View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5837_low_5 (Length: 383)

Name: NF5837_low_5
Description: NF5837
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5837_low_5
NF5837_low_5
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (1-383)||(22907223-22907606)
chr8 (1-157)||(5238184-5238341)
chr8 (1-157)||(24661257-24661414)
chr8 (1-157)||(43685643-43685800)
chr8 (1-279)||(16193725-16194005)
chr8 (4-286)||(43373480-43373761)
chr8 (1-283)||(17345540-17345823)
chr8 (3-286)||(16404986-16405268)
chr8 (4-279)||(24548956-24549233)
chr8 (4-279)||(6774258-6774535)
chr8 (1-296)||(24928800-24929096)
chr8 (8-286)||(21844576-21844856)
chr8 (8-286)||(21851969-21852249)
chr8 (4-286)||(30120690-30120974)
chr8 (312-383)||(5238126-5238197)
chr8 (312-383)||(24661401-24661472)
chr8 (312-383)||(43685585-43685656)
chr8 (67-286)||(222754-222975)
chr8 (67-286)||(736377-736598)
chr8 (67-286)||(860272-860493)
chr8 (4-124)||(16674392-16674512)
chr8 (142-296)||(23837154-23837308)
chr8 (213-294)||(13662481-13662561)
chr8 (233-282)||(16674624-16674672)
chr8 (260-297)||(41246613-41246650)
chr8 (316-373)||(22321597-22321654)
chr8 (8-49)||(23149985-23150026)
chr8 (8-49)||(23226076-23226117)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-383)||(26680071-26680454)
chr4 (1-282)||(15675098-15675381)
chr4 (1-297)||(13246386-13246684)
chr4 (1-297)||(54118253-54118551)
chr4 (19-279)||(31115603-31115865)
chr4 (1-157)||(10488659-10488816)
chr4 (1-157)||(16327935-16328092)
chr4 (1-282)||(10104259-10104523)
chr4 (8-286)||(10644187-10644467)
chr4 (1-124)||(122020-122143)
chr4 (1-124)||(13048230-13048353)
chr4 (155-286)||(111362-111493)
chr4 (4-286)||(47357622-47357906)
chr4 (312-383)||(10488601-10488672)
chr4 (1-54)||(33240901-33240954)
chr4 (312-368)||(16328079-16328135)
chr4 (8-189)||(40885570-40885753)
chr4 (208-283)||(7849970-7850044)
chr4 (142-236)||(41166083-41166177)
chr4 (142-286)||(15044794-15044938)
chr4 (265-297)||(44055870-44055902)
chr4 (142-257)||(8374504-8374619)
chr4 (142-286)||(15109486-15109630)
chr4 (136-257)||(17145796-17145917)
chr4 (9-49)||(13809511-13809551)
chr4 (142-206)||(13809647-13809711)
chr4 (142-253)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-383)||(7292887-7293270)
chr7 (1-298)||(13037023-13037322)
chr7 (3-286)||(11580750-11581035)
chr7 (1-279)||(47481040-47481320)
chr7 (1-157)||(11516324-11516481)
chr7 (1-157)||(15441573-15441730)
chr7 (1-157)||(30262138-30262295)
chr7 (1-286)||(16211733-16212020)
chr7 (1-286)||(18253844-18254130)
chr7 (1-286)||(36052634-36052918)
chr7 (1-279)||(13320988-13321270)
chr7 (10-283)||(16478968-16479244)
chr7 (1-286)||(3059933-3060220)
chr7 (1-124)||(25292347-25292470)
chr7 (4-286)||(10989378-10989661)
chr7 (8-286)||(13572644-13572924)
chr7 (3-286)||(2437425-2437710)
chr7 (312-383)||(15441717-15441788)
chr7 (312-383)||(30262282-30262353)
chr7 (4-268)||(13911024-13911292)
chr7 (312-383)||(11516266-11516337)
chr7 (1-283)||(295975-296257)
chr7 (1-34)||(14113998-14114031)
chr7 (1-34)||(14423648-14423681)
chr7 (265-297)||(15822691-15822723)
chr7 (212-286)||(25292560-25292633)
chr7 (142-297)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-367)||(37075-37442)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-383)||(16744124-16744507)
chr3 (1-280)||(17912492-17912771)
chr3 (1-297)||(15859033-15859331)
chr3 (1-286)||(14842570-14842856)
chr3 (1-157)||(2449247-2449404)
chr3 (1-286)||(2049777-2050064)
chr3 (1-286)||(15936636-15936922)
chr3 (1-297)||(51158027-51158325)
chr3 (1-286)||(12030156-12030443)
chr3 (1-296)||(13838852-13839148)
chr3 (1-286)||(15938478-15938764)
chr3 (36-279)||(15614808-15615053)
chr3 (212-373)||(15468555-15468717)
chr3 (1-124)||(13975731-13975853)
chr3 (1-124)||(45860937-45861059)
chr3 (1-286)||(13954899-13955185)
chr3 (212-373)||(22275088-22275250)
chr3 (144-279)||(47984624-47984759)
chr3 (144-279)||(48003198-48003333)
chr3 (144-279)||(47993911-47994046)
chr3 (144-279)||(48012484-48012619)
chr3 (4-286)||(55316187-55316471)
chr3 (26-294)||(16821099-16821369)
chr3 (312-383)||(2449391-2449462)
chr3 (4-286)||(41270043-41270327)
chr3 (1-54)||(19231982-19232035)
chr3 (234-286)||(19231945-19231997)
chr3 (8-49)||(14080715-14080756)
chr3 (212-286)||(13975944-13976017)
chr3 (224-286)||(45860773-45860834)
chr3 (265-297)||(22144532-22144564)
chr3 (136-254)||(12264932-12265050)
chr3 (293-373)||(18969968-18970048)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-286)||(19173-19460)
scaffold0195 (1-286)||(21257-21544)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-278)||(18531076-18531355)
chr5 (1-282)||(22053842-22054125)
chr5 (1-286)||(23506932-23507219)
chr5 (1-297)||(27182556-27182854)
chr5 (1-157)||(20623066-20623223)
chr5 (1-157)||(21233537-21233694)
chr5 (1-154)||(37052844-37052998)
chr5 (1-157)||(16536294-16536451)
chr5 (1-283)||(34939248-34939531)
chr5 (1-157)||(25900415-25900571)
chr5 (4-286)||(22366481-22366765)
chr5 (4-286)||(25426596-25426880)
chr5 (7-286)||(18777995-18778276)
chr5 (4-286)||(12342-12626)
chr5 (4-286)||(19499867-19500151)
chr5 (4-286)||(21073595-21073879)
chr5 (4-124)||(29188284-29188404)
chr5 (4-267)||(4199985-4200251)
chr5 (312-383)||(20623008-20623079)
chr5 (312-383)||(21233681-21233752)
chr5 (7-286)||(43443398-43443679)
chr5 (8-286)||(27009809-27010089)
chr5 (212-296)||(17471803-17471887)
chr5 (312-383)||(25900558-25900629)
chr5 (312-383)||(37052783-37052854)
chr5 (206-279)||(29190479-29190552)
chr5 (312-383)||(16536236-16536307)
chr5 (142-254)||(23493916-23494029)
chr5 (8-49)||(21310709-21310750)
chr5 (8-49)||(23981516-23981557)
chr5 (142-206)||(7728466-7728530)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-286)||(36982450-36982737)
chr2 (7-297)||(19794719-19795011)
chr2 (1-282)||(24341398-24341681)
chr2 (1-157)||(19689410-19689567)
chr2 (1-157)||(23820168-23820325)
chr2 (1-157)||(14906449-14906606)
chr2 (1-279)||(25265399-25265679)
chr2 (1-286)||(8891209-8891496)
chr2 (1-157)||(20015108-20015265)
chr2 (1-286)||(462706-462992)
chr2 (1-286)||(43642966-43643250)
chr2 (1-286)||(20627322-20627609)
chr2 (42-283)||(7507894-7508138)
chr2 (1-124)||(17396662-17396784)
chr2 (4-286)||(19886661-19886945)
chr2 (312-383)||(14906593-14906664)
chr2 (312-383)||(20015050-20015121)
chr2 (312-383)||(23820110-23820181)
chr2 (312-357)||(19689554-19689599)
chr2 (224-286)||(17396887-17396948)
chr2 (175-257)||(19669279-19669362)
chr2 (176-236)||(9636761-9636821)
chr2 (175-254)||(19666525-19666605)
chr2 (176-220)||(24884718-24884762)
chr2 (265-297)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-282)||(8820-9103)
scaffold0025 (1-286)||(148688-148975)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-286)||(1091-1378)
scaffold0266 (1-286)||(3591-3877)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-286)||(36922-37209)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-297)||(23153403-23153701)
chr6 (1-286)||(35009448-35009735)
chr6 (1-283)||(1657757-1658040)
chr6 (3-279)||(14626129-14626407)
chr6 (1-283)||(15862443-15862725)
chr6 (4-279)||(1650105-1650382)
chr6 (4-286)||(25175531-25175815)
chr6 (150-283)||(27740808-27740941)
chr6 (4-286)||(27653983-27654267)
chr6 (4-286)||(16825752-16826038)
chr6 (143-297)||(18381821-18381975)
chr6 (5-75)||(27751605-27751675)
chr6 (166-272)||(22361926-22362032)
chr6 (8-49)||(16887792-16887833)
chr6 (1-189)||(29665937-29666128)
chr6 (268-297)||(32898745-32898774)
chr6 (8-49)||(33324898-33324939)
chr6 (8-49)||(35136013-35136054)
chr6 (142-297)||(21623123-21623278)
chr6 (142-206)||(25367374-25367438)
chr6 (175-254)||(33324690-33324770)
chr6 (175-254)||(35136182-35136262)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-286)||(48565-48852)
scaffold0023 (26-282)||(36065-36323)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-286)||(20445646-20445933)
chr1 (1-286)||(20931312-20931599)
chr1 (1-297)||(20893635-20893933)
chr1 (1-286)||(20531411-20531698)
chr1 (1-157)||(51452589-51452746)
chr1 (1-283)||(41394191-41394476)
chr1 (1-286)||(20913004-20913284)
chr1 (1-286)||(37844459-37844746)
chr1 (3-286)||(22227777-22228061)
chr1 (3-286)||(22232474-22232758)
chr1 (4-279)||(2116228-2116506)
chr1 (4-124)||(45051554-45051674)
chr1 (312-383)||(51452531-51452602)
chr1 (4-286)||(5072388-5072672)
chr1 (4-286)||(18601118-18601402)
chr1 (199-279)||(45051416-45051496)
chr1 (265-296)||(49967607-49967638)
chr1 (176-257)||(20254308-20254389)
chr1 (8-49)||(22143361-22143402)
chr1 (175-254)||(22143531-22143611)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-286)||(965-1250)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-286)||(48155-48441)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-286)||(123173-123460)
scaffold0011 (265-297)||(255074-255106)
scaffold0011 (265-297)||(261680-261712)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (1-157)||(22637-22794)
scaffold0141 (1-157)||(26892-27049)
scaffold0141 (312-383)||(22579-22650)
scaffold0141 (312-383)||(26834-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-157)||(1591-1748)
scaffold0124 (312-383)||(1735-1806)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (1-286)||(107715-108001)
scaffold0026 (8-286)||(64527-64812)
scaffold0026 (7-49)||(89863-89905)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-286)||(6073-6358)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-297)||(41686-41983)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-286)||(12083-12367)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-279)||(13480-13760)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (1-286)||(128178-128464)
scaffold0008 (26-267)||(31697-31942)
scaffold0008 (265-293)||(22650-22678)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-279)||(41622-41902)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-286)||(247451-247738)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-284)||(543-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (3-283)||(34471-34755)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-286)||(8846-9132)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-286)||(5070-5356)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-286)||(26424-26710)
scaffold0162 (1-279)||(8189-8466)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-296)||(171863-172159)
scaffold0001 (1-296)||(177566-177862)
scaffold0001 (265-297)||(70882-70914)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (3-279)||(2936-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (26-279)||(9371-9626)
scaffold0215 (26-279)||(16269-16524)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (155-297)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (42-286)||(5254-5498)
scaffold0022 (9-49)||(102923-102963)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-124)||(5660-5783)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-296)||(271983-272277)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (42-286)||(3690-3936)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-124)||(51191-51314)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (27-286)||(42965-43226)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-124)||(89463-89586)
scaffold0028 (3-43)||(107795-107835)
scaffold0028 (8-49)||(79745-79786)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (26-286)||(14083-14344)
scaffold0139 (3-286)||(21115-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (8-286)||(3-283)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (4-124)||(13325-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (164-286)||(48482-48603)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (164-286)||(26-147)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (4-124)||(1304-1424)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (42-254)||(54415-54630)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (199-278)||(3183-3262)
scaffold0361 (4-75)||(3370-3441)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (233-286)||(1815-1867)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (142-297)||(76984-77139)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (8-49)||(1546-1587)
scaffold0456 (8-49)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (8-49)||(8216-8257)
scaffold0123 (175-254)||(8007-8087)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (8-49)||(70307-70348)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (260-297)||(132505-132542)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (142-277)||(197390-197525)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-117)||(56108-56226)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (176-254)||(104793-104872)
scaffold0032 (8-49)||(93773-93814)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (8-46)||(1348-1386)
scaffold0409 (8-46)||(9603-9641)
[»] scaffold0389 (2 HSPs)
scaffold0389 (175-272)||(10642-10739)
scaffold0389 (9-49)||(10868-10908)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (175-236)||(2471-2532)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (268-297)||(7522-7551)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (8-49)||(22422-22463)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (268-297)||(38253-38282)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (165-229)||(2548-2612)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (179-298)||(116687-116806)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 22907223 - 22907606
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  22907223 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 22907322  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907323 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 22907422  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22907423 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgat 22907522  T
Q  300 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  22907523 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcat 22907606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5238341 - 5238184
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  5238341 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 5238242  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238241 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 24661257 - 24661414
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  24661257 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 24661356  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661357 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43685800 - 43685643
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  43685800 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 43685701  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685700 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16193725 - 16194005
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |    
T  16193725 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaa 16193824  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  16193825 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 16193924  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193925 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 43373480 - 43373761
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  43373480 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 43373579  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 201  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||    
T  43373580 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgat 43373679  T
Q  202 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373680 gttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17345823 - 17345540
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| |    
T  17345823 tgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 17345724  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || ||||| || ||| || ||||     
T  17345723 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaatt 17345625  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345624 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 16404986 - 16405268
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||    
T  16404986 ttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaa 16405085  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||    
T  16405086 tgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattga 16405182  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  16405183 tgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 201  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  202 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 201  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  202 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 24928800 - 24929096
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  24928800 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 24928899  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || ||||     
T  24928900 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaatt 24928999  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929000 gatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844856
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852249
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238126
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 5238126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661472
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 24661472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685585
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcat 43685585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  67 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 163  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  164 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 263  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  264 ttgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  67 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 163  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  164 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 263  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  264 ttgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  67 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 163  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  164 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 263  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  264 ttgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Original strand, 13662481 - 13662561
Alignment:
Q  213 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 294  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662481 tgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Original strand, 16674624 - 16674672
Alignment:
Q  233 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674624 catattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41246650 - 41246613
Alignment:
Q  260 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246650 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 373
Target Start/End: Original strand, 22321597 - 22321654
Alignment:
Q  316 ttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 373  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22321597 ttgttaaattgtgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatg 22321654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26680454 - 26680071
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26680454 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaa 26680355  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680354 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 26680255  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  26680254 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgggaatcgat 26680155  T
Q  300 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  26680154 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcat 26680071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15675098 - 15675381
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  15675098 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 15675197  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  15675198 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaatt 15675297  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675298 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13246684 - 13246386
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  13246684 tgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 13246585  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  13246584 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 13246485  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246484 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 54118253 - 54118551
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  54118253 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 54118352  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  54118353 attgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaatt 54118452  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54118453 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  19 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  119 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 216  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  217 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10488816 - 10488659
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  10488816 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 10488717  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488716 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 16327935 - 16328092
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  16327935 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 16328034  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328035 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 10104259 - 10104523
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  10104259 tgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 10104358  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||              
T  10104359 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt---------- 10104448  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
             ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104449 ---------gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644187
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 122143 - 122020
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  122143 tgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 122044  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  122043 aatgataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13048230 - 13048353
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |    
T  13048230 tgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 13048329  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || || |||||||||| |||||||    
T  13048330 aaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  155 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 254  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  255 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488601
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 10488601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 33240954 - 33240901
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240954 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328135
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattga 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattga 16328135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 106  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  107 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 189  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7850044 - 7849970
Alignment:
Q  208 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850044 gttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 236  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8374619 - 8374504
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcat 241  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| || | ||||||||||||| | ||    
T  8374619 atgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacataattat 8374520  T
Q  242 ggattgatgatgaaaa 257  Q
     |||||||||||||||    
T  8374519 cgattgatgatgaaaa 8374504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 286
Target Start/End: Original strand, 15109486 - 15109630
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15109486 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15109585  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15109586 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15109630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 257
Target Start/End: Original strand, 17145796 - 17145917
Alignment:
Q  136 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 235  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  17145796 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 17145895  T
Q  236 attcatggattgatgatgaaaa 257  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  17145896 aattacggattgatgatgaaaa 17145917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 206  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 253
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265757
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  241 tggattgatgatg 253  Q
    ||  |||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatg 52265757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7293270 - 7292887
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  7293270 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 7293171  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293170 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 7293071  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7293070 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgat 7292971  T
Q  300 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  7292970 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatgttgatctcat 7292887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 13037023 - 13037322
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |    
T  13037023 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaaca 13037122  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  ||||     
T  13037123 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaatt 13037222  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 298  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037223 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 11580750 - 11581035
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||    
T  11580750 ttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaa 11580849  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||    
T  11580850 tgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattga 11580949  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580950 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 47481040 - 47481320
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |    
T  47481040 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 47481139  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||    
T  47481140 aatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaat 47481238  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
     |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481239 tgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11516481 - 11516324
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  11516481 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 11516382  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516381 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 15441573 - 15441730
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  15441573 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 15441672  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441673 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 30262138 - 30262295
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  30262138 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 30262237  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262238 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16212020 - 16211733
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |    
T  16212020 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaa 16211921  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || ||||     
T  16211920 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaatt 16211821  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211820 gatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 18253844 - 18254130
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  18253844 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 18253943  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  18253944 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 18254043  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254044 gatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36052918 - 36052634
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  36052918 tgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaa 36052819  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||   | | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || ||||     
T  36052818 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt---taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaatt 36052722  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052721 gatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13321270 - 13320988
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||    
T  13321270 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgta 13321171  T
Q  99 gaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgcta 195  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||  | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||    
T  13321170 taaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtta 13321072  T
Q  196 atagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    || |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13321071 attgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479244
Alignment:
Q  10 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaag 109  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  110 ttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgta 207  Q
    || ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | ||||||||     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  208 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3060220 - 3059933
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  3060220 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 3060121  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc--aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    ||||| || || |||||||| |||  |||||| ||||||| |  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || ||||    
T  3060120 aatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaat 3060022  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  3060021 tgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtgggtgttttgatgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 25292347 - 25292470
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |    
T  25292347 tgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 25292446  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || || ||| |||||| |||||||    
T  25292447 aaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| | | | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572644
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437425
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||  | |  ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |     
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattgg-tgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 2437512  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| || |  ||||||||| || | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437511 gatattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441788
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 15441788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262353
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 30262353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 268
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911292
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    || |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | |    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt 268  Q
    || || |  ||||||||| ||   |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516266
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcat 11516266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 295975 - 296257
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||| || || |  | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  295975 tgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaa 296074  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgac-atgttgtagtt-gaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 196  Q
    ||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||||||  | |  |||  ||| |||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  296075 aatgagaagttataaaaattatatccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaa 296173  T
Q  197 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    | ||||||||   |||||||| |  | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  296174 ttgatgttgt---tgatgaattactgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 14113998 - 14114031
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113998 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 14423648 - 14423681
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423648 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 25292560 - 25292633
Alignment:
Q  212 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292560 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 17224075 - 17224230
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| |||||||||   || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  17224075 atgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattca 17224174  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  17224175 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaattg 17224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 37075 - 37442
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  37075 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 37174  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37175 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 37274  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37275 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgat 37374  T
Q  300 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattg 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37375 gaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattg 37442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 16744124 - 16744507
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |    
T  16744124 tgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaa 16744223  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16744224 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataa 16744323  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16744324 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattgag 16744423  T
Q  300 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||    
T  16744424 gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgatagttgatgttgatctcat 16744507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17912492 - 17912771
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |    
T  17912492 tgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 17912590  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| || |||| |    
T  17912591 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattg 17912690  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 280  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912691 atgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 15859033 - 15859331
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |    
T  15859033 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaaca 15859132  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  15859133 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 15859232  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859233 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 14842570 - 14842856
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  14842570 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaa 14842669  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  14842670 aatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 14842769  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842770 gatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 2449247 - 2449404
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  2449247 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 2449346  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449347 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2050064 - 2049777
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  2050064 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 2049965  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
     |||| || || ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || ||||     
T  2049964 catgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaatt 2049865  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049864 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15936636 - 15936922
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  15936636 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15936735  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  15936736 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 15936835  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936836 gatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 51158027 - 51158325
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  51158027 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 51158126  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  51158127 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 51158226  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgtt-ggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  51158227 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttttgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 12030156 - 12030443
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  12030156 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 12030255  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || ||||     
T  12030256 agtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaatt 12030355  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030356 gatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13839148 - 13838852
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  13839148 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 13839049  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  13839048 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 13838949  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838948 gatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15938478 - 15938764
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  15938478 tgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15938577  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  15938578 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 15938677  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938678 gatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614808
Alignment:
Q  36 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  135 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 233  Q
    ||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  234 atattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614853 atattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468717
Alignment:
Q  212 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 310  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgaca 15468654  T
Q  311 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 373  Q
     ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||| || ||| |||| |||| |||||    
T  15468655 tgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 15468717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13975731 - 13975853
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |    
T  13975731 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 13975829  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  13975830 aatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 45861059 - 45860937
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |    
T  45861059 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 45860961  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  45860960 aatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 13954899 - 13955185
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |    
T  13954899 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaa 13954997  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || |    
T  13954998 aatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatt 13955097  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |||  | |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955098 tgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275088
Alignment:
Q  212 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 310  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgaca 22275151  T
Q  311 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 373  Q
     ||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||| || ||| |||| |||| |||||    
T  22275150 tgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 22275088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  144 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 243  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  244 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  144 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 243  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  244 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  144 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 243  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  244 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  144 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 243  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  244 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  125 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 222  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  223 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 294  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449462
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 2449462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19232035 - 19231982
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232035 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19231997 - 19231945
Alignment:
Q  234 atattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231997 atattcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 13975944 - 13976017
Alignment:
Q  212 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975944 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45860834 - 45860773
Alignment:
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860834 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265050
Alignment:
Q  136 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 235  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  236 attcatggattgatgatga 254  Q
    | | |||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatga 12265050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18970048 - 18969968
Alignment:
Q  293 aattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 373  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||    
T  18970048 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattctgatggaaagcatgattataagttgtggttgtggttgattgttgatg 18969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19460 - 19173
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  19460 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 19361  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  19360 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaatt 19261  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19260 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21544 - 21257
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  21544 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 21445  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  21444 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaatt 21345  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21344 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 18531076 - 18531355
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  18531076 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 18531175  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  18531176 aatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaat 18531274  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 278  Q
     |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531275 tgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 22053842 - 22054125
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  22053842 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 22053941  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  22053942 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 22054041  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054042 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23507219 - 23506932
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  23507219 tgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 23507120  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  23507119 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 23507020  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507019 gatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 27182556 - 27182854
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |    
T  27182556 tgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaaca 27182655  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  27182656 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 27182755  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182756 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20623223 - 20623066
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  20623223 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 20623124  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623123 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 21233537 - 21233694
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  21233537 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 21233636  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233637 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37052998 - 37052844
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  37052998 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgga 37052899  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052898 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16536451 - 16536294
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  16536451 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 16536352  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536351 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34939531 - 34939248
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| |    
T  34939531 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 34939432  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||  | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || ||||     
T  34939431 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaatt 34939333  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939332 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25900415 - 25900571
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |    
T  25900415 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaa 25900514  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900515 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778276
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 106  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  107 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 203  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  204 tgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200251
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 267  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623008
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 20623008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233752
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 21233752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443679
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 106  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  107 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 203  Q
    |||||||||| |||||||  ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| |    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  204 tgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009809
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471887
Alignment:
Q  212 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900629
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 25900629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052783
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcat 37052783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 29190479 - 29190552
Alignment:
Q  206 tagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29190479 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536236
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 16536236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493916
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  241 tggattgatgatga 254  Q
    ||  ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatga 23493916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310750
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaa 21310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981557
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23981557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 206  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 36982450 - 36982737
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  36982450 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 36982549  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  36982550 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaatt 36982649  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982650 gatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19795011
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | ||||||     
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  107 aagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| ||||||    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgtt 19794918  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtg-ttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
     ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19794919 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaatttttgttggtgtttttggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24341398 - 24341681
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| |    
T  24341398 tgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaa 24341497  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||     
T  24341498 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaatt 24341597  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
    ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341598 gatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 19689410 - 19689567
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  19689410 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 19689509  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689510 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23820325 - 23820168
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  23820325 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 23820226  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820225 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 14906449 - 14906606
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  14906449 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 14906548  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906549 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 25265399 - 25265679
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  25265399 tgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 25265498  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||     
T  25265499 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaatt 25265598  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25265599 gatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8891496 - 8891209
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |    
T  8891496 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaaca 8891397  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||     
T  8891396 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaatt 8891297  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891296 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20015265 - 20015108
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  20015265 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 20015166  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015165 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 462992 - 462706
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  462992 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 462893  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||    
T  462892 aatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaat 462794  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     ||||| ||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462793 tgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 43642966 - 43643250
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  43642966 tgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 43643065  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||     
T  43643066 aatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaatt 43643165  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||| |||||    
T  43643166 gatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga---gatgttggtgttttgatgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 20627322 - 20627609
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||| |    
T  20627322 tgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaa 20627421  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | | || ||||     
T  20627422 aatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaatt 20627521  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20627522 ggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 139  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  140 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 237  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  238 tcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 17396662 - 17396784
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |    
T  17396662 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaa 17396760  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  17396761 aatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906664
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 14906664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015050
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 20015050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820110
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 23820110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 357
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689599
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 19689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Original strand, 17396887 - 17396948
Alignment:
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396887 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669362
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaa 19669362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  176 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 236  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19666605 - 19666525
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19666605 caattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatga 19666525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  176 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9103 - 8820
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  9103 tgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 9004  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  ||||     
T  9003 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaatt 8904  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8903 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 148975 - 148688
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  148975 tgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 148876  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  148875 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 148776  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148775 gaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1091
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  1378 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 1279  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  1278 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 1179  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| |||| |||||||||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1178 gatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 3591 - 3877
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  3591 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 3690  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  3691 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 3790  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  |||| |||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3791 gatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 36922 - 37209
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  36922 tgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 37021  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || ||||     
T  37022 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaatt 37121  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37122 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23153701 - 23153403
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  23153701 tgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 23153602  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || ||||     
T  23153601 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaatt 23153502  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153501 gatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 35009448 - 35009735
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  35009448 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 35009547  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||     
T  35009548 aatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaatt 35009647  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009648 gatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 1657757 - 1658040
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| |    
T  1657757 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaa 1657856  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || ||||     
T  1657857 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaatt 1657955  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657956 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 14626129 - 14626407
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  14626129 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 14626228  T
Q  103 tgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |    
T  14626229 tgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 14626327  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14626328 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15862725 - 15862443
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| |    
T  15862725 tgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtata 15862626  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| || ||||     
T  15862625 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataatt 15862528  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862527 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 201  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  202 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175531
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  150 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 249  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  250 gatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826038
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaa 101  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  102 atgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatg--ttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||  | |   |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||       
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| || |  ||||||||| || | || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381975
Alignment:
Q  143 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcat 241  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 18381920  T
Q  242 ggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18381921 gatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751605
Alignment:
Q  5 gctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 75  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 272
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362032
Alignment:
Q  166 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaat 264  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaa-ttgagt 22362024  T
Q  265 tgttgttg 272  Q
    ||||||||    
T  22362025 tgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887833
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaa 16887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29666128 - 29665937
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatgta 98  Q
    ||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||  || |||| |    
T  29666128 tgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgca 29666029  T
Q  99 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 189  Q
     |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29666028 taaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  268 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136054
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 35136054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21623278 - 21623123
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| |||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  21623278 atgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattca 21623179  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||  |||  ||||||||  ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  21623178 tgatttgtggatgaaaa-atgagttgttgttggtagtttggtaaaattggtgaattg 21623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 206  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33324770 - 33324690
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  33324770 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 33324690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 35136182 - 35136262
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  35136182 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 35136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48852 - 48565
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  48852 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaa 48753  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  | | | |||||||  | | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||     
T  48752 aatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaatt 48653  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48652 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 124  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  125 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 222  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  | |  ||||||||| || |    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  223 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 282  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20445933 - 20445646
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |    
T  20445933 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 20445834  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || ||||     
T  20445833 aatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaatt 20445734  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445733 gatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20931599 - 20931312
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |    
T  20931599 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaa 20931500  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  20931499 aatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 20931400  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931399 gatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 20893635 - 20893933
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |    
T  20893635 tgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaaca 20893734  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || ||||     
T  20893735 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaatt 20893834  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893835 gatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20531698 - 20531411
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |    
T  20531698 tgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 20531599  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || ||||     
T  20531598 aatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaatt 20531499  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531498 gatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51452746 - 51452589
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  51452746 tgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaa 51452647  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452646 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41394476 - 41394191
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||| |    
T  41394476 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaa 41394377  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || |     
T  41394376 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttattt 41394277  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41394276 gatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20913284 - 20913004
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |    
T  20913284 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaa 20913185  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  20913184 aatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 20913092  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| |||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913091 gatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 37844459 - 37844746
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |    
T  37844459 tgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaaca 37844558  T
Q  101 aatgagaagtta-tgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    ||||| ||  || ||||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||    
T  37844559 aatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaat 37844658  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844659 tgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227777
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22227862  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227861 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232474
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22232559  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232558 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116228
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctat-gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051554
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452531
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 51452531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601402
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051416
Alignment:
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20254389 - 20254308
Alignment:
Q  176 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 257  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20254389 aattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaa 20254308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 22143531 - 22143611
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  22143531 caattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatga 22143611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 965 - 1250
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  965 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 1064  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||     
T  1065 aataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatt 1163  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     ||||| |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1164 tatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48441 - 48155
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  48441 tgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 48342  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  48341 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaatt 48242  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48241 gatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 123173 - 123460
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  123173 tgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 123272  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  123273 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 123372  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123373 gatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22794 - 22637
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  22794 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 22695  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22694 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27049 - 26892
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  27049 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 26950  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26949 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22579
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 22579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26834
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1748
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |    
T  1591 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaa 1690  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1691 aatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1806
Alignment:
Q  312 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcat 383  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcat 1806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 108001 - 107715
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || | |    
T  108001 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaa 107902  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  107901 aatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 107802  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107801 gatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64812
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    || || |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 49
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  7 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 6073 - 6358
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |    
T  6073 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaa 6172  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||| | ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||     
T  6173 aataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatt 6271  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
      |||| |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6272 tttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41983 - 41686
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |    
T  41983 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaa 41884  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| || || ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || ||||     
T  41883 aatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaatt 41784  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    | |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41783 gttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12367 - 12083
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |    
T  12367 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaa 12268  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||     
T  12267 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaatt 12170  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| |  || |||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12169 gatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13760 - 13480
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  13760 tgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 13661  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||     
T  13660 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaatt 13561  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13560 gatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 128178 - 128464
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |    
T  128178 tgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 128277  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc--aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
      ||  ||||| ||||||||||||  || |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  128278 ggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatg 128376  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128377 gatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  125 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 221  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||     
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  222 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 267  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41902 - 41622
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  41902 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 41803  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaat 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||     
T  41802 aatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaa 41704  T
Q  198 agatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
     |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41703 tgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 247451 - 247738
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  247451 tgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaaca 247550  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || ||||     
T  247551 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaatt 247650  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247651 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 543 - 828
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  543 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 642  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | | |||||||     
T  643 aatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaatt 742  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtga 284  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  743 gatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 34471 - 34755
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || | |||| |||    
T  34471 ttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaa 34570  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    |  |||||| |||||||||| |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |    
T  34571 tatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 34670  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 283  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34671 atgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9132 - 8846
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |    
T  9132 tgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 9033  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||     
T  9032 aatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 8933  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8932 gatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5356
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |    
T  5070 tgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaa 5169  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  5170 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 5269  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5270 gatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 26424 - 26710
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |    
T  26424 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaa 26523  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  26524 aatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 26623  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26624 gatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8466
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| || |||||| |    
T  8189 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaa 8288  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||     
T  8289 aatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaatt 8385  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8386 gatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 172159 - 171863
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  172159 tgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 172060  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  172059 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 171960  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171959 gatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 177862 - 177566
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  177862 tgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaaca 177763  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || ||||     
T  177762 aatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaatt 177663  T
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177662 gatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 297
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  265 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 199  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  200 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 279
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  126 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 223  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 279
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  126 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 223  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 279  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  155 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 254  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  255 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 139  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  140 acat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 238  Q
     |   ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  239 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5783 - 5660
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |    
T  5783 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaa 5684  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||    
T  5683 aatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 272277 - 271983
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||    
T  272277 ttgctaaatacgtactccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaa 272178  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| ||    
T  272177 tgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattga 272078  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 296  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||  | |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272077 tgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg-ttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa-tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttg 139  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  140 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 238  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  239 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 51191 - 51314
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |    
T  51191 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaa 51290  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  51291 aatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  27 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 125  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  126 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 223  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 89463 - 89586
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |    
T  89463 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaca 89562  T
Q  101 aatgagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||    
T  89563 aattataagttgtgaaaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Original strand, 107795 - 107835
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatg 43  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107795 ttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79745
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 79745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 286
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  26 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 124  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  125 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 223  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | |||||| |  ||||||||| || |     
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  224 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21399
Alignment:
Q  3 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 102  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  103 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 200  Q
    ||| |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttga 21314  T
Q  201 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||| |  ||||||||| || | ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21315 tgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 3
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 107  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  108 agttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 204  Q
    ||||||| | |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  205 gtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
     |  || |||||| || | |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48482
Alignment:
Q  164 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 263  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 48504  T
Q  264 ttgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  48503 ttg-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 286
Target Start/End: Original strand, 26 - 147
Alignment:
Q  164 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 263  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 125  T
Q  264 ttgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  126 ttgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 103  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  104 gagaagttatgaaaattgtgc 124  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54415
Alignment:
Q  42 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 138  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  139 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 237  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  238 tcatggattgatgatga 254  Q
    | |||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatga 54415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3183
Alignment:
Q  199 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 278  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3370
Alignment:
Q  4 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 75  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3441 tgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1815
Alignment:
Q  233 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1867 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 76984 - 77139
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  76984 atgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattca 77083  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77084 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8087 - 8007
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  8087 caattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Original strand, 132505 - 132542
Alignment:
Q  260 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132505 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197525
Alignment:
Q  142 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 240  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatca 197489  T
Q  241 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 277  Q
    ||  |||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  197490 tgctttgatgatgagaa-ttgagttgttgttgttgtt 197525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 56108 - 56226
Alignment:
Q  1 tgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatgta 98  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||||    
T  56108 tgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgta 56207  T
Q  99 gaaatgagaagttatgaaa 117  Q
     |||||  |||||||||||    
T  56208 taaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 254
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104872
Alignment:
Q  176 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 254  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatga 104872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1386
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 46  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9641
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 46  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10739 - 10642
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttg 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| | |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10739 caattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaa-atgaattgttgttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10868
Alignment:
Q  9 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaa 10868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  175 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  268 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22463
Alignment:
Q  8 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 49  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaa 22463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  268 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  165 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 229  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 298
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116806
Alignment:
Q  179 tgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata-ttcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 277  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||| |    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatgga-ttgttgttggtggt 116785  T
Q  278 ttggtgaaatttgtgaattga 298  Q
    || || ||||| |||||||||    
T  116786 tttgtaaaattggtgaattga 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University