||||||||||   ||| |||||| | |||||||    
T  16262987 gcttccggatctgcaacgttgatgcacaaatcattgattgaatatgtgattgactgcagttgatttttcaatatgaatcaaacgaacaccacaacaagac 16262888  T
Q  251 gcaaaatc 258  Q
    || |||||    
T  16262887 gcgaaatc 16262880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21687637 - 21687522
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  21687637 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaaaggtgaatctgctaacaaactcacaacacccaaattaatagcataaaacgagaaaatgcctacaaata 21687538  T
Q  118 atatgataaaacctaa 133  Q
    ||||||||||||||||    
T  21687537 atatgataaaacctaa 21687522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 32678988 - 32679159
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  32678988 aacatcgctaaaaacgta--ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatggcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 32679085  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  32679086 ctaaatcaccataatactcatgcttccggatttgcaatgttggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 32679159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39888441 - 39888233
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |    
T  39888441 acatcagatacaaacatcactcaaaacgtaaagagtgaatctgcgaataaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgataaaatgcatataaaga 39888342  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||   |||   || |||| |||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  39888341 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacctgtgcgctcggatctacaacgtggacgcccaaatcattgattgaagttgtaattgactgaagtcgatctt 39888242  T
Q  218 tcaatatga 226  Q
    |||||||||    
T  39888241 tcaatatga 39888233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16162066 - 16161951
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16162066 aaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcag 16161967  T
Q  139 caaaatacacatgctt 154  Q
    || ||||| |||||||    
T  16161966 cagaatacccatgctt 16161951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14489519 - 14489403
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||     
T  14489519 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgctaataaactctcaatacccaagttaataacatacaacaacaaaatacctacaaataatatgataaaat 14489420  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatac 146  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14489419 ctaaatcaccagaatac 14489403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 19596293 - 19596405
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19596293 acattagatagaaatatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcgtagcatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 19596392  T
Q  118 atatgataaaacc 130  Q
    |||||||||||||    
T  19596393 atatgataaaacc 19596405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50377582 - 50377461
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |    
T  50377582 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaaattgcgaacaaactctcagcacccaagttaataacatacgacggaaaaatgcctacagaca 50377483  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  50377482 atatgataaaatctaagtcacc 50377461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27456646 - 27456527
Alignment:
Q  171 gacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcaca 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  27456646 gacgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcaca 27456547  T
Q  271 agacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  27456546 agatgactaacaacacaacg 27456527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 284
Target Start/End: Original strand, 31692312 - 31692568
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| || ||| || |||| || |||||||||||| |||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||     
T  31692312 aacatcgttaaaaatgttaagagtaaatacgcgaacaaactcacaacacccaagtcgatagtatacatcgacaaaatgcatacaaattatatgataaaat 31692411  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
      || |||||||||||  ||| ||| || |||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||| | | |   ||||||||||||||||     
T  31692412 aaaattcaccaaaatatgcatactttcggatctacaacattgacatcgaaatcattgattaaatttgttattgactaaagctaatctttcaatatgaac- 31692510  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaac 284  Q
     ||| |||||||| |||||| ||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  31692511 caacgaacaccgcaacaagaagcaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacaaacaac 31692568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9341923 - 9341716
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| | | ||||||| | |||||||||||    
T  9341923 caagttaatagtatacaacaacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaagtcaccagaatatacatgctcctgaatctgcatcgttgacgtccaa 9341824  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacga 276  Q
    | ||||| | |||| ||| |||||||||  | |||  || ||||||||   |||||||||||| ||||||| || ||||    ||||| |||||||||||    
T  9341823 aacattgatggaatatgtgattgattga-attgatagtttaatatgaatcaaacaaacaccgcaacaagacacagaatcaaacaacgctgcacaagacga 9341725  T
Q  277 cgaacaaca 285  Q
    |||||||||    
T  9341724 cgaacaaca 9341716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15492481 - 15492373
Alignment:
Q  83 gttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatc 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||    
T  15492481 gttaatagcatacaacggtaaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcaccataatatccatgctccaggatctgcaacactgacgcccaaatc 15492382  T
Q  183 attgcttga 191  Q
    |||| ||||    
T  15492381 attgattga 15492373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 285
Target Start/End: Original strand, 11462462 - 11462548
Alignment:
Q  199 attgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11462462 attgactgatgtagatcttccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 11462548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43412550 - 43412424
Alignment:
Q  101 caaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaat 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||  ||    
T  43412550 caaaatacctgcaaataatatgataaaatctagatcaccaaaatacgcatgcttctggatctgcaacgttgactttcaaatcattgattgaatatgcgat 43412451  T
Q  201 tgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43412450 tgattgaaatagatatttcaatatgaa 43412424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 50165924 - 50166089
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  50165924 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 50166023  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||| ||||| ||| || |||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  50166024 ttaaagtcaccagaatacccatggcctccggatctacaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 50166089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 6217717 - 6217866
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaat----acacatgcttccgcatctgcaacattgacg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||    || ||||||| |  || |||||  |||||     
T  6217717 ccaagttaatagcatacaacggtaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcacgaggatattcactcatgcttacagatatgcaatgttgaca 6217816  T
Q  175 tccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||    
T  6217817 tccaaatcattgattgaatttgtgattgactgaagttgatctttcaatat 6217866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 280
Target Start/End: Original strand, 36894262 - 36894365
Alignment:
Q  178 aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacg-ccgcacaagacga 276  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  36894262 aaattattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaagaggaactgaacaaaccccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgcccgcacaagacaa 36894361  T
Q  277 cgaa 280  Q
    ||||    
T  36894362 cgaa 36894365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 13075504 - 13075667
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13075504 atcgctaaaaaagtaaagggtgaatctgcgaaaaatctcacaaaacccaattta-tagcatacaaagggtaaatgcttacaaataatatgataaaatcta 13075602  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    |||||| | ||||| ||||  | || ||||||||| ||| |  | ||||||||| ||||||||||    
T  13075603 aatcactagaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgcctcctaaatcattgattgaatttgt 13075667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25564212 - 25564072
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||  |||||||||  ||||    
T  25564212 aacaaactcataggacccaagttaataacatacaacaacaaaatatctacaaacaatataataaaatataaatcaccagaataatcatgcttccagatct 25564113  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    ||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  25564112 gcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatctgtgattga 25564072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 25406109 - 25406208
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  25406109 aacaccgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 25406208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 51868470 - 51868569
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  51868470 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 51868569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51872119 - 51872020
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  51872119 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 51872020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 940460 - 940351
Alignment:
Q  179 aatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacg 278  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  |||||| || |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||     
T  940460 aatcattggttga-tttgtaattgacagatgtatatatttcaataggaattaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgaca 940362  T
Q  279 aacaacacaac 289  Q
    |||||||||||    
T  940361 aacaacacaac 940351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27456734 - 27456648
Alignment:
Q  27 acaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 113  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27456734 acaaacatcgttaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaca 27456648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7342978 - 7342813
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||| ||| | |||||||||||    
T  7342978 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacatcataatgcctataaaaatatatgataaaa 7342879  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgct-tccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  7342878 ttaaagtcaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 7342813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7998045 - 7997960
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  7998045 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaa 7997960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 31130418 - 31130503
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  31130418 aacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagaatataacgacataatgcctacaaa 31130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34529311 - 34529206
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  34529311 aaaacgtaaagattgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagtatacaacaaaaaaatgcctacaaataatgtgataaaatttaaatcacc 34529212  T
Q  140 aaaata 145  Q
    | ||||    
T  34529211 ataata 34529206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 50616520 - 50616652
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||| ||  | |||||||||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  50616520 aacattgctaaaaacgtaaaacgtgaatctgtgagcaaactcacaacatccaagtcattagcatgcaaaggcaaaatatctacaaataatatgataaaat 50616619  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  50616620 ttaaatcacaaaaatactcatgcttccgtatct 50616652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 50624347 - 50624479
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||| ||  | |||||||||| || |||||| | |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  50624347 aacattgctaaaaacgtaaaacgtgaatctgtgagcaaactcacaacatccaagtcattagcatgcaaaggcaaaatatctacaaataatatgataaaat 50624446  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  50624447 ttaaatcacaaaaatactcatgcttccgtatct 50624479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5701515 - 5701432
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 113  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5701515 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctaca 5701432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 9687030 - 9687129
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  9687030 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 9687129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41994595 - 41994411
Alignment:
Q  109 ctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgat 208  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| | | ||||| |||     
T  41994595 ctacaaataaaatgataaaatctaaatcaccagaatactcgttcttccggattagcaacgttgacgtccaaatcattgattaaatatttgattgactgaa 41994496  T
Q  209 gtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
       |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||  | |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41994495 actgatctttcaatatgaacgaaacgaacaccacaacaagatccgaaatcaaacaacgctgcacaagacgatgaacaacacaacg 41994411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50377417 - 50377315
Alignment:
Q  188 ttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||| ||||| || ||| || || |||||||||||||||    
T  50377417 ttgactttgtaattgactgatgtcgatctttcaatagggactaaacgtacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccacaaaaaacgacgaacaacaca 50377318  T
Q  288 acg 290  Q
    |||    
T  50377317 acg 50377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 19715720 - 19715805
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  19715720 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 19715805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31837090 - 31837005
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31837090 aacaccgctaaaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31837005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 50271965 - 50272050
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50271965 aacaccgctaaaaaggtaacggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 50272050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Original strand, 45425894 - 45425990
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  45425894 atcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaa 45425990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Original strand, 32873763 - 32873918
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatca 183  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| | || | | | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||   ||||||    
T  32873763 ttaatagcatacaatgacaatatgtctacaaataatatgataaaatcaaagtgatcgaaatacccatgtttctggatctgcaacattgacgcttaaatca 32873862  T
Q  184 ttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacac 239  Q
    ||| || ||| ||||||||| ||| || | || ||||||| ||||| ||| |||||    
T  32873863 ttgattaaatgtgtaattgactgaagtcggtcattcaataggaactaaacgaacac 32873918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 39927380 - 39927479
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  39927380 aacatcgctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaaattaataagatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 39927479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Original strand, 41081562 - 41081672
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatc 161  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||| |||    
T  41081562 aacaaactcacaacatccgagttaataacatataactgcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaaatgaccagaatacacatgcctccggatc 41081661  T
Q  162 tgcaacattga 172  Q
    |||||||||||    
T  41081662 tgcaacattga 41081672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9172746 - 9172581
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  9172746 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaa 9172647  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||   || || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9172646 ttaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 9172581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9180728 - 9180563
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  9180728 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaa 9180629  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||   || || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9180628 ttaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 9180563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9919639 - 9919566
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgc 108  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9919639 cgctaaaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgc 9919566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 38520360 - 38520445
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38520360 aacatcactaaaaacgtaaaggatgaatttgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaa 38520445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 50148626 - 50148541
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  50148626 aacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaacaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 50148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 194
Target Start/End: Original strand, 7311980 - 7312096
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtcc 177  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  || | ||| |||||| |||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  7311980 ccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccgaaatactcatgcaaccggatctgcaatgttgacgtcc 7312079  T
Q  178 aaatcattgcttgaatt 194  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  7312080 aaatctttgtttgaatt 7312096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 8211140 - 8211216
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | |||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8211140 acattagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagcgtgaatctacgaacaaactcacaacatccgagttaatagcata 8211216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19723562 - 19723470
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19723562 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 19723470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 203
Target Start/End: Original strand, 24597242 - 24597342
Alignment:
Q  103 aaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||   ||| | | || ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24597242 aaatgccaacaaataatattataaagtataagtaatcagaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttataattg 24597341  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  24597342 a 24597342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26535503 - 26535403
Alignment:
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    |||||| |||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  26535503 ataaaatctaagtcaccggaatactcatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattgatttaaattgtaatttattgatttcgatctttcaat 26535404  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  26535403 a 26535403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26535595 - 26535515
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaac 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26535595 acatcagatacaaacatagctaaaaacgtaaatgataaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaac 26535515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 5324384 - 5324482
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  5324384 aacatcgctaaaaacgtaaagcatgaatctgcgaacaa-ctcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 5324482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Original strand, 40163286 - 40163411
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcct-acaaataatatgat-aaa 127  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||  ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||| |||    
T  40163286 aacatcgctaaaacg-taaatggtgggtatgcgaacaaactcaca---cccaagttaatagcatacgatggcaaaatgcctaaaaaatattatgatgaaa 40163381  T
Q  128 acctaaatcaccaaaatacacatgcttccg 157  Q
    | ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  40163382 atctaaatcaccatattacccatgcttccg 40163411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 40880838 - 40880937
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  40880838 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgcatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 40880937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 48217687 - 48217608
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  48217687 gctaaaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaa 48217608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 290
Target Start/End: Original strand, 15434895 - 15434980
Alignment:
Q  205 tgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||| | ||| | ||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15434895 tgatgtcgatctttcaagaggaattaaatgaacatcacgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacagaacg 15434980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3871631 - 3871579
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3871631 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 3871579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5856106 - 5856058
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  5856106 caagttaatagcatacaacggcaaaatttctacaaataatatggtaaaa 5856058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11454193 - 11454129
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11454193 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 11454129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 11709539 - 11709631
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || | || |||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11709539 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaaattaatagcatatcacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 11709631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 27914932 - 27915014
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||   | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  27914932 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaat---cgaacaaactcacagcatccaaattaatagcatataacgacaaaatacctacaaa 27915014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 33291251 - 33291342
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  33291251 taaaaacgtaaatgatgaatctgctaacaaactcacagcatccaagttaacagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 33291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28035393 - 28035310
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  28035393 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgca--caaactcacaacatcaaagttaataacatataacggcataatgcctacaaa 28035310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34519379 - 34519285
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | || | || ||||| |||||| | |||||||||||    
T  34519379 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcaaataatgacataatgcatacaaaaatatatgataaaa 34519285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 40646931 - 40646845
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaa-ctcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  40646931 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaa 40646845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 45805662 - 45805818
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatc 136  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| | |||||||||||   || ||    
T  45805662 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaata-catataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtc 45805760  T
Q  137 accaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||  ||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  45805761 accggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaat 45805818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27872985 - 27872894
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  27872985 taaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaataacatataacggcataatgcttacaaaaatatatgataaaa 27872894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 28053585 - 28053660
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| |||||| ||||||| | || |||||| || | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28053585 tgaatttgcaaataaactcataacatccaagtaaagatcatacaacaataaaatgcctacaaataatatgataaaa 28053660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 123
Target Start/End: Original strand, 30712196 - 30712239
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatga 123  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  30712196 caagttaatagcatagaacaacaaaatgcctacaaataatatga 30712239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34528829 - 34528716
Alignment:
Q  178 aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagac 274  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||  || ||||||||  |||||| || |||||    ||| |||| ||||||    
T  34528829 aaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttgatctttcaatataaaccaaagaaacaccgaaacaagatgcgaaatcaaacaacaccgcgcaagac 34528730  T
Q  275 gacgaacaacacaa 288  Q
    ||||||||||||||    
T  34528729 gacgaacaacacaa 34528716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Original strand, 48365616 - 48365755
Alignment:
Q  55 aatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgct 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| || ||| |||||||| | |||||||||||   || | | |  |||||  |||||    
T  48365616 aatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacttataacgacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaatacttatgct 48365715  T
Q  154 tccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
     ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  48365716 cccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaat 48365755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 50730870 - 50730795
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa 105  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  50730870 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatatgtgaacaaactcacagcactcgaattcatagtatacaacgacaaaa 50730795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15836223 - 15836181
Alignment:
Q  246 aagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15836223 aagacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacacaa 15836181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41740589 - 41740507
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  41740589 aacaaactaacaacatctaagttaataacatacaacggaagaatgcttataaataatatgataaaatataagtcatcaaaata 41740507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 49648744 - 49648818
Alignment:
Q  54 gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  49648744 gaatatgtgaacaaactcacatcacccaaattaataacatacaataacaaaatgtttacaaataatataataaaa 49648818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1602224 - 1602163
Alignment:
Q  142 aatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1602224 aatacacgtgcttccggatatgcaacattgatgcctaaatcattgattgaaattgtaattga 1602163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4397165 - 4397116
Alignment:
Q  79 ccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4397165 ccaagttaataacatacagtgacaaaatacctacaaataatatgataaaa 4397116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 18569136 - 18569221
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||| ||||||||  |||||  ||||| ||| || ||||||||| || |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  18569136 aacattgctaaaaacataaagcttgaatttgcgaataaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaa 18569221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34479661 - 34479589
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaa 103  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  34479661 aacatcactaaaaacgtaa-gagtgaatctgggaacaaactcacaacacttaagttaatagcatacaacggcaa 34479589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39987593 - 39987480
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||  |||||||||||   || | |||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  39987593 caagttaatagcatataacagcataatgcctataaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgcccaa 39987494  T
Q  180 atcattgcttgaat 193  Q
     || ||| ||||||    
T  39987493 ttctttgattgaat 39987480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 42276730 - 42276689
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  42276730 aacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 42276689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5601012 - 5600924
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||||| ||| ||||||||||||  | |||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  5601012 aacattgctaaaaatgtaaataatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaaataaataacatacaacgataaaatgcctacaaataa 5600924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 288
Target Start/End: Original strand, 34413172 - 34413200
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34413172 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 34413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 35584457 - 35584505
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaat 88  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35584457 aaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaat 35584505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 120)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1421941 - 1421675
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1421941 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagg-tgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 1421843  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1421842 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 1421743  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1421742 tcaatagaaactggacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaaca 1421675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 7677709 - 7677979
Alignment:
Q  20 atcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7677709 atcagatataaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaacttgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaataat 7677808  T
Q  120 atgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7677809 atgataaaacctaattcacggaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 7677908  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7677909 aataggaactgaacaaacaccgagataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 7677979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31788722 - 31788451
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31788722 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31788623  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31788622 atatgttaaaacctaagtcactgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctt 31788523  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31788522 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagatgc-aaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacaaaacg 31788451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 33585569 - 33585827
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33585569 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 33585668  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33585669 atatgataaaacttaaatcaccgaattactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgaggtagatttt 33585768  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacga 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  33585769 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgtaatcaaacgccacacaagacga 33585827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4779019 - 4778747
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4779019 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 4778920  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4778919 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 4778820  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4778819 tcaagaggaattgaataaacaccgcgagaaaacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaataacacaacg 4778747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 38445432 - 38445160
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38445432 acatcagatacaaacattgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcaccaaagttaataacatacaatggcaaaatgcctacaaata 38445333  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38445332 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccacgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatttactgatgtagatctt 38445233  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38445232 tcaataggaactgaacaaacaccgcgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38445160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18763734 - 18763463
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18763734 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 18763635  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18763634 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgtaacgttgacgcccaaatgattggttgaatttgtaattgattgatgccgatctt 18763535  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763534 tcaataggaactaaacgaacaccgtgataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 18763463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 27097241 - 27097512
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27097241 acatcaaatacaaatatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagtatacaacggcaaaattcctacaaata 27097340  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27097341 atatgataaaacttaagtcaccgaaatac-catgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 27097439  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27097440 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaaggtgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 27097512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33923971 - 33923704
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  33923971 acatcagatacaaaaatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacgacaaaacgcctgcaaata 33923872  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33923871 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 33923772  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33923771 tcaataggaaataaacaaacaccacgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 33923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 5427703 - 5427974
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  5427703 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgataaaatgcttgcaaata 5427802  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5427803 atatgataaaacctaagtcactgaaatacacatacttccggatctgcaacgttgacgcacaagtcattggttgaatttgt-attgactgatgtagatctt 5427901  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5427902 ccaatatgaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacaaaacg 5427974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7646744 - 7646467
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646744 acatcaaatataaagatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 7646645  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtcc-----aaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtag 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7646644 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtag 7646545  T
Q  213 atctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7646544 atctttcaaaaagaattgaacaaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacataacg 7646467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1415823 - 1415551
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1415823 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgttaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattaaacggtaaaatgcctacaaata 1415724  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  1415723 atctgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 1415624  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1415623 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgaagaacaacacaacg 1415551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 37876440 - 37876712
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37876440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaatctgcgaacaaactcgcatcacccaagttaatagcatacgacggcaaaatgcctacaaata 37876539  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37876540 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 37876639  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37876640 ccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 37876712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 36942956 - 36943227
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36942956 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacatactcacagcacccagattaatagcataca-cggcataatgcctacaaata 36943054  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||   || ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||    
T  36943055 atatgataaaattcaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaatcgactaatgtagatctt 36943154  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36943155 tcaattggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 36943227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 9169092 - 9169364
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggt-gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169092 catcagataaaaacatcactaaaaacgtaaagggttgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 9169191  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9169192 atatgataagacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattcgttgaatttgtaattcactgatgtagatctt 9169291  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | |||| ||||||||| |||| ||| |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9169292 tcaagaggaaccgaacaaacatcgcggcaaaacgtgaaatcaaacgacgcacaagacaacgaacaacacaacg 9169364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Original strand, 19062187 - 19062458
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaat-----a 117  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  19062187 agatacaaacat-gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaattaaata 19062285  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19062286 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgaaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtagatctt 19062385  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| | ||| ||||||||||| | |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19062386 tcaacaggaattgaacaaacactgtgacaagacgtgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 19062458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 4041428 - 4041700
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4041428 acatcagatacaaaaatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaacagcaaaatggctacaaata 4041527  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||| ||||| | | | |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  4041528 atatgataaagcctaagttatcgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgagtttgcaattgactaatgtaaatctt 4041627  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4041628 tcaataggaaccgaacaaacaccatgacaagatgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacg 4041700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36692140 - 36691868
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36692140 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacaaccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 36692041  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  36692040 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgctttaggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgaccgatgtcaatctt 36691941  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||| ||  |||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||    
T  36691940 tcagtagaaactaaacgaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgtcgcactaaacgatgaacaacaaaacg 36691868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Original strand, 31210507 - 31210713
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatca 183  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  31210507 ttaatagcataatccggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgctttctgatctgcaacgttgacgtccaaatca 31210606  T
Q  184 ttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  31210607 ttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaataggaactgaacaaacaccacgataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacaacaaacaa 31210706  T
Q  284 cacaacg 290  Q
    |||||||    
T  31210707 cacaacg 31210713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 25508902 - 25509174
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25508902 acatcatatacaaacatcggtaaaaacataaacgatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 25509001  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||| ||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| || |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25509002 atacgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgtttccggatttgcaacgttgacgcccagatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 25509101  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25509102 tcaatgggaactaaacgaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgtcgcacaagacgaataacaacacaacg 25509174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 4903979 - 4904251
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4903979 acatcaaatataaatattgctaaaaacgtaaaggctgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 4904078  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4904079 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttctggatctgcaacgttgacacccaaatcatcagttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 4904178  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4904179 tcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacacaaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacg 4904251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 11985067 - 11985334
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11985067 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaacatccaagttaataggatacaacagcaaaatgcctacaaata 11985166  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||| | ||||||||| |||||  | ||||||||| |||| |||||||||||    ||| | ||||    
T  11985167 atatgataaaacctaagtcactgaaatactcattcttctggatctgcaacgttgacacctaaatcattggttgagtttgtaattga---ctgtcgctctt 11985263  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11985264 tcaataggaactaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacaaacaacacaa 11985334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 290
Target Start/End: Original strand, 43396970 - 43397225
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43396970 cgctaaaaacgtaaagggtgaatctggaa-caaactaacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcgtacaaataatatgataaaacctaag 43397068  T
Q  135 tcaccaaaatacacatgcttccgcatctgc-aacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaac 233  Q
    ||||  |||| |||||||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  | |||  |||||||||||||||| | |||    
T  43397069 tcactgaaattcacatgcttccggatcttcaaacgttgacgcccaaatcattggttgaattcgtagttggctaatgccgatctttcaatatgaaataaac 43397168  T
Q  234 aaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43397169 gaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 43397225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10929916 - 10929656
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  10929916 atcgctaaaaacataaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagcattcaacaacaaaatgcctataaataatatgataaaattta 10929817  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  ||| |||||| ||||||  ||    
T  10929816 aatcaccagaatacacatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatttttcaacatgaaccaaa 10929717  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc----taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||     |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10929716 cgaacaccgcaacaagacgctaaatcaaaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacacaac 10929656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 30399863 - 30400139
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30399863 acatcagatataaatatcgcaaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacacctaagttaatgacatacgacggcaaaatgcctacaaata 30399962  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaa------tacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgta 211  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||      ||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  30399963 atatgataaaatctaagtcactaaaaatcaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgaagtt 30400062  T
Q  212 gatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  30400063 gatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgacacgatgcaaaatcaaatgccgcacaagacgaagaacaacacaa 30400139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Original strand, 17248996 - 17249253
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  17248996 atcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatataatcta 17249095  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||    |||||||||||||||||  ||    
T  17249096 aatcaccagaatactcttgcttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaaactgatctttcaatatgaac-caa 17249194  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatcta---acgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    |||||||||| |||||| || ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17249195 caaacaccgcaacaagatgccaaataaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 17249253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 29279404 - 29279676
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29279404 acatcaaatacagacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacaccatagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 29279503  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |    
T  29279504 atatgataaaatttaagtcaccgaaaaactcatgtttccggatctgcaacattgacgcacaaatcattgattgaatttgtaatcgactgatgttgatcat 29279603  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||   ||||| ||| || ||||||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  29279604 tcaacgggaactaaactaataccgcgacaagacacgaaatcaaatgtcgcccaagacgactaccaacacaacg 29279676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35220594 - 35220324
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35220594 acatcagatacaaagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 35220495  T
Q  118 -atatgat--aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagat 214  Q
       ||| |  || |  ||| ||||  |||||| |||||||    ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  35220494 cccatgcttcaagatttaagtcacagaaatacccatgctttaagatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaatggactgatgttgat 35220395  T
Q  215 ctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35220394 ctttcaataggaactaaatgaacaccgtgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaaca 35220324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 12677285 - 12677489
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  12677285 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaataaactcataatacccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacaa-ta 12677383  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  12677384 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgacttatgccgatctt 12677483  T
Q  218 tcaata 223  Q
    ||||||    
T  12677484 tcaata 12677489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 290
Target Start/End: Original strand, 31128624 - 31128886
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  31128624 agatacaaatatcactaaaaatgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatat-----aacggcaaaatgcctacaaataatatg 31128718  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    ||||||  ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  31128719 ataaaatataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgatatcgatttttcaat 31128818  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31128819 aggaactaaacgaacaccgcgacaagaagcggaatcaaacgccacacaagacgactaacaacacaacg 31128886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Original strand, 29173551 - 29173793
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca---a 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||   |    
T  29173551 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaataacatacaacaacaaaatgcatacaaata 29173650  T
Q  115 ataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagat 214  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||     
T  29173651 ataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacacccaaataattgattgaatttgtaattga-tgatgtcgag 29173749  T
Q  215 ctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  29173750 ctttcaataggaactaaacgaacactgcgataagacgcaaaatc 29173793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7448421 - 7448241
Alignment:
Q  110 tacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  7448421 tacaaataatatgataaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatatgtaattgactgatg 7448322  T
Q  210 tagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7448321 tagatctttcaagaggcactgaacaaacatcgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 7448241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8809540 - 8809278
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| | || || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  8809540 agatacaaacatcactaaaaacgtaaaagatggatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacta-taatatg 8809442  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaat 222  Q
    |||||| |||| ||||  |||| | |||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8809441 ataaaatctaagtcactgaaattctcatgcttccggatctgcaatgttggcgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatctttcaat 8809342  T
Q  223 atgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacac 286  Q
    | |||||   | |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  8809341 aggaactatgcgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaattgccgcacaagacgactaacaacac 8809278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 10237065 - 10237260
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10237065 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatcta 10237164  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  10237165 aatcatcagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaac 10237260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24461697 - 24461470
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||     
T  24461697 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaaatatgatgaaat 24461598  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||  |||| ||| || |||||||||||||||||     
T  24461597 ctaaatcaccaaaatactaatgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaatcatcgattgaatctgtggttgactgaagttgatctttcaatatgaacc 24461498  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaat 257  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24461497 aaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaat 24461470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 19028754 - 19029020
Alignment:
Q  24 gatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatga 123  Q
    |||||||| || | |||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19028754 gatacaaatattgttaaaaatgtaaaaggtgaatttgcgaacaatctcacaacactcaagttaatagcataaaacgaaaaaatgcctacaaatagtatga 19028853  T
Q  124 taaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    ||||| |||| | ||| |||||  |||||||| | || |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  19028854 taaaatctaagttaccgaaatatccatgcttctggatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtacttgactgaagtcgatctttcaata 19028953  T
Q  224 tgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19028954 ggaactaaatgaacaccgagacaagacgcgaaatcaaatgccgcacatgacgacgaataacacaacg 19029020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 288
Target Start/End: Original strand, 32448495 - 32448725
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat---aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgca 159  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||| ||||| | |||||| | |    
T  32448495 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataataatctaaatcaccagaatactcttgcttctgga 32448594  T
Q  160 tctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc- 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| || |||||     
T  32448595 tctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac-caacgaacaccgcaacaagatgccaaatca 32448693  T
Q  259 --taacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
       |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32448694 aacaacggcgcacaagacgacgaacaacacaa 32448725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3309196 - 3309006
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||    
T  3309196 atcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgactacaaataatatgatgaaatata 3309097  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||| ||||||||    
T  3309096 aatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttaacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatatttcaata 3309006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4100594 - 4100417
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4100594 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc-aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 4100496  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtag 212  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4100495 aaaacttaagtcaccgaaatac-catgcttccggatc--------tgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtag 4100417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 290
Target Start/End: Original strand, 12554036 - 12554287
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12554036 aaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatatcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagttac 12554135  T
Q  139 caaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaaca 238  Q
      |||||| |||||||||  || |||||  |  ||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||   ||| ||||    
T  12554136 tgaaatactcatgcttccaaatatgcaatgtccacacccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaagttgatatttcaatatgaatcaaacgaaca 12554235  T
Q  239 ccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| || |||| ||||||  || | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  12554236 ccgcaactagacacaaaattaaatgtcgcacaaggtgacggacaacacaacg 12554287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 28871634 - 28871873
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||      
T  28871634 aacattgctaaaaatataaagggtgaatccacgaacaaactcacagcatccaagttaatagtatacaacggcaaaatgcttacgattagtatgataaatt 28871733  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     | | |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| | |||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||     
T  28871734 ttgagtcactaaaatatacatgattctgaatctgcaacgtcgacgcctaaatcattggttgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaataggaacc 28871833  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcac 269  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28871834 aaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcac 28871873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Original strand, 17994560 - 17994743
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcataca----acggcaaaatgcctaca 113  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||    
T  17994560 acatcagatactaacatcgctacaaacgtaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacatacaatggcaaaatgcctaca 17994659  T
Q  114 aataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17994660 aataatatgataaaatttaagtcaccgaaatacctatggttccggatgtgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgt 17994743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17151675 - 17151430
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  | |    
T  17151675 atcgttaaaaacgtaaagggtgaatatgcggacaaactcacaacattcaagttaatagcatacaacaacaaaatacctactaataatatgataaattcca 17151576  T
Q  133 aatcaccaaaatacac-atgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactga 231  Q
    | ||||| |||||| | ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||| |||   |    
T  17151575 agtcaccgaaatacccaatgcttccggatctacaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaaattgatctttcaataggaatcaa 17151476  T
Q  232 acaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgac 277  Q
    || |||||||  |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17151475 acgaacaccgtaacaagatgcgaaatcaaacgctgcacaagacgac 17151430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 33760039 - 33760236
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  33760039 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgagtctgtaaacaaactaacagcacacaagttaatagcttacaacagcaaaatgcctacaaataatatgataagtt 33760138  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaa 227  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| | | ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  33760139 ctaagtcactgaaatacacatgtttatggatctgcaacatcgacgctcaaatcattgattgagtctataattgactgaagttgatctttcaatatgaa 33760236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37994538 - 37994371
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||| ||||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37994538 aacatccctaaaatcgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaat 37994439  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgt 197  Q
    ||||||||||  ||||  | | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37994438 ctaaatcaccggaatattctttcttccggatctgcaacgctgacgtccaaatcattcattgaatttgt 37994371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 256
Target Start/End: Original strand, 19595775 - 19595975
Alignment:
Q  59 tgcaaacaaactcacagcacccaagttaat---agcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttc 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  19595775 tgcaaacaaactcacagcatccaagttaataatagcatacaaaggcaaaatacctacaaataatatgataaaatcaaaatcatcaaaatattcatgcttc 19595874  T
Q  156 cgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaa 255  Q
    |  ||| ||||  |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||| | |  |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  19595875 cagatcggcaattttgacgcccaaatcatttattgaatttatgattgattaaagctgatctttcaataagaactaaacaaacatcgcaacaagacacaaa 19595974  T
Q  256 a 256  Q
    |    
T  19595975 a 19595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 290
Target Start/End: Original strand, 42698676 - 42698807
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42698676 atctgcaacgctgacgtccaaatcactgattgaatttgtaattcactgatgtcgatctttcaatagaaactaaacaaacattgcgacaagacgcaaaatc 42698775  T
Q  259 taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42698776 aaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 42698807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14955780 - 14955618
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14955780 atcgctaaaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaataacatacaatgataaaatgtctacaaataatatgataaaatcta 14955681  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaattt 195  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14955680 aatcatcagaatacacatgtttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaattt 14955618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 285
Target Start/End: Original strand, 18107603 - 18107848
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatc 136  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  18107603 ctaaaaacgtaaagagtgaatatgcgaacaaactcacaacacgcaagttaataatataaaacgacaaaatgcctacaaataatatgattaattctaagtc 18107702  T
Q  137 accaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaa 236  Q
    | | ||||||||||||||| | |||||    |||||||   ||||  ||  |||||| ||| ||||| ||| ||  |||| |||||||||||  ||| ||    
T  18107703 atcgaaatacacatgcttctggatctg---tattgacgcataaattgttaattgaatctgtgattgagtgaggtttatctctcaatatgaaccaaacgaa 18107799  T
Q  237 caccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18107800 caccgcagcatgacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 18107848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 255
Target Start/End: Original strand, 23933512 - 23933690
Alignment:
Q  77 acccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||  || || ||| ||||||||    
T  23933512 acccaagttaatagcttacaacggcaaaattcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagattatccatgcttccagatatgtaacgttgacgtc 23933611  T
Q  177 caaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaa 255  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||||| ||| || || ||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||| |||||    
T  23933612 caaataattgattgaatctgtgattgactgaagttgaactttcaataagaaccaaacgaacaccgcaacaagatgcaaa 23933690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Original strand, 29574507 - 29574737
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||    
T  29574507 aacaaactcacaacgtccaaattaatagcatataatgacaaaatgactacaaaaaatatgatgaaatctaaatcatcataatattcatgcttccggatct 29574606  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |   |||||||||||||||   ||||||||| || |||| | |  ||||| |||    
T  29574607 gcaacgttggcgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctaatctttcaatatgaatcaaacaaacactgcaacaaaatgtgaaatcaaac 29574706  T
Q  263 ---gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29574707 aatgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 29574737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 39310703 - 39310957
Alignment:
Q  21 tcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataata 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||||||||    
T  39310703 tcagatacaaacatcattaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcat-------------gcctacaaataata 39310789  T
Q  121 tgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttca 220  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||| ||||| || | || |||||  |||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||  |    
T  39310790 tgataaaatctaagtcactgaaatacccatgcctcgg-atgtgcaatgttgatgcccaaatcaatgattgaatttgtaattgactgaagtcgatcttcaa 39310888  T
Q  221 atatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39310889 ataggaactaaacaaataccgcgataaggcgcgaaatcaaacgctgcacaagacgaagaacaacacaac 39310957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14423583 - 14423367
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata----caacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14423583 aacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaataaactcaaaacacccaagttaataacatatatacaacggcaaaatgcctaaatataatatgata 14423484  T
Q  126 aaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatg 225  Q
    ||| |||| | ||| |||||| |||| |||   || |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | | || |||||||||||| |    
T  14423483 aaatctaactaacctaaatacccatgtttctagatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattaaatctgtaattgactaaagtcgatctttcaataag 14423384  T
Q  226 aactgaacaaacaccgc 242  Q
    |||  ||||||||||||    
T  14423383 aaccaaacaaacaccgc 14423367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Original strand, 34128533 - 34128788
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaccta 132  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  34128533 atcgcaaaaaatgtaaagggtgaatctgcaaacaacctcacaatatccaagttaataacatactgcgacaaaatgcctataaataatatgataaaatcca 34128632  T
Q  133 aatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaa 232  Q
    | | | | |||||| || | || |  || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| || | | || ||||||| |||| ||||  ||    
T  34128633 agtaatcgaaatacccaagatttcagatatgcaacattgacgcccaaataattgattgaatttataatcgactaaagtcgatcttttaataggaaccaaa 34128732  T
Q  233 caaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||    
T  34128733 caaacaccacaacaagacgcacaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaaca 34128788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37416943 - 37416766
Alignment:
Q  51 ggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacat 150  Q
    ||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  37416943 ggtgaatgtgcgaacaaacttataacacccaagttaacaacatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgataaaatataaatcactagaatacacat 37416844  T
Q  151 gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||||   ||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |   || ||| |||||||||||||    
T  37416843 gcttccgggcctgcaatgttgacatccaaatcattgattgaatctgtgattgactcgagttgatatttcaatatgaac 37416766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41694874 - 41694703
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||| | | |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41694874 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgtgaacaaacttaaa-caccaaagttaataacatataacgacaaaatgcctataaataatatgataaaat 41694776  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattg 202  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41694775 ctaagtcaccagaatctacatgcttctgcatctgcaacgttgatgcccaaatcattgattgaatatgtaattg 41694703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16376185 - 16376030
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16376185 taaaaatgtagacggtgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatcgcatacaacaccaaaatgactacaaataatatgataaaatttaaatca 16376086  T
Q  138 ccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
     || |||||||||||||  | ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  16376085 tcataatacacatgcttttgaatctgcaactttgacgccgaaatcattgattgaat 16376030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4264664 - 4264467
Alignment:
Q  92 atacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttga 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||| | |||||| |||||||||  || || |||||||||  | ||||||||| || |    
T  4264664 atacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaatttgaagtcatcgaaatacccatgcttccagatttggaacattgactcctaaatcattgattaa 4264565  T
Q  192 atttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    || ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4264564 atctgtaattgactgaagttgatctttcaataagaaccaaatgaacaccgcaataagacgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacgaacaacgcaac 4264467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4099180 - 4099097
Alignment:
Q  207 atgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4099180 atgtagatctttcaataggaactgaacaaacaccacgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacg 4099097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6436811 - 6436609
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaa 179  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||| | | ||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  6436811 caagttaaaaacataaaacggtaaaatacctacaagtaatatgataaaatttaaaccactagattactcatgtttcaggatctgtaacattgacgtccaa 6436712  T
Q  180 atcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacga 279  Q
    ||||||| |||||| | | ||||| ||| |  ||||||||| |||||||   || |||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6436711 atcattgattgaatatttgattgactgaagctgatctttcattatgaaccagacgaacaccgtaacaagatgcaaaatcaaacgtcgcacaagacgacga 6436612  T
Q  280 aca 282  Q
    |||    
T  6436611 aca 6436609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 228
Target Start/End: Original strand, 12647004 - 12647153
Alignment:
Q  76 cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgt 175  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||    
T  12647004 cacccaagttaatagcatctaacagcaaaatgcctacaaaaaatatga---aatctaaatcaccaaaatattcatgcttccggatctacaacattggcgt 12647100  T
Q  176 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    |||||| || | |||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  12647101 ccaaatgatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaac 12647153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 290
Target Start/End: Original strand, 6358763 - 6358982
Alignment:
Q  66 aaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgca 165  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||           || ||||    
T  6358763 aaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatacgtacaaataatatgataaaatctaaatcaccataataca----------tatttgca 6358852  T
Q  166 acattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccg--cgacaagacgcaaaatc---ta 260  Q
    || |||||| |||||| || | |||||||||| | ||  ||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||  | |||||| || |||||    |    
T  6358853 acgttgacgcccaaattatagattgaatttgtgactgtctgaagttgatctttcaataagaaccaaacaaacaccgtacaacaagatgcgaaatcaaaca 6358952  T
Q  261 acgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6358953 acgctgcacaagacgacgaacaacacaacg 6358982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Original strand, 28533800 - 28533909
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  28533800 aacatcgttaaaaacgtaaaaggtggatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaat 28533899  T
Q  130 ctaaatcacc 139  Q
    | ||||||||    
T  28533900 ccaaatcacc 28533909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8806122 - 8806023
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8806122 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaatatatgataaaa 8806023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 281042 - 280977
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  281042 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa 280977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 84006 - 84105
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctac-aaataatatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  84006 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaa 84105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 8971453 - 8971552
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  8971453 aacaccgctaagaatgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaa 8971552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19598068 - 19597984
Alignment:
Q  55 aatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacca 140  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19598068 aatatgcgaacaaattcacaacactcaagttaatagcatacaacggtaaaatgtctacaaataatatgat-aaatctaaatcacca 19597984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4228379 - 4228280
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  4228379 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4228280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 9986167 - 9986266
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  9986167 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 9986266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 21570233 - 21570332
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  21570233 aacaccgctaaaaacataaaggctgaatctgcgaacaaacttacagcattcaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 21570332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41327977 - 41327898
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 125  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41327977 taaagggtagatatgcgaataaactcacatcacctaagttaatagcatacaatgccaaaatgcctacaaataatatgata 41327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 31193170 - 31193244
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagca 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31193170 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaatttaacagca 31193244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 7015542 - 7015635
Alignment:
Q  36 gctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||| |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7015542 gctaaaaacgtaacgaatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 7015635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 27248976 - 27249061
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  27248976 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaa 27249061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 31580485 - 31580565
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31580485 cgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31580565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Original strand, 36175481 - 36175577
Alignment:
Q  169 ttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgcc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  36175481 ttgacgtccaaatcattgattgaatatgtaattgtttgatgttgatctttcaatagaaaccaaacgaacaccgcaacaagacgcggaatcaaacgcc 36175577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 2808298 - 2808396
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  2808298 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaa-ctcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 2808396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21612493 - 21612360
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaat--atgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||  ||| | | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||    
T  21612493 aacatcgctaaaaacgtaaagggtaaatctatgaacaaaaactcatatgacccaagttaatagcatacaacgacaaatttc-tacaaacaatatgataaa 21612395  T
Q  128 acctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    |  |||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  21612394 atataaatcaccagaatacttatgcttccggatct 21612360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34600470 - 34600371
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  34600470 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcgcatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 34600371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 40659757 - 40659840
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 113  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  40659757 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatggctaca 40659840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 20046907 - 20047072
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  20046907 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacagcatccaagttaataagatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 20047006  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
       || |||||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  20047007 ttaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgtccaaatctttgattgaat 20047072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 22538162 - 22538290
Alignment:
Q  39 aaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcac 138  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22538162 aaaaacgtaaagagtgaatttgcaaagaaacgcacatcgctcaagttaatagcatgcaacgacaaaatatttacaaataatatgataaaatttaagtcac 22538261  T
Q  139 caaaatacacatgcttccgcatctgcaac 167  Q
      |||||  |||||||||  |||||||||    
T  22538262 agaaatattcatgcttccatatctgcaac 22538290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30420925 - 30420853
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggca 102  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  30420925 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 30420853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11833602 - 11833503
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| || || |||||||||| | || | ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11833602 atctgcaacgttgatgtccagatcattgatttaacttgtaattgacttatatcgatctcttaatatgaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatc 11833503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41431284 - 41431185
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| || ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  41431284 aacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 41431185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4193088 - 4192994
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | | |||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4193088 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctccgaacacactcacagtatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4192994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18114107 - 18114025
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18114107 taaagggtaaatatgcgaacaaactcacataatccaagttaataatatacagcggcaaaatgtctaaaagtaatatgataaaa 18114025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25087282 - 25087196
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  25087282 aaaacgtaaaggatgaatctgggaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcttaatgcctacaaaatatatgataa 25087196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32190902 - 32190820
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32190902 taaatggtgaatctgcaaataaactcacaacatttaagttaatagcatacaatagaaaaatgcttacaaataatatgataaaa 32190820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41327618 - 41327564
Alignment:
Q  169 ttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaata 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  41327618 ttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgaaatagatctttcaata 41327564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 3268684 - 3268745
Alignment:
Q  54 gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  3268684 gaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaataccatataaaggcataatgcctacaaa 3268745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Original strand, 32678941 - 32679100
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaa 133  Q
    |||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   ||    
T  32678941 cgctaaaaacataaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatc-aagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaa 32679039  T
Q  134 atcaccaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
     |||||  ||||   || || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  32679040 gtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 32679100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32913481 - 32913397
Alignment:
Q  45 gtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||    
T  32913481 gtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcatacaaaaatatatgataaaa 32913397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27949682 - 27949583
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||    
T  27949682 aacaccgctaaaaacgtaaatgatgaatctccgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgtcataatgtctataaaaatatatgataaaa 27949583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 10548409 - 10548343
Alignment:
Q  62 aaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  10548409 aaacaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaatgcctataaataatttgagaaaa 10548343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 32445367 - 32445457
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  32445367 taaaaacgtaaatgatgaatatgccaacaaactcactacatccaagttaataacatataactgcaaaactcttacaaataataagataaaa 32445457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 38575326 - 38575395
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  38575326 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaa 38575395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 42698558 - 42698661
Alignment:
Q  21 tcagatacaaacatcgctaaaaaggta---aagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||   || ||| ||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  42698558 tcagatacaaacatcgtaaaaaacgtacgtaaaggtaaatctgcgaataaattcacagcacccaaattaataacatgcaacggtataatgcctacaaata 42698657  T
Q  118 atat 121  Q
    ||||    
T  42698658 atat 42698661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 18056331 - 18056403
Alignment:
Q  54 gaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataa 126  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||| | ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  18056331 gaatatgcaaacaaactcataacatctaagttaacaacatacaatgacaaaatacttacaaataatatgataa 18056403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36234254 - 36234190
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36234254 aacaccgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 36234190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 121
Target Start/End: Original strand, 39641138 - 39641222
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||| |||||    
T  39641138 ctaaaaacgtaaagaatgaatttgcgaacaaactcacatcatccaagttaatcgcatataacgacataatgcctataaaaaatat 39641222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 6174072 - 6174013
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaata 89  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  6174072 aacaccgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 6174013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 127
Target Start/End: Original strand, 13014819 - 13014866
Alignment:
Q  80 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 127  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13014819 caagttaatagcatacgacagcaaaatgcctacatataatgtgataaa 13014866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17319568 - 17319431
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcc--tacaaataatatgataaaacctaaat 135  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||| |||| |||| || ||||||  ||||||| |||||||||||   || |    
T  17319568 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacgacatccaagttaataacatataacgacataatgcctatacaaat-atatgataaaattaaagt 17319470  T
Q  136 caccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacg 174  Q
     |||  ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17319469 gaccggaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacg 17319431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22421979 - 22421920
Alignment:
Q  35 cgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22421979 cgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaattgcata 22421920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3241011 - 3240977
Alignment:
Q  159 atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3241011 atctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaat 3240977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3725429 - 3725351
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| || ||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3725429 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaacttacatcatccaaactaatagcatataacggcgtaatgcctacaaa 3725351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5754686 - 5754616
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5754686 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgtgaacaaactcacatcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 5754616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7558701 - 7558647
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagc 91  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7558701 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcatagcatccaagttaatagc 7558647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 11189468 - 11189566
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||  ||||| ||||||| | ||||||  | |||||||| | || |||||||||||||||||| | | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  11189468 aacatcgtaaaaaaagtaaaggataaatatgtgagcaaactcatatcatccaagttaatagcatacagctgtaaaataccgataaataatatgataaaa 11189566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14416369 - 14416223
Alignment:
Q  76 cacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgt 175  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||   ||||| ||||||| || || |||||  || | ||    
T  14416369 cacctaagttaataacatacaatgacaaactccctacaattaatatgataaaatctatgtcactctaatacccatgctttcgaatatgcaatgttaatgt 14416270  T
Q  176 ccaaa-tcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaa 221  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  14416269 ccaaattcattgattgaatctgtaattgactgaagtcgatatttcaa 14416223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 25622769 - 25622839
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25622769 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacgtcaaa 25622839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 43473862 - 43473932
Alignment:
Q  34 tcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaa 104  Q
    ||||||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  43473862 tcgctaaaaacaaaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccatgttaatagcataaaacggcaaa 43473932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 289
Target Start/End: Original strand, 12647999 - 12648028
Alignment:
Q  260 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647999 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 12648028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 34471345 - 34471292
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    ||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34471345 tgaatatgtgaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaat 34471292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37628932 - 37628855
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| || ||||||    | ||||||||||||||||||    
T  37628932 tgaatatgcaaacaaactcaccacactcaagttaatgacatacagcgacaaaatattgataaataatatgataaaacc 37628855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 106
Target Start/End: Original strand, 15673721 - 15673765
Alignment:
Q  62 aaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaat 106  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15673721 aaacaaactcacaacatccatgttaatagcataaaacggcaaaat 15673765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Original strand, 40625882 - 40625946
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcata 94  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  40625882 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcataacattcaagttaatagcata 40625946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 42577308 - 42577268
Alignment:
Q  84 ttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42577308 ttaatagcataaaacgacaaaatacctacaaataatatgat 42577268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15748 - 15476
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15748 acatcagttacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaata 15649  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15648 atatgataaaacctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 15549  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc-taacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 289  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15548 tcaataggaaatgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 15476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 32580 - 32852
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  32580 acatcagatacaaacatggctaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcacaacactcaagttaatagtatacagcgacaaaatgcctacaaata 32679  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32680 atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 32779  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32780 tcaataggaactgaacaaataccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacg 32852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1600 - 1328
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1600 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 1501  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   | ||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||  ||||||    
T  1500 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttctagaactgcaacgttgacgcccaaattattggtcgaatttgtaattgactgatgccgatctt 1401  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1400 tcaataggaactaaacgaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacg 1328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 71703 - 71969
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71703 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 71802  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||      || |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  71803 atatgataaaacttaagtcac------acccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattggttgaatttgtaattgactaatgtagatctt 71896  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  71897 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaactccgcacaagacaacgaacaacacaacg 71969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0884 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0884
Description:

Target: scaffold0884; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 285
Target Start/End: Original strand, 1807 - 2073
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1807 catcaggtacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaataacatacaacagcaaaatgcctacaaataa 1906  T
Q  119 tatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1907 tatgataaaacctaaatcaccgaaatacttatgttttcggatctgcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaattgactaatgtagatcttt 2006  T
Q  219 caatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaaca 285  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  2007 caataggaactaaaaaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgccacataagacgacgaacaaca 2073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Original strand, 9879 - 10145
Alignment:
Q  22 cagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatat 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9879 cagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagtcaatagcataaaacggaaaaatgcctacaaataatat 9978  T
Q  122 gataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaa 221  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9979 gataaaacccaattcactgaaatacacatgtttctggatctgcaacgttgactctcaaatcattggttgaatttgtaattgatcgatgtcgatctttcaa 10078  T
Q  222 tatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 288  Q
    || ||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10079 taggaattaaatgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaaacaa 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38306 - 38052
Alignment:
Q  23 agatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatg 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| | | ||||||| || | ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  38306 agatacaaatatcgcaaaaaacgtaaatgatgaatctacgaacaaacccataacacccaagttaatagcatatagcg-caaaatccctacaaataatatg 38208  T
Q  123 ataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgc---atctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 219  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||   |||  |||  |||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  38207 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccgccggatcaacaatgttgacacccaaatcatcgattgaatttgtaattgactgaagtctatctttc 38108  T
Q  220 aatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacg 275  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  |||||||   |||||  |||||||||||||||    
T  38107 aatatgaactaaacgaacactgtaacaagacatgaaatcatacgccgcacaagacg 38052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 34630 - 34705
Alignment:
Q  53 tgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| || | |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34630 tgaatctgcgaacaaacttacaacatctaagttaaaggcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaa 34705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 65875 - 66147
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65875 acatcatatacaaacatcggtaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 65974  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  65975 atatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggcacccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 66074  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
     ||||   |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  66075 ccaattgtaactaaacaaacaccacgacaagatgcaaaatcagacgccacacaagacgacgaacaacataacg 66147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51012 - 50785
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatca 137  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  51012 taaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtca 50913  T
Q  138 ccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaac 237  Q
    || |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| || | ||| |||||||||    
T  50912 ccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactaacgtagatcttttaagaggaaatgaacaaac 50813  T
Q  238 accgcgacaagacgcaaaatctaacgcc 265  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  50812 accgcgacaaaacgcgaaatcaaacgcc 50785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 31107 - 31379
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  31107 acatcagatacaaacatcgcttaaaacgtaaaggatgaatcaacgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctataaata 31206  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 217  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31207 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgctcaaatcgttgattgaatttgtaattgagtgatgtcgatctt 31306  T
Q  218 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||||| ||||| ||  |  |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31307 tcaataggaactaaatgattaccgtgacaagacgggaaatcaaacgtcgcacaagacgactaacaacataacg 31379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 71140 - 71405
Alignment:
Q  25 atacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  71140 atacaaacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctacaaacaaacttacaacacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatataat 71239  T
Q  125 aaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatat 224  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||     
T  71240 aaaatctaagtcatcaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacaccccaatcattgattgaatttataattgactgatgccgatctttaaatag 71339  T
Q  225 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  71340 gaactaaacgaacaccacgacaagacgcgaaatcaactgctgcacaagtcgactaacaacacaacg 71405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8723 - 8496
Alignment:
Q  63 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatct 162  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||  ||||    
T  8723 aacaaactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgattaatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatct 8624  T
Q  163 gcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaac 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  8623 gcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaac 8524  T
Q  263 gccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8523 gctgcacaagacgatgaacaatacaacg 8496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 57933 - 58161
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  57933 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 58032  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||      
T  58033 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcagtatgaaac 58132  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc 258  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  58133 aaacaaacaccgcaacaagacgcaaaatc 58161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6274 - 6014
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6274 aacatcactaaaaatgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcttgtaacaacaaaatgtctacaaataatatgataaaat 6175  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||  |  |||||||||||||     
T  6174 ctaaatcaccagaatacacatgcttccggatctgcaacattgacatccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagttaacatttcaatatgaacc 6075  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacaca 287  Q
     ||  |||||||| |||| |||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6074 aaatgaacaccgcaacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37082 - 36814
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcaccc-aagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaat 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  |||| | | ||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  37082 acatcagatacacacatcgctataaacttaaatgatcaatctacgaacaaactcacaacaccccaagttaatagcataaaacatcaaaatacctacaaat 36983  T
Q  117 aatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatct 216  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||  || |    
T  36982 aatatgataaaatctaaatcactgaaatacccatgcttccagattagcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattaactaatgtcaatat 36883  T
Q  217 ttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
    |||     ||||| || ||||||||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36882 ttc-----gaactaaaaaaacaccgaaataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgactaccaacacaacg 36814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7700
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggta-aagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7960 aacattgctaaaaacgtacaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaatagcaaaatccctacaaataatatgataaat 7861  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
      ||| |||| | | ||| |||||||||| || |||||| | |||  |||||| |||| | |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||  ||     
T  7860 tataactcactacattac-catgcttccggatatgcaacgtcgacacccaaataattgatggaatttataattgactgaagtggatctttcaatagaaaa 7762  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      ||| ||||| ||  |||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7761 ctaacgaacactgcatcaagacgcgaattcaaacgccacacaagacgacaaacaacacaacg 7700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 273
Target Start/End: Original strand, 1723 - 1907
Alignment:
Q  89 agcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgct 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||| |    
T  1723 agcatacaacggtaaaatgcctacaaataatatgataaaatataagtcatcgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggtgcccaaatcattgat 1822  T
Q  189 tgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatctaacgccgcacaaga 273  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||  || | ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  1823 tgaatttgtaatttaccgatgtcgatcttccaatagaaattaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaaccaaacgacgcacaaga 1907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 93351 - 93087
Alignment:
Q  29 aaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||  |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  93351 aaacatcgctaaaacg-taaatggtgaatctgtgaacaagttcatagcacccaagttaatagcacacaacaacaaaatgcctacaaacaatatgataaaa 93253  T
Q  129 cctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
      |||||||||| ||||| |||  ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| |||    |||||||||||||||||    
T  93252 tttaaatcaccagaatacccatatttctggatctgcaacgttgacgtcctaatcattgattcaatatgtgattgagtgaaaccgatctttcaatatgaac 93153  T
Q  229 tgaacaaacaccgcgacaagacgc-aaaatc---taacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 290  Q
      ||| |||||| | ||||||| | || |||    ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  93152 caaacgaacaccacaacaagacacgaatatcaaacaacgccgcacaagacaacaaacaacacaacg 93087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 14704 - 14881
Alignment:
Q  18 acatcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 117  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  14704 acatcatatacaaacatcactaaaaatataaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataatagcaaaatgcatacaaata 14803  T
Q  118 atatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttg 196  Q
    ||||||| ||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||||||  ||||   | ||||||||| |||||||||    
T  14804 atatgat-aaatctaagtcatcgaaatactcatgtttccggatctgcaatgttgattcctaaatcattgattgaatttg 14881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 92341 - 92562
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaac 129  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |   |||||||||||| |||  |||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  92341 aacatcgctaaaaacataaagggtgaatctttgaacaaactcacatcacttaagttaatagtatgcaacaacaaaatgcctacaaacaatatgataaaat 92440  T
Q  130 ctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaact 229  Q
     ||||  |||| ||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | | |  | |||||||||||||||||     
T  92441 ttaaactaccagaatacccatgcttctggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgatttactaaaattgatctttcaatatgaacc 92540  T
Q  230 gaacaaacaccgcgacaagacg 251  Q
     ||| |||||| | ||||||||    
T  92541 aaacgaacaccacaacaagacg 92562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 228
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1721
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcacc 139  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1533 aaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatcaaaattaatagcatataacgataaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 1632  T
Q  140 aaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
    | ||||| |||| ||| | |||| | || ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  1633 agaatacccatgtttctggatctactacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaac 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4058
Alignment:
Q  31 acatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacc 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| || || |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  3891 acatcgctaaaaatgtaaagggtaaatctgcgatcaaactcccatcatccaagttaatagcat----cggcaaaatgtctacaaataatatgataaaatt 3986  T
Q  131 taaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 203  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3987 taaatcaccagaatac-catgtttccgtatatgcaacgttgacgtctaaatcattggttgaatctgtgattga 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5642 - 5485
Alignment:
Q  38 taaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatc 136  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || ||    
T  5642 taaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtc 5543  T
Q  137 accaaaatacacat-gcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    |||  ||||  ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5542 accggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 5485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4361 - 4273
Alignment:
Q  85 taatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgac 173  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  4361 taatagcatccaatgacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaatactcaagctttcggatctgcaacgttgac 4273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8778
Alignment:
Q  40 aaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaacctaaatcac 138  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   || | ||    
T  8933 aaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 8834  T
Q  139 caaaatacacatgct-tccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaat 193  Q
    || ||||  |||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  8833 cagaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 8778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 128
Target Start/End: Original strand, 26936 - 27018
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaa 128  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26936 taaaggatgaatatacgaacaaactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatgagaaaa 27018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Original strand, 18944 - 19117
Alignment:
Q  46 taaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaata 145  Q
    |||||||||||| | | || ||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||     
T  18944 taaagggtgaatttacgaataaattcatagcaccaaa-ttaatagtatacaacggcaaaatgcatacaaataatatgataaaatccaaatcaccggcat- 19041  T
Q  146 cacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaac 228  Q
           ||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  19042 -------ttctgaatttgcaacattgacctccaaatcattgattgattctgtgattgactgaagttcatctttcaatatgaac 19117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 16145 - 16230
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  16145 aacaccgctaaaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 16230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 102
Target Start/End: Original strand, 83264 - 83333
Alignment:
Q  33 atcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggca 102  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  83264 atcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggca 83333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25455 - 25315
Alignment:
Q  109 ctacaaataatatgataaaacctaaatcaccaaaatacacatgcttccgcatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgat 208  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||| |||| ||  | |||| |||  ||||||  |||||||||| || ||||||||||| | ||||    
T  25455 ctacaaataatatgatcaaatctaagtcacagaaatactcatgtttttggatctacaatgttgacgctcaaatcattgatttaatttgtaattaactgat 25356  T
Q  209 gtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaaga 249  Q
    ||  || |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  25355 gtcaatatttcaacatgaactaaacggacaccgcgacaaga 25315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25536 - 25468
Alignment:
Q  19 catcagatacaaacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||  |||||||||||| ||  ||||||||    
T  25536 catcagatacaaacatcgctaaaaacttaaggggtaaatctgtgaacaaactcacaacattcaagttaa 25468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 361624 - 361709
Alignment:
Q  30 aacatcgctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaa 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||| ||||||| || ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  361624 aacaccgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacacactcacaacatccaagttaacaacatataacggcataatgcctacaaa 361709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 201205 - 201297
Alignment:
Q  37 ctaaaaaggtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||  |||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  201205 ctaaaaatgtaaaggatgaatttgtgaacatactcacagaatccaatttaatagcatataacggcatgatgcctacaaaaatatatgataaaa 201297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8099
Alignment:
Q  183 attgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatatgaactgaacaaacaccgcgac 245  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||    
T  8161 attgattgaatttgtatttgattgatgtcgatctttcaacaggaactaaacgaacaccacgac 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6523 - 6457
Alignment:
Q  64 acaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata-atatgataaaac 129  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  6523 acaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaac 6457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University