View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5797-Insertion-7 (Length: 890)

Name: NF5797-Insertion-7
Description: NF5797
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5797-Insertion-7
NF5797-Insertion-7
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (9-882)||(1300830-1301697)
chr7 (9-882)||(8658735-8659600)
chr7 (226-882)||(10494305-10494959)
chr7 (222-864)||(8654029-8654670)
chr7 (155-882)||(8666931-8667656)
chr7 (452-882)||(13333387-13333815)
chr7 (227-852)||(6789096-6789721)
chr7 (391-767)||(27830919-27831295)
chr7 (471-761)||(3147092-3147382)
chr7 (493-851)||(17260091-17260449)
chr7 (225-853)||(8585664-8586292)
chr7 (235-841)||(8646469-8647075)
chr7 (258-851)||(17267554-17268147)
chr7 (391-578)||(8616429-8616616)
chr7 (226-346)||(13333833-13333953)
chr7 (154-301)||(8671608-8671755)
chr7 (610-853)||(8545600-8545843)
chr7 (720-853)||(8628609-8628742)
chr7 (610-755)||(7877789-7877934)
chr7 (510-853)||(8570178-8570521)
chr7 (227-437)||(8590222-8590432)
chr7 (610-755)||(29577728-29577873)
chr7 (295-344)||(8102319-8102368)
chr7 (228-437)||(8581285-8581494)
chr7 (610-755)||(29581897-29582042)
chr7 (224-344)||(3146845-3146965)
chr7 (610-853)||(8576293-8576536)
chr7 (670-786)||(8636369-8636484)
chr7 (225-356)||(8545215-8545346)
chr7 (309-437)||(29582215-29582343)
chr7 (292-351)||(8017873-8017932)
chr7 (55-110)||(8646295-8646350)
chr7 (258-356)||(17259856-17259954)
chr7 (55-104)||(3146682-3146731)
chr7 (225-278)||(8616260-8616313)
chr7 (687-755)||(8609961-8610029)
chr7 (706-757)||(8602037-8602088)
chr7 (226-269)||(8609500-8609543)
chr7 (467-538)||(8673894-8673965)
chr7 (58-104)||(8586407-8586453)
chr7 (726-755)||(8538119-8538148)
chr7 (716-757)||(8559406-8559447)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (177-882)||(16657448-16658151)
chr2 (225-853)||(43624994-43625622)
chr2 (225-853)||(16661950-16662578)
chr2 (235-769)||(12245448-12245982)
chr2 (491-853)||(7542074-7542436)
chr2 (466-853)||(12234512-12234899)
chr2 (227-851)||(12258541-12259165)
chr2 (467-767)||(14703232-14703532)
chr2 (227-853)||(11998992-11999604)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (225-882)||(4678489-4679143)
chr1 (228-853)||(15594619-15595244)
chr1 (508-854)||(34466750-34467088)
chr1 (232-344)||(34467255-34467367)
chr1 (52-104)||(4679255-4679307)
chr1 (470-533)||(52549290-52549353)
chr1 (79-116)||(29465291-29465328)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (222-880)||(9335824-9336480)
chr4 (226-851)||(30774835-30775460)
chr4 (667-761)||(35132472-35132566)
chr4 (469-578)||(35132283-35132392)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (469-762)||(28219744-28220037)
chr5 (225-350)||(28219500-28219625)
chr5 (55-105)||(28219336-28219386)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (394-762)||(43744567-43744935)
chr8 (297-839)||(12528158-12528700)
chr8 (55-104)||(43744234-43744283)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 765; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 765; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 882
Target Start/End: Original strand, 1300830 - 1301697
Alignment:
Q  9 caagggagtgccacgaggagcacctcgacggatagaaagcttgaacgaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaacacta 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1300830 caagggggtgccacgaggagcacctcgacggatagaaagcttgaacgaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaacacta 1300929  T
Q  109 atcaagacaacaccaatatcacaatccttggcggttttaaattattttgtcttcctgacaggcacggtagtgttccttggaatcaccacactcgtgacat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1300930 atcaagacaacaccaatatcataatcatcagcagttttaaattcttttgtcttcctgacaggcacggtagtgttccttggaatcaccacactcatgacat 1301029  T
Q  209 gatcaagacctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaat 308  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301030 gatca---cctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaat 1301126  T
Q  309 agctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatccta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301127 agctgcaccataagcaacagcctcgtcggg-ttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatccta 1301225  T
Q  409 gacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagat 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1301226 gacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttgtacactcattaaaaagat 1301325  T
Q  509 ccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaaga 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301326 ccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaaga 1301425  T
Q  609 gagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctaca 708  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1301426 gagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctaca 1301525  T
Q  709 aagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggata 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301526 aagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagt-ggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggata 1301624  T
Q  809 gacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1301625 gacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaata-ttccgtttaccat-cacagtcacttctcttgt 1301697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 882
Target Start/End: Original strand, 8658735 - 8659600
Alignment:
Q  9 caagggagtgccacgaggagcacctcgacggatagaaagcttgaacgaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaacacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8658735 caagggagtgccacgaggagcacctggacggcaagaaagtttgaacgaaccaagcagattgttgtctagcgctcttgctctctcaccctcgtaaacacga 8658834  T
Q  109 atcaagacaacaccaatatcacaatccttggcggttttaaattattttgtcttcctgacaggcacggtagtgttccttggaatcaccacactcgtgacat 208  Q
    ||| ||||||||||| | |||||| |  | ||      | ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  8658835 atcgagacaacaccattgtcacaaccagttgc------atatccttttgtcttcctgagaggcacagtagtgttccttggaatcactacacccatgacat 8658928  T
Q  209 gatcaagacctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaat 308  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  8658929 gatcaacatctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttaaagcctttgcttaaaacagcagcttgaag 8659028  T
Q  309 agctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatccta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8659029 agctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatactcttgtataaaaccttctttgggaaaaggtcttgcaatagatcttgcactttgggaatccta 8659128  T
Q  409 gacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagat 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8659129 gacgaaccacccacaagaacaatatcgtcaatatcactcatctgtatttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagat 8659228  T
Q  509 ccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaaga 608  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8659229 ccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaaga 8659328  T
Q  609 gagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctaca 708  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659329 gagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctaca 8659428  T
Q  709 aagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggata 808  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  8659429 aagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaagt-ggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggata 8659527  T
Q  809 gacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8659528 gacacatcaaaagtaccaccaccaagatcaaagaccaaaatattt-tgtttaccat-cacagtcacctctcttgt 8659600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 226 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 10494959 - 10494305
Alignment:
Q  226 ataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10494959 ataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttcgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaa 10494860  T
Q  326 cagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaag 425  Q
    ||||||| || |||||||||| | || ||||  | ||| ||  |||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10494859 cagcctcatctgggttgatacgcatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaag 10494760  T
Q  426 aacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactc-attaaaaagatccatattaatttcctc 524  Q
    |||||||||||| |||| | || || |||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||  ||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  10494759 aacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaag-tctatattaatttcctc 10494661  T
Q  525 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 624  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  10494660 aaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgcc 10494561  T
Q  625 ctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattc 724  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  10494560 ctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattc 10494461  T
Q  725 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtac 823  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  10494460 tgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagt-ggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtac 10494362  T
Q  824 caccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||    
T  10494361 caccacccagatcaaagacaaaaatattt-cggttaccct-cacaatcacttctcttgt 10494305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 222 - 864
Target Start/End: Original strand, 8654029 - 8654670
Alignment:
Q  222 tgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||| ||| || |||||     
T  8654029 tgcgataccaagtgacaatggggtaacatcacgtagcaccaagttggggacattcttaaagtcttcactcaaaatagcagcctgaacagcagcgccatat 8654128  T
Q  322 gcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccaccca 421  Q
    |||| |||||| || ||||||||| || |  | ||| | ||| ||  |||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654129 gcaatagcctcatctgggttgatattcataaacaaagccttccccttgaaaaactctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccaccca 8654228  T
Q  422 caagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttc 521  Q
    | || |||| |||||| |||| | || || |||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  8654229 cgagtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttc 8654328  T
Q  522 ctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtccttttt 621  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  8654329 ctcaaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatccttttt 8654428  T
Q  622 gccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcacca 721  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8654429 gccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacacca 8654528  T
Q  722 ttctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaag 820  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||    
T  8654529 ttctgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagt-ggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaag 8654627  T
Q  821 taccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatc 864  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8654628 taccaccaccaagatcaaataccaaaata-ttccgtttaccatc 8654670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 155 - 882
Target Start/End: Original strand, 8666931 - 8667656
Alignment:
Q  155 ttgtcttcctgacaggcacggtagtgttccttggaatcaccacactcgtgacatgatcaagacctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttg 254  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  8666931 ttgtcttcttgacaggtatggaagtgtttctaggaatcaccacactcatgatatgttcaatacttacagaaataccaagtgacaaaggggtcacatctcg 8667030  T
Q  255 cagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtat 354  Q
     ||||||||||| |||||||||||  | ||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||    
T  8667031 tagcaccaagttggggacattcttacagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatacccatgaat 8667130  T
Q  355 aaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcata 454  Q
    ||  | ||| ||  ||||   ||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| | || || |||    
T  8667131 aattccttccccttgaaatattctagcaattgttcctgcactttgggaatcctagacgagccaccgacaagtacaacatcatcaatatcattcttgtata 8667230  T
Q  455 tttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaa 554  Q
    | |||||||| || |||||  | |||||  | ||  |||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||    
T  8667231 tctttgaatccctgagacaggtgtcaactatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaacaaaa 8667330  T
Q  555 gtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaag 654  Q
    ||||||||||  | |||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8667331 gtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaag 8667430  T
Q  655 gatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgag 754  Q
    |||||  ||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8667431 gattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgag 8667530  T
Q  755 tgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||     
T  8667531 tgtttcctgcagt-ggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtcccgccacccagatcaaagacaaaaatattt- 8667628  T
Q  854 cgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    ||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  8667629 cggctaccat-cacagtcatttctcttgt 8667656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 452 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 13333815 - 13333387
Alignment:
Q  452 atatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactc-attaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaac 550  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||| | ||  ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  13333815 atatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaag-tctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaag 13333717  T
Q  551 agaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctcct 650  Q
    | ||||||||||||  | |||||| ||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13333716 aaaagtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctcct 13333617  T
Q  651 taaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaagg 750  Q
    |||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13333616 taaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaagg 13333517  T
Q  751 tgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaata 849  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  13333516 tgagtgtttcctgcggt-ggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacccagatcaaagacaaaaata 13333418  T
Q  850 tttccgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    ||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  13333417 ttt-cgcttaccat-cacaatcacgtctcttgt 13333387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 227 - 852
Target Start/End: Original strand, 6789096 - 6789721
Alignment:
Q  227 taccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaac 326  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||| ||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  6789096 taccaagagacaacggtgtaacatcttgcagcaccaagtttggaacactcttagagccttcgctcaacaaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaac 6789195  T
Q  327 agcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaaga 426  Q
    |||||| || |||||||| ||| || | ||| | ||  ||  |||||  ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||     
T  6789196 agcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatcctttcccatgaaaacttcttgcaatagttgttgcactttgggaattctagaagacccaccaacaagg 6789295  T
Q  427 acaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaa 526  Q
    |||| |||||  | |  |||| ||   || || |  ||   ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6789296 acaacatcatttacaatactcttgtccatcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaa 6789395  T
Q  527 acttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccct 626  Q
    ||||||| ||||| | | |||||  ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||  || ||||| | | |||||||||||  |||||| |||||    
T  6789396 acttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccct 6789495  T
Q  627 ctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattcta 726  Q
     ||||| ||| |||||||||| |||||||   |   ||| ||| |||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||| | |||| ||      
T  6789496 ttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcgg 6789595  T
Q  727 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtacca 825  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||  ||||| |   | ||||| || | |||||||||||| ||||| |||    
T  6789596 ttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggt-ggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgcca 6789694  T
Q  826 ccgccaaggtcaaagaccaaaatattt 852  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||    
T  6789695 ccaccaaggtcgaagacgaaaatattt 6789721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 391 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 27831295 - 27830919
Alignment:
Q  391 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttg 490  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||| ||   || || || ||  | ||||||||||||||||| |       
T  27831295 tgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatcttagagtcagtgagacaactctcaacagtctcca 27831196  T
Q  491 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggt 590  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| || |||| | |||| | ||| | |||||  ||    
T  27831195 tacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtcaatgccctcaaataaggcatctatctcaatagt 27831096  T
Q  591 ggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttc 690  Q
     ||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| |||||| |||| | |  |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  27831095 agtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggctcttgggttcccactaatgtccactcttttcttc 27830996  T
Q  691 tttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagt 767  Q
    || |||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27830995 ttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgtttccagcagt 27830919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 471 - 761
Target Start/End: Original strand, 3147092 - 3147382
Alignment:
Q  471 acaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatat 570  Q
    |||||||| ||||||||    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||| ||    
T  3147092 acaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaat 3147191  T
Q  571 aaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccac 670  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||  | ||||||||| ||| | | |||||| || ||||| ||  || ||||||||||||||| | |   |||  |||    
T  3147192 aaagaatctatctcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttgctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcac 3147291  T
Q  671 taatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcc 761  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3147292 taatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcc 3147382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 493 - 851
Target Start/End: Original strand, 17260091 - 17260449
Alignment:
Q  493 cactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtgg 592  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || |  |  |||| | ||||||  || ||||||||  |||    
T  17260091 cactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattgg 17260190  T
Q  593 tgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctt 692  Q
    | ||  | |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||| ||| ||| |  |    
T  17260191 tcacagaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttct 17260290  T
Q  693 tttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcc 792  Q
    ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||| || ||||| ||||| |   |    
T  17260291 tttgatctcctctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggt-ggccttaacttcgaagaccttatc 17260389  T
Q  793 cttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatt 851  Q
    ||| || |||| || ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  17260390 cttaattgtaacgagagacacatcaaaagtccccccaccaaggtcaaagacaaaaatatt 17260449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 8586292 - 8585664
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||  |||| |  |  | || ||| ||||  || || |||  ||||    
T  8586292 gataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcaccaagtttggaactttcttaaagtctttacacagcaaagaagcctgaactgcagccccactagca 8586193  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 424  Q
    |||||||| || || |||||  ||||| ||||| ||||| |   ||| | |||   |||||  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  8586192 acagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaagtcactcaatagttcctgtactttgggaattctggacgagccaccgacaa 8586093  T
Q  425 gaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctc 524  Q
    | |||||||| || | |  | || |   ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8586092 ggacaatatcgtctacaccattcttctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctc 8585993  T
Q  525 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 624  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||  |||| | ||||| |||| |  ||||  || ||||| ||    ||||| |||||||||||||||    
T  8585992 aaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgcc 8585893  T
Q  625 ctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattc 724  Q
     | ||||||||  |||| |||| ||| || | | |  ||||   | |||| ||||| || |||||  | || || ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  8585892 ttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattc 8585793  T
Q  725 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtac 823  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  8585792 tgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggt-tgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcc 8585694  T
Q  824 caccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  8585693 caccaccaagatcaaacacaaaaatatttc 8585664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 841
Target Start/End: Original strand, 8646469 - 8647075
Alignment:
Q  235 gacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgt 334  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| || || |  | ||| | |||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| | |    
T  8646469 gacaatggggtgacatcttgaaacaccaagtttggagcattcttaaagccatcacataataaagcagcctgaacggctgcgccataagcaacggccacat 8646568  T
Q  335 cggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatc 434  Q
    | |||||||| |||| | ||||  | |||||   |||||  || | ||  || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  8646569 cagggttgatgctctcgcataattccttctcattgaaaaactccttcagcatctgttgtacttttggaattctagaggagccaccaacaagaacaacatc 8646668  T
Q  435 atcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggca 534  Q
    || ||||  |||| ||   || || | |||  || ||||||||||||||||||    ||| ||  | || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  8646669 atggatagaactcttgtccatcttggcatcattatgacaactctcaacagtttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggca 8646768  T
Q  535 cgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatg 634  Q
    ||||||||| |||||   ||||| || || | | |||||||||| |  |||| |||||||    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8646769 cgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatg 8646868  T
Q  635 caattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaa 734  Q
    |  |||||||||||||||||| | |   ||| ||| |||||||||| || |||||||| || || || | | |||||| |  |||||||||| |||||||    
T  8646869 ccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaa 8646968  T
Q  735 gtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaag 833  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| || | |||||| |   |||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8646969 gtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggt-ggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccaccaag 8647067  T
Q  834 gtcaaaga 841  Q
    ||| ||||    
T  8647068 gtcgaaga 8647075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 851
Target Start/End: Original strand, 17267554 - 17268147
Alignment:
Q  258 caccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaa 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |   ||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||     
T  17267554 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataat 17267653  T
Q  358 actttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcga-tatgactcatgcatatt 456  Q
     | ||| ||  ||| | ||  |||||||  |  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| | | || ||| ||   ||     
T  17267654 tccttccccttgaagaagttctgcaatagttgctgcactttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctg-ctcttgtcaatc 17267752  T
Q  457 tttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagt 556  Q
    || | ||| ||||||||  |||||||| | |   | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |    
T  17267753 ttagcatcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaat 17267852  T
Q  557 cgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaagga 656  Q
    | |  |||| | ||||||  || ||||||||  |||| ||  | || ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| | ||     
T  17267853 caacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcacagaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggc 17267952  T
Q  657 tttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtg 756  Q
    |||  |||| |||  ||| | || ||| || ||| ||||||  ||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  17267953 ttttgggttcccaacaattttcaatttttttttccttttgatttcctcaacaaaatagtataccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtg 17268052  T
Q  757 tttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatt 851  Q
    | |||||| || ||| || ||||| ||||| |   |||| || |||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17268053 tctccaccggt-ggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaacgagagacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacaaaaatatt 17268147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 578
Target Start/End: Original strand, 8616429 - 8616616
Alignment:
Q  391 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttg 490  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||| |   ||| || |||||  ||| ||||||||||||||| |||     
T  8616429 tgcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatcttagaatcattaaaacaactctcaacagtcttta 8616528  T
Q  491 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatc 578  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| | ||||| ||||    
T  8616529 tacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccctcacataaataatc 8616616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13333953 - 13333833
Alignment:
Q  226 ataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaa 325  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13333953 ataccaagtgataatgggataacatctcgtagcaccaagttcgggacagtcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaa 13333854  T
Q  326 cagcctcgtcggggttgatac 346  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  13333853 cagcctcatctgggttgatac 13333833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8671755 - 8671608
Alignment:
Q  154 tttgtcttcctgacaggcacggtagtgttccttggaatcaccacactcgtgacatgatcaagacctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatctt 253  Q
    ||||||||  ||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||  | | | || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  8671755 tttgtctttgtgacaggtatggaagtgtttcttggaatcaccacactcatgatatgttcaatccttgcagcaataccaagtgacaatggcgtaacatctc 8671656  T
Q  254 gcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcag 301  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  8671655 gtagcaccaagttggggacattcttaaagcctttgctcaaaatagcag 8671608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 610 - 853
Target Start/End: Original strand, 8545600 - 8545843
Alignment:
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||   |||| | |||||| ||| | || |||||| | ||||||||||  ||||    
T  8545600 agtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaaggcttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaa 8545699  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatag 809  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| || || || |||| ||||| |||| |||| ||| || || |||||||| |     || || ||||| ||||    
T  8545700 agtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagtgtctccagcagt-ggccttgacatcaaagaccttatttttaattgtaagaatag 8545798  T
Q  810 acacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8545799 acacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 720 - 853
Target Start/End: Original strand, 8628609 - 8628742
Alignment:
Q  720 cattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aa 818  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||| ||    
T  8628609 cattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagt-ggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 8628707  T
Q  819 agtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  8628708 agtcccaccaccaagatcaaacacaaaaatatttc 8628742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7877934 - 7877789
Alignment:
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||   || |||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||   || |    
T  7877934 agtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcacta 7877835  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 755  Q
    | | | ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7877834 aatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagt 7877789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 510 - 853
Target Start/End: Original strand, 8570178 - 8570521
Alignment:
Q  510 catattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagag 609  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || ||| | |||||  ||||   |   | || | ||     
T  8570178 catattcatttcctcaaacttggcccgggttattgatgaactgaagtcaattcccttatatatagcatctagctcaattgtggcctcagtatcatatgaa 8570277  T
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||| |||  |||| | |||||| ||| | || |||||||| ||||||| ||  ||||    
T  8570278 agtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaa 8570377  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatag 809  Q
    |||   ||| |||||| |||||||| || || ||||| |||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||   |   |||| |  || || ||||    
T  8570378 agtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagt-ggccttgacttcatagttgttatccttaactgtgagaatag 8570476  T
Q  810 acacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8570477 acacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8570521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 437
Target Start/End: Original strand, 8590222 - 8590432
Alignment:
Q  227 taccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaac 326  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |  || |  |  |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8590222 taccaagagacaatggagtaacatcttgtagcaccaaattaggaacattcttaatcccatcacaaagcaaagcagcttgaacagctgcaccataagcaac 8590321  T
Q  327 agcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaaga 426  Q
    |||||| || || ||||| || ||||| | | | ||| ||   |||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  8590322 agcctcatctggattgatgctattgtaaagatccttccccataaaaaagtcttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaaccaccaacaagt 8590421  T
Q  427 acaatatcatc 437  Q
    |||| ||||||    
T  8590422 acaacatcatc 8590432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29577873 - 29577728
Alignment:
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | |||  ||||   |||||||||||| || |||||| | || ||||| |  ||||    
T  29577873 agtgccctctttgccctctcacaagcagttctcagcttccttaaagcttttgggttcaaactaatgtccacattgttcttcctcttcaactcattcacaa 29577774  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 755  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29577773 agtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagt 29577728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Original strand, 8102319 - 8102368
Alignment:
Q  295 atagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgat 344  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8102319 atagcagcttgaacagcggcaccataagcaacagcctcgtcggggttgat 8102368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 437
Target Start/End: Original strand, 8581285 - 8581494
Alignment:
Q  228 accaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaaca 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||| ||| |||| |  ||||  || |  | |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8581285 accaagtgacaatggtgtaacatctcgcaaaatcaagtttggaacactcttaatgccttcactaaccaaagcagcctgaatagcagcaccataagcaaca 8581384  T
Q  328 gcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaa 427  Q
    ||||| || |||||||| |||||| ||||  | ||| || ||||||  || || ||||  | |  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  8581385 gcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttcccctggaaaaactcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccaccaacaagga 8581484  T
Q  428 caatatcatc 437  Q
    ||| ||||||    
T  8581485 caacatcatc 8581494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29582042 - 29581897
Alignment:
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||| | ||||||| | |||  |||| |||||||||||||  || |||||| | || ||||| |   |||    
T  29582042 agtgtcctctttgccctctcacaagctgttctcagcttccttaaagcttttgggttcccactaatgtccaaattgttcttcctcttcaactcattcgcaa 29581943  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 755  Q
    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29581942 agtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagt 29581897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 344
Target Start/End: Original strand, 3146845 - 3146965
Alignment:
Q  224 cgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagc 323  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||  |||  || || | ||||||||| | |||||||||||||||    
T  3146845 cgataccaagagacaaaggagcaacatcttgcaccaccaagtttggaacatttttaaagtcttcactcaacaaagcagcttgcacagctgcaccataagc 3146944  T
Q  324 aacagcctcgtcggggttgat 344  Q
    ||| ||||| || ||||||||    
T  3146945 aacggcctcatcagggttgat 3146965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 610 - 853
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576536
Alignment:
Q  610 agtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaa 709  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||    ||  ||||||| ||| |||| | ||| ||  |||||||||  ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  710 agtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatag 809  Q
    |||    ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||  |||| ||| || ||||| ||||||| |  ||| |  || || ||||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagt-ggccttgacttcgaagacattgttcttaactgtgagaatag 8576491  T
Q  810 acacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8576492 acacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaagataaaaatatttc 8576536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 670 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 8636484 - 8636369
Alignment:
Q  670 ctaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgg 769  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||  ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |    
T  8636484 ctaatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagt-g 8636386  T
Q  770 gcttttacttcaaagac 786  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8636385 gctttaacttcaaagac 8636369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 356
Target Start/End: Original strand, 8545215 - 8545346
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||     |||  || |  | |||||| || | ||||||||||||||||    
T  8545215 gataccaagtgacaaaggggtaacatctcgtagcaccatgtttgggacattcttattgtcttcactcagcaaagcagcctggacagctgcaccataagca 8545314  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactcttgtataa 356  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  8545315 acagcctcatcagggttaatgctcttgcataa 8545346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29582343 - 29582215
Alignment:
Q  309 agctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatccta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || | ||| | ||| ||  |||||  ||||||||||  |  |||||||||||||| |||    
T  29582343 agctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttccccttgaaaaattcttgcaatagctgatgcactttgggaattcta 29582244  T
Q  409 gacgagccacccacaagaacaatatcatc 437  Q
    || |||||||| | ||| || ||||||||    
T  29582243 gaagagccaccaataaggacgatatcatc 29582215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8017932 - 8017873
Alignment:
Q  292 aaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttg 351  Q
    ||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8017932 aaaattgctgcttgtacagcggcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatactcttg 8017873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Original strand, 8646295 - 8646350
Alignment:
Q  55 gaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaacactaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8646295 gaaccaagcagattgttgtcacttgctcttgctctctcaccctcataaacaataat 8646350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 17259856 - 17259954
Alignment:
Q  258 caccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataa 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |   ||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  17259856 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataa 17259954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 104
Target Start/End: Original strand, 3146682 - 3146731
Alignment:
Q  55 gaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3146682 gaaccaagcagattgttgtcactagctcttgctctctcaccctcataaac 3146731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Original strand, 8616260 - 8616313
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattctt 278  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8616260 gataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcgccaagtttggaacattctt 8616313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 687 - 755
Target Start/End: Original strand, 8609961 - 8610029
Alignment:
Q  687 cttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 755  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8609961 cttccttttgaactccttcacaaagtgattaaccattctgtgatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 8610029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 757
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602088
Alignment:
Q  706 acaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgt 757  Q
    ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgt 8602088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 269
Target Start/End: Original strand, 8609500 - 8609543
Alignment:
Q  226 ataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgg 269  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8609500 ataccaagtgacaaaggtgtaacatctcgcagcaccaagtttgg 8609543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 8673965 - 8673894
Alignment:
Q  467 taagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgag 538  Q
    |||||||| ||||||||||||    |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8673965 taagacaattctcaacagtttccaaacactcgttgaaaagattgatattgatttcctcaaacttggcacgag 8673894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8586453 - 8586407
Alignment:
Q  58 ccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaac 104  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8586453 ccaagcagattgttgtcactagctcttgctctctcaccctcataaac 8586407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 726 - 755
Target Start/End: Original strand, 8538119 - 8538148
Alignment:
Q  726 attatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538119 attatcaaagtcctctcctccaaggtgagt 8538148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 716 - 757
Target Start/End: Original strand, 8559406 - 8559447
Alignment:
Q  716 tcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgt 757  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8559406 tcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgt 8559447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 16658151 - 16657448
Alignment:
Q  177 agtgttccttggaatcaccacactcgtgacatgatcaagacctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattc 276  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  16658151 agtgttcctaggaatcacaacactcatgacatgatcaacatcggctaagataccaagcgacaatggggtaacatctctcaacaccaaatctgggacattc 16658052  T
Q  277 ttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgt 376  Q
    || || ||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||| | ||  ||  ||||| ||    
T  16658051 ttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccgtaagcaacagcttcatccgggttgatacttttgcataaatccttgcccttgaaaaagt 16657952  T
Q  377 cttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaact 476  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||   || |||||||| | ||||||| |    
T  16657951 cttgcaatagatcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcacgaagacaatt 16657852  T
Q  477 ctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaa 576  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16657851 ctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaa 16657752  T
Q  577 tcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgt 676  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |   ||| ||||| ||||    
T  16657751 tctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgt 16657652  T
Q  677 ccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggctttta 776  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16657651 ccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagt-ggctttta 16657553  T
Q  777 cttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcactt 875  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16657552 cctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccgccaaggtcaaagacaaaaata-ttccgtttaccat-cacaatcactt 16657455  T
Q  876 ctcttgt 882  Q
    |||||||    
T  16657454 ctcttgt 16657448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 225 - 853
Target Start/End: Original strand, 43624994 - 43625622
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  43624994 gataccaagtgacaaaggggtaacatctcgcagcaccaattttggaacattcttaatgcctttactcaaaatagcagcctggacagctgcaccataagca 43625093  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 424  Q
    |||||||| || ||||| || || | | || |  | ||| ||  |||||  || ||||| |  | ||  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  43625094 acagcctcatcagggtttatgctttcgcatgattccttccccttgaaaaactcctgcaacagctgttttacttttggaattctagaggagccgccaacaa 43625193  T
Q  425 gaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctc 524  Q
    | |||| ||| | ||||  |||| ||   |  || | |||  |||||||||||| |||||||||   |||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  43625194 ggacaacatcgtggatagcactcttgtccaacttggcatcaataagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatc 43625293  T
Q  525 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 624  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||  |  |||||||||| |||||||  ||| |||   |||||||||| |||||||||||| |     
T  43625294 aaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaataccacggaataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcct 43625393  T
Q  625 ctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattc 724  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| || | |   ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |  || || ||| |||||||| |||||||||    
T  43625394 ctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattc 43625493  T
Q  725 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtac 823  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    ||||| | | |||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  43625494 tatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagt-ggctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtac 43625592  T
Q  824 caccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  43625593 caccaccaaggtcaaagatgaaaatatttc 43625622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 225 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 16662578 - 16661950
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  || || | ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16662578 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 16662479  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 424  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||  | ||| |   ||| | ||   ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  16662478 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaa 16662379  T
Q  425 gaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctc 524  Q
    ||||||||||||  | |   | | ||   || ||||||||   || ||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  16662378 gaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttc 16662279  T
Q  525 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 624  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||  |||||| |||| | |||||  | |||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  16662278 aaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcc 16662179  T
Q  625 ctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattc 724  Q
     | ||||| | | ||||||||||||| |||| | |  | || | | | || |||||||| |||||| | || || || |  ||||||||| ||| |||||    
T  16662178 ttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattc 16662079  T
Q  725 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtac 823  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||| ||||| |    
T  16662078 tgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaagt-ggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcc 16661980  T
Q  824 caccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  16661979 caccaccaagatcaaagacaaaaatatttc 16661950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 12245982 - 12245448
Alignment:
Q  235 gacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgt 334  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |   |||| || || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12245982 gacaaaggagtaacatcctgcaacaccaaatttggaacattcttaacatctttactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgt 12245883  T
Q  335 cggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatc 434  Q
    | ||||| || |||||| | ||  | ||| |   ||||| ||| || ||||  | ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||    
T  12245882 cagggttaatgctcttgcacaattccttcccgttgaaaaagtcctgtaatagctgttggactttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatc 12245783  T
Q  435 atcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggca 534  Q
    ||| |||  |||| ||   || |||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| | ||| | |||||||||||| ||     
T  12245782 atctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcc 12245683  T
Q  535 cgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatg 634  Q
    ||| ||||  ||||| | || || || || ||| |||||||||| |||||||  || |  || | |  ||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  12245682 cgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaag 12245583  T
Q  635 caattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaa 734  Q
    || ||||||| ||||| |||| |||     |  ||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  12245582 cagttctcaatctcctcaaggcttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaa 12245483  T
Q  735 gtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgg 769  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12245482 atcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtgg 12245448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 491 - 853
Target Start/End: Original strand, 7542074 - 7542436
Alignment:
Q  491 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggt 590  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||  ||||| | ||||| || || ||| |||||||||| |||||||  ||    
T  7542074 tacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagt 7542173  T
Q  591 ggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttc 690  Q
    ||  || | |   ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||  | || ||||||||||||||||| |||||     
T  7542174 ggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttcttt 7542273  T
Q  691 tttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcg 790  Q
     | |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||  |||   | |    
T  7542274 ctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctattatcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagt-ggccttaacttggaagttgttg 7542372  T
Q  791 cccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    ||||| || || || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  7542373 cccttaatcgttagtaaagacacatcaaaagtgccaccgccaagatcaaaaacaaaaatatttc 7542436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 853
Target Start/End: Original strand, 12234512 - 12234899
Alignment:
Q  466 ctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccct 565  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||| | || || || || |    
T  12234512 ctaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgcctt 12234611  T
Q  566 gatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggtt 665  Q
     | |||||||||| ||||||| ||| |  || | |   ||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||  | ||    
T  12234612 caaataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaagacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatt 12234711  T
Q  666 accactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccacca 765  Q
     ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| |   ||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |     
T  12234712 tccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgagcaaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggct 12234811  T
Q  766 gtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    || |||||| ||||  |||||||  || ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  12234812 gt-ggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggagagacacatcaaaagtgccaccgccgagatcaaaaacaaaaatatttc 12234899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 12259165 - 12258541
Alignment:
Q  227 taccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaac 326  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||   |||  ||||| | |||||| |||||||| || ||| |||| ||    
T  12259165 taccaagagacaaaggtgtaacatcctgcagctccaactttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctac 12259066  T
Q  327 agcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaaga 426  Q
    |||||| || || || || |||||| | ||  ||||| ||  |||||  || || ||||  |  ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||     
T  12259065 agcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaagg 12258966  T
Q  427 acaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaa 526  Q
    |||| |||||| | || |||| ||    | || | |||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  12258965 acaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatccgtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaa 12258866  T
Q  527 acttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccct 626  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | | || || || || | | |||||||||| | |||||  || |  || | |  | |||| ||||  |||||||| ||    
T  12258865 acttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaacaacaagataagaaagtgatctttttgcact 12258766  T
Q  627 ctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattcta 726  Q
    |||||| ||  || |||| ||||| || | | |  | || ||||| || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12258765 ctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattcta 12258666  T
Q  727 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtacca 825  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || || |||| ||||||||   |||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||    
T  12258665 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgt-agccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgcca 12258567  T
Q  826 ccgccaaggtcaaagaccaaaatatt 851  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||    
T  12258566 ccaccaagatcaaagacaaaaatatt 12258541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 467 - 767
Target Start/End: Original strand, 14703232 - 14703532
Alignment:
Q  467 taagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctg 566  Q
    ||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||  ||||| | ||||| || |  ||    
T  14703232 taagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgcattg 14703331  T
Q  567 atataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggtta 666  Q
    | |||||| ||| |||||||  |||| ||| |     ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||||| |||  | ||     
T  14703332 aaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaaggcttttggattt 14703431  T
Q  667 ccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccag 766  Q
    ||||||||||||| | | || ||  | |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  14703432 ccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcag 14703531  T
Q  767 t 767  Q
    |    
T  14703532 t 14703532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 853
Target Start/End: Original strand, 11998992 - 11999604
Alignment:
Q  227 taccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaac 326  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |   |||  || || | ||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  11998992 taccaagagacaaaggagtaacatcctgcaacaccaaatttggaacattcttaacatcttcactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagctac 11999091  T
Q  327 agcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaaga 426  Q
    |||||| || ||||| || |||||| | ||  | ||| |   ||||| ||| || ||||  | ||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||     
T  11999092 agcctcatcagggttaatgctcttgcacaactccttcccgttgaaaaagtcatgtaatagctgttggactttggga-tcctagaagatccaccaacaagt 11999190  T
Q  427 acaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaa 526  Q
    |||| |||||| |||  |||| ||   || |||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| | ||| | ||||||||    
T  11999191 acaacatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaa 11999290  T
Q  527 acttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccct 626  Q
    |||| || ||| ||||  ||||| | || || || || ||| |||||||||| |||||||  || |  || | |  ||| || ||| | |||||||||||    
T  11999291 actttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttgcaacaacaagaaatgatagtattctttttgccct 11999390  T
Q  627 ctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattcta 726  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||     | |||||||| |||||||  |||||  | |||||||| | |||||||||                 
T  11999391 ctcacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttgaacttccactaatatccacttcgttctttatcttgaactcttgtacaaagta------------- 11999477  T
Q  727 ttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtacca 825  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | || ||| || ||||  ||||||| | |||| || || || ||||||| ||| ||||| |||    
T  11999478 ttatcaaaatcctctcctccgaagtgagtgtttccagctgt-ggccttaacttggaagacattgtccttaattgttagtatagacaaatcaaaagtgcca 11999576  T
Q  826 ccgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11999577 ccgccaagatcaaagactaaaatgtttc 11999604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 225 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 4679143 - 4678489
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4679143 gataccaagtgacaatggggtaacatctcgcagcacaaaattcgggacattcttaaaaccttcgctcaaaatagcagcttggatagctgcaccataagca 4679044  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 424  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||  |   |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  4679043 acagcctcatctgggttgatactcttgcacaaatccttccgcttaaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctcgatgaaccacccacaa 4678944  T
Q  425 gaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctc 524  Q
    |||||| |||||| |||| ||||  ||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  4678943 gaacaacatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctc 4678844  T
Q  525 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 624  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  4678843 aaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgcc 4678745  T
Q  625 ctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattc 724  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4678744 ctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattc 4678645  T
Q  725 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtac 823  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4678644 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagt-ggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtac 4678546  T
Q  824 caccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcacttctcttgt 882  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||  |||||||||||||    
T  4678545 caccaccaaggtcaaagacaaatatattt-cgtttacaat-cactttcacttctcttgt 4678489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 853
Target Start/End: Original strand, 15594619 - 15595244
Alignment:
Q  228 accaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaaca 327  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||  || || | |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  15594619 accaagagacaaaggtgcaacatcttgtatcaccaagtttggaacatttttaaaaccttcactcaacaaagcagcctggacagctgcaccataagcaaca 15594718  T
Q  328 gcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaa 427  Q
    ||||| || |||||||| ||| || | ||  | ||  ||  |||||  || | |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |    
T  15594719 gcctcatcagggttgatgctcatgcacaattcctttccctcgaaaaaatccttcaatagttgttgcactttgggaatcctagaagacccaccaacaatga 15594818  T
Q  428 caatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaa 527  Q
    |||||||||  | |  |||| |    || || | |||   |||||||||||||||  | ||  |||| || |||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  15594819 caatatcatttacactactcttattcatcttagcatcatcaagacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaa 15594918  T
Q  528 cttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctc 627  Q
    ||||| |||||| |   ||||| ||||||| || || | | ||||| |||| ||||||| ||| |||||   || ||||||||||  ||||||||||||     
T  15594919 cttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaaataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctt 15595018  T
Q  628 tcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctat 727  Q
    || || ||| ||||||| ||||| ||||   |  |||| ||| |||| |||||||| |||||| | ||||| ||||   |||||||| | |||||||| |    
T  15595019 tcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgt 15595118  T
Q  728 tatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtaccac 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||  ||||| | | |||| || || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15595119 tatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccgcctgt-ggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccac 15595217  T
Q  827 cgccaaggtcaaagaccaaaatatttc 853  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15595218 caccaagatcaaagacaaaaatatttc 15595244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 508 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 34467088 - 34466750
Alignment:
Q  508 tccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaag 607  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||| ||| |||||||||||| |  ||||| || | ||| ||||          
T  34467088 tccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgacaaaag------ 34466995  T
Q  608 agagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctac 707  Q
      |||||||| |||||  |||| || ||| ||||||||||||| || | | |  |||| |||||||| |||   |||| |||| | |||||||||| | |    
T  34466994 --agtgtcctctttgcattctcgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgc 34466897  T
Q  708 aaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggat 807  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||| ||| || |||||||||||||   |||| || |||||||     
T  34466896 aaagtggttcgccattctattatcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagt-ggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggag 34466798  T
Q  808 agacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttcc 854  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34466797 agacacatcaaaagtcccaccaccaaggtcaaagacgaaaatatttcc 34466750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34467367 - 34467255
Alignment:
Q  232 agtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcct 331  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||    
T  34467367 agtgacaatggtgtaacatctcgcagcaccaagtttggaacattgttaaagcctttactcaacaaagcagcttgcacagctgcgacataagcgacagcct 34467268  T
Q  332 cgtcggggttgat 344  Q
    | || ||||||||    
T  34467267 catcagggttgat 34467255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4679307 - 4679255
Alignment:
Q  52 aacgaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4679307 aacgaaccaagcagattgttgtctgttgctcttgctctctcaccctcataaac 4679255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 52549353 - 52549290
Alignment:
Q  470 gacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggc 533  Q
    ||||||| |||||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52549353 gacaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttggc 52549290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 116
Target Start/End: Original strand, 29465291 - 29465328
Alignment:
Q  79 gctcttgctctctcaccctcataaacactaatcaagac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29465291 gctcttgctctctcaccctcatataccctaatcaagac 29465328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 222 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 9336480 - 9335824
Alignment:
Q  222 tgcgataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| || ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9336480 tgcgataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttgggcgcattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccataa 9336381  T
Q  322 gcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccaccca 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | || ||||  | ||| ||  |||||  ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9336380 gcaacagcctcatctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagttcttgcactttcggaatcctagacgagccaccca 9336281  T
Q  422 caagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttc 521  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||| || |||||  | |||||| | ||  |||||||||| ||||  ||||| |||| |||    
T  9336280 caagaacaatatcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttc 9336181  T
Q  522 ctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtccttttt 621  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  9336180 ctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagacagtatccttttt 9336081  T
Q  622 gccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcacca 721  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | ||||    
T  9336080 gccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaacca 9335981  T
Q  722 ttctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaag 820  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  9335980 ttctgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggt-ggcttttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaag 9335882  T
Q  821 taccaccgccaaggtcaaagaccaaaatatttccgtttaccatccacagtcacttctctt 880  Q
    |||| || || || |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  9335881 taccgccacccagatcaaagacaaaaatattt-cggttaccat-cacagtcatttctctt 9335824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 226 - 851
Target Start/End: Original strand, 30774835 - 30775460
Alignment:
Q  226 ataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagcaa 325  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  ||||  || || | |||||| || | |||||| || | |||||    
T  30774835 ataccaagtgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagcaa 30774934  T
Q  326 cagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaag 425  Q
    | ||||| || || ||||| |||||| | ||| | ||| |   ||| |  |   ||||||  || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  30774935 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 30775034  T
Q  426 aacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctca 525  Q
    |||||||||||| | |  |||| ||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30775035 aacaatatcatctacactactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctca 30775134  T
Q  526 aacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccc 625  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||  | ||| |||||  ||| | ||||||    ||||  ||    || ||||||||||||||||||     
T  30775135 aacttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 30775234  T
Q  626 tctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattct 725  Q
    | ||||||||| ||||||||   || || | | |  | || ||  |||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||  ||| ||||||    
T  30775235 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattct 30775334  T
Q  726 attatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatc-aaagtacc 824  Q
     ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||  |  | ||||| || | ||||||||| ||||| ||    
T  30775335 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagt-tgctttaacttcaaacacatcatctctaatggtgagaagagacacatcaaaagtccc 30775433  T
Q  825 accgccaaggtcaaagaccaaaatatt 851  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  30775434 accaccaagatcaaagacaaaaatatt 30775460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 667 - 761
Target Start/End: Original strand, 35132472 - 35132566
Alignment:
Q  667 ccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcc 761  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  35132472 ccactaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttcc 35132566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 469 - 578
Target Start/End: Original strand, 35132283 - 35132392
Alignment:
Q  469 agacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgat 568  Q
    ||||||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | || || || || |||     
T  35132283 agacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgccttgaa 35132382  T
Q  569 ataaagaatc 578  Q
    ||||||||||    
T  35132383 ataaagaatc 35132392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 469 - 762
Target Start/End: Original strand, 28219744 - 28220037
Alignment:
Q  469 agacaactctcaacagtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgat 568  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| || || || | |     
T  28219744 agacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctcaaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaa 28219843  T
Q  569 ataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttacc 668  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||| | |   ||| ||    
T  28219844 ataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgctctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttcc 28219943  T
Q  669 actaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcca 762  Q
    | |||||||||| || |||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28219944 agtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttcca 28220037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 28219500 - 28219625
Alignment:
Q  225 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 324  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||  || || | |||||| || | ||||||||||||||||    
T  28219500 gataccaagagacaaaggtgtaacatcttgcagcaccaacttcggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagca 28219599  T
Q  325 acagcctcgtcggggttgatactctt 350  Q
    |||||||| || ||||| || |||||    
T  28219600 acagcctcatcagggttaatgctctt 28219625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 105
Target Start/End: Original strand, 28219336 - 28219386
Alignment:
Q  55 gaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaaca 105  Q
    ||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28219336 gaaccaagcagattgttgtcacttgcttttgctctctcaccctcataaaca 28219386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 394 - 762
Target Start/End: Original strand, 43744567 - 43744935
Alignment:
Q  394 actttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtac 493  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||   ||| ||   || || | |||  ||||||||||||||||| ||||   ||    
T  43744567 acttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagcgctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaac 43744666  T
Q  494 actcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggt 593  Q
    |||| || || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || | |||| || || |||| | |||||||||| |||||||  |||||    
T  43744667 actcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggt 43744766  T
Q  594 gactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttcttt 693  Q
    ||| | ||||||||| | |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| | | |  |||| ||| |||||||||| || ||||||||     
T  43744767 gacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttc 43744866  T
Q  694 ttgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcca 762  Q
    || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43744867 ttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttcca 43744935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 839
Target Start/End: Original strand, 12528158 - 12528700
Alignment:
Q  297 agcagcttgaatagctgcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcact 396  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | ||  ||  |||||  || |||||||  |  | ||||    
T  12528158 agcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaactcctgcaatagctgcttcact 12528257  T
Q  397 ttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatgactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacagtttttgtacact 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |  |||| ||   || || | |||| | | |||||| ||||| || |   ||||||    
T  12528258 ttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaactttcaacggtctccatacact 12528357  T
Q  497 cattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgatataaagaatcgacctcaacggtggtgac 596  Q
      | ||| || |||||||| | || ||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||| | ||| || ||| |  ||||  || |   |    
T  12528358 tttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgccctcacatatagcatctatgtcaattgtagcctc 12528457  T
Q  597 taaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacatgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttttg 696  Q
    |  | |  | || ||||||||||| ||| |||| ||   | ||||||| ||||||| || |||   ||| ||| ||||||| ||||| |||||| | ||     
T  12528458 tgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaactttgttcttcctctta 12528557  T
Q  697 aactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccaccagtgggcttttacttcaaagacatcgcccttg 796  Q
    ||||| |  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| || ||||| |||||||    |||     
T  12528558 aactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagt-ggccttgacttcgaagacattattcttt 12528656  T
Q  797 atggtaaggatagacacatc-aaagtaccaccgccaaggtcaaa 839  Q
    |  ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12528657 actgtaagaagagacacatcaaaagttccaccgccaaggtcaaa 12528700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 104
Target Start/End: Original strand, 43744234 - 43744283
Alignment:
Q  55 gaaccaagcagattgttgtcttgcgctcttgctctctcaccctcataaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43744234 gaaccaagcagattgttgtcacttgctcttgctctctcaccctcataaac 43744283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University