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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5867-Insertion-1 (Length: 863)
Name: NF5867-Insertion-1
Description: NF5867
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5867-Insertion-1 |
 | |
|
| [»] chr7 (19 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 761; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 761; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22876428 - 22875575
Alignment:
| Q |
11 |
tcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattga |
110 |
Q |
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| T |
22876428 |
tcaggcttgtgttcatgttgttttatcttgttacattggtagcaagtgaagaaaacagtttcatctataatggattccaatcatcaaatttatatcttga |
22876329 |
T |
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| Q |
111 |
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210 |
Q |
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| T |
22876328 |
tggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaa |
22876229 |
T |
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| Q |
211 |
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310 |
Q |
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| T |
22876228 |
aacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgttg |
22876129 |
T |
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| Q |
311 |
tttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgt |
410 |
Q |
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| T |
22876128 |
tttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgt |
22876029 |
T |
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| Q |
411 |
tgaacttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctaca |
510 |
Q |
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| T |
22876028 |
tgaacttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctaca |
22875929 |
T |
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| Q |
511 |
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610 |
Q |
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| T |
22875928 |
ggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgaaaaaaaagattg |
22875829 |
T |
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| Q |
611 |
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710 |
Q |
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| T |
22875828 |
atgttactttagctccaatagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtatgt |
22875729 |
T |
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| Q |
711 |
tggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctccgaa |
810 |
Q |
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| T |
22875728 |
tggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctctgaa |
22875629 |
T |
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| Q |
811 |
cttcctaaactacctgcagag-nnnnnnngtcgaaatttttaactgttggattg |
863 |
Q |
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| T |
22875628 |
cttcctaaactacctgcagagaaaaaaaagtcgaaatttttaactgttggattg |
22875575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22889806 - 22888945
Alignment:
| Q |
9 |
cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt |
108 |
Q |
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| T |
22889806 |
cctcagacatgtgttcatgttgttttttcatgttacattggttgcaagtgaagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatctt |
22889707 |
T |
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| Q |
109 |
gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca |
208 |
Q |
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| T |
22889706 |
gatggtattgctgagttaactacaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaaagagacaaaggacatggtttctatccaaatccaatagttttca |
22889607 |
T |
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| Q |
209 |
aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgt |
308 |
Q |
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| T |
22889606 |
aaaacacttccagtgaaagcgtgtcttctttctcaactacttttttatttgccataatacctcaatatgcaaatattggtggccatggaattgtttttgt |
22889507 |
T |
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| Q |
309 |
tgtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggt |
408 |
Q |
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| T |
22889506 |
tatttctccaacaaaagggctaccagattcactaccaagtcaataccttggtctctttaacgattccaacagtggaaacagtagcaaccatgtttttggt |
22889407 |
T |
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| Q |
409 |
gttgaacttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttcta |
508 |
Q |
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| T |
22889406 |
gttgagcttgacactcgtcaaaattttgagtttgatgatatcaacgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctgattcaactcctg |
22889307 |
T |
|
| Q |
509 |
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608 |
Q |
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| T |
22889306 |
caggatattatgatggttatggtcaattcaaggatttatccctttccagtggataccctatgcaggtatggattgaatatgatggagtgaagaaaaagat |
22889207 |
T |
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| Q |
609 |
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702 |
Q |
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| T |
22889206 |
tgatgttactttagcaccaatgagtgttggtgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttcttcaattctcaacaataga |
22889107 |
T |
|
| Q |
703 |
atgtatgttggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaa |
802 |
Q |
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| T |
22889106 |
atgtatgttggattctcatcttcaacagggttaatggtagcttctcagtatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaa |
22889007 |
T |
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| Q |
803 |
tctccgaacttcctaaactacctgcagag-nnnnnnngtcgaaatttttaactgttggattg |
863 |
Q |
| |
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| T |
22889006 |
tctctgaacttcctaaactacctgcagagaaaaaaaagtcgaaatttttaactgttggattg |
22888945 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 22815541 - 22814726
Alignment:
| Q |
9 |
cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt |
108 |
Q |
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| T |
22815541 |
cctcaaacatgtgttcatgttgttttttctcgttacattggtagcaagtgtagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttaaatctt |
22815442 |
T |
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| Q |
109 |
gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca |
208 |
Q |
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| T |
22815441 |
gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttca |
22815342 |
T |
|
| Q |
209 |
aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgt |
308 |
Q |
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| T |
22815341 |
aaaacacttccaatgaaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtgtttgcaataagacctcaatatccaccttttagtggccaaggaattgtttttgt |
22815242 |
T |
|
| Q |
309 |
tgtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggt |
408 |
Q |
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| T |
22815241 |
tctttctcctacaaaagggctaccaaattcactaccaagtcaataccttggtctctttaacgattccaacaatggaaacagtaacaaccatgtttttggt |
22815142 |
T |
|
| Q |
409 |
gttgaacttgattct-gttttgactaatg-agtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttc |
506 |
Q |
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| T |
22815141 |
gttgagcttgacactcgtcaagatt--tgcagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtatcgatatcaattatttgaaatcagctaattcaactcc |
22815044 |
T |
|
| Q |
507 |
tacaggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgnnnnnnnng |
606 |
Q |
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| T |
22815043 |
tgcaggatattataatgatcatggtcaattcagggagttatccctttccaatggatttcctatacaggtatggattgactatgatggagtgaagaaaaag |
22814944 |
T |
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| Q |
607 |
atagatgttactttagctccaa------tagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaata |
700 |
Q |
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| T |
22814943 |
attgatgttactttagctccaatgagtgttggtgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttcttcaattctcaacaata |
22814844 |
T |
|
| Q |
701 |
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800 |
Q |
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| T |
22814843 |
gaatgtatgttggattctcatcttcaacagggttacttgtagcttctcattatattcttgggtggagttttaaggttaatggccaagctcaaaaccttga |
22814744 |
T |
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| Q |
801 |
aatctccgaacttcctaa |
818 |
Q |
| |
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| T |
22814743 |
aatatctgaacttcctaa |
22814726 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 22840566 - 22839753
Alignment:
| Q |
15 |
acttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcat------atataatggattccaatcatcacatttatatatt |
108 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
22840566 |
acttgtgttcatgttgttttttcatgttacattggtagcaagtatagacaacagtttcatctataaatataatggattccaatcatcaaatttatatctt |
22840467 |
T |
|
| Q |
109 |
gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca |
208 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22840466 |
gatggtaccgctgagttagcctcaactggcttactaagactcaccaatgatacaaaacaagaaaaaggacaagctttctatccaaatcctatagttttca |
22840367 |
T |
|
| Q |
209 |
aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgt |
308 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22840366 |
aaaacacttccagcggaagtgtttcttctttctcaactacttttgtattttccataaaatcttcatatccaactcttagtggccatggaattgttttcgt |
22840267 |
T |
|
| Q |
309 |
tgtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggt |
408 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22840266 |
tatttctcctacaaaagggctaccaaattcactaccaagtcaataccttggtctctttaaccaatccaacattggaaacggtggcaaccatgtttttggt |
22840167 |
T |
|
| Q |
409 |
gttgaacttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttcta |
508 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22840166 |
gttgaacttgatactcttctaagtagtgagtttgatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaattcaactcctg |
22840067 |
T |
|
| Q |
509 |
caggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgnnnnnnnngat |
608 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22840066 |
caggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatccctctccagtggatatcctatgcaagtatggattgaatatgatagagtgaagaaaaagat |
22839967 |
T |
|
| Q |
609 |
agatgttactttagctcca------atagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaataga |
702 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22839966 |
tgatgttaccttagctccatttagtgttggttttagtcataaaccaacacaaccgacgttatcattgaccaaagatctttccccaattctcaacaataga |
22839867 |
T |
|
| Q |
703 |
atgtatgttggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaa |
802 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
22839866 |
atgtatgttggattctcatcttcaacagggttcattgcagcttctcattatattcatggttggagttttatggttaatggccaatctcaaaaccttgaaa |
22839767 |
T |
|
| Q |
803 |
tctccgaacttcct |
816 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| |
|
|
| T |
22839766 |
tctctgaccttcct |
22839753 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 22898770 - 22897965
Alignment:
| Q |
16 |
cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22898770 |
cttgcgttcatgttgttttttcatgttacattggtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggta |
22898671 |
T |
|
| Q |
116 |
ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac |
215 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22898670 |
ttgctaatttaacctccaatggcttacttagactcaccaatgataccaagcaagaaaaagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaagaacac |
22898571 |
T |
|
| Q |
216 |
ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgttgtttct |
315 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22898570 |
ttctaatggaagtgtttcttctttctcaactacttttgtgtttgccataagacctcaatatccaactcttagtggccatggaattgtttttgttgtctct |
22898471 |
T |
|
| Q |
316 |
cctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgaac |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22898470 |
cctacaaaagggctaccaaattcactacaaagtcaataccttggtctctttaacaaatccaacaatggaaatagtagcaaccatgtttttggtgttgaac |
22898371 |
T |
|
| Q |
416 |
ttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctacaggata |
515 |
Q |
| |
|
||||| || || | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |
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| T |
22898370 |
ttgatactattattagtagtgagtttaatgatatcaatgataaccatgttggtattgatatcaatgatttgaaatcagctaaatcaactcctgcaggata |
22898271 |
T |
|
| Q |
516 |
ttacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgnnnnnnnngatagatgtt |
615 |
Q |
| |
|
||| |||| || || | ||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |
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| T |
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815 |
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Target: chr7; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 22810151 - 22809342
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Q |
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| Q |
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Q |
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T |
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Q |
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| Q |
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Q |
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| Q |
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T |
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| Q |
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615 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22805823 - 22805029
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Q |
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tgtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggt |
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Q |
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caggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgnnnnnnnngat |
608 |
Q |
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T |
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609 |
agatgttactttagctccaatagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtat |
708 |
Q |
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T |
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gttggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctc |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 67 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 22914124 - 22913373
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acctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgttgtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctcttt |
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aacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgaacttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttg |
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467 |
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563 |
Q |
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| T |
22913724 |
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22913625 |
T |
|
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564 |
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663 |
Q |
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22913624 |
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22913528 |
T |
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| Q |
664 |
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763 |
Q |
| |
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| T |
22913527 |
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22913428 |
T |
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| Q |
764 |
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818 |
Q |
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| T |
22913427 |
ggagttttaaggttaatggtcaagctcaaaatcttgtaatctctgaacttcctaa |
22913373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 472 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22880642 - 22880302
Alignment:
| Q |
472 |
gatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctacaggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgc |
571 |
Q |
| |
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|
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| T |
22880642 |
gatatcaatgatttgaaatcagtaaattcaatttctgcaggatattatgatgattatgatcgattcaaggatttatccctttccagtggatatcccatgc |
22880543 |
T |
|
| Q |
572 |
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665 |
Q |
| |
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| T |
22880542 |
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22880443 |
T |
|
| Q |
666 |
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765 |
Q |
| |
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|
| T |
22880442 |
attgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagtatgtatgttggattatcatcttcaacaaggttaattttagcttctcattatgttcttggttgg |
22880343 |
T |
|
| Q |
766 |
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806 |
Q |
| |
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| T |
22880342 |
agttttaaggttaatggtcaagctcaaaaccttgaaatctc |
22880302 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22881076 - 22880674
Alignment:
| Q |
17 |
ttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataa------tggattccaatcatcacatttatatattga |
110 |
Q |
| |
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| T |
22881076 |
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22880977 |
T |
|
| Q |
111 |
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210 |
Q |
| |
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|
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| T |
22880976 |
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22880877 |
T |
|
| Q |
211 |
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310 |
Q |
| |
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| T |
22880876 |
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22880777 |
T |
|
| Q |
311 |
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410 |
Q |
| |
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| T |
22880776 |
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22880677 |
T |
|
| Q |
411 |
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413 |
Q |
| |
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||| |
|
|
| T |
22880676 |
tga |
22880674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 22885930 - 22885556
Alignment:
| Q |
183 |
tttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaact |
282 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
22885930 |
tttctatccaaatcctatagttttcaaaaacact--cagtgaaagtgtgtcttctttctcaactaattctttatttgctataaaatcttaatatccaact |
22885833 |
T |
|
| Q |
283 |
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382 |
Q |
| |
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| T |
22885832 |
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22885735 |
T |
|
| Q |
383 |
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482 |
Q |
| |
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| T |
22885734 |
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22885635 |
T |
|
| Q |
483 |
tttgaaatcagctatttcaacttctacaggatattacgatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatat |
564 |
Q |
| |
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|
| T |
22885634 |
tttgaaatcagctaattcaactcctgcaggatattatgatg---attatggattcaggaatttatccctttccagtggatat |
22885556 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 320 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 22858665 - 22858160
Alignment:
| Q |
320 |
caaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgaacttga |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
22858665 |
caaaagggctaccagattcacttccaaaccaataccttggtccctttaacgattccaacattggaaacactagcaaccatgtgtttgctgttgagcttga |
22858566 |
T |
|
| Q |
420 |
ttctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctacaggatattac |
519 |
Q |
| |
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|
| T |
22858565 |
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22858466 |
T |
|
| Q |
520 |
gatgaatataatcgattcagggatttatcccttttcagtggatatcccatgcaggtatggattgactatgatggagtgnnnnnnnngatagatgttactt |
619 |
Q |
| |
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||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| | |
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| T |
22858465 |
aatgctattggtcgattcaacgacttatccctttctagtggatatcctatgcaggtatggatagaatatgatggagtgaagaaaaatattgatgttacat |
22858366 |
T |
|
| Q |
620 |
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710 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22858365 |
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22858266 |
T |
|
| Q |
711 |
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810 |
Q |
| |
|
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| T |
22858265 |
tggattctcatcttcaaccggggtaattgtagcttcccattatattcttggttggagttttaaggttaatggccaagctcaaaaccttgaaatctctaaa |
22858166 |
T |
|
| Q |
811 |
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816 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
22858165 |
cttcct |
22858160 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22842677 - 22842264
Alignment:
| Q |
16 |
cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataat------ggattccaatcatcacatttatatattg |
109 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
22842677 |
cttgtgtttatgttgttttttcttgttacattggtagcaagtgaagacaacagtttcatctataataatagaggattccaatcatttcatttgtatcttg |
22842578 |
T |
|
| Q |
110 |
atggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| || | | ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
22842577 |
atggtattgctgagttaacctcaggtggcttaccaagactcaccaatgatacaaaacaatacaaaggtcatgctttatatccaaaaccaatagttttcaa |
22842478 |
T |
|
| Q |
210 |
aaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatcc------aactattagtggtgatggaattgtt |
303 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||| |||| ||||||| | || |||||| |
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|
| T |
22842477 |
aaacacttctagtgaaagtgtgtcttctttctcaactacttttttatttgccataaaatctccagatccagaactaactcttagtggccacgggattgtt |
22842378 |
T |
|
| Q |
304 |
t--ttgtt----gtttctcctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaacc |
397 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22842377 |
ttgttgtttcaactttcacctacaaaagggcaaccaaattcactaccaggtcaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaatagtagcaacc |
22842278 |
T |
|
| Q |
398 |
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411 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22842277 |
atgtttttggtgtt |
22842264 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 636 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 22885506 - 22885326
Alignment:
| Q |
636 |
tagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacaggttta |
735 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22885506 |
tagtgataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaatactcaacaatagaatgtatgttggattctcatcttcaacagggtta |
22885407 |
T |
|
| Q |
736 |
attttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctccgaacttcct |
816 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22885406 |
attgtagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatagccaagctcaaaaccttgaaatctctgaacttcct |
22885326 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22858895 - 22858677
Alignment:
| Q |
47 |
tggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaa |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22858895 |
tggtagcaagtgaagacaacggtttcatctataaaggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcaactggcttactaag |
22858796 |
T |
|
| Q |
147 |
actcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaact |
246 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22858795 |
actcaccaatgatatcgggcaagatacagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttctagtgaaactgtgtcttctttctcaact |
22858696 |
T |
|
| Q |
247 |
acttttgtatttgccataa |
265 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22858695 |
acttttttatttgccataa |
22858677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 610 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 22826162 - 22825952
Alignment:
| Q |
610 |
gatgttactttagctccaatagatgctagtaataaaccaacacaacctttgttatcattgaccaaagatctttctccaattctcaacaatagaatgtatg |
709 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22826162 |
gatgttactttagctccaattaatgtt-gt--taaaccaaaacaacctttgttttcattgaccagagatcttcctccaattttgaacaatagtatgtatg |
22826066 |
T |
|
| Q |
710 |
ttggattctcatcttcaacaggtttaattttagcttctcattatattcttggttggagttttaaggttaatggtcaagctcaaacccttgaaatctccga |
809 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || || |
|
|
| T |
22826065 |
ttggattctcatcagctactggttcagttttcacttctcattatattcttggttgaagttttaagcttaatggtcaagctcaaaatcttgtaatttctga |
22825966 |
T |
|
| Q |
810 |
acttcctaaactac |
823 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
22825965 |
acttcctaaactac |
22825952 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22873660 - 22873589
Alignment:
| Q |
9 |
cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataa |
80 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22873660 |
cctcaggcttgtgctcatgttgttttatcttgttacattagtagcaagtgaagacaacagtttcatctataa |
22873589 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 816
Target Start/End: Original strand, 21150207 - 21151013
Alignment:
| Q |
16 |
cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21150207 |
cttgtgtttatgttgtttaatcttgttacattggtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggta |
21150306 |
T |
|
| Q |
116 |
ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
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| T |
21150307 |
ttgctgagttaacctcaaatggcttactaagactcactagtgatacagatcatgaaatagggcatgctttctatccaaatcctatagttttcgaaaacac |
21150406 |
T |
|
| Q |
216 |
ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaattgtttttgttgtttct |
315 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
21150407 |
ttccggcgaaagtgtgttttctttttcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactcttggtggccatggaattgtttttgttatttct |
21150506 |
T |
|
| Q |
316 |
cctacaaaagggctaccaaactcactaccacgtcaataccttggtctctttaacaattcaaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgaac |
415 |
Q |
| |
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|
| T |
21150507 |
cctacaaaagagctaccaaattcactaccaacacaataccttggtctctttaacaattccaacaatggaaacagtagcaaccatgtttttggtgttgagc |
21150606 |
T |
|
| Q |
416 |
ttgattctgttttgactaatgagtttaatgatatcgatgataaccatgttggaattgatatcaatgatttgaaatcagctatttcaacttctacaggata |
515 |
Q |
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615 |
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709 |
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710 |
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809 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr2 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: chr2
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Target: chr2; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Original strand, 3741480 - 3741560
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T |
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