View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5845-Insertion-1 (Length: 1000)

Name: NF5845-Insertion-1
Description: NF5845
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5845-Insertion-1
NF5845-Insertion-1
[»] scaffold0014 (6 HSPs)
scaffold0014 (8-954)||(121147-122088)
scaffold0014 (11-823)||(136759-137572)
scaffold0014 (15-702)||(139687-140374)
scaffold0014 (11-399)||(104964-105352)
scaffold0014 (461-839)||(104523-104902)
scaffold0014 (746-841)||(140385-140481)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (11-954)||(26739-27685)
[»] scaffold0654 (1 HSPs)
scaffold0654 (11-954)||(887-1834)
[»] scaffold0652 (2 HSPs)
scaffold0652 (343-954)||(962-1568)
scaffold0652 (11-232)||(5779-6000)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (11-954)||(15714659-15715601)
chr6 (21-391)||(15727402-15727772)
chr6 (474-900)||(15726912-15727340)
chr6 (11-324)||(16702319-16702632)
chr6 (452-922)||(16701855-16702319)
chr6 (167-840)||(24934208-24934882)
chr6 (161-792)||(29866184-29866815)
chr6 (161-792)||(29834750-29835381)
chr6 (119-790)||(29348433-29349104)
chr6 (119-784)||(29098836-29099501)
chr6 (219-784)||(29115854-29116419)
chr6 (147-840)||(29949681-29950375)
chr6 (118-790)||(29084510-29085182)
chr6 (161-783)||(29073298-29073920)
chr6 (161-783)||(29105871-29106493)
chr6 (167-717)||(24739103-24739653)
chr6 (161-792)||(29886832-29887463)
chr6 (147-840)||(24941721-24942415)
chr6 (219-720)||(29366326-29366827)
chr6 (118-792)||(29894045-29894719)
chr6 (150-717)||(21160533-21161100)
chr6 (156-415)||(24272157-24272416)
chr6 (112-773)||(29881921-29882582)
chr6 (112-773)||(29909077-29909738)
chr6 (314-840)||(29953478-29954005)
chr6 (161-393)||(24263984-24264216)
chr6 (23-783)||(29928670-29929430)
chr6 (446-790)||(30126890-30127234)
chr6 (157-404)||(29902787-29903034)
chr6 (92-415)||(29897548-29897866)
chr6 (43-399)||(30153917-30154273)
chr6 (267-792)||(28926380-28926905)
chr6 (455-783)||(29078356-29078684)
chr6 (147-823)||(30149048-30149725)
chr6 (163-415)||(29358189-29358441)
chr6 (468-723)||(24890148-24890403)
chr6 (150-723)||(24730379-24730952)
chr6 (23-412)||(30028535-30028924)
chr6 (460-648)||(29946271-29946459)
chr6 (452-723)||(30060064-30060335)
chr6 (310-648)||(29876509-29876847)
chr6 (239-645)||(29905252-29905658)
chr6 (157-398)||(29889051-29889292)
chr6 (467-790)||(29889571-29889894)
chr6 (161-415)||(24886731-24886985)
chr6 (467-840)||(24897918-24898292)
chr6 (90-199)||(15864173-15864282)
chr6 (544-648)||(25451036-25451140)
chr6 (444-648)||(30999915-31000119)
chr6 (314-504)||(30053115-30053305)
chr6 (487-717)||(30134986-30135217)
chr6 (219-283)||(24890588-24890652)
chr6 (147-279)||(30578114-30578246)
chr6 (118-273)||(29211430-29211585)
chr6 (681-790)||(24263587-24263696)
chr6 (162-296)||(25450444-25450578)
chr6 (681-790)||(29211228-29211337)
chr6 (92-190)||(29954056-29954154)
chr6 (219-301)||(31000262-31000344)
chr6 (156-201)||(29946162-29946207)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (50-898)||(5620-6470)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (11-899)||(16350435-16351325)
chr3 (11-841)||(11990697-11991528)
chr3 (164-724)||(24219136-24219696)
chr3 (453-836)||(33997767-33998151)
chr3 (26-109)||(33997445-33997528)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (11-906)||(2616-3515)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (146-954)||(30984-31784)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (11-798)||(125950-126737)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (11-527)||(13904695-13905212)
[»] scaffold0051 (4 HSPs)
scaffold0051 (50-632)||(43278-43862)
scaffold0051 (11-327)||(50802-51118)
scaffold0051 (460-855)||(47671-48068)
scaffold0051 (742-906)||(43035-43201)
[»] scaffold0308 (3 HSPs)
scaffold0308 (553-922)||(8922-9294)
scaffold0308 (11-336)||(8380-8705)
scaffold0308 (800-898)||(8-107)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (11-399)||(3642422-3642810)
chr7 (467-899)||(3642878-3643312)
chr7 (651-836)||(25861964-25862150)
chr7 (572-753)||(38144592-38144773)
chr7 (225-399)||(38144946-38145120)
chr7 (652-853)||(2857524-2857727)
chr7 (149-243)||(13093890-13093984)
[»] scaffold1840 (2 HSPs)
scaffold1840 (11-399)||(794-1182)
scaffold1840 (467-526)||(1250-1309)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (11-841)||(41315654-41316476)
chr1 (156-853)||(19489780-19490479)
chr1 (155-798)||(17250842-17251485)
chr1 (598-755)||(41198713-41198866)
chr1 (161-282)||(10129672-10129793)
chr1 (156-301)||(4260641-4260786)
chr1 (156-301)||(4264263-4264408)
chr1 (443-504)||(10129954-10130015)
chr1 (617-773)||(28946406-28946563)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (147-840)||(44262377-44263071)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (234-591)||(15062910-15063267)
chr2 (164-243)||(21456140-21456219)
chr2 (555-648)||(33322443-33322534)
[»] scaffold0573 (1 HSPs)
scaffold0573 (267-792)||(3778-4303)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (161-773)||(21878-22490)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (241-648)||(53573-53980)
scaffold0054 (92-320)||(54006-54234)


Alignment Details
Target: scaffold0014 (Bit Score: 675; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 675; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 122088 - 121147
Alignment:
Q  8 aagttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatga 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  122088 aagttggtcaacaccaatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtgactgaggcttatgagttatattctcaaatga 121989  T
Q  108 ttctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtga 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  121988 ttctaaagaaaatttctcctaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccatga 121889  T
Q  208 aatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgata 307  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  121888 aatgctattgaaaaacatcaacccaaatatttatacttttaccatattgattgatgctctttgcaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaaatgtgata 121789  T
Q  308 gttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatg 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  121788 gctgtgatgatgaaagaaggcgtggagcctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagataatgaagtgaataaggcaaagaatg 121689  T
Q  408 tattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagcctt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121688 tattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctaatgttcacagctacactatcattattaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagcctt 121589  T
Q  508 cagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcat 607  Q
     | | ||||||| ||||||| |||  ||         ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  121588 gaatttctttaaagaaatgcattgtgaa---------cctaatacggtaacttacagttctcttattgatgctttgtgcaaatcagggagaatctctcat 121498  T
Q  608 gcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttg 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  121497 gcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgccaatattatcacatacaattccttattgcatgctttatgcaaaaatcatcaagttg 121398  T
Q  708 acaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaag 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  121397 acaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaagatcagggcattcaacccaatattaacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaagaaggaag 121298  T
Q  807 acttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttgga- 904  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  121297 acttgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggctataaggtaaaagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggag 121198  T
Q  905 ggactgtttgatgaagctatga-cctaccggaaaaaatggaagacaatggt 954  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  121197 ggactgtttgatgaagctatgaccctactggaaaaaatggaagacaatggt 121147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 823
Target Start/End: Original strand, 136759 - 137572
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||     
T  136759 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtatagcataattattgatagtttgtgtaaagataaacttgtaattgatgcttatgagttatattctgaaatgattg 136858  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  136859 caaagacaatttctcctgatgttgtcactttcaattctctaatctatggattttgcattgttggtcgattgaaagaagcatttggtttgttccatcaaat 136958  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||| |||||  |||  | | | |    
T  136959 ggtattgaaaaacatcaacccaaatgattatacttttaatatattggttgatgctctttgcaaggaaggaaatgtgaaaggagctaagaatgcgttggct 137058  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
     ||||||| |||| | |  |  ||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  137059 atgatgatcaaaggaagtataaaaccagatgttgttacatacaattcattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggccaaacatgttt 137158  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    | | |   || |    || | || || | ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| || ||    
T  137159 taagcactattgctcgaatgggagtggctcctgatgctcagagctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcaatgaagctttgag 137258  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||     
T  137259 tctctttaatgaaatgcgttgtcaaagaatttctcccaatacggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatctcccatgct 137358  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||    ||  || | || ||||  || ||  || |||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  137359 tggaagcttgtcgatgagatgcatgttaatggtcaaccacctgacatatttacctacagttctttaatagatgctttatgcaaaaacaatcatcttgaca 137458  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagact 809  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||| |||| ||||    
T  137459 aagctattgcattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaaccaaatatgtacacatacaatatacttattgatgggttatgcaaaggaggacgact 137558  T
Q  810 tgagaatgcacaag 823  Q
    | ||||||||||||    
T  137559 taagaatgcacaag 137572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 702
Target Start/End: Original strand, 139687 - 140374
Alignment:
Q  15 tcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaa 114  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || |||  |||||||||| ||||||||  |||    
T  139687 tcaacactaatgtggtaatgcataatacaatcattgatagtttgtgtaaagataaattggtacttgatgcctatgggttatattctgaaatgattgcaaa 139786  T
Q  115 gaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggta 214  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  139787 gaaaatttatcctgatgttgtcactttcagttctctaatctatggattttgtattgttggtcaattcaaagatgcatttcgtttgttccatgaaatggta 139886  T
Q  215 atgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtga 314  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||  ||| || |||  || |    
T  139887 ttgaaaaacatcaaccgagatgtttatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaagaaggagatgtgaaagtagctaagaatctgttagccgtta 139986  T
Q  315 tgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaa 414  Q
    ||||||||||||| ||   |||   ||||||||| ||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||    
T  139987 tgatgaaagaaggtgtaataccggatgttgttacctacggttcattaatggatggatattgcctagttaatgaagtaaataaggccaaacatgtgttcaa 140086  T
Q  415 cgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctc 514  Q
    | | ||     ||| | || || | ||||||| ||| | ||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  140087 cattatttctcaaatgggagtggctcctgatgctcatacctatagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctc 140186  T
Q  515 tttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatggg 614  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     |||| ||||    
T  140187 tttgatgaaatgcgtcgcagaggaattgctcctaatacggtaacttacaattctctcattgatggtttatgcaaatcagggagaatcccctatgcttggg 140286  T
Q  615 agcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatca 702  Q
    ||||| |||||   |||||| |||  |||||||||| |||  || |||||||||| || ||  || ||||| |||| |||||||||||    
T  140287 agcttgttgatacaatgcataataatggtcaacctgccgacatattcacttacaattctttgatagatgctctatgcaaaaaccatca 140374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 105352 - 104964
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||| ||| || ||| ||||||| ||| ||||||||     
T  105352 ttggtcaacaccaatgtggtaatgtataacacagtcattgatagtttgtgcaaagataaacttgtaagtgatgcatatgagttatactctgaaatgatta 105253  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  105252 caaagaaaatttctcctactgttgtcacttttagtgctctaatttatgggttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttggtccatcaaat 105153  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||  | | |  ||||     
T  105152 ggtattgaaaaacatcaacccagatgtgtatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggagatgtgaaaggagctaagagtttcttagtc 105053  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggc 399  Q
    || |||||||||||||| ||   |||   ||||||||| || ||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  105052 gtaatgatgaaagaaggtgtaataccggatgttgttacctacaattcaataatggatggacattgcctagttaatgaagttaacaaggc 104964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 461 - 839
Target Start/End: Complemental strand, 104902 - 104523
Alignment:
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  104902 atcatgattaatggattctgtaagattaaaatgatcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgtagaggaattgctcctaatacggtaactt 104803  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | |  ||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||  ||||||||     |  || |    
T  104802 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatctgggagattctcttgtgcttgggagcttgtggatgagatgcatgttaatggtcaaccacctaacatatt 104703  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaat 760  Q
     |||||||  || ||  || |||||||||| |||||| ||||  ||||||| || ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  104702 tacttacagttctttaatagatgctttatgcaaaaacaatcatcttgacaaagctatgacattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaaccagat 104603  T
Q  761 attaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatct 839  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  104602 atgtacacatacaatatacttattgatgggttatgcaaaggaggacgacttaagaatgcacaagatgtttttcaggatct 104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 841
Target Start/End: Original strand, 140385 - 140481
Alignment:
Q  746 ggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttt 841  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  140385 ggcattcaaccagatatgtatacatacaatatacttattgatggactatgcaaaggaggacgacttaagaatgcacaagatatttttcaagatcttt 140481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 616; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 616; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 954
Target Start/End: Original strand, 26739 - 27685
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26739 ttggtcaacaccaatgtggtaatgtatagcacaatcattgatagtttgtgtaaagagaaattagtgactgaggcttatgagttatattctcaaatgattg 26838  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26839 taaagaaagtttctcctgatgttgtaacttttagtgctctaatctatggattttgcatggttggtcaattcaaagaagcatttggtttgttccatgaaat 26938  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||| |||| || ||| |    
T  26939 ggtattgacaaacatcaaccctgatgtttgtactttcaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaagcacgaaagaaactaaaaatgtgttagct 27038  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||| ||||||    
T  27039 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctgat-ttgttacatatagctctctaatggatgggtattgcttagttaatcaagtaaacaaggccaagcatgtat 27137  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27138 tcaacatcataggaaaaaggagagtgacacctgatgttcacagctacactatcattattaagagattatgtaagattaaaatggtcgatgaagccttgag 27237  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27238 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcccgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatctctcatgca 27337  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27338 tgggagcttcttgatcagatgcatgctagaggtcaacctgccgatgtaatcacatacacctccttcttgcatgctttatgtaaaaaccaccaagttgaca 27437  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagact 809  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27438 aggcagttgcattggtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaaccaaatattaacacgtacaatatacttatcgatggactatgcaaagaaggaagatt 27537  T
Q  810 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttgga-gga 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27538 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggctataaggtaacagtctggacatataatattatgattaatggtctttgtttggaggga 27637  T
Q  908 ctgtttgatgaagctatga-cctaccggaaaaaatggaagacaatggt 954  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27638 ttgtttgatgaagctatgaccctactggaaaaaatggaagataatggt 27685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 1834 - 887
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||  |||||||||| ||||||||     
T  1834 ttggttaacactgatgtggtaatgtatagcacaatcattgatagtttgtgtaaagataaattggtgaccgaggcatatgtgttatattctgaaatgatta 1735  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  1734 caaagagaatttctcccgatgttgtcacttttagtgctctgatttatggattttgcattgttggtcaactgaaagaagcatttggtttgtttcacgaaat 1635  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||| |    
T  1634 ggtattgaaaaacatcaaccctgatgtgtatacttttaatatattggtcgatgctttttgtaaggaaggaaacacgaaagaagctaaaaatgtgatagct 1535  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
     |||||||||||||||| |||  |||   ||||||||| ||   | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || ||  |||| |    
T  1534 atgatgatgaaagaaggtgtgataccggatgttgttacctacggttcattaatggatggatattgcctagttaataaagtaaataaagccaaacatgtgt 1435  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    | | | | ||      || | || |||| ||| ||| | | ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1434 taagcctgatttctcgaatgggattgactcctaatgctaatagctataatattattattaatggattctgtaagattaaaatggtcgatgaagccttaaa 1335  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||    
T  1334 tctctttaatgaaatgtgttgcagaggaattgctcctgataaggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggaaaatttctcatgca 1235  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234 tgggagcttcttgattagatgcatgatagaggtcaacatgcaaatgtgatcacttacaattccttcttacacgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 1135  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagact 809  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  1134 aggcaattgcatttgtcaagaaaattaaagatcatggcattcaaccttatattaacacatacaatatacttatcgatggactttgcaaagaagtaagact 1035  T
Q  810 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttgga-gga 907  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1034 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggctataaggtaacggtctggacatataatattatgattaatggcctttgtttggaggga 935  T
Q  908 ctgtttgatgaagctatga-cctaccggaaaaaatggaagacaatggt 954  Q
     |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  934 ttgtttgatcaagctatgatcctgctggaaaaaatggaagaaaatggt 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 343 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 1568 - 962
Alignment:
Q  343 tgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacct 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1568 tgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagctaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacct 1469  T
Q  443 gatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaatta 542  Q
     |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||           
T  1468 tatgttttcagctacattatcattattaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaa------- 1376  T
Q  543 ctcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagagg 642  Q
      ||  |||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1375 --cccaatacagtaacttacaactctctaattgacggtttgtgcaaatcagggagaatttctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagagg 1278  T
Q  643 tcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggc 742  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1277 tcaacctgccgatgtgatcacttacaattccttcttacacgctttatgtaaaaatcatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaagat 1178  T
Q  743 caaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tt 840  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1177 cagggcattcaacccaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaaagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttt 1078  T
Q  841 tgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttgga-ggactgtttgatgaagctatga-cctaccggaaaa 938  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1077 tgattaaaggctataaggtaacactctggacatatacaattatgattaatggtctttgtctggagggattgtttgatgaagctatgaccctactggaaaa 978  T
Q  939 aatggaagacaatggt 954  Q
    ||||||||||||||||    
T  977 aatggaagacaatggt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5779
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6000 ttggttaacactggtgttgtaatgtataacacaatcattgatagtttgtgtaaagagaaattggtgactgaggcttatgagttatattctcaaatgattg 5901  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5900 taaagaaaatttctcctgatgttgttactttgagctctctaatatttggattttgcattgttggtcaactgaaagaagcattttgtttgttccatgaaat 5801  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaaccca 232  Q
    | || ||| ||||||| |||||    
T  5800 gctattgacaaacatccaccca 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 15715601 - 15714659
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||| | |||   |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  15715601 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataccgcaatcatcgatagtttgtgtaaaaataaagatgtaaatgatgcctatgagttatattctgaaatgatta 15715502  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaag-aagcatttggtttgttccgtgaaa 209  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15715501 caaagagaatttctcctaatgttgtaacttttagtgctctcatttatggcttttgcatggttggtcaattcaaaacaagcatttggtttgttccatgaaa 15715402  T
Q  210 tggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagt 309  Q
    ||||| | | |||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||     
T  15715401 tggtattaacaaacatcctcccaaatgtttatacttctaatatcttggttgatgctctttgtaaagaaggaaatgttaaacaagctaaaaatatgatagc 15715302  T
Q  310 tgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgta 409  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||    
T  15715301 tatgatgatgaaacaaggtgtggtacccgatgttgttacatatacttcactaatggatgggtattgcttagttaatcaagtgaacaaggccaagcatgta 15715202  T
Q  410 ttcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttca 509  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15715201 ttcaacatcttagggaaaaggaaaattaaacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttga 15715102  T
Q  510 gtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgc 609  Q
     |||||| || |||||||  ||  ||         ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||    
T  15715101 atctcttcaaagaaatgcactgtgaa---------cctaatatggtaacttacagttctcttattgatggtttatgcaaatctgggagagtttctcatgc 15715011  T
Q  610 atgggagcttcttgatcagatgcatgat---agaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagtt 706  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15715010 ttgggagcttcttgataagatgcatgatgacagaggtcaacctgtcaatattatcacatacaattccttattgcatgctttatgcaaaaatcatcacgtt 15714911  T
Q  707 gacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaa 805  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15714910 gacaaggcaattgctttggtcaagaagatcaaagaccaaggaattgaaccaaatatgaccacatacaacatccttatcgatggactatgcaaagaaggaa 15714811  T
Q  806 gacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttgga 904  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||    
T  15714810 gacttaggaacgcacaagtgatttttaaacatcttttgattataggctataatttaactgtttggacatagagtattatgatcaatggtctttgtttaga 15714711  T
Q  905 ggac-tgtttgatgaagctatga-cctaccggaaaaaatggaagacaatggt 954  Q
    || | | |||||||||||  ||| ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  15714710 gggcttatttgatgaagcagtgaccctgctgtcaaaaatggaagacaatggt 15714659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15727772 - 15727402
Alignment:
Q  21 ccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaat 120  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  15727772 ccgatgtggtaatgcacaatacgatcattgatagtttgtgtaaacataaatttgtaactgatgcctatgagttatattctgaaatgattacaaagagaat 15727673  T
Q  121 ttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaa 220  Q
    |||||| ||| || | ||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||    
T  15727672 ttctcctaatattatcactttcaattctttaatttacggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttctatcaaatgctattgaaa 15727573  T
Q  221 aacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatga 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15727572 aacatcaacccagatatttatacttttaacatattggttgatgttctatgtaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaaatgtgatagctgtgatgatga 15727473  T
Q  321 aagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtg 391  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15727472 aagaaggtgtggaacctgatgttgttacatacaattcattaatggatggttattgcctagttaaagaagtg 15727402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 474 - 900
Target Start/End: Complemental strand, 15727340 - 15726912
Alignment:
Q  474 gcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcat 573  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15727340 gcttgtgtaagattaaaatgatcgatgaagccttgagtctctttaatgaaatgcgtagcaaaggaattactcctgataaggtaacttacaattctctcat 15727241  T
Q  574 tgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactcc 673  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||      ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||  |||  ||| | | |  || |||||||||| ||     
T  15727240 tgatggtttgtgcaaagcaaggagaatcccctgtgcttgggagtttgttgatgagatgcatgctaatggtataccagccaacatattcacttacaattcg 15727141  T
Q  674 ttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacataca 773  Q
    ||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||  | ||||| |    
T  15727140 ttaatagatgctttatgcaaaaaccatcacgttgacaaggcaattgtattagtcaagaaaatcaaagaccagggcattcaatcagatatgtatacatata 15727041  T
Q  774 gtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggac 871  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  ||||| ||    
T  15727040 gtatacttatcgatggactatgcaaacaaggaagacttaaggatgcacaagtgatttttcaagatcttttgattaaaggctataatttaaatgtttgcac 15726941  T
Q  872 atataatactatgattaatggtctttgtt 900  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15726940 atatagtattatgatcaatggtctttgtt 15726912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16702632 - 16702319
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||| | ||||||||||| ||| | |||| ||| || |||   ||||||||  ||||||||     
T  16702632 ttggtcaacaccaatgtggtaatgtatagtacagtcattgatggtttgtgtaaagataaactagtaattgatgcctatggtttatattcagaaatgattg 16702533  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  16702532 taaagagaattcctcccaccgttgtcactttcagttctctaatctattgattttgcattgttggtcaattgaaagaagcgtttagtttgttccatgaaat 16702433  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |    
T  16702432 ggtattgaaaaacatcaacccaaatgtttatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggacggaaagatcaaagaagctaaaaatgtgatagct 16702333  T
Q  311 gtgatgatgaaaga 324  Q
    ||||||||| ||||    
T  16702332 gtgatgatgtaaga 16702319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 452 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 16702319 - 16701855
Alignment:
Q  452 agctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgata 551  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||         ||  |||    
T  16702319 agctacaatatccttattaatggattatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaa---------cccaata 16702229  T
Q  552 aggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgt 651  Q
      ||| ||||||   |||| |||||||| || |||||||| | |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  16702228 cagtatcttacaacactcttattgatggattctgcaaatctgggagactttctcatgcttggaagcttcttgatcagatgcgtgatagaggccaacctcc 16702129  T
Q  652 cgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcatt 751  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  16702128 caatgtaatcacttacaattccttattacatgctttatgtaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcattggtcaacaattttaaagaccaaggcatt 16702029  T
Q  752 caaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaag 849  Q
    |||||| ||||  ||||||| | || |||| | |||||||||||| || ||||||||||| || | || ||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  16702028 caaccagatatgcacacatataatacacttgttgatggactatgcaaacaaggaagacttaaggacgcgcaactgatttttcaagatcttttgattaaag 16701929  T
Q  850 gctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggaggac-tgtttgatgaagct 922  Q
    |||| ||  || ||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  16701928 gctacaatttaccaacctggacatataatattatgatcaatggtctttgtttagagggcttgcttgatgaagct 16701855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 840
Target Start/End: Original strand, 24934208 - 24934882
Alignment:
Q  167 attgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctc 266  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |     
T  24934208 attgtgggtcgattgaaagaagcagttggtttgttcaatcaaatgttgttgaaaaacattaaaccagacgtttatacatttaatatattggttgatggtt 24934307  T
Q  267 tttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatgga 366  Q
    | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |||| |||||  ||| | ||||||| |||||| | ||||||||    
T  24934308 tatgtaaggaaggagagatgaaaaaagctagaaatgtgttagctgttatgataaaacaaggtgtggattctaatattgttacttataattctttaatgga 24934407  T
Q  367 tgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcatt 466  Q
    |||||||| | | || ||  ||| ||||||||| |    ||| ||||||   || |  | |||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  24934408 tgggtatttcttggtcaaacaagagaataaggccacatttgtgttcaacactatggctagaaggggagtgactcctgatgttcaaagctacagtattatg 24934507  T
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| | | |||||| || ||||||| || |||| | ||  ||||| |||  ||||| |||| ||    
T  24934508 attaatggactatgcaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcttcaaagaaatgcattccaaaagtatggctcctaatactgtaacatacaatt 24934607  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    | || || |||||| |   |||||  | |||||| | | |||| ||||| ||| |  || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24934608 cacttatcgatggtcttctcaaatatgggagaatctctgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacctgccgatgtgatcactta 24934707  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaac 766  Q
    ||  ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||| |||||| ||||| ||||||||| |     
T  24934708 cagttccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattaataacgaagatcaaagaccaaggaattcagccaaatatttat 24934807  T
Q  767 acatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    || |||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||    
T  24934808 acttacactatacttgttgatggactatgcaaaaatggaagacttaaggatgcacaagcggtttatcaggatctt 24934882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 792
Target Start/End: Original strand, 29866184 - 29866815
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  | || ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  29866184 ttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacattggaaaacatcaaccctgatatgtatacctttaatatattggttg 29866283  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    ||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||| ||||   | ||    
T  29866284 atgcattttgtaaggaaggaaaaatgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgcttt 29866383  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||   || |   |  || || |||  |||||| ||||||| |||| |    
T  29866384 aatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaacacaatggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagt 29866483  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||| | ||||||||  | |||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||||||  ||||||||    
T  29866484 atcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaactt 29866583  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||| | || ||| | | |||| | | ||||  ||||| ||||||||||| | |||  |||    ||| ||||    
T  29866584 acaattcccttattgatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataat 29866683  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||| || |||| ||| || |||| ||||||    
T  29866684 tacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgtt-attaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaa 29866782  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  29866783 tatgtacacatacactattcttattgatggact 29866815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 792
Target Start/End: Original strand, 29834750 - 29835381
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  | || ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  29834750 ttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacattggaaaacatcaaccctgatatgtatacctttaatatattggttg 29834849  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    ||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||| ||||   | ||    
T  29834850 atgcattttgtaaggaaggaaaaatgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgcttt 29834949  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||   || |   |  || || |||  |||||| ||||||| |||| |    
T  29834950 aatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaacacaatggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagt 29835049  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||| | ||||||||  | |||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||||||  ||||||||    
T  29835050 atcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaactt 29835149  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||| ||| || |||||||||||||| ||||  | || ||| | | |||| | | ||||  ||||| ||||||||||| | |||  |||    ||| ||||    
T  29835150 acaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataat 29835249  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||| ||| || |||| ||||||    
T  29835250 tacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgtt-attaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaa 29835348  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  29835349 tatgtacacatacactattcttattgatggact 29835381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 29349104 - 29348433
Alignment:
Q  119 atttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||  || ||||   ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||  | ||||| ||  |     
T  29349104 atttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgatatcgg 29349005  T
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgat 318  Q
    || | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| | |||||||    
T  29349004 aagaaatcaaccctgatgtgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgat 29348905  T
Q  319 gaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtc 418  Q
    |||| ||||| |  |||||  ||||||||| |||    | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||       
T  29348904 gaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaacact 29348805  T
Q  419 ataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttta 518  Q
    || |   |  || || ||||  || ||||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  29348804 atggctcaggggggagtgactgctaatgttcagagctacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctcttta 29348705  T
Q  519 atgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagct 618  Q
    | ||||||| |||||||   |||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| || ||| | | |||| | | ||||    
T  29348704 aagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcagggaaaatctcttatgctttgaagct 29348605  T
Q  619 tcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaatt 718  Q
      | ||| |||||||||||||||||  |||    |||  ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29348604 agtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaattacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatt 29348505  T
Q  719 gcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatgga 790  Q
    || ||| | | ||| || ||||   |||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  29348504 gcgttgttaacgaagatgaaagatgaaggaattcaaccagatatgtacacatacactattcttattgatgga 29348433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 784
Target Start/End: Original strand, 29098836 - 29099501
Alignment:
Q  119 atttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||  || ||||   ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| || ||     
T  29098836 atttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgg 29098935  T
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgat 318  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||| || || | || | | | |||||||    
T  29098936 aaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttaatgcattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgatatgatgat 29099035  T
Q  319 gaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtc 418  Q
    |||| ||||| |  |||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||       
T  29099036 gaaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacact 29099135  T
Q  419 ataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttta 518  Q
    || |   |  || || |||  |||||| |||| || |||| |||||| ||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||    
T  29099136 atggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctcttta 29099235  T
Q  519 atgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagct 618  Q
    | ||||||| | |||||   |||| |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||| |   |||| | | ||||    
T  29099236 aagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagct 29099335  T
Q  619 tcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaatt 718  Q
    | | |||||||||||||||||||||  |||     || ||   |||||||| ||  | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29099336 tgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatatgtacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaagttgacaaagcaatt 29099435  T
Q  719 gcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatc 784  Q
    |||||| | | |||| |||||| | | ||  |||||||| ||||   |||||||||||| ||||||    
T  29099436 gcattgttaacgaaatttaaagacaagggttttcaaccagatatatccacatacagtattcttatc 29099501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 784
Target Start/End: Original strand, 29115854 - 29116419
Alignment:
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgat 318  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||||| || || | || | | | |||||||    
T  29115854 aaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttaatgcattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgatatgatgat 29115953  T
Q  319 gaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtc 418  Q
    |||| ||||| |  |||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||       
T  29115954 gaaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacact 29116053  T
Q  419 ataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttta 518  Q
    || |   |  || || |||  |||||| |||| || |||| |||||| ||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||    
T  29116054 atggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctcttta 29116153  T
Q  519 atgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagct 618  Q
    | ||||||| | |||||   |||| |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||| |   |||| | | ||||    
T  29116154 aagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagct 29116253  T
Q  619 tcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaatt 718  Q
    | | |||||||||||||||||||||  |||      | ||   |||||||| ||  | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29116254 tgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctactatacgtacttacaattctatattagatgctttatgcaaaatccatcaagttgacaaagcaatt 29116353  T
Q  719 gcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatc 784  Q
    |||||| | | |||| | |||| | | || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  29116354 gcattgttaacgaaattgaaagacaagggtattcaaccaaatatgtacacatacagtattcttatc 29116419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 29950375 - 29949681
Alignment:
Q  147 ctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttt 246  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||   | |||||   |||||||||||||  || ||||||  ||||||    
T  29950375 ctctaatatatggtttttccattttgggtcaaatgaaagaagcagttggtttgttaaatcaaatgtcgatgaaaaacatcagtccggatgttcttacttt 29950276  T
Q  247 taatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgtt 346  Q
     | || ||||||||||| | | |||||| ||||| || | ||| |||||||| || || | | ||| ||||| ||| || | |||||||||  | |||||    
T  29950275 cactacattggtcgatggtttatgtaagcaaggagaggtgaaaaaagctagacatgtgttggctgttatgataaaacaacgtgtggaacctgatattgtt 29950176  T
Q  347 acatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatg 446  Q
    || |||| | | ||||||||||| |||| | | ||||| ||||| || ||||| ||  || ||||||||  | |      |||| || |||| ||| |||    
T  29950175 acttatagttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtcaacaaggccaaacatctattcaacacccttcctctaaggggagtgactcctaatg 29950076  T
Q  447 ttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcc 546  Q
    ||   ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||    | |||||| || ||||||| || ||     || |||||    
T  29950075 tttttagctacaatatcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtgaatgaagctgcgaatctcttcaaagaaatgcattccagtaatatgactcc 29949976  T
Q  547 tgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaa 646  Q
     ||||  ||| | |||| |||||| ||||||||  | |||||||||| |||||| | | |||  ||||| |||||||   |||||||||||| ||| |||    
T  29949975 agatactgtatcatacaattctcttattgatggactttgcaaatcagggagaatctctgatgtttgggatcttcttgtcgagatgcatgatataggccaa 29949876  T
Q  647 cctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaag 746  Q
    ||||   |||| ||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || || || |||| |||||    
T  29949875 cctgctaatgtgatcacttacaattctttattagatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcgattgcattattaaaaaagataaaagaccaag 29949776  T
Q  747 gcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    | ||||| ||||||||  | ||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  29949775 gaattcagccaaatatgtatacatacactatacttgttgatggactatgcaaaaatggaagacttgaggatgcacaagagatttatcatgatctt 29949681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 790
Target Start/End: Original strand, 29084510 - 29085182
Alignment:
Q  118 aatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  || ||||   ||| |||| | |||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||  || ||    
T  29084510 aatttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcgttgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaataatattg 29084609  T
Q  218 aaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatga 317  Q
     |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||| || || | || | | | ||||||    
T  29084610 gaaaacatcaaaccggatgggtatacttttaatatattggttgatggattttgtaaggacagaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatga 29084709  T
Q  318 tgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgt 417  Q
    ||||| ||||| |   ||||  ||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||      
T  29084710 tgaaacaaggcatcatacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaatacggctaagagtatattcaacac 29084809  T
Q  418 cataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttt 517  Q
     || |   || |  || |||  |||||| ||| ||| |||| |||| | |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||  | | |||||||    
T  29084810 tatggctcaaggcggagtgaatcctgatattcgcagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgataaagctatgaatctcttt 29084909  T
Q  518 aatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagc 617  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| ||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |   |||| | | |||    
T  29084910 aatgaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacaattctcttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagc 29085009  T
Q  618 ttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaat 717  Q
    || | |||||||||||||||||||||  |||     || || | |||||||| ||  |  || |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  29085010 ttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatacttacttacaattctataatagatgctttattcaaaacccatcaagttgacaaagcaat 29085109  T
Q  718 tgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatgga 790  Q
    ||||||| | | |||| |||||| ||| || ||||||||||  ||  ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  29085110 tgcattgataacgaaatttaaagaccagggtattcaaccaagcatgtacacatacactattcttattgatgga 29085182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 783
Target Start/End: Original strand, 29073298 - 29073920
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| || || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29073298 tttttcattgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttg 29073397  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    |||   |||||||||| |||||||| ||||||| || || | || | | | ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||| |||    | ||    
T  29073398 atggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctcttt 29073497  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||   || |   |  || || |||  ||||||  ||| || |||| |    
T  29073498 aatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaacactatggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaat 29073597  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||   |||| |||| ||  ||| ||||    
T  29073598 atcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgactt 29073697  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| |||||||||||||||||  |||    ||| ||||    
T  29073698 acacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataat 29073797  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| |||| |||||     
T  29073798 tacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcatt-attaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaac 29073896  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttat 783  Q
    |||  ||||||||| ||| |||||    
T  29073897 tatgcacacatacactattcttat 29073920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 783
Target Start/End: Original strand, 29105871 - 29106493
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| || || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29105871 tttttcattgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttg 29105970  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    |||   |||||||||| |||||||| ||||||| || || | || | | | ||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||| |||    | ||    
T  29105971 atggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctcttt 29106070  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||   || |   |  || || |||  ||||||  ||| || |||| |    
T  29106071 aatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaacactatggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaat 29106170  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||   |||| |||| ||  ||| ||||    
T  29106171 atcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgactt 29106270  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| |||||||||||||||||  |||    ||| ||||    
T  29106271 acacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataat 29106370  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| |||| |||||     
T  29106371 tacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcatt-attaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaac 29106469  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttat 783  Q
    |||  ||||||||| ||| |||||    
T  29106470 tatgcacacatacactattcttat 29106493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 24739653 - 24739103
Alignment:
Q  167 attgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctc 266  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |  |||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |     
T  24739653 attgtgggtcgattgaaagaagcagttggtttgttcaatcaaatgttgttgaaaaacattaaaccagacatttatacatttaatatattggttgatggtt 24739554  T
Q  267 tttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatgga 366  Q
    | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| || | ||||| |||  |||  |||| |||||| | || |||||    
T  24739553 tatgtaaggaaggagagatgaaaaaagctagaaatgtgttagctgttatgataaaacaaagtgtggatcctgatgtcattacttataattctttgatgga 24739454  T
Q  367 tgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcatt 466  Q
    |||||||| | | || ||  ||| ||||||||| |    ||| ||||||   || |  | |||| || |||| ||||||||||| ||||| | | ||||     
T  24739453 tgggtatttcttggtcaaacaagagaataaggccacatttgtgttcaacactatggctagaaggggagtgactcctgatgttcatagctatagtgtcatg 24739354  T
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| | || ||||||| || |||| | ||  ||||| |||  ||||| |||||||    
T  24739353 attaatggactatgtaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcctcaaagaaatgcattccaaaagtatggctcctaatactgtaacatacagtt 24739254  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    | || || |||||| |   |||||| | |||||| | | |||| ||||| ||| |  || |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  24739253 cacttatcgatggtcttcacaaatctgggagaatctttgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacctgctgatgtgatcactta 24739154  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaat 717  Q
    ||| ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24739153 caattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaat 24739103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 792
Target Start/End: Original strand, 29886832 - 29887463
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||| |||  | |||||  |  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  29886832 ttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaactgatttattcaataaaatgacatcgaaaaacatcaacccaactgtgtatacttttaatatattggttg 29886931  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    ||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||| ||||| |  | |||| || |||||| ||||   | ||    
T  29886932 atgcattttgtaaggaaggaaacgtaaaagaggctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcatcaatcctaatgctgttacttatagctcttt 29887031  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||  | |||||| |   ||       ||| || ||||  || |||||   ||||||| |    
T  29887032 aatggatggatattgcctagttaatgaagtgaacaatgccaagggtatattcagcactatgtctcttaggggagtgactgctaatgtttggagctacaat 29887131  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||| | ||||||| ||| | |  | | | |||||||  ||||||||    
T  29887132 atcatgattaatggattttgtaagattaaaatgaccgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaactaattcctgatgtggtaactt 29887231  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    ||| ||| || ||  |||||||||||||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    ||| ||||    
T  29887232 acaattcccttatcaatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataat 29887331  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||  || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||| || |||| ||| || |||| ||||||    
T  29887332 tacttacagttctttattagatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgtt-attaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaa 29887430  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  29887431 tatgtacacatacactattcttattgatggact 29887463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 840
Target Start/End: Original strand, 24941721 - 24942415
Alignment:
Q  147 ctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttt 246  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  || |||||||   | ||||| |  |||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  24941721 ctctaatatatggcttttgtattgtgggtcaatttaaagaagctgttcgtttgttaaatcaaatgttgttgaaaaacatcagcccggatgttcaaacttt 24941820  T
Q  247 taatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgtt 346  Q
    ||||| |||||| |||| | | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  24941821 taatacattggttgatggtttatgtaaggaaggagaaattaaacaagctagaaatgtgttagctgttatgataaaacaaggtgtggaacctaatgttgtt 24941920  T
Q  347 acatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatg 446  Q
    || |||| | | || |||||||||| || | | ||||| |||||||| | ||| |   |||||||||||   || |   ||||  || || | ||| ||     
T  24941921 acttatacttctttgatggatgggtgtttcttggttaaagaagtgaacagggccacatatgtattcaacactatggctcaaagaggagtggctcctaatc 24942020  T
Q  447 ttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcc 546  Q
    |||| ||||||| | |||| || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||| ||| |   | |   ||  ||||    
T  24942021 ttcatagctacagtgtcatgataactggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgtcaatctcttcaaagaattgcatataagaaacatggctcc 24942120  T
Q  547 tgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaa 646  Q
    |||||   ||   |||||||| || ||||||||  | |||||||| |  ||||| | | |||  ||||| ||| | ||| |||||||| ||||||| |||    
T  24942121 tgatattatagtatacagttcgcttattgatggactttgcaaatcgggaagaatctctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatagaggccaa 24942220  T
Q  647 cctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaag 746  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||| || |||| |||||    
T  24942221 cctgctgatgtgatcacgtacaattccttattggatgctttgttcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattacattattaatgaagatcaaagaccaag 24942320  T
Q  747 gcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    | ||||| ||||||||  | || |||| ||||||| | |||||||||||||| || |||||| || || ||||||||| | ||| |||| |||||    
T  24942321 gaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgatggactatgcaaaaatggaagatttaagcatgcacaagcggtttatcagtatctt 24942415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 29366827 - 29366326
Alignment:
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgat 318  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| || ||| | |||||||    
T  29366827 aaaacatcaacccaaatgtgtatacttttaacatattggttgatggattttgtaaggaaagaaggttgaaagaagctaaaaatgtgctagctatgatgat 29366728  T
Q  319 gaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtc 418  Q
    |||| ||||| |  |||||   ||| |||| |||||  | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  || ||||||||       
T  29366727 gaaacaaggcattaaacctgacgtttttacttataactctttaatggatagatattgcctagttaaagaagtcaataaggctaaacatatattcaacact 29366628  T
Q  419 ataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttta 518  Q
    |||    | ||| || |||  ||| || |||||||||||| |||||| ||| | || || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||    
T  29366627 atatctcagaggggagtgaatcctaatattcacagctacagtatcatgattcacgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctcttta 29366528  T
Q  519 atgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagct 618  Q
    | ||||||| ||||||    |||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  | || ||| | | |||| | | ||||    
T  29366527 aagaaatgcattgcaataacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagct 29366428  T
Q  619 tcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaatt 718  Q
      | ||| |||||||||||||||||  |||    |||  ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29366427 agtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaattacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatt 29366328  T
Q  719 gc 720  Q
    ||    
T  29366327 gc 29366326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 792
Target Start/End: Original strand, 29894045 - 29894719
Alignment:
Q  118 aatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  || ||||   ||| |||| || |||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| || ||    
T  29894045 aatttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcactgttggtcaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattg 29894144  T
Q  218 aaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatga 317  Q
     |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| || || | || | | | ||||||    
T  29894145 gaaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatga 29894244  T
Q  318 tgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgt 417  Q
    ||||| ||||| |  |||||| ||||||||| |||    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||  ||      
T  29894245 tgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacctattgctctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacac 29894344  T
Q  418 cataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctcttt 517  Q
     ||     | ||| || |||  |||||| |||| || |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||  | | |||||||    
T  29894345 tatgtctcagaggggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt 29894444  T
Q  518 aatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagc 617  Q
    || ||||||| |  ||||   |||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  | || ||| | | |||| | | |||    
T  29894445 aaagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagc 29894544  T
Q  618 ttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaat 717  Q
    |  ||||| ||||||||||| | |||  |||    ||| |||| |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29894545 tagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaat 29894644  T
Q  718 tgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    ||| ||  | || |||||| |||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  29894645 tgcgtt-attaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattcttattgatggact 29894719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 21161100 - 21160533
Alignment:
Q  150 taatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaa 249  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| |  |||||||||||| |||  |||||   ||||||||    
T  21161100 taatatatggcttttgcattgtgggtcaaatgaaacaagcaattgatttgttaaatgaaatgttgttgaaaaacatcagccccaatgttgtaacttttaa 21161001  T
Q  250 tatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttaca 349  Q
     | |||||| |||| | | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||  || ||| | | ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||     
T  21161000 cacattggttgatggtttatgtaaggaaggagagatgaaaaaagctagaaaagtgttagcttttatgataaaacaaggcgtggaacttaatgttgttact 21160901  T
Q  350 tataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttc 449  Q
    |||| |   || ||||||||||||| | | || || |||||||||||||| |    ||| ||||||   || |  | |||| || ||||  || ||||||    
T  21160900 tatagttttttgatggatgggtatttcttggtcaaagaagtgaataaggccacatttgtgttcaacactatggttagaaggggagtgacttctaatgttc 21160801  T
Q  450 acagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctga 549  Q
    | ||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||  |||   ||  |||||||    
T  21160800 atagctatactgtcatgattaatggactatgtaagaataaaatggtggatgaagccgttaatctctttaaagaaatgcatttaaaaaacatggctcctga 21160701  T
Q  550 taaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacct 649  Q
    ||  ||||| |||| ||| || || |||||| |   |||||  | |||||| | | |||| ||||| ||| |  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  21160700 tattgtaacatacaattcacttatcgatggtcttctcaaatatgggagaatctctgatgcttgggatcttgtaaatgagatgcataatagaggccaacct 21160601  T
Q  650 gtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaat 717  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21160600 gctgatgtgatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacatggcaat 21160533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24272416 - 24272157
Alignment:
Q  156 atggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatatt 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  |  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24272416 atggtttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacatcggaaaacatcaaccctgatgtgtatacttttaatatatt 24272317  T
Q  256 ggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataat 355  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||  | ||| | ||||||||||| ||||| |  |||||   |||||||| |||||     
T  24272316 ggttgatgcattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgggttagctatgatgatgaaacaaggcattaaacctgacgttgttacttataac 24272217  T
Q  356 acattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaac 415  Q
     | ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  24272216 tctttaatggatcgatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccaagagtatattcaac 24272157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 773
Target Start/End: Original strand, 29881921 - 29882582
Alignment:
Q  112 aaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||  || ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||   | |||||    
T  29881921 aaagagaatttctcctaatgttgtcacttatagtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttgtttaataaaatg 29882020  T
Q  212 gtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttg 311  Q
     || || |||||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| |     
T  29882021 atattggaaaacatcaatccgaatgtgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagcta 29882120  T
Q  312 tgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtatt 411  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||||| || |   | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||| | ||||    
T  29882121 tgatgatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatatt 29882220  T
Q  412 caacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagt 511  Q
    ||||   ||     | ||| || ||||  || ||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |      
T  29882221 caacactatgtctcataggggagtgactgctaatgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaa 29882320  T
Q  512 ctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcat 611  Q
    || || || ||||||| |  ||||  ||||  |||||||  | ||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||| |  |||||||   |||| |    
T  29882321 cttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctt 29882420  T
Q  612 gggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaa 711  Q
     ||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||     ||| |||| || ||||| ||  | ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29882421 tggaacttgtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataattacctacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaa 29882520  T
Q  712 ggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacataca 773  Q
     |||||||||||  | || |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  29882521 agcaattgcatt-attaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccagatatgaacacataca 29882582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 773
Target Start/End: Original strand, 29909077 - 29909738
Alignment:
Q  112 aaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||  || ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||   | |||||    
T  29909077 aaagagaatttctcctaatgttgtcacttatagtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttgtttaataaaatg 29909176  T
Q  212 gtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttg 311  Q
     || || |||||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| |     
T  29909177 atattggaaaacatcaatccgaatgtgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagcta 29909276  T
Q  312 tgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtatt 411  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||||| || |   | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||| | ||||    
T  29909277 tgatgatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatatt 29909376  T
Q  412 caacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagt 511  Q
    ||||   ||     | ||| || ||||  || ||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |      
T  29909377 caacactatgtctcataggggagtgactgctaatgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaa 29909476  T
Q  512 ctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcat 611  Q
    || || || ||||||| |  ||||  ||||  |||||||  | ||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||| |  |||||||   |||| |    
T  29909477 cttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctt 29909576  T
Q  612 gggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaa 711  Q
     ||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||     ||| |||| || ||||| ||  | ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29909577 tggaacttgtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataattacctacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaa 29909676  T
Q  712 ggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacataca 773  Q
     |||||||||||  | || |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  29909677 agcaattgcatt-attaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccagatatgaacacataca 29909738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 29954005 - 29953478
Alignment:
Q  314 atgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattca 413  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |   || ||||||    
T  29954005 atgataaaacaaggtgtggaacctaatgttgttacttatacttctttgatggatgggtatttcctagttaaagaagtcaacaaggccacatatatattca 29953906  T
Q  414 acgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtct 513  Q
    ||   || |   ||||| || |||| |||||  |||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||    | |||    
T  29953905 acactattgctcaaaggggagtgactcctgaacttcatagctacaatgtcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtgaatgaagctgcgaatct 29953806  T
Q  514 ctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgg 613  Q
    ||| || || |||| || || |   || ||||||||||   || | |||| |||||| ||||||||  | |||||||||| ||| || | | |||  |||    
T  29953805 cttcaaagatatgcattccagaaatatgactcctgatacaatatcatacaattctcttattgatggactttgcaaatcagggagcatctctgatgtttgg 29953706  T
Q  614 gagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaagg 713  Q
    || ||| | ||| |||||||| ||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| || || ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29953705 gatcttatagatgagatgcataatagatgtcaaccggttaatgtgatcacttacaattctttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaagg 29953606  T
Q  714 caattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttga 812  Q
    | ||||||||  | ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||     
T  29953605 cgattgcattattaaagaagatgaaagaccaagggattcagccaaatatgtatacatacactatacttgttgatgggctatgcaaaaatggaagacttgc 29953506  T
Q  813 gaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    | |||||| || ||||| ||| ||||||    
T  29953505 ggatgcacgagagatttatcatgatctt 29953478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24264216 - 24263984
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  |  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24264216 ttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacatcggaaaacatcaaccctgatgtgtatacttttaatatattggttg 24264117  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    ||||  ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||  | ||| | ||||||||||| ||||| |  |||||    ||||||| |||||  | ||    
T  24264116 atgcattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgggttagctatgatgatgaaacaaggcattaaacctgacattgttacttataactcttt 24264017  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaa 393  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  24264016 aatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaa 24263984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 783
Target Start/End: Original strand, 29928670 - 29929430
Alignment:
Q  23 gatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaattt 122  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||| |  |||||||||| |||   || | ||| |||| | | ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||    
T  29928670 gatgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggttgcaaagagaattt 29928769  T
Q  123 ctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaa 222  Q
    |||| |||||||| ||||  ||  || ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| || || ||||    
T  29928770 ctcctaatgttgtcacttatagtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcatttgatttttttaataaaatgatattgtaaaa 29928869  T
Q  223 catcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaa 322  Q
    |||||  ||  || | ||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| | |||||||||||    
T  29928870 catcattccgtatttgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaa 29928969  T
Q  323 gaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcatag 422  Q
     ||||| |  |||||  ||||||||| || |   | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||   ||      
T  29928970 caaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtcttgtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgt 29929069  T
Q  423 gaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatga 522  Q
       | ||| || ||||  || ||| | | ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |  || || || ||    
T  29929070 ctcataggggagtgactgctaatgctaagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaaga 29929169  T
Q  523 aatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttctt 622  Q
    ||||| |  ||||  ||||  |||||||  | ||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| | | ||||| |     
T  29929170 aatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtc 29929269  T
Q  623 gatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcat 722  Q
    |||||||||||||||||||||  | |     || || | |||||||| ||  | ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29929270 gatcagatgcatgatagaggtgtagcacctaatatagttacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaggttgacaaagcaattgcat 29929369  T
Q  723 tggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttat 783  Q
    || | | |||| | |||| ||| || |||||||||| | |  ||||||||| ||| |||||    
T  29929370 tgttaacgaaattcaaagaccagggtattcaaccaagtgtgtacacatacactattcttat 29929430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 446 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 30127234 - 30126890
Alignment:
Q  446 gttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactc 545  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| | | ||||||| | |||||||  ||||||  ||||| ||    
T  30127234 gttcaaagctacaatatcatgattaatgggttttgtaagattaaaagggtgggtgaagccattaatctctttgaagaaatgcaatgcaaaaaaattattc 30127135  T
Q  546 ctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtca 645  Q
    |||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| | | | ||  |  || |||||||||||||||||||    
T  30127134 ctgatgtggtaacttatagttcccttattgatggtttctgtaaatcggagaaaatctctcatgctttgaatctagtcaatgagatgcatgatagaggtca 30127035  T
Q  646 acctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaa 745  Q
    |||    ||| |||| | |||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||| |||||  |||     
T  30127034 accacctgatataattatttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaagcaattgcattgttaacgaaatttaaaaaccag 30126935  T
Q  746 ggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatgga 790  Q
    || |||||||||| | |  ||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  30126934 ggtattcaaccaagtgtgtacacatacactattcttattgatgga 30126890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 404
Target Start/End: Original strand, 29902787 - 29903034
Alignment:
Q  157 tggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattg 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||| ||| ||   | ||||| || |  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  29902787 tggattttgcattgttggtaaactgagagatgcaattgatttctttaataaaatgatattcgaaaacatcaacccaaatgtgtatacttttactatattg 29902886  T
Q  257 gtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataata 356  Q
    || |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| | ||||||||||| ||||| |  |||||   |||||||| |||||      
T  29902887 gttgatggtttttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcatcaaacctgacgttgttacttataact 29902986  T
Q  357 cattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaaga 404  Q
    | ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29902987 ctttaatggatggatactgcatagttaaagaagtgaataaggctaaga 29903034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 415
Target Start/End: Original strand, 29897548 - 29897866
Alignment:
Q  92 ttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcat 191  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| ||||| ||||  |||||||||||  ||  || ||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  29897548 ttatattctgaaatggttgcaaagagaatttatcccggtgttgttacttacagtgctttaattattggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaa 29897647  T
Q  192 ttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaaga 291  Q
    |||||||||||  | ||||| || |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||| |||| ||||   ||||||||||||    | | |||||    
T  29897648 ttggtttgttcaataaaatgatattgaaaaacatcatcccggatgtgtatacctttagtata-tggttgatggattttgtaaggaag----ggtgaaaga 29897742  T
Q  292 agctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtg 391  Q
    ||||| |||| || | | | ||||||||||| ||| | |  |||||| |||| |||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29897743 agctaaaaatgtgtttgctatgatgatgaaacaagacattaaacctaatgtttttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtg 29897842  T
Q  392 aataaggcaaagaatgtattcaac 415  Q
    |||||||| |||| | ||||||||    
T  29897843 aataaggctaagagtatattcaac 29897866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 399
Target Start/End: Original strand, 30153917 - 30154273
Alignment:
Q  43 aatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttg 142  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||| | |||| ||| || ||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||| || |||||     
T  30153917 aatcattgatagtttctgtaaggataaactcgtaattgacgcgtatgatttatattctgaaatgattgttaagaaaatttatcctaatgtcgtcactttc 30154016  T
Q  143 agctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttata 242  Q
    |    | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||  |||| ||||    
T  30154017 aatagtttaatctatggattttgcattgtgggtcaattcgaagaagcagttggtttgttcaatgaaatgatactcaaaaacaccaaccccaatgtgtata 30154116  T
Q  243 cttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgt 342  Q
    | || ||||||||||| |||| | | |||||||||||| || | |||  ||||| || | |  |   ||| ||||| ||| ||   |||||||||  |||    
T  30154117 ccttcaatatattggttgatggtttatgtaaggaaggagaggtgaaaagagctaaaagtgttttgactgttatgataaaacaacatgtggaacctgatgt 30154216  T
Q  343 tgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggc 399  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  30154217 tgttacttataattctttgatggatgggtatttcttggttaaagaagtgaataaggc 30154273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 28926905 - 28926380
Alignment:
Q  267 tttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatgga 366  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || | | || |||||||||| ||||  |  ||||||  |||||||| ||||   | ||||||||    
T  28926905 tttgtaaggaaggaaaagtaaaagaagctaaaaatgtgtttgctgcgatgatgaaaaaaggtttcaaacctaacgttgttacttatagctctttaatgga 28926806  T
Q  367 tgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcatt 466  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||   || |   |  || || |||  |||||| |||| || |||| |||| |     
T  28926805 tggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacaatatcttg 28926706  T
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    |||||||| || |||||||||||||||   |||| |||| | | ||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||| ||    
T  28926705 attaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaatt 28926606  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    | || || ||||||||||| ||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||    
T  28926605 cccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattactta 28926506  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaa 765  Q
    ||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||| ||  |||||||||||||  |    
T  28926505 cagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcatt-attaacaaaattgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgta 28926407  T
Q  766 cacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||    
T  28926406 cacatacactattcttattaatggact 28926380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 455 - 783
Target Start/End: Original strand, 29078356 - 29078684
Alignment:
Q  455 tacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataagg 554  Q
    |||| |||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||   |||| |||| ||  ||    
T  29078356 tacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtgg 29078455  T
Q  555 taacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcga 654  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| |||||||||||||||||  |||    ||    
T  29078456 tgacttacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctga 29078555  T
Q  655 tgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattca 753  Q
    | |||| |||||||  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||     
T  29078556 tataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcatt-attaacaaaattgaaagaccaaggtattcg 29078654  T
Q  754 accaaatattaacacatacagtatacttat 783  Q
    ||||| |||  ||||||||| ||| |||||    
T  29078655 accaactatgcacacatacactattcttat 29078684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 823
Target Start/End: Original strand, 30149048 - 30149725
Alignment:
Q  147 ctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttt 246  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||   | |||||   |||||||||||||  || ||||||  ||||||    
T  30149048 ctctaatatatggtttttccattttgggtcaaatgaaagaagcagttggtttgttaaatcaaatgtcgatgaaaaacatcagtccggatgttcttacttt 30149147  T
Q  247 taatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgtt 346  Q
     | || ||||||||||| | | |||||| ||||| || | ||| |||||||| || || | | ||| ||||| ||| || | |||||||||  | |||||    
T  30149148 cactacattggtcgatggtttatgtaagtaaggagaggtgaaaaaagctagatatgtgttggctgttatgataaaacaacgtgtggaacctgatattgtt 30149247  T
Q  347 acatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatg 446  Q
    || |||| | | ||||||||||| |||| | | ||||| ||||| || ||||| ||  || ||||||||  | |      |||| || |||| ||| |||    
T  30149248 acttatagttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtcaacaaggccaaacatctattcaacaccctttctctaaggggagtgactcctaatg 30149347  T
Q  447 ttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcc 546  Q
    ||   ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||| || || ||||||| ||  ||||  || | |||    
T  30149348 tttttagctacaatatcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgtaaatcttttcaaagaaatgcattcgaaagatatgattcc 30149447  T
Q  547 tgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaa 646  Q
    | | |  ||||| |||| ||| || ||||||||  | ||||||| || |||| ||| | |||  |||||  || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  30149448 taacactgtaacatacaattcccttattgatggactttgcaaattagggagagtatctgatgtttgggattttatagatgagatgcatgatagaggtcaa 30149547  T
Q  647 cctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaag 746  Q
    ||   |||  ||||||||||||| || || ||  |||  || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | || || || |||| ||| |    
T  30149548 ccaaccgacataatcacttacaattctttatttgatggattgtgcaaaaaccatcaggttgacagggcaattgcattattaaaaaagatcaaagaccagg 30149647  T
Q  747 gcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaag 823  Q
    | ||||| |||| |||  |  |||||| ||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  30149648 gaattcagccaagtatgtattcatacactatactttttgttggactatgcaaaaacggaagacttgaggatgcacaag 30149725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29358441 - 29358189
Alignment:
Q  163 ttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgat 262  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||    
T  29358441 ttgcattgttggtaaactgaaagatgcagttgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaacccggatgtgtatacctttactatattagttgat 29358342  T
Q  263 gctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaa 362  Q
    |   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| | ||||||||| | ||||| |  |||||   |||||||| |||||  | ||||    
T  29358341 ggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgatacaaggcattaaacctggcgttgttacttataactctttaa 29358242  T
Q  363 tggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaac 415  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  29358241 tggatggatatttcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 468 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 24890403 - 24890148
Alignment:
Q  468 ttaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttc 567  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||| | |  ||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  24890403 ttaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttacagttc 24890304  T
Q  568 tctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttac 667  Q
     || |||||||||||||| ||||  | |||||| | | |||| | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||     || || | ||||||    
T  24890303 ccttattgatggtttgtgtaaattggggagaatcttttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcagccacctaatatagttacttac 24890204  T
Q  668 aactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcatt 723  Q
    |  ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24890203 agttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcatt 24890148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 723
Target Start/End: Original strand, 24730379 - 24730952
Alignment:
Q  150 taatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaa 249  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |   ||||| || |  |||||||||||||   | | ||||| ||||     
T  24730379 taatttatggcttctgcattatgggtcaattgaaagaggcagttggtttgttacacaaaatgatattagaaaacatcaaccctcgtatgtatacatttag 24730478  T
Q  250 tatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttaca 349  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||| ||| | |   || |  |||||||||     
T  24730479 catattggttgatgctttttgtaaggaaggaaaggtgaaagaagctaaaatgatgttaggtgtgacgatgaaaaaagacattatacttgatgttgttact 24730578  T
Q  350 tataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttc 449  Q
    |||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||| | || ||||| ||  || ||||| |    || |    |||| || | |   || ||||||    
T  24730579 tataactctttaatggatggatattgcttagttaaagaaattaacaaggccaaagatatattcgatagtatggcctcaaggggagtcattgctaatgttc 24730678  T
Q  450 acagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctga 549  Q
    | ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||| | ||||||||||| | |  ||||| |||| |    
T  24730679 agagctataccaccatgattaatggattatgtaagattaaaatggtggatgaagctgtaaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaa 24730778  T
Q  550 taaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacct 649  Q
    |  ||||||||||| ||| || |||||||||||| | ||||  | || ||| | |  ||  | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  24730779 tgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgggtaaattggggaaaatctcttgtgtgttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaacca 24730878  T
Q  650 gtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcatt 723  Q
        || |||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24730879 cctaatataataacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcatt 24730952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 412
Target Start/End: Original strand, 30028535 - 30028924
Alignment:
Q  23 gatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaattt 122  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| || ||| | || || || |||||| |||| |||||| ||||| ||  |||||| ||||    
T  30028535 gatgtggtaatgtatactacaatcattgatagtttgtgtaaggataaactcgtgaccgatgcttatgagttgtattctgaaatggttgaaaagaagattt 30028634  T
Q  123 ctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaa 222  Q
     ||| |||||||||||||  ||  |  | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  || | |||||   ||||||| |  |||||||    
T  30028635 ttccgaatgttgttacttatagtacgttgatatatggtttttgtattgtgggtcagttgaaagatgctgttaggttgtttaatgaaatgatgttgaaaaa 30028734  T
Q  223 catcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaa 322  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||   | |||||| | ||| |||| | | ||||||| ||| || | | | ||||||| |||    
T  30028735 cattgacccggatgtttatacttttaatatattgattgatgggttgtgtaagaatggagagatgagaaaagctaggaatttgttgggtttgatgataaaa 30028834  T
Q  323 gaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattc 412  Q
       || ||  ||| || ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  30028835 agtggagttaaacttaatgttgttacttatagttctttaatggatgggtattttcaagtcaatgaagtgaataaggcgaaagatgtattc 30028924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 460 - 648
Target Start/End: Original strand, 29946271 - 29946459
Alignment:
Q  460 tatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaact 559  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||| |||||||  ||||  |||| ||  |||||||    
T  29946271 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 29946370  T
Q  560 tacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacc 648  Q
    |||| ||| || ||| |||||||||||| ||| | |||||| |   |||| | ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29946371 tacaattcccttattaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 29946459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 30060335 - 30060064
Alignment:
Q  452 agctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgata 551  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||| |||||||   |||| |||||||     
T  30060335 agctacaatataatgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatg 30060236  T
Q  552 aggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgt 651  Q
     |||||| |||| ||| || ||||||||| | || ||||| | || ||| | | |||| |   ||||  | ||| ||||| |||||||||||||||        
T  30060235 tggtaacatacaattcccttattgatggtatctgtaaatcggggaaaatctcttatgctttaaagctagtcgatgagatgaatgatagaggtcaactacc 30060136  T
Q  652 cgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcatt 723  Q
     ||| |||| |||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30060135 tgatataattacttacaattctatattaaatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcatt 30060064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 648
Target Start/End: Original strand, 29876509 - 29876847
Alignment:
Q  310 tgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgta 409  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  | || |||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||    
T  29876509 tgtgatgatgaaagaaggtgtgaaacctgatattattacttataactctttaatggatggatattgtctggttaaagaagtggacaaggctaagaatata 29876608  T
Q  410 ttcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttca 509  Q
    ||||||   || |   | ||| || ||||  |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||  | |    
T  29876609 ttcaacactatggttcagaggggagtgactgcaaatgttcggagctacagtatcatgattaatggattttgtaaggttaaaatgatggatgaagcaatga 29876708  T
Q  510 gtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgc 609  Q
     ||||||  | ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| | || |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||    || ||    
T  29876709 atctcttccaagaaatgcattgtaaagaaataattcctgatacgatagcttatagttcccttattgatggtttttgcaaatcggggagaattccacaggc 29876808  T
Q  610 atgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacc 648  Q
     | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29876809 tttggagcttgttgatgagatgcatgatagaggccaacc 29876847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 645
Target Start/End: Original strand, 29905252 - 29905658
Alignment:
Q  239 tatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaaccta 338  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || | ||||| ||||||||| ||||  |  ||||||    
T  29905252 tatacctttaatatattcgttgatgcattttgtaaggaaggaaaagtaaaagaagctaaaaatgtgtttgttgttatgatgaaaaaaggtttcaaaccta 29905351  T
Q  339 ctgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgac 438  Q
       ||||||| |||||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||| | ||||||||   || |   |   | || |||     
T  29905352 actttgttacttataactctttaatggatggatattgcttacttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacactatggctcaggagggagtgaa 29905451  T
Q  439 acctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaagga 538  Q
     |||| | |||| || |||| |||| | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| | ||||||| ||| | |  |    
T  29905452 tcctgctattcaaagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaa 29905551  T
Q  539 attactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgata 638  Q
     | | |||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |  | ||| | | |||| | | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  29905552 ttaattcctgatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgata 29905651  T
Q  639 gaggtca 645  Q
    |||||||    
T  29905652 gaggtca 29905658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 398
Target Start/End: Original strand, 29889051 - 29889292
Alignment:
Q  157 tggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattg 256  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||  ||   | ||||| || || |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| ||    
T  29889051 tggattttgcattgttggtaaaatgaaagatgcaattgattgttttaataaaatgatattggaaaacatcaatccgaatgtgtatacctttaacataatg 29889150  T
Q  257 gtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataata 356  Q
    || ||||   ||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||| | |||||||||||  || | |  ||| || ||||||||| |||||      
T  29889151 gttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacgagacatcaaacttaatgttgttacttataact 29889250  T
Q  357 cattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataagg 398  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29889251 ctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataagg 29889292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 467 - 790
Target Start/End: Original strand, 29889571 - 29889894
Alignment:
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||   |||| |||| ||  ||| ||||||| ||    
T  29889571 attaatgggttttgtaagattaaaaaagtcgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacaatt 29889670  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| || ||| |   |||  | | ||||| | |||||||||||||||||||||  |||     || || |||||||    
T  29889671 ctcttattgatggtttaagcaaatcagggataatctcatatgttttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatagtcactta 29889770  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaa-gaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaa 765  Q
    ||| ||  | ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||| |||  | |||||||||||| |  |    
T  29889771 caattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaggttgacaaaacaattgcatt-gtcaacgaaatttaaagaccagagtattcaaccaaatgtgta 29889869  T
Q  766 cacatacagtatacttatcgatgga 790  Q
     ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  29889870 aacatacactattcttattgatgga 29889894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24886985 - 24886731
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  || |||| ||||||  | |||||  |  | |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  24886985 ttttgcattgttggtaaattgaatgatacaattgggttgttcaataaaatgacagcggaaaatatcaacccggatgtgtatacctttaatatatcggttg 24886886  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    ||||| ||||||||||||| | | | |||||||||| | || || ||  | ||||||||||| | ||| |  |||||| |||||| || ||||| || ||    
T  24886885 atgctttttgtaaggaaggtagggtgaaagaagctaaatatgtgttatctatgatgatgaaacacggcatcaaacctagtgttgtcacttataacacttt 24886786  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaac 415  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||| || ||||||||    
T  24886785 aatgaatggatattgcttagttaaagaaatgaacatggccaaggatatattcaac 24886731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 840
Target Start/End: Original strand, 24897918 - 24898292
Alignment:
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||| || ||| ||| ||  |||   ||  |||||||||  ||| | |||||||    
T  24897918 attaacggattatgtaagaataaaatggtggatgaagctgtcaatctcttcaaagaattgcatttaaaaaacatggctcctgatattgtagcatacagtt 24898017  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    | || ||||||||  | |||||||| | || ||||| | |||  ||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||  |  ||  |||||| |||    
T  24898018 cacttattgatggactttgcaaatcggggaaaatatctgatgtttgggatcttatagatgatatgcatgatagaggtcaacaagctgacataatcattta 24898117  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaac 766  Q
    || ||| || ||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || |||| ||  || ||| ||||| ||||   |    
T  24898118 cacctcgttattggatgcattgtttaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcgttattgaagaagatcaaagaccggggaattgaaccagatatgttc 24898217  T
Q  767 acatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    |||||||  || ||| | |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| | ||| || |||||||    
T  24898218 acatacacaatgcttgttgatggactatgcaaaaatggaagacttaaggatgcacaagaggtttatcgggatctt 24898292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15864282 - 15864173
Alignment:
Q  90 agttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagc 189  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||| |||  |||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  15864282 agttatagtctaaaatcattgtaaagagaatttttcctgatgtagtcactttcaattctctaatctatggattatgctttgttggtcatttgaaagaagc 15864183  T
Q  190 atttggtttg 199  Q
    |||| |||||    
T  15864182 atttcgtttg 15864173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 648
Target Start/End: Original strand, 25451036 - 25451140
Alignment:
Q  544 tcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggt 643  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||   | |||| | | ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25451036 tcctgatgtggtaacttacagttcccttgttgatggtttgtgcaaatcggagagaattcctaatgctttgaagcttgtcgatgagatgcatgatagaggt 25451135  T
Q  644 caacc 648  Q
    |||||    
T  25451136 caacc 25451140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31000119 - 30999915
Alignment:
Q  444 atgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattac 543  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||| | |  |||||     
T  31000119 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgcaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 31000020  T
Q  544 tcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggt 643  Q
    || | ||  | ||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||| | |||||| | | ||||   | ||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  31000019 tcgtaatgtgttaatttacagtttccttattgatggtttgtgtaaatcggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 30999920  T
Q  644 caacc 648  Q
    |||||    
T  30999919 caacc 30999915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 504
Target Start/End: Original strand, 30053115 - 30053305
Alignment:
Q  314 atgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattca 413  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | || ||||||||||||| | | || || ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  30053115 atgataaaacaaggcgtggaacctaatgttgttacttatacttctttgatggatgggtatttcttggtaaaagaagtcaacaaggccaaacatgtattca 30053214  T
Q  414 acgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagc 504  Q
    ||   ||      |||| || |||| ||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30053215 acactatttctctaaggggagtgactcctaatgttcatagctacattgtcatgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagc 30053305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 717
Target Start/End: Original strand, 30134986 - 30135217
Alignment:
Q  487 taaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgc 586  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||| || |||| |||| |||||||| |   | || |||| ||| || ||||||||  | |||    
T  30134986 taaaatggttgatgaagccgtgaatctcttaaacgaaatgcattccaaaagaatgactcctgacacattcacgtacacttcgcttattgatggactttgc 30135085  T
Q  587 aaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctt 686  Q
    | ||| | |||||  | | |||  ||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||| || || ||  ||||||    
T  30135086 atatcggggagaacctctgatgtttgggatcttatagatgagatgcatgaaagaggtcaacctgctaatgtgatcacttacaattctttattggatgctt 30135185  T
Q  687 tatgtaaaaaccatcaag-ttgacaaggcaat 717  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  30135186 tgtgcaaaaaccatcaggtttgacaaggcaat 30135217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24890652 - 24890588
Alignment:
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaag 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||    
T  24890652 aaaacatcaacccaaatgtgtatacctttaatatactggttgatggcttttgtaaggaaggaaag 24890588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30578246 - 30578114
Alignment:
Q  147 ctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttt 246  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||  || |||||||   |||||||  | ||||||||||   |||| |||||| || |||    
T  30578246 ctctaatatatggtttttgtattgtgggtcaattggaagatgctattcgtttgtttaatgaaatgagattgaaaaacattgtcccaaatgtttgtagttt 30578147  T
Q  247 taatatattggtcgatgctctttgtaaggaagg 279  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  30578146 taatatattgatcgatggtttatgtaaggaagg 30578114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29211585 - 29211430
Alignment:
Q  118 aatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  || ||||   ||| |||| || ||||||| || ||||||| ||| ||| | ||||   | ||||| ||  |    
T  29211585 aatttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcactgttggtaaactgaaagatgcagttgatctgtttaataaaatgatatcg 29211486  T
Q  218 aaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaa 273  Q
     |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  29211485 gaaaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatgttttttgtaa 29211430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 681 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 24263696 - 24263587
Alignment:
Q  681 atgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatac 779  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||| ||| |    
T  24263696 atgccttatgcaaaaaccatctggttgacaaggcaattgcatt-attaataaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattc 24263598  T
Q  780 ttatcgatgga 790  Q
    |||| ||||||    
T  24263597 ttattgatgga 24263587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 296
Target Start/End: Original strand, 25450444 - 25450578
Alignment:
Q  162 tttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcga 261  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||      |||||||  | ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  25450444 tttgcatcgttggacaattgaaagatgcaattagtttgtttaagataatggtatcggaaaacatcaacccaactgtgtataccttcaatatattggttga 25450543  T
Q  262 tgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagcta 296  Q
    ||   ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  25450544 tggattttgtaaggaaggaaaggtgaaagatgcta 25450578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 681 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 29211337 - 29211228
Alignment:
Q  681 atgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatac 779  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||  | || |||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||| |    
T  29211337 atgctttatgcaaaacccatcgggttgacaaggcagttgcatt-attaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaaatatgcacacatacactattc 29211239  T
Q  780 ttatcgatgga 790  Q
    |||| ||||||    
T  29211238 ttattgatgga 29211228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29954154 - 29954056
Alignment:
Q  92 ttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagca 190  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||  |   || |||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  29954154 ttatattctgaaatgattgtcaagaaaatttctcctaatgttgtcacttacacgactttaatatatggcttttgcattgtgggacggttgaaagaagca 29954056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31000344 - 31000262
Alignment:
Q  219 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaat 301  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||| || | | | |||||||||| ||||    
T  31000344 aaaacatcaacccggatgtgtatacctttaatatactggttgatggtttttgtaaggatggtagggtgaaagaagctaaaaat 31000262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 201
Target Start/End: Original strand, 29946162 - 29946207
Alignment:
Q  156 atggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgtt 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29946162 atggcttttgcattgtgggtcaattgaatgatgcatttggtttgtt 29946207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 898
Target Start/End: Original strand, 5620 - 6470
Alignment:
Q  50 gatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctc 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |  |||     
T  5620 gatagtttgtgtaaagagaaattggtgaccgaggcttatgagttatattctcaaatgattgtaaagaaaatttctcctgatgttgtcactttcaattctt 5719  T
Q  150 taatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5720 taatctatggattttgcattgttggtcaattgatagaagcatttggtttgttccatgaaatggtattgaaaaacatcaacccaaatgtgtatacttttaa 5819  T
Q  250 tatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttaca 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||  ||| || |||  ||||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||     
T  5820 tatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatctgaaaggagctaagaatctgttagccgtgatgatgaaagaaggtgtaataccgaatgttgttacc 5919  T
Q  350 tataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttc 449  Q
    || | | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || | |   ||      || | || || | ||||||| ||    
T  5920 tacagttcaataatggatggatattgcctagttaatgaagtgaataaggccaaacatgttttaagcactattactcgaatgggagtgcctcctgatgctc 6019  T
Q  450 acagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctga 549  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |    
T  6020 agagctataatatcatgattaatgggttctgtaagattaaaatgatcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctcccaa 6119  T
Q  550 taaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacct 649  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |   |||| |||||| || ||||| |||||| |||||  ||||||||     
T  6120 tacagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgtaaattaggtagaatctcctatgcttgggagtttgttgatgagatgcgtgataatggtcaacca 6219  T
Q  650 gtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggca 749  Q
       ||  ||  ||||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6220 cctgacatatgcacttacaattctttaatagatgcattatgcaaaaaccatcatgttgacaaggctattgtattagtcaagaaaattaaagaccaaggca 6319  T
Q  750 ttcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaa 847  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6320 ttcaactaaatatgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaaggcttaaggatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaa 6419  T
Q  848 aggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttg 898  Q
    |||||| ||  ||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  6420 aggctacaatttaacagtctggacatatactattatgatcaaaggtctttg 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 899
Target Start/End: Original strand, 16350435 - 16351325
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||||| || |||   ||||||||  ||||||||     
T  16350435 ttggtcaacaccaatgtggtaatgtatagcacaatcattgatggtttgtgtaaagataaactagtaactgatgcctatggtttatattcagaaatgattg 16350534  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
    |||||| |||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||   ||||||    
T  16350535 taaagagaattcctcccactgttgtcactttcagttctctaatctatggattttgtattgttggtaaattcaaagatgcatttcgtttgtttaatgaaat 16350634  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |    
T  16350635 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgcttatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaaatgtgatagct 16350734  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||| |    
T  16350735 gtgatgatgaaagaaggtgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgggtaaggccaaacatgtgt 16350834  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    | |   | |||     || |||| || ||||| ||  ||  ||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  16350835 taagtattatatctcgaatgagagtggcacctaattctcgtagctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttatg 16350934  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     ||||     
T  16350935 tctctttcatgaaatgtgttgcagaggaattgctcctcataaggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggagaatcccctatgct 16351034  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||   ||  ||| | |||  || |||||||||| || ||  || ||| ||| || |||||||| || |||||||    
T  16351035 tgggagcttgttgatgagatgcataataattgtataccagccgacatagtcacttacaattctttgatagatgttttctgcaaaaaccaacatgttgaca 16351134  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagact 809  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||    
T  16351135 aggctattgcattagttaagaaaattaaagaacatggcattcaaccaaatatgtgcacatacaatatacttattgatggactatgcaaaggaggacaact 16351234  T
Q  810 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgt 899  Q
      ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||  | |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16351235 caagaatgcacaagatgtttttcaggatcttttgattaagggttataacgtaaatgcttggacgtataatattatgatcaatggactttgt 16351325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 841
Target Start/End: Original strand, 11990697 - 11991528
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||     
T  11990697 ttggtcaagatcaatgtggtaatgtataacacaatcattgatagtttgtgtaaacataaattggtaattgatgcctatgagttatattctcaaatgattg 11990796  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11990797 caaaaaaaatttctcccgatgttgtcacttttagtgctctaatttatggattttgcattgttggtcaactggaagaagcatttggtttgtttcgtgaaat 11990896  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||  |||||| |||||    
T  11990897 ggtattgaaaaacatcaaccctgattattatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatttgaaaggggctaagaatatgttagtt 11990996  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
    ||||||||||||||||| |||   || | ||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||    
T  11990997 gtgatgatgaaagaaggtgtgatgccaaatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgcctagttaaccaagttaataaggccaaacatgtat 11991096  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    | |||   ||     ||| | ||  | | ||| ||| ||| |||||   ||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11991097 taaacactatttctcaaatgggagcggctcctaatgctcatagctattgtactatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgag 11991196  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||     
T  11991197 tctctttaatgatatgcagttcaaaggaattgctcctgataaggtaacttataattctctcattgatggtttgtgcaaatcagggagaatctcctatgct 11991296  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||| | | || || ||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  11991297 tgggagcttgttgatgaaatgcatgataatggtcaaccagccaatatattcacttacaactgtttaatagatgctttatgtaaaaaccatcatgttgacc 11991396  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagact 809  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||| | || |||||||||  ||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  11991397 aggctattgcattagttaagaaaattaaagatcaaggcattcaaccagatatgtacacgttcaatatacttatttatggattatgcaaagtaggacgact 11991496  T
Q  810 tgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttt 841  Q
    | ||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  11991497 taagaatgcacaagatgttttccaggatcttt 11991528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 24219696 - 24219136
Alignment:
Q  164 tgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatg 263  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||| || || ||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  24219696 tgcattatgggtcaattgaaagatgcaattggtttgttacataaaatgatattggaaaacatcaacccaactgtgtatacctttagtatattggttgatg 24219597  T
Q  264 ctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaat 363  Q
    |  ||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||  ||  ||||||   ||||||| |||||  | |||||    
T  24219596 cattttgtaaggaaggaaaagtgaaagaagctaaaaatgtgtttgttgtgatgatgaaaaaagatgtaaaacctaacattgttacttataactctttaat 24219497  T
Q  364 ggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatc 463  Q
    | |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||  | | | ||||||||   || |   |||   || || | ||||| ||||| || |||| ||||    
T  24219496 gaatggatattgtctggtaaatgaggtgaacaaggccgaaagtatattcaacactatggctcaaattggagtggctcctgacgttcatagttacagtatc 24219397  T
Q  464 attattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttaca 563  Q
    || |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||||| |||||||  ||||  ||| |||  ||| || ||||    
T  24219396 atgattagtggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaactctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcccgatgtggtgacgtaca 24219297  T
Q  564 gttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcac 663  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| |  ||||| |   |||| | | | ||| | |   ||||||||||||||||||||||     || |||| ||    
T  24219296 attcccttattgatggtttgtgcaaatcgggaagaatctcatatgctttgaaacttatcggagagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattac 24219197  T
Q  664 ttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattg 724  Q
    |||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24219196 ttacaattctttattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgaattg 24219136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 836
Target Start/End: Original strand, 33997767 - 33998151
Alignment:
Q  453 gctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataa 552  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || ||||  |||| ||| ||||||||| | | ||||||||| || |||| ||| |||   |||| |||||||      
T  33997767 gctacaatatcattattaatggattgtgcaagaaaaaaagggtggatgaagccatgaatctctttaaagagatgcattggaaaaagattaatcctgatgt 33997866  T
Q  553 ggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtc 652  Q
    ||||||||||| |   || ||||||||||||||||||| || || ||| |    | | | ||||||| ||||| |||||| |  || |||  || | |||    
T  33997867 ggtaacttacaatatccttattgatggtttgtgcaaattagggaaaatctcaacttctttggagcttgttgatgagatgcgtagtatagggaaaacggtc 33997966  T
Q  653 gatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattc 752  Q
    ||| |||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  33997967 gatataatcacttataattctttattgcatgctttatgcaaaaatcatcatctcgaccaggcaattacattggttaaggaaattaaagaccaaggtattc 33998066  T
Q  753 aaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcagga 836  Q
    | |||||| ||  |||||| | || ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  33998067 agccaaatgtttgcacatatactacactaattgatggactatgcaaagatggaagacttgaggatgcatatgtgatttttcagga 33998151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Original strand, 33997445 - 33997528
Alignment:
Q  26 gtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgatt 109  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33997445 gtggtaatgtatagcacaatcattgatagtttgtgtaaaggaaaatttgtaaccgatgcttataggttatattctgaaatgatt 33997528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 906
Target Start/End: Original strand, 2616 - 3515
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||||| ||| | |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  2616 ttggtcagtaccgatgttgtaatgtatagtacaatcattgatggtttgtgcaaagataaacttgtaaatgatgcatatgagttatattctgaaatgatta 2715  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| ||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2716 caaagagaatttctcctactgttgtcactctcaattctctaatctatggatattgcattgttggtcaattcaaagaagcatttggtttgctccgtgaaat 2815  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| |    
T  2816 ggtattgaaaaacatcaacccagatgtgtatacttttaacatattggttgacgctctatgtaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaagtgggatagct 2915  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||   ||||||||| || | | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||| |    
T  2916 gtgatgatgaaagaaggtgtgatgccagatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgtcttgttaatgaagttaataaggccaaacatgtgt 3015  T
Q  411 tca--acgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttc 508  Q
    | |  |  | |||     || |||| || | ||  ||| ||  ||||| | |||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  3016 taagtatattatatctcgaatgagagtggctcccaatgctcgtagctatagtatcgtgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacaaagccttg 3115  T
Q  509 agtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatg 608  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |   |||    
T  3116 agtctcttttatgaaatgcgttgcagaagaattgctcctgatacggtaacttacaattctctaattgatggtttgtgcaaatctgggagaatctcctatg 3215  T
Q  609 catgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttga 708  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3216 cttgggagcttgttgatgagatgcgtgatagtggtcaaccagctgatataatcacttacaattcattaatagatgctttatgcaaaaaccatcatgttga 3315  T
Q  709 caaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaaga 807  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  3316 caaggctattgcattagtcaagaaaattaaagaccaaggcattcaactagatatgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaagg 3415  T
Q  808 cttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggagg 906  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  3416 cttaaggatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggctacaatttaacagtctggacatatactattatgatcaatggtctttgtttagagg 3515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 146 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 31784 - 30984
Alignment:
Q  146 tctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatactt 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31784 tctctaatccatggattttgcattgttggtcaattcaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtattgaaaaacatcaacccagatatttatactt 31685  T
Q  246 ttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgt 345  Q
    |||  |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31684 ttagcatattggttgatgttctatgtaaggaatgaaagatcaaagaagctaaaaatgtgatagctgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactattgt 31585  T
Q  346 tacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgat 445  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||  |    
T  31584 tacatatagttcattaatggacgggtattgcctggttattgaagtgaataaggcaaagcatgtattcaacatcatatgaaaaatgaaagtgatacctatt 31485  T
Q  446 gttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactc 545  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||         |    
T  31484 gttaacagctacaatatcattattaatggattatgtaagattaaaattgttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaa---------c 31394  T
Q  546 ctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtca 645  Q
    |  |||  ||||||||||  ||||| ||||||   ||||||||||| || ||| | |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31393 ccaatacagtaacttacaactctcttattgatttgttgtgcaaatcggatagagtttccgatgcttggaagcttcttgatcagatgcatgatagaggcca 31294  T
Q  646 acctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaa 745  Q
    || |  | ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||| ||  | |||| ||||    
T  31293 acgtcccaatgtaatcacttatacttccttattacatgctttatgtaaaaaccatcatgttgacaaggc-----cattggtcaacaatttaaaagtccaa 31199  T
Q  746 ggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttga 843  Q
    |||||||||||| ||||  | | || || || |||||| |||||| ||||| || || |||| ||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31198 ggcattcaaccagatatacagatattcaatacacttattgatggattatgcaaacaaagaaggcttaaggacgcacaactgatttttcaggatcttttga 31099  T
Q  844 ttaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggaggac-tgtttgatgaagctatga---cctaccggaaaaa 939  Q
     ||||||||| || ||||||   ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||   ||| | |  ||||    
T  31098 ctaaaggctacaatgtaacaacctggacatataatattattatcaatggtctttgtttagagggcttatttgatgaagctatgaacccctgctgtcaaaa 30999  T
Q  940 atggaagacaatggt 954  Q
    |||||||||||||||    
T  30998 atggaagacaatggt 30984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 284; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 126737 - 125950
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||  |||||||||| ||||||||     
T  126737 ttggtcaacaccaatgtggtaatgtacagcacaataatcgatagtttgtgtaaagataaattggtgaccgaggcatatgtgttatattctgaaatgatta 126638  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  126637 caaagagaatttctcccaatgttgtcactttcaattctctaatttatggattttgtattgttggtcaattcaaagatgcgtttcgtttgttccatgaaat 126538  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |    
T  126537 agtattgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatataatggttgatgctctatgtaaggaaggaaagatgaaagaagctaaaagtgtgatagct 126438  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
    ||||||||||||||| | |||   ||   ||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||      
T  126437 gtgatgatgaaagaatgtgtgatgcccgatgttgttacctacaattcattaatggatggatattgcctagttaatgaagtcaataaggccaaacatgtgc 126338  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    | | | | ||    ||||  ||| || | ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||    
T  126337 taatcattatttctaaaataagagtggctcctgatgctcatagctatagtatcatgattaatggattatgtaaggttaaaatggtcgacgaagccttgag 126238  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||   | | ||||     
T  126237 tctcttttatgaaatgcgttgcagaggaattgctcctaatacggtaacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaatctgggagatactcttatgct 126138  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgaca 710  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||   || || ||   | || || |||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  126137 tgggaccttgttgatgagatgcatgatcatggccatccacccaatatattcacttacaattccttaatagatgctttatgcaaaaaccatcagattgaca 126038  T
Q  711 aggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaa 798  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  126037 aggctattgcattagttaagaaaatcaaagatcaaggcattcaaccagatatgtgcacatacaatatacttattgatggactatgcaa 125950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 13905212 - 13904695
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||| | |||   |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  13905212 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataccgcaatcatcgatagtttgtgtaaaaataaagatgtaaatgatgcctatgagttatattctgaaatgatta 13905113  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaag-aagcatttggtttgttccgtgaaa 209  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  13905112 caaagagaatttctcctaatgttgtaacttttagtgctctcatttatggcttttgcatggttggtcaattcaaaacaagcatttggtttgttccatgaaa 13905013  T
Q  210 tggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagt 309  Q
    ||||| | | |||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||     
T  13905012 tggtattaacaaacatcctcccaaatgtttatacttctaatatcttggttgatgctctttgtaaagaaggaaatgttaaacaagctaaaaatatgatagc 13904913  T
Q  310 tgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgta 409  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| |||||    
T  13904912 tatgatgatgaaacaaggtgtggtacccgatgttgttacatatacttcactaatggatgggtattgcttagttaatcaagtgaacaaggccaagcatgta 13904813  T
Q  410 ttcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttca 509  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13904812 ttcaacatcttagggaaaaggaaaattaaacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttga 13904713  T
Q  510 gtctctttaatgaaatgc 527  Q
     |||||| || |||||||    
T  13904712 atctcttcaaagaaatgc 13904695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 43862 - 43278
Alignment:
Q  50 gatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctc 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |  |||     
T  43862 gatagtttgtgtaaagagaaattggtgaccgaggcttatgagttatattctcaaatgattgtaaagaaaatttctcctgatgttgtcactttcaattctt 43763  T
Q  150 taatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaa 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43762 taatctatggattttgctttgttggtcaattgatagaagcatttggtttgttccatgaaatggtattgaaaaacatcaacccaaatgtgtatacttttaa 43663  T
Q  250 tatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgt--tgtta 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||  ||| || |||   ||||||||||| |||| ||   ||| | |||  | |||    
T  43662 tatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatgtgaaaggagctaagaatctgttagccatgatgatgaaacaaggtgtaataccgaatgttatatta 43563  T
Q  348 catataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgt 447  Q
    | || | | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || | |   ||     ||| | || || | |||||||     
T  43562 cctacagttcaataatggatggatattgcctagttaatgaagtcaataaggccaaacatgttttaagcactattactcaaatgggagtgcctcctgatgc 43463  T
Q  448 tcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcct 547  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  43462 tcagagctataatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctccc 43363  T
Q  548 gataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgc 632  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |   |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  43362 aatacagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaattaggtagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgc 43278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51118 - 50802
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51118 ttggttaacactgatgtggtaatgtatagcacaatcattgatagtttgtgtaaagagatatttgtgactgaggcttatgagttatattctcaaatgattg 51019  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  51018 taaagaaattttctccttatgttgttactttgagctctctaatatatggattttgcattgttggtcaactgaaaaaagcattttgtttgttccatgaaat 50919  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    | || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||  ||| || |||      
T  50918 gctattgacaaacatccacccaaatgtttatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatgtgaaaggagctatgaatctgttagcc 50819  T
Q  311 gtgatgatgaaagaagg 327  Q
    || ||||||||||||||    
T  50818 gttatgatgaaagaagg 50802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 460 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 48068 - 47671
Alignment:
Q  460 tatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaact 559  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | || || ||||| ||| | |||||    
T  48068 tatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcattgcagaagatttgctcctaatacgataact 47969  T
Q  560 tacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaa 659  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| | | |  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||   | || ||     
T  47968 tacagttcgctcattgatggtttgtgcaaagctgggagattctcttgtgcttgggagcttgttgatgagatgcatgataatggccaaccacccaatatat 47869  T
Q  660 tcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
    |||||||||| || ||  || || ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||||| |    
T  47868 tcacttacaattctttaataaattctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggctattgcattagttaataaaatcaaagatcaagggattcaaccaga 47769  T
Q  760 tattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt-tgattaaaggctata 855  Q
    |||   | | || | |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||   ||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  47768 tatgttcgcgtataatatacttatcgatggactatgcaaaggaggacgacttcagaatgcatgagatgtttttcaagatcttatgattaaaggttata 47671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 742 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 43201 - 43035
Alignment:
Q  742 ccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaag-aaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    |||||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43201 ccaaggcattcaactagacatgtacacatacaatatacttattgatggactatgcaagcaaggaaggcttaaggatgcacaagtgatttttcaggatctt 43102  T
Q  841 t-gattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggagg 906  Q
    | |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  43101 ttgattaaaggctacaatttaacagtctggacatatactattatgatcaatggtctttgtttagagg 43035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 553 - 922
Target Start/End: Original strand, 8922 - 9294
Alignment:
Q  553 ggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtc 652  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  8922 ggtaacttacagttctcttattgatggtttgtgcaaatcagggagaatttctcatgcttgggagttgcttgatgagatgcatgatagaggtcaacctgcc 9021  T
Q  653 gatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattc 752  Q
     |||||||||||| ||  || || ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  9022 aatgtaatcactttcagttcattattacacgctctatgtaaaaaccgtcatgttgacaaggcaattgaattggtcaagaaacttaaagaccgagacattc 9121  T
Q  753 aaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaagg 850  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  9122 aaccaaatatgtacacatacaatatacttatcgatggactatgcaaacaaggaagacttaaggacgcacaagtgatttttcaagatcttttcattaaagg 9221  T
Q  851 ctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttgtttggaggac-tgtttgatgaagct 922  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  9222 ctacaatttaacagtatggacatataatattatgatcaatggtctttgtttagagggcttgcttgatgaagct 9294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Original strand, 8380 - 8705
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||     
T  8380 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataacacaatcatcgatagtttgtgtaaagagaaattggtgaccgaggcatatgagttatattctgaaatgatta 8479  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||    
T  8480 caaagacaatttctcctactgttgtcactttcagttctctaatctatggattttgtattgttggtcaattcaaagatgcatttcgtttgttcaatgaaat 8579  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| |    
T  8580 ggtattgaaaaacatcaacccaaatgtttatacttttaatatattggttgatgctctctgtaaggaaggaaaaatgaaagaagctaaaaatgtgttagct 8679  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacc 336  Q
     ||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  8680 atgatggtgaaacaaggtgtgaaacc 8705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 800 - 898
Target Start/End: Original strand, 8 - 107
Alignment:
Q  800 aaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacagtttggacatataatactatgattaatggtctttg 898  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  8 aaggaaggcttaaggatgcacaagtgatttttcaggatcttttgattaaaggctacaatttaacagtctggacatatactattatgatcaaaggtctttg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 4e-90; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 3642422 - 3642810
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||   |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  3642422 ttggttaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcaatagtttgtgtaaagataaagctgtaagtgatgcctatcagttatattctgaaatgatta 3642521  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3642522 caaagagaatttctcccgatgttgtcactttcaattctctaatcttgggattttgcgttgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccatgaaat 3642621  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |  |||||  |||||| |||      
T  3642622 ggtattgaaaaatatcaacccagatgtttatactttcagtatattggttgatgctctttgtaaggatggaaatatcacaagagctaagaatatgttagcc 3642721  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggc 399  Q
    || ||||||||| |||| |||   ||   ||||||||| || | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3642722 gttatgatgaaacaaggtgtgattccggatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgtctagttaatgaagtgaataaggc 3642810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 467 - 899
Target Start/End: Original strand, 3642878 - 3643312
Alignment:
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3642878 attaatggattgggtaagattaaaatggtcgatgaagccttaagtctctttaaggaaatgtgttgcaaaggaattgctcctgatacggtaacttacaatt 3642977  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||   |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||  |||  ||| | |||  || | |||||    
T  3642978 ctctcattgatggtttgtgcaaattaggaagaatatcctatgcttggcagcttgttgatgagatgcataataatggtataccagccgacatattaactta 3643077  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaac 766  Q
    ||| || ||  || ||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3643078 caattctttgatagatgttttatgcaaaaaccatcatattgacaaagctattgcattagttaagaaaattaaagaccagggcattcaaccaagtatgtac 3643177  T
Q  767 acatacagtatacttatcgatggactatg-caagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggctataaggtaacag 864  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||| || ||||  ||||  |    
T  3643178 acatacaatatacttattgatggactctgtaaaggaggacgacttaagaatgcacaagatgttttccaggatcttttgattaagggttatagtgtaaatg 3643277  T
Q  865 tttggacatataatactatgattaatggtctttgt 899  Q
     |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3643278 cttggacgtataatattatgatcaatggactttgt 3643312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 651 - 836
Target Start/End: Original strand, 25861964 - 25862150
Alignment:
Q  651 tcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcat 750  Q
    |||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||  |    
T  25861964 tcgatgtaatcacttataattctttattgcatgctttatgcaaaaatcatcaactcgacaaggaaattgcattggttaaggaatttaaagaccaaggttt 25862063  T
Q  751 tcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaaga-aggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcagga 836  Q
    ||| |||||| || || ||| || || ||| || |||||| | || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25862064 tcagccaaatgttcactcattcactacactaatagatggattgtggaaaagtggaagacttaagaatgcacaagtgatttttcagga 25862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 38144773 - 38144592
Alignment:
Q  572 attgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaact 671  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| | | |||||||| ||||| ||  | |||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  38144773 attgatggtttgtgcaagtcaggaagaatttcttatgcatggaagcttgttcgtgagatgcgtgatatgggtcaaccagccgatgaaatcacttacaatt 38144674  T
Q  672 ccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattca 753  Q
    ||||||| ||  |||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |   ||||||||||||    
T  38144673 ccttcttgcacactttttgcaaaaatcatcaacttgataaggcaattgcattagtcaaggaaattcataaccaaggcattca 38144592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38145120 - 38144946
Alignment:
Q  225 tcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaaga 324  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||   |||||  | ||||||| || |||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||| | |    
T  38145120 tcaacccagatgtttgtacctttaatatatttatcgatgagttttgtttgcaaggaaatatgaaagaagctaaaaacatattaggtgtgatgatgataca 38145021  T
Q  325 aggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggc 399  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  38145020 aggtatgaaacctaatgttgttacatatagtgctttaatggatgggtactgcctattaaatggagtgaacaaggc 38144946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 652 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 2857727 - 2857524
Alignment:
Q  652 cgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcatt 751  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| || |||| ||||||| |||  ||| ||| ||||||| | |||||||||||||  || || ||     
T  2857727 cgatgtaatcacttacaattctttcataaatgctttctgcaaaagccatcaaattggtaagccaactgcattgctaaagaaaattaaagatcacggtata 2857628  T
Q  752 caaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgca-agaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttt-gattaaag 849  Q
    ||  ||||| |  |||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| | || ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2857627 caggcaaatgtgtacatgtacagtgtacttgttgatggactttgcagagatggaagacataaggatgcacaaaagatttttaaggatctttagattaaag 2857528  T
Q  850 gcta 853  Q
    ||||    
T  2857527 gcta 2857524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13093984 - 13093890
Alignment:
Q  149 ctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatac 243  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||  || ||||||||   ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13093984 ctaatatatggcttttgtattgcgggtcaattgaaacaagccattagtttgttcaccgaaatggttttgaaaaacatcaaccctgatgtttatac 13093890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1840 (Bit Score: 157; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold1840
Description:

Target: scaffold1840; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 399
Target Start/End: Original strand, 794 - 1182
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    |||||||  ||| |||| |||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||||| ||| | |||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  794 ttggtcagaaccaatgttgtaatgtatagtacaatcattgatggtttgtgcaaagataaacttgtaaatgatgcatatgagttatattctgaaatgatta 893  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| ||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  894 caaagagaatttctcctactgttgtcactctcaattctctaatctatggatattgcattgttggtcaattcaaagaagcatttggtttgctccgtgaaat 993  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| |    
T  994 ggtattgaaaaacatcaacccagatgtgtatacttttaacatattggttgacgctctatgtaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaagtgggatagct 1093  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggc 399  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||   ||||||||| || | | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  1094 gtgatgatgaaagaaggtgtgatgccagatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgtcttgttaatgaagttaataaggc 1182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1840; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 526
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1309
Alignment:
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatg 526  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1250 attaatggattctgtaagattaaaatggtcgacaaagccttgagtctcttttatgaaatg 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 9e-79; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 841
Target Start/End: Original strand, 41315654 - 41316476
Alignment:
Q  11 ttggtcaacaccgatgtggtaatgtataatataatcatcgatagcttgtgtaaagagaaattggtaactgaggcttataagttatattctcaaatgattc 110  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| || ||| | ||||||||||| ||  | |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||     
T  41315654 ttggtcaactccgatgtagtaatgtataacacaataattgatggtttgtgtaaagataagcttgtaaatgatgcttatgagttatattctgaaatgattg 41315753  T
Q  111 taaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaat 210  Q
     | |||||||||||||  ||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  41315754 cagagaaaatttctcctgatgttgccactttcaattctctaatatatggattttgcattattggtcaattgaaagatgcatttggtttgttcagtcaaat 41315853  T
Q  211 ggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagtt 310  Q
    |||| |||||||||| |||||    || ||||||||||  || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |    
T  41315854 ggtattgaaaaacattaacccgagcgtgtatacttttaccattttggttgatggtctatgtaaggaaggaaagatgaaagaagctaaaagtgtgatagct 41315953  T
Q  311 gtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtat 410  Q
     ||||||||||||| || ||   ||| | ||||||||| || | | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |    
T  41315954 atgatgatgaaagatggtgtattaccgaatgttgttacctacacttcaataatggagggatattgcctagttaatgaagtgaataagaccaaacatgttt 41316053  T
Q  411 tcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcag 510  Q
    |||     ||      || | || || | ||| ||  ||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||| |     
T  41316054 tcagaactatttctcgaatgggagtggctcctaatactcagagctataatatcatgattaacggattctgtaagattaaaatagtcaatgaagccttgat 41316153  T
Q  511 tctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgca 610  Q
    ||||||||| |||||| |||| | |||||||  ||||  ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||  ||||     
T  41316154 tctctttaaggaaatgtgttgtagaggaattgttcctattacagttacttacagttctcttattgatggtttgtgcaaatc----------tactatgct 41316243  T
Q  611 tgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttct-tacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgac 709  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||||||    ||| ||  ||||||||  || || | || |||||||||| |||| | ||||  |||||    
T  41316244 tgggagtttgttgatgagatgcatgttaatggtcaaccacctgatatatccacttacagttctttatatagatgctttatgcaaaagcaatcatcttgac 41316343  T
Q  710 aaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagac 808  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||    
T  41316344 aaggctattgcattagtgaagaaaattaaagaccaaggcattcaatcggatatgtacacatccaatatacttattgatgggttatgcaaatgaggaagac 41316443  T
Q  809 ttgagaatgcacaagtgatttttcaggatcttt 841  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  41316444 ttaagaatgcacaagatgtttttcaggatcttt 41316476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 853
Target Start/End: Original strand, 19489780 - 19490479
Alignment:
Q  156 atggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatatt 255  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  |||||   |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    
T  19489780 atgggttttgtatcgtcggtcaattgaaagaagtgtttgtattgttaaatgaaatggtattgaaaaacatcaatccggatgtttatacatttaatacatt 19489879  T
Q  256 ggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataat 355  Q
    ||| |||||| | |  |||||||||||| | |||||||||| |  | |||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |   ||||||| |||| |    
T  19489880 ggttgatgctttgttcaaggaaggaaaggtcaaagaagctaaatgtttgattgcggtgatgatgaaagaaggtgttgaaccgaacattgttacttatagt 19489979  T
Q  356 acattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagct 455  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||    ||     ||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  19489980 gttttgatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaacaaggcgaaagatatattcaattctatgatgcaaaggggaatgactcctgatattcagagct 19490079  T
Q  456 acactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggt 555  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||| | ||||||| || || |   || || | ||||    |    
T  19490080 atactatcatgattaatggattatgtaagatgaaaatgttggatgaagcggtaagtctctttgaagaaatgcattccacaaatatgacgcttgatgtaat 19490179  T
Q  556 aacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgat 655  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||| ||  |  ||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||   ||||    
T  19490180 aacttatagttctcttattaatggtttatgcaaatcggggagattaatttctgcttggaagctttttgatgagatgcttgatagaggtcagccacccgat 19490279  T
Q  656 gtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaac 755  Q
    ||||| ||||| || || || ||| |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||| |||||  | |  ||||| ||||  ||||| ||||||     
T  19490280 gtaataacttataattctttattagatgctttatgtaaaagtcatcaaaccgacaaggcaatagcattactaagcaaaatgaaagatcaaggtattcaag 19490379  T
Q  756 caaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgc-aagaaggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatc-tttgattaaaggcta 853  Q
    || ||||   |||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||  |||| |||  ||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19490380 cagatatcttcacatacaatatacttattgatggactttgcaaagatggaagacttgatgatgcgcaaaagatatttcgggatcttttgattaaaagcta 19490479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 798
Target Start/End: Original strand, 17250842 - 17251485
Alignment:
Q  155 tatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatat 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| |||||   |||||||||  |||||||| | |||||  |||||| ||| ||||||| ||    
T  17250842 tatgggttttgcattgtgggtcaattggataaagcgtttggattgttaaatgaaatggtgttgaaaaacgtaaaccctaatgtttgtacgtttaatacat 17250941  T
Q  255 tggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataa 354  Q
    |||| |||| | | ||||||||||||||||| | |||||| | || | || | |  ||||||||||||||||| |||| |||   |||| |||| |||||    
T  17250942 tggttgatggtttatgtaaggaaggaaagatgagagaagcgaaaagtttggttgcagtgatgatgaaagaaggtgtgggaccggatgtttttacttataa 17251041  T
Q  355 tacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagc 454  Q
    | | || |||||||| ||||   ||||||| |||| |   ||||| ||||||||||| ||| | || |   ||| | || ||||   ||||||||| |||    
T  17251042 tgctttgatggatggatattttttagttaaggaagcggggaaggccaagaatgtatttaacattatggctcaaatgggagtgacttgtgatgttcatagc 17251141  T
Q  455 tacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataagg 554  Q
    || | | |||| |||| ||| |||| ||| || |||||| | ||||||||  |   ||||||| | |  ||||||  | ||    | | |||||||   |    
T  17251142 tatagtgtcatgattagtggattatctaaaatgaaaatgttggatgaagctatggatctctttgaagggatgcgtaacgaaaatgtgattcctgatgtag 17251241  T
Q  555 taacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcga 654  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | | ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||     |    
T  17251242 tagcttatagttctcttattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatcaatagtgctttgaagtatgttgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaa 17251341  T
Q  655 tgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaa 754  Q
    |||||| |||||||  || ||  || ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| |||||     
T  17251342 tgtaataacttacacttctttgatagatgctttgtgcaaaagccatcaagttgataaggcaattgcattactaaagaaaattaaagatcaaggtattcag 17251441  T
Q  755 ccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaa 798  Q
     |||||||  | ||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  17251442 gcaaatatgtatacatacaatatacttgttgatggactttgcaa 17251485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 755
Target Start/End: Original strand, 41198713 - 41198866
Alignment:
Q  598 aatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaac 697  Q
    ||||| |||||| ||| |||| ||| || |||||||| || || || |||||  |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41198713 aatatctcatgcttggaagctacttaatgagatgcattatggaagttaacctaccgatataatcagttgcaattccttattacatgctttatgtaaaaac 41198812  T
Q  698 catcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaac 755  Q
    ||||| ||||||||||    |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  41198813 catcatgttgacaagg----tgcactggtcaagaaatttaaagaccaagacattcaac 41198866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Original strand, 10129672 - 10129793
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||||| |    
T  10129672 ttttgcgttgtgggtcaattgaaagatgcaattggtttgttgcataaaatgatattggaaaacattaacccaaatgtttataccatgagtatattggttg 10129771  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaa 282  Q
    ||||| |||||||||| |||||    
T  10129772 atgctttttgtaaggatggaaa 10129793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4260786 - 4260641
Alignment:
Q  156 atggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatatt 255  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||     ||||| ||  | ||||||| |||||  |||| ||||||||||||  |||    
T  4260786 atggtttttgcgttgttggtaaattggaagaagcgttgggtttgtttaaaaaaatgatatcggaaaacattaacccgaatgtgtatacttttaatggatt 4260687  T
Q  256 ggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaat 301  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4260686 ggtagatgccttttgtaaggaaggaaagatagaagaagctaaaaat 4260641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4264408 - 4264263
Alignment:
Q  156 atggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatatt 255  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||     ||||| ||  | ||||||| |||||  |||| ||||||||||||  |||    
T  4264408 atggtttttgcgttgttggtaaattggaagaagcgttgggtttgtttaaaaaaatgatatcggaaaacattaacccgaatgtgtatacttttaatggatt 4264309  T
Q  256 ggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaat 301  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4264308 ggtagatgccttttgtaaggaaggaaagatagaagaagctaaaaat 4264263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 504
Target Start/End: Original strand, 10129954 - 10130015
Alignment:
Q  443 gatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagc 504  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10129954 gatgttcaaagttacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagc 10130015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 773
Target Start/End: Original strand, 28946406 - 28946563
Alignment:
Q  617 cttcttgatcagatgcat-gatagaggtcaacctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggca 715  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |   |||| ||||| || || ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||    
T  28946406 cttcttgatgagatgcattgatagagaccaaccagcttatgtgatcacctaaaattccctattaaatgctttatgaaaaaactatcatgttgataaggca 28946505  T
Q  716 attgcattggtcaagaaaattaaaggccaaggcattcaaccaaatattaacacataca 773  Q
     || ||||  |||||||||||||||  ||  | |||||||||||| |  |||||||||    
T  28946506 gttacattattcaagaaaattaaagatcagagtattcaaccaaatctacacacataca 28946563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 44263071 - 44262377
Alignment:
Q  147 ctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttt 246  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   | ||||| |  |||||||||||| ||  |||||| | |||||    
T  44263071 ctctaatacatggcttttgtattgtgggtcaatttaaagaagcagttggtttgttaaatcaaatgttgttgaaaaacatcagcctggatgttcaaacttt 44262972  T
Q  247 taatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgtt 346  Q
    ||||| |||||| |||| | | |||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||| ||| |||| ||||| |||  | || ||    
T  44262971 taatacattggttgatggtttatgtaaggaaggagaagttaaacaagctagaaatgtgttagctgttatgataaaacaaggtgtggatcctgatattttt 44262872  T
Q  347 acatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatg 446  Q
    || |||| | | || ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||   || |    |||  || |||  |||  ||    
T  44262871 acttatatttctttgatggatgggtatttcttggttaaagaagtgaacaaggccacatatgtattcaacactattgctcgaagtggagtgattcctagtg 44262772  T
Q  447 ttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcc 546  Q
    |||| ||||||| | | || |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||| |||     |||   ||  ||||    
T  44262771 ttcaaagctacagtgttatgattaatggattgtgtaagaaaaaaatggtggatgaagccgtcaatctcttcaaagaactgcaaataaaaaacatggctcc 44262672  T
Q  547 tgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaa 646  Q
     ||||   |||| |||| ||| || ||||||||  | ||||||||||  ||||||| | |||  ||||| ||| | ||| |||||||| ||| ||| |||    
T  44262671 cgatactataacatacaattcacttattgatggactttgcaaatcaggaagaatatctgatgtttgggatcttatagatgagatgcataatataggccaa 44262572  T
Q  647 cctgtcgatgtaatcacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaattaaaggccaag 746  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||| |||||    
T  44262571 cctgctgatgttatcacttacaattccttattggatgctttgtgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaatcacattattaacgaagatcaaagaccaag 44262472  T
Q  747 gcattcaaccaaatattaacacatacagtatacttatcgatggactatgcaagaa-ggaagacttgagaatgcacaagtgatttttcaggatctt 840  Q
    | ||||| ||||||||  | || |||| ||||||| | || ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  44262471 gaattcagccaaatatgtatacttacactatacttgttgacggactatgcaaaaatggaagacttaaggatgcacaagtggtttatcagaatctt 44262377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 15063267 - 15062910
Alignment:
Q  234 atgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtgga 333  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||  |||  |    
T  15063267 atgtgtatacttttagtatattgattgatggtttttgtaaggaaggaaaggtgagagaagctaaaaatgtgttagctgtgatgatgaaaaaaaacgtaaa 15063168  T
Q  334 acctactgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggaga 433  Q
    || |  ||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||||||| || |   ||||| ||    
T  15063167 acttgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcttagttaaacaagtgaacaaggccaagagtttattcaacgttatggctcaaagggga 15063068  T
Q  434 atgacacctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgca 533  Q
     | || ||||| |||   ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||||| ||| |    
T  15063067 gtaactcctgacgtttggagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtagatgaagccatgaagctctttgaagaaatgcattgta 15062968  T
Q  534 aaggaattactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatc 591  Q
    ||  ||||  |||  ||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  15062967 aacaaatttttccaaatgtggtaacttacaattcccttgttgatggtttgtgtaaatc 15062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 21456140 - 21456219
Alignment:
Q  164 tgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatac 243  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21456140 tgcattgcgggttaattgaaagaagcatctgaattgttggatgaaatggtattgaaaaacatcaagccagatgtttatac 21456219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 555 - 648
Target Start/End: Original strand, 33322443 - 33322534
Alignment:
Q  555 taacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacc 648  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||    
T  33322443 taacttacaactctcttattgatggtttgtgcaaatc--agagactatctcatgcttggaagctgcttaatgagatgcatgatggaagtcaacc 33322534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 792
Target Start/End: Original strand, 3778 - 4303
Alignment:
Q  267 tttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacattaatgga 366  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||| || | | || |||||||||| ||||  |  ||||||  |||||||| ||||   | ||||||||    
T  3778 tttgtaaggaaggaaaagtaaaagaagctaaaaatgtgtttgctgcgatgatgaaaaaaggtttcaaacctaacgttgttacttatagctctttaatgga 3877  T
Q  367 tgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacactatcatt 466  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||   || |   |  || || |||  |||||| |||| || |||| |||| |     
T  3878 tggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacaatatcttg 3977  T
Q  467 attaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaacttacagtt 566  Q
    |||||||| || |||||||||||||||   |||| |||| | | ||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||| ||    
T  3978 attaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaatt 4077  T
Q  567 ctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaatcactta 666  Q
    | || || ||||||||||| ||||| | || ||| | | |||| | | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    ||| |||| |||||    
T  4078 cccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattactta 4177  T
Q  667 caactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaatattaa 765  Q
    ||  ||  | ||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  | || |||||| |||| ||| ||  |||||||||||||  |    
T  4178 cagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatccaggtgacaaggcaattgcatt-attaacaaaattgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgta 4276  T
Q  766 cacatacagtatacttatcgatggact 792  Q
    |||||||| ||| |||||  |||||||    
T  4277 cacatacactattcttattaatggact 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 773
Target Start/End: Original strand, 21878 - 22490
Alignment:
Q  161 ttttgcattgttggtcaattgaaagaagcatttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcg 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||  | |||||  |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  21878 ttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttattcaataaaatgacatcgaaaaacatcatcccagatgtgtatacctttagtatattggttg 21977  T
Q  261 atgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctactgttgttacatataatacatt 360  Q
    |||   |||||||||| ||||| || ||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||| || || |  |||||  ||||||||| || |   | ||    
T  21978 atggattttgtaaggacggaaacataaaagaggctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaagcattaaacctgatgttgttacttacagctcttt 22077  T
Q  361 aatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacacctgatgttcacagctacact 460  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||   ||     | ||| |  ||||  || ||||||| ||||||| |    
T  22078 aatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgtctcataggggtgtgactgctaatgttcagagctacaat 22177  T
Q  461 atcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcctgataaggtaactt 560  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |  || || || ||||||| |  ||||  ||||  |||||||  | ||||||    
T  22178 atcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataactt 22277  T
Q  561 acagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacctgtcgatgtaat 660  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |||||||   |||| | ||| ||| | ||| |||||||| || |||| ||||     ||| ||||    
T  22278 atagttcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcattatcgagggcaacaacctgatataat 22377  T
Q  661 cacttacaactccttcttacatgctttatgtaaaaaccatcaagttgacaaggcaattgcattggtcaagaaaatt-aaaggccaaggcattcaaccaaa 759  Q
     |||||||| ||  | ||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||  | || |||||| ||||||||||| |||| |||| |    
T  22378 tacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgtggacaaagcaattacatt-attaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccaga 22476  T
Q  760 tattaacacataca 773  Q
    ||| ||||||||||    
T  22477 tatgaacacataca 22490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 53980 - 53573
Alignment:
Q  241 tacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaagaagctagaaatatgatagttgtgatgatgaaagaaggcgtggaacctact 340  Q
    ||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||| || || | || | | | ||||||||||| ||||| |  |||||| |    
T  53980 tacttttaatacattggttgatggattttgtaaggacagaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatgaaacaaggcattaaacctaat 53881  T
Q  341 gttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggcaaagaatgtattcaacgtcataggaaaaaggagaatgacac 440  Q
    |||||||| |||    | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||   ||     | ||| || ||||      
T  53880 gttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagaagatattcaacactatgtctcagaggggagtgactg 53781  T
Q  441 ctgatgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaat 540  Q
    || ||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||||| | |  ||||| |  ||||||| |  ||||   ||    
T  53780 ctaatgttcatagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaaaggtggataaagccatgaaactcttcatagaaatgcatcacaaacatat 53681  T
Q  541 tactcctgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatatatcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgataga 640  Q
    || |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| | || ||||| | |||| |   ||||  |  || ||||||||||||||    
T  53680 tattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatatcttatgctttccagctagtcaatgagatgcatgataga 53581  T
Q  641 ggtcaacc 648  Q
    ||||||||    
T  53580 ggtcaacc 53573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54234 - 54006
Alignment:
Q  92 ttatattctcaaatgattctaaagaaaatttctcccaatgttgttactttgagctctctaatctatggattttgcattgttggtcaattgaaagaagcat 191  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||  || ||||    || |||| |||||||||| || ||||||| |||     
T  54234 ttatattctgaaatggttgcaaagagaatttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagagggtttttcattgttggtaaactgaaagatgcaa 54135  T
Q  192 ttggtttgttccgtgaaatggtaatgaaaaacatcaacccagatgtttatacttttaatatattggtcgatgctctttgtaaggaaggaaagattaaaga 291  Q
    ||| | ||||   | ||||| || || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||   ||||||||||||||| | | ||| |    
T  54134 ttgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaaaccggatgtgtatacctttaatatattagttgatggattttgtaaggaaggaaggctgaaaaa 54035  T
Q  292 agctagaaatatgatagttgtgatgatga 320  Q
    ||||| |||| || ||| | |||||||||    
T  54034 agctaaaaatgtgttagatatgatgatga 54006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University