View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5867_low_3 (Length: 310)

Name: NF5867_low_3
Description: NF5867
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5867_low_3
NF5867_low_3
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (21-310)||(22876139-22876428)
chr7 (19-300)||(22815260-22815541)
chr7 (19-310)||(22889515-22889806)
chr7 (26-298)||(22809879-22810151)
chr7 (19-310)||(22805532-22805823)
chr7 (26-310)||(22898486-22898770)
chr7 (25-310)||(22840275-22840566)
chr7 (19-310)||(22894167-22894458)
chr7 (27-273)||(22880824-22881076)
chr7 (57-275)||(22858677-22858895)
chr7 (26-275)||(22831289-22831538)
chr7 (26-275)||(22842422-22842677)
chr7 (77-219)||(22913982-22914124)
chr7 (193-310)||(22885815-22885930)
chr7 (19-90)||(22873589-22873660)
chr7 (91-123)||(22885937-22885969)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (26-310)||(21150207-21150491)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22876428 - 22876139
Alignment:
Q  21 tcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattga 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22876428 tcaggcttgtgttcatgttgttttatcttgttacattggtagcaagtgaagaaaacagtttcatctataatggattccaatcatcaaatttatatcttga 22876329  T
Q  121 tggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22876328 tggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaa 22876229  T
Q  221 aacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22876228 aacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 22876139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22815541 - 22815260
Alignment:
Q  19 cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt 118  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22815541 cctcaaacatgtgttcatgttgttttttctcgttacattggtagcaagtgtagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttaaatctt 22815442  T
Q  119 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22815441 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttca 22815342  T
Q  219 aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtgg 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  22815341 aaaacacttccaatgaaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtgtttgcaataagacctcaatatccaccttttagtgg 22815260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22889806 - 22889515
Alignment:
Q  19 cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22889806 cctcagacatgtgttcatgttgttttttcatgttacattggttgcaagtgaagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatctt 22889707  T
Q  119 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca 218  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22889706 gatggtattgctgagttaactacaaatggcttactaaaactcaccaatgatacagaaagagacaaaggacatggtttctatccaaatccaatagttttca 22889607  T
Q  219 aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  22889606 aaaacacttccagtgaaagcgtgtcttctttctcaactacttttttatttgccataatacctcaatatgcaaatattggtggccatggaatt 22889515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22810151 - 22809879
Alignment:
Q  26 cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta 125  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22810151 cttgtgtttatgttgttttttcttgttacattagtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggta 22810052  T
Q  126 ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22810051 ttgctgagttaaccccagatggcttactaagactcaccaatgatacagaacatgaaaaaggacatgctttctatccaaatcctgtagttttcaaaaacac 22809952  T
Q  226 ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagt 298  Q
    |  || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22809951 tatcagtgaaagtgtatcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactcttagt 22809879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22805823 - 22805532
Alignment:
Q  19 cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt 118  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22805823 cctcaaacttgtgtttatgttgttttttcatgttacattagtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatctt 22805724  T
Q  119 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | | || ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22805723 gatggttttgctgagttaacctcagatggcatactaagactcaccaatgatacagaacaagtaataggtcatgctttctatccaaatccaatagttttca 22805624  T
Q  219 aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||  ||||||||    
T  22805623 aaaacacttccagtgaaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataatacctcaatatccaccttttactggccatggaatt 22805532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22898770 - 22898486
Alignment:
Q  26 cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta 125  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22898770 cttgcgttcatgttgttttttcatgttacattggtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggta 22898671  T
Q  126 ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac 225  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||  |  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22898670 ttgctaatttaacctccaatggcttacttagactcaccaatgataccaagcaagaaaaagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaagaacac 22898571  T
Q  226 ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22898570 ttctaatggaagtgtttcttctttctcaactacttttgtgtttgccataagacctcaatatccaactcttagtggccatggaatt 22898486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22840566 - 22840275
Alignment:
Q  25 acttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcat------atataatggattccaatcatcacatttatatatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||  ||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22840566 acttgtgttcatgttgttttttcatgttacattggtagcaagtatagacaacagtttcatctataaatataatggattccaatcatcaaatttatatctt 22840467  T
Q  119 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca 218  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22840466 gatggtaccgctgagttagcctcaactggcttactaagactcaccaatgatacaaaacaagaaaaaggacaagctttctatccaaatcctatagttttca 22840367  T
Q  219 aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22840366 aaaacacttccagcggaagtgtttcttctttctcaactacttttgtattttccataaaatcttcatatccaactcttagtggccatggaatt 22840275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22894458 - 22894167
Alignment:
Q  19 cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatatt 118  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22894458 cctcaggcttgtgtttatgttgttttttcttgttacattggtaccaagtgaagacaaaagtttcatctataatgatttccaatcatctcatttgtatctt 22894359  T
Q  119 gatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttca 218  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||  || | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  22894358 gatggtattgctaatttaacctccaatggcttactaagactcaccaatgacaccaaacaagaaaaagcacatgctttctatccaaaccctatagttttga 22894259  T
Q  219 aaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||  ||||||||    
T  22894258 agaacacttccaatggaagtgtttcttcattctcaactacttttgtatttgccataagacatcaaggtccaacttatagtggccatggaatt 22894167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22881076 - 22880824
Alignment:
Q  27 ttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataa------tggattccaatcatcacatttatatattga 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22881076 ttgtgtttatgttgttttttcttgttacattgatagcaagtgaagaaaacagtttcatctataaatacaatggattccattcatcacatttatatcttga 22880977  T
Q  121 tggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaa 220  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||   |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880976 tggtattgctaaggtaaactcaaatggcttactaagactcaccaatgacacagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttcaaa 22880877  T
Q  221 aacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccat 273  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880876 aacacttccaatgaaagtgtgtattctttctcaactacttttgtatttgccat 22880824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22858895 - 22858677
Alignment:
Q  57 tggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaa 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  22858895 tggtagcaagtgaagacaacggtttcatctataaaggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcaactggcttactaag 22858796  T
Q  157 actcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaact 256  Q
    |||||||||| |||  |   | || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||    
T  22858795 actcaccaatgatatcgggcaagatacagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttctagtgaaactgtgtcttctttctcaact 22858696  T
Q  257 acttttgtatttgccataa 275  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  22858695 acttttttatttgccataa 22858677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22831538 - 22831289
Alignment:
Q  26 cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta 125  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22831538 cttgtgtttatgttgttttttcttgttacatttgtagcaagtgaagacagcagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggta 22831439  T
Q  126 ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac 225  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |     || | || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22831438 ttgctgagttaacttcagatggcttactaagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacac 22831339  T
Q  226 ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataa 275  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831338 ttcgaatgcaagtgtgtcatctttctcaactacttttgtatttaccataa 22831289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22842677 - 22842422
Alignment:
Q  26 cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataat------ggattccaatcatcacatttatatattg 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||      |||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  22842677 cttgtgtttatgttgttttttcttgttacattggtagcaagtgaagacaacagtttcatctataataatagaggattccaatcatttcatttgtatcttg 22842578  T
Q  120 atggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |  | ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  22842577 atggtattgctgagttaacctcaggtggcttaccaagactcaccaatgatacaaaacaatacaaaggtcatgctttatatccaaaaccaatagttttcaa 22842478  T
Q  220 aaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataa 275  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22842477 aaacacttctagtgaaagtgtgtcttctttctcaactacttttttatttgccataa 22842422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22914124 - 22913982
Alignment:
Q  77 agtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaat 176  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||| || ||  |     
T  22914124 agtttcacatataatggtttcaaatcatcacatttatatcttgatggtgttgctgaattaacctcaaatggtttactaagattaaccaatgattcaagac 22914025  T
Q  177 atgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaa 219  Q
    |  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22914024 aacaaaagggtcatgctttctatccaaaccctatagttttcaa 22913982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22885930 - 22885815
Alignment:
Q  193 tttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaact 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| | || |||||||||||    
T  22885930 tttctatccaaatcctatagttttcaaaaacact--cagtgaaagtgtgtcttctttctcaactaattctttatttgctataaaatcttaatatccaact 22885833  T
Q  293 attagtggtgatggaatt 310  Q
      ||||||  ||||||||    
T  22885832 catagtggccatggaatt 22885815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22873660 - 22873589
Alignment:
Q  19 cctcagacttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataa 90  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22873660 cctcaggcttgtgctcatgttgttttatcttgttacattagtagcaagtgaagacaacagtttcatctataa 22873589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22885969 - 22885937
Alignment:
Q  91 tggattccaatcatcacatttatatattgatgg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22885969 tggattccaatcatcacatttatatcttgatgg 22885937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Original strand, 21150207 - 21150491
Alignment:
Q  26 cttgtgttcatgttgttttatcttattacgctggtagcaagtgaagaaaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatattgatggta 125  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21150207 cttgtgtttatgttgtttaatcttgttacattggtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggta 21150306  T
Q  126 ttgctgagttaacctcaaatggcttactaaaactcaccaataatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21150307 ttgctgagttaacctcaaatggcttactaagactcactagtgatacagatcatgaaatagggcatgctttctatccaaatcctatagttttcgaaaacac 21150406  T
Q  226 ttccaatggaagtgtgtcttctttctcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactattagtggtgatggaatt 310  Q
    ||||   | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  21150407 ttccggcgaaagtgtgttttctttttcaactacttttgtatttgccataagacctcaatatccaactcttggtggccatggaatt 21150491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University