View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5866_low_4 (Length: 736)

Name: NF5866_low_4
Description: NF5866
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5866_low_4
NF5866_low_4
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (238-727)||(39751659-39752148)
chr8 (346-727)||(35965484-35965865)
chr8 (342-727)||(43370708-43371093)
chr8 (343-727)||(45455317-45455701)
chr8 (342-727)||(43688906-43689291)
chr8 (351-727)||(7341020-7341396)
chr8 (351-727)||(30304354-30304730)
chr8 (351-727)||(32377652-32378028)
chr8 (351-727)||(32431609-32431985)
chr8 (351-727)||(8422600-8422976)
chr8 (342-727)||(7168841-7169217)
chr8 (351-727)||(1115713-1116089)
chr8 (342-727)||(2145734-2146110)
chr8 (2-337)||(2124345-2124698)
chr8 (11-337)||(35962481-35962811)
chr8 (5-333)||(43679564-43679896)
chr8 (2-337)||(43376848-43377201)
chr8 (2-337)||(23924130-23924469)
chr8 (2-246)||(39751225-39751473)
chr8 (36-337)||(22588011-22588316)
chr8 (2-337)||(39622-39961)
chr8 (34-337)||(30301332-30301639)
chr8 (34-337)||(32375849-32376156)
chr8 (34-337)||(7344125-7344432)
chr8 (34-337)||(8419602-8419909)
chr8 (58-337)||(7171886-7172179)
chr8 (522-708)||(22580864-22581049)
chr8 (2-337)||(31959616-31959969)
chr8 (2-337)||(22661143-22661482)
chr8 (2-319)||(4867380-4867711)
chr8 (2-227)||(20548938-20549167)
chr8 (173-337)||(41744163-41744327)
chr8 (342-436)||(22581060-22581154)
chr8 (2-140)||(34367076-34367214)
chr8 (3-261)||(30972519-30972781)
chr8 (2-139)||(41239013-41239150)
chr8 (2-98)||(23578599-23578695)
chr8 (2-135)||(41744029-41744162)
chr8 (214-283)||(31281193-31281262)
chr8 (548-657)||(14401713-14401824)
chr8 (553-657)||(45116258-45116362)
chr8 (553-657)||(44320872-44320976)
chr8 (551-657)||(17340021-17340127)
chr8 (2-143)||(31280975-31281118)
chr8 (2-56)||(7172465-7172519)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (342-727)||(37015855-37016240)
chr1 (342-727)||(46974105-46974490)
chr1 (342-727)||(50116498-50116883)
chr1 (342-727)||(38691674-38692059)
chr1 (342-715)||(51663211-51663584)
chr1 (351-727)||(41454778-41455154)
chr1 (342-727)||(13174722-13175107)
chr1 (351-727)||(29355432-29355808)
chr1 (342-727)||(12649314-12649697)
chr1 (351-727)||(13630357-13630733)
chr1 (351-727)||(38774859-38775235)
chr1 (351-727)||(3947205-3947581)
chr1 (351-727)||(3984054-3984430)
chr1 (351-727)||(44466523-44466899)
chr1 (351-727)||(20350397-20350773)
chr1 (351-708)||(5078895-5079252)
chr1 (342-727)||(21943099-21943484)
chr1 (409-727)||(44619905-44620223)
chr1 (463-727)||(7980068-7980332)
chr1 (2-337)||(8459122-8459461)
chr1 (5-337)||(9710745-9711081)
chr1 (5-337)||(37018965-37019301)
chr1 (1-337)||(51666235-51666575)
chr1 (2-337)||(44469580-44469919)
chr1 (2-337)||(7966147-7966492)
chr1 (2-337)||(50113472-50113825)
chr1 (2-337)||(29352398-29352737)
chr1 (2-337)||(20353504-20353843)
chr1 (4-337)||(25039650-25039987)
chr1 (2-337)||(30909598-30909937)
chr1 (5-337)||(13633441-13633778)
chr1 (45-337)||(38690117-38690412)
chr1 (2-337)||(1655649-1655998)
chr1 (2-337)||(5081933-5082274)
chr1 (2-337)||(12643373-12643709)
chr1 (2-337)||(13177695-13178042)
chr1 (2-325)||(19495204-19495544)
chr1 (34-337)||(3944172-3944479)
chr1 (2-337)||(6558052-6558405)
chr1 (34-337)||(3993411-3993718)
chr1 (347-727)||(26466010-26466390)
chr1 (34-337)||(38771828-38772135)
chr1 (4-342)||(36072529-36072881)
chr1 (4-337)||(5141439-5141775)
chr1 (16-337)||(33168082-33168417)
chr1 (1-165)||(4518160-4518325)
chr1 (2-165)||(46979002-46979166)
chr1 (173-337)||(4517963-4518125)
chr1 (475-727)||(16246622-16246871)
chr1 (173-337)||(46978803-46978967)
chr1 (2-201)||(15051053-15051256)
chr1 (347-727)||(32106383-32106760)
chr1 (2-141)||(22345818-22345952)
chr1 (2-145)||(94562-94705)
chr1 (2-145)||(16281861-16282004)
chr1 (2-141)||(19521761-19521900)
chr1 (11-145)||(21144396-21144530)
chr1 (10-160)||(46886137-46886288)
chr1 (25-145)||(31780155-31780275)
chr1 (5-145)||(52805325-52805465)
chr1 (2-145)||(22527460-22527603)
chr1 (2-145)||(470835-470978)
chr1 (343-421)||(19498199-19498277)
chr1 (4-137)||(50617369-50617503)
chr1 (553-657)||(36360466-36360570)
chr1 (554-657)||(18887570-18887673)
chr1 (553-657)||(7403629-7403733)
chr1 (551-680)||(25231290-25231419)
chr1 (553-657)||(45472363-45472467)
chr1 (458-657)||(25593679-25593878)
chr1 (1-74)||(29261528-29261601)
chr1 (553-657)||(28862901-28863005)
chr1 (344-419)||(25231551-25231626)
chr1 (548-594)||(39914011-39914057)
chr1 (28-97)||(47714900-47714969)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (342-728)||(14399495-14399881)
chr3 (342-727)||(77755-78140)
chr3 (342-727)||(36816251-36816636)
chr3 (342-727)||(7841751-7842135)
chr3 (342-727)||(6504690-6505075)
chr3 (342-727)||(7838537-7838922)
chr3 (342-727)||(46991981-46992366)
chr3 (342-727)||(48249602-48249987)
chr3 (342-727)||(21954974-21955358)
chr3 (351-727)||(13746465-13746841)
chr3 (351-727)||(9428577-9428953)
chr3 (351-727)||(6741828-6742204)
chr3 (351-727)||(16445561-16445937)
chr3 (351-727)||(3949684-3950060)
chr3 (351-727)||(8159727-8160103)
chr3 (351-727)||(30946386-30946762)
chr3 (456-727)||(29930309-29930580)
chr3 (456-727)||(29979463-29979734)
chr3 (2-337)||(21951964-21952303)
chr3 (2-337)||(6489493-6489847)
chr3 (2-337)||(9426770-9427109)
chr3 (2-337)||(48246576-48246915)
chr3 (5-337)||(46989680-46990030)
chr3 (2-337)||(13743432-13743770)
chr3 (2-337)||(6744895-6745234)
chr3 (2-337)||(4002060-4002413)
chr3 (2-337)||(2857551-2857890)
chr3 (34-337)||(30943388-30943695)
chr3 (34-337)||(8156706-8157013)
chr3 (34-337)||(3952783-3953090)
chr3 (2-337)||(50957248-50957601)
chr3 (10-337)||(67046-67387)
chr3 (2-337)||(36813002-36813355)
chr3 (565-727)||(50954214-50954376)
chr3 (173-337)||(2743795-2743959)
chr3 (150-337)||(14402574-14402764)
chr3 (2-205)||(7841260-7841467)
chr3 (2-145)||(600309-600452)
chr3 (2-145)||(50213622-50213765)
chr3 (2-145)||(36134048-36134191)
chr3 (342-460)||(29908027-29908144)
chr3 (342-460)||(29949193-29949310)
chr3 (342-460)||(29998347-29998464)
chr3 (2-145)||(42166177-42166320)
chr3 (2-145)||(47070633-47070776)
chr3 (2-145)||(2271519-2271663)
chr3 (2-145)||(16646939-16647081)
chr3 (11-138)||(9473721-9473848)
chr3 (25-135)||(52387987-52388097)
chr3 (501-727)||(33399476-33399702)
chr3 (2-94)||(14402813-14402905)
chr3 (553-657)||(2285003-2285107)
chr3 (565-664)||(8263742-8263841)
chr3 (458-594)||(1275240-1275376)
chr3 (553-657)||(9556727-9556831)
chr3 (553-657)||(51548479-51548583)
chr3 (458-657)||(4510287-4510486)
chr3 (74-142)||(2743678-2743746)
chr3 (553-657)||(4120740-4120843)
chr3 (553-657)||(32426622-32426726)
chr3 (553-657)||(40468155-40468259)
chr3 (551-605)||(12491150-12491204)
chr3 (687-727)||(11389065-11389105)
chr3 (2-51)||(2743562-2743611)
[»] scaffold0219 (3 HSPs)
scaffold0219 (342-727)||(17010-17395)
scaffold0219 (2-260)||(19743-20019)
scaffold0219 (258-337)||(19503-19582)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (342-727)||(7799741-7800126)
chr5 (342-721)||(18537071-18537450)
chr5 (342-727)||(4202674-4203059)
chr5 (344-727)||(34078721-34079104)
chr5 (342-727)||(25895832-25896221)
chr5 (344-727)||(27866582-27866965)
chr5 (351-714)||(37819621-37819984)
chr5 (351-727)||(11032196-11032572)
chr5 (351-727)||(38858934-38859310)
chr5 (351-714)||(28885152-28885515)
chr5 (351-700)||(7020624-7020973)
chr5 (344-727)||(13566828-13567222)
chr5 (2-337)||(7796742-7797081)
chr5 (342-595)||(1036424-1036677)
chr5 (2-337)||(13563806-13564145)
chr5 (4-337)||(27863570-27863907)
chr5 (4-337)||(33994718-33995055)
chr5 (2-337)||(34122689-34123042)
chr5 (2-337)||(25890159-25890498)
chr5 (2-337)||(37814747-37815086)
chr5 (26-337)||(28882177-28882492)
chr5 (516-727)||(1035459-1035670)
chr5 (347-710)||(20285967-20286330)
chr5 (5-337)||(38855882-38856219)
chr5 (5-337)||(11029176-11029511)
chr5 (2-337)||(24053318-24053667)
chr5 (2-284)||(34079753-34080039)
chr5 (2-337)||(7017676-7018002)
chr5 (10-337)||(24050199-24050542)
chr5 (2-292)||(25877785-25878089)
chr5 (2-337)||(1039361-1039713)
chr5 (124-337)||(14280547-14280764)
chr5 (113-337)||(4196792-4197018)
chr5 (2-337)||(30352592-30352934)
chr5 (527-727)||(20286449-20286650)
chr5 (182-337)||(28387825-28387979)
chr5 (604-727)||(33994192-33994315)
chr5 (212-333)||(43179438-43179559)
chr5 (1-145)||(7762008-7762152)
chr5 (11-145)||(38407320-38407454)
chr5 (2-285)||(6267639-6267925)
chr5 (2-145)||(41799534-41799676)
chr5 (2-169)||(43179640-43179808)
chr5 (551-683)||(13157978-13158110)
chr5 (450-680)||(23028403-23028640)
chr5 (652-727)||(31097980-31098055)
chr5 (367-532)||(20287404-20287569)
chr5 (2-122)||(28388307-28388427)
chr5 (2-61)||(4196719-4196778)
chr5 (551-657)||(25048408-25048515)
chr5 (553-657)||(6552800-6552904)
chr5 (553-657)||(42343502-42343606)
chr5 (553-657)||(43295232-43295336)
chr5 (553-657)||(27013615-27013719)
chr5 (555-605)||(11819279-11819329)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (342-727)||(41007715-41008100)
chr2 (343-727)||(436252-436636)
chr2 (342-727)||(43949017-43949402)
chr2 (351-727)||(24750599-24750975)
chr2 (342-727)||(12907227-12907612)
chr2 (343-727)||(24604825-24605209)
chr2 (342-727)||(28354637-28355022)
chr2 (344-727)||(11692552-11692934)
chr2 (351-727)||(27275104-27275480)
chr2 (351-727)||(212185-212561)
chr2 (351-727)||(3802310-3802686)
chr2 (351-727)||(10623198-10623574)
chr2 (342-727)||(34920517-34920892)
chr2 (361-727)||(39794911-39795277)
chr2 (342-727)||(45476305-45476683)
chr2 (351-727)||(5348108-5348484)
chr2 (351-727)||(41560953-41561329)
chr2 (351-727)||(38946704-38947080)
chr2 (2-337)||(41181575-41181914)
chr2 (4-337)||(28342689-28343027)
chr2 (342-630)||(9655194-9655482)
chr2 (2-337)||(45479390-45479729)
chr2 (2-337)||(24601804-24602155)
chr2 (2-337)||(24611959-24612310)
chr2 (347-721)||(17996912-17997286)
chr2 (466-727)||(7263973-7264234)
chr2 (2-337)||(9659609-9659964)
chr2 (345-572)||(1098564-1098791)
chr2 (2-337)||(43943854-43944205)
chr2 (2-337)||(12905684-12906033)
chr2 (5-337)||(41052789-41053137)
chr2 (3-337)||(439379-439729)
chr2 (2-337)||(24753593-24753932)
chr2 (2-337)||(1096734-1097087)
chr2 (2-337)||(7267013-7267352)
chr2 (20-337)||(39798009-39798329)
chr2 (34-337)||(41564059-41564366)
chr2 (34-337)||(5351300-5351607)
chr2 (34-337)||(10620171-10620478)
chr2 (2-337)||(3795501-3795854)
chr2 (1-337)||(41004690-41005040)
chr2 (34-337)||(209182-209489)
chr2 (2-337)||(81819-82171)
chr2 (566-727)||(1100042-1100203)
chr2 (2-240)||(38950232-38950474)
chr2 (5-135)||(25184606-25184736)
chr2 (157-336)||(1150601-1150783)
chr2 (2-145)||(10825383-10825526)
chr2 (2-145)||(39950936-39951079)
chr2 (2-145)||(32952895-32953038)
chr2 (34-205)||(18000430-18000605)
chr2 (628-727)||(9652132-9652231)
chr2 (2-145)||(29398074-29398213)
chr2 (237-337)||(38949755-38949855)
chr2 (46-166)||(3206956-3207077)
chr2 (351-419)||(7264229-7264297)
chr2 (214-328)||(25613583-25613697)
chr2 (553-657)||(9639183-9639287)
chr2 (565-609)||(24683458-24683502)
chr2 (555-619)||(28423423-28423487)
chr2 (13-143)||(25613379-25613508)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (342-719)||(4976704-4977081)
chr4 (342-727)||(4978693-4979074)
chr4 (342-727)||(11502447-11502832)
chr4 (351-727)||(9890963-9891339)
chr4 (351-727)||(19072401-19072777)
chr4 (351-727)||(49565208-49565584)
chr4 (343-721)||(51643234-51643614)
chr4 (351-727)||(41024141-41024516)
chr4 (351-714)||(3404744-3405107)
chr4 (343-727)||(21471735-21472118)
chr4 (393-727)||(18580117-18580448)
chr4 (2-337)||(10422977-10423315)
chr4 (2-337)||(38460590-38460929)
chr4 (38-337)||(10374240-10374543)
chr4 (2-336)||(44050650-44051001)
chr4 (342-591)||(38463572-38463821)
chr4 (342-619)||(4769179-4769460)
chr4 (2-337)||(3407808-3408148)
chr4 (2-337)||(37394772-37395125)
chr4 (2-337)||(4774173-4774522)
chr4 (342-558)||(44049720-44049936)
chr4 (34-337)||(49564039-49564346)
chr4 (2-250)||(50904819-50905071)
chr4 (2-337)||(19069351-19069704)
chr4 (5-337)||(18578790-18579136)
chr4 (71-337)||(24415392-24415674)
chr4 (2-240)||(51642171-51642423)
chr4 (173-337)||(11506663-11506827)
chr4 (1-315)||(6186810-6187140)
chr4 (637-727)||(38463827-38463917)
chr4 (2-140)||(51492236-51492374)
chr4 (2-145)||(37016063-37016206)
chr4 (2-145)||(50278588-50278731)
chr4 (2-140)||(44674302-44674440)
chr4 (623-727)||(17140530-17140634)
chr4 (2-142)||(15995886-15996026)
chr4 (347-680)||(6182664-6182999)
chr4 (213-283)||(30043046-30043116)
chr4 (553-657)||(17916198-17916302)
chr4 (553-657)||(4617714-4617818)
chr4 (551-657)||(1590845-1590950)
chr4 (28-97)||(30043245-30043314)
chr4 (553-653)||(46517380-46517480)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (344-727)||(47061824-47062207)
chr7 (351-727)||(18106329-18106705)
chr7 (351-727)||(43622879-43623255)
chr7 (351-727)||(617493-617869)
chr7 (351-714)||(42500361-42500724)
chr7 (351-727)||(30787480-30787856)
chr7 (351-727)||(45764320-45764696)
chr7 (344-727)||(8400527-8400910)
chr7 (391-714)||(15060568-15060890)
chr7 (344-727)||(43827344-43827726)
chr7 (2-337)||(34622663-34623002)
chr7 (2-337)||(47742558-47742897)
chr7 (5-340)||(19044460-19044813)
chr7 (5-340)||(20709823-20710176)
chr7 (2-337)||(18109362-18109702)
chr7 (2-337)||(15069919-15070259)
chr7 (4-337)||(603946-604283)
chr7 (10-337)||(42503407-42503739)
chr7 (1-337)||(10705411-10705761)
chr7 (34-337)||(30790575-30790882)
chr7 (34-337)||(45767429-45767736)
chr7 (34-337)||(43619877-43620184)
chr7 (16-337)||(12111394-12111727)
chr7 (173-337)||(29592842-29593006)
chr7 (70-337)||(47064863-47065148)
chr7 (524-727)||(21799953-21800156)
chr7 (25-138)||(34742168-34742281)
chr7 (2-145)||(5538009-5538152)
chr7 (2-145)||(17838400-17838543)
chr7 (2-144)||(40928719-40928861)
chr7 (2-135)||(29592708-29592841)
chr7 (59-145)||(10522280-10522366)
chr7 (2-145)||(13323480-13323623)
chr7 (553-657)||(46791336-46791440)
chr7 (553-657)||(47867442-47867546)
chr7 (458-657)||(8194131-8194330)
chr7 (553-657)||(45172855-45172959)
chr7 (554-657)||(40445512-40445615)
chr7 (548-618)||(20908458-20908528)
chr7 (553-657)||(1296997-1297101)
chr7 (458-594)||(3761979-3762115)
chr7 (351-395)||(15067162-15067206)
chr7 (462-594)||(16794468-16794600)
chr7 (556-657)||(40793934-40794035)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (351-727)||(12203-12580)
scaffold0116 (2-337)||(15524-15863)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (342-727)||(18606937-18607322)
chr6 (342-721)||(31147269-31147648)
chr6 (342-727)||(29287687-29288067)
chr6 (351-727)||(1611495-1611871)
chr6 (2-337)||(29286367-29286706)
chr6 (432-727)||(28250837-28251132)
chr6 (2-336)||(18609803-18610141)
chr6 (342-671)||(21358085-21358411)
chr6 (342-671)||(23962067-23962393)
chr6 (2-337)||(31150634-31150973)
chr6 (4-337)||(25140674-25141012)
chr6 (2-337)||(7537351-7537704)
chr6 (2-337)||(2051192-2051545)
chr6 (2-337)||(23959055-23959394)
chr6 (2-337)||(29667392-29667741)
chr6 (2-337)||(28362286-28362639)
chr6 (432-727)||(24220107-24220404)
chr6 (34-337)||(1608491-1608798)
chr6 (2-337)||(13382792-13383145)
chr6 (537-727)||(7362120-7362310)
chr6 (571-727)||(7362307-7362463)
chr6 (2-169)||(26702452-26702619)
chr6 (28-309)||(34230670-34230956)
chr6 (2-201)||(18351348-18351551)
chr6 (627-727)||(35243544-35243644)
chr6 (2-145)||(3502429-3502572)
chr6 (11-145)||(31771505-31771639)
chr6 (101-337)||(2259349-2259588)
chr6 (4-138)||(11840022-11840156)
chr6 (2-308)||(20448386-20448695)
chr6 (2-92)||(2258450-2258540)
chr6 (637-727)||(13387724-13387814)
chr6 (344-429)||(28357557-28357642)
chr6 (2-115)||(8304602-8304715)
chr6 (67-144)||(19129204-19129281)
chr6 (2-144)||(20439771-20439913)
chr6 (548-657)||(34111603-34111712)
chr6 (667-727)||(23985364-23985424)
chr6 (553-605)||(22864869-22864921)
chr6 (45-144)||(20436063-20436162)
chr6 (458-537)||(26684880-26684959)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (351-727)||(1822-2198)
scaffold0494 (2-337)||(4895-5235)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (351-727)||(16101-16477)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (351-727)||(33750-34126)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (2-337)||(22566-22918)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (532-727)||(95-290)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (1-236)||(8363-8602)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (192-337)||(10833-10978)
scaffold0169 (2-77)||(1517-1592)
[»] scaffold0794 (1 HSPs)
scaffold0794 (173-337)||(1320-1484)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (2-337)||(21814-22142)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (2-145)||(236001-236144)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (25-140)||(12591-12706)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (553-657)||(3847-3951)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 238 - 727
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39752148
Alignment:
Q  238 ataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39751659 ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc 39751758  T
Q  338 ttcgcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctt 437  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||     
T  39751759 gtcgcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctc 39751858  T
Q  438 tattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgg 537  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751859 tatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgg 39751958  T
Q  538 aagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattg 637  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |    
T  39751959 aagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcataaatatgtcattctaaagccggttccattgcatgg 39752058  T
Q  638 ttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||    
T  39752059 ttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgcttactttgatatccaccaatcatgaacaaacatccacattttctt 39752148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 346 - 727
Target Start/End: Original strand, 35965484 - 35965865
Alignment:
Q  346 tgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcc 445  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  35965484 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgcc 35965583  T
Q  446 tttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatct 545  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35965584 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatct 35965683  T
Q  546 tgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaac 645  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35965684 tgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaac 35965783  T
Q  646 tccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35965784 tccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 35965865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 43371093 - 43370708
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  43371093 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcagctctatt 43370994  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43370993 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 43370894  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43370893 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactccatcgcatggttgt 43370794  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43370793 gaactccattaagaatgttcaaaccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 43370708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 343 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 45455701 - 45455317
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatta 442  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||     
T  45455701 gattgtggtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctattt 45455602  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45455601 gcctttcatatttgttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggtattttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 45455502  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  45455501 ttttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtt 45455402  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45455401 aactccattaagaatgtccaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 45455317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 43688906 - 43689291
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  43688906 cgattatagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatt 43689005  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43689006 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttcgaagc 43689105  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43689106 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcttttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactccatcgcatggttgt 43689205  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43689206 gaactccattaagaatgttaaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 43689291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7341396 - 7341020
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  7341396 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 7341297  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7341296 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 7341197  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  7341196 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 7341097  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  7341096 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 7341020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 30304354 - 30304730
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  30304354 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 30304453  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30304454 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctatggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 30304553  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  30304554 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 30304653  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  30304654 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 30304730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 32377652 - 32378028
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  32377652 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 32377751  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32377752 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 32377851  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32377852 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 32377951  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  32377952 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 32378028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 32431609 - 32431985
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  32431609 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 32431708  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32431709 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 32431808  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32431809 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 32431908  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  32431909 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 32431985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 8422600 - 8422976
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  8422600 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 8422699  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8422700 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 8422799  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  8422800 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatagttgtgaactccat 8422899  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  8422900 taagaatgtttaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 8422976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7169217 - 7168841
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||         ||||| ||||    
T  7169217 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg---------cacctctatt 7169127  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7169126 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 7169027  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7169026 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcatcttgtcgtcctcctttaatctactagcaagaatgtatccttctaaagtcggctccatcgcatggttgt 7168927  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7168926 gaactccattaagaatgttcaatccccactcctttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaagcacccacattttctt 7168841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1116089 - 1115713
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  1116089 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 1115990  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1115989 tatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaattgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 1115890  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||    
T  1115889 ttggtcaagtcacgtactatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctctatgggatggttgtgaactccat 1115790  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  1115789 taagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 1115713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 2145734 - 2146110
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2145734 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacaacttcttgtcacctctatt 2145833  T
Q  442 a-----gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttg 536  Q
    |     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145834 atatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtgatcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttg 2145933  T
Q  537 gaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatt 636  Q
    |||| ||||||   |||           ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2145934 gaagcatcttg---ttg-----------tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatatgtccttctaaagtcggctccatcgcatg 2146019  T
Q  637 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  2146020 gttgtgaactccattaaaaatgttcaatctccattcatttgtttgcttactttgatatccactaatcacgaacaagcatccacattttctt 2146110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 2124345 - 2124698
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  2124345 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatcaaaccg 2124444  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattc---acacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  2124445 acatttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 2124544  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  2124545 aattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtc 2124644  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2124645 gctattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 2124698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 337
Target Start/End: Original strand, 35962481 - 35962811
Alignment:
Q  11 aaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggt 110  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || || ||||    
T  35962481 aaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgaaatttggt 35962580  T
Q  111 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattcc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35962581 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtgcataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctacttacattca 35962680  T
Q  207 acacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaag 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35962681 acgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaag 35962780  T
Q  307 gcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35962781 gcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 35962811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Original strand, 43679564 - 43679896
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  43679564 atttccaaaggcaatataaatcatacaaaattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca 43679663  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctactta 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43679664 tttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattatattaaatccctgctta 43679763  T
Q  201 cattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataa 300  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||   |||||    
T  43679764 cattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaataa 43679863  T
Q  301 gtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgt 333  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  43679864 gtcaaggcatataacttgtcgttttccatgcgt 43679896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43377201 - 43376848
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  43377201 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaaccg 43377102  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  43377101 aaatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccttaattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 43377002  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  43377001 aattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtc 43376902  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43376901 actatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 43376848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 23924130 - 23924469
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  23924130 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 23924229  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23924230 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 23924329  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  23924330 ttacattcaacgcaactgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 23924429  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23924430 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 23924469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 39751225 - 39751473
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39751225 agcatttccaaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatcaaactg 39751324  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  39751325 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 39751424  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 246  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751425 ttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 39751473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22588316 - 22588011
Alignment:
Q  36 tgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 135  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588316 tgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 22588217  T
Q  136 catcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacat 231  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22588216 gatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacat 22588117  T
Q  232 acatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||   ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22588116 acatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccgttttccatgc 22588017  T
Q  332 gtattc 337  Q
    ||||||    
T  22588016 gtattc 22588011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 39622 - 39961
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  39622 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 39721  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  39722 acatttggttaaaattaaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 39821  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||| |||||    
T  39822 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaa 39921  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39922 taagcaaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 39961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 30301332 - 30301639
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  30301332 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 30301431  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  30301432 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 30301531  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30301532 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 30301631  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  30301632 gcgtattc 30301639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 32375849 - 32376156
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  32375849 attgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaatcgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 32375948  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  32375949 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 32376048  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32376049 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttcccat 32376148  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  32376149 gcgtattc 32376156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7344432 - 7344125
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| | | ||||||||||    
T  7344432 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaa 7344333  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  7344332 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 7344233  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7344232 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 7344133  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  7344132 gcgtattc 7344125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 8419602 - 8419909
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  8419602 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 8419701  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  8419702 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 8419801  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8419802 gtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 8419901  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  8419902 gcgtattc 8419909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7172179 - 7171886
Alignment:
Q  58 aaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtc 156  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  7172179 aaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagtgtc 7172080  T
Q  157 cataattaaacaattca-------------cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataata 243  Q
    |||||||||||||  ||             ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7172079 cataattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataata 7171980  T
Q  244 tattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7171979 tattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 7171886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 522 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 22581049 - 22580864
Alignment:
Q  522 tcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagc 621  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22581049 tcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagt 22580950  T
Q  622 cggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaa 708  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22580949 cggctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccattc-tttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 22580864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31959969 - 31959616
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||       
T  31959969 agcatttccaaaggcaaaataattcatataagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaattaaaccc 31959870  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag---------------tgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||                ||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  31959869 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcatta 31959770  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  31959769 aattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccaaaacataaatccgacgtc 31959670  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31959669 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 31959616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22661482 - 22661143
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  22661482 agcatttccaaaggcattattagttgtacaacatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtccataattaaatcaaaccg 22661383  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    | || | ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||   || ||| |||||||||||| ||||    
T  22661382 atatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcgttaaattaaatctctac 22661283  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    | ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| |||    
T  22661282 tgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattccgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaa 22661183  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  22661182 taagccaaggcatatggcttgccgttttccatgcatattc 22661143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4867711 - 4867380
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||       
T  4867711 agcatttccaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaacca 4867612  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa-------------ttcacacatcattaaatt 187  Q
    |||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||              | ||  |||||||||||    
T  4867611 acatttgatttaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaatt 4867512  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  4867511 aaatccctacttacattcaacgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcgtta 4867412  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgc 319  Q
     | || |||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  4867411 tcatctcgaataagccaatgcacataggttgc 4867380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20549167 - 20548938
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  20549167 agcatttccaaagacaaaataattcatacaagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 20549068  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  20549067 aaatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttac 20548968  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacga 227  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20548967 ttacattcaacgcaattgcatatggaacga 20548938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Original strand, 41744163 - 41744327
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  41744163 acacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaatata 41744262  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  41744263 aatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattc 41744327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22581154 - 22581060
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacct 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22581154 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggattcttgtcacct 22581060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 34367076 - 34367214
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34367076 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacagcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 34367175  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 140  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34367176 acattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 34367214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30972781 - 30972519
Alignment:
Q  3 gcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattga 102  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |    
T  30972781 gcattttcagaggcaatacaactcatacatcatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaa 30972682  T
Q  103 catctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa---ttcacacatcattaaattaaatccctact 198  Q
    ||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||    | ||||||||||| || ||||  |||      
T  30972681 catttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattacataaaatatctatc 30972582  T
Q  199 tacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatat 261  Q
     |||||| || ||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30972581 gacattctacgcatgtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattatcttcaaccatat 30972519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 41239013 - 41239150
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |    
T  41239013 agcatttcgaaatgcaaaataattcatacaacattgaatctcggacataaacaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccg 41239112  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 139  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41239113 acatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatc 41239150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 23578599 - 23578695
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23578599 agcatttccaaaggcaatataaattatacaacattgaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaa 23578695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 41744029 - 41744162
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||  |    
T  41744029 agcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaattaaaccg 41744128  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 135  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744129 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 41744162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 31281193 - 31281262
Alignment:
Q  214 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31281193 tgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatcctacgtc 31281262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 548 - 657
Target Start/End: Original strand, 14401713 - 14401824
Alignment:
Q  548 ctcttggtcaagtcatat--acaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaac 645  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||   ||| |||   ||| |||||||||    
T  14401713 ctcttggtcaagtcatatgtacaatcttcttgtcatcatcccttaatcttcctgcaagaatgtgccattctaaacttggcaccaattcatggttgtgaac 14401812  T
Q  646 tccattaagaat 657  Q
    ||||||||||||    
T  14401813 tccattaagaat 14401824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 45116362 - 45116258
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  45116362 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggaaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45116263  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  45116262 agaat 45116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 44320976 - 44320872
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  44320976 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgtttatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 44320877  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  44320876 agaat 44320872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17340127 - 17340021
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   | |  |||| ||| |||||||| |||||    
T  17340127 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatgacaacatctcatggttgtgaattccat 17340028  T
Q  651 taagaat 657  Q
    |||||||    
T  17340027 taagaat 17340021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 31280975 - 31281118
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||||| |||| | | |||||||||| |||||| |||| |  |||||||||| ||| |  ||||||||||||  ||    
T  31280975 agcatttccagagacaatacaactcatacaccatttataatcggtcataaacaagaacaatacataatcttttacaattgactgtaattaaatcaatctg 31281074  T
Q  102 acatctggttcaaa--ttacacaaacgtttgaaattcatcaaaa 143  Q
    |||| | ||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31281075 acatttcgttaaaattttacacgaatgtttgaaattcatcaaaa 31281118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 7172519 - 7172465
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaag 56  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  7172519 agcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaacttagtcataaacaag 7172465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 37016240 - 37015855
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  37016240 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 37016141  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37016140 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 37016041  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37016040 atcttgctcttggtcaagtcacgcacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccagctccatcgcatggttgt 37015941  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37015940 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 37015855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 46974490 - 46974105
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46974490 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatt 46974391  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  46974390 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctttaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 46974291  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46974290 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatgtaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgt 46974191  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  46974190 aaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaacacccacattttctt 46974105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 50116498 - 50116883
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  50116498 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 50116597  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50116598 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 50116697  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    ||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  50116698 atctaactcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggtagt 50116797  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50116798 gaactccattaagaatgttcaatctccattcctttatttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 50116883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 38691674 - 38692059
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||    
T  38691674 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggcttcttgtcatctctatt 38691773  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  38691774 tgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 38691873  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38691874 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggcaagaacgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgt 38691973  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38691974 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaacacccacattttctt 38692059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 342 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 51663584 - 51663211
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  51663584 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttattgtcacctctatt 51663485  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51663484 tgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 51663385  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  51663384 atcttgctcttggtcaagtcgcgtacaatcttcttgtcctcctcctttaatctaccagcaagaatgtgtcattctaaagccggcttcatcgcatggttgt 51663285  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcac 715  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51663284 gagctccattaagaatgttcaatccccattcttttgtttgcttactttgatattcactaatcatgaacaagcac 51663211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 41455154 - 41454778
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  41455154 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 41455055  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41455054 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 41454955  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  41454954 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 41454855  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  41454854 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 41454778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 13175107 - 13174722
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  13175107 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatt 13175008  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13175007 tgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttattggaagc 13174908  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13174907 atcttgctcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccagcgagaatgtgtcctcctaaagccggctccatcgcatggttgt 13174808  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13174807 gaactccattaagaatgttcaatccacattcctttgtttgcttactttgatatccattaatcatgaacaagcacccacattttctt 13174722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 29355432 - 29355808
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  29355432 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 29355531  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29355532 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 29355631  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  29355632 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 29355731  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  29355732 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 29355808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 12649314 - 12649697
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12649314 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 12649413  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12649414 tgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttatttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 12649513  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  12649514 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtgctc--ttaatttaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgt 12649611  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12649612 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatacccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 12649697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 13630733 - 13630357
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  13630733 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 13630634  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13630633 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 13630534  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13630533 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 13630434  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13630433 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 13630357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 38774859 - 38775235
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  38774859 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccatatttgccttcca 38774958  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38774959 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 38775058  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  38775059 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 38775158  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  38775159 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 38775235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 3947205 - 3947581
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  3947205 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 3947304  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3947305 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 3947404  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  3947405 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 3947504  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  3947505 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 3947581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 3984430 - 3984054
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  3984430 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 3984331  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3984330 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 3984231  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  3984230 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 3984131  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  3984130 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 3984054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 44466899 - 44466523
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  44466899 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 44466800  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44466799 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 44466700  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  44466699 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 44466600  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  44466599 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 44466523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20350773 - 20350397
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  20350773 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 20350674  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20350673 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 20350574  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20350573 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 20350474  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  20350473 taagaatgtttaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 20350397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 351 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5079252 - 5078895
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||  ||||| ||    
T  5079252 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatctgccttcca 5079153  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5079152 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtattaaaatatttcttggaagcatcttgctc 5079053  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  5079052 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 5078953  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaa 708  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5078952 taagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 5078895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 21943099 - 21943484
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||||    
T  21943099 cgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagtttcttgtcgcctctatt 21943198  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21943199 tgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagc 21943298  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  21943299 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtccttctaaacccggctccatcccatggttgt 21943398  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21943399 gaactccattgagaatgttcaatccccattcctttgtttgcctactttgatatccactaaccataaacaagcacccacattttctt 21943484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 409 - 727
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620223
Alignment:
Q  409 tagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttg 508  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgg 44620004  T
Q  509 ttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgt 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620005 ttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 44620104  T
Q  609 gtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaa 708  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44620105 gtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 44620204  T
Q  709 caagcacccacatattctt 727  Q
     ||||| || ||| |||||    
T  44620205 taagcaaccgcattttctt 44620223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 463 - 727
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980332
Alignment:
Q  463 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtca 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtca 7980167  T
Q  563 tatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttca 662  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7980168 cgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactgcattgcatggttgtgaactccattaagaatgttca 7980267  T
Q  663 atccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7980268 atccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaacacccacattttctt 7980332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 8459122 - 8459461
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  8459122 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 8459221  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgtt-gcaagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  8459222 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattaaattaaatccctac 8459321  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8459322 ttacattcaacgcaattacatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaa 8459421  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8459422 taagccaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 8459461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 9710745 - 9711081
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9710745 atttccaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactaggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgaca 9710844  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactta 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  9710845 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactta 9710944  T
Q  201 cattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataa 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9710945 cattcaacgcaattgcatatggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataa 9711044  T
Q  301 gtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9711045 gcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattc 9711081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37019301 - 37018965
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||    
T  37019301 attttcaaaggtaaaataattcatacaacattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccaaca 37019202  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactta 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37019201 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatctctactta 37019102  T
Q  201 cattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataa 300  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37019101 cattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaataa 37019002  T
Q  301 gtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37019001 gccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 37018965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 51666575 - 51666235
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  51666575 aagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaacc 51666476  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  51666475 gacatttggttcaaattacataaaagtttgaaattcatcaaaaagttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattatattaaatcccta 51666376  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||   |    
T  51666375 cttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcttta 51666276  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  51666275 ataagccaaggcatatagcttgtcgtgttccatgtgtattc 51666235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44469919 - 44469580
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  44469919 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 44469820  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44469819 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 44469720  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  44469719 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 44469620  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44469619 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 44469580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 7966147 - 7966492
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatctttt-acagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  7966147 agcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaatcaaacc 7966246  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa---------ttcacacatcattaaattaaa 190  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||||    
T  7966247 gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacatttacacatcattaaattaaa 7966346  T
Q  191 tccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccg 290  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||    
T  7966347 tccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcg 7966446  T
Q  291 tcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7966447 tcgcgaataag-caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 7966492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 50113472 - 50113825
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  50113472 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaacgttgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 50113571  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               |||||||||||||||||| |||   ||||| ||||    
T  50113572 acatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataacaaagtgtccataattaaacaactcattacacattatta 50113671  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  50113672 aattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtc 50113771  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113772 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 50113825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 29352398 - 29352737
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  |    
T  29352398 agcatttgcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccg 29352497  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29352498 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 29352597  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  29352598 ttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 29352697  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29352698 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 29352737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20353843 - 20353504
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  20353843 agcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagacaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 20353744  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattcac---acatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||    
T  20353743 acatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattatacatcattaaattaaatccctac 20353644  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  20353643 ttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 20353544  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20353543 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 20353504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25039987 - 25039650
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  25039987 catttccaaagacaatataacttgtacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactgat 25039888  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||||   |||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25039887 atttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 25039788  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  25039787 acattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaata 25039688  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25039687 agccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattc 25039650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30909937 - 30909598
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  || | || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  30909937 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaacataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 30909838  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  30909837 acgtttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactcattacacatcattaaattaaatccctac 30909738  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  30909737 ttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 30909638  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30909637 taagcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattc 30909598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13633778 - 13633441
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||  ||||    
T  13633778 atttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatttaaccgaca 13633679  T
Q  105 tct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    | | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13633678 ttttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcaataaattaaatccctactt 13633579  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   | |||||||||    
T  13633578 acattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaata 13633479  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13633478 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 13633441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 337
Target Start/End: Original strand, 38690117 - 38690412
Alignment:
Q  45 gtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac 144  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38690117 gtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccatagttaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaac 38690216  T
Q  145 gttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatata 240  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38690217 gttacaaagtgtccataattaaacaacacattacacatcattatattaaatcc-tacttacattcatcacaattgcatatggaacaaacatacatatata 38690315  T
Q  241 atatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38690316 atatattattttccaccatattttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 38690412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1655998 - 1655649
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  1655998 agcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacgg 1655899  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaatt 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||   |||||||  ||             ||||||||||||||    
T  1655898 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaatt 1655799  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1655798 aaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcta 1655699  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1655698 tcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattc 1655649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5082274 - 5081933
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcg--gtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaat 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||   | |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     
T  5082274 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactctcagacataataaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaac 5082175  T
Q  100 tgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccct 195  Q
     ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  | ||   ||||||||||||||||||||| |    
T  5082174 cgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaagtactccttacacatcattaaattaaatccat 5082075  T
Q  196 acttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcg 295  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  5082074 atttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcg 5081975  T
Q  296 aataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5081974 aataagcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtattc 5081933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 12643373 - 12643709
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  12643373 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 12643472  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattca---tcaaaacgttgcaagtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccct 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||  |||| |   || | |  |   |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  12643473 acatttggttaaaattaaacaaacgttt--aattaagtgtctataatt---aagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccct 12643567  T
Q  196 acttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcg 295  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  12643568 acttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcg 12643667  T
Q  296 aataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12643668 aataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 12643709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13178042 - 13177695
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||  |  || |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  13178042 agcatttccaaaggcaatataacttatatta--tttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 13177945  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaatt 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  ||             ||||| ||||||||    
T  13177944 acatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaaatt 13177845  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13177844 aaatccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcta 13177745  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13177744 tcgttgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattc 13177695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 19495204 - 19495544
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  19495204 agcatttccaaaggtaatataattcatacaacatttaaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 19495303  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac---gttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaa 184  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||  ||             |||||||||||    
T  19495304 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcattaa 19495403  T
Q  185 attaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcg 284  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19495404 attaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacgtcg 19495503  T
Q  285 ctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccatttt 325  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19495504 ctatcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgtttt 19495544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 3944172 - 3944479
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  3944172 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 3944271  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  3944272 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 3944371  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3944372 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 3944471  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  3944472 gcgtattc 3944479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 6558052 - 6558405
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  6558052 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 6558151  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa--------------acgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||              || || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||    
T  6558152 acatttggttaaaattaaacaaatgtttgaaattcatcaaattaaaccactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcatta 6558251  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6558252 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 6558351  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6558352 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 6558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3993718 - 3993411
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  3993718 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 3993619  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  3993618 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 3993519  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3993518 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 3993419  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  3993418 gcgtattc 3993411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 347 - 727
Target Start/End: Original strand, 26466010 - 26466390
Alignment:
Q  347 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcct 446  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||  | | ||   |||| | |  | ||    
T  26466010 gtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtatgact 26466109  T
Q  447 ttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatctt 546  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||    
T  26466110 tccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgttttttgttcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcacctt 26466209  T
Q  547 gctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaact 646  Q
      ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26466210 agtcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtcattctaaagccggctccatctcatggttgtgaact 26466309  T
Q  647 ccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||||| ||  |||||||  |||| |||| |||||    
T  26466310 ccattaagaatgtttaatctccaatcatttgtttgcctactaagatatccacgaacaatgaacatacacctacattttctt 26466390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 38771828 - 38772135
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  38771828 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcctttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 38771927  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  38771928 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 38772027  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38772028 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 38772127  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  38772128 gcgtattc 38772135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 36072529 - 36072881
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  36072529 catttccaaaggcaatataacttatacaacagttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgac 36072628  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaat-------------tcacacatcattaaattaa 189  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||              | |||||||||||||||||    
T  36072629 atttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattagatagtgtccatgattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaattaa 36072728  T
Q  190 atccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctacc 289  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  36072729 atctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatc 36072828  T
Q  290 gtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcttcgc 342  Q
     ||   ||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  36072829 atcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatcgc 36072881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5141775 - 5141439
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5141775 catttccaaaggcaatataactcatacaacatttatactcaggcataaacaagaaaattaca-tatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgac 5141677  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattcac---acatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    |   ||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||  ||    | ||| |||||||||||| |||||     
T  5141676 aaggggttcgaattactcgaatgtttgaaattcattaaaacgttaaatagtgtcaataattaaacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactg 5141577  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  5141576 acattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaata 5141477  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5141476 agccaacgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 5141439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Original strand, 33168082 - 33168417
Alignment:
Q  16 caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaa 115  Q
    |||||||| |||||||||||    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  33168082 caatataattcatacaacatctgtactcagtcataaacaaggaaaatatattatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgacatttagttcaaa 33168181  T
Q  116 ttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaattaaatccctacttac 201  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||             || |||||||||||||||||||||||||    
T  33168182 gtacacgaaagtttgaaaatcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttac 33168281  T
Q  202 attccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataag 301  Q
    | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||   ||||||    
T  33168282 actcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataag 33168381  T
Q  302 tcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33168382 tcaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattc 33168417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4518325 - 4518160
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  4518325 aagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc 4518226  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  4518225 gacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcagaacgttacaaaatgtccataattaa 4518160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46979166 - 46979002
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  46979166 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatagaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacag 46979067  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaa 165  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  46979066 acatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa 46979002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4518125 - 4517963
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  4518125 acacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatattccgaaacata 4518028  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||| ||||  |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4518027 aatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 4517963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 727
Target Start/End: Original strand, 16246622 - 16246871
Alignment:
Q  475 ttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttc 574  Q
    |||||| | |||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| | | |||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  16246622 ttgcttgatatttgttatgcaatcttgtctttttctcttcaaatttaacaaaatatt-cttggatgcaccttgcttttggt-aagtcacgtacaatcttc 16246719  T
Q  575 ttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcat 674  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16246720 ttgtcatcctcttttaatctaccggtaagcatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaacttcattaacaat-ttcaatctccattcat 16246818  T
Q  675 ttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||  ||   ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  16246819 ttgtttgcctacacagatattcactaaccatgaacatacacccacattttctt 16246871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 46978967 - 46978803
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||    
T  46978967 acacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcgaaacata 46978868  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  46978867 aatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattc 46978803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15051256 - 15051053
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  15051256 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 15051157  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15051156 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 15051057  T
Q  198 ttac 201  Q
    ||||    
T  15051056 ttac 15051053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 347 - 727
Target Start/End: Original strand, 32106383 - 32106760
Alignment:
Q  347 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcct 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |  | ||||| ||||| | || | ||    
T  32106383 gtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatgcatcatcgtcttgtcacctctgttcgact 32106482  T
Q  447 ttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatctt 546  Q
    | |||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| || |||  ||||| ||  ||| | |      
T  32106483 tccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaac-tattttttcaaagcaccaa 32106581  T
Q  547 gctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaact 646  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||| |||  |||||||||    
T  32106582 actcttggtcaagtcacatacaagctttttgtcattctcctttaatctaccagcaatcatgtgtccttctaaacttggctccatctcatgattgtgaact 32106681  T
Q  647 ccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |  |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |   ||  ||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||    
T  32106682 c--ttaagaatattcaatctccaatcatttgtttaccttctaagatatccacgaaccatgaacattcacccacattttctt 32106760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22345952 - 22345818
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  22345952 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcgg-----accaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataagtaaatcaaaccg 22345858  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22345857 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 22345818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 94562 - 94705
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  94562 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 94661  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  94662 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 94705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 16281861 - 16282004
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  16281861 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccg 16281960  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16281961 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 16282004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 19521761 - 19521900
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  19521761 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacagcattgaaactcggacataaacaagaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcg 19521860  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521861 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaa 19521900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21144530 - 21144396
Alignment:
Q  11 aaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21144530 aaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggt 21144431  T
Q  111 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21144430 tcaaattacacaaacgtttgaaattcgtcataacg 21144396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46886288 - 46886137
Alignment:
Q  10 caaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctgg 109  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||    
T  46886288 caaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgg 46886189  T
Q  110 ttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccata 160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  46886188 ttaaaattacacaaacgtttgaaattcatcgaaacattacaaagtgtccata 46886137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 31780155 - 31780275
Alignment:
Q  25 tcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  31780155 tcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaa 31780254  T
Q  125 cgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31780255 cgtttgaaattcatcataacg 31780275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52805465 - 52805325
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||    
T  52805465 atttccaaaggcaaaataattcatataacattgaaactctgacataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgaca 52805366  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52805365 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 52805325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22527603 - 22527460
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  22527603 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 22527504  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22527503 acatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 22527460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 470978 - 470835
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |    
T  470978 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttaccattgttcataatttaatcaaaccg 470879  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  470878 acatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatcataacg 470835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 421
Target Start/End: Original strand, 19498199 - 19498277
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498199 gattgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 50617369 - 50617503
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaat-ataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattga 102  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||  ||    
T  50617369 cattttgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactctgacataaacaaaaaaaaacacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccga 50617468  T
Q  103 catctggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 137  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50617469 catttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 50617503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 36360466 - 36360570
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  36360466 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccgacaagaatgtgtcctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 36360565  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  36360566 agaat 36360570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 657
Target Start/End: Original strand, 18887570 - 18887673
Alignment:
Q  554 gtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaa 653  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18887570 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccattaa 18887669  T
Q  654 gaat 657  Q
    ||||    
T  18887670 gaat 18887673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 7403733 - 7403629
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  7403733 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 7403634  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  7403633 agaat 7403629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25231419 - 25231290
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| | || ||  ||||||||||||||    
T  25231419 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttggtatcctcccttgatctacctgcaagcatgtgtccttccaaacttggcttcgtctcacggttgtgaactccat 25231320  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgttt 680  Q
    | | ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  25231319 tgaaaatattcaatctccagtcatttgttt 25231290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 45472467 - 45472363
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  45472467 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccacaccatctcatggttgtgaacgccatta 45472368  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  45472367 agaat 45472363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 25593878 - 25593679
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtca 557  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||| | | | ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||   || |   || |||||||    
T  25593878 tgacgttcattgtagacttgtttgatatttgtcatggactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggttttaccgaactattggtca 25593779  T
Q  558 agtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaat 657  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  ||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  25593778 agtcacatacaatcgccttgtcgtcctccattaatattcccgcaagaaggtgccctgctaaatatggcaacatcttatggttgtgaacaccattaagaat 25593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 29261528 - 29261601
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatctttt 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  29261528 aagcattttcaaaggtaatataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttt 29261601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28863005 - 28862901
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28863005 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtccttcattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 28862906  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  28862905 agaat 28862901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25231626 - 25231551
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 419  Q
    ||||||||||||||||||| || | | | | |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25231626 attgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattagatactgca 25231551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 548 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 39914057 - 39914011
Alignment:
Q  548 ctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatct 594  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39914057 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttcattaatct 39914011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47714969 - 47714900
Alignment:
Q  28 tacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaa 97  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  47714969 tacaacatttatactcagtcataaacaacaaaaatacattatcttttatagctgtccataattgaatcaa 47714900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 342 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14399881 - 14399495
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14399881 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 14399782  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14399781 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 14399682  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14399681 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatggcatggttgt 14399582  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattcttc 728  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14399581 gaactccatttagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaacacccacattttcttc 14399495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 77755 - 78140
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  77755 cgatggtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 77854  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  77855 tgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 77954  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  77955 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcaataatgtgtccttctaaagccggctccatcaaatggttgt 78054  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  78055 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcactcacattttctt 78140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 36816251 - 36816636
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  36816251 cgattgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatt 36816350  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36816351 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 36816450  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  36816451 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgt 36816550  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36816551 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcaaccacattttctt 36816636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 7841751 - 7842135
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  7841751 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 7841849  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7841850 tgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 7841949  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7841950 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacaggcaagaatgtgtccttctaaagccggcttcatcgcatggttgt 7842049  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7842050 gaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 7842135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 6504690 - 6505075
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  6504690 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggcttcttgtcacctctatg 6504789  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6504790 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaac 6504889  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6504890 atcttgttcttggtcaagtcatgtacaatcttcttttcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatcgcatggttgt 6504989  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6504990 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 6505075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7838922 - 7838537
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7838922 cgattgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttcttgccacctctatt 7838823  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7838822 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 7838723  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7838722 atattgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 7838623  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7838622 gaactccactaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 7838537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 46991981 - 46992366
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  46991981 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 46992080  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46992081 tgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaatgtatcaaaaaatttcttggaagc 46992180  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46992181 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 46992280  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46992281 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 46992366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 48249602 - 48249987
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  48249602 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 48249701  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48249702 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 48249801  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  48249802 atcttgctcttggtcaagtcacgtacagtcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttataaagccggctccatcgcatggttgt 48249901  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48249902 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 48249987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 21954974 - 21955358
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  21954974 cgattgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggcttcttgtcacctctatt 21955072  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21955073 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 21955172  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21955173 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaataatgtgtccttctagagccggctccatcgcatggttgt 21955272  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21955273 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttacttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 21955358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 13746465 - 13746841
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  13746465 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 13746564  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13746565 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 13746664  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13746665 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 13746764  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13746765 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 13746841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 9428577 - 9428953
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  9428577 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 9428676  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9428677 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 9428776  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  9428777 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 9428876  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  9428877 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 9428953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6742204 - 6741828
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  6742204 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 6742105  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6742104 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 6742005  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  6742004 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 6741905  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  6741904 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 6741828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 16445937 - 16445561
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  16445937 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 16445838  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16445837 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 16445738  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16445737 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 16445638  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16445637 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 16445561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 3950060 - 3949684
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  3950060 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 3949961  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3949960 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 3949861  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  3949860 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 3949761  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  3949760 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 3949684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 8159727 - 8160103
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  8159727 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 8159826  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8159827 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 8159926  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  8159927 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 8160026  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  8160027 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 8160103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 30946386 - 30946762
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  30946386 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 30946485  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30946486 tatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 30946585  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  30946586 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 30946685  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  30946686 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 30946762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930309
Alignment:
Q  456 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggt 555  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggt 29930481  T
Q  556 caagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaaga 655  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29930480 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaaga 29930381  T
Q  656 atgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29930380 atgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 29930309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 456 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979463
Alignment:
Q  456 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggt 555  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggt 29979635  T
Q  556 caagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaaga 655  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29979634 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaaga 29979535  T
Q  656 atgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29979534 atgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 29979463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 21951964 - 21952303
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  21951964 agcatttccaaatgcaatataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 21952063  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||     
T  21952064 acatttgattaaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccatgattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctag 21952163  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21952164 ttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccatattccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaa 21952263  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21952264 taagccaaggcacatagcttgccgttttccatgcgtattc 21952303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 6489493 - 6489847
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  6489493 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 6489592  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa----------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatt 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||                |||||||||||||||||| |||   |||||||||    
T  6489593 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcattgaaacgttacaaaagtgtccatacttaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatt 6489692  T
Q  183 aaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgt 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  6489693 aaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaatataaatccgacga 6489792  T
Q  283 cgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6489793 cgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 6489847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 9426770 - 9427109
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  9426770 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 9426869  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  9426870 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 9426969  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  9426970 ttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 9427069  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9427070 taagcaaaggcatatagtttgccgttttccatgcgtattc 9427109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 48246576 - 48246915
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  48246576 agcattttcaaaggcaaaataattcataaaacattgaaactcagacataagcaatataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 48246675  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  48246676 acatttggttaaaattacacaaacttttgaaattcatcaaaaaattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 48246775  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||    
T  48246776 ttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaa 48246875  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48246876 taagccaaagcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 48246915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 46989680 - 46990030
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||    
T  46989680 attttcaaaggcaaaataattcatacaaatgtgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccgaca 46989779  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaat 186  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||               |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  46989780 tttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaat 46989879  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgct 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||      
T  46989880 taaatccctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgtc 46989979  T
Q  287 accgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46989980 atcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 46990030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 13743432 - 13743770
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  13743432 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 13743531  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  13743532 acatttggtt-aaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 13743630  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  13743631 ttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 13743730  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13743731 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 13743770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6745234 - 6744895
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  6745234 agcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 6745135  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  6745134 acatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 6745035  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||   |||||||||    
T  6745034 ttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaa 6744935  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6744934 taagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattc 6744895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4002413 - 4002060
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  4002413 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 4002314  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||               ||||||||||||||| || |||   ||||||||||    
T  4002313 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataactaagtgtccataattaaataactcattacacatcatta 4002214  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  4002213 aattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtc 4002114  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4002113 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 4002060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2857890 - 2857551
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  2857890 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaacttggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 2857791  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  2857790 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcttaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 2857691  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  2857690 ttacattcaacgcaattacatatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 2857591  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2857590 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 2857551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 30943388 - 30943695
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  30943388 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 30943487  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  30943488 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 30943587  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30943588 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 30943687  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  30943688 gcgtattc 30943695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 8156706 - 8157013
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  8156706 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 8156805  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  8156806 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 8156905  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8156906 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 8157005  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  8157006 gcgtattc 8157013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3953090 - 3952783
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| | | ||||||||||    
T  3953090 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaa 3952991  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  3952990 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 3952891  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3952890 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 3952791  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  3952790 gcgtattc 3952783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50957601 - 50957248
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  50957601 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacag 50957502  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa--------------acgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||              || || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||    
T  50957501 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattccaaagtgtccataattaaactactcattacacatcatta 50957402  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  50957401 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacaaaaatccgacgtc 50957302  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50957301 gccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattc 50957248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 67046 - 67387
Alignment:
Q  10 caaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctgg 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  | |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  67046 caaatgcaatataattcatacaacatttaaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgg 67145  T
Q  110 ttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaattaaatccct 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||             ||||||||||||| ||||||||    
T  67146 ttcaaactacacaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatgaaatccct 67245  T
Q  196 acttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcg 295  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||       
T  67246 acttacattcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctattgtcttt 67345  T
Q  296 aataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  67346 aataagccaagacatatagcttgccgtttttcatgcgtattc 67387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 36813002 - 36813355
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  36813002 agcatttccaaaggcaaaataatccatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccg 36813101  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag---------------tgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||                ||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  36813102 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtttccataattaattgtccataattaaacaactcattacacatcatta 36813201  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36813202 aattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 36813301  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  36813302 gccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccacacgtattc 36813355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 565 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 50954376 - 50954214
Alignment:
Q  565 tacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaat 664  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50954376 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 50954277  T
Q  665 ccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  50954276 ccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 50954214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Original strand, 2743795 - 2743959
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2743795 acacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacata 2743894  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2743895 aatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 2743959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14402764 - 14402574
Alignment:
Q  150 aagtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14402764 aagtgtccataattaaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatat 14402665  T
Q  247 tatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14402664 tattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 14402574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 205
Target Start/End: Original strand, 7841260 - 7841467
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||  |    
T  7841260 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaattaaaccg 7841359  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7841360 acatttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctac 7841459  T
Q  198 ttacattc 205  Q
    ||||||||    
T  7841460 ttacattc 7841467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 600452 - 600309
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  600452 agcatttttaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 600353  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  600352 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 50213622 - 50213765
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  50213622 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 50213721  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50213722 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 50213765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36134191 - 36134048
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  36134191 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 36134092  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36134091 acatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 36134048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 342 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29908144 - 29908027
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29908144 cgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctc-tctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatt 29908046  T
Q  442 agcctttcatatttgttga 460  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  29908045 tgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 342 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29949310 - 29949193
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29949310 cgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctc-tctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatt 29949212  T
Q  442 agcctttcatatttgttga 460  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  29949211 tgccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 342 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29998464 - 29998347
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29998464 cgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctc-tctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatt 29998366  T
Q  442 agcctttcatatttgttga 460  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  29998365 tgccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42166320 - 42166177
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  42166320 agcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 42166221  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  42166220 acatttggttcaaattacactaatgtttgaaatttatcataacg 42166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 47070633 - 47070776
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  47070633 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttccaattgtccataattaaatcaaaccg 47070732  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47070733 acgtttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 47070776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 2271519 - 2271663
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaaga-aaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    |||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  2271519 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggacataaacaagataaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc 2271618  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  2271619 gacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcatcataacg 2271663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16647081 - 16646939
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |    
T  16647081 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaa-aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatcaaaccg 16646983  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16646982 acatttggtttaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 16646939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9473848 - 9473721
Alignment:
Q  11 aaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggt 110  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  9473848 aaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatcaaaccgacatttggt 9473749  T
Q  111 tcaaattacacaaacgtttgaaattcat 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9473748 tcaagttacacaaacgtttgaaattcat 9473721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 52387987 - 52388097
Alignment:
Q  25 tcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  52387987 tcatacaacattgaaactcggacataaacaatataaatacaatatcttttacaattgaccataattaaatcaaaccgacattttgttcaaattacacaaa 52388086  T
Q  125 cgtttgaaatt 135  Q
    |||||||||||    
T  52388087 cgtttgaaatt 52388097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33399702 - 33399476
Alignment:
Q  501 gtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggc 600  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| | |   |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33399702 gtcttttggtcttcaaatttaacaaaatattttttggaagcaccaaactcttggtcaagtcacgtacaagcttcttgccatcctcctttaatctacccgc 33399603  T
Q  601 aagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccacta 700  Q
    ||| ||||||| |||||||    | | |||| | | ||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||| ||||  |||  ||||||||| |    
T  33399602 aagcatgtgtctttctaaacttcgttacatctcttggttgtgaactccattaagaatatttaatctcgaatcatttgcttgcctactaagatatccacga 33399503  T
Q  701 atcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    | ||||||||  |||| |||| |||||    
T  33399502 accatgaacatacacctacattttctt 33399476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14402905 - 14402813
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaat 94  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14402905 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat 14402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 2285003 - 2285107
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  2285003 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 2285102  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  2285103 agaat 2285107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8263841 - 8263742
Alignment:
Q  565 tacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaat 664  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8263841 tacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaatggtcaat 8263742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 458 - 594
Target Start/End: Original strand, 1275240 - 1275376
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtca 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||| | | | ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||    |||   || |||||||    
T  1275240 tgacgttcattgtagacttgcttgatatttttcatggactcttgtctttttttctttaaatttgtcaaaatattttttggtttcatcgaactattggtca 1275339  T
Q  558 agtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatct 594  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1275340 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 1275376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 9556727 - 9556831
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  9556727 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgccctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 9556826  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  9556827 agaat 9556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 51548479 - 51548583
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| || |||    
T  51548479 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgtcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccgtta 51548578  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  51548579 agaat 51548583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 4510486 - 4510287
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtca 557  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||  | | | ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    | |   || |||||||    
T  4510486 tgacgttcattgtagacttacttgatatttgtcatagactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccgaactattggtca 4510387  T
Q  558 agtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaat 657  Q
    |||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||    
T  4510386 agtcatgtataattttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaaaacggcaccatctcgtggttgtgaacaccataaagaat 4510287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 142
Target Start/End: Original strand, 2743678 - 2743746
Alignment:
Q  74 tacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa 142  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2743678 tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 2743746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 4120740 - 4120843
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4120740 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccgtcaag-aggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4120838  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  4120839 agaat 4120843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 32426726 - 32426622
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  32426726 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctgcataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 32426627  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  32426626 agaat 32426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 40468155 - 40468259
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  40468155 ggtcaagtaatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtaccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 40468254  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  40468255 agaat 40468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 12491204 - 12491150
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaa 605  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  12491204 ttggtcaagtcgtgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 12491150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 727
Target Start/End: Original strand, 11389065 - 11389105
Alignment:
Q  687 tttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11389065 tttgatatccactaatcatgaacaagcacccgcattttctt 11389105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 2743562 - 2743611
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataa 51  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  2743562 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataa 2743611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 17395 - 17010
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17395 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctatt 17296  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17295 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 17196  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17195 atcttgctcttggtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 17096  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17095 gaactccattaagaatgttcaatccctattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 17010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20019 - 19743
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  20019 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 19920  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |               |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  19919 acatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtggccgtaattaagtgttcataattaaacaactcattgcacatcatta 19820  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccata 260  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19819 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatcttccaccata 19743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19503
Alignment:
Q  258 atattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19582 atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 19503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 7799741 - 7800126
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  7799741 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 7799840  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7799841 ttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 7799940  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7799941 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 7800040  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7800041 gaactccattaagaatgttcaattcccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 7800126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 342 - 721
Target Start/End: Original strand, 18537071 - 18537450
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  18537071 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 18537170  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18537171 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 18537270  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  18537271 atctcactcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagctggctcaatcgcatggttgt 18537370  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537371 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgttttcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 18537450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 4202674 - 4203059
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4202674 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 4202773  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4202774 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatattacttggaagc 4202873  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4202874 atcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagagtgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 4202973  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4202974 gaactccattaagaatgttcaatcatctttcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 4203059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34079104 - 34078721
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  34079104 attgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 34079005  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtat 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34079004 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcat 34078905  T
Q  544 cttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtga 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||    
T  34078904 cttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttttga 34078805  T
Q  644 actccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34078804 actccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 34078721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 25895832 - 25896221
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttc----gagattagatattgcaacgacttcttgccacctt 437  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     || |||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  25895832 cgattgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgcaacggcttcttgtcacctc 25895931  T
Q  438 tattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgg 537  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25895932 tatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttgg 25896031  T
Q  538 aagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattg 637  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  25896032 aagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatgg 25896131  T
Q  638 ttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25896132 ttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 25896221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Original strand, 27866582 - 27866965
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||||      
T  27866582 attgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaaggtttcttgtcacctctatttt 27866681  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtat 543  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27866682 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcat 27866781  T
Q  544 cttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtga 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  27866782 cttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtga 27866881  T
Q  644 actccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27866882 actccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 27866965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 351 - 714
Target Start/End: Original strand, 37819621 - 37819984
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  37819621 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 37819720  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37819721 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 37819820  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  37819821 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaacaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 37819920  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagca 714  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37819921 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagca 37819984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 11032196 - 11032572
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  11032196 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttcca 11032295  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11032296 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctt 11032395  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  11032396 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 11032495  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  11032496 taagaatgttcaatccccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 11032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 38858934 - 38859310
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  38858934 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 38859033  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  38859034 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgttt 38859133  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  38859134 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 38859233  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  38859234 taagaatgttcaatctccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 38859310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 714
Target Start/End: Original strand, 28885152 - 28885515
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  28885152 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 28885251  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28885252 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 28885351  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28885352 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatctatccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 28885451  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagca 714  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28885452 taagaatgttcaatccccattcctttgttttcttactttgatatccactaatcatgaataagca 28885515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 351 - 700
Target Start/End: Original strand, 7020624 - 7020973
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  7020624 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 7020723  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7020724 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttcctc 7020823  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  7020824 ttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 7020923  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccacta 700  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7020924 taagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccacta 7020973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Original strand, 13566828 - 13567222
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  13566828 attgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 13566927  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttc-----------ttcaaatgtatcaaaatattt 532  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||    
T  13566928 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcacacttgcttcttcaaatgtatcaaaatattt 13567027  T
Q  533 cttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcg 632  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13567028 cttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtccttctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagctggctccatgg 13567127  T
Q  633 cattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13567128 gatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttacgttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 13567222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 7796742 - 7797081
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |    
T  7796742 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggttataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccg 7796841  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7796842 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 7796941  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7796942 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaa 7797041  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7797042 taagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 7797081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 342 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1036677 - 1036424
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1036677 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 1036578  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1036577 ttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 1036478  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatcta 595  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1036477 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatcta 1036424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 13563806 - 13564145
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  13563806 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 13563905  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  13563906 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 13564005  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||    
T  13564006 ttacattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaa 13564105  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13564106 taagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 13564145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 27863570 - 27863907
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||    
T  27863570 catttccaaaggcaaaataattcacacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgac 27863669  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27863670 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 27863769  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27863770 acattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaata 27863869  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27863870 agcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattc 27863907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33995055 - 33994718
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  33995055 catttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac 33994956  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||   |||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  33994955 atttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctactt 33994856  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33994855 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaata 33994756  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  33994755 agccaaggcatatagtttgccgttgtccatgcgtattc 33994718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 34122689 - 34123042
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  34122689 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 34122788  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag---------------tgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||               ||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  34122789 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaaggttacaaggtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 34122888  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34122889 aattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtc 34122988  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  34122989 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtattc 34123042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 25890159 - 25890498
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  25890159 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttatacaattgttcataattaaattaaaccg 25890258  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  25890259 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 25890358  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  25890359 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaa 25890458  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  25890459 taagcaaaggcatatcgcttgctgttttccacgcgtattc 25890498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 37814747 - 37815086
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  37814747 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 37814846  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37814847 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 37814946  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||| |||    
T  37814947 ttactttcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaa 37815046  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37815047 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 37815086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 337
Target Start/End: Original strand, 28882177 - 28882492
Alignment:
Q  26 catacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaac 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||    
T  28882177 catacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttcgttaaaattaaacaaac 28882276  T
Q  126 gtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatg 221  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  28882277 gtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgcaattgcatatg 28882376  T
Q  222 gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgcca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||  || ||||||||||||||     
T  28882377 gaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcatatagcttgccg 28882476  T
Q  322 ttttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  28882477 ttttccatgcgtattc 28882492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 516 - 727
Target Start/End: Original strand, 1035459 - 1035670
Alignment:
Q  516 aatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035459 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 1035558  T
Q  616 taaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcac 715  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035559 taaagccggctccatggcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcac 1035658  T
Q  716 ccacatattctt 727  Q
    |||||| |||||    
T  1035659 ccacattttctt 1035670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 347 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 20286330 - 20285967
Alignment:
Q  347 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcct 446  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |    ||||| ||||| | || | ||    
T  20286330 gtagtactttcattttgtgttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgact 20286231  T
Q  447 ttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatctt 546  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||    
T  20286230 tccatatttgttgatgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcacctt 20286131  T
Q  547 gctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaact 646  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20286130 actcttggttaagtcacatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggctccatcacatggttgtgaact 20286031  T
Q  647 ccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaaca 710  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||||||||    
T  20286030 ccattaagaatgttcagtttccattcatttgtttgcctactaagatatccacttaccatgaaca 20285967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 38855882 - 38856219
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||  ||||    
T  38855882 atttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcgtaattaaattaaaccgaca 38855981  T
Q  105 tct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    | | |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  38855982 ttttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattcaatccctactt 38856081  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  38856082 acattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 38856181  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38856182 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 38856219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 11029176 - 11029511
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||    
T  11029176 atttccaaaggctaaataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgaca 11029275  T
Q  105 -tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaagtgtccataattaaacaa---ttcacacatcattaaattaaatccctactta 200  Q
     | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029276 ttttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaa-agtccataattaaactactcatcacacatcattaaattaaatccctactta 11029374  T
Q  201 cattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataa 300  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11029375 cattcaacgcaattacatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataa 11029474  T
Q  301 gtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11029475 gcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 11029511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 24053318 - 24053667
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |    
T  24053318 agcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattacatcaaaccg 24053417  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa-------------ttcacacatcattaaatt 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||              | |||||||||||||||    
T  24053418 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaaatt 24053517  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    | ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24053518 atatccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgcta 24053617  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||||   |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24053618 tcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 24053667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34080039 - 34079753
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  34080039 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 34079940  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||    
T  34079939 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccttac 34079840  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcg 284  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34079839 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgccgtcg 34079753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 7017676 - 7018002
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  7017676 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 7017775  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7017776 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 7017875  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||   |||||||||    
T  7017876 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattct-------------gacgtcgccgtcgtcgcgaa 7017962  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7017963 taagcaaaggcatatagcttgccattttccatgtgtattc 7018002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Original strand, 24050199 - 24050542
Alignment:
Q  10 caaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctgg 109  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24050199 caaaggaaatataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgg 24050298  T
Q  110 ttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaattaaatccct 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||             ||||||||||||||| ||||||    
T  24050299 ttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattatatccct 24050398  T
Q  196 acttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcg 293  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  24050399 acttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtct 24050498  T
Q  294 cgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
      |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24050499 tcaattcgccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 24050542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 25877785 - 25878089
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |    
T  25877785 agcattttcaaaagcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat--aaccg 25877882  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattc---acacatcatta 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||| ||   |||| | ||||    
T  25877883 acatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacgtgatta 25877982  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
     ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25877983 tattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 25878080  T
Q  284 gctaccgtc 292  Q
    |||| ||||    
T  25878081 gctatcgtc 25878089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1039713 - 1039361
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  1039713 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacacgataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 1039614  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||               ||||| |||||| ||||| |||   || |||||||    
T  1039613 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtctataattaagtgtcaataatttaacaactcattacatatcatta 1039514  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  1039513 aattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatattc-caaacataaatccgatgtc 1039415  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1039414 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 1039361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14280764 - 14280547
Alignment:
Q  124 acgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcata 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  14280764 acgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata 14280665  T
Q  220 tggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14280664 tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc 14280565  T
Q  320 cattttccatgcgtattc 337  Q
    | ||||||||||||||||    
T  14280564 cgttttccatgcgtattc 14280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Original strand, 4196792 - 4197018
Alignment:
Q  113 aaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccac 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   || || |||| |||||||||||||||||||||  |    
T  4196792 aaattacacaaacgtttggtattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatc 4196891  T
Q  209 acaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggc 308  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||   |||||| ||||||    
T  4196892 acaattgcatatggaacgaa--tacatatataatatattattttcgaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggc 4196989  T
Q  309 atatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || ||||||| | |||||||||| |||||    
T  4196990 atgtagcttgtcgttttccatgcatattc 4197018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 30352592 - 30352934
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||       
T  30352592 agcatttccaaatgcaatataagccatacaacatttaaactcagtcataa--aagaaaaatacaatatctttt-----tgtccataattaaatcaaacca 30352684  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaaca----at---------tcacacatcattaaatt 187  Q
     ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||         | ||| |||| ||||||    
T  30352685 gcatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaatt 30352784  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  30352785 aaatctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgcta 30352884  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||||   || ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  30352885 tcgtctttaacaagccaaggcatataacttgccgtttttcatgcatattc 30352934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 527 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20286650 - 20286449
Alignment:
Q  527 atatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggct 626  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20286650 atatttcttggatgcaccttactcttggtcaagtcatgtacaatctttttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggct 20286551  T
Q  627 ccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccac-taatcatgaacaagcacccacatattc 725  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||    
T  20286550 ccatcacatggttgtaaactccattaagaatgttcaggttccattcatttgtttgcctactaagatatccacttacccatgaacatacacccacattttc 20286451  T
Q  726 tt 727  Q
    ||    
T  20286450 tt 20286449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387825
Alignment:
Q  182 taaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacg 281  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  28387979 taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg 28387880  T
Q  282 tcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| ||||| ||||||   |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||    
T  28387879 tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattc 28387825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 604 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 33994315 - 33994192
Alignment:
Q  604 aatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatc 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33994315 aatgtgtccttctaaagccggctccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcgttcctttgtttgcttactttgatatccactaatc 33994216  T
Q  704 atgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  33994215 atgaacaagcacccatattttctt 33994192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179438
Alignment:
Q  212 attgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcata 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43179559 attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata 43179460  T
Q  312 tagcttgccattttccatgcgt 333  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  43179459 tagcttaccgttttccatgcgt 43179438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7762152 - 7762008
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  7762152 aagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc 7762053  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7762052 gacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 7762008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 38407320 - 38407454
Alignment:
Q  11 aaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  38407320 aaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatcaaaccggcatttggt 38407419  T
Q  111 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38407420 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 38407454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Original strand, 6267639 - 6267925
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||  | || ||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |    
T  6267639 agcatttccaaaggcaatactagtcgtacaacatttatcctcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaccgttatccataattaaatcaatccg 6267738  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| |  || ||||| ||  || ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||  ||   || |||||||||||||||| ||||    
T  6267739 acatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacatatcattaaattaaatctctac 6267838  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgc 285  Q
    | |||||| || || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  6267839 tgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg-aacataaattcgacgtcgc 6267925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41799676 - 41799534
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  41799676 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacttggacataaacaagaaaaatacaattt-ttttacaattgtccataattaaattaaaccg 41799578  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41799577 acatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 41799534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43179808 - 43179640
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||        
T  43179808 agcattttcaaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcggtcaaaaacaagaaaaatatattatcttttacacttgtccataattaatacaatcca 43179709  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa 169  Q
    |||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  43179708 acatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaa 43179640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 551 - 683
Target Start/End: Original strand, 13157978 - 13158110
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13157978 ttggtgaagtcacatacaagtttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgcgtccttttaaatttgactccatttcatggttgtgaactccat 13158077  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgct 683  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13158078 taagaatgttcaatctccaatcatttgtttgct 13158110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 680
Target Start/End: Original strand, 23028403 - 23028640
Alignment:
Q  450 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgct 549  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | |  ||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||| |||   ||    
T  23028403 atatttttttacgttcattgtatacttgcatgatatttgtcatgcactcttttctttttctcttcaaatttaataaaatattttttgaaagcatcaaact 23028502  T
Q  550 cttggtcaagtca-------tatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    |||||||||||||       | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||   | || |||| ||| ||||||    
T  23028503 cttggtcaagtcaccaatcatgtacaatcttcttgtcatcctcccttaatctacccgcaagcatgtgttcttctaaacttgccttcatctcatggttgtg 23028602  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgttt 680  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23028603 aactccattaataatattcaatctccaatcatttgttt 23028640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 652 - 727
Target Start/End: Original strand, 31097980 - 31098055
Alignment:
Q  652 aagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31097980 aagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 31098055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 367 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 20287569 - 20287404
Alignment:
Q  367 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttcatatttgttgacgttca 466  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||  | ||||| ||||| | || | ||||||||||| ||||||||||    
T  20287569 tcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaaccccgtcttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttca 20287470  T
Q  467 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatattt 532  Q
    || || |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20287469 ttatatacttgcttgatatttgtcatacaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaaaatattt 20287404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28388427 - 28388307
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  28388427 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccg 28388328  T
Q  102 acatctggttcaaattacaca 122  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28388327 acatttggttcaaattacaca 28388307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 4196719 - 4196778
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaa 61  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4196719 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaa 4196778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 551 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 25048515 - 25048408
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtg-tccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactcca 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||  ||  |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  25048515 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataagttgccccttctaaatatggcaccatcgcattgttctgaacacca 25048416  T
Q  650 ttaagaat 657  Q
    ||||||||    
T  25048415 ttaagaat 25048408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 6552904 - 6552800
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  6552904 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacacaccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 6552805  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  6552804 agaat 6552800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 42343606 - 42343502
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  42343606 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttatgaacaccatta 42343507  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  42343506 agaat 42343502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 43295336 - 43295232
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43295336 ggtcaaatcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtggcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 43295237  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  43295236 agaat 43295232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 27013615 - 27013719
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  27013615 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaatgccatta 27013714  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  27013715 agaat 27013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 11819329 - 11819279
Alignment:
Q  555 tcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaa 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11819329 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 11819279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 41007715 - 41008100
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  41007715 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 41007814  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41007815 tgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 41007914  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41007915 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctacatcgcatggttgt 41008014  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41008015 gaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 41008100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 343 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 436636 - 436252
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatta 442  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||     
T  436636 gattgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 436537  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  436536 gccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 436437  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  436436 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 436337  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  436336 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgataaccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 436252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 43949017 - 43949402
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  43949017 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggcttcttgtcacctatatt 43949116  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43949117 tgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 43949216  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43949217 atcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccttcgcatggttgt 43949316  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43949317 gaactccattaataatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 43949402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 24750975 - 24750599
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  24750975 tactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttcca 24750876  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24750875 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 24750776  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  24750775 tcggtcaattcatgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaatccggctccatgggatggttgtgaactccat 24750676  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24750675 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 24750599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 12907227 - 12907612
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  12907227 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggcttcttgtcacctctatt 12907326  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12907327 tgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcagaatatttcttggaagc 12907426  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12907427 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgt 12907526  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12907527 gaactccattaagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 12907612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 343 - 727
Target Start/End: Original strand, 24604825 - 24605209
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||     
T  24604825 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 24604924  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24604925 gtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 24605024  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24605025 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaattttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtacttctaaagccggctccatcgcatggttgtg 24605124  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24605125 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 24605209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 28354637 - 28355022
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28354637 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatt 28354736  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28354737 tgacttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtcttttattcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 28354836  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  28354837 atcttgctcatggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccagcaagaatgtgtcattctaaagcaggctccatcgcatggttat 28354936  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28354937 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 28355022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Original strand, 11692552 - 11692934
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||| |    
T  11692552 attgtagtaatttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctatttg 11692651  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtat 543  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11692652 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgt-cttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcat 11692750  T
Q  544 cttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtga 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  11692751 cttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctcgatcacatggttgtga 11692850  T
Q  644 actccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11692851 actccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 11692934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 27275104 - 27275480
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  27275104 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 27275203  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27275204 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 27275303  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  27275304 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 27275403  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27275404 taagaatgttcaatccccattcccttgtttgcttactttgatatccattaatcatgaacaagcacccacattttctt 27275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 212185 - 212561
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  212185 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 212284  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  212285 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 212384  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  212385 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 212484  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  212485 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 212561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 3802310 - 3802686
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  3802310 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 3802409  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3802410 tatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttattggaagcatcttgctc 3802509  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  3802510 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 3802609  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  3802610 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccaataatcatgaataagcaaccacattttctt 3802686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 10623198 - 10623574
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  10623198 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 10623297  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10623298 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 10623397  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  10623398 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 10623497  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  10623498 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 10623574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 34920517 - 34920892
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34920517 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 34920616  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34920617 tgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 34920716  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||          ||||||    
T  34920717 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggtaagaatgtgtccttctaaagccggc----------tgttgt 34920806  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34920807 gaactccattaagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 34920892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 361 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 39795277 - 39794911
Alignment:
Q  361 ttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttcatatttgttga 460  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  39795277 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 39795178  T
Q  461 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39795177 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctttttgtcaagt 39795078  T
Q  561 catatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgtt 660  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  39795077 cacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgcccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgtt 39794978  T
Q  661 caatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  39794977 caatccccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 39794911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 45476683 - 45476305
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  45476683 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 45476584  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  45476583 tgccttccatatt-gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttcttcaaacgtatcaaaatatttcttgtaagc 45476485  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  45476484 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggatccatcgcatggttat 45476385  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||     || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45476384 gaactc-----ag-atgttcaatcaccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagaacccacattttctt 45476305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5348484 - 5348108
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  5348484 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 5348385  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5348384 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 5348285  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  5348284 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggctgtgaactccat 5348185  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  5348184 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccgctaatcatgaataagcaaccgcattttctt 5348108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 41561329 - 41560953
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  41561329 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 41561230  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41561229 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 41561130  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  41561129 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 41561030  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  41561029 taagaatgttcaatccttattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 41560953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 38947080 - 38946704
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  38947080 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttcca 38946981  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38946980 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctctagttcttcaagtgtatcaaaatatttcatggaagcatcttgctc 38946881  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  38946880 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgttgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 38946781  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  38946780 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 38946704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 41181575 - 41181914
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  41181575 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccg 41181674  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  41181675 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 41181774  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  41181775 ttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgta 41181874  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41181875 taagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 41181914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 28342689 - 28343027
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  28342689 catttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgac 28342788  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28342789 atttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatccctactt 28342888  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctg-aaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaat 298  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28342889 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaat 28342988  T
Q  299 aagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  28342989 aagccaaggcatatagcttgccgttttacatgtgtattc 28343027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 342 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 9655482 - 9655194
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9655482 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 9655383  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9655382 tgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 9655283  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccat 630  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655282 atcttgctcttggttaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccat 9655194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45479729 - 45479390
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |    
T  45479729 agcatttccaaaggcaatataactaatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccg 45479630  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  45479629 acatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctac 45479530  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  45479529 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaa 45479430  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45479429 taagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 45479390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 24601804 - 24602155
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  24601804 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 24601903  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  24601904 acatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 24602003  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  24602004 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacata--tatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgtt 24602101  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24602102 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattc 24602155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24612310 - 24611959
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  24612310 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 24612211  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  24612210 acatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 24612111  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  24612110 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacata--tatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatccgacgtt 24612013  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24612012 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattc 24611959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 347 - 721
Target Start/End: Original strand, 17996912 - 17997286
Alignment:
Q  347 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcct 446  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||  | ||||| ||||| |||| | ||    
T  17996912 gtagtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaacatcgtcttgtcacctctatttgact 17997011  T
Q  447 ttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatctt 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  17997012 tccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtcttttgctcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagcacctt 17997111  T
Q  547 gctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaact 646  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17997112 gctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctaccagcaagcatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgcgaact 17997211  T
Q  647 ccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 721  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||   |||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  17997212 tcatgaagaatgttcaatctccattcctttgtttgtctactaagatatccactaaccttgaacatgaacccacat 17997286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 466 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7263973
Alignment:
Q  466 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatat 565  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaccatcttgctcttggtcaagtcacgt 7264135  T
Q  566 acaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatc 665  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264134 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggttccatgagatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7264035  T
Q  666 cccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  7264034 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 7263973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9659964 - 9659609
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  9659964 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaacg 9659865  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattc---acacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  9659864 acatttggttaaaattacacaaacgcttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 9659765  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatac--atatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacg 281  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  9659764 aattaaatacctacttacattcaacgcaattgcatattgaacgaacatacaaatataaaatatattatcttccaccatattccgaaacataaactcgacg 9659665  T
Q  282 tcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9659664 tcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 9659609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 345 - 572
Target Start/End: Original strand, 1098564 - 1098791
Alignment:
Q  345 ttgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagc 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  1098564 ttgtagtactttcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgc 1098663  T
Q  445 ctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatc 544  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1098664 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatc 1098763  T
Q  545 ttgctcttggtcaagtcatatacaatct 572  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1098764 ttgctctcggtcaagtcacgtacaatct 1098791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 43943854 - 43944205
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaa--tataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaat 99  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  43943854 agcatttccaaaggcaaaatataaatcatacaacattaaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaac 43943953  T
Q  100 tgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaa----------ttca---cacatcattaaa 185  Q
     ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||          ||||   ||||||||||||    
T  43943954 cgacatttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatcattaaa 43944053  T
Q  186 ttaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgc 285  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  43944054 ttaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgc 43944153  T
Q  286 taccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43944154 tatcatcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 43944205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 12905684 - 12906033
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  12905684 agcatttccaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccg 12905783  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaatt 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||  ||             ||||||||||||||    
T  12905784 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatt 12905883  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12905884 aaatccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcta 12905983  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12905984 tcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattc 12906033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 41052789 - 41053137
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  41052789 atttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca 41052888  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaat 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  41052889 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaattcattacacatcattaaat 41052988  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgc--atatggaacgaacatacatatat-aatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |     ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41052989 t-----cctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 41053083  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  41053084 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtattc 41053137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 439729 - 439379
Alignment:
Q  3 gcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattga 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  439729 gcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaa--tacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccga 439632  T
Q  103 catctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaa 184  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||               |||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||     
T  439631 catttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaagcgttacaaagtatccataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatgattat 439532  T
Q  185 attaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  439531 attaaatccctccttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattactttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg 439432  T
Q  285 ctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||| ||||   |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  439431 ctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 439379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24753932 - 24753593
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||  |    
T  24753932 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactgggacataaacaagataaatacaatatcttttacaatttttcataattaaattaaaccg 24753833  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  24753832 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 24753733  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||   |||||||||    
T  24753732 ttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaa 24753633  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24753632 taagcaaaagcatatagcttgccgttttccatacgtattc 24753593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 1096734 - 1097087
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  1096734 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 1096833  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||               |||| ||||||||||||| |||   || |||||||    
T  1096834 acatttggttcaaactacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgttcataattaaacaactcattacatatcatta 1096933  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1096934 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaattcgacgtc 1097033  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||| |||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1097034 gctatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtattc 1097087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7267352 - 7267013
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||       
T  7267352 agcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacct 7267253  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  7267252 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctac 7267153  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||    
T  7267152 ttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaa 7267053  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7267052 taagcaaaggtatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 7267013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39798329 - 39798009
Alignment:
Q  20 ataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatct-ggttcaaatta 118  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| | |||| | ||||    
T  39798329 ataattcatacaatattgaaactcggtcataatcaagataaatgcaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaacatta 39798230  T
Q  119 cacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaagtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattg 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||     
T  39798229 aacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaa-gtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaatta 39798131  T
Q  216 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39798130 catatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagc 39798031  T
Q  316 ttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  39798030 ttgccgttttccatgcgtattc 39798009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41564366 - 41564059
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  41564366 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 41564267  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  41564266 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 41564167  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41564166 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 41564067  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  41564066 gcgtattc 41564059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5351607 - 5351300
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  5351607 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 5351508  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  5351507 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 5351408  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5351407 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 5351308  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  5351307 gcgtattc 5351300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 10620171 - 10620478
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  10620171 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 10620270  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  10620271 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 10620370  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10620371 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 10620470  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  10620471 gcgtattc 10620478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 3795501 - 3795854
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  3795501 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 3795600  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa--------------acgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||              || || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||    
T  3795601 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcatta 3795700  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3795701 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 3795800  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3795801 gccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 3795854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 41004690 - 41005040
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      
T  41004690 aagcatttccaaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtctataattaaatcaaacc 41004789  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaa-------------ttcacacatcattaaat 186  Q
     |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||              | ||||||||||| ||    
T  41004790 aacatttggtttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatat 41004889  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgct 286  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||| |||||| |     
T  41004890 taaatcactacttacattcatcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatattctgaaacataaatctgacgtccca 41004989  T
Q  287 accgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | ||||   |||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  41004990 atcgtctttaataagccagggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtattc 41005040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 209182 - 209489
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  209182 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 209281  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  209282 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 209381  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  209382 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 209481  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  209482 gcgtattc 209489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 82171 - 81819
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |    
T  82171 agcatttctaaaggcagtataaatcatccaacatcaaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccata-ttaaatcaaaccg 82073  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||               |||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||    
T  82072 acatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtgcataattaaacaactcattacacatgatta 81973  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
     ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  81972 tattaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttcaaccatattccgaaacataaatccgacgtc 81873  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | || ||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  81872 gttatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtattc 81819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 566 - 727
Target Start/End: Original strand, 1100042 - 1100203
Alignment:
Q  566 acaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatc 665  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100042 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccatctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 1100141  T
Q  666 cccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1100142 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 1100203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38950474 - 38950232
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  38950474 agcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 38950375  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  38950374 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctac 38950275  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatata 240  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38950274 ttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata 38950232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25184736 - 25184606
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  25184736 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgata 25184637  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 135  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184636 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 25184606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1150783 - 1150601
Alignment:
Q  157 cataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttc 253  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1150783 cataattaaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttc 1150684  T
Q  254 caccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtatt 336  Q
    || |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1150683 catcatattccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatt 1150601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 10825383 - 10825526
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  10825383 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacag 10825482  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10825483 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 10825526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39951079 - 39950936
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  39951079 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 39950980  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39950979 acatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 39950936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 32952895 - 32953038
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  32952895 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacatcaacaagaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccg 32952994  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32952995 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 32953038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 18000430 - 18000605
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18000430 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 18000529  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctacttacattc 205  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000530 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattc 18000605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 628 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9652231 - 9652132
Alignment:
Q  628 catcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9652231 catcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 9652132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 29398074 - 29398213
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  29398074 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataa----gaaaaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccg 29398169  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29398170 acatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcatcataacg 29398213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949755
Alignment:
Q  237 tataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtatt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38949855 tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtatt 38949756  T
Q  337 c 337  Q
    |    
T  38949755 c 38949755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Original strand, 3206956 - 3207077
Alignment:
Q  46 tcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3206956 tcataaacaagaaagatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatcaaaacg 3207055  T
Q  146 ttgca-agtgtccataattaaa 166  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  3207056 ttgcatggtgtccataattaaa 3207077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7264297 - 7264229
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 419  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7264297 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 25613583 - 25613697
Alignment:
Q  214 tgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatata 313  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  25613583 tgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaattatattcataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacata 25613682  T
Q  314 gcttgccattttcca 328  Q
    ||| ||| |||||||    
T  25613683 gctcgccgttttcca 25613697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 9639183 - 9639287
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  9639183 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccagcaagaaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 9639282  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  9639283 agaat 9639287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 24683502 - 24683458
Alignment:
Q  565 tacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtg 609  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24683502 tacaatcttcttgtcatcctccattaatcttcccgcaagaatgtg 24683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 555 - 619
Target Start/End: Original strand, 28423423 - 28423487
Alignment:
Q  555 tcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 619  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||    
T  28423423 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaa 28423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 25613379 - 25613508
Alignment:
Q  13 aggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttc 112  Q
    |||||||| || ||||||| |||| ||| || ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| ||| |||||||||||   | ||| | |||     
T  25613379 aggcaatacaactcatacatcatttaaaatcagtcataaacaagaaaa-tacataatcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgttt 25613477  T
Q  113 aaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaa 143  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  25613478 aaattacaagaatgtttgaaattcatcaaaa 25613508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 342 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 4977081 - 4976704
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4977081 cgattgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 4976982  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4976981 tgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 4976882  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4976881 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtctttctaaagccggctccatcgcatggttgc 4976782  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccac 719  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4976781 aaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccac 4976704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 4978693 - 4979074
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||       
T  4978693 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggcttcttgtcaccttt--- 4978789  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4978790 -gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 4978888  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  4978889 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcatcctttagtctgctggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgg 4978988  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4978989 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 4979074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 11502832 - 11502447
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  11502832 cgattgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 11502733  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11502732 tgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 11502633  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11502632 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcatgaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatgggtgt 11502533  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11502532 gaactccattaagaatgttcaatactcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 11502447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9891339 - 9890963
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  9891339 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 9891240  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9891239 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 9891140  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  9891139 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 9891040  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  9891039 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 9890963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 19072401 - 19072777
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  19072401 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 19072500  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19072501 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 19072600  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  19072601 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttataaagcagactccatagaatggttgtgaactccat 19072700  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  19072701 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaaaaagcaaacacattttctt 19072777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 49565208 - 49565584
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  49565208 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 49565307  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49565308 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 49565407  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  49565408 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 49565507  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  49565508 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 49565584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 343 - 721
Target Start/End: Original strand, 51643234 - 51643614
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||     
T  51643234 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcgtcttgtcaactctattt 51643333  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  51643334 gccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatattttttgaaagca 51643433  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagcc-ggctccatcgcattgttgt 641  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  51643434 ttttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtccttataaagccgggctccatcgcatgtttgt 51643533  T
Q  642 g-aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 721  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643534 gaaactccattaagaatgttcaatctcaattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 51643614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 41024516 - 41024141
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| ||    
T  41024516 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgactttttgtcacccctatttgccttcca 41024417  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41024416 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 41024317  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  41024316 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaattccat 41024217  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  41024216 taagaatgttcaat-cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 41024141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 351 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 3405107 - 3404744
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  3405107 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 3405008  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3405007 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 3404908  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  3404907 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtccttctaaagccaactccatgggatggttgtgaactccat 3404808  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagca 714  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3404807 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagca 3404744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 343 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21472118 - 21471735
Alignment:
Q  343 gattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatta 442  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  21472118 gattttagtactttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctattt 21472019  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21472018 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattttt-atccaatgtggtcttttgttcatcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 21471920  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||| || |||||  | |||||| | || ||||||    
T  21471919 tcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttattctatcttcaagaatgtgtctttttaaagttgtctccattgtatggttgtg 21471820  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21471819 aactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 21471735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 393 - 727
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580448
Alignment:
Q  393 cctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 492  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtc---catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  493 gcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaat 592  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18580214 gcaatgaggtctttagttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaat 18580313  T
Q  593 ctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgat 692  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  18580314 ctatcggcaagaatgtgtcattctaaagccggcttcattgcatggttgtgaactccattaagaatgtttaatcctcattcctttgtttgcttactttgat 18580413  T
Q  693 atccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18580414 atccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 18580448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10423315 - 10422977
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  10423315 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaataca-tatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 10423217  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   || ||||||| |||||||||||||    
T  10423216 acattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaaacaactcattacatatcattagattaaatccctac 10423117  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||    
T  10423116 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaa 10423017  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10423016 taagccaagacatatagcttgtcgttttccatgtgtattc 10422977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 38460590 - 38460929
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  38460590 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 38460689  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  38460690 acatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctac 38460789  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||    
T  38460790 ttacattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaa 38460889  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38460890 taagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgcattc 38460929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 10374240 - 10374543
Alignment:
Q  38 aaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374240 aaactcggtcataaccaagaaaaatacaataccttttacagttgtccataattaaatgaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca 10374339  T
Q  138 tcaaaacgttgcaag-tgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatac 233  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10374340 tcaaaacattacaaggtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatac 10374439  T
Q  234 atatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10374440 atatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgt 10374539  T
Q  334 attc 337  Q
    ||||    
T  10374540 attc 10374543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44051001 - 44050650
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  44051001 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 44050902  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc---------------aagtgtccataattaaacaattc---acacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  44050901 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 44050802  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44050801 aattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 44050702  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtatt 336  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||   |||||||||||||||    
T  44050701 gctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtatt 44050650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 342 - 591
Target Start/End: Original strand, 38463572 - 38463821
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38463572 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatt 38463671  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38463672 tgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtcttttgtccttcaaatgtatcaaaatattttttggaagc 38463771  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaa 591  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  38463772 atcttgctcttggtcaagtcacgtgcaatcttcttgtcgtcctcctttaa 38463821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 342 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 4769460 - 4769179
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4769460 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatt 4769361  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatg----tatcaaaatatttcttgg 537  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||     
T  4769360 tgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatcaatttatcaaaatatttcttga 4769261  T
Q  538 aagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 619  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4769260 aagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtccttctaaa 4769179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3408148 - 3407808
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  3408148 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 3408049  T
Q  102 acatct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||    
T  3408048 acattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatcccta 3407949  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  3407948 cttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcga 3407849  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3407848 ataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 3407808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37395125 - 37394772
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  37395125 agcatttccaaaggaaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 37395026  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  37395025 acatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 37394926  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  37394925 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacgtc 37394826  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  37394825 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtattc 37394772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4774522 - 4774173
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4774522 agcatttccaaagccaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaatcg 4774423  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaatt 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||   |||||||  ||             ||||||||||||||    
T  4774422 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaatt 4774323  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4774322 aaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgcta 4774223  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4774222 tcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattc 4774173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 342 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 44049936 - 44049720
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  44049936 cgattgtagtagtttcactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatt 44049837  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44049836 tgccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 44049737  T
Q  542 atcttgctcttggtcaa 558  Q
    |||||||| ||||||||    
T  44049736 atcttgctattggtcaa 44049720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 49564039 - 49564346
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  49564039 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 49564138  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  49564139 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 49564238  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49564239 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 49564338  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  49564339 gcgtattc 49564346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50905071 - 50904819
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  50905071 agcatttctaaatgcaatataaatcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatatgaaatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 50904972  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  50904971 acattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctac 50904872  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatc 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50904871 ttacattcaacacaattgcatatggaacaaacatacaaatataatatattatc 50904819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 19069351 - 19069704
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  19069351 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtaaaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 19069450  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa--------------acgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||              || || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||    
T  19069451 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcatta 19069550  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  19069551 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatgtataatatattatcttccaccatattccgaaacataaacccgacgtc 19069650  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19069651 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 19069704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 18578790 - 18579136
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  18578790 atttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca 18578889  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaattaaa 190  Q
    | || |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||             |||||||||||||||||    
T  18578890 tttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaa 18578989  T
Q  191 tccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccg 290  Q
    || || ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18578990 tcacttcttacattcaacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcgctatcg 18579089  T
Q  291 tcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18579090 tcttcaattagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 18579136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 337
Target Start/End: Original strand, 24415392 - 24415674
Alignment:
Q  71 ttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaa 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24415392 ttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaa 24415491  T
Q  170 ttca-------------cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccac 256  Q
      ||             || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24415492 cacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccat 24415591  T
Q  257 catattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggc--atatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24415592 catattccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattc 24415674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 51642171 - 51642423
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  51642171 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcgatcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 51642270  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaa-------------ttcacacatcattaaatt 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||              | ||| |||||||| ||    
T  51642271 acatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatatcattaagtt 51642370  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatata 240  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51642371 aaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatatata 51642423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11506827 - 11506663
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||    
T  11506827 acacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaacata 11506728  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11506727 aatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 11506663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 6186810 - 6187140
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcata--accaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaa 98  Q
    |||||||| | |||||||||  | || ||||||||| | |||| ||||||  | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  6186810 aagcatttccgaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcagtcatataaacaagaaaaatacattatcttttatagtagtcaataattaaatcaat 6186909  T
Q  99 ttgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag-tgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaa 184  Q
      ||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||  ||             || ||||||||    
T  6186910 ccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacattaaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcattaa 6187009  T
Q  185 attaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcg 284  Q
    |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| | ||||    
T  6187010 attaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgtcg 6187109  T
Q  285 ctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagc 315  Q
    ||| ||||| ||||||| |||| || |||||    
T  6187110 ctatcgtcgtgaataagccaagacacatagc 6187140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 637 - 727
Target Start/End: Original strand, 38463827 - 38463917
Alignment:
Q  637 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38463827 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 38463917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 51492236 - 51492374
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  51492236 agcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcgaacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 51492335  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51492336 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 51492374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 37016063 - 37016206
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37016063 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacatcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaactg 37016162  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37016163 acgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcatcataacg 37016206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 50278731 - 50278588
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||  |    
T  50278731 agcatttcgaaaggcaaaataatctatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatcaaaccg 50278632  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50278631 acatttggttgaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 50278588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 44674302 - 44674440
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  44674302 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 44674401  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatca 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44674402 acatttggttcaaattacacaaacatttaaaattcatca 44674440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 623 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 17140634 - 17140530
Alignment:
Q  623 ggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacata 722  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||     
T  17140634 ggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaaacatccacatt 17140535  T
Q  723 ttctt 727  Q
    |||||    
T  17140534 ttctt 17140530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 15995886 - 15996026
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  15995886 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaagtcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 15995985  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa 142  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15995986 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaa 15996026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 6182999 - 6182664
Alignment:
Q  347 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcct 446  Q
    |||||||||||| |||||| | | | | |||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |  | ||||| ||||| | || | ||    
T  6182999 gtagtactttcaatttgtgttatggtgaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttgact 6182900  T
Q  447 ttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacat--ttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatc 544  Q
    |  |||||| |||| |||||||||| | ||| ||   ||  |||||||||| | | |||||||  |||| |||| || |||||||||| ||| ||| | |    
T  6182899 tgaatattttttgatgttcattgtatatttgtttttgatgtttgtcatgcactcttgtctttttctcttaaaatttaacaaaatattttttgaaagcacc 6182800  T
Q  545 ttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaa 644  Q
       |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||||   |||| |||| ||| ||||||||    
T  6182799 aaactcttggtcaagtcatgtacaattttcttgtcaccatcccttaatatacttgcaagcatatgtccttctaaacttggcttcatctcatggttgtgaa 6182700  T
Q  645 ctccattaagaatgttcaatccccattcatttgttt 680  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  6182699 ctccatcaagaatattcaatctccaatcgtttgttt 6182664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30043116 - 30043046
Alignment:
Q  213 ttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30043116 ttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 30043046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17916302 - 17916198
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  17916302 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 17916203  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  17916202 agaat 17916198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 4617818 - 4617714
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||   || ||| |  |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4617818 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccagcaagaaggttctctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4617719  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  4617718 agaat 4617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1590950 - 1590845
Alignment:
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1590950 ttggtcaagtcatgtacaatcttc-tgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccacaccatctcatggttgtgaacgccat 1590852  T
Q  651 taagaat 657  Q
    |||||||    
T  1590851 taagaat 1590845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30043314 - 30043245
Alignment:
Q  28 tacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaa 97  Q
    ||||||||| | |||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30043314 tacaacatttatactaagtcataaacaagaaaaatgtattatcttttacaattatccataattaaatcaa 30043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 653
Target Start/End: Original strand, 46517380 - 46517480
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  46517380 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttctagcaagaaggtgccctgctatataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46517479  T
Q  653 a 653  Q
    |    
T  46517480 a 46517480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 47062207 - 47061824
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgcca-cctttatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||     
T  47062207 attgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcaacctctattt 47062109  T
Q  443 gcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagta 542  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47062108 gccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagca 47062009  T
Q  543 tcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtg 642  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  47062008 tcttgctcttggtcaagtcacatacaatctttttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttcaaaagtcggctccatcgcatggttgtg 47061909  T
Q  643 aactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47061908 aactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 47061824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 18106705 - 18106329
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  18106705 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 18106606  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18106605 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 18106506  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  18106505 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 18106406  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  18106405 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 18106329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 43622879 - 43623255
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  43622879 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 43622978  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43622979 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 43623078  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  43623079 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 43623178  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  43623179 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 43623255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 617493 - 617869
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  617493 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttcca 617592  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  617593 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 617692  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  617693 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 617792  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  617793 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 617869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42500724 - 42500361
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  42500724 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 42500625  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  42500624 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgaaagcatcttgatc 42500525  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  42500524 tttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtttccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 42500425  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagca 714  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42500424 taagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagca 42500361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30787856 - 30787480
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| || || ||    
T  30787856 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgctttcca 30787757  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30787756 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 30787657  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  30787656 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 30787557  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  30787556 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 30787480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 45764696 - 45764320
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  45764696 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 45764597  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45764596 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 45764497  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  45764496 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcattctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 45764397  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  45764396 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 45764320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 8400910 - 8400527
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |    
T  8400910 attgtagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttg 8400811  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtat 543  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||    
T  8400810 ccttccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtcttttgttcttcaaatttatcaaaatattttttggtaacat 8400711  T
Q  544 cttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtga 643  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8400710 cttgctcttggtcaagtcacctacaatcttcttgtcatcctcctttaatgtaccagcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgtga 8400611  T
Q  644 actccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8400610 actccattgaaaatgttcaatccccattcttttgtttgcctactaagatatccactaaccatgaacaagcacccacattttctt 8400527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 391 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060568
Alignment:
Q  391 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  491 atgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctccttta 590  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatattccttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctccttta 15060691  T
Q  591 atctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttg 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15060690 atctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaa-ccccattcctttgtttgcttactttg 15060592  T
Q  691 atatccactaatcatgaacaagca 714  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  15060591 atatccactaatcatgaataagca 15060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 344 - 727
Target Start/End: Original strand, 43827344 - 43827726
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattag 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  43827344 attgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgagat-agatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 43827442  T
Q  444 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtat 543  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  43827443 ccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatttatcaaaatatttcttggaagcat 43827542  T
Q  544 cttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtga 643  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  43827543 cttgcacttggtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcattctaaagctggctccttcgcatggttgtga 43827642  T
Q  644 actccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  43827643 actccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgtctactaagatatccactaaccatgaacaaacacccacattttctt 43827726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 34622663 - 34623002
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  34622663 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaataagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccg 34622762  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||   ||||    
T  34622763 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacttctac 34622862  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34622863 ttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaa 34622962  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34622963 taagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 34623002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47742897 - 47742558
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || || || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||       
T  47742897 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaattaaacca 47742798  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  47742797 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 47742698  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  47742697 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaa 47742598  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47742597 taagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 47742558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 340
Target Start/End: Original strand, 19044460 - 19044813
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19044460 atttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgaca 19044559  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaat 186  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  19044560 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaat 19044659  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgct 286  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  19044660 taaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgct 19044759  T
Q  287 accgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcttc 340  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  19044760 atcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttc 19044813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20710176 - 20709823
Alignment:
Q  5 attttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgaca 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20710176 atttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccgaca 20710077  T
Q  105 tctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaat 186  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  20710076 tttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattacacatcattaaat 20709977  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgct 286  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  20709976 taaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgct 20709877  T
Q  287 accgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcttc 340  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  20709876 atcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttc 20709823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18109702 - 18109362
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  18109702 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 18109603  T
Q  102 acatct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||    
T  18109602 acattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatcccta 18109503  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  18109502 cttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcga 18109403  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18109402 ataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 18109362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15070259 - 15069919
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  15070259 agcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 15070160  T
Q  102 acatct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||    
T  15070159 acattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatcccta 15070060  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  15070059 cttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcga 15069960  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15069959 ataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 15069919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Original strand, 603946 - 604283
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||    
T  603946 catttccaaaggtaaaataattcatacaagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaatcgac 604045  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  604046 atttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctactt 604145  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaata 299  Q
    |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||    
T  604146 acattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaata 604245  T
Q  300 agtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  604246 agcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 604283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42503739 - 42503407
Alignment:
Q  10 caaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatct-g 108  Q
    ||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||   |||| | |    
T  42503739 caaaggctaaataattcatgcaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttataattgttcatgattaaattaaaccaacattttg 42503640  T
Q  109 gttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacatt 204  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503639 gttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatt 42503540  T
Q  205 ccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtca 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  |    
T  42503539 caacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaa 42503440  T
Q  305 aggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42503439 aggcatgtagcttgccgttttccatgcgtattc 42503407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 10705411 - 10705761
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  10705411 aagcatttctaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc 10705510  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaat 186  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||             ||||||| |||||    
T  10705511 gacatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataaat 10705610  T
Q  187 taaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgct 286  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10705611 taaatctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcgct 10705710  T
Q  287 accgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | ||||   ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10705711 atcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattc 10705761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30790882 - 30790575
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  30790882 attgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 30790783  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  30790782 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 30790683  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30790682 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctgttttccat 30790583  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  30790582 gcgtattc 30790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45767736 - 45767429
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  45767736 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 45767637  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  45767636 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 45767537  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45767536 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 45767437  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  45767436 gcgtattc 45767429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 43619877 - 43620184
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  43619877 attgaaactcagacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 43619976  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  43619977 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 43620076  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43620077 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 43620176  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  43620177 gcgtattc 43620184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 337
Target Start/End: Original strand, 12111394 - 12111727
Alignment:
Q  16 caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  12111394 caatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa 12111493  T
Q  116 ttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgtt-gcaagtgtccataattaaacaat-------------tcacacatcattaaattaaatccctacttac 201  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||             | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12111494 ttacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttac 12111593  T
Q  202 attccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataag 301  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||   |||||     
T  12111594 attcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaa 12111691  T
Q  302 tcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12111692 ccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattc 12111727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Original strand, 29592842 - 29593006
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29592842 acacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaacata 29592941  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29592942 aatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattc 29593006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47065148 - 47064863
Alignment:
Q  70 cttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag---------------tg 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||                ||    
T  47065148 cttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatg 47065049  T
Q  155 tccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatct 251  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47065048 tccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattt 47064949  T
Q  252 tccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||  ||||| |||||  |||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47064948 tccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 47064863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 524 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21800156 - 21799953
Alignment:
Q  524 aaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccg 623  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||||||| | ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21800156 aaaatattttttggatgcaccttgctcttgattaagtcacgtataattttcttgttatcctcctttaatctaccgacaaacatgtgtccttctaaagccg 21800057  T
Q  624 gctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatat 723  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |  |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  21800056 actccatcgcatggttgtgaactccattaacaatgttcaatctccattgctttgttttcctactaagatatccactaaccatgaacatgcacccacattt 21799957  T
Q  724 tctt 727  Q
    ||||    
T  21799956 tctt 21799953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34742281 - 34742168
Alignment:
Q  25 tcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34742281 tcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttgattcaaattacacaaa 34742182  T
Q  125 cgtttgaaattcat 138  Q
    ||||||||||||||    
T  34742181 cgtttgaaattcat 34742168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 5538009 - 5538152
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5538009 agcatttcgaaagggaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaaaccg 5538108  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5538109 acatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcatcataacg 5538152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17838543 - 17838400
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  17838543 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 17838444  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17838443 acatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 17838400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40928861 - 40928719
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  40928861 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 40928762  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac 144  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40928761 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaac 40928719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 29592708 - 29592841
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  29592708 agcatttccaaaggaaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccg 29592807  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaatt 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29592808 acatttggttcaaattacacaaacttttgaaatt 29592841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10522366 - 10522280
Alignment:
Q  59 aaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10522366 aaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcataacg 10522280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13323623 - 13323480
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  ||||| || |||| ||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||  |    
T  13323623 agcatttcgaaaggtaaaataattcatacaacgttgaaactgagacattaacaagaaaaatacaatattttttacaattttccataattaaattaaaccg 13323524  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13323523 gcatttcgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 13323480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 46791440 - 46791336
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  46791440 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46791341  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  46791340 agaat 46791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 47867442 - 47867546
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||| |  | || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47867442 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaagatgccctgctacataccgcaccatctcattgttgtgaacgccatta 47867541  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  47867542 agaat 47867546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 657
Target Start/End: Original strand, 8194131 - 8194330
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtca 557  Q
    |||||| |||| || |||||||| | |||||||||| | | | ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    | |   || ||| |||    
T  8194131 tgacgtacattatagacttgcttgatatttgtcatggactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccgaactattgctca 8194230  T
Q  558 agtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaat 657  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| | |||  || | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  8194231 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgcaaaatacgccaccatctcatggttgtgaacaccattaagaat 8194330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 45172855 - 45172959
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  45172855 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45172954  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  45172955 agaat 45172959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 554 - 657
Target Start/End: Original strand, 40445512 - 40445615
Alignment:
Q  554 gtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaa 653  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  40445512 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggttccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaa 40445611  T
Q  654 gaat 657  Q
    ||||    
T  40445612 gaat 40445615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 618
Target Start/End: Original strand, 20908458 - 20908528
Alignment:
Q  548 ctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaa 618  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20908458 ctcttggtaaagtcacgcacaatcttcttgtcatcctcccttaatcttcctgcaagaatgtgcccttctaa 20908528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 1297101 - 1296997
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||| ||| | ||| ||||||    
T  1297101 ggtcaagtcatgtacaatcttctcgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttattaacaccatta 1297002  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  1297001 agaat 1296997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 3762115 - 3761979
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtca 557  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||   ||||||||  |||||||||||| ||||  | |||   ||||||||||    
T  3762115 tgacgttcattgtatgctttctttacatttgtcatgcactcttgtctttttcccttcaaattcatcaaaatattttttggctgcatcaaactcttggtca 3762016  T
Q  558 agtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatct 594  Q
    ||| |  || |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  3762015 agttacctagaatctttttgtcatcttcccttaatct 3761979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15067206 - 15067162
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcct 395  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067206 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 462 - 594
Target Start/End: Original strand, 16794468 - 16794600
Alignment:
Q  462 gttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctcttggtcaagtc 561  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| | | |   ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    | |   || |||||||||||    
T  16794468 gttcattgtagacttgcttgatatttgtcatggactctttccttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttggtttcaccaaactattggtcaagtc 16794567  T
Q  562 atatacaatcttcttgtcatcctcctttaatct 594  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16794568 atgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 16794600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 40794035 - 40793934
Alignment:
Q  556 caagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaaga 655  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  40794035 caagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaattttcctgcaagaaggtgccctactacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccattaaga 40793936  T
Q  656 at 657  Q
    ||    
T  40793935 at 40793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12203
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttc- 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  450 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgct 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctttct 12381  T
Q  550 cttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactcca 649  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  12380 cttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctaccggaaagaatgtgtccttctaaagccagctccatggcatggttttgaactcca 12281  T
Q  650 ttaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12280 ttaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 12203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15863 - 15524
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  15863 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 15764  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15763 acatttagttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 15664  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |   |||||||||    
T  15663 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaa 15564  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15563 taagcaaaggcatatagcttgccgttttccatacgtattc 15524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 18607322 - 18606937
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  18607322 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttcttatcacctctatt 18607223  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18607222 tgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttattcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 18607123  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18607122 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcgacaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgt 18607023  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18607022 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 18606937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 342 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 31147648 - 31147269
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  31147648 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 31147549  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31147548 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtataaaaatattacttggaagc 31147449  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31147448 atcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcattctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgt 31147349  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacat 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31147348 gaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgttaccttactttgatatccactaatcatgaacaaccacccacat 31147269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 29287687 - 29288067
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  29287687 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatt 29287782  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29287783 tgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 29287882  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  29287883 atcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttataaagccgactccatcgcatggttgt 29287982  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  29287983 gaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatcc-ctaatcatgaacaaacatccacattttctt 29288067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 1611495 - 1611871
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  1611495 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 1611594  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1611595 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 1611694  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1611695 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 1611794  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  1611795 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 1611871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 29286367 - 29286706
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  29286367 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacgttgaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 29286466  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| | ||||    
T  29286467 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaacctctac 29286566  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29286567 ttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaa 29286666  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  29286667 taagccaaggcatatagtttgccgttttctatgtgtattc 29286706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 28251132 - 28250837
Alignment:
Q  432 cacctttattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatt 531  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28251132 cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatt 28251033  T
Q  532 tcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28251032 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagctggctccatg 28250933  T
Q  632 gcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28250932 ggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 28250837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18610141 - 18609803
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  18610141 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 18610042  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  18610041 acatctggttcgaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatgattatattaaatccctac 18609942  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||    
T  18609941 ttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaa 18609842  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtatt 336  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  18609841 taagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcatatt 18609803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 342 - 671
Target Start/End: Original strand, 21358085 - 21358411
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  21358085 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 21358184  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||  |   ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21358185 tgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 21358281  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||    
T  21358282 atcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccaacttcatcgcctggttgt 21358381  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccatt 671  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21358382 gaacttcattgagaatgttcaatccccatt 21358411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 342 - 671
Target Start/End: Original strand, 23962067 - 23962393
Alignment:
Q  342 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttatt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  23962067 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatt 23962166  T
Q  442 agcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagt 541  Q
     ||||| |||||||||  |   ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23962167 tgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagc 23962263  T
Q  542 atcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgt 641  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||    
T  23962264 atcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagccaacttcatcgcctggttgt 23962363  T
Q  642 gaactccattaagaatgttcaatccccatt 671  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23962364 gaacttcattgagaatgttcaatccccatt 23962393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31150973 - 31150634
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  31150973 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 31150874  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31150873 acatttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctac 31150774  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
     ||||||| || ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31150773 atacattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaa 31150674  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31150673 taagccaaggcatatagcttgccgttttccaagcgtattc 31150634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25141012 - 25140674
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  25141012 catttccaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgac 25140913  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatccctactt 199  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  25140912 atttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt 25140813  T
Q  200 acattccacacaattgcatatggaacgaacataca-tatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaat 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25140812 acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaat 25140713  T
Q  299 aagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25140712 aagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattc 25140674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 7537351 - 7537704
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  7537351 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 7537450  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  7537451 acatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccataattaaacaaatcattgcacatcatta 7537550  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7537551 aattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 7537650  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7537651 gctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtattc 7537704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 2051192 - 2051545
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2051192 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaaccg 2051291  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||               |||| ||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  2051292 acattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgataaaaagtgttaataattaagtgttcataattaaacaactcattacacatcatta 2051391  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2051392 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatccgacgtc 2051491  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    || | ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2051492 gccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtattc 2051545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 23959055 - 23959394
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |    
T  23959055 agcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaatcaaaccg 23959154  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  23959155 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacacatcattaaattaaatccctac 23959254  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  23959255 ttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaa 23959354  T
Q  298 taagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23959355 taagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 23959394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29667741 - 29667392
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  29667741 agcattttcaaaggcaatataacttatacaacttttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 29667642  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca-------------cacatcattaaatt 187  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||             ||||||||||||||    
T  29667641 acatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaatt 29667542  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  29667541 aaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgcta 29667442  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29667441 tcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 29667392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28362639 - 28362286
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |    
T  28362639 agcatttccaaaggtaatataaatcatataacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacagttgtctaaaattaaattaaaccg 28362540  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaag---------------tgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||                ||||||| ||||||||| |||   ||||||||||    
T  28362539 acatttggttcaaattacacaaccgattgaaattcaacaaaacgttacaaagtgttcataattaaatgtccatcattaaacaactcattacacatcatta 28362440  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28362439 aattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaattcgacgtc 28362340  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28362339 gctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcttattc 28362286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 24220404 - 24220107
Alignment:
Q  432 cacctttattagcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatt 531  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24220404 cacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatttatcaaaatatt 24220305  T
Q  532 tcttggaagtatctt--gctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctcca 629  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24220304 tcttggaagcatcttatgctcttggtcaagtcacgtataattttcttgtcgtcctcctttaatctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccgactcca 24220205  T
Q  630 tcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  24220204 tcgcatggttgtgaactgcattaagaattttcaatccccattcatttgttttcctactaagatatccactaaccatggacaagcacccacattttctt 24220107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Original strand, 1608491 - 1608798
Alignment:
Q  34 attgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaa 133  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  1608491 attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa 1608590  T
Q  134 ttcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaac 229  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  1608591 ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaac 1608690  T
Q  230 atacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1608691 atacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccat 1608790  T
Q  330 gcgtattc 337  Q
    ||||||||    
T  1608791 gcgtattc 1608798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 13382792 - 13383145
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  13382792 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagtttgaaactcggacataataaagataactacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 13382891  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaa--------------acgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||              || || ||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||    
T  13382892 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaattaaactactcaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattgcacatcatta 13382991  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13382992 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc 13383091  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  13383092 gccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgtattc 13383145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 537 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7362310 - 7362120
Alignment:
Q  537 gaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatt 636  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  7362310 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatg 7362211  T
Q  637 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7362210 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttctt 7362120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 571 - 727
Target Start/End: Original strand, 7362307 - 7362463
Alignment:
Q  571 cttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccat 670  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7362307 cttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcat 7362406  T
Q  671 tcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  7362407 tcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaccatccacattttctt 7362463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26702619 - 26702452
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  26702619 agcatttccaaaggcagtataaatcatacaacatagaaattcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat-aaaccg 26702521  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaa 169  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26702520 acatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaa 26702452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 309
Target Start/End: Original strand, 34230670 - 34230956
Alignment:
Q  28 tacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacg- 126  Q
    ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||  || |     
T  34230670 tacaacatttatactcagtcataaagaataaaaatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttcgttaaaattacatgaatgc 34230769  T
Q  127 tttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatgg 222  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||    
T  34230770 tttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatgg 34230869  T
Q  223 aacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||| | ||  ||||||| |||||||    
T  34230870 aacgaacatacatatataatatattatcttctaccatattctaaaacataaatcggacgtcactatcctcttgaataagccaaggca 34230956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18351551 - 18351348
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  18351551 agcattttcaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 18351452  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaa---ttcacacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |    | |||||||||||||||||||||||||    
T  18351451 acatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactacttattacacatcattaaattaaatccctac 18351352  T
Q  198 ttac 201  Q
    ||||    
T  18351351 ttac 18351348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 627 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 35243644 - 35243544
Alignment:
Q  627 ccatcgcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattct 726  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35243644 ccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttct 35243545  T
Q  727 t 727  Q
    |    
T  35243544 t 35243544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3502572 - 3502429
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  3502572 agcatttcaaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggccataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 3502473  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3502472 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 3502429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31771639 - 31771505
Alignment:
Q  11 aaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggt 110  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  31771639 aaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggt 31771540  T
Q  111 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31771539 tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 31771505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 337
Target Start/End: Original strand, 2259349 - 2259588
Alignment:
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||   ||  | |||||||||||||| ||    
T  2259349 gacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttattaaattaaatcctta 2259448  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    ||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||  ||||   |    
T  2259449 cttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaatctgacgtcgctttcgtcttta 2259547  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  2259548 ataagccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtattc 2259588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11840156 - 11840022
Alignment:
Q  4 cattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgac 103  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  11840156 catttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaaccgac 11840057  T
Q  104 atctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat 138  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840056 atttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat 11840022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20448695 - 20448386
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20448695 agcatttacagaggcaatataactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaagaatacattatcttttacagttgtccataattaaatcaatccg 20448596  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgca-agtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatccctac 197  Q
    |||| | ||| |||||| |  || ||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||   || ||||||| || ||||  |||     
T  20448595 acatttcgttaaaattagaggaatgtttgaaattcataaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatttcatatcattacataaaatatctat 20448496  T
Q  198 ttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcgaa 297  Q
      |||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||| |||||   ||||||||| |||| ||||    
T  20448495 cgacattctacacatttgcaaatgtaacaaacacacatatataatatattatctt-caacatatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaa 20448397  T
Q  298 taagtcaaggc 308  Q
    |||| ||||||    
T  20448396 taagccaaggc 20448386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Original strand, 2258450 - 2258540
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2258450 agcattttcaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa 2258540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 637 - 727
Target Start/End: Original strand, 13387724 - 13387814
Alignment:
Q  637 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  13387724 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccacgaatcatgaataagcaaccacattttctt 13387814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28357642 - 28357557
Alignment:
Q  344 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttctt 429  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28357642 attgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Original strand, 8304602 - 8304715
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  8304602 agcatttccaaagccaatatacctcatacaacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 8304701  T
Q  102 acatctggttcaaa 115  Q
    |||| |||||||||    
T  8304702 acatttggttcaaa 8304715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 19129204 - 19129281
Alignment:
Q  67 tatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19129204 tatcttttacagttgtccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaac 19129281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20439913 - 20439771
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | |||  ||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20439913 agcatttccagaggcaatacaactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccataattaaatcaatccg 20439814  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac 144  Q
    |||| | ||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  20439813 acattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaac 20439771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 548 - 657
Target Start/End: Original strand, 34111603 - 34111712
Alignment:
Q  548 ctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactc 647  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||    ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  34111603 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttctagtcatcttcctttaatcttcctgcaagaattttcccttctaactttggcgccatctcatggttgtgaactc 34111702  T
Q  648 cattaagaat 657  Q
    ||||||||||    
T  34111703 cattaagaat 34111712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 667 - 727
Target Start/End: Original strand, 23985364 - 23985424
Alignment:
Q  667 ccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23985364 ccattcttttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaagcacccacattttctt 23985424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 22864921 - 22864869
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaa 605  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22864921 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcctcctccattaatcttccggcaagaa 22864869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20436162 - 20436063
Alignment:
Q  45 gtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaac 144  Q
    ||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |  || ||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  20436162 gtcataaacaagaggaatacattatcttttacagttgtccatgattaaatcaatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcatgaaaac 20436063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 537
Target Start/End: Original strand, 26684880 - 26684959
Alignment:
Q  458 tgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttgg 537  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||| | | | ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  26684880 tgacgttcattgtaaacttgttttatatttgtcatggactcttgtcttttcttcttcaaatttgtcaaaatattttttgg 26684959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 1822
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  2198 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 2099  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2098 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 1999  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1998 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 1899  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  1898 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 1822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5235 - 4895
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |    
T  5235 agcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccg 5136  T
Q  102 acatct-ggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa-gtgtccataattaaacaattca---cacatcattaaattaaatcccta 196  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||    
T  5135 acattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactactcattacacatcattaaattaaatcccta 5036  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgtcgcga 296  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  5035 cttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcga 4936  T
Q  297 ataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4935 ataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Original strand, 16101 - 16477
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| || || ||    
T  16101 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcgttcca 16200  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16201 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 16300  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16301 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcttcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 16400  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  16401 taagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttctt 16477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34126 - 33750
Alignment:
Q  351 tactttcactttgtgctcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgccacctttattagcctttca 450  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||| ||    
T  34126 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 34027  T
Q  451 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagtatcttgctc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34026 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttcttcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctc 33927  T
Q  551 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccat 650  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  33926 ttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccat 33827  T
Q  651 taagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  33826 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttctt 33750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 22566 - 22918
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  22566 agcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaattaaaccg 22665  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgcaa---------------gtgtccataattaaacaattca---cacatcatta 183  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||               |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  22666 acatttggttaaaattaaacaaacgtt-gaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccataattaaacaactcattacacatcatta 22764  T
Q  184 aattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22765 aattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc 22864  T
Q  284 gctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    ||   |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22865 gccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 22918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 532 - 727
Target Start/End: Original strand, 95 - 290
Alignment:
Q  532 tcttggaagtatcttgctcttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 631  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgttctcctttagtctactcgtaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 194  T
Q  632 gcattgttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgctaactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatattctt 727  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  195 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcaccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 8363 - 8602
Alignment:
Q  1 aagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaatt 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||      
T  8363 aagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaacc 8462  T
Q  101 gacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttgc-aagtgtccataattaaacaattc---acacatcattaaattaaatcccta 196  Q
     |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8463 aacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaactcattacacatcattaaattaaatcccta 8562  T
Q  197 cttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacata 236  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8563 cttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10833
Alignment:
Q  192 ccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgctaccgt 291  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  10978 ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt 10879  T
Q  292 cgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10878 cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattc 10833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1592 - 1517
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttaca 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1592 agcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttaca 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1320
Alignment:
Q  173 acacatcattaaattaaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaaccta 272  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||    
T  1484 acacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaacata 1385  T
Q  273 aatccgacgtcgctaccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
    |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1384 aatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc 1320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Original strand, 21814 - 22142
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||            ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  21814 agcatttccaaaagcaatataaatcatacaatattgaaactcg------------aaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccg 21901  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgtt-gcaagtgtccataattaaacaa-------------ttcacacatcattaaatt 187  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||              | ||||||||||| |||    
T  21902 acatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaaagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatatt 22001  T
Q  188 aaatccctacttacattccacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacctaaatccgacgtcgcta 287  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  22002 aaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatat---------ttttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgcta 22092  T
Q  288 ccgtcgcgaataagtcaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattc 337  Q
      |||   |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22093 ttgtctttaataagccaagacatataacttgtcattttccatgcgtattc 22142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 236144 - 236001
Alignment:
Q  2 agcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattg 101  Q
    |||||||  |||||||| | || |||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  236144 agcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaatattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaatcg 236045  T
Q  102 acatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  236044 acatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcataacg 236001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Original strand, 12591 - 12706
Alignment:
Q  25 tcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccataattaaatcaaattgacatctggttcaaattacacaaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||    
T  12591 tcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgtttaaattacacaaa 12690  T
Q  125 cgtttgaaattcatca 140  Q
    ||||| ||||||||||    
T  12691 cgtttaaaattcatca 12706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3951 - 3847
Alignment:
Q  553 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcattgttgtgaactccatta 652  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |    || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3951 ggtcaagttatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataacgcaccatctcatggttgtgaactccatta 3852  T
Q  653 agaat 657  Q
    |||||    
T  3851 agaat 3847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University