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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5809_high_23 (Length: 222)

Name: NF5809_high_23
Description: NF5809
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5809_high_23
NF5809_high_23
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-204)||(53895561-53895764)
chr4 (1-205)||(30218162-30218369)
chr4 (6-204)||(20948930-20949126)
chr4 (9-205)||(4838920-4839115)
chr4 (9-205)||(5273346-5273541)
chr4 (9-205)||(22047864-22048059)
chr4 (9-164)||(9417217-9417372)
chr4 (24-203)||(55326961-55327139)
chr4 (11-205)||(21677453-21677646)
chr4 (26-205)||(33110503-33110681)
chr4 (9-203)||(52618688-52618880)
chr4 (9-205)||(323621-323816)
chr4 (25-203)||(19247628-19247804)
chr4 (10-201)||(40995332-40995521)
chr4 (9-203)||(26069913-26070105)
chr4 (25-203)||(1188150-1188326)
chr4 (9-203)||(35416480-35416672)
chr4 (9-203)||(42532670-42532864)
chr4 (11-203)||(46691823-46692013)
chr4 (9-203)||(26373415-26373606)
chr4 (108-203)||(6640162-6640259)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (9-205)||(36083940-36084136)
chr1 (9-205)||(12168000-12168195)
chr1 (9-205)||(33491982-33492177)
chr1 (9-205)||(38121716-38121911)
chr1 (9-205)||(39000965-39001160)
chr1 (10-205)||(49249247-49249441)
chr1 (9-203)||(432125-432317)
chr1 (9-203)||(9667480-9667672)
chr1 (25-203)||(11738598-11738774)
chr1 (9-203)||(15161612-15161805)
chr1 (9-203)||(44505052-44505245)
chr1 (9-203)||(40999888-41000080)
chr1 (9-205)||(8996046-8996240)
chr1 (9-203)||(16832567-16832759)
chr1 (7-203)||(13217831-13218022)
chr1 (9-131)||(16130762-16130883)
chr1 (33-205)||(9268819-9268989)
chr1 (102-203)||(13830472-13830571)
chr1 (140-203)||(39454291-39454354)
chr1 (147-203)||(6244380-6244436)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (9-205)||(3544662-3544858)
chr7 (1-205)||(2477842-2478046)
chr7 (9-205)||(24482929-24483124)
chr7 (9-205)||(10346089-10346284)
chr7 (7-205)||(2631579-2631776)
chr7 (9-205)||(8107672-8107867)
chr7 (9-205)||(23795277-23795472)
chr7 (9-205)||(31158060-31158255)
chr7 (9-203)||(1274773-1274965)
chr7 (7-203)||(22909303-22909497)
chr7 (6-205)||(29032575-29032762)
chr7 (9-203)||(2797347-2797539)
chr7 (9-203)||(19471974-19472166)
chr7 (9-203)||(22321585-22321777)
chr7 (9-203)||(31878785-31878977)
chr7 (9-203)||(31664279-31664471)
chr7 (9-203)||(12090244-12090437)
chr7 (9-203)||(12191028-12191219)
chr7 (11-203)||(6172701-6172891)
chr7 (9-203)||(45500495-45500687)
chr7 (9-203)||(12184051-12184242)
chr7 (77-203)||(22818597-22818721)
chr7 (9-90)||(22820401-22820482)
chr7 (64-163)||(1954172-1954270)
chr7 (160-200)||(29864599-29864639)
chr7 (25-57)||(31882440-31882472)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (9-205)||(5988786-5988981)
chr6 (1-205)||(21631365-21631569)
chr6 (9-205)||(34006685-34006880)
chr6 (9-205)||(3539230-3539425)
chr6 (9-205)||(9932589-9932784)
chr6 (9-205)||(25977132-25977327)
chr6 (9-205)||(26515212-26515407)
chr6 (9-204)||(14270856-14271050)
chr6 (9-205)||(24879048-24879243)
chr6 (9-203)||(13173608-13173800)
chr6 (9-203)||(13182141-13182333)
chr6 (9-205)||(1454979-1455169)
chr6 (9-205)||(1466671-1466861)
chr6 (73-204)||(32821983-32822114)
chr6 (9-203)||(21596312-21596504)
chr6 (9-203)||(24161040-24161232)
chr6 (25-203)||(34913874-34914050)
chr6 (9-203)||(16698095-16698287)
chr6 (9-203)||(32806547-32806739)
chr6 (1-205)||(15642600-15642804)
chr6 (1-203)||(26604524-26604726)
chr6 (108-205)||(9518324-9518422)
chr6 (140-199)||(25541287-25541346)
chr6 (140-203)||(6867966-6868029)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-205)||(14367-14571)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (23-205)||(14700825-14701007)
chr2 (9-205)||(28457661-28457855)
chr2 (28-203)||(9786907-9787082)
chr2 (1-164)||(40200162-40200325)
chr2 (9-205)||(29223897-29224092)
chr2 (9-205)||(29337196-29337391)
chr2 (1-164)||(31758500-31758663)
chr2 (7-205)||(27257568-27257764)
chr2 (9-203)||(43991710-43991903)
chr2 (9-203)||(23924816-23925008)
chr2 (9-203)||(36667653-36667845)
chr2 (11-203)||(13230128-13230318)
chr2 (9-200)||(21160154-21160343)
chr2 (9-204)||(41977779-41977972)
chr2 (9-137)||(36557346-36557474)
chr2 (25-203)||(36040062-36040239)
chr2 (11-203)||(42700759-42700949)
chr2 (1-205)||(24662905-24663109)
chr2 (9-203)||(32523114-32523306)
chr2 (170-205)||(36557465-36557500)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (9-205)||(49434279-49434475)
chr3 (6-201)||(2357348-2357541)
chr3 (1-205)||(26335290-26335494)
chr3 (9-205)||(7653006-7653201)
chr3 (9-204)||(33248173-33248367)
chr3 (9-205)||(10385854-10386049)
chr3 (9-205)||(52307869-52308064)
chr3 (9-205)||(3588583-3588778)
chr3 (9-205)||(9989579-9989773)
chr3 (7-203)||(37471469-37471663)
chr3 (9-203)||(27850335-27850527)
chr3 (9-203)||(48167978-48168170)
chr3 (9-202)||(4742787-4742977)
chr3 (26-203)||(37022874-37023049)
chr3 (9-203)||(1232275-1232467)
chr3 (9-203)||(20837279-20837471)
chr3 (9-203)||(22097852-22098044)
chr3 (9-205)||(36469220-36469414)
chr3 (25-203)||(45527832-45528009)
chr3 (9-203)||(23194108-23194297)
chr3 (74-205)||(8615686-8615816)
chr3 (9-170)||(20963040-20963200)
chr3 (162-205)||(23385579-23385622)
chr3 (147-203)||(17405041-17405097)
chr3 (165-200)||(23411714-23411749)
chr3 (9-67)||(8625943-8626001)
chr3 (61-128)||(23411748-23411814)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-205)||(16958734-16958938)
chr8 (9-199)||(22222459-22222648)
chr8 (9-205)||(22233634-22233829)
chr8 (9-205)||(8743067-8743262)
chr8 (9-199)||(22228801-22228990)
chr8 (9-205)||(9067951-9068146)
chr8 (9-205)||(11308771-11308966)
chr8 (7-205)||(22243025-22243222)
chr8 (9-205)||(28370276-28370471)
chr8 (1-164)||(21692669-21692832)
chr8 (9-204)||(28925927-28926121)
chr8 (9-205)||(41577115-41577310)
chr8 (9-204)||(27348210-27348404)
chr8 (9-203)||(13510149-13510341)
chr8 (9-203)||(13599679-13599871)
chr8 (9-203)||(22180787-22180979)
chr8 (9-205)||(3298985-3299179)
chr8 (9-203)||(4861735-4861927)
chr8 (9-203)||(34006557-34006748)
chr8 (6-176)||(13849110-13849278)
chr8 (9-167)||(17993087-17993244)
chr8 (73-205)||(16580268-16580399)
chr8 (25-203)||(12538343-12538525)
chr8 (1-203)||(1607470-1607672)
chr8 (23-136)||(36737004-36737115)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (9-205)||(7315387-7315582)
chr5 (9-205)||(9404607-9404802)
chr5 (9-205)||(11723060-11723255)
chr5 (9-205)||(14344644-14344839)
chr5 (10-205)||(7315148-7315342)
chr5 (9-205)||(16904393-16904588)
chr5 (9-205)||(30606860-30607055)
chr5 (9-203)||(37251689-37251881)
chr5 (9-205)||(34456480-34456673)
chr5 (9-205)||(31846163-31846357)
chr5 (9-205)||(33434786-33434980)
chr5 (9-203)||(27166882-27167074)
chr5 (9-205)||(11766938-11767132)
chr5 (11-203)||(6270075-6270265)
chr5 (9-203)||(34869530-34869722)
chr5 (9-205)||(24835918-24836100)
chr5 (1-105)||(519311-519415)
chr5 (1-205)||(39655812-39656016)
chr5 (25-135)||(32226911-32227020)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (9-205)||(28683-28878)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-205)||(8925-9120)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (9-205)||(25434-25629)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (5-205)||(16253-16451)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (7-203)||(116350-116544)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (9-205)||(768-962)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (9-205)||(11988-12182)
scaffold0298 (9-205)||(15758-15952)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (9-204)||(12272-12458)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (9-203)||(76236-76428)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (9-203)||(6917-7109)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-205)||(12376-12572)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (109-203)||(7248-7341)
scaffold0447 (109-203)||(11862-11955)
scaffold0447 (25-79)||(7340-7394)
scaffold0447 (25-79)||(11954-12008)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (109-203)||(9857-9950)
scaffold0383 (25-79)||(9949-10003)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (155-204)||(35211-35260)
scaffold0160 (11-103)||(35109-35198)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (140-203)||(9364-9427)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53895764 - 53895561
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895764 taaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 53895665  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895664 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 53895565  T
Q  201 aaaa 204  Q
    ||||    
T  53895564 aaaa 53895561  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 30218162 - 30218369
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30218162 taaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc 30218261  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaata---aataagctagaaccatat 197  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  30218262 ttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaacaatattgaataaataataagctagaaccatat 30218361  T
Q  198 attaaaag 205  Q
    ||||||||    
T  30218362 attaaaag 30218369  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20949126 - 20948930
Alignment:
Q  6 gatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttaga 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  20949126 gatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctggaatgaaaactta-gatagattgttattctattcct-aga 20949029  T
Q  106 cccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949028 tccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 20948930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 4838920 - 4839115
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  4838920 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 4839018  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4839019 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 4839115  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 5273346 - 5273541
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  5273346 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 5273444  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273445 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaag 5273541  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22048059 - 22047864
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  22048059 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 22047961  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047960 aaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaataaaacaataaaaacaaaaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 22047864  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Original strand, 9417217 - 9417372
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9417217 ccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttacgatagattgttattctatttcttagatcc 9417316  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  9417317 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 9417372  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 55327139 - 55326961
Alignment:
Q  24 tctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaa 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |    
T  55327139 tctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtcca 55327041  T
Q  124 tatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55327040 tatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaa 55326961  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 21677453 - 21677646
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  21677453 aaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaa 21677551  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677552 aagtatgtgtccatatcattttaaatctcaatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 21677646  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 33110503 - 33110681
Alignment:
Q  26 tagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaata 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  33110503 tagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgataacttaagatagactcttatgtt-tttcctagattcaaaagtatttgtcaata 33110601  T
Q  126 tcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33110602 tcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 33110681  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52618880 - 52618688
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  52618880 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 52618782  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52618781 aaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 52618688  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 323816 - 323621
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  323816 ccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagcgtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 323718  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323717 aaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 323621  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 19247628 - 19247804
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  19247628 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtctat 19247726  T
Q  125 atcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19247727 atcattttgaagctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 19247804  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 40995332 - 40995521
Alignment:
Q  10 caaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccca 109  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  40995332 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattca 40995430  T
Q  110 aaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatta 201  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40995431 aaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatatta 40995521  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26070105 - 26069913
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  26070105 ccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacatacatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 26070007  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26070006 aaaagtctgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 26069913  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1188326 - 1188150
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  1188326 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccat 1188228  T
Q  125 atcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1188227 atcattttgaatctcaataaaacattaaattcaataataacaacaatattaaataaataa-ctagaatcatatattaaa 1188150  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 35416480 - 35416672
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  35416480 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 35416578  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| || ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35416579 aaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaatatcaataatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaa 35416672  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 42532670 - 42532864
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttaga-cc 107  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |    
T  42532670 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttc-tagattc 42532768  T
Q  108 caaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaa-ccatatattaaa 203  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42532769 aaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacccatatattaaa 42532864  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 46691823 - 46692013
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  46691823 aaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtttagagggataacttaagatagattgttattctatttc-tagatttaa 46691921  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46691922 aagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 46692013  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 26373415 - 26373606
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |    
T  26373415 ccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaaggtagattgttattctattt-atagattc 26373513  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26373514 aaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaaca-taaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 26373606  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6640259 - 6640162
Alignment:
Q  108 caaaagtatttgtcaatatcattttgaat-atgaataaagcattaaatacaagaataacaa-caatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6640259 caaaagtatttttcaataacatttcaaatcataaataaagcattaaacacaagaacaataatcaataatgaataaataaattagaaccttatattaaa 6640162  T

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Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36084136 - 36083940
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36084136 ccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattatatttcttagaccc 36084037  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084036 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 36083940  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 12168000 - 12168195
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  12168000 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 12168098  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12168099 aaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 12168195  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 33491982 - 33492177
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  33491982 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 33492080  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33492081 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 33492177  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 38121716 - 38121911
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  38121716 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 38121814  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121815 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 38121911  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 39000965 - 39001160
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  39000965 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 39001063  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001064 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 39001160  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49249441 - 49249247
Alignment:
Q  10 caaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccca 109  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  49249441 caaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattca 49249343  T
Q  110 aaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49249342 aaagtatgtgtccatataattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 49249247  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 432125 - 432317
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  432125 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 432223  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  432224 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaa 432317  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 9667480 - 9667672
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  9667480 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 9667578  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9667579 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaa 9667672  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 11738598 - 11738774
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||| ||    
T  11738598 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaattatgtgtccat 11738696  T
Q  125 atcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11738697 atcattttgaatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 11738774  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15161805 - 15161612
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || | || ||    
T  15161805 ccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatcc 15161707  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatat-gaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15161706 aaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 15161612  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 44505052 - 44505245
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  44505052 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaagatagattgttattctatttc-tagattc 44505150  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaa-ccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44505151 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacccatatattaaa 44505245  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 40999888 - 41000080
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  40999888 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 40999986  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40999987 aaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaagaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 41000080  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 8996046 - 8996240
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  8996046 ccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagcatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 8996144  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8996145 aaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaataataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatattaaaag 8996240  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 16832567 - 16832759
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  16832567 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 16832665  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16832666 aaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatgcaagaatagcaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 16832759  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 13217831 - 13218022
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  13217831 atccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttc-tagat 13217929  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||  |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13217930 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacattaaaggc---aataacaacaatattgaataaat-agctagaaccgtatattaaa 13218022  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16130883 - 16130762
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  16130883 ccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttc-tagattc 16130785  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattt 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||    
T  16130784 aaaagtatgtgtccatatcattt 16130762  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9268989 - 9268819
Alignment:
Q  33 aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcatttt 132  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   || |||| |||||||||||||||||||  ||||     
T  9268989 aaggtgattatcaaagattaaattctatgtctagaatgaacactt-agatagattattattct-gatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttc 9268892  T
Q  133 gaatat-gaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
     ||| |  |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9268891 aaatctcaaataaagctttagatgcaagaataataacaatattgaataaat-agctagaaacatatattaaaag 9268819  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13830571 - 13830472
Alignment:
Q  102 tagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13830571 tagacccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagtattaaatacaataataacaa---tattgaataaataagctagaaccatatatt 13830475  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39454354 - 39454291
Alignment:
Q  140 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39454354 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaa 39454291  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6244436 - 6244380
Alignment:
Q  147 cattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  6244436 cattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatattaaa 6244380  T

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Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 3544662 - 3544858
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3544662 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatcc 3544761  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544762 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 3544858  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2478046 - 2477842
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2478046 taaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc 2477947  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477946 ttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagccttaaatagaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 2477847  T
Q  201 aaaag 205  Q
    |||||    
T  2477846 aaaag 2477842  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24483124 - 24482929
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  24483124 ccaaaagcatta-agtctagattaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagataaattattattctagttcttagaccc 24483026  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24483025 aaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataaactagaaccatattttaaaag 24482929  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 10346089 - 10346284
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10346089 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 10346187  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346188 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 10346284  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2631776 - 2631579
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2631776 atccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagat 2631678  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631677 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 2631579  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 8107672 - 8107867
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  8107672 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 8107770  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107771 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 8107867  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23795472 - 23795277
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  23795472 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 23795374  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23795373 aaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaag 23795277  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 31158060 - 31158255
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  31158060 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 31158158  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158159 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 31158255  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1274965 - 1274773
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  1274965 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 1274867  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1274866 aaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 1274773  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22909497 - 22909303
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22909497 atccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagat 22909399  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22909398 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatatat-agctagaaccatatattaaa 22909303  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 29032575 - 29032762
Alignment:
Q  6 gatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |             ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29032575 gatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaag------------tgataacttaagatatatttttattctatttcttaga 29032662  T
Q  106 cccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29032663 ttcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 29032762  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 2797347 - 2797539
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  2797347 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 2797445  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2797446 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 2797539  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 19471974 - 19472166
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  19471974 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 19472072  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19472073 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 19472166  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 22321585 - 22321777
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  22321585 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttc-tagattc 22321683  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321684 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaata-tgaataaataagctagaaccatatattaaa 22321777  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31878977 - 31878785
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  31878977 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattatatttc-tagattc 31878879  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31878878 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaactgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 31878785  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 31664279 - 31664471
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |    
T  31664279 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaagatagattgttattctagttc-tagattc 31664377  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31664378 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 31664471  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 12090244 - 12090437
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |    
T  12090244 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttc-tagattc 12090342  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaac-aatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12090343 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 12090437  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12191219 - 12191028
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12191219 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 12191121  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  12191120 aaaagtatgtgtccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-atccagaaccatatattaaa 12191028  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6172891 - 6172701
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  6172891 aaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattaaa 6172793  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6172792 aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagcaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 6172701  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 45500495 - 45500687
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  45500495 ccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatacattgttattctatttc-tagattc 45500593  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45500594 aaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataa-ctataaccatatattaaa 45500687  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12184242 - 12184051
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  12184242 ccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtatagagtgataactcaagatagattgttattctatctc-tagattc 12184144  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12184143 aaaagtatgtatccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaacaaat-agctagaaccatatattaaa 12184051  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818597
Alignment:
Q  77 taagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattga 22818623  T
Q  177 ataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22818622 ataaat-agctagaaccatacattaaa 22818597  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22820482 - 22820401
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgtt 90  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22820482 ccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtt 22820401  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1954270 - 1954172
Alignment:
Q  64 tagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaata 163  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||  ||||||||    
T  1954270 tagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaaagcaagaata 1954172  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29864639 - 29864599
Alignment:
Q  160 aataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29864639 aataataataatattgaataaataagctagaaccatatatt 29864599  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 31882472 - 31882440
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatc 57  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31882472 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatc 31882440  T

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Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 5988786 - 5988981
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5988786 ccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttat-ctagttcttagaccc 5988884  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5988885 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 5988981  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21631569 - 21631365
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631569 taaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc 21631470  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21631469 ttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtatt 21631370  T
Q  201 aaaag 205  Q
    |||||    
T  21631369 aaaag 21631365  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34006880 - 34006685
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  34006880 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 34006782  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006781 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 34006685  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3539425 - 3539230
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Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  3539425 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 3539327  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539326 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 3539230  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 9932589 - 9932784
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  9932589 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 9932687  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932688 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 9932784  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25977327 - 25977132
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  25977327 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 25977229  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25977228 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatacaaaaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaag 25977132  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 26515212 - 26515407
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  26515212 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 26515310  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515311 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 26515407  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14271050 - 14270856
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  14271050 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgctattctatttct-agattc 14270952  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14270951 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 14270856  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24879243 - 24879048
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  24879243 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 24879145  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24879144 aaaagtatgtgtccatatcattttgtatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctatagccatatattaaaag 24879048  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 13173608 - 13173800
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  13173608 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 13173706  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13173707 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatattaaa 13173800  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 13182141 - 13182333
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  13182141 ccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 13182239  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13182240 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatattaaa 13182333  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1455169 - 1454979
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||      ||  |    
T  1455169 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaattctat------gattc 1455076  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1455075 aaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaag 1454979  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1466861 - 1466671
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||      ||  |    
T  1466861 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgtaattctat------gattc 1466768  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1466767 aaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaag 1466671  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32822114 - 32821983
Alignment:
Q  73 aacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaata 172  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32822114 aacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaacaata 32822015  T
Q  173 ttgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32822014 ttgaataaataagctagaaccatatattaaaa 32821983  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 21596312 - 21596504
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  21596312 ccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagtttgttattctatttc-tagattc 21596410  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21596411 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 21596504  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 24161040 - 24161232
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  24161040 ccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgagagtgataacttaagatagattattattctatttct-agattc 24161138  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24161139 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataa-ctagaaccatatattaaa 24161232  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34914050 - 34913874
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  34914050 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccat 34913952  T
Q  125 atcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34913951 atcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagcaatattgaataaat-agatagaaccatatattaaa 34913874  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16698287 - 16698095
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  16698287 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataggttgttattctatttc-tagattc 16698189  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16698188 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agttagaaccatatattaaa 16698095  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 32806547 - 32806739
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  32806547 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagatttttattctatttc-tagattc 32806645  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32806646 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaccaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctataaccatatattaaa 32806739  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15642804 - 15642600
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagatta-aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctattt 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||| |||||   ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |     
T  15642804 taaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtctagaatgaaaacata-gatagattattattctaatc 15642706  T
Q  100 cttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 198  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| | || |||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15642705 ct-agatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataataacaatattcaataaataagctagaaccatata 15642607  T
Q  199 ttaaaag 205  Q
    |||||||    
T  15642606 ttaaaag 15642600  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26604726 - 26604524
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagatta-aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctattt 99  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||       
T  26604726 taaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaataaaaacttt-gatagattattattctaacc 26604628  T
Q  100 cttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 198  Q
    || | | |||||||||||| |||||| |||||  ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26604627 ct-acatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataacaatattgaataaataagctagaatcttata 26604529  T
Q  199 ttaaa 203  Q
    |||||    
T  26604528 ttaaa 26604524  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Original strand, 9518324 - 9518422
Alignment:
Q  108 caaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9518324 caaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaattatgaataaataaactagaaccatatattaaaag 9518422  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25541346 - 25541287
Alignment:
Q  140 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatat 199  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25541346 aataaagcaagaaacacaagaataataacaatatttaataaataagctagaaccttatat 25541287  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Original strand, 6867966 - 6868029
Alignment:
Q  140 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  6867966 aataaagcattaaacacaagactaataaaaatatcaaaaaaatgagctagaaccatatattaaa 6868029  T

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Target: scaffold0091 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14571 - 14367
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14571 taaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 14472  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14471 ttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatattgaataaataaactagaaccatatatt 14372  T
Q  201 aaaag 205  Q
    |||||    
T  14371 aaaag 14367  T

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Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14701007 - 14700825
Alignment:
Q  23 ttctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtca 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14701007 ttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctca 14700908  T
Q  123 atatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700907 atatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 14700825  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 28457661 - 28457855
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28457661 ccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaaccc 28457760  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28457761 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcatt--acacaagaataacaacaatattaaataaataagctagaactatatattaaaag 28457855  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Original strand, 9786907 - 9787082
Alignment:
Q  28 gattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatc 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9786907 gattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatc 9787006  T
Q  128 attttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9787007 atattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaa 9787082  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40200325 - 40200162
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40200325 taaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctggaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 40200226  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataa 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  40200225 ttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaggaataa 40200162  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29224092 - 29223897
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  29224092 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 29223994  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29223993 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 29223897  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29337391 - 29337196
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  29337391 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 29337293  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337292 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 29337196  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31758663 - 31758500
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31758663 taaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctggaatgaaaacttaagatagcttgttattctatttc 31758564  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataa 164  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  31758563 ttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 31758500  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27257764 - 27257568
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27257764 atccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaagatagattgttattctatttc-tagat 27257666  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
      |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27257665 ttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatttaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaactatatattaaaag 27257568  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43991903 - 43991710
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |    
T  43991903 ccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctacagtgataacttaagatagattgttattctattttctagattc 43991804  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43991803 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagcaccatatattaaa 43991710  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 23924816 - 23925008
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  23924816 ccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttc-tagattc 23924914  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23924915 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctataaccatatattaaa 23925008  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 36667653 - 36667845
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  36667653 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgcctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 36667751  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36667752 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 36667845  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 13230128 - 13230318
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  13230128 aaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaa 13230226  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13230227 aagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 13230318  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21160343 - 21160154
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  21160343 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttc-tagattc 21160245  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21160244 aaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatatt 21160154  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41977972 - 41977779
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  41977972 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttc-tagattc 41977874  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  41977873 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctaaaatcgtatattaaaa 41977779  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 36557346 - 36557474
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36557346 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattc 36557445  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaata 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36557446 aaaagtatttgtcaatatcatattgaata 36557474  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 36040062 - 36040239
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||    
T  36040062 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctattt-atagattcaaaagtatgtgtccat 36040160  T
Q  125 atcattttgaatatgaat-aaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| | ||| |||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36040161 atcattttgaatctcaataaaaaaaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 36040239  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 42700759 - 42700949
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  42700759 aaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacttccatgtctagagtgataacttaatatagattgttattctatttc-tagattcaa 42700857  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  42700858 aagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattaaacaaat-agctagaaccatatattaaa 42700949  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 24662905 - 24663109
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagatta-aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctattt 99  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |     
T  24662905 taaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaatgaaaactta-gatagattattattttaat- 24663002  T
Q  100 cttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663003 cttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccatata 24663102  T
Q  199 ttaaaag 205  Q
    |||||||    
T  24663103 ttaaaag 24663109  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32523306 - 32523114
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |    
T  32523306 ccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttagagtgataacttaagatggattgttattctatttc-tagattc 32523208  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  32523207 aaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacactattgaataaat-cgctataaccatatattaaa 32523114  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 205
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557500
Alignment:
Q  170 atattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaag 36557500  T

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Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49434475 - 49434279
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49434475 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgtaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 49434376  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49434375 aaaagtatttgtcaatatcattttaaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattaaataaataagttagaactatatattaaaag 49434279  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2357541 - 2357348
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Q  6 gatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2357541 gatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatct--gtctagagtgataacttaatatagattattattctatttcttaga 2357444  T
Q  106 cccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatta 201  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357443 ttcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatta 2357348  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26335494 - 26335290
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||     
T  26335494 taaacgacccataagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagttataacttaagatagattgttattctatttt 26335395  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26335394 ttagatccaaaagtatttgtcaatatcgttttgaatctcaataaagcaataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctaaaatcatatatt 26335295  T
Q  201 aaaag 205  Q
    |||||    
T  26335294 aaaag 26335290  T

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Target: chr3; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 7653006 - 7653201
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Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  7653006 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 7653104  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653105 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 7653201  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33248367 - 33248173
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33248367 ccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctagttcttagaccc 33248268  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33248267 aaaaatattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacataag-ataacaacaatattgaataaattagctagaatcatatattaaaa 33248173  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 10385854 - 10386049
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Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10385854 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 10385952  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10385953 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatacaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 10386049  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 52307869 - 52308064
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |    
T  52307869 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttat-agattc 52307967  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52307968 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaag 52308064  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3588778 - 3588583
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  3588778 ccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatctct-agattc 3588680  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3588679 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 3588583  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9989773 - 9989579
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  9989773 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 9989675  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9989674 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaaag 9989579  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 37471469 - 37471663
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37471469 atccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagat 37471567  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37471568 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 37471663  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 27850335 - 27850527
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27850335 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttacgatagattgttattctatttc-tagattc 27850433  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27850434 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 27850527  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 48167978 - 48168170
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  48167978 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 48168076  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  48168077 aaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctaaaacaatatattaaa 48168170  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 4742787 - 4742977
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  4742787 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 4742885  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaa 202  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4742886 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaa-caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaa 4742977  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37023049 - 37022874
Alignment:
Q  26 tagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaata 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||| |||    
T  37023049 tagattaaaagtgattatcaaatatcaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaaatatgtgtccata 37022951  T
Q  126 tcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37022950 tcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 37022874  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 1232275 - 1232467
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  1232275 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctatagtgataacttaagatatattgttattctatttc-tagattc 1232373  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1232374 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 1232467  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20837471 - 20837279
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  20837471 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 20837373  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20837372 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaataatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 20837279  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22098044 - 22097852
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  22098044 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 22097946  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22097945 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacaatattgaataaat-ggctagaaccatatattaaa 22097852  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 36469220 - 36469414
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  36469220 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatgtc-tagattc 36469318  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  36469319 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaacaataaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatgtattaaaag 36469414  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45528009 - 45527832
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  45528009 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagatttttattttatttc-tagattcaaaagtatgtgtccat 45527911  T
Q  125 atcattttgaatatgaataaagcatt-aaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45527910 atcattttgaatctcaataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatgtattaaa 45527832  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23194297 - 23194108
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  23194297 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 23194199  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23194198 aaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaat---aacaatattgaataaat-agatagaaccatatattaaa 23194108  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615686
Alignment:
Q  74 acttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatat 8615718  T
Q  174 tgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615717 tgaataaataagctagaaccatatattaaaag 8615686  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Original strand, 20963040 - 20963200
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  20963040 ccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataccttaagatatattgttattctatttc-tagattc 20963138  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaa 170  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||| |||||||||||    
T  20963139 aaaagtatatgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385579
Alignment:
Q  162 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 23385579  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Original strand, 17405041 - 17405097
Alignment:
Q  147 cattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  17405041 cattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatatattaaa 17405097  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23411749 - 23411714
Alignment:
Q  165 caacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411749 caacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 23411714  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8626001 - 8625943
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctaga 67  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8626001 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga 8625943  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23411814 - 23411748
Alignment:
Q  61 gtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatca 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||    
T  23411814 gtctagagtgataacttaagatagatcgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

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Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16958938 - 16958734
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16958938 taaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaatctatgtctaaagtgataacttaaaatagattgttattctatttc 16958839  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16958838 ttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatagtgaataaataagctagaaccatatatt 16958739  T
Q  201 aaaag 205  Q
    |||||    
T  16958738 aaaag 16958734  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 22222459 - 22222648
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22222459 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatcc 22222558  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22222559 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatat 22222648  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 22233634 - 22233829
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22233634 ccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatcc 22233733  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22233734 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaa-cagctagaatcatatattaaaag 22233829  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 8743067 - 8743262
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  8743067 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 8743165  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743166 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 8743262  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 22228801 - 22228990
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22228801 ccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatcc 22228900  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22228901 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaatcatatat 22228990  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 9067951 - 9068146
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  9067951 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 9068049  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068050 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 9068146  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 11308771 - 11308966
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  11308771 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 11308869  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308870 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 11308966  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 22243025 - 22243222
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22243025 atccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agat 22243123  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243124 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 22243222  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28370471 - 28370276
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |    
T  28370471 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttct-agattc 28370373  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370372 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 28370276  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21692832 - 21692669
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21692832 taaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaatttaaaatagattgttattctatttc 21692733  T
Q  101 ttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataa 164  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21692732 ttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 21692669  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 28925927 - 28926121
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  28925927 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 28926025  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28926026 aaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 28926121  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 41577115 - 41577310
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  41577115 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaagatccatgtttagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 41577213  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577214 aaaagtacgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 41577310  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27348404 - 27348210
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  |    
T  27348404 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatggattgttattctatttct-agattc 27348306  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348305 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 27348210  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13510341 - 13510149
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  13510341 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttc-tagattc 13510243  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13510242 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 13510149  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13599871 - 13599679
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  13599871 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatatattgttattctatttc-tagattc 13599773  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13599772 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 13599679  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22180979 - 22180787
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  22180979 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 22180881  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22180880 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 22180787  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3299179 - 3298985
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  3299179 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 3299081  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3299080 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaaag 3298985  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 4861735 - 4861927
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  4861735 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttc-tagattc 4861833  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4861834 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 4861927  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 34006557 - 34006748
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |    
T  34006557 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtatagagtgataacttaagatagattgttattctattt-atagattc 34006655  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34006656 aaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaataaa-caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 34006748  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 13849110 - 13849278
Alignment:
Q  6 gatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttaga 105  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||    
T  13849110 gatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatagaatgaaaactt-agatagattgttattcta-ctcctaga 13849207  T
Q  106 cccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattga 176  Q
      ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13849208 ttcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataataacaatattga 13849278  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17993244 - 17993087
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  17993244 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 17993146  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaa 167  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17993145 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 17993087  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16580399 - 16580268
Alignment:
Q  73 aacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaata 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  16580399 aacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaata 16580301  T
Q  173 ttgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580300 ttgaataaataagctagaaccatatattaaaag 16580268  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12538525 - 12538343
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  12538525 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatatctagagtgataacttaagataaattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccat 12538427  T
Q  125 atc------attttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||      ||||| ||| | ||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12538426 atcattttaattttaaatctcaataaaataataaaatcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 12538343  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1607672 - 1607470
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagatta-aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctattt 99  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| |||||   |||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  1607672 taaacgatacaatagcattaacttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatatctagaataaaaactta-gatagattattattctaact 1607574  T
Q  100 cttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 198  Q
    || ||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1607573 ct-agatccaaaattatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataacaatatttaataaataaggtagaaccatata 1607475  T
Q  199 ttaaa 203  Q
    |||||    
T  1607474 ttaaa 1607470  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 136
Target Start/End: Original strand, 36737004 - 36737115
Alignment:
Q  23 ttctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtca 122  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  36737004 ttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctagagtgaaaactt-agatagattattattcta-ttcctagattcaaaagtatttgtca 36737101  T
Q  123 atatcattttgaat 136  Q
    ||||||||||||||    
T  36737102 atatcattttgaat 36737115  T

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Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7315582 - 7315387
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  7315582 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 7315484  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315483 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 7315387  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9404802 - 9404607
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  9404802 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 9404704  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404703 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 9404607  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 11723060 - 11723255
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  11723060 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 11723158  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723159 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 11723255  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14344839 - 14344644
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  14344839 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 14344741  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14344740 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagttagaaccatatattaaaag 14344644  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7315148
Alignment:
Q  10 caaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccca 109  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  7315342 caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattca 7315244  T
Q  110 aaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315243 aaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 7315148  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 16904393 - 16904588
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  16904393 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 16904491  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16904492 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataggctagaaccatatattaaaag 16904588  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 30606860 - 30607055
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  30606860 ccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattattattctatttct-agattc 30606958  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30606959 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 30607055  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 37251689 - 37251881
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  37251689 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 37251787  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37251788 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 37251881  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34456673 - 34456480
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  34456673 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgag--tgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 34456577  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456576 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 34456480  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31846357 - 31846163
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  31846357 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 31846259  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31846258 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaaag 31846163  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33434980 - 33434786
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  33434980 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 33434882  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33434881 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaaag 33434786  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 27166882 - 27167074
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  27166882 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagataaattgttattctatttc-tagattc 27166980  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27166981 aaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 27167074  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11767132 - 11766938
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  11767132 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 11767034  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11767033 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-tgctagaaccatatattaaaag 11766938  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6270265 - 6270075
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaa 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  6270265 aaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaa 6270167  T
Q  111 aagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||  |||| |||||||||||| | | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6270166 aagtacatgtccatatcattttgagtctcaataaaacaataaagacaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaatatatattaaa 6270075  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 34869530 - 34869722
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |    
T  34869530 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagaaagattgttattttatttc-tagattc 34869628  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||  |||| |||||||||| ||| | |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869629 aaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaatagaacattatatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 34869722  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24836100 - 24835918
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||             |||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  24836100 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt-------------ttaagatagattgttattctatttct-agattc 24836015  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24836014 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 24835918  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 519415 - 519311
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  519415 taaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatttagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttc 519316  T
Q  101 ttaga 105  Q
    |||||    
T  519315 ttaga 519311  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 39655812 - 39656016
Alignment:
Q  1 taaacgatccaaaagcattatattctagatta-aaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctattt 99  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||| ||||| || |||||||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||       
T  39655812 taaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaattaaaactta-gatagattattattttaacc 39655910  T
Q  100 cttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 198  Q
    || |||  |||||||||||||||||| |||||  ||| | || |||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39655911 ct-agattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaagattgaataaataagctagaaccatata 39656009  T
Q  199 ttaaaag 205  Q
    |||||||    
T  39656010 ttaaaag 39656016  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32227020 - 32226911
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaat 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||    
T  32227020 ctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctagagtgataacttaagacagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccat 32226922  T
Q  125 atcattttgaa 135  Q
    |||||||||||    
T  32226921 atcattttgaa 32226911  T

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Target: scaffold0159 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 28683 - 28878
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  28683 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 28781  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 28878  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9120 - 8925
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  9120 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 9022  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 8925  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 25434 - 25629
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  25434 ccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattc 25532  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 25629  T

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Target: scaffold0059 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Original strand, 16253 - 16451
Alignment:
Q  5 cgatccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttag 104  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||    
T  16253 cgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctagaatgaaaactta-gatagattgttata-taattcctag 16350  T
Q  105 acccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351 atccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaatacaagaataacaaccatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 16450  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 116350 - 116544
Alignment:
Q  7 atccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagac 106  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  116350 atccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagat 116448  T
Q  107 ccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  116449 tcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaattaat-agctagaaccatatattaaa 116544  T

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Target: scaffold0505 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 768 - 962
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  768 ccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 866  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  867 aaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagcta-caccatatattaaaag 962  T

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Target: scaffold0298 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 11988 - 12182
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  11988 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 12086  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12087 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagtaccatatattaaaag 12182  T

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Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 15758 - 15952
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  15758 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 15856  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15857 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagtaccatatattaaaag 15952  T

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Target: scaffold0444 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 12272 - 12458
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12272 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 12370  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |        || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatct--------caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 12458  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Original strand, 76236 - 76428
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  76236 ccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattttatttc-tagattc 76334  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  76335 aaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatacattaaa 76428  T

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Target: scaffold0147 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7109 - 6917
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  7109 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaaaatatattgttattctatttc-tagattc 7011  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||| | || ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7010 aaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaa 6917  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12572 - 12376
Alignment:
Q  9 ccaaaagcattatattctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagaccc 108  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12572 ccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattc 12474  T
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagc-attaaatacaagaat-aacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaag 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12473 aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatattgaataaat-agctagtaccatatattaaaag 12376  T

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Target: scaffold0447 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7248
Alignment:
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagat-agctagaaccatatattaaa 7248  T

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Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11862
Alignment:
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagat-agctagaaccatatattaaa 11862  T

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Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7394 - 7340
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaa 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  7394 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

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Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12008 - 11954
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaa 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  12008 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

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Target: scaffold0383 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9857
Alignment:
Q  109 aaaagtatttgtcaatatcattttgaatatgaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagat-agctagaaccatatattaaa 9857  T

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Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10003 - 9949
Alignment:
Q  25 ctagattaaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaa 79  Q
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T  10003 ctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

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Target: scaffold0160 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Original strand, 35211 - 35260
Alignment:
Q  155 acaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35211 acaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaa 35260  T

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Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 35109 - 35198
Alignment:
Q  11 aaaagcattatattctagatt-aaaggtgattatcaaatattaacatctaggtctagaatgaaaacttaagatagattgttattctatttctta 103  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35109 aaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatcta----tagagtgataacttaaggtagattgttattctatttctta 35198  T

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Target: scaffold0458 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9427
Alignment:
Q  140 aataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9364 aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaa 9427  T

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