View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5800_low_9 (Length: 247)

Name: NF5800_low_9
Description: NF5800
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5800_low_9
NF5800_low_9
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (16-232)||(2041-2257)
scaffold0234 (16-232)||(10932-11148)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (12-232)||(25706-25926)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (16-232)||(22171758-22171974)
chr8 (17-232)||(21940936-21941151)
chr8 (16-232)||(15326469-15326685)
chr8 (16-232)||(15506838-15507054)
chr8 (16-232)||(6094394-6094610)
chr8 (16-232)||(24642920-24643135)
chr8 (16-157)||(28548393-28548534)
chr8 (131-229)||(24797224-24797321)
chr8 (16-232)||(8371253-8371465)
chr8 (83-227)||(14983710-14983852)
chr8 (16-232)||(12562213-12562425)
chr8 (16-232)||(21969423-21969635)
chr8 (16-232)||(22659494-22659706)
chr8 (16-232)||(25611285-25611497)
chr8 (16-232)||(27007517-27007729)
chr8 (16-232)||(27014660-27014872)
chr8 (16-232)||(27880487-27880699)
chr8 (16-232)||(28020668-28020880)
chr8 (16-232)||(22130609-22130821)
chr8 (16-232)||(45534273-45534485)
chr8 (16-232)||(21916766-21916978)
chr8 (16-232)||(26240574-26240786)
chr8 (32-232)||(38232115-38232313)
chr8 (101-232)||(8781959-8782087)
chr8 (26-123)||(24796731-24796826)
chr8 (16-232)||(6430976-6431188)
chr8 (32-219)||(20535226-20535409)
chr8 (113-232)||(18835440-18835556)
chr8 (16-174)||(2962932-2963089)
chr8 (11-129)||(36970439-36970556)
chr8 (12-129)||(2375411-2375528)
chr8 (43-165)||(29645675-29645797)
chr8 (16-77)||(8968015-8968076)
chr8 (57-177)||(32872609-32872729)
chr8 (28-76)||(41368106-41368154)
chr8 (28-76)||(41375077-41375125)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (16-232)||(17684189-17684405)
chr6 (16-232)||(17691160-17691376)
chr6 (16-232)||(27296900-27297116)
chr6 (16-232)||(27380972-27381188)
chr6 (16-232)||(27471355-27471571)
chr6 (16-232)||(11651994-11652210)
chr6 (16-232)||(29309161-29309377)
chr6 (16-232)||(29316121-29316336)
chr6 (17-232)||(16559193-16559408)
chr6 (20-231)||(25536915-25537126)
chr6 (16-232)||(188697-188913)
chr6 (16-232)||(16394165-16394381)
chr6 (33-174)||(13359010-13359152)
chr6 (16-232)||(1586108-1586320)
chr6 (16-232)||(27508347-27508559)
chr6 (16-232)||(16789161-16789373)
chr6 (16-232)||(22859888-22860100)
chr6 (38-232)||(10359073-10359262)
chr6 (30-232)||(27527947-27528145)
chr6 (16-232)||(14074570-14074782)
chr6 (16-232)||(8613005-8613221)
chr6 (16-129)||(33317055-33317167)
chr6 (26-177)||(2669616-2669768)
chr6 (85-232)||(8510194-8510338)
chr6 (60-232)||(18019885-18020053)
chr6 (101-232)||(20736413-20736541)
chr6 (113-232)||(21994678-21994794)
chr6 (94-157)||(28172899-28172963)
chr6 (16-230)||(17120505-17120715)
chr6 (33-172)||(28756145-28756283)
chr6 (119-177)||(17850321-17850379)
chr6 (113-206)||(19218540-19218630)
chr6 (113-232)||(4073666-4073781)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (16-232)||(24695186-24695402)
chr5 (16-232)||(19714218-19714434)
chr5 (16-232)||(18569581-18569797)
chr5 (16-232)||(19706939-19707154)
chr5 (12-190)||(27347252-27347428)
chr5 (16-123)||(24701950-24702057)
chr5 (16-232)||(17298621-17298835)
chr5 (16-232)||(17285470-17285684)
chr5 (138-232)||(39538859-39538953)
chr5 (16-232)||(22941340-22941552)
chr5 (16-232)||(12789663-12789875)
chr5 (16-232)||(20941117-20941329)
chr5 (16-232)||(25805385-25805597)
chr5 (16-232)||(31096906-31097118)
chr5 (16-232)||(31989-32201)
chr5 (16-232)||(23546012-23546224)
chr5 (16-232)||(24933306-24933518)
chr5 (28-206)||(20100255-20100429)
chr5 (103-228)||(18806483-18806606)
chr5 (103-228)||(18806663-18806786)
chr5 (103-228)||(18806843-18806966)
chr5 (16-232)||(5097741-5097953)
chr5 (12-101)||(28719471-28719558)
chr5 (16-232)||(12764990-12765206)
chr5 (16-233)||(18829281-18829498)
chr5 (16-232)||(7865430-7865646)
chr5 (16-232)||(9811733-9811949)
chr5 (16-232)||(12703874-12704090)
chr5 (12-232)||(26129689-26129905)
chr5 (16-97)||(39538954-39539035)
chr5 (149-232)||(22546872-22546952)
chr5 (16-232)||(26245192-26245404)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (16-232)||(8858438-8858654)
chr4 (16-232)||(18262483-18262699)
chr4 (16-232)||(18269344-18269560)
chr4 (16-232)||(26963911-26964127)
chr4 (16-232)||(26970734-26970950)
chr4 (16-232)||(55612954-55613170)
chr4 (16-232)||(868868-869084)
chr4 (16-232)||(19926480-19926696)
chr4 (16-232)||(5707591-5707807)
chr4 (16-232)||(5714219-5714435)
chr4 (16-232)||(10621053-10621269)
chr4 (16-232)||(28392854-28393070)
chr4 (16-232)||(8845474-8845690)
chr4 (16-232)||(10628132-10628348)
chr4 (16-232)||(5667849-5668063)
chr4 (16-232)||(35223831-35224047)
chr4 (16-232)||(4426336-4426540)
chr4 (16-232)||(10677303-10677518)
chr4 (16-232)||(10890943-10891158)
chr4 (12-228)||(20311567-20311781)
chr4 (16-232)||(15461587-15461799)
chr4 (16-232)||(34975641-34975853)
chr4 (16-232)||(2677103-2677315)
chr4 (16-232)||(15815111-15815323)
chr4 (16-232)||(18111043-18111255)
chr4 (16-232)||(20244027-20244239)
chr4 (16-232)||(26531703-26531915)
chr4 (32-232)||(19365609-19365806)
chr4 (16-232)||(1941814-1942026)
chr4 (16-232)||(3369023-3369235)
chr4 (16-232)||(4675983-4676195)
chr4 (16-232)||(17299959-17300171)
chr4 (16-232)||(18163252-18163464)
chr4 (117-232)||(21453961-21454075)
chr4 (16-232)||(30040489-30040701)
chr4 (32-232)||(5616485-5616681)
chr4 (16-232)||(5870508-5870720)
chr4 (16-232)||(11421097-11421309)
chr4 (33-232)||(19362500-19362695)
chr4 (16-232)||(9487641-9487853)
chr4 (32-184)||(5528495-5528645)
chr4 (118-232)||(32636574-32636685)
chr4 (32-232)||(9538049-9538244)
chr4 (94-144)||(24701361-24701411)
chr4 (16-149)||(32646523-32646656)
chr4 (44-125)||(9937745-9937826)
chr4 (101-232)||(4546170-4546298)
chr4 (113-184)||(33888672-33888743)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (16-232)||(6110335-6110551)
chr3 (16-232)||(8490766-8490982)
chr3 (16-232)||(16482203-16482419)
chr3 (16-232)||(10579075-10579291)
chr3 (16-232)||(15357306-15357522)
chr3 (16-232)||(15600604-15600820)
chr3 (16-232)||(15607149-15607365)
chr3 (16-232)||(10572312-10572528)
chr3 (16-232)||(15341939-15342155)
chr3 (16-232)||(17780838-17781054)
chr3 (16-232)||(32056619-32056835)
chr3 (16-232)||(18520246-18520462)
chr3 (20-232)||(18522934-18523146)
chr3 (16-232)||(13211573-13211789)
chr3 (16-232)||(13248878-13249094)
chr3 (12-230)||(17199900-17200118)
chr3 (16-232)||(17136624-17136840)
chr3 (16-232)||(13517082-13517294)
chr3 (16-228)||(1647241-1647453)
chr3 (16-232)||(16200701-16200917)
chr3 (16-232)||(29925242-29925458)
chr3 (16-232)||(29974395-29974611)
chr3 (16-232)||(21034328-21034540)
chr3 (16-232)||(15846536-15846748)
chr3 (16-232)||(21398882-21399094)
chr3 (16-232)||(12300000-12300212)
chr3 (16-232)||(20147554-20147766)
chr3 (16-232)||(25978728-25978940)
chr3 (16-232)||(55427111-55427323)
chr3 (16-232)||(14890481-14890693)
chr3 (16-201)||(28088227-28088408)
chr3 (50-232)||(15526843-15527021)
chr3 (34-172)||(24253130-24253267)
chr3 (114-232)||(14147111-14147226)
chr3 (54-169)||(30464147-30464261)
chr3 (16-232)||(11787677-11787889)
chr3 (90-207)||(32280388-32280507)
chr3 (16-232)||(15317176-15317385)
chr3 (113-177)||(36138033-36138097)
chr3 (113-177)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (16-232)||(18252301-18252517)
chr1 (16-232)||(18532234-18532450)
chr1 (16-232)||(27131130-27131345)
chr1 (16-232)||(27310297-27310513)
chr1 (16-232)||(16358755-16358971)
chr1 (16-232)||(3855639-3855855)
chr1 (16-232)||(22641594-22641809)
chr1 (16-232)||(36816354-36816569)
chr1 (16-232)||(27277278-27277493)
chr1 (16-208)||(9916497-9916688)
chr1 (144-232)||(21171081-21171169)
chr1 (16-232)||(19706439-19706651)
chr1 (16-232)||(28134723-28134935)
chr1 (16-232)||(43802365-43802577)
chr1 (16-232)||(20391239-20391451)
chr1 (16-232)||(9456206-9456418)
chr1 (16-232)||(20779645-20779857)
chr1 (16-232)||(22670257-22670469)
chr1 (16-232)||(42816989-42817201)
chr1 (36-232)||(634024-634216)
chr1 (16-232)||(8727757-8727969)
chr1 (16-232)||(22612582-22612794)
chr1 (16-171)||(23507229-23507385)
chr1 (16-187)||(47667485-47667654)
chr1 (16-129)||(28145723-28145835)
chr1 (32-232)||(29096812-29097008)
chr1 (116-219)||(21881475-21881575)
chr1 (103-186)||(24301691-24301774)
chr1 (94-163)||(12014084-12014154)
chr1 (83-163)||(12006332-12006413)
chr1 (183-232)||(22657108-22657157)
chr1 (118-177)||(10852402-10852461)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (16-232)||(7378-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (16-232)||(6654-6870)
scaffold0390 (16-232)||(13670-13886)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (20-232)||(15152714-15152926)
chr7 (16-232)||(29328055-29328271)
chr7 (16-232)||(12751097-12751313)
chr7 (16-232)||(11535782-11535998)
chr7 (16-232)||(11542700-11542916)
chr7 (16-232)||(12738807-12739023)
chr7 (16-232)||(13392421-13392637)
chr7 (16-232)||(18561278-18561485)
chr7 (10-232)||(18257559-18257778)
chr7 (16-232)||(2365193-2365407)
chr7 (16-232)||(41680968-41681180)
chr7 (16-232)||(2204642-2204854)
chr7 (16-232)||(8465089-8465301)
chr7 (16-232)||(15729841-15730053)
chr7 (16-232)||(18400194-18400406)
chr7 (16-232)||(18407178-18407390)
chr7 (16-232)||(48808496-48808708)
chr7 (16-232)||(18139338-18139550)
chr7 (16-232)||(19230978-19231190)
chr7 (28-232)||(30254228-30254428)
chr7 (16-232)||(18259124-18259336)
chr7 (28-232)||(47166871-47167071)
chr7 (16-232)||(28130651-28130863)
chr7 (16-232)||(34128663-34128875)
chr7 (27-164)||(39112138-39112275)
chr7 (102-233)||(31190524-31190652)
chr7 (38-232)||(24443349-24443539)
chr7 (38-232)||(25845498-25845688)
chr7 (38-232)||(25845917-25846107)
chr7 (16-232)||(10668901-10669114)
chr7 (16-204)||(15169290-15169474)
chr7 (101-178)||(19388697-19388774)
chr7 (54-232)||(19393462-19393636)
chr7 (90-165)||(22948499-22948574)
chr7 (16-232)||(14591940-14592153)
chr7 (16-232)||(16011531-16011744)
chr7 (116-219)||(22969053-22969153)
chr7 (106-170)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (16-232)||(18559-18774)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (16-232)||(21329968-21330184)
chr2 (16-232)||(18796777-18796993)
chr2 (10-232)||(18620075-18620296)
chr2 (16-232)||(36270437-36270650)
chr2 (30-232)||(6991847-6992048)
chr2 (16-232)||(20978146-20978360)
chr2 (28-232)||(18822354-18822556)
chr2 (16-232)||(30174467-30174679)
chr2 (16-232)||(24250032-24250244)
chr2 (16-179)||(17241034-17241196)
chr2 (28-232)||(15342014-15342214)
chr2 (16-232)||(24229215-24229427)
chr2 (16-163)||(22183206-22183354)
chr2 (14-232)||(29800561-29800775)
chr2 (83-163)||(36799745-36799826)
chr2 (114-232)||(40301034-40301148)
chr2 (16-83)||(41661694-41661761)
chr2 (101-206)||(19616551-19616653)
chr2 (41-178)||(41316305-41316441)
chr2 (113-232)||(21626840-21626955)
chr2 (101-177)||(28740910-28740986)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (35-232)||(1264-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-232)||(230111-230327)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (12-232)||(5800-6013)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (28-232)||(12961-13161)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (16-232)||(273-485)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (16-232)||(67374-67586)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (16-232)||(3675-3887)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (16-232)||(119820-120032)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (16-232)||(26632-26844)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (16-206)||(102-288)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (54-232)||(130262-130436)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (44-232)||(8821-9005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (16-232)||(39988-40200)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (113-232)||(8395-8511)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (113-232)||(83111-83227)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (16-174)||(11526-11683)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (16-129)||(53955-54066)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (140-232)||(11332-11421)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2257
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatatt 2257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11148
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatatt 11148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25926
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  212 gatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatatt 25926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171758
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatatt 22171758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940936
Alignment:
Q  17 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  117 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  217 atccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatatt 21940936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326469
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15326485 aatccaatataaatatt 15326469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506838
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15506854 aatccaatataaatatt 15506838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094394
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatataaatatt 6094394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642920
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatatt 24642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797321
Alignment:
Q  131 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaat 24797321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371465
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 8371351  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  8371449 aatccaatataaatatt 8371465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983852
Alignment:
Q  83 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttca 181  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  182 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa 14983852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562213
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  12562229 aatccaatataaatatt 12562213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969423
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  21969439 aatccaatataaatatt 21969423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659706
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 22659592  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| |||| |||||    
T  22659690 aatccagtatacatatt 22659706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611285
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  25611301 aatccaatataaatatt 25611285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007729
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 27007615  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27007713 aatccaatataaatatt 27007729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014872
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 27014758  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27014856 aatccaatataaatatt 27014872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880699
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 27880585  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27880683 aatccaatataaatatt 27880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020880
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 28020766  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  28020864 aatccaatataaatatt 28020880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130821
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 22130707  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  22130805 aatccaatataaatatt 22130821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534485
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 45534371  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  45534469 aatccaatataaatatt 45534485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916766
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 21916880  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||  | || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttacaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  21916782 aatccaatataaatatt 21916766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240574
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  26240590 aatccaatataaatatt 26240574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232313
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  132 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 230  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782087
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  201 ttctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatatt 8782087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  26 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430976
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 6431090  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||| | ||||||||||    
T  6430992 tatctagtataaatatt 6430976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535409
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 219  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatgcaatattctcatggtgggtcaatc 20535409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835440
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||   |||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaac--atactatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatatt 18835440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963089
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcat 2963030  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 174  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgaca 2963089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  11 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 110  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  111 tacatagtggtttcaggtc 129  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  112 acatagtggtttcaggtc 129  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  43 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 142  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  143 caccactatcactatgagaatat 165  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Original strand, 32872609 - 32872729
Alignment:
Q  57 ctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta 156  Q
    |||||| ||||||||||||||     |||||| ||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||  | ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  32872609 ctgttatggacaacgtttgaacaacaacaaagtacttgacttctacatcaaggatagatagtggtttcaaattgaagggtgacatacaccaatatcacta 32872708  T
Q  157 tgagaatatcttatgacactt 177  Q
    ||| ||||  |||||| ||||    
T  32872709 tgataataatttatgatactt 32872729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 76  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 76  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684405
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatatt 17684405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691376
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatatt 17691376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296900
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27296916 aatccaatataaatatt 27296900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381188
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatatt 27381188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471571
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatatt 27471571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651994
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatatt 11651994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309161
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatatt 29309161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316121
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatatt 29316121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559408
Alignment:
Q  17 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  117 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  217 atccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatatt 16559408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537126
Alignment:
Q  20 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  120 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  220 caatataaatat 231  Q
    ||||||||||||    
T  25537115 caatataaatat 25537126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188913
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  188897 aatccaatataaatatt 188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394381
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  16394365 aatccaatataaatatt 16394381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 174
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359152
Alignment:
Q  33 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  133 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgaca 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca 13359152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586320
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 1586206  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  1586304 aatccaatataaatatt 1586320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508559
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcc-acatctagagatcat 27508445  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||| |||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatatt 27508559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789161
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  16789177 aatccaatataaatatt 16789161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860100
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcc-acatctagagatcat 22859986  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  22860084 aatccaatataaatatt 22860100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359262
Alignment:
Q  38 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 137  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  138 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||    
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatatt 10359262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528145
Alignment:
Q  30 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcc-acatctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  130 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 229  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074570
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || | | ||||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagt-ctacatctagggatcat 14074684  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14074586 aatccattataaatatt 14074570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8613005
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  8613024 gtctatccagtataaatatt 8613005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  116 agtggtttcaggtc 129  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669616
Alignment:
Q  26 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 125  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  126 ggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    |||| ||  ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatactt 2669616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510194
Alignment:
Q  85 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa 184  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  185 cttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | ||  |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatatt 8510194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 232
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020053
Alignment:
Q  60 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 159  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  160 gaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18019984 gaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatatt 18020053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736541
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 200  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |   || |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagc--ataatatgtagta 20736509  T
Q  201 ttctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatatt 20736541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994678
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     ||| |||| ||||||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatatt 21994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  94 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 157  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120715
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  216 aatccaatataaata 230  Q
    |||||| ||||||||    
T  17120701 aatccagtataaata 17120715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 172
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  33 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 132  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  133 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 172  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 177
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850379
Alignment:
Q  119 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatactt 17850379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218540
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctca 19218540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073666
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||||||| ||  |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatg--aattttcataac--atattatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatatt 4073666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695402
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatatt 24695402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714434
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatatt 19714434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569797
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18569781 aatccaatataaatatt 18569797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707154
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatatt 19707154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347428
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 190  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  116 agtggttt 123  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298835
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatatt 17298835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285684
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatatt 17285684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538859
Alignment:
Q  138 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatatt 39538859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941340
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  22941356 aatccaatataaatatt 22941340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789875
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 12789761  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  12789859 aatccaatataaatatt 12789875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941117
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20941133 aatccaatataaatatt 20941117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805597
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 25805483  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  25805581 aatccaatataaatatt 25805597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096906
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  31096922 aatccaatataaatatt 31096906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31989
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 32103  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  32005 aatccaatataaatatt 31989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23546012
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 23546126  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  23546028 aatccaatataaatatt 23546012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933518
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 24933404  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  24933502 aatccaatataaatatt 24933518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100429
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 206  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctca 20100429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806606
Alignment:
Q  103 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  202 tctcatggcggatcaatccaatataaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaa 18806606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806786
Alignment:
Q  103 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  202 tctcatggcggatcaatccaatataaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaa 18806786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18806966
Alignment:
Q  103 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  202 tctcatggcggatcaatccaatataaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaa 18806966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097741
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  5097757 aatccaatataaatatt 5097741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765206
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12765088  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | |||||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     || ||||||||||||||||    
T  12765187 gtctatccaatataaatatt 12765206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829498
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 211  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||| |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  212 gatcaatccaatataaatattg 233  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18829477 ggtcaatccaatataaatattg 18829498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865646
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  7865627 gtctatccagtataaatatt 7865646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811949
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 9811831  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     || ||||||||||||||||    
T  9811930 gtctatccaatataaatatt 9811949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704090
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12703972  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     || ||||||||||||||||    
T  12704071 gtctatccaatataaatatt 12704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129905
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 211  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  212 gatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatatt 26129905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 97  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 232
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22546952
Alignment:
Q  149 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgata-tttacataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatatt 22546952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245192
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||| | |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtcc-atatctagagatcat 26245306  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||| |||||||| |  | |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||| | ||||||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatatt 26245192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858438
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatatt 8858438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262483
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatatt 18262483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269344
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatatt 18269344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963911
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatatt 26963911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970734
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatatt 26970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612954
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatatt 55612954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868868
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatatt 868868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926696
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatatt 19926696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707591
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatatt 5707591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714219
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatatt 5714219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621269
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatatt 10621269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393070
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  28393054 aatccaatataaatatt 28393070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845474
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatatt 8845474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628348
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatatt 10628348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668063
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5668047 aatccagtataaatatt 5668063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223831
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  35223847 aatccagtataaatatt 35223831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426540
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatatt 4426540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677518
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatatt 10677518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891158
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatatt 10891158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311567
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 210  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |  || ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  211 ggatcaatccaatataaa 228  Q
     | |||||||||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaa 20311567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461587
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15461603 aatccaatataaatatt 15461587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975641
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 34975755  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  34975657 aatccaatataaatatt 34975641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677103
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 2677217  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  2677119 aatccaatataaatatt 2677103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815111
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 15815225  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15815127 aatccaatataaatatt 15815111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111255
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18111141  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18111239 aatccaatataaatatt 18111255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20244027
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20244141  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20244043 aatccaatataaatatt 20244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531703
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 26531817  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  26531719 aatccaatataaatatt 26531703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365609
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcact-atgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 230  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941814
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 1941928  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  1941830 aatccaatataaatatt 1941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369235
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatcaagagatcat 3369121  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||| |||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatatt 3369235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676195
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 4676081  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  4676179 aatccaatataaatatt 4676195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300171
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 17300057  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  17300155 aatccaatataaatatt 17300171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163252
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18163366  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18163268 aatccaatataaatatt 18163252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454075
Alignment:
Q  117 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 216  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  217 atccaatataaatatt 232  Q
    || |||||||||||||    
T  21454060 attcaatataaatatt 21454075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040701
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||| | ||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatatt 30040701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616485
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 231  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870508
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  5870524 aatccaatataaatatt 5870508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421097
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatt 11421097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362500
Alignment:
Q  33 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 132  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  133 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487641
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| ||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatatt 9487641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528645
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa 184  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa 5528645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636574
Alignment:
Q  118 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 217  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  218 tccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||    
T  32636588 tccaatataaatatt 32636574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538049
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 231  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  94 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 144  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646656
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 149  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccact 32646656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  44 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546170
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagta 4546202  T
Q  201 ttctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| || || ||  |||| ||||||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatatt 4546170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888672
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa 184  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataa 33888672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110335
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatatt 6110335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490766
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatatt 8490766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482419
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatatt 16482419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579291
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatatt 10579291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357522
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    || ||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatatt 15357522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600820
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatatt 15600820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607365
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatatt 15607365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572528
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatatt 10572528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342155
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatatt 15342155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781054
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatatt 17781054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056835
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatatt 32056835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520246
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatatt 18520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522934
Alignment:
Q  20 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  120 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  220 caatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||    
T  18522946 caatataaatatt 18522934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211573
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatatt 13211573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248878
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatatt 13248878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200118
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  212 gatcaatccaatataaata 230  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaata 17200118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136624
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatataaatatt 17136624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517082
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgg----ggccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatatt 13517082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647453
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  216 aatccaatataaa 228  Q
    |||| ||||||||    
T  1647441 aatcaaatataaa 1647453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200701
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatatt 16200701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925242
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatataaatatt 29925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974395
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatataaatatt 29974395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034328
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 21034442  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  21034344 aatccaatataaatatt 21034328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846748
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15846732 aatccaatataaatatt 15846748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398882
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  21398898 aatccaatataaatatt 21398882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12300000
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcc-acatctagagatcat 12300114  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  12300016 aatccaatataaatatt 12300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147766
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20147652  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20147750 aatccaatataaatatt 20147766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978940
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 25978826  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| ||||||||||    
T  25978924 tatccagtataaatatt 25978940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427111
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 55427225  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  55427127 aatccaatataaatatt 55427111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890481
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  14890497 aatccaatataaatatt 14890481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088227
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 201  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526843
Alignment:
Q  50 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 149  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  150 atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 15526843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 172
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253267
Alignment:
Q  34 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 133  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaa- 24253228  T
Q  134 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 172  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24253229 tgtggaatacaccgttatcactatgagaataacttatga 24253267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147111
Alignment:
Q  114 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 213  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataac--atactatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  214 tcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14147129 tcaatccagtataaatatt 14147111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  54 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 153  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  154 ctatgagaatatctta 169  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787677
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |   | ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttga-ttatagatctagggatcat 11787791  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| ||||||||||    
T  11787693 tatccagtataaatatt 11787677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280388
Alignment:
Q  90 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataac 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  186 ttttactatgtagtattctcat 207  Q
      | |||||||| |||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcat 32280388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317385
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||| | ||||||||||    
T  15317369 tatctagtataaatatt 15317385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252301
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatatt 18252301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532450
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatataaatatt 18532450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131345
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatatt 27131345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310513
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  27310497 aatccaatataaatatt 27310513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16358971
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  16358955 aatccaatataaatatt 16358971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855855
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  3855839 aatccaatataaatatt 3855855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641809
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||| | ||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatatt 22641809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816569
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataat-ttttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatataaatatt 36816569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277493
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||| | ||||||||||    
T  27277477 aatctagtataaatatt 27277493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  116 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 232
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171169
Alignment:
Q  144 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 21171169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706651
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 19706537  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  19706635 aatccaatataaatatt 19706651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28134935
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  28134919 aatccaatataaatatt 28134935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802577
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 43802463  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  43802561 aatccaatataaatatt 43802577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391451
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20391435 aatccaatataaatatt 20391451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456206
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 9456320  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  9456222 aatccaatataaatatt 9456206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779857
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20779743  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  20779841 aatccaatataaatatt 20779857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670469
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 22670355  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  22670453 aatccaatataaatatt 22670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817201
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 42817087  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  42817185 aatccaatataaatatt 42817201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634024
Alignment:
Q  36 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 135  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  136 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatatt 634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727757
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8727773 aatccagtataaatatt 8727757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612582
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatatt 22612582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507229
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatg 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg 23507229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667654
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 47667583  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactt 187  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataactt 47667654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  116 agtggtttcaggtc 129  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096812
Alignment:
Q  32 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 131  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  132 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 231  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881575
Alignment:
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  216 aatc 219  Q
    ||||    
T  21881572 aatc 21881575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301774
Alignment:
Q  103 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataact 186  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataact 24301774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014154
Alignment:
Q  94 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 163  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaat 12014154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  83 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 163  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657157
Alignment:
Q  183 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatatt 22657157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  118 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7378
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatatt 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6870
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatatt 6870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13886
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatatt 13886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152714
Alignment:
Q  20 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  120 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  220 caatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||    
T  15152726 caatataaatatt 15152714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29328055
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatatt 29328055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751097
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatataaatatt 12751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11535998
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatatt 11535998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542916
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatatt 11542916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738807
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatatt 12738807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392421
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13392437 aatccagtataaatatt 13392421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561278
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatataaatatt 18561278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257778
Alignment:
Q  10 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 109  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagg 18257657  T
Q  110 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 209  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgac--atactatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  210 cggatcaatccaatataaatatt 232  Q
     || | |||||||||||||||||    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatatt 18257778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365193
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataac--ttcctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatatt 2365193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681180
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  41681164 aatccagtataaatatt 41681180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204642
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 2204756  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  2204658 aatccaatataaatatt 2204642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8465089
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  8465105 aatccaatataaatatt 8465089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729841
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 15729955  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  15729857 aatccaatataaatatt 15729841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400194
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18400308  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18400210 aatccaatataaatatt 18400194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407178
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18407292  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18407194 aatccaatataaatatt 18407178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808708
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 48808594  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  48808692 aatccaatataaatatt 48808708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139550
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcc-acatctagagatcat 18139436  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatatt 18139550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230978
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcc-acatttagggatcat 19231092  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttattatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19230994 aatccagtataaatatt 19230978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254228
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  228 atatt 232  Q
    |||||    
T  30254232 atatt 30254228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259336
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| ||||||||||    
T  18259320 tatccagtataaatatt 18259336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167071
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  228 atatt 232  Q
    |||||    
T  47167067 atatt 47167071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130651
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  28130667 aatccagtataaatatt 28130651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128663
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| ||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatatt 34128663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  27 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  127 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 164  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190652
Alignment:
Q  102 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 201  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  202 tctcatggcggatcaatccaatataaatattg 233  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattg 31190652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443539
Alignment:
Q  38 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 137  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  138 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || || | |||| | ||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatatt 24443539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845688
Alignment:
Q  38 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 137  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  138 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatatt 25845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846107
Alignment:
Q  38 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 137  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  138 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatatt 25846107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669114
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcc-acatttacggatcat 10668999  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatc-actatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | |||| | |  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||| | ||||||||||    
T  10669097 caatctagtataaatatt 10669114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 204  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388697
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 178  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacacttt 19388697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393636
Alignment:
Q  54 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 153  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  154 ctatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
     | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatatt 19393636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 165
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  90 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 165  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14592153 - 14591940
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  14592153 catgattcatcaagtacccattagccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 14592054  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || || ||    
T  14592053 agtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataac--aaactgtgtagtattctcacggtgggtc 14591957  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14591956 aatccagtataaatatt 14591940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16011744 - 16011531
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  16011744 catgattcatcaagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 16011645  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| || ||    
T  16011644 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--aaactgtatagtattctcatggtgggtc 16011548  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16011547 aatccagtataaatatt 16011531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969053
Alignment:
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  216 aatc 219  Q
    ||||    
T  22969056 aatc 22969053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  106 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 170  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18559
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatatt 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330184
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatatt 21330184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796777
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatatt 18796777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620075
Alignment:
Q  10 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  110 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacac-tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  210 cggatcaatccaatataaatatt 232  Q
     || |||||| | ||||||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatatt 18620075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270437
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||  ||| |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36270454 caatccaatataaatatt 36270437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992048
Alignment:
Q  30 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  129 cgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcac-ttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  228 atatt 232  Q
    |||||    
T  6992044 atatt 6992048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978146
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 214  Q
    ||| || ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataa--ttttccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  215 caatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatatt 20978146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822354
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgaga-tctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  227 aatatt 232  Q
    ||||||    
T  18822359 aatatt 18822354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174467
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 30174581  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  30174483 aatccaatataaatatt 30174467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250244
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcc-acatctagagatcat 24250130  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  24250228 aatccaatataaatatt 24250244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 179  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342214
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  228 atatt 232  Q
    |||||    
T  15342210 atatt 15342214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229427
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24229411 aatccagtataaatatt 24229427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 163
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183354
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 163  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaat 22183354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800561
Alignment:
Q  14 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtac 113  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  114 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  214 tcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtataaatatt 29800561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  83 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 163  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 232
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301148
Alignment:
Q  114 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  214 tcaatccaatataaatatt 232  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatatt 40301148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616551
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagta 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  201 ttctca 206  Q
    ||||||    
T  19616556 ttctca 19616551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316441
Alignment:
Q  41 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 140  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  141 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 178  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacacttt 41316441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626840
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||   |||||||||||||||| ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatatt 21626840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  101 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 177  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1264
Alignment:
Q  35 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 134  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  135 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatatt 1264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230327
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatatt 230327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5800
Alignment:
Q  12 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  112 acatagtggtttcaggtcg-aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacac-ttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaat---------gcactatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  210 cggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatatt 5800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13161
Alignment:
Q  28 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 127  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  128 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 227  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| || || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  228 atatt 232  Q
    |||||    
T  13157 atatt 13161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 273
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  289 aatccaatataaatatt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67586
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  67570 aatccaatataaatatt 67586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3887
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 3773  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  3871 aatccaatataaatatt 3887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119820
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 119934  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  119836 aatccaatataaatatt 119820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26632
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||| ||||||||||    
T  26648 aatccagtataaatatt 26632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130436
Alignment:
Q  54 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 153  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  154 ctatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatatt 130436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8821
Alignment:
Q  44 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 143  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  144 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatatt 8821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40200
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 215  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  | || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  216 aatccaatataaatatt 232  Q
    |||||  ||||||||||    
T  40184 aatccggtataaatatt 40200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8395
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     |||||||||||||||||||    
T  8414 gtcaatccaatataaatatt 8395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 232
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83227
Alignment:
Q  113 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 212  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  213 atcaatccaatataaatatt 232  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatatt 83227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11683
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  116 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 174  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgaca 11683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53955
Alignment:
Q  16 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  116 agtggtttcaggtc 129  Q
    ||||||||||||||    
T  53968 agtggtttcaggtc 53955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11332
Alignment:
Q  140 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 232  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||    
T  11421 atacaccattatcactattagaataacttataaca-tcttcataacat--actatgtagtattctcatggtgggtaaatccatcataaatatt 11332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University